View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9936_low_5 (Length: 679)

Name: NF9936_low_5
Description: NF9936
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9936_low_5
NF9936_low_5
[»] chr2 (162 HSPs)
chr2 (3-526)||(27104531-27105053)
chr2 (3-526)||(19502010-19502534)
chr2 (3-526)||(19504345-19504868)
chr2 (20-526)||(42064264-42064771)
chr2 (79-526)||(13910044-13910491)
chr2 (15-526)||(24162222-24162724)
chr2 (20-526)||(21520692-21521201)
chr2 (20-526)||(6258816-6259321)
chr2 (20-526)||(40032052-40032553)
chr2 (98-526)||(22287335-22287764)
chr2 (111-526)||(43623579-43623982)
chr2 (190-526)||(42452702-42453036)
chr2 (190-526)||(45279983-45280321)
chr2 (111-526)||(6264147-6264560)
chr2 (190-526)||(23452236-23452577)
chr2 (191-526)||(19007560-19007896)
chr2 (231-526)||(35215585-35215881)
chr2 (231-526)||(35217962-35218258)
chr2 (190-526)||(42923508-42923847)
chr2 (20-343)||(22407592-22407915)
chr2 (191-526)||(28196557-28196891)
chr2 (191-526)||(11739558-11739895)
chr2 (191-526)||(17849037-17849373)
chr2 (191-526)||(17848365-17848696)
chr2 (194-526)||(3022086-3022428)
chr2 (191-526)||(31732775-31733100)
chr2 (201-526)||(34979576-34979904)
chr2 (191-526)||(14837193-14837524)
chr2 (191-526)||(44289066-44289403)
chr2 (192-435)||(15539566-15539809)
chr2 (231-499)||(45239003-45239271)
chr2 (321-526)||(5375345-5375550)
chr2 (344-526)||(36558863-36559047)
chr2 (344-526)||(36561140-36561324)
chr2 (191-497)||(11578136-11578439)
chr2 (142-526)||(18800312-18800686)
chr2 (344-526)||(45332180-45332364)
chr2 (191-366)||(22163109-22163282)
chr2 (190-526)||(22874061-22874387)
chr2 (192-519)||(20146613-20146941)
chr2 (388-526)||(22407453-22407592)
chr2 (231-366)||(38020162-38020296)
chr2 (397-522)||(7462950-7463077)
chr2 (190-526)||(17897244-17897578)
chr2 (190-324)||(5377631-5377769)
chr2 (3-173)||(36559173-36559342)
chr2 (281-515)||(28459200-28459435)
chr2 (81-499)||(35107110-35107524)
chr2 (190-526)||(37962940-37963263)
chr2 (3-125)||(36561539-36561661)
chr2 (591-663)||(45279862-45279934)
chr2 (407-526)||(22707750-22707872)
chr2 (3-134)||(45332528-45332659)
chr2 (327-499)||(40699429-40699604)
chr2 (441-526)||(22163021-22163106)
chr2 (591-663)||(42453799-42453871)
chr2 (591-662)||(13909907-13909978)
chr2 (591-663)||(3022489-3022562)
chr2 (591-663)||(23452097-23452170)
chr2 (591-663)||(27105119-27105192)
chr2 (591-663)||(24162084-24162156)
chr2 (591-663)||(35217830-35217902)
chr2 (591-663)||(36558741-36558813)
chr2 (591-663)||(36561001-36561073)
chr2 (3-104)||(43623968-43624069)
chr2 (138-262)||(12342673-12342798)
chr2 (591-663)||(17849434-17849507)
chr2 (591-663)||(19007957-19008030)
chr2 (591-648)||(28459073-28459130)
chr2 (192-285)||(38020064-38020157)
chr2 (348-499)||(17943540-17943690)
chr2 (596-663)||(19501862-19501930)
chr2 (596-663)||(19504197-19504265)
chr2 (591-655)||(42064820-42064884)
chr2 (591-648)||(14837585-14837642)
chr2 (406-526)||(23870951-23871072)
chr2 (591-661)||(42923373-42923445)
chr2 (591-661)||(22287203-22287274)
chr2 (591-649)||(5375225-5375283)
chr2 (591-649)||(6258697-6258755)
chr2 (591-649)||(7462825-7462883)
chr2 (345-460)||(20589763-20589881)
chr2 (605-663)||(35215453-35215511)
chr2 (591-663)||(38020397-38020470)
chr2 (591-663)||(45332040-45332112)
chr2 (591-661)||(6264015-6264086)
chr2 (90-173)||(36561450-36561532)
chr2 (591-637)||(22407346-22407392)
chr2 (591-663)||(43623443-43623517)
chr2 (596-649)||(22874431-22874484)
chr2 (591-663)||(28196952-28197025)
chr2 (247-460)||(43139356-43139564)
chr2 (345-499)||(2736205-2736359)
chr2 (461-525)||(14699036-14699100)
chr2 (591-662)||(15539396-15539467)
chr2 (591-661)||(21520556-21520628)
chr2 (594-646)||(22162907-22162959)
chr2 (314-413)||(38414194-38414291)
chr2 (591-646)||(22707634-22707689)
chr2 (591-661)||(34979456-34979527)
chr2 (179-234)||(45332384-45332439)
chr2 (39-104)||(6264546-6264611)
chr2 (281-455)||(27136195-27136368)
chr2 (610-651)||(17848775-17848816)
chr2 (596-645)||(20592395-20592444)
chr2 (461-525)||(8390179-8390243)
chr2 (461-525)||(13569332-13569396)
chr2 (481-525)||(17057369-17057413)
chr2 (481-525)||(17085352-17085396)
chr2 (345-499)||(17462436-17462590)
chr2 (461-525)||(20522224-20522288)
chr2 (190-234)||(36559067-36559111)
chr2 (190-234)||(36561344-36561388)
chr2 (345-499)||(39686983-39687137)
chr2 (596-655)||(11577986-11578045)
chr2 (348-499)||(27517666-27517818)
chr2 (90-125)||(36561518-36561553)
chr2 (224-286)||(38414281-38414337)
chr2 (463-525)||(1345572-1345634)
chr2 (345-406)||(20054886-20054947)
chr2 (345-406)||(22712637-22712698)
chr2 (345-406)||(22717346-22717407)
chr2 (345-406)||(28458949-28459011)
chr2 (161-219)||(28462593-28462651)
chr2 (596-646)||(31732666-31732716)
chr2 (345-406)||(39680045-39680106)
chr2 (345-406)||(45567409-45567470)
chr2 (591-663)||(11739441-11739514)
chr2 (150-234)||(20147040-20147125)
chr2 (345-404)||(26345677-26345738)
chr2 (460-525)||(34682362-34682427)
chr2 (481-525)||(723744-723788)
chr2 (345-499)||(2740941-2741095)
chr2 (461-525)||(8040064-8040128)
chr2 (461-525)||(10445473-10445537)
chr2 (461-525)||(28259206-28259270)
chr2 (481-525)||(34139770-34139814)
chr2 (390-426)||(38020311-38020347)
chr2 (481-525)||(39284960-39285004)
chr2 (478-525)||(2838076-2838123)
chr2 (482-525)||(11151591-11151634)
chr2 (348-406)||(12781342-12781400)
chr2 (329-406)||(17921754-17921833)
chr2 (348-406)||(17932637-17932695)
chr2 (460-499)||(33670994-33671033)
chr2 (142-221)||(45156922-45157001)
chr2 (460-499)||(45679838-45679877)
chr2 (604-648)||(17897134-17897176)
chr2 (345-385)||(20050163-20050204)
chr2 (133-219)||(35028440-35028527)
chr2 (247-288)||(41304627-41304667)
chr2 (481-525)||(11067429-11067473)
chr2 (481-525)||(14633825-14633869)
chr2 (498-526)||(15539528-15539556)
chr2 (461-525)||(17865207-17865271)
chr2 (461-525)||(33118140-33118204)
chr2 (461-525)||(34388862-34388926)
chr2 (481-525)||(36773686-36773730)
chr2 (481-525)||(38312364-38312408)
chr2 (461-525)||(39482935-39482999)
chr2 (140-239)||(40699178-40699278)
chr2 (461-525)||(42039698-42039762)
[»] chr4 (233 HSPs)
chr4 (3-526)||(51015056-51015579)
chr4 (20-526)||(22044390-22044897)
chr4 (3-526)||(37089371-37089898)
chr4 (24-526)||(31849598-31850101)
chr4 (3-526)||(38409009-38409538)
chr4 (11-526)||(11006236-11006756)
chr4 (3-526)||(24888606-24889130)
chr4 (20-526)||(22802733-22803239)
chr4 (15-526)||(9174145-9174657)
chr4 (74-526)||(22046685-22047135)
chr4 (15-526)||(36919583-36920098)
chr4 (3-526)||(11434785-11435288)
chr4 (15-526)||(36921492-36922006)
chr4 (39-526)||(5198266-5198754)
chr4 (20-526)||(9148087-9148586)
chr4 (20-526)||(48486146-48486653)
chr4 (18-526)||(40091414-40091923)
chr4 (3-526)||(9176473-9177019)
chr4 (111-526)||(22800861-22801276)
chr4 (41-526)||(24880299-24880786)
chr4 (3-466)||(5637524-5637990)
chr4 (40-526)||(24878836-24879324)
chr4 (3-526)||(7941149-7941657)
chr4 (15-526)||(18846953-18847486)
chr4 (3-468)||(3824627-3825096)
chr4 (113-526)||(47274647-47275059)
chr4 (190-526)||(8631418-8631759)
chr4 (44-526)||(11008567-11009075)
chr4 (190-526)||(2484872-2485209)
chr4 (190-526)||(40637071-40637408)
chr4 (190-526)||(44599837-44600174)
chr4 (167-526)||(16934142-16934502)
chr4 (190-526)||(24348211-24348552)
chr4 (167-526)||(16931788-16932148)
chr4 (41-526)||(619447-619932)
chr4 (190-526)||(6764836-6765178)
chr4 (190-526)||(47868398-47868735)
chr4 (190-526)||(22132391-22132735)
chr4 (190-526)||(14633317-14633652)
chr4 (231-526)||(18709163-18709458)
chr4 (231-526)||(22134617-22134909)
chr4 (190-526)||(17662244-17662574)
chr4 (192-522)||(33415491-33415821)
chr4 (191-526)||(38928176-38928513)
chr4 (191-526)||(12395844-12396180)
chr4 (231-526)||(22780372-22780668)
chr4 (231-526)||(22782737-22783033)
chr4 (191-526)||(12400806-12401142)
chr4 (190-526)||(14787428-14787769)
chr4 (190-521)||(47210756-47211082)
chr4 (190-526)||(36378289-36378627)
chr4 (191-526)||(19095880-19096217)
chr4 (192-526)||(37313064-37313400)
chr4 (92-443)||(52942542-52942881)
chr4 (190-516)||(16453306-16453634)
chr4 (266-526)||(26085976-26086236)
chr4 (190-526)||(53405124-53405467)
chr4 (192-521)||(56030443-56030770)
chr4 (201-526)||(19322705-19323029)
chr4 (195-526)||(41997494-41997826)
chr4 (97-499)||(8756277-8756679)
chr4 (191-526)||(18409346-18409681)
chr4 (192-505)||(13543953-13544272)
chr4 (191-526)||(18537472-18537806)
chr4 (269-526)||(36380425-36380684)
chr4 (191-421)||(3937314-3937543)
chr4 (388-526)||(11437558-11437696)
chr4 (388-526)||(5635475-5635614)
chr4 (310-526)||(16455358-16455576)
chr4 (191-411)||(6132871-6133090)
chr4 (191-526)||(18534830-18535164)
chr4 (370-526)||(4215483-4215640)
chr4 (342-522)||(13547302-13547484)
chr4 (273-526)||(38890223-38890476)
chr4 (342-526)||(2891439-2891626)
chr4 (276-526)||(27499128-27499376)
chr4 (191-355)||(38270158-38270321)
chr4 (191-355)||(24446756-24446914)
chr4 (3-134)||(16932213-16932344)
chr4 (190-329)||(5100994-5101133)
chr4 (3-134)||(22783170-22783301)
chr4 (191-308)||(2891314-2891432)
chr4 (3-129)||(16934572-16934698)
chr4 (192-526)||(28453686-28454018)
chr4 (3-134)||(22780805-22780936)
chr4 (345-526)||(16185833-16186018)
chr4 (190-515)||(15032557-15032872)
chr4 (191-526)||(12102088-12102423)
chr4 (591-663)||(31849459-31849531)
chr4 (394-526)||(5101130-5101262)
chr4 (201-526)||(9863716-9864047)
chr4 (591-663)||(22046547-22046619)
chr4 (591-663)||(47210657-47210729)
chr4 (591-661)||(9148635-9148705)
chr4 (591-661)||(11006116-11006186)
chr4 (591-661)||(11008430-11008500)
chr4 (593-663)||(24348603-24348673)
chr4 (591-661)||(51015645-51015715)
chr4 (591-663)||(11435354-11435427)
chr4 (281-526)||(30136640-30136884)
chr4 (591-663)||(2484734-2484806)
chr4 (591-663)||(5635337-5635409)
chr4 (591-663)||(8631279-8631351)
chr4 (247-502)||(9022362-9022616)
chr4 (591-663)||(9176334-9176406)
chr4 (591-663)||(14633718-14633790)
chr4 (591-663)||(22134477-22134549)
chr4 (591-660)||(22044255-22044324)
chr4 (591-663)||(22132249-22132322)
chr4 (591-663)||(22802597-22802670)
chr4 (591-663)||(5198804-5198876)
chr4 (599-663)||(9174006-9174070)
chr4 (591-663)||(17662111-17662183)
chr4 (592-663)||(7941724-7941795)
chr4 (591-661)||(38409604-38409674)
chr4 (594-663)||(38928044-38928114)
chr4 (591-663)||(11437762-11437835)
chr4 (591-663)||(14787294-14787367)
chr4 (591-663)||(14789293-14789366)
chr4 (591-663)||(37089232-37089305)
chr4 (591-663)||(18847553-18847624)
chr4 (591-663)||(24889193-24889265)
chr4 (592-663)||(47868802-47868874)
chr4 (591-663)||(40637471-40637545)
chr4 (167-484)||(40998990-40999306)
chr4 (591-661)||(47563154-47563225)
chr4 (594-663)||(16455624-16455694)
chr4 (599-661)||(18709026-18709088)
chr4 (20-104)||(22801262-22801346)
chr4 (591-663)||(36919449-36919522)
chr4 (441-526)||(47563010-47563095)
chr4 (596-663)||(6765247-6765315)
chr4 (591-663)||(16931651-16931723)
chr4 (591-662)||(40091281-40091353)
chr4 (591-663)||(44599700-44599771)
chr4 (596-663)||(3937146-3937212)
chr4 (591-662)||(4215698-4215769)
chr4 (591-661)||(5101311-5101382)
chr4 (594-663)||(16453706-16453776)
chr4 (591-649)||(37312959-37313017)
chr4 (591-663)||(2891687-2891760)
chr4 (596-649)||(18409228-18409281)
chr4 (591-663)||(22800725-22800798)
chr4 (599-663)||(26085837-26085902)
chr4 (591-663)||(36921358-36921431)
chr4 (596-649)||(41997887-41997940)
chr4 (591-663)||(49088951-49089024)
chr4 (596-649)||(53405538-53405591)
chr4 (332-499)||(3982202-3982374)
chr4 (596-648)||(18534718-18534770)
chr4 (328-488)||(31983564-31983727)
chr4 (591-649)||(6133232-6133290)
chr4 (345-499)||(7050284-7050439)
chr4 (480-526)||(14789427-14789473)
chr4 (591-663)||(33415354-33415428)
chr4 (441-526)||(49088819-49088905)
chr4 (610-663)||(22780232-22780285)
chr4 (610-663)||(22782597-22782650)
chr4 (591-663)||(27499443-27499516)
chr4 (596-649)||(56030857-56030910)
chr4 (461-525)||(10047383-10047447)
chr4 (247-519)||(10112927-10113198)
chr4 (345-499)||(11853549-11853703)
chr4 (596-648)||(18537360-18537412)
chr4 (413-488)||(24446678-24446754)
chr4 (152-526)||(25357595-25357977)
chr4 (461-525)||(39245998-39246062)
chr4 (594-663)||(3824469-3824540)
chr4 (591-661)||(12395712-12395783)
chr4 (591-661)||(12400674-12400745)
chr4 (591-661)||(24446524-24446595)
chr4 (329-519)||(47150898-47151092)
chr4 (190-263)||(16186099-16186173)
chr4 (20-70)||(22048492-22048542)
chr4 (591-663)||(52942350-52942424)
chr4 (345-406)||(55822265-55822326)
chr4 (431-526)||(26557823-26557920)
chr4 (461-525)||(5269220-5269284)
chr4 (596-648)||(5664635-5664687)
chr4 (596-648)||(12102479-12102531)
chr4 (596-648)||(19323090-19323142)
chr4 (591-627)||(24879387-24879423)
chr4 (461-524)||(36315258-36315321)
chr4 (461-524)||(36329467-36329530)
chr4 (591-646)||(48486716-48486771)
chr4 (460-526)||(6133105-6133171)
chr4 (607-648)||(8756138-8756179)
chr4 (591-648)||(36378686-36378742)
chr4 (591-661)||(38270016-38270084)
chr4 (461-525)||(5396700-5396764)
chr4 (481-525)||(5429803-5429847)
chr4 (481-525)||(12739550-12739594)
chr4 (591-661)||(13547549-13547621)
chr4 (596-648)||(15032429-15032480)
chr4 (202-262)||(16455296-16455356)
chr4 (481-525)||(26175636-26175680)
chr4 (481-525)||(36463389-36463433)
chr4 (461-525)||(38152468-38152532)
chr4 (481-525)||(48893638-48893682)
chr4 (486-526)||(52942487-52942527)
chr4 (473-525)||(54867188-54867239)
chr4 (483-526)||(3937273-3937316)
chr4 (348-406)||(4556180-4556238)
chr4 (348-406)||(4558314-4558372)
chr4 (461-524)||(6743444-6743507)
chr4 (348-406)||(8529270-8529328)
chr4 (348-406)||(15316961-15317019)
chr4 (348-406)||(18586969-18587027)
chr4 (460-499)||(18587082-18587121)
chr4 (348-406)||(31300427-31300485)
chr4 (385-416)||(38270120-38270151)
chr4 (591-649)||(47275119-47275177)
chr4 (431-526)||(3578670-3578766)
chr4 (348-392)||(4884877-4884922)
chr4 (476-525)||(5143263-5143312)
chr4 (80-129)||(16689331-16689380)
chr4 (607-663)||(16934008-16934062)
chr4 (20-84)||(52942910-52942974)
chr4 (461-525)||(3796548-3796612)
chr4 (481-525)||(5871944-5871988)
chr4 (81-129)||(8529012-8529060)
chr4 (481-525)||(9927458-9927502)
chr4 (603-646)||(10113272-10113313)
chr4 (481-525)||(12743925-12743969)
chr4 (481-525)||(12745314-12745358)
chr4 (461-525)||(16623322-16623386)
chr4 (481-525)||(27416965-27417009)
chr4 (461-525)||(31985663-31985726)
chr4 (481-525)||(34570414-34570458)
chr4 (481-525)||(46147391-46147435)
chr4 (481-525)||(47038411-47038455)
chr4 (167-219)||(52043737-52043789)
chr4 (481-525)||(52467354-52467398)
[»] chr1 (217 HSPs)
chr1 (15-526)||(51749806-51750319)
chr1 (3-526)||(20302214-20302738)
chr1 (20-526)||(28840451-28840959)
chr1 (3-526)||(13761593-13762116)
chr1 (3-526)||(51752120-51752643)
chr1 (20-526)||(28842266-28842774)
chr1 (20-526)||(15823319-15823826)
chr1 (3-526)||(10399829-10400353)
chr1 (20-526)||(13214854-13215366)
chr1 (3-526)||(6822791-6823294)
chr1 (15-443)||(6823651-6824088)
chr1 (44-526)||(41646717-41647200)
chr1 (167-526)||(16226087-16226447)
chr1 (20-526)||(3579618-3580126)
chr1 (114-526)||(38925482-38925892)
chr1 (190-526)||(31735522-31735863)
chr1 (39-526)||(39462310-39462799)
chr1 (191-522)||(2617460-2617792)
chr1 (190-526)||(27336941-27337280)
chr1 (180-526)||(20291390-20291736)
chr1 (94-526)||(28207069-28207500)
chr1 (190-526)||(27339132-27339472)
chr1 (239-526)||(46431707-46431996)
chr1 (112-526)||(14097970-14098385)
chr1 (167-526)||(47179629-47179992)
chr1 (190-526)||(9463245-9463588)
chr1 (190-526)||(24325599-24325943)
chr1 (190-526)||(9459418-9459761)
chr1 (231-526)||(15294835-15295131)
chr1 (167-526)||(47177278-47177641)
chr1 (193-526)||(39932017-39932354)
chr1 (193-489)||(21948226-21948526)
chr1 (190-526)||(47906207-47906550)
chr1 (107-523)||(47451508-47451919)
chr1 (190-526)||(17324637-17324974)
chr1 (191-526)||(50307547-50307884)
chr1 (190-526)||(12302506-12302848)
chr1 (191-526)||(18839531-18839868)
chr1 (190-526)||(2510326-2510666)
chr1 (190-526)||(6995701-6996038)
chr1 (190-526)||(28998254-28998591)
chr1 (190-526)||(29003970-29004307)
chr1 (190-526)||(16428596-16428934)
chr1 (191-526)||(17186128-17186465)
chr1 (191-526)||(50076673-50077009)
chr1 (191-526)||(50078821-50079158)
chr1 (192-526)||(25251275-25251611)
chr1 (191-526)||(11457476-11457812)
chr1 (192-526)||(18307054-18307389)
chr1 (190-526)||(2949233-2949569)
chr1 (231-526)||(4131376-4131676)
chr1 (190-518)||(9241094-9241424)
chr1 (231-526)||(25127856-25128153)
chr1 (190-468)||(48665114-48665400)
chr1 (212-526)||(31425016-31425335)
chr1 (190-526)||(6756470-6756808)
chr1 (191-526)||(50248571-50248909)
chr1 (191-526)||(31489859-31490192)
chr1 (190-526)||(31422861-31423212)
chr1 (192-526)||(17318838-17319167)
chr1 (342-526)||(51757625-51757810)
chr1 (191-526)||(17324009-17324344)
chr1 (140-526)||(42922126-42922512)
chr1 (314-526)||(16231630-16231842)
chr1 (240-526)||(40133937-40134225)
chr1 (344-526)||(23785935-23786119)
chr1 (191-526)||(14183591-14183923)
chr1 (190-499)||(8347300-8347607)
chr1 (40-526)||(30790401-30790882)
chr1 (190-499)||(15669421-15669729)
chr1 (388-526)||(23816027-23816166)
chr1 (238-526)||(16432396-16432676)
chr1 (342-526)||(16429051-16429238)
chr1 (314-526)||(25248552-25248766)
chr1 (190-499)||(18800600-18800907)
chr1 (192-526)||(8349051-8349385)
chr1 (3-185)||(16225903-16226083)
chr1 (190-515)||(49495222-49495537)
chr1 (167-287)||(16231521-16231641)
chr1 (345-526)||(6115103-6115287)
chr1 (3-185)||(47177094-47177274)
chr1 (3-129)||(47179444-47179570)
chr1 (3-125)||(23783254-23783376)
chr1 (192-286)||(25248756-25248850)
chr1 (591-663)||(13447136-13447208)
chr1 (591-663)||(15294697-15294769)
chr1 (3-92)||(20291296-20291386)
chr1 (591-660)||(31735388-31735457)
chr1 (591-663)||(47906612-47906684)
chr1 (591-663)||(51750385-51750457)
chr1 (451-526)||(13358778-13358853)
chr1 (112-199)||(49687405-49687492)
chr1 (591-663)||(10399690-10399763)
chr1 (591-660)||(51757881-51757950)
chr1 (591-663)||(13762182-13762254)
chr1 (591-663)||(23816231-23816303)
chr1 (591-663)||(46431568-46431640)
chr1 (325-526)||(16561544-16561749)
chr1 (15-104)||(16231369-16231458)
chr1 (591-663)||(2510205-2510277)
chr1 (591-662)||(4131243-4131315)
chr1 (599-663)||(9459297-9459361)
chr1 (599-663)||(9463124-9463188)
chr1 (209-499)||(13125485-13125775)
chr1 (591-663)||(23786186-23786258)
chr1 (167-526)||(27916417-27916778)
chr1 (591-663)||(2949099-2949172)
chr1 (591-663)||(20291802-20291875)
chr1 (591-663)||(50078656-50078729)
chr1 (348-526)||(21353347-21353525)
chr1 (591-663)||(24326009-24326081)
chr1 (599-663)||(28842848-28842912)
chr1 (591-663)||(31490253-31490325)
chr1 (596-663)||(39932426-39932494)
chr1 (591-661)||(2617863-2617934)
chr1 (419-526)||(15916562-15916672)
chr1 (201-435)||(26520206-26520445)
chr1 (329-526)||(26613239-26613440)
chr1 (591-663)||(9240954-9241027)
chr1 (599-663)||(16226522-16226587)
chr1 (591-663)||(20302787-20302860)
chr1 (591-663)||(25251141-25251214)
chr1 (591-663)||(50248437-50248510)
chr1 (591-661)||(14097837-14097909)
chr1 (596-663)||(16429299-16429367)
chr1 (591-663)||(51752715-51752786)
chr1 (591-661)||(3579452-3579523)
chr1 (593-663)||(6995560-6995631)
chr1 (599-654)||(28841033-28841088)
chr1 (591-649)||(13215425-13215483)
chr1 (591-663)||(11457342-11457415)
chr1 (599-663)||(16231917-16231982)
chr1 (591-663)||(47177708-47177781)
chr1 (591-661)||(28206934-28207006)
chr1 (329-489)||(155788-155950)
chr1 (90-173)||(23783362-23783444)
chr1 (591-649)||(27336819-27336878)
chr1 (591-646)||(47451972-47452027)
chr1 (596-662)||(15916734-15916800)
chr1 (591-649)||(18307450-18307508)
chr1 (591-663)||(39462862-39462936)
chr1 (599-663)||(13358927-13358992)
chr1 (596-649)||(17186014-17186067)
chr1 (591-663)||(18839929-18840002)
chr1 (591-663)||(47180059-47180132)
chr1 (591-661)||(12302373-12302445)
chr1 (596-648)||(14183490-14183542)
chr1 (329-406)||(14353047-14353126)
chr1 (591-649)||(27339010-27339069)
chr1 (591-649)||(50307424-50307483)
chr1 (591-663)||(15823890-15823964)
chr1 (599-649)||(17324423-17324473)
chr1 (591-649)||(25248433-25248491)
chr1 (345-499)||(30738655-30738815)
chr1 (596-645)||(30790288-30790337)
chr1 (591-663)||(31424882-31424955)
chr1 (596-648)||(6114989-6115041)
chr1 (473-525)||(13598402-13598454)
chr1 (461-525)||(16124545-16124609)
chr1 (461-525)||(37069774-37069838)
chr1 (596-649)||(40134288-40134343)
chr1 (461-525)||(47703965-47704029)
chr1 (348-499)||(2401248-2401400)
chr1 (224-263)||(6115344-6115383)
chr1 (596-663)||(8348925-8348991)
chr1 (600-643)||(16429000-16429043)
chr1 (462-525)||(19072932-19072995)
chr1 (462-525)||(19120822-19120885)
chr1 (190-229)||(23783494-23783533)
chr1 (167-262)||(26613503-26613601)
chr1 (591-649)||(28998129-28998190)
chr1 (591-649)||(29003845-29003906)
chr1 (591-642)||(30780387-30780438)
chr1 (462-525)||(47098854-47098917)
chr1 (345-406)||(2232597-2232658)
chr1 (596-646)||(17319233-17319283)
chr1 (594-649)||(38925363-38925420)
chr1 (193-234)||(15295142-15295183)
chr1 (460-525)||(21536597-21536662)
chr1 (591-649)||(25860288-25860342)
chr1 (476-525)||(26644941-26644990)
chr1 (461-522)||(29651818-29651879)
chr1 (481-525)||(834167-834211)
chr1 (461-525)||(9476265-9476329)
chr1 (481-525)||(13659336-13659380)
chr1 (591-662)||(17324500-17324572)
chr1 (596-648)||(18800458-18800510)
chr1 (461-525)||(27104401-27104465)
chr1 (481-525)||(28220226-28220270)
chr1 (481-525)||(28265554-28265598)
chr1 (270-468)||(28279292-28279489)
chr1 (348-406)||(9526469-9526527)
chr1 (441-526)||(13127687-13127774)
chr1 (201-296)||(13127862-13127955)
chr1 (348-406)||(25134074-25134132)
chr1 (462-525)||(47102871-47102934)
chr1 (20-86)||(49687334-49687400)
chr1 (476-522)||(3281715-3281761)
chr1 (345-406)||(4144804-4144865)
chr1 (596-642)||(26519328-26519373)
chr1 (591-649)||(31422741-31422799)
chr1 (20-69)||(38925915-38925965)
chr1 (483-525)||(45644354-45644396)
chr1 (20-77)||(47451438-47451495)
chr1 (591-641)||(50076563-50076613)
chr1 (607-648)||(13125346-13125386)
chr1 (607-648)||(13127576-13127616)
chr1 (80-129)||(13449947-13449996)
chr1 (599-663)||(16432736-16432801)
chr1 (481-525)||(3156989-3157033)
chr1 (481-525)||(4552637-4552681)
chr1 (481-525)||(10925350-10925394)
chr1 (190-242)||(16431044-16431096)
chr1 (481-525)||(28223421-28223465)
chr1 (481-525)||(31659362-31659406)
chr1 (599-661)||(41647269-41647333)
chr1 (389-526)||(46783189-46783329)
[»] chr5 (205 HSPs)
chr5 (20-526)||(38881878-38882385)
chr5 (3-517)||(4236386-4236900)
chr5 (20-526)||(16775930-16776437)
chr5 (3-526)||(2174696-2175198)
chr5 (3-526)||(25921472-25921976)
chr5 (20-526)||(21947803-21948306)
chr5 (3-526)||(31544814-31545360)
chr5 (78-526)||(21684451-21684909)
chr5 (167-526)||(31542655-31543014)
chr5 (131-526)||(2818334-2818731)
chr5 (190-526)||(31179370-31179707)
chr5 (190-526)||(10529098-10529435)
chr5 (112-526)||(6756359-6756772)
chr5 (190-526)||(39854427-39854763)
chr5 (192-526)||(18466625-18466964)
chr5 (231-526)||(34477052-34477349)
chr5 (231-526)||(34479417-34479714)
chr5 (190-526)||(27912473-27912816)
chr5 (112-526)||(36402327-36402741)
chr5 (231-526)||(6745053-6745348)
chr5 (190-526)||(26097676-26098011)
chr5 (201-526)||(18511211-18511539)
chr5 (231-522)||(25804009-25804300)
chr5 (190-526)||(27910388-27910730)
chr5 (190-526)||(6747247-6747584)
chr5 (190-526)||(40221465-40221803)
chr5 (190-526)||(18468950-18469289)
chr5 (231-526)||(15552229-15552525)
chr5 (191-526)||(25904047-25904383)
chr5 (191-526)||(1189606-1189949)
chr5 (191-526)||(17072827-17073164)
chr5 (115-526)||(31465988-31466389)
chr5 (193-526)||(18509317-18509652)
chr5 (112-522)||(12555926-12556337)
chr5 (191-526)||(24126800-24127136)
chr5 (194-526)||(10474322-10474655)
chr5 (190-524)||(18596590-18596924)
chr5 (201-526)||(17818491-17818814)
chr5 (231-526)||(16092198-16092495)
chr5 (191-526)||(31472611-31472948)
chr5 (201-526)||(2954370-2954696)
chr5 (190-526)||(10586782-10587112)
chr5 (191-526)||(695833-696158)
chr5 (190-526)||(37705779-37706116)
chr5 (269-526)||(658355-658610)
chr5 (191-522)||(39397996-39398327)
chr5 (314-526)||(4410090-4410302)
chr5 (20-323)||(20507665-20507968)
chr5 (191-405)||(20042994-20043208)
chr5 (191-478)||(34530712-34531001)
chr5 (344-526)||(10749796-10749980)
chr5 (191-409)||(20044954-20045172)
chr5 (326-526)||(20505842-20506041)
chr5 (201-526)||(21288718-21289041)
chr5 (323-526)||(39798123-39798327)
chr5 (344-526)||(10757273-10757456)
chr5 (344-526)||(38960131-38960314)
chr5 (196-526)||(6661183-6661512)
chr5 (344-526)||(3373136-3373320)
chr5 (344-526)||(15354574-15354757)
chr5 (344-526)||(23665140-23665323)
chr5 (344-526)||(23793264-23793447)
chr5 (314-526)||(41585743-41585956)
chr5 (190-382)||(26098395-26098587)
chr5 (344-526)||(15356850-15357033)
chr5 (15-182)||(34477438-34477604)
chr5 (388-526)||(23741858-23741995)
chr5 (310-526)||(2723965-2724173)
chr5 (3-217)||(39797865-39798058)
chr5 (3-173)||(31542458-31542628)
chr5 (191-526)||(36208524-36208856)
chr5 (3-173)||(10749521-10749690)
chr5 (3-173)||(10756976-10757145)
chr5 (3-173)||(15354880-15355049)
chr5 (3-173)||(15357156-15357325)
chr5 (3-104)||(34479855-34479956)
chr5 (190-287)||(4410000-4410101)
chr5 (247-493)||(17413198-17413441)
chr5 (591-663)||(25804370-25804442)
chr5 (591-663)||(38882434-38882506)
chr5 (192-487)||(9020167-9020460)
chr5 (44-134)||(31179807-31179897)
chr5 (591-663)||(4236974-4237046)
chr5 (234-526)||(20053834-20054117)
chr5 (3-173)||(23664850-23665019)
chr5 (3-173)||(23667125-23667294)
chr5 (3-173)||(23793568-23793737)
chr5 (591-663)||(21684313-21684385)
chr5 (344-526)||(23667415-23667598)
chr5 (591-663)||(25921334-25921406)
chr5 (591-662)||(2175247-2175318)
chr5 (20-104)||(659746-659829)
chr5 (591-663)||(34476913-34476986)
chr5 (591-663)||(34479278-34479351)
chr5 (591-663)||(41585600-41585673)
chr5 (599-663)||(38959992-38960056)
chr5 (591-663)||(31179233-31179305)
chr5 (599-663)||(39798384-39798448)
chr5 (591-661)||(17818357-17818428)
chr5 (42-122)||(659850-659929)
chr5 (591-649)||(26098166-26098224)
chr5 (441-526)||(26098287-26098373)
chr5 (591-663)||(2724234-2724307)
chr5 (591-663)||(3372997-3373070)
chr5 (591-663)||(10528958-10529031)
chr5 (591-663)||(10750045-10750118)
chr5 (591-663)||(10757521-10757594)
chr5 (596-649)||(18469360-18469413)
chr5 (591-663)||(34530579-34530652)
chr5 (3-104)||(38960487-38960588)
chr5 (591-663)||(40221870-40221943)
chr5 (385-461)||(42770948-42771025)
chr5 (596-663)||(10587166-10587233)
chr5 (596-663)||(18467035-18467103)
chr5 (599-663)||(31543088-31543152)
chr5 (190-286)||(41585946-41586042)
chr5 (596-663)||(4410373-4410439)
chr5 (591-646)||(26098072-26098127)
chr5 (591-649)||(10474203-10474261)
chr5 (591-649)||(20045327-20045385)
chr5 (591-649)||(36208914-36208972)
chr5 (596-649)||(21289105-21289158)
chr5 (596-649)||(27912887-27912940)
chr5 (591-661)||(6747647-6747721)
chr5 (596-663)||(15354434-15354502)
chr5 (596-663)||(15356710-15356778)
chr5 (596-663)||(23665396-23665464)
chr5 (596-663)||(23741717-23741785)
chr5 (596-663)||(23793123-23793191)
chr5 (348-499)||(4897828-4897983)
chr5 (591-646)||(17073228-17073283)
chr5 (591-649)||(1189487-1189545)
chr5 (591-649)||(6756833-6756891)
chr5 (591-649)||(18511091-18511149)
chr5 (591-661)||(21948373-21948446)
chr5 (591-663)||(36402190-36402264)
chr5 (247-488)||(2144599-2144840)
chr5 (20-104)||(2818729-2818813)
chr5 (190-235)||(3373332-3373377)
chr5 (591-663)||(16776501-16776574)
chr5 (592-663)||(658223-658295)
chr5 (345-499)||(1170811-1170965)
chr5 (591-661)||(6745411-6745485)
chr5 (591-662)||(12555779-12555851)
chr5 (343-499)||(15143560-15143720)
chr5 (599-663)||(15552600-15552664)
chr5 (190-234)||(23665081-23665125)
chr5 (190-234)||(23793462-23793506)
chr5 (596-663)||(27910784-27910852)
chr5 (594-648)||(696218-696273)
chr5 (591-646)||(2954756-2954811)
chr5 (591-649)||(20043330-20043389)
chr5 (348-499)||(22672837-22672989)
chr5 (591-661)||(37705649-37705720)
chr5 (345-406)||(2298122-2298183)
chr5 (596-646)||(6661074-6661124)
chr5 (591-645)||(18509201-18509255)
chr5 (345-499)||(35385479-35385634)
chr5 (190-415)||(42770717-42770934)
chr5 (190-231)||(15354777-15354818)
chr5 (190-231)||(15357053-15357094)
chr5 (591-663)||(18596986-18597059)
chr5 (599-648)||(20054182-20054231)
chr5 (591-661)||(2818199-2818271)
chr5 (461-525)||(9353361-9353425)
chr5 (478-526)||(20043222-20043270)
chr5 (20-123)||(20504316-20504419)
chr5 (591-661)||(20505709-20505783)
chr5 (190-234)||(23667356-23667400)
chr5 (190-234)||(23742057-23742101)
chr5 (461-525)||(36932379-36932443)
chr5 (190-234)||(38960334-38960378)
chr5 (15-85)||(18186489-18186559)
chr5 (348-499)||(25452498-25452650)
chr5 (591-646)||(25904444-25904499)
chr5 (462-525)||(28832263-28832326)
chr5 (190-228)||(10757207-10757245)
chr5 (591-663)||(31465853-31465927)
chr5 (460-525)||(11917000-11917065)
chr5 (476-525)||(17004004-17004053)
chr5 (350-499)||(25445501-25445651)
chr5 (20-92)||(31466391-31466463)
chr5 (461-525)||(10281755-10281819)
chr5 (461-525)||(15464536-15464600)
chr5 (481-525)||(19806487-19806531)
chr5 (167-219)||(29748261-29748313)
chr5 (599-663)||(31545437-31545501)
chr5 (481-525)||(32636948-32636992)
chr5 (167-219)||(34477379-34477431)
chr5 (348-406)||(11962554-11962612)
chr5 (460-499)||(17841276-17841315)
chr5 (591-649)||(39854827-39854886)
chr5 (591-649)||(16092080-16092137)
chr5 (591-663)||(24127197-24127271)
chr5 (190-227)||(10749730-10749767)
chr5 (480-525)||(31300644-31300689)
chr5 (80-129)||(39854317-39854366)
chr5 (80-129)||(42238047-42238096)
chr5 (481-525)||(533893-533937)
chr5 (80-128)||(1240171-1240219)
chr5 (80-136)||(4409890-4409946)
chr5 (461-525)||(19588750-19588814)
chr5 (3-51)||(21684905-21684953)
chr5 (167-219)||(34479740-34479792)
chr5 (481-525)||(42428430-42428474)
[»] chr8 (141 HSPs)
chr8 (20-526)||(27829126-27829632)
chr8 (20-526)||(27826815-27827321)
chr8 (3-526)||(14807564-14808097)
chr8 (20-526)||(15067810-15068317)
chr8 (20-526)||(15072539-15073047)
chr8 (54-526)||(44720686-44721179)
chr8 (90-526)||(28251566-28252002)
chr8 (3-526)||(18810499-18811043)
chr8 (111-526)||(4423938-4424354)
chr8 (3-526)||(18812684-18813217)
chr8 (190-526)||(3874005-3874346)
chr8 (190-526)||(15809214-15809554)
chr8 (190-526)||(32339304-32339645)
chr8 (201-526)||(608736-609070)
chr8 (190-526)||(22684652-22685002)
chr8 (191-526)||(27106896-27107232)
chr8 (239-526)||(43079650-43079938)
chr8 (20-302)||(12517248-12517532)
chr8 (140-526)||(14419189-14419578)
chr8 (231-526)||(43082013-43082309)
chr8 (190-526)||(28283220-28283561)
chr8 (190-526)||(24873180-24873523)
chr8 (191-526)||(30480502-30480838)
chr8 (143-526)||(13858483-13858868)
chr8 (190-522)||(27911014-27911345)
chr8 (190-522)||(27957433-27957764)
chr8 (190-526)||(1225165-1225503)
chr8 (190-526)||(41384744-41385080)
chr8 (190-526)||(43530123-43530451)
chr8 (192-526)||(36865538-36865873)
chr8 (191-526)||(25952521-25952857)
chr8 (191-435)||(14477276-14477520)
chr8 (190-526)||(41382672-41382998)
chr8 (191-522)||(5372179-5372512)
chr8 (191-522)||(33541413-33541723)
chr8 (111-291)||(3886153-3886336)
chr8 (190-526)||(15185713-15186046)
chr8 (191-526)||(21482322-21482647)
chr8 (190-366)||(26775200-26775375)
chr8 (224-519)||(21480547-21480832)
chr8 (147-382)||(5622882-5623117)
chr8 (190-526)||(31162212-31162549)
chr8 (224-526)||(3005629-3005929)
chr8 (281-526)||(15956051-15956294)
chr8 (3-134)||(43079363-43079494)
chr8 (113-263)||(2468361-2468511)
chr8 (191-355)||(35872555-35872713)
chr8 (3-126)||(43081738-43081861)
chr8 (591-663)||(43530517-43530589)
chr8 (326-526)||(31035252-31035457)
chr8 (314-490)||(181622-181799)
chr8 (190-286)||(181536-181632)
chr8 (591-663)||(3874395-3874467)
chr8 (591-663)||(18811109-18811182)
chr8 (591-663)||(15809620-15809692)
chr8 (397-526)||(2468128-2468259)
chr8 (591-655)||(3883464-3883528)
chr8 (591-663)||(28251431-28251503)
chr8 (599-663)||(28283082-28283146)
chr8 (224-343)||(37214374-37214512)
chr8 (591-663)||(44721245-44721317)
chr8 (591-649)||(36865936-36865994)
chr8 (591-663)||(4424420-4424493)
chr8 (591-663)||(18813283-18813356)
chr8 (591-663)||(27827387-27827460)
chr8 (591-663)||(27829698-27829771)
chr8 (591-663)||(32339711-32339784)
chr8 (599-663)||(43082383-43082447)
chr8 (591-661)||(41383061-41383132)
chr8 (20-105)||(28252008-28252093)
chr8 (152-364)||(31035029-31035238)
chr8 (596-649)||(13858369-13858422)
chr8 (591-663)||(14808158-14808231)
chr8 (591-663)||(15073109-15073182)
chr8 (591-663)||(22684513-22684586)
chr8 (599-663)||(43080012-43080076)
chr8 (591-655)||(609137-609203)
chr8 (15-96)||(3886330-3886412)
chr8 (591-649)||(15068379-15068437)
chr8 (596-661)||(27106769-27106835)
chr8 (329-526)||(31578275-31578476)
chr8 (20-104)||(4423868-4423952)
chr8 (599-663)||(24873059-24873124)
chr8 (591-663)||(33541275-33541348)
chr8 (592-663)||(14477648-14477720)
chr8 (591-661)||(14419057-14419128)
chr8 (591-646)||(30480386-30480441)
chr8 (591-661)||(37214131-37214202)
chr8 (475-526)||(37214263-37214314)
chr8 (431-515)||(6376229-6376315)
chr8 (596-649)||(2468013-2468066)
chr8 (596-649)||(15185599-15185652)
chr8 (345-499)||(16757295-16757449)
chr8 (413-488)||(35872477-35872553)
chr8 (599-661)||(25952925-25952988)
chr8 (329-457)||(31573794-31573924)
chr8 (591-661)||(35872323-35872394)
chr8 (599-649)||(15956358-15956408)
chr8 (461-525)||(4696625-4696689)
chr8 (345-526)||(4812487-4812669)
chr8 (461-525)||(9765848-9765912)
chr8 (147-219)||(17847484-17847556)
chr8 (461-525)||(26403259-26403323)
chr8 (345-499)||(28327908-28328062)
chr8 (596-648)||(31162612-31162664)
chr8 (348-498)||(590797-590948)
chr8 (345-406)||(9021228-9021289)
chr8 (345-406)||(16752643-16752704)
chr8 (344-499)||(17847677-17847828)
chr8 (345-406)||(28895502-28895563)
chr8 (591-639)||(41385143-41385192)
chr8 (596-648)||(3005521-3005572)
chr8 (461-525)||(7412345-7412409)
chr8 (481-525)||(10930199-10930243)
chr8 (481-525)||(15212910-15212954)
chr8 (345-392)||(17799558-17799606)
chr8 (596-649)||(21482708-21482763)
chr8 (461-525)||(23799606-23799670)
chr8 (481-525)||(27811402-27811446)
chr8 (461-525)||(31071258-31071322)
chr8 (481-525)||(33352274-33352318)
chr8 (481-525)||(40321204-40321248)
chr8 (481-524)||(4733830-4733873)
chr8 (462-525)||(19752424-19752487)
chr8 (460-499)||(25684758-25684797)
chr8 (460-499)||(28890881-28890920)
chr8 (348-499)||(29554812-29554964)
chr8 (348-406)||(33032657-33032715)
chr8 (606-648)||(1225567-1225609)
chr8 (345-406)||(28332631-28332692)
chr8 (472-525)||(5702523-5702576)
chr8 (481-522)||(40221869-40221910)
chr8 (481-525)||(4743214-4743258)
chr8 (481-525)||(5689395-5689439)
chr8 (190-234)||(6375988-6376032)
chr8 (481-525)||(6599096-6599140)
chr8 (481-525)||(6674549-6674593)
chr8 (481-525)||(12702634-12702678)
chr8 (461-525)||(19175783-19175847)
chr8 (596-649)||(21480900-21480955)
chr8 (481-525)||(43036547-43036591)
[»] chr6 (147 HSPs)
chr6 (3-526)||(14507175-14507700)
chr6 (3-526)||(11983028-11983550)
chr6 (20-526)||(9019735-9020241)
chr6 (20-420)||(19227514-19227915)
chr6 (190-526)||(28241320-28241657)
chr6 (20-482)||(15530166-15530628)
chr6 (201-526)||(14458766-14459090)
chr6 (70-526)||(30728823-30729284)
chr6 (70-526)||(15541139-15541596)
chr6 (190-526)||(1230248-1230585)
chr6 (231-526)||(4816230-4816526)
chr6 (190-525)||(12195515-12195851)
chr6 (167-526)||(20915355-20915717)
chr6 (190-526)||(30967176-30967516)
chr6 (190-526)||(30034602-30034943)
chr6 (112-522)||(32279897-32280308)
chr6 (70-526)||(15532681-15533137)
chr6 (196-526)||(19704566-19704905)
chr6 (190-526)||(2628885-2629226)
chr6 (231-526)||(26065005-26065296)
chr6 (231-526)||(26084974-26085265)
chr6 (191-526)||(13057173-13057510)
chr6 (20-308)||(8995288-8995575)
chr6 (190-526)||(3390357-3390695)
chr6 (191-526)||(25477253-25477597)
chr6 (190-526)||(26932561-26932906)
chr6 (191-526)||(3629864-3630199)
chr6 (191-526)||(13039733-13040070)
chr6 (193-526)||(3631938-3632271)
chr6 (191-516)||(3233739-3234065)
chr6 (191-526)||(24338447-24338783)
chr6 (112-335)||(1072068-1072291)
chr6 (311-526)||(5273215-5273431)
chr6 (191-526)||(12161557-12161889)
chr6 (344-526)||(26066123-26066307)
chr6 (344-526)||(29754708-29754892)
chr6 (190-499)||(3027878-3028186)
chr6 (344-526)||(33308988-33309171)
chr6 (191-460)||(22490618-22490889)
chr6 (344-526)||(26068394-26068578)
chr6 (344-526)||(33311257-33311440)
chr6 (224-526)||(15719666-15719959)
chr6 (342-526)||(1069717-1069904)
chr6 (152-526)||(16455423-16455798)
chr6 (191-335)||(32447506-32447651)
chr6 (3-134)||(26068735-26068866)
chr6 (191-526)||(14466312-14466639)
chr6 (3-173)||(33308701-33308870)
chr6 (3-173)||(33310970-33311139)
chr6 (3-134)||(26066464-26066595)
chr6 (167-526)||(12186070-12186429)
chr6 (190-320)||(17852520-17852650)
chr6 (3-173)||(29755094-29755263)
chr6 (310-526)||(15367132-15367347)
chr6 (44-182)||(4816612-4816749)
chr6 (201-340)||(13870608-13870746)
chr6 (201-526)||(17012033-17012356)
chr6 (191-526)||(19696420-19696757)
chr6 (388-526)||(15346523-15346662)
chr6 (591-663)||(4816091-4816163)
chr6 (591-663)||(14507037-14507109)
chr6 (591-663)||(28241182-28241254)
chr6 (591-663)||(11982892-11982964)
chr6 (591-663)||(29754569-29754641)
chr6 (591-663)||(1230109-1230181)
chr6 (599-663)||(18322482-18322546)
chr6 (591-663)||(26065981-26066053)
chr6 (591-663)||(26068255-26068327)
chr6 (599-663)||(26932423-26932487)
chr6 (591-663)||(30967582-30967654)
chr6 (591-663)||(19704424-19704498)
chr6 (591-649)||(24338330-24338388)
chr6 (591-663)||(9020305-9020378)
chr6 (591-663)||(15367405-15367478)
chr6 (596-663)||(2628746-2628814)
chr6 (591-661)||(3629733-3629804)
chr6 (329-526)||(22857951-22858152)
chr6 (88-186)||(24192635-24192733)
chr6 (599-663)||(5273076-5273141)
chr6 (591-663)||(15346720-15346793)
chr6 (407-526)||(25465589-25465710)
chr6 (342-526)||(26945272-26945461)
chr6 (591-663)||(30728689-30728762)
chr6 (591-663)||(33309237-33309310)
chr6 (591-663)||(33311506-33311579)
chr6 (191-303)||(10584105-10584212)
chr6 (443-526)||(10584227-10584311)
chr6 (168-262)||(15346347-15346441)
chr6 (88-186)||(24191538-24191636)
chr6 (594-663)||(26065365-26065435)
chr6 (594-663)||(26085334-26085404)
chr6 (610-663)||(8717215-8717268)
chr6 (599-663)||(20915217-20915281)
chr6 (167-235)||(26066319-26066387)
chr6 (167-235)||(26068590-26068658)
chr6 (591-661)||(3631806-3631877)
chr6 (437-499)||(12911472-12911535)
chr6 (610-663)||(12195374-12195427)
chr6 (345-499)||(13878727-13878881)
chr6 (345-499)||(13883475-13883629)
chr6 (345-499)||(16785919-16786073)
chr6 (599-663)||(30034466-30034528)
chr6 (342-526)||(28037724-28037916)
chr6 (591-644)||(1069603-1069656)
chr6 (591-647)||(3394743-3394800)
chr6 (591-663)||(14458627-14458700)
chr6 (599-648)||(17012417-17012466)
chr6 (190-239)||(29754983-29755032)
chr6 (461-525)||(5757507-5757571)
chr6 (461-525)||(10077194-10077258)
chr6 (345-486)||(20526937-20527081)
chr6 (437-499)||(12937220-12937282)
chr6 (348-406)||(22351973-22352031)
chr6 (387-499)||(30445698-30445813)
chr6 (462-525)||(31979517-31979580)
chr6 (345-406)||(26887345-26887406)
chr6 (411-526)||(28078193-28078310)
chr6 (345-406)||(31248835-31248896)
chr6 (345-406)||(35201447-35201508)
chr6 (348-404)||(19701985-19702041)
chr6 (80-129)||(26084818-26084867)
chr6 (167-219)||(4816552-4816604)
chr6 (461-525)||(5572270-5572334)
chr6 (612-663)||(13057587-13057639)
chr6 (461-525)||(21356040-21356104)
chr6 (481-525)||(33211185-33211229)
chr6 (345-406)||(3577636-3577696)
chr6 (599-646)||(14466706-14466753)
chr6 (348-406)||(17036058-17036116)
chr6 (348-406)||(17694972-17695030)
chr6 (476-526)||(30443553-30443604)
chr6 (462-525)||(31936591-31936654)
chr6 (460-526)||(35201326-35201393)
chr6 (607-649)||(15541025-15541067)
chr6 (190-224)||(33308932-33308966)
chr6 (190-224)||(33311201-33311235)
chr6 (140-255)||(15366963-15367086)
chr6 (607-663)||(22491002-22491059)
chr6 (462-519)||(24436001-24436058)
chr6 (607-663)||(32280386-32280443)
chr6 (481-525)||(603088-603132)
chr6 (591-646)||(3233605-3233661)
chr6 (329-365)||(11138423-11138459)
chr6 (348-406)||(13467585-13467642)
chr6 (481-525)||(16569146-16569190)
chr6 (190-234)||(18318004-18318048)
chr6 (591-663)||(25480254-25480326)
[»] chr3 (264 HSPs)
chr3 (3-526)||(5191389-5191911)
chr3 (3-526)||(22114302-22114826)
chr3 (3-526)||(18099167-18099691)
chr3 (89-526)||(3859350-3859787)
chr3 (46-526)||(10956024-10956505)
chr3 (20-526)||(5522624-5523119)
chr3 (20-526)||(11170178-11170664)
chr3 (80-526)||(10958320-10958767)
chr3 (20-526)||(26720301-26720807)
chr3 (20-525)||(32264035-32264547)
chr3 (110-526)||(10084386-10084807)
chr3 (80-526)||(45882752-45883200)
chr3 (3-523)||(18096900-18097406)
chr3 (110-526)||(10191307-10191727)
chr3 (167-526)||(38889939-38890300)
chr3 (190-526)||(4308278-4308615)
chr3 (190-526)||(4103893-4104233)
chr3 (110-526)||(6065793-6066210)
chr3 (190-526)||(43228214-43228551)
chr3 (190-526)||(43226009-43226345)
chr3 (190-526)||(51727004-51727340)
chr3 (112-526)||(24979552-24979968)
chr3 (167-526)||(6063443-6063805)
chr3 (167-526)||(50493899-50494259)
chr3 (111-526)||(18162508-18162923)
chr3 (231-526)||(25533406-25533702)
chr3 (111-426)||(35777266-35777581)
chr3 (190-526)||(1313333-1313669)
chr3 (190-526)||(746674-747017)
chr3 (231-526)||(9604604-9604899)
chr3 (231-526)||(42990268-42990564)
chr3 (243-526)||(25388882-25389165)
chr3 (190-526)||(458203-458544)
chr3 (112-526)||(48361668-48362082)
chr3 (190-526)||(455826-456167)
chr3 (231-526)||(30005805-30006101)
chr3 (191-526)||(43423460-43423796)
chr3 (190-526)||(53917661-53917998)
chr3 (231-526)||(10621527-10621823)
chr3 (152-526)||(12267972-12268338)
chr3 (167-526)||(38210268-38210630)
chr3 (191-526)||(1626680-1627016)
chr3 (190-526)||(27101178-27101519)
chr3 (154-526)||(15780747-15781139)
chr3 (192-526)||(43421412-43421747)
chr3 (271-526)||(1321483-1321739)
chr3 (191-526)||(3314608-3314945)
chr3 (190-526)||(51943294-51943630)
chr3 (190-526)||(53915493-53915830)
chr3 (191-526)||(28101999-28102335)
chr3 (20-336)||(11162924-11163219)
chr3 (191-526)||(5926761-5927097)
chr3 (257-526)||(28413029-28413299)
chr3 (191-526)||(880448-880785)
chr3 (201-482)||(6561744-6562028)
chr3 (190-523)||(35917944-35918283)
chr3 (289-526)||(7606585-7606822)
chr3 (113-526)||(32218941-32219345)
chr3 (191-526)||(36011751-36012087)
chr3 (231-526)||(47148892-47149188)
chr3 (231-487)||(29956650-29956907)
chr3 (191-526)||(53468450-53468788)
chr3 (140-526)||(28761424-28761813)
chr3 (20-267)||(1321194-1321441)
chr3 (192-526)||(51674763-51675087)
chr3 (190-526)||(39715393-39715725)
chr3 (190-526)||(42992205-42992530)
chr3 (191-517)||(889779-890104)
chr3 (191-526)||(54691571-54691906)
chr3 (191-422)||(28100143-28100374)
chr3 (190-526)||(23633383-23633713)
chr3 (343-526)||(5886274-5886458)
chr3 (343-526)||(5899747-5899931)
chr3 (318-522)||(25688161-25688367)
chr3 (280-526)||(6484372-6484620)
chr3 (20-366)||(24177032-24177374)
chr3 (191-525)||(53591119-53591442)
chr3 (342-526)||(11168175-11168361)
chr3 (191-422)||(28180948-28181177)
chr3 (191-499)||(31151271-31151577)
chr3 (3-186)||(6063808-6063990)
chr3 (230-526)||(4666488-4666774)
chr3 (190-519)||(13420189-13420506)
chr3 (191-468)||(54884081-54884357)
chr3 (4-186)||(5899476-5899657)
chr3 (190-519)||(53597164-53597491)
chr3 (192-443)||(23636952-23637199)
chr3 (191-415)||(28137415-28137628)
chr3 (238-526)||(561771-562058)
chr3 (315-526)||(6231849-6232060)
chr3 (3-116)||(10192401-10192513)
chr3 (274-526)||(17795269-17795519)
chr3 (274-526)||(19103709-19103959)
chr3 (390-526)||(27635655-27635792)
chr3 (192-321)||(27635830-27635959)
chr3 (239-519)||(36871304-36871583)
chr3 (232-360)||(41849117-41849244)
chr3 (191-321)||(47701798-47701928)
chr3 (394-526)||(47701668-47701801)
chr3 (42-186)||(5886039-5886182)
chr3 (274-526)||(25635391-25635642)
chr3 (3-134)||(38210083-38210214)
chr3 (3-134)||(50493692-50493823)
chr3 (44-186)||(25388654-25388795)
chr3 (3-116)||(10085481-10085593)
chr3 (3-128)||(53896613-53896738)
chr3 (192-320)||(6231374-6231502)
chr3 (15-104)||(38889786-38889875)
chr3 (591-663)||(43228613-43228685)
chr3 (192-308)||(3306724-3306840)
chr3 (591-663)||(5191977-5192049)
chr3 (591-663)||(10955886-10955958)
chr3 (591-663)||(10958182-10958254)
chr3 (450-526)||(41849243-41849319)
chr3 (3-104)||(35777179-35777280)
chr3 (346-526)||(3306839-3307020)
chr3 (591-663)||(10084248-10084320)
chr3 (591-663)||(10191171-10191243)
chr3 (591-663)||(25533751-25533822)
chr3 (591-663)||(43226404-43226475)
chr3 (591-663)||(53893913-53893985)
chr3 (591-663)||(11168427-11168500)
chr3 (388-526)||(24181501-24181642)
chr3 (591-655)||(25389233-25389297)
chr3 (599-663)||(41849387-41849451)
chr3 (591-663)||(50494325-50494397)
chr3 (459-526)||(35919112-35919179)
chr3 (591-660)||(7606465-7606535)
chr3 (591-663)||(1321805-1321878)
chr3 (190-435)||(1673898-1674140)
chr3 (591-663)||(27635518-27635591)
chr3 (591-663)||(38890366-38890439)
chr3 (599-663)||(456242-456306)
chr3 (599-663)||(458619-458683)
chr3 (591-662)||(1313728-1313800)
chr3 (591-663)||(4308143-4308215)
chr3 (591-663)||(27101043-27101115)
chr3 (459-526)||(53894054-53894121)
chr3 (591-663)||(32219408-32219482)
chr3 (167-245)||(53896475-53896553)
chr3 (599-663)||(747092-747157)
chr3 (345-499)||(1620485-1620642)
chr3 (190-287)||(4560502-4560599)
chr3 (594-663)||(5886528-5886596)
chr3 (594-663)||(5900001-5900069)
chr3 (591-663)||(36012150-36012223)
chr3 (591-663)||(43421280-43421353)
chr3 (591-663)||(45883264-45883337)
chr3 (591-663)||(53917526-53917599)
chr3 (591-663)||(9604467-9604539)
chr3 (591-661)||(1626548-1626619)
chr3 (591-649)||(3315006-3315065)
chr3 (596-663)||(31151667-31151734)
chr3 (591-646)||(43423346-43423401)
chr3 (3-104)||(6719532-6719635)
chr3 (591-663)||(18099030-18099104)
chr3 (410-526)||(25634030-25634148)
chr3 (596-646)||(26720878-26720928)
chr3 (591-649)||(51943694-51943752)
chr3 (345-499)||(5858546-5858699)
chr3 (599-663)||(6065653-6065718)
chr3 (591-655)||(11170696-11170761)
chr3 (599-663)||(22114162-22114227)
chr3 (591-663)||(28181325-28181397)
chr3 (591-663)||(32263901-32263974)
chr3 (599-663)||(42990633-42990698)
chr3 (591-663)||(51726866-51726938)
chr3 (167-239)||(6719396-6719468)
chr3 (591-661)||(24980032-24980104)
chr3 (348-499)||(29913982-29914132)
chr3 (591-663)||(38210697-38210769)
chr3 (594-649)||(880331-880386)
chr3 (591-662)||(3859837-3859908)
chr3 (601-663)||(5522485-5522548)
chr3 (45-104)||(6066195-6066254)
chr3 (111-186)||(6719471-6719546)
chr3 (3-70)||(7606880-7606947)
chr3 (599-663)||(10621386-10621452)
chr3 (246-495)||(13419864-13420110)
chr3 (591-649)||(18096775-18096834)
chr3 (591-646)||(53591504-53591559)
chr3 (607-661)||(28412892-28412946)
chr3 (591-663)||(53915358-53915431)
chr3 (461-525)||(1736324-1736388)
chr3 (345-499)||(10094102-10094256)
chr3 (461-525)||(18552902-18552966)
chr3 (596-663)||(28761307-28761375)
chr3 (461-525)||(30709809-30709873)
chr3 (596-663)||(42992712-42992780)
chr3 (591-655)||(54691445-54691509)
chr3 (591-646)||(12267857-12267912)
chr3 (329-461)||(14634504-14634638)
chr3 (596-663)||(23633775-23633842)
chr3 (591-663)||(6484679-6484753)
chr3 (311-407)||(4560401-4560497)
chr3 (591-662)||(25688021-25688094)
chr3 (614-655)||(36957651-36957692)
chr3 (461-525)||(8370505-8370569)
chr3 (481-525)||(9666466-9666510)
chr3 (345-499)||(10100119-10100273)
chr3 (345-499)||(10200982-10201136)
chr3 (161-221)||(13893287-13893347)
chr3 (594-661)||(15781203-15781271)
chr3 (591-646)||(18162986-18163042)
chr3 (461-525)||(21711227-21711291)
chr3 (461-525)||(27974971-27975035)
chr3 (461-525)||(27986465-27986529)
chr3 (591-627)||(48361568-48361604)
chr3 (462-525)||(1417510-1417573)
chr3 (348-499)||(10897008-10897160)
chr3 (610-649)||(28101883-28101922)
chr3 (348-526)||(47878170-47878350)
chr3 (591-661)||(53468318-53468389)
chr3 (348-499)||(54193229-54193381)
chr3 (178-224)||(5886196-5886242)
chr3 (345-406)||(16462203-16462264)
chr3 (345-406)||(22626105-22626166)
chr3 (345-406)||(47883003-47883064)
chr3 (167-224)||(5899660-5899717)
chr3 (610-663)||(6063303-6063356)
chr3 (190-255)||(6484308-6484373)
chr3 (607-648)||(36871185-36871225)
chr3 (142-219)||(46966940-46967017)
chr3 (591-628)||(47148794-47148831)
chr3 (461-522)||(48438221-48438282)
chr3 (596-648)||(561659-561710)
chr3 (591-662)||(5926630-5926702)
chr3 (591-627)||(6232120-6232156)
chr3 (345-499)||(6303310-6303464)
chr3 (345-499)||(10208028-10208182)
chr3 (461-525)||(16264354-16264418)
chr3 (481-525)||(16499153-16499197)
chr3 (167-219)||(25388798-25388850)
chr3 (607-663)||(25635713-25635769)
chr3 (461-525)||(32143325-32143389)
chr3 (461-525)||(33386685-33386749)
chr3 (481-525)||(40913417-40913461)
chr3 (481-525)||(44331669-44331713)
chr3 (591-627)||(47701574-47701610)
chr3 (594-649)||(880120-880175)
chr3 (591-646)||(4666835-4666890)
chr3 (348-406)||(10595155-10595213)
chr3 (462-525)||(37466295-37466358)
chr3 (596-646)||(17795581-17795631)
chr3 (596-646)||(19104021-19104071)
chr3 (190-263)||(1618916-1618992)
chr3 (80-129)||(4308676-4308725)
chr3 (274-366)||(25633930-25634018)
chr3 (476-525)||(25795785-25795834)
chr3 (472-525)||(26298992-26299045)
chr3 (329-366)||(31021304-31021341)
chr3 (611-663)||(51674629-51674682)
chr3 (596-663)||(4103755-4103822)
chr3 (481-525)||(23391909-23391953)
chr3 (461-525)||(27452962-27453026)
chr3 (481-525)||(29196386-29196430)
chr3 (481-525)||(30236249-30236293)
chr3 (485-525)||(32744436-32744476)
chr3 (461-525)||(36029097-36029161)
chr3 (481-525)||(39153361-39153405)
chr3 (481-525)||(40734622-40734666)
chr3 (481-521)||(40735507-40735547)
chr3 (473-525)||(47923937-47923989)
chr3 (481-525)||(51398938-51398982)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (28-526)||(2670-3168)
scaffold0250 (599-663)||(3243-3306)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (3-526)||(69291-69817)
scaffold0025 (3-342)||(73207-73528)
scaffold0025 (596-663)||(69152-69220)
scaffold0025 (305-354)||(73160-73208)
[»] chr7 (217 HSPs)
chr7 (3-526)||(3878338-3878867)
chr7 (15-526)||(27306229-27306740)
chr7 (20-526)||(35412-35919)
chr7 (24-526)||(25542317-25542818)
chr7 (20-526)||(44347-44854)
chr7 (111-526)||(1049295-1049710)
chr7 (3-526)||(40836742-40837245)
chr7 (20-526)||(31435045-31435553)
chr7 (190-526)||(38393935-38394276)
chr7 (193-526)||(7470021-7470359)
chr7 (167-526)||(31155910-31156271)
chr7 (191-526)||(44724533-44724869)
chr7 (231-526)||(1046924-1047219)
chr7 (193-526)||(7471979-7472317)
chr7 (190-526)||(48457602-48457943)
chr7 (190-526)||(3035670-3036014)
chr7 (201-526)||(20625998-20626328)
chr7 (201-526)||(20629889-20630219)
chr7 (201-526)||(20642308-20642638)
chr7 (190-526)||(40946277-40946618)
chr7 (190-526)||(20299407-20299750)
chr7 (231-526)||(1849975-1850271)
chr7 (190-526)||(18345490-18345831)
chr7 (191-526)||(11355212-11355548)
chr7 (111-426)||(26804448-26804761)
chr7 (190-526)||(13099473-13099812)
chr7 (231-526)||(7351651-7351947)
chr7 (190-526)||(42330996-42331335)
chr7 (190-513)||(7349285-7349615)
chr7 (190-522)||(20297311-20297648)
chr7 (231-526)||(28487547-28487843)
chr7 (190-522)||(43253520-43253860)
chr7 (191-526)||(20137108-20137444)
chr7 (192-526)||(21990106-21990440)
chr7 (190-526)||(443548-443886)
chr7 (191-526)||(4295933-4296271)
chr7 (191-516)||(21679981-21680307)
chr7 (191-526)||(21678020-21678356)
chr7 (190-526)||(28485515-28485855)
chr7 (20-356)||(18567396-18567731)
chr7 (192-522)||(37412128-37412462)
chr7 (191-526)||(24748548-24748885)
chr7 (224-526)||(21592142-21592445)
chr7 (190-470)||(11757177-11757464)
chr7 (191-522)||(9680768-9681106)
chr7 (191-468)||(25276095-25276374)
chr7 (191-526)||(39145985-39146322)
chr7 (191-506)||(27832651-27832969)
chr7 (191-526)||(42223110-42223448)
chr7 (212-513)||(24258438-24258744)
chr7 (192-526)||(9679009-9679349)
chr7 (315-526)||(38396713-38396924)
chr7 (175-468)||(22251602-22251893)
chr7 (310-526)||(7092212-7092428)
chr7 (190-485)||(22828672-22828969)
chr7 (344-526)||(2935374-2935558)
chr7 (140-492)||(7188445-7188796)
chr7 (201-515)||(24817362-24817674)
chr7 (316-522)||(7094463-7094670)
chr7 (344-526)||(9027193-9027376)
chr7 (344-526)||(22108173-22108356)
chr7 (344-526)||(40549933-40550116)
chr7 (190-492)||(20091580-20091877)
chr7 (344-526)||(1606486-1606669)
chr7 (344-526)||(22137184-22137367)
chr7 (344-526)||(40552211-40552394)
chr7 (266-526)||(24813496-24813755)
chr7 (83-382)||(22392319-22392606)
chr7 (3-134)||(1047356-1047487)
chr7 (3-173)||(9027502-9027671)
chr7 (3-134)||(2935086-2935217)
chr7 (3-173)||(22136894-22137063)
chr7 (3-173)||(40551921-40552090)
chr7 (3-173)||(22107883-22108052)
chr7 (3-173)||(40549643-40549812)
chr7 (391-526)||(22393876-22394013)
chr7 (388-526)||(26295598-26295738)
chr7 (591-663)||(11759483-11759555)
chr7 (591-663)||(20297718-20297790)
chr7 (591-663)||(20299816-20299888)
chr7 (591-663)||(48458009-48458081)
chr7 (192-526)||(24465503-24465827)
chr7 (591-663)||(35985-36057)
chr7 (591-663)||(7471841-7471913)
chr7 (591-663)||(28487909-28487981)
chr7 (591-663)||(38394342-38394414)
chr7 (591-663)||(43253377-43253449)
chr7 (591-663)||(44920-44992)
chr7 (591-663)||(1850337-1850409)
chr7 (591-663)||(3036080-3036152)
chr7 (591-663)||(40836604-40836676)
chr7 (237-298)||(38396316-38396377)
chr7 (201-286)||(7094662-7094751)
chr7 (599-663)||(9027054-9027118)
chr7 (591-663)||(25542884-25542956)
chr7 (591-663)||(28485921-28485993)
chr7 (591-663)||(38396995-38397067)
chr7 (591-655)||(40946686-40946750)
chr7 (596-663)||(20626394-20626461)
chr7 (596-663)||(20630285-20630352)
chr7 (596-663)||(20642704-20642771)
chr7 (591-661)||(18345897-18345967)
chr7 (3-104)||(26804361-26804462)
chr7 (388-499)||(6046644-6046757)
chr7 (193-286)||(7092414-7092512)
chr7 (591-663)||(1606735-1606807)
chr7 (591-663)||(2935625-2935697)
chr7 (599-662)||(1049151-1049216)
chr7 (345-526)||(6332326-6332512)
chr7 (591-649)||(42330881-42330939)
chr7 (610-663)||(1046778-1046831)
chr7 (591-655)||(3878934-3878999)
chr7 (591-663)||(27306096-27306169)
chr7 (385-460)||(6348930-6349006)
chr7 (599-663)||(7351512-7351576)
chr7 (591-663)||(7469884-7469955)
chr7 (596-663)||(22137439-22137507)
chr7 (591-662)||(37411988-37412060)
chr7 (596-663)||(40552466-40552534)
chr7 (594-661)||(44724932-44725000)
chr7 (345-499)||(25351353-25351506)
chr7 (20-101)||(1049699-1049780)
chr7 (596-661)||(24748946-24749012)
chr7 (190-239)||(1606423-1606472)
chr7 (247-460)||(6048885-6049094)
chr7 (591-663)||(7092073-7092146)
chr7 (473-526)||(11759364-11759417)
chr7 (591-663)||(13099337-13099410)
chr7 (591-663)||(26804862-26804935)
chr7 (591-662)||(443949-444021)
chr7 (615-663)||(1502835-1502883)
chr7 (592-663)||(4295801-4295873)
chr7 (596-648)||(7188890-7188942)
chr7 (599-663)||(7349138-7349202)
chr7 (591-661)||(9679410-9679482)
chr7 (596-663)||(40550189-40550257)
chr7 (591-649)||(21990501-21990560)
chr7 (591-661)||(22251452-22251523)
chr7 (345-499)||(2120899-2121054)
chr7 (247-526)||(11081522-11081801)
chr7 (591-649)||(21678413-21678471)
chr7 (591-663)||(7094320-7094393)
chr7 (591-663)||(31434913-31434986)
chr7 (345-499)||(3320078-3320232)
chr7 (345-499)||(3324826-3324980)
chr7 (190-234)||(22108114-22108158)
chr7 (190-234)||(22137125-22137169)
chr7 (345-499)||(25405393-25405547)
chr7 (190-234)||(40549874-40549918)
chr7 (190-234)||(40552152-40552196)
chr7 (462-525)||(9190038-9190101)
chr7 (462-525)||(20284093-20284156)
chr7 (591-661)||(21680379-21680450)
chr7 (345-499)||(25357047-25357200)
chr7 (74-217)||(42006404-42006545)
chr7 (591-661)||(42223507-42223578)
chr7 (591-649)||(21592024-21592081)
chr7 (596-646)||(24465887-24465937)
chr7 (345-499)||(25410130-25410285)
chr7 (591-649)||(39145866-39145924)
chr7 (345-405)||(16297146-16297207)
chr7 (596-649)||(27832523-27832576)
chr7 (461-525)||(4796696-4796760)
chr7 (345-499)||(7069780-7069934)
chr7 (345-499)||(7074787-7074941)
chr7 (190-234)||(9027396-9027440)
chr7 (591-646)||(11355610-11355666)
chr7 (461-525)||(21983288-21983352)
chr7 (599-663)||(26295801-26295865)
chr7 (461-525)||(46516339-46516403)
chr7 (462-525)||(2580394-2580457)
chr7 (190-233)||(2935306-2935349)
chr7 (192-259)||(3677235-3677301)
chr7 (462-525)||(9185195-9185258)
chr7 (417-526)||(13290472-13290583)
chr7 (596-650)||(22108429-22108484)
chr7 (142-217)||(45366451-45366526)
chr7 (596-662)||(6349149-6349215)
chr7 (345-406)||(42006663-42006724)
chr7 (190-297)||(30906280-30906386)
chr7 (190-234)||(1849918-1849962)
chr7 (461-525)||(2647725-2647789)
chr7 (591-661)||(9681171-9681243)
chr7 (596-640)||(22394075-22394119)
chr7 (191-406)||(26210500-26210710)
chr7 (481-525)||(27347941-27347985)
chr7 (461-525)||(29159807-29159871)
chr7 (481-525)||(41317434-41317478)
chr7 (201-322)||(6348782-6348903)
chr7 (462-525)||(28617255-28617318)
chr7 (348-406)||(30246973-30247031)
chr7 (462-525)||(33332480-33332543)
chr7 (348-406)||(44512646-44512704)
chr7 (345-406)||(8378625-8378686)
chr7 (345-406)||(15541116-15541177)
chr7 (345-382)||(21369642-21369680)
chr7 (488-526)||(26804762-26804800)
chr7 (461-522)||(55955-56015)
chr7 (596-648)||(20091041-20091094)
chr7 (472-525)||(35960820-35960873)
chr7 (342-437)||(40281466-40281563)
chr7 (80-129)||(40946167-40946216)
chr7 (481-525)||(8153466-8153510)
chr7 (481-525)||(12097867-12097911)
chr7 (481-525)||(14069833-14069877)
chr7 (481-525)||(14379861-14379905)
chr7 (481-525)||(18126768-18126812)
chr7 (610-646)||(20137030-20137066)
chr7 (612-648)||(24813383-24813419)
chr7 (612-663)||(25276497-25276546)
chr7 (481-525)||(30814560-30814604)
chr7 (481-525)||(31732969-31733013)
chr7 (481-525)||(41649011-41649055)
chr7 (481-525)||(43864368-43864412)
chr7 (348-395)||(44143997-44144045)
chr7 (461-525)||(44848713-44848777)
chr7 (481-525)||(48489555-48489599)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (20-526)||(14801-15308)
scaffold0131 (203-526)||(14381-14707)
scaffold0131 (591-663)||(14250-14322)
[»] scaffold0068 (3 HSPs)
scaffold0068 (78-526)||(29001-29459)
scaffold0068 (591-663)||(29525-29597)
scaffold0068 (3-51)||(28957-29005)
[»] scaffold0472 (2 HSPs)
scaffold0472 (3-526)||(5943-6488)
scaffold0472 (596-663)||(6558-6626)
[»] scaffold0339 (2 HSPs)
scaffold0339 (113-526)||(3872-4284)
scaffold0339 (591-649)||(4344-4402)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (190-526)||(41482-41819)
scaffold0038 (591-663)||(41344-41416)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (193-526)||(79140-79474)
scaffold0031 (591-663)||(79537-79611)
[»] scaffold0005 (6 HSPs)
scaffold0005 (190-526)||(183640-183975)
scaffold0005 (190-526)||(51961-52302)
scaffold0005 (591-663)||(183502-183574)
scaffold0005 (591-663)||(50364-50437)
scaffold0005 (591-663)||(52363-52436)
scaffold0005 (480-526)||(50257-50303)
[»] scaffold0154 (2 HSPs)
scaffold0154 (190-526)||(11472-11809)
scaffold0154 (591-663)||(11335-11409)
[»] scaffold0267 (2 HSPs)
scaffold0267 (231-526)||(34-330)
scaffold0267 (591-663)||(380-453)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (190-489)||(1988-2293)
[»] scaffold0370 (2 HSPs)
scaffold0370 (305-526)||(1452-1673)
scaffold0370 (591-663)||(1313-1385)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (191-526)||(79812-80148)
scaffold0004 (345-406)||(188363-188424)
scaffold0004 (591-661)||(80211-80283)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (191-506)||(85184-85500)
scaffold0045 (591-663)||(85579-85653)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (140-526)||(15819-16205)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (191-418)||(35593-35819)
scaffold0011 (591-649)||(35945-36004)
scaffold0011 (460-526)||(35817-35883)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (192-526)||(16648-16981)
scaffold0057 (596-648)||(16536-16587)
[»] scaffold0140 (9 HSPs)
scaffold0140 (344-526)||(22221-22404)
scaffold0140 (344-526)||(24496-24679)
scaffold0140 (3-173)||(21931-22100)
scaffold0140 (3-173)||(24206-24375)
scaffold0140 (596-663)||(24751-24819)
scaffold0140 (610-663)||(22491-22544)
scaffold0140 (461-525)||(8448-8512)
scaffold0140 (190-234)||(22162-22206)
scaffold0140 (190-234)||(24437-24481)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (201-526)||(1640-1957)
scaffold0468 (596-663)||(1512-1578)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (190-303)||(1054-1167)
[»] scaffold0127 (2 HSPs)
scaffold0127 (3-134)||(12907-13038)
scaffold0127 (599-660)||(12738-12799)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (201-519)||(4777-5095)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (591-663)||(1312-1384)
scaffold1674 (491-526)||(1450-1485)
[»] scaffold0891 (2 HSPs)
scaffold0891 (472-526)||(4678-4732)
scaffold0891 (591-663)||(4538-4610)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (622-663)||(1-42)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (473-525)||(5687-5739)
scaffold0006 (345-406)||(224819-224880)
scaffold0006 (461-525)||(2496-2560)
scaffold0006 (481-525)||(149097-149141)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (348-499)||(16328-16480)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (416-499)||(57454-57539)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (461-525)||(43990-44054)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (481-525)||(20415-20459)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (460-499)||(3097-3136)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (460-499)||(17013-17052)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (462-522)||(10736-10796)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (461-525)||(45257-45321)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 162)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 27104531 - 27105053
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104531 aaatcagatttctgcagaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 27104630  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaa 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27104631 gggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacataaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataa 27104730  T
Q  203 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 302  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104731 atatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 27104830  T
Q  303 tcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaa 401  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27104831 tcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaa 27104928  T
Q  402 ttaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaa 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27104929 ttaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca 27105028  T
Q  502 atttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27105029 atttggaccgaactgggtcaacaaa 27105053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 19502534 - 19502010
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502534 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 19502435  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  19502434 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcgacgaataacagaaacatatttttggttgcagatttgatccaaattttaagggaaaattttactataa 19502335  T
Q  203 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19502334 atatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctct 19502235  T
Q  303 tcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaa 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19502234 tcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaa 19502136  T
Q  402 ttaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  19502135 ttaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtc 19502036  T
Q  501 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19502035 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 19502010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 19504868 - 19504345
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504868 aaatcaggtttcagcagaatcatggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttaattttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 19504769  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19504768 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcgacgaataacagaaacacatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataa 19504669  T
Q  203 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504668 atatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 19504569  T
Q  303 tcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaa 401  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19504568 tcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagaggctgggactttgggtagaa 19504471  T
Q  402 ttaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  19504470 ttaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtc 19504371  T
Q  501 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19504370 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 19504345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 42064264 - 42064771
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  42064264 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggtacgactggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatgggatcacatcgtggc 42064362  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42064363 acgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 42064462  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42064463 agagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 42064562  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42064563 ggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagactta 42064661  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactg 516  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42064662 ttcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactg 42064761  T
Q  517 ggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||    
T  42064762 ggtcaacaaa 42064771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 13910491 - 13910044
Alignment:
Q  79 gcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaa 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13910491 gcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcattgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaa 13910392  T
Q  179 ttttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 278  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910391 ttttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 13910292  T
Q  279 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacgga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  13910291 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcacctt-gggaaacaatattaggattgagtctcttggttacggg 13910193  T
Q  378 aagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggc 477  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13910192 aagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggc 13910093  T
Q  478 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13910092 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 13910044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 24162724 - 24162222
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatc 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162724 tgcagaatcgtggcacaatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatc 24162625  T
Q  114 gtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacctt 213  Q
    |||||||||| ||||| |||| || ||||  | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24162624 gtggcacgattgtgcgctggctgcgaatattagaaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 24162525  T
Q  214 gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaac 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24162524 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 24162425  T
Q  314 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 412  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||          |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24162424 actagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaagattgagtctcttggtt----------gctgggactttgggtagaattaggcgggag 24162336  T
Q  413 acttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccga 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24162335 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccccggactaggtcaatttggaccga 24162236  T
Q  513 actgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||||||||    
T  24162235 attgggtcaacaaa 24162222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21521201 - 21520692
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  21521201 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaagcaagccactggaaaaatcgtgccacgatgggatcgcaacgtggc 21521103  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21521102 acgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaaatttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatc 21521003  T
Q  219 aaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact 316  Q
    | |  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21521002 agactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacact 21520903  T
Q  317 agggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 415  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520902 agggtttgagggttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagact 21520804  T
Q  416 tattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaac 514  Q
     |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21520803 aattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 21520704  T
Q  515 tgggtcaacaaa 526  Q
    |  |||||||||    
T  21520703 tttgtcaacaaa 21520692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6259321 - 6258816
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  6259321 aatcgtggcacgatggctgtgcaacgtggcactattggatgtttcagtttt-gaggaaagtcactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcaacgtgac 6259223  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  6259222 acgatggtgcgctggcggtgaataacagaaacatatttttgggtgcagacttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatt 6259123  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | |  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  6259122 agactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactag 6259023  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   || | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6259022 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagactta 6258926  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaact 515  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6258925 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaact 6258827  T
Q  516 gggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||    
T  6258826 gggtcaacaaa 6258816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 40032553 - 40032052
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||    ||||||||||||||| |               
T  40032553 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gagacaagtcactggatttttcgtggcacgatgggat----------- 40032466  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40032465 acgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaagttttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 40032366  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40032365 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 40032266  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40032265 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagactta 40032167  T
Q  418 ttcttgtaaaccattga----tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 511  Q
    ||||||||| |||||||    |||||| |||| || ||||||||||| ||||||| | | |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40032166 ttcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccg 40032067  T
Q  512 aactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||    
T  40032066 aactgggtcaacaaa 40032052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 98 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22287764 - 22287335
Alignment:
Q  98 acgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttac 197  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22287764 acgatgggatcgtaacgtggcaccatggtgcgctggcagcgaataacaaaaatgtatgtttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttac 22287665  T
Q  198 tacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 297  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22287664 tataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctg 22287565  T
Q  298 tctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttggg 396  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||||| |||||  ||| |||| |||    
T  22287564 tctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcggg 22287466  T
Q  397 tagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 495  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||    
T  22287465 tagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccctagact 22287366  T
Q  496 aggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22287365 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22287335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 111 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 43623982 - 43623579
Alignment:
Q  111 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  43623982 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaaaatagac 43623884  T
Q  211 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaga 310  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  43623883 cttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc--------- 43623793  T
Q  311 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 409  Q
       |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43623792 ---actaggttttgagggttgattcaccttggg-aaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 43623697  T
Q  410 gagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 508  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43623696 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgga 43623597  T
Q  509 ccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  43623596 ccgaactaggtcaacaaa 43623579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 42452702 - 42453036
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42452702 acttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 42452801  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    | |||||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42452802 aaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 42452898  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  42452899 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-c 42452997  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42452998 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 42453036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 45280321 - 45279983
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag-gcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45280321 actttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 45280222  T
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| || | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  45280221 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttggg-atacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 45280123  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45280122 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 45280023  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45280022 ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 45279983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 111 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6264560 - 6264147
Alignment:
Q  111 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 210  Q
    ||||||||||||||||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  6264560 atcgtggcacgatggtgcattagcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatatttttactataaatatagac 6264461  T
Q  211 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaga 310  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  6264460 cttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtctctttggtaca 6264365  T
Q  311 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 409  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  || ||  || | |||||| ||||||||| |||    
T  6264364 aacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgg 6264266  T
Q  410 gagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgg 507  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6264265 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 6264166  T
Q  508 accgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6264165 accgaactgggtcaacaaa 6264147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 23452577 - 23452236
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452577 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 23452478  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23452477 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 23452379  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23452378 tgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 23452279  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23452278 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 23452236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007896
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||  || |     
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcacctt-gggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattgggg 19007758  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  19007759 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctccc 19007858  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19007859 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 19007896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 35215881 - 35215585
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  35215881 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35215782  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 428  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  35215781 gattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaact 35215683  T
Q  429 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  35215682 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 35215585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35217962
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 428  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  35218158 gattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacc 35218060  T
Q  429 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  35218059 cgttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 35217962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 42923847 - 42923508
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 287  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42923847 acttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgt 42923748  T
Q  288 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 386  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||    
T  42923747 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattg 42923649  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  42923648 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctct 42923549  T
Q  486 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42923548 cccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 42923508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22407915 - 22407592
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||| | | || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||||||    
T  22407915 aatcgtggcacgattgaagggtaacatggcacgattggatgtttcagtttt-gaggcaagtcagtgaaaaaattgtggcacgatgggatcacaacgtggc 22407817  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22407816 acgatggtgcgttggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttcaaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatc 22407717  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22407716 agagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 22407617  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggg 343  Q
    |||||| |||||||||| |||||||    
T  22407616 ggtttgagggttgattcaccttggg 22407592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196891
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||     
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagg 28196755  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||    
T  28196756 ctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctccc 28196855  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  28196856 ccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaa 28196891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739558
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | |||||  || ||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattggga 11739697  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||    
T  11739696 ctttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 11739597  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11739596 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 11739558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849373
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgaga 17849235  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||||    
T  17849236 ctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaac-gggggctgctctctcc 17849334  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | || ||||||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  17849335 cacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaa 17849373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 17848365 - 17848696
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||  | || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17848365 cttttactataaatataggctttgtatca--gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17848462  T
Q  291 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||    
T  17848463 gagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattc-actttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 17848561  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | || | |||||||||||    
T  17848562 gctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgt-aaccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcc 17848657  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17848658 cccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaa 17848696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 194 - 526
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022428
Alignment:
Q  194 ttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  294 tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactt 392  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||  ||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttt 3022284  T
Q  393 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca----------tatagtggatcagagggctgctc 482  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||||||          |||| || | |||| ||||||||    
T  3022285 taggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctc 3022384  T
Q  483 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3022385 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3022428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732775
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||            || ||    
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgtt-gggaaacactgttaggattgagtctcttggtt------------tggga 31732914  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| | | |||| |||||||||||    
T  31732913 ctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcc 31732814  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  31732813 cccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaa 31732775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34979904 - 34979576
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 300  Q
    |||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  34979904 aaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtct 34979805  T
Q  301 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 399  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |  |||||| |||||    
T  34979804 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtag 34979706  T
Q  400 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctct-ctcccccagacta 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| |  |||||| |||| | |||||| ||||    
T  34979705 aattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaacta 34979606  T
Q  497 ggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34979605 ggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa 34979576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837524
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtctttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |      || |||||  ||||||    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctct-----tgggaagagattgagac 14837386  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || || |||||||||||    
T  14837387 tttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctccc 14837486  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14837487 ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 14837524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289066
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || ||    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattggga 44289205  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||| ||||||||||| | || | |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||| | |||| || |||||| |||    
T  44289204 cttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcc 44289105  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44289104 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 44289066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 192 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539566
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagac 15539611  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15539610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 231 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239003
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | || ||||||||||||||| |||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggtt 45239173  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  45239172 gattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaaccc 45239074  T
Q  430 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239073 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggt 45239003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 321 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375345
Alignment:
Q  321 tttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 419  Q
    |||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttagg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttatt 5375453  T
Q  420 cttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactggg 518  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5375452 cttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 5375353  T
Q  519 tcaacaaa 526  Q
    ||||||||    
T  5375352 tcaacaaa 5375345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558863
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 36558863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561140
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 36561140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578136
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    || ||| |||||| | || ||  |||||||||   |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  || ||    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaa--actagggtt--ggggttgattcacc-tcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga 11578246  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||    
T  11578245 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcc 11578146  T
Q  488 cccagactag 497  Q
    ||||||||||    
T  11578145 cccagactag 11578136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 18800686 - 18800312
Alignment:
Q  142 aacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 241  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| | |||||| ||||    
T  18800686 aacagaaacatatttttaagtgcagatttgttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatataggg 18800587  T
Q  242 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||          || ||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  18800586 ggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttg 18800499  T
Q  342 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 440  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18800498 gg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctc 18800400  T
Q  441 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||| ||||||| ||| ||||||| | | ||||||| |||||| |||||||| |||| |  |||||||| |||||||| ||||||    
T  18800399 ttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctct-ccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaa 18800312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332180
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 45332180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163109
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct 366  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattagg-ttgagtct 22163109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 22874061 - 22874387
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||| ||| ||||| || | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||    
T  22874061 acttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtat 22874152  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||| ||||| | || |||||||| ||||   |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| || || |||| |||||  ||||    
T  22874153 agagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttgga-aaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgag 22874247  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||    
T  22874248 gctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctc 22874347  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22874348 cctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaa 22874387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 20146941 - 20146613
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| |     |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  20146941 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtat 20146843  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||| | ||| | || |||||||| |||| |  | ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||||    
T  20146842 agagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggg-aaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgag 20146747  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  20146746 attttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 20146647  T
Q  487 ccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggt 519  Q
    || ||||||| || | | ||||||||||||||||    
T  20146646 cctcagactaagtcagtattggaccgaactgggt 20146613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 388 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22407592 - 22407453
Alignment:
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  22407592 gacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 22407493  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22407492 ccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 22407453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 231 - 366
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020296
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct 366  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  38020262 gattcaccat-ggtaaacactattaggattgagtct 38020296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 397 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  397 tagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  496 aggt-aaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 17897578 - 17897244
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctga-aacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||  ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  17897578 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttgt 17897481  T
Q  288 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 386  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |  || ||  ||    
T  17897480 atagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattg 17897386  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctc 484  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||| || | || ||||||||||    
T  17897385 agattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctc 17897286  T
Q  485 tcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||    
T  17897285 t-ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaa 17897244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5377769 - 5377631
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5377769 actttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 5377670  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttg 324  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  5377669 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 36559342 - 36559173
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559342 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 36559243  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36559242 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 36559173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459200
Alignment:
Q  281 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaa 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggc-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 28459337  T
Q  380 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggc 477  Q
    |||  || | |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||    
T  28459336 gagtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggc 28459237  T
Q  478 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaact 515  Q
    | ||||||  || ||||||||| |||||||| ||||||    
T  28459236 ttctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaact 28459200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 499
Target Start/End: Original strand, 35107110 - 35107524
Alignment:
Q  81 actggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaatt 180  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||| |||  ||||||| ||   || |||||||||| | |||||||   |||| ||||||||||||||    
T  35107110 actggaaaaaacgtgtcacgatgggatcgtaacgtgtcacattggtgcgctgaaggcgaataacataatcgtatttttcaatgcagatttgttccaaatt 35107209  T
Q  181 ttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 279  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||| |||| | | || ||| |||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  35107210 ttaagggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtaga-gagtctaaaaccaagagtttag-aagtcaacaagaaaacta 35107307  T
Q  280 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | || ||||   ||||||   || ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  35107308 gggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaac---agggtt--gggattgattcacctt-gagaaacattattaggattgagtctcttggtcacggga 35107400  T
Q  379 agaggctgagactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagag 474  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||     | |||||||||||||| |||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||     
T  35107401 agagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgt-aacctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggat 35107499  T
Q  475 ggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || || |||||  ||||||||||||    
T  35107500 ggttgttctctttcccagactaggt 35107524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 37963263 - 37962940
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| |    
T  37963263 acttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtgt 37963172  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    | |||||| |||||   || |||||| | ||||   | |||||||| |||| |  ||||| ||||  |||||||||| ||||| ||   |||||  ||||    
T  37963171 atagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttaga-aaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgag 37963077  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||| | ||| || ||| ||||||     
T  37963076 gctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgatt--tttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctct 37962979  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  37962978 cccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaa 37962940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 36561661 - 36561539
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  |  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561661 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcacggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 36561562  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatgg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36561561 ggggtcgcatcgtggcacgatgg 36561539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 45279934 - 45279862
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45279934 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 45279862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707750
Alignment:
Q  407 cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc--tctcccccagactaggtaaat 503  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  504 ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||| ||||| ||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaa 22707750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 45332659 - 45332528
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45332659 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggaactggaaaaatcgtggaacgat 45332560  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45332559 ggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggc 45332528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 327 - 499
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699604
Alignment:
Q  327 ggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgt 424  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||  || |||||||||||||||||||   || |||||||| ||||    
T  40699429 ggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgt 40699527  T
Q  425 aaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || || ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40699528 aatcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggt 40699604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 441 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22163106 - 22163021
Alignment:
Q  441 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22163106 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa 22163021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 42453799 - 42453871
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42453799 aattgttccatacattttattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 42453871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 13909978 - 13909907
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtga 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13909978 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagttgttattggtgtga 13909907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 3022489 - 3022562
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3022489 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtttgttatttgtgtgat 3022562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 23452170 - 23452097
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23452170 aattgttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 23452097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 27105119 - 27105192
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27105119 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 27105192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 24162156 - 24162084
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24162156 aattgtttcatacacttttttttggttgcttgattatctctttctccacacatcaagttgttattggtgtgat 24162084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 35217902 - 35217830
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35217902 aattattccatacgctttgttttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 35217830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 36558813 - 36558741
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36558813 aattgttccatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttattattggtgtgat 36558741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 36561073 - 36561001
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36561073 aattgttccatacgctttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 36561001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 43624069 - 43623968
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43624069 aaatcaggtttctgcagaatcatggcacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggcactgaaaaaatcgtggcacga 43623971  T
Q  102 tgg 104  Q
    |||    
T  43623970 tgg 43623968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12342798 - 12342673
Alignment:
Q  138 aaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||    || |||||||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||||||||    
T  12342798 aaataacataatcatatttttggggtcagatttgttccaatttttttaggatacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatag 12342699  T
Q  238 agggggctgaaac-aagggtttagaa 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12342698 agggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 17849434 - 17849507
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17849434 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 17849507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 19007957 - 19008030
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19007957 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 19008030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 28459130 - 28459073
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28459130 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagt 28459073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 285
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||   | |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 499
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943690
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttgt 17943635  T
Q  446 aacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17943636 aaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggt 17943690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 19501930 - 19501862
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgtttt-ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19501930 ttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 19501862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 19504265 - 19504197
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgtttt-ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19504265 ttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 19504197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 655
Target Start/End: Original strand, 42064820 - 42064884
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttatt 655  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42064820 aattgttccatacactttgttttagttgcttgatcatcccttgctccacacatcaagttgttatt 42064884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 648
Target Start/End: Original strand, 14837585 - 14837642
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14837585 aattgttctatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagt 14837642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 406 - 526
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871072
Alignment:
Q  406 gcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatt 504  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  505 tggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| | |||| ||||||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaa 23871072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 42923445 - 42923373
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt-ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  42923445 aattgtttcatacactttgtttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 42923373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 22287274 - 22287203
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22287274 aattgttccatacactatgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 22287203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 5375283 - 5375225
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5375283 aattgttccatacactttgttttgattgcttgattatcccttactccacacatcaagtt 5375225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 6258755 - 6258697
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6258755 aattgttccagacactttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtt 6258697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 7462883 - 7462825
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7462883 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagtt 7462825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 460
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589881
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-t 441  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcat 460  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 605 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 35215511 - 35215453
Alignment:
Q  605 ctttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35215511 ctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 35215453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 38020397 - 38020470
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc-aagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  38020397 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccatacatcaaatttgttattggtgtgat 38020470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 45332112 - 45332040
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45332112 aattgttacaaacgctttgttttggttgcttaattatcccttgttccacacatcaagttgttattggtgtgat 45332040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 6264086 - 6264015
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6264086 aattgttccatacactttgttttggttgcctgatagtcacttgctccacacatcaagtttgttattagtgtg 6264015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 36561532 - 36561450
Alignment:
Q  90 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36561532 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 36561450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 22407392 - 22407346
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctcc 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22407392 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatctcttgctcc 22407346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 43623517 - 43623443
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt-gttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43623517 aattgttccatacactttaattttggttgcctgattatctattgctccacacatcaagttagttattggtgtgat 43623443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Original strand, 22874431 - 22874484
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22874431 ttccatacactttgttttagttgcttgactatcacttgctccacacatcaagtt 22874484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 28196952 - 28197025
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc-aagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  28196952 aattgtttcatacactttgttttggttgctggactatcccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgat 28197025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 460
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139564
Alignment:
Q  247 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 346  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | || |||||||||||||    | |||||||  |||||| ||    
T  43139356 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcatcttggg-aa 43139448  T
Q  347 acactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttg 444  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |   ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  43139449 acattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctctttg 43139548  T
Q  445 taacgttactcatcat 460  Q
    ||| ||||||||||||    
T  43139549 taaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736359
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2736300  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2736301 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 2736359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699100
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15539467 - 15539396
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtga 662  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15539467 aattgttcaatacactttgttttgattgcttgataatc-cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtga 15539396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 21520628 - 21520556
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21520628 aattgttccatacactttaattttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 21520556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 594 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22162959 - 22162907
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22162959 tgttccatacaatttgttttggttgcttgattatcccttgcttcacacatcaa 22162907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 314 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  314 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 412  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaa-agattgggacttttggtagaattaggcgggag 38414195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22707689 - 22707634
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  22707689 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattgttccttactccacacatcaa 22707634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 34979527 - 34979456
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34979527 aattgttccatacactttattttggttgctttattattccttactccacacatcaagtttgttattggtgtg 34979456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45332439 - 45332384
Alignment:
Q  179 ttttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45332439 ttttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 45332384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6264611 - 6264546
Alignment:
Q  39 ggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 104  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6264611 ggcaacgtggcatgattggatgtttcagtttt-gaggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatgg 6264546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136195
Alignment:
Q  281 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaa 379  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||| |  |||||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttgga-aaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaa 27136273  T
Q  380 gaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactc 455  Q
    ||   || ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  27136272 gaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 610 - 651
Target Start/End: Original strand, 17848775 - 17848816
Alignment:
Q  610 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgt 651  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17848775 ttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagttgt 17848816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 645
Target Start/End: Original strand, 20592395 - 20592444
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatca 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  20592395 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctctacacatca 20592444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390243
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569332
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  13569396 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462590
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  | |   | ||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcct---tatctctt 17462531  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17462532 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 17462590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522224
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36559111 - 36559067
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36559111 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36561388 - 36561344
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36561388 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36561344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687137
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 39687078  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39687079 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggt 39687137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 11578045 - 11577986
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttatt 655  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  11578045 ttccatatactttattttggttgcttgattattacttgttccacacatcaagtttttatt 11577986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517666
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 27517723  T
Q  446 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27517722 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggt 27517666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 36561553 - 36561518
Alignment:
Q  90 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561553 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgg 36561518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 38414337 - 38414281
Alignment:
Q  224 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38414337 aaaccttgagatagagggggctgaaac------ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38414281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 525
Target Start/End: Original strand, 1345572 - 1345634
Alignment:
Q  463 agtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  1345572 agtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1345634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054886
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28462651 - 28462593
Alignment:
Q  161 gtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28462651 gtgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtatca 28462593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 31732716 - 31732666
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  31732716 ttccatacactctgttttggttgcttgattataacttgcttcacacatcaa 31732666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680106
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 39680106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 11739514 - 11739441
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  11739514 aattgtttcatacactttgtttttatttcttgactatcccttgctctacacatcaagtttgttattggtgtgat 11739441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20147125 - 20147040
Alignment:
Q  150 catatttttgggtgcaaatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20147125 catatttttgggctcaaatttgttccaattttatgaggaatatttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 26345677 - 26345738
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct-gagactttgggtagaatta 404  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26345677 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 525
Target Start/End: Original strand, 34682362 - 34682427
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||    
T  34682362 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723744
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741095
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||    | |||| ||||||| ||  ||||    ||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggactt-gggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 2741036  T
Q  443 tgtaacgttactcat-cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2741037 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 2741095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8040128 - 8040064
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||    
T  8040128 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445537
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 28259206 - 28259270
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  28259206 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139770
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 426
Target Start/End: Original strand, 38020311 - 38020347
Alignment:
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38020311 ctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 38020347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285004
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 525
Target Start/End: Original strand, 2838076 - 2838123
Alignment:
Q  478 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  2838076 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 2838123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11151634 - 11151591
Alignment:
Q  482 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11151634 ctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 406
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  329 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct-gagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  | | |||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 33671033 - 33670994
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33671033 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 33670994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 221
Target Start/End: Original strand, 45156922 - 45157001
Alignment:
Q  142 aacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaa 221  Q
    ||||||||| ||||||| || |   |||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45156922 aacataaacgtatttttaggcgtggatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttatatcaaa 45157001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 499
Target Start/End: Original strand, 45679838 - 45679877
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45679838 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 45679877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 17897176 - 17897134
Alignment:
Q  604 actttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  17897176 actttgttttggttgcttgatta--ttttgctccacacatcaagt 17897134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050163
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct 385  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggct 20050163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 219
Target Start/End: Original strand, 35028440 - 35028527
Alignment:
Q  133 gcagcaaataacataaa--catatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||| || || | ||||||||||| |||| || || |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35028440 gcagcaaataaaataaaatcatattttaggttg-agatttgttccaattttttagggatacttttactataaatatagacattgtatca 35028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41304667 - 41304627
Alignment:
Q  247 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41304667 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgta 41304627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 11067429 - 11067473
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  11067429 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaacaa 11067473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14633869 - 14633825
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  14633869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 14633825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 15539556 - 15539528
Alignment:
Q  498 gtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539556 gtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 15539528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17865271 - 17865207
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| |  || ||| |||||||||||||||    
T  17865271 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaa 17865207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33118204 - 33118140
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||| | ||||||    
T  33118204 atagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaa 33118140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34388926 - 34388862
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  34388926 atagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 34388862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 36773686 - 36773730
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  36773686 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 38312364 - 38312408
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  38312364 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 38312408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 39482999 - 39482935
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  39482999 atagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39482935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 239
Target Start/End: Original strand, 40699178 - 40699278
Alignment:
Q  140 ataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 238  Q
    |||||| || ||||||||||||   | ||||||||||| ||| | || || |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||| |||    
T  40699178 ataacagaatcatatttttgggctgagatttgttccaattttctgagggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagaga 40699277  T
Q  239 g 239  Q
    |    
T  40699278 g 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 42039698 - 42039762
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| | |||||||    
T  42039698 atagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 42039762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 233)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 51015056 - 51015579
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51015056 aaatcagatttctgcagaatcgtggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaaaattgtggcacgat 51015155  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  51015156 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataa 51015255  T
Q  203 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 302  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51015256 atatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctct 51015355  T
Q  303 tcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaa 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  51015356 tcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaa 51015454  T
Q  402 ttaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaa 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  51015455 ttaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtca 51015554  T
Q  502 atttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  51015555 atttggaccgaactgggtcaacaaa 51015579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22044897 - 22044390
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt--gaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtgg 117  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22044897 aatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtgg 22044798  T
Q  118 cacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtat 217  Q
    |||||||||| | ||||||  || |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22044797 cacgatggtgtgctggcagggaaaaacagaaacatatttttag-tgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtat 22044699  T
Q  218 caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacacta 317  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22044698 cagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 22044599  T
Q  318 gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactt 416  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044598 gggtttgtgggttgattcccctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 22044500  T
Q  417 attcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22044499 atttttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactg 22044400  T
Q  517 ggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||    
T  22044399 ggtcaacaaa 22044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 37089898 - 37089371
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37089898 aaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatgagatgttttagttttttaggtgaggcactggaaaaatcgtggcacga 37089799  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37089798 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactata 37089699  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089698 aatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 37089599  T
Q  299 ctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggt 397  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37089598 ctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggt 37089500  T
Q  398 agaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactag 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37089499 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactag 37089400  T
Q  498 gtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37089399 gtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 37089371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31850101 - 31849598
Alignment:
Q  24 gtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacga 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31850101 gtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgg-ggcaaggcactggaaaaatcttggcacgatggggtcgcatcgtggcacga 31850003  T
Q  123 tggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaag 222  Q
    ||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  31850002 tggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactagaaatataggtcttgtatcagag 31849903  T
Q  223 caaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact-agggt 321  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  31849902 caaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggtt 31849803  T
Q  322 ttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 420  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31849802 ttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattc 31849704  T
Q  421 ttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtc 520  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31849703 ttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtc 31849604  T
Q  521 aacaaa 526  Q
    ||||||    
T  31849603 aacaaa 31849598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 38409009 - 38409538
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38409009 aaattagatttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacga 38409107  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  38409108 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcggcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactata 38409207  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409208 aatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 38409307  T
Q  296 tgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttg 394  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38409308 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttg 38409406  T
Q  395 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagac 494  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  38409407 ggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatac 38409506  T
Q  495 taggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38409507 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 38409538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11006756 - 11006236
Alignment:
Q  11 tttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgc 110  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006756 tttatgcagaatcgtggcacgatcgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcaattttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgc 11006657  T
Q  111 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  11006656 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagac 11006557  T
Q  211 cttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcg 305  Q
    ||||||||| | | |  ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006556 cttgtatcaga-ctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcg 11006458  T
Q  306 gaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatt 403  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11006457 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt 11006359  T
Q  404 aggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat 503  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11006358 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 11006259  T
Q  504 ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  11006258 ttggaccgaactaggttaacaaa 11006236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 24888606 - 24889130
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24888606 aaatcagatttctgcagaattgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacga 24888704  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  24888705 tgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactata 24888804  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24888805 aatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctc 24888904  T
Q  302 ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtaga 400  Q
    || |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  24888905 tttggaacaaacactaggctttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtaga 24889003  T
Q  401 attaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24889004 attaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggt 24889103  T
Q  500 aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  24889104 caatttggaccgaactgggtcaacaaa 24889130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22803239 - 22802733
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22803239 aatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggaaaggcactggaaaaatcgtggctcgatggggtcgcatcgtggc 22803141  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22803140 acgatggtgcgctggcagcgaataacaaaaacgtatttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 22803042  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  22803041 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattag 22802942  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802941 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 22802843  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  22802842 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaacta 22802743  T
Q  517 ggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||    
T  22802742 ggtcaacaaa 22802733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9174657 - 9174145
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcg 114  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9174657 tgcagaatcgtggcacgacggctaggcaacgtagcacgatggaggttttagtttattaggcaaggcactggaaaaatcatggcacgatggggtctcatcg 9174558  T
Q  115 tggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  9174557 tggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagtttttaagcaagacttttactataaatatagaccttg 9174458  T
Q  215 tatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaaca 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  9174457 tatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaaca 9174358  T
Q  315 ctagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 412  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9174357 ctagggttcgtgagttgattcacctt-gggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggag 9174259  T
Q  413 acttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccga 512  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9174258 acttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccga 9174159  T
Q  513 actgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||    
T  9174158 actgggtcaacaaa 9174145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22047135 - 22046685
Alignment:
Q  74 gcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  || |||| |||||||||||| | |||| |||||||    
T  22047135 gcaaggcactggaaaaatc-tggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagggaaaaacagaaacatatttttag-tgcagatttgtt 22047038  T
Q  174 ccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaca 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047037 ccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaca 22046938  T
Q  274 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22046937 aaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtt 22046839  T
Q  373 acggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcag 472  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22046838 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcgg 22046739  T
Q  473 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22046738 agggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22046685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 36920098 - 36919583
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36920098 tgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaatttt-gaggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatc 36920000  T
Q  114 gtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacctt 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36919999 gtggcacgatggtgcgctggcagcgaatagtagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 36919900  T
Q  214 gtatcaaagcaaactttg--agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aaga 310  Q
    |||||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || || |    
T  36919899 gtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaaca 36919800  T
Q  311 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 409  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36919799 aacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgg 36919701  T
Q  410 gagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 508  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36919700 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 36919601  T
Q  509 ccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36919600 ccgaactgggtcaacaaa 36919583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 11434785 - 11435288
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||             
T  11434785 aaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaagacactggaaaaatc--------- 11434875  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
                |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11434876 ------------gtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactata 11434963  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434964 aatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 11435063  T
Q  302 ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtaga 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||  |||||||||||||    
T  11435064 ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtaga 11435162  T
Q  401 attaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggta 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  11435163 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtc 11435262  T
Q  501 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11435263 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 11435288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 36922006 - 36921492
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatc 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36922006 tgcaaaatcgtggtacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatt 36921908  T
Q  114 gtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacctt 213  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  36921907 gtggcacgatggtgcattggcagcgaataacagaaacgtatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagacctt 36921808  T
Q  214 gtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aaga 310  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |    
T  36921807 gtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaaca 36921709  T
Q  311 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 409  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36921708 aacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 36921610  T
Q  410 gagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 508  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36921609 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttgga 36921510  T
Q  509 ccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36921509 ccgaactgggtcaacaaa 36921492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 39 - 526
Target Start/End: Original strand, 5198266 - 5198754
Alignment:
Q  39 ggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagc 137  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5198266 ggcaacgtggcacgattggagatttcaagttt-gaggcaaagctctggaaaaatcgtggcacgatgggatcacatcgtggcacgatggtgcgctggcagc 5198364  T
Q  138 aaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag 237  Q
     || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5198365 gaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatag 5198464  T
Q  238 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||      
T  5198465 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattc-a 5198563  T
Q  338 cttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatt 436  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5198564 ctttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 5198663  T
Q  437 tctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5198664 tctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaa 5198754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 9148087 - 9148586
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9148087 aatcgtggtacgattgctgggcaacgtggcgcgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatggggttgcatcgtggc 9148185  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    |||||||        |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9148186 acgatgg--------cagcaaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatc 9148276  T
Q  219 aaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact 316  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9148277 agagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacact 9148376  T
Q  317 agggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 415  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9148377 agggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagact 9148475  T
Q  416 tattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaact 515  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  9148476 tattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 9148575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 48486146 - 48486653
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||||||||||||| ||  |||||    
T  48486146 aatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatggggtcacaatgtggc 48486244  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48486245 acaatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 48486344  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  48486345 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactag 48486444  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486445 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactta 48486543  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  48486544 ttcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactg 48486643  T
Q  517 ggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||    
T  48486644 ggtcaacaaa 48486653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 18 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 40091923 - 40091414
Alignment:
Q  18 ataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtg 116  Q
    |||||||||||||| |||   || ||||||||||||| |||| |||||||||| || | ||| || ||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  40091923 ataatcgtggcacggtggttgggtaacgtggcacgattggagatttcagtttt-gaagtaagccattggaaaaatcgtgccatgatggggtcgcaacgtg 40091825  T
Q  117 gcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgta 216  Q
     |||||||||||  || |||| |||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40091824 acacgatggtgcactgacagcgaataacgtaaacgtatttttcagtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgta 40091725  T
Q  217 tcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40091724 tcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacact 40091625  T
Q  317 agggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 415  Q
    | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091624 atggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagact 40091526  T
Q  416 tattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaac 514  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40091525 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaac 40091426  T
Q  515 tgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||    
T  40091425 tgggtcaacaaa 40091414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9177019 - 9176473
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9177019 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggttaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 9176920  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtg----------------------caaatttgttccaaatt 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||||||||||||||||                      || ||||||| ||  ||    
T  9176919 ggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttataaatttaaagcagatttgttacagttt 9176820  T
Q  181 ttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 280  Q
    |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9176819 ttaagcaagacatttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 9176720  T
Q  281 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaa 378  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  9176719 ggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacggga 9176621  T
Q  379 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggct 478  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  9176620 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggct 9176521  T
Q  479 gctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  9176520 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaa 9176473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 111 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22801276 - 22800861
Alignment:
Q  111 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 210  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22801276 atcgtggcacgatggtgcgccggcagcaaataacagaaacgtatttt-gagtgcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 22801178  T
Q  211 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaga 310  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22801177 cttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaaca 22801078  T
Q  311 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 409  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801077 aacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 22800979  T
Q  410 gagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 508  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22800978 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 22800879  T
Q  509 ccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22800878 ccgaactgggtcaacaaa 22800861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 41 - 526
Target Start/End: Original strand, 24880299 - 24880786
Alignment:
Q  41 caacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaa 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  24880299 caacgtggcacgaatggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgcggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcga 24880397  T
Q  140 ataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 239  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  24880398 ataacagaaacgtatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagag 24880497  T
Q  240 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcct 339  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  24880498 ggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcacct 24880597  T
Q  340 tggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttc 438  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  24880598 t-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 24880696  T
Q  439 tc-tttgt-aacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24880697 tcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 24880786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 3 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5637990 - 5637524
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5637990 aaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-gaggcaaggcactggaaaaatcatgtcacgat 5637892  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaa 202  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5637891 gggatcgcatcgtggcatgatggtgagctggcagcgaaaaacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataa 5637793  T
Q  203 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 298  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637792 atatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 5637693  T
Q  299 ctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggt 397  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5637692 ctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 5637594  T
Q  398 agaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtg 466  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5637593 agaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 40 - 526
Target Start/End: Original strand, 24878836 - 24879324
Alignment:
Q  40 gcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagca 138  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||| |     
T  24878836 gcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gacgcaagtcactggatttttcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggtacgctggcatcg 24878934  T
Q  139 aataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 238  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  24878935 aataacagaaacgtatttttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagataga 24879034  T
Q  239 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 338  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  24879035 gggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcacc 24879134  T
Q  339 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 437  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24879135 tt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 24879233  T
Q  438 ctc-tttgt-aacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||| |||| ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24879234 ctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 24879324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 7941149 - 7941657
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||          
T  7941149 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatggtg------ 7941242  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
                   ||||||||||||| |||   | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7941243 ---------------gcacgatggtgcgctggtgacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactata 7941327  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 299  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941328 aatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 7941427  T
Q  300 tcttcggaagaaa--cactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttggg 396  Q
    ||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  7941428 tcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttggg 7941526  T
Q  397 tagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7941527 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagact 7941626  T
Q  496 aggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7941627 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 7941657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Original strand, 18846953 - 18847486
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatc 113  Q
    |||| |||||||||||||| |   || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18846953 tgcagaatcgtggcacgattgttgggaatcgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactggaaaaatcgtggtacgatggggtcgcatc 18847051  T
Q  114 gtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattt----------------------taagcgaaac 191  Q
    |||||||||||||||| | || |  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||                      ||||| | ||    
T  18847052 gtggcacgatggtgcgctcgcggggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacaaatttaaagcagatttgttacagattttaagcaagac 18847151  T
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847152 ttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 18847251  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  18847252 agtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattggga 18847350  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  18847351 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccc 18847449  T
Q  490 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18847450 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 18847486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 3 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3825096 - 3824627
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  3825096 aaatcaggtttctgcagaatcgtgacacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaagcactggaaaaatcatggcacaa 3824998  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  3824997 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcgacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactata 3824898  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaa-ctttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 296  Q
    |||||||||||||||||| || |   ||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824897 aatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 3824800  T
Q  297 gtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgg 395  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3824799 gtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgg 3824701  T
Q  396 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824700 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 113 - 526
Target Start/End: Original strand, 47274647 - 47275059
Alignment:
Q  113 cgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  47274647 cgtggcacgatggtgcgatggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagacct 47274746  T
Q  213 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaa 312  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||    
T  47274747 tgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaa 47274845  T
Q  313 cactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47274846 cactagggtttgagggttgattcatctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcggga 47274944  T
Q  412 gacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggacc 510  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  47274945 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggacc 47275043  T
Q  511 gaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| |||||||||||    
T  47275044 gaaccgggtcaacaaa 47275059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 8631759 - 8631418
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631759 actttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 8631660  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8631659 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 8631561  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8631560 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 8631461  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8631460 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 8631418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 44 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11009075 - 11008567
Alignment:
Q  44 cgtggcacgatggaggtttcagtttttg-aggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaata 142  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  11009075 cgtggcacaatggaggtttcaatttttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcactggcagcaaaaa 11008976  T
Q  143 acataaacatatttttgggtg----------------------caaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaa 220  Q
    ||| |||||||||||||||||                      || ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  11008975 acagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag 11008876  T
Q  221 agcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacac 315  Q
     || |  ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11008875 -gctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac 11008777  T
Q  316 tagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11008776 tagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 11008678  T
Q  414 cttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaa 513  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11008677 cttattcttgtaacccattgatt--tctttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 11008580  T
Q  514 ctgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||||||||    
T  11008579 ctaggtcaacaaa 11008567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2485209 - 2484872
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485209 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 2485110  T
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  2485109 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 2485011  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2485010 gactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 2484911  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2484910 cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 2484872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 40637071 - 40637408
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637071 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40637170  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||    
T  40637171 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgag 40637269  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  40637270 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 40637369  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40637370 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 40637408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 44600174 - 44599837
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44600174 acttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 44600075  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||     
T  44600074 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 44599976  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44599975 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 44599876  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  44599875 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 44599837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16934502 - 16934142
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 266  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16934502 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagc 16934403  T
Q  267 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  16934402 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gagaaacactattaggattggagtc 16934304  T
Q  366 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 464  Q
    | |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16934303 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 16934204  T
Q  465 tggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  16934203 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 16934142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 24348211 - 24348552
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24348211 acttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 24348310  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24348311 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 24348409  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24348410 tgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 24348509  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24348510 ctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 24348552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16932148 - 16931788
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 266  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16932148 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagc 16932049  T
Q  267 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  16932048 aacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gagaaacactattaggattggagtc 16931950  T
Q  366 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 464  Q
    | |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16931949 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 16931850  T
Q  465 tggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  16931849 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 16931788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 41 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 619932 - 619447
Alignment:
Q  41 caacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaa 139  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| || ||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || |    
T  619932 caacgtggcacaattggatgtttcagtttt-gaggcaagtcattggatttttcgtggcacgatggggtcgcaacgtggcacaatggtgcgctggcggcga 619834  T
Q  140 ataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  619833 ataacagaaacatatttttgggtagagattttttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 619734  T
Q  240 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcct 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  619733 ggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttacct 619634  T
Q  340 tggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttc 438  Q
    | ||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||  || | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| ||    
T  619633 t-gggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatc 619535  T
Q  439 tc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  619534 tcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctccccta-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 619447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 6764836 - 6765178
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764836 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6764935  T
Q  290 agagtttgtctcttc-----ggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 383  Q
    ||||||||||||||      |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  6764936 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggg-aaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagagg 6765034  T
Q  384 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 482  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6765035 ctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctc 6765134  T
Q  483 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6765135 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 6765178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 47868398 - 47868735
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868398 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 47868497  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47868498 agagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 47868596  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  47868597 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 47868696  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47868697 cccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 47868735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22132735 - 22132391
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22132735 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttg 22132636  T
Q  281 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22132635 ggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 22132538  T
Q  380 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22132537 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 22132438  T
Q  480 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22132437 ctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22132391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 14633317 - 14633652
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14633317 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 14633415  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  14633416 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattggg 14633513  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  14633514 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 14633613  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14633614 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14633652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709163
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18709358 gattcaccttggg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 18709260  T
Q  430 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  18709259 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 18709163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134617
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22134811 gattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22134713  T
Q  430 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22134712 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22134617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 17662574 - 17662244
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662574 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 17662475  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    ||           ||||| | || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  17662474 gt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagac 17662387  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17662386 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 17662287  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17662286 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 17662244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 192 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415491
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||  |||| |    
T  33415721 agtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 33415624  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||     
T  33415623 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccct 33415524  T
Q  490 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33415523 caggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 33415491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928176
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  291 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  || |    
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 38928315  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  38928314 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctcc 38928215  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38928214 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 38928176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395844
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||    || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtga 12395982  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  12395981 ctttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccc 12395882  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12395881 ccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaa 12395844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780372
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 428  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22780568 gattcaccttggg-aaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 22780470  T
Q  429 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22780469 cattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 22780372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782737
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 428  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782933 gattcaccttggg-aaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 22782835  T
Q  429 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  22782834 cattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaa 22782737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400806
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||    || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtga 12400944  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  12400943 ctttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccc 12400844  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12400843 ccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaa 12400806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14787769 - 14787428
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14787769 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 14787670  T
Q  288 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 386  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||    
T  14787669 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 14787571  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg--ctct 483  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||    
T  14787570 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 14787471  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14787470 ctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 14787428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 190 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 47211082 - 47210756
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211082 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47210983  T
Q  284 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||             | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  47210982 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg-------------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagag 47210896  T
Q  383 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 481  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47210895 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 47210796  T
Q  482 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtca 521  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  47210795 ctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 36378289 - 36378627
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36378289 acttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 36378388  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||  || |    
T  36378389 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattggg 36378487  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  36378488 actttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 36378587  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36378588 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaa 36378627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096217
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  291 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||    
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-ag 19096077  T
Q  389 a-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  19096078 agctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctc 19096177  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19096178 ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 19096217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313064
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||     
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggat 37313202  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  37313201 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccc 37313102  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||| ||||||||    
T  37313101 ccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaa 37313064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 92 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 52942881 - 52942542
Alignment:
Q  92 cgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaac 191  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||    
T  52942881 cgtggcacgatggggtcacaacgtggcacgatgatgcgctggcagcgaataacataaacatattttttggtgcagatttgttccaaattttaagtaatac 52942782  T
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtat--caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942781 tttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 52942683  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                
T  52942682 agagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg------------ 52942596  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt 443  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  52942595 -gtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 52942542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 190 - 516
Target Start/End: Original strand, 16453306 - 16453634
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  16453306 acttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtac 16453405  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  || |    
T  16453406 aaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 16453504  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||    
T  16453505 actttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctc 16453604  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16453605 ccccagactaggtcaatttggaccgaactg 16453634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 266 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085976
Alignment:
Q  266 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtc 26086138  T
Q  366 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 464  Q
    | |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26086137 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  465 tggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26086037 tggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaa 26085976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 53405124 - 53405467
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga---gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 286  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405124 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 53405223  T
Q  287 tatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct 385  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53405224 tatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcacctt-gagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggct 53405321  T
Q  386 gagactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggct 478  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  53405322 gagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagct 53405421  T
Q  479 gctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53405422 g--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 53405467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 192 - 521
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030770
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||   |    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagc 56030641  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||   || | | |||||||||||||||||    
T  56030642 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttct-tttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctccc 56030737  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtca 521  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  56030738 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Original strand, 19322705 - 19323029
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 300  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19322705 aaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ct 19322802  T
Q  301 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 399  Q
    ||| | || |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||    
T  19322803 cttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtag 19322899  T
Q  400 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactag 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19322900 aattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactag 19322999  T
Q  498 gt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || |  ||||||||||||||| | ||||||    
T  19323000 gtcagttttggaccgaactggataaacaaa 19323029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 195 - 526
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997826
Alignment:
Q  195 tactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 294  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  295 ttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagacttt 393  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  ||||| |||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagatttt 41997692  T
Q  394 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctccccca 491  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || || |||| ||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||| ||||||| |||||    
T  41997693 gggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-cccca 41997791  T
Q  492 gactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  41997792 gactaggttaatttggaccgaactggataaacaaa 41997826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 97 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 8756679 - 8756277
Alignment:
Q  97 cacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaactttta 196  Q
    ||||||| | ||||| |||| || | ||||||| |||  || ||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  8756679 cacgatgagatcgcaacgtgccatgttggtgcgctggaggcgaataacagaaacatatttctcggtgcagatttgttccaaattataaacgatactttta 8756580  T
Q  197 ctacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  8756579 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaattaggatttgtatagagtt 8756481  T
Q  296 tgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgag--tctttggttacggaaagaggctgagacttt 393  Q
    || ||||| | || |||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||  |||||||||    
T  8756480 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcacctt-gggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagacttt 8756385  T
Q  394 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccccca 491  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| | || || |||||||||| |||    
T  8756384 gagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctcca 8756285  T
Q  492 gactaggt 499  Q
    ||||||||    
T  8756284 gactaggt 8756277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409346
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||| ||| | || ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||  | |||||  |||||    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcggg-aacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgaga 18409484  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||    
T  18409483 cttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctcc 18409385  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  18409384 ctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaa 18409346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 192 - 505
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544272
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 286  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  287 tatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||      
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 13544150  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||  |||||||    
T  13544151 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctct 13544250  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaattt 505  Q
    ||  |||||||||||| |||||    
T  13544251 ctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537472
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18537709  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||| ||||| | || || |||||||||| |  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||    
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttagg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 18537613  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  18537612 acttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 18537513  T
Q  487 ccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| | ||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  18537512 ccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaa 18537472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 269 - 526
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380684
Alignment:
Q  269 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-t 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtatct 36380523  T
Q  368 tggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagt 465  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36380524 tggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagt 36380623  T
Q  466 ggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  36380624 ggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaa 36380684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||  ||||     
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgagg 3937346  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattct 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937345 ctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 388 - 526
Target Start/End: Original strand, 11437558 - 11437696
Alignment:
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11437558 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 11437657  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11437658 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 11437696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 388 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635475
Alignment:
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5635475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 310 - 526
Target Start/End: Original strand, 16455358 - 16455576
Alignment:
Q  310 aaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 408  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16455358 aaacactagggtttgatggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcg 16455456  T
Q  409 ggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttg 506  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| | | || | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16455457 ggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttg 16455556  T
Q  507 gaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16455557 gaccgaactgggtcaacaaa 16455576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 411
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccct-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 6133068  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcggga 411  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6133069 ctttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 18535164 - 18534830
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||||| | |||||||||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||    
T  18535164 cttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18535067  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||  ||||    
T  18535066 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgag-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgag 18534971  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||   ||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||| |    
T  18534970 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctccc 18534871  T
Q  487 ccccagactaggtaa-atttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  18534870 ccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaa 18534830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 370 - 526
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215640
Alignment:
Q  370 gttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtgga 468  Q
    ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  469 tcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 4215640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 342 - 522
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547484
Alignment:
Q  342 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  441 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaa 13547484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 273 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890223
Alignment:
Q  273 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||   ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggtt--ggggttgattcatatt-gggaaacactattaggattgagtctcttgat 38890381  T
Q  372 tacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggat 469  Q
     |||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  38890380 cacgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 38890281  T
Q  470 cagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  38890280 cagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaa 38890223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 342 - 526
Target Start/End: Original strand, 2891439 - 2891626
Alignment:
Q  342 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  2891439 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattgatatctc 2891538  T
Q  441 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  2891539 ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaa 2891626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 276 - 526
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499376
Alignment:
Q  276 actagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattc-tccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtta 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcct--gagaaacactattaggattgagtctattggtta 27499225  T
Q  374 cggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcag 472  Q
    ||  |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | | || ||| ||||||| ||||||||||| |||| || | |      
T  27499226 cgataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacctaat-atctct-tttgtaaggttactcatcattatattgaaacga 27499323  T
Q  473 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27499324 agggctgctct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 27499376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactatta 355  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446756
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtata 24446820  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactatta 355  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16932344 - 16932213
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16932344 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 16932245  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16932244 ggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 16932213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 190 - 329
Target Start/End: Original strand, 5100994 - 5101133
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5100994 acttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 5101093  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggt 329  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  5101094 agagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22783301 - 22783170
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22783301 aaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcatggcacgat 22783202  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22783201 ggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 22783170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 308
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891432
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgta-tcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaa 308  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  2891414 agagtttgtctctttggaa 2891432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16934698 - 16934572
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934698 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacatggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 16934599  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 129  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||    
T  16934598 ggggtctcatcctggcacgatggtgcg 16934572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28454018
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |     
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgca- 28453782  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
     ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  |  |    
T  28453783 -gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttggg-aaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgg 28453877  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    || |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||  || |||||||    
T  28453878 accttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctc 28453977  T
Q  487 ccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  28453978 ccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaa 28454018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22780936 - 22780805
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22780936 aaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcatggcacgat 22780837  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22780836 ggggtctcattgtggcacgatggtgcgctggc 22780805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 345 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185833
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||  ||||||||||||||||||   || |||||||||||| || || ||||| | ||||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctt 16185919  T
Q  443 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16185918 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaa 16185833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15032872 - 15032557
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||| || || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15032872 acttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtat 15032774  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||| ||||| | || |||          ||  |||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |||  || ||  |  |    
T  15032773 agagtttg-ctctttgcaacaaa----------tg-aggttgattcatatt-tggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttgg 15032687  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |  || |||||||||||    
T  15032686 acttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctc 15032587  T
Q  487 ccccagactaggtaaat-ttggaccgaact 515  Q
    ||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  15032586 ccccaaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 12102088 - 12102423
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||    
T  12102088 cttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-ta 12102184  T
Q  289 tagag-tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 386  Q
     |||| ||| |||   ||| ||||||  |||||||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | || || ||  ||    
T  12102185 gagagatttctctaagcgggagaaac--tagggttgttg--ttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattg 12102279  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctct 483  Q
      ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  12102280 gaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 12102379  T
Q  484 ctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  12102380 ctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaa 12102423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 31849531 - 31849459
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31849531 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 31849459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 394 - 526
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101262
Alignment:
Q  394 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccag 492  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||| ||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctcccc-ag 5101228  T
Q  493 actaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5101262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Original strand, 9863716 - 9864047
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag-agggggctgaaa--caagggtttagaaaggcaacaacaaaa-ctagggtttgtatagagttt 296  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || | |||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  9863716 aaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttagaa-gccaaaaacaaaaactagggtttgta--gagttt 9863812  T
Q  297 gtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgg 395  Q
    || |||| | || |||||||| |||| |  | ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  9863813 gt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttggg-aaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgg 9863908  T
Q  396 gtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca----tatagtggatcagagggctgctctct--ccc 488  Q
    |||||||| ||   | ||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||| | ||| ||||||||||  |||    
T  9863909 gtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 9864008  T
Q  489 ccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||    
T  9864009 ccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 9864047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22046619 - 22046547
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22046619 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 22046547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 47210729 - 47210657
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47210729 aattgttccatacactttgttttggttgctttattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 47210657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 9148635 - 9148705
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9148635 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgttccacacatcaagttgttattggtgtg 9148705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 11006186 - 11006116
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11006186 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtg 11006116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 11008500 - 11008430
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11008500 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtg 11008430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 593 - 663
Target Start/End: Original strand, 24348603 - 24348673
Alignment:
Q  593 ttgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24348603 ttgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 24348673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 51015645 - 51015715
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51015645 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtg 51015715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 11435354 - 11435427
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt-ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11435354 aattgttccatacactttgtttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 11435427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 526
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136884
Alignment:
Q  281 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaa 379  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||| |||  ||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggg-aaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaa 30136735  T
Q  380 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggc 477  Q
    ||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| ||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| |||    
T  30136736 gaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggc 30136835  T
Q  478 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  30136836 tgctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaa 30136884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 2484806 - 2484734
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2484806 aattgttccatacactttattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 2484734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 5635409 - 5635337
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5635409 aattgttccatacactttgttttggttgattgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 5635337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 8631351 - 8631279
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8631351 aattgttccatacactttgttttagttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 8631279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 502
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022616
Alignment:
Q  247 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 346  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | || |||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  347 acactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaacc--attgatttctctt 442  Q
    ||| ||||||||| || | | ||||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||   || |||| |||||||||| |   |||||| ||||||    
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctctt 9022555  T
Q  443 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaa 502  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9022556 tgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcccccatattaggtaaa 9022616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 9176406 - 9176334
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9176406 aattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 9176334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 14633718 - 14633790
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14633718 aattgttccatacattttgtttcggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 14633790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22134549 - 22134477
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22134549 aattgttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 22134477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 591 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 22044324 - 22044255
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgt 660  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22044324 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgt 22044255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22132322 - 22132249
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt-ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22132322 aattgttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 22132249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22802670 - 22802597
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22802670 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 22802597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 5198804 - 5198876
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5198804 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaagttattattggtgtgat 5198876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 9174070 - 9174006
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9174070 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattagtgtgat 9174006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 17662183 - 17662111
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17662183 aattgttccatacactttggtttgattgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 17662111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 592 - 663
Target Start/End: Original strand, 7941724 - 7941795
Alignment:
Q  592 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7941724 attgttccatacactttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttgttggtgtgat 7941795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 38409604 - 38409674
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38409604 aattgttccatacaatttgttttagttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtg 38409674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 594 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 38928114 - 38928044
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38928114 tgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 38928044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 11437762 - 11437835
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt-ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11437762 aattgttccatacactttgtttttggctgcttgattatctcttgctccatacatcaagttgttattggtgtgat 11437835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 14787367 - 14787294
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14787367 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 14787294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 14789366 - 14789293
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14789366 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 14789293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 37089305 - 37089232
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37089305 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 37089232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 18847553 - 18847624
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18847553 aattattccatacactttgttt-ggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 18847624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 24889193 - 24889265
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24889193 aattgttccatacactttgttttggttgttagattattccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 24889265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 592 - 663
Target Start/End: Original strand, 47868802 - 47868874
Alignment:
Q  592 attgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47868802 attgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 47868874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 40637471 - 40637545
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt--ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40637471 aattgttccatacactttgttttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 40637545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 40999306 - 40998990
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagg 265  Q
    ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||| ||||| |||| | | ||| |||||||||||||| | |     
T  40999306 atttgttccaaattttaagggttatttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtaga-gagtctgaaaacaagggtttag-acgt 40999209  T
Q  266 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc 365  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||   || |||||||||| ||    | ||||||| || | || ||||| |||||||||||||||    
T  40999208 caacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt--gagattgattcacc-taggaaaacattattaggattgagtc 40999113  T
Q  366 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc-ata 461  Q
    | ||||| |||| |||||   |||||||||||||||||||||   |||||||   | |||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||    
T  40999112 tcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgtta 40999013  T
Q  462 tagtggatcagagggctgctctc 484  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  40999012 tagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 47563154 - 47563225
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47563154 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 47563225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 594 - 663
Target Start/End: Original strand, 16455624 - 16455694
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16455624 tgttccatacactttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 16455694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 599 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 18709088 - 18709026
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18709088 catacactttgttttggttgcttgattatgccttgctccacacatcaagttgttattggtgtg 18709026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22801346 - 22801262
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 104  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22801346 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggaactggaaaaatcgtggcacgatgg 22801262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 36919522 - 36919449
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36919522 aattgttccatacactttattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 36919449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 441 - 526
Target Start/End: Original strand, 47563010 - 47563095
Alignment:
Q  441 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  47563010 tttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 47563095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 6765247 - 6765315
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6765247 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgat 6765315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 16931723 - 16931651
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16931723 aattattccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacattaagttgttattggtgtgat 16931651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 40091353 - 40091281
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtga 662  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40091353 aattattccatacactttattttggttgcttgattatcttttgctccacacatcaagtttgttattggtgtga 40091281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 44599771 - 44599700
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44599771 aattattccatacgctttgttttggttgcttaattatc-cttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 44599700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 3937212 - 3937146
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3937212 ttccatacactttgttt-ggttgcttgattatcccttgctcctcacatcaagttgttattggtgtgat 3937146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Original strand, 4215698 - 4215769
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtga 662  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4215698 aattgtttcatacactttgtttttgttgcttgattattccttgcttcacacatcaagttgttatttgtgtga 4215769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 5101311 - 5101382
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5101311 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgatccacacatcaagtttgttattggtgtg 5101382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 594 - 663
Target Start/End: Original strand, 16453706 - 16453776
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16453706 tgtttcatacactttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 16453776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 37313017 - 37312959
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37313017 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtt 37312959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 2891687 - 2891760
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2891687 aattgttccatacactttattttggttgcttgattattctttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 2891760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 18409281 - 18409228
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18409281 ttccatacactttgttttggttgcttgactatcacttgctccacacatcaagtt 18409228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22800798 - 22800725
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  22800798 aattgttccatatactttgttttggttgcttgactatcccttgctccccacatcaagtttgttattggtgtgat 22800725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 26085902 - 26085837
Alignment:
Q  599 catacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26085902 catacactttgattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 26085837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 36921431 - 36921358
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36921431 aattgtttcatacactttattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 36921358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Original strand, 41997887 - 41997940
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41997887 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcactttctccacacatcaagtt 41997940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 49088951 - 49089024
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  49088951 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttactcaacacatcaagtttgttattggtgtgat 49089024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Original strand, 53405538 - 53405591
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53405538 ttccatacattttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtt 53405591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 332 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982202
Alignment:
Q  332 attctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaac 428  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||  | | ||||||||||||||||| |   || |||| ||||||||||      
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  429 cattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    | ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggt 3982202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18534770 - 18534718
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18534770 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagt 18534718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  328 gttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 425  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  31983727 gttgattcaccttggg-aaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 31983629  T
Q  426 aaccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    | || ||||| || | |||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31983628 accctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 6133232 - 6133290
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6133232 aattgtttcatacactttgtttcggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtt 6133290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050284
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 7050344  T
Q  443 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7050343 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggt 7050284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 480 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14789473 - 14789427
Alignment:
Q  480 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14789473 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14789427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 33415428 - 33415354
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33415428 aattgtcccatacactttgattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttatttgtgtgat 33415354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 441 - 526
Target Start/End: Original strand, 49088819 - 49088905
Alignment:
Q  441 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc-cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||  || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49088819 tttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaa 49088905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22780285 - 22780232
Alignment:
Q  610 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22780285 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 22780232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22782650 - 22782597
Alignment:
Q  610 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22782650 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 22782597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 27499443 - 27499516
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27499443 aattgttccataaactttgttttggttgcttggttattcattgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 27499516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Original strand, 56030857 - 56030910
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  56030857 ttccatacactttgttttggttgcgtgactatctcttgctccacatatcaagtt 56030910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047383
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 519
Target Start/End: Original strand, 10112927 - 10113198
Alignment:
Q  247 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 346  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | || |||||||||||||    | ||||||| |||| || ||    
T  10112927 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttagg-aa 10113019  T
Q  347 acactattaggattgagtct-ttggttacgga-aagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccatt-gatttctctt 442  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||  |  ||||||||||||||||||    || |||| |||||||||| |  || ||| ||||||    
T  10113020 acactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctctt 10113119  T
Q  443 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggt 519  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  10113120 tgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853703
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 11853644  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11853645 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 11853703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18537412 - 18537360
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18537412 ttccatacactttgttttgattgcttgattattacttgctccacacatcaagt 18537360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 413 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446678
Alignment:
Q  413 acttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24446678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 526
Target Start/End: Original strand, 25357595 - 25357977
Alignment:
Q  152 tatttttgggtgcaaatttgttccaaatttta--agcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggc 244  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| |||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||     |||||    
T  25357595 tatttttgggctcagatttgttccaa-ttttacgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggc 25357693  T
Q  245 tgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggg 343  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||  | |||| || |||||  |   || ||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  25357694 tgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt--agagagatt-tctctaagtgggagacactagggtt-gtga-ttgattcaccttggg 25357786  T
Q  344 gaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggta----gaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgattt 437  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||  || |||||||| ||    |||||| |   || ||||||||||||||| || ||||| |    
T  25357787 -aaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgtaaccctttgatat 25357885  T
Q  438 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||| || | ||  |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||||    
T  25357886 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggtaaacaaa 25357977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39245998
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 3824540 - 3824469
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3824540 tgttccatacattttgattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 3824469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 12395783 - 12395712
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12395783 aatttttcgatactctttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 12395712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 12400745 - 12400674
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12400745 aatttttcgatactctttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 12400674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 24446595 - 24446524
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24446595 aatttttccatacactttattttggttgcttgattatcccttacttcacacatcaagtttgttattggtgtg 24446524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150898
Alignment:
Q  329 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 426  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||  ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttggg-aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 47150994  T
Q  427 accattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggt 519  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||  | || | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  47150993 ccctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggt 47150898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16186173 - 16186099
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaaa 263  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16186173 acttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaa 16186099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 22048542 - 22048492
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt 70  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22048542 aatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt 22048492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 52942424 - 52942350
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc-aagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  52942424 aattgttccatacactttgattttgattgcctgattatctcttactccacacatcaaatttgttatttgtgtgat 52942350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822326
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 526
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557920
Alignment:
Q  431 ttgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||| ||| ||||||    
T  26557823 ttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaa 26557920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 5269220 - 5269284
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  5269220 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 5664635 - 5664687
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||    
T  5664635 ttccatacactttgttttggttgcttgattattaccttctccacacatcaagt 5664687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 12102479 - 12102531
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||    
T  12102479 ttccatacactttgttttggttgctcggttattacttgctccacacatcaagt 12102531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 19323090 - 19323142
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19323090 ttccatacactttattttagttgcttgattattacttgctccacacatcaagt 19323142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 627
Target Start/End: Original strand, 24879387 - 24879423
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattat 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879387 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattat 24879423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 524
Target Start/End: Original strand, 36315258 - 36315321
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaaca 524  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  36315258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 524
Target Start/End: Original strand, 36329467 - 36329530
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaaca 524  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  36329467 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 48486716 - 48486771
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  48486716 aattgttccattcactttgttttagttgcttgattatcgcttgttccacgcatcaa 48486771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 460 - 526
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133171
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||| | || | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaa 6133171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 8756179 - 8756138
Alignment:
Q  607 ttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8756179 ttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagt 8756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 648
Target Start/End: Original strand, 36378686 - 36378742
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  36378686 aattgtttcatacactttgttt-ggttgcttgattattacttgctccacatatcaagt 36378742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 38270084 - 38270016
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  38270084 aattgttccatac---ttgttttggttgcttgactatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtg 38270016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396764
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5396700 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 5429803 - 5429847
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5429803 tctctcccccagattaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 5429847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739550
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 13547549 - 13547621
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13547549 aattgttccatacactttgattttggttgtctaattatcacttgttccacacatcaagtttgttattggtgtg 13547621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15032480 - 15032429
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15032480 ttccatacactttgttt-ggttgcttgattattacttgctccgcacatcaagt 15032429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 262
Target Start/End: Original strand, 16455296 - 16455356
Alignment:
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 262  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16455296 aatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175636
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463389
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 38152468 - 38152532
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||    
T  38152468 atagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893638
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 486 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942487
Alignment:
Q  486 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 52942487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 54867239 - 54867188
Alignment:
Q  473 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  54867239 agggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3937316 - 3937273
Alignment:
Q  483 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3937316 tctccctcagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3937273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 524
Target Start/End: Original strand, 6743444 - 6743507
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaaca 524  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  6743444 atagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529328
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8529328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587027
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 499
Target Start/End: Original strand, 18587082 - 18587121
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18587082 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 18587121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300485
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 38270151 - 38270120
Alignment:
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagactt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270151 tgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 47275119 - 47275177
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47275119 aattattctatacacttcattttgattgcttgattatcccttactccacacatcaagtt 47275177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3578766 - 3578670
Alignment:
Q  431 ttgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||    
T  3578766 ttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattagaccgaactgggtaaacaaa 3578670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 392
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4884922
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactt 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 4884922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5143312 - 5143263
Alignment:
Q  476 gctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  5143312 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16689380 - 16689331
Alignment:
Q  80 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  16689380 cactggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcg 16689331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 16934062 - 16934008
Alignment:
Q  607 ttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16934062 ttgttttggttgcttaatt--cccttgctccacacattaagttgttattggtgtgat 16934008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 52942974 - 52942910
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 84  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  52942974 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcagcttt-gaggcaagtcactg 52942910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 3796548 - 3796612
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||| | ||||| |  |||||| |||||||||||||||    
T  3796548 atagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaa 3796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 5871944 - 5871988
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  5871944 tctctcccccagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacaa 5871988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 129
Target Start/End: Original strand, 8529012 - 8529060
Alignment:
Q  81 actggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  8529012 actggaaaaatcgtgccacgatgaagccgcatcgtgccacgatggtgcg 8529060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9927502 - 9927458
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  9927502 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 9927458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 603 - 646
Target Start/End: Original strand, 10113272 - 10113313
Alignment:
Q  603 cactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  10113272 cactttgttttggttgcttgatta--ttttgctccacacatcaa 10113313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 12743969 - 12743925
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12743969 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 12745358 - 12745314
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12745358 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12745314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 16623322 - 16623386
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  16623322 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 16623386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27417009 - 27416965
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  27417009 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 27416965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 31985663 - 31985726
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  31985663 atagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34570458 - 34570414
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  34570458 tctctcccccagattaggttaagttggatcgaactgggtcaacaa 34570414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 46147435 - 46147391
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  46147435 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 46147391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 47038455 - 47038411
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  47038455 tctctcccccagagtaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 47038411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52043789 - 52043737
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    ||||||||||| |||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52043789 atttgttccaattttttagggatgcttttactataaatatagaccttgtatca 52043737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 52467398 - 52467354
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  52467398 tctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 52467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 217)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Original strand, 51749806 - 51750319
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-tgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatc 113  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749806 tgcagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggtacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatc 51749905  T
Q  114 gtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacctt 213  Q
    |||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51749906 gtggcacgatagtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 51750005  T
Q  214 gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaac 313  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51750006 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 51750105  T
Q  314 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 412  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51750106 actagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 51750204  T
Q  413 acttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 511  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51750205 acttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 51750304  T
Q  512 aactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||    
T  51750305 aactgggtcaacaaa 51750319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 20302214 - 20302738
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-tgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20302214 aaatcagatttctgcagaatcgcggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaattgtggcacga 20302313  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  20302314 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcatatttgttccaaattttaagtgaaacttttattata 20302413  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302414 aatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 20302513  T
Q  302 ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtaga 400  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||  |||||||||||||    
T  20302514 ttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtaga 20302612  T
Q  401 attaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggta 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||     
T  20302613 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctcccccagactaggtc 20302712  T
Q  501 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20302713 aatttggaccgaacttggtcaacaaa 20302738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 28840451 - 28840959
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28840451 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttt-aggcaaggtactggaaaaattgtggcacgatgggatcgcatcgtggc 28840549  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28840550 acgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 28840649  T
Q  219 aaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact 316  Q
    | ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28840650 agagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacact 28840749  T
Q  317 agggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840750 agggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagact 28840848  T
Q  416 tattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaact 515  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28840849 tattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 28840948  T
Q  516 gggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||    
T  28840949 gggtcaacaaa 28840959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 13761593 - 13762116
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761593 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 13761692  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaa 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13761693 ggggtcgcatcgcggcacgatggtgtgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataa 13761792  T
Q  203 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761793 atatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctct 13761892  T
Q  303 tcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaa 401  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  13761893 ttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaactt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaa 13761991  T
Q  402 ttaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaa 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13761992 ttaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtca 13762091  T
Q  502 atttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  13762092 atttggactgaactgggtcaacaaa 13762116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 51752120 - 51752643
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-tgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752120 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 51752219  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51752220 tggggccgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactata 51752319  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  51752320 aatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctc 51752419  T
Q  302 ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtaga 400  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51752420 ttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtaga 51752517  T
Q  401 attaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggta 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  51752518 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc 51752617  T
Q  501 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  51752618 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 51752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 28842266 - 28842774
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28842266 aatcgtggcacgatggcaaggctacgtggcacgattggaggtttcagttttt-aggcaaggtactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggc 28842364  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    |||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28842365 acgatggtgtcctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatc 28842464  T
Q  219 aaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact 316  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28842465 agagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacact 28842564  T
Q  317 agggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 415  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842565 agggtttgtgggttgattcacattggg-aaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 28842663  T
Q  416 tattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaact 515  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28842664 tattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaact 28842763  T
Q  516 gggtcaacaaa 526  Q
     ||||||||||    
T  28842764 aggtcaacaaa 28842774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 15823319 - 15823826
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823319 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactagaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 15823417  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15823418 acgatggtgcgctagcagcaaataacagaaacatatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 15823517  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15823518 aaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 15823617  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823618 ggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 15823716  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15823717 ttcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactg 15823816  T
Q  517 ggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||    
T  15823817 ggtcaacaaa 15823826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10400353 - 10399829
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10400353 aaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaatatcgtggcacga 10400255  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10400254 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaactttttctata 10400155  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400154 aatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 10400055  T
Q  302 ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtaga 400  Q
    || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||| ||||||    
T  10400054 ttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtaga 10399956  T
Q  401 attaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399955 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggt 10399856  T
Q  500 aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  10399855 caatttggaccgaactgggtcaacaaa 10399829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 13214854 - 13215366
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||| |||||| | ||| ||||||    
T  13214854 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcatgatgggattgcaacgtggc 13214952  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13214953 acgatggtgtgttggcagcaaataacaaaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 13215052  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13215053 agagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 13215152  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215153 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactta 13215251  T
Q  418 ttcttgtaaaccattga----tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 511  Q
    ||||||||| |||||||    |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13215252 ttcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 13215351  T
Q  512 aactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| |||||||||    
T  13215352 aactgcgtcaacaaa 13215366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 6822791 - 6823294
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||             
T  6822791 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatc--------- 6822881  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
                |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6822882 ------------gtggcacgatggtgcgctggcggcgaataatagaaatgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatt 6822969  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 301  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6822970 tatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 6823069  T
Q  302 ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtaga 400  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  || | |||||||||||    
T  6823070 ttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtaga 6823167  T
Q  401 attaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823168 attaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggt 6823267  T
Q  500 aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  6823268 caatttggaccgaactgggtcaacaaa 6823294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 443
Target Start/End: Original strand, 6823651 - 6824088
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-tgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatc 113  Q
    |||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6823651 tgcagaatcatggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggggtcgcatc 6823750  T
Q  114 gtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacctt 213  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  6823751 gtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagacctt 6823850  T
Q  214 gtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaa 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6823851 gtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa 6823950  T
Q  313 cactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt--------ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |        |||||||| |||||  || | |||||||||||||||    
T  6823951 cactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaatta 6824049  T
Q  405 ggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt 443  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6824050 ggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 6824088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 44 - 526
Target Start/End: Original strand, 41646717 - 41647200
Alignment:
Q  44 cgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaata 142  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  41646717 cgtggcacgattagaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcacggtgggattgcaacgtggcacgatggtgcactggcagcgaata 41646815  T
Q  143 acataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 242  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41646816 acagaaacatatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggg 41646915  T
Q  243 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttgg 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||   ||||||||| |||| |    
T  41646916 gctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcacctt-g 41647014  T
Q  343 ggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc- 440  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  41647015 ggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctct 41647114  T
Q  441 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41647115 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 41647200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Original strand, 16226087 - 16226447
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 266  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  16226087 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagc 16226186  T
Q  267 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16226187 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtc 16226285  T
Q  366 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 464  Q
    | |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16226286 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 16226385  T
Q  465 tggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  16226386 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 16226447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3580126 - 3579618
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||    
T  3580126 aatcgtggcacgattgcagggcaacgtgacacaattggatgtttcagttat-gaggcaagtcattggaaaaatcgtggtacggtgggattgcaacgtggc 3580028  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3580027 acgatggtgcgctggcggcgaatatcataaacgtattttagagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactttaaatatagaccttgtatc 3579928  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagag--ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact 316  Q
    |  | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  3579927 agcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacact 3579828  T
Q  317 agggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 415  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3579827 agggtttgagggttgattcacctt-aggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagact 3579729  T
Q  416 tattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaac 514  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| | | || |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3579728 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaac 3579630  T
Q  515 tgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||    
T  3579629 tgggtcaacaaa 3579618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 114 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 38925892 - 38925482
Alignment:
Q  114 gtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacctt 213  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || |||| ||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38925892 gtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaagtgtatttttgggtgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 38925793  T
Q  214 gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaac 313  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38925792 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 38925693  T
Q  314 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 412  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38925692 actagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggag 38925594  T
Q  413 acttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 511  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||  | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38925593 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtaaaacggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccg 38925497  T
Q  512 aactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| |||||||||    
T  38925496 aactgagtcaacaaa 38925482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31735863 - 31735522
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga----gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735863 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31735764  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||    
T  31735763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggc 31735665  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31735664 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 31735565  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31735564 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 31735522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 39 - 526
Target Start/End: Original strand, 39462310 - 39462799
Alignment:
Q  39 ggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagc 137  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| | ||||     
T  39462310 ggcaacgtggcacgattagaggtttcagtttt-gaggcaagtcagtggatttttcgtggcacgatgggattgcaatgtggcacgatggtgcgcttgcagt 39462408  T
Q  138 aaataacataaacatatttt-tgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagata 236  Q
     ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  39462409 gaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagata 39462508  T
Q  237 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattct 336  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||     
T  39462509 gagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattca 39462608  T
Q  337 ccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgat 435  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  39462609 cctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgat 39462707  T
Q  436 ttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     |||| |||| || |||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39462708 atctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 39462799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 191 - 522
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617792
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 2617658  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2617659 ctttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 2617758  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2617759 tcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaa 2617792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27337280 - 27336941
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337280 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27337181  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
     |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  27337180 ttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggc 27337083  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 484  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27337082 tgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 27336983  T
Q  485 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27336982 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 27336941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 180 - 526
Target Start/End: Original strand, 20291390 - 20291736
Alignment:
Q  180 tttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291390 tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 20291489  T
Q  280 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  20291490 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 20291588  T
Q  379 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggct 478  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  20291589 agagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggtt 20291688  T
Q  479 gctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20291689 gttctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20291736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 94 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28207500 - 28207069
Alignment:
Q  94 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaactt 193  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28207500 tggcacgatggggtcacaacgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtttttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatactt 28207401  T
Q  194 ttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  28207400 ttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaag 28207301  T
Q  294 tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactt 392  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||  || | |||    
T  28207300 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcacctt-gggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctt 28207202  T
Q  393 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccca 491  Q
    ||  || ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  28207201 tgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctctctccccca 28207104  T
Q  492 gactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28207103 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28207069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27339472 - 27339132
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |    |||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27339472 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggttt 27339373  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  27339372 gtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggc 27339274  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27339273 tgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctc 27339174  T
Q  485 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27339173 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 27339132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 239 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431707
Alignment:
Q  239 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  339 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 437  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46431896 ttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 46431798  T
Q  438 ctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc--ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46431797 ctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 46431707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 112 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14098385 - 14097970
Alignment:
Q  112 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 211  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||    
T  14098385 tcgttgcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatt-gttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacc 14098287  T
Q  212 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 311  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  14098286 ttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaa 14098187  T
Q  312 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga-ctttgggtagaattaggcgg 409  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||| |||    
T  14098186 acactagagtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-agagctttgggtagaattagacgg 14098089  T
Q  410 gagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaa-cgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgg 507  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  14098088 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttgg 14097989  T
Q  508 accgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14097988 accgaactgggtcaacaaa 14097970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Original strand, 47179629 - 47179992
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaa 262  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179629 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 47179728  T
Q  263 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-g 361  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  47179729 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgg 47179827  T
Q  362 agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 460  Q
    ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47179828 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat 47179927  T
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  47179928 atagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 47179992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9463588 - 9463245
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463588 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 9463489  T
Q  284 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattga-gtct-ttggttacggaaaga 381  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9463488 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 9463390  T
Q  382 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 481  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9463389 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 9463290  T
Q  482 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  9463289 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 9463245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 24325599 - 24325943
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 281  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24325599 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagg 24325697  T
Q  282 gtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24325698 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 24325796  T
Q  381 aggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 479  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||    
T  24325797 aggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctg 24325896  T
Q  480 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24325897 ctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaa 24325943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9459761 - 9459418
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9459761 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggt 9459662  T
Q  284 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattga-gtct-ttggttacggaaaga 381  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9459661 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 9459563  T
Q  382 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 481  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9459562 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 9459463  T
Q  482 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  9459462 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 9459418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 15295131 - 15294835
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||    
T  15295131 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 15295032  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  15295031 gattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaaccc 15294933  T
Q  430 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15294932 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 15294835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Original strand, 47177278 - 47177641
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaa 262  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177278 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 47177377  T
Q  263 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggat-tg 361  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |    
T  47177378 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggatggg 47177476  T
Q  362 agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 460  Q
    ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47177477 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat 47177576  T
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  47177577 atagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaa 47177641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 193 - 526
Target Start/End: Original strand, 39932017 - 39932354
Alignment:
Q  193 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932017 tttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39932116  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  39932117 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgaga 39932215  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc-tcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  39932216 ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcc 39932315  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39932316 cccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaa 39932354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 193 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21948526 - 21948226
Alignment:
Q  193 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948526 tttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 21948427  T
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||     
T  21948426 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt--ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgg 21948329  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21948328 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 21948229  T
Q  487 ccc 489  Q
    |||    
T  21948228 ccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 47906207 - 47906550
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  47906207 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggt 47906306  T
Q  284 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 382  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  47906307 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 47906405  T
Q  383 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 481  Q
      || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47906406 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 47906505  T
Q  482 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47906506 ctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 47906550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 107 - 523
Target Start/End: Original strand, 47451508 - 47451919
Alignment:
Q  107 tcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  47451508 tcgcatcgtggcacgatggtgcgctgacagcgaataacagaaacgtattttttggtgcagatttgttccaaatattaagcgatacttttactataaatat 47451607  T
Q  207 agaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg 306  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47451608 agaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg 47451707  T
Q  307 aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattag 405  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| | || | |        |||||||||||||| |||||||||| |||||  || | ||||||||| ||||||    
T  47451708 aacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtg-------tttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattag 47451800  T
Q  406 gcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatt 504  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |  | | ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  47451801 gcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatt 47451900  T
Q  505 tggaccgaactgggtcaac 523  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47451901 tggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 17324974 - 17324637
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | || || |||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17324974 acttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtat 17324875  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  17324874 agagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 17324776  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  17324775 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 17324676  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17324675 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 17324637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307547
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  291 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 50307686  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  50307685 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 50307586  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50307585 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 50307547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12302848 - 12302506
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12302848 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtt 12302749  T
Q  285 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 383  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  12302748 tgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 12302650  T
Q  384 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 482  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  12302649 ttgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 12302550  T
Q  483 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12302549 tctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 12302506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839868
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||    
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgaga 18839729  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  18839730 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcc 18839829  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18839830 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 18839868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2510666 - 2510326
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2510666 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggttt 2510567  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  2510566 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-tggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagat 2510468  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    |  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | || |||||||||    
T  2510467 ttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 2510369  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2510368 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 2510326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6996038 - 6995701
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996038 acttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6995939  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  6995938 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcacctt-gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggg 6995840  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  6995839 gctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 6995740  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6995739 tccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 6995701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28998591 - 28998254
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28998591 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 28998492  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || |    
T  28998491 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 28998393  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || |||||||    
T  28998392 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcc 28998293  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28998292 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28998254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 29004307 - 29003970
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29004307 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 29004208  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || |    
T  29004207 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 29004109  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || |||||||    
T  29004108 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcc 29004009  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29004008 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 29003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 16428596 - 16428934
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| ||||||||   || ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428596 acttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 16428695  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||||||||||   || |||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  16428696 agagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 16428794  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||    
T  16428795 actttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctc 16428894  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16428895 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 16428934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186128
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  |   |    
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaa 17186267  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  17186266 ctttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcc 17186167  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17186166 cccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaa 17186128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076673
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 50076811  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || | ||||||||| |    
T  50076810 atttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-c 50076712  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  50076711 cccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 50076673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078821
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |  ||    
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttgga 50078960  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50078959 ctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcc 50078860  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||    
T  50078859 cccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaa 50078821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251275
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||  || |||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggac 25251413  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  25251412 tttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccc 25251313  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25251312 caatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 25251275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457476
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    |||||||  |||| | || ||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||  || |     
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggg 11457614  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | || | ||||||||||||    
T  11457613 gtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctccc 11457514  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11457513 ccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 11457476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307389
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || | |    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc-tcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 18307252  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||| ||    
T  18307253 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-cc 18307351  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18307352 ccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaa 18307389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2949569 - 2949233
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||| | |||||||||  ||| |||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  2949569 acttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 2949470  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||  || |    
T  2949469 agagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggg 2949371  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2949370 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 2949271  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2949270 ccc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 2949233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4131676 - 4131376
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  4131676 gagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 4131577  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  4131576 gatttacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaaccc 4131479  T
Q  430 attga----tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaac 523  Q
    |||||    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||    
T  4131478 attgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaac 4131379  T
Q  524 aaa 526  Q
    |||    
T  4131378 aaa 4131376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 190 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 9241424 - 9241094
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241424 acttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 9241326  T
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||     
T  9241325 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 9241227  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  9241226 ggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 9241127  T
Q  486 cccccagactaggtaaatttggaccgaactggg 518  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9241126 cccccatactaggtcaatttggaccgaactggg 9241094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128153
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| |||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25127956 gattcacctt-gtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattc 25128054  T
Q  430 attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | | ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25128055 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaa 25128153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 190 - 468
Target Start/End: Original strand, 48665114 - 48665400
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc------tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665114 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 48665213  T
Q  284 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtta-cggaaaga 381  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  48665214 ttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaaga 48665312  T
Q  382 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 468  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665313 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 212 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31425016
Alignment:
Q  212 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aaga 310  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  311 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagt---ct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattagg 31425137  T
Q  407 cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatt 504  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  31425136 cgggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaatt 31425038  T
Q  505 tggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31425037 tggaccgaactgggtcaacaaa 31425016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756808
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||   | |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756470 acttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6756569  T
Q  290 agagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtctttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||  || |    
T  6756570 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtc-ttgattacgagaagagattggg 6756667  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct- 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || | |||||||||     
T  6756668 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctc 6756767  T
Q  486 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  6756768 cccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaa 6756808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248571
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||   ||||    
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgaga 50248711  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg--ctctctc 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| || ||  |||||||    
T  50248710 ctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctc 50248611  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  50248610 ccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaa 50248571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490192
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtat- 31489957  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||  |||||    
T  31489958 -agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgaga 31490055  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||    
T  31490056 ctttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-ccc 31490154  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  31490155 ccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaa 31490192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31423212 - 31422861
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31423212 acttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatat 31423113  T
Q  290 agagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||    
T  31423112 agagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcacctt-gggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattga 31423014  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tata------------gtggatcaga 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||            ||| | ||||    
T  31423013 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacaga 31422914  T
Q  474 gggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  31422913 gggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaa 31422861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319167
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||||||| ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||      |||||||||||| |||||||||| || ||  || |||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcacctt-gggaaac------aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggac 17319030  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||| ||    
T  17319031 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-cc 17319129  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17319130 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 17319167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 342 - 526
Target Start/End: Original strand, 51757625 - 51757810
Alignment:
Q  342 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  51757625 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttctc 51757724  T
Q  441 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  51757725 tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 51757810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324344
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || || |||||  ||  |    
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaa 17324205  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | | || ||||| |||||||    
T  17324206 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctcc 17324305  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17324306 ccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 17324344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 140 - 526
Target Start/End: Original strand, 42922126 - 42922512
Alignment:
Q  140 ataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||||  |||||||| || |||| || |||||||    
T  42922126 ataacataatcatatttttgggctgagatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagataga 42922225  T
Q  239 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 338  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||    ||||||||| ||    
T  42922226 gggggttgaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcacc 42922321  T
Q  339 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 437  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  42922322 ttgcgaaaa-actattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatat 42922420  T
Q  438 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  42922421 ctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaa 42922512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 314 - 526
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231842
Alignment:
Q  314 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga 411  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcggga 16231728  T
Q  412 gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 511  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  16231729 gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 16231828  T
Q  512 aactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||||||    
T  16231829 aact-ggtcaacaaa 16231842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 240 - 526
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134225
Alignment:
Q  240 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcct 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  340 tggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttc 438  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  40134037 t-gggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatc 40134135  T
Q  439 tc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  40134136 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaa 40134225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786119
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 23786119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183591
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtata 14183827  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||| ||| ||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||  |   |    
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgga-aaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaa 14183731  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||    
T  14183730 ttttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 14183631  T
Q  488 cccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  14183630 cccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaa 14183591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 190 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 8347607 - 8347300
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  8347607 acttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgta 8347510  T
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    ||||| ||| ||||| | || |||||| | |||| |  ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||  |||    
T  8347509 tagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggttag--ggttgattcaccttagg-aaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattga 8347414  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||| |    
T  8347413 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctcttt 8347314  T
Q  486 cccccagactaggt 499  Q
    |||| |||||||||    
T  8347313 cccctagactaggt 8347300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 30790882 - 30790401
Alignment:
Q  40 gcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagca 138  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||  |      
T  30790882 gcaatgtggcacgattggatgtttcagttat-gaagcaagtcactggaaaaaacgtggcacgatgggatcgcaatgtggcacgatggtgcgctggagggg 30790784  T
Q  139 aataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 238  Q
    || ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  30790783 aaaaacataaacgtatttttcagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 30790684  T
Q  239 gggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctc 337  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |   || ||||||||| |||| ||||||||  |    
T  30790683 gggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttac 30790592  T
Q  338 cttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgat 435  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  |||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30790591 ctt-gggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 30790494  T
Q  436 ttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||   || | |||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||    
T  30790493 atctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 190 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 15669729 - 15669421
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 287  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| || | | |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| | | |||| || ||||| ||||||||||    
T  15669729 acttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttggga-ggcagca-caaaagtagggtttgt 15669632  T
Q  288 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 386  Q
    ||| |||||| ||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||    
T  15669631 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 15669536  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctc 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||    
T  15669535 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctc 15669436  T
Q  485 tcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |||||||||    
T  15669435 tccccgagactaggt 15669421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 388 - 526
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816166
Alignment:
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 23816166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 238 - 526
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432676
Alignment:
Q  238 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctc 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  338 cttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatt 436  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||     
T  16432485 cttggg-aaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgata 16432583  T
Q  437 tctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccccc-agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | | || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16432584 tctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 16432676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 342 - 526
Target Start/End: Original strand, 16429051 - 16429238
Alignment:
Q  342 gggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16429051 gggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctc 16429150  T
Q  441 ttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16429151 ttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaa 16429238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 314 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248552
Alignment:
Q  314 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 412  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggag 25248668  T
Q  413 acttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggacc 510  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||| | | |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25248667 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggacc 25248568  T
Q  511 gaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||    
T  25248567 gaactgggtcaacaaa 25248552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 190 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 18800907 - 18800600
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  18800907 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttag-aagtcaacaagaaaactacggtttgtat 18800809  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||| ||||| |  | ||| |||||||||   |||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||  |       
T  18800808 agagtttg-ctcttggccacaaatactagggtt--ggggttgattcaccct-gagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttga 18800713  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||  ||||||||||    
T  18800712 actttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctc 18800613  T
Q  487 ccccagactaggt 499  Q
    ||||| |||||||    
T  18800612 ccccaaactaggt 18800600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 8349385 - 8349051
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  8349385 ttttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaattaaggtttgtata 8349287  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||| ||||| | || |||||||||||||   ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| |||||  |  ||    
T  8349286 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggtttattcacctt-gggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattagga 8349191  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||  |||||| || |||||||    
T  8349190 ctttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctcc 8349091  T
Q  488 cccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || |||||| || |  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  8349090 ccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaa 8349051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Original strand, 16225903 - 16226083
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16225903 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggttgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 16226002  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  16226003 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacata-ttttgggtgcagatttgttacagattttaag 16226083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 190 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 49495537 - 49495222
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||||| ||    
T  49495537 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgcat 49495446  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggctgag 388  Q
    | |||||| ||||| | || |||||||| ||||   | |||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||| |||| |||||  || |    
T  49495445 atagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttggg-aaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggg 49495351  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |  ||||||  ||||||    
T  49495350 gctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctc 49495251  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaact 515  Q
    ||| |||||| || ||||| |||||||||    
T  49495250 cccaagactatgtcaatttagaccgaact 49495222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 167 - 287
Target Start/End: Original strand, 16231521 - 16231641
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 266  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16231521 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagc 16231620  T
Q  267 aacaacaaaactagggtttgt 287  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  16231621 aacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 345 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6115287 - 6115103
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt 443  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  6115287 aaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaaccaattgatatctcttt 6115188  T
Q  444 -gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||  ||||||||||| |||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6115187 tgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaa 6115103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Original strand, 47177094 - 47177274
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47177094 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacgactgggcaacgtggcacgatggaggttttagtttttg-ggcaagacactggaaaaatcgtggcacgat 47177192  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |  || || | |||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  47177193 ggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacctatttttgggagcagatttgttacagattttaag 47177274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 129
Target Start/End: Original strand, 47179444 - 47179570
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47179444 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgaaaaaatcgtggcacgat 47179543  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  47179544 ggggtctcatcgtggcacgatggtgcg 47179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Original strand, 23783254 - 23783376
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783254 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 23783353  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatgg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23783354 ggggtcgcatcgtggcacgatgg 23783376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 286  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 13447208 - 13447136
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13447208 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 13447136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 15294769 - 15294697
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15294769 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 15294697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 92
Target Start/End: Original strand, 20291296 - 20291386
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcag-tttttgaggcaaggcactggaaaaatc 92  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20291296 aaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacggtggaggtttcagttttttgaggcatggcactggaaaaatc 20291386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 591 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 31735457 - 31735388
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgt 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31735457 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgt 31735388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 47906612 - 47906684
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47906612 aattgttccatacactttggtttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 47906684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 51750385 - 51750457
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51750385 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 51750457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 451 - 526
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358853
Alignment:
Q  451 tactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 13358853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 199
Target Start/End: Original strand, 49687405 - 49687492
Alignment:
Q  112 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttacta 199  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49687405 tcgtggcacgatggtgcgctgacagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacta 49687492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10399763 - 10399690
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10399763 aattgttccatacactttgattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 10399690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 660
Target Start/End: Original strand, 51757881 - 51757950
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgt 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51757881 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgt 51757950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 13762182 - 13762254
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13762182 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccctttctccacacatcaagttgttattggtgtgat 13762254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 23816231 - 23816303
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23816231 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 23816303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 46431640 - 46431568
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46431640 aattgttccatacgctttgttttggttgcttgattatctcttgctccaaacatcaagttgttattggtgtgat 46431568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 325 - 526
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561749
Alignment:
Q  325 tgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 422  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  16561544 tgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattctt 16561642  T
Q  423 gtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggt 519  Q
    |||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||| ||    
T  16561643 gtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgt 16561742  T
Q  520 caacaaa 526  Q
     ||||||    
T  16561743 aaacaaa 16561749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 104
Target Start/End: Original strand, 16231369 - 16231458
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 104  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16231369 tgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaagacactggaaaaatcgtggcacgatgg 16231458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 2510277 - 2510205
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  2510277 aattgttccatacactttgttttcgttgcttgattatctcttgcttcacatatcaagttgttattggtgtgat 2510205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 4131315 - 4131243
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtga 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  4131315 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccgcacatcaagtttgttattggtgtga 4131243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 9459361 - 9459297
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9459361 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 9459297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 9463188 - 9463124
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9463188 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 9463124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 13125775 - 13125485
Alignment:
Q  209 accttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-gtatagagtttgtctcttcgga 307  Q
    ||||||||||| || |||  |||||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| |      
T  13125775 accttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaag-aagccaacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcg 13125678  T
Q  308 agaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    | |||||||||||||    ||||||||| | || ||||||| || ||||||||||| || ||||| | || |||||  || |||||||||||||||||||    
T  13125677 acaaacactagggtt--gaggttgattcacatt-gggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattagg 13125581  T
Q  407 -cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
       | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||  |||||||    
T  13125580 tttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggt 13125485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 23786186 - 23786258
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23786186 aattgttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 23786258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Original strand, 27916417 - 27916778
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctg--aaacaagggtttagaaa 263  Q
    ||||||||||| |||  || || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || | ||    ||||||||||||||||     
T  27916417 atttgttccaattttggagggatacttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttagaa- 27916515  T
Q  264 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgag 363  Q
    | || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |    ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||    
T  27916516 gccagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttgga-aaacactattagaattgag 27916609  T
Q  364 tct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaac--cattgatttctctttgtaacgttactcatca 459  Q
    ||| ||||| ||   |||||  || |||||||||| ||||||||   || |||| |||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  27916610 tctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctctttgtaaagttactcatcg 27916709  T
Q  460 t-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| ||||||    
T  27916710 ttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaa 27916778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 2949172 - 2949099
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2949172 aattgttccatacactttattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 2949099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 20291802 - 20291875
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20291802 aattgttccatacaccttgattttggttacttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 20291875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 50078729 - 50078656
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  50078729 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 50078656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353347
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 21353430  T
Q  446 aacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || |  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  21353429 aaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaa 21353347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 24326009 - 24326081
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24326009 aattgttccatacactttactttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagttgttattggtgtgat 24326081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 28842848 - 28842912
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28842848 catacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagttgttattagtgtgat 28842912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 31490253 - 31490325
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  31490253 aattgtttcatacactttattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtttgtattggtgtgat 31490325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 39932426 - 39932494
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39932426 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 39932494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 2617863 - 2617934
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2617863 aattgttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgcttcacacatcaagttgttattggtgtg 2617934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 419 - 526
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916672
Alignment:
Q  419 tcttgtaaaccattgatttctctttg-taacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaact 515  Q
    |||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  516 gggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||    
T  15916662 gggtaaacaaa 15916672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26520445 - 26520206
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 298  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  26520445 aaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg- 26520348  T
Q  299 ctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttg------gttacggaaagaggctgagact 391  Q
    ||||| | || |||||||| | ||    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||      || |||| |||||  || ||||    
T  26520347 ctcttggcaacaaacactaagatt--gaggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggact 26520251  T
Q  392 ttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgat 435  Q
    |||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26520250 ttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 329 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613239
Alignment:
Q  329 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 426  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| || | |||||  |||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttggg-aaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 26613342  T
Q  427 accattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaac 523  Q
     || ||||| ||||||| | || |||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| | | || ||||||||||||| |||    
T  26613341 ccctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaac 26613242  T
Q  524 aaa 526  Q
    |||    
T  26613241 aaa 26613239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 9241027 - 9240954
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  9241027 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacttcaagtttgttattggtgtgat 9240954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 16226522 - 16226587
Alignment:
Q  599 catacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16226522 catacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 16226587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 20302787 - 20302860
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20302787 aattgttccatacaccttgattttggttacttgattatctcttgctccagacatcaagttgttattggtgtgat 20302860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 25251214 - 25251141
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25251214 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 25251141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 50248510 - 50248437
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc-aagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  50248510 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaaatttgttattggtgtgat 50248437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 14097909 - 14097837
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14097909 aattgttccatacactttgattttggttgcttgattatctcttgcttcacacatcaagtttgttattggtgtg 14097837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 16429299 - 16429367
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16429299 ttccatacactttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 16429367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 51752715 - 51752786
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  51752715 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacat-aagttattattggtgtgat 51752786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 3579523 - 3579452
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3579523 aattgttccatacactttattttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 3579452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 593 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 6995631 - 6995560
Alignment:
Q  593 ttgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6995631 ttgttccatacactttgttttgattgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 6995560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 599 - 654
Target Start/End: Original strand, 28841033 - 28841088
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttat 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28841033 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccactcatcaagttgttat 28841088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 13215425 - 13215483
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13215425 aattgttccatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctccacacatcaagtt 13215483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 11457415 - 11457342
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11457415 aattgttccatatactttgttttggttgcctgattatcacttgcttcacacatcaagtttgttattggtgtgat 11457342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 16231917 - 16231982
Alignment:
Q  599 catacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16231917 catacactttgattttggttgcttgattatccgttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 16231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 47177708 - 47177781
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47177708 aattattccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 47177781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 28207006 - 28206934
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28207006 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 28206934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 489
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155950
Alignment:
Q  329 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 426  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  || |||||||| ||||||||||   | ||| | ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttggg-aaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaa 155886  T
Q  427 accattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccc 489  Q
     |  ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  155887 ccttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 155950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 173
Target Start/End: Original strand, 23783362 - 23783444
Alignment:
Q  90 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23783362 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 23783444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 27336878 - 27336819
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27336878 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtt 27336819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 47451972 - 47452027
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  47451972 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcgacacatcaa 47452027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 662
Target Start/End: Original strand, 15916734 - 15916800
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtga 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  15916734 ttccatacactttgttttggttgcttgattgttacttgctccacacatcaagtatttattggtgtga 15916800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 18307450 - 18307508
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  18307450 aattgttccatacactttgttttggttgcctaattatcatttgctccacacatcaagtt 18307508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 39462862 - 39462936
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39462862 aattgttccatacactttgattttgattgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 39462936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 13358927 - 13358992
Alignment:
Q  599 catacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13358927 catacactttgattttggttgcttgactatcccttactccacacatcaagttgttattggtgtgat 13358992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 17186067 - 17186014
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  17186067 ttccatacactttgttttggttgcttgactatcacttgctccacatatcaagtt 17186014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 18839929 - 18840002
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18839929 aattgttccatacactttgtttcgattacttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 18840002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 47180059 - 47180132
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47180059 aattattccatacgctttgattttgattgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 47180132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 12302445 - 12302373
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12302445 aattgttccatacactttgattttggtttcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 12302373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 14183542 - 14183490
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  14183542 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaagt 14183490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 406
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  329 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct-gagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 27339069 - 27339010
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27339069 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgttccacacatcaagtt 27339010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 50307483 - 50307424
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50307483 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccagacatcaagtt 50307424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 15823890 - 15823964
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15823890 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattaccccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgat 15823964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 649
Target Start/End: Original strand, 17324423 - 17324473
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17324423 catacactttgttatggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtt 17324473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 25248491 - 25248433
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  25248491 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgactattccttactccacacatcaagtt 25248433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 30738815 - 30738655
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-t 441  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||  || || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||| |||| |    
T  30738815 aaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatgtctctt 30738716  T
Q  442 ttgtaacgttactcatca---tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||| | | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  30738715 ttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggt 30738655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 30790337 - 30790288
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatca 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  30790337 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 30790288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 31424955 - 31424882
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31424955 aattgtcccatacattttgttatggttgcttgagtattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 31424882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 6115041 - 6114989
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6115041 ttccatacattttattttggttgcttgattatcactttctccacacatcaagt 6114989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13598454 - 13598402
Alignment:
Q  473 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  13598454 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 16124545 - 16124609
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  16124545 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Original strand, 40134288 - 40134343
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgat--tatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  40134288 ttccatacactttgttttggttgcctgattatatcacttgctccacacatcaagtt 40134343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704029
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401248
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 2401305  T
Q  446 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2401304 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggt 2401248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6115383 - 6115344
Alignment:
Q  224 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115383 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 8348991 - 8348925
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  8348991 ttccatacactttgttt-ggttgcttgattattacttgttccacacgtcaagtttttattggtgtgat 8348925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 600 - 643
Target Start/End: Original strand, 16429000 - 16429043
Alignment:
Q  600 atacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacat 643  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16429000 atacactttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacat 16429043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19072995 - 19072932
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19072995 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19120885 - 19120822
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19120885 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 229
Target Start/End: Original strand, 23783494 - 23783533
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783494 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 23783533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26613601 - 26613503
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 262  Q
    ||||||||||| |||| || ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26613601 atttgttccaatttttgagggattcttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttagaa 26613503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 28998190 - 28998129
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttt---tggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28998190 aattgttccatacactttgattctttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtt 28998129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 29003906 - 29003845
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttt---tggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29003906 aattgttccatacactttgattctttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtt 29003845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 642
Target Start/End: Original strand, 30780387 - 30780438
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacaca 642  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  30780387 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattattccttactccacaca 30780438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 47098854 - 47098917
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  47098854 tagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232658
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 646
Target Start/End: Original strand, 17319233 - 17319283
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  17319233 ttccatacactttgttttggttgtttgattattccttactccacacatcaa 17319283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 38925420 - 38925363
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttg--ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38925420 tgttccatacactttgatttttggttgcctgattatcacttactccacacatcaagtt 38925363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15295183 - 15295142
Alignment:
Q  193 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15295183 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 15295142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 525
Target Start/End: Original strand, 21536597 - 21536662
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  21536597 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 25860342 - 25860288
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25860342 aattgttccatacactttgttttgg----ttgactatcccttgctccacacatcaagtt 25860288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 525
Target Start/End: Original strand, 26644941 - 26644990
Alignment:
Q  476 gctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  26644941 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 29651879 - 29651818
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  29651879 atagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834167
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476265
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9476329 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13659380 - 13659336
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13659380 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 13659336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 17324572 - 17324500
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtga 662  Q
    |||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17324572 aattgttctattcactttgttatggctgcttgactatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtga 17324500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18800510 - 18800458
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  18800510 ttccatacactttgttttgattgcttgattattatttgctctacacatcaagt 18800458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 27104401 - 27104465
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  27104401 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaa 27104465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220226
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265554
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 468
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279489
Alignment:
Q  270 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgag-tcttt 368  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||   || ||||||||||||| |  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  369 ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagt 465  Q
    ||| |||| |||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||  |||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 28279486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526527
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 13127774 - 13127687
Alignment:
Q  441 tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||    
T  13127774 tttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaa 13127687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13127955 - 13127862
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 296  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||| || ||| |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  13127955 aaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47102934
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Original strand, 49687334 - 49687400
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 86  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  49687334 aatcgtggcatgatggctgggcaacgtggcacaattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactgga 49687400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 476 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 3281761 - 3281715
Alignment:
Q  476 gctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  3281761 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 26519373 - 26519328
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacaca 642  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26519373 ttccatacactttgttt-ggttgcttgattattacttgctccacaca 26519328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 31422799 - 31422741
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31422799 aattattccgtacactttattttagttgattgattattccttgctccacacatcaagtt 31422741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 38925965 - 38925915
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttt 69  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38925965 aatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt 38925915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 483 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 45644396 - 45644354
Alignment:
Q  483 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45644396 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 77
Target Start/End: Original strand, 47451438 - 47451495
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaa 77  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  47451438 aatcgtggcacgatggctgggcaatgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaa 47451495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 50076613 - 50076563
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacac 641  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||    
T  50076613 aattgttccatacactttgttttagttgctttattattcattgctccacac 50076563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 13125386 - 13125346
Alignment:
Q  607 ttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13125386 ttgttttggttgcttgattat-ttttgctccacacatcaagt 13125346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 13127616 - 13127576
Alignment:
Q  607 ttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13127616 ttgttttggttgcttgattat-ttttgctccacacatcaagt 13127576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 13449996 - 13449947
Alignment:
Q  80 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 129  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  13449996 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcg 13449947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 16432736 - 16432801
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc-aagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  16432736 catacactgtgttttgattgcctgattattacttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgat 16432801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 3156989 - 3157033
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3156989 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 3157033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4552681 - 4552637
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4552681 tctctccctcagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4552637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 10925350 - 10925394
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10925350 tctctcccctagattaggtaaagttggatcgaactgggtcaacaa 10925394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 242
Target Start/End: Original strand, 16431044 - 16431096
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 242  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16431044 acttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg 16431096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28223465 - 28223421
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28223465 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28223421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 31659362 - 31659406
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31659362 tctctccctcagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31659406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 661
Target Start/End: Original strand, 41647269 - 41647333
Alignment:
Q  599 catacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  41647269 catacactttgattttggttgtctgattatcacttgctccgcacatcaagtttgttattggtgtg 41647333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 526
Target Start/End: Original strand, 46783189 - 46783329
Alignment:
Q  389 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||| || ||||| ||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||    
T  46783189 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctc 46783288  T
Q  487 ccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||| || || ||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  46783289 ctccagagtaagtcaatattggatcgaactggataaacaaa 46783329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 205)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 38881878 - 38882385
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 119  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38881878 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggttttagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 38881977  T
Q  120 cgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38881978 cgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 38882077  T
Q  220 aagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  38882078 gagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactag 38882177  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38882178 ggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 38882276  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgg 517  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38882277 ttcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgg 38882376  T
Q  518 gtcaacaaa 526  Q
    |||||||||    
T  38882377 gtcaacaaa 38882385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 517
Target Start/End: Original strand, 4236386 - 4236900
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4236386 aaatcagatttctgcagaattgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttta-aggcaaggcactggaaaaatcgtggcacaa 4236484  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  4236485 tgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacgtatttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactata 4236583  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236584 aatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 4236683  T
Q  302 ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtaga 400  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4236684 tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaga 4236782  T
Q  401 attaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4236783 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggt 4236882  T
Q  500 aaatttggaccgaactgg 517  Q
     |||||||||||||||||    
T  4236883 caatttggaccgaactgg 4236900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 16775930 - 16776437
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775930 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtgacacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactgaaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 16776028  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaa-tatagaccttgtat 217  Q
    ||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16776029 acgatggtgcgctggcatcgaaaaacagaaacatatttttgagtgaagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaaatatagaccttgtat 16776128  T
Q  218 caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacacta 317  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16776129 ctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacacta 16776228  T
Q  318 gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactt 416  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776229 gggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 16776327  T
Q  417 attcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaact 515  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  16776328 attcttgt-aaccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaact 16776426  T
Q  516 gggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||    
T  16776427 gggtcaacaaa 16776437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 2174696 - 2175198
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||              
T  2174696 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaaaatc---------- 2174785  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaa 202  Q
               |||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  2174786 -----------gtggcacgatggtgcactggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataa 2174874  T
Q  203 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 302  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174875 atacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 2174974  T
Q  303 tcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaa 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2174975 tcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaa 2175073  T
Q  402 ttaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaa 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2175074 ttaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca 2175173  T
Q  502 atttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2175174 atttggaccgaactgggtcaacaaa 2175198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 25921976 - 25921472
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||             
T  25921976 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggttggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatc--------- 25921886  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
                |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  25921885 ------------gtggcacgatggtgcgctgacagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactata 25921798  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921797 aatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 25921698  T
Q  302 ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtaga 400  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  25921697 tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtaga 25921599  T
Q  401 attaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25921598 attaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggt 25921499  T
Q  500 aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  25921498 caatttggaccgaactgggtcaacaaa 25921472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 21947803 - 21948306
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||     |||||||||||||| | ||| ||||||    
T  21947803 aatcgtggcacgatggctaggcaacgtgacacgattggaggtttcagtttt-gaggtaagtcactggactttacgtggcacgatgggattgcaacgtggc 21947901  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    |||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21947902 acgatggtg---tggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 21947998  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21947999 agagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 21948097  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21948098 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagactta 21948196  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21948197 ttcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactg 21948296  T
Q  517 ggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||    
T  21948297 ggtcaacaaa 21948306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 31544814 - 31545360
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31544814 aaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 31544913  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtg----------------------caaatttgttccaaatt 180  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||| |||| |  || |||| |||||||||||||||||                      || ||||||| || |||    
T  31544914 ggggtctcatcgagacacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttattacagattttaagcagatttgttacagatt 31545013  T
Q  181 ttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 280  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545014 ttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 31545113  T
Q  281 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaa 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  31545114 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattagagtctcttggttacggga 31545212  T
Q  379 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggct 478  Q
    |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  31545213 agaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggct 31545312  T
Q  479 gctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  31545313 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 31545360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 78 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21684909 - 21684451
Alignment:
Q  78 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  21684909 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttacaa 21684810  T
Q  178 attttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 267  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21684809 attttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggca 21684710  T
Q  268 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct- 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  21684709 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttggg-atacactattaggattgagtctc 21684611  T
Q  367 ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtg 466  Q
    |||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21684610 ttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtg 21684511  T
Q  467 gatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21684510 gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 21684451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Original strand, 31542655 - 31543014
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 266  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542655 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 31542754  T
Q  267 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31542755 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtc 31542853  T
Q  366 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 464  Q
    | |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31542854 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatatag 31542952  T
Q  465 tggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  31542953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 31543014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 131 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2818731 - 2818334
Alignment:
Q  131 tggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt 230  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2818731 tggcagcgaataacaaaaacgtattttcgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttt 2818632  T
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtggg-t 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |    
T  2818631 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 2818532  T
Q  330 tgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 428  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  2818531 tgattcacctt-ggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 2818433  T
Q  429 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2818432 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 2818334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31179707 - 31179370
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179707 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31179608  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||     
T  31179607 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 31179509  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31179508 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 31179409  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  31179408 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 31179370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10529435 - 10529098
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10529435 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttat 10529336  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  10529335 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 10529237  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  10529236 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctcc 10529137  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10529136 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 10529098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 112 - 526
Target Start/End: Original strand, 6756359 - 6756772
Alignment:
Q  112 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||| |    
T  6756359 tcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttggtgcagatttattccaaattttaagttatacttttactattaatatagatc 6756458  T
Q  212 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 311  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6756459 ttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 6756558  T
Q  312 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6756559 acactagggtttgagggttgattctcctt-gggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggg 6756657  T
Q  411 agacttattcttgtaaaccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 508  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| ||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6756658 agacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgga 6756754  T
Q  509 ccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6756755 ccgaactgagtcaacaaa 6756772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 39854427 - 39854763
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854427 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 39854525  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||      
T  39854526 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactgga 39854624  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39854625 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 39854724  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39854725 cccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 39854763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18466964
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgg 18466724  T
Q  288 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 386  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctg 18466823  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  18466824 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctct 18466923  T
Q  486 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18466924 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 18466964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477052
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaaa 427  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  34477249 gattcaccttggg-aaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 34477151  T
Q  428 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34477150 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 34477052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479417
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaaa 427  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  34479614 gattcaccttggg-aaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 34479516  T
Q  428 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34479515 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 34479417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 27912473 - 27912816
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912473 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27912572  T
Q  284 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 382  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  27912573 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 27912671  T
Q  383 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  27912672 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgct 27912771  T
Q  482 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27912772 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 27912816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 112 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 36402741 - 36402327
Alignment:
Q  112 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36402741 tcgtggcacgatggtgcgttggcaacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttc-aaattttaagcgatacttttactataaatatagacc 36402643  T
Q  212 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 311  Q
    || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  36402642 ttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 36402543  T
Q  312 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||  ||  |||||||||| |||||||| ||    
T  36402542 acactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctgg 36402444  T
Q  411 agacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggac 509  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  36402443 agacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagat 36402344  T
Q  510 cgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||| ||||||||||    
T  36402343 cgaactaggtcaacaaa 36402327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745348
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6745152 gattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 6745250  T
Q  430 attgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6745251 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 6745348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 26097676 - 26098011
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26097676 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggat 26097775  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | |||| |    
T  26097776 agagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt--ggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctggg 26097873  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26097874 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctcc 26097972  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26097973 tccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaa 26098011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 18511539 - 18511211
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511539 aaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 18511440  T
Q  299 ctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggt 397  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||| |    
T  18511439 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggat 18511341  T
Q  398 agaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  18511340 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagacta 18511241  T
Q  497 ggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18511240 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 18511211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 231 - 522
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804300
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25804109 gattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 25804207  T
Q  430 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25804208 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 25804300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 27910388 - 27910730
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||      ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27910388 acttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 27910486  T
Q  284 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 382  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  27910487 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagag 27910585  T
Q  383 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 481  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  27910586 gctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgct 27910685  T
Q  482 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27910686 ctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 27910730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 6747247 - 6747584
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 287  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6747247 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgt 6747346  T
Q  288 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 386  Q
    ||| | |||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  6747347 ataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactg 6747444  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6747445 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctc 6747544  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6747545 tctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 6747584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 40221465 - 40221803
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40221465 acttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 40221564  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || |    
T  40221565 agagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 40221663  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||    
T  40221664 acttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 40221763  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40221764 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 40221803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 18468950 - 18469289
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468950 acttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18469049  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18469050 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 18469148  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |  || ||||||||    
T  18469149 tgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctct 18469248  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18469249 ct--cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaa 18469289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552525
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 428  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15552329 gattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 15552427  T
Q  429 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15552428 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 15552525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904383
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  |     
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattaggg 25904245  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | || | ||||||||||||    
T  25904246 ctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctccc 25904345  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25904346 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 25904383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189606
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||      
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc-actttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagat 1189751  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctc 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||    
T  1189750 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctc 1189651  T
Q  483 tctcc-cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1189650 tctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1189606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073164
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||  || |     
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattgggg 17073025  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||    
T  17073026 ctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcc 17073125  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17073126 cccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 17073164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31466389 - 31465988
Alignment:
Q  115 tggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttg 214  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31466389 tggcacgatggtgcactggcagggaataccataaatgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgacacttttactataaatatagaccttg 31466290  T
Q  215 tatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaaca 314  Q
    ||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31466289 tatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaca 31466190  T
Q  315 ctagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 413  Q
    | ||||||||  ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31466189 ccagggtttgacggttgattcacctt-gagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggaga 31466091  T
Q  414 cttattcttgtaaaccattgatttct-ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccga 512  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||          |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  31466090 c-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat----------agggctgctctcacccccagactagttcaatttggaccga 31466002  T
Q  513 actgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||||||    
T  31466001 actaggtcaacaaa 31465988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 193 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509317
Alignment:
Q  193 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggac 18509454  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttct-ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc 489  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||    
T  18509453 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccc 18509354  T
Q  490 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  18509353 tagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaa 18509317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 112 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 12556337 - 12555926
Alignment:
Q  112 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 211  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||  |||||||| || || ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12556337 tcgtggcacgatgatgcgctggcagcgaataacagaaatgtatttttgtgtacagatttgtttcaaaatttaagcgatacttttactataaatatagacc 12556238  T
Q  212 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 311  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  12556237 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaa 12556138  T
Q  312 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 410  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||  || || ||| ||||||||||| |  |    
T  12556137 acactaaggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattg-gagttttggtagaattagacaag 12556040  T
Q  411 agacttattcttgtaaaccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 508  Q
    |||||| |||||||||  |||||  || ||| |||||||||||||||||| || || | | | |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  12556039 agactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttgga 12555940  T
Q  509 ccgaactgggtcaa 522  Q
    | ||||||||||||    
T  12555939 ctgaactgggtcaa 12555926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127136
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||||||||  | ||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgacctt-gggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggga 24126998  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  24126999 ctttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24127098  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24127099 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 24127136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 194 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474322
Alignment:
Q  194 ttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 293  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  294 tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactt 392  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||  || |||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacacctt-gggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactt 10474457  T
Q  393 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccca 491  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  10474456 tgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccccca 10474357  T
Q  492 gactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10474356 tactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 10474322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 190 - 524
Target Start/End: Original strand, 18596590 - 18596924
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18596590 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtata--aagacaacaacaaaactagggtttgtat 18596687  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  18596688 agagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 18596786  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||    
T  18596787 actttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 18596886  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaaca 524  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18596887 ctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 18596924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 17818814 - 17818491
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 300  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17818814 aaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtct 17818716  T
Q  301 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 399  Q
    ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||||    
T  17818715 ctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttacctt-gggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtag 17818617  T
Q  400 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 498  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  17818616 aattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaactagg 17818519  T
Q  499 taaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17818518 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 17818491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092198
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| |||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16092395 gattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 16092297  T
Q  430 attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  16092296 attgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaa 16092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472611
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  || ||    
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga 31472750  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  31472749 cttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcc 31472650  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31472649 cccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 31472611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Original strand, 2954370 - 2954696
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 300  Q
    |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  2954370 aaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgtct 2954469  T
Q  301 cttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggta 398  Q
    ||| || || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  2954470 ctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgga-aaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggta 2954568  T
Q  399 gaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 498  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2954569 gaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactagg 2954668  T
Q  499 taaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2954669 tcaattttgaccgaactgggtcaacaaa 2954696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 10586782 - 10587112
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 286  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          
T  10586782 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag------ 10586875  T
Q  287 tatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
         |||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||      
T  10586876 -----agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagat 10586969  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 484  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10586970 tgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 10587069  T
Q  485 t-cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10587070 tccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 10587112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696158
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
              ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 696019  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  696020 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 696119  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  696120 cccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 696158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 37706116 - 37705779
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37706116 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtat 37706017  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||| |||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |  |    
T  37706016 agactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 37705918  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
      ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |  | ||||  |||||||    
T  37705917 gttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcc 37705818  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37705817 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 37705779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 269 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658355
Alignment:
Q  269 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-t 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| |    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgag-aaacactattaggatcgagtctct 658512  T
Q  368 tggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtg 466  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  658511 tggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 658412  T
Q  467 gatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     | | || |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  658411 aaacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 658355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 191 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39397996
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| |   | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  291 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||      
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgga 39398131  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||  || |||||||  | | || |||||||||||||    
T  39398130 actttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctcc 39398031  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39398030 cacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 39397996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 314 - 526
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410302
Alignment:
Q  314 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 412  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 4410188  T
Q  413 acttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccga 512  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  4410189 acttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  513 actgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaa 4410302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20507968 - 20507665
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||| |   |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||    ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  20507968 aatcgtggcacgatagttgggcaacgtagcacgattggaggttttagtttt-gaggcaagtcattggatttttcgtggcacgatgggattgcaacatggc 20507870  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    |||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20507869 acgaaggtgcgctagcagcgaataacagaaacatatttttgggagcagatttgttccaagatttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatc 20507770  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  20507769 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaag 20507670  T
Q  319 ggttt 323  Q
    |||||    
T  20507669 ggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 191 - 405
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 20043192  T
Q  390 ctttgggtagaattag 405  Q
    |||||| |||||||||    
T  20043193 ctttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530712
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  |  ||    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattagga 34530803  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggct 478  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  34530802 ctttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaagagagggct 34530712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749980
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 10749980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 191 - 409
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||  || ||    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattggga 20045152  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgg 409  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20045153 ctttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 326 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505842
Alignment:
Q  326 gggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 424  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506041 gggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  425 aaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaac 523  Q
    ||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Original strand, 21288718 - 21289041
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 300  Q
    |||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21288718 aaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtct 21288817  T
Q  301 cttcggaagaaacac------tagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagacttt 393  Q
    ||| |||| ||||||      ||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  |  ||||||    
T  21288818 ctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacctt--gaaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggacttt 21288915  T
Q  394 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccaga 493  Q
    || |||||||| |||||||| || |||||||||  ||      ||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  21288916 ggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactca------tct-tttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctcccccaga 21289008  T
Q  494 ctaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21289009 ctaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa 21289041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 323 - 526
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798327
Alignment:
Q  323 tgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 421  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 39798221  T
Q  422 tgtaaaccattgatttctctttg-taacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtc 520  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  39798222 tgtaacccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtc 39798321  T
Q  521 aacaaa 526  Q
    ||||||    
T  39798322 aacaaa 39798327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757456
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaa-gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaa 10757456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960131
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 38960131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 196 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661183
Alignment:
Q  196 actacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  296 tgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttg 394  Q
    ||| |||| | || ||||||||| |||   |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||   ||||| ||||    
T  6661413 tgt-tcttggcaacaaacactagagtt--ggggttgattcaccat-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttg 6661318  T
Q  395 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccag 492  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| | || | |||||||||||| |||    
T  6661317 ggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcag 6661218  T
Q  493 actaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  6661217 actaggtcagatttggaccgaactggataaacaaa 6661183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373136
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattga-gtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 3373136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354574
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 15354574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665323
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 23665323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793264
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 23793264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 314 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585743
Alignment:
Q  314 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 412  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||  || | |||||||||||||||||| ||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggag 41585858  T
Q  413 acttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 511  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41585857 acttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 41585758  T
Q  512 aactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||    
T  41585757 aactgggtcaacaaa 41585743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 190 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26098587 - 26098395
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26098587 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtat 26098488  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 382  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26098487 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagag 26098395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356850
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 15356850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 34477604 - 34477438
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcg 114  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477604 tgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcg 34477505  T
Q  115 tggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaatttt 182  Q
    ||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  34477504 tggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggtgcagatttgttacagatttt 34477438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 388 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 23741995 - 23741858
Alignment:
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  23741995 gactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttc 23741897  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  23741896 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 23741858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 310 - 526
Target Start/End: Original strand, 2723965 - 2724173
Alignment:
Q  310 aaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 408  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||         |||||||||||||    
T  2723965 aaacactagggtttgagggatgattcaccttggg-aaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg---------gtagaattaggcg 2724054  T
Q  409 ggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgg 507  Q
    || || |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  508 accgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaa 2724173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 39797865 - 39798058
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||          
T  39797865 aaatcaggtttctgcataatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcaccggaaaaatcatgg------ 39797958  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaa 202  Q
                   |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  39797959 ---------------cacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataa 39798043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 31542458 - 31542628
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542458 aaatcaggtttctgcaaaatcgtgacacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 31542557  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||| |||| |  || |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31542558 ggggtctcatcgagacacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgtt 31542628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208856
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||     
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-tag 36208620  T
Q  290 agag-tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    |||| ||| |||   ||| ||||||  |||||||  ||  ||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||| ||||| |||| |||||  |||    
T  36208621 agagatttctctaagcgggagaaac--tagggttgttg--ttgattcaccttggg-aaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattga 36208715  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcggg-agacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctc 484  Q
    |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | | | ||||||||||     
T  36208716 gactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctt 36208815  T
Q  485 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36208816 tcccc-atactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaa 36208856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 10749521 - 10749690
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749521 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 10749620  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10749621 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 10749690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 10756976 - 10757145
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||| |||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10756976 aaatcaggtttctgcacaatcgtagcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 10757075  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10757076 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 10757145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15355049 - 15354880
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355049 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 15354950  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15354949 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 15354880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15357325 - 15357156
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357325 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 15357226  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15357225 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 15357156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 34479956 - 34479855
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479956 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 34479857  T
Q  103 gg 104  Q
    ||    
T  34479856 gg 34479855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 287
Target Start/End: Original strand, 4410000 - 4410101
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410000 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4410099  T
Q  286 gt 287  Q
    ||    
T  4410100 gt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413198
Alignment:
Q  247 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 346  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||||||| ||||||| ||    
T  17413441 aaacaagggtttagaa-ggcagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggg-aa 17413349  T
Q  347 acactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaaaccattgatttctcttt- 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||  ||||||||| ||||||||||||   || | ||||||||||||| || ||||| |||||||     
T  17413348 acactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 17413249  T
Q  444 gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccaga 493  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17413248 gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccaga 17413198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 25804370 - 25804442
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25804370 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 25804442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 38882434 - 38882506
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38882434 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 38882506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 487
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020460
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| | | |||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttggga-ggcaaca-caaaagtagggtttgtat 9020264  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||   ||||| | || |||||||||||||   |  ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||  ||      
T  9020265 agagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgga-aaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattgga 9020359  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  9020360 gctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctc 9020459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31179897 - 31179807
Alignment:
Q  44 cgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31179897 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaagacactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 31179807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 4236974 - 4237046
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4236974 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgcttcacacatcaagttgttattggtgtgat 4237046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 234 - 526
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054117
Alignment:
Q  234 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgat 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | || |||||||||||||    |||||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttag-aaggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gaggttgat 20053929  T
Q  334 tctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccatt 432  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||       |||  || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||       
T  20053930 tcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtt-----tggagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc--- 20054020  T
Q  433 gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || | || ||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||||| || ||||||    
T  20054021 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaa 20054117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 23664850 - 23665019
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23664850 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 23664949  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23664950 gggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 23665019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 23667125 - 23667294
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23667125 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 23667224  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23667225 gggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 23667294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23793737 - 23793568
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23793737 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 23793638  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23793637 gggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 23793568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 21684385 - 21684313
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21684385 aattgttccatacactttgttttgattgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 21684313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667598
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||| ||||||| | ||| ||| |||| |||||||  || ||||||||  |||||||||||  | ||| || |||| || ||||||||||||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||    
T  23667514 ttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaa 23667598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 25921406 - 25921334
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25921406 aattgttccatacactttattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 25921334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Original strand, 2175247 - 2175318
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtga 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2175247 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtga 2175318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Original strand, 659746 - 659829
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  659746 aatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttt--gaggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatgg 659829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 34476986 - 34476913
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34476986 aattgttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 34476913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 34479351 - 34479278
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34479351 aattgttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 34479278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 41585673 - 41585600
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41585673 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgccccacacatcaagtttgttattggtgtgat 41585600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 38960056 - 38959992
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38960056 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 38959992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 31179305 - 31179233
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31179305 aattattccatacactttgttttggttgcttaattatcccttgctccatacatcaagttgttattggtgtgat 31179233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 39798384 - 39798448
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39798384 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaaattgttattggtgtgat 39798448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 17818428 - 17818357
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17818428 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 17818357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 659929 - 659850
Alignment:
Q  42 aacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacga 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  659929 aacgtggcacgattggaggtttcagttt--gaggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatgaggtcgcattgtggcacga 659850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 26098224 - 26098166
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26098224 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtt 26098166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 441 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26098373 - 26098287
Alignment:
Q  441 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc-ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26098373 tttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 26098287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 2724234 - 2724307
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||    
T  2724234 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctatacacatcaagtttgttattggtgtgat 2724307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 3373070 - 3372997
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3373070 aattgttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 3372997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10529031 - 10528958
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10529031 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgcttcacacatcaagttgttattggtgtgat 10528958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 10750045 - 10750118
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10750045 aattgttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 10750118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 10757521 - 10757594
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10757521 aattgttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 10757594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Original strand, 18469360 - 18469413
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18469360 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtt 18469413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 34530652 - 34530579
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  34530652 aattgttccatacgctttgttttggttgcttgattatcacttgctcgacacatcaagtttgttattggtgtgat 34530579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 38960588 - 38960487
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||   | |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960588 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggctttgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 38960489  T
Q  103 gg 104  Q
    ||    
T  38960488 gg 38960487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 40221870 - 40221943
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40221870 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcctttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 40221943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 385 - 461
Target Start/End: Original strand, 42770948 - 42771025
Alignment:
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcata 461  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  42770948 tgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 10587166 - 10587233
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10587166 ttccatacactttgttttggttgcttgattatc-cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 10587233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 18467035 - 18467103
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18467035 ttccatacactttgttttgattgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattagtgtgat 18467103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 31543088 - 31543152
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31543088 catacgctttgttttggttgcttgattaacccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 31543152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41586042 - 41585946
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 286  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  41586042 acttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 4410373 - 4410439
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4410373 ttccatacacctt-ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 4410439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 26098072 - 26098127
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26098072 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaa 26098127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 10474261 - 10474203
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10474261 aattgttccatacactttgttttggttacttgattattccttgctccacacatcaagtt 10474203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 20045327 - 20045385
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  20045327 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcatttgcttcacacatcaagtt 20045385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 36208914 - 36208972
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36208914 aattgttctatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctctacacatcaagtt 36208972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Original strand, 21289105 - 21289158
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21289105 ttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtt 21289158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Original strand, 27912887 - 27912940
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27912887 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagtt 27912940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 6747647 - 6747721
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgt---tttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  6747647 aattgttccatacactttgtgtttttggttgcttgattatctcttgctctacacatcaagtttgttattggtgtg 6747721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 15354502 - 15354434
Alignment:
Q  596 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15354502 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 15354434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 15356778 - 15356710
Alignment:
Q  596 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15356778 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 15356710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 23665396 - 23665464
Alignment:
Q  596 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23665396 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 23665464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 23741785 - 23741717
Alignment:
Q  596 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23741785 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 23741717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 23793191 - 23793123
Alignment:
Q  596 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23793191 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 23793123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 499
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897983
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttg 444  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  445 taacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggt 4897983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 17073228 - 17073283
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17073228 aattgttccatacactttgttttagttgcttgatcatcacttgctccacacatcaa 17073283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 1189545 - 1189487
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1189545 aattgttccatacattttgttttggtggcttgattattccttgctccacacatcaagtt 1189487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 6756833 - 6756891
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6756833 aattgtttcatacactttgttttgattgcctgattatcacttgctccacacatcaagtt 6756891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 18511149 - 18511091
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18511149 aattgtttcatacactttgttttagttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtt 18511091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 21948373 - 21948446
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt--ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21948373 aattgttccatacactttattttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 21948446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 36402264 - 36402190
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36402264 aattgttctatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 36402190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 2144840 - 2144599
Alignment:
Q  247 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa-acactagggtttgtgggttgattctccttgggga 345  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | || || ||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||    
T  2144840 aaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggaga 2144747  T
Q  346 aacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag-actttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattg-atttctct 441  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||  | || ||||||||| ||||||||   || |||| |||||||||| |  ||  || |||||    
T  2144746 aacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctct 2144647  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  2144646 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 2818813 - 2818729
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    ||||||||||||||    
T  2818813 aatcgtggcacgatggctaggcaacatggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatgg 2818729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3373377 - 3373332
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373377 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 16776501 - 16776574
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16776501 aattgtttcatacactttgttttgattgcctgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 16776574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 592 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 658295 - 658223
Alignment:
Q  592 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc-aagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  658295 attgttccgtacactttgttttggttgcctgattattccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgat 658223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170965
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 1170906  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1170907 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 1170965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 6745411 - 6745485
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt---ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6745411 aattgttccatacactttgtttttttggctgcttgactatctcttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 6745485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 12555851 - 12555779
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc-aagttgttattcgtgtga 662  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12555851 aattgtttcatacactttattttggttgcttgattattccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtga 12555779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 499
Target Start/End: Original strand, 15143560 - 15143720
Alignment:
Q  343 ggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctc 440  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  |  || ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  15143560 ggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctc 15143659  T
Q  441 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||| | | | |||||| ||||||| |||||||||    
T  15143660 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggt 15143720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 15552600 - 15552664
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15552600 catacactttgttttagttgcttgattatcccttacttcacgcatcaagttgttattggtgtgat 15552664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 23665081 - 23665125
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665081 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23665125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23793506 - 23793462
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793506 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 27910784 - 27910852
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc-aagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  27910784 ttccatacactttattttggttgattgattatcccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgat 27910852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Original strand, 696218 - 696273
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttgttttggttg-cttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696218 tgttccatacactttattttggttttcttgattatctcttgctccacacatcaagt 696273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 2954756 - 2954811
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  2954756 aattgttccatacactttgttttggttgtctgattatcacttactccacacatcaa 2954811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 20043330 - 20043389
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttga-ttatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20043330 aattgttccatacactttgttttggctgcttgatttatcacttgctccacaaatcaagtt 20043389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 499
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22672989
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 22672932  T
Q  446 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22672933 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 22672989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 37705720 - 37705649
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37705720 aattattccatatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 37705649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 6661124 - 6661074
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6661124 ttccatacactttattttggttgcttgattattacttgctccacacatcaa 6661074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 18509255 - 18509201
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatca 645  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  18509255 aattgtttcatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctccacacatca 18509201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385479
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 35385539  T
Q  443 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35385538 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 35385479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 415
Target Start/End: Original strand, 42770717 - 42770934
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||| ||    
T  42770717 acttttactataaatataaactttgtatcga-gtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaattagg-tttata 42770812  T
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    |||| |||| ||||| | || |||||||| |||| |  |||| |||| || |||| ||   ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||  |||    
T  42770813 tagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaa---ctattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattga 42770906  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagact 415  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770907 gactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15354818 - 15354777
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354818 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15357094 - 15357053
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357094 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15357053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 18596986 - 18597059
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  18596986 aattgttccatacactttattttggatgtctgattatcacttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgat 18597059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 648
Target Start/End: Original strand, 20054182 - 20054231
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  20054182 catacactttgttttggttgcttgattattacttgctctacacatcaagt 20054231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 2818271 - 2818199
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  2818271 aattgttccatacactttgattttggatgcctgattatcccttgctccatacatcaagtttgttattggtgtg 2818199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353425
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9353361 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 526
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043270
Alignment:
Q  478 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaa 20043270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20504419 - 20504316
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || ||||    ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  20504419 aatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgattggaggttttag-ttttgaggcaagtcaatggatttttcgtggcacgatgggattgcaacgtggc 20504321  T
Q  119 acgat 123  Q
    |||||    
T  20504320 acgat 20504316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 20505783 - 20505709
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg---ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20505783 aattgttccatacactttgattttttggttgcctgattattacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 20505709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 23667356 - 23667400
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667356 actttaactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23667400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23742101 - 23742057
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23742101 acttttactataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 23742057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932443
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  36932379 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38960378 - 38960334
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38960378 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 38960334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18186559 - 18186489
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 85  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18186559 tgcagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactgg 18186489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 499
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452650
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| |  ||   || |||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgt 25452593  T
Q  446 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25452594 aaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggt 25452650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 25904444 - 25904499
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  25904444 aattgttccatacactttgttttcattgcttgactatcccttgcaccacacatcaa 25904499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28832326 - 28832263
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  28832326 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 228
Target Start/End: Original strand, 10757207 - 10757245
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaact 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757207 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 10757245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 31465927 - 31465853
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc-aagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||| |||||||||| || |||||||| |||||||    
T  31465927 aattgttccatacactttgattttggttgcttaattattccttgttccacacatcaaatttgttattggtgtgat 31465853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 525
Target Start/End: Original strand, 11917000 - 11917065
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  11917000 tatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 525
Target Start/End: Original strand, 17004004 - 17004053
Alignment:
Q  476 gctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  17004004 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 499
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445651
Alignment:
Q  350 ctattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaa 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| |||||||| |  ||   || |||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgtaa 25445596  T
Q  448 cgttactcat--cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
     |  ||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25445597 agaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 25445651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 31466463 - 31466391
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatc 92  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  31466463 aatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatgagatgtttcagttat-gaggcaagtcactggaaaaatc 31466391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10281819 - 10281755
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  10281819 atagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15464600 - 15464536
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  15464600 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806531
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Original strand, 29748261 - 29748313
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29748261 atttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttgtatca 29748313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 31545437 - 31545501
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31545437 catacgctttattttaattgcttgattaacccttactccacacatcaagttgttattggtgtgat 31545501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32636992
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34477431 - 34477379
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34477431 atttgttacagattttaagcgagacttttactataaaaatagaccttgtatca 34477379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962554
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 17841315 - 17841276
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17841315 tatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggt 17841276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 39854827 - 39854886
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt-ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  39854827 aattgttccatacactttatttttggttgcttaactatcccttgctccacatatcaagtt 39854886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 16092137 - 16092080
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||    
T  16092137 aattgttccatatactttgttt-ggttgcttgactatccattgctccacatatcaagtt 16092080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 24127197 - 24127271
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttg-gttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24127197 aattgtttcatacactttgttttttgttgtctgattatcccttgctccacacattaagtttgttatttgtgtgat 24127271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 227
Target Start/End: Original strand, 10749730 - 10749767
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaac 227  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10749730 acttttagtataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 10749767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 480 - 525
Target Start/End: Original strand, 31300644 - 31300689
Alignment:
Q  480 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  31300644 ctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 129
Target Start/End: Original strand, 39854317 - 39854366
Alignment:
Q  80 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 129  Q
    |||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  39854317 cactggaaaaatcgtgtcacggttgaatcgcatcgtggcacgatggtgcg 39854366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 129
Target Start/End: Original strand, 42238047 - 42238096
Alignment:
Q  80 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  42238047 cactggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcg 42238096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 533893 - 533937
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  533893 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 533937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 128
Target Start/End: Original strand, 1240171 - 1240219
Alignment:
Q  80 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgc 128  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  1240171 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgc 1240219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 136
Target Start/End: Original strand, 4409890 - 4409946
Alignment:
Q  80 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcag 136  Q
    |||||||||||||||| ||| || || ||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4409890 cactggaaaaatcgtgccacaattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgatggcag 4409946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19588814 - 19588750
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  19588814 atagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaa 19588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 21684953 - 21684905
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcac 51  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21684953 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 21684905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34479792 - 34479740
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34479792 atttgttacagattttaagcgagacctttactataaaaatagaccttgtatca 34479740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 42428474 - 42428430
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42428474 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 42428430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 141)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 27829126 - 27829632
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 119  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27829126 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttgaggcaaaacactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggca 27829225  T
Q  120 cgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27829226 cgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatca 27829325  T
Q  220 aagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagg 319  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27829326 gagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg 27829425  T
Q  320 gtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 418  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27829426 gtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttat 27829524  T
Q  419 tcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactggg 518  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27829525 tcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 27829624  T
Q  519 tcaacaaa 526  Q
    ||||||||    
T  27829625 tcaacaaa 27829632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 27826815 - 27827321
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 119  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27826815 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttgaagcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggca 27826914  T
Q  120 cgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27826915 cgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatca 27827014  T
Q  220 aagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagg 319  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27827015 gagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg 27827114  T
Q  320 gtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 418  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27827115 gtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttat 27827213  T
Q  419 tcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactggg 518  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27827214 tcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactggg 27827313  T
Q  519 tcaacaaa 526  Q
    ||||||||    
T  27827314 tcaacaaa 27827321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 14807564 - 14808097
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14807564 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcatgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacga 14807662  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14807663 tggggtcgcatcgtggcacggtggtgcgctggcagcgaaaaacataaacgtatttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactata 14807761  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807762 aatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 14807861  T
Q  302 ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtaga 400  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14807862 tttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaga 14807960  T
Q  401 attaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg----------ctctctcccc 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||          ||||||||||    
T  14807961 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccctctctcccc 14808060  T
Q  490 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14808061 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14808097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 15067810 - 15068317
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||    
T  15067810 aatcgtggcaagatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaagcaagccactggaaaaatcatgccacgatgggatcgcaacgtggc 15067908  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15067909 acgatggtgcgctggcagcgaataacaaaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatc 15068008  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15068009 aacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 15068108  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    |||||| ||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15068109 ggtttgagggttaattcacctt-gggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagactta 15068207  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15068208 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactg 15068307  T
Q  517 ggtcaacaaa 526  Q
    || |||||||    
T  15068308 ggccaacaaa 15068317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 15072539 - 15073047
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  15072539 aatcgtgacacgatggctgggcaacgtgacacgattggaggtttcagtttt-gaagcaagccactagaaaaatcgtgtcacgatgggatcgcaacgtggc 15072637  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15072638 atgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 15072737  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15072738 agactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 15072837  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaaga-ggctgagactttgggtagaattaggcgggagactt 416  Q
    |||||  |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15072838 ggttttagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagattt 15072936  T
Q  417 attcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaact 515  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15072937 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaact 15073036  T
Q  516 gggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||    
T  15073037 gggtcaacaaa 15073047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Original strand, 44720686 - 44721179
Alignment:
Q  54 tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacata 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  44720686 tggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaa-aacagaaacata 44720783  T
Q  154 tttttgggtg----------------------caaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 231  Q
    ||||||||||                      || ||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44720784 tttttgggtgcagatttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttg 44720883  T
Q  232 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44720884 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 44720983  T
Q  332 attctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacca 430  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44720984 attcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 44721083  T
Q  431 ttgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44721084 ttgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 44721179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 90 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28252002 - 28251566
Alignment:
Q  90 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaa 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  28252002 atcgtggcacgatgggatcgcatcgtggtacgatggtgcgttggcagcgaaaaacagaaacgtatttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgat 28251904  T
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28251903 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 28251804  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  28251803 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 28251705  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28251704 actttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 28251605  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28251604 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28251566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 18810499 - 18811043
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18810499 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttatttttttaggcaaggcactggaaaaattgcggcacgat 18810598  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttcca----------------------aatt 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||                      ||||    
T  18810599 ggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacacatttttgggtgcagatttgttacagattttgagcagatttgttacaaatt 18810697  T
Q  181 ttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 280  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810698 ttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 18810797  T
Q  281 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18810798 ggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 18810896  T
Q  380 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 479  Q
     |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18810897 taggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctg 18810996  T
Q  480 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18810997 ctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaa 18811043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 111 - 526
Target Start/End: Original strand, 4423938 - 4424354
Alignment:
Q  111 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4423938 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaatagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatacagac 4424037  T
Q  211 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaga 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  4424038 cttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaaca 4424137  T
Q  311 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||   |||||| |||||||||||||    
T  4424138 aacactagggtttgtgggttgattcaccgt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgg 4424236  T
Q  410 gagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 508  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4424237 gagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 4424336  T
Q  509 ccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4424337 ccgaactgggtcaacaaa 4424354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 18812684 - 18813217
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18812684 aaatcaggtttctgaagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 18812783  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtg----------------------caaatttgttccaaatt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | |||||||||||||||||                      || ||||||| ||||||    
T  18812784 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttgagcagatttgttacaaatt 18812882  T
Q  181 ttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 280  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18812883 ttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 18812982  T
Q  281 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaa 379  Q
               ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  18812983 -----------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaa 18813070  T
Q  380 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18813071 gaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctg 18813170  T
Q  480 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18813171 ctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 18813217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 3874005 - 3874346
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  3874005 acttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagttt 3874104  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  3874105 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggc 3874203  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3874204 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 3874303  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3874304 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3874346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 15809214 - 15809554
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809214 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 15809313  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |    
T  15809314 gtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaac 15809411  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809412 taggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 15809511  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15809512 cttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 15809554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 32339304 - 32339645
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339304 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 32339403  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||      
T  32339404 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 32339502  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32339503 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 32339602  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32339603 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaa 32339645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Original strand, 608736 - 609070
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 292  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  608736 aaatatagaccttatatcatagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtataga 608835  T
Q  293 gtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagact 391  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  608836 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggact 608934  T
Q  392 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccc 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  608935 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 609034  T
Q  491 agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  609035 agactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 609070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22685002 - 22684652
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 279  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22685002 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 22684903  T
Q  280 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 378  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22684902 gggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 22684804  T
Q  379 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc---attgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagag 474  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22684803 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggag 22684704  T
Q  475 ggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22684703 ggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22684652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106896
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtga 27107034  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||     
T  27107033 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcct 27106934  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27106933 ccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 27106896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 239 - 526
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079938
Alignment:
Q  239 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  339 ttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatt 436  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43079750 ttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 43079848  T
Q  437 tctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  43079849 tctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 43079938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12517532 - 12517248
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12517532 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaatgtactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggc 12517434  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  12517433 acgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactatatatatataccttgtatc 12517334  T
Q  219 aaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 302  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517333 agagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 140 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14419578 - 14419189
Alignment:
Q  140 ataacataaacatatttttggg-tgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 238  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| || | || || |||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||    
T  14419578 ataacagaaacatatttttgggctgagattttgttccaatttatgagtgatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga 14419479  T
Q  239 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  14419478 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcacc 14419379  T
Q  339 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 437  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  14419378 tt-gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatat 14419280  T
Q  438 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     || ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14419279 gtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14419189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082309
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 428  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43082113 gattcaccttggg-aaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacc 43082211  T
Q  429 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  43082212 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 43082309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28283561 - 28283220
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28283561 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 28283462  T
Q  284 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 382  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  28283461 ttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagag 28283363  T
Q  383 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 482  Q
      || | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28283362 attggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 28283263  T
Q  483 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28283262 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28283220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 24873523 - 24873180
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873523 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 24873424  T
Q  284 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaaga 381  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24873423 ttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacggaaaga 24873325  T
Q  382 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 481  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24873324 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 24873225  T
Q  482 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||||||| || |||||||||    
T  24873224 ctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaa 24873180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480502
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||     
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagg 30480640  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |   || ||||||||||||||    
T  30480639 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctccc 30480540  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30480539 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 30480502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 143 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 13858868 - 13858483
Alignment:
Q  143 acataaacatatttttggg-tgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || | || || |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  13858868 acataaacatatttttgggctgagattttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 13858769  T
Q  242 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttg 341  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  13858768 ggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt- 13858670  T
Q  342 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| || ||||    
T  13858669 gggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctc 13858571  T
Q  441 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13858570 ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaa 13858483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 190 - 522
Target Start/End: Original strand, 27911014 - 27911345
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27911014 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtat 27911112  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  27911113 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 27911211  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |    
T  27911212 actttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-c 27911310  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27911311 cccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaa 27911345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 190 - 522
Target Start/End: Original strand, 27957433 - 27957764
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27957433 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtat 27957531  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  27957532 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 27957630  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |    
T  27957631 actttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-c 27957729  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27957730 cccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaa 27957764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 1225165 - 1225503
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1225165 acttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 1225264  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  1225265 agagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 1225363  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||    
T  1225364 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctc 1225463  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1225464 cctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 1225503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 41384744 - 41385080
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41384744 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41384842  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||      
T  41384843 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-gggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 41384941  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41384942 gctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 41385041  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41385042 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 41385080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 43530123 - 43530451
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                 
T  43530123 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac------------- 43530209  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggc 384  Q
    || ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  43530210 gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggc 43530308  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  43530309 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgt 43530408  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43530409 ctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 43530451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865873
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtctttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
    ||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| |||||  ||  ||    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctct--tcacgggaagagattggaac 36865734  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||  |||||||||||||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctccc 36865834  T
Q  489 cc-agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36865835 ccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaa 36865873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952857
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattaggg-ttgtata 25952619  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
     |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||   |||||    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgaga 25952718  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25952719 cattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 25952818  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25952819 cccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaa 25952857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 191 - 435
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477520
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
     |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 14477474  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgat 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477475 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 41382672 - 41382998
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41382672 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41382771  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||            |||| |||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  41382772 agaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct------------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattggg 41382859  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41382860 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 41382959  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41382960 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 41382998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372179
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||  | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  || ||    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggga 5372315  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct-c 486  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||| | |||||| |    
T  5372314 ctttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctcc 5372215  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5372214 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaa 5372179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541413
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  || ||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt-gggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattggga 33541525  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||| ||||||||||||                      ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  33541524 cttttggtagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctccc 33541447  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33541446 ccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaa 33541413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 111 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3886336 - 3886153
Alignment:
Q  111 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatattttt---gggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatata 207  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3886336 atcgtggtacgatggtgtgctggcagcgaataacagaaacatattttttttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatata 3886237  T
Q  208 gaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886236 gactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 15186046 - 15185713
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| |||    
T  15186046 acttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatat 15185947  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct---ttggttacggaaagaggctg 386  Q
    | |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||        
T  15185946 aaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagag---- 15185852  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctc 484  Q
        |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| | | |||| ||| ||||    
T  15185851 ---atttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctc 15185755  T
Q  485 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15185754 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 15185713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482647
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 21482413  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
     |||||| ||||| | || |||||||||||||   ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||  || |     
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttggg-aaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattgggg 21482508  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||  | | | ||||||||||||||||    
T  21482509 ctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcc 21482608  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21482609 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaa 21482647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 366
Target Start/End: Original strand, 26775200 - 26775375
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26775200 acttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtat 26775299  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct 366  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||||    
T  26775300 atagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctt-ggaaaacactattagaattgagtct 26775375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 224 - 519
Target Start/End: Original strand, 21480547 - 21480832
Alignment:
Q  224 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggttt 323  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| ||     
T  21480547 aaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt- 21480636  T
Q  324 gtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 422  Q
      |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||   || |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21480637 --gggttgattcaccttggg-aaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattctt 21480733  T
Q  423 gtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggt 519  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21480734 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 147 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5623117 - 5622882
Alignment:
Q  147 aaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg 246  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| || | || ||  ||||||||| ||||||||   |||||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  5623117 aaacatatttttgggcctaattttgttccaatttatgagtgattcttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctg 5623018  T
Q  247 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||    
T  5623017 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt-tggaa 5622919  T
Q  347 acactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 382  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  5622918 acattatttggattgagtctcttgattacgggaagag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 31162212 - 31162549
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaa-caacaaaactagggtttgt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||||    
T  31162212 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caagcaacaaat-tagtgtttgt 31162308  T
Q  288 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 386  Q
    ||| |||||| ||||| | || ||||||||  ||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||  ||    
T  31162309 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgttag--ggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattg 31162404  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctc 484  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  31162405 ggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctc 31162504  T
Q  485 t--cccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |  |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  31162505 tcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 31162549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 224 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3005929 - 3005629
Alignment:
Q  224 aaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtt 322  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||    
T  3005929 aaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt 3005833  T
Q  323 tgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 421  Q
       || ||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3005832 ---ggattgattcactttgga-aaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 3005737  T
Q  422 tgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactggg 518  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  3005736 tgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactggg 3005637  T
Q  519 tcaacaaa 526  Q
    | ||||||    
T  3005636 taaacaaa 3005629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 281 - 526
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956294
Alignment:
Q  281 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaa 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggg-aaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaa 15956145  T
Q  380 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggc 477  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||     
T  15956146 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggt 15956245  T
Q  478 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15956246 ttctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaa 15956294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 43079363 - 43079494
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43079363 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggtacgat 43079462  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  43079463 ggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 43079494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2468511 - 2468361
Alignment:
Q  113 cgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacct 212  Q
    ||||||||||||||||| |||  || ||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2468511 cgtggcacgatggtgcgctggatgcgaataacagaaacgtattttttagtgcagatttgttccaaatgttaagcgatacttttactataaatatagacct 2468412  T
Q  213 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 263  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2468411 tgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttagaaa 2468361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872555
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtata 35872619  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactatta 355  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 43081738 - 43081861
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081738 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaaagtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 43081837  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggt 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  43081838 ggggtctcatcgtggcacgatggt 43081861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 43530517 - 43530589
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43530517 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 43530589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 326 - 526
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035457
Alignment:
Q  326 gggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttg 423  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||| || | |||||  ||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttggg-aaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttg 31035350  T
Q  424 taaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagacta--ggtaaat-ttggaccgaactgggt 519  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||||    
T  31035351 taaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  520 caacaaa 526  Q
     ||||||    
T  31035451 aaacaaa 31035457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 314 - 490
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181799
Alignment:
Q  314 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactatt-aggattgagtct-ttggttacg--gaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 409  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||  | |||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttggg-aaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgg 181720  T
Q  410 gagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccc 490  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||| | ||||||||||||||    
T  181721 aagacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatgactgctctctccccc 181799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 286
Target Start/End: Original strand, 181536 - 181632
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 286  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  181536 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 3874395 - 3874467
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3874395 aattgttccatacactttgttttggttgcttggttatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 3874467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 18811109 - 18811182
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18811109 aattgttccatacactttgattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 18811182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 15809620 - 15809692
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15809620 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 15809692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 397 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468128
Alignment:
Q  397 tagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagac 494  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  495 taggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaa 2468128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 3883528 - 3883464
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttatt 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3883528 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagttgttatt 3883464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 28251503 - 28251431
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28251503 aattgttccatacactttgttttggttgcctgattattccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 28251431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 28283146 - 28283082
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28283146 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 28283082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37214512 - 37214374
Alignment:
Q  224 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagagtttgtctcttc 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||     
T  37214512 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctcttt 37214413  T
Q  305 ggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggg 343  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37214412 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg 37214374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 44721245 - 44721317
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44721245 aattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagttgttattggtgtgat 44721317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 36865936 - 36865994
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36865936 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtt 36865994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 4424420 - 4424493
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt-ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4424420 aattgttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacaccaagttgttattggtgtgat 4424493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 18813283 - 18813356
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  18813283 aattgttccatacactttgattttggttgcttgattatctcttgctctacatatcaagttgttattggtgtgat 18813356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 27827387 - 27827460
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27827387 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 27827460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 27829698 - 27829771
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27829698 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 27829771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 32339711 - 32339784
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32339711 aattgttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgccccacacatcaagttgttattggtgtgat 32339784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 43082383 - 43082447
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43082383 catacactttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 43082447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 41383061 - 41383132
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41383061 aattgttccataaactttgttttgattgcttgattatctcttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 41383132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28252093 - 28252008
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28252093 aatcgtggcacgatggctaggcaacgtggtacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatggg 28252008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Original strand, 31035029 - 31035238
Alignment:
Q  152 tatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga--tagagggggctgaa 248  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| |||| || || | |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||| |  |||||    
T  31035029 tatttttgggctcagatttgttccaattttttag-gatatttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagt-ctgaa 31035126  T
Q  249 a-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaa 347  Q
    | ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   || ||||||| |||| ||||||    
T  31035127 aacaatggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcacctt-gggaaa 31035221  T
Q  348 cactattaggattgagt 364  Q
    ||| |||||||||||||    
T  31035222 caccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 13858422 - 13858369
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13858422 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtt 13858369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 14808158 - 14808231
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14808158 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatccgttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 14808231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 15073109 - 15073182
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15073109 aattgttccatacactttgttttgattgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 15073182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22684586 - 22684513
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22684586 aattgttccataaactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 22684513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 43080012 - 43080076
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43080012 catacactttgttttggttgcttaattatccattgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 43080076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 655
Target Start/End: Original strand, 609137 - 609203
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt--ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttatt 655  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  609137 aattgtttcatacactttgttttttggttgcttgattatctcttgctccacgcatcaagttgttatt 609203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 3886412 - 3886330
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagt-ttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtgg 96  Q
    |||| ||||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3886412 tgcagaatcgtgacatgatggctggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaagacactggaaaaatcgtgg 3886330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 15068379 - 15068437
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  15068379 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgttccacacatcaagtt 15068437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 27106835 - 27106769
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27106835 ttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 27106769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578275
Alignment:
Q  329 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 426  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| | || |||||  || |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttggg-aaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 31578378  T
Q  427 accattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaac 523  Q
     |  ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||||||||| |||    
T  31578377 ccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaac 31578278  T
Q  524 aaa 526  Q
    |||    
T  31578277 aaa 31578275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Original strand, 4423868 - 4423952
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 104  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423868 aatcgtggcacaattgctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagtttta-aggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 4423952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 24873124 - 24873059
Alignment:
Q  599 catacactttgtttt-ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24873124 catacactttgtttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 24873059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 33541348 - 33541275
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33541348 aattgttccatacactttattttgattgcttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgat 33541275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 592 - 663
Target Start/End: Original strand, 14477648 - 14477720
Alignment:
Q  592 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14477648 attgtttcatacactttgttttggttgtctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 14477720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 14419128 - 14419057
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  14419128 aattgttccatacactttgttttggtttcctgattatcacttgctccatacatcaagtttgttattggtgtg 14419057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 30480441 - 30480386
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  30480441 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttactccacacatcaa 30480386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 37214202 - 37214131
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  37214202 aattgttctatacactttgttttggttgcttgcttatctcttactccatacatcaagtttgttattggtgtg 37214131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 37214314 - 37214263
Alignment:
Q  475 ggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37214314 ggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 37214263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 515
Target Start/End: Original strand, 6376229 - 6376315
Alignment:
Q  431 ttgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaact 515  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||    
T  6376229 ttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaact 6376315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 2468066 - 2468013
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2468066 ttccctacactttgttttggttgcttgactatcacttgctccacacatcaagtt 2468013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 15185652 - 15185599
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  15185652 ttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttactccacacatcaagtt 15185599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757295
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16757354  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16757353 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 16757295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 413 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872477
Alignment:
Q  413 acttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 35872477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 599 - 661
Target Start/End: Original strand, 25952925 - 25952988
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25952925 catacactttattttggttgcttgattatcactttctccacacatcaagtttgttattggtgtg 25952988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 31573924 - 31573794
Alignment:
Q  329 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 426  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  31573924 ttgattcaccttggg-aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 31573826  T
Q  427 accattgatttctc-tttgtaacgttactcat 457  Q
      | ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  31573825 ttctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 35872394 - 35872323
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  35872394 aatttttccatacactttattttggttgcttgattatcccttacttcacacatcaagtttgttattggtgtg 35872323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 649
Target Start/End: Original strand, 15956358 - 15956408
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15956358 catacactttgttttggttgtttgactatcccttgctccacacatcaagtt 15956408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 4696625 - 4696689
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  4696625 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812487
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 4812574  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| |  | ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||| ||||||    
T  4812573 tgtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaa 4812487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9765912
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 219
Target Start/End: Original strand, 17847484 - 17847556
Alignment:
Q  147 aaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    |||||||||||  | | || |||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17847484 aaacatattttcagcttcagatttgttccaaattttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatca 17847556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403323
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328062
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 28328003  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28328004 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggt 28328062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 31162612 - 31162664
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  31162612 ttccatacactttgttttggttacttaattattacttgctccacacatcaagt 31162664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 498
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590948
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | |||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctttgt 590892  T
Q  446 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 498  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  590893 aaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgttctctcccccagactagg 590948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021228
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 499
Target Start/End: Original strand, 17847677 - 17847828
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc- 440  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||| ||||| ||||     
T  17847677 gaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt-aacctttgatatctct 17847775  T
Q  441 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    |||||||    | ||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847776 tttgtaa----aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggt 17847828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895563
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 639
Target Start/End: Original strand, 41385143 - 41385192
Alignment:
Q  591 aattgttccatacacttt-gttttggttgcttgattatctcttgctccac 639  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41385143 aattgttccatacacttttgttttggttgtttgattatcccttgctccac 41385192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 3005572 - 3005521
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3005572 ttccatacactttgttt-ggttgtttgattattacttgctccacacatcaagt 3005521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 7412409 - 7412345
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  7412409 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930199
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 10930199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212954
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799558
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactt 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 17799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Original strand, 21482708 - 21482763
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgtttt--ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21482708 ttccatacactttattttttggttgcttcattatcacttgctccacacatcaagtt 21482763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 23799606 - 23799670
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  23799606 atagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811446
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 31071258 - 31071322
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  31071258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352318
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321248
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 524
Target Start/End: Original strand, 4733830 - 4733873
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaaca 524  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4733830 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 19752424 - 19752487
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  19752424 tagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 499
Target Start/End: Original strand, 25684758 - 25684797
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25684758 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 25684797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 499
Target Start/End: Original strand, 28890881 - 28890920
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28890881 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 28890920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554812
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |   | | ||||||||||| ||  ||   || |||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattatgtttgaatacttattcttggaactca---atatctctttgt 29554869  T
Q  446 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29554868 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 29554812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 606 - 648
Target Start/End: Original strand, 1225567 - 1225609
Alignment:
Q  606 tttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  1225567 tttgttttggttgcttgattattccttgttccacacatcaagt 1225609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332692
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 525
Target Start/End: Original strand, 5702523 - 5702576
Alignment:
Q  472 gagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5702523 gagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 522
Target Start/End: Original strand, 40221869 - 40221910
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  40221869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 40221910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4743258 - 4743214
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4743258 tctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4743214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 5689395 - 5689439
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5689395 tctctcccccagatttggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 5689439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 6375988 - 6376032
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  6375988 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgaga 6376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 6599096 - 6599140
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6599096 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6599140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 6674549 - 6674593
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6674549 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6674593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 12702678 - 12702634
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12702678 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12702634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 19175783 - 19175847
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  19175783 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Original strand, 21480900 - 21480955
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgtttt--ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  21480900 ttccatacactttgttttttggttgtttgattgtcacttactccacacatcaagtt 21480955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 43036547 - 43036591
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  43036547 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43036591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 147)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14507700 - 14507175
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt--gaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacg 100  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14507700 aaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttttgatacaaggcactggaaaaatggtggcacg 14507601  T
Q  101 atggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  14507600 atggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctgccagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgtagatttgttccaaattttaagcgatacttttactat 14507501  T
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 300  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507500 aaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14507401  T
Q  301 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14507400 cttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 14507302  T
Q  400 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507301 aattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggt 14507202  T
Q  500 aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  14507201 caatttggaccgaactgggtcaacaaa 14507175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11983550 - 11983028
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11983550 aaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatggttgggcaacatggtacgatggaggtttcagttgt-gaggtaag-cactggaaaaatcgtggcacgat 11983453  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11983452 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtttcaaattttaaacgaaacttttactataa 11983353  T
Q  203 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983352 atatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 11983253  T
Q  303 tcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaa 401  Q
    | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11983252 ttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaa 11983154  T
Q  402 ttaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  11983153 ttaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtc 11983054  T
Q  501 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11983053 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 11983028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 9019735 - 9020241
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9019735 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcacatcgtggc 9019833  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9019834 acgatggtgcgctgacagcaaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatc 9019932  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  9019933 agagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactag 9020032  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020033 gttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactta 9020131  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9020132 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactg 9020231  T
Q  517 ggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||    
T  9020232 ggtcaacaaa 9020241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 20 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 19227915 - 19227514
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 119  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227915 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcatgatggaggtttcaatttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 19227816  T
Q  120 cgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatattttt-gggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19227815 cgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatc 19227716  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  19227715 agagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactag 19227616  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227615 ggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 19227517  T
Q  418 ttc 420  Q
    |||    
T  19227516 ttc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28241657 - 28241320
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241657 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 28241558  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  28241557 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 28241459  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28241458 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 28241359  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28241358 cccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28241320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15530628 - 15530166
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15530628 aatcgtggcacgatggctgggtaacgtggcacaattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactcgaaaattcgtggtacgatggggccgcatcgtggc 15530530  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||| | ||||||  ||| | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15530529 acgatggtgtgctggcagtgaattatagaaacatatttttgggtgcaggtttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 15530430  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | || |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15530429 agagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 15530330  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15530329 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagactta 15530231  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 482  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15530230 ttcttgt-aaccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14459090 - 14458766
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459090 aaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14458991  T
Q  301 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 399  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14458990 cttgggaacaaacactagggtttgagggctgat--tcctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 14458894  T
Q  400 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458893 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 14458794  T
Q  499 taaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14458793 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14458766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 70 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 30729284 - 30728823
Alignment:
Q  70 tgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatt 169  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  30729284 tgaggcaagtcactggaaatttcgtgccacgatggggtcacaacgtggcacgatagtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatt 30729185  T
Q  170 tgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac 269  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  30729184 tgttccaaattttaagcggtacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaac 30729085  T
Q  270 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-tt 368  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  30729084 aacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgactctctt 30728986  T
Q  369 ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattga----tttctc-tttgtaacgttactcatcatata 463  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    |||||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  30728985 ggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattata 30728886  T
Q  464 gtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| | || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  30728885 gtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 30728823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 70 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 15541596 - 15541139
Alignment:
Q  70 tgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatt 169  Q
    ||||||| | |||||||||  || || ||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||    
T  15541596 tgaggcacgtcactggaaatttcatgccacgatgagatcgcaacgtggcacgatggtacgctggcagcgaatagcagaaacatatttttaggtgcagatt 15541497  T
Q  170 tgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac 269  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15541496 tgttccaaattttaagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaa 15541397  T
Q  270 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-tt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  15541396 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattagaattgagtctctt 15541298  T
Q  369 ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgg 467  Q
    ||| |||  |||||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  15541297 ggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtga 15541198  T
Q  468 atcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15541197 aacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaa 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1230585 - 1230248
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230585 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1230486  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||| |    
T  1230485 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctggg 1230387  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  1230386 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 1230287  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1230286 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1230248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4816526 - 4816230
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4816526 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4816427  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4816426 gattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 4816328  T
Q  430 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4816327 attgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 4816230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 190 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 12195851 - 12195515
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12195851 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 12195752  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||     
T  12195751 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 12195653  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12195652 gactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 12195553  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  12195552 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 20915717 - 20915355
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 263  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915717 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaaattgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 20915619  T
Q  264 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-a 362  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20915618 ggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgga 20915520  T
Q  363 gtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 461  Q
    |||| |||||||||  |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20915519 gtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 20915420  T
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20915419 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20915355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 30967176 - 30967516
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagc-aaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30967176 acttttactataaatatagaccttgtat--aggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtt 30967273  T
Q  285 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 383  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30967274 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 30967372  T
Q  384 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 482  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30967373 ctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctc 30967472  T
Q  483 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30967473 tctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 30967516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 30034943 - 30034602
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30034943 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagttt 30034844  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  30034843 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggc 30034745  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30034744 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctct 30034645  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30034644 ctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 30034602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 112 - 522
Target Start/End: Original strand, 32279897 - 32280308
Alignment:
Q  112 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 211  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  32279897 tcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaatgtatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttcctatatatatagacc 32279996  T
Q  212 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 311  Q
    |||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  32279997 ttgtatcatagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa 32280095  T
Q  312 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 410  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||  ||||||||||||||||    
T  32280096 acacttgggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcggg 32280194  T
Q  411 agacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc-atatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 508  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32280195 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 32280294  T
Q  509 ccgaactgggtcaa 522  Q
    ||||||| ||||||    
T  32280295 ccgaacttggtcaa 32280308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 70 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 15533137 - 15532681
Alignment:
Q  70 tgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatt 169  Q
    ||||||||| |||||||||  | ||| ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  15533137 tgaggcaagtcactggaaattttgtgccacgatgagatcgcaacgtgtcacaatggtgcgctggtagcaaataagagaaacatatttttaggtgcagatt 15533038  T
Q  170 tgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac 269  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15533037 tgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaac 15532938  T
Q  270 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-tt 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  15532937 aacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctctt 15532839  T
Q  369 ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgg 467  Q
    ||| | || |||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  15532838 ggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtga 15532739  T
Q  468 atcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | | |||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  15532738 aacggagggctgctctat-ccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaa 15532681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 196 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 19704905 - 19704566
Alignment:
Q  196 actacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704905 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19704806  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||     
T  19704805 agagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 19704707  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatt--tctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19704706 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 19704607  T
Q  486 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19704606 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 19704566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2629226 - 2628885
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629226 acttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 2629127  T
Q  285 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 383  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  2629126 tgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 2629028  T
Q  384 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
     || ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2629027 ttgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctct 2628928  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2628927 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaa 2628885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065296
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26065102 gattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26065200  T
Q  430 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26065201 attgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 26065296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085265
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26085071 gattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26085169  T
Q  430 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26085170 attgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 26085265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057510
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggga 13057371  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  13057372 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcc 13057471  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13057472 cccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaa 13057510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 308
Target Start/End: Original strand, 8995288 - 8995575
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8995288 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcacatcgtggc 8995386  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8995387 acgatggtgcgctgacagcaaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatc 8995485  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaa 308  Q
    | || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8995486 agagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaa 8995575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 3390357 - 3390695
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390357 acttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3390456  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || |    
T  3390457 agagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggg 3390555  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||    
T  3390556 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctc 3390655  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  3390656 ccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaa 3390695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477597
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |     
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgggg 25477451  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaa-------cgttactcatca-tatagtggatcagagggctgc 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||       |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  25477452 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgc 25477551  T
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25477552 tctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaa 25477597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26932906 - 26932561
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 281  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  26932906 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagg 26932807  T
Q  282 gtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  26932806 gtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgag-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 26932708  T
Q  380 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 479  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  26932707 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttg 26932608  T
Q  480 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  26932607 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 26932561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629864
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  || |     
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattgggg 3630001  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| || |||||||| | | |||||||||||||| ||    
T  3630000 ctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctct-cc 3629902  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3629901 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3629864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040070
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgaga 13039931  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  13039932 ctttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 13040031  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13040032 cctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa 13040070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 193 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631938
Alignment:
Q  193 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 292  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  293 gtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagact 391  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatctt-gggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggact 3632073  T
Q  392 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccc 489  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| |  ||    
T  3632072 ttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--cc 3631975  T
Q  490 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3631974 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3631938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 191 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233739
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  291 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
     |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||    
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 3233868  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  3233867 gctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcc 3233768  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  3233767 cccacactaggtcaattttgaccgaactg 3233739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338447
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacacta-gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgag 388  Q
     ||||||| |||| | || |||||||| ||||||| |||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  | ||    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttacctt-ggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaag 24338585  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||    
T  24338584 actttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctc 24338487  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24338486 ccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaa 24338447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 112 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1072291 - 1072068
Alignment:
Q  112 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 211  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||     
T  1072291 tcgtggcacgatggtacgtaggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaca 1072192  T
Q  212 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 311  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  1072191 ttgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 1072092  T
Q  312 acactagggtttgtgggttgattc 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  1072091 acactagggtttgtgagttgattc 1072068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 311 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273215
Alignment:
Q  311 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg 5273333  T
Q  409 ggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 508  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5273332 ggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 5273233  T
Q  509 ccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5273232 ccgaactgggtcaacaaa 5273215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161557
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  12161790 gagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgtt-gggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgaga 12161694  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |   || ||||| ||||| ||    
T  12161693 ctttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-cc 12161595  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  12161594 ctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaa 12161557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066123
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 26066123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754708
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 29754708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 3028186 - 3027878
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3028186 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggttt-ggaaggcaac-acaaaactagggtttgta 3028089  T
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||  |||    
T  3028088 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattga 3027993  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |    
T  3027992 gactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctcttt 3027893  T
Q  486 -cccccagactaggt 499  Q
     ||||||||||||||    
T  3027892 ccccccagactaggt 3027878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309171
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 33309171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 460
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490889
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta-gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||    || | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |    
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacacctt-gcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggg 22490816  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 460  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  22490817 actttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068394
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 26068394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311440
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 33311440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 224 - 526
Target Start/End: Original strand, 15719666 - 15719959
Alignment:
Q  224 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggttt 323  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| || || | || |||||||||||||     
T  15719666 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt- 15719755  T
Q  324 gtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 422  Q
      | |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719756 --gagttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15719852  T
Q  423 gtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct-cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggt 519  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15719853 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggt 15719952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 342 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1069904 - 1069717
Alignment:
Q  342 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1069904 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 1069805  T
Q  441 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||| | | | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  1069804 ttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaa 1069717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16455798 - 16455423
Alignment:
Q  152 tatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaa 249  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| |||| || || || ||||||| ||||||| ||||||||||   | |||| ||||||  ||||| |  ||||||    
T  16455798 tatttttgggctcagatttgttccaatttttcagggatacctttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagt-ctgaaa 16455700  T
Q  250 -caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaac 348  Q
     ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||  |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  16455699 acaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttggg-aaac 16455605  T
Q  349 actattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgta 446  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  16455604 actgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgta 16455505  T
Q  447 acgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| || ||||||    
T  16455504 aaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaa 16455423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447506
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactag-ggtttgtgggttgattc 335  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| | |||| ||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattc 32447506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26068866 - 26068735
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068866 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcatgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 26068767  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26068766 ggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 26068735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466639
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||              
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag---------- 14466401  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggttt-gtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
     ||||||||| || | || |||||||||||||| | || |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |    
T  14466402 -agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggg 14466499  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | | || | ||||| | ||    
T  14466500 agtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttc 14466599  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14466600 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaa 14466639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 33308701 - 33308870
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308701 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 33308800  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33308801 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 33308870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 33310970 - 33311139
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33310970 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 33311069  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33311070 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 33311139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26066595 - 26066464
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066595 aaatcaggtttctgtagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttatttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 26066496  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  26066495 ggggtctcatcgtggcacaatggtgcgctggc 26066464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12186429 - 12186070
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaa-acttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 263  Q
    ||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12186429 atttgttccaattttttagcgattacttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaaa 12186330  T
Q  264 ggca-acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattga 362  Q
      || |||||||| | ||| |||  | ||| ||| |||   ||| ||||||  |||||||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12186329 --cagacaacaaaccaaggttttagagaga-tttctctaagcgggagaaac--tagggttgttg--ttgattcaccttggg-aaacactattaggattga 12186238  T
Q  363 gtctttggtt-acggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatca 459  Q
    |||| | ||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  12186237 gtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatca 12186138  T
Q  460 t-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | |||||||| | |||||||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  12186137 ttatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaacaaa 12186070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 190 - 320
Target Start/End: Original strand, 17852520 - 17852650
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  17852520 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 17852619  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactaggg 320  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  17852620 agagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29755263 - 29755094
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29755263 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 29755164  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29755163 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 29755094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 526
Target Start/End: Original strand, 15367132 - 15367347
Alignment:
Q  310 aaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 408  Q
    |||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||  ||| |||||  ||| |||||||||| |||||  ||    
T  15367132 aaacactagggtt---gggttgattcaccttggg-aaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaatcg 15367227  T
Q  409 ggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc-ccccagactaggtaaatttg 506  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15367228 ggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtcaatttg 15367327  T
Q  507 gaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  15367328 gaccgaactgggtaaacaaa 15367347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4816749 - 4816612
Alignment:
Q  44 cgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaata 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |    
T  4816749 cgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgtgctggtagcaaa-a 4816652  T
Q  143 acataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaatttt 182  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||    
T  4816651 acagaaacatattttttggtgcagatttgttacagatttt 4816612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 201 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13870746 - 13870608
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 300  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13870746 aaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtct 13870648  T
Q  301 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcctt 340  Q
    ||| | || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  13870647 cttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Original strand, 17012033 - 17012356
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaa-acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 299  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  17012033 aaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaa-gtaaacaacaaa-ctagggtttgtataaagtttg-c 17012129  T
Q  300 tcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggta 398  Q
    |||| | || |||||||||||||    ||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||  |||||  |||  |||| ||||    
T  17012130 tcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttctg-aaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggta 17012226  T
Q  399 gaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc-atatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||| || || | |  ||||||||||||||||    
T  17012227 gaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag-ggaacatagagatcatctctcccccagacta 17012325  T
Q  497 ggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| | | |||||||||||| ||| ||||||    
T  17012326 ggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaa 17012356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 19696420 - 19696757
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--ggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 287  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   |  |||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||    
T  19696420 cttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgt 19696517  T
Q  288 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 386  Q
    |||||||||| ||||| | || || ||||||||||      ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||||  ||    
T  19696518 atagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttggg-aaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattg 19696613  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctct 483  Q
    ||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  19696614 agactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctct 19696713  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  19696714 ctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 19696757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 388 - 526
Target Start/End: Original strand, 15346523 - 15346662
Alignment:
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | | ||  |||||||||||    
T  15346523 gactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctctc 15346622  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346623 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaa 15346662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 4816163 - 4816091
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4816163 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 4816091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 14507109 - 14507037
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14507109 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 14507037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 28241254 - 28241182
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28241254 aattgttccatacactttgttttgattgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 28241182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 11982964 - 11982892
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11982964 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 11982892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 29754641 - 29754569
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29754641 aattgttccatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 29754569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 1230181 - 1230109
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1230181 aattgtttcatacactttattttggttgcttgattatctcttgatccacacatcaagttgttattggtgtgat 1230109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 18322482 - 18322546
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18322482 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 18322546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 26066053 - 26065981
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26066053 aattgttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 26065981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 26068327 - 26068255
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26068327 aattgttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 26068255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 26932487 - 26932423
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26932487 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 26932423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 30967582 - 30967654
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30967582 aattattccatgcactttgttttggttacttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 30967654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 19704498 - 19704424
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg--ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19704498 aattgttccatacactttgatttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 19704424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 24338388 - 24338330
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24338388 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatctcttgctccacacatcaagtt 24338330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 9020305 - 9020378
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9020305 aattgttccatacactttgttttggttgtctgattatctcttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 9020378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 15367405 - 15367478
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15367405 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacatgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 15367478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 2628814 - 2628746
Alignment:
Q  596 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2628814 ttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 2628746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 3629804 - 3629733
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3629804 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 3629733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 329 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22858152 - 22857951
Alignment:
Q  329 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 426  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||||  ||||||||| |||||| |||||   || |||| ||||||||||    
T  22858152 ttgattcaccttggg-aaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaa 22858054  T
Q  427 accatt-gatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaac 523  Q
     || || ||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || |||    
T  22858053 cccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaac 22857954  T
Q  524 aaa 526  Q
    |||    
T  22857953 aaa 22857951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24192733 - 24192635
Alignment:
Q  88 aaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 186  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24192733 aaatcgtgccacgatgggattgcaatgtggcatgatggggcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagc 24192635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 5273141 - 5273076
Alignment:
Q  599 catacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5273141 catacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 5273076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 15346720 - 15346793
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15346720 aattgttccatatactttgttttggttgcttgattatcacttgttccacacatcaagtttgttattggtgtgat 15346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 407 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465589
Alignment:
Q  407 cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-t 504  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||| || | | |    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtat 25465611  T
Q  505 tggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  25465610 tggaccgaactgggtaaacaaa 25465589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 526
Target Start/End: Original strand, 26945272 - 26945461
Alignment:
Q  342 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttct 439  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||  ||||||| |||    
T  26945272 gggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgtaactcattgatatct 26945371  T
Q  440 c-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||| || |  ||||| |||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  26945372 cttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaacaaa 26945461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 30728762 - 30728689
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30728762 aattgttccatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 30728689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 33309237 - 33309310
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33309237 aattgttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 33309310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 33311506 - 33311579
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33311506 aattgttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 33311579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584212
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||     |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  291 gagtttgtctctt 303  Q
    |||||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 526
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584311
Alignment:
Q  443 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaa 10584311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Original strand, 15346347 - 15346441
Alignment:
Q  168 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 262  Q
    |||||||||| || | || || |||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15346347 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttagaa 15346441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24191636 - 24191538
Alignment:
Q  88 aaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 186  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  |||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24191636 aaatcgtgccacgatgggattgcaatgtggtatgatggggcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagc 24191538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 594 - 663
Target Start/End: Original strand, 26065365 - 26065435
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26065365 tgttccatacgctttgattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 26065435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 594 - 663
Target Start/End: Original strand, 26085334 - 26085404
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26085334 tgttccatacgctttgattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 26085404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 610 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 8717268 - 8717215
Alignment:
Q  610 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8717268 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 8717215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 20915281 - 20915217
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20915281 catacactttgttttggttgcttgattaccccttgccccacacatcaagttattattggtgtgat 20915217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26066387 - 26066319
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 235  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066387 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26066319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26068658 - 26068590
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 235  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068658 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26068590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 3631877 - 3631806
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  3631877 aattgttccatacactttgttttggttgcctaattatcacttgctccacacgtcaagtttgttattggtgtg 3631806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 12911535 - 12911472
Alignment:
Q  437 tctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12911535 tctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggt 12911472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 12195427 - 12195374
Alignment:
Q  610 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12195427 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 12195374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878881
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 13878822  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13878823 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 13878881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883629
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcat---tatctctt 13883570  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13883571 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 13883629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786073
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16786014  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16786015 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 16786073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 30034528 - 30034466
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30034528 catacactttgttt-ggttgcttgattatc-cttgctccatacatcaagttgttattggtgtgat 30034466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28037916 - 28037724
Alignment:
Q  342 gggaaacactattaggattgagtctttggtt-acggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaaaccattgatttct 439  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    | | ||||||||||||| || ||||| |||    
T  28037916 gggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaaccctttgatatct 28037817  T
Q  440 c-tttgtaacgttactcatcat-atagtgga---tcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||||    |  | |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||| ||||||    
T  28037816 cttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaacaaa 28037724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 1069656 - 1069603
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc 644  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  1069656 aattgttccatacactttgttttgattgcttgactatcccttgctccatacatc 1069603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 647
Target Start/End: Original strand, 3394743 - 3394800
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt-ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag 647  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  3394743 aattgttccatacactttgtttttggttgcttgattatccatttctccacacatcaag 3394800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 14458700 - 14458627
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  14458700 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattatccattactccacacatcaagctattattggtgtgat 14458627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 648
Target Start/End: Original strand, 17012417 - 17012466
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17012417 catacactttgttttggttgcttgattattatttgctccacacatcaagt 17012466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29755032 - 29754983
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29755032 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagagagag 29754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757571
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5757507 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 10077194 - 10077258
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  10077194 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 486
Target Start/End: Original strand, 20526937 - 20527081
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||  | ||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| |  ||||| ||||||    
T  20526937 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctt 20527036  T
Q  443 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  20527037 tgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 12937282 - 12937220
Alignment:
Q  437 tctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12937282 tctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggt 12937220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Original strand, 30445698 - 30445813
Alignment:
Q  387 agactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||    
T  30445698 agactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctct 30445797  T
Q  484 ctcccccagactaggt 499  Q
    |||| ||| |||||||    
T  30445798 ctccaccatactaggt 30445813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31979580 - 31979517
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||    
T  31979580 tagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887345
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078193
Alignment:
Q  411 agacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttgg 507  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | | | |||||||||||| || ||||||| || ||| |    
T  28078310 agacttattcttgtaa-cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattttag 28078212  T
Q  508 accgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  28078211 accgaacagggtaaacaaa 28078193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701985
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatta 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 129
Target Start/End: Original strand, 26084818 - 26084867
Alignment:
Q  80 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 129  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  26084818 cactggaaaaatcgtgccacgattgaatcgcatcgtggcacgatggtgcg 26084867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4816604 - 4816552
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4816604 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatca 4816552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 5572270 - 5572334
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  5572270 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 612 - 663
Target Start/End: Original strand, 13057587 - 13057639
Alignment:
Q  612 ttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13057587 ttggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 13057639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356040
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211185
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 646
Target Start/End: Original strand, 14466706 - 14466753
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  14466706 catacattttgttttggttgcttgactatcacttgctgcacacatcaa 14466753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694972
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 526
Target Start/End: Original strand, 30443553 - 30443604
Alignment:
Q  476 gctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  30443553 gctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaa 30443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31936654 - 31936591
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  31936654 tagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 35201393 - 35201326
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||| ||||||    
T  35201393 tatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaa 35201326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 607 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 15541067 - 15541025
Alignment:
Q  607 ttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15541067 ttgttttggtttcttgactatcccttgctccacacatcaagtt 15541025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 224
Target Start/End: Original strand, 33308932 - 33308966
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagca 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33308932 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33308966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 224
Target Start/End: Original strand, 33311201 - 33311235
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagca 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33311201 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33311235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Original strand, 15366963 - 15367086
Alignment:
Q  140 ataacataaacatatttttggg-tgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-------gcaaactttg 231  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||| || | || || |||||||||| |||||||||| |||||||| |       | |||| |||    
T  15366963 ataacataaacgtatttttgggctgatattttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagacatcggtgtaaaccttg 15367062  T
Q  232 agatagagggggctgaaacaaggg 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  15367063 agatagagggggctgaaccaaggg 15367086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 663
Target Start/End: Original strand, 22491002 - 22491059
Alignment:
Q  607 ttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  22491002 ttgttttggttgcttgattatccttagctccacacattaagtttgttattggtgtgat 22491059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 519
Target Start/End: Original strand, 24436001 - 24436058
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggt 519  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||| ||||||||||    
T  24436001 tagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgggt 24436058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 663
Target Start/End: Original strand, 32280386 - 32280443
Alignment:
Q  607 ttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  32280386 ttgtattggttgcttgattatcacttactccatacatcaagtttgttatttgtgtgat 32280443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 603132 - 603088
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  603132 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 603088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 3233661 - 3233605
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  3233661 aattgtttcatgcactttgattttggttgcctgattatcacttactccacacatcaa 3233605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 365
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138459
Alignment:
Q  329 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc 365  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtc 11138459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467585
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 16569146 - 16569190
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16569146 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 16569190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 18318004 - 18318048
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18318004 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 18318048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 25480254 - 25480326
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||| |  ||||| |||||||    
T  25480254 aattgtttcatacactttattttggttgctcgactatcccttactctacacatcaaatatttattggtgtgat 25480326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 264)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 5191389 - 5191911
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5191389 aaatcagatttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactggaaaaatcgtggcacga 5191487  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5191488 tgggatctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactata 5191587  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191588 aatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 5191687  T
Q  302 ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtaga 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5191688 ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaga 5191786  T
Q  401 attaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggta 500  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  5191787 attaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctct-ccccagactaggtc 5191885  T
Q  501 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5191886 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 5191911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22114826 - 22114302
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22114826 aaatcaggtttctgtagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaattgtggcacgat 22114727  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22114726 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgatggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataa 22114627  T
Q  203 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114626 atatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 22114527  T
Q  303 tcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaa 401  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  22114526 tcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaa 22114428  T
Q  402 ttaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| || | |||    
T  22114427 ttaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagta 22114328  T
Q  501 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22114327 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 22114302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 18099691 - 18099167
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18099691 aaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagacactggaaaaatcgtggcacga 18099593  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || || || | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  18099592 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaacaatagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgagacttttactata 18099493  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 300  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099492 a-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 18099394  T
Q  301 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 399  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18099393 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 18099295  T
Q  400 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18099294 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactagg 18099195  T
Q  499 taaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18099194 tcaatatggaccgaactgggtcaacaaa 18099167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 526
Target Start/End: Original strand, 3859350 - 3859787
Alignment:
Q  89 aatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcga 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3859350 aatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataatataaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcga 3859449  T
Q  189 aacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859450 aacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 3859549  T
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3859550 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 3859648  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3859649 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctcc 3859748  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3859749 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3859787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10956505 - 10956024
Alignment:
Q  46 tggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataac 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10956505 tggcacgattggaggtttcagttttgg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataac 10956407  T
Q  145 ataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc 244  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||    
T  10956406 ataaacgtatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggc 10956307  T
Q  245 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttgggg 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||    
T  10956306 tgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-ggg 10956208  T
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tt 442  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  10956207 aaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt 10956108  T
Q  443 tgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10956107 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 10956024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5523119 - 5522624
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5523119 aatcgtggcaagattgctgggcaacatggcacgattggtggtttcagtttt-gaggcaaggtactggaaaaatcgtggcacaatgggatcgcatcgtggc 5523021  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5523020 acgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatc 5522921  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||| ||||||| |    
T  5522920 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt-----------ttgtctcttcggaacaaacactcg 5522832  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522831 ggtttgtgggttgatttacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 5522733  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgg 517  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5522732 ttcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 5522633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 11170178 - 11170664
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 119  Q
    |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                     |||||     
T  11170178 aatcgtggcacggttgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcggtttttgaggcaaggcactggaaaaatc---------------------gtggct 11170256  T
Q  120 cgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    |||| ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11170257 cgattgtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 11170356  T
Q  220 aagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagg 319  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11170357 gagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg 11170456  T
Q  320 gtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 418  Q
    ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11170457 gtttgcggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttat 11170555  T
Q  419 tcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgg 517  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11170556 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgg 11170655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 80 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10958767 - 10958320
Alignment:
Q  80 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10958767 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagccaataacagaaacgtatttttaggtgcagatttgttccaaat 10958668  T
Q  180 tttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 279  Q
    ||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10958667 tttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaacta 10958568  T
Q  280 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  10958567 gggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 10958469  T
Q  379 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggc 477  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  10958468 agaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggc 10958369  T
Q  478 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10958368 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 10958320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 26720301 - 26720807
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26720301 aatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcaggattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggc 26720399  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26720400 acgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttagtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatc 26720499  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  26720500 agagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactag 26720599  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26720600 ggtttgagggttgattcaccttgggtta--actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 26720697  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    ||||| ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26720698 ttcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactg 26720797  T
Q  517 ggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||    
T  26720798 ggtcaccaaa 26720807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 32264547 - 32264035
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  32264547 aatcgtggcacgatggctggg-aacgtggcacgattggaggtttcagtttttgaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatgggcttgcaacgtggc 32264449  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32264448 acgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 32264349  T
Q  219 aaagca----aactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaaca 314  Q
    | || |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32264348 agagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 32264249  T
Q  315 ctagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 413  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  32264248 ctagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggaga 32264150  T
Q  414 cttattcttgtaaaccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggacc 510  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32264149 cttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttggacc 32264050  T
Q  511 gaactgggtcaacaa 525  Q
     |||||| |||||||    
T  32264049 aaactggatcaacaa 32264035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 110 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10084807 - 10084386
Alignment:
Q  110 catcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatataga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  10084807 catcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatataga 10084708  T
Q  210 ccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcg 305  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10084707 ccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttg 10084608  T
Q  306 gaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatta 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10084607 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 10084509  T
Q  405 ggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat 503  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10084508 ggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaat 10084409  T
Q  504 ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10084408 ttggaccgaactgggtcaacaaa 10084386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 80 - 526
Target Start/End: Original strand, 45882752 - 45883200
Alignment:
Q  80 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaat 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  45882752 cactggaaaaatcgtgccacgatgggattgcaacgtggcacgatggtgcgctgacaacgaataacagaaacctatttttgggtgcagatttgttgaaaat 45882851  T
Q  180 tttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 279  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882852 tttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 45882951  T
Q  280 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 378  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  45882952 gggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 45883050  T
Q  379 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggc 477  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  45883051 agaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 45883150  T
Q  478 tgctctctccccc-agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45883151 tgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 45883200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 3 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 18097406 - 18096900
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18097406 aaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggcataggaaaaatcgtggcacga 18097308  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    ||||||||||| |||||                 || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  18097307 tggggtcgcatagtggcg----------------gcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcgagacttttactata 18097224  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 300  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097223 aatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 18097124  T
Q  301 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 399  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18097123 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 18097025  T
Q  400 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18097024 aattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccctagactagg 18096925  T
Q  499 taaatttggaccgaactgggtcaac 523  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  18096924 tcaatttggaccgaacttggtcaac 18096900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 110 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10191727 - 10191307
Alignment:
Q  110 catcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatataga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10191727 catcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataga 10191628  T
Q  210 ccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcg 305  Q
    |||||||||  ||||||||||    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  10191627 ccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttg 10191528  T
Q  306 gaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatta 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10191527 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaatta 10191430  T
Q  405 ggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat 503  Q
    || ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  10191429 ggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaat 10191330  T
Q  504 ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10191329 ttggaccgaactgggtcaacaaa 10191307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Original strand, 38889939 - 38890300
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaa 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38889939 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat---agcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 38890035  T
Q  263 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattga 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38890036 aggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattga 38890134  T
Q  363 gtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 460  Q
    |||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38890135 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 38890234  T
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38890235 atagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 38890300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4308615 - 4308278
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308615 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 4308516  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  4308515 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggg 4308417  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4308416 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 4308317  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4308316 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 4308278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4104233 - 4103893
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104233 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4104134  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4104133 gtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 4104035  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 484  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  4104034 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatc 4103935  T
Q  485 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4103934 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 4103893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 110 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6066210 - 6065793
Alignment:
Q  110 catcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatataga 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  || || | |||  |||||||||| ||| ||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  6066210 catcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaatgtatttttgggagcagatttgttacagattttaagcagaacttttactataaatataga 6066112  T
Q  210 ccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6066111 ccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaa 6066012  T
Q  309 gaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||    
T  6066011 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 6065913  T
Q  407 cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttg 506  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |  |||    
T  6065912 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattg 6065813  T
Q  507 gaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  6065812 gacagaactgggtcaacaaa 6065793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 43228214 - 43228551
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43228214 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtat 43228313  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  43228314 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43228412  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43228413 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 43228512  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43228513 cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 43228551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 43226009 - 43226345
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43226009 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtat 43226107  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  43226108 agagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43226206  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43226207 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 43226306  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43226307 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 43226345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 51727340 - 51727004
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51727340 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtat 51727241  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  51727240 agagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgag 51727143  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  51727142 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 51727043  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  51727042 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 51727004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 112 - 526
Target Start/End: Original strand, 24979552 - 24979968
Alignment:
Q  112 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 211  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||| |||    
T  24979552 tcgtggcacgatggtacgctggtagcgaataacataaacatattttttggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatatacc 24979651  T
Q  212 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 311  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  24979652 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 24979751  T
Q  312 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24979752 acactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcagg 24979850  T
Q  411 agacttattcttgtaaaccattgatttc-tctttgt-aacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 508  Q
    ||||||||||||||||   ||| || || | ||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24979851 agacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgga 24979950  T
Q  509 ccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     |||||||||||||||||    
T  24979951 tcgaactgggtcaacaaa 24979968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6063805 - 6063443
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaag 264  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063805 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 6063706  T
Q  265 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-ag 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6063705 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggag 6063607  T
Q  364 tct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 462  Q
    ||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6063606 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 6063507  T
Q  463 agtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  6063506 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaa 6063443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Original strand, 50493899 - 50494259
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 266  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50493899 atttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 50493998  T
Q  267 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  50493999 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtc 50494097  T
Q  366 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 464  Q
    | |||||||||| ||| |  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50494098 tcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 50494197  T
Q  465 tggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  50494198 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 50494259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 111 - 526
Target Start/End: Original strand, 18162508 - 18162923
Alignment:
Q  111 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 210  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18162508 atcgtgccacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 18162607  T
Q  211 cttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaag 309  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  18162608 cttgtatcatgagtaaacttggagataga--gggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaac 18162705  T
Q  310 aaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 408  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |    
T  18162706 aaacactagggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtg 18162804  T
Q  409 ggagacttattcttgtaaaccattgat-ttctctttgt-aacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttg 506  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18162805 ggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 18162904  T
Q  507 gaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  18162905 ga-cgaactgtgtcaacaaa 18162923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Original strand, 25533406 - 25533702
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  25533406 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 25533505  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25533506 gattcacctt-gggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 25533604  T
Q  430 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25533605 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaa 25533702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 111 - 426
Target Start/End: Original strand, 35777266 - 35777581
Alignment:
Q  111 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  35777266 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaa-aacataaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagac 35777364  T
Q  211 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaga 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35777365 attgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 35777464  T
Q  311 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  35777465 aacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg 35777563  T
Q  409 ggagacttattcttgtaa 426  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35777564 ggagacttattcttgtaa 35777581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 1313333 - 1313669
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1313333 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 1313431  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  || |    
T  1313432 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggg 1313530  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  1313531 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 1313630  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1313631 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1313669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 746674 - 747017
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  746674 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 746773  T
Q  284 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaaga 381  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  746774 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 746872  T
Q  382 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 481  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  746873 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgct 746972  T
Q  482 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  746973 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 747017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9604899 - 9604604
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  9604899 gagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggtt 9604801  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9604800 gattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 9604702  T
Q  430 attgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9604701 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaa 9604604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990564
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  42990368 gattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 42990466  T
Q  430 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42990467 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 42990564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 243 - 526
Target Start/End: Original strand, 25388882 - 25389165
Alignment:
Q  243 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttgg 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25388882 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 25388981  T
Q  343 ggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 440  Q
      ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25388982 --aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc 25389079  T
Q  441 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25389080 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 25389165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 458203 - 458544
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458203 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 458302  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagagg 383  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||     
T  458303 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 458401  T
Q  384 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  458402 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 458501  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  458502 ctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaa 458544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 112 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 48362082 - 48361668
Alignment:
Q  112 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 211  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  48362082 tcgtggcatgatggtgcgctggcagcgaatagcagaaacgtatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacc 48361983  T
Q  212 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 311  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  48361982 ttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaa-ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaa 48361884  T
Q  312 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 410  Q
    | ||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  || | |||| |||||||||||||||     
T  48361883 aaactagggtttgagggttgattcacatt-gggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcgga 48361785  T
Q  411 agacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggac 509  Q
    |||||| |||||||||  ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  48361784 agactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggat 48361685  T
Q  510 cgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||    
T  48361684 cgaactgggtcaacaaa 48361668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 455826 - 456167
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455826 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 455925  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagagg 383  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||     
T  455926 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 456024  T
Q  384 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  456025 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 456124  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  456125 ctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaa 456167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006101
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  30005905 gattcacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 30006003  T
Q  430 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30006004 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 30006101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423460
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |     
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 43423598  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  43423597 ctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccc 43423498  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43423497 tgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 43423460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 53917998 - 53917661
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  53917998 acttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53917899  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  53917898 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 53917800  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  53917799 attttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 53917700  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  53917699 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 53917661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621527
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 428  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10621723 gattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 10621625  T
Q  429 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  10621624 cattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaa 10621527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 152 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12268338 - 12267972
Alignment:
Q  152 tatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaaca 251  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  12268338 tatttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaaca 12268239  T
Q  252 agggtttagaaaggcaacaac-aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaaca 349  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  12268238 agagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-cggaaaca 12268140  T
Q  350 ctattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaac 448  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||    
T  12268139 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa---------ctct-tttgtaac 12268050  T
Q  449 gttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12268049 gttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 12267972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Original strand, 38210268 - 38210630
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 263  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||  || |  ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210268 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataggccttgtatcag-gctattttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 38210366  T
Q  264 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-a 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  38210367 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgga 38210465  T
Q  363 gtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 461  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38210466 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 38210565  T
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  38210566 tagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 38210630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626680
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  || ||    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattggga 1626818  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  1626817 ctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgc 1626718  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  1626717 ccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaa 1626680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27101519 - 27101178
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaact----ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101519 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27101420  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||      
T  27101419 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaa 27101321  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  27101320 tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 27101221  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27101220 ctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 27101178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 154 - 526
Target Start/End: Original strand, 15780747 - 15781139
Alignment:
Q  154 tttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15780747 tttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaag 15780846  T
Q  254 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag-----------agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttgg 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  15780847 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-g 15780945  T
Q  343 ggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattg----attt 437  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||||    
T  15780946 ggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatattt 15781045  T
Q  438 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagaggg---ctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||| |||| | |||| ||||||||| |  ||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15781046 ctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 15781139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421412
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
     ||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||  || |      
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattgggga 43421549  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc 489  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  43421548 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctcccc 43421449  T
Q  490 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43421448 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 43421412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 271 - 526
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321739
Alignment:
Q  271 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttg 369  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttg 1321581  T
Q  370 gttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtgga 468  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1321582 gttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 1321681  T
Q  469 tcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1321682 tcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1321739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314945
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || |     
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggg 3314806  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  3314807 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 3314906  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3314907 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3314945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 51943294 - 51943630
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943294 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51943393  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  || |    
T  51943394 agagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 51943492  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||    
T  51943493 gctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcc 51943591  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51943592 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 51943630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 53915830 - 53915493
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  53915830 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53915731  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  53915730 agattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttacctt-gtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 53915632  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||    
T  53915631 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcc 53915532  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  53915531 cccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaa 53915493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28101999
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |     
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 28102137  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  28102136 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctccc 28102037  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | |  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  28102036 caaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaa 28101999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 336
Target Start/End: Original strand, 11162924 - 11163219
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 119  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||                     |||    
T  11162924 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaattgtg---------------------gca 11163002  T
Q  120 cgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11163003 cgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttacgataaatatagaccttgtatca 11163102  T
Q  220 aagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagg 319  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11163103 gagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg 11163202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926761
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||   | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgcctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 5926899  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||||||| ||||||||||||||| || | | || | ||||||||||||    
T  5926898 cttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctccc 5926799  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5926798 gcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5926761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 257 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413029
Alignment:
Q  257 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattag 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattag 28413201  T
Q  357 gattga-gtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttact 454  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  28413200 gattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaact 28413101  T
Q  455 catcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||    
T  28413100 catcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaa 28413029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880448
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  291 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||| ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || |    
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggg 880587  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||    
T  880586 gctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctcc 880487  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  880486 cctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaa 880448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 201 - 482
Target Start/End: Original strand, 6561744 - 6562028
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 300  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561744 aaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 6561843  T
Q  301 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 399  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||    
T  6561844 ctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 6561942  T
Q  400 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctc 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6561943 aattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 190 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 35918283 - 35917944
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918283 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 35918184  T
Q  290 agagtttgtctcttcgga------agaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 382  Q
    |||||||||||||| |||      | ||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  35918183 agagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcacctt-gcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagag 35918085  T
Q  383 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 481  Q
     ||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  35918084 actgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgct 35917985  T
Q  482 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaac 523  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  35917984 ctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 289 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606585
Alignment:
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 7606724  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7606723 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 7606585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 113 - 526
Target Start/End: Original strand, 32218941 - 32219345
Alignment:
Q  113 cgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| | || ||||||||||||    
T  32218941 cgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataagagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcagtataaatatagacct 32219040  T
Q  213 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaa 312  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||           |||||||||||| | || |||    
T  32219041 tgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaa 32219129  T
Q  313 cactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga 411  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||  || ||||||||| |||||||||||| |    
T  32219130 cactagggtttgaaggttgattcaccttggg-aaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaa 32219228  T
Q  412 gacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaa-cgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggac 509  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  32219229 gacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggac 32219328  T
Q  510 cgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||    
T  32219329 cgaactgggtcaacaaa 32219345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012087
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||  || ||    
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgtt-gggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtga 36011949  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  36011950 ctttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttct 36012049  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36012050 tcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 36012087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 47149188 - 47148892
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| || ||||  |||    
T  47149188 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggt 47149089  T
Q  330 tgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 428  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47149088 tgattcacctt--ggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 47148991  T
Q  429 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47148990 cattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaa 47148892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 231 - 487
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956907
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  29956750 gattcacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 29956848  T
Q  430 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29956849 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468450
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaacca-ggtttgtata 53468690  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||  || ||    
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattggga 53468591  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||  ||    
T  53468590 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccc 53468491  T
Q  488 cccag--actaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53468490 cccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 53468450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 140 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28761813 - 28761424
Alignment:
Q  140 ataacataaacatatttttggg-tgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 238  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| || | || || |||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||    
T  28761813 ataacaaaaacatatttttgggctgagattttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagataga 28761714  T
Q  239 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 338  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || |||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  28761713 gggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcacc 28761615  T
Q  339 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 437  Q
    || || |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  28761614 tt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatat 28761516  T
Q  438 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||    
T  28761515 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaa 28761424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Original strand, 1321194 - 1321441
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321194 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattagaggtttcaagttt-gaggcaaagcactgaaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 1321292  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1321293 acgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatc 1321392  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 267  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321393 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 1321441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674763
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
           | ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  || ||     
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggat 51674900  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc 489  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||    
T  51674899 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctcccc 51674800  T
Q  490 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || || |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  51674799 cataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 51674763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 39715393 - 39715725
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39715393 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtat 39715491  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  39715492 agagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 39715590  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||| | |||| || ||  ||||||    
T  39715591 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatggttg--ctctcc 39715686  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||| | | |||||||| |||| ||||||||||    
T  39715687 cccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaa 39715725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 42992205 - 42992530
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42992205 acttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggttt 42992304  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||      
T  42992305 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagag 42992403  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||               ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  42992404 tg-gactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctct 42992487  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42992488 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 42992530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889779
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtata 890007  T
Q  291 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||| || || || ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagt-tggg 889909  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||| | |||||    
T  889908 gctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcc 889809  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgg 517  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  889808 cgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691571
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||  |  |     
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattaggg 54691709  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  54691708 ctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctccc 54691609  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | |||||| || |||||| || ||||| |||| |||||    
T  54691608 ctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaa 54691571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 191 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |     
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggg 28100176  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100175 ctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 23633383 - 23633713
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  23633383 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtat 23633481  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    || ||||| ||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||    
T  23633482 agtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc---gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 23633575  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| |    
T  23633576 actttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctct-c 23633674  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  23633675 cccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaa 23633713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 343 - 526
Target Start/End: Original strand, 5886274 - 5886458
Alignment:
Q  343 ggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5886274 ggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttgtct 5886373  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5886374 ttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 343 - 526
Target Start/End: Original strand, 5899747 - 5899931
Alignment:
Q  343 ggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5899747 ggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 5899846  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5899847 ttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 318 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688161
Alignment:
Q  318 gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactt 416  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 25688269  T
Q  417 attcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaa-cgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaac 514  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25688268 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 25688169  T
Q  515 tgggtcaa 522  Q
    ||||||||    
T  25688168 tgggtcaa 25688161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 280 - 526
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484620
Alignment:
Q  280 gggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacgga 377  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggtttgagtctcttggttacggg 6484470  T
Q  378 aagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagaggg 476  Q
    |||||  || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||    
T  6484471 aagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggaggg 6484570  T
Q  477 ctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6484571 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 6484620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 24177032 - 24177374
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||    
T  24177032 aatcgtggcacgtttgcagggcaacgtggcacgattggttgtttcagttct-gaagcaagtcactggaaaaaatgtggcacgatgggatcgcaatgtggc 24177130  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| |||  || || ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24177131 acgatggtgcgttggaggcgaaaaacataaacgtatttttaagtgcagatttgttccaaattttaagggatacttttattataaatatagaccttgtatc 24177230  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacacta 317  Q
    | || |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  24177231 atagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttag-atgtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta 24177328  T
Q  318 gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct 366  Q
     ||||   |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24177329 aggtt--ggggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtct 24177374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 525
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591442
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt--- 53591215  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
            |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||  || ||  |  ||    
T  53591216 --------ctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttgga 53591306  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||| ||    
T  53591307 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-cc 53591405  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  53591406 ccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 342 - 526
Target Start/End: Original strand, 11168175 - 11168361
Alignment:
Q  342 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11168175 gggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatttctc 11168274  T
Q  441 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  11168275 ttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaa 11168361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 422
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181177
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| || |||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattc-actttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattggga 28181144  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 422  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28181145 ctttggatagaattaggcgggagacgtattctt 28181177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 499
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151577
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||| |||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||     
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgg 31151465  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactca-tcatatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||| |||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  31151466 gactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctct 31151563  T
Q  486 cccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||||||    
T  31151564 cccccagactaggt 31151577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6063990 - 6063808
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6063990 aaatcaggtttatgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacaatggaggttttagttttttgggcaaggcactgaaaaaatcgtggcacgat 6063891  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||| |  || || | ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  6063890 ggggtcgcatcgtggcacgatggtggactggcggataaaaata-aaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagc 6063808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 230 - 526
Target Start/End: Original strand, 4666488 - 4666774
Alignment:
Q  230 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggt 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||           |||||   || | ||||||||||||| ||||    
T  4666488 tgagatagagggggctgaaagaagggtctagtaagacaacaacaaaaatagggtttgt-----------ctcttgacaacagacactagggtttgagggt 4666576  T
Q  330 tgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaa 426  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4666577 tgattcatcttggg-aaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaa 4666675  T
Q  427 accattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaaca 524  Q
     |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4666676 tccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaaca 4666772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 190 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 13420506 - 13420189
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||          ||  ||||||||||||||||    
T  13420506 acttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggttta----------aatcaaactagggtttgtat 13420417  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||| |||||  | || |||||||||||||   | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||    
T  13420416 agagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 13420322  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||     
T  13420321 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgctctct- 13420223  T
Q  487 ccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggt 519  Q
    | ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  13420222 caccagactaggtcagttttggaccgaaatgggt 13420189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 468
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884357
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||| | ||||||| || ||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttg--ta 54884178  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |    
T  54884179 gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaa 54884277  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 468  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  54884278 ctttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 54884357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Original strand, 5899476 - 5899657
Alignment:
Q  4 aatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatg 103  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5899476 aatcaggtttctgcataatcatggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggatgttttagttttttaggcaaggcactggaaaaatcatggcacgatg 5899575  T
Q  104 gggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || || | |||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  5899576 gggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagataaaaata-aaacgtatttttgggtacagatttgttacagattttaagc 5899657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 190 - 519
Target Start/End: Original strand, 53597164 - 53597491
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  53597164 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga-ggggatgaaacaagggttta-taagtcaacaagaaaactaggggttgtat 53597261  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||| |||||| | || |||||||||||||     |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  || ||  ||||    
T  53597262 agagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--gaagttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgag 53597357  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||||    
T  53597358 attttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctc 53597457  T
Q  487 ccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggt 519  Q
    || || ||||||| | | |||||||||| |||||    
T  53597458 ccacaaactaggtcagtattggaccgaattgggt 53597491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 443
Target Start/End: Original strand, 23636952 - 23637199
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23636952 ttttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaactagggtttgtatag 23637050  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
    ||| || ||||| | || |||||||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||   |  |||    
T  23637051 agtctg-ctcttggcaacaaacactagggtt--tgggttgatttacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggac 23637146  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23637147 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 23637199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||    
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac-----------ta 28137540  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||  || |     
T  28137539 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattgggg 28137441  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagact 415  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137440 ctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 238 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 562058 - 561771
Alignment:
Q  238 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctc 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||    ||||||||| |    
T  562058 agggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacatgaaa-ctagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--caggttgattcac 561964  T
Q  338 cttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatt 436  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||     
T  561963 att-gggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgata 561865  T
Q  437 tc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc-ccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||    
T  561864 tcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaa 561771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 315 - 526
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232060
Alignment:
Q  315 ctagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 413  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggaga 6231946  T
Q  414 cttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 511  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||| | |||| | | |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  6231947 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtgaa-cggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccg 6232045  T
Q  512 aactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||    
T  6232046 aactgggtcaacaaa 6232060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10192513 - 10192401
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10192513 aaatcagatttatgcggaatcgtggcacgatcgcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 10192415  T
Q  103 ggggtcgcatcgtg 116  Q
    ||| ||||||||||    
T  10192414 gggatcgcatcgtg 10192401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 274 - 526
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795519
Alignment:
Q  274 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtt 372  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | || |||||||||||||   |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||     
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaa-actattaggattgagtctcttggtc 17795363  T
Q  373 acggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 470  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | |    
T  17795364 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaac 17795463  T
Q  471 agagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||| ||||||    
T  17795464 ggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaa 17795519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 274 - 526
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103959
Alignment:
Q  274 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtt 372  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | || |||||||||||||   |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||     
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaa-actattaggattgagtctcttggtc 19103803  T
Q  373 acggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 470  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | |    
T  19103804 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaac 19103903  T
Q  471 agagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||| ||||||    
T  19103904 ggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaa 19103959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 390 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27635792 - 27635655
Alignment:
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  27635792 ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 27635693  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27635692 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 27635655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 192 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635830
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggt 321  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 239 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 36871583 - 36871304
Alignment:
Q  239 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 338  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||| |  | ||||||| ||    
T  36871583 gggggctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcacc 36871488  T
Q  339 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatt 436  Q
    ||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   || |||||||||||| || || ||| |     
T  36871487 ttgga-aaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgtta 36871389  T
Q  437 tctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggt 519  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  36871388 tctctttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggt 36871304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 232 - 360
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  232 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  332 attctccttggggaaacactattaggatt 360  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  41849217 attcacctt-gggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggt 321  Q
    |||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 394 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701668
Alignment:
Q  394 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccag 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  493 actaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaa 47701668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 186
Target Start/End: Original strand, 5886039 - 5886182
Alignment:
Q  42 aacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaat 141  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||     
T  5886039 aacgtggcacgatggatgttttagttttttaggcaaggtactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggtacgatggtgcgctggcagataaa 5886138  T
Q  142 aacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 186  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5886139 aata-aaacgtatttttgggtgcaaatttgttacagattttaagc 5886182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 274 - 526
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635642
Alignment:
Q  274 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtt 372  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||     
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttggg-aaacactattaggatttagtctcttggtc 25635486  T
Q  373 acggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 470  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||| ||| | |    
T  25635487 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaac 25635586  T
Q  471 agagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||| ||||||||||||  | |||||  |||||||||| ||||| || ||||||    
T  25635587 agagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaa 25635642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 38210083 - 38210214
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210083 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 38210182  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  38210183 ggggtctcatcgtggcacgatagtgcgctggc 38210214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 50493692 - 50493823
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493692 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 50493791  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  50493792 ggagtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 50493823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 25388654 - 25388795
Alignment:
Q  44 cgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataa 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||    
T  25388654 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagataaaaa 25388753  T
Q  144 cataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 186  Q
     | ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  25388754 ta-aaacatatttttgggagcagatttgttacagattttaagc 25388795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10085593 - 10085481
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10085593 aaatcagatttatgcggaatcgtggcatgatcgcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 10085495  T
Q  103 ggggtcgcatcgtg 116  Q
    ||| || |||||||    
T  10085494 gggatcacatcgtg 10085481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 53896738 - 53896613
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53896738 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggtactggaaaaatcgtggcacgat 53896639  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgc 128  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  53896638 ggggtctcatcgtggcacgatggtgc 53896613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 320
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactaggg 320  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 104
Target Start/End: Original strand, 38889786 - 38889875
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 104  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38889786 tgcagaatcgtggtacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcattggaaaaatcgtggcacgatgg 38889875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 43228613 - 43228685
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43228613 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 43228685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 308
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306840
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  292 agtttgtctcttcggaa 308  Q
    |||||||||||| ||||    
T  3306824 agtttgtctctttggaa 3306840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 5191977 - 5192049
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5191977 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 5192049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10955958 - 10955886
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10955958 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 10955886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10958254 - 10958182
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10958254 aattgttctatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 10958182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 450 - 526
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849319
Alignment:
Q  450 ttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 41849319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Original strand, 35777179 - 35777280
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777179 aaattagatttctgcagaatcgtggcacgacagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 35777278  T
Q  103 gg 104  Q
    ||    
T  35777279 gg 35777280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 346 - 526
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307020
Alignment:
Q  346 aacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-ttt 443  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  444 gtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |   || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaa 3307020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10084320 - 10084248
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10084320 aattgtcccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 10084248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10191243 - 10191171
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10191243 aattgtcccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 10191171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 25533751 - 25533822
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25533751 aattgttccatacactttgttttggttgcttgat-atctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 25533822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 43226404 - 43226475
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43226404 aattgttccatacactt-gttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 43226475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 53893985 - 53893913
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53893985 aattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 53893913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 11168427 - 11168500
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11168427 aattgttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 11168500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 388 - 526
Target Start/End: Original strand, 24181501 - 24181642
Alignment:
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||    
T  24181501 gactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct 24181600  T
Q  486 cccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  24181601 cctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaa 24181642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 655
Target Start/End: Original strand, 25389233 - 25389297
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttatt 655  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25389233 aattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttatt 25389297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 41849387 - 41849451
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41849387 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 41849451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 50494325 - 50494397
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50494325 aattattccatacgctttgttttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 50494397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 459 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919112
Alignment:
Q  459 atatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 35919112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 591 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 7606535 - 7606465
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgt 660  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7606535 aattgttccatacactttgattttggttgcttgactatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgt 7606465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 1321805 - 1321878
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1321805 aattgttccatacactttgttttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 1321878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Original strand, 1673898 - 1674140
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 287  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||  |||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||    
T  1673898 acttttactataaatatagaacttgtatcaaaagtaaaccttgatgtagagagt-ctgaaaataagggtttagaa-gttaacaagaaaactagtgtttgt 1673995  T
Q  288 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 386  Q
    ||| |||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  ||    
T  1673996 atatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatggg-aaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattg 1674091  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgat 435  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  1674092 ggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgat 1674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 27635591 - 27635518
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27635591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 27635518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 38890366 - 38890439
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38890366 aattgttccatacgctttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 38890439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 456242 - 456306
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  456242 catacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 456306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 458619 - 458683
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  458619 catacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 458683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Original strand, 1313728 - 1313800
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtga 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1313728 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtga 1313800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 4308215 - 4308143
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4308215 aattgttccatacactttgttttggttgttggattattccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 4308143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 27101115 - 27101043
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27101115 aattgttccatacactttgttttggttgcctgattattcattgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 27101043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 459 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 53894121 - 53894054
Alignment:
Q  459 atatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53894121 atatattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 53894054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 32219408 - 32219482
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32219408 aattgttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttatttgtgtgat 32219482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53896553 - 53896475
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 245  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53896553 atttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 747092 - 747157
Alignment:
Q  599 catacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  747092 catacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 747157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 1620642 - 1620485
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||   || | ||  ||||||||| || ||||| ||||||    
T  1620642 aaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaaccctttgatatctctt 1620543  T
Q  443 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1620542 tgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggt 1620485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4560599 - 4560502
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 287  Q
    ||||| |||| || |||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4560599 actttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactagagtttgt 4560502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 594 - 663
Target Start/End: Original strand, 5886528 - 5886596
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5886528 tgttccatacactttgttt-ggttgcttgtttatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 5886596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 594 - 663
Target Start/End: Original strand, 5900001 - 5900069
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5900001 tgttccatacactttgttt-ggttgcttgtttatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 5900069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 36012150 - 36012223
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  36012150 aattgttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgat 36012223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 43421353 - 43421280
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa-gttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  43421353 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatatcttgctccacacatcaactttgttattggtgtgat 43421280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 45883264 - 45883337
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45883264 aattgttccatacactttgttttggttgcttaactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 45883337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 53917599 - 53917526
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  53917599 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattagtgtgat 53917526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 9604539 - 9604467
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9604539 aattgtttcatacactttggtttggttacttgattattccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 9604467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 1626619 - 1626548
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1626619 aattgttccatacactttgtttttgttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 1626548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 3315006 - 3315065
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3315006 aattgttccatacactttgcttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtt 3315065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 31151667 - 31151734
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  31151667 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtatttattggtgtgat 31151734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 43423401 - 43423346
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43423401 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaa 43423346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6719635 - 6719532
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatgg---aggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcac 99  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||||| |   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6719635 aaatcaggtttctgcttaatcgtggcacgattgaagggcatcgtggcacgattggagaggtttcagttttt-aggcaatgcactggaaaaatcgtggcac 6719537  T
Q  100 gatgg 104  Q
    |||||    
T  6719536 gatgg 6719532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 18099104 - 18099030
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18099104 aattgttccatacactttgatttttgttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 18099030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 410 - 526
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634148
Alignment:
Q  410 gagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgg 507  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | |  | ||||||||||||| ||||||||||  ||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  508 accgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaa 25634148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 646
Target Start/End: Original strand, 26720878 - 26720928
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26720878 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaa 26720928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 51943694 - 51943752
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  51943694 aattgttccaaacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtt 51943752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858699
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtctttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctcttt 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||   || |||||||    
T  5858546 aaacactattaggattgagtctt-ggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt 5858640  T
Q  444 gtaacgttactcat--cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    |||| |  ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5858641 gtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggt 5858699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 6065718 - 6065653
Alignment:
Q  599 catacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6065718 catacactttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 6065653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 655
Target Start/End: Original strand, 11170696 - 11170761
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttatt 655  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11170696 aattattccatacactttgattttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagttgttatt 11170761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22114227 - 22114162
Alignment:
Q  599 catacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22114227 catacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgctattggtgtgat 22114162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 28181325 - 28181397
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28181325 aattgttccatacactttgttttggttgtttgattgtc-cttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 28181397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 32263974 - 32263901
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc-aagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  32263974 aattgttccatacactttgttttggttgtctgattatcacttgctccacacatcaaatttgttattagtgtgat 32263901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 42990633 - 42990698
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42990633 catacactttgttttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 42990698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 51726938 - 51726866
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  51726938 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattat-tcttgccccacacatcaagttgttattggtgtgat 51726866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6719468 - 6719396
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 239  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6719468 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 24980032 - 24980104
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24980032 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 24980104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 348 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913982
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 29914037  T
Q  446 aacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || |  ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  29914036 aaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggt 29913982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 38210697 - 38210769
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38210697 aattattccatacgctttgttttgtttgtttgataatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 38210769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 880386 - 880331
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  880386 tgttccatacactttgttttggttgcttgattaatccttgctccacacatcaagtt 880331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Original strand, 3859837 - 3859908
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtga 662  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3859837 aattgtttcatacactttgttttggttgcttaactatcccttattccacacatcaagttgttattggtgtga 3859908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 5522548 - 5522485
Alignment:
Q  601 tacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5522548 tacactttgattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 5522485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6066254 - 6066195
Alignment:
Q  45 gtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6066254 gtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaacatcgtggcacgatgg 6066195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6719546 - 6719471
Alignment:
Q  111 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  6719546 atcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgatacagattttaagc 6719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 7606947 - 7606880
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt 70  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606947 aaatcaggtttctgcagaatcgtgacacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt 7606880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10621452 - 10621386
Alignment:
Q  599 catacactttg--ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10621452 catacactttggtttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 10621386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 495
Target Start/End: Original strand, 13419864 - 13420110
Alignment:
Q  246 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttgggga 345  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | || |||||||||||||   || ||||||| |||| ||||    
T  13419864 gaaacaaaggttta-aaagccaacaagaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcacctt-ggga 13419956  T
Q  346 aacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa-accattgatttctctt 442  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||  | | | ||||||||||||| ||  || ||| | ||| |||||| |   ||||| ||||||    
T  13419957 aacactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaagaataatttttgtaacatttttgatatctctt 13420056  T
Q  443 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 495  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  || || || ||||||||||||||||    
T  13420057 tgtaaagttactcatcattatagtggaatagtggactcctctctcccccagact 13420110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 18096834 - 18096775
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18096834 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtt 18096775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 53591504 - 53591559
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  53591504 aattgttccatacattttgttttggttgcttgattatcccttgttccacacatcaa 53591559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 607 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 28412946 - 28412892
Alignment:
Q  607 ttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28412946 ttgttttggttacttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtg 28412892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 53915431 - 53915358
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  53915431 aattgtttcatacacttggttttggttgcttgactatcccttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgat 53915358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736388
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094102
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10094161  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10094160 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 10094102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18552966
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 28761375 - 28761307
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  28761375 ttccatacactttattttggttgtttgattatcacttgctccacacatcaagattattattggtgtgat 28761307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30709873
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 42992712 - 42992780
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  42992712 ttccatacactttgttttggttgtctgattatcccttgctctacacatcaagtttgttattagtgtgat 42992780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 591 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 54691509 - 54691445
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttatt 655  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  54691509 aattgtttcatacattttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacataaatttgttatt 54691445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12267912 - 12267857
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||    
T  12267912 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactattccctgctccacacatcaa 12267857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634504
Alignment:
Q  329 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 426  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||  |||||  ||||||||||||||| ||||||   || |||| ||||||||||    
T  14634638 ttgattcaccttggg-aaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaa 14634540  T
Q  427 accattgatttctc-tttgtaacgttactcatcata 461  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  14634539 acctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 14634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 23633775 - 23633842
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||  ||||| |||||||    
T  23633775 ttccatacactttgttttggttgcttgattttcacttgcttcacacatctagtatttattggtgtgat 23633842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 6484679 - 6484753
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc-aagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  6484679 aattgttccatacactttgattttggttgcttaattattccttgctccacacatcaaatttgttattagtgtgat 6484753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  311 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggc 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 25688094 - 25688021
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtga 662  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  25688094 aattgttccatacactttgattttggttgtctgattatcacttgctccacacataaagtttgttattggtgtga 25688021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 614 - 655
Target Start/End: Original strand, 36957651 - 36957692
Alignment:
Q  614 ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttatt 655  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36957651 ggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttatt 36957692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370569
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  8370505 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9666510 - 9666466
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9666510 tctctcccccagattaggtaaagttggaccgaactgggtcaacaa 9666466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100119
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||   || |||| ||||||| ||  ||||    ||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 10100178  T
Q  443 tgtaacgttactcat-cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10100177 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 10100119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200982
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10201041  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || || |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10201040 tggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 10200982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 221
Target Start/End: Original strand, 13893287 - 13893347
Alignment:
Q  161 gtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaa 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13893287 gtgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatatagacattgtatcaaa 13893347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 661
Target Start/End: Original strand, 15781203 - 15781271
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15781203 tgttccatacactttattttgcctgcttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtg 15781271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 18162986 - 18163042
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  18162986 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttactccacacatcaa 18163042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 21711291 - 21711227
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  21711291 atagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975035
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  27974971 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986529
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  27986465 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 48361604 - 48361568
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattat 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48361604 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattat 48361568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 1417510 - 1417573
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  1417510 tagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 499
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897160
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 10897103  T
Q  446 aacgttactcat--cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || |  ||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10897104 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 10897160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 610 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 28101922 - 28101883
Alignment:
Q  610 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28101922 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtt 28101883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878170
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 47878255  T
Q  446 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||| ||||||    
T  47878254 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaa 47878170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 53468389 - 53468318
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  53468389 aattgttccatacactttgttttggctgctccattattcattgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 53468318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 499
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193381
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 54193324  T
Q  446 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || |  || |  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54193325 aaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 54193381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 5886196 - 5886242
Alignment:
Q  178 attttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagca 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  5886196 attttaagcgaaacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5886242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626105
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 224
Target Start/End: Original strand, 5899660 - 5899717
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagca 224  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  5899660 atttgttacagattttaagcgagacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5899717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 6063356 - 6063303
Alignment:
Q  610 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6063356 ttttggttgcttaattatcccttgttccacacatcaagttgttatcggtgtgat 6063303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 255
Target Start/End: Original strand, 6484308 - 6484373
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg 255  Q
    |||||| ||| |||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484308 acttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 36871225 - 36871185
Alignment:
Q  607 ttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36871225 ttgttttggttgcttgattat-tcttgctccacacatcaagt 36871185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 46967017 - 46966940
Alignment:
Q  142 aacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  46967017 aacagaaacatatttttcaatgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaacattgtatca 46966940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 47148831 - 47148794
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatc 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47148831 aattgttccatacactttgttttggttgtttgattatc 47148794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 48438282 - 48438221
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  48438282 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 561710 - 561659
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  561710 ttccatacactttgttt-ggttgcttgattattacttactccacacatcaagt 561659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 5926702 - 5926630
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtga 662  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  5926702 aattgttccttacactttgttttggttacttgattattccttacttcacacatgaagtttgttattggtgtga 5926630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 627
Target Start/End: Original strand, 6232120 - 6232156
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattat 627  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6232120 aattgttccatacactttattttggttgcttgattat 6232156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303464
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||   || |||| ||||||| ||  ||||    ||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 6303405  T
Q  443 tgtaacgttactcat-cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6303406 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 6303464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208028
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10208087  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10208086 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggt 10208028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16264418 - 16264354
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  16264418 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 16499153 - 16499197
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16499153 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 16499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Original strand, 25388798 - 25388850
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 219  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25388798 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatca 25388850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 607 - 663
Target Start/End: Original strand, 25635713 - 25635769
Alignment:
Q  607 ttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  25635713 ttgtattggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtatttattagtgtgat 25635769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 32143389 - 32143325
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  32143389 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 33386685 - 33386749
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  33386685 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913461
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331713
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 47701610 - 47701574
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattat 627  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47701610 aattgttccatacactttgttttcgttgcttgattat 47701574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 880175 - 880120
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  880175 tgtttcatacactttgttttctttgcttgattattccttactccacacatcaagtt 880120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 4666835 - 4666890
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  4666835 aattgtttcatacactttattttggttgcatgataatcacttactccacacatcaa 4666890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595155
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 10595155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 37466358 - 37466295
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  37466358 tagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 646
Target Start/End: Original strand, 17795581 - 17795631
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  17795581 ttccatacattttattttggttgcttgactatcagttgctccacacatcaa 17795631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 646
Target Start/End: Original strand, 19104021 - 19104071
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  19104021 ttccatacattttattttggttgcttgactatcagttgctccacacatcaa 19104071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1618992 - 1618916
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 263  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| || || |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1618992 actttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 1618916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 4308725 - 4308676
Alignment:
Q  80 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 129  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  4308725 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcg 4308676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634018
Alignment:
Q  274 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| |   || ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggct--gggattgattcacctt-gggagacattattaggattgagtct 25634018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 25795834 - 25795785
Alignment:
Q  476 gctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  25795834 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26299045 - 26298992
Alignment:
Q  472 gagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||    
T  26299045 gagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31021341 - 31021304
Alignment:
Q  329 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct 366  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31021341 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtct 31021304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 611 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 51674682 - 51674629
Alignment:
Q  611 tttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  51674682 tttggttgcttgattattccttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgat 51674629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 4103822 - 4103755
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  4103822 ttccatacactttttttcggttgtttgactatc-cttgctccacgcatcaagtttgttattggtgtgat 4103755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 23391953 - 23391909
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23391953 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 23391909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27453026 - 27452962
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  27453026 atagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 27452962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29196430 - 29196386
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29196430 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 29196386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236293
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 30236293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 32744476 - 32744436
Alignment:
Q  485 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32744476 tcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32744436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #259
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 36029161 - 36029097
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||    
T  36029161 atagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaa 36029097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #260
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153361
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 39153361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #261
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 40734622 - 40734666
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40734622 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40734666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #262
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 521
Target Start/End: Original strand, 40735507 - 40735547
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtca 521  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  40735507 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtca 40735547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #263
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 473 - 525
Target Start/End: Original strand, 47923937 - 47923989
Alignment:
Q  473 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  47923937 agggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 47923989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #264
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 51398938 - 51398982
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 526
Target Start/End: Original strand, 2670 - 3168
Alignment:
Q  28 cacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggt 126  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2670 cacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggt 2768  T
Q  127 gcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaa 226  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2769 gcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaa 2868  T
Q  227 ctttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2869 ctttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 2968  T
Q  327 ggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 425  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2969 ggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 3067  T
Q  426 aaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3068 acccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaa 3167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 3243 - 3306
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3243 catacactttgttt-ggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 69817 - 69291
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  69817 aaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtagcacaa 69719  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  69718 tgggatcgcatcgttgcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaata 69620  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 297  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69619 aatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 69520  T
Q  298 tctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttggg 396  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||    
T  69519 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttggg 69421  T
Q  397 tagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  69420 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccagacta 69321  T
Q  497 ggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  69320 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 69291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 73528 - 73207
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||          
T  73528 aaatcagatttatgcagaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaattgtg------ 73436  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
                   ||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  73435 ---------------gcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagagatacttttactata 73352  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 297  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  73351 aatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 73252  T
Q  298 tctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttgg 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  73251 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 69220 - 69152
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  69220 ttccatacattttgttttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 69152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73160
Alignment:
Q  305 ggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactatt 354  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  73208 ggaaaaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 217)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 3878338 - 3878867
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3878338 aaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacga 3878436  T
Q  102 tggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3878437 tggggtcgcatcgtggcacgatggtacgctggcagcgaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactata 3878535  T
Q  202 aat----atagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 295  Q
    |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878536 aattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 3878635  T
Q  296 tgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttg 394  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3878636 tgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcacctt-ggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttg 3878734  T
Q  395 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccaga 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3878735 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaga 3878834  T
Q  494 ctaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3878835 ctatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3878867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27306740 - 27306229
Alignment:
Q  15 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27306740 tgcaaaatcgtggcacgatggctggacaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcattggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcttc 27306642  T
Q  114 gtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacctt 213  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27306641 gtggcacgatggtgcgctagcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 27306542  T
Q  214 gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaac 313  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  27306541 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaa 27306443  T
Q  314 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 412  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27306442 actagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggag 27306344  T
Q  413 acttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 511  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  27306343 acttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggacca 27306244  T
Q  512 aactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||    
T  27306243 aactgggtcaacaaa 27306229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 35412 - 35919
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35412 aatcgtggcacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 35510  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
     |||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35511 ccgatcgtgcgctggcagcaaatagcagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 35610  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35611 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactag 35710  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35711 gttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 35809  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35810 ttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactg 35909  T
Q  517 ggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||||    
T  35910 gatcaacaaa 35919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 526
Target Start/End: Original strand, 25542317 - 25542818
Alignment:
Q  24 gtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacga 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25542317 gtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttta-aggcaaggcacttgaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacga 25542415  T
Q  123 tggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgg-gtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaa 221  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25542416 tggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttgagtgtagatttattccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaga 25542515  T
Q  222 gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggt 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25542516 gcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggt 25542614  T
Q  322 ttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 420  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25542615 ttgtgggttgattcaccttgg--aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattc 25542712  T
Q  421 ttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtc 520  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25542713 ttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtc 25542812  T
Q  521 aacaaa 526  Q
    ||||||    
T  25542813 aacaaa 25542818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 44347 - 44854
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44347 aatcgtggcacgatttctgggcaatgtggcacgattggaggtttcaagttt-gacgcaaagcactggaaaaatcatggcacgatggggtcgcatcgtggc 44445  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44446 acgatggtgcgctggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcagatttgtaccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 44545  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44546 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactag 44645  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
    | |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44646 gttttgagggttgattcacctt-aggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagactta 44744  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44745 ttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactg 44844  T
Q  517 ggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||    
T  44845 ggtcaacaaa 44854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1049710 - 1049295
Alignment:
Q  111 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 210  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1049710 atcgtggcacgaaggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 1049611  T
Q  211 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaga 310  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1049610 cttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaata 1049511  T
Q  311 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1049510 aacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 1049412  T
Q  410 gagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggac 509  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1049411 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 1049312  T
Q  510 cgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||    
T  1049311 cgaactgggtcaacaaa 1049295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 40837245 - 40836742
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||              
T  40837245 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggtcggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaaaatc---------- 40837156  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgg-gtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactaca 201  Q
               |||||||||||||| | ||||||| || || | |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  40837155 -----------gtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaatagaaacatattttttgagtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactata 40837067  T
Q  202 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40837066 aatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 40836967  T
Q  302 ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtaga 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40836966 ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtaga 40836868  T
Q  401 attaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggta 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  40836867 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtc 40836768  T
Q  501 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  40836767 aatttggaccgaactgggtcaacaaa 40836742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31435553 - 31435045
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||||||||||||| || | ||||    
T  31435553 aatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatggggtcacaacttggc 31435455  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttg-ggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtat 217  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31435454 acgatggtgcgctggcaacgaataacagaaacgtatttttttggtgcaaatt-gttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtat 31435356  T
Q  218 caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacacta 317  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  31435355 cagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgcta 31435256  T
Q  318 gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactt 416  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||    
T  31435255 gggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagactt 31435157  T
Q  417 attcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaac 514  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  31435156 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaac 31435057  T
Q  515 tgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||    
T  31435056 tgggtcaacaaa 31435045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 38393935 - 38394276
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393935 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38394034  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  38394035 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 38394133  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38394134 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38394233  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38394234 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 38394276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 193 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7470021
Alignment:
Q  193 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7470260  T
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7470259 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 7470161  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  7470160 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctc 7470061  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7470060 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 7470021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 167 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31156271 - 31155910
Alignment:
Q  167 atttgttccaaattt-taagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 265  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156271 atttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 31156172  T
Q  266 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagt 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31156171 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagt 31156073  T
Q  365 ct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 463  Q
    || |||| ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31156072 ctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcctata 31155973  T
Q  464 gtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  31155972 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 31155910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724869
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctggga 44724731  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44724732 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 44724831  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44724832 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 44724869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1046924
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1047119 gattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 1047021  T
Q  430 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1047020 attgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1046924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 193 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7471979
Alignment:
Q  193 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 7472218  T
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  7472217 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 7472119  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7472118 aactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctc 7472019  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7472018 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 7471979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 48457602 - 48457943
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457602 actttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 48457701  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48457702 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacc-tagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 48457800  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48457801 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 48457900  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48457901 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 48457943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 3035670 - 3036014
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035670 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 3035769  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacgg---aaaga 381  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  3035770 ttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaga 3035868  T
Q  382 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgc 480  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3035869 ggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 3035968  T
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3035969 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3036014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Original strand, 20625998 - 20626328
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 296  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625998 aaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 20626097  T
Q  297 gtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgg 395  Q
    |||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20626098 gtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 20626196  T
Q  396 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagac 494  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20626197 gtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 20626296  T
Q  495 taggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20626297 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20626328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Original strand, 20629889 - 20630219
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 296  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629889 aaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 20629988  T
Q  297 gtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgg 395  Q
    |||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20629989 gtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 20630087  T
Q  396 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagac 494  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20630088 gtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 20630187  T
Q  495 taggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20630188 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20630219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Original strand, 20642308 - 20642638
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 296  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642308 aaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 20642407  T
Q  297 gtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgg 395  Q
    |||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20642408 gtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 20642506  T
Q  396 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagac 494  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20642507 gtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 20642606  T
Q  495 taggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20642607 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20642638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 40946277 - 40946618
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946277 actttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 40946376  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  40946377 gtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatt-tactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggc 40946475  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40946476 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctct 40946575  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40946576 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 40946618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 20299407 - 20299750
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20299407 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 20299506  T
Q  285 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactaggg-tttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 382  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20299507 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 20299605  T
Q  383 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 481  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20299606 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgct 20299705  T
Q  482 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20299706 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20299750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850271
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1850075 gattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 1850173  T
Q  430 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1850174 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1850271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 18345490 - 18345831
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag----atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||     |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345490 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18345589  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  18345590 gtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggc 18345688  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  18345689 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttct 18345788  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18345789 ctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaa 18345831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355548
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||    
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgaga 11355410  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttc-tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11355411 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctccc 11355510  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11355511 ctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 11355548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 111 - 426
Target Start/End: Original strand, 26804448 - 26804761
Alignment:
Q  111 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26804448 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 26804546  T
Q  211 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaga 310  Q
    |||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  26804547 cttgtg----agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 26804642  T
Q  311 aacac---tagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||   ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804643 aacactagtagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 26804741  T
Q  407 cgggagacttattcttgtaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26804742 cgggagacttattcttgtaa 26804761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 13099812 - 13099473
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13099812 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 13099713  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  13099712 agagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggg 13099614  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  13099613 gctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct 13099514  T
Q  486 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13099513 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 13099473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 7351947 - 7351651
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  7351947 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7351848  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 428  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7351847 gattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 7351749  T
Q  429 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  7351748 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 7351651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 42331335 - 42330996
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  42331335 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtat 42331236  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtt--acggaaagaggctg 386  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||  ||    
T  42331235 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattg 42331137  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||  |||||    
T  42331136 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctct 42331037  T
Q  486 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42331036 cccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 42330996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 190 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7349615 - 7349285
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349615 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 7349516  T
Q  284 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaaga 381  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  7349515 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 7349417  T
Q  382 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 481  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7349416 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 7349317  T
Q  482 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaa 513  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  7349316 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 190 - 522
Target Start/End: Original strand, 20297311 - 20297648
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20297311 acttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggttt 20297410  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||      
T  20297411 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 20297509  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20297510 tggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 20297609  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20297610 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 20297648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Original strand, 28487547 - 28487843
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  28487547 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggtt 28487646  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 429  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28487647 gattcacctt-tggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 28487745  T
Q  430 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28487746 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 28487843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 190 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 43253860 - 43253520
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--------ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 281  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| |||| |        ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  43253860 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagg 43253761  T
Q  282 gtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43253760 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttgattacggaaag 43253663  T
Q  381 aggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 479  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253662 aggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 43253563  T
Q  480 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43253562 ctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaa 43253520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137108
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||| | | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  || ||    
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattggga 20137246  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| |    
T  20137245 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-c 20137147  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20137146 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20137108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990440
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  292 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 390  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||| |    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgag-aaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 21990303  T
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc 489  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21990304 tttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccc 21990403  T
Q  490 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21990404 aagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 21990440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 443548 - 443886
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  443548 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 443647  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  || |    
T  443648 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattggg 443746  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct-c 486  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| |    
T  443747 actttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcc 443846  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  443847 cccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 443886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4295933
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagacctt-gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  290 agagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||     
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 4296073  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  4296072 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctc 4295973  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4295972 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaa 4295933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 191 - 516
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680307
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || ||    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattggga 21680179  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  21680180 ctttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctccc 21680279  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680280 ccagactaggtgaatttggaccgaactg 21680307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678356
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||   || ||    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattggga 21678218  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21678219 ctttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctccc 21678318  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21678319 ctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaa 21678356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 28485515 - 28485855
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485515 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 28485614  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||      
T  28485615 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctt-tggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagat 28485713  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  28485714 tggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctct 28485813  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28485814 ct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28485855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 18567396 - 18567731
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||||||||||||| || | ||||    
T  18567396 aatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatggggtcacaacttggc 18567494  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttg-ggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtat 217  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18567495 acgatggtgcgctggcaacgaataacagaaacgtatttttttggtgcaaatt-gttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtat 18567593  T
Q  218 caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacacta 317  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  18567594 cagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgcta 18567693  T
Q  318 gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattag 356  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18567694 gggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 192 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412128
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 291  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  292 agtttgtctc-ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||    
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactggga 37412264  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||    
T  37412263 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 37412164  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37412163 ccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaa 37412128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748885
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||  || ||    
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccct-gggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattggga 24748746  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  24748747 ctttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 24748846  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24748847 tccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 24748885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 224 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21592445 - 21592142
Alignment:
Q  224 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggttt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21592445 aaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 21592346  T
Q  324 gtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 422  Q
    | |||||||||| |||| || || ||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21592345 gagggttgattcacctt-ggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattctt 21592247  T
Q  423 gtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtca 521  Q
    ||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21592246 gtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtca 21592147  T
Q  522 acaaa 526  Q
    |||||    
T  21592146 acaaa 21592142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 190 - 470
Target Start/End: Original strand, 11757177 - 11757464
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11757177 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 11757276  T
Q  285 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactaggg-tttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 382  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11757277 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 11757375  T
Q  383 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatc 470  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757376 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatc 11757464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 191 - 522
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681106
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  286 gtatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 383  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc-tcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 9680966  T
Q  384 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 482  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  9680967 ttgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctc 9681066  T
Q  483 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  9681067 tctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaa 9681106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 191 - 468
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276374
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 25276293  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25276294 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 25276374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39145985
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||  |    
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-ggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaa 39146124  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | | |||||||||| | |    
T  39146123 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttc 39146024  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  39146023 cctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaa 39145985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 191 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832651
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||    
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 27832771  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt-tgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |   ||||||| |||||||    
T  27832770 actttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctc 27832671  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttg 506  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  27832670 ccccagactaggtcaatttg 27832651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223448
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg-gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  290 agagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||     
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 42223308  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
      |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||    
T  42223309 agctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctc 42223408  T
Q  487 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  42223409 ccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaa 42223448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 212 - 513
Target Start/End: Original strand, 24258438 - 24258744
Alignment:
Q  212 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 311  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  24258438 ttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa 24258537  T
Q  312 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 410  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  24258538 acactatggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcgga 24258636  T
Q  411 agacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca----tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaattt 505  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||    ||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  24258637 aaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaattt 24258736  T
Q  506 ggaccgaa 513  Q
    ||||||||    
T  24258737 ggaccgaa 24258744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679349
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 286  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  287 tatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 384  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||      
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 9679206  T
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 483  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||  |||||||    
T  9679207 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctct 9679306  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  9679307 ctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaa 9679349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 315 - 526
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396924
Alignment:
Q  315 ctagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 413  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttggg-aaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 38396811  T
Q  414 cttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaa 513  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38396812 cttatttttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  514 ctgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaa 38396924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 175 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22251893 - 22251602
Alignment:
Q  175 caaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa 274  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22251893 caaattttaagcgacacttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaa 22251794  T
Q  275 aactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtta 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||          ||||||||||||| |||||||    
T  22251793 aactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggg---------ataggattgagtctcttggtta 22251703  T
Q  374 cggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattga----tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgg 467  Q
    ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22251702 cgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtgg 22251603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 310 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 7092428 - 7092212
Alignment:
Q  310 aaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 408  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || | |||||||||||||||||||    
T  7092428 aaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg 7092330  T
Q  409 ggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgg 507  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7092329 ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttgg 7092231  T
Q  508 accgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7092230 accgaactgggtcaacaaa 7092212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 22828969 - 22828672
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22828969 acttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtat 22828870  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||| ||||||   || ||||||||| |||||  |||||||||   ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||    
T  22828869 agagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagatt-agaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgag 22828771  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||    
T  22828770 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935558
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 2935558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 140 - 492
Target Start/End: Original strand, 7188445 - 7188796
Alignment:
Q  140 ataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||| ||| | || || |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  7188445 ataacataaacgtatttttgggctgagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga 7188544  T
Q  239 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 338  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||| ||    
T  7188545 gggggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcacc 7188640  T
Q  339 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 437  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  7188641 tt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatat 7188739  T
Q  438 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccag 492  Q
     || ||||||| |||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  7188740 ttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccccag 7188796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 201 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24817674 - 24817362
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 299  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  24817674 aaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatagagtttg-c 24817578  T
Q  300 tcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggta 398  Q
    |||| | || |||||||||||||   |||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  24817577 tctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgga-aagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggta 24817482  T
Q  399 gaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  24817481 gaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatacta 24817382  T
Q  497 ggt-aaatttggaccgaact 515  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  24817381 ggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 316 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 7094670 - 7094463
Alignment:
Q  316 tagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagac 414  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||  || | |||||||||||||||||||||||||    
T  7094670 tagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagac 7094572  T
Q  415 ttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaa 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  7094571 ttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaa 7094472  T
Q  514 ctgggtcaa 522  Q
    |||||||||    
T  7094471 ctgggtcaa 7094463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027193
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 9027193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108356
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 22108356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550116
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 40550116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20091877 - 20091580
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  20091877 acttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga-ggcaaca-caaaactagggtttgta 20091780  T
Q  289 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 387  Q
    ||||||||| || || | || ||| | ||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||  |||    
T  20091779 tagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttggg-aaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattga 20091684  T
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  20091683 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctctc 20091586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606669
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaa 1606669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137367
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 22137367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552394
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 40552394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 266 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813496
Alignment:
Q  266 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc 365  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttggg-aagcactattaggattgagtc 24813661  T
Q  366 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tat 462  Q
    | ||||| |||| ||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  24813660 tcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattat 24813561  T
Q  463 agtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  24813560 agtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaa 24813496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 382
Target Start/End: Original strand, 22392319 - 22392606
Alignment:
Q  83 tggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaatttt 182  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||| |||| |||  |||||||  ||||| |||||||||||||| |    
T  22392319 tggagaaatcgtgccacgatgggatcgcaacgtggtacgatggtgcgctggaggcaaaaaacagaaatgtatttttcagtgcagatttgttccaaattgt 22392418  T
Q  183 aagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 282  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||  |||||||||    
T  22392419 aagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttata--------aatcaaactaggg 22392510  T
Q  283 tttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaaga 381  Q
    |||||||||| |||| || || | || ||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22392511 tttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggt---tgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 22392605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1047487 - 1047356
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047487 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 1047388  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1047387 ggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 1047356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9027671 - 9027502
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9027671 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 9027572  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9027571 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 9027502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 2935086 - 2935217
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935086 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 2935185  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2935186 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 2935217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 22136894 - 22137063
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136894 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 22136993  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22136994 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 22137063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 40551921 - 40552090
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40551921 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 40552020  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40552021 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 40552090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 22107883 - 22108052
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107883 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatgcaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 22107982  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22107983 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 22108052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 40549643 - 40549812
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549643 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatgcaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 40549742  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40549743 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 40549812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 391 - 526
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394013
Alignment:
Q  391 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  489 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaa 22394013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 388 - 526
Target Start/End: Original strand, 26295598 - 26295738
Alignment:
Q  388 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||    
T  26295598 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctct 26295697  T
Q  486 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||    
T  26295698 cctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaa 26295738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 11759483 - 11759555
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11759483 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 11759555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 20297718 - 20297790
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20297718 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 20297790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 20299816 - 20299888
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20299816 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 20299888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 48458009 - 48458081
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48458009 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 48458081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465827
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 24465594  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    | ||||| ||||| | || |||||||||||||   |  ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||||  || ||    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gaattgattcaccttggg-aaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattggga 24465689  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||| | || ||||||| | ||||||||| |||| || | | |  | |||||||||||    
T  24465690 ctttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcc 24465788  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||| | ||| || ||||||||| || ||||||    
T  24465789 cccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaa 24465827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 35985 - 36057
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35985 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 36057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7471913 - 7471841
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7471913 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 7471841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 28487909 - 28487981
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28487909 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 28487981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 38394342 - 38394414
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38394342 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 38394414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 43253449 - 43253377
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43253449 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaaattgttattggtgtgat 43253377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 44920 - 44992
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44920 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 44992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 1850337 - 1850409
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1850337 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 1850409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 3036080 - 3036152
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  3036080 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccaaacatcaaattgttattggtgtgat 3036152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 40836676 - 40836604
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40836676 aattgttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 40836604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  237 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 7094751 - 7094662
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7094751 aaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 9027118 - 9027054
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9027118 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 9027054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 25542884 - 25542956
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25542884 aattgttccatacattttgttttgattgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 25542956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 28485921 - 28485993
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28485921 aattgttccatacattttgttttggttgcttgattatcccttgctccacatatcaagttgttattggtgtgat 28485993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 38396995 - 38397067
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38396995 aattgttctatacactttgttttggttgctttattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 38397067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 655
Target Start/End: Original strand, 40946686 - 40946750
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttatt 655  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40946686 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttatt 40946750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 20626394 - 20626461
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20626394 ttccatacactttattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaggttgttattggtgtgat 20626461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 20630285 - 20630352
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20630285 ttccatacactttattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaggttgttattggtgtgat 20630352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 20642704 - 20642771
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20642704 ttccatacactttattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaggttgttattggtgtgat 20642771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 18345897 - 18345967
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18345897 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagttgttgttggtgtg 18345967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Original strand, 26804361 - 26804462
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    ||||||| ||| | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26804361 aaatcaggtttctacagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggtacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggcagtggaaaaatcgtggcacga 26804459  T
Q  102 tgg 104  Q
    |||    
T  26804460 tgg 26804462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 388 - 499
Target Start/End: Original strand, 6046644 - 6046757
Alignment:
Q  388 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 485  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    || ||||||||||    
T  6046644 gactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctct 6046743  T
Q  486 cccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||||||    
T  6046744 cccccagactaggt 6046757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 7092512 - 7092414
Alignment:
Q  193 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa-actagggtttg 286  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  7092512 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 1606735 - 1606807
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1606735 aattattccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 1606807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 2935625 - 2935697
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2935625 aattgttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgcttcacacatcaagttgttattggtgtgat 2935697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 599 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 1049216 - 1049151
Alignment:
Q  599 catacactttgtttt--ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtga 662  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1049216 catacactttgttttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtga 1049151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 526
Target Start/End: Original strand, 6332326 - 6332512
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-t 441  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||||  ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||| || || || |||| |    
T  6332326 aaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctctt 6332425  T
Q  442 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| | || | ||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  6332426 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 6332512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 42330939 - 42330881
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42330939 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaagtt 42330881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 610 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 1046831 - 1046778
Alignment:
Q  610 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1046831 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 1046778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 655
Target Start/End: Original strand, 3878934 - 3878999
Alignment:
Q  591 aattgttccatacacttt-gttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttatt 655  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3878934 aattgttccatacatttttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttattatt 3878999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 27306169 - 27306096
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27306169 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgttccacacatcaagtttgttattggtgtgat 27306096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 460
Target Start/End: Original strand, 6348930 - 6349006
Alignment:
Q  385 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  6348930 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7351576 - 7351512
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7351576 catacactttgttttggttgcttaattatcccttactccacacatcaagttgttattggtgtgat 7351512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7469955 - 7469884
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7469955 aattgttccatacactttgttttagttgcttgattatc-cctgctccacacatcaaattgttattggtgtgat 7469884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 22137439 - 22137507
Alignment:
Q  596 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22137439 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 22137507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 37412060 - 37411988
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtga 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37412060 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgttccacacatcaagtttgttattggtgtga 37411988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 40552466 - 40552534
Alignment:
Q  596 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40552466 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 40552534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 594 - 661
Target Start/End: Original strand, 44724932 - 44725000
Alignment:
Q  594 tgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  44724932 tgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 44725000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351506
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25351448  T
Q  443 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25351449 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggt 25351506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 1049780 - 1049699
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 101  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1049780 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaagcaaggtactggaaaaatcgtggcacga 1049699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 661
Target Start/End: Original strand, 24748946 - 24749012
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24748946 ttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 24749012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 239
Target Start/End: Original strand, 1606423 - 1606472
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606423 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 460
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049094
Alignment:
Q  247 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 346  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | || |||||||||| |||| || ||||||| |||||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  347 acactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttg 444  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||   ||||||||||| ||||||||||   | |||| ||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccctttg 6049078  T
Q  445 taacgttactcatcat 460  Q
    ||| ||||||||||||    
T  6049079 taaagttactcatcat 6049094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7092146 - 7092073
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7092146 aattgttccacacactttattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 7092073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759417
Alignment:
Q  473 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 11759417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 13099410 - 13099337
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13099410 aattgttccatacactttgttttggttgtttgacgatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 13099337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 26804862 - 26804935
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatc-aagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  26804862 aattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcctttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgat 26804935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 591 - 662
Target Start/End: Original strand, 443949 - 444021
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtga 662  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  443949 aattgttcaatacactttgttttggttgcttgactattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtga 444021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 615 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 1502883 - 1502835
Alignment:
Q  615 gttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1502883 gttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 1502835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 592 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 4295873 - 4295801
Alignment:
Q  592 attgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4295873 attgttctatacactttgttttggttgcttgatgattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 4295801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 7188890 - 7188942
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7188890 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagt 7188942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7349202 - 7349138
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7349202 catacactttattttggttgcttaattatcccttactccacacatcaagttgttattggtgtgat 7349138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 9679410 - 9679482
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9679410 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 9679482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 40550189 - 40550257
Alignment:
Q  596 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40550189 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 40550257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 21990501 - 21990560
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21990501 aattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtt 21990560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 22251523 - 22251452
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  22251523 aattgtttcatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctcaacacatcaagtttgttattggtgtg 22251452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2121054
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  2120899 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 2120994  T
Q  443 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2120995 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 2121054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 526
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081801
Alignment:
Q  247 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 346  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | || |||||||||||||    | ||||||| | ||||| ||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcactttggg-aa 11081614  T
Q  347 acactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccatt--gatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  |  || |||| ||| |||||||   || |||| |||||||||| || ||  ||| ||||||    
T  11081615 acactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctctt 11081714  T
Q  443 -tgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
     ||||| |||||||||| | | | |||| | || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11081715 gtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaa 11081801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 21678413 - 21678471
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  21678413 aattgttccttacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacaaatcaagtt 21678471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7094393 - 7094320
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7094393 aattgttccacacactttattttggttgcttgactatgccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 7094320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 31434986 - 31434913
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31434986 aattgttccttacactttattttgattgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 31434913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320078
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 3320137  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3320136 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 3320078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324826
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 3324885  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3324884 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 3324826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 22108114 - 22108158
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108114 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22108158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 22137125 - 22137169
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137125 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22137169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405547
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 25405488  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25405489 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 25405547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 40549874 - 40549918
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549874 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40549918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 40552152 - 40552196
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552152 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40552196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190101
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284093
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 21680379 - 21680450
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  21680379 aattgttccatacactttgtttttgttgcatgattattccttgcttcacacatcaagcttgttattggtgtg 21680450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357200
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25357142  T
Q  443 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||||  || | || |||||||||||||||||||    
T  25357143 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggt 25357200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 217
Target Start/End: Original strand, 42006404 - 42006545
Alignment:
Q  74 gcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| | || | || ||||||||||||| || ||||  ||| | |||||||    
T  42006404 gcaagtcactgaaaaaatcgtggcacgatggaatcgtaacgtggcacgatggtac-gttgaaggaaataacataaacgta-ttttcagtgaagatttgtt 42006501  T
Q  174 ccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtat 217  Q
    ||| |||||||| |  |||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  42006502 ccatattttaagggttacttttactataaatataaaccgtgtat 42006545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 42223507 - 42223578
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  42223507 aattgttttatacactttattttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtg 42223578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 21592081 - 21592024
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21592081 aattgttccatacacttt-ttttggttgtctgattatcacttgctccacacatcaagtt 21592024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 646
Target Start/End: Original strand, 24465887 - 24465937
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  24465887 ttccatacactttgttttggttgcttgaatatcacttgttccacacatcaa 24465937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410285
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25410225  T
Q  443 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25410226 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggt 25410285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 39145924 - 39145866
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39145924 aattgtttaatacaatttgttttggttgcttgattatcacttactccacacatcaagtt 39145866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16297207 - 16297146
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattag 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  16297207 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 16297146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 27832576 - 27832523
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  27832576 ttccatacactttgttttggttacttgattatttcctgctccacacattaagtt 27832523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796760
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  4796696 atagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069934
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 7069875  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  7069876 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggt 7069934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 499
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074941
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 442  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 7074882  T
Q  443 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7074883 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggt 7074941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9027440 - 9027396
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9027440 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 9027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 11355610 - 11355666
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt-ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  11355610 aattgttccatacactttgtttttggttgcctgattattccttgctccacacatcaa 11355666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983288
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 663
Target Start/End: Original strand, 26295801 - 26295865
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  26295801 catacactttgttttgattgcttgattatcacgtgctccatacatcaagtatttattggtgtgat 26295865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516403
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 2580457 - 2580394
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  2580457 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 233
Target Start/End: Original strand, 2935306 - 2935349
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2935306 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgag 2935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 259
Target Start/End: Original strand, 3677235 - 3677301
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 259  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3677235 ttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 9185195 - 9185258
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9185195 tagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 417 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 13290583 - 13290472
Alignment:
Q  417 attcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaac 514  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | ||||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  13290583 attcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagcggaacagagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaac 13290484  T
Q  515 tgggtcaacaaa 526  Q
    ||||| ||||||    
T  13290483 tgggtaaacaaa 13290472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 650
Target Start/End: Original strand, 22108429 - 22108484
Alignment:
Q  596 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttg 650  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22108429 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttg 22108484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 217
Target Start/End: Original strand, 45366451 - 45366526
Alignment:
Q  142 aacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtat 217  Q
    |||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  45366451 aacagaaacgtatttttcagtgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtat 45366526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 662
Target Start/End: Original strand, 6349149 - 6349215
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtga 662  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||  ||||| ||||||    
T  6349149 ttccgtacactttgttttggttgcttgattattacttgctccatacgtcaagtatttattggtgtga 6349215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30906386 - 30906280
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 288  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||  |  ||||||| |||||||    
T  30906386 acttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaa--caaataacaaactagagtttgta 30906289  T
Q  289 tagagtttg 297  Q
    |||||||||    
T  30906288 tagagtttg 30906280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 1849918 - 1849962
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1849918 acttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 1849962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 2647725 - 2647789
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||| |||||||||||    
T  2647725 atagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 9681171 - 9681243
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9681171 aattgttccatacactttgattttggttgtctaattatcacttgttccacacatcaagtttgttattggtgtg 9681243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 640
Target Start/End: Original strand, 22394075 - 22394119
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccaca 640  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  22394075 ttccatacactttgttttggttgtttgactatcacttgctccaca 22394119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 406
Target Start/End: Original strand, 26210500 - 26210710
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| || |||||  ||||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||     
T  26210500 cttttagtataaatatagaacttgtatcaaatgtaaaccttgagagag-gggggaggaaacaaggttttagaatc-caacctcaaaactagggtttgtag 26210597  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct-ga 387  Q
    ||| ||   ||||| | || || |||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |     
T  26210598 agaatt---ctcttggcaacaa-cactagggtt-gtga-ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgg 26210691  T
Q  388 gactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  26210692 gactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27347985
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159807
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317434
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 322
Target Start/End: Original strand, 6348782 - 6348903
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 298  Q
    ||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| |||||||     
T  6348782 aaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaa-gtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagtttg- 6348879  T
Q  299 ctcttcggaagaaacactagggtt 322  Q
    ||||| | || ||||| |||||||    
T  6348880 ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 28617255 - 28617318
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  28617255 tagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 525
Target Start/End: Original strand, 33332480 - 33332543
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||||||    
T  33332480 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512646
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378625
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8378625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541116
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattagg 15541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 382
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369680
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 382  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 21369680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 488 - 526
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804800
Alignment:
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa 26804800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 56015 - 55955
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  56015 atagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 20091094 - 20091041
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttt-tggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  20091094 ttccatacactttgtatctggttgcttgattattacttgctcaacacatcaagt 20091041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 35960873 - 35960820
Alignment:
Q  472 gagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||| |||||||||    
T  35960873 gagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 40281563 - 40281466
Alignment:
Q  342 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgattt 437  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||   || ||||||||||||||| || |||||||    
T  40281563 gggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 129
Target Start/End: Original strand, 40946167 - 40946216
Alignment:
Q  80 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 129  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  40946167 cactggaaaaatcgtgtcacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcg 40946216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153510
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 8153510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 12097911 - 12097867
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14069877 - 14069833
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14069877 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14069833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14379905 - 14379861
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14379905 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14379861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 18126768 - 18126812
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  18126768 tctctcccccagactaggtcaagtttgaccgacctgggtcaacaa 18126812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20137066 - 20137030
Alignment:
Q  610 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaa 646  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20137066 ttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaa 20137030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 612 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 24813419 - 24813383
Alignment:
Q  612 ttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24813419 ttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagt 24813383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 612 - 663
Target Start/End: Original strand, 25276497 - 25276546
Alignment:
Q  612 ttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25276497 ttggttgcttgattaact--tgatccacacatcaagttgttattggtgtgat 25276546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 30814560 - 30814604
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30814560 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 30814604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31733013 - 31732969
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31733013 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31732969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 41649055 - 41649011
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41649055 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41649011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 43864368 - 43864412
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  43864368 tctctctcccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43864412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgg 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 44848713 - 44848777
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  44848713 atagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 44848777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Original strand, 48489555 - 48489599
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  48489555 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtaaacaa 48489599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 526
Target Start/End: Original strand, 14801 - 15308
Alignment:
Q  20 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatgg-aggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 118  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || || |||| |    
T  14801 aatcgtggcacgattgaagggcaacgtggaacgatgggaagtttcagttat-gaggcaagtcactggaaatttcgtggcacgatgggatcacaacgtgac 14899  T
Q  119 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14900 acgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 14999  T
Q  219 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  15000 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactag 15099  T
Q  319 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 417  Q
     ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15100 agtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagactta 15198  T
Q  418 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 516  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  15199 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactg 15298  T
Q  517 ggtcaacaaa 526  Q
      ||||||||    
T  15299 actcaacaaa 15308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 203 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14381
Alignment:
Q  203 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 300  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgagagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14608  T
Q  301 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 399  Q
    ||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14607 ctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 14509  T
Q  400 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14508 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactagg 14409  T
Q  499 taaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14408 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 14322 - 14250
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14322 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 14250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 3)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 78 - 526
Target Start/End: Original strand, 29001 - 29459
Alignment:
Q  78 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  29001 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttacaa 29100  T
Q  178 attttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 267  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29101 attttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggca 29200  T
Q  268 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct- 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  29201 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttggg-atacactattaggattgagtctc 29299  T
Q  367 ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtg 466  Q
    |||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29300 ttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtg 29399  T
Q  467 gatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29400 gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 29459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 29525 - 29597
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29525 aattgttccatacactttgttttgattgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 29597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Original strand, 28957 - 29005
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcac 51  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28957 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 29005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 2)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 526
Target Start/End: Original strand, 5943 - 6488
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5943 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgat 6042  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaa----------------------tt 180  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||                      ||    
T  6043 ggggtctcatcatggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggtgcagatttgttacaaatttaaagcagatttgttacagttt 6141  T
Q  181 ttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 280  Q
    ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6142 ttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactag 6241  T
Q  281 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaa 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  6242 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgaagtctcttggttacggga 6340  T
Q  379 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggct 478  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6341 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggct 6440  T
Q  479 gctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  6441 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaa 6488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 6558 - 6626
Alignment:
Q  596 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6558 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 6626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 113 - 526
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4284
Alignment:
Q  113 cgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  3872 cgtggcacgatggtgcgatggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagacct 3971  T
Q  213 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaa 312  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||    
T  3972 tgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaa 4070  T
Q  313 cactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4071 cactagggtttgagggttgattcatctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcggga 4169  T
Q  412 gacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggacc 510  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4170 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggacc 4268  T
Q  511 gaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||| |||||||||||    
T  4269 gaaccgggtcaacaaa 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 4344 - 4402
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4344 aattattctatacacttcattttgattgcttgattatcccttactccacacatcaagtt 4402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 41819 - 41482
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41819 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 41720  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  41719 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 41621  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41620 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 41521  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41520 cccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaa 41482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 41416 - 41344
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41416 aattgttccatacactttgttttgattgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 41344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 193 - 526
Target Start/End: Original strand, 79140 - 79474
Alignment:
Q  193 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79140 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 79239  T
Q  293 gtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagact 391  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  79240 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaat 79338  T
Q  392 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccc 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  79339 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 79438  T
Q  491 agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  79439 agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 79474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 79537 - 79611
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  79537 aattgttccatacactttgattttggttgcctaattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 79611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 6)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 183975 - 183640
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  183975 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 183877  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  183876 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattggg 183779  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  183778 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 183679  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  183678 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 183640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Original strand, 51961 - 52302
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51961 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 52060  T
Q  288 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 386  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||    
T  52061 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 52159  T
Q  387 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg--ctct 483  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||    
T  52160 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 52259  T
Q  484 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  52260 ctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 52302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 183574 - 183502
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  183574 aattgttccatacattttgtttcggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 183502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 50364 - 50437
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  50364 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 50437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 52363 - 52436
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  52363 aattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 52436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 526
Target Start/End: Original strand, 50257 - 50303
Alignment:
Q  480 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  50257 ctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaa 50303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 190 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11809 - 11472
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  11809 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 11710  T
Q  290 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  11709 agagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttcctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 11611  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  11610 actttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcc 11511  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11510 cccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaa 11472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 11409 - 11335
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttg--gttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11409 aattgttccatacactttattttttcgttgcttaattattccttactccacacatcaagttgttattggtgtgat 11335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 231 - 526
Target Start/End: Original strand, 34 - 330
Alignment:
Q  231 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  331 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 428  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  134 gattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacc 232  T
Q  429 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  233 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 380 - 453
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  380 aattgttccatacgctttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 190 - 489
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2293
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 283  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2087  T
Q  284 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  2088 ttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 2185  T
Q  383 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 481  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  2186 gctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctact 2285  T
Q  482 ctctcccc 489  Q
    ||||||||    
T  2286 ctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 305 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1452
Alignment:
Q  305 ggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatt 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt 1575  T
Q  404 aggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat 503  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1574 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  504 ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaa 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1313
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1385 aattgttacatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 1313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 191 - 526
Target Start/End: Original strand, 79812 - 80148
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  291 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 388  Q
    ||||||||||||| || || ||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |    
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggg 80010  T
Q  389 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  80011 gctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 80109  T
Q  488 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  80110 cccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaa 80148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 661
Target Start/End: Original strand, 80211 - 80283
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtg 661  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  80211 aatttttccatacactttgattttcgttgcctgattattacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 80283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 506
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85500
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||  ||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||  || ||    
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtga 85381  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||    
T  85382 ctttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 85481  T
Q  488 cccagactaggtaaatttg 506  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  85482 cccagactaggtcaatttg 85500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Original strand, 85579 - 85653
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaag-ttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  85579 aattgttccatacactttgattttggttgtttgattatctcttgctccacacattaagattgttattggtgtgat 85653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 140 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16205 - 15819
Alignment:
Q  140 ataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||||  |||||||| || |||| || |||||||    
T  16205 ataacataatcatatttttgggctgagatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagataga 16106  T
Q  239 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 338  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||    ||||||||| ||    
T  16105 gggggttgaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcacc 16010  T
Q  339 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 437  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16009 ttgcgaaaa-actattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatat 15911  T
Q  438 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  15910 ctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaa 15819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 191 - 418
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  191 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacc-tagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctggga 35790  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791 ctttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Original strand, 35945 - 36004
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgtttt-ggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagtt 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  35945 aattgtttcatacactttgtttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtt 36004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 526
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35883
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaa 35883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 192 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16981 - 16648
Alignment:
Q  192 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 290  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16981 ttttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtata 16884  T
Q  291 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 389  Q
    ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||  |||||    
T  16883 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttagg-aaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgaga 16788  T
Q  390 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 487  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||| |  |||||||    
T  16787 ctttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcc 16688  T
Q  488 cccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16687 cccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaa 16648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 16587 - 16536
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt 648  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16587 ttccatgcactttgtttag-ttgcttgattattacttgctccacacatcaagt 16536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 9)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22404
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 22404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 344 - 526
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24679
Alignment:
Q  344 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  442 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 24679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 21931 - 22100
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21931 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 22030  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22031 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 22100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 24206 - 24375
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24206 aaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 24305  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24306 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 24375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Original strand, 24751 - 24819
Alignment:
Q  596 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24751 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 24819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 663
Target Start/End: Original strand, 22491 - 22544
Alignment:
Q  610 ttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22491 ttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 22544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8512
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  8448 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 22162 - 22206
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22162 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 22206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 24437 - 24481
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24437 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 24481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 201 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1957 - 1640
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 299  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||       
T  1957 aaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttc-- 1861  T
Q  300 tcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggta 398  Q
           || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||| |||| |||||  || |||||||||||    
T  1860 -------aacaaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttggg-aaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggta 1771  T
Q  399 gaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 496  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  1770 gaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatacta 1671  T
Q  497 ggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||| |  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  1670 ggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaa 1640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 1578 - 1512
Alignment:
Q  596 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  1578 ttccatacactttgttt-ggttgcttgattattacttgctccacacatcaaatatttattggtgtgat 1512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 190 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1167 - 1054
Alignment:
Q  190 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 289  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1068  T
Q  290 agagtttgtctctt 303  Q
    ||||||||||||||    
T  1067 agagtttgtctctt 1054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13038 - 12907
Alignment:
Q  3 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 102  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13038 aaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatgtcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 12939  T
Q  103 ggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12938 ggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 12907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 599 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 12799 - 12738
Alignment:
Q  599 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgt 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12799 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagttgttattggtgt 12738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 201 - 519
Target Start/End: Original strand, 4777 - 5095
Alignment:
Q  201 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 299  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| || || ||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||    
T  4777 aaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaa-gtaagcaacaaa-ctagggtttatatagcgttt-tc 4873  T
Q  300 tcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggta 398  Q
    |||  | || ||||||||| |||    | |||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||  |||  |||| ||||    
T  4874 tctcagcaacaaacactagagttga--gtttgattcatgttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggta 4970  T
Q  399 gaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 495  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||    
T  4971 gaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagact 5070  T
Q  496 aggtaaat-ttggaccgaactgggt 519  Q
    |||| | | |||||||||| |||||    
T  5071 aggtcagtattggaccgaattgggt 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 1384 - 1312
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1384 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctttttctccacacatcaagttgttattggtgtgat 1312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1450
Alignment:
Q  491 agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 472 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4732 - 4678
Alignment:
Q  472 gagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4732 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 4678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 591 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 4610 - 4538
Alignment:
Q  591 aattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4610 aattgttccatacgctttgactttgttgcttgattatcccttactccacacatcaaattgttattggtgtgat 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 622 - 663
Target Start/End: Original strand, 1 - 42
Alignment:
Q  622 gattatctcttgctccacacatcaagttgttattcgtgtgat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1 gattatctcttgctccacacatcaagttgttattggtgtgat 42  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5739 - 5687
Alignment:
Q  473 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5739 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  345 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 2560 - 2496
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  2560 atagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 149141 - 149097
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  149141 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 149097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 499
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16480
Alignment:
Q  348 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  ||   || |||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctctttgt 16423  T
Q  446 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16424 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggt 16480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 57539 - 57454
Alignment:
Q  416 tattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||| |||| ||||||||| | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  57539 tattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggt 57454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44054
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  43990 atagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20415
Alignment:
Q  481 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3097
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3136 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 3097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 17052 - 17013
Alignment:
Q  460 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 499  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17052 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 17013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 10796 - 10736
Alignment:
Q  462 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 522  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  10796 tagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 10736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 45321 - 45257
Alignment:
Q  461 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 525  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||| ||||||||    
T  45321 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaa 45257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University