View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9937_low_16 (Length: 326)

Name: NF9937_low_16
Description: NF9937
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9937_low_16
NF9937_low_16
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (4-310)||(34217974-34218278)
chr7 (54-234)||(30244260-30244438)
chr7 (75-235)||(45754705-45754862)
chr7 (73-234)||(7517570-7517729)
chr7 (57-229)||(6054555-6054725)
chr7 (60-236)||(40094770-40094944)
chr7 (54-234)||(30245067-30245241)
chr7 (41-234)||(1085593-1085784)
chr7 (66-234)||(45433231-45433397)
chr7 (55-234)||(23368-23545)
chr7 (54-234)||(22567029-22567206)
chr7 (41-234)||(47129085-47129275)
chr7 (53-235)||(11845182-11845360)
chr7 (97-234)||(7554015-7554150)
chr7 (74-216)||(19122740-19122879)
chr7 (53-234)||(30032557-30032736)
chr7 (54-218)||(37533354-37533516)
chr7 (85-235)||(24838722-24838871)
chr7 (55-218)||(37533002-37533162)
chr7 (61-234)||(9901635-9901804)
chr7 (66-234)||(24177425-24177591)
chr7 (74-234)||(45434626-45434784)
chr7 (115-234)||(22566713-22566830)
chr7 (72-233)||(36939741-36939900)
chr7 (67-218)||(29157571-29157720)
chr7 (104-234)||(16569186-16569314)
chr7 (104-234)||(16596348-16596476)
chr7 (74-231)||(8128451-8128606)
chr7 (67-214)||(14681520-14681663)
chr7 (51-151)||(37167852-37167952)
chr7 (66-234)||(118301-118469)
chr7 (54-167)||(30253547-30253656)
chr7 (104-229)||(40230331-40230454)
chr7 (73-235)||(36534795-36534953)
chr7 (127-234)||(41910657-41910762)
chr7 (66-234)||(36622950-36623116)
chr7 (104-236)||(43241483-43241613)
chr7 (67-235)||(20599303-20599471)
chr7 (54-134)||(37532741-37532821)
chr7 (41-137)||(47129454-47129549)
chr7 (166-233)||(36109017-36109084)
chr7 (134-231)||(28301613-28301708)
chr7 (104-234)||(1085288-1085417)
chr7 (63-151)||(28300252-28300340)
chr7 (166-234)||(30244691-30244759)
chr7 (166-234)||(30245484-30245552)
chr7 (166-234)||(30255329-30255397)
chr7 (182-234)||(36967345-36967397)
chr7 (66-121)||(30244453-30244508)
chr7 (117-218)||(44361517-44361615)
chr7 (39-121)||(30253671-30253753)
chr7 (90-151)||(21619071-21619132)
chr7 (70-137)||(28300574-28300642)
chr7 (66-121)||(30245256-30245311)
chr7 (103-169)||(21416180-21416246)
chr7 (66-234)||(41854625-41854790)
chr7 (105-151)||(23569043-23569089)
chr7 (115-169)||(48071439-48071493)
chr7 (90-167)||(4124114-4124191)
chr7 (174-231)||(40094502-40094559)
chr7 (115-169)||(27598038-27598092)
chr7 (77-130)||(45755019-45755072)
[»] chr1 (67 HSPs)
chr1 (66-234)||(26661524-26661690)
chr1 (54-232)||(17294569-17294746)
chr1 (53-218)||(44290447-44290610)
chr1 (51-218)||(44290811-44290977)
chr1 (54-232)||(3875321-3875497)
chr1 (73-234)||(37556101-37556260)
chr1 (53-234)||(41142362-41142542)
chr1 (66-232)||(41157367-41157531)
chr1 (54-234)||(26661888-26662066)
chr1 (61-234)||(11977270-11977441)
chr1 (53-234)||(34364497-34364676)
chr1 (66-235)||(41156980-41157147)
chr1 (71-231)||(24600321-24600479)
chr1 (66-234)||(34649428-34649594)
chr1 (58-218)||(3550726-3550881)
chr1 (66-232)||(5319967-5320131)
chr1 (51-233)||(40082398-40082577)
chr1 (66-214)||(3537601-3537747)
chr1 (66-218)||(41759489-41759639)
chr1 (99-234)||(34364915-34365048)
chr1 (66-231)||(22077497-22077660)
chr1 (42-234)||(37850579-37850768)
chr1 (51-212)||(45493962-45494124)
chr1 (41-235)||(31767138-31767330)
chr1 (66-235)||(29798188-29798355)
chr1 (79-232)||(38804370-38804521)
chr1 (54-218)||(50052014-50052175)
chr1 (41-232)||(66449-66638)
chr1 (73-233)||(37555721-37555878)
chr1 (104-218)||(32594756-32594868)
chr1 (61-216)||(14318875-14319028)
chr1 (128-235)||(41184489-41184594)
chr1 (67-218)||(48588491-48588640)
chr1 (53-234)||(39066190-39066368)
chr1 (66-228)||(45084378-45084532)
chr1 (104-214)||(5528794-5528902)
chr1 (54-231)||(66079-66254)
chr1 (74-218)||(9955913-9956057)
chr1 (66-197)||(32168700-32168823)
chr1 (54-229)||(22077819-22077991)
chr1 (104-187)||(44043812-44043893)
chr1 (56-155)||(11977011-11977110)
chr1 (66-199)||(22077112-22077243)
chr1 (70-231)||(24131994-24132150)
chr1 (103-219)||(5575109-5575223)
chr1 (54-151)||(50051679-50051775)
chr1 (143-218)||(3537226-3537299)
chr1 (73-231)||(19283464-19283620)
chr1 (90-231)||(1188614-1188753)
chr1 (74-231)||(30630648-30630803)
chr1 (70-232)||(22793270-22793431)
chr1 (74-235)||(45839616-45839779)
chr1 (73-167)||(24448332-24448426)
chr1 (73-155)||(47380176-47380258)
chr1 (177-234)||(35154150-35154207)
chr1 (172-224)||(4266888-4266940)
chr1 (141-235)||(21378118-21378210)
chr1 (85-167)||(883596-883678)
chr1 (66-209)||(44091909-44092050)
chr1 (121-168)||(10554983-10555030)
chr1 (97-167)||(10351215-10351285)
chr1 (115-231)||(44685449-44685563)
chr1 (66-229)||(1187365-1187527)
chr1 (104-149)||(9956213-9956258)
chr1 (166-231)||(50469181-50469246)
chr1 (156-231)||(4878796-4878869)
chr1 (107-167)||(35154046-35154106)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (40-234)||(16454897-16455089)
chr6 (53-235)||(2377743-2377923)
chr6 (73-235)||(16107667-16107827)
chr6 (41-218)||(29518509-29518684)
chr6 (41-218)||(29518926-29519101)
chr6 (41-218)||(32741185-32741360)
chr6 (54-234)||(16454565-16454743)
chr6 (39-234)||(2578418-2578610)
chr6 (40-235)||(2843543-2843737)
chr6 (41-235)||(2579850-2580041)
chr6 (58-218)||(2378132-2378290)
chr6 (66-231)||(10073993-10074156)
chr6 (66-218)||(35210210-35210360)
chr6 (53-218)||(1846754-1846917)
chr6 (54-235)||(593697-593878)
chr6 (74-218)||(3409265-3409407)
chr6 (72-231)||(10074371-10074528)
chr6 (41-234)||(2579087-2579273)
chr6 (66-214)||(3058236-3058382)
chr6 (53-218)||(14748331-14748490)
chr6 (54-218)||(3415464-3415628)
chr6 (66-218)||(3409666-3409816)
chr6 (65-231)||(10073617-10073779)
chr6 (66-234)||(5832029-5832194)
chr6 (67-234)||(6999799-6999964)
chr6 (104-235)||(9062390-9062518)
chr6 (115-218)||(32460631-32460732)
chr6 (73-218)||(1127366-1127509)
chr6 (53-234)||(16108053-16108221)
chr6 (66-231)||(2578837-2578999)
chr6 (53-218)||(26544055-26544218)
chr6 (63-235)||(5958606-5958772)
chr6 (72-218)||(2579500-2579644)
chr6 (68-231)||(10911558-10911720)
chr6 (79-234)||(1950200-1950353)
chr6 (90-232)||(6071124-6071264)
chr6 (66-157)||(12071693-12071784)
chr6 (67-157)||(12085037-12085127)
chr6 (104-232)||(8481919-8482044)
chr6 (66-218)||(17135071-17135221)
chr6 (97-231)||(12092515-12092647)
chr6 (67-170)||(31714722-31714823)
chr6 (87-130)||(10902453-10902496)
chr6 (104-151)||(11637761-11637808)
chr6 (110-151)||(22605301-22605342)
chr6 (106-209)||(2975567-2975668)
chr6 (124-168)||(20117208-20117252)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (57-234)||(37990632-37990807)
chr3 (54-235)||(29644892-29645071)
chr3 (61-234)||(43346788-43346959)
chr3 (66-234)||(37990979-37991145)
chr3 (65-235)||(15772843-15773011)
chr3 (54-234)||(32462890-32463069)
chr3 (54-234)||(25755384-25755562)
chr3 (55-234)||(42342081-42342258)
chr3 (66-231)||(33803254-33803417)
chr3 (66-231)||(35946515-35946678)
chr3 (66-234)||(42342390-42342556)
chr3 (53-232)||(54017805-54017982)
chr3 (66-235)||(12114564-12114731)
chr3 (40-234)||(15773182-15773376)
chr3 (53-236)||(52634664-52634844)
chr3 (66-234)||(29644583-29644749)
chr3 (66-234)||(53117977-53118142)
chr3 (66-234)||(3135456-3135629)
chr3 (40-235)||(32589693-32589885)
chr3 (53-218)||(22304575-22304738)
chr3 (53-234)||(41359753-41359929)
chr3 (66-234)||(25739427-25739593)
chr3 (66-234)||(54018200-54018366)
chr3 (72-215)||(39934963-39935104)
chr3 (66-231)||(21832347-21832508)
chr3 (67-232)||(45395656-45395819)
chr3 (54-236)||(1634305-1634485)
chr3 (104-235)||(49336727-49336856)
chr3 (66-234)||(45901703-45901870)
chr3 (70-234)||(31190007-31190161)
chr3 (97-232)||(3135106-3135237)
chr3 (72-234)||(22303963-22304116)
chr3 (106-218)||(39389076-39389186)
chr3 (75-235)||(39914241-39914399)
chr3 (56-218)||(11661957-11662117)
chr3 (56-235)||(53577353-53577530)
chr3 (70-231)||(47964921-47965080)
chr3 (66-218)||(50612449-50612604)
chr3 (54-231)||(33175649-33175829)
chr3 (103-231)||(8327897-8328023)
chr3 (40-234)||(32462535-32462727)
chr3 (108-218)||(4823661-4823769)
chr3 (90-231)||(47964544-47964683)
chr3 (54-218)||(37726510-37726664)
chr3 (67-164)||(22303662-22303759)
chr3 (106-214)||(42584864-42584970)
chr3 (66-232)||(44160549-44160710)
chr3 (71-231)||(9240142-9240300)
chr3 (130-216)||(7767380-7767464)
chr3 (97-155)||(39336003-39336061)
chr3 (168-234)||(43346640-43346706)
chr3 (139-218)||(51886567-51886644)
chr3 (66-137)||(41359493-41359564)
chr3 (98-230)||(33362327-33362460)
chr3 (169-218)||(22304252-22304301)
chr3 (106-151)||(54017590-54017635)
chr3 (166-234)||(11661525-11661593)
chr3 (90-161)||(25317219-25317290)
chr3 (55-142)||(43978856-43978947)
chr3 (103-169)||(53596013-53596079)
chr3 (103-169)||(53596328-53596394)
chr3 (41-98)||(9239937-9239994)
chr3 (53-113)||(22304302-22304362)
chr3 (103-151)||(53596546-53596594)
chr3 (103-137)||(11661605-11661639)
chr3 (110-151)||(17731950-17731991)
chr3 (116-169)||(17735043-17735096)
chr3 (110-151)||(19033181-19033222)
chr3 (116-169)||(19036312-19036365)
chr3 (66-137)||(7766785-7766854)
chr3 (66-118)||(8328374-8328426)
chr3 (192-232)||(12747878-12747918)
chr3 (103-218)||(25991409-25991522)
chr3 (115-151)||(46546376-46546412)
chr3 (115-159)||(52635003-52635047)
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (55-235)||(3038281-3038459)
chr8 (72-234)||(34834866-34835026)
chr8 (53-234)||(9309345-9309523)
chr8 (54-218)||(3669693-3669855)
chr8 (104-235)||(30359260-30359389)
chr8 (53-234)||(6876851-6877031)
chr8 (66-235)||(25561817-25561985)
chr8 (68-234)||(30359599-30359763)
chr8 (71-218)||(30441087-30441236)
chr8 (74-229)||(45122067-45122220)
chr8 (53-234)||(34835199-34835378)
chr8 (67-235)||(70277-70442)
chr8 (68-199)||(9483191-9483320)
chr8 (52-232)||(40518061-40518241)
chr8 (68-218)||(3670066-3670214)
chr8 (104-234)||(8794101-8794229)
chr8 (55-229)||(40518577-40518749)
chr8 (66-200)||(45122648-45122780)
chr8 (32-233)||(5915863-5916056)
chr8 (68-234)||(9482608-9482770)
chr8 (66-234)||(33113369-33113535)
chr8 (53-212)||(5420663-5420820)
chr8 (70-234)||(37544496-37544658)
chr8 (66-218)||(45121912-45122062)
chr8 (66-229)||(1513917-1514078)
chr8 (53-231)||(41972151-41972330)
chr8 (53-231)||(9308970-9309150)
chr8 (69-231)||(9608738-9608898)
chr8 (53-234)||(34835464-34835644)
chr8 (53-234)||(34835730-34835910)
chr8 (97-218)||(147457-147576)
chr8 (71-232)||(9507769-9507933)
chr8 (66-234)||(8918766-8918932)
chr8 (54-218)||(40579496-40579658)
chr8 (40-211)||(20870549-20870718)
chr8 (53-218)||(1014233-1014397)
chr8 (54-218)||(32640521-32640679)
chr8 (109-235)||(43274824-43274948)
chr8 (41-214)||(18371970-18372142)
chr8 (66-234)||(45122996-45123162)
chr8 (71-234)||(45121663-45121823)
chr8 (53-234)||(147819-147989)
chr8 (72-218)||(1013879-1014023)
chr8 (54-231)||(9620668-9620841)
chr8 (73-230)||(12283867-12284021)
chr8 (66-144)||(41129066-41129144)
chr8 (54-147)||(40579259-40579352)
chr8 (68-217)||(18371665-18371807)
chr8 (132-211)||(3037776-3037853)
chr8 (66-217)||(6651510-6651650)
chr8 (166-218)||(18372356-18372408)
chr8 (105-231)||(4154707-4154831)
chr8 (66-137)||(8919146-8919217)
chr8 (118-234)||(18372988-18373098)
chr8 (117-218)||(20130455-20130553)
chr8 (115-169)||(12156709-12156763)
chr8 (73-232)||(4154290-4154446)
chr8 (72-218)||(6731910-6732045)
chr8 (166-218)||(18372799-18372851)
chr8 (166-214)||(25561744-25561792)
chr8 (115-226)||(18372657-18372762)
chr8 (166-217)||(41416271-41416322)
chr8 (53-111)||(3037958-3038016)
chr8 (106-218)||(18380059-18380169)
chr8 (55-128)||(43274626-43274699)
chr8 (90-218)||(2467508-2467632)
chr8 (87-201)||(9609108-9609220)
chr8 (90-145)||(20995442-20995497)
chr8 (97-168)||(27856185-27856256)
chr8 (119-218)||(43398123-43398223)
chr8 (167-231)||(20995502-20995566)
chr8 (115-198)||(32305503-32305584)
chr8 (192-231)||(18645713-18645752)
chr8 (54-122)||(18372273-18372342)
chr8 (53-85)||(3038041-3038073)
chr8 (182-218)||(18372487-18372523)
chr8 (198-234)||(43274699-43274735)
chr8 (145-208)||(44358151-44358212)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (54-234)||(6421375-6421553)
chr2 (56-234)||(15880253-15880429)
chr2 (53-231)||(962591-962767)
chr2 (41-218)||(5542602-5542777)
chr2 (55-218)||(36178596-36178757)
chr2 (53-234)||(15511485-15511661)
chr2 (54-218)||(37105930-37106092)
chr2 (60-218)||(37106194-37106350)
chr2 (53-218)||(14745656-14745819)
chr2 (66-229)||(35580726-35580886)
chr2 (61-234)||(6712966-6713138)
chr2 (41-218)||(5542975-5543150)
chr2 (66-234)||(40733507-40733673)
chr2 (53-235)||(36005869-36006048)
chr2 (54-231)||(42514642-42514817)
chr2 (66-235)||(38796620-38796789)
chr2 (66-234)||(40733873-40734038)
chr2 (66-218)||(41283477-41283627)
chr2 (63-218)||(33731654-33731807)
chr2 (53-227)||(1769889-1770061)
chr2 (54-202)||(36178161-36178307)
chr2 (67-231)||(40679632-40679794)
chr2 (66-208)||(6422126-6422266)
chr2 (54-159)||(6421794-6421899)
chr2 (94-234)||(16542439-16542577)
chr2 (103-234)||(28254276-28254405)
chr2 (115-218)||(36178320-36178421)
chr2 (39-211)||(23346250-23346419)
chr2 (64-231)||(28531314-28531479)
chr2 (66-216)||(29676543-29676685)
chr2 (66-234)||(29676893-29677064)
chr2 (69-227)||(7598606-7598754)
chr2 (53-213)||(40163361-40163520)
chr2 (115-234)||(31468801-31468914)
chr2 (69-231)||(37632602-37632762)
chr2 (66-227)||(7598225-7598384)
chr2 (71-218)||(14745300-14745446)
chr2 (90-232)||(30313170-30313309)
chr2 (166-234)||(38796318-38796386)
chr2 (68-159)||(6421689-6421780)
chr2 (78-231)||(5367448-5367599)
chr2 (94-231)||(33561481-33561616)
chr2 (77-167)||(36784273-36784363)
chr2 (134-234)||(31899496-31899594)
chr2 (106-235)||(31259658-31259788)
chr2 (167-234)||(36785664-36785731)
chr2 (68-150)||(3672773-3672855)
chr2 (40-232)||(29873513-29873703)
chr2 (115-231)||(33953822-33953936)
chr2 (74-233)||(12529038-12529195)
chr2 (110-216)||(37895107-37895211)
chr2 (53-167)||(3673123-3673237)
chr2 (176-234)||(6421294-6421352)
chr2 (111-216)||(12910236-12910339)
chr2 (115-228)||(29874074-29874185)
chr2 (54-231)||(16590881-16591051)
chr2 (117-208)||(28254165-28254254)
chr2 (103-229)||(37894731-37894855)
chr2 (92-231)||(41678396-41678534)
chr2 (103-169)||(28226708-28226773)
chr2 (105-232)||(30323456-30323581)
chr2 (91-167)||(31385792-31385868)
chr2 (103-169)||(28226390-28226456)
chr2 (54-164)||(35580428-35580540)
chr2 (40-132)||(31899079-31899170)
chr2 (189-234)||(3673075-3673120)
[»] chr4 (88 HSPs)
chr4 (67-235)||(25483325-25483491)
chr4 (66-234)||(36572009-36572175)
chr4 (54-234)||(36608649-36608827)
chr4 (54-236)||(39792848-39793028)
chr4 (66-235)||(34646649-34646816)
chr4 (66-231)||(36629230-36629393)
chr4 (41-229)||(39404013-39404200)
chr4 (61-218)||(41370363-41370518)
chr4 (61-234)||(50002416-50002587)
chr4 (54-234)||(10245910-10246087)
chr4 (66-234)||(22183264-22183430)
chr4 (42-234)||(39404388-39404577)
chr4 (66-235)||(1731647-1731814)
chr4 (66-235)||(50459710-50459877)
chr4 (54-217)||(50630743-50630904)
chr4 (55-218)||(55933113-55933274)
chr4 (73-231)||(3244458-3244614)
chr4 (53-229)||(3340802-3340976)
chr4 (104-236)||(4955355-4955485)
chr4 (53-234)||(54936190-54936364)
chr4 (53-227)||(54017582-54017754)
chr4 (103-232)||(41707502-41707628)
chr4 (66-215)||(44621011-44621158)
chr4 (66-234)||(22027961-22028127)
chr4 (66-234)||(45489332-45489497)
chr4 (54-231)||(2740693-2740866)
chr4 (54-235)||(16889524-16889704)
chr4 (74-231)||(52884688-52884844)
chr4 (58-214)||(54343000-54343147)
chr4 (66-231)||(20825829-20825992)
chr4 (71-231)||(32941128-32941286)
chr4 (103-234)||(52884877-52885007)
chr4 (66-234)||(22028369-22028537)
chr4 (43-230)||(44620654-44620838)
chr4 (70-218)||(49302910-49303058)
chr4 (74-209)||(54108928-54109060)
chr4 (67-233)||(51768061-51768225)
chr4 (66-215)||(44620362-44620509)
chr4 (67-232)||(3700357-3700512)
chr4 (66-167)||(23817681-23817782)
chr4 (103-231)||(54741215-54741341)
chr4 (99-222)||(6975489-6975610)
chr4 (58-201)||(18932741-18932882)
chr4 (68-234)||(43174496-43174661)
chr4 (62-231)||(20826210-20826377)
chr4 (54-234)||(49076439-49076614)
chr4 (55-235)||(49076820-49076997)
chr4 (97-209)||(45496820-45496930)
chr4 (115-240)||(54017751-54017876)
chr4 (104-218)||(49880166-49880278)
chr4 (67-236)||(4390102-4390269)
chr4 (39-234)||(16888789-16888983)
chr4 (53-167)||(31691207-31691323)
chr4 (53-130)||(43174233-43174310)
chr4 (53-206)||(3271802-3271959)
chr4 (115-234)||(3341118-3341235)
chr4 (53-167)||(18879861-18879975)
chr4 (56-229)||(34004575-34004744)
chr4 (115-231)||(2741064-2741178)
chr4 (76-235)||(19504694-19504842)
chr4 (81-165)||(15841383-15841467)
chr4 (166-234)||(44620286-44620354)
chr4 (73-209)||(54108551-54108686)
chr4 (94-230)||(15841013-15841146)
chr4 (73-224)||(45489721-45489870)
chr4 (141-231)||(10246340-10246428)
chr4 (61-198)||(48111693-48111828)
chr4 (58-159)||(43827503-43827603)
chr4 (103-169)||(11197279-11197345)
chr4 (90-167)||(34544161-34544239)
chr4 (103-231)||(28034222-28034348)
chr4 (87-226)||(40067041-40067179)
chr4 (176-232)||(45050593-45050649)
chr4 (41-136)||(39698919-39699014)
chr4 (110-169)||(51681591-51681650)
chr4 (103-169)||(10396184-10396250)
chr4 (63-133)||(11348261-11348330)
chr4 (90-167)||(760244-760320)
chr4 (73-162)||(11783560-11783649)
chr4 (166-234)||(44620934-44621003)
chr4 (55-95)||(20695925-20695965)
chr4 (166-230)||(44621420-44621484)
chr4 (104-151)||(922489-922536)
chr4 (115-169)||(1868104-1868158)
chr4 (103-169)||(10396469-10396535)
chr4 (172-214)||(50788087-50788129)
chr4 (124-169)||(45484772-45484817)
chr4 (183-235)||(11706636-11706688)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (53-235)||(503-683)
scaffold0702 (58-218)||(141-294)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (53-234)||(1095-1274)
scaffold0391 (103-167)||(1730-1794)
scaffold0391 (173-234)||(3092-3153)
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (66-234)||(40296317-40296483)
chr5 (51-234)||(42405585-42405764)
chr5 (53-235)||(15370088-15370268)
chr5 (66-235)||(36492219-36492386)
chr5 (54-234)||(25327925-25328103)
chr5 (40-218)||(18603096-18603272)
chr5 (68-234)||(34753029-34753193)
chr5 (73-234)||(26074602-26074761)
chr5 (71-235)||(26075168-26075331)
chr5 (66-218)||(6500457-6500606)
chr5 (54-231)||(36568559-36568732)
chr5 (50-218)||(32487400-32487565)
chr5 (66-218)||(41170640-41170790)
chr5 (73-231)||(26074155-26074311)
chr5 (40-218)||(27502012-27502188)
chr5 (53-218)||(624202-624365)
chr5 (54-231)||(1028507-1028682)
chr5 (66-231)||(41632775-41632938)
chr5 (66-229)||(35150002-35150162)
chr5 (42-228)||(3294993-3295176)
chr5 (66-232)||(3295347-3295509)
chr5 (54-234)||(299479-299658)
chr5 (66-235)||(12662654-12662821)
chr5 (78-231)||(13415774-13415925)
chr5 (66-234)||(6224186-6224352)
chr5 (54-222)||(9498645-9498810)
chr5 (104-234)||(26074821-26074950)
chr5 (66-218)||(6500829-6500978)
chr5 (54-198)||(15370428-15370570)
chr5 (66-234)||(11416979-11417143)
chr5 (90-235)||(41635217-41635360)
chr5 (54-218)||(38427554-38427715)
chr5 (56-218)||(623824-623984)
chr5 (66-235)||(35167840-35168007)
chr5 (97-218)||(36522270-36522389)
chr5 (54-235)||(300948-301119)
chr5 (102-232)||(31509615-31509744)
chr5 (66-234)||(35914839-35915005)
chr5 (87-218)||(5723814-5723943)
chr5 (68-212)||(33747783-33747925)
chr5 (53-136)||(26900006-26900089)
chr5 (85-218)||(29549276-29549407)
chr5 (90-210)||(31509745-31509864)
chr5 (127-232)||(42508604-42508707)
chr5 (54-218)||(2411013-2411175)
chr5 (166-231)||(39309677-39309742)
chr5 (66-231)||(24489208-24489369)
chr5 (115-231)||(36521947-36522061)
chr5 (72-187)||(26590918-26591031)
chr5 (87-222)||(39003543-39003676)
chr5 (103-169)||(13042592-13042658)
chr5 (103-169)||(13112590-13112656)
chr5 (185-235)||(26900089-26900139)
chr5 (176-234)||(35150737-35150795)
chr5 (176-234)||(35151028-35151086)
chr5 (127-224)||(42524717-42524811)
chr5 (66-150)||(13785634-13785718)
chr5 (55-135)||(38427306-38427386)
chr5 (66-231)||(13786003-13786166)
chr5 (97-164)||(32445943-32446010)
chr5 (87-165)||(36527118-36527196)
chr5 (110-169)||(34103607-34103666)
chr5 (87-137)||(795255-795305)
chr5 (166-216)||(6225052-6225102)
chr5 (142-218)||(26074324-26074398)
chr5 (166-218)||(7768856-7768908)
chr5 (192-232)||(36527209-36527249)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (73-235)||(5385-5546)
scaffold0734 (73-234)||(5767-5931)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (104-232)||(5349-5475)
scaffold0078 (71-236)||(4970-5133)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (66-235)||(47349-47516)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (106-234)||(17496-17624)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (145-234)||(10192-10279)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (192-232)||(39830-39870)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Original strand, 34217974 - 34218278
Alignment:
Q  4 tgtggcaggggaaacatctttattgcagccccacgattgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34217974 tgtggcaggggaaacatctttattgcagccccacgattgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcg 34218073  T
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34218074 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcact--tataaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtga 34218171  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaacaacaacgatggggccaaatattcttgctaagaactgtatgtatgatgcaccttgtaggcaatgtgtcgtaacc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34218172 gacatataactcacatttgtacacaacaacaacgatggggccaaatattcttgctaagaactgtatgtatgatgcaccttgtaggcaatgtgtcgtaacc 34218271  T
Q  304 aagattt 310  Q
    |||||||    
T  34218272 aagattt 34218278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30244438 - 30244260
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30244438 ggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgag 30244339  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30244338 tcctcttact--tataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 30244260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754705
Alignment:
Q  75 acatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttact--tataaggtg 45754765  T
Q  175 ttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45754764 ttcaacatttactattttatccgatgtg-gacatataactcacacttgtacacaacaacaa 45754705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7517729 - 7517570
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||    
T  7517729 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact--tataagg 7517632  T
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7517631 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 7517570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6054725 - 6054555
Alignment:
Q  57 gagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcc 156  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  6054725 gagctcgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcc 6054626  T
Q  157 tctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  6054625 tcttact--tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttgtccacaa 6054555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 40094770 - 40094944
Alignment:
Q  60 ctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctct 159  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40094770 ctcgggggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctct 40094869  T
Q  160 cacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaac 236  Q
     |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  40094870 tact--tataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaacaac 40094944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30245241 - 30245067
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  30245241 ggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 30245146  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    || ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30245145 tcgtcttacttata--aggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 30245067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 234
Target Start/End: Original strand, 1085593 - 1085784
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagaca 140  Q
    |||||| | ||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  1085593 tgttgggtcatgaggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggca 1085692  T
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1085693 atgggtttatgggtcctcttact--tataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 1085784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45433397 - 45433231
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||      
T  45433397 ggaccgaccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttact-- 45433300  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45433299 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttgtacacaacaaca 45433231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 234
Target Start/End: Original strand, 23368 - 23545
Alignment:
Q  55 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagt 154  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  23368 gggagctcgggggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggt 23467  T
Q  155 cctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23468 cctcttact--tataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgcacacaacaaca 23545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Original strand, 22567029 - 22567206
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  22567029 ggggagctcgggggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 22567128  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  22567129 tcctcttact--tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtg-gacatattactcacacttgcatacaacaaca 22567206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47129275 - 47129085
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagaca 140  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||  | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |     
T  47129275 tgttggatcatgaggggagctcgg-ggaccgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcg 47129177  T
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47129176 atgggtttatgggtcctcttact--tataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgtgcacaacaaca 47129085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11845360 - 11845182
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||     
T  11845360 gggggagcacgggggaccgtctacatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgg 11845261  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  11845260 gtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac--ttgtgcacaacaacaa 11845182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7554150 - 7554015
Alignment:
Q  97 acaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatcc 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7554150 acaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttata--aggtgttcaacctttactattttatcc 7554053  T
Q  197 gatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7554052 gatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 7554015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122740
Alignment:
Q  74 cacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggt 173  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttact--tataaggt 19122782  T
Q  174 gttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactca 216  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19122781 gttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30032736 - 30032557
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||     
T  30032736 gggggagctcgggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatgg 30032637  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
     | |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  30032636 atactcttacttata--aggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacatgtacgcaacaaca 30032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 37533354 - 37533516
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  37533354 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggg 37533453  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||   ||||||||||||||    
T  37533454 tcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactcaca 37533516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 235
Target Start/End: Original strand, 24838722 - 24838871
Alignment:
Q  85 ttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcc-tctcacttatataaggtgttcaacatt 183  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||| |||  ||||||||||||||| ||    
T  24838722 ttgaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttact--tataaggtgttcaacctt 24838819  T
Q  184 tactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  24838820 tactcttttattcgatgtgagacatataacttacacttatacacaacaacaa 24838871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 37533002 - 37533162
Alignment:
Q  55 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagt 154  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| |  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  37533002 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 37533100  T
Q  155 cctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37533101 cctcttacttata--aggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcaca 37533162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9901804 - 9901635
Alignment:
Q  61 tcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctc 160  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||     
T  9901804 tcggaggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctct- 9901706  T
Q  161 acttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||   |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  9901705 ac--gtataagatgttcaacctttactgttttatccgatgtg-gacatataactcacacttatacacaataaca 9901635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24177591 - 24177425
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  24177591 ggaccgtccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttactta 24177492  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  24177491 ta--aggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttgcacacaacaaca 24177425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45434784 - 45434626
Alignment:
Q  74 cacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggt 173  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| ||||||| |||||||  ||||    
T  45434784 cacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttacttata--aggt 45434687  T
Q  174 gttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  45434686 gttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaaca 45434626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 22566713 - 22566830
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22566713 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata--aggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattact 22566810  T
Q  215 cacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||| ||| | |||||||||    
T  22566811 cacacttgcatacaacaaca 22566830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 233
Target Start/End: Original strand, 36939741 - 36939900
Alignment:
Q  72 tccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataag 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||  ||||||    
T  36939741 tccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttact--tataag 36939838  T
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaac 233  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  36939839 gtgttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgcacagaacaac 36939900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29157720 - 29157571
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat 166  Q
    ||||||||||||| || || || |||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||  |    
T  29157720 gaccgtccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttact--t 29157623  T
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29157622 ataaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcaca 29157571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16569314 - 16569186
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| |||||| |||||| || ||||||||||||    
T  16569314 agagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata--aggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  16569216 gacatataactcacacttgcatacaacaaca 16569186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Original strand, 16596348 - 16596476
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| |||||| |||||| || ||||||||||||    
T  16596348 agagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata--aggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  16596446 gacatataactcacacttgcatacaacaaca 16596476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Original strand, 8128451 - 8128606
Alignment:
Q  74 cacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggt 173  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||    
T  8128451 cacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttac--atataaggt 8128548  T
Q  174 gttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||| |||| | || |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8128549 gttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 8128606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14681663 - 14681520
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat 166  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  |    
T  14681663 gaccgtccacatcaaggctagaacaacc--acacttgtgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttact--t 14681568  T
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  14681567 acaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataact 14681520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37167952 - 37167852
Alignment:
Q  51 tggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  37167952 tggggggagcgcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttat 37167853  T
Q  151 g 151  Q
    |    
T  37167852 g 37167852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 118301 - 118469
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagaga--gacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcact 163  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||  ||| | ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||| |||    
T  118301 ggaccgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctcttact 118400  T
Q  164 tatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||   ||||||||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  118401 tatt--aggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaaca 118469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30253656 - 30253547
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  30253656 ggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 30253561  T
Q  154 tcctctcacttata 167  Q
    | |||| |||||||    
T  30253560 ttctcttacttata 30253547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 40230331 - 40230454
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||     
T  40230331 agagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttact--tataagatgttcaacttttacttttttattcgatgtgg 40230428  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  40230429 gacatataacttacacttgcacacaa 40230454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Original strand, 36534795 - 36534953
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |||  |||||||    
T  36534795 ccacatcgaggctggaacaaccacacttgtgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttact--tataagg 36534890  T
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||    
T  36534891 tgttcaacctctactgttttatccgaggtgggacatataagttacacttgcacacaacaacaa 36534953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 234
Target Start/End: Original strand, 41910657 - 41910762
Alignment:
Q  127 aaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtaca 226  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||    
T  41910657 aaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctcagttata--aggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttacaca 41910754  T
Q  227 caacaaca 234  Q
    ||||||||    
T  41910755 caacaaca 41910762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36623116 - 36622950
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||| |||   |||||| || |||||  |||||| ||| | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||  |||||    
T  36623116 ggaccgtccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctactta 36623017  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    || ||  |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  36623016 taaaa--tgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaataaca 36622950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43241613 - 43241483
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    |||||||||  | ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||     
T  43241613 agagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttata--aggtgttcaacctttatttttttatccgatgtgg 43241516  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaacaacaac 236  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  43241515 aacatataactcacacttgcacacaacaacaac 43241483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20599471 - 20599303
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactct--tacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactt 164  Q
    |||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| | ||    
T  20599471 gaccgttcacatcaaggttaaaacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttattt 20599372  T
Q  165 atataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||| |  ||||| | | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  20599371 ataaa--gtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacacttatagacaacaacaa 20599303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 37532741 - 37532821
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaacctt 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37532741 ggggagcgcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 47129549 - 47129454
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaag 137  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47129549 tgttgggtcatgaggggagctcgg-ggaccgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 47129454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 233
Target Start/End: Original strand, 36109017 - 36109084
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaac 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36109017 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgcacacaacaac 36109084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301708
Alignment:
Q  134 taagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata--aggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 28301708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Original strand, 1085288 - 1085417
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| |||  ||| || |||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  1085288 agagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttact--tatgagttgttcaacttttactattttatccgatatgg 1085385  T
Q  204 gacat-ataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  1085386 gacataaaaactcacacttgcacacaacaaca 1085417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 151
Target Start/End: Original strand, 28300252 - 28300340
Alignment:
Q  63 ggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  || |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28300252 ggaggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatg 28300340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30244759 - 30244691
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  30244759 tataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 30244691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30245552 - 30245484
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  30245552 tataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 30245484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30255397 - 30255329
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  30255397 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgcacacaacaaca 30255329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 234
Target Start/End: Original strand, 36967345 - 36967397
Alignment:
Q  182 tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36967345 tttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 36967397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30244508 - 30244453
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactct 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  30244508 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30244453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361615
Alignment:
Q  117 actcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactca 216  Q
    ||||||||| |||||| ||||   |||||||||||  || ||| |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta---aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctca 44361613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30253753 - 30253671
Alignment:
Q  39 attgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactct 121  Q
    |||||||| | ||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  30253753 attgttgggtcatgaggggagcctgggggacagtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30253671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 151
Target Start/End: Original strand, 21619071 - 21619132
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21619071 caaccatacaagtgaaagatacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 21619132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 137
Target Start/End: Original strand, 28300574 - 28300642
Alignment:
Q  70 cgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactctta-cccaaaaccttaag 137  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28300574 cgtccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaag 28300642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30245311 - 30245256
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactct 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  30245311 ggaccgtccacattgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Original strand, 21416180 - 21416246
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  21416180 gagagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtctcctctcttatata 21416246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41854790 - 41854625
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||  |||||  ||| ||||   ||||||||||||||||||||||| || |   |||||  ||| |||  ||||    
T  41854790 ggaccgtctacattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgctta 41854691  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  41854690 ta--aggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttgcacacaaaaaca 41854625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 151
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569089
Alignment:
Q  105 gagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 23569089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 48071493 - 48071439
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  48071493 acactcttatccaaaaccttaagacaataggtttatgagttccctctcttatata 48071439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 167
Target Start/End: Original strand, 4124114 - 4124191
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  4124114 caaccaaaaaagtgagagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttata 4124191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094559
Alignment:
Q  174 gttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgcacacaaca 40094559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27598092 - 27598038
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  27598092 acactcttacgcaaaaccctaagacaatgggtttatgggtctcctctcttatata 27598038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 45755072 - 45755019
Alignment:
Q  77 atcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaa 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  45755072 atcgaggcttgaacaaccacacaagtaagggagacaccacacttttacccaaaa 45755019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 67)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 26661524 - 26661690
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||      
T  26661524 ggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcact-- 26661621  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26661622 tataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 26661690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17294746 - 17294569
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccat-acaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  17294746 ggggagctcgggcgaccgtccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 17294647  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17294646 gtcctcttact--tataaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 17294569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Original strand, 44290447 - 44290610
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  44290447 gggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 44290546  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||| |||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44290547 gtcctcttact--tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 44290610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Original strand, 44290811 - 44290977
Alignment:
Q  51 tggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactc-ttacccaaaaccttaagacaatgggttta 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44290811 tggggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 44290910  T
Q  150 tgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    || ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44290911 tgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 44290977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 3875321 - 3875497
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3875321 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgag 3875420  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    |||||| |||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  3875421 tcctcttact--tataaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgcacacaacaa 3875497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556101
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||  ||||||     
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatg-gtcctcttact--tataaga 37556164  T
Q  173 tgttcaacatttact-cttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37556163 tgttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 37556101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41142542 - 41142362
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactctt-acccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41142542 gggggaactcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatg 41142443  T
Q  152 agtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
     ||||| | |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  41142442 ggtccttttacttata--aggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacagaacaaca 41142362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41157531 - 41157367
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||      
T  41157531 ggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttact-- 41157434  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41157433 tataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 41157367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Original strand, 26661888 - 26662066
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||| ||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  26661888 ggggagctagggagaccatccgcatcaaggattgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatggg 26661987  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26661988 tcttctcact--tataaggtgttcaacctttactcttttatctgatatgggatatataactcacacttgtacacaacaaca 26662066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11977441 - 11977270
Alignment:
Q  61 tcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctc 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||     
T  11977441 tcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctctt 11977342  T
Q  161 acttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11977341 act--tataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacacagcaaca 11977270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34364676 - 34364497
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||| | | ||| |||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |     
T  34364676 gggggagctcagggaaccatccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacgg 34364577  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
     |||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34364576 atcctcttacttata--aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaaca 34364497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41157147 - 41156980
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||      
T  41157147 ggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttact-- 41157050  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  41157049 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgcacacaacaacaa 41156980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Original strand, 24600321 - 24600479
Alignment:
Q  71 gtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataa 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  |||||    
T  24600321 gtccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttact--tataa 24600418  T
Q  171 ggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
      |||||||| |||||| || |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24600419 tatgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 24600479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34649594 - 34649428
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||| || | |||||||| || ||  ||||||    
T  34649594 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcactta 34649495  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34649494 ta--aggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtatacaacaaca 34649428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3550881 - 3550726
Alignment:
Q  58 agctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcct 157  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||   || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3550881 agctcggaaaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcct 3550785  T
Q  158 ctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    || |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3550784 cttact--tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcaca 3550726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 232
Target Start/End: Original strand, 5319967 - 5320131
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||      
T  5319967 ggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcact-- 5320064  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  5320065 tataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgcatacaacaa 5320131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40082577 - 40082398
Alignment:
Q  51 tggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 150  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  40082577 tggggggagctcggaggactatccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttat 40082478  T
Q  151 gagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaac 233  Q
    || |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  40082477 ga-tcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcgcacaacaac 40082398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 214
Target Start/End: Original strand, 3537601 - 3537747
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||      
T  3537601 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttact-- 3537698  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3537699 cataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 3537747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41759639 - 41759489
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||| |||      
T  41759639 ggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttact-- 41759542  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41759541 tataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcaca 41759489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34365048 - 34364915
Alignment:
Q  99 aagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccga 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  34365048 aagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttattattttatccga 34364951  T
Q  199 tgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34364950 tgtgtgacatataactcacacttgcacacaacaaca 34364915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Original strand, 22077497 - 22077660
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | | ||||||| ||||||| |||      
T  22077497 ggaccgtccatatcgatgcttgaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttact-- 22077594  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22077595 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 22077660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Original strand, 37850579 - 37850768
Alignment:
Q  42 gttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaa 141  Q
    ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||     
T  37850579 gttggatcatgaggggagctagg-ggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacat 37850677  T
Q  142 tgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    | |||||||| || |||| |||  ||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  37850678 taggtttatgggttctcttact--tataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 37850768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 212
Target Start/End: Original strand, 45493962 - 45494124
Alignment:
Q  51 tggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 150  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45493962 tggggggagctggg-ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttat 45494060  T
Q  151 gagtcctctcact--tatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataa 212  Q
    |  || ||| |||  |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  45494061 ggatcatcttacttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 45494124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Original strand, 31767138 - 31767330
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagaca 140  Q
    |||||| | ||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  31767138 tgttgggtcatgagggaagcttgggggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggca 31767237  T
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
     | |||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  31767238 ttaggttaatgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgcacacaacaacaa 31767330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29798355 - 29798188
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||||||| ||  || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||      
T  29798355 ggaccgtctatatcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact-- 29798258  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  29798257 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttgcatacaacaacaa 29798188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 232
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804521
Alignment:
Q  79 cgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttca 178  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||| |||  ||||| |||||||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttact--tataatgtgttca 38804467  T
Q  179 acatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  38804468 acctttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaacaacaa 38804521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 50052014 - 50052175
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| | | || | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |    
T  50052014 ggggagctcgggggactgtccacatcgaggttagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatggg 50052112  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||| |||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50052113 tcctcttact--tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 50052175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 232
Target Start/End: Original strand, 66449 - 66638
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagaca 140  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |     
T  66449 tgttgggtcatgaggggagcttggataaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggcc 66548  T
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||  |||||||  |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  66549 atatgtttatggatcctcttact--tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgcacacaacaa 66638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555721
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||| | ||||||| |||  ||||| |    
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggatttaag-gtcctcttact--tataatg 37555782  T
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaac 233  Q
    | |||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  37555781 tattcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacacttttacacaacaac 37555721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Original strand, 32594756 - 32594868
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||      
T  32594756 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtag 32594853  T
Q  204 gacatataactcaca 218  Q
    |||||||||||||||    
T  32594854 gacatataactcaca 32594868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14319028 - 14318875
Alignment:
Q  61 tcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctc 160  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||     
T  14319028 tcgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttctt 14318929  T
Q  161 acttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactca 216  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  14318928 act--tataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184594
Alignment:
Q  128 aaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacac 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaa--gtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacac 41184586  T
Q  228 aacaacaa 235  Q
    ||||||||    
T  41184587 aacaacaa 41184594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 218
Target Start/End: Original strand, 48588491 - 48588640
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat 166  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||| ||| |||  |    
T  48588491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttact--t 48588588  T
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  48588589 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcaca 48588640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Original strand, 39066190 - 39066368
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  39066190 gggggagtttgggggaccgtc-acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgg 39066288  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||| ||| | |  ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  39066289 gtcatcttagt--tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgcacacaacaaca 39066368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45084532 - 45084378
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| |||      
T  45084532 ggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagac------gttatgggtcctcttact-- 45084441  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacaca 228  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||    
T  45084440 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgcacaca 45084378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 214
Target Start/End: Original strand, 5528794 - 5528902
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5528794 agagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttata--agatgttcaacctttactcttttatccgatgtga 5528891  T
Q  204 gacatataact 214  Q
    |||||||||||    
T  5528892 gacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Original strand, 66079 - 66254
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||   | | ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |    
T  66079 ggggagctcgggggattgtctacatcgaggccagaacaaccatacaagtgagagg--cgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatggg 66176  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttc-aacatttactcttttatccgatgtgagacat-ataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||| |||  |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  66177 tcctcttact--tataaggtgttcaaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttgcacacaaca 66254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9956057 - 9955913
Alignment:
Q  74 cacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggttt-atgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    |||||||||||| || |||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| |||  ||||| |    
T  9956057 cacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttact--tataatg 9955960  T
Q  173 tgttcaacatttac-tcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9955959 tgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcaca 9955913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Original strand, 32168700 - 32168823
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||          
T  32168700 ggactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct------ 32168793  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccg 197  Q
      ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  32168794 --taaggtgttcaacctttactattttatccg 32168823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 229
Target Start/End: Original strand, 22077819 - 22077991
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| || |||||| | |||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||| |    
T  22077819 ggggagcctggaggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctt-aggctatgagtttatggg 22077917  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
    |||||| |||  |||||| |||||||| |||| | || |||||||| | | |||||||||||||| ||| ||||||    
T  22077918 tcctcttact--tataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttgcacacaa 22077991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Original strand, 44043812 - 44043893
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttact 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  44043812 agagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttact--tataaggtgttcaacatttact 44043893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11977110 - 11977011
Alignment:
Q  56 ggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtc 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||  ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  11977110 ggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtc 11977011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Original strand, 22077112 - 22077243
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||   ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||      
T  22077112 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttact-- 22077209  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgat 199  Q
    |||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  22077210 tataaggtattcaacctttacttttctatccgat 22077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 231
Target Start/End: Original strand, 24131994 - 24132150
Alignment:
Q  70 cgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||| || |  | ||||    
T  24131994 cgtctacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacac--cacacttaccc-aaaccttaaggcaatgagtttatggatcccctta--tttata 24132088  T
Q  170 aggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  24132089 aggtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgcatacaaca 24132150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5575223 - 5575109
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtg 202  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||  ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  5575223 gagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttata--aggtgttcaacctttactcttctatccgacgtg 5575126  T
Q  203 agacatataactcacat 219  Q
     ||||||||| ||||||    
T  5575125 ggacatataattcacat 5575109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 151
Target Start/End: Original strand, 50051679 - 50051775
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| | | || | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  50051679 ggggagctagggggaccgtccacatcgatgctagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaagataatgggtttatg 50051775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 218
Target Start/End: Original strand, 3537226 - 3537299
Alignment:
Q  143 gggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3537226 gggtttatgggtcctcttacttata--aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 3537299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Original strand, 19283464 - 19283620
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    ||||||| ||||| || |||||  ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||  | || || |    
T  19283464 ccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgagtttatgtgtcctctca--tttacaaag 19283561  T
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    || ||||| |  ||| || |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19283562 tgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 19283620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 1188614 - 1188753
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactct 189  Q
    |||||| | ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||| |  ||| |    
T  1188614 caaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcacttataaaa--tattcaacctccacttt 1188711  T
Q  190 tttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    | |||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1188712 tctatccgatatggaacatataactcacacttgcacacaaca 1188753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Original strand, 30630648 - 30630803
Alignment:
Q  74 cacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggt 173  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||| |||  ||||| ||    
T  30630648 cacatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttact--tataaagt 30630745  T
Q  174 gttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  30630746 gtcaaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgcacataaca 30630803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22793431 - 22793270
Alignment:
Q  70 cgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaa-tgggtttatgagtcctctcacttatat 168  Q
    |||||| || |||||  ||||||||| |||||  ||||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||     
T  22793431 cgtccatattgaggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataa 22793332  T
Q  169 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    |  || |||||| | |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22793331 a--gttttcaacctctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgctcacaacaa 22793270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839616
Alignment:
Q  74 cacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggt 173  Q
    |||||||||||  |||||| |  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |   |||||| ||| ||| |||||||  ||||    
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttata--aggt 45839682  T
Q  174 gttc-----aacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||     ||| |||| | || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45839681 gttcgattcaacctttatt-ttctatccgatgtgggacatataactcatacttgtacacaacaacaa 45839616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24448426 - 24448332
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    ||||||| |||| |||||||||  | ||| |||||| || | ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24448426 ccacatctaggcctgaacaacctcataagtgagagacacgccacacttttatccaaaatcttaagacaatgagtttatgagccctctcacttata 24448332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Original strand, 47380176 - 47380258
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtc 155  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  47380176 ccacatctaggcttgagcaaccagacaagtgagagagatgtcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgagtc 47380258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 234
Target Start/End: Original strand, 35154150 - 35154207
Alignment:
Q  177 caacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35154150 caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 35154207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Original strand, 4266888 - 4266940
Alignment:
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgta 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  4266888 gtgttcaacatttactcttttatctaatgtaggacatataactcacatttgta 4266940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 235
Target Start/End: Original strand, 21378118 - 21378210
Alignment:
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  || | |||||| |||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  21378118 atgggtttatgggtcctcttacttata--agatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgcacacaacaacaa 21378210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 167
Target Start/End: Original strand, 883596 - 883678
Alignment:
Q  85 ttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    ||||| || |||| ||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||    
T  883596 ttgaataatcatataagtgagaaagacactacactttaacctaaaaccttaagacattaagttaatgagtcctctcacttata 883678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44092050 - 44091909
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||| |||| |||| | ||||||||||||| || ||||| | | | | |||||| || ||||||||      
T  44092050 ggaccgtctacatcgaggccagaacaacaaaacaagtgagaaagacgccacactcttacccacaatcttaaaatattagatttatgggttctctcact-- 44091953  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacata 209  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||    
T  44091952 tataaagtgttcaacctttacttttacatctgatgtgtgacata 44091909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10555030 - 10554983
Alignment:
Q  121 ttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatat 168  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  10555030 ttaccctaaaccttaagacaatgagtttatgagtgctctcatttatat 10554983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10351285 - 10351215
Alignment:
Q  97 acaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||   |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  10351285 acaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttata 10351215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44685563 - 44685449
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaa-catttactcttttatccgatgtgagacatataac 213  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||| | |||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  44685563 acactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttata--aggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataac 44685467  T
Q  214 tcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  44685466 tcacacttgcacacaaca 44685449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 1187365 - 1187527
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaa-gcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactt 164  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||| ||| || | |||||||||   ||||| |||| ||||| ||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  1187365 ggaccgtccacatctaggtcagaacaactataaaaagtgagagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctcactt 1187464  T
Q  165 atataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
    ||| ||  |||| ||| |  ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  1187465 ataaaa--tgtttaacctccacttttatattcgatgtgagacatataattcacacttgcacacaa 1187527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 149
Target Start/End: Original strand, 9956213 - 9956258
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggttta 149  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9956213 agagagacatcacactcttacccaaaacattaagacaatgtgttta 9956258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 231
Target Start/End: Original strand, 50469181 - 50469246
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  50469181 tataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttgcacacaaca 50469246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878796
Alignment:
Q  156 ctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||||||||| ||  |||||||  || ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4878869 ctctcacttataaaa--tgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgcacacaaca 4878796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Original strand, 35154046 - 35154106
Alignment:
Q  107 gagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||    
T  35154046 gagacaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16455089 - 16454897
Alignment:
Q  40 ttgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagac 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  16455089 ttgttggattatgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggc 16454990  T
Q  140 aatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||| |||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16454989 aataggtttatgggtcctattact--tataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcacatttgtacacaacaaca 16454897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2377923 - 2377743
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  2377923 ggggaagctcgggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 2377824  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2377823 gtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttgtgcacaacaacaa 2377743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16107827 - 16107667
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    ||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  16107827 ccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact--tataagg 16107730  T
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16107729 tgtttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttgtacacaacaacaa 16107667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29518684 - 29518509
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagaca 140  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  29518684 tgttgggttatgagaggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggta 29518585  T
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29518584 atgggtttatgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 29518509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29519101 - 29518926
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagaca 140  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  29519101 tgttgggttatgagaggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggta 29519002  T
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29519001 atgggtttatgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 29518926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32741360 - 32741185
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagaca 140  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  32741360 tgttgggttatgagaggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggta 32741261  T
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32741260 atgggtttatgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 32741185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16454743 - 16454565
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  16454743 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatggg 16454644  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16454643 tcctcttact--tataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttgtacacaacaaca 16454565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 234
Target Start/End: Original strand, 2578418 - 2578610
Alignment:
Q  39 attgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaaga 138  Q
    |||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  2578418 attgttgggtcatgaggggggctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 2578517  T
Q  139 caatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2578518 ctatgggtttatgggtcctcttact--tataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 2578610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2843737 - 2843543
Alignment:
Q  40 ttgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagac 139  Q
    ||||||||| ||| |||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  2843737 ttgttggatcatgaggggagttagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggc 2843638  T
Q  140 aatgggtttat-gagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||  ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2843637 aatgagtttatggggtcctcttact--tataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcacaattgtgcacaacaacaa 2843543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Original strand, 2579850 - 2580041
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagaca 140  Q
    |||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |     
T  2579850 tgttgggtaatgaggggagcttgg-ggaccttccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggct 2579948  T
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
     |||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2579949 gtgggtttatgggtcctcttact--tataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacaa 2580041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2378290 - 2378132
Alignment:
Q  58 agctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcct 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  2378290 agctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcct 2378191  T
Q  158 ctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    || |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2378190 cttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 2378132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Original strand, 10073993 - 10074156
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||      
T  10073993 ggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact-- 10074090  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||    
T  10074091 tataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgcacacaaca 10074156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35210360 - 35210210
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||      
T  35210360 ggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttact-- 35210263  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210262 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcaca 35210210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1846917 - 1846754
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||     
T  1846917 ggggaagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgg 1846818  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    || |||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1846817 gtgctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcaca 1846754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 235
Target Start/End: Original strand, 593697 - 593878
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagc--gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||   |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  593697 ggggagctcgggggaccgtcaacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggtttatg 593796  T
Q  152 agtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || || ||||||    
T  593797 agtcctcttacttata--aggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttgcactcagcaacaa 593878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409265
Alignment:
Q  74 cacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggt 173  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact--tataaggt 3409310  T
Q  174 gttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3409309 gttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcaca 3409265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Original strand, 10074371 - 10074528
Alignment:
Q  72 tccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataag 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||    
T  10074371 tccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact--tataag 10074468  T
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||||    
T  10074469 gtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgcacacaaca 10074528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 234
Target Start/End: Original strand, 2579087 - 2579273
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagaca 140  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||        
T  2579087 tgttgggtcatgaggggagctcgg-ggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagtt 2579185  T
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||||||||  ||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2579186 atgggtttatggttcctct------tataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttgtacacaacaaca 2579273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3058382 - 3058236
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||      
T  3058382 ggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatact-- 3058285  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3058284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 3058236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Original strand, 14748331 - 14748490
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    | ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||     
T  14748331 gggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgg 14748426  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14748427 gtcctcttatttata--aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 14748490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3415628 - 3415464
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttga--acaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3415628 ggggagcttgggggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatg 3415529  T
Q  152 agtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
     ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3415528 ggtcctcttacttatat--ggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcaca 3415464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3409816 - 3409666
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| |||      
T  3409816 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttact-- 3409719  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  3409718 tataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcaca 3409666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Original strand, 10073617 - 10073779
Alignment:
Q  65 aggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactt 164  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||| |||     
T  10073617 aggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcctcttact- 10073715  T
Q  165 atataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
     ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  10073716 -tataaggtgttcaaccttta--cttttctccgatgtgggacatataactaacacttgcacacaaca 10073779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 5832029 - 5832194
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    ||| |||||| ||||||| |||||    
T  5832029 ggaccgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg-tggctttatgggtcctcttactta 5832127  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  5832128 ta--aggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttgtgcacaacaaca 5832194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999964
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat 166  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |  ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||  |||||| ||  ||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttac--at 6999896  T
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  6999897 ataaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacacttatacacaataaca 6999964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Original strand, 9062390 - 9062518
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  9062390 agagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttata--agatgttcaacctttactattttatccgatgtgg 9062486  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9062487 gacatataactcacatttatacacaataacaa 9062518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 32460631 - 32460732
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  32460631 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataact 32460728  T
Q  215 caca 218  Q
    ||||    
T  32460729 caca 32460732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1127509 - 1127366
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    ||||||||||| | || |||||| | |||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  1127509 ccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttact--tataagg 1127412  T
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  1127411 tgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcaca 1127366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16108221 - 16108053
Alignment:
Q  53 gggggagctcggagg-accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||  |||||| |||||||||| ||||            ||||||| |||||||||||||    
T  16108221 gggggagctcggagggaccgtccacatcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacac------------ccttaaggcaatgggtttatg 16108134  T
Q  152 agtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
     ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16108133 ggtcctcttacttata--aggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 16108053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Original strand, 2578837 - 2578999
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||| |  |     
T  2578837 ggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctctta--tt 2578934  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||  |||||||    
T  2578935 tataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcacacttgctcacaaca 2578999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26544218 - 26544055
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||| ||||||| ||||  | ||||| |||||| |||||| |  |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||     
T  26544218 ggggaagctcgggggactcttcacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgg 26544119  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26544118 gtcctcttact--tataacgtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 26544055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 235
Target Start/End: Original strand, 5958606 - 5958772
Alignment:
Q  63 ggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcac 162  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| || |||||    |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |     
T  5958606 ggaggagcgtccacatcgaggttagaacaatcacacaag----agagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttat 5958701  T
Q  163 ttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  5958702 ttata--aggtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacacatataactcacaattgcacaccacaacaa 5958772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Original strand, 2579500 - 2579644
Alignment:
Q  72 tccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataag 171  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||  ||||||    
T  2579500 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttact--tataag 2579597  T
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    || | | || |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2579598 gtatccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcaca 2579644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10911720 - 10911558
Alignment:
Q  68 accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  ||  |||||||||  |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||    
T  10911720 accgtccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact--ta 10911623  T
Q  168 taaggtgttcaacatttac-tcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  10911622 taaggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacacttgcatacaaca 10911558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 234
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950353
Alignment:
Q  79 cgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttca 178  Q
    ||||||| ||||||||  |||||  ||||||||   |||||||||| |||||||||||| || | | ||||||  |||||| |||| ||  |||||||||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgta--aggtgttca 1950297  T
Q  179 acatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  1950298 acctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttatacgcaacaaca 1950353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6071264 - 6071124
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactct 189  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||  || |||||||  ||||| ||||||||| |  ||| |    
T  6071264 caaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcact--tataaagtgttcaacctccacttt 6071167  T
Q  190 tttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    | ||| | ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6071166 tctattcaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 6071124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 157
Target Start/End: Original strand, 12071693 - 12071784
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcct 157  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  12071693 ggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtttatgagtcct 12071784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 157
Target Start/End: Original strand, 12085037 - 12085127
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcct 157  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  12085037 gaccgttcgcatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttatgagtcct 12085127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8482044 - 8481919
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||| |  ||| || |||| ||||||     
T  8482044 agagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctca--tttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgtg- 8481948  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8481947 gacatataactcacacttgcacacaacaa 8481919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Original strand, 17135071 - 17135221
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||| |||| |   ||||||||| ||||||| ||   |||||| |||||||| ||||||  ||||    
T  17135071 ggaccgtccacatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttgctta 17135170  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||  |||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17135171 ta--aggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcaca 17135221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 231
Target Start/End: Original strand, 12092515 - 12092647
Alignment:
Q  97 acaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatcc 196  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||| || |||||    
T  12092515 acaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcact--tataaagtgctcaacctccacttttctatcc 12092612  T
Q  197 gatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||| ||||| |||| |||  ||| ||||||||    
T  12092613 gatgtgggacatctaacacacccttgcacacaaca 12092647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31714823 - 31714722
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat 166  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | | || | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||||    
T  31714823 gaccgtccacatcgaggctagagcaaccacacaagcgaaaaa-acgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctctca-ttat 31714726  T
Q  167 ataa 170  Q
    ||||    
T  31714725 ataa 31714722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 130
Target Start/End: Original strand, 10902453 - 10902496
Alignment:
Q  87 gaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaa 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10902453 gaacaaccatacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 10902496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 151
Target Start/End: Original strand, 11637761 - 11637808
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11637761 agagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatg 11637808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Original strand, 22605301 - 22605342
Alignment:
Q  110 acactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22605301 acaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 22605342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2975668 - 2975567
Alignment:
Q  106 agagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgaga 205  Q
    |||||||  |||||||||  |||||| ||||||||| || |||||| ||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| || |||  |||||| ||    
T  2975668 agagacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttata--aggtgttcaacatttacttttctatttgatgtggga 2975571  T
Q  206 cata 209  Q
    ||||    
T  2975570 cata 2975567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20117252 - 20117208
Alignment:
Q  124 cccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatat 168  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  20117252 cccaaaaccttaagacattgaatttatgagtactctcacttatat 20117208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 234
Target Start/End: Original strand, 37990632 - 37990807
Alignment:
Q  57 gagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcc 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37990632 gagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcc 37990731  T
Q  157 tctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37990732 tcttact--tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 37990807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 235
Target Start/End: Original strand, 29644892 - 29645071
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||  | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29644892 ggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatggg 29644991  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  29644992 tcctcttact--tataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaacaa 29645071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 234
Target Start/End: Original strand, 43346788 - 43346959
Alignment:
Q  61 tcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctc 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||     
T  43346788 tcggaggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 43346887  T
Q  161 acttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43346888 act--tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 43346959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 37990979 - 37991145
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||| |||      
T  37990979 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttact-- 37991076  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37991077 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 37991145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15773011 - 15772843
Alignment:
Q  65 aggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactt 164  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||     
T  15773011 aggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttact- 15772913  T
Q  165 atataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  15772912 -tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttgcacacgacaacaa 15772843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Original strand, 32462890 - 32463069
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32462890 ggggagcttggaagaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgag 32462989  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaa-catttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    || ||| |||  |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32462990 tcttcttact--tataaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 32463069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25755562 - 25755384
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  25755562 ggggagttcgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgag 25755463  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25755462 tcctcttact--tataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 25755384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 234
Target Start/End: Original strand, 42342081 - 42342258
Alignment:
Q  55 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagt 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42342081 gggagttcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagt 42342180  T
Q  155 cctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||| |||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  42342181 cctcttact--tataaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgcacacaacaaca 42342258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Original strand, 33803254 - 33803417
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33803254 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttactta 33803353  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33803354 tat--ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattgcacacaaca 33803417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35946678 - 35946515
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  35946678 ggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttactta 35946579  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35946578 ta--aggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 35946515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 42342390 - 42342556
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||      
T  42342390 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttact-- 42342487  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  42342488 tataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 42342556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Original strand, 54017805 - 54017982
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  54017805 gggggagccagggggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatga 54017904  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  54017905 gtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaa 54017982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Original strand, 12114564 - 12114731
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  12114564 ggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttact-- 12114661  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  12114662 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgcacacaacaacaa 12114731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15773376 - 15773182
Alignment:
Q  40 ttgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgag--agagacactacactcttacccaaaaccttaag 137  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  15773376 ttgttggatcatgaggggagttaggaggatcgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaag 15773277  T
Q  138 acaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
     ||||| | ||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15773276 gcaatgagcttatgagtcctcttacttata--agatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 15773182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52634844 - 52634664
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||   |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  52634844 gggggagctcgggggacagtctacatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 52634745  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaac 236  Q
    ||| ||| |||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52634744 gtc-tcttacttata--aggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacaac 52634664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 29644583 - 29644749
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||| |||||||||| |||  |||||||  | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||      
T  29644583 ggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttact-- 29644680  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  29644681 tataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaaaaca 29644749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 53117977 - 53118142
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||      
T  53117977 ggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcact-- 53118073  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  53118074 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgcccacaacaaca 53118142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 3135456 - 3135629
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat--gagtcctctcact 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| |||    
T  3135456 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctcttact 3135555  T
Q  164 tat---ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
     ||   |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3135556 aatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 3135629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32589885 - 32589693
Alignment:
Q  40 ttgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagac 139  Q
    ||||||||| |||  ||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |    
T  32589885 ttgttggatcatgaagggagcgagggggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggc 32589786  T
Q  140 aatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  32589785 aatgggtttatgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgcacacaacaacaa 32589693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22304738 - 22304575
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||| |||| || |||| |||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  22304738 ggggaagctagggggactgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgg 22304639  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||| |||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22304638 gtcctcttact--tataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcaca 22304575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Original strand, 41359753 - 41359929
Alignment:
Q  53 gggggagctcggagg-accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41359753 gggggagctcggggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 41359852  T
Q  152 agtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
     ||||||| |||  |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |    |||||||||| ||| |||||||||||    
T  41359853 ggtcctcttact--tataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtggg----ataactcacacttgcacacaacaaca 41359929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 25739427 - 25739593
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  25739427 ggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttactta 25739526  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||  | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25739527 tat--gatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 25739593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 54018200 - 54018366
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||| |||      
T  54018200 ggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttact-- 54018297  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  54018298 tataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgcacataacaaca 54018366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935104
Alignment:
Q  72 tccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataag 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||  ||||||    
T  39934963 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttact--tataag 39935060  T
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactc 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39935061 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactc 39935104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Original strand, 21832347 - 21832508
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||      
T  21832347 ggactgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgc--cactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttact-- 21832442  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  21832443 tataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttgcacataaca 21832508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 232
Target Start/End: Original strand, 45395656 - 45395819
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat 166  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||  |    
T  45395656 gaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttact--t 45395753  T
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  45395754 ataacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgcacacaacaa 45395819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 236
Target Start/End: Original strand, 1634305 - 1634485
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  1634305 ggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatggg 1634403  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttt-tatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaac 236  Q
    |||||| |||||||  | ||||| ||| |||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  1634404 tcctcttacttata--atgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacagcaacaac 1634485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Original strand, 49336727 - 49336856
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  49336727 agagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttata--aggtggtcaacctttacttttctatccgatgtga 49336824  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  49336825 gacatgtaactcacacttgtacacaacaacaa 49336856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45901870 - 45901703
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| || |||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||| |||      
T  45901870 ggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttact-- 45901773  T
Q  166 tataaggtgttcaa-catttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45901772 tataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 45901703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31190161 - 31190007
Alignment:
Q  70 cgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||        ||||| |||||||      
T  31190161 cgtccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggt--------cctctaacttata-- 31190072  T
Q  170 aggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  31190071 aggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgcacacaacaaca 31190007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Original strand, 3135106 - 3135237
Alignment:
Q  97 acaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatcc 196  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| | || |||||||||| || || | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3135106 acaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttata--aggtgttcaacatttactattttatcc 3135203  T
Q  197 gatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3135204 gatgtgggacatataactcac--ttgtacacaacaa 3135237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Original strand, 22303963 - 22304116
Alignment:
Q  72 tccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataag 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||  ||||||    
T  22303963 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttact--tataag 22304060  T
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
           || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22304061 -------acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 22304116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39389186 - 39389076
Alignment:
Q  106 agagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgaga 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  39389186 agagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagt--tttaaggtgttcaacctttactattttatccgatgtagga 39389089  T
Q  206 catataactcaca 218  Q
    |||||||||||||    
T  39389088 catataactcaca 39389076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914241
Alignment:
Q  75 acatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtg 174  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| || | |||||||| ||||||| | |||||  |||||    
T  39914399 acatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttata--aggtg 39914302  T
Q  175 ttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  39914301 ttcaacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaacaa 39914241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11662117 - 11661957
Alignment:
Q  56 ggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaa-ccttaagacaatgggtttatgagt 154  Q
    ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     
T  11662117 ggagctcgtgggactgttcacatcgaggctagaacaaccacacaat-gagagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgagg 11662019  T
Q  155 cctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  11662018 cctctcactttta--aggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcaca 11661957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 53577530 - 53577353
Alignment:
Q  56 ggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtc 155  Q
    |||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||  ||    
T  53577530 ggagttcgggggaccatccacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatc 53577431  T
Q  156 ctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    | || | || ||  || |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  53577430 cacttattttta--agatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacacaacaacaa 53577353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 231
Target Start/End: Original strand, 47964921 - 47965080
Alignment:
Q  70 cgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||||||||| ||||  |||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47964921 cgtccacatctaggccagaacaatcatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcacttatata 47965020  T
Q  170 aggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |  |||| ||| |  ||| || |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  47965021 a--tgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaacatataactcacacttgcacacaaca 47965080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Original strand, 50612449 - 50612604
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtt-----tatgagtcctctc 160  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||     ||||||||||||     
T  50612449 ggaccgtccacgtcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctctt 50612548  T
Q  161 acttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50612549 acttata--aggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 50612604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Original strand, 33175649 - 33175829
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagaga---cactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggt---t 147  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||   |    
T  33175649 ggggagctcgggggactgcccacaccgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcac-acactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttat 33175747  T
Q  148 tatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||| || |||| |||  ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33175748 tatgggttctcttact--tataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaaca 33175829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8328023 - 8327897
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtg 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || |||| |||||||  || | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  8328023 gagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctcttacttata--agatattcatcctttactcttttatccgatgtg 8327926  T
Q  203 agacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8327925 ggacatataactcacacttgcacacaaca 8327897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 234
Target Start/End: Original strand, 32462535 - 32462727
Alignment:
Q  40 ttgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagac 139  Q
    ||||||||| ||| |||||| | || || ||||| |||||||||||  ||||| |  |||| | |||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |    
T  32462535 ttgttggatcatgaggggagtttggggg-ccgtctacatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagc 32462633  T
Q  140 aatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacattt-actcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||| ||||||||  || ||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32462634 aataggtttatggatcatcttacttata--aggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 32462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4823769 - 4823661
Alignment:
Q  108 agacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagaca 207  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  4823769 agacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttata--aggtgtttaacttttactattttatccgatgtgagact 4823672  T
Q  208 tataactcaca 218  Q
    |||||||||||    
T  4823671 tataactcaca 4823661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964683
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactct 189  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |  ||  |    
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatata--gcgttcaacctccacatt 47964641  T
Q  190 tttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    | ||||||||| | |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  47964642 tctatccgatgcgggacatacaactcacacttgcacacaaca 47964683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37726664 - 37726510
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| | ||   ||||||||| ||||||||| ||| |||||| |           
T  37726664 ggggagttcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatggat------- 37726572  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
     ||||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726571 -cctcttacttata--aggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcaca 37726510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 22303662 - 22303759
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactt 164  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22303662 gaccgtctacatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 214
Target Start/End: Original strand, 42584864 - 42584970
Alignment:
Q  106 agagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgaga 205  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  42584864 agagacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttata--aggtgttcaatctttactcttctatccgatgtggga 42584961  T
Q  206 catataact 214  Q
    |||||||||    
T  42584962 catataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 232
Target Start/End: Original strand, 44160549 - 44160710
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |   ||||  |||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |  |     
T  44160549 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcg--caagtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctctta--tt 44160643  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  44160644 tataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttgcatacaacaa 44160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9240300 - 9240142
Alignment:
Q  71 gtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataa 170  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  || |  ||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||  |    
T  9240300 gtccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttata--a 9240203  T
Q  171 ggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||||| | ||||||  | |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9240202 ggtgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgcacacaaca 9240142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 216
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767464
Alignment:
Q  130 accttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagt--tataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactca 7767464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 39336003 - 39336061
Alignment:
Q  97 acaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtc 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  39336003 acaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtc 39336061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346640
Alignment:
Q  168 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgcacacaacaaca 43346640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 51886644 - 51886567
Alignment:
Q  139 caatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51886644 caatgagtttatgggtcctcttacttatatga--tgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcaca 51886567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 137
Target Start/End: Original strand, 41359493 - 41359564
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaag 137  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41359493 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaag 41359564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 230
Target Start/End: Original strand, 33362327 - 33362460
Alignment:
Q  98 caagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccg 197  Q
    ||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||| |||| | |||||||||    
T  33362327 caagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttact--tataaggtattcaacctttattattttatccg 33362424  T
Q  198 atgtgaga---catataactcacatttgtacacaac 230  Q
    |  |||||   ||||||||||||| || ||||||||    
T  33362425 acatgagatatcatataactcacacttatacacaac 33362460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304252
Alignment:
Q  169 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 22304252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 151
Target Start/End: Original strand, 54017590 - 54017635
Alignment:
Q  106 agagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54017590 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 54017635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11661593 - 11661525
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11661593 tataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaccaaca 11661525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317219
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctca 161  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||    
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctca 25317219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 43978856 - 43978947
Alignment:
Q  55 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacact----cttacccaaaaccttaagacaat 142  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||| | |||||    |||||||||||||||||| ||||    
T  43978856 gggagctcgggggacagtccacatcgaggttagaacaaacacacaagtgagagagacgccacactctagcttacccaaaaccttaaggcaat 43978947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 53596079 - 53596013
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  53596079 gagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtctcctctcttatata 53596013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 53596394 - 53596328
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  53596394 gagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtctcctctcttatata 53596328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 9239994 - 9239937
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatac 98  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9239994 tgttggatcatgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaaaaaccatac 9239937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22304362 - 22304302
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacac 113  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  22304362 ggggaagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 53596594 - 53596546
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  53596594 gagagagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatg 53596546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11661639 - 11661605
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaag 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11661639 gagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 11661605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17731991
Alignment:
Q  110 acactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatg 17731991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Original strand, 17735043 - 17735096
Alignment:
Q  116 cactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||| ||||||||    
T  17735043 cactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggttccctctcttatata 17735096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033222
Alignment:
Q  110 acactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatg 19033222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Original strand, 19036312 - 19036365
Alignment:
Q  116 cactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||| ||||||||    
T  19036312 cactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggttccctctcttatata 19036365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 137
Target Start/End: Original strand, 7766785 - 7766854
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaag 137  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||    
T  7766785 ggaccatctacatcgaggctagaacaaccatacaa--gtgagagacgccacaatcttacctaaaaccttaag 7766854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8328426 - 8328374
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacac 118  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  8328426 ggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 232
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747918
Alignment:
Q  192 tatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 12747918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25991522 - 25991409
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtg 202  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||||||||||| || | |||||||  || |||||||||||| ||  |||| |||||| |||  |||||  ||||||    
T  25991522 gagagagagaccacactttaacccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaa--tgtttaacattaacttgtttatttgatgtg 25991425  T
Q  203 agacatataactcaca 218  Q
     ||||||| |||||||    
T  25991424 ggacatattactcaca 25991409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 151
Target Start/End: Original strand, 46546376 - 46546412
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  46546376 acactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatg 46546412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 52635047 - 52635003
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctct 159  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  52635047 acactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctct 52635003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 235
Target Start/End: Original strand, 3038281 - 3038459
Alignment:
Q  55 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  3038281 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 3038380  T
Q  155 cctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||| | |||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3038381 ccttttact--tataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacaa 3038459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34835026 - 34834866
Alignment:
Q  72 tccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataag 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||    
T  34835026 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttact--tataag 34834929  T
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34834928 gtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 34834866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9309523 - 9309345
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |   ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |     
T  9309523 gggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacatact-gagagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagg 9309425  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9309424 gtcctcttacttata--aggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 9309345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3669855 - 3669693
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3669855 ggggagctagggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgag 3669756  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3669755 tcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcaca 3669693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30359389 - 30359260
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30359389 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgcttata--aggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 30359292  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30359291 gacatataactcacacttgtacacaacaacaa 30359260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Original strand, 6876851 - 6877031
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||     
T  6876851 gggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgg 6876950  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagac-atataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||| ||| |  | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6876951 gtcatctta--tttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgcacacaacaaca 6877031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Original strand, 25561817 - 25561985
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttaccc-aaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactt 164  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  25561817 ggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttactt 25561916  T
Q  165 atataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25561917 ata--aggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtagacaacaacaa 25561985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359599
Alignment:
Q  68 accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||  | |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  168 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
      ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30359663 --aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 30359599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30441236 - 30441087
Alignment:
Q  71 gtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata--t 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||  |    
T  30441236 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataatt 30441137  T
Q  169 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30441136 aaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcaca 30441087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122220
Alignment:
Q  74 cacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggt 173  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||  ||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttact--tataaggt 45122164  T
Q  174 gttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45122165 gttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 45122220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34835378 - 34835199
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||     
T  34835378 gggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgg 34835279  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  34835278 gtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttgtacacagcaaca 34835199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Original strand, 70277 - 70442
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat 166  Q
    |||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||| ||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||    
T  70277 gaccgtccgcattgaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttat 70376  T
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  70377 a--agatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcac-tttgtacacaacaacaa 70442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 199
Target Start/End: Original strand, 9483191 - 9483320
Alignment:
Q  68 accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  9483191 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttact--ta 9483288  T
Q  168 taaggtgttcaacatttactcttttatccgat 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9483289 taaggtgttcaacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40518241 - 40518061
Alignment:
Q  52 ggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40518241 ggggggagctcgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatg 40518142  T
Q  152 agtcctctcacttatataaggtgttcaacatttac--tcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
     ||||  | |||  ||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  40518141 ggtccatttact--tataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttgaacacaacaa 40518061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3670214 - 3670066
Alignment:
Q  68 accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||  |||  ||    
T  3670214 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatact--ta 3670117  T
Q  168 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3670116 taaggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 3670066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794101
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttata--agatgttcaacatttattcttttatccgatgtga 8794132  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8794131 gacatataactcacacttgtacacaacaaca 8794101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40518749 - 40518577
Alignment:
Q  55 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagt 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  40518749 gggagctcagaggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggt 40518650  T
Q  155 cctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
    ||||| |  | ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  40518649 cctctta--tttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgaacacaa 40518577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 45122780 - 45122648
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||      
T  45122780 ggaccttccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttact-- 45122683  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatg 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  45122682 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 45122648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5916056 - 5915863
Alignment:
Q  32 ccccacgattgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaac 131  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5916056 ccccactattgttggatcattgggggagttcgg-ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac 5915958  T
Q  132 cttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||      ||||| ||||| ||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5915957 cttaaggcaatgagtttatgggtcctct------tataaagtgttaaac-tttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttgcacacaaca 5915865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Original strand, 9482608 - 9482770
Alignment:
Q  68 accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  9482608 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttact--ta 9482705  T
Q  168 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9482706 taaggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac--ttgtacacaacaaca 9482770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 33113369 - 33113535
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||      
T  33113369 ggaccgtccgcattgagcctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact-- 33113466  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33113467 tataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcaaacttgtacacaacaaca 33113535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5420820 - 5420663
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||   ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5420820 gggggagttccgcggacggtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatga 5420721  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataa 212  Q
    ||||||| |||  |||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  5420720 gtcctcttact--tataagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataa 5420663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 234
Target Start/End: Original strand, 37544496 - 37544658
Alignment:
Q  70 cgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||  ||  ||||    
T  37544496 cgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttct--tata 37544593  T
Q  170 aggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37544594 atgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttgtgcacaacaaca 37544658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Original strand, 45121912 - 45122062
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||      
T  45121912 ggaccttccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact-- 45122009  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45122010 tataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcaca 45122062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 1513917 - 1514078
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| |||||    
T  1513917 ggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttactta 1514016  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||    
T  1514017 ta--aggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttgtacacaa 1514078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41972330 - 41972151
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaa---aaccttaagacaatgggttta 149  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||   ||| ||| | |||||||||||    
T  41972330 gggggagttcgggagaccgtccatattgaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggttta 41972231  T
Q  150 tgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    || ||||| |||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41972230 tgggtcctatcacttata--aggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 41972151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9309150 - 9308970
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactac---actcttacccaaaaccttaagacaatgggttta 149  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||| ||   |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  9309150 gggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccaca-tagtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggttta 9309052  T
Q  150 tgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtg--agacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    || ||||||| |||  |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9309051 tgggtcctcttact--tataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttgcacacaaca 9308970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9608898 - 9608738
Alignment:
Q  69 ccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatat 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||  |||    
T  9608898 ccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttact--tat 9608801  T
Q  169 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9608800 aaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 9608738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34835644 - 34835464
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||     
T  34835644 gggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgg 34835545  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatc-cgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  34835544 gtcctcttact--tataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgtacacagcaaca 34835464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34835910 - 34835730
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||     
T  34835910 gggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgg 34835811  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatc-cgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  34835810 gtcctcttact--tataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgtacacagcaaca 34835730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 147576 - 147457
Alignment:
Q  97 acaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatcc 196  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  147576 acaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatttata--aggtgttcaacctttactcttttatcc 147479  T
Q  197 gatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  147478 gatgtgggacatataactcaca 147457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9507933 - 9507769
Alignment:
Q  71 gtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  9507933 gtccacatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttact--tataa 9507836  T
Q  171 ggtgttcaacatttact---cttttatccgatgtg--agacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||| |||||| ||||||   ||||||||| || ||   || |||||||||||| ||| |||||||||    
T  9507835 ggtattcaacctttactgtacttttatccaatatggaggagatataactcacacttgcacacaacaa 9507769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 8918766 - 8918932
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||| ||| || ||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||      
T  8918766 ggaccgtccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttact-- 8918863  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  8918864 tataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgcacacaacaaca 8918932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 40579496 - 40579658
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||| |    
T  40579496 ggggagcatggaggatcgtccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatggg 40579595  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  40579596 tcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcaca 40579658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 211
Target Start/End: Original strand, 20870549 - 20870718
Alignment:
Q  40 ttgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagac 139  Q
    ||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |    
T  20870549 ttgttgggtcatgaggggagccaggaggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggc 20870648  T
Q  140 aatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatata 211  Q
    | |||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  20870649 agtgggtttatgggtcctcttact--tataagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatata 20870718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Original strand, 1014233 - 1014397
Alignment:
Q  53 gggggagctcggagga-ccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || | ||||| |    
T  1014233 gggggagctcgggggaaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacg 1014332  T
Q  152 agtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
     ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  1014333 ggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcaca 1014397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 32640521 - 32640679
Alignment:
Q  54 ggggagctc-ggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||||||| |||||| || | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  32640521 ggggagctctggcggaccgctcacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcg 32640620  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||| || ||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32640621 gtcctcttaccta-------tgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcaca 32640679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 235
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274948
Alignment:
Q  109 gacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacat 208  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  |  | |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataata--tattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacat 43274921  T
Q  209 ataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||||||||| || |||||||||||||    
T  43274922 ataactcacacttatacacaacaacaa 43274948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 18371970 - 18372142
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggagga-ccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagac 139  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| || |||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  18371970 tgttgggtcatgaggggagctcgggggaaccgttcacattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagc 18372069  T
Q  140 aatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    |||| |||||||  |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||  ||||||||||    
T  18372070 aatgagtttatggatcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45123162 - 45122996
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactct--tacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcact 163  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||  ||||   |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||    
T  45123162 ggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatcttact 45123063  T
Q  164 tatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  45123062 ta----aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacagcaaca 45122996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 234
Target Start/End: Original strand, 45121663 - 45121823
Alignment:
Q  71 gtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataa 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | |||  ||||||| |  |||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||  |||||| |||||||  |    
T  45121663 gtccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttata--a 45121760  T
Q  171 ggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  45121761 ggtgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttgtacacaacaaca 45121823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 147989 - 147819
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||| |||||| |||||||   |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  147989 gggggagctatgaggaccgctcacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgg 147890  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||           |||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  147889 gt-----------tatatgttgttcaacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 147819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014023
Alignment:
Q  72 tccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataag 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||  | |||||||  |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||  |||| |    
T  1013879 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttact--tatagg 1013976  T
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1013977 gtgttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcaca 1014023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Original strand, 9620668 - 9620841
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||  | |||||||   |||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  9620668 ggggagcccgggggaccgtccacatccaggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactctta--taaaatcttaaggcaatgagtttatggg 9620765  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||| | |||| || |||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9620766 tcctctcact--tataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 9620841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283867
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||| | | |||  | ||||     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttact--tttaaga 12283925  T
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaac 230  Q
    | ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  12283924 tattcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttgcacacaac 12283867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41129144 - 41129066
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgg 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41129144 ggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatgg 41129066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Original strand, 40579259 - 40579352
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtt 147  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  40579259 ggggagctcgggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatgggtt 40579352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 18371665 - 18371807
Alignment:
Q  68 accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||      
T  18371665 accgtccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggc-atgggtttatgggtcttcttactta-- 18371761  T
Q  168 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 217  Q
         |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18371762 ----atgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18371807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037853
Alignment:
Q  132 cttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatata 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttact--tataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatata 3037853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6651650 - 6651510
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || |||| |        
T  6651650 ggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta---- 6651555  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 217  Q
           | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6651554 -------ttttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 6651510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Original strand, 18372356 - 18372408
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372356 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcaca 18372408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Original strand, 4154707 - 4154831
Alignment:
Q  105 gagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgag 204  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||| |  ||| || |||| |||||| |    
T  4154707 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcact--tataaagtgttcaacctccacttttctatcagatgtggg 4154804  T
Q  205 acatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4154805 acatataactcacacttgcacacaaca 4154831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 137
Target Start/End: Original strand, 8919146 - 8919217
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaag 137  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8919146 ggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaag 8919217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373098
Alignment:
Q  118 ctcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 217  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttata--aggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcac 18373082  T
Q  218 atttgtacacaacaaca 234  Q
    |  ||||||||||||||    
T  18373083 a-ctgtacacaacaaca 18373098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130455
Alignment:
Q  117 actcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactca 216  Q
    ||||||||| |||||| ||||   |||||||||||  || ||| |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta---aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctca 20130457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 12156709 - 12156763
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  12156709 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagttctttctcttatata 12156763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 232
Target Start/End: Original strand, 4154290 - 4154446
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    ||||||| ||||  || |||||| ||||  ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |  |    
T  4154290 ccacatctaggccagagcaaccaaacaattgagagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggtc-tctcacttataaa--g 4154386  T
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    |||||||| |  ||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4154387 tgttcaacctccacttttctatctgatgtaggacatataactcacatttgcacacaacaa 4154446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6732045 - 6731910
Alignment:
Q  72 tccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataag 171  Q
    |||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| || |||| |||            
T  6732045 tccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttact-------- 6731954  T
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
       |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6731953 ---ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 6731910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Original strand, 18372799 - 18372851
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18372799 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcaca 18372851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 25561744 - 25561792
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25561744 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 226
Target Start/End: Original strand, 18372657 - 18372762
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||| |||||| ||||||||||  ||  |||||||| |    
T  18372657 acactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttat---aagtgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaat 18372750  T
Q  215 cacatttgtaca 226  Q
    |||| |||||||    
T  18372751 cacacttgtaca 18372762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Original strand, 41416271 - 41416322
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 217  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41416271 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 41416322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 111
Target Start/End: Original strand, 3037958 - 3038016
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagac 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  3037958 gggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagatagagagac 3038016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 18380059 - 18380169
Alignment:
Q  106 agagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgaga 205  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||  | || || |||  ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||    
T  18380059 agaggcaccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttact--tataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtggga 18380156  T
Q  206 catataactcaca 218  Q
     ||||||||||||    
T  18380157 tatataactcaca 18380169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 128
Target Start/End: Original strand, 43274626 - 43274699
Alignment:
Q  55 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaa 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  43274626 gggagctcgggggaccgtccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2467632 - 2467508
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactct 189  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |  ||||||| ||||    ||||||||| | || | |    
T  2467632 caaccatacaagtgagagagacgtcacacttttaccaaaaactttaagacaacgagtttatgtgctctctcacatata----gtgttcaacttctaattt 2467537  T
Q  190 tttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2467536 tctatccgacgtgagacatataactcaca 2467508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9609220 - 9609108
Alignment:
Q  87 gaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttac 186  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||| |||  |||||| |||||||| |||||    
T  9609220 gaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttact--tataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  187 tcttttatccgatgt 201  Q
    | || |||| |||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 145
Target Start/End: Original strand, 20995442 - 20995497
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatggg 145  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20995442 caaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatggg 20995497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27856256 - 27856185
Alignment:
Q  97 acaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatat 168  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  27856256 acaagtgagagagacacaacacttttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgagtcctctatcttatat 27856185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Original strand, 43398123 - 43398223
Alignment:
Q  119 tcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat--ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactca 216  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||  |||||| |||||| | |||||  |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  43398123 tcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctc-ctcttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactca 43398221  T
Q  217 ca 218  Q
    ||    
T  43398222 ca 43398223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995566
Alignment:
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||| ||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 20995566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32305584 - 32305503
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccga 198  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||  ||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32305584 acactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttacttata--aggtgttcaacctttactattttatccga 32305503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645752
Alignment:
Q  192 tatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 18645752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Original strand, 18372273 - 18372342
Alignment:
Q  54 ggggagctcggagga-ccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactctt 122  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  | |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18372273 ggggagctcgggggaaccgtccacatcgagactaaagcaaccgcacaagcgagagagacaccacactctt 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 85
Target Start/End: Original strand, 3038041 - 3038073
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggct 85  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3038041 gggggagctcgggggaccgtccacatcgaggct 3038073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 218
Target Start/End: Original strand, 18372487 - 18372523
Alignment:
Q  182 tttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18372487 tttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 18372523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 234
Target Start/End: Original strand, 43274699 - 43274735
Alignment:
Q  198 atgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43274699 atgtgagatatataactcacacttgtacacaacaaca 43274735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Original strand, 44358151 - 44358212
Alignment:
Q  145 gtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacat 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  44358151 gtttatgagtcatctcacttataaaa--tggtcaacattcacttttttatctgatgtgagacat 44358212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6421553 - 6421375
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  6421553 ggggagctcgggggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgag 6421454  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6421453 tcctcttact--tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtgcacaacaaca 6421375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15880429 - 15880253
Alignment:
Q  56 ggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtc 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  15880429 ggagctcggaggaacgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 15880330  T
Q  156 ctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15880329 ctcttact--tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 15880253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 962767 - 962591
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  962767 gggggagttcgggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgg 962668  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  962667 gtcctctcact--tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcatacaaca 962591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 5542602 - 5542777
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagaca 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5542602 tgttggatcatggggggagctcgggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 5542701  T
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    || |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  5542702 ataggtttatgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcaca 5542777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 36178596 - 36178757
Alignment:
Q  55 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagt 154  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  36178596 gggagcgcgggggatcgtccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 36178695  T
Q  155 cctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36178696 cctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 36178757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Original strand, 15511485 - 15511661
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15511485 gggggagctcgg-ggatcgtccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgg 15511583  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  15511584 gtcctcttact--tataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac--ttgcacacaacaaca 15511661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37106092 - 37105930
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  37106092 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatggg 37105993  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||| || |||  ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37105992 tccccttact--tataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcaca 37105930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37106350 - 37106194
Alignment:
Q  60 ctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctct 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  37106350 ctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctct 37106251  T
Q  160 cacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
     |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37106250 tact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 37106194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Original strand, 14745656 - 14745819
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14745656 gggggagctcgggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 14745755  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14745756 gtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcaca 14745819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Original strand, 35580726 - 35580886
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||      
T  35580726 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg-gtcctctcact-- 35580822  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35580823 tataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 35580886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6713138 - 6712966
Alignment:
Q  61 tcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaa-ccttaagacaatgggtttatgagtcctct 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  6713138 tcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctct 6713039  T
Q  160 cacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
     |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6713038 tacttata--aggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtatacaacaaca 6712966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 218
Target Start/End: Original strand, 5542975 - 5543150
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagaca 140  Q
    |||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  5542975 tgttggatcatggggggagctcaaggtaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggca 5543074  T
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    || ||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5543075 ataggtttatggatcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcaca 5543150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40733673 - 40733507
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    | |||||||| ||||||| |||||    
T  40733673 ggaccatccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttactta 40733574  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40733573 ta--aggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaataaca 40733507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Original strand, 36005869 - 36006048
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  36005869 gggggagctcgagagactgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 36005968  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36005969 gtcctcttact--tataaggtgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacaa 36006048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42514817 - 42514642
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |    
T  42514817 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatggg 42514718  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  42514717 tcctcttact--tataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgcatacaaca 42514642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Original strand, 38796620 - 38796789
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactaca--ctcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcact 163  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| | |||  |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| |||    
T  38796620 ggaccgtcgacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttact 38796719  T
Q  164 tatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||  ||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38796720 tata--aggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacaa 38796789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40734038 - 40733873
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |  | || ||||||| ||||| |||      
T  40734038 ggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgtagg-ttatgagccctcttact-- 40733942  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40733941 tataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaataaca 40733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Original strand, 41283477 - 41283627
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||      
T  41283477 ggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact-- 41283574  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  41283575 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcaca 41283627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33731807 - 33731654
Alignment:
Q  63 ggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcac 162  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||    
T  33731807 ggaggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttac 33731708  T
Q  163 ttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33731707 t--tataaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcaca 33731654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1770061 - 1769889
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||  |||| | | ||  | ||| ||||||||    
T  1770061 gggggagctaggaggatcgttcacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatga 1769962  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacac 227  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  1769961 gtcctcttacttata--aggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacac 1769889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 202
Target Start/End: Original strand, 36178161 - 36178307
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  36178161 ggggagcgcgggggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggg 36178260  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtg 202  Q
    | | || |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  36178261 ttcccttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 36178307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679794
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat 166  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||  |||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||| |||  |    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttact--t 40679729  T
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40679730 ataaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgcacacaaca 40679794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6422266 - 6422126
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| | |      
T  6422266 ggacagtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaat-- 6422169  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacat 208  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  6422168 tataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6421899 - 6421794
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  6421899 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg 6421800  T
Q  154 tcctct 159  Q
    ||||||    
T  6421799 tcctct 6421794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16542577 - 16542439
Alignment:
Q  94 catacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactctttta 193  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||||||| |||||| |||||    
T  16542577 catacaagtgagagagatgctacactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttata--aggtgttcaacctttactatttta 16542480  T
Q  194 tccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16542479 tccgatgtgggacttataactcacacttgcacacaacaaca 16542439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Original strand, 28254276 - 28254405
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtg 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  28254276 gagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact--tataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtg 28254373  T
Q  203 agacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
     ||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  28254374 ggacatataagtcacactggcacacaacaaca 28254405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178421
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttact--tataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataact 36178417  T
Q  215 caca 218  Q
    ||||    
T  36178418 caca 36178421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23346419 - 23346250
Alignment:
Q  39 attgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaaga 138  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||     
T  23346419 attgttgggtcatgaggggagctcgggcgaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaagg 23346320  T
Q  139 caatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatata 211  Q
    | ||||||||||| | |||||   |  ||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  23346319 ctatgggtttatgggccctct---tattataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 28531314 - 28531479
Alignment:
Q  64 gaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcact 163  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||   | ||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||| |||    
T  28531314 gaggaccatccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttact 28531413  T
Q  164 tatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||  ||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28531414 tata--aggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 28531479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29676685 - 29676543
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||      ||| ||||| ||||||| || ||||||||      
T  29676685 ggaccgtccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaa------aaggcaatgagtttatgggttctctcact-- 29676594  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactca 216  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29676593 tataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29677064 - 29676893
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctca-ctt 164  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||   |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||     
T  29677064 ggaccatccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctctc 29676965  T
Q  165 a--tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  29676964 acctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaaca 29676893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7598754 - 7598606
Alignment:
Q  69 ccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatat 168  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||        | ||||| ||||||| |||  |||    
T  7598754 ccgtccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaa--------ggttatgggtcctcttact--tat 7598665  T
Q  169 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacac 227  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  7598664 aaggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacac 7598606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 213
Target Start/End: Original strand, 40163361 - 40163520
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaacctt-aagacaatgggtttatg 151  Q
    |||||||||| |  |||| || ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||| |||    
T  40163361 gggggagctcaggagaccatctacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatg 40163460  T
Q  152 agtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataac 213  Q
     ||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  40163461 ggtcatcttact--tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 31468801 - 31468914
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||      |||||| | |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31468801 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctct------tataagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 31468894  T
Q  215 cacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  31468895 cacacttgcacacaacaaca 31468914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 231
Target Start/End: Original strand, 37632602 - 37632762
Alignment:
Q  69 ccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatat 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||  |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||| |||||||     
T  37632602 ccgtccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataa 37632701  T
Q  169 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||  |||  ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37632702 aa--tgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaaca 37632762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7598384 - 7598225
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| |  |     
T  7598384 ggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctta--tt 7598287  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacac 227  Q
    ||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||||   |||||||| ||||| ||| ||||    
T  7598286 tataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttgcacac 7598225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Original strand, 14745300 - 14745446
Alignment:
Q  71 gtccacatcgaggcttgaacaaccat-acaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||   | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||  || |    
T  14745300 gtccacatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatact--taca 14745397  T
Q  170 aggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    || ||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14745398 agatgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcaca 14745446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30313309 - 30313170
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactct 189  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||   | ||||||||| |  ||| |    
T  30313309 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttat---aagtgttcaacctccacttt 30313213  T
Q  190 tttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  30313212 tctatccgatgtgagacatataacacacgcttgcacacaacaa 30313170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Original strand, 38796318 - 38796386
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38796318 tataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 38796386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6421780 - 6421689
Alignment:
Q  68 accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctct 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  6421780 accgtccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctct 6421689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367448
Alignment:
Q  78 tcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttc 177  Q
    |||||||| |||||||   |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||  || ||| |||  ||||||||||||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttact--tataaggtgttc 5367502  T
Q  178 aacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  5367501 aacctttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttgtacacaaca 5367448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 231
Target Start/End: Original strand, 33561481 - 33561616
Alignment:
Q  94 catacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactctttta 193  Q
    |||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||| |  ||| || ||    
T  33561481 cataaaagtgagagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcact--tataaagtgtttaacctccacttttcta 33561578  T
Q  194 tccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    || ||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33561579 tctgatgtggaacatataactcacacttgcacacaaca 33561616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 167
Target Start/End: Original strand, 36784273 - 36784363
Alignment:
Q  77 atcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  36784273 atcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttata 36784363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899594
Alignment:
Q  134 taagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaac 233  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttata--aggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactttcacacaacaac 31899593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 235
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259788
Alignment:
Q  106 agagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatcc---gatgtg 202  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||| ||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttata--aggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtg 31259755  T
Q  203 agacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  31259756 agacatataactcgcacttacacacaacaacaa 31259788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785731
Alignment:
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 36785731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3672855 - 3672773
Alignment:
Q  68 accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 150  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3672855 accgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 232
Target Start/End: Original strand, 29873513 - 29873703
Alignment:
Q  40 ttgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagac 139  Q
    ||||||| ||| | |||||||  ||||||||| | ||||| || |  || |||||| ||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||| |    
T  29873513 ttgttgggttacgaggggagccaggaggaccgcctacatccagaccagagcaaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggc 29873612  T
Q  140 aatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |  ||| || |||| |||||| ||||| |||| |||  ||| |||||||||    
T  29873613 aatgagtttatgagtcctcccacttataaaa--tgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacacacccttgcacacaacaa 29873703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Original strand, 33953822 - 33953936
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |  ||| || |||| |||||| ||| |||||||    
T  33953822 acactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatata--gtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataact 33953919  T
Q  215 cacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||||| ||||||||    
T  33953920 cacatttgcacacaaca 33953936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 12529038 - 12529195
Alignment:
Q  74 cacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggt 173  Q
    ||||| |||| | ||||||||  |||| | |||||||||||||  ||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  12529038 cacattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact--tatacggt 12529135  T
Q  174 gttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaac 233  Q
    ||||||  |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  12529136 gttcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgcatacaacaac 12529195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895211
Alignment:
Q  110 acactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacata 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || | |||  | |||||| |||||| |||| | || ||||||||||| ||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttact--tttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacata 37895204  T
Q  210 taactca 216  Q
    |||||||    
T  37895205 taactca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3673237 - 3673123
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||||||||  ||||||||| |||||| |||||  ||||| |||||||     
T  3673237 gggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatgg 3673138  T
Q  153 gtcctctcacttata 167  Q
     |||||| |||||||    
T  3673137 atcctcttacttata 3673123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421294
Alignment:
Q  176 tcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaaca 6421294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12910339 - 12910236
Alignment:
Q  111 cactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||  ||||||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||  ||||||    
T  12910339 cactacactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcact--tataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatat 12910242  T
Q  211 aactca 216  Q
    ||||||    
T  12910241 aactca 12910236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 228
Target Start/End: Original strand, 29874074 - 29874185
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||||||||| |  ||| || |||| |||||| ||||||||||     
T  29874074 acactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaat--tataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatataaca 29874171  T
Q  215 cacatttgtacaca 228  Q
    |||| |||||||||    
T  29874172 cacacttgtacaca 29874185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16591051 - 16590881
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||  ||||||||| || | ||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  16591051 ggggagctcgggagactgtccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttatggg 16590952  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttac-tcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||| ||||        |||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16590951 tcctcttactt--------tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 16590881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 208
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  117 actcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacat 208  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttact--tataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 229
Target Start/End: Original strand, 37894731 - 37894855
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtg 202  Q
    |||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||  |||| || | | |||||| || ||| | |||||    
T  37894731 gagagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttata--aggtttttagcctttacttttctattcaatgtg 37894828  T
Q  203 agacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||    
T  37894829 ggacatataactcacatttgcacacaa 37894855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 41678396 - 41678534
Alignment:
Q  92 accatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttt 191  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||| |   || ||     
T  41678396 accatacaagtgagagagacgttacactcttactcaaaaccttaaggcaaagg-tttatgggtcctctcacttataaa--gtgtttaacctccccttttc 41678492  T
Q  192 tatccgatgtgagacatat--aactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||    
T  41678493 tatctgatgtgagacatatataactcacacttgcacacaaca 41678534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28226773 - 28226708
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  28226773 gagagagacaccacactcttaccaaaaacct-aagacaatgggtttatgagtctcctctcttatata 28226708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323456
Alignment:
Q  105 gagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgag 204  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||  | ||| ||||||||| |  | | || |||| ||| || |    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcact--tctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttggg 30323484  T
Q  205 acatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  30323483 acatataacacacacttgcacacaacaa 30323456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31385868 - 31385792
Alignment:
Q  91 aaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31385868 aaccacacaagtgaaagagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttata 31385792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28226456 - 28226390
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||    
T  28226456 gagagagacaccacactcttacctaaaaccctaagacaatgtgtttatgggtctcctctcttatata 28226390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 164
Target Start/End: Original strand, 35580428 - 35580540
Alignment:
Q  54 ggggagctcggagga-ccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactaca--ctcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 150  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| || |  || ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  35580428 ggggagctcgggggaaccgtccacatcgaggctaaaacaatcaca-tagggagagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 35580526  T
Q  151 gagtcctctcactt 164  Q
    | |||||| |||||    
T  35580527 gggtcctcacactt 35580540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 132
Target Start/End: Original strand, 31899079 - 31899170
Alignment:
Q  40 ttgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaacc 132  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||||| | ||| ||||  |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  31899079 ttgttggatcatgaggggagcttgg-ggaccgttcacatcgaggttagaagaaccccacaagcaagagagatacctcactcttacccaaaacc 31899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3673120 - 3673075
Alignment:
Q  189 ttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3673120 ttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 3673075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 88)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25483491 - 25483325
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat 166  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||  |    
T  25483491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttact--t 25483394  T
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25483393 ataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaacaa 25483325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36572175 - 36572009
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||      
T  36572175 ggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttact-- 36572078  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36572077 tataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 36572009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Original strand, 36608649 - 36608827
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  36608649 ggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgga 36608748  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36608749 tcctcttact--tatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgcacacaacaaca 36608827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 236
Target Start/End: Original strand, 39792848 - 39793028
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |      
T  39792848 ggggagctcagaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggt 39792947  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaac 236  Q
    ||||||  ||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39792948 tcctctttct--tataaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacagcaac 39793028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Original strand, 34646649 - 34646816
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||    
T  34646649 ggaccgtccacaacaaggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagtta 34646748  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34646749 ta--aggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacaa 34646816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36629393 - 36629230
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||      
T  36629393 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact-- 36629296  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36629295 tataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgaacacaaca 36629230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39404200 - 39404013
Alignment:
Q  41 tgttggatta-tggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagac 139  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  39404200 tgttggattagtgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgc 39404101  T
Q  140 aatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
     ||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39404100 tatgagtttatgagtcctcttact--tataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttgtacacaa 39404013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41370518 - 41370363
Alignment:
Q  61 tcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctc 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||     
T  41370518 tcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 41370419  T
Q  161 acttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  41370418 act--tataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcaca 41370363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 50002587 - 50002416
Alignment:
Q  61 tcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctc 160  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  50002587 tcgggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctctt 50002488  T
Q  161 acttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  50002487 act--taaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaacaacaaca 50002416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10246087 - 10245910
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |    
T  10246087 ggggagcttgggggagcgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttatg-g 10245989  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10245988 tcctcttact--tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgcacacaacaaca 10245910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 22183264 - 22183430
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||      
T  22183264 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttact-- 22183361  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22183362 tataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgcacacaacaaca 22183430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39404577 - 39404388
Alignment:
Q  42 gttggatta-tggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagaca 140  Q
    ||||||||| || |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |     
T  39404577 gttggattagtgaggggagctcgg--gaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggct 39404480  T
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    || |||||||| ||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39404479 ataggtttatgggtcctcttact--tataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 39404388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Original strand, 1731647 - 1731814
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |  |     
T  1731647 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctta--tt 1731744  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1731745 tataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgcacacaacaacaa 1731814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50459877 - 50459710
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||      
T  50459877 ggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttact-- 50459780  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  50459779 tataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacacttatgcactacaacaa 50459710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 50630743 - 50630904
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  50630743 ggggagctaggcggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 50630842  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 217  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  50630843 tcctcttact--tataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcac 50630904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 55933113 - 55933274
Alignment:
Q  55 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagt 154  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  55933113 gggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggt 55933212  T
Q  155 cctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  55933213 cctcttact--tataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcaca 55933274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Original strand, 3244458 - 3244614
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||     
T  3244458 ccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttact--tataaga 3244555  T
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3244556 tgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 3244614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3340976 - 3340802
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  3340976 gggggagctcaggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgg 3340877  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3340876 gtcctcttact--tataaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttgcacacaa 3340802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 236
Target Start/End: Original strand, 4955355 - 4955485
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||    
T  4955355 agagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact--tataaggtgttcaaccttaactattttatccgatatga 4955452  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaacaacaac 236  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4955453 gacatataactcacacttgcacacaacaacaac 4955485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 54936364 - 54936190
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  54936364 gggggagctcgggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54936266  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||| |||  || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |    |||||||||| |||||||||||||||    
T  54936265 gtcctcttact--tacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggg----ataactcacacttgtacacaacaaca 54936190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 227
Target Start/End: Original strand, 54017582 - 54017754
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  54017582 gggggagctagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017681  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacac 227  Q
    ||||||| |||  |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  54017682 gtcctcttact--tataagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgcacac 54017754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 232
Target Start/End: Original strand, 41707502 - 41707628
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtg 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41707502 gagagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatat--ggtgttcaacctttactcttttatccgatgtg 41707598  T
Q  203 agacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41707599 ggacatataactcacacttgtacacaacaa 41707628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44621158 - 44621011
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||      
T  44621158 ggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttact-- 44621061  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactc 215  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  44621060 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 22027961 - 22028127
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| |||      
T  22027961 ggactgtccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatgggtcctcttact-- 22028058  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  22028059 tataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgcacacaacaaca 22028127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 45489332 - 45489497
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| || || ||| | |||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| | |||||| |||| |||| |||||    
T  45489332 ggaccatccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaa-acagtaggtttaagagttctcttactta 45489430  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  45489431 tat--ggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttgtacacaacaaca 45489497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2740866 - 2740693
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||  |    
T  2740866 ggggagctcgggggaccatccatatcgaggctagaacaacca--caagtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttatagg 2740769  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2740768 tcctcttacttata--aggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 2740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 235
Target Start/End: Original strand, 16889524 - 16889704
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||| || |||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||     
T  16889524 ggggagctcgagggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaa 16889623  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttg-tacacaacaacaa 235  Q
    |||||| |||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  16889624 tcctcttact--tataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttgccacacaacaacaa 16889704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884688
Alignment:
Q  74 cacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactctta-cccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    |||||||||||| || |||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || ||| |||  |||||||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttact--tataagg 52884747  T
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  52884746 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 52884688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Original strand, 54343000 - 54343147
Alignment:
Q  58 agctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcct 157  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||    
T  54343000 agctcgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggg-------gtcct 54343092  T
Q  158 ctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    || |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54343093 cttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20825992 - 20825829
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||  | |||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| || |||| | |||    
T  20825992 ggactgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctcttattta 20825893  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20825892 ta--aggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacatttgtacacaaca 20825829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Original strand, 32941128 - 32941286
Alignment:
Q  71 gtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataa 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |  | |||||    
T  32941128 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctctta--tttataa 32941225  T
Q  171 ggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||||||| |||||| || | |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  32941226 ggtgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgcagacaaca 32941286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 52885007 - 52884877
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttaccc-aaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgt 201  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  52885007 gagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttata--aggtgttcaacctttactattttatccgatgt 52884910  T
Q  202 gagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  52884909 gggacatataactcacacttgcacacaacaaca 52884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 22028369 - 22028537
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||      
T  22028369 ggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttact-- 22028466  T
Q  166 tataaggtgttcaacattta--ctcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
     |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||  ||||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  22028467 aataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttgcacacaacaaca 22028537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44620838 - 44620654
Alignment:
Q  43 ttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaat 142  Q
    |||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||| |  |||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||    
T  44620838 ttggatcatgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttat 44620739  T
Q  143 gggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaac 230  Q
     |||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  44620738 -ggtttatgggtcctcttact--tataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaac 44620654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49303058 - 49302910
Alignment:
Q  70 cgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||||||||||||| | |||||| |  | |||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  49303058 cgtccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttttata 49302959  T
Q  170 aggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    || |||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  49302958 agatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcaca 49302910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108928
Alignment:
Q  74 cacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggt 173  Q
    |||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact--tataaggt 54108964  T
Q  174 gttcaacatttactcttttatccgatgtgagacata 209  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  54108963 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 51768061 - 51768225
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat 166  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |  | |||  |||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  51768061 gaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttat 51768160  T
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaac 233  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51768161 a--aggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttgcacacaacaac 51768225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44620509 - 44620362
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||   |     
T  44620509 ggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg--ctctcttatt 44620412  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactc 215  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  44620411 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3700512 - 3700357
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||        |||||| | ||||||    
T  3700512 gaccgtccacatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatg--------agtccttttacttat 3700421  T
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3700420 a--aggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaa 3700357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Original strand, 23817681 - 23817782
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  23817681 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttactta 23817780  T
Q  166 ta 167  Q
    ||    
T  23817781 ta 23817782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 231
Target Start/End: Original strand, 54741215 - 54741341
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtg 202  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  54741215 gagagagagactacactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttata--aggtgttcaacctttacttttctatccgatgtg 54741312  T
Q  203 agacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  54741313 agacatataattcacacttgcacacaaca 54741341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975610
Alignment:
Q  99 aagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccga 198  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||| | |||||| |||||| ||||||| ||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttact--tataagatattcaacctttactattttatcgga 6975586  T
Q  199 tgtgagacatataactcacatttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6975587 tgtgagacatataactcacatttg 6975610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 201
Target Start/End: Original strand, 18932741 - 18932882
Alignment:
Q  58 agctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcct 157  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18932741 agctcgggggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcct 18932840  T
Q  158 ctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgt 201  Q
    || |  | |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  18932841 ctta--tttataaggtattcaacctttactattttatccgatgt 18932882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43174661 - 43174496
Alignment:
Q  68 accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||| || |||||   || |||||||| ||||||| |||  ||    
T  43174661 accgtccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttact--ta 43174564  T
Q  168 taaggtgttcaacatttactc-ttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43174563 taaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacacttgtacacaacaaca 43174496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20826377 - 20826210
Alignment:
Q  62 cggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctca 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |  | |||  |||||||||  ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||| || |||| |    
T  20826377 cggagggccgtccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctctta 20826278  T
Q  162 cttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20826277 cttata--acgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacatttctacataaca 20826210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Original strand, 49076439 - 49076614
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |  | |||||||| ||||||  | | |||||||||| | ||||||||||||||||||  |    
T  49076439 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctataacaatcgcataagcgagacagacac--cgcccttacccaaa-ctttaagacaatgggtttatagg 49076535  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  49076536 tcctcttacttata--aggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgcacacaacaaca 49076614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 235
Target Start/End: Original strand, 49076820 - 49076997
Alignment:
Q  55 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagt 154  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  49076820 gggagctcaggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggttatgggtttatgggt 49076919  T
Q  155 cctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
     |||| ||   ||||||||||||||| |||||| ||||| || || ||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  49076920 tctcttac---tataaggtgttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttgcacacaacgacaa 49076997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 45496930 - 45496820
Alignment:
Q  97 acaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatcc 196  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  45496930 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttacgattttatcc 45496833  T
Q  197 gatgtgagacata 209  Q
    |||||| ||||||    
T  45496832 gatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 240
Target Start/End: Original strand, 54017751 - 54017876
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgt--gagacatataa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || | ||||||    
T  54017751 acactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatatataa 54017848  T
Q  213 ctcacatttgtacacaacaacaacgatg 240  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  54017849 ctcacatttgcacacaacaacaaagatg 54017876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49880278 - 49880166
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||     
T  49880278 agagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtgg 49880181  T
Q  204 gacatataactcaca 218  Q
    |||||||||||||||    
T  49880180 gacatataactcaca 49880166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 236
Target Start/End: Original strand, 4390102 - 4390269
Alignment:
Q  67 gaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttat 166  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||   |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||| | | | |  |||||| |||  |    
T  4390102 gaccgtccgcatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttact--t 4390199  T
Q  167 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaac 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4390200 ataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgcacacaacaacaac 4390269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 234
Target Start/End: Original strand, 16888789 - 16888983
Alignment:
Q  39 attgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaaga 138  Q
    |||||||||| |  |||||||||  | |||||||| |||||||  || |||||| |  |||| | |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  16888789 attgttggatcagcgggggagcttaggggaccgtctacatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaaga 16888888  T
Q  139 caatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttg-tacacaacaaca 234  Q
    ||||| ||||||  || |||| |||  |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  16888889 caatgagtttataggttctcttact--tataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgccacacaacaaca 16888983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31691323 - 31691207
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagaga--gacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 150  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31691323 gggggagctcgaaggatcgtccacatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 31691224  T
Q  151 gagtcctctcacttata 167  Q
    | ||||||| |||||||    
T  31691223 gggtcctcttacttata 31691207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 43174310 - 43174233
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43174310 gggggagctcgggggaccgtccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3271959 - 3271802
Alignment:
Q  53 gggggagctcggagg-accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaag---cgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggttt 148  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||| | ||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3271959 gggggagctcggggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacac-acactcttacccaaaaccttaaggcaataggttt 3271861  T
Q  149 atgagtcctctcacttat-ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagac 206  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  3271860 atgggttctcttacttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgtgagac 3271802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3341235 - 3341118
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||||| ||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3341235 acactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttacttataaa--gtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataact 3341138  T
Q  215 cacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  3341137 cacacttgcacacaacaaca 3341118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18879975 - 18879861
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | | ||||||   |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||      
T  18879975 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatag 18879876  T
Q  153 gtcctctcacttata 167  Q
    ||| ||| |||||||    
T  18879875 gtcatcttacttata 18879861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Original strand, 34004575 - 34004744
Alignment:
Q  56 ggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtc 155  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||||  |||| ||||||| |||    
T  34004575 ggagctcgggagaccgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaag-gaatgagtttatgggtc 34004673  T
Q  156 ctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
    |||| |||  |||||| |||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34004674 ctcttact--tataagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgcacacaa 34004744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2741178 - 2741064
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||  |||||||| |||||| |||||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  2741178 acactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttact--tataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  215 cacatttgtacacaaca 231  Q
    |||| ||| ||| ||||    
T  2741080 cacacttgcacataaca 2741064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504694
Alignment:
Q  76 catcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgt 175  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||            ||||    
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt-----------gtgt 19504754  T
Q  176 tcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19504753 tcaacttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttgtacacaacaacaa 19504694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 165
Target Start/End: Original strand, 15841383 - 15841467
Alignment:
Q  81 aggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||| || |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15841383 aggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcactta 15841467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44620354 - 44620286
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44620354 tataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactcatatttgtacacaacaaca 44620286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 54108686 - 54108551
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatg-ggtttatgagtcctctcacttatataag 171  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||| ||||| | |||  ||||||    
T  54108686 ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttact--tataag 54108589  T
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacata 209  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| || || ||||||    
T  54108588 gtgttcaacctttactattttatcctatatgggacata 54108551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 230
Target Start/End: Original strand, 15841013 - 15841146
Alignment:
Q  94 catacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactctttta 193  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||   |||||||||||||| ||  |||||| | |  ||| || ||    
T  15841013 catacaagtgagagagacaatacactcttacccaaaa-cttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaa--tgttcagcctccacttttcta 15841109  T
Q  194 tccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaac 230  Q
    || ||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15841110 tctgatatgggacatataattcacatttgtacacaac 15841146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Original strand, 45489721 - 45489870
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaat-gggtttatgagtcctctcacttatataag 171  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |  |||||| |  || ||| ||||||||  |    
T  45489721 ccacatcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaa-actttaaggtttaaggatcatcttacttatat--g 45489817  T
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgta 224  Q
     | |||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  45489818 atattcaatctttactcttttatccaatgtgatacatataactcacaattgta 45489870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10246428 - 10246340
Alignment:
Q  141 atgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  10246428 atgggtttatgggtcctctaacttata--agatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgcacacaaca 10246340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 48111693 - 48111828
Alignment:
Q  61 tcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctc 160  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||| |   | ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| |     
T  48111693 tcgggggaccgtccacattgaggttagaaaaaccacatttgtgagagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtcctttt 48111792  T
Q  161 acttatataaggtgttcaacatttactcttttatccga 198  Q
    |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  48111793 act--tataatgtgttcaacctttactcttttatccga 48111828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43827603 - 43827503
Alignment:
Q  58 agctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcct 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||  |||||| |||||    
T  43827603 agctcgggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcct 43827505  T
Q  158 ct 159  Q
    ||    
T  43827504 ct 43827503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11197345 - 11197279
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  11197345 gagagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtctcctctcttatata 11197279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34544239 - 34544161
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaa-ccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    ||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  34544239 caaccgtacaagtgagagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttata 34544161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28034348 - 28034222
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtg 202  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||| || ||||||||  ||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||| |    
T  28034348 gagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcact--tataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcg 28034251  T
Q  203 agacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
     ||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  28034250 ggacatataattcacacttgcacacaaca 28034222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40067179 - 40067041
Alignment:
Q  87 gaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacattt-a 185  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||  | ||| | |||| ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| |    
T  40067179 gaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttata--atgtgttcaacttttta 40067082  T
Q  186 ctcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtaca 226  Q
    | ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  40067081 cacttttatccgatgtagaacatataactcacacttgtaca 40067041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45050649 - 45050593
Alignment:
Q  176 tcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  45050649 tcaacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaa 45050593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 136
Target Start/End: Original strand, 39698919 - 39699014
Alignment:
Q  41 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaa 136  Q
    |||||||| ||| || ||||||  ||||| |||||||||||| || ||| ||||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  39698919 tgttggatgatgaggagagctcataggactgtccacatcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaa 39699014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 51681650 - 51681591
Alignment:
Q  110 acactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  51681650 acaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtatatgagtcccctctcttatata 51681591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10396250 - 10396184
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  10396250 gagagagacaccaccctcttacctaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtcttctctcttatata 10396184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 133
Target Start/End: Original strand, 11348261 - 11348330
Alignment:
Q  63 ggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaacct 133  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11348261 ggaggacctttcacatcgagacttgaacaaccacataagtgagagagacac-acactcttaccaaaaacct 11348330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 760320 - 760244
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  760320 caaccacacaaatgagagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttata 760244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 162
Target Start/End: Original strand, 11783560 - 11783649
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcac 162  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||| ||||||||||    
T  11783560 ccacatctaggctagagcaactatacaagcgagagaaacgacacactcttacccaaaactttatggcaataggtgtatgggtcctctcac 11783649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44621003 - 44620934
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatg-tgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  44621003 tataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttgtccacaacaaca 44620934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20695965 - 20695925
Alignment:
Q  55 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaacca 95  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20695965 gggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaacca 20695925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44621484 - 44621420
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaac 230  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  44621484 tataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgcacacaac 44621420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 922536 - 922489
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 151  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  922536 agagagacaccacactcttatccaaacccctaagacaatgggtttatg 922489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868104
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggttccctctcttatata 1868104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10396535 - 10396469
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  10396535 gagagagagaccacactcttatccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtctcctctcttatata 10396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 214
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788129
Alignment:
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 50788129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 45484817 - 45484772
Alignment:
Q  124 cccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||    
T  45484817 cccaaaaccttaaggcattgggtttatgggttctctcacttatata 45484772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 11706636 - 11706688
Alignment:
Q  183 ttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  11706636 ttacttttttatccgatgtgggacatacaactcacccttgcacacaacaacaa 11706688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Original strand, 503 - 683
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  503 ggggaagctcgggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 602  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  603 gtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttgtgcacaacaacaa 683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 218
Target Start/End: Original strand, 141 - 294
Alignment:
Q  58 agctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcct 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||   |||| |||||| |||||    
T  141 agctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atgg-tttatg-gtcct 235  T
Q  158 ctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    || |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  236 cttacttata--aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Original strand, 1095 - 1274
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1095 gggggagcttggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatga 1194  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||| |  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1195 gtcctttttct--tataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 1274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Original strand, 1730 - 1794
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1730 gagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttata 1794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 234
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3153
Alignment:
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaaca 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 40296317 - 40296483
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||      
T  40296317 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttact-- 40296414  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  40296415 tataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaccaaca 40296483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 234
Target Start/End: Original strand, 42405585 - 42405764
Alignment:
Q  51 tggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 150  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  42405585 tggggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga--caccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttat 42405682  T
Q  151 gagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||| | |||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42405683 gagtccttttacttgta--aggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttgtacacaacaaca 42405764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15370268 - 15370088
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||     
T  15370268 gggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgg 15370169  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||| |||  |||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15370168 gtcctcttact--tataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacaa 15370088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Original strand, 36492219 - 36492386
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||| |||      
T  36492219 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttact-- 36492316  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  36492317 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacaacaacaa 36492386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25328103 - 25327925
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  25328103 ggggagctcgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatggg 25328004  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  25328003 tcctcttact--tataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacacttagacacaacaaca 25327925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Original strand, 18603096 - 18603272
Alignment:
Q  40 ttgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagac 139  Q
    ||||||| ||| | |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |    
T  18603096 ttgttgggttacgaggggagccaggagaaccgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggc 18603195  T
Q  140 aatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18603196 aatgggtttatgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcaca 18603272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Original strand, 34753029 - 34753193
Alignment:
Q  68 accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| |||  ||    
T  34753029 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttact--ta 34753126  T
Q  168 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34753127 taaggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataacttacatttgtacacaacaaca 34753193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26074761 - 26074602
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    ||||||||||| | || |||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||    
T  26074761 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact--tataagg 26074664  T
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26074663 tgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgtacacaaaaaca 26074602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 235
Target Start/End: Original strand, 26075168 - 26075331
Alignment:
Q  71 gtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactctt-acccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||  || ||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||      
T  26075168 gtccacatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata-- 26075265  T
Q  170 aggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26075266 aggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgtacacaacaacaa 26075331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6500606 - 6500457
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||      
T  6500606 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaaggtcctcttact-- 6500509  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6500508 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactcaca 6500457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Original strand, 36568559 - 36568732
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |    
T  36568559 ggggagctcgggggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacggg 36568656  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    || |||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36568657 tcatctcacttata--aggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 36568732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32487565 - 32487400
Alignment:
Q  50 atggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggttta 149  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32487565 atgggggaagcttgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 32487466  T
Q  150 tgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    || ||||||| ||||||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32487465 tgggtcctcttacttat---aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 32487400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41170790 - 41170640
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||      
T  41170790 ggaccgtctacaccgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact-- 41170693  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41170692 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 41170640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Original strand, 26074155 - 26074311
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataagg 172  Q
    ||||||||||| | || |||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||  |||| |||    
T  26074155 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttac--atatgagg 26074252  T
Q  173 tgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26074253 tgttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacacaaca 26074311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Original strand, 27502012 - 27502188
Alignment:
Q  40 ttgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagac 139  Q
    ||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |    
T  27502012 ttgttgggtcatgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggc 27502111  T
Q  140 aatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27502112 aataggtttatgggtcctcttact--tataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcaca 27502188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 624365 - 624202
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||     
T  624365 gggggagctcggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgg 624266  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||| ||| |||  ||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  624265 gtcatcttact--tataacgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcaca 624202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Original strand, 1028507 - 1028682
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||   || |||||||| |    
T  1028507 ggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatggg 1028606  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1028607 tcctcttact--tataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 1028682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41632938 - 41632775
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||||||||| ||||||| |||      
T  41632938 ggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttact-- 41632841  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  41632840 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgcacacaaca 41632775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35150162 - 35150002
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||      
T  35150162 ggacggtccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggt-ctcttact-- 35150066  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaa 229  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35150065 tataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 35150002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 228
Target Start/End: Original strand, 3294993 - 3295176
Alignment:
Q  42 gttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaa 141  Q
    ||||||| ||| |||||||  || |||| |||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||    
T  3294993 gttggatcatgaggggagcgagggggactgtccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaa 3295092  T
Q  142 tgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacaca 228  Q
    |||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  3295093 tgggtttatgggtcttcttact--tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttgcacaca 3295176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 232
Target Start/End: Original strand, 3295347 - 3295509
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||      
T  3295347 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactctta-ccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttact-- 3295443  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||  |||||||||    
T  3295444 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacacttccacacaacaa 3295509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 299658 - 299479
Alignment:
Q  54 ggggagctc-ggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatga 152  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||     
T  299658 ggggagctccgggggactgtccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgg 299559  T
Q  153 gtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  299558 gtcatcttacttata--aggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcgcacaacaaca 299479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Original strand, 12662654 - 12662821
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||    
T  12662654 ggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttactta 12662753  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    || ||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12662754 taaaa--tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacaa 12662821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Original strand, 13415774 - 13415925
Alignment:
Q  78 tcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttc 177  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  13415774 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttact--tataaggtgttc 13415871  T
Q  178 aacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13415872 aacctttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 13415925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6224352 - 6224186
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||| || |||||| || |||||  |||||| |  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  6224352 ggaccgtccatattgaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttactta 6224253  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6224252 ta--aggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 6224186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Original strand, 9498645 - 9498810
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||| || || | | | || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  9498645 ggggagctagggggaccgtccacattgaggctagaccagc-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggg 9498743  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttg 222  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9498744 tcctcttact--tataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagacatataactcacatttg 9498810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Original strand, 26074821 - 26074950
Alignment:
Q  104 agagagacactacactctt-acccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtg 202  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26074821 agagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatatt--gtgttcaacctttactcttttatccgatgtg 26074918  T
Q  203 agacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26074919 ggacatataactcacacttgtacacaacaaca 26074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6500978 - 6500829
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |  |     
T  6500978 ggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctttta--tt 6500881  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6500880 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactcaca 6500829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15370570 - 15370428
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |    
T  15370570 ggggagcatggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttatggg 15370471  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccga 198  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15370470 tcctcttact--tataaggtgttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Original strand, 11416979 - 11417143
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| |  |||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||      
T  11416979 ggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttact-- 11417076  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  11417077 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac--ttgcacacaacaaca 11417143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Original strand, 41635217 - 41635360
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactct 189  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||  |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  41635217 caaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttata--aggtgttcaacatttactct 41635314  T
Q  190 tttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  41635315 tttatctgatgggaaacatataactcatacttatacacaacaacaa 41635360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38427715 - 38427554
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |    
T  38427715 ggggagctcggaagatcatccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatggg 38427616  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||| |||  |||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  38427615 tcctct-act--tataagatgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcaca 38427554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 623984 - 623824
Alignment:
Q  56 ggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtc 155  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||  ||    
T  623984 ggagctcgggggaccgtctacattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctc 623885  T
Q  156 ctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
      || |||  | ||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  623884 aacttact--tgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagacatataactcaca 623824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Original strand, 35167840 - 35168007
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||| || || | ||||||||  ||||||||||| ||||| | ||| |||| | |||||| ||| ||  |||||    
T  35167840 ggacagtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctactta 35167939  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||    
T  35167940 ta--aggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttgtacacaacaacaa 35168007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 218
Target Start/End: Original strand, 36522270 - 36522389
Alignment:
Q  97 acaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatcc 196  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||| |  | | || |||||    
T  36522270 acaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaa--tgttcaacttccatttttctatcc 36522367  T
Q  197 gatgtgagacatataactcaca 218  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  36522368 aatgtgagacatataactcaca 36522389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 301119 - 300948
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||          
T  301119 ggggagttcggaggaccgttcacgtcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggcaatggatt------ 301026  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
      |||| |||  |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  301025 --ctcttact--tataaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttgtacacaaaaacaa 300948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31509744 - 31509615
Alignment:
Q  102 cgagagagacactacactcttacccaaaa-ccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| |  ||| || |||||||||    
T  31509744 cgagagagacactacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaa--gtgctcaacctccacttttctatccgatg 31509647  T
Q  201 tgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31509646 tgagacatataactcacacttgcacacaacaa 31509615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35915005 - 35914839
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||| |||| |||| ||||||| || ||| ||||| |||| |  ||| | |||||| |||| | ||| ||| |||||    
T  35915005 ggaccgtccacattgaggtttgaccaatcatataagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggcaatggatttacgggtcttcttactta 35914906  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  35914905 taaaa--tgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactcatacttatacacaacaaca 35914839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 218
Target Start/End: Original strand, 5723814 - 5723943
Alignment:
Q  87 gaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttac 186  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   || ||| || |||| ||  |||||| ||||||||| ||||     
T  5723814 gaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttac--atataatgtgttcaacttttat 5723911  T
Q  187 tcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5723912 tattttatccgatgtgggacatataactcaca 5723943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33747925 - 33747783
Alignment:
Q  68 accgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  | |||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||  |||||| |||  ||    
T  33747925 accgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttact--ta 33747828  T
Q  168 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataa 212  Q
    ||| || || ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33747827 taaagtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 136
Target Start/End: Original strand, 26900006 - 26900089
Alignment:
Q  53 gggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaa 136  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26900006 gggggagcttgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 218
Target Start/End: Original strand, 29549276 - 29549407
Alignment:
Q  85 ttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacattt 184  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||| | |||    
T  29549276 ttgaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatat--ggtgttcatccttt 29549373  T
Q  185 actcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  29549374 actattttatctgatatggaacatataactcaca 29549407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31509864 - 31509745
Alignment:
Q  90 caaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaa-ccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactc 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  |||     
T  31509864 caaccgtacaagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcact--tataaagtgctcaacctccactt 31509767  T
Q  189 ttttatccgatgtgagacatat 210  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  31509766 ttctatccgatgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508604
Alignment:
Q  127 aaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtaca 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||| |||||| || ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact--tattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttgtaca 42508610  T
Q  227 caacaa 232  Q
    ||||||    
T  42508609 caacaa 42508604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2411175 - 2411013
Alignment:
Q  54 ggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgag 153  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||  | ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |    
T  2411175 ggggagcttgggggaccgtccatatcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatggg 2411076  T
Q  154 tcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    | |||| |||  || ||| |||||||| ||||||  | ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  2411075 ttctcttact--tacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactcaca 2411013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39309742 - 39309677
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39309742 tataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttgtacacaaca 39309677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Original strand, 24489208 - 24489369
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||  |||||  | |||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||| |||      
T  24489208 ggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttact-- 24489303  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaaca 231  Q
     |||||||||| ||| ||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24489304 aataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgaacacaaca 24489369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Original strand, 36521947 - 36522061
Alignment:
Q  115 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataact 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| | |  ||||||||| |  ||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  36521947 acactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaaga--gtgttcaacctcaacttttctatctgatgtgggacatataact 36522044  T
Q  215 cacatttgtacacaaca 231  Q
    |||| |||  |||||||    
T  36522045 cacacttgcgcacaaca 36522061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 26590918 - 26591031
Alignment:
Q  72 tccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataag 171  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||  ||||||  |||||| |||  ||||||    
T  26590918 tccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttact--tataag 26591015  T
Q  172 gtgttcaacatttact 187  Q
    ||||||||| ||||||    
T  26591016 gtgttcaacctttact 26591031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39003676 - 39003543
Alignment:
Q  87 gaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttac 186  Q
    |||||| |||| ||| |||||| |||| ||| | | || ||||| ||||||||| | ||||  || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39003676 gaacaatcatataagtgagagaaacaccacattttaactcaaaatcttaagacattaggttattgggtcatctcacttatataa--tgttcaacatttac 39003579  T
Q  187 tcttttatccgatgtgagacatataactcacatttg 222  Q
      ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39003578 attttcatccgatgtcagacatattactcacatttg 39003543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13042658 - 13042592
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  13042658 gagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtctcctctcttatata 13042592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13112656 - 13112590
Alignment:
Q  103 gagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  13112656 gagaaagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtctcctctcttatata 13112590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Original strand, 26900089 - 26900139
Alignment:
Q  185 actcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26900089 actcttttatctgatgtgggacatataactcaaatttgtacacaacaacaa 26900139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35150795 - 35150737
Alignment:
Q  176 tcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35150795 tcaatatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 35150737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35151086 - 35151028
Alignment:
Q  176 tcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35151086 tcaatatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 35151028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524717
Alignment:
Q  127 aaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgta 224  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |  ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctctta--ttcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgta 42524717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 150
Target Start/End: Original strand, 13785634 - 13785718
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 150  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||   ||||||||||    
T  13785634 ggaccgtccacatcgaagttagaacaaccatacaaacgagagaaacaccacacttttacttaaaaccttaaggttatgggtttat 13785718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 38427386 - 38427306
Alignment:
Q  55 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaacctta 135  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  38427386 gggagctcgggggaccgccaacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Original strand, 13786003 - 13786166
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||| ||||  || ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| | ||| ||| |||      
T  13786003 ggaccgtcgacaacgaggccagaacaatcataatagtgagagagacatcacactcttatccaaaatcttaagacaatagatttacgggtcatcttact-- 13786100  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacat-ataactcacatttgtacacaaca 231  Q
    ||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||    
T  13786101 tataaagtgttcaaccatcact-ttttatccgatgtgaaacataattactcacacttgtgcacaaca 13786166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 32446010 - 32445943
Alignment:
Q  97 acaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactt 164  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||    
T  32446010 acaagtgagagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcactt 32445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 165
Target Start/End: Original strand, 36527118 - 36527196
Alignment:
Q  87 gaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  36527118 gaacagccacacaagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34103666 - 34103607
Alignment:
Q  110 acactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatata 169  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  34103666 acaccacactcttattcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagttctctctcttatata 34103607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 137
Target Start/End: Original strand, 795255 - 795305
Alignment:
Q  87 gaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaag 137  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  795255 gaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaag 795305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6225102 - 6225052
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactca 216  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  6225102 tataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactca 6225052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26074398 - 26074324
Alignment:
Q  142 tgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||  |||| | || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  26074398 tgggtttatgggtcctcttacttata--aggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcaca 26074324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7768908 - 7768856
Alignment:
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 218  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  7768908 tataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcaca 7768856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 232
Target Start/End: Original strand, 36527209 - 36527249
Alignment:
Q  192 tatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36527209 tatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 36527249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5385
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaacctt-aagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| | ||||| |||||||  ||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttata--ag 5449  T
Q  172 gtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5448 gtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaacaa 5385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5931 - 5767
Alignment:
Q  73 ccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaac-----cttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttata 167  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||  | |||||||| |||||||||| |||||      |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5931 ccacatcgaagtttgaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 5832  T
Q  168 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
      ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5831 --aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgcacacaacaaca 5767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5475 - 5349
Alignment:
Q  104 agagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||     
T  5475 agagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact--tataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5377 aacatataactcacacttgcacacaacaa 5349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5133 - 4970
Alignment:
Q  71 gtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataa 170  Q
    ||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| | | |||  |||||    
T  5133 gtccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttact--tataa 5036  T
Q  171 ggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaac 236  Q
    | | || ||| |||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  5035 gatattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgcacacaacaacaac 4970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47516 - 47349
Alignment:
Q  66 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacactacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 165  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||   ||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||  | |||| |||      
T  47516 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttact-- 47419  T
Q  166 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaacaa 235  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||    
T  47418 tataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgcacacatcaacaa 47349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17624
Alignment:
Q  106 agagacactacactcttacccaaaa--ccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 203  Q
    |||||||| | ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||     
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttaca--aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgt 17593  T
Q  204 gacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17594 gacatataactcacacttgcacacaacaaca 17624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 234
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10279
Alignment:
Q  145 gtttatgagtcctctcacttatataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 234  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttata--aggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttgtgcacaacaaca 10279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39870 - 39830
Alignment:
Q  192 tatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaa 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39870 tatccgatgtgggacatataactcacacttgaacacaacaa 39830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University