View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9985A_low_430 (Length: 225)

Name: NF9985A_low_430
Description: NF9985A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9985A_low_430
NF9985A_low_430
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (3-222)||(22133049-22133268)
chr1 (2-222)||(20527896-20528116)
chr1 (2-222)||(20828688-20828908)
chr1 (2-222)||(20927897-20928117)
chr1 (2-222)||(41215156-41215372)
chr1 (126-216)||(20172011-20172101)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (4-222)||(17201092-17201310)
chr3 (1-222)||(6150315-6150536)
chr3 (2-222)||(30149814-30150034)
chr3 (2-222)||(8271862-8272082)
chr3 (82-222)||(15948014-15948154)
chr3 (2-222)||(13964818-13965035)
chr3 (2-205)||(22150200-22150403)
chr3 (123-222)||(15612559-15612658)
chr3 (126-222)||(30140263-30140359)
chr3 (154-222)||(12796024-12796092)
chr3 (154-222)||(16258930-16258998)
chr3 (154-222)||(18915514-18915582)
chr3 (1-72)||(15944057-15944128)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (1-222)||(21194218-21194439)
chr8 (2-222)||(23903056-23903276)
chr8 (2-222)||(20650022-20650242)
chr8 (8-222)||(22437184-22437398)
chr8 (2-222)||(21848004-21848224)
chr8 (2-222)||(16414985-16415200)
chr8 (126-222)||(24931619-24931711)
chr8 (130-211)||(23154838-23154919)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (1-222)||(16100707-16100928)
chr6 (2-222)||(16379742-16379962)
chr6 (2-222)||(16647338-16647558)
chr6 (16-222)||(18401337-18401543)
chr6 (58-222)||(1646239-1646403)
chr6 (123-222)||(18578113-18578212)
chr6 (2-186)||(14133824-14133993)
chr6 (123-222)||(23025251-23025350)
chr6 (123-222)||(16235051-16235149)
chr6 (126-218)||(19985697-19985789)
chr6 (154-222)||(18836178-18836246)
[»] scaffold0021 (6 HSPs)
scaffold0021 (2-222)||(90359-90579)
scaffold0021 (2-222)||(8014-8234)
scaffold0021 (2-157)||(21103-21257)
scaffold0021 (2-157)||(30679-30833)
scaffold0021 (176-222)||(21255-21301)
scaffold0021 (176-222)||(30831-30877)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (2-222)||(6231-6452)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (2-222)||(25131068-25131288)
chr2 (2-220)||(22739418-22739636)
chr2 (2-222)||(22280564-22280784)
chr2 (4-222)||(24567434-24567652)
chr2 (126-218)||(25878531-25878623)
chr2 (154-222)||(12638818-12638886)
chr2 (154-222)||(12644485-12644553)
chr2 (154-222)||(24829105-24829172)
chr2 (155-222)||(34821609-34821675)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (2-225)||(4442741-4442964)
chr7 (2-222)||(13458852-13459070)
chr7 (2-222)||(7826717-7826937)
chr7 (2-222)||(27105007-27105227)
chr7 (2-222)||(27173098-27173318)
chr7 (123-222)||(11284627-11284726)
chr7 (157-222)||(17926436-17926501)
chr7 (23-96)||(14207264-14207337)
chr7 (23-96)||(14215954-14216027)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (2-222)||(34942-35162)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (2-222)||(25035-25255)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (2-222)||(23508426-23508646)
chr5 (2-222)||(24583952-24584172)
chr5 (51-222)||(21934643-21934814)
chr5 (154-222)||(23505316-23505383)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (2-224)||(14999472-14999694)
chr4 (2-222)||(15290382-15290602)
chr4 (1-220)||(12340090-12340309)
chr4 (123-222)||(9292994-9293093)
chr4 (123-222)||(15139015-15139113)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (2-222)||(4129-4349)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (2-222)||(848-1068)
scaffold0467 (2-64)||(13558-13620)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (2-222)||(26253-26473)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (2-222)||(23820-24040)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (2-222)||(5531-5751)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (2-222)||(73824-74044)
scaffold0011 (2-222)||(78205-78425)
scaffold0011 (2-220)||(175740-175958)
scaffold0011 (2-135)||(181934-182067)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (16-222)||(12866-13072)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (4-222)||(131718-131936)
scaffold0008 (51-222)||(26634-26804)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (2-222)||(1068-1288)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (2-222)||(1179-1399)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (2-222)||(2431-2648)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (2-222)||(5032-5253)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (2-222)||(7089-7308)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-222)||(15767-15988)
scaffold0162 (154-222)||(10553-10621)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (1-222)||(3356-3577)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (123-222)||(2335-2434)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (123-222)||(24913-25012)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (109-222)||(2579-2692)
scaffold0462 (3-73)||(2703-2773)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (88-180)||(2292-2384)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (126-222)||(3340-3436)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (126-222)||(93791-93887)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (131-222)||(364-455)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (123-222)||(17696-17794)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (131-222)||(53967-54058)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (123-222)||(46431-46529)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (154-222)||(929-997)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (148-222)||(8199-8273)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (154-222)||(3331-3399)
scaffold0409 (154-222)||(11586-11654)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (29-217)||(20980-21168)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (154-222)||(10757-10826)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (154-222)||(131-198)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (154-222)||(51698-51766)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (172-222)||(202-252)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (2-170)||(77339-77507)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (4-86)||(25929-26012)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 22133049 - 22133268
Alignment:
Q  3 ggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtg 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||    
T  22133049 ggtgctactcattcttttacctcggttagttgtgttgagcatttgaaattggttctaactccgttgttgcgagggatggtcatcgacaccccggctaatg 22133148  T
Q  103 gttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22133149 gttcggtgactacttgttttgtgtgcgctaagtgtcctattaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatgga 22133248  T
Q  203 tgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22133249 tgtgatttttggtatggatt 22133268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20528116 - 20527896
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||  ||||     
T  20528116 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccgactaga 20528017  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  20528016 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttaaagcatatgg 20527917  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  20527916 atgtgatttttgatatggatt 20527896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 20828688 - 20828908
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  20828688 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagc 20828787  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20828788 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 20828887  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20828888 atgtgatttttggtatggatt 20828908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20928117 - 20927897
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| || |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  20928117 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgatcgtttgaaattggttataactcctttgttacggggaatggttattgacaccccggctagc 20928018  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  20928017 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaaatgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttagatcttgtttgtcttccgttgaagcatatag 20927918  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20927917 atgtgatttttggtatggatt 20927897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 41215156 - 41215372
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  41215156 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaatttggttgtaactccgttgttgcgagggatggttatcgacaccccggctagt 41215255  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
        ||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||    
T  41215256 ----cggtgactacttccttagtgtgtgctaagtgtcatgttaattttggtaacattaattttgagttggatcttgtttgtcttccgttttagcatatgg 41215351  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  41215352 atgtgatttttggtattgatt 41215372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20172101 - 20172011
Alignment:
Q  126 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggta 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  20172101 tgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgcttgccgttggtgaatatggatgtgattttcggta 20172011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17201310 - 17201092
Alignment:
Q  4 gtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtgg 103  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  17201310 gtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcgagggatggtcatcgacacccgtgctagcgg 17201211  T
Q  104 ttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggat 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17201210 ttcggtgactacttcttttgtgtgtgctaattgtcctgttaatttaggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggat 17201111  T
Q  204 gtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17201110 gtgatttttggtatggatt 17201092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 6150315 - 6150536
Alignment:
Q  1 ttggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctag 100  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||    
T  6150315 ttggtgctactcattcttttatatcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcccttgttgcggggaatggttattgacaccccggctag 6150414  T
Q  101 tggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatg 200  Q
     |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6150415 aggttcggttactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatg 6150514  T
Q  201 gatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6150515 gatgtgatttttggtatggatt 6150536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30150034 - 30149814
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  30150034 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagc 30149935  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30149934 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 30149835  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30149834 atgtgatttttggtatggatt 30149814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 8271862 - 8272082
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  8271862 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagc 8271961  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8271962 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaaatgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 8272061  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8272062 atgtgatttttggtatggatt 8272082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Original strand, 15948014 - 15948154
Alignment:
Q  82 tcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtg 181  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15948014 tcatcaacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttg 15948113  T
Q  182 tcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15948114 tcttccgtttaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 15948154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 13964818 - 13965035
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||   |||| | |||||||||||||  |||||||| |  ||||| ||  | ||||| |||||     
T  13964818 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaaagtttggatttggttgtaactcgtttgttgcgtggaatggttattgataccccggctagc 13964917  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13964918 ggttcggtgactactt---ttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 13965014  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13965015 atgtgatttttggtatggatt 13965035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 205
Target Start/End: Original strand, 22150200 - 22150403
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||  | ||||| |||||     
T  22150200 tggtgctagtcattcttttatcttggttagctgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaacggttattgataccccggctagc 22150299  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22150300 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcttgttaattttggttatgttaattttgagttgggtcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 22150399  T
Q  202 atgt 205  Q
    ||||    
T  22150400 atgt 22150403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15612658 - 15612559
Alignment:
Q  123 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15612658 gtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 15612559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30140359 - 30140263
Alignment:
Q  126 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30140359 tgtgttaagtgttctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgttatttttggtatggatt 30140263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12796092 - 12796024
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12796092 atgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 12796024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16258998 - 16258930
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16258998 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagaatatggatgttatttttggtatggatt 16258930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18915582 - 18915514
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18915582 atgttgactttgagttggatcttgtttggcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 18915514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 15944057 - 15944128
Alignment:
Q  1 ttggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgc 72  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15944057 ttggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaacttctttgttgc 15944128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21194218 - 21194439
Alignment:
Q  1 ttggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctag 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||||    
T  21194218 ttggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttaagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcgggggatggttatcgacaccccggctag 21194317  T
Q  101 tggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatg 200  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21194318 aggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatg 21194417  T
Q  201 gatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21194418 gatgtgatttttggtatggatt 21194439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23903276 - 23903056
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||| ||||||    
T  23903276 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgagcatttgaatttggttgtaactccgttatcgcgagggatggtcatcgacaccccggctagt 23903177  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23903176 ggttcggtgactacttccttagtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggaaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatgg 23903077  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  23903076 atgtgattttttgtatggatt 23903056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 20650022 - 20650242
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||  | ||     
T  20650022 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcgggggatggttattgacaccccgaccagc 20650121  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20650122 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgataagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatgg 20650221  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20650222 atgtgatttttggtatggatt 20650242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22437398 - 22437184
Alignment:
Q  8 tactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcg 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||     
T  22437398 tactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagggatggtcatcgacaccccgactagtggttca 22437299  T
Q  108 gtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtga 207  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  22437298 gtgactacttctttagtgtgtgctaagtgtcatgttaattttggtaatgttgattttgagttagatcttgtgtgtcttccattgaatcatatggatgtga 22437199  T
Q  208 tttttggtatggatt 222  Q
    ||||| |||||||||    
T  22437198 ttttttgtatggatt 22437184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 21848004 - 21848224
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||||    
T  21848004 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagt 21848103  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21848104 ggttcggtgactacttcgtttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttgttgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 21848203  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  21848204 atgttatttttggtatggatt 21848224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16415200 - 16414985
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||| || | ||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  16415200 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattgattttgactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagc 16415101  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |      |||||| ||||||    
T  16415100 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgatt-----tttgaagcatatgg 16415006  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16415005 atgtgatttttggtatggatt 16414985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 24931619 - 24931711
Alignment:
Q  126 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24931619 tgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatct----tgttttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 24931711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Original strand, 23154838 - 23154919
Alignment:
Q  130 ctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttt 211  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23154838 ctaagtgtcatgttaattatggtaatgttgattttgagtttgatcttgtgtatcttccgttgaagcatatggatgtgatttt 23154919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16100928 - 16100707
Alignment:
Q  1 ttggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctag 100  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||  ||||    
T  16100928 ttggtgctactcatttttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccgactag 16100829  T
Q  101 tggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatg 200  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16100828 cggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgcgtgtcttccgttgaagcatatg 16100729  T
Q  201 gatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16100728 gatgtgatttttggtatggatt 16100707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 16379742 - 16379962
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  16379742 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagc 16379841  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16379842 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 16379941  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16379942 atgtgatttttggtatggatt 16379962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 16647338 - 16647558
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| | | |||| | |||||||||||||  |||||||| |  ||||| ||  |||||||  ||||     
T  16647338 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttaaacgtttggatttggttgtaactcatttgttgcgtggaatggttattgacaccccgactagc 16647437  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16647438 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 16647537  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16647538 atgtgatttttggtatggatt 16647558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18401543 - 18401337
Alignment:
Q  16 cttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactac 115  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||   |||| ||||| ||||||||    
T  18401543 cttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttggaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccctgactagcggttcagtgactac 18401444  T
Q  116 ttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggt 215  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18401443 ttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaatttcggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtctcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggt 18401344  T
Q  216 atggatt 222  Q
    |||||||    
T  18401343 atggatt 18401337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 222
Target Start/End: Original strand, 1646239 - 1646403
Alignment:
Q  58 taactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgt 157  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1646239 taactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgt 1646338  T
Q  158 tgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1646339 tgattttgagttggatcttgtttttcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 1646403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18578212 - 18578113
Alignment:
Q  123 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18578212 gtgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 18578113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14133993 - 14133824
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||          
T  14133993 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagggatggtcattgacacccca------ 14133900  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttc 186  Q
             |||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14133899 ---------actacttccttagtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaaggttgattttgagctggatcttgtgtgtcttc 14133824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Original strand, 23025251 - 23025350
Alignment:
Q  123 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23025251 gtgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtaacattgattttgagttggatcttgtgcgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 23025350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16235149 - 16235051
Alignment:
Q  123 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  16235149 gtgtgtgctaagtgtcctgttaat-ttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccattgaagcatatggatgtgatttttgttttggatt 16235051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 218
Target Start/End: Original strand, 19985697 - 19985789
Alignment:
Q  126 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatg 218  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  19985697 tgtgttaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcctgtttgtcttccgttgaagcatatagatgtgattttttgtatg 19985789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 18836178 - 18836246
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18836178 atgttgattttgagttggatcttgtctgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 18836246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 6)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 90579 - 90359
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||| |     
T  90579 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctggc 90480  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  90479 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcgtatgg 90380  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  90379 atgtgatttttggtatggatt 90359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8234 - 8014
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| || |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  8234 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaaatggttgtaacccctttgttccggggaatggttattgacaccccggctagc 8135  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8134 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgtcaattttggtgatgttgattttaagttgtatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatgg 8035  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8034 atgtgatttttggtatggatt 8014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Original strand, 21103 - 21257
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||  || ||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||    
T  21103 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaccgtttgaacatg-ttgtaactctgttgttgcgagggatggtcatcgacaccccggctagt 21201  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgt 157  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21202 ggttcggtgactacttctttagtgtgtgctaagtgtcctattaattttggtaatgt 21257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Original strand, 30679 - 30833
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||  || ||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||    
T  30679 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaccgtttgaacatg-ttgtaactctgttgttgcgagggatggtcatcgacaccccggctagt 30777  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgt 157  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30778 ggttcggtgactacttctttagtgtgtgctaagtgtcctattaattttggtaatgt 30833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 222
Target Start/End: Original strand, 21255 - 21301
Alignment:
Q  176 tgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21255 tgtgtgtcttccgttgaagcatatagatgtgatttttggtatcgatt 21301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 222
Target Start/End: Original strand, 30831 - 30877
Alignment:
Q  176 tgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30831 tgtgtgtcttccgttgaagcatatagatgtgatttttggtatcgatt 30877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 6231 - 6452
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||    
T  6231 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaatttggttgtgactccgttattgcgaggaatggtcatcgacaccccggctagt 6330  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaa-tattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatg 200  Q
    ||||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6331 ggttcagtgactacttccttagtgtgtgctaagtgccctgttaatttttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtgttccgttgaagcatatg 6430  T
Q  201 gatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6431 gatgtgatttttggtatggatt 6452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25131288 - 25131068
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| | | | |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||    
T  25131288 tggtgctactcattcttctatctcggttagttgtgtttaacgtctgaatttggttgtaactccgttgtcgcgagggatggtcatcgacaccccggctagt 25131189  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25131188 ggttcggtgactacttccttagtgtgtgctaagtgccctgttaattttggtaatattgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatgg 25131089  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25131088 atgtgatttttggtatggatt 25131068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 22739418 - 22739636
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||| | |||||     
T  22739418 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgtgcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcgggggatggttatcgacacctcggctagc 22739517  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22739518 ggttcggtaactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaatttttgtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatgg 22739617  T
Q  202 atgtgatttttggtatgga 220  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  22739618 atgtgatttttggcatgga 22739636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22280784 - 22280564
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  22280784 tggtgctagtcattcatttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagc 22280685  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22280684 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaatttaggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 22280585  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22280584 atgtgatttttggtatggatt 22280564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 24567434 - 24567652
Alignment:
Q  4 gtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtgg 103  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||| | ||  |||||||  |||| ||    
T  24567434 gtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcagggaatgattattgacaccccgactagcgg 24567533  T
Q  104 ttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggat 203  Q
    |||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  24567534 ttcgatgacaacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttgattttggtactgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccatggaagcatatggat 24567633  T
Q  204 gtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24567634 gtgatttttggtatggatt 24567652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 218
Target Start/End: Original strand, 25878531 - 25878623
Alignment:
Q  126 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatg 218  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25878531 tgtgttaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatg 25878623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 12638818 - 12638886
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12638818 atgttgattttgagttggattttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 12638886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 12644485 - 12644553
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12644485 atgttgattttgagttggattttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 12644553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 24829105 - 24829172
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24829105 atgttgattttgagttggatctttt-tgtcttccgttgaagcatatgaatgtgatttttggtatggatt 24829172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34821675 - 34821609
Alignment:
Q  155 tgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  34821675 tgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgcga-ttttggtatggatt 34821609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4442964 - 4442741
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||    
T  4442964 tggtgctactcattcttctacctcggttagttgtgttgagcgtttgaatttggttgtaactccgttgttgcgagggatggtcattgacaccccggctagt 4442865  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||||| ||||| || |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4442864 ggttcggtaactacttccttagtgtgtgctaggtgtcatgctaattttggtaacattgattttgagttgtatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatgg 4442765  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatttga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4442764 atgtgatttttggtatggatttga 4442741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13459070 - 13458852
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  13459070 tggtgctactcattcttttatttcggttagttgtgttgagcatttgaatttagttgtaactctgttgttgcgagggatggtcatcaacaccccggctagt 13458971  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||    
T  13458970 ggttaggtgactacttctttagtgtg--ctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggattttgtgtgtatgccgttgaaccatatgg 13458873  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13458872 atgtgatttttggtatggatt 13458852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7826937 - 7826717
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  7826937 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagc 7826838  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7826837 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 7826738  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7826737 atgtgatttttggtatggatt 7826717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 27105007 - 27105227
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  27105007 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagc 27105106  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27105107 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 27105206  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27105207 atgtgatttttggtatggatt 27105227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27173318 - 27173098
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||   |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  27173318 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttgggtttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagc 27173219  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27173218 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 27173119  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27173118 atgtgatttttggtatggatt 27173098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11284726 - 11284627
Alignment:
Q  123 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11284726 gtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggattttgtgtgtcttccattgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 11284627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17926501 - 17926436
Alignment:
Q  157 ttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  17926501 ttgattttgagttggatcctgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatctctggtatggatt 17926436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14207337 - 14207264
Alignment:
Q  23 ctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccag 96  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| | |||||||    
T  14207337 ctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactccgttgtcgcgtggaatggtcatcgataccccag 14207264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14216027 - 14215954
Alignment:
Q  23 ctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccag 96  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| | |||||||    
T  14216027 ctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactccgttgtcgcgtggaatggtcatcgataccccag 14215954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35162 - 34942
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  35162 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgtatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagc 35063  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35062 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaaatgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 34963  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34962 atgtgatttttggtatggatt 34942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25255 - 25035
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  25255 tggtgctactcattcttttatctcggttagttatgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagc 25156  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    || ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25155 ggatcggtgactacttcttttatgggtgctaaatgtcctattaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttaaagcatatgg 25056  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25055 atgtgatttttggtatggatt 25035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23508646 - 23508426
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||| || |||||||| |||||     
T  23508646 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggctgtaactcctttgttgcggggaatggttattaacaccccggctagc 23508547  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23508546 ggtttggtgactacttcttttatgtgtgttaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttagatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 23508447  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23508446 atgtgatttttggtatggatt 23508426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24584172 - 24583952
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  24584172 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagc 24584073  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24584072 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatattgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 24583973  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24583972 atgtgatttttggtatggatt 24583952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 222
Target Start/End: Original strand, 21934643 - 21934814
Alignment:
Q  51 ttggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattg 150  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21934643 ttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccctggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttg 21934742  T
Q  151 gtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21934743 gtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 21934814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23505383 - 23505316
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23505383 atgttgattttgagttggatcttgtttgtcttctgttgaagcatatggatgtgattttt-gtatggatt 23505316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14999694 - 14999472
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  14999694 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagc 14999595  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14999594 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 14999495  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14999494 atgtgatttttggtatggatttg 14999472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 15290382 - 15290602
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  15290382 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagc 15290481  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15290482 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 15290581  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15290582 atgtgatttttggtatggatt 15290602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 12340090 - 12340309
Alignment:
Q  1 ttggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctag 100  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||  | ||    
T  12340090 ttggtcctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtgactccgttgttgcgagggagggtcatcgacaccccgaccag 12340189  T
Q  101 tggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatg 200  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12340190 tggttcggtgactacttccttggtgtgcgctaagtgtcatgttaactctggtaatgttgactttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcacatg 12340289  T
Q  201 gatgtgatttttggtatgga 220  Q
    || |||||||||||||||||    
T  12340290 gacgtgatttttggtatgga 12340309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9293093 - 9292994
Alignment:
Q  123 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9293093 gtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 9292994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Original strand, 15139015 - 15139113
Alignment:
Q  123 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15139015 gtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgt-tgtcttccgttgaagcttatggatgtaatttttggtatggatt 15139113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 4129 - 4349
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  | ||||| |||||     
T  4129 tggtgctactcattcttttatctcgattaattgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgataccccggctagc 4228  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4229 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaaatgccctgttaattttggtaatgttgactttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatgg 4328  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4329 atgtgatttttggtatggatt 4349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 848 - 1068
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||  |  ||||| ||  ||||||| ||||||    
T  848 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtattgaacgtttgaaattggttgtaactcctttgtcgcaggggatggttattgacaccccggctagt 947  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  948 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatactgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 1047  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1048 atgtgatttttggtatggatt 1068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Original strand, 13558 - 13620
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactcc 64  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13558 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcc 13620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26473 - 26253
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  26473 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagc 26374  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26373 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 26274  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26273 atgtgatttttggtatggatt 26253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24040 - 23820
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  24040 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagc 23941  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23940 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 23841  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23840 atgtgatttttggtatggatt 23820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 5531 - 5751
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  5531 tggtgctactcattcttttatcttggttagttatgttgagcgtttgaaattggttataactcctttgttgcggggaatggttattgacacccctgctagc 5630  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  5631 agttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgaatttgatcttgtttgtcttctgttgaagcatatgg 5730  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5731 atgtgatttttggtatggatt 5751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 73824 - 74044
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  73824 tggtgctactcattgttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctctattgcggggaatggttattgacaccccggctagc 73923  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  73924 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttgttaatgttgattttgagttcgatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 74023  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  74024 atgtgatttttggtatggatt 74044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 78205 - 78425
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  78205 tggtgctactcattgttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctctattgcggggaatggttattgacaccccggctagc 78304  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  78305 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttgttaatgttgattttgagttcgatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 78404  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  78405 atgtgatttttggtatggatt 78425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 175740 - 175958
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||| | |||||  | |||    
T  175740 tggtgctactcattctttcatctccgttagttgtgttaaacgtttgaatttggttgtgactccgttattgtgaggaatggtcatcgataccccgaccagt 175839  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    ||||||||||||||||  ||   |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  175840 ggttcggtgactacttccttgaggtgttctaagtgtcccgttaactttggtaatgttgattttgagttggttcttgtgtttcttccgttaaagcacatgg 175939  T
Q  202 atgtgatttttggtatgga 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  175940 atgtgatttttggtatgga 175958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 182067 - 181934
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  182067 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattcgttgtaactccttttttgcggggaatggttattgacaccccggctagc 181968  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagt 135  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  181967 ggttcggtgactacttcatttatgtctgctaagt 181934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 12866 - 13072
Alignment:
Q  16 cttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactac 115  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  12866 cttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggtttagtgactac 12965  T
Q  116 ttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggt 215  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12966 ttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgaattttggt 13065  T
Q  216 atggatt 222  Q
    |||||||    
T  13066 atggatt 13072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 131718 - 131936
Alignment:
Q  4 gtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtgg 103  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| ||    
T  131718 gtgctactcattattttatctcggttagttgtgttgatcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcgg 131817  T
Q  104 ttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggat 203  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  131818 ttcggtgactacttcttttatgtgtgctaaatgtcctattaattttggtaatgttaattttaagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggat 131917  T
Q  204 gtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  131918 gtgatttttggtatggatt 131936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26804 - 26634
Alignment:
Q  51 ttggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattg 150  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26804 ttggttgttactcctttgttgcgtggtatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttg 26705  T
Q  151 gtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26704 gtaatgtt-aatttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatagatt 26634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1288 - 1068
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||   |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  1288 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgtttttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagc 1189  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  1188 ggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttctcttccgttgaagcatatgg 1089  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1088 atgtgatttttggtatggatt 1068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 1179 - 1399
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||   |||||     
T  1179 tggtgctactcattcttttatctcgattagttgtgttgaacgtttgaaattggtcgtaactcctttgttgcggggaatggttatcgacaccttggctagc 1278  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  1279 gtttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctattaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttctgttgaagcatatgg 1378  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1379 atgtgatttttggtatggatt 1399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2648 - 2431
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||  |||||    
T  2648 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgcg--tttgaatttggttgtaactccgtttttgcgagggatggtcatcgacaccccgactagt 2551  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
     |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  2550 tgttcggtgactacttccttagtgtgtgctaagtgtcctattaattttggtaattttgattttgagttggatcttgtgtgtctt-cgttaaagcatatgg 2452  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  2451 gtgtgatttttggtatggatt 2431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 5032 - 5253
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccag-ctag 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| | ||||    
T  5032 tggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacacccccggctag 5131  T
Q  101 tggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatg 200  Q
     |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5132 cggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgttctgttaattttggtgatgttgattttgtgttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatg 5231  T
Q  201 gatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5232 gatgtgatttttggtatggatt 5253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 7089 - 7308
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||     
T  7089 tggtgctacttattcttttatctcggttagttgcgttgatcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagc 7188  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatgg 201  Q
    ||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7189 ggttcagtgactacttcttta-tgtgtgctaaatgtccagttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatgg 7287  T
Q  202 atgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7288 atgtgatttttggtatggatt 7308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15988 - 15767
Alignment:
Q  1 ttggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctag 100  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| ||||||   |  ||||| ||  ||||||   ||||    
T  15988 ttggtgttacttattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgtatttggttgtaactcctttgttgtttggaatggttattgacaccctgtctag 15889  T
Q  101 tggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatg 200  Q
     |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  15888 cggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaaatgtcctgttaattttggtaatgctgattttgagttggatcttgtttgccttccgttgaagcatatg 15789  T
Q  201 gatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  15788 gatgtgagttttggtatggatt 15767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 10553 - 10621
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10553 atgttgattttgagttggatcttgtatgtcttccgttgaagaatatggatgtaatttttggtatggatt 10621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3577 - 3356
Alignment:
Q  1 ttggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctag 100  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| | | |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||  | ||    
T  3577 ttggtgctactcattctttcatctcggttagttgtgttcaacgtttgaatttgtttggaactctgttgttgcgagggatggtcatcgacaccccgaccag 3478  T
Q  101 tggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatg 200  Q
    ||| || ||||||||||  || | |||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  3477 tggctcagtgactacttcgttagggtgtgctaagtgtcttgttcgttttggtagtgttgatttagagttggatcttgtgtgtctttcgttgaagcacatg 3378  T
Q  201 gatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3377 gatgtgatttttggtatggatt 3356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2434 - 2335
Alignment:
Q  123 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2434 gtgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 2335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Original strand, 24913 - 25012
Alignment:
Q  123 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24913 gtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtctcccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 25012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2692 - 2579
Alignment:
Q  109 tgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgat 208  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  2692 tgactacttcttttatgtgcgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttagatcttgtgtgttttccgttaaagcatatggatgtgat 2593  T
Q  209 ttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||    
T  2592 ttttggtatggatt 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 2773 - 2703
Alignment:
Q  3 ggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcg 73  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2773 ggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcttttgaaattggctgtaactcctttgttgcg 2703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 180
Target Start/End: Original strand, 2292 - 2384
Alignment:
Q  88 acaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgt 180  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2292 acaccccggctagtggttcggtgactacttcttttgtgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgt 2384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3436 - 3340
Alignment:
Q  126 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3436 tgtggtaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccattgaagcatatgaatgtgatttttggtatggatt 3340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Original strand, 93791 - 93887
Alignment:
Q  126 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  93791 tgtgttaagtgtcctgttaatttcggtaatgttgatttggagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 93887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 364
Alignment:
Q  131 taagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  455 taagtgtcctgttaattttgataatgttgattttaagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Original strand, 17696 - 17794
Alignment:
Q  123 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17696 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatttcggtaatgttgatttt-agttgaatcttgtgtgtcttccattgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 17794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 131 - 222
Target Start/End: Original strand, 53967 - 54058
Alignment:
Q  131 taagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53967 taagtgtcctgttaattttgataatgttgattttaagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 54058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Original strand, 46431 - 46529
Alignment:
Q  123 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  46431 gtgtttgctaagtgtcctgtaaatttcggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtga-ttttggtatggatt 46529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 929
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  997 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 222
Target Start/End: Original strand, 8199 - 8273
Alignment:
Q  148 ttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  8199 ttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggattttatttttggtatggatt 8273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 3331 - 3399
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3331 atgttgattttgagttggatcttttgtgtcttcggttgaagcatatagatgtgatttttggtatggatt 3399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 11586 - 11654
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11586 atgttgattttgagttggatcttttgtgtcttcggttgaagcatatagatgtgatttttggtatggatt 11654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 217
Target Start/End: Original strand, 20980 - 21168
Alignment:
Q  29 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 128  Q
    ||||| |||||| | |||||| ||||| ||||||||||| |   ||| || ||||||| | |||||  | | ||| |||||||||||||  |||   |||    
T  20980 tagttgtgttgatcgtttgaatttggtagtaactccgttatcaggaggtaaggtcatcgataccccgaccaatgggtcggtgactacttcctttagttgt 21079  T
Q  129 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtat 217  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||  || |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21080 gctaagtgtcccgttagttttggtagcgtcgattttgagttgtatcttgtttgtcttctgttgaagcatatggatgtgattttcggtat 21168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 10757 - 10826
Alignment:
Q  154 atgttgattttg-agttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10757 atgttgattttggagttggatcttgtttgtcttccgttaaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 10826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 198 - 131
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  198 atgttgattttgagttggat-ttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgttatttttggtatggatt 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51766 - 51698
Alignment:
Q  154 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  51766 atgttgattttgaattggatcttgtttatcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggcatggatt 51698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 202 - 252
Alignment:
Q  172 atcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  202 atcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 77507 - 77339
Alignment:
Q  2 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 101  Q
    ||||||||| | |||||| | |||| |||||| |||||| | |||||| |||||| |||||| ||| ||   ||  ||||||||| |||||| ||| | |    
T  77507 tggtgctacgcattctttcatctcgcttagttatgttgaacgtttgaatttggttttaactctgttttttaaagggatggtcatcgacaccctagccaat 77408  T
Q  102 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttg 170  Q
    || | | |||||||||  || || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  77407 ggcttgatgactacttccttagtttgtgctaagtttcctgttaattttggtaacgttgattttgagttg 77339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Original strand, 25929 - 26012
Alignment:
Q  4 gtgctactc-tttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatc 86  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  25929 gtgctactcattttttttatctcggttagttgcgttgagcgtttgaaattgattgtaactccgttgttgcgtgggatggtcatc 26012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University