View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9991_low_13 (Length: 389)

Name: NF9991_low_13
Description: NF9991
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9991_low_13
NF9991_low_13
[»] chr3 (109 HSPs)
chr3 (176-367)||(29081276-29081467)
chr3 (182-367)||(28676885-28677070)
chr3 (180-367)||(16127134-16127321)
chr3 (180-367)||(19948313-19948500)
chr3 (180-367)||(26540930-26541117)
chr3 (184-367)||(37088258-37088441)
chr3 (180-367)||(37528718-37528905)
chr3 (175-367)||(2579922-2580114)
chr3 (175-367)||(38185736-38185927)
chr3 (180-367)||(35499572-35499758)
chr3 (180-367)||(44845594-44845781)
chr3 (180-367)||(50499733-50499919)
chr3 (177-367)||(40563358-40563548)
chr3 (180-367)||(25570349-25570536)
chr3 (180-367)||(45345003-45345189)
chr3 (180-366)||(52857866-52858052)
chr3 (180-367)||(24536549-24536736)
chr3 (180-366)||(52166086-52166272)
chr3 (180-355)||(8872843-8873018)
chr3 (180-367)||(54672175-54672361)
chr3 (182-355)||(46247971-46248143)
chr3 (211-367)||(4240279-4240435)
chr3 (175-367)||(38891981-38892172)
chr3 (211-367)||(52794896-52795052)
chr3 (180-367)||(29718196-29718382)
chr3 (180-355)||(44748793-44748967)
chr3 (177-355)||(40480028-40480206)
chr3 (180-366)||(46972003-46972189)
chr3 (182-367)||(47897601-47897786)
chr3 (211-367)||(55305104-55305260)
chr3 (211-355)||(37713972-37714116)
chr3 (211-367)||(50317024-50317180)
chr3 (180-367)||(49853038-49853225)
chr3 (184-355)||(46318766-46318938)
chr3 (180-367)||(53779008-53779188)
chr3 (252-367)||(2121869-2121984)
chr3 (184-355)||(21707125-21707296)
chr3 (254-367)||(2851861-2851974)
chr3 (209-355)||(42217662-42217808)
chr3 (195-367)||(30864412-30864583)
chr3 (211-355)||(43525744-43525888)
chr3 (180-366)||(12063724-12063910)
chr3 (258-367)||(21603846-21603955)
chr3 (211-367)||(52225286-52225442)
chr3 (216-367)||(24628194-24628345)
chr3 (254-367)||(46627492-46627605)
chr3 (254-367)||(51709055-51709168)
chr3 (211-355)||(48942992-48943134)
chr3 (180-359)||(33391873-33392052)
chr3 (258-355)||(41246297-41246394)
chr3 (218-355)||(39876622-39876759)
chr3 (256-367)||(30548790-30548901)
chr3 (211-351)||(54541946-54542086)
chr3 (263-367)||(42497047-42497151)
chr3 (184-355)||(48378200-48378371)
chr3 (211-362)||(44947201-44947352)
chr3 (196-330)||(47173554-47173688)
chr3 (180-367)||(41518331-41518518)
chr3 (180-315)||(44545201-44545335)
chr3 (180-358)||(45368580-45368758)
chr3 (211-357)||(193398-193544)
chr3 (183-360)||(42465029-42465206)
chr3 (283-367)||(45693381-45693465)
chr3 (209-351)||(30814261-30814403)
chr3 (270-367)||(51003307-51003404)
chr3 (180-316)||(41785779-41785915)
chr3 (252-362)||(32026409-32026519)
chr3 (254-367)||(7041105-7041218)
chr3 (253-362)||(29203027-29203136)
chr3 (211-367)||(39469914-39470056)
chr3 (204-357)||(35100181-35100328)
chr3 (269-355)||(37489931-37490017)
chr3 (223-357)||(2598608-2598742)
chr3 (177-359)||(20450425-20450607)
chr3 (228-357)||(33897898-33898027)
chr3 (256-351)||(52595345-52595440)
chr3 (275-357)||(52868184-52868266)
chr3 (256-367)||(27446473-27446584)
chr3 (285-362)||(5506704-5506781)
chr3 (217-355)||(39719361-39719498)
chr3 (256-315)||(43740325-43740384)
chr3 (252-366)||(37713134-37713251)
chr3 (253-355)||(52931152-52931241)
chr3 (256-353)||(32982921-32983011)
chr3 (283-364)||(22257726-22257807)
chr3 (269-345)||(24350282-24350358)
chr3 (171-243)||(52363003-52363075)
chr3 (182-243)||(24536808-24536869)
chr3 (322-367)||(44545328-44545373)
chr3 (180-281)||(51950326-51950427)
chr3 (180-234)||(889683-889736)
chr3 (288-362)||(51980820-51980892)
chr3 (257-358)||(612099-612200)
chr3 (191-243)||(28394173-28394225)
chr3 (294-353)||(43359249-43359307)
chr3 (258-289)||(45693479-45693510)
chr3 (314-359)||(50938176-50938221)
chr3 (300-364)||(12122110-12122173)
chr3 (314-354)||(22978191-22978231)
chr3 (314-362)||(32390052-32390100)
chr3 (314-362)||(36807035-36807083)
chr3 (314-362)||(38732263-38732311)
chr3 (314-362)||(40374446-40374494)
chr3 (314-354)||(41888921-41888961)
chr3 (322-362)||(43968290-43968330)
chr3 (314-362)||(44896004-44896052)
chr3 (314-362)||(46668454-46668502)
chr3 (314-362)||(49918349-49918397)
chr3 (211-243)||(52788677-52788709)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (177-355)||(31100017-31100195)
chr6 (177-367)||(32731725-32731915)
chr6 (177-366)||(34232906-34233095)
chr6 (180-367)||(12297334-12297521)
chr6 (180-367)||(14227526-14227712)
chr6 (180-367)||(2442394-2442581)
chr6 (180-367)||(30811139-30811326)
chr6 (180-367)||(20804960-20805146)
chr6 (180-366)||(7317602-7317788)
chr6 (211-367)||(558360-558517)
chr6 (180-349)||(31451962-31452131)
chr6 (211-355)||(10856133-10856277)
chr6 (218-367)||(12432611-12432760)
chr6 (211-367)||(34685006-34685161)
chr6 (209-355)||(33453734-33453880)
chr6 (218-367)||(33540716-33540865)
chr6 (252-367)||(5681561-5681676)
chr6 (254-367)||(5943035-5943148)
chr6 (211-366)||(34439683-34439838)
chr6 (175-329)||(1806343-1806496)
chr6 (254-366)||(6709687-6709799)
chr6 (252-362)||(28076464-28076574)
chr6 (180-367)||(34903929-34904103)
chr6 (258-367)||(2970722-2970831)
chr6 (254-366)||(5301593-5301705)
chr6 (211-362)||(3108001-3108153)
chr6 (211-362)||(11015590-11015741)
chr6 (256-362)||(31049379-31049485)
chr6 (254-355)||(3636643-3636744)
chr6 (217-367)||(29823026-29823176)
chr6 (268-362)||(12140874-12140968)
chr6 (180-367)||(29414914-29415088)
chr6 (270-362)||(21894311-21894403)
chr6 (218-367)||(7292539-7292688)
chr6 (252-357)||(6104671-6104776)
chr6 (218-355)||(23648201-23648338)
chr6 (280-360)||(15591148-15591228)
chr6 (218-355)||(20563400-20563538)
chr6 (271-362)||(9896766-9896857)
chr6 (254-352)||(1225475-1225573)
chr6 (270-357)||(5893894-5893981)
chr6 (280-348)||(26561419-26561487)
chr6 (281-362)||(19415351-19415432)
chr6 (280-359)||(32563242-32563321)
chr6 (298-351)||(11443033-11443086)
chr6 (270-357)||(15131386-15131473)
chr6 (314-362)||(18801813-18801861)
[»] chr5 (81 HSPs)
chr5 (174-367)||(2236497-2236690)
chr5 (180-367)||(32382818-32383005)
chr5 (177-367)||(8023965-8024155)
chr5 (180-367)||(12774545-12774732)
chr5 (180-367)||(14647338-14647524)
chr5 (180-367)||(30299667-30299854)
chr5 (180-367)||(36685785-36685972)
chr5 (180-367)||(1711184-1711371)
chr5 (180-367)||(12713281-12713468)
chr5 (180-367)||(30412593-30412780)
chr5 (180-366)||(1174753-1174939)
chr5 (177-362)||(24793938-24794123)
chr5 (180-367)||(5591558-5591744)
chr5 (180-367)||(13228454-13228640)
chr5 (180-367)||(19525718-19525905)
chr5 (180-367)||(39744523-39744709)
chr5 (182-366)||(10697240-10697424)
chr5 (180-366)||(35236649-35236836)
chr5 (184-366)||(30774174-30774356)
chr5 (182-367)||(32381655-32381840)
chr5 (180-355)||(4221466-4221640)
chr5 (180-367)||(31168968-31169155)
chr5 (194-367)||(35639923-35640096)
chr5 (211-367)||(5997875-5998031)
chr5 (175-362)||(19956294-19956479)
chr5 (190-367)||(6603891-6604068)
chr5 (180-367)||(9160673-9160853)
chr5 (180-367)||(12363593-12363780)
chr5 (211-367)||(27130333-27130489)
chr5 (211-367)||(35235708-35235864)
chr5 (180-355)||(2671383-2671558)
chr5 (180-367)||(3037406-3037593)
chr5 (204-367)||(39275416-39275579)
chr5 (209-367)||(26699087-26699245)
chr5 (209-367)||(26968820-26968978)
chr5 (196-366)||(3670263-3670433)
chr5 (218-367)||(43402451-43402600)
chr5 (253-367)||(2178802-2178916)
chr5 (180-367)||(15443425-15443612)
chr5 (196-355)||(29392100-29392258)
chr5 (209-367)||(5381925-5382082)
chr5 (218-367)||(15530442-15530591)
chr5 (196-355)||(9587179-9587339)
chr5 (211-355)||(39246830-39246973)
chr5 (252-367)||(11062888-11063003)
chr5 (211-362)||(19347705-19347857)
chr5 (180-355)||(3669510-3669685)
chr5 (253-367)||(4379300-4379414)
chr5 (192-355)||(6893372-6893533)
chr5 (253-367)||(7651682-7651796)
chr5 (180-355)||(13156879-13157054)
chr5 (253-367)||(36027972-36028086)
chr5 (196-358)||(11663881-11664043)
chr5 (254-361)||(5521341-5521448)
chr5 (252-367)||(22977186-22977301)
chr5 (218-357)||(648538-648677)
chr5 (211-357)||(11100753-11100899)
chr5 (211-362)||(16474771-16474922)
chr5 (256-359)||(9627143-9627246)
chr5 (252-362)||(23920498-23920608)
chr5 (252-357)||(13936233-13936338)
chr5 (252-357)||(2497604-2497709)
chr5 (256-367)||(4875689-4875800)
chr5 (253-366)||(6280437-6280550)
chr5 (254-359)||(42323596-42323701)
chr5 (269-357)||(13921783-13921871)
chr5 (297-367)||(6349426-6349496)
chr5 (297-358)||(4657591-4657652)
chr5 (283-358)||(27005844-27005919)
chr5 (269-351)||(31407980-31408062)
chr5 (280-358)||(32321652-32321730)
chr5 (180-355)||(25872221-25872376)
chr5 (254-358)||(33694719-33694823)
chr5 (252-357)||(41471900-41472006)
chr5 (297-358)||(7896599-7896659)
chr5 (280-353)||(18480557-18480630)
chr5 (209-243)||(22977330-22977364)
chr5 (314-362)||(7948376-7948424)
chr5 (314-362)||(13019107-13019155)
chr5 (314-354)||(15524477-15524517)
chr5 (314-362)||(20768806-20768854)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (180-367)||(12707-12894)
[»] chr2 (86 HSPs)
chr2 (180-367)||(3377360-3377546)
chr2 (180-367)||(16486850-16487036)
chr2 (177-367)||(4453510-4453700)
chr2 (175-367)||(28382667-28382859)
chr2 (177-367)||(36712523-36712712)
chr2 (177-362)||(38579000-38579185)
chr2 (180-367)||(650767-650953)
chr2 (180-367)||(2266139-2266325)
chr2 (180-367)||(8688949-8689135)
chr2 (180-367)||(13111729-13111917)
chr2 (180-367)||(21865213-21865401)
chr2 (180-367)||(9886960-9887146)
chr2 (180-367)||(36999457-36999643)
chr2 (196-367)||(41322739-41322910)
chr2 (180-367)||(2546311-2546498)
chr2 (180-355)||(5039742-5039917)
chr2 (180-367)||(40024929-40025116)
chr2 (180-367)||(24402039-24402219)
chr2 (196-367)||(37356151-37356323)
chr2 (204-367)||(15521470-15521633)
chr2 (180-355)||(41796741-41796916)
chr2 (184-362)||(8815185-8815362)
chr2 (182-355)||(4038339-4038511)
chr2 (211-367)||(43507549-43507705)
chr2 (180-355)||(6760603-6760778)
chr2 (180-367)||(10839567-10839753)
chr2 (180-367)||(17263740-17263920)
chr2 (218-367)||(39167756-39167905)
chr2 (180-367)||(26911479-26911665)
chr2 (192-355)||(43135597-43135759)
chr2 (211-367)||(29514832-29514987)
chr2 (180-366)||(38880770-38880957)
chr2 (209-367)||(10393022-10393180)
chr2 (252-362)||(7400383-7400493)
chr2 (212-355)||(31616385-31616528)
chr2 (201-355)||(4385524-4385678)
chr2 (201-367)||(6232267-6232433)
chr2 (209-355)||(40869358-40869504)
chr2 (180-366)||(44275630-44275815)
chr2 (256-367)||(8070607-8070718)
chr2 (201-367)||(8339967-8340133)
chr2 (216-366)||(38842838-38842988)
chr2 (201-367)||(10727818-10727984)
chr2 (175-367)||(13527891-13528081)
chr2 (180-367)||(18212087-18212260)
chr2 (252-355)||(43285657-43285760)
chr2 (254-355)||(42132708-42132809)
chr2 (253-351)||(7213664-7213762)
chr2 (275-357)||(24019948-24020030)
chr2 (258-367)||(9053117-9053226)
chr2 (263-367)||(2047308-2047411)
chr2 (280-362)||(25071437-25071519)
chr2 (271-362)||(15250163-15250254)
chr2 (280-357)||(16669119-16669196)
chr2 (275-362)||(23356976-23357063)
chr2 (274-362)||(4055951-4056039)
chr2 (280-367)||(7823534-7823621)
chr2 (253-367)||(598931-599045)
chr2 (270-358)||(2221446-2221534)
chr2 (256-351)||(2758874-2758969)
chr2 (211-362)||(5520060-5520211)
chr2 (285-357)||(6222636-6222708)
chr2 (180-355)||(6153461-6153622)
chr2 (196-288)||(18710173-18710265)
chr2 (300-355)||(18710257-18710312)
chr2 (253-360)||(39675059-39675166)
chr2 (295-357)||(41877821-41877883)
chr2 (269-355)||(34884866-34884952)
chr2 (297-357)||(13761842-13761900)
chr2 (291-355)||(37674497-37674561)
chr2 (300-355)||(7569853-7569908)
chr2 (297-355)||(13351603-13351660)
chr2 (312-357)||(6807492-6807537)
chr2 (300-360)||(7511704-7511764)
chr2 (300-360)||(7515988-7516048)
chr2 (314-362)||(44525925-44525973)
chr2 (203-288)||(7569775-7569861)
chr2 (277-357)||(33850121-33850201)
chr2 (278-357)||(2689067-2689145)
chr2 (288-354)||(10361481-10361546)
chr2 (320-362)||(43496281-43496323)
chr2 (184-225)||(29514812-29514853)
chr2 (314-362)||(7454449-7454497)
chr2 (314-362)||(18109653-18109701)
chr2 (314-362)||(26339972-26340020)
chr2 (314-362)||(32482183-32482231)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (177-367)||(17115504-17115694)
chr8 (177-367)||(31581660-31581850)
chr8 (171-367)||(45141445-45141640)
chr8 (177-367)||(44827307-44827497)
chr8 (180-367)||(6338287-6338474)
chr8 (180-367)||(25023275-25023462)
chr8 (180-367)||(28716633-28716820)
chr8 (180-367)||(31478045-31478232)
chr8 (172-367)||(32541184-32541379)
chr8 (180-367)||(10618776-10618962)
chr8 (180-367)||(16422799-16422985)
chr8 (180-355)||(17081623-17081798)
chr8 (196-367)||(36681437-36681608)
chr8 (180-367)||(39702275-39702462)
chr8 (180-367)||(23676840-23677028)
chr8 (180-367)||(38171417-38171604)
chr8 (180-355)||(1893843-1894019)
chr8 (179-367)||(39871234-39871420)
chr8 (196-367)||(8270891-8271062)
chr8 (180-355)||(28709276-28709451)
chr8 (180-365)||(42142727-42142912)
chr8 (211-367)||(27781102-27781258)
chr8 (180-365)||(37560521-37560706)
chr8 (204-355)||(43276773-43276924)
chr8 (180-364)||(22877918-22878102)
chr8 (211-367)||(39320056-39320212)
chr8 (218-355)||(31688052-31688189)
chr8 (211-367)||(41693896-41694055)
chr8 (180-367)||(40223074-40223260)
chr8 (211-355)||(41313375-41313519)
chr8 (175-355)||(37587720-37587901)
chr8 (180-355)||(32099505-32099681)
chr8 (180-367)||(11298031-11298218)
chr8 (180-367)||(24652237-24652423)
chr8 (252-366)||(2642409-2642523)
chr8 (254-355)||(36112843-36112944)
chr8 (254-362)||(44157240-44157348)
chr8 (254-367)||(36590180-36590292)
chr8 (180-355)||(34395348-34395525)
chr8 (262-367)||(11741093-11741198)
chr8 (211-355)||(3427623-3427767)
chr8 (182-355)||(9210958-9211130)
chr8 (218-357)||(13969982-13970121)
chr8 (211-366)||(29189717-29189872)
chr8 (252-358)||(39746938-39747044)
chr8 (257-366)||(3511264-3511373)
chr8 (270-367)||(35243342-35243439)
chr8 (218-362)||(43849202-43849346)
chr8 (252-360)||(7378889-7378997)
chr8 (216-362)||(38780666-38780812)
chr8 (256-364)||(22957354-22957462)
chr8 (254-356)||(1363793-1363895)
chr8 (275-357)||(2855146-2855228)
chr8 (258-367)||(40551856-40551964)
chr8 (180-351)||(16831503-16831666)
chr8 (255-362)||(40045444-40045551)
chr8 (297-362)||(39677442-39677507)
chr8 (292-360)||(44263388-44263456)
chr8 (218-362)||(8436519-8436663)
chr8 (291-358)||(9370315-9370382)
chr8 (297-355)||(42203405-42203463)
chr8 (296-358)||(13888326-13888388)
chr8 (301-367)||(10651115-10651181)
chr8 (281-345)||(26293837-26293901)
chr8 (281-345)||(26307094-26307158)
chr8 (269-358)||(26036979-26037068)
chr8 (297-352)||(44318316-44318371)
chr8 (171-243)||(11741207-11741279)
chr8 (296-362)||(2773521-2773586)
chr8 (180-226)||(43276909-43276955)
chr8 (218-288)||(42203452-42203522)
chr8 (253-298)||(35151040-35151085)
chr8 (314-362)||(12208919-12208967)
chr8 (314-362)||(12453347-12453395)
chr8 (314-354)||(29725884-29725924)
chr8 (180-243)||(36590105-36590168)
[»] chr1 (104 HSPs)
chr1 (181-367)||(26204249-26204434)
chr1 (177-367)||(29704059-29704249)
chr1 (175-367)||(33524496-33524688)
chr1 (175-367)||(36838670-36838862)
chr1 (177-367)||(1917996-1918185)
chr1 (177-367)||(19898883-19899073)
chr1 (177-367)||(36301080-36301268)
chr1 (180-367)||(30721598-30721786)
chr1 (175-367)||(44909809-44910000)
chr1 (180-367)||(2497895-2498082)
chr1 (180-367)||(31150400-31150586)
chr1 (196-367)||(42064292-42064463)
chr1 (196-367)||(29586147-29586318)
chr1 (180-357)||(13121569-13121745)
chr1 (180-367)||(15313217-15313403)
chr1 (180-355)||(17046702-17046877)
chr1 (175-367)||(30774054-30774241)
chr1 (180-367)||(32368314-32368501)
chr1 (180-366)||(34319362-34319548)
chr1 (177-367)||(38676460-38676649)
chr1 (180-355)||(7710941-7711116)
chr1 (196-367)||(17499860-17500031)
chr1 (180-355)||(39826573-39826748)
chr1 (180-357)||(47134516-47134692)
chr1 (211-367)||(50351036-50351192)
chr1 (180-367)||(26843724-26843911)
chr1 (180-367)||(1507718-1507906)
chr1 (182-367)||(3660920-3661105)
chr1 (201-367)||(15348818-15348984)
chr1 (211-367)||(322869-323025)
chr1 (211-367)||(3270663-3270818)
chr1 (211-355)||(38967451-38967594)
chr1 (210-365)||(49220450-49220605)
chr1 (191-355)||(25601971-25602134)
chr1 (203-362)||(29374326-29374485)
chr1 (253-367)||(37703716-37703830)
chr1 (253-367)||(37672325-37672439)
chr1 (254-367)||(22098965-22099078)
chr1 (253-367)||(46369853-46369964)
chr1 (254-367)||(36043275-36043388)
chr1 (254-367)||(49185160-49185273)
chr1 (254-367)||(50171272-50171385)
chr1 (180-367)||(33561884-33562057)
chr1 (211-362)||(7781144-7781295)
chr1 (211-357)||(34086970-34087116)
chr1 (254-367)||(39583143-39583256)
chr1 (255-367)||(42614110-42614222)
chr1 (260-367)||(43727074-43727181)
chr1 (252-366)||(3391165-3391279)
chr1 (201-363)||(51422963-51423126)
chr1 (218-367)||(40887892-40888035)
chr1 (204-355)||(50540769-50540920)
chr1 (180-367)||(2479134-2479306)
chr1 (252-362)||(34318451-34318561)
chr1 (253-358)||(5697523-5697628)
chr1 (257-362)||(9769953-9770058)
chr1 (267-362)||(49822147-49822242)
chr1 (177-367)||(8221210-8221400)
chr1 (252-355)||(49240268-49240371)
chr1 (254-355)||(28429076-28429171)
chr1 (221-367)||(46928959-46929105)
chr1 (255-355)||(30495182-30495282)
chr1 (254-362)||(52703091-52703199)
chr1 (254-357)||(25134895-25134998)
chr1 (263-367)||(36379121-36379225)
chr1 (252-355)||(18347403-18347506)
chr1 (280-362)||(13570773-13570855)
chr1 (278-366)||(41004969-41005057)
chr1 (288-366)||(33151975-33152053)
chr1 (269-358)||(16085595-16085684)
chr1 (256-357)||(42963877-42963978)
chr1 (204-362)||(46087980-46088138)
chr1 (14-78)||(2277087-2277151)
chr1 (269-357)||(44956340-44956428)
chr1 (252-351)||(44718962-44719061)
chr1 (269-357)||(46056411-46056499)
chr1 (300-355)||(7024916-7024971)
chr1 (294-355)||(9169142-9169203)
chr1 (287-355)||(40719554-40719622)
chr1 (180-278)||(9169051-9169149)
chr1 (301-362)||(9894931-9894992)
chr1 (254-366)||(28868987-28869099)
chr1 (300-364)||(33632331-33632395)
chr1 (298-367)||(6814118-6814187)
chr1 (304-356)||(40935893-40935945)
chr1 (280-357)||(10628814-10628891)
chr1 (281-357)||(2028961-2029037)
chr1 (327-367)||(12891644-12891684)
chr1 (180-244)||(22099687-22099750)
chr1 (201-243)||(40719492-40719534)
chr1 (296-367)||(2459579-2459649)
chr1 (180-243)||(7024816-7024879)
chr1 (296-367)||(38058845-38058915)
chr1 (280-362)||(912726-912808)
chr1 (322-364)||(2937458-2937500)
chr1 (283-357)||(27659350-27659424)
chr1 (304-350)||(31434449-31434495)
chr1 (314-362)||(9223953-9224001)
chr1 (314-362)||(27667788-27667836)
chr1 (314-362)||(30899360-30899408)
chr1 (180-243)||(36043400-36043463)
chr1 (314-362)||(39325455-39325503)
chr1 (211-243)||(46369809-46369841)
chr1 (314-362)||(50940136-50940184)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (180-367)||(22564-22751)
[»] chr7 (78 HSPs)
chr7 (180-367)||(43254073-43254260)
chr7 (177-367)||(36246374-36246563)
chr7 (194-367)||(42587381-42587554)
chr7 (175-367)||(10312027-10312219)
chr7 (196-367)||(45686914-45687085)
chr7 (180-366)||(43134375-43134560)
chr7 (180-367)||(40637158-40637345)
chr7 (170-366)||(44596570-44596766)
chr7 (180-367)||(40258827-40259014)
chr7 (180-367)||(47470960-47471146)
chr7 (180-367)||(48313422-48313608)
chr7 (180-366)||(482981-483166)
chr7 (201-367)||(21374624-21374790)
chr7 (182-367)||(44743689-44743874)
chr7 (182-355)||(42375793-42375964)
chr7 (211-367)||(27089654-27089810)
chr7 (211-367)||(27188491-27188647)
chr7 (211-367)||(31511301-31511457)
chr7 (182-366)||(36407200-36407384)
chr7 (180-367)||(21254695-21254881)
chr7 (183-367)||(9487380-9487564)
chr7 (180-367)||(21741941-21742129)
chr7 (211-367)||(35587580-35587736)
chr7 (211-367)||(45222071-45222227)
chr7 (214-367)||(33026881-33027033)
chr7 (207-367)||(33203666-33203826)
chr7 (211-367)||(48832051-48832207)
chr7 (180-351)||(36436124-36436294)
chr7 (203-362)||(27655676-27655835)
chr7 (180-355)||(47587115-47587288)
chr7 (224-367)||(48590728-48590871)
chr7 (211-367)||(40106003-40106159)
chr7 (180-367)||(34709210-34709390)
chr7 (180-355)||(17192452-17192626)
chr7 (210-366)||(17844544-17844700)
chr7 (180-355)||(21313799-21313976)
chr7 (218-355)||(19832000-19832137)
chr7 (252-367)||(12345065-12345180)
chr7 (204-367)||(49148326-49148489)
chr7 (203-357)||(11466047-11466201)
chr7 (256-366)||(23029836-23029946)
chr7 (209-367)||(28425609-28425767)
chr7 (253-367)||(38531181-38531294)
chr7 (180-315)||(32168803-32168938)
chr7 (253-366)||(9485759-9485872)
chr7 (211-362)||(1342777-1342928)
chr7 (216-351)||(38481286-38481421)
chr7 (252-364)||(46879525-46879637)
chr7 (211-362)||(791336-791487)
chr7 (219-338)||(21316611-21316730)
chr7 (252-357)||(46757752-46757857)
chr7 (201-367)||(48620449-48620614)
chr7 (254-357)||(22642259-22642362)
chr7 (275-362)||(40893437-40893524)
chr7 (256-362)||(19757519-19757625)
chr7 (256-362)||(36612114-36612220)
chr7 (271-357)||(35000773-35000859)
chr7 (282-357)||(27869570-27869645)
chr7 (254-357)||(7884691-7884790)
chr7 (252-359)||(21740152-21740258)
chr7 (301-355)||(39698930-39698984)
chr7 (269-322)||(24170803-24170856)
chr7 (257-357)||(45672341-45672441)
chr7 (294-367)||(24170860-24170933)
chr7 (303-355)||(47584185-47584237)
chr7 (284-362)||(22621461-22621539)
chr7 (322-355)||(32168931-32168964)
chr7 (300-364)||(35669619-35669682)
chr7 (280-354)||(39229953-39230027)
chr7 (288-354)||(41406276-41406341)
chr7 (314-367)||(46334761-46334814)
chr7 (288-352)||(981425-981488)
chr7 (314-362)||(31030702-31030750)
chr7 (314-354)||(33979729-33979769)
chr7 (314-362)||(35670292-35670340)
chr7 (314-362)||(37658053-37658101)
chr7 (314-362)||(39869959-39870007)
chr7 (314-362)||(40061276-40061324)
[»] chr4 (119 HSPs)
chr4 (180-367)||(8829806-8829993)
chr4 (180-367)||(12233958-12234145)
chr4 (180-367)||(28307221-28307408)
chr4 (172-367)||(45906097-45906292)
chr4 (180-367)||(53407156-53407342)
chr4 (180-367)||(46895248-46895436)
chr4 (180-367)||(7706338-7706525)
chr4 (180-367)||(11600649-11600836)
chr4 (180-367)||(18582811-18582997)
chr4 (180-367)||(42116862-42117049)
chr4 (180-367)||(56372402-56372588)
chr4 (180-366)||(55764526-55764711)
chr4 (180-367)||(4517182-4517369)
chr4 (180-367)||(19513873-19514059)
chr4 (180-367)||(4392717-4392903)
chr4 (180-367)||(22038348-22038535)
chr4 (180-351)||(35777393-35777564)
chr4 (180-355)||(55495883-55496058)
chr4 (211-367)||(11151930-11152086)
chr4 (180-367)||(8941871-8942057)
chr4 (195-366)||(22892509-22892680)
chr4 (195-366)||(22944173-22944344)
chr4 (204-367)||(52669984-52670147)
chr4 (182-367)||(39087549-39087733)
chr4 (211-367)||(25440475-25440631)
chr4 (211-367)||(27397757-27397913)
chr4 (211-367)||(4939377-4939532)
chr4 (180-367)||(9043601-9043788)
chr4 (211-367)||(23867860-23868016)
chr4 (211-367)||(29413528-29413684)
chr4 (180-367)||(35822290-35822477)
chr4 (180-355)||(37115286-37115460)
chr4 (180-351)||(47417482-47417653)
chr4 (180-355)||(55828970-55829145)
chr4 (180-366)||(37970261-37970446)
chr4 (203-367)||(55856518-55856679)
chr4 (211-367)||(3009708-3009864)
chr4 (252-367)||(9031986-9032101)
chr4 (252-367)||(21369918-21370033)
chr4 (180-367)||(51011056-51011243)
chr4 (214-355)||(31678969-31679110)
chr4 (211-355)||(29663926-29664070)
chr4 (180-355)||(43225680-43225855)
chr4 (253-367)||(26826560-26826674)
chr4 (253-367)||(55358329-55358443)
chr4 (182-367)||(15635910-15636095)
chr4 (180-367)||(4355583-4355763)
chr4 (211-367)||(35468012-35468168)
chr4 (252-362)||(5465406-5465516)
chr4 (189-355)||(35580948-35581114)
chr4 (218-367)||(33114979-33115128)
chr4 (254-367)||(30366137-30366250)
chr4 (253-366)||(56270083-56270196)
chr4 (254-367)||(23162641-23162755)
chr4 (255-367)||(27185623-27185737)
chr4 (180-367)||(44442048-44442234)
chr4 (216-366)||(23113468-23113618)
chr4 (180-334)||(53273084-53273238)
chr4 (201-367)||(31338491-31338659)
chr4 (216-352)||(37831924-37832060)
chr4 (216-362)||(22430637-22430783)
chr4 (252-355)||(11050355-11050458)
chr4 (252-364)||(4391702-4391814)
chr4 (252-360)||(25235183-25235291)
chr4 (275-362)||(21633812-21633899)
chr4 (174-357)||(36196834-36197017)
chr4 (211-362)||(35190612-35190763)
chr4 (276-357)||(20148803-20148884)
chr4 (253-357)||(20511448-20511552)
chr4 (172-288)||(25199366-25199482)
chr4 (211-367)||(36008009-36008152)
chr4 (256-367)||(55684737-55684848)
chr4 (268-357)||(42085723-42085812)
chr4 (254-366)||(43078188-43078300)
chr4 (271-355)||(44525694-44525778)
chr4 (280-355)||(33005111-33005186)
chr4 (208-331)||(29656720-29656843)
chr4 (281-355)||(40497399-40497473)
chr4 (255-357)||(48056607-48056709)
chr4 (256-357)||(4465472-4465573)
chr4 (180-355)||(45780760-45780915)
chr4 (211-308)||(33005178-33005275)
chr4 (254-357)||(37047069-37047172)
chr4 (218-358)||(52707999-52708138)
chr4 (297-362)||(24954217-24954282)
chr4 (254-367)||(36486376-36486489)
chr4 (258-350)||(50502284-50502376)
chr4 (180-299)||(29656597-29656716)
chr4 (297-367)||(42124670-42124740)
chr4 (258-357)||(32101736-32101835)
chr4 (257-367)||(35842600-35842696)
chr4 (280-357)||(31435072-31435149)
chr4 (297-357)||(17715647-17715707)
chr4 (296-355)||(53224309-53224368)
chr4 (280-366)||(52713560-52713646)
chr4 (253-362)||(32948179-32948289)
chr4 (253-359)||(37337678-37337784)
chr4 (285-355)||(41864083-41864153)
chr4 (256-357)||(38048878-38048979)
chr4 (297-362)||(40119903-40119968)
chr4 (218-357)||(30562850-30562988)
chr4 (283-355)||(31953224-31953296)
chr4 (330-367)||(53274812-53274849)
chr4 (314-362)||(20530799-20530847)
chr4 (278-357)||(39068890-39068969)
chr4 (283-357)||(8716919-8716993)
chr4 (301-362)||(3932245-3932306)
chr4 (259-299)||(44525659-44525699)
chr4 (201-244)||(19169164-19169207)
chr4 (298-356)||(26443389-26443447)
chr4 (288-362)||(55495127-55495200)
chr4 (314-359)||(48953143-48953188)
chr4 (301-358)||(49239219-49239276)
chr4 (314-362)||(202403-202451)
chr4 (314-362)||(19912786-19912834)
chr4 (314-362)||(28459725-28459773)
chr4 (314-362)||(30411190-30411238)
chr4 (314-354)||(31624344-31624384)
chr4 (201-241)||(45520095-45520135)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (180-367)||(126750-126936)
[»] scaffold1632 (1 HSPs)
scaffold1632 (180-366)||(28-214)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (252-367)||(431299-431414)
scaffold0002 (256-358)||(119238-119340)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (180-367)||(7027-7213)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (254-367)||(63887-64000)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (180-367)||(28066-28262)
scaffold0197 (211-355)||(30179-30323)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (211-362)||(192013-192164)
scaffold0009 (288-353)||(94351-94415)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (180-333)||(27158-27312)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (252-355)||(53023-53126)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (218-367)||(93376-93525)
scaffold0016 (280-357)||(84325-84402)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (253-355)||(5451-5552)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (180-367)||(41755-41921)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (275-362)||(72760-72847)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (281-355)||(4562-4636)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (275-357)||(9294-9376)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (281-362)||(10833-10914)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (172-351)||(8969-9147)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (177-243)||(36321-36387)
[»] scaffold1360 (1 HSPs)
scaffold1360 (301-362)||(1240-1301)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 109)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 176 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29081467 - 29081276
Alignment:
Q  176 tggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttca 275  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  29081467 tggctctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttca 29081368  T
Q  276 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29081367 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29081276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28677070 - 28676885
Alignment:
Q  182 tgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 281  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28677070 tgtttgggaaaccctaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatga 28676971  T
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28676970 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 28676885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16127321 - 16127134
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16127321 tctgattggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 16127222  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16127221 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 16127134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19948500 - 19948313
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19948500 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttctagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccat 19948401  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19948400 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 19948313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 26540930 - 26541117
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26540930 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 26541029  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26541030 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttacagcttatagcttctcac 26541117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Original strand, 37088258 - 37088441
Alignment:
Q  184 tttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagc 283  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37088258 tttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagc 37088357  T
Q  284 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37088358 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 37088441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37528905 - 37528718
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37528905 tctgtttgggaaacccaaaaaaaaagcttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 37528806  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37528805 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 37528718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2580114 - 2579922
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 274  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  2580114 ttgggtctgtttggttaaccctaaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 2580015  T
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2580014 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 2579922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Original strand, 38185736 - 38185927
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 274  Q
    |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  38185736 ttgggtctgtttggttaacctaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 38185834  T
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38185835 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaacttatagcttatagcttctcac 38185927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 35499572 - 35499758
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  35499572 tctgtttgggaaacccaaaaaaa-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaatctctgtttggtaacactttttcaccat 35499670  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35499671 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 35499758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 44845594 - 44845781
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44845594 tctgtttggttaacctcaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 44845693  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44845694 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 44845781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 50499733 - 50499919
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | | ||||||||||||||||||||||||    
T  50499733 tctgtttggttaacccaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgataaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccat 50499831  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50499832 aagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 50499919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40563548 - 40563358
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  40563548 ggctctgtttggttatccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 40563449  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40563448 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 40563358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 25570349 - 25570536
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25570349 tctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 25570448  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25570449 gagcttatagcttatttcacaagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 25570536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45345189 - 45345003
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45345189 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 45345091  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45345090 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 45345003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Original strand, 52857866 - 52858052
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  52857866 tctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagtttatagcttataagctcgttttacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccat 52857965  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52857966 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtatcgtttgagcttatagcttatagcttctca 52858052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24536736 - 24536549
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||| | |||| | ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24536736 tctgtttcggaaactccaaaaaagagcttttagctcttagcttagagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 24536637  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24536636 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 24536549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 52166272 - 52166086
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||| |||||    
T  52166272 tctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaatctctgtttggcaacactttttgaccat 52166173  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52166172 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttatagcttctca 52166086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Original strand, 8872843 - 8873018
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8872843 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaatactttttcaccat 8872942  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8872943 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 8873018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 54672361 - 54672175
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||    
T  54672361 tctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttga-gaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccat 54672263  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54672262 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataccttatagcttctcac 54672175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 182 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 46248143 - 46247971
Alignment:
Q  182 tgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 281  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46248143 tgtttgggaaacccaaaa-aagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatga 46248045  T
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46248044 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 46247971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 4240279 - 4240435
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4240279 agcttttagcttataacttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 4240378  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4240379 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 4240435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38892172 - 38891981
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 274  Q
    |||| |||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||    
T  38892172 ttgggtctgtttggttaatctaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttc 38892074  T
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38892073 accatgagcttatagcttatttcacgagcctataagctatttttcagaaactattccaagtagcatttgagcttatagcttatatcttctcac 38891981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 52794896 - 52795052
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52794896 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttccccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 52794995  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52794996 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 52795052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29718382 - 29718196
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| || ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| || |||    
T  29718382 tctgtttgggaaaccaaaaaaaaaagcttttagtttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt-catcat 29718284  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29718283 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29718196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 44748967 - 44748793
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748967 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataaacttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 44748869  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748868 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 44748793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 177 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40480206 - 40480028
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    |||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  40480206 ggctctgtttggtacacctcaaaaatgagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcac 40480107  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40480106 catgagcttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40480028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Original strand, 46972003 - 46972189
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |          | |||||||||||||||||| |||||    
T  46972003 tctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaatttatgtttggtaacactttttgaccat 46972102  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46972103 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 46972189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47897786 - 47897601
Alignment:
Q  182 tgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 281  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47897786 tgtttggttaaccgcaaaaaagagcttttaccttttagtttatagcttataaactcatttgacaaaaaaagctctgtttagtaacactttttcaccatga 47897687  T
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47897686 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 47897601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 55305260 - 55305104
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55305260 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 55305161  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55305160 ctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 55305104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37714116 - 37713972
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37714116 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 37714017  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37714016 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37713972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50317180 - 50317024
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||       | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50317180 agcttttaacttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggcaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 50317081  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50317080 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 50317024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49853225 - 49853038
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||| |||||||  || ||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||        ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  49853225 tctgattggtaacacctaaaaaagagcttttaactcttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaggctatctttggtaacactttttcaccat 49853126  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49853125 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 49853038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 46318938 - 46318766
Alignment:
Q  184 tttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatga 281  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46318938 tttggtaacacccaaaa-aagagcttttatctcttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatga 46318840  T
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46318839 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 46318766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 53779008 - 53779188
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  53779008 tctgtttgggaaacctaaaaaaagagcttttagcttttagcttata-------agctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccat 53779100  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53779101 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttataacttctcac 53779188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Original strand, 2121869 - 2121984
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2121869 gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 2121968  T
Q  352 gcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||    
T  2121969 gcttatagcttctcac 2121984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 355
Target Start/End: Original strand, 21707125 - 21707296
Alignment:
Q  184 tttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagc 283  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |        | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21707125 tttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttaacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgaga 21707224  T
Q  284 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21707225 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgagcttatagctt 21707296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Original strand, 2851861 - 2851974
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2851861 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 2851960  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||    
T  2851961 ttatagcttctcac 2851974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 209 - 355
Target Start/End: Original strand, 42217662 - 42217808
Alignment:
Q  209 ttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 308  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42217662 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 42217761  T
Q  309 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42217762 agctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 42217808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 30864412 - 30864583
Alignment:
Q  195 caaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 294  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30864412 caaaaaaagagcttttaacttttagtttatagcttataagct-gtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccattagcttatagcttat 30864510  T
Q  295 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30864511 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 30864583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 211 - 355
Target Start/End: Original strand, 43525744 - 43525888
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43525744 agcttttagcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 43525843  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43525844 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 43525888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12063910 - 12063724
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| || ||||||          |||||||||||||||||||| |||||    
T  12063910 tctgtttggtaaactccaaaaaagagcttttagctcttagtttatagcttataaacttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttgaccat 12063811  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12063810 aagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatatcttatagcttctca 12063724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 258 - 367
Target Start/End: Original strand, 21603846 - 21603955
Alignment:
Q  258 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21603846 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctacttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 21603945  T
Q  358 agcttctcac 367  Q
    ||||||||||    
T  21603946 agcttctcac 21603955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 52225286 - 52225442
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52225286 agcttatagctcatagcttataagctcgtttgacaacaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataag 52225385  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52225386 ctatttttcagaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 52225442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 216 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24628345 - 24628194
Alignment:
Q  216 ttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24628345 ttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatt 24628246  T
Q  316 tttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24628245 tttcagaagctattccaagtaacatttgaacttatagcttatagcttctcac 24628194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46627605 - 46627492
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46627605 tctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaggttataagctaattttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 46627506  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||    
T  46627505 ttatagcttctcac 46627492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Original strand, 51709055 - 51709168
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51709055 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagc 51709154  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    |||||| |||||||    
T  51709155 ttatagtttctcac 51709168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 211 - 355
Target Start/End: Original strand, 48942992 - 48943134
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48942992 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa--tctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 48943089  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48943090 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 48943134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 180 - 359
Target Start/End: Original strand, 33391873 - 33392052
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||        | |||||||||||||||||||||||||    
T  33391873 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagtttttagctcttaacttagagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcacca 33391971  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatag 359  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33391972 tgagcttatagtttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatag 33392052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 258 - 355
Target Start/End: Original strand, 41246297 - 41246394
Alignment:
Q  258 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41246297 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 41246394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 355
Target Start/End: Original strand, 39876622 - 39876759
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||        |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39876622 agcttatagcttataagttcgtttgactaaaaaagctctgtttgataacactttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 39876721  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39876722 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39876759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 367
Target Start/End: Original strand, 30548790 - 30548901
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30548790 tgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30548889  T
Q  356 atagcttctcac 367  Q
    | || |||||||    
T  30548890 acagtttctcac 30548901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 211 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 54542086 - 54541946
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54542086 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttttgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 54541987  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54541986 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttata 54541946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 263 - 367
Target Start/End: Original strand, 42497047 - 42497151
Alignment:
Q  263 taacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42497047 taacactttttcatcatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagttt 42497146  T
Q  363 ctcac 367  Q
    |||||    
T  42497147 ctcac 42497151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 355
Target Start/End: Original strand, 48378200 - 48378371
Alignment:
Q  184 tttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgag 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||          |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  48378200 tttggtaacacccaaaa-aagagcttttacctcttagcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaaaatctgtttggtaacattttttcaccacgag 48378298  T
Q  283 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48378299 tctatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 48378371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44947352 - 44947201
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947352 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataag 44947253  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44947252 ctatttttcagaagctattccaagcagtgtttgagcttatagcttatagctt 44947201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 196 - 330
Target Start/End: Original strand, 47173554 - 47173688
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 295  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||       | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47173554 aaaaaaagagcttatagctcttagcttataggttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttgataacgctttttcaccatgagcttatagcttatt 47173653  T
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattc 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47173654 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattc 47173688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 41518331 - 41518518
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||| |||  || ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||       ||| | ||||||||| |||||| || ||    
T  41518331 tctgtttgataacacctaaaaaagagcttatagtttatagctgatagcttataagctcgtctgataaaaaaagctttctttggtaacgcttttttacaat 41518430  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41518431 gagcttatagcttatttcaagagcttataaactatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcgtctcac 41518518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 315
Target Start/End: Original strand, 44545201 - 44545335
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44545201 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccat 44545299  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44545300 gaacttatagcttatttcacgagcttataagctatt 44545335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 358
Target Start/End: Original strand, 45368580 - 45368758
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| |||        ||||||||||||||| |||||| || |    
T  45368580 tctgtttggtaacacccaaaa-aggagcttatagcttatagctgatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaa 45368678  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368679 caagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttata 45368758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 211 - 357
Target Start/End: Original strand, 193398 - 193544
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  193398 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaatagctctgtttggtaacaattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 193497  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  193498 ctatttttcagatgctattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 193544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42465206 - 42465029
Alignment:
Q  183 gtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 281  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||          | |||||||||||| ||||||  |||||    
T  42465206 gtttggtaacacccaaaa-aagagcttatagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaattatgtttggtaacattttttcggcatga 42465108  T
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 360  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42465107 gcttatagcttatttcacaagtttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagattatagcttatagc 42465029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 283 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45693465 - 45693381
Alignment:
Q  283 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693465 cttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 45693381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 209 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30814403 - 30814261
Alignment:
Q  209 ttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 308  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||        | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30814403 ttagcttatagcttatagcttttaagctcgtttgacaaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttata 30814304  T
Q  309 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30814303 agatatttttcggaaactattccaagtagcgtttgaacttata 30814261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 270 - 367
Target Start/End: Original strand, 51003307 - 51003404
Alignment:
Q  270 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51003307 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 51003404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Original strand, 41785779 - 41785915
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41785779 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataatactttttcaccat 41785878  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41785879 gagcttatagcttatttcatgagcttataggctattt 41785915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 252 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32026519 - 32026409
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32026519 gctctgtttgataatggtttttcaccacgagcttatagtttatttcacaagcttataagctatttttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttata 32026420  T
Q  352 gcttatagctt 362  Q
     ||||||||||    
T  32026419 acttatagctt 32026409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Original strand, 7041105 - 7041218
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||     
T  7041105 tctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttaagcttatagt 7041204  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||||| ||||||    
T  7041205 ttatagcgtctcac 7041218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 253 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29203136 - 29203027
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||||||||  ||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29203136 ctctgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttatag 29203037  T
Q  353 cttatagctt 362  Q
    ||||||||||    
T  29203036 cttatagctt 29203027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 39469914 - 39470056
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  39469914 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttat--- 39470010  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
               |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39470011 -----------aagctattccaagtagcgtttgagtttatagcttatagcttctcac 39470056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 204 - 357
Target Start/End: Original strand, 35100181 - 35100328
Alignment:
Q  204 agcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn--gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacga 301  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||         | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35100181 agcttttagttcttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacg- 35100279  T
Q  302 gcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
           ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35100280 -------agccatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 35100328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 269 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37490017 - 37489931
Alignment:
Q  269 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37490017 ttttccaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37489931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 357
Target Start/End: Original strand, 2598608 - 2598742
Alignment:
Q  223 atagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaga 322  Q
    |||| |||||||||||||||||        |||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2598608 atagcttataagctcgtttgatcaaaaaaactctgtttggtaatgttttttcaccacaaacttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcaga 2598707  T
Q  323 agctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2598708 agttattccaagtagcgtttgagcttataacttat 2598742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Original strand, 20450425 - 20450607
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    |||||||||||| || ||||||| | |||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||| |||        |||||||||||||||| ||||| ||    
T  20450425 ggctctgtttggcaagcccaaaaaacgagcttatagcttatagcggatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacagttttttac 20450524  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatag 359  Q
     |  || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20450525 aacaagtttataacttatttcacgagcttataagttatttttcagacgctattgcaagtagcgtttgtgcttataacttatag 20450607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33898027 - 33897898
Alignment:
Q  228 ttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagcta 327  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33898027 ttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagacgcta 33897928  T
Q  328 ttccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  33897927 ttccaaatagcgtttgaacttataacttat 33897898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 256 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 52595440 - 52595345
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52595440 tgtttggtaatgttttttcaccatgagtttatagcttatttcacaagattataagctatttttcagaagctattccaagtagcgttggagcttata 52595345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 52868266 - 52868184
Alignment:
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  52868266 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctatttcaagtagtgtttgagcttataacttat 52868184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 367
Target Start/End: Original strand, 27446473 - 27446584
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagctt-atagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||    
T  27446473 tgtttggtaacactttttcac-atgagctttatagcttatttcacgagtttatatgctatttttcagaagctatttcaaatagcgtctgagtttataact 27446571  T
Q  355 tatagcttctcac 367  Q
    |||| ||||||||    
T  27446572 tatatcttctcac 27446584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 285 - 362
Target Start/End: Original strand, 5506704 - 5506781
Alignment:
Q  285 tatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5506704 tatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 5506781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 355
Target Start/End: Original strand, 39719361 - 39719498
Alignment:
Q  217 tagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| ||||  ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  39719361 tagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacgtttttt-acaacaagcttatagcttatttcacgagcttataagttatta 39719459  T
Q  317 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39719460 tgaagaagctattccaaatagcgtttgagtttatagctt 39719498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43740384 - 43740325
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 315  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43740384 tgtttggtaacagtttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatt 43740325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37713251 - 37713134
Alignment:
Q  252 gctctgtttg-gtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagct--t 348  Q
    |||||||||| |||||  ||||| || | |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |    
T  37713251 gctctgtttgagtaacggttttttacaacgagcttatagtttattttacgagcttataaactatttttaagaagttattctaagtagcgtttgagcttat 37713152  T
Q  349 atagcttatagcttctca 366  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  37713151 ataacttatagcttctca 37713134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 52931241 - 52931152
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52931241 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat-------------aagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatag 52931155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 32983011 - 32982921
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  32983011 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttat-------tttacgagcttataagctatttttcggaagctatttcaagtaatgcttgagcttatagc 32982921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 283 - 364
Target Start/End: Original strand, 22257726 - 22257807
Alignment:
Q  283 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttct 364  Q
    ||||||||||||||||  |||||||    ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22257726 cttatagcttatttcataagcttattgcttatttttcaaatgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatatcttct 22257807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24350358 - 24350282
Alignment:
Q  269 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgag 345  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  24350358 tttttcaccacgagcttatagtttatttcacgagtttataaattatttttcagacgctgtttcaattagcgtttgag 24350282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 243
Target Start/End: Original strand, 52363003 - 52363075
Alignment:
Q  171 gatattggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga 243  Q
    ||||| || ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52363003 gatatagggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttga 52363075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24536869 - 24536808
Alignment:
Q  182 tgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga 243  Q
    ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24536869 tgtttgggaaactccaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttga 24536808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Original strand, 44545328 - 44545373
Alignment:
Q  322 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44545328 aagctattccaagtaacgtttgagcttataacttatagcttctcac 44545373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 281
Target Start/End: Original strand, 51950326 - 51950427
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||||||  || ||| ||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51950326 tctgtttggtaatacctaaaaaagagtttatcgctcttagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 51950425  T
Q  280 ga 281  Q
    ||    
T  51950426 ga 51950427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 234
Target Start/End: Original strand, 889683 - 889736
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataag 234  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  889683 tctgtttggttaaccctaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataag 889736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 362
Target Start/End: Original strand, 51980820 - 51980892
Alignment:
Q  288 agcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  51980820 agcttttttcacgagcttata-gct-tttttcagaagctatttcaagtagctttttaacttatagctgatagctt 51980892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 358
Target Start/End: Original strand, 612099 - 612200
Alignment:
Q  257 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctta 356  Q
    ||||||||||  ||||| || | |||||||||| || ||| |  |||||||||  |||||| || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  612099 gtttggtaacgattttttacaacgagcttatagtttcttttagaagcttataacttattttccatacgccatttcaagtagcgtttgagcttatagctta 612198  T
Q  357 ta 358  Q
    ||    
T  612199 ta 612200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28394225 - 28394173
Alignment:
Q  191 aacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga 243  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  28394225 aaccccaaaaaagagcttttagcttttaccttataacttataagctcgtttga 28394173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 43359307 - 43359249
Alignment:
Q  294 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43359307 tttcactagcttata-gctttttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagc 43359249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 45693510 - 45693479
Alignment:
Q  258 tttggtaacactttttcaccatgagcttatag 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693510 tttggtaacactttttcaccatgagcttatag 45693479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50938221 - 50938176
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatag 359  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  50938221 tttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagctgatag 50938176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12122173 - 12122110
Alignment:
Q  300 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttct 364  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  12122173 gagcttata-gctttttttgagaagctatttcaagtagcttttaaacttatagcttatagattct 12122110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 354
Target Start/End: Original strand, 22978191 - 22978231
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22978191 tttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagct 22978231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32390100 - 32390052
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  32390100 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 32390052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 36807035 - 36807083
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  36807035 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 36807083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 38732263 - 38732311
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  38732263 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 38732311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40374494 - 40374446
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  40374494 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 40374446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 354
Target Start/End: Original strand, 41888921 - 41888961
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41888921 tttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagct 41888961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43968330 - 43968290
Alignment:
Q  322 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43968330 aagctatttcaagtagcttttgagcttgtagcttatagctt 43968290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44896052 - 44896004
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44896052 tttttaagaagctaattcaagtagcttttgagcttatagcttgtagctt 44896004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 46668454 - 46668502
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  46668454 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 46668502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 49918349 - 49918397
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  49918349 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 49918397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 243
Target Start/End: Original strand, 52788677 - 52788709
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttga 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52788677 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga 52788709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 177 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31100195 - 31100017
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  31100195 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 31100096  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31100095 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31100017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Original strand, 32731725 - 32731915
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  32731725 ggctctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcac 32731824  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32731825 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 32731915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 177 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34233095 - 34232906
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  34233095 ggctctgtttggttatcccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 34232996  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34232995 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 34232906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 12297334 - 12297521
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297334 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttaccttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 12297433  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297434 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 12297521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14227712 - 14227526
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14227712 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaa-gctttgtttggtaacactttttcaccat 14227614  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14227613 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 14227526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 2442394 - 2442581
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2442394 tctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 2442493  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2442494 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcac 2442581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30811326 - 30811139
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30811326 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccat 30811227  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30811226 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 30811139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 20804960 - 20805146
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20804960 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccat 20805058  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20805059 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 20805146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7317788 - 7317602
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |        |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7317788 tctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttaacttatagcttataagttcgtttcacagaaaaagctctgtttggtaacattttttgaccat 7317689  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7317688 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 7317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 558360 - 558517
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  558360 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 558459  T
Q  310 gctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  558460 gctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 558517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31452131 - 31451962
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31452131 tctgtttgggaaaacaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 31452032  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31452031 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctgtttttcagaagctattccaagtagtgtttgagctta 31451962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 355
Target Start/End: Original strand, 10856133 - 10856277
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10856133 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 10856232  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10856233 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 10856277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 218 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12432760 - 12432611
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12432760 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaatctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 12432661  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12432660 tcagaagccattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 12432611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34685161 - 34685006
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34685161 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacattttcac-atgagcttatagcttatttcacgagcttataag 34685063  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34685062 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 34685006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 209 - 355
Target Start/End: Original strand, 33453734 - 33453880
Alignment:
Q  209 ttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 308  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33453734 ttagcttatagcttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 33453833  T
Q  309 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33453834 agctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 33453880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 218 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33540865 - 33540716
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33540865 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacgagcttataatctatttt 33540766  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33540765 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 33540716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Original strand, 5681561 - 5681676
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5681561 gctctgtttggcaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 5681660  T
Q  352 gcttatagcttctcac 367  Q
     |||||||||||||||    
T  5681661 acttatagcttctcac 5681676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Original strand, 5943035 - 5943148
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5943035 tctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagc 5943134  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||    
T  5943135 ttatagcttctcac 5943148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Original strand, 34439683 - 34439838
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34439683 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 34439782  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34439783 ctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttacagcttctca 34439838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 175 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1806496 - 1806343
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 274  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  1806496 ttgggtctgtttggttaacccaaaa-aagagcttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgactaaaaaatctctgtttggtaacactttttc 1806398  T
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1806397 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatt 1806343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6709799 - 6709687
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6709799 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaaattataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 6709700  T
Q  354 ttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||    
T  6709699 ttatagcttctca 6709687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 362
Target Start/End: Original strand, 28076464 - 28076574
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28076464 gctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 28076563  T
Q  352 gcttatagctt 362  Q
    |||||||||||    
T  28076564 gcttatagctt 28076574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 34903929 - 34904103
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34903929 tctgtttgggaaactccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 34904028  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34904029 gagcttatagct-------------tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 34904103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 258 - 367
Target Start/End: Original strand, 2970722 - 2970831
Alignment:
Q  258 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2970722 tttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2970821  T
Q  358 agcttctcac 367  Q
    ||||||||||    
T  2970822 agcttctcac 2970831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 254 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5301705 - 5301593
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5301705 tctgtttggtaatgttttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatagc 5301606  T
Q  354 ttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||    
T  5301605 ttatagcttctca 5301593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3108153 - 3108001
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta-tttcacgagcttataa 309  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3108153 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttggtaacactttttcaccatgagcttataacttaatttcacgagcttataa 3108054  T
Q  310 gctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3108053 gctatttttcagaagctatttcaaatagcgtttgagcttatagcttatagctt 3108001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Original strand, 11015590 - 11015741
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11015590 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttacaag 11015689  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11015690 ctatttttgagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 11015741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 362
Target Start/End: Original strand, 31049379 - 31049485
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31049379 tgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctattccaaatagtgtttgagcttatagctt 31049478  T
Q  356 atagctt 362  Q
    |||||||    
T  31049479 atagctt 31049485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 254 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3636744 - 3636643
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3636744 tctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcctttgaacttatagc 3636645  T
Q  354 tt 355  Q
    ||    
T  3636644 tt 3636643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 217 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29823176 - 29823026
Alignment:
Q  217 tagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  29823176 tagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacattttttcaccatgagctaatagcttattttgcgagcttataagttattt 29823077  T
Q  317 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29823076 ttcaaaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29823026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 268 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12140968 - 12140874
Alignment:
Q  268 ctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12140968 ctttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttatagctt 12140874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29415088 - 29414914
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29415088 tctgtttggtaacacctaaaaaagagtttatagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 29414989  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29414988 gagcttatagcttat-------------aagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29414914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 270 - 362
Target Start/End: Original strand, 21894311 - 21894403
Alignment:
Q  270 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894311 ttttcaccacgagattatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 21894403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 218 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7292688 - 7292539
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||       |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7292688 agcttatagcttataagctcgtcggataaaaaaagctctgtttgataacgcttttttacaatgagcttatagcttatttcagaagcttataagctatttt 7292589  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7292588 tcataagctacttcaagtaacgtttgagcttatagcttatagcgtctcac 7292539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 252 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6104776 - 6104671
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6104776 gctctgtttggtaatggtctttcaccacgagcttatagcttatttcgcgagcttataagctatttttcagatactatttcaagtagcgtttgagcttata 6104677  T
Q  352 gcttat 357  Q
    ||||||    
T  6104676 gcttat 6104671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 355
Target Start/End: Original strand, 23648201 - 23648338
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||        ||||||||||||||  || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648201 agcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 23648300  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  23648301 tcagaagctatttcaagtagcttctgagcttatagctt 23648338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 280 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15591228 - 15591148
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15591228 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttataacttatagc 15591148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 355
Target Start/End: Original strand, 20563400 - 20563538
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||| |||  || | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20563400 agcttatagtttataagcttgtttgataaaaaaaagctctgtttgataatgctctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 20563499  T
Q  317 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20563500 ttcagaagctatttcaagtagcatctgagcttatagctt 20563538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 362
Target Start/End: Original strand, 9896766 - 9896857
Alignment:
Q  271 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9896766 tttcaccacgagcttatagtttatttcacaagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagttaatagcttatagctt 9896857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 254 - 352
Target Start/End: Original strand, 1225475 - 1225573
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1225475 tctgtttgataacactttttcatcaagagcttatattttatttcacaagtttataagctattttttagaagttatttcaagtagcgtttgagcttatag 1225573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 270 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5893981 - 5893894
Alignment:
Q  270 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5893981 ttttcaccacaagcttttagcttattttactagcttataacttattttccagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 5893894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Original strand, 26561419 - 26561487
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagctt 348  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  26561419 gagcttatagtttatttcaggagcttataacttatttttcaaacgctatttcaagtagcgtttgagctt 26561487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 362
Target Start/End: Original strand, 19415351 - 19415432
Alignment:
Q  281 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19415351 agcttatagcgtttttcacgagcttgttgcttatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagtttatagcttacagctt 19415432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32563321 - 32563242
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatag 359  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  32563321 gagcttataacttatttcagaagcttataatttatttttcagacgctatttcaaatagtgtttgagattataacttatag 32563242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 351
Target Start/End: Original strand, 11443033 - 11443086
Alignment:
Q  298 acgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11443033 acgagcttataacctattttccagactctatttcaagtagcgtttgagcttata 11443086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15131473 - 15131386
Alignment:
Q  270 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||| || | ||||||   ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15131473 ttttcatcacgagcttataacttattttactaacttatagcttatttttcagacgctatttcaagtagcatttaagcatatagcttat 15131386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 18801813 - 18801861
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  18801813 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 18801861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 81)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 174 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2236690 - 2236497
Alignment:
Q  174 attggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttttt 273  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  2236690 attgggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacacttttt 2236591  T
Q  274 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2236590 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 2236497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 32382818 - 32383005
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32382818 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccat 32382917  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32382918 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 32383005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8024155 - 8023965
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  8024155 ggctctgtttggttatcccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 8024056  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8024055 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 8023965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 12774545 - 12774732
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774545 tctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 12774644  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12774645 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatatcttctcac 12774732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14647524 - 14647338
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14647524 tctgtttggttaacctaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 14647426  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14647425 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 14647338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 30299667 - 30299854
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30299667 tctgtttagttaacccaaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 30299766  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30299767 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 30299854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 36685785 - 36685972
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36685785 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 36685884  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36685885 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 36685972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1711371 - 1711184
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1711371 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 1711272  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1711271 gagcttataacttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 1711184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 12713281 - 12713468
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12713281 tctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 12713380  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12713381 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttatatcttctcac 12713468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30412780 - 30412593
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30412780 tctgtttgggaaacccaaaaaaaaagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 30412681  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30412680 gagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatatcttctcac 30412593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Original strand, 1174753 - 1174939
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |        | |||||||||||||||||||| |||||    
T  1174753 tctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccat 1174852  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1174853 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 1174939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 177 - 362
Target Start/End: Original strand, 24793938 - 24794123
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  24793938 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 24794037  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794038 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 24794123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 5591558 - 5591744
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5591558 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccat 5591656  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5591657 gagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 5591744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13228640 - 13228454
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13228640 tctgtttgggaaactccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccat 13228542  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13228541 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 13228454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 19525718 - 19525905
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19525718 tctgtttggttaaccctaaaaaagagcttttagcttttaccttatagtttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttcaccat 19525817  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19525818 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 19525905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39744709 - 39744523
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  39744709 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttttgtaacattttttcaccat 39744611  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39744610 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 39744523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 10697240 - 10697424
Alignment:
Q  182 tgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 281  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |        |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10697240 tgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcatttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatga 10697339  T
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10697340 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttctca 10697424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35236836 - 35236649
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35236836 tctgtttggtaaaccaaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcataaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgacca 35236737  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35236736 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctca 35236649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30774356 - 30774174
Alignment:
Q  184 tttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagc 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30774356 tttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccataagc 30774257  T
Q  284 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30774256 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttttagcttctca 30774174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32381840 - 32381655
Alignment:
Q  182 tgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 281  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||         || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32381840 tgtttggttgaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatga 32381741  T
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32381740 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 32381655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4221640 - 4221466
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4221640 tctgtttggttaactcaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccat 4221542  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4221541 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4221466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31169155 - 31168968
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||         ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31169155 tctgtttgggaaactaaaaaaaagagtttttagcttttagtttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaaactctgtttgataacactttttcaccat 31169056  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31169055 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 31168968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 194 - 367
Target Start/End: Original strand, 35639923 - 35640096
Alignment:
Q  194 ccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 293  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||       |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35639923 ccaaaaaaagagcttttagtttttaacttataatttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttgataatactttttcaccatgagtttatagctta 35640022  T
Q  294 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35640023 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 35640096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5998031 - 5997875
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5998031 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataag 5997932  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5997931 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 5997875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19956479 - 19956294
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 274  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||    
T  19956479 ttgggtctctttggttaacctaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttaacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 19956381  T
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19956380 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta-ttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 19956294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 190 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6604068 - 6603891
Alignment:
Q  190 aaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatag 289  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6604068 aaaccccaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccgtgagcttatag 6603969  T
Q  290 cttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603968 cttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 6603891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9160853 - 9160673
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9160853 tctgtttaggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttaacttata-------agctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 9160761  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9160760 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 9160673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12363780 - 12363593
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||    
T  12363780 tctgtttggttaatccagaa-aagagcttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcacca 12363682  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12363681 tgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 12363593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 27130333 - 27130489
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130333 agcttttagcttatagcttataagctcttttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27130432  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130433 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 27130489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35235864 - 35235708
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35235864 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 35235765  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35235764 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 35235708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Original strand, 2671383 - 2671558
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||  |||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671383 tctgtttgggaaactaaaaaaaaaaacttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 2671482  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671483 gagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 2671558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3037593 - 3037406
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||       | | |||||||||||||||||| |||||    
T  3037593 tctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagcttgtttgataaaaaaaggtatgtttggtaacacttttttaccat 3037494  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3037493 gagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 3037406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 204 - 367
Target Start/End: Original strand, 39275416 - 39275579
Alignment:
Q  204 agcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39275416 agcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagc 39275515  T
Q  304 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39275516 ttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 39275579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26699245 - 26699087
Alignment:
Q  209 ttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 308  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26699245 ttagcttatagcttataggttataagctcgtttgacaaataaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 26699146  T
Q  309 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26699145 agctatttttcagaggctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 26699087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26968978 - 26968820
Alignment:
Q  209 ttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 308  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26968978 ttagcttatagcttataggttataagctcgtttgacaaataaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 26968879  T
Q  309 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26968878 agctatttttcagaggctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 26968820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 196 - 366
Target Start/End: Original strand, 3670263 - 3670433
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 295  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |         ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3670263 aaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttatgagctcgtttcacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttgaccatgcgcttatagcttatt 3670362  T
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670363 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 3670433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 218 - 367
Target Start/End: Original strand, 43402451 - 43402600
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43402451 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 43402550  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43402551 tcaaaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 43402600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Original strand, 2178802 - 2178916
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178802 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 2178901  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||    
T  2178902 cttatagcttctcac 2178916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 15443425 - 15443612
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||        | | || |||||||||||||||||||||    
T  15443425 tctgtctgggaaacccaaaaaaagagtttttaacttttagtttatagcttataagttcgtttgacaagtttagttttggttggtaacactttttcaccat 15443524  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15443525 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 15443612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 196 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29392258 - 29392100
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29392258 aaaaaaagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatt 29392160  T
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29392159 tcacgagcttataagctattttttaaaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 29392100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 209 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5382082 - 5381925
Alignment:
Q  209 ttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 308  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5382082 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccacgagcttataacttatttcatgagcttata 5381984  T
Q  309 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5381983 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 5381925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 218 - 367
Target Start/End: Original strand, 15530442 - 15530591
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||         || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15530442 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 15530541  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530542 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 15530591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 196 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9587339 - 9587179
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 294  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||         | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9587339 aaaaaaagagcttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttat 9587240  T
Q  295 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9587239 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 9587179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 211 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 39246973 - 39246830
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39246973 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt-caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 39246875  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39246874 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39246830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11063003 - 11062888
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11063003 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 11062904  T
Q  352 gcttatagcttctcac 367  Q
    | ||||||||||||||    
T  11062903 gtttatagcttctcac 11062888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Original strand, 19347705 - 19347857
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 309  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19347705 agcttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 19347804  T
Q  310 gctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19347805 gctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 19347857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Original strand, 3669510 - 3669685
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||| ||||  || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3669510 tctgttttgtaacacctaaaaaagagcttttagctcttagcttatagtttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccat 3669609  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
     | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3669610 aaacttgtagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagctt 3669685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Original strand, 4379300 - 4379414
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  4379300 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataa 4379399  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
    ||||||| |||||||    
T  4379400 cttatagtttctcac 4379414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6893533 - 6893372
Alignment:
Q  192 acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagct 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6893533 acccaaaa-aagagctgttagctcttagcttatagtttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagct 6893436  T
Q  292 tatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6893435 tatttcacgagcttataaactagttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 6893372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Original strand, 7651682 - 7651796
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7651682 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagctatttcaagtagtgtttgagcttatag 7651781  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||    
T  7651782 cttatagcttctcac 7651796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13157054 - 13156879
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13157054 tctgtttgaaaaaccccaaaaaagagcttttagcttttaccttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 13156955  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13156954 taacttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgagcttatagctt 13156879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36028086 - 36027972
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  36028086 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataa 36027987  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||    
T  36027986 cttatagcttctcac 36027972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11664043 - 11663881
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 295  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  11664043 aaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccataagtttatagcttatt 11663944  T
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11663943 tcacgagcttataagttatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttata 11663881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 254 - 361
Target Start/End: Original strand, 5521341 - 5521448
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5521341 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagtttatagc 5521440  T
Q  354 ttatagct 361  Q
    ||||||||    
T  5521441 ttatagct 5521448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22977301 - 22977186
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22977301 gctctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataaactatttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttata 22977202  T
Q  352 gcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||    
T  22977201 gcttatagcttctcac 22977186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 218 - 357
Target Start/End: Original strand, 648538 - 648677
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||        ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  648538 agcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 648637  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  648638 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 648677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 211 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11100899 - 11100753
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||        |||||||||||||||   |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11100899 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgtctttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataag 11100800  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11100799 ctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 11100753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Original strand, 16474771 - 16474922
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||        ||||||||||||||   | | | |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16474771 agcttatagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaatagctctgtttggtaatggtctcttaccacgagcttatagtttatttcacgagattataag 16474870  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16474871 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 16474922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9627246 - 9627143
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  9627246 tgtttgataacacttttttacaatgagcttatagcttatttcagaagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttataactt 9627147  T
Q  356 atag 359  Q
    ||||    
T  9627146 atag 9627143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 252 - 362
Target Start/End: Original strand, 23920498 - 23920608
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |    
T  23920498 gctctgtttggtaactatctttcaccaggagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagtgtttgaacttaga 23920597  T
Q  352 gcttatagctt 362  Q
    | |||||||||    
T  23920598 gtttatagctt 23920608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 252 - 357
Target Start/End: Original strand, 13936233 - 13936338
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13936233 gctctgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttata 13936332  T
Q  352 gcttat 357  Q
    ||||||    
T  13936333 gcttat 13936338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 252 - 357
Target Start/End: Original strand, 2497604 - 2497709
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2497604 gctctatttggtaatgctttttcaccatgagattataacttatttcacgagcttataagttatttttcaaaagctattctaaatagcgtttgagcttata 2497703  T
Q  352 gcttat 357  Q
     |||||    
T  2497704 acttat 2497709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 367
Target Start/End: Original strand, 4875689 - 4875800
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4875689 tgtttggtaacatttttttactacgagtttatagtttattttaggagtttataagctattttttaaaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagctt 4875788  T
Q  356 atagcttctcac 367  Q
    ||||||| ||||    
T  4875789 atagcttttcac 4875800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6280550 - 6280437
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  6280550 ctctgtttgatgacgctttttcatcatgagcttatagtttatttcacgggtttataaactatttttcataagttatttcaagtagcatttaagcttatag 6280451  T
Q  353 cttatagcttctca 366  Q
    |||||| |||||||    
T  6280450 cttataacttctca 6280437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42323701 - 42323596
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||   |||| |||||| | |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42323701 tctgtttggtaatgtttttgcaccataaccttataacatattttacgagtttataagctatttttcagacgctattctaagtagtgtttgagcttatagc 42323602  T
Q  354 ttatag 359  Q
    ||||||    
T  42323601 ttatag 42323596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 269 - 357
Target Start/End: Original strand, 13921783 - 13921871
Alignment:
Q  269 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  13921783 ttttttaccacgaacttataacttatttcacgagcttaaaagctatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgaacttataacttat 13921871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Original strand, 6349426 - 6349496
Alignment:
Q  297 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6349426 cacgagcttataaactatttttcagacgctattctaagtagcgtttgagcttatagcttataacttatcac 6349496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4657652 - 4657591
Alignment:
Q  297 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4657652 cacgagcttataagctatttttcagaaactatttcaagtagagtttgagcttatagcttata 4657591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27005919 - 27005844
Alignment:
Q  283 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27005919 cttatagcttatttcaagagcttataacttattttccaaacgctatttcaagtaacgtttgagcttatagcttata 27005844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 351
Target Start/End: Original strand, 31407980 - 31408062
Alignment:
Q  269 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| || |||||    
T  31407980 tttttcagcacgagttaataacttatttcacgagcttataagctatttgtcagacgctattccaattagcgtttaagattata 31408062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32321730 - 32321652
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  32321730 gagcttatagcttatttcacgaacttacaacttatttttcagactctatttcaaataacgtttgagcttatagcttata 32321652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25872376 - 25872221
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  25872376 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagcttttagctcgtagcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacca 25872278  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||| ||||||    ||||                ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25872277 tgaacttata----attt----------------atttttcagaagctattccaagtagagtttgagcttatagctt 25872221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 358
Target Start/End: Original strand, 33694719 - 33694823
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||| || || ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  | ||||    
T  33694719 tctgtttgggaatagttttttaccacgagcttataatttattttacaagtttataagttatttttcagacgttattcgaagtagcgtttgagtctgtagc 33694818  T
Q  354 ttata 358  Q
    |||||    
T  33694819 ttata 33694823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41472006 - 41471900
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacact-ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttat 350  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |  | ||| |||||||||||| |||||| ||   |||||| |||| |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  41472006 gctctgtttggtaacagtcttttcacaacaaacttgtagcttatttcaggagcttttagcttattttccagacgctatttcaaatagtgtttgagcttat 41471907  T
Q  351 agcttat 357  Q
    |||||||    
T  41471906 agcttat 41471900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 358
Target Start/End: Original strand, 7896599 - 7896659
Alignment:
Q  297 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7896599 cacgagcttataagctatttt-caaacgctatttcaaatagcgtttgagtttatagcttata 7896659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18480630 - 18480557
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  18480630 gagcttatatcttatttcacaagcttatagtttattttttagacgctatctcaagtagcatttgagcttatagc 18480557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22977364 - 22977330
Alignment:
Q  209 ttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22977364 ttagcttatagcttatagtttataagctcgtttga 22977330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7948424 - 7948376
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  7948424 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 7948376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 13019107 - 13019155
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  13019107 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 13019155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 354
Target Start/End: Original strand, 15524477 - 15524517
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15524477 tttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagct 15524517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20768854 - 20768806
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  20768854 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 20768806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12894 - 12707
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12894 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 12795  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12794 gagcttatagcttatttgacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagcttatagcttctcac 12707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 86)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 3377360 - 3377546
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3377360 tctgtttggttaacccaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 3377458  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3377459 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 3377546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 16486850 - 16487036
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16486850 tctgtttggttaacccaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 16486948  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16486949 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 16487036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4453700 - 4453510
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  4453700 ggctctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 4453601  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4453600 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttctcac 4453510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28382859 - 28382667
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 274  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  28382859 ttggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 28382760  T
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28382759 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 28382667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36712712 - 36712523
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  36712712 ggctctgtttggttatccaaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 36712614  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36712613 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 36712523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38579185 - 38579000
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  38579185 ggctctgtttggttaaccctaaaaaagaacttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 38579086  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38579085 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 38579000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 650953 - 650767
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  650953 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttt-agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 650855  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650854 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 650767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2266325 - 2266139
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  2266325 tctgtttgggaaacccaaaaaaaaa-cttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccat 2266227  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2266226 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 2266139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8689135 - 8688949
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689135 tctgtttggttaaccccaaa-aagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 8689037  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689036 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 8688949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13111917 - 13111729
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgttt-ggtaacactttttcacca 278  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13111917 tctgtttgggaaaccccaaaaaatagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttttggtaacactttttcacca 13111818  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13111817 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 13111729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 21865213 - 21865401
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  21865213 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacca 21865312  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21865313 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 21865401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 9886960 - 9887146
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9886960 tctgtttggttaacctaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 9887058  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9887059 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcataagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 9887146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 36999457 - 36999643
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36999457 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 36999555  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36999556 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 36999643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Original strand, 41322739 - 41322910
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41322739 aaaaaaagagcttttagcttttatcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 41322838  T
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41322839 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 41322910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2546498 - 2546311
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||  |||| |||||    
T  2546498 tctgtttgagaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaaattttaaccat 2546399  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2546398 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 2546311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Original strand, 5039742 - 5039917
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5039742 tctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccgt 5039841  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5039842 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 5039917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40025116 - 40024929
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  40025116 tctgtttgggaaactccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcatataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccat 40025017  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40025016 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcctttgagcttatagcttatagcttctcac 40024929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24402219 - 24402039
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24402219 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttata-------agctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 24402127  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24402126 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 24402039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Original strand, 37356151 - 37356323
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 294  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356151 aaaaaaagagtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 37356250  T
Q  295 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356251 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 37356323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 204 - 367
Target Start/End: Original strand, 15521470 - 15521633
Alignment:
Q  204 agcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15521470 agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaaaactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 15521569  T
Q  304 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15521570 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 15521633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41796916 - 41796741
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41796916 tctgtttggtaaaccaataaaaagagcttttagctcttagcttatagtttataagctcgttttataaaaaaagctctgtttcgtaacactttttgaccat 41796817  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796816 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 41796741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 184 - 362
Target Start/End: Original strand, 8815185 - 8815362
Alignment:
Q  184 tttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagc 283  Q
    |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8815185 tttggttaactcaaaa-aagagcctttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagc 8815283  T
Q  284 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8815284 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 8815362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 182 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4038511 - 4038339
Alignment:
Q  182 tgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 281  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4038511 tgtttggttaacccaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttacaagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatga 4038413  T
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4038412 gcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4038339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43507705 - 43507549
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43507705 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 43507606  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43507605 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 43507549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6760778 - 6760603
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6760778 tctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccat 6760679  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6760678 gagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 6760603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10839753 - 10839567
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10839753 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagaacttttagcttttagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 10839655  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10839654 gagcttatatcttatttcactagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 10839567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17263920 - 17263740
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||        ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17263920 tctgtttggaaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttata-------agctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacatgttttcaccat 17263828  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17263827 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 17263740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 367
Target Start/End: Original strand, 39167756 - 39167905
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39167756 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 39167855  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39167856 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 39167905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 26911479 - 26911665
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||    
T  26911479 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagcttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa-ctctctttggtaacactttttcacca 26911576  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26911577 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 26911665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Original strand, 43135597 - 43135759
Alignment:
Q  192 acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagct 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43135597 acccaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttgataacactttttcatcatgagcttatagct 43135695  T
Q  292 tatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43135696 tatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 43135759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 29514832 - 29514987
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29514832 agcttttagcttttagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccaagagcttatagcttatttcacgagcttataag 29514930  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29514931 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29514987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 38880957 - 38880770
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |         | |||||||||||||||||||| ||||    
T  38880957 tctgtttggtaaattcaaaaaaagagcttttaactcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgacca 38880858  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38880857 tgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 38880770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 209 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10393180 - 10393022
Alignment:
Q  209 ttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 308  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10393180 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 10393081  T
Q  309 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10393080 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagtttatagcttatagtttctcac 10393022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7400493 - 7400383
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7400493 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 7400394  T
Q  352 gcttatagctt 362  Q
    |||||||||||    
T  7400393 gcttatagctt 7400383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 212 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31616528 - 31616385
Alignment:
Q  212 gcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagc 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31616528 gcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagc 31616429  T
Q  312 tatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31616428 tatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 31616385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 201 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4385678 - 4385524
Alignment:
Q  201 aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4385678 aagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagtttatagcttatttcacg 4385579  T
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4385578 agcttataagctatttttcagaaactatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 4385524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 201 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6232433 - 6232267
Alignment:
Q  201 aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6232433 aagagcttttagctcttagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaatattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagtttatttcacg 6232334  T
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6232333 agcttataagctatttttcagaagatatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagtttctcac 6232267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 209 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40869504 - 40869358
Alignment:
Q  209 ttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40869504 ttagcttatagcttatagtttataagctcatttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 40869405  T
Q  309 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40869404 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40869358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Original strand, 44275630 - 44275815
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |          | |||||||||||||||||| ||||     
T  44275630 tctgtttggtaaacctaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaat-tatgtttggtaacactttttgaccac 44275728  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275729 gagcttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagttattccaattagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 44275815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 256 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8070718 - 8070607
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8070718 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagttt 8070619  T
Q  356 atagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||    
T  8070618 atagcttctcac 8070607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 201 - 367
Target Start/End: Original strand, 8339967 - 8340133
Alignment:
Q  201 aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacg 300  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||        | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  8339967 aagagcttttagctcttaacttatagtttataagttcgtttgacgaaaaaagttctgtttggtaacactttttcatcatgagcttatagtttattttacg 8340066  T
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8340067 aatttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttaaagcttatagcttctcac 8340133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Original strand, 38842838 - 38842988
Alignment:
Q  216 ttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38842838 ttagcttatagtttataagttcgtttgataaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataaactatt 38842937  T
Q  316 tttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38842938 tttcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttataacttctca 38842988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 201 - 367
Target Start/End: Original strand, 10727818 - 10727984
Alignment:
Q  201 aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacg 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||       | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10727818 aagagtttttaacttttagcttatagcttattagcccgtttgataaaaaaagttctgtttgataacactttttcatcataagcttatagcttatttcacg 10727917  T
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10727918 aacttataagctatttttcaaaaactattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 10727984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13528081 - 13527891
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 274  Q
    |||| |||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        |||||||| |||||||| |||||    
T  13528081 ttgggtctgtttggttaaccaaaaaaaag--cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttcggtaacaccttttc 13527984  T
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13527983 accatgagtttataacttatttcacaagtttataagctatttttcagaagctatttcaagtaacgtttgaacttatagcttataacttctcac 13527891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 18212087 - 18212260
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18212087 tctgtttggttaaccccaaaaaggagcttttagcttttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 18212186  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18212187 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt--------------caagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 18212260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 355
Target Start/End: Original strand, 43285657 - 43285760
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43285657 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagtttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttata 43285756  T
Q  352 gctt 355  Q
    ||||    
T  43285757 gctt 43285760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 254 - 355
Target Start/End: Original strand, 42132708 - 42132809
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42132708 tctgtttggtaacaccttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagc 42132807  T
Q  354 tt 355  Q
    ||    
T  42132808 tt 42132809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 253 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7213762 - 7213664
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7213762 ctctgtttgataatactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgtgcttata 7213664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 24019948 - 24020030
Alignment:
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24019948 accacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 24020030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9053226 - 9053117
Alignment:
Q  258 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  9053226 tttggtaacacttattcaccatgaactaatagtttatttcacgagcttataaactattcttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttac 9053127  T
Q  358 agcttctcac 367  Q
    ||||||||||    
T  9053126 agcttctcac 9053117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 263 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2047411 - 2047308
Alignment:
Q  263 taacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2047411 taacactttttcac-atgagtttatagcttatttcatgagtttataagctatttttcagaagttattctaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 2047313  T
Q  363 ctcac 367  Q
    |||||    
T  2047312 ctcac 2047308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 280 - 362
Target Start/End: Original strand, 25071437 - 25071519
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25071437 gagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 25071519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 271 - 362
Target Start/End: Original strand, 15250163 - 15250254
Alignment:
Q  271 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15250163 tttcaccacgagcttatagcttatttctcgagcttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagtttatagctt 15250254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 357
Target Start/End: Original strand, 16669119 - 16669196
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16669119 gagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 16669196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23357063 - 23356976
Alignment:
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23357063 accacgagcttatagcttatttcacgagcttatatgctatttttcagaagctatttcaagtagcgtctgagcttatagcttttagctt 23356976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Original strand, 4055951 - 4056039
Alignment:
Q  274 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4055951 caccacgagcttatagcttatttcacgagcttattagctatttttcagacactattccaaatagcgtttgaacttatagcttatagctt 4056039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 280 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7823621 - 7823534
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7823621 gagcttgtagcttatttcacgagcttataagctattttttataagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcatctcac 7823534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Original strand, 598931 - 599045
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||| |||||||| |||||| || | ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  598931 ctctgcttggtaacgcttttttacaacgagtttatagtttatttcaaaagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatag 599030  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
     ||||||| ||||||    
T  599031 tttatagcgtctcac 599045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Original strand, 2221446 - 2221534
Alignment:
Q  270 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  2221446 ttttcaccatgagtttatagtttatttcacgagcttctaagctatttttcagacgctattccaagtaacgtttgaacttataacttata 2221534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 351
Target Start/End: Original strand, 2758874 - 2758969
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||| ||| ||||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2758874 tgtttggtgacagttttttacaacgagcttataacttatttcatgagcttataagctattttttagacgctattccaagtagcgtttgagcttata 2758969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5520211 - 5520060
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||          |||||||| |||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  5520211 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgtaaaaaaaaactctgtttagtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagtttataag 5520112  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5520111 ctatttttcagatgctattacaaatagcgtttgagcttatagcatatagctt 5520060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6222708 - 6222636
Alignment:
Q  285 tatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  6222708 tatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagcagcatttgaacttatagcttat 6222636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6153622 - 6153461
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        | | |||||||||| ||||||| ||||    
T  6153622 tctgtttggtaacatccaaaa-aagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagttttgtttggtaaaacttttttacca 6153525  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||             ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6153524 tgagcttatagcttat-------------aagctatttttcagaagttattccaagtagtgtttgagcttatagctt 6153461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 288
Target Start/End: Original strand, 18710173 - 18710265
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttata 288  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18710173 aaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttata 18710265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 355
Target Start/End: Original strand, 18710257 - 18710312
Alignment:
Q  300 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710257 gagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 18710312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 360
Target Start/End: Original strand, 39675059 - 39675166
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    |||| |||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||     
T  39675059 ctctatttggtaaaacttttttacaatgaacttataacttatttcaagagtttataagatatttttcaaaagctgcttcaagtagcgtttgagcttataa 39675158  T
Q  353 cttatagc 360  Q
    ||||||||    
T  39675159 cttatagc 39675166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 357
Target Start/End: Original strand, 41877821 - 41877883
Alignment:
Q  295 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41877821 ttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagtgtttgagcttatagcttat 41877883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 355
Target Start/End: Original strand, 34884866 - 34884952
Alignment:
Q  269 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34884866 ttttccaccacgagtttatagtttatttcacgagcttatagcctatttttcagactctattccaagtagtgtttcagcttatagctt 34884952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 357
Target Start/End: Original strand, 13761842 - 13761900
Alignment:
Q  297 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761842 cacgagcttataagctatttttcagaagtta--ccaagtagcgtttgagcttatagcttat 13761900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 355
Target Start/End: Original strand, 37674497 - 37674561
Alignment:
Q  291 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37674497 ttatttcacgagcttgtaaactatattttagacgctattccaagtagcgtttgagtttatagctt 37674561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 355
Target Start/End: Original strand, 7569853 - 7569908
Alignment:
Q  300 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  7569853 gagcttataagctatttttcagaagttattttaagtaacgtttgagcttatagctt 7569908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13351660 - 13351603
Alignment:
Q  297 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13351660 cacgagtttataa-ctatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 13351603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 357
Target Start/End: Original strand, 6807492 - 6807537
Alignment:
Q  312 tatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6807492 tatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 6807537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7511764 - 7511704
Alignment:
Q  300 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 360  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7511764 gagcttataagctatttttcaaaagctacttagagtagcatttgagcttatagcttatagc 7511704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7516048 - 7515988
Alignment:
Q  300 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 360  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7516048 gagcttataagctatttttcaaaagctacttagagtagcatttgagcttatagcttatagc 7515988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44525973 - 44525925
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44525973 tttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagcttatagctt 44525925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 288
Target Start/End: Original strand, 7569775 - 7569861
Alignment:
Q  203 gagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttata 288  Q
    ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7569775 gagcttttaactctcagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttata 7569861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33850201 - 33850121
Alignment:
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||   |||| | || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33850201 catgagcttatagcgtatttcactagtttatagcttattctccatacgctatttcaagtagcgtttgagtttatagcttat 33850121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2689145 - 2689067
Alignment:
Q  278 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  2689145 atgagcttatagcttatttcagaagct-atagtttattttccaaaagctatttcaagtagcgtttgaacttataacttat 2689067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 354
Target Start/End: Original strand, 10361481 - 10361546
Alignment:
Q  288 agcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||||||    
T  10361481 agcttttttcacgagcttataa-ctttttttaagaagctatttcaagtagttttttagcttatagct 10361546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 362
Target Start/End: Original strand, 43496281 - 43496323
Alignment:
Q  320 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43496281 agaagctatttcaagtagcttttgagcttatagcttgtagctt 43496323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 225
Target Start/End: Original strand, 29514812 - 29514853
Alignment:
Q  184 tttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttata 225  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29514812 tttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttata 29514853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7454497 - 7454449
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  7454497 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 7454449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18109701 - 18109653
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  18109701 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 18109653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26340020 - 26339972
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  26340020 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 26339972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32482231 - 32482183
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  32482231 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 32482183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Original strand, 17115504 - 17115694
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  17115504 ggctctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 17115603  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17115604 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 17115694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Original strand, 31581660 - 31581850
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  31581660 ggctctgtttggttatccaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 31581759  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581760 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 31581850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 171 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45141640 - 45141445
Alignment:
Q  171 gatattggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactt 270  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  45141640 gatattgggtctgtttggttaatccaaaa-aagagtttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactt 45141542  T
Q  271 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45141541 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 45141445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44827497 - 44827307
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  44827497 ggctctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 44827398  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44827397 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 44827307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 6338287 - 6338474
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6338287 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttctagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttggtaacacttttttaccat 6338386  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6338387 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 6338474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 25023275 - 25023462
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25023275 tctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 25023374  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25023375 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 25023462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 28716633 - 28716820
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28716633 tctgtttgggaaaacccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 28716732  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28716733 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 28716820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 31478045 - 31478232
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478045 tctgtttggttaaccccaaaagagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 31478144  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478145 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 31478232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 172 - 367
Target Start/End: Original strand, 32541184 - 32541379
Alignment:
Q  172 atattggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttt 271  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  32541184 atataggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 32541283  T
Q  272 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32541284 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 32541379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 10618776 - 10618962
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||       | | ||||||||||||||||||||||||    
T  10618776 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccat 10618874  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618875 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 10618962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 16422799 - 16422985
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16422799 tctgtttggttaacccaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcctataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttagtaacactttttcatcat 16422897  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422898 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 16422985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Original strand, 17081623 - 17081798
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17081623 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 17081722  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17081723 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 17081798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36681608 - 36681437
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 295  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36681608 aaaaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 36681509  T
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36681508 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 36681437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 39702275 - 39702462
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39702275 tctgtttgggaaactaaaaaaaagaacttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacataaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 39702374  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39702375 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 39702462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 23676840 - 23677028
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        | ||| |||||||||||||||||||||    
T  23676840 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctctttggtaacactttttcacca 23676939  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23676940 tgagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 23677028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38171604 - 38171417
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38171604 tctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttgttcaccat 38171505  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38171504 gagcttatagcttatttcacgagcttataagttgtttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 38171417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1894019 - 1893843
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||    
T  1894019 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcacca 1893920  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1893919 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagctt 1893843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 179 - 367
Target Start/End: Original strand, 39871234 - 39871420
Alignment:
Q  179 ctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||    
T  39871234 ctctgtttgggaaactaaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctatttggtaacactttttcacca 39871331  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39871332 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttatagcttctcac 39871420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Original strand, 8270891 - 8271062
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 295  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8270891 aaaaaaagagcttttagtttttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatt 8270990  T
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8270991 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 8271062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Original strand, 28709276 - 28709451
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28709276 tctgtttgggaaaacccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 28709375  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28709376 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 28709451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 42142912 - 42142727
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  42142912 tctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccat 42142813  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42142812 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagtgtttgagcttatagcttatagcttctc 42142727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 27781102 - 27781258
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27781102 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27781201  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27781202 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 27781258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37560706 - 37560521
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |        | |||||||||||||||||||| | |||    
T  37560706 tctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgatcat 37560607  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctc 365  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37560606 gaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctc 37560521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 204 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43276924 - 43276773
Alignment:
Q  204 agcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 303  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43276924 agcttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 43276825  T
Q  304 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43276824 ttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 43276773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 180 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22878102 - 22877918
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  22878102 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagcttatagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacca 22878004  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttct 364  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22878003 tgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctcagtagcgtttgagcttatagcttatagtttct 22877918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39320212 - 39320056
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39320212 agcttttagcttatagcttataaattcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 39320113  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  39320112 ctatttttcagaagctattccaagtagcgttcgagcttataacttatagcttctcac 39320056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 218 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31688189 - 31688052
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31688189 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 31688090  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31688089 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31688052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41694055 - 41693896
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn---gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41694055 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaatttttagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat 41693956  T
Q  308 aagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41693955 aagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagtttctcac 41693896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40223260 - 40223074
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn--gctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||          ||||||||||||||||||||  |||    
T  40223260 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagcttttagctcttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaaagctctgtttggtaacacttt--cac 40223164  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40223163 catgagcttatagcttatttcacgagcttataa-ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 40223074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 211 - 355
Target Start/End: Original strand, 41313375 - 41313519
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41313375 agcttttagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 41313474  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41313475 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 41313519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37587901 - 37587720
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttt 272  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||    
T  37587901 ttgggtctgtttggtaacacccaaaa-aagagtttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacactttt 37587803  T
Q  273 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37587802 tcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttttagctt 37587720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Original strand, 32099505 - 32099681
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnng-ctctgtttggtaacactttttcacc 277  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||          ||||||||| |||||||||||||||    
T  32099505 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagcttatagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaatctctgtttgataacactttttcacc 32099603  T
Q  278 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32099604 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 32099681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11298218 - 11298031
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11298218 tctgtttggtaacacccaaaa-aagaggttatagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacattttttcatca 11298120  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298119 tcagcttatagcttatttcacgagcttataagatatttttcagaagctattccaaataacgtttgagcttatagcttatagcttctcac 11298031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 24652237 - 24652423
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||| |||||    
T  24652237 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagcttttacctcttatcttatagcttataagctcgtttgacaaagaaagttctgtttggtaacactttt-cacca 24652334  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24652335 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagccattttttagaagctatttcaagtagcatttgagcttatagcttatagcttctcac 24652423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2642523 - 2642409
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2642523 gctctgtttggtaatattttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 2642424  T
Q  352 gcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||    
T  2642423 gcttatagcttctca 2642409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 36112944 - 36112843
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36112944 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 36112845  T
Q  354 tt 355  Q
    ||    
T  36112844 tt 36112843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 362
Target Start/End: Original strand, 44157240 - 44157348
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44157240 tctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 44157339  T
Q  354 ttatagctt 362  Q
    |||||||||    
T  44157340 ttatagctt 44157348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Original strand, 36590180 - 36590292
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36590180 tctgtttggtaacacttttttaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagctt-tagc 36590278  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||    
T  36590279 ttatagcttctcac 36590292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34395525 - 34395348
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnng-ctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34395525 tctgtttggtaaaccttaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaactctgtttgataacactttttgacca 34395426  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctat-ttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34395425 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttttcagaagctattcaaagtagcgtttgaacttatagctt 34395348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11741198 - 11741093
Alignment:
Q  262 gtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagct 361  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11741198 gtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaatctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagct 11741099  T
Q  362 tctcac 367  Q
    ||||||    
T  11741098 tctcac 11741093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 211 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3427767 - 3427623
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||        ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3427767 agcttatagcttataggttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcaccatgaccttatagcttatttcacgagcttataag 3427668  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3427667 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 3427623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 355
Target Start/End: Original strand, 9210958 - 9211130
Alignment:
Q  182 tgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 281  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| | ||||||        |||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  9210958 tgtttgataaacccaaaa-aagagcttttaattcttagcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaagctccgtttgataacactttttgaccatga 9211056  T
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9211057 gcttataacttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatcccaagtagcgtttgagcttatagctt 9211130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 218 - 357
Target Start/End: Original strand, 13969982 - 13970121
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13969982 agcttatagcttataagctcgtttgatcaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 13970081  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13970082 tcagacgctattcgaagtagcgtttgagcttatagcttat 13970121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29189872 - 29189717
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||       ||||||||| |||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29189872 agcttatagcttatagcttataaactcgtttgataagaaaagctctgtttagtaacggttttttactacgagcttatagcttatttcacgagcttatatg 29189773  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29189772 ttatttttaagaagctattccaagtagcgtttgagcttacagcttatagcttctca 29189717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 252 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 39747044 - 39746938
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39747044 gctctgtttggtaatgttttttcaccacgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttata 39746945  T
Q  352 gcttata 358  Q
    |||||||    
T  39746944 gcttata 39746938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 257 - 366
Target Start/End: Original strand, 3511264 - 3511373
Alignment:
Q  257 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctta 356  Q
    |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3511264 gtttggtaatgctttttagccatgagcttgtagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagctta 3511363  T
Q  357 tagcttctca 366  Q
    ||||||||||    
T  3511364 tagcttctca 3511373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 270 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35243439 - 35243342
Alignment:
Q  270 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35243439 ttttcaccacgagcttatatcttatttcacgagcttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 35243342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43849346 - 43849202
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  43849346 agcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttt 43849247  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43849246 tcagatgctattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 43849202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 360
Target Start/End: Original strand, 7378889 - 7378997
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  7378889 gctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagtgtttgagcttata 7378988  T
Q  352 gcttatagc 360  Q
    |||||||||    
T  7378989 gcttatagc 7378997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 216 - 362
Target Start/End: Original strand, 38780666 - 38780812
Alignment:
Q  216 ttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||       | ||||||||  ||   |||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  38780666 ttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttgacaatgatttttcaccacgaacttataacttattttacgagcttataaactatt 38780765  T
Q  316 tttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38780766 tttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 38780812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 364
Target Start/End: Original strand, 22957354 - 22957462
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  22957354 tgtttcgtaacatttttttaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagttatttttcagaagctattctaagtagtgtttgagtttatagttt 22957453  T
Q  356 atagcttct 364  Q
    |||||||||    
T  22957454 atagcttct 22957462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1363895 - 1363793
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1363895 tctgtttggtaatatttttttaccatgagcttataacttatttcacgagtttataagctattattcagacgctattctaagtagcgtttgaacttatagc 1363796  T
Q  354 tta 356  Q
    |||    
T  1363795 tta 1363793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 2855146 - 2855228
Alignment:
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2855146 accacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 2855228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 367
Target Start/End: Original strand, 40551856 - 40551964
Alignment:
Q  258 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  40551856 tttggtaacattttttcaccatgagtttatagcttatttcatgagcttat-agctatttttcagaagctatttcagatagcgtttgagcttatagtttat 40551954  T
Q  358 agcttctcac 367  Q
    | || |||||    
T  40551955 aactcctcac 40551964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 351
Target Start/End: Original strand, 16831503 - 16831666
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||        | || |||||||||||||||||||||||    
T  16831503 tctgtttggtaacaccaaaaaaagagtttttagctcttaacttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttcagtttggtaacactttttcaccat 16831602  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||        ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16831603 gagcttatagct--------gagtttataagctatttttcataagctattttaagtagcgtttgagcttata 16831666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 255 - 362
Target Start/End: Original strand, 40045444 - 40045551
Alignment:
Q  255 ctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagct-atttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40045444 ctgtttggtaactgtttttcatcaagagcttatagctttttt-actagcttataagcttatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagc 40045542  T
Q  354 ttatagctt 362  Q
    |||||||||    
T  40045543 ttatagctt 40045551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 297 - 362
Target Start/End: Original strand, 39677442 - 39677507
Alignment:
Q  297 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39677442 cacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagctt 39677507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 360
Target Start/End: Original strand, 44263388 - 44263456
Alignment:
Q  292 tatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44263388 tatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 44263456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8436663 - 8436519
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||| ||||  ||||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  8436663 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttgataacgattttttacaacgaacttatagcttattttatgagcttataagttatttt 8436564  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  8436563 tcagatgctattacaaatatcgtttgaacttatagcttatagctt 8436519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 291 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9370382 - 9370315
Alignment:
Q  291 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9370382 ttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttata 9370315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42203463 - 42203405
Alignment:
Q  297 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42203463 cacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagctt 42203405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 358
Target Start/End: Original strand, 13888326 - 13888388
Alignment:
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13888326 tcacgagcttataaactatttttcagacgctattccaagtagcgtttaagcttatagcttata 13888388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 367
Target Start/End: Original strand, 10651115 - 10651181
Alignment:
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10651115 agcttataagctattttttagaagcaattttaagtagcgtttgagtttatagcttatagcttctcac 10651181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 345
Target Start/End: Original strand, 26293837 - 26293901
Alignment:
Q  281 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgag 345  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26293837 agcttatagcttatttcacaaatttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtttgag 26293901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 345
Target Start/End: Original strand, 26307094 - 26307158
Alignment:
Q  281 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgag 345  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26307094 agcttatagcttatttcacaaatttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtttgag 26307158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26037068 - 26036979
Alignment:
Q  269 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  26037068 ttttttaccacgagtttatagtttatttcatgagtttataagttatttttcagatgttattccaagttgcgtttgagtttatagcctata 26036979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 352
Target Start/End: Original strand, 44318316 - 44318371
Alignment:
Q  297 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  44318316 cacgagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcatttgagcttatag 44318371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11741279 - 11741207
Alignment:
Q  171 gatattggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga 243  Q
    ||||| || |||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11741279 gatatagggtctgtttggttaatctcaaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttga 11741207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2773586 - 2773521
Alignment:
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  2773586 tcacgagcttataa-ctttttttgagaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagctt 2773521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43276955 - 43276909
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatag 226  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43276955 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatag 43276909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 42203522 - 42203452
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttata 288  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42203522 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccacgagcttata 42203452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 298
Target Start/End: Original strand, 35151040 - 35151085
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttca 298  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35151040 ctctgtttggtaatattttttcaccacgagcttataacttatttca 35151085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 12208919 - 12208967
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  12208919 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 12208967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 12453347 - 12453395
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  12453347 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 12453395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 354
Target Start/End: Original strand, 29725884 - 29725924
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29725884 tttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagct 29725924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 243
Target Start/End: Original strand, 36590105 - 36590168
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga 243  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||    
T  36590105 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagcttttagctcttaatttatagcttataaactcgtttga 36590168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 104)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 367
Target Start/End: Original strand, 26204249 - 26204434
Alignment:
Q  181 ctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatg 280  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26204249 ctgtttggttaacccaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatg 26204347  T
Q  281 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26204348 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 26204434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29704249 - 29704059
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  29704249 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttaatttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 29704150  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29704149 catgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29704059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Original strand, 33524496 - 33524688
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 274  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  33524496 ttgggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 33524595  T
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33524596 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagtttatagcttctcac 33524688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36838862 - 36838670
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 274  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||    
T  36838862 ttgggtctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttc 36838763  T
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36838762 tccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 36838670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Original strand, 1917996 - 1918185
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  1917996 ggctctgtttggttaacccaaaa-agtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 1918094  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1918095 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 1918185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19899073 - 19898883
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        | |||||||||||||||||||||||    
T  19899073 ggctctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcac 19898974  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19898973 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 19898883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36301268 - 36301080
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  36301268 ggctctgtttggttaacccaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttgataacactttttcac 36301171  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36301170 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 36301080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30721786 - 30721598
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  30721786 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacca 30721687  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30721686 tgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 30721598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Original strand, 44909809 - 44910000
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 274  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  44909809 ttgggtctgtttggttaaccccaaa-aagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 44909907  T
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44909908 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 44910000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 2497895 - 2498082
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2497895 tctgtttagttaaccctaaaatagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttcaccat 2497994  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2497995 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 2498082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31150586 - 31150400
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31150586 tctgtttgggaaacccaaaaaaa-agcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttgggtaacactttttcaccat 31150488  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31150487 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 31150400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42064463 - 42064292
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064463 aaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 42064364  T
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064363 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 42064292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Original strand, 29586147 - 29586318
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29586147 aaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatt 29586246  T
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29586247 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29586318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13121745 - 13121569
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121745 tctgtttggttaaccccaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 13121647  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121646 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 13121569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 15313217 - 15313403
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15313217 tctgtttgggaaacccaaaaaaagaacttttagcttttaacttatagcttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttt-caccat 15313315  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15313316 gagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 15313403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Original strand, 17046702 - 17046877
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17046702 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttcaccat 17046801  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046802 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 17046877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Original strand, 30774054 - 30774241
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 274  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  30774054 ttgggtctgtttggttaacccaaaa-aagagcttttagcttttaacttatagcttataagttcgtttgataaa----gctctgtttggtaacactttttc 30774148  T
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30774149 accataagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 30774241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32368501 - 32368314
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32368501 tctgtttggttaaccctaaaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 32368402  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32368401 gagcttataacttatttcacgagcttatatgctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 32368314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Original strand, 34319362 - 34319548
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |        | |||||||||||||||||||| |||||    
T  34319362 tctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccat 34319461  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34319462 gaccttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctca 34319548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Original strand, 38676460 - 38676649
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  38676460 ggctctgattgggaaaccccaaaaaa-agcttttagcttttaacttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 38676558  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38676559 catgagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 38676649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7711116 - 7710941
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7711116 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcatcat 7711017  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7711016 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 7710941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17500031 - 17499860
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17500031 aaaaaaagagcttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 17499932  T
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17499931 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatagcttatatcttctcac 17499860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Original strand, 39826573 - 39826748
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39826573 tctgattggttaaccccataaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 39826672  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39826673 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39826748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47134692 - 47134516
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47134692 tctgtttggttaacccaaaa-aagagcttttagcttttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 47134594  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47134593 gagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttat 47134516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 50351036 - 50351192
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50351036 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttaaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 50351135  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50351136 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagcttatagcttctcac 50351192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 26843724 - 26843911
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  26843724 tctgtttggaaaatccaaaaaaatagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttgataatactttttcaccat 26843823  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26843824 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagtttatagcttataacttctcac 26843911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1507906 - 1507718
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacc 277  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  1507906 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagtttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaagaagctctgtttggtaacactttttcacc 1507808  T
Q  278 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1507807 attagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 1507718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 3660920 - 3661105
Alignment:
Q  182 tgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatg 280  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||        | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3660920 tgtttggtaacacccaaaa-aagagcttttagttcttagcttatagcttataagctcatttgacaacaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatg 3661018  T
Q  281 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3661019 agcttatatcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcac 3661105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 201 - 367
Target Start/End: Original strand, 15348818 - 15348984
Alignment:
Q  201 aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacg 300  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348818 aagagcttttagctctttgcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacg 15348917  T
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15348918 agcttataaattatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagtttatagcttctcac 15348984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 322869 - 323025
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||        | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  322869 agcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 322968  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322969 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 323025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 3270663 - 3270818
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3270663 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaa-tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 3270761  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3270762 ctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 3270818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 211 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 38967594 - 38967451
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967594 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga-caaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 38967496  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967495 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 38967451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 210 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 49220605 - 49220450
Alignment:
Q  210 tagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49220605 tagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttacagcttatttcacgagcttataa 49220506  T
Q  310 gctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctc 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49220505 gctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctc 49220450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 355
Target Start/End: Original strand, 25601971 - 25602134
Alignment:
Q  191 aacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagc 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  25601971 aacccaaaa-aagagcttttagctcttagcttataggttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtatcacttttttaccatgaccttatagc 25602069  T
Q  291 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25602070 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 25602134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 203 - 362
Target Start/End: Original strand, 29374326 - 29374485
Alignment:
Q  203 gagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 302  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  29374326 gagcttatagcttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcaagag 29374425  T
Q  303 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29374426 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagagtttgagcttatagcttatagctt 29374485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Original strand, 37703716 - 37703830
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  37703716 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttataa 37703815  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||    
T  37703816 cttatagcttctcac 37703830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37672439 - 37672325
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  37672439 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttataa 37672340  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||    
T  37672339 cttatagcttctcac 37672325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Original strand, 22098965 - 22099078
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22098965 tctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 22099064  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||    
T  22099065 ttatagcttctcac 22099078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Original strand, 46369853 - 46369964
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46369853 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct---aagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 46369949  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||    
T  46369950 cttatagcttctcac 46369964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36043388 - 36043275
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36043388 tctgtttggtaacagtttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagatgctattctaagtagcgtttgagcttatagc 36043289  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||    
T  36043288 ttatagcttctcac 36043275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49185273 - 49185160
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49185273 tctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacaagcttataaactatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagc 49185174  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||    
T  49185173 ttatagcttctcac 49185160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50171385 - 50171272
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50171385 tctgtttggtaacacctttttaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagc 50171286  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||    
T  50171285 ttatagcttctcac 50171272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33562057 - 33561884
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33562057 tctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 33561958  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33561957 gagcttatagcttatttcacgagcttataagc--------------tattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 33561884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7781295 - 7781144
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781295 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataag 7781196  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7781195 ctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagctt 7781144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 357
Target Start/End: Original strand, 34086970 - 34087116
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34086970 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagctaatttcacgagcttataag 34087069  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34087070 ctatttttgagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 34087116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Original strand, 39583143 - 39583256
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  39583143 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttaacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagtttatacc 39583242  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||    
T  39583243 ttatagcttctcac 39583256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 255 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42614222 - 42614110
Alignment:
Q  255 ctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42614222 ctgtttggtaacattttttcaccatgagcttctagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagct 42614123  T
Q  355 tatagcttctcac 367  Q
    |||||| ||||||    
T  42614122 tatagcatctcac 42614110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 260 - 367
Target Start/End: Original strand, 43727074 - 43727181
Alignment:
Q  260 tggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatag 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43727074 tggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataaactatttttcagaagttattccaagtagcgtttgaacttatagcttatag 43727173  T
Q  360 cttctcac 367  Q
    ||||||||    
T  43727174 cttctcac 43727181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Original strand, 3391165 - 3391279
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3391165 gctctgtttggtaatactttttcaccatgaacttatagtttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtaacgtttaagcttata 3391264  T
Q  352 gcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||    
T  3391265 gcttatagcttctca 3391279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 201 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 51423126 - 51422963
Alignment:
Q  201 aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcac 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||        | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51423126 aagagcttttaacttttagcttatagcttataagtttgtttgataaaaaaaagttctgtttgataacactttttcaccatgaacttatagcttatttcac 51423027  T
Q  300 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttc 363  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51423026 gagtttataaactattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttc 51422963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 218 - 367
Target Start/End: Original strand, 40887892 - 40888035
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||       | ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40887892 agcttttagtttataagttcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttca------gcttatagcttattttacgagcttataagctatttt 40887985  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40887986 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 40888035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 204 - 355
Target Start/End: Original strand, 50540769 - 50540920
Alignment:
Q  204 agcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 303  Q
    ||||| || ||| |||||||||| |||||| ||||||||||       | |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  50540769 agcttataacttatagcttatagcttataaactcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccataaacttatagcttatttcacgagt 50540868  T
Q  304 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50540869 ttataagctatttttcagaagctattacaagtagcgtttgagcttatagctt 50540920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 2479134 - 2479306
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| | |||    
T  2479134 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttatcat 2479232  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479233 gagtttatagcttatttcacgagcttat--------------aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 2479306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 252 - 362
Target Start/End: Original strand, 34318451 - 34318561
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34318451 gctctgtttggtaatggtttttcaccacgagcttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagatgctattccaagtagtgtttgagcttata 34318550  T
Q  352 gcttatagctt 362  Q
    |||||||||||    
T  34318551 gcttatagctt 34318561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 253 - 358
Target Start/End: Original strand, 5697523 - 5697628
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  5697523 ctctatttggtaacagttttttacaatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatac 5697622  T
Q  353 cttata 358  Q
    ||||||    
T  5697623 cttata 5697628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 257 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9770058 - 9769953
Alignment:
Q  257 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctta 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  9770058 gtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaaataacgtttgagcttataacttc 9769959  T
Q  357 tagctt 362  Q
    ||||||    
T  9769958 tagctt 9769953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 267 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 49822242 - 49822147
Alignment:
Q  267 actttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49822242 actttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttttagaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 49822147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8221400 - 8221210
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    |||||||||||||||| |||| |    ||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||| |||        |||||||||||||||  ||||| ||    
T  8221400 ggctctgtttggtaaagccaagaagctagcttatagcttatagcggatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacggttttttac 8221301  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8221300 aacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaaactattccaaatagcgtttgaatttatagcttatagcttctcac 8221210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 49240371 - 49240268
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  49240371 gctctgtttggtaatgctttttcactatgaacttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctatttcaaatagcgtttgagcttata 49240272  T
Q  352 gctt 355  Q
    ||||    
T  49240271 gctt 49240268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 254 - 355
Target Start/End: Original strand, 28429076 - 28429171
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||    
T  28429076 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaag------caagtagcgtttgagcgtatagc 28429169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46929105 - 46928959
Alignment:
Q  221 ttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||       | |||||||  || || |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46929105 ttatagtttataaactcgtttgataaaaaaagttctgtttaatatcattttttcactaagaacttatagcttattttacgagcttataagctatttttca 46929006  T
Q  321 gaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46929005 gaagctattctaattagcgtttgtgcttatagcttatagcttctcac 46928959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 255 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30495282 - 30495182
Alignment:
Q  255 ctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30495282 ctgtttggtaatactttttgaccatgagcttatagcttatttctagagtttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttcagcttatagct 30495183  T
Q  355 t 355  Q
    |    
T  30495182 t 30495182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 254 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 52703199 - 52703091
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||  || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52703199 tctgtttggtaatgctctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagc 52703100  T
Q  354 ttatagctt 362  Q
    || ||||||    
T  52703099 ttttagctt 52703091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 254 - 357
Target Start/End: Original strand, 25134895 - 25134998
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25134895 tctgtttggtaacagttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattttaagtagtgtttgagcttatagc 25134994  T
Q  354 ttat 357  Q
    ||||    
T  25134995 ttat 25134998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36379225 - 36379121
Alignment:
Q  263 taacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36379225 taacacttttttacgatgagtttatagtttatttcatgagtttataagttatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataactt 36379126  T
Q  363 ctcac 367  Q
    |||||    
T  36379125 ctcac 36379121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18347506 - 18347403
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18347506 gctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagacactattccaagtagtgtttgagcttata 18347407  T
Q  352 gctt 355  Q
    ||||    
T  18347406 gctt 18347403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13570855 - 13570773
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13570855 gagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagacgctattccaaatagcgtttgaacttatagcttatagctt 13570773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 278 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41005057 - 41004969
Alignment:
Q  278 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41005057 atgagtttatagcttatttcatgagcttataagttatttttaagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttatagcttctca 41004969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 288 - 366
Target Start/End: Original strand, 33151975 - 33152053
Alignment:
Q  288 agcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33151975 agcttatttcacgagcttataagctatttttaagaagctatttcaagtagcgtttgagcttgtaacttatagcttctca 33152053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16085684 - 16085595
Alignment:
Q  269 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16085684 tttttcaccacgatcttatagtctattttacgagcttataagctatttttcagatgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttata 16085595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 357
Target Start/End: Original strand, 42963877 - 42963978
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  42963877 tgtttgataatactttttcactatgagcttataatttattttacgagtttataagctatttttgagaagctatttcaagtagcgtttgagcttacagctt 42963976  T
Q  356 at 357  Q
    ||    
T  42963977 at 42963978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 46088138 - 46087980
Alignment:
Q  204 agcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 303  Q
    ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||        |||||||||| |||   |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||     
T  46088138 agcttatagcttatagcagatagtttataagctcgtttgactagaaaagctctgtttgataatgttttttcgccacgagcttataacttatttcacgagt 46088039  T
Q  304 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  46088038 ttataagctatttttcagacgttattccaagtaatatttgagcttgtagcttatagctt 46087980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 2277087 - 2277151
Alignment:
Q  14 agaggcttggcctttgggtgctgacctacgaccttttataattaaggaagccttcatgaacatta 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2277087 agaggcttggcctttgggtgctgacctacgaccttttataattgaggaagccttcatgaacatta 2277151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 357
Target Start/End: Original strand, 44956340 - 44956428
Alignment:
Q  269 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  44956340 ttttttaccatgagcttatagcttatttaacgagattataagttatttttcagatgctattccaagtagagtttgagcttataacttat 44956428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 44719061 - 44718962
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44719061 gctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttattttacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtagcgtttaagcttata 44718962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 269 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 46056499 - 46056411
Alignment:
Q  269 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  46056499 tttttcaccacgaacttatagtttatttcacgagcttataagatatttttcagacgctatttcaagtagcatttaagcttatagcttat 46056411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 355
Target Start/End: Original strand, 7024916 - 7024971
Alignment:
Q  300 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7024916 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 7024971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Original strand, 9169142 - 9169203
Alignment:
Q  294 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9169142 tttcaccaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 9169203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 355
Target Start/End: Original strand, 40719554 - 40719622
Alignment:
Q  287 tagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40719554 tagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagttatttcaagtagcgtttgagtttatagctt 40719622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 278
Target Start/End: Original strand, 9169051 - 9169149
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  9169051 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagttcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacca 9169149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 362
Target Start/End: Original strand, 9894931 - 9894992
Alignment:
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9894931 agcttataagctatttttcagacgctattcaaagtagcgtttgagcttatagtttatagctt 9894992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28869099 - 28868987
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||   ||||| || | ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28869099 tctgtttggtaaaggttttttacaacgagtttatagtttatttcacgagcttataaattatttttaagaaattatttcaagtaacgtttgagcttatagc 28869000  T
Q  354 ttatagcttctca 366  Q
    |||||| ||||||    
T  28868999 ttatagtttctca 28868987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 364
Target Start/End: Original strand, 33632331 - 33632395
Alignment:
Q  300 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33632331 gagcttataagctatttttcagaagctattccaaacagcgtttgagcttattgctgatagcttct 33632395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 367
Target Start/End: Original strand, 6814118 - 6814187
Alignment:
Q  298 acgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6814118 acgaacttataagttatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatagcttttcac 6814187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40935945 - 40935893
Alignment:
Q  304 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctta 356  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40935945 ttataaactatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagctta 40935893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10628891 - 10628814
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10628891 gagcttatagtttattttactagcttataacttatttttcagacattatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 10628814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 281 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2029037 - 2028961
Alignment:
Q  281 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| || ||||| |||||    
T  2029037 agcttatagtttatttaacgagtttataaactatttttcagacgctatttcaagtaccgtttaagattataacttat 2028961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 12891644 - 12891684
Alignment:
Q  327 attccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12891644 attccaagtagcgtttgagtttatagcttatagcttctcac 12891684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22099750 - 22099687
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgat 244  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22099750 tctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttag-ttttagcttatagcttataagctcgtttgat 22099687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 243
Target Start/End: Original strand, 40719492 - 40719534
Alignment:
Q  201 aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga 243  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40719492 aagagcttttagctttgagtttatagtttataagctcgtttga 40719534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2459649 - 2459579
Alignment:
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  2459649 tcacgagcttatat-ctttttttgagaagctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagcttttcac 2459579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 243
Target Start/End: Original strand, 7024816 - 7024879
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga 243  Q
    ||||||||||||  || ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  7024816 tctgtttggtaacacctaaaaaagagcttttagctcttagcatatagcttataagttcgtttga 7024879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 367
Target Start/End: Original strand, 38058845 - 38058915
Alignment:
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  38058845 tcacgagcttata-gctttttttgagaagctatttcaaatagctttttagcttatagctgatagcttttcac 38058915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 362
Target Start/End: Original strand, 912726 - 912808
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||  |||  ||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||||    
T  912726 gagcttataacttatttcaggagcttatatcctattttctagacactatttcaaataacatttgagcttataacttatagctt 912808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 364
Target Start/End: Original strand, 2937458 - 2937500
Alignment:
Q  322 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttct 364  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2937458 aagctatttcaagtagcttttgagcttatagcttataacttct 2937500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27659424 - 27659350
Alignment:
Q  283 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||   |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27659424 cttataacttatttcaggagtttatagtttattttccaaacgctatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 27659350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 350
Target Start/End: Original strand, 31434449 - 31434495
Alignment:
Q  304 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttat 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  31434449 ttataagctatttttcagacgctattccaagtaggatttaagcttat 31434495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 9223953 - 9224001
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  9223953 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 9224001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 27667788 - 27667836
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  27667788 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttttagctt 27667836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30899408 - 30899360
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30899408 tttttaagaagctaattcaagtagctttttagcttatagcttatagctt 30899360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36043463 - 36043400
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga 243  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||    
T  36043463 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagcttatagctcttagcttatagcatataagttcgtttga 36043400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39325503 - 39325455
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  39325503 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 39325455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 243
Target Start/End: Original strand, 46369809 - 46369841
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttga 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46369809 agcttttagcttatagcttataagctcgtttga 46369841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 50940184 - 50940136
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  50940184 tttttgagaaactatttcaagtagcttttgagcttataacttatagctt 50940136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 22564 - 22751
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22564 tctgtttggttaacccgaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 22663  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22664 gagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 22751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 78)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 43254073 - 43254260
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254073 tctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 43254172  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254173 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 43254260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36246563 - 36246374
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  36246563 ggctctgtttggttaacccaaaa-agtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 36246465  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36246464 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 36246374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 194 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42587554 - 42587381
Alignment:
Q  194 ccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42587554 ccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 42587455  T
Q  294 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42587454 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 42587381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10312219 - 10312027
Alignment:
Q  175 ttggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc 274  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  10312219 ttgggtctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttc 10312120  T
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10312119 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatatcttatagcttctcac 10312027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45687085 - 45686914
Alignment:
Q  196 aaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45687085 aaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatt 45686986  T
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45686985 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 45686914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Original strand, 43134375 - 43134560
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43134375 tctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttca-caaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccat 43134473  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43134474 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctca 43134560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40637345 - 40637158
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40637345 tctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggcaacactttttcaccat 40637246  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637245 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 40637158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 366
Target Start/End: Original strand, 44596570 - 44596766
Alignment:
Q  170 agatattggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacact 269  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||||||||    
T  44596570 agatatcgggtctttttggtaaacctaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagtttataagctcgtttcacaaaaaaaattctgtttggtaacact 44596669  T
Q  270 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44596670 tttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 44596766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 40258827 - 40259014
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||        ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40258827 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagcttttagctcttagcttatagcttataagcttgtttgacagaaaaagctatgtttggtaacactttttcacca 40258925  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40258926 tgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 40259014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47471146 - 47470960
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        | |||||||||||| |||||||||||||    
T  47471146 tctgtttggttaacccaaaa-aagagcgtttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccat 47471048  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47471047 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 47470960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48313608 - 48313422
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||    
T  48313608 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaggttatagtttataagttcgtttga-caaaaaagctctgattggtaacactttttcaccat 48313510  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48313509 gagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgagcttatagcttatagcttctcac 48313422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 483166 - 482981
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |        ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  483166 tctgtttggtaaacttaaaa-aagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttgaccat 483068  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  483067 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 482981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 201 - 367
Target Start/End: Original strand, 21374624 - 21374790
Alignment:
Q  201 aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21374624 aagagcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacg 21374723  T
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21374724 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 21374790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 44743689 - 44743874
Alignment:
Q  182 tgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatg 280  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44743689 tgtttggtaacacccaaaaaaa-agcttttagctcttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatg 44743787  T
Q  281 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44743788 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagtttatagcttataacttctcac 44743874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 182 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42375964 - 42375793
Alignment:
Q  182 tgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 281  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42375964 tgtttggttaacccaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa-ctctgtttggtaacactttttcaccatga 42375867  T
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42375866 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 42375793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27089810 - 27089654
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27089810 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27089711  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27089710 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 27089654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 27188491 - 27188647
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188491 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27188590  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188591 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 27188647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 31511301 - 31511457
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31511301 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 31511400  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31511401 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 31511457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 182 - 366
Target Start/End: Original strand, 36407200 - 36407384
Alignment:
Q  182 tgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 281  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| |        | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  36407200 tgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttaactcttagcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccatga 36407299  T
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36407300 gcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 36407384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21254881 - 21254695
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21254881 tctgtttggttaacttaaaa-aagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcactat 21254783  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21254782 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 21254695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Original strand, 9487380 - 9487564
Alignment:
Q  183 gtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgag 282  Q
    ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||        | |||||||||||||||||||| || |||||    
T  9487380 gtttggttaactccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttactatgag 9487479  T
Q  283 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9487480 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttttcac 9487564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 21741941 - 21742129
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngct-ctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||          | |||||||||||||| |||||||||    
T  21741941 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagattttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaattctgtttggtaacaccttttcacca 21742040  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21742041 tgagcttatagcttatttcacgagcttaaaagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 21742129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 35587580 - 35587736
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35587580 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 35587679  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35587680 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 35587736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45222227 - 45222071
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45222227 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 45222128  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45222127 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttttagcttatagcttctcac 45222071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 214 - 367
Target Start/End: Original strand, 33026881 - 33027033
Alignment:
Q  214 ttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33026881 ttttagtttatagtttataagctcctttga-caaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta 33026979  T
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33026980 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 33027033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 207 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33203826 - 33203666
Alignment:
Q  207 ttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33203826 ttttagcttttagtttatagtttataagttcctttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 33203727  T
Q  307 taagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33203726 taagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 33203666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48832207 - 48832051
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48832207 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataag 48832108  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48832107 ctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 48832051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 180 - 351
Target Start/End: Original strand, 36436124 - 36436294
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36436124 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatatcttataagctcgtttga-caaaaaagctatgtttggtaacactttttcaccat 36436222  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36436223 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttata 36436294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 203 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27655835 - 27655676
Alignment:
Q  203 gagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 302  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27655835 gagcttatagcttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcaagag 27655736  T
Q  303 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27655735 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 27655676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47587288 - 47587115
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||        |||||||||||||||||||| ||||||    
T  47587288 tctgtttgagaaacccaaaa-aagagattttagcttttagcttatagcttataaactcgtctgataaaaaaaactctgtttggtaacactttt-caccat 47587191  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47587190 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 47587115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 224 - 367
Target Start/End: Original strand, 48590728 - 48590871
Alignment:
Q  224 tagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  48590728 tagtttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcaaaa 48590827  T
Q  324 gctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48590828 gctattcaaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 48590871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40106159 - 40106003
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40106159 agcttttagctcttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 40106060  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40106059 ctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagtttatagcttctcac 40106003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 34709210 - 34709390
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||       || | ||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34709210 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttata-------agtttgtttgactaaaaaagctctgtctggtaacactttttcaccat 34709302  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34709303 gagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttttcac 34709390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17192626 - 17192452
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17192626 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagtttttagctcttaacttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttt-cacca 17192529  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17192528 tgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 17192452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 210 - 366
Target Start/End: Original strand, 17844544 - 17844700
Alignment:
Q  210 tagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 309  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17844544 tagcttatagtttatagtttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctatttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 17844643  T
Q  310 gctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17844644 gctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 17844700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21313976 - 21313799
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn--gctctgtttggtaacactttttcac 276  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||    
T  21313976 tctgtttggtaatacccaaaa-aagaacttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcac 21313878  T
Q  277 catgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21313877 catgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 21313799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19832137 - 19832000
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19832137 agcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 19832038  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19832037 tcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 19832000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12345180 - 12345065
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12345180 gctctgtttggtaacactttttcacgaagagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcatttgagcttata 12345081  T
Q  352 gcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||    
T  12345080 gcttatagcttctcac 12345065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 204 - 367
Target Start/End: Original strand, 49148326 - 49148489
Alignment:
Q  204 agcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 303  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||||        ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49148326 agcttttagctcttagctaatagcttataagcttttttgacaaaaaaagctctgtttagtaacacttttccaccatgagcttatagcttatttcacgagc 49148425  T
Q  304 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49148426 ttatgagctatttttcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagtttatagcttctcac 49148489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 203 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11466201 - 11466047
Alignment:
Q  203 gagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 302  Q
    |||||| ||| || |||||| ||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  11466201 gagcttatagtttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttaaccatgagcttatagcttatttcacgaa 11466102  T
Q  303 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11466101 cttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 11466047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 256 - 366
Target Start/End: Original strand, 23029836 - 23029946
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23029836 tgtttggtaatgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattattcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 23029935  T
Q  356 atagcttctca 366  Q
    |||||||||||    
T  23029936 atagcttctca 23029946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 209 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28425767 - 28425609
Alignment:
Q  209 ttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 308  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||        | | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425767 ttagcttatagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaatgttttgtttggtaactttttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 28425668  T
Q  309 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425667 agttatttttcataagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttctcac 28425609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38531294 - 38531181
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38531294 ctctgtttggtaacactttttcaccatgatctaatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagttatt-caagtagcgtttgagcttatag 38531196  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||    
T  38531195 cttatagcttctcac 38531181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 315
Target Start/End: Original strand, 32168803 - 32168938
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168803 tctgtttggtaacgcccaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 32168902  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168903 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 32168938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 253 - 366
Target Start/End: Original strand, 9485759 - 9485872
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  9485759 ctctctttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagctatttcaagtatcatttgagcttatag 9485858  T
Q  353 cttatagcttctca 366  Q
    ||||||| ||||||    
T  9485859 cttataggttctca 9485872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Original strand, 1342777 - 1342928
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||        ||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1342777 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcagaagcttataag 1342876  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1342877 ctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 1342928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 216 - 351
Target Start/End: Original strand, 38481286 - 38481421
Alignment:
Q  216 ttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 315  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38481286 ttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaacagctctgtttggtaacactttttcaccatgaatttatagcttatttcacgagtctataagctatt 38481385  T
Q  316 tttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38481386 tttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttata 38481421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 252 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 46879637 - 46879525
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  46879637 gctctgtctggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttata 46879538  T
Q  352 gcttatagcttct 364  Q
    |||||||||||||    
T  46879537 gcttatagcttct 46879525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 791487 - 791336
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||  ||||| || | || |||||||||||||| | |||||||||||    
T  791487 agcttatagtttatagtttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttgataacgattttttacaacgaacttatagcttattttatgagcttataag 791388  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  791387 ctatttttcagatgctattacaagtagcgtttgaacttatagcttatagctt 791336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 219 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21316730 - 21316611
Alignment:
Q  219 gcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 318  Q
    |||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21316730 gcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaaactctgtttggtaacactttttcactatgagcttatagcttatttcataagcttataagctattttt 21316631  T
Q  319 cagaagctattccaagtagc 338  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21316630 cagaagctattccaagtagc 21316611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 252 - 357
Target Start/End: Original strand, 46757752 - 46757857
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  46757752 gctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttataacttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttata 46757851  T
Q  352 gcttat 357  Q
    ||||||    
T  46757852 gcttat 46757857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 367
Target Start/End: Original strand, 48620449 - 48620614
Alignment:
Q  201 aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacg 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||         || ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||    
T  48620449 aagagtttttagctcttagcttatagtttataaacttgtttgacggaaaaaactttgtttggtaacactttt-catcatgagtttatagtttatttcacg 48620547  T
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  48620548 agcttataaactatttttcagaaactatttcaagtagcgtttgagcatataatttatatcttctcac 48620614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 254 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22642362 - 22642259
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22642362 tctgtttggtaacggtttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagtttataagctattttttaaacgctattctaagtagcatttgagcttatagc 22642263  T
Q  354 ttat 357  Q
    ||||    
T  22642262 ttat 22642259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 362
Target Start/End: Original strand, 40893437 - 40893524
Alignment:
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40893437 accacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctattttttagaacctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 40893524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19757625 - 19757519
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||| |||| |||||| || | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19757625 tgtttgataacgcttttttacaacgagcttatagcttaattcaggagcttataagctatttttcaaaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 19757526  T
Q  356 atagctt 362  Q
    |||||||    
T  19757525 atagctt 19757519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36612220 - 36612114
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||| |||||| || | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36612220 tgtttggtaacgcttttttacaacgagcttttagcttatttcaggagtttataagctattttttagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 36612121  T
Q  356 atagctt 362  Q
    |||||||    
T  36612120 atagctt 36612114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 271 - 357
Target Start/End: Original strand, 35000773 - 35000859
Alignment:
Q  271 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35000773 tttcatcaggagcttatagcttatttcacaagtttataaactatttttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 35000859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27869645 - 27869570
Alignment:
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27869645 gcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcggacgttattccaagtagcgtttgagtttatagcttat 27869570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7884790 - 7884691
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    ||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7884790 tctgtttgttaatactttttcaccatgaacttatagcgtattttacgagc----aagttatttttgtgaagctattctaagtagcgtttgagcttatagc 7884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21740258 - 21740152
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||||| ||||||    
T  21740258 gctctgtttggtaacgcttttttacaacaagcttatagcttatttcagaagtttataagctatttttcagaaactacttgaaatagcgtttga-cttata 21740160  T
Q  352 gcttatag 359  Q
    ||||||||    
T  21740159 gcttatag 21740152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 355
Target Start/End: Original strand, 39698930 - 39698984
Alignment:
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39698930 agcttacaagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagctt 39698984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 322
Target Start/End: Original strand, 24170803 - 24170856
Alignment:
Q  269 tttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaga 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24170803 tttttcaccatgagtttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcaga 24170856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 357
Target Start/End: Original strand, 45672341 - 45672441
Alignment:
Q  257 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctta 356  Q
    |||| |||||| ||||| || | || ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  45672341 gtttcgtaacaattttttacaacgaacttataatttattttacgaacttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagcttatagttta 45672440  T
Q  357 t 357  Q
    |    
T  45672441 t 45672441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 367
Target Start/End: Original strand, 24170860 - 24170933
Alignment:
Q  294 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24170860 tttcatgagcttataagctatttttcagacattattccaagtagtgcttgagcttataacttatagcttatcac 24170933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 355
Target Start/End: Original strand, 47584185 - 47584237
Alignment:
Q  303 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  47584185 cttataaactatttttcagaagttattccaaatagcgtttgagtttatagctt 47584237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22621539 - 22621461
Alignment:
Q  284 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22621539 ttatagtttatttcaggagctcataacttatttttcagacattatttcaagcagcgtttgagcttataacttatagctt 22621461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 32168931 - 32168964
Alignment:
Q  322 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168931 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 32168964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35669682 - 35669619
Alignment:
Q  300 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttct 364  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  35669682 gagcttataa-ctttttttgagaagctatttcaagtatcttttgaacttatagcttatagcttct 35669619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 354
Target Start/End: Original strand, 39229953 - 39230027
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  39229953 gagcttataacctatttcacgaacttataacttatttttcagatactattttaaatagtgtttgagcttatagct 39230027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 354
Target Start/End: Original strand, 41406276 - 41406341
Alignment:
Q  288 agcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||| |||||| |||||||||  | ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41406276 agcttttttcactagcttataaagt-tttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagct 41406341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 367
Target Start/End: Original strand, 46334761 - 46334814
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  46334761 tttttgagatgctatttcaagtagcattcgagtttatagcttatagcttctcac 46334814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 352
Target Start/End: Original strand, 981425 - 981488
Alignment:
Q  288 agcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  981425 agcttttttcacgagcttat-agctttttttgagaagctatttcaagtagccttttatcttatag 981488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31030750 - 31030702
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  31030750 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 31030702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 354
Target Start/End: Original strand, 33979729 - 33979769
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33979729 tttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagct 33979769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 35670340 - 35670292
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  35670340 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 35670292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37658101 - 37658053
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  37658101 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 37658053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39870007 - 39869959
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  39870007 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 39869959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 40061276 - 40061324
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  40061276 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 40061324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 119)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8829993 - 8829806
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8829993 tctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 8829894  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8829893 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 8829806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12234145 - 12233958
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12234145 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 12234046  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12234045 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 12233958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 28307221 - 28307408
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28307221 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctcggtttgataacactttttcaccat 28307320  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28307321 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 28307408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 172 - 367
Target Start/End: Original strand, 45906097 - 45906292
Alignment:
Q  172 atattggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttt 271  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  45906097 atattggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttaccttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 45906196  T
Q  272 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45906197 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 45906292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 53407156 - 53407342
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53407156 tctgtttggttaaccccaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 53407254  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53407255 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 53407342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 46895248 - 46895436
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataa-gagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||    
T  46895248 tctgtttgggaaacccaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcacca 46895347  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46895348 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 46895436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 7706338 - 7706525
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7706338 tctgtttgggaaaaccaagaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 7706437  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7706438 gagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 7706525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 11600649 - 11600836
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11600649 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaacactttttcaccat 11600748  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11600749 gagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 11600836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 18582811 - 18582997
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18582811 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 18582909  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18582910 gagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 18582997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 42116862 - 42117049
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42116862 tctgtttgggaaacctcaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 42116961  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42116962 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 42117049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 56372402 - 56372588
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56372402 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 56372500  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56372501 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 56372588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Original strand, 55764526 - 55764711
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  55764526 tctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttca-aaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccat 55764624  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55764625 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 55764711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4517369 - 4517182
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4517369 tctgtttggttaatcccaaaaaagagcttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttcaccat 4517270  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4517269 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 4517182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19514059 - 19513873
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19514059 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 19513961  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19513960 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgttttagcttatagcttatagcttctcac 19513873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4392903 - 4392717
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4392903 tctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 4392804  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4392803 gagcttatagcttatttcacgagcttataagcta-ttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 4392717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22038535 - 22038348
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22038535 tctgtttggttaaccccataaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 22038436  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22038435 gagcttatagcttatttctcgagcttataggctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttatagcttctcac 22038348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 35777564 - 35777393
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777564 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 35777465  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777464 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 35777393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 55496058 - 55495883
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55496058 tctgtttgggaaactaaaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 55495959  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55495958 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 55495883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11152086 - 11151930
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11152086 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 11151987  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11151986 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 11151930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 8941871 - 8942057
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8941871 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttaacttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 8941969  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8941970 gagcttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttttcac 8942057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 366
Target Start/End: Original strand, 22892509 - 22892680
Alignment:
Q  195 caaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 294  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22892509 caaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttat 22892608  T
Q  295 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892609 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 22892680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 366
Target Start/End: Original strand, 22944173 - 22944344
Alignment:
Q  195 caaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 294  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22944173 caaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttat 22944272  T
Q  295 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22944273 ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 22944344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 204 - 367
Target Start/End: Original strand, 52669984 - 52670147
Alignment:
Q  204 agcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52669984 agcttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc 52670083  T
Q  304 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52670084 ttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 52670147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39087733 - 39087549
Alignment:
Q  182 tgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatga 281  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39087733 tgtttggttaacctaaaa-aagagcttttagcttctagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatga 39087635  T
Q  282 gcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39087634 gcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 39087549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25440631 - 25440475
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25440631 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 25440532  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25440531 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 25440475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27397913 - 27397757
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397913 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27397814  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397813 ctatttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 27397757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4939532 - 4939377
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4939532 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttt-accatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 4939434  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4939433 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 4939377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9043788 - 9043601
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttc-acca 278  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  9043788 tctgtttgggaaactcaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttatgtttggtaacactttttccacca 9043690  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9043689 tgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 9043601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23868016 - 23867860
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23868016 agcttttagcttatagcttataagctcttttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 23867917  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23867916 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 23867860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 29413528 - 29413684
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29413528 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataag 29413627  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29413628 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 29413684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35822477 - 35822290
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  35822477 tctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagcttttagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccat 35822378  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35822377 gagcttacaacttatttcacgagattataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 35822290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37115460 - 37115286
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37115460 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagtttttagcttttagcttatagcatataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccat 37115362  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37115361 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37115286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 47417653 - 47417482
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47417653 tctgtttgggaaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 47417554  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47417553 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatctttcataagctattccaagcagcgtttgagcttata 47417482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Original strand, 55828970 - 55829145
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  55828970 tctgttcggtaaacccaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccat 55829069  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55829070 gagcttataacttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 55829145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Original strand, 37970261 - 37970446
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |         ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37970261 tctgtttggtaaaccaaaaaaatgagcttttagctcttagcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaa-ctctgtttggtaacactttttgaccat 37970359  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970360 gagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 37970446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 203 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 55856679 - 55856518
Alignment:
Q  203 gagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgag 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55856679 gagcttttaacttttagcttatagcttataagtttgtttgataaaa---gctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgag 55856583  T
Q  303 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55856582 cttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 55856518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 3009708 - 3009864
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||        |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3009708 agcttttagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacatttttttaccttgagcttatagcttatttcacgagcttataag 3009807  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3009808 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 3009864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9032101 - 9031986
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9032101 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttata 9032002  T
Q  352 gcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||    
T  9032001 gcttatagcttctcac 9031986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Original strand, 21369918 - 21370033
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21369918 gctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 21370017  T
Q  352 gcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||    
T  21370018 gcttatagcttctcac 21370033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51011243 - 51011056
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||        | ||| ||||| |||||||||||||||    
T  51011243 tctgtttggttaactcaaaa-aagagcttttagcttctagcttataacttataagctcgtttgataaaaaaaagttctatttggcaacactttttcacca 51011145  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51011144 taagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 51011056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 214 - 355
Target Start/End: Original strand, 31678969 - 31679110
Alignment:
Q  214 ttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31678969 ttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta 31679068  T
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31679069 tttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31679110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 211 - 355
Target Start/End: Original strand, 29663926 - 29664070
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29663926 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataag 29664025  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29664026 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 29664070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43225855 - 43225680
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  43225855 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagtttttagcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcacca 43225757  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43225756 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 43225680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Original strand, 26826560 - 26826674
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26826560 ctctgtttggtaacactttttcacgatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 26826659  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||    
T  26826660 cttatagcttctcac 26826674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 253 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 55358443 - 55358329
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55358443 ctctgtttgataacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 55358344  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||    
T  55358343 cttatagcttctcac 55358329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 367
Target Start/End: Original strand, 15635910 - 15636095
Alignment:
Q  182 tgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatg 280  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| || |||||||       ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15635910 tgtttggtaacacccaaaa-aagagcttttacctcttagcttatagcttataaacttgtttgataaaaaaagctttgtttggtaacactttttcactatg 15636008  T
Q  281 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15636009 agtttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgattttatagcttatagcttctcac 15636095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4355763 - 4355583
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||       |||||||        | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4355763 tctgtttggtaaacccaaaaaaagagcttttagcttatagcttataaatt-------cgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccat 4355671  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4355670 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcac 4355583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Original strand, 35468012 - 35468168
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35468012 agcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaatctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 35468111  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35468112 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttataacatatagcttctcac 35468168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5465516 - 5465406
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5465516 gctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 5465417  T
Q  352 gcttatagctt 362  Q
    |||||||||||    
T  5465416 gcttatagctt 5465406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35581114 - 35580948
Alignment:
Q  189 taaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttata 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35581114 taaacccaaaaaaagagcttttaacttttagcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttata 35581015  T
Q  289 gcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35581014 gtttatttcacgagcttataaactatttttcagaggctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 35580948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 367
Target Start/End: Original strand, 33114979 - 33115128
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33114979 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 33115078  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33115079 tcagaagctatttcaagtatcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 33115128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30366250 - 30366137
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30366250 tctgtttggtaacactttttcatcatgagcttatatcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagc 30366151  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||    
T  30366150 ttatagcttctcac 30366137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 253 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 56270196 - 56270083
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  56270196 ctctgtttggtaacattttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttttag 56270097  T
Q  353 cttatagcttctca 366  Q
    ||||||||||||||    
T  56270096 cttatagcttctca 56270083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Original strand, 23162641 - 23162755
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttg-agcttatag 352  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23162641 tctgtttggtaacactttttccccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgaagcttatag 23162740  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
    ||||||| |||||||    
T  23162741 cttatagattctcac 23162755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 255 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27185737 - 27185623
Alignment:
Q  255 ctgtttggt-aacactttttc-accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185737 ctgtttggttaacactttttctaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 27185638  T
Q  353 cttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||| ||||    
T  27185637 cttatagcttatcac 27185623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 44442048 - 44442234
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||  |||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||    
T  44442048 tctgtttgagaaactccaaaaaagagcttttaacttttagcttataatttataagttcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccat 44442147  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44442148 gagcttattgcttatctcacgagcttaaaa-ctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcac 44442234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23113618 - 23113468
Alignment:
Q  216 ttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||        || || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23113618 ttagcttatagtttataagctcgtttgataaaaaaaactttgattggtaatactttttcgccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 23113519  T
Q  316 tttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  23113518 tttcagaagttattccaagtagcgtttgagtttataacttataacttctca 23113468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 334
Target Start/End: Original strand, 53273084 - 53273238
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  53273084 tctgtttggttaacctcaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctatttggtaacactttttcaccat 53273183  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaag 334  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53273184 gaacttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaag 53273238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 201 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31338659 - 31338491
Alignment:
Q  201 aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttttt--caccatgagcttatagcttatttca 298  Q
    |||||||| ||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||        ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31338659 aagagcttatagctcttaactgatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttagtaacattttttttcaccatgagcttatagcttatttca 31338560  T
Q  299 cgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31338559 cgggcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 31338491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 216 - 352
Target Start/End: Original strand, 37831924 - 37832060
Alignment:
Q  216 ttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37831924 ttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatt 37832023  T
Q  316 tttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37832024 tttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatag 37832060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 216 - 362
Target Start/End: Original strand, 22430637 - 22430783
Alignment:
Q  216 ttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||       ||||| |||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22430637 ttagcttatagcttataagctcgttcgataaaaaaagctctatttgataatggtttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 22430736  T
Q  316 tttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22430737 tttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 22430783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 355
Target Start/End: Original strand, 11050355 - 11050458
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11050355 gctctgtttggtaatgctttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttata 11050454  T
Q  352 gctt 355  Q
    ||||    
T  11050455 gctt 11050458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4391814 - 4391702
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4391814 gctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttata 4391715  T
Q  352 gcttatagcttct 364  Q
    |||||||||||||    
T  4391714 gcttatagcttct 4391702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 252 - 360
Target Start/End: Original strand, 25235183 - 25235291
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25235183 gctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttata 25235282  T
Q  352 gcttatagc 360  Q
    |||||||||    
T  25235283 gcttatagc 25235291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21633899 - 21633812
Alignment:
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21633899 accacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagctt 21633812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 357
Target Start/End: Original strand, 36196834 - 36197017
Alignment:
Q  174 attggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttttt 273  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  | | |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||   | | |    
T  36196834 attgggtctgtttggtaagcccattaaatgagcttatagtttatagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaatagctctgtttgataattgtctct 36196933  T
Q  274 caccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  36196934 taccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattctaagtagtgtttgagcttatagcttat 36197017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 35190763 - 35190612
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||         |||||||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  35190763 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaacgcttttttacaacgagtttgtagcttatttcaggagcttataag 35190664  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35190663 ctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 35190612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 276 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20148884 - 20148803
Alignment:
Q  276 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20148884 ccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 20148803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 253 - 357
Target Start/End: Original strand, 20511448 - 20511552
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20511448 ctctgtttgataacagttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttataa 20511547  T
Q  353 cttat 357  Q
    |||||    
T  20511548 cttat 20511552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 172 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25199482 - 25199366
Alignment:
Q  172 atattggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttt 271  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  25199482 atattgggtatgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttt 25199383  T
Q  272 ttcaccatgagcttata 288  Q
    |||||||||||||||||    
T  25199382 ttcaccatgagcttata 25199366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36008152 - 36008009
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||    
T  36008152 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat-------------aag 36008066  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36008065 ctgtttttcagaagctattccaagtagcgtttgagtttatagcttatagcttctcac 36008009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 367
Target Start/End: Original strand, 55684737 - 55684848
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||  |||||| || | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  55684737 tgtttggtaatgcttttttacaacgagcttctagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 55684836  T
Q  356 atagcttctcac 367  Q
    ||||| ||||||    
T  55684837 atagcgtctcac 55684848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 268 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42085812 - 42085723
Alignment:
Q  268 ctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42085812 ctttttcaccacgaacttatagcttatttcacgagcttataagctttttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 42085723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43078300 - 43078188
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||   |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43078300 tctgtttggtaatgttttttcgccacgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttatagc 43078201  T
Q  354 ttatagcttctca 366  Q
    ||||| |||||||    
T  43078200 ttataacttctca 43078188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 271 - 355
Target Start/End: Original strand, 44525694 - 44525778
Alignment:
Q  271 tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44525694 tttcactatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 44525778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33005186 - 33005111
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33005186 gagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 33005111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29656843 - 29656720
Alignment:
Q  208 tttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat 307  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29656843 tttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacagaaaaagttctgtttgttaacactttttcgccatgagcttatagcttatttcacgagctaat 29656744  T
Q  308 aagctatttttcagaagctattcc 331  Q
    ||  ||||||||||||||||||||    
T  29656743 aatttatttttcagaagctattcc 29656720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40497473 - 40497399
Alignment:
Q  281 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40497473 agcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40497399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 48056709 - 48056607
Alignment:
Q  255 ctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||||||||||| ||||| || | || ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48056709 ctgtttggtaacaattttttacaacgaacttatagtttatttcacgaacttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagct 48056610  T
Q  355 tat 357  Q
    |||    
T  48056609 tat 48056607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4465573 - 4465472
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4465573 tgtttggtaacgtctttttacaatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctgttccaagtagcgtttgagcttgtagctt 4465474  T
Q  356 at 357  Q
    ||    
T  4465473 at 4465472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 45780915 - 45780760
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45780915 tctgtttggttaaccctaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttggtaacactttttcaccat 45780816  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||                    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45780815 gagct--------------------tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 45780760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33005275 - 33005178
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 308  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33005275 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 33005178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 357
Target Start/End: Original strand, 37047069 - 37047172
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  37047069 tctgtttgataacgcttttttacaacgagcttatagcttattttaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaaatagcgtttgagcttatagc 37047168  T
Q  354 ttat 357  Q
    ||||    
T  37047169 ttat 37047172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 52708138 - 52707999
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52708138 agcttatagcttataagctcgtttgatagaaaaaactctgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 52708039  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
    ||||| | |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  52708038 tcagatgttattacaagtaacg-ttgagcttatagcttata 52707999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 297 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24954282 - 24954217
Alignment:
Q  297 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24954282 cacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 24954217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36486489 - 36486376
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  36486489 tctgtttggtaatactttttcaccatgaatttatagtttattttatgagcttataaactatttttcataagctattttaagtaacgtttgaacttatagc 36486390  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||| ||||||||    
T  36486389 ttataacttctcac 36486376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 350
Target Start/End: Original strand, 50502284 - 50502376
Alignment:
Q  258 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttat 350  Q
    |||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  50502284 tttggtaacggttttttacaacgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagtgtttgagcttat 50502376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29656716 - 29656597
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  29656716 tctgtttggtaacacccaaaa-aagagcttttagctcttaccttatagcttttaagctcgtttgacaagaaaagctctgtttggtaacactttttcacca 29656618  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcac 299  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  29656617 cgagcttatagcttatttcac 29656597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 297 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42124740 - 42124670
Alignment:
Q  297 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42124740 cacgagcttataaactatctttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 42124670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32101835 - 32101736
Alignment:
Q  258 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||  | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32101835 tttggtaacggtcttttaccacgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttctaagacgttattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 32101736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35842696 - 35842600
Alignment:
Q  257 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctta 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35842696 gtttggtaacactttttcaccatgagcttatagattatttcgcgagcttataagc--------------tattccaagtagcgtttgagcttatagctta 35842611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 357
Target Start/End: Original strand, 31435072 - 31435149
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31435072 gagcttatagcttatttcacgagtttataagttatttttcatacgctattccaagtagcgtttgaggttataacttat 31435149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 297 - 357
Target Start/End: Original strand, 17715647 - 17715707
Alignment:
Q  297 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17715647 cacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagattatagcttat 17715707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 53224309 - 53224368
Alignment:
Q  296 tcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53224309 tcacgagtttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 53224368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 366
Target Start/End: Original strand, 52713560 - 52713646
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52713560 gagcttataacttatttcacaaacttataagttatttttaagacactattctaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctca 52713646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32948289 - 32948179
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaaca-ctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||  ||||||  ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  32948289 ctctgtttgataacaactttttcatcatgagtttatatcttattttatgatattataaagtatttttcagacgctattctaaatagcgtttgagcttata 32948190  T
Q  352 gcttatagctt 362  Q
    | |||||||||    
T  32948189 gtttatagctt 32948179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 359
Target Start/End: Original strand, 37337678 - 37337784
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||||||||  ||||| |  || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  37337678 ctctgtttggtaacggttttttataataagcatatagcttatttcaggtacttataagctatttttcataagctacttcaagtagcgtttgaacttatag 37337777  T
Q  353 cttatag 359  Q
     ||||||    
T  37337778 tttatag 37337784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41864153 - 41864083
Alignment:
Q  285 tatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  41864153 tatagcttattttacgaacttataagctatttttaagaagctattccaaatagcgtttaagtttatagctt 41864083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38048979 - 38048878
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||| ||||  ||||||| || || ||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  38048979 tgtttgttaacgttttttcatcacgaacttataatttatttcacgagtttataaactatttttcagacgctattccaaatagcatttgagtttatagctt 38048880  T
Q  356 at 357  Q
    ||    
T  38048879 at 38048878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 362
Target Start/End: Original strand, 40119903 - 40119968
Alignment:
Q  297 cacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  40119903 cacgagcttataaactatttttcagacgctattccaagtagcatttgagcttgtagcctatagctt 40119968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 30562988 - 30562850
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||        | | |||||||||||  ||||| || | || |||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  30562988 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttatgtttggtaacgattttttacaacgaacttataacttattttatgagca-ataagctatttt 30562890  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30562889 tcagatgctattacaagtagcgtttaagcttatagcttat 30562850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 355
Target Start/End: Original strand, 31953224 - 31953296
Alignment:
Q  283 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31953224 cttatagcttatttcacgactttataaactattttttagacattatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 31953296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 367
Target Start/End: Original strand, 53274812 - 53274849
Alignment:
Q  330 ccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53274812 ccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 53274849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20530847 - 20530799
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20530847 tttttgagaagttattccaagtagcttttgagcttatagcttatagctt 20530799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 357
Target Start/End: Original strand, 39068890 - 39068969
Alignment:
Q  278 atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  39068890 atgagcttataacttatttcaggagtttataacttatttttcagacgatatttcaagtaacgtttgatcttataacttat 39068969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8716993 - 8716919
Alignment:
Q  283 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||   |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8716993 cttatagcttatttcaaaagcttatagtttattttccagaggctatttcaagtagtgtttgagcttatagtttat 8716919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3932306 - 3932245
Alignment:
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3932306 agcttatgagccatttttcaaacgttatttcaagtagcatttgagcttatagcttatagctt 3932245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 299
Target Start/End: Original strand, 44525659 - 44525699
Alignment:
Q  259 ttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcac 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  44525659 ttggtaacactttttcactatgagtttatagcttatttcac 44525699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19169207 - 19169164
Alignment:
Q  201 aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgat 244  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19169207 aagagcttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttgat 19169164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 356
Target Start/End: Original strand, 26443389 - 26443447
Alignment:
Q  298 acgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctta 356  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  26443389 acgagcttataaactatttttcaaaagctacttcaagtaacgtttaagcttataactta 26443447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 55495200 - 55495127
Alignment:
Q  288 agcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  55495200 agcttttttcacgagcttat-agttttttttgagaagctatttcaagtagctttttaacttatagctgatagctt 55495127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 359
Target Start/End: Original strand, 48953143 - 48953188
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatag 359  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  48953143 tttttaagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagctgatag 48953188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 49239276 - 49239219
Alignment:
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 358  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  49239276 agcttataaactatttttcagacgctattataagtaacgtttgaacttatagtttata 49239219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 202403 - 202451
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  202403 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 202451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 19912786 - 19912834
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  19912786 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 19912834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Original strand, 28459725 - 28459773
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  28459725 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 28459773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30411238 - 30411190
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  30411238 tttttaagaagctaatccaagtagctttttagcttatagcttgtagctt 30411190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31624384 - 31624344
Alignment:
Q  314 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagct 354  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31624384 tttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagct 31624344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 241
Target Start/End: Original strand, 45520095 - 45520135
Alignment:
Q  201 aagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgttt 241  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45520095 aagagtttttagctcttagcttatagcttataagctcgttt 45520135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 126936 - 126750
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  126936 tctgtttggttaacccaaga-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 126838  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  126837 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgcttgagcttatagcttatagcttctcac 126750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1632 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1632
Description:

Target: scaffold1632; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 180 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 28
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||    
T  214 tctgtttggtaaactcaaaaaaagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccat 115  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctca 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Original strand, 431299 - 431414
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  431299 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttata 431398  T
Q  352 gcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||    
T  431399 gcttatagcttctcac 431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 119340 - 119238
Alignment:
Q  256 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    ||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  119340 tgtttagtaacagttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagatcctattccaagtagagtttgagcttatagctt 119241  T
Q  356 ata 358  Q
    |||    
T  119240 ata 119238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Original strand, 7027 - 7213
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||        | |||||||||||||||||||| |||||    
T  7027 tctgtttggttaacctcaaa-aagagcttttagtttttagcttatagcttttaagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccat 7125  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7126 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttttagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttctcac 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 254 - 367
Target Start/End: Original strand, 63887 - 64000
Alignment:
Q  254 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  63887 tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagc 63986  T
Q  354 ttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||    
T  63987 ttatagcttctcac 64000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28262 - 28066
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaa-acccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28262 tctgtttggtaacactcaaaa-aagagcttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacactttttcacca 28164  T
Q  279 tgagcttatagcttat---------ttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28163 tgagcttatagcttataagctatttttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 28066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 211 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30323 - 30179
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323 agcttttagtttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataag 30224  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30223 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Original strand, 192013 - 192164
Alignment:
Q  211 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 310  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  192013 agcttatagcttatagcttataagctcgtatgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 192112  T
Q  311 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  192113 ctatttttgagaagctattccaagtagcttttgagcttatagcttatagctt 192164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 94415 - 94351
Alignment:
Q  288 agcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagc 353  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  94415 agcttttttcactagcttata-gcattttttgagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagc 94351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27312 - 27158
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnn-gctctgtttggtaacactttttcacca 278  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27312 tctgtttggttaaccccaaaaaagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaataaagctatgtttggtaacactttttcacca 27213  T
Q  279 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaa 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27212 tgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaa 27158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 53126 - 53023
Alignment:
Q  252 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53126 gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcctatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 53027  T
Q  352 gctt 355  Q
    ||||    
T  53026 gctt 53023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 93525 - 93376
Alignment:
Q  218 agcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 317  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93525 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacactttaaaaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 93426  T
Q  318 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93425 tcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 93376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 357
Target Start/End: Original strand, 84325 - 84402
Alignment:
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  84325 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 84402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 253 - 355
Target Start/End: Original strand, 5451 - 5552
Alignment:
Q  253 ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 352  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5451 ctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttata-cttatttcacgagcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatag 5549  T
Q  353 ctt 355  Q
    |||    
T  5550 ctt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41921 - 41755
Alignment:
Q  180 tctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacactttttcaccat 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41921 tctgtttgggaaaccaaaaa-aagagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccat 41823  T
Q  280 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 367  Q
    |||||                    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41822 gagct--------------------tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcac 41755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 72847 - 72760
Alignment:
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72847 accacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctattttttagaacctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 72760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 355
Target Start/End: Original strand, 4562 - 4636
Alignment:
Q  281 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4562 agcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 9294 - 9376
Alignment:
Q  275 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 357  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9294 accacgagctcatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagtgtttgagcttatagcttat 9376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 362
Target Start/End: Original strand, 10833 - 10914
Alignment:
Q  281 agcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  10833 agcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagacgctattccaaatagcgtttgagcttacggtttatagctt 10914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9147 - 8969
Alignment:
Q  172 atattggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgatnnnnnnngctctgtttggtaacacttt 271  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||    ||||| |||||| ||||  |||| |||||||||  ||||||       ||||||||||||||    ||    
T  9147 atataggctctgtttggtaagaccaaaaagttagcttatagcttatagcggatagcttataagcttatttgatcaaaaaagctctgtttggtaatgggtt 9048  T
Q  272 ttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 351  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||| ||||||||    
T  9047 ttcaccacgagcttatagtttatttcacaagtttataagctatttttcagacact-tttcaagtagcatttaagcttata 8969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 243
Target Start/End: Original strand, 36321 - 36387
Alignment:
Q  177 ggctctgtttggtaaacccaaaataagagcttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttga 243  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36321 ggctctgtttggttaaccccaaaaagtagcttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga 36387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1301 - 1240
Alignment:
Q  301 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 362  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1301 agcttatgagccatttttcaaacgttatttcaagtagcatttgagcttatagcttatagctt 1240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University