View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: Solexa-NF5802-4 (Length: 173)

Name: Solexa-NF5802-4
Description: NF5802
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] Solexa-NF5802-4
Solexa-NF5802-4
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (1-173)||(8277-8449)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (1-173)||(9871233-9871405)
chr4 (1-167)||(9638226-9638392)
chr4 (1-173)||(51992736-51992908)
chr4 (1-173)||(15448078-15448248)
chr4 (1-146)||(32466974-32467119)
chr4 (1-167)||(10704719-10704883)
chr4 (1-167)||(10918489-10918653)
chr4 (11-136)||(15612227-15612353)
chr4 (77-173)||(4615807-4615903)
chr4 (77-173)||(27027950-27028046)
chr4 (77-171)||(2584952-2585046)
chr4 (77-171)||(6511791-6511885)
chr4 (77-170)||(21061743-21061837)
chr4 (78-171)||(13446669-13446762)
chr4 (42-170)||(20899468-20899594)
chr4 (77-173)||(14933182-14933278)
chr4 (77-173)||(14942388-14942484)
chr4 (42-165)||(18229880-18230003)
chr4 (98-171)||(49547987-49548060)
chr4 (74-173)||(20774-20874)
chr4 (77-173)||(16997745-16997842)
chr4 (77-173)||(37018816-37018913)
chr4 (82-155)||(14629915-14629987)
chr4 (98-155)||(14630105-14630162)
chr4 (77-146)||(25090900-25090968)
chr4 (107-173)||(19435543-19435611)
chr4 (98-173)||(16026850-16026924)
chr4 (107-171)||(3485134-3485199)
chr4 (77-146)||(19609571-19609639)
chr4 (77-146)||(42875046-42875114)
chr4 (107-173)||(11425172-11425240)
chr4 (98-146)||(13036493-13036541)
chr4 (107-146)||(33244021-33244060)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (1-171)||(19311-19481)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (11-173)||(20862-21024)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (1-163)||(14642217-14642379)
chr3 (1-171)||(6158612-6158782)
chr3 (1-171)||(37038033-37038203)
chr3 (4-173)||(42324891-42325060)
chr3 (1-161)||(12512485-12512645)
chr3 (1-173)||(13523078-13523248)
chr3 (3-173)||(10562921-10563093)
chr3 (11-173)||(14250795-14250954)
chr3 (1-173)||(3394669-3394839)
chr3 (3-173)||(18367427-18367595)
chr3 (1-173)||(179374-179544)
chr3 (1-130)||(6819367-6819494)
chr3 (1-173)||(11886338-11886511)
chr3 (43-173)||(13520490-13520618)
chr3 (77-173)||(10550483-10550579)
chr3 (77-173)||(20417293-20417389)
chr3 (77-173)||(23395801-23395897)
chr3 (42-173)||(14818239-14818368)
chr3 (77-173)||(52213218-52213314)
chr3 (1-55)||(12275880-12275934)
chr3 (98-171)||(3803096-3803169)
chr3 (98-171)||(11850405-11850478)
chr3 (98-168)||(54520701-54520771)
chr3 (77-162)||(17548292-17548377)
chr3 (42-173)||(52338673-52338802)
chr3 (77-173)||(41173108-41173205)
chr3 (106-173)||(12275813-12275880)
chr3 (77-173)||(35065317-35065414)
chr3 (78-162)||(13179367-13179451)
chr3 (77-173)||(5206391-5206488)
chr3 (77-146)||(14153207-14153275)
chr3 (77-146)||(44273721-44273789)
chr3 (77-146)||(50348843-50348911)
chr3 (77-146)||(2842199-2842267)
chr3 (82-155)||(11192170-11192242)
chr3 (77-146)||(11258714-11258782)
chr3 (77-146)||(15932244-15932312)
chr3 (77-146)||(17693315-17693383)
chr3 (77-146)||(22307320-22307388)
chr3 (82-167)||(54876184-54876268)
chr3 (107-173)||(5215083-5215151)
chr3 (77-171)||(16728503-16728598)
chr3 (77-145)||(19884260-19884327)
chr3 (107-146)||(14508098-14508137)
chr3 (82-173)||(19569070-19569160)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (9-173)||(19761900-19762064)
chr1 (1-173)||(38057318-38057490)
chr1 (1-166)||(22349808-22349973)
chr1 (1-173)||(8276659-8276829)
chr1 (5-173)||(24726539-24726699)
chr1 (1-173)||(7792519-7792689)
chr1 (1-173)||(21180992-21181162)
chr1 (2-173)||(44822789-44822958)
chr1 (1-173)||(45754670-45754844)
chr1 (1-173)||(16400882-16401053)
chr1 (1-131)||(24815519-24815644)
chr1 (77-173)||(18275130-18275226)
chr1 (77-172)||(52983361-52983456)
chr1 (77-173)||(18270476-18270572)
chr1 (31-170)||(51476194-51476330)
chr1 (76-173)||(1642655-1642751)
chr1 (86-167)||(10813273-10813354)
chr1 (42-173)||(18823821-18823950)
chr1 (77-162)||(13528535-13528620)
chr1 (103-167)||(21240017-21240081)
chr1 (77-168)||(13302007-13302097)
chr1 (76-173)||(42696935-42697032)
chr1 (77-170)||(21046786-21046880)
chr1 (77-173)||(20587896-20587993)
chr1 (77-173)||(20592434-20592531)
chr1 (78-173)||(19675969-19676065)
chr1 (77-146)||(42912297-42912365)
chr1 (77-173)||(4596582-4596679)
chr1 (77-146)||(16059051-16059119)
chr1 (107-173)||(20634401-20634469)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (1-171)||(669-839)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (1-162)||(18388964-18389125)
chr2 (1-173)||(25045218-25045390)
chr2 (1-131)||(31520374-31520502)
chr2 (1-74)||(22501180-22501253)
chr2 (1-74)||(22509114-22509187)
chr2 (1-74)||(24883698-24883771)
chr2 (77-173)||(27860499-27860594)
chr2 (77-173)||(44071706-44071801)
chr2 (77-173)||(27851793-27851888)
chr2 (82-155)||(3538972-3539044)
chr2 (77-150)||(6478041-6478114)
chr2 (77-173)||(9975146-9975243)
chr2 (104-173)||(10897555-10897625)
chr2 (77-143)||(14693456-14693521)
chr2 (77-173)||(17306705-17306802)
chr2 (77-173)||(36839392-36839489)
chr2 (77-130)||(18391071-18391124)
chr2 (77-146)||(19358178-19358246)
chr2 (66-131)||(21368056-21368121)
chr2 (77-146)||(27485207-27485275)
chr2 (107-173)||(28653268-28653336)
chr2 (77-173)||(24515404-24515501)
chr2 (76-156)||(5985315-5985397)
chr2 (77-146)||(23969360-23969428)
chr2 (107-146)||(24781606-24781645)
chr2 (84-167)||(25141307-25141389)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-173)||(5630-5802)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (1-173)||(39695195-39695367)
chr8 (1-162)||(25849112-25849274)
chr8 (1-173)||(42266259-42266432)
chr8 (6-170)||(23418545-23418709)
chr8 (1-173)||(19699280-19699452)
chr8 (1-173)||(20454454-20454624)
chr8 (1-166)||(20455218-20455381)
chr8 (1-166)||(20460196-20460359)
chr8 (1-131)||(15635847-15635975)
chr8 (79-173)||(23947414-23947509)
chr8 (73-173)||(22244617-22244718)
chr8 (78-173)||(22584477-22584572)
chr8 (54-128)||(18302688-18302762)
chr8 (31-166)||(19882187-19882320)
chr8 (77-173)||(17907710-17907807)
chr8 (1-70)||(23409923-23409992)
chr8 (77-170)||(23888942-23889035)
chr8 (77-173)||(17217802-17217898)
chr8 (77-146)||(19140012-19140080)
chr8 (82-150)||(22318702-22318769)
chr8 (76-173)||(22259105-22259203)
chr8 (98-167)||(20025044-20025113)
chr8 (82-155)||(31723356-31723428)
chr8 (82-167)||(36728072-36728156)
chr8 (107-146)||(39936776-39936815)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (1-164)||(19829619-19829782)
chr6 (1-173)||(610955-611125)
chr6 (1-168)||(18658426-18658591)
chr6 (12-173)||(24550959-24551117)
chr6 (1-173)||(29848172-29848342)
chr6 (42-173)||(13751062-13751191)
chr6 (31-173)||(13764565-13764705)
chr6 (29-173)||(31735619-31735761)
chr6 (98-171)||(5110525-5110598)
chr6 (77-162)||(19444023-19444108)
chr6 (82-173)||(22212254-22212346)
chr6 (107-173)||(24441140-24441206)
chr6 (98-171)||(5289884-5289957)
chr6 (42-171)||(24266982-24267109)
chr6 (77-162)||(16133413-16133498)
chr6 (77-173)||(15891440-15891537)
chr6 (77-173)||(17318859-17318956)
chr6 (77-146)||(27126214-27126282)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-171)||(53302-53471)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (1-166)||(13166-13331)
scaffold0220 (1-173)||(15977-16149)
scaffold0220 (1-170)||(17627-17797)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-173)||(159617-159789)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (1-173)||(10953187-10953359)
chr5 (1-167)||(17812617-17812781)
chr5 (1-167)||(24277273-24277437)
chr5 (1-167)||(24384776-24384940)
chr5 (1-72)||(17875313-17875384)
chr5 (77-171)||(8952791-8952885)
chr5 (98-171)||(41876311-41876384)
chr5 (107-173)||(23200328-23200394)
chr5 (76-170)||(25250631-25250725)
chr5 (76-170)||(25314416-25314510)
chr5 (42-125)||(22357666-22357747)
chr5 (98-167)||(20565821-20565890)
chr5 (82-150)||(21618787-21618854)
chr5 (107-173)||(21406454-21406521)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (1-166)||(12554-12719)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-158)||(59085-59242)
chr7 (1-173)||(36705335-36705507)
chr7 (1-173)||(47094293-47094465)
chr7 (27-171)||(17070980-17071124)
chr7 (1-173)||(8757063-8757233)
chr7 (1-173)||(40555410-40555580)
chr7 (1-132)||(13699555-13699686)
chr7 (1-171)||(832690-832858)
chr7 (1-171)||(1197870-1198038)
chr7 (1-173)||(4325271-4325441)
chr7 (1-150)||(12755373-12755520)
chr7 (1-162)||(13407998-13408157)
chr7 (1-162)||(13865053-13865212)
chr7 (29-170)||(17130437-17130578)
chr7 (1-102)||(10659631-10659731)
chr7 (77-171)||(3289563-3289657)
chr7 (94-173)||(10660019-10660098)
chr7 (77-173)||(11053845-11053941)
chr7 (31-166)||(14191786-14191919)
chr7 (42-162)||(21735208-21735328)
chr7 (31-166)||(14188992-14189125)
chr7 (82-167)||(19558072-19558156)
chr7 (112-165)||(836857-836910)
chr7 (112-165)||(1202037-1202090)
chr7 (86-167)||(11309504-11309585)
chr7 (82-167)||(15139343-15139427)
chr7 (77-173)||(15281477-15281572)
chr7 (77-173)||(46386824-46386921)
chr7 (77-146)||(3287163-3287231)
chr7 (77-146)||(11066715-11066783)
chr7 (77-146)||(13148209-13148277)
chr7 (82-155)||(15096432-15096504)
chr7 (77-146)||(43277562-43277630)
chr7 (98-166)||(14219775-14219843)
chr7 (77-173)||(18875662-18875759)
chr7 (77-173)||(20585574-20585671)
chr7 (76-173)||(33001175-33001272)
chr7 (82-167)||(1489972-1490056)
chr7 (77-146)||(12127901-12127969)
chr7 (82-167)||(13133304-13133388)
chr7 (77-146)||(37785102-37785170)
chr7 (106-146)||(12371525-12371565)
chr7 (107-173)||(19282310-19282378)
chr7 (110-168)||(4070945-4071003)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (1-162)||(397720-397881)
scaffold0002 (78-162)||(127537-127621)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (1-173)||(2921-3091)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-173)||(8272-8442)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (1-162)||(6025-6184)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (1-105)||(36238-36342)
scaffold0116 (136-173)||(36340-36377)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (1-173)||(3482-3655)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (1-155)||(1482-1634)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-173)||(51173-51343)
scaffold0042 (76-173)||(28493-28590)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (77-173)||(6121-6217)
scaffold0309 (77-173)||(8273-8369)
[»] scaffold2046 (1 HSPs)
scaffold2046 (42-173)||(325-454)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (77-173)||(5039-5135)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (31-173)||(3642-3782)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (77-173)||(3250-3346)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (77-173)||(6835-6931)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (78-173)||(379-474)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (31-173)||(12207-12347)
scaffold0008 (82-167)||(136364-136448)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (77-170)||(2731-2824)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (77-161)||(34132-34216)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (77-166)||(59565-59654)
scaffold0004 (4-130)||(109423-109546)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (77-173)||(10891-10987)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (42-158)||(1984-2100)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (77-173)||(40966-41062)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (77-170)||(444-538)
scaffold0409 (77-170)||(8699-8793)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (98-171)||(134-207)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (77-173)||(66226-66321)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (79-170)||(1272-1363)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (77-173)||(3093-3189)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (74-173)||(60473-60573)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (77-173)||(158-255)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (86-173)||(95499-95587)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (77-167)||(2674-2765)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (107-173)||(127187-127254)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (77-173)||(5450-5547)
[»] scaffold1695 (1 HSPs)
scaffold1695 (82-167)||(583-667)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-46)||(3055-3100)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (77-144)||(9040-9106)
[»] scaffold1186 (2 HSPs)
scaffold1186 (82-155)||(800-872)
scaffold1186 (98-155)||(990-1047)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (98-155)||(187221-187278)
scaffold0005 (82-155)||(187396-187468)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (107-173)||(13300-13368)
scaffold0111 (107-173)||(19567-19635)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-40)||(77033-77072)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (82-167)||(4955-5039)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (82-167)||(168704-168788)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (78-146)||(8124-8191)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (77-144)||(57997-58063)


Alignment Details
Target: scaffold0630 (Bit Score: 153; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8449 - 8277
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8449 agttatagacttacagagagcctgaatcaaattattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaattat 8350  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8349 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 153; Significance: 2e-81; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 9871233 - 9871405
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9871233 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatagaaattat 9871332  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9871333 tattgtttatatcagtcaagttgttattattgatgtttctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 9871405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9638392 - 9638226
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9638392 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaattat 9638293  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9638292 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgttattgttgttgtc 9638226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 51992908 - 51992736
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51992908 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgactaataattgttgaattgtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattat 51992809  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51992808 tattgtttatatcattcaagttgttattgttgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtctctgct 51992736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 15448078 - 15448248
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  15448078 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatat 15448175  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15448176 cgttgtttatatcattcaagtttttattattaatatttctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctgct 15448248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 32466974 - 32467119
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  32466974 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttgattaatttaagatatttatataatgtgttgaaaacgtatgatatggaaaatat 32467073  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||    
T  32467074 tattgtttatatcattcaagctgttgttatcaatgttgctatgttg 32467119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10704883 - 10704719
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||||||| |||  ||| |||    
T  10704883 agttatagacttacagagagccggaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgag--caaaatgtatggtataaaaaatat 10704786  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  10704785 cgttgtttatataattcaagttgttattattaatattgttatgttgcaagttgcttttgttgttgtc 10704719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10918653 - 10918489
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||||||| |||  ||| |||    
T  10918653 agttatagacttacagagagccggaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgag--caaaatgtatggtataaaaaatat 10918556  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  10918555 cgttgtttatataattcaagttgttattattaatattgttatgttgcaagttgcttttgttgttgtc 10918489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15612353 - 15612227
Alignment:
Q  11 ttacagagagcctgaatcaaa-tgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgttta 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15612353 ttacagagagcctgaatcaaaatgattattgattgttggttagtttgagatatttatatattgtgttgaaaatgtatgatatggaaattgttattgttta 15612254  T
Q  110 tatcattcaagttgttattattgatgt 136  Q
    |||||| ||||||| || |||| ||||    
T  15612253 tatcatccaagttgctagtattaatgt 15612227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 4615807 - 4615903
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  4615807 gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 4615903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27028046 - 27027950
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  27028046 gaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtttctgct 27027950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Original strand, 2584952 - 2585046
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2584952 gaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 2585046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6511885 - 6511791
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||| |||||    
T  6511885 gaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatatttcaagttgtttatgttgttgcctctg 6511791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21061837 - 21061743
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctct 170  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21061837 gaaaatgtttgatatagaaaatattgatgtttatatcattcaagttgttgttattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgttgtctct 21061743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13446762 - 13446669
Alignment:
Q  78 aaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    ||||||||||| || |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13446762 aaaatgtatgagatagaaaatatcgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctg 13446669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 170
Target Start/End: Original strand, 20899468 - 20899594
Alignment:
Q  42 ttgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgcta 141  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  20899468 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgtta 20899565  T
Q  142 tgttgcaagatgtttatgttgttgtctct 170  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20899566 tgttgcaagttgcttatgttgttgtctct 20899594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 14933182 - 14933278
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  14933182 gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtttctgct 14933278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 14942388 - 14942484
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||| | |||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  14942388 gaaaatgtatgatctagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtttctgct 14942484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18230003 - 18229880
Alignment:
Q  42 ttgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgcta 141  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||| || |||| |||  |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  18230003 ttgttggttaacttaagctatttataaaatatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttaatattaatattgcta 18229904  T
Q  142 tgttgcaagatgtttatgttgttg 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  18229903 tgttgcaagttgtttatgttgttg 18229880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 171
Target Start/End: Original strand, 49547987 - 49548060
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  49547987 tattcttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 49548060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20874 - 20774
Alignment:
Q  74 gttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgc 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||| || ||| || ||||||||| |||||||||    
T  20874 gttgaaaatgtatgatatggaaattgttagtgtttatatcatccaagttgttagtattaatctggctatgatgtaagttgctttatgttgctgtctctgc 20775  T
Q  173 t 173  Q
    |    
T  20774 t 20774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16997842 - 16997745
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16997842 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 16997745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37018913 - 37018816
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  37018913 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 37018816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14629987 - 14629915
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt 155  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| ||||    
T  14629987 tgtatgatatagaaat-attattgtttatatcattcaagttgttcctgttaatgttgttatgatgcaagttgtt 14629915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14630162 - 14630105
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt 155  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14630162 tattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttgatgttgttatgttgcaagttgtt 14630105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25090968 - 25090900
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  25090968 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgttatgttg 25090900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 19435543 - 19435611
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19435543 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 19435611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Original strand, 16026850 - 16026924
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||    
T  16026850 tattgttgttcatatcattcaagttgctattgttaatgttgttatgatgcaagttg-ttatgttgttgtctttgct 16026924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3485199 - 3485134
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt-tatgttgttgtctctg 171  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  3485199 ttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgattcaagttgttgtatgttgttgtctctg 3485134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19609639 - 19609571
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19609639 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttaa-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 19609571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 42875114 - 42875046
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42875114 gaaaaagtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 42875046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11425240 - 11425172
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||    
T  11425240 ttatatcattcatgttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgatgtatgttgttgtctctgct 11425172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 13036493 - 13036541
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  13036493 tattgttgttcatatcattcaagttgttgtttttgatgttgttatgttg 13036541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 33244021 - 33244060
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33244021 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 33244060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 19311 - 19481
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19311 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaattat 19410  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19411 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgtttctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctg 19481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21024 - 20862
Alignment:
Q  11 ttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21024 ttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttat 20925  T
Q  111 atcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20924 atcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 20862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 14642217 - 14642379
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14642217 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaattat 14642316  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14642317 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgt 14642379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6158782 - 6158612
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6158782 agttatagactaaccgagagtctgaatcaaatgattaatgattgttggttaatttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaattat 6158683  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6158682 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtttctg 6158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 37038203 - 37038033
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37038203 agttatagagttaaagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttaatttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaattat 37038104  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37038103 tattgtttatatcattcaaattgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtttctg 37038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Original strand, 42324891 - 42325060
Alignment:
Q  4 tatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattat 103  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42324891 tatagacttagatagagtctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatctatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattattat 42324990  T
Q  104 tgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42324991 tgtttatatcattcaagttgttattattcatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgatgtttctgct 42325060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 12512485 - 12512645
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12512485 agttacagacttacagagaacctgaatcaaatgattgatgattgttgaattgtttaagatatttttataatgtgttgaaaatgaatgatatggaaattat 12512584  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12512585 tattgtttatatcattcaagttgttattgttgatgttgctatgttgcaagatgtttatgtt 12512645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 13523078 - 13523248
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||| |||    
T  13523078 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgag--gaaaatgtatgatatagaaaatat 13523175  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13523176 cgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctgct 13523248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10563093 - 10562921
Alignment:
Q  3 ttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattatta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10563093 ttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatataaaaattatta 10562994  T
Q  103 ttgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  10562993 ttgtttatatcgttcaagttgttatttttaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttatctctgct 10562921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 14250795 - 14250954
Alignment:
Q  11 ttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttat 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |    
T  14250795 ttacagagaacctgaatcaaatgattaatgattgttgaattgtttaagatattcgtataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattattattgt---t 14250891  T
Q  111 atcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14250892 ataattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtctctgct 14250954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 3394669 - 3394839
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  3394669 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatattcatattatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatat 3394766  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  3394767 cgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtttctgct 3394839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 18367427 - 18367595
Alignment:
Q  3 ttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattatta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||      
T  18367427 ttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--gaaaatgtatgatattgaaaatatcg 18367524  T
Q  103 ttgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  18367525 ttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgttatgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 18367595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 179374 - 179544
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||||| |||||| |||| |||    
T  179374 agttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--caaaatgtttgatatagaaaatat 179471  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      |||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  179472 cgttgttattatcattcaagttgttactattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtttctgct 179544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6819494 - 6819367
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  6819494 agttatatacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatat 6819397  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattat 130  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||    
T  6819396 cgttgttattatcattcaagttgttattat 6819367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 11886338 - 11886511
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | ||   |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11886338 agttatagatttacagagaccctgatcaaaatgattaatgagtgttgtttagtttgagatatttatgtatcttgttgaaattgtatgatatggaaattat 11886437  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| | || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  11886438 tattgtttatatcatctaagttgttagtattaacgtggctatgttgcaagttgctttatgttgctgtctctgct 11886511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 173
Target Start/End: Original strand, 13520490 - 13520618
Alignment:
Q  43 tgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctat 142  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  13520490 tgttggtttgtttaagatatttatattatgag--gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattaatattgctat 13520587  T
Q  143 gttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13520588 gttgcaagttgcttatgttgttgtctctgct 13520618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10550579 - 10550483
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  10550579 gaaaatgtatgatatagaaattatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctttgct 10550483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20417389 - 20417293
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20417389 gaaaatgtatgatataaaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgatatgttgcaagttgtttatgttgttgtctctgct 20417293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 23395801 - 23395897
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23395801 gaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatattgcaagttgtttatgttgttgtctctgct 23395897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14818368 - 14818239
Alignment:
Q  42 ttgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgcta 141  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  14818368 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctg 14818271  T
Q  142 tgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    | ||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  14818270 tattgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 14818239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 52213218 - 52213314
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  52213218 gaaaatgtattatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattgaagttgctattttgcaagttgcttatgttgttgtttctgct 52213314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 12275934 - 12275880
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttt 55  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12275934 agttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttt 12275880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3803169 - 3803096
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3803169 tattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 3803096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 171
Target Start/End: Original strand, 11850405 - 11850478
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11850405 tattgttgtttatatcattctagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 11850478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 54520771 - 54520701
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtct 168  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  54520771 tattcttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtct 54520701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 17548292 - 17548377
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  17548292 gaaaatgtatgatatagaaaaaatcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttg 17548377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Original strand, 52338673 - 52338802
Alignment:
Q  42 ttgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgcta 141  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||| |||| | |  || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  52338673 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttatttatatcattcaagttgttgttattaatattgcta 52338770  T
Q  142 tgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||| || |||  ||| ||||||||||    
T  52338771 tgttgcaagttgattaaattgatgtctctgct 52338802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 41173108 - 41173205
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41173108 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 41173205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12275880 - 12275813
Alignment:
Q  106 tttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||| ||| ||||||    
T  12275880 tttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgtttcaagttgcttatgttgctgtttctgct 12275813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 35065317 - 35065414
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35065317 gaaaaagtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 35065414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13179451 - 13179367
Alignment:
Q  78 aaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattat-tgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  13179451 aaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagttgttg-tatgttgcaagttgttgatgttg 13179367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 5206391 - 5206488
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||    
T  5206391 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgct 5206488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 14153207 - 14153275
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14153207 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 14153275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44273789 - 44273721
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44273789 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 44273721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 50348843 - 50348911
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  50348843 gaaaaggtatgatatagaaaataatattgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 50348911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 2842199 - 2842267
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  2842199 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagtttttattattaatgatgctatgttg 2842267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11192242 - 11192170
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt 155  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| ||||    
T  11192242 tgtatgatatagaaat-attattgttcatatcattcaagttgttgctgttaatgttgttatgatgcaagttgtt 11192170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11258782 - 11258714
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  11258782 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttg 11258714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 15932244 - 15932312
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    |||| |||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15932244 gaaattgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 15932312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17693383 - 17693315
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17693383 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgat-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 17693315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 22307320 - 22307388
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22307320 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 22307388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Original strand, 54876184 - 54876268
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||| |||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  54876184 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatattgttatgatgcaagttgttattgttgttgtc 54876268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5215151 - 5215083
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||    
T  5215151 ttataccattcaagttgttattatttatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgct 5215083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16728598 - 16728503
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctg 171  Q
    ||||||||||||||| ||||  | | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  16728598 gaaaatgtatgatatagaaaacaatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctg 16728503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Original strand, 19884260 - 19884327
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgtt 145  Q
    ||||||||||||||| |||| || | || |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  19884260 gaaaatgtatgatatagaaaataatgtt-tttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgtt 19884327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14508137 - 14508098
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14508137 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 14508098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 173
Target Start/End: Original strand, 19569070 - 19569160
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||  | || |||||| |||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  19569070 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttattgctgttaatgttgttatgatgcaagttgttattgttgctgtctctgct 19569160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 6e-79; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Original strand, 19761900 - 19762064
Alignment:
Q  9 acttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgttt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19761900 acttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttgattagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattattattgatt 19761999  T
Q  109 atatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19762000 atatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgatgtctctgct 19762064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 38057318 - 38057490
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38057318 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttaatttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaattat 38057417  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38057418 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 38057490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22349973 - 22349808
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22349973 agttatagacttacaaagagcctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattat 22349874  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349873 tattgtttatatcattcaagttattattatcgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 22349808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 8276659 - 8276829
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8276659 agttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatattt--ataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaattat 8276756  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  8276757 tattgtatatatcattcaagttgttgttattgatgttgttatgttgcaagatatttatgttgatgtttctgct 8276829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24726699 - 24726539
Alignment:
Q  5 atagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattatt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24726699 atagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttgattaatttaagatatttatataacgtgttgaaaacgtatgatatggaaattattatt 24726600  T
Q  105 gtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||        | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24726599 gtttatatcattcaagctgttgttat--------caatgttgcaagatgtttatgttgctgtctctgct 24726539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 7792519 - 7792689
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||| |||    
T  7792519 agttatagacatacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgag--gaaaatgtatgatatagaaaatat 7792616  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  7792617 cgttgtaaatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctttgct 7792689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 21180992 - 21181162
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |   ||||| |||||||| |||| |||    
T  21180992 agttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttagcttaagatatttatattatgaga--aaaatatatgatatagaaaatat 21181089  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  21181090 cgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 21181162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 44822789 - 44822958
Alignment:
Q  2 gttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattatt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||| |||     
T  44822789 gttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgag--gaaaatgtatgatatagaaaatatc 44822886  T
Q  102 attgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||    
T  44822887 gttgtttatatcattcaagttgttattattaatatcactatgttgcaagttgcctatgttgctatctctgct 44822958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 45754844 - 45754670
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaa-tcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaatta 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||||     
T  45754844 agttatagatttacagagagcctgaaataaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatatattatattgaaaatgtatgatatggaaattg 45754745  T
Q  100 ttattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| |||| || |||||||||  |||||||||    
T  45754744 ttattgtttatatcatccaagttgttagtattaatgtggctatgttacaagttgatttatgttgcagtctctgct 45754670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16401053 - 16400882
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |   ||||||||||| || |||| |||    
T  16401053 agttatagacttacagaaagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgag--aaaaatgtatgagatagaaaatat 16400956  T
Q  101 tattgtttata-tcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  16400955 cgttgtttatagtcattcaagttgttattattaatatttctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 16400882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 24815519 - 24815644
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||   |     
T  24815519 agttatagacttacaaagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgag--gaaaatgtatgatatagaa---aa 24815613  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattatt 131  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24815614 tatcgtttatatcattcaagttgttattatt 24815644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18275226 - 18275130
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18275226 gaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgttgtccctgct 18275130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 52983456 - 52983361
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgc 172  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  52983456 gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgttatgttgcaagttgcttatgttgatgtctctgc 52983361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18270572 - 18270476
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18270572 gaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattctagttgttattatttacgttgttatgttgcaagttgtttatgttgttgtccctgct 18270476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 51476330 - 51476194
Alignment:
Q  31 atgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattat 130  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||  | ||| |||||  ||||||||||||||| || | ||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  51476330 atgattaatg-ttgttggttaatttaagctacatatattatgtg--gaaaatgtatgatatagataataccgttgtttatattattcaagttgttattat 51476234  T
Q  131 tgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctct 170  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  51476233 taatgttgctatgttgcaagttgtttatgttgttctctct 51476194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1642751 - 1642655
Alignment:
Q  76 tgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||| ||| |||| || | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1642751 tgaaaatgtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgct 1642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 167
Target Start/End: Original strand, 10813273 - 10813354
Alignment:
Q  86 tgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10813273 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtc 10813354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18823950 - 18823821
Alignment:
Q  42 ttgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgcta 141  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||  |||||| |||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  18823950 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtg--gaaaatatatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgtta 18823853  T
Q  142 tgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  18823852 tgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 18823821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 13528535 - 13528620
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
    ||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  13528535 gaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttg 13528620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Original strand, 21240017 - 21240081
Alignment:
Q  103 ttgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  21240017 ttgttcatatcattcaagttgttattgttgatgttgttatgttgcaagttgtttgtgttgctgtc 21240081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13302097 - 13302007
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtct 168  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||    
T  13302097 gaaattgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttattatcagtgttgttatgttgcaagtttttgatgttgttgtct 13302007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 42697032 - 42696935
Alignment:
Q  76 tgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgttt-atgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42697032 tgaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcatccaagatgttgttattaatgttgctacgttgcaagttgttttatgttgttgtctctgct 42696935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Original strand, 21046786 - 21046880
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctct 170  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||    
T  21046786 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctct 21046880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20587993 - 20587896
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  20587993 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatactatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgct 20587896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20592531 - 20592434
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  20592531 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatactatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgct 20592434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19676065 - 19675969
Alignment:
Q  78 aaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19676065 aaaaggtatgatatagaaaataattttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 19675969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 42912365 - 42912297
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42912365 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 42912297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 4596582 - 4596679
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||    
T  4596582 gaaaaggtatgatatagaaactaatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgct 4596679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 16059051 - 16059119
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16059051 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 16059119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 20634401 - 20634469
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  20634401 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgct 20634469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 143; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 669 - 839
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  669 agttatagatttacaaagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttggtttgagatatttgtataatgtgttggaaatgtatgatatgaaaattat 768  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  769 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 142; Significance: 8e-75; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 18388964 - 18389125
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18388964 agttatagacttacagagagcctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattat 18389063  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389064 tattgtttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 18389125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25045390 - 25045218
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25045390 agttatagacgtacagaaagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttggtttaagttatttatataatgtgttgaaaatgtaagatatggaaattat 25045291  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  25045290 tattgtttatatcattcaagttgttgttattgatgttgctatgttgcaagacgtttatgttgctgtttctgct 25045218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31520502 - 31520374
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  31520502 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatat 31520405  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattatt 131  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31520404 cattgttattatcattcaagttgttattatt 31520374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22501253 - 22501180
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtg 74  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22501253 agttatagacttacagaaagcccgaatcaaatgattaatgtttgttggttagtttaagatatttatataatgtg 22501180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22509187 - 22509114
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtg 74  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22509187 agttatagacttacagaaagcccgaatcaaatgattaatgtttgttggttagtttaagatatttatataatgtg 22509114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24883771 - 24883698
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtg 74  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  24883771 agttatagacttacaaagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatatattgtg 24883698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27860594 - 27860499
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  27860594 gaaattgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttattatcagtgttgttatgttgcaagttgttgatgttgttgtctttgct 27860499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 44071801 - 44071706
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  44071801 gaaattgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcgttcaagttgttattattagtgttgttatgttgcaagttgttgatgttgttgtctttgct 44071706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27851888 - 27851793
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| | || |||||||||||| ||||    
T  27851888 gaaattgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttattatcagtgttgttatgttgcaagttattgatgttgttgtctttgct 27851793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3539044 - 3538972
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt 155  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3539044 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttgttgttgatgttgttatgttgcaagttgtt 3538972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Original strand, 6478041 - 6478114
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaag 150  Q
    ||||||| ||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  6478041 gaaaatggatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttgcaag 6478114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9975243 - 9975146
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9975243 gaaaatgtatggtatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtaaagttgttgtatgttgttgtctctgct 9975146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 173
Target Start/End: Original strand, 10897555 - 10897625
Alignment:
Q  104 tgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10897555 tgtttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgattcaagttgttgtatgttgttgtctctgct 10897625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14693521 - 14693456
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatg 143  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14693521 gaaaatgtatgatatagaaaatattgatgtt-atatcattcaagttgttatgattaatgttgctatg 14693456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17306802 - 17306705
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17306802 gaaaaggtatgatatagaaaataatattgtt-ataaaattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 17306705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 36839489 - 36839392
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgt-ttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  36839489 gaaaatgtatgatatagaaaatagtgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtcgtatgttgttgtctctgct 36839392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 130
Target Start/End: Original strand, 18391071 - 18391124
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattat 130  Q
    |||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18391071 gaaaatatatgatatcggaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 18391124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19358246 - 19358178
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19358246 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 19358178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21368121 - 21368056
Alignment:
Q  66 tataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattatt 131  Q
    |||||| ||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21368121 tataatatgtggaagatgtttgatatataaattattattgtttatatcattcaagatgtcattatt 21368056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 27485207 - 27485275
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27485207 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 27485275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 28653268 - 28653336
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28653268 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 28653336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24515501 - 24515404
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgc-aagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24515501 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattgaagttgttatgattaatgatgctatgttgcgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 24515404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5985397 - 5985315
Alignment:
Q  76 tgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgtt---attattgatgttgctatgttgcaagatgttt 156  Q
    |||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5985397 tgaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcatccaagttgttgttattattgatgttgctatgtggcaagttgttt 5985315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 23969360 - 23969428
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  23969360 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttg 23969428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 24781606 - 24781645
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24781606 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 24781645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25141389 - 25141307
Alignment:
Q  84 tatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  25141389 tatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttgctgttaatgttgttatgatgcaagttgttattgttgttgtc 25141307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 141; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5630
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5802 agttatagacttacagaaaggttgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttttataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaattat 5703  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5702 tattgtttatataattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 5630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 3e-74; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 39695195 - 39695367
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39695195 agttatagacttatagagagactgaatcaaatgattaatgattgttggctagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatataaaaattat 39695294  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39695295 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 39695367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 25849112 - 25849274
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggtta-gtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaatta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25849112 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgagtgttggctaagtttaagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaatta 25849211  T
Q  100 ttattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25849212 ttattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctgtgttgcaagatggttatgttg 25849274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 42266259 - 42266432
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  42266259 agttataaacttacagagagcataaatcaaatgattactgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaatcat 42266358  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42266359 tattgtttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttgcaagatgttttatgttgttgtttctgct 42266432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23418709 - 23418545
Alignment:
Q  6 tagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  23418709 tagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttgattaatttaagatatttatataacgtgttgaaaacatatgatatggaaattattattg 23418610  T
Q  106 tttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctct 170  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23418609 tttatatcattcaaaccgttgttatcaatgttgttatgttgcaagatgtttatgttgttgtctct 23418545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19699452 - 19699280
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  19699452 agttatagatttacagagagcatgaatcaaatgattaatgattgttggttagttga-gatatttatatattgtgttgaaaatgtatgatatggaaattgt 19699354  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  19699353 tattgtttatattatccaagttgttagtattaatgtggctatgatgtaagttgctttatgttgttgtctctgct 19699280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20454624 - 20454454
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |  | |||||| |||||| |||| |||    
T  20454624 agttatagacttacaaagagtctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgag--ggaaatgtgtgatatagaaaatat 20454527  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  20454526 cgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 20454454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20455381 - 20455218
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||   || |||||| |||||| |||| |||    
T  20455381 agttatagacttacaaagagcctgaatcaaatgattaatgattattagttagtttaagatatttatattatga--tggaaatgtgtgatatagaaaatat 20455284  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 166  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20455283 cgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgt 20455218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20460359 - 20460196
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||   || |||||| |||||| |||| |||    
T  20460359 agttatagacttacaaagagcctgaatcaaatgattaatgattattagttagtttaagatatttatattatga--tggaaatgtgtgatatagaaaatat 20460262  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 166  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20460261 cgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgt 20460196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 15635847 - 15635975
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||| |||||| |||| |||    
T  15635847 agttataggcttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgag--gaaaatgtgtgatatagaaaatat 15635944  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattatt 131  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15635945 cgttgtttatatcattcaagttgttattatt 15635975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23947509 - 23947414
Alignment:
Q  79 aaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  23947509 aaatgtatgatatagaaaatattattgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgctgtctctgct 23947414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22244718 - 22244617
Alignment:
Q  73 tgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctg 171  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  22244718 tgttgaaaatgtatgatatagaaaatattattgtttatatctttcaagttgttattattaatgtttctatgttgcaagttgttttatgttgatgtctctg 22244619  T
Q  172 ct 173  Q
    ||    
T  22244618 ct 22244617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Original strand, 22584477 - 22584572
Alignment:
Q  78 aaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22584477 aaaatgtatgatattgaaaatatcgttgtttatatcattcaagtggttattattaatgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctgct 22584572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 128
Target Start/End: Original strand, 18302688 - 18302762
Alignment:
Q  54 ttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttatt 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18302688 ttaagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatataaattattattgtttatatcattcaagttgttatt 18302762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19882320 - 19882187
Alignment:
Q  31 atgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattat 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |  | |||| | |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19882320 atgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgag--ggaaatctgtgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattat 19882223  T
Q  131 tgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 166  Q
    | || ||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19882222 taatattgctatgttgcaagtttcttatgttgttgt 19882187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 17907710 - 17907807
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17907710 gaaaaagtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgatattattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgttgtctctgct 17907807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 23409992 - 23409923
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataa 70  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23409992 agttatagatttacagagagcctgaattaaataattaatgattgttggttagtttaagatatttatataa 23409923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23889035 - 23888942
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctct 170  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23889035 gaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcgttcaagttgttattattaatgtagctgtgttgcaagttgtttatgttgctgtctct 23888942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17217898 - 17217802
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||| |||||||||| |||| || | ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  17217898 gaaagtgtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcatctaagttgttattattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgctgtctctgct 17217802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19140080 - 19140012
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19140080 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 19140012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Original strand, 22318702 - 22318769
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaag 150  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  22318702 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatgttgttatgttgcaag 22318769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Original strand, 22259105 - 22259203
Alignment:
Q  76 tgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22259105 tgaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgccatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 22259203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 167
Target Start/End: Original strand, 20025044 - 20025113
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  20025044 tattgttgttcatatcattcaagttaatgtgattaatgttgctatgttgcaagttgttattgttgttgtc 20025113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Original strand, 31723356 - 31723428
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt 155  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||| ||||    
T  31723356 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatgttgttatgatgcaagttgtt 31723428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Original strand, 36728072 - 36728156
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||| || |  ||||||||||    
T  36728072 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatgttgttatgatgcaagttgctattgttgttgtc 36728156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 39936776 - 39936815
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39936776 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 39936815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 1e-73; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 19829619 - 19829782
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19829619 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaattat 19829718  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgtt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19829719 tattgtttatatcattcaagttgatattattgatgttgctatgttgcaagatgttgttgttgtt 19829782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 611125 - 610955
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||| |||    
T  611125 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtctaagatatttatattatgag--gaaaatgtatgatatagaaaatat 611028  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  611027 cgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 610955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18658591 - 18658426
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  18658591 agttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggctagtttaagatatttatattatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatat 18658494  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtct 168  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  18658493 cgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtct 18658426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 173
Target Start/End: Original strand, 24550959 - 24551117
Alignment:
Q  12 tacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttata 111  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24550959 tacagagaacctaaatcaaatgattaatgactgttgaattgtttaaaatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattattattgtttata 24551058  T
Q  112 tcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24551059 tcattc---tagttattattgatgttgctatgttgcaagatatttatgttgatgtctctgct 24551117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 29848172 - 29848342
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||| |||||| |||| |||    
T  29848172 agttatagacttacaaagagcctgaatcaaattattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgag--gaaaatgtgtgatatagaaaatat 29848269  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  29848270 tgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 29848342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Original strand, 13751062 - 13751191
Alignment:
Q  42 ttgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgcta 141  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13751062 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgcta 13751159  T
Q  142 tgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13751160 tgttgcaagttgcttatgttgttgtctctgct 13751191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13764705 - 13764565
Alignment:
Q  31 atgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattat 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |  | |||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13764705 atgactaatgattgttagttagtttaagttatttatattatgag--ggaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattat 13764608  T
Q  131 tgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    | || |||||||||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  13764607 taatattgctatgttgctagttgcttatgttgttgtccctgct 13764565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Original strand, 31735619 - 31735761
Alignment:
Q  29 aaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttatt 128  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | |||  | ||| |||||  |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31735619 aaatgattaatg-ttgttggttaatttgaaatacatatattatgtg--gaaaatgtttgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaaattgttatt 31735715  T
Q  129 attgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||| ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  31735716 attaatgttgctatgttacaagttgttttatgttgctgtctctgct 31735761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 171
Target Start/End: Original strand, 5110525 - 5110598
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5110525 tattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 5110598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 19444023 - 19444108
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  19444023 gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttg 19444108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 173
Target Start/End: Original strand, 22212254 - 22212346
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| || |||||||    
T  22212254 tgtatgatatagaaaataattttgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgttgtgttgcaagttgttttatgttgctgcctctgct 22212346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24441206 - 24441140
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24441206 ttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctgct 24441140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 171
Target Start/End: Original strand, 5289884 - 5289957
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5289884 tattgttgtttatatcattcgagttgttattattaccgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 5289957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24267109 - 24266982
Alignment:
Q  42 ttgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgcta 141  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||   ||||||||||||||  ||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  24267109 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtga--aaaatgtatgatataaaaaatgtccttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgtta 24267012  T
Q  142 tgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24267011 tgttgcaagttgcttatgttgctgtctctg 24266982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 16133413 - 16133498
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
    ||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  || ||||||||    
T  16133413 gaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttgcaatttgcttatgttg 16133498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 15891440 - 15891537
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15891440 gaaaatgtatgatatagaaaataattttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 15891537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 17318859 - 17318956
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17318859 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 17318956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 27126214 - 27126282
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27126214 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 27126282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 139; Significance: 5e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 53302 - 53471
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53302 agttataaacttacagagggcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataatgtattgaaaatgtatgatatggaaattat 53401  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53402 tatt-tttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtctctg 53471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13331 - 13166
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13331 agttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttaatttaagatatttatataaggtgttgcaaatgtatgatatagaaattat 13232  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13231 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgtttctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 13166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16149 - 15977
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16149 agttatagacttacagagagtctgaattaaatgattaatgattgttggttaatttaagatatttatataaggtgttgtaaatgtatgatatagaaattat 16050  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16049 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgatgtttctgct 15977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17797 - 17627
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || | | |||||| |||||||||| |||||| |    
T  17797 agttatagatttacagagaccctgatcaaaatgattaatgagtgttggttagtttgagatatttatgtattatattgaaattgtatgatatggaaattgt 17698  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctct 170  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  17697 tattgtttatatcatccaaggtgttagtattaatgtggctatgttgcaagttgttttatgttgctgtctct 17627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 137; Significance: 8e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 159617 - 159789
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  159617 agttatagacttacacagagcctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatgaaaattat 159716  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  159717 tattgtttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttgcaagatgtttatgctgctgtctctgct 159789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 8e-72; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10953359 - 10953187
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10953359 agttacaggcttacagagaacctgaatcaaatgattaatgattgttgaattgtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattat 10953260  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953259 tattgtttataccattcaagttgttattgttgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 10953187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17812781 - 17812617
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |  | |||||| |||||| |||| |||    
T  17812781 agttatagacttacaaagagtctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgag--ggaaatgtgtgatatagaaaatat 17812684  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17812683 cgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtc 17812617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 24277273 - 24277437
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||| |  ||||||||||||||| |||| |||    
T  24277273 agttatagactttcagagagtctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatatatattatgag--gaaaatgtatgatatagaaaatat 24277370  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24277371 cgttgtttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtc 24277437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24384940 - 24384776
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||| |  ||||||||||||||| |||| |||    
T  24384940 agttatagactttcagagagtctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatatatattatgag--gaaaatgtatgatatagaaaatat 24384843  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24384842 cgttgtttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtc 24384776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17875384 - 17875313
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatg 72  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17875384 agttatagacttacagagagtctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataatg 17875313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Original strand, 8952791 - 8952885
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    ||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8952791 gaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctg 8952885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 171
Target Start/End: Original strand, 41876311 - 41876384
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41876311 tattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 41876384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 23200328 - 23200394
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23200328 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgtaagatgtttatgttgttgtctatgct 23200394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 170
Target Start/End: Original strand, 25250631 - 25250725
Alignment:
Q  76 tgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctct 170  Q
    |||||||||||||||| |||| || | ||| | ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25250631 tgaaaatgtatgatatagaaaataatgttgat-atatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgttgtctct 25250725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 170
Target Start/End: Original strand, 25314416 - 25314510
Alignment:
Q  76 tgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctct 170  Q
    |||||||||||||||| |||| || | ||| | ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25314416 tgaaaatgtatgatatagaaaataatgttgat-atatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgttgtctct 25314510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 125
Target Start/End: Original strand, 22357666 - 22357747
Alignment:
Q  42 ttgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgtt 125  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  22357666 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatgttgttgtttatatcattcaagttgtt 22357747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20565890 - 20565821
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  20565890 tattgttgttcatatcattcgagttgttgttgtttatgttgttatgttgcaagttgttattgttgttgtc 20565821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Original strand, 21618787 - 21618854
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaag 150  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||||    
T  21618787 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttattgttgttgatgttgttatgttacaag 21618854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 21406454 - 21406521
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  21406454 ttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgattcaagttgttgtatgttgctgtctctgct 21406521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 134; Significance: 5e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12719 - 12554
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12719 agttatagacttacagatagcctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattat 12620  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12619 tattgtttatatcattcaagttattattatcgatgttgatatgttgcaagatgtttatgttgttgt 12554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 130; Significance: 1e-67; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 59085 - 59242
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  59085 agttatagacttacagggagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaattat 59184  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttat 158  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  59185 tattgtttatatcatttaaattgttattattgatgttgctatgttgcatgatgtttat 59242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 36705335 - 36705507
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36705335 agttacagacttacagagaacctgaatcaaatgattaatgattgttgaattgtttgagatatttgtacaatgtgttgaaaatgtatgatatgaaaattat 36705434  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36705435 tattgtttatatcattcaagttgttattgttcatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 36705507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 47094465 - 47094293
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaa-tgtatgatatcgaaatta 99  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  47094465 agttatagacttacagagagtctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaaatgtatgatata-aaatta 47094367  T
Q  100 ttattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47094366 ttattgtttatatcattcaagttgttgttatcgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 47094293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 171
Target Start/End: Original strand, 17070980 - 17071124
Alignment:
Q  27 tcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgtta 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17070980 tcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcattcaagttgtta 17071079  T
Q  127 ttattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17071080 ttattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgatgtttctg 17071124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 8757063 - 8757233
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||| |||| |||    
T  8757063 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaaatat 8757160  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  8757161 cgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 8757233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 40555410 - 40555580
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  40555410 agttataaacttacagagagcctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatatg--gaaaatgtatgatatagaaaatat 40555507  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  40555508 cgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 40555580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 13699555 - 13699686
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13699555 agttatagacttacagagagtctgaatcaaatgattaatgactgtcggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatagggaaattat 13699654  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13699655 tattgtttatatcattcaagttgttattattg 13699686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 832690 - 832858
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||  |||| |||    
T  832690 agttatagacttacagagagcctgaatcaaattattaatgagtgttggttagtttaagatatttatattatgag--gaaaatgtatgataaagaaaatat 832787  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  832788 cgttttttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctg 832858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 1197870 - 1198038
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||  |||| |||    
T  1197870 agttatagacttacagagagcctgaatcaaattattaatgagtgttggttagtttaagatatttatattatgag--gaaaatgtatgataaagaaaatat 1197967  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1197968 cgttttttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctg 1198038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4325441 - 4325271
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  4325441 agttatagacttacagagagcttgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatt--tatattatgttgaaaatgtatgatatagaaaatat 4325344  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| || ||||||| ||||| |||||    
T  4325343 cgttgttattatcattcaagttgttattattaatatttctatgttgcaagttgcttatgttattgtccctgct 4325271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 12755373 - 12755520
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  12755373 agttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatcatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatat 12755470  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaag 150  Q
      |||||||||| |||||||||||||| ||| || || ||||||||||||    
T  12755471 cgttgtttatataattcaagttgttatgattaatatttctatgttgcaag 12755520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13408157 - 13407998
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||| |||    
T  13408157 agttatagacgtacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgag--gaaaatgtatgatatagaaaatat 13408060  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
      ||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  13408059 cgttgtaattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttg 13407998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 13865053 - 13865212
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  13865053 agttatagacgtacggagagcctgaatcaaattattaatgattgttggttagtttaagata--tgtatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaatat 13865150  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
      |||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  13865151 cgttgttattatcattgaagttgttattattaatattgctatgttgcaagctgcttatgttg 13865212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Original strand, 17130437 - 17130578
Alignment:
Q  29 aaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  17130437 aaatgatcaatgattgttggttagtttgagataattatatattgtgttgaaaatgtatgatat-gaaattgttattgtttatatcatccaagttgttagt 17130535  T
Q  129 attgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctct 170  Q
    ||| |||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  17130536 attaatgtggctatgttgtaagttgttttatgttgttgtctct 17130578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 10659631 - 10659731
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10659631 agttatagatttacagagagcctgaatcaaatgattaatgatttttggttag-ttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattat 10659729  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  10659730 ta 10659731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Original strand, 3289563 - 3289657
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3289563 gaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattgacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgttgtctctg 3289657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 173
Target Start/End: Original strand, 10660019 - 10660098
Alignment:
Q  94 aaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  10660019 aaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttacgttgctgtctttgct 10660098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11053941 - 11053845
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  11053941 gaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgctatattgcaagttctttatgttgttgtctatgct 11053845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 166
Target Start/End: Original strand, 14191786 - 14191919
Alignment:
Q  31 atgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattat 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||| |  | |||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14191786 atgattaatgattgttagttagtttaagatatctatattatgag--ggaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattat 14191883  T
Q  131 tgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 166  Q
    | || ||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  14191884 taatattgctttgttgcaagttgcttatgttgttgt 14191919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 162
Target Start/End: Original strand, 21735208 - 21735328
Alignment:
Q  42 ttgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgcta 141  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| || |||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21735208 ttgttggttaacttaagctatttatataatatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgcta 21735307  T
Q  142 tgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  21735308 tgttgcaagttgtttatgttg 21735328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 166
Target Start/End: Original strand, 14188992 - 14189125
Alignment:
Q  31 atgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattat 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||| |  | |||||| ||||||  ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14188992 atgattaatgattgttagttagtttaagatatctatattatgag--ggaaatgtgtgatatataaaatatcgttgtttatatctttcaagttgttattat 14189089  T
Q  131 tgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 166  Q
    | || ||||| ||||| ||| || ||||||||||||    
T  14189090 taatattgctttgttgtaagttgcttatgttgttgt 14189125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Original strand, 19558072 - 19558156
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19558072 tgtatgatatagaaat-atagttgttcatatcattcaagttgttgttattgatgttgttatgttgcaagttgttattgttgttgtc 19558156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 165
Target Start/End: Original strand, 836857 - 836910
Alignment:
Q  112 tcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttg 165  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  836857 tcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttg 836910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 165
Target Start/End: Original strand, 1202037 - 1202090
Alignment:
Q  112 tcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttg 165  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1202037 tcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttg 1202090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11309585 - 11309504
Alignment:
Q  86 tgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||| || |||||||||||||    
T  11309585 tgatatagaaaatattgttgtttatattattcaagttgttattattaatattgttatggggcaagttgcttatgttgttgtc 11309504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15139427 - 15139343
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  15139427 tgtatgatatagaaat-attgttgtttatatcaatcaagttgttagtgttaatgttgttatgttgcaagttgttattgttgttgtc 15139343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15281572 - 15281477
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgttt-atgttgttgtctctgct 173  Q
    |||| |||||||||| |||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  15281572 gaaagtgtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcatccaagttgttattata-atgttgctatgttgcaagttgtttaatggtgttgtctctgct 15281477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 46386824 - 46386921
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  46386824 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgct 46386921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3287231 - 3287163
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3287231 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 3287163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11066783 - 11066715
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11066783 gaaaatgtatgatatggaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 11066715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 13148209 - 13148277
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13148209 gaaaaggtatgatatagaaaataatatt-tttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 13148277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Original strand, 15096432 - 15096504
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt 155  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||| ||||    
T  15096432 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatgttgttatgttgcaagttgtt 15096504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 43277562 - 43277630
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43277562 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 43277630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Original strand, 14219775 - 14219843
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 166  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  14219775 tattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttggtgttgttatgttgcaagttgttattgttgttgt 14219843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 18875662 - 18875759
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18875662 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atacaattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 18875759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20585671 - 20585574
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20585671 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtcgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 20585574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33001272 - 33001175
Alignment:
Q  76 tgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||| |||| |  | |||||  |||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  33001272 tgaaaatgtatgatatagaaaattatgttgttg-tatcatccaagttattgttattaacgttgctatgttgcaagttgttttatgttgctgtctctgct 33001175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Original strand, 1489972 - 1490056
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||| |||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  1489972 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatattgttatgatgcaagttgttattgttgttgtc 1490056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 12127901 - 12127969
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  12127901 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatactatgttg 12127969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Original strand, 13133304 - 13133388
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  13133304 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttgctgttaatgttgttatgatgcaagttgttattgttgttgtc 13133388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 37785102 - 37785170
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37785102 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 37785170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12371565 - 12371525
Alignment:
Q  106 tttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12371565 tttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 12371525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19282378 - 19282310
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19282378 ttataccattcaagttgttattattaacgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 19282310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4071003 - 4070945
Alignment:
Q  110 tatcattcaagttgttattatt-gatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtct 168  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4071003 tatcattcaagttgttattatcagttgttg-tatgttgcaagttgttgatgttgttgtct 4070945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 122; Significance: 7e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 397881 - 397720
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  397881 agttatagactttcagagagcctgaattaaatgattaatgattgttggttagttcaagatatttatataatgtgttggaaatgtatgatatgaaaattat 397782  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  397781 tattgtttatatcattcaagttgttattcttgatgttgctattttgcaaaatgtttatgttg 397720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 162
Target Start/End: Original strand, 127537 - 127621
Alignment:
Q  78 aaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattat-tgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  127537 aaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagttgttg-tatgttgcaagttgttgatgttg 127621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 102; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3091 - 2921
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||| |||    
T  3091 agttatagacttacaaagagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgag--gaaaatgtatgatatagaaaatat 2994  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  2993 cgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattactatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 2921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 94; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8442 - 8272
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  8442 agttatagacttacagagagcctaaatcaaatgattaatgattgtcggttagtttaagatatttatattatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatat 8345  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  8344 cgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgatatgttgcaagttgcttatgttgctgtccctgct 8272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 91; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6184 - 6025
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| |||||| |||| |||    
T  6184 agttatagacttacagagagcttgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--gaaaatgtgtgatatagaaaatat 6087  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 162  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| || ||||||||    
T  6086 cgttgttattatcattcaagttgttattattaatatttctatgttgcaagttgcttatgttg 6025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 36238 - 36342
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36238 agttatagacttacagagagcctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattat 36337  T
Q  101 tattg 105  Q
    |||||    
T  36338 tattg 36342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 173
Target Start/End: Original strand, 36340 - 36377
Alignment:
Q  136 ttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36340 ttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtttctgct 36377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 86; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3655 - 3482
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||   | ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3655 agttatagatttacagagaccctgaatcaaatgattaatgagttttggttagtttgagatatttatactttatgttgaaaatgtatgatatggaaattgt 3556  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||  |||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  3555 tattgtttatatcatccaagttgttagtatcaatgtgactatgttgcaagttgctttatgtttttgtctctgct 3482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 84; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 1482 - 1634
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| |||||| |||| |||    
T  1482 agttttagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattattggttagtttaagatatttatattatgtg--gaaaatgtttgatatagaaaatat 1579  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt 155  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  1580 cgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgatatgttgcaagttgtt 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 82; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 51343 - 51173
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||||| ||||||  ||| |||    
T  51343 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--caaaatgtttgatataaaaaatat 51246  T
Q  101 tattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
      | |||  ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  51245 cgtagttattatcatttaagttattactattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtttctgct 51173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28590 - 28493
Alignment:
Q  76 tgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||  |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  28590 tgaaaatgtatgatacagaaactaatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgtgactatgctgcaagttgttttatgttgctatctctgct 28493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 69; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6217 - 6121
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6217 gaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttgcaagttgtttatgttgttgtctctgct 6121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8369 - 8273
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8369 gaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttgcaagttgtttatgttgttgtctctgct 8273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 65; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 454 - 325
Alignment:
Q  42 ttgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgcta 141  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  454 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtg--gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgcta 357  T
Q  142 tgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  356 tgttgcaagttgcttatgttgttgtctctgct 325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 65; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5135 - 5039
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5135 gaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctgct 5039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 64; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Original strand, 3642 - 3782
Alignment:
Q  31 atgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattat 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |  | |||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||     
T  3642 atgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgag--ggaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattac 3739  T
Q  131 tgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    | || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  3740 taatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3346 - 3250
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3346 gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataacattcaagttgttattgttaatattgctatgttgcaagttgtttatgttgttgtctctgct 3250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6931 - 6835
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  6931 gaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcatttgagttgttattattaatgttgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 6835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 60; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Original strand, 379 - 474
Alignment:
Q  78 aaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  379 aaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 7e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Original strand, 12207 - 12347
Alignment:
Q  31 atgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattat 130  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||| |  | |||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12207 atgattaatgattgtaagttagtttaaaatatttatattatgag--ggaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattat 12304  T
Q  131 tgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    | || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  12305 taatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 12347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Original strand, 136364 - 136448
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||   ||||||||||    
T  136364 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttgttattaatgttattatgttgcaagttgtcattgttgttgtc 136448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Original strand, 2731 - 2824
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctct 170  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  2731 gaaaatgtatgatatagaaaatatcattgtttatatcattcaagttgttatttttaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctct 2824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 57; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 161
Target Start/End: Original strand, 34132 - 34216
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgtt 161  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34132 gaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgctatgttgctagttgtttatgtt 34216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 59654 - 59565
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 166  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  59654 gaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatgttgcaagttgtttatgttgttgt 59565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 109546 - 109423
Alignment:
Q  4 tatagacttacagagagcctgaatcaaa-tgattaatgattgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattatta 102  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||  | ||| |||||  |||| |||||||| | || || ||||    
T  109546 tatagccttacagagagtctgaattaaaatgattaatg-ttgttggttaatttgagatacatatattatgtg--gaaattgtatgatgtagagat-atta 109451  T
Q  103 ttgtttatatcattcaagttgttattat 130  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||    
T  109450 atgttcatatcattcaagttgttattat 109423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10987 - 10891
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||||||||||||  |   |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10987 gaaaatgtatgatatatatgatattgttctttatatcattcaagttgttattattaatgtttctatgttgcaagttgtctatgttgttgtctctgct 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 158
Target Start/End: Original strand, 1984 - 2100
Alignment:
Q  42 ttgttggttagtttaagatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgcta 141  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| || |||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1984 ttgttggttaacttaagctatttatataatatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgcta 2083  T
Q  142 tgttgcaagatgtttat 158  Q
    ||||||||| |||||||    
T  2084 tgttgcaagttgtttat 2100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 40966 - 41062
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  40966 gaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgatatgttgcaagttgcttatgttgctgtcactgct 41062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 538 - 444
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctct 170  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  538 gaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgttattattcatgttgctacgttgtaagttgttttatgttgttgtctct 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8793 - 8699
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctct 170  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  8793 gaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgttattattcatgttgctacgttgtaagttgttttatgttgttgtctct 8699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 50; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 171
Target Start/End: Original strand, 134 - 207
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctg 171  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  134 tattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 66321 - 66226
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  66321 gaaattgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattaaagttgttattattaatgttgttatgttgcaagttgttgatgttgttgtctttgct 66226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 170
Target Start/End: Original strand, 1272 - 1363
Alignment:
Q  79 aaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctct 170  Q
    |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  1272 aaatgtatgatatataaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgtaagttgcttatgttgctgtctct 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 45; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3189 - 3093
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||    
T  3189 gaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttgcaagttgcttaaattgatgtctctgct 3093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 45; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 60573 - 60473
Alignment:
Q  74 gttgaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgc 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||| || ||| || ||||||||| |||||||||    
T  60573 gttgaaaatgtatgatatggaaattgttagtgtttatatcatccaagttgttagtattaatctggctatgatgtaagttgctttatgttgctgtctctgc 60474  T
Q  173 t 173  Q
    |    
T  60473 t 60473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 158 - 255
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  158 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 95587 - 95499
Alignment:
Q  86 tgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgttt-atgttgttgtctctgct 173  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||| | | ||| |||||| ||||||||||    
T  95587 tgatatagaaattattattgcttatatcattcaagatgttattatttatattgctatgctgcatgttatttaatgttgatgtctctgct 95499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 167
Target Start/End: Original strand, 2674 - 2765
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattat-tgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||| |||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2674 gaaattgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaaatcgttattatcagttgttgctatgttgcaagttgtttatgttgatgtc 2765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 127187 - 127254
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatg-tttatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  127187 ttatatcatccaagttgttgttattaaagttgctatgttgcaagctgttttatgttgttgtctctgct 127254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 5450 - 5547
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5450 gaaaaagtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgttgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 5547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1695
Description:

Target: scaffold1695; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 667 - 583
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||    
T  667 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttgttgttgttgatgttgttatgttacaagttgttattgttgttgtc 583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 3100 - 3055
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgtt 46  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3100 agttatagatttacatagagcctgaatcaaatgattaatgattgtt 3055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 144
Target Start/End: Original strand, 9040 - 9106
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgt 144  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9040 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgt 9106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 872 - 800
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt 155  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| ||||    
T  872 tgtatgatatagaaat-attattgtttatatcattcaagttgttcctgttaatgttgttatgatgcaagttgtt 800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1047 - 990
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt 155  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1047 tattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttgatgttgttatgttgcaagttgtt 990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Original strand, 187221 - 187278
Alignment:
Q  98 tattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt 155  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  187221 tattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttgatgttgttatgttgcaagttgtt 187278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Original strand, 187396 - 187468
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtt 155  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| ||||    
T  187396 tgtatgatatagaaat-attattgtttatatcattcaagttgttcctgttaatgttgttatgatgcaagttgtt 187468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 33; Significance: 0.0000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 13300 - 13368
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  13300 ttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttattgtctctgct 13368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 173
Target Start/End: Original strand, 19567 - 19635
Alignment:
Q  107 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgttgtctctgct 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  19567 ttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttcttgtctctgct 19635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 77072 - 77033
Alignment:
Q  1 agttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatg 40  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  77072 agttatagacttacagataacctgaatcaaatgattaatg 77033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5039 - 4955
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  5039 tgtatgatatagaaat-attgttgttcatatcattcaagttattgttgttaatgttgttatgatgcaagttgttattgttgttgtc 4955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 168788 - 168704
Alignment:
Q  82 tgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtc 167  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  168788 tgtatgatattgaaat-attgttgttcatattattcaagttgttgttgttaatgttgttatgttgcaatttgttattgttgttgtc 168704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Original strand, 8124 - 8191
Alignment:
Q  78 aaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 146  Q
    |||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8124 aaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 8191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 28; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 58063 - 57997
Alignment:
Q  77 gaaaatgtatgatatcgaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgt 144  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  58063 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 57997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University