View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: Solexa-NF5817-16 (Length: 160)

Name: Solexa-NF5817-16
Description: NF5817
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] Solexa-NF5817-16
Solexa-NF5817-16
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (7-156)||(1541246-1541395)
chr6 (7-156)||(12741995-12742144)
chr6 (7-156)||(22781941-22782098)
chr6 (7-156)||(33861464-33861621)
chr6 (7-148)||(2291524-2291673)
chr6 (7-148)||(8054698-8054847)
chr6 (7-148)||(18334936-18335085)
chr6 (7-148)||(19004715-19004864)
chr6 (7-148)||(24422216-24422365)
chr6 (7-156)||(26924975-26925132)
chr6 (7-148)||(33863947-33864096)
chr6 (7-128)||(25591120-25591249)
chr6 (7-128)||(25688245-25688358)
chr6 (34-148)||(19859263-19859378)
chr6 (7-64)||(25656472-25656529)
chr6 (63-128)||(25714168-25714233)
chr6 (83-128)||(25656524-25656569)
chr6 (7-64)||(25714136-25714193)
chr6 (83-128)||(17229985-17230031)
chr6 (83-128)||(17742939-17742985)
chr6 (83-126)||(20136415-20136459)
chr6 (83-126)||(22196410-22196454)
chr6 (83-128)||(16492893-16492938)
chr6 (83-128)||(18896640-18896685)
chr6 (83-128)||(35007894-35007939)
chr6 (83-128)||(18178001-18178048)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (7-156)||(26356294-26356443)
chr7 (7-156)||(26358746-26358895)
chr7 (7-148)||(32125168-32125309)
chr7 (7-156)||(16409737-16409886)
chr7 (7-148)||(41522594-41522735)
chr7 (7-148)||(41525056-41525197)
chr7 (7-156)||(455999-456148)
chr7 (7-149)||(15377056-15377206)
chr7 (7-149)||(20385465-20385615)
chr7 (7-148)||(11972165-11972314)
chr7 (7-156)||(14949457-14949614)
chr7 (7-148)||(21189939-21190088)
chr7 (7-148)||(16232189-16232338)
chr7 (7-156)||(24701924-24702065)
chr7 (7-156)||(24704374-24704515)
chr7 (7-130)||(11393637-11393760)
chr7 (9-156)||(27216546-27216687)
chr7 (47-148)||(18639988-18640090)
chr7 (55-148)||(18423415-18423508)
chr7 (39-127)||(10064143-10064240)
chr7 (83-129)||(42461692-42461739)
chr7 (83-128)||(38519115-38519161)
chr7 (85-128)||(16995967-16996011)
chr7 (86-128)||(9033642-9033685)
chr7 (83-128)||(131148-131193)
chr7 (83-128)||(11525896-11525941)
chr7 (83-128)||(17017749-17017795)
chr7 (106-148)||(1543510-1543554)
chr7 (39-72)||(18423415-18423448)
chr7 (83-126)||(9390184-9390228)
chr7 (89-128)||(19281935-19281974)
chr7 (86-128)||(48990965-48991007)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (7-156)||(10733275-10733424)
chr5 (7-156)||(29348131-29348280)
chr5 (7-156)||(29350604-29350753)
chr5 (7-156)||(42245700-42245849)
chr5 (7-156)||(29345650-29345807)
chr5 (10-148)||(265112-265258)
chr5 (7-148)||(20908681-20908830)
chr5 (7-127)||(39363084-39363196)
chr5 (7-130)||(31143957-31144074)
chr5 (40-148)||(39244845-39244954)
chr5 (7-128)||(2155000-2155105)
chr5 (83-128)||(26733120-26733166)
chr5 (89-128)||(23202861-23202900)
chr5 (86-128)||(23469549-23469592)
chr5 (83-128)||(15796166-15796212)
chr5 (83-128)||(21732259-21732304)
chr5 (83-128)||(21809910-21809955)
chr5 (83-128)||(26740976-26741022)
chr5 (89-129)||(16227522-16227563)
chr5 (83-128)||(25743507-25743554)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (7-156)||(16454616-16454765)
chr3 (7-156)||(55500620-55500769)
chr3 (7-156)||(7781644-7781801)
chr3 (7-148)||(9707950-9708099)
chr3 (7-148)||(17462847-17462996)
chr3 (7-148)||(34158995-34159144)
chr3 (7-156)||(10248058-10248199)
chr3 (7-148)||(45607251-45607384)
chr3 (10-148)||(13152135-13152265)
chr3 (10-148)||(13154600-13154730)
chr3 (7-127)||(55476191-55476303)
chr3 (39-129)||(29172969-29173059)
chr3 (59-156)||(28848946-28849043)
chr3 (59-156)||(6469465-6469563)
chr3 (54-148)||(15977236-15977330)
chr3 (39-148)||(45578182-45578284)
chr3 (47-128)||(21618184-21618266)
chr3 (47-128)||(36166290-36166372)
chr3 (83-128)||(9577449-9577495)
chr3 (63-128)||(15206659-15206725)
chr3 (8-43)||(29173072-29173107)
chr3 (83-128)||(12377703-12377749)
chr3 (83-128)||(13919110-13919156)
chr3 (83-128)||(15245761-15245807)
chr3 (83-128)||(15264882-15264928)
chr3 (83-128)||(32404482-32404527)
chr3 (83-125)||(37427490-37427533)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (7-148)||(23594079-23594220)
chr1 (7-148)||(21475431-21475572)
chr1 (7-149)||(13988579-13988729)
chr1 (7-149)||(21923634-21923784)
chr1 (7-131)||(41372783-41372907)
chr1 (83-128)||(20316158-20316204)
chr1 (83-128)||(21043613-21043659)
chr1 (83-128)||(22118556-22118602)
chr1 (83-128)||(48520036-48520082)
chr1 (83-127)||(23967499-23967544)
chr1 (83-128)||(47190382-47190427)
chr1 (83-128)||(52954649-52954694)
chr1 (85-128)||(20957935-20957979)
chr1 (83-126)||(35982167-35982211)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (7-148)||(571074-571215)
chr2 (7-156)||(24905968-24906125)
chr2 (7-156)||(24908443-24908600)
chr2 (9-156)||(26507529-26507684)
chr2 (7-149)||(23709875-23710025)
chr2 (7-148)||(32039842-32039983)
chr2 (7-148)||(18808612-18808761)
chr2 (7-156)||(24901014-24901171)
chr2 (7-156)||(24903491-24903648)
chr2 (7-127)||(34402872-34402992)
chr2 (7-156)||(39681983-39682140)
chr2 (12-156)||(23135265-23135417)
chr2 (9-156)||(26505051-26505206)
chr2 (7-156)||(24898531-24898696)
chr2 (39-148)||(45030198-45030308)
chr2 (7-127)||(23130547-23130674)
chr2 (7-127)||(23133014-23133141)
chr2 (7-128)||(24529917-24530022)
chr2 (83-148)||(28576852-28576917)
chr2 (83-128)||(18547277-18547323)
chr2 (83-128)||(34136683-34136729)
chr2 (83-128)||(43947659-43947705)
chr2 (84-128)||(39828288-39828333)
chr2 (83-125)||(21115485-21115527)
chr2 (87-125)||(21237519-21237558)
chr2 (83-128)||(23285563-23285610)
chr2 (83-129)||(23791017-23791064)
chr2 (83-128)||(26392168-26392210)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (7-148)||(13624-13765)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (7-148)||(1837853-1837996)
chr4 (7-149)||(15118695-15118845)
chr4 (7-131)||(12033500-12033624)
chr4 (7-148)||(18239763-18239912)
chr4 (7-148)||(50222683-50222832)
chr4 (7-156)||(44614957-44615115)
chr4 (7-148)||(14718310-14718459)
chr4 (7-147)||(3514715-3514848)
chr4 (47-148)||(44773431-44773533)
chr4 (7-100)||(29267332-29267433)
chr4 (39-129)||(15355668-15355759)
chr4 (55-148)||(7641526-7641619)
chr4 (83-128)||(15791428-15791474)
chr4 (83-128)||(26045625-26045671)
chr4 (83-128)||(26050806-26050852)
chr4 (83-126)||(15098938-15098982)
chr4 (106-147)||(15869195-15869238)
chr4 (83-126)||(19736381-19736425)
chr4 (83-129)||(17333022-17333068)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (7-156)||(40070-40227)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (7-156)||(136350-136507)
scaffold0028 (7-156)||(138819-138976)
scaffold0028 (7-156)||(143757-143914)
scaffold0028 (7-156)||(133881-134038)
scaffold0028 (7-156)||(141288-141445)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (7-156)||(4542708-4542865)
chr8 (7-156)||(5853627-5853784)
chr8 (7-156)||(14823444-14823601)
chr8 (7-148)||(1484071-1484220)
chr8 (7-148)||(20402896-20403045)
chr8 (10-148)||(22001426-22001572)
chr8 (7-127)||(4482981-4483093)
chr8 (7-127)||(18678390-18678517)
chr8 (7-127)||(18717579-18717706)
chr8 (47-148)||(20046495-20046597)
chr8 (39-127)||(26225636-26225725)
chr8 (39-127)||(26219445-26219534)
chr8 (83-125)||(37515270-37515313)
chr8 (83-128)||(18833179-18833225)
chr8 (83-128)||(20502432-20502478)
chr8 (83-128)||(22253495-22253541)
chr8 (83-128)||(22963743-22963789)
chr8 (83-128)||(28397293-28397339)
chr8 (83-128)||(22382064-22382110)
chr8 (83-128)||(22525302-22525348)
chr8 (83-128)||(22984028-22984074)
chr8 (83-128)||(22995586-22995632)
chr8 (84-128)||(23667670-23667714)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (7-149)||(37491-37641)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (7-148)||(13061-13210)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (7-148)||(20416-20565)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (7-148)||(9418-9567)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (7-148)||(94080-94229)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (7-128)||(158795-158924)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (7-147)||(4393-4535)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (47-128)||(116154-116236)
[»] scaffold0853 (1 HSPs)
scaffold0853 (83-128)||(2995-3041)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (83-128)||(9915-9961)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (83-128)||(1637-1683)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (83-128)||(8633-8679)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (83-128)||(17247-17293)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (83-128)||(10882-10928)
scaffold0040 (55-128)||(21956-22028)
scaffold0040 (83-128)||(103962-104006)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (83-128)||(38446-38492)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (83-128)||(6758-6804)
scaffold0010 (87-128)||(394-436)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (83-128)||(497206-497252)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (83-129)||(12002-12049)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (83-128)||(1444-1490)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (83-128)||(2149-2195)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (83-128)||(10805-10850)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (83-128)||(106064-106110)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (83-128)||(12314-12358)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (106-148)||(8780-8824)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (83-128)||(136715-136759)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (106-147)||(9677-9720)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (83-128)||(769-816)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (86-128)||(5026-5068)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 146; Significance: 3e-77; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1541395 - 1541246
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1541395 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 1541296  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1541295 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 1541246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 12741995 - 12742144
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12741995 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 12742094  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12742095 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 12742144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 22781941 - 22782098
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22781941 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 22782040  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22782041 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 22782098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 33861464 - 33861621
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861464 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 33861563  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33861564 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 33861621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2291673 - 2291524
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291673 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 2291574  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291573 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 2291524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 8054698 - 8054847
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8054698 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 8054797  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8054798 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 8054847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18335085 - 18334936
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18335085 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 18334986  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334985 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 18334936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 19004715 - 19004864
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19004715 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 19004814  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19004815 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 19004864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 24422216 - 24422365
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422216 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 24422315  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422316 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 24422365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26925132 - 26924975
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26925132 agaatcacaactttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 26925033  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26925032 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 26924975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 33863947 - 33864096
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33863947 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 33864046  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864047 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 33864096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25591249 - 25591120
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaa--------cttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25591249 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaatttgataacttgacaactcgacaacttaacctcttgactatgcaactt 25591150  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25591149 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 25591120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 25688245 - 25688358
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||    
T  25688245 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaactcgataacttgacaa--------cttgactatgccacttaatcttct 25688336  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25688337 aatcatgcatgtggtaccaatc 25688358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19859378 - 19859263
Alignment:
Q  34 atttaacaacttaacaactcgacaa-cttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttg 132  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859378 atttatcaacttgacaacttgacaatcttgacaactcgacaacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttg 19859279  T
Q  133 agcgtaaataggctcc 148  Q
    || |||||||| ||||    
T  19859278 agtgtaaatagactcc 19859263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 64
Target Start/End: Original strand, 25656472 - 25656529
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgac 64  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656472 agaataacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgac 25656529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Original strand, 25714168 - 25714233
Alignment:
Q  63 acaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714168 acaactcgacaacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 25714233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 25656524 - 25656569
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656524 cttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 25656569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 64
Target Start/End: Original strand, 25714136 - 25714193
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgac 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  25714136 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaactcgacaacttgacaacttgac 25714193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17230031 - 17229985
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17230031 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 17229985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 17742939 - 17742985
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17742939 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 17742985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 20136415 - 20136459
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20136415 cttgactatgcaacttcatcttcttaatcatgcatgtggtaccaa 20136459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22196454 - 22196410
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22196454 cttgactatgcaacttcatcttcttaatcatgcatgtggtaccaa 22196410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 16492893 - 16492938
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16492893 cttgactatgcaactta-tcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 16492938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18896685 - 18896640
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18896685 cttgactatgcaactta-tcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 18896640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 35007894 - 35007939
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttc-taatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35007894 cttgactatgcaacttaa-cttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 35007939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18178048 - 18178001
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct--aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18178048 cttgactatgcaactctatcttcttaaatcatgcatgtggtaccaatc 18178001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 142; Significance: 8e-75; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26356443 - 26356294
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26356443 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 26356344  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26356343 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 26356294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26358895 - 26358746
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358895 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 26358796  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26358795 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 26358746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 32125168 - 32125309
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125168 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 32125267  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125268 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 32125309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 16409737 - 16409886
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16409737 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaactcgataacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 16409836  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16409837 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 16409886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 41522594 - 41522735
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522594 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 41522693  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522694 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 41522735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 41525056 - 41525197
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525056 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 41525155  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525156 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 41525197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 455999 - 456148
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455999 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 456098  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  456099 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggcttcagggcatc 456148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15377206 - 15377056
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15377206 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 15377107  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15377106 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 15377056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20385615 - 20385465
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385615 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 20385516  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385515 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 20385465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 11972165 - 11972314
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972165 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 11972264  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972265 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 11972314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14949614 - 14949457
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949614 agaatcatagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 14949515  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14949514 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 14949457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21190088 - 21189939
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21190088 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 21189989  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189988 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 21189939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 16232189 - 16232338
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232189 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 16232288  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16232289 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttaagcgtaaataggctcc 16232338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 24701924 - 24702065
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701924 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgaca--------acttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 24702015  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24702016 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 24702065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 24704374 - 24704515
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704374 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgaca--------acttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 24704465  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24704466 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 24704515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11393760 - 11393637
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393760 agaatcatagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaacttgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 11393661  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11393660 aatcatgcatgtggtaccaatctt 11393637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 27216546 - 27216687
Alignment:
Q  9 aatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctct--tgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27216546 aatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaactt--------gacaacttgataacttgacaacttaacctctcttgactatgcaacttaatcttct 27216637  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27216638 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 27216687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 18639988 - 18640090
Alignment:
Q  47 acaactcgacaa-cttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggc 145  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18639988 acaacttgacaatcttgacaactcgacaacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggc 18640087  T
Q  146 tcc 148  Q
    |||    
T  18640088 tcc 18640090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Original strand, 18423415 - 18423508
Alignment:
Q  55 acaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    |||||||  ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18423415 acaacttatcaactcgacaacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 18423508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10064240 - 10064143
Alignment:
Q  39 acaacttaacaactcgacaacttgacaa-cttgacaact---taacct-----cttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaat 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10064240 acaacttatcaactcgacaacttgacaatcttgacaactcgataacttgagaacttgactatgcaacttaatcctctaatcatgcatgtggtaccaat 10064143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 129
Target Start/End: Original strand, 42461692 - 42461739
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatct 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42461692 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatct 42461739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 38519115 - 38519161
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38519115 cttgactatgcaacttattcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 38519161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 128
Target Start/End: Original strand, 16995967 - 16996011
Alignment:
Q  85 tgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16995967 tgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 16996011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9033685 - 9033642
Alignment:
Q  86 gactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9033685 gactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 9033642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 131193 - 131148
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  131193 cttgactatgcaactta-tcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 131148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11525941 - 11525896
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11525941 cttgactatgcaactta-tcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 11525896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17017795 - 17017749
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17017795 cttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 17017749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1543554 - 1543510
Alignment:
Q  106 taatcatgcatgtggtaccaatc--tttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  1543554 taatcatgcatgtggtaccaatcatattgagcgtaaataggctcc 1543510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 72
Target Start/End: Original strand, 18423415 - 18423448
Alignment:
Q  39 acaacttaacaactcgacaacttgacaacttgac 72  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18423415 acaacttatcaactcgacaacttgacaacttgac 18423448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9390228 - 9390184
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaa 126  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9390228 cttgactatgcaacttcaacttcttaatcatgcatgtggtaccaa 9390184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 128
Target Start/End: Original strand, 19281935 - 19281974
Alignment:
Q  89 tatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19281935 tatgcaacttcaacttctaatcatgcatgtagtaccaatc 19281974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 128
Target Start/End: Original strand, 48990965 - 48991007
Alignment:
Q  86 gactatgcaacttaatcttc-taatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  48990965 gactatgcaacttaa-cttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 48991007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 142; Significance: 8e-75; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10733424 - 10733275
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733424 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 10733325  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10733324 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 10733275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 29348131 - 29348280
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348131 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 29348230  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29348231 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 29348280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 29350604 - 29350753
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350604 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 29350703  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29350704 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 29350753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42245849 - 42245700
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245849 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 42245750  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42245749 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 42245700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 29345650 - 29345807
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29345650 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 29345749  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29345750 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 29345807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 265258 - 265112
Alignment:
Q  10 atcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  265258 atcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaat 265159  T
Q  102 cttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  265158 cttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 265112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 20908681 - 20908830
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20908681 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcaacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 20908780  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20908781 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 20908830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 39363084 - 39363196
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363084 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgaca--------acttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 39363175  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39363176 aatcatgcatgtggtaccaat 39363196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 31143957 - 31144074
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaact--taatctt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31143957 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgaca--------acttgacaacttaacctcttgactatgcaacttataatctt 31144048  T
Q  105 ctaatcatgcatgtggtaccaatctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31144049 ctaatcatgcatgtggtaccaatctt 31144074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 148
Target Start/End: Original strand, 39244845 - 39244954
Alignment:
Q  40 caacttaacaactcgacaactt-gacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgta 138  Q
    ||||| ||||||| ||||| || |||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244845 caactcaacaacttgacaattttgacaactccacaacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgta 39244944  T
Q  139 aataggctcc 148  Q
    ||||||||||    
T  39244945 aataggctcc 39244954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2155105 - 2155000
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||||||    
T  2155105 agaatcacaactttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaact----------------tgactatgcaacttaatcttct 2155022  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2155021 aatcatgcatgtggtaccaatc 2155000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26733166 - 26733120
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttc-taatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26733166 cttgactatgcaacttaatcctcataatcatgcatgtggtaccaatc 26733120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23202900 - 23202861
Alignment:
Q  89 tatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23202900 tatgcaacttcaacttctaatcatgcatgtggtaccaatc 23202861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 128
Target Start/End: Original strand, 23469549 - 23469592
Alignment:
Q  86 gactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23469549 gactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 23469592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 15796166 - 15796212
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15796166 cttgactatgcaactctatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 15796212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21732304 - 21732259
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21732304 cttgactatgcaactta-tcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 21732259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21809955 - 21809910
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21809955 cttgactatgcaactta-tcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 21809910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26741022 - 26740976
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26741022 cttgactatccaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 26740976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 129
Target Start/End: Original strand, 16227522 - 16227563
Alignment:
Q  89 tatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatct 129  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16227522 tatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatct 16227563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 25743507 - 25743554
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct--aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25743507 cttgactatgcaactctatcttcttaaatcatgcatgtggtaccaatc 25743554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 142; Significance: 8e-75; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16454765 - 16454616
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454765 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 16454666  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16454665 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 16454616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 55500620 - 55500769
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55500620 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcaacaacttgacaacttgacaacttaacttcttgactatgcaacttaatcttct 55500719  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  55500720 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctctagggcatc 55500769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7781801 - 7781644
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781801 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataactggacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 7781702  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7781701 aatcttctaaacatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 7781644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9708099 - 9707950
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9708099 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 9708000  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707999 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 9707950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 17462847 - 17462996
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462847 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 17462946  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462947 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 17462996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 34158995 - 34159144
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158995 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 34159094  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159095 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 34159144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10248199 - 10248058
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10248199 agaatcacagctttcaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaactt--------aacctcttgactatgcaacttaatcttct 10248108  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10248107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 10248058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 45607384 - 45607251
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607384 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaactt--------aacctcttgactatgcaacttaatcttct 45607293  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607292 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 45607251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13152265 - 13152135
Alignment:
Q  10 atcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13152265 atcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaactt--------aacctcttgactatgcaacttaatcttctaat 13152174  T
Q  110 catgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13152173 catgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 13152135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13154730 - 13154600
Alignment:
Q  10 atcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154730 atcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaactt--------aacctcttgactatgcaacttaatcttctaat 13154639  T
Q  110 catgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154638 catgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 13154600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 55476191 - 55476303
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476191 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgaca--------acttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 55476282  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  55476283 aatcatgcatgtggtaccaat 55476303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 29173059 - 29172969
Alignment:
Q  39 acaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatct 129  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173059 acaacttgacaacttgataacttgacaactcgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatct 29172969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28849043 - 28848946
Alignment:
Q  59 cttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28849043 cttgacaactcgacaacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcataaataggctccagggcatc 28848946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6469563 - 6469465
Alignment:
Q  59 cttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggct-ccaggacatc 156  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6469563 cttgacaactcgacaacttgacaacttgattatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcccaggacatc 6469465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Original strand, 15977236 - 15977330
Alignment:
Q  54 gacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15977236 gacaactcgacaactcgacaacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcataaataggctcc 15977330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 45578284 - 45578182
Alignment:
Q  39 acaacttaacaactcgacaacttgacaa-cttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgt 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578284 acaacttatcaactcgacaacttgacaatcttgacaa--------cttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgt 45578193  T
Q  138 aaataggctcc 148  Q
    |||||||||||    
T  45578192 aaataggctcc 45578182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 21618184 - 21618266
Alignment:
Q  47 acaactcgacaa-cttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618184 acaacttgacaatcttgacaactcgacaacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 21618266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 36166290 - 36166372
Alignment:
Q  47 acaactcgacaa-cttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166290 acaacttgacaatcttgacaactcgacgacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 36166372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 9577449 - 9577495
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9577449 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 9577495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Original strand, 15206659 - 15206725
Alignment:
Q  63 acaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15206659 acaacttatcaacttaacaacttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 15206725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 29173107 - 29173072
Alignment:
Q  8 gaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaac 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29173107 gaatcacagctttaaacaatttcataatttaacaac 29173072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 12377703 - 12377749
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12377703 cttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 12377749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 13919110 - 13919156
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13919110 cttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 13919156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 15245761 - 15245807
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15245761 cttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 15245807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 15264882 - 15264928
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15264882 cttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 15264928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32404527 - 32404482
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32404527 cttgactatgcaactta-tcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 32404482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 125
Target Start/End: Original strand, 37427490 - 37427533
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtacca 125  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37427490 cttgactatgcaacatcatcttcttaatcatgcatgtggtacca 37427533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 8e-75; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23594220 - 23594079
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23594220 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 23594121  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23594120 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 23594079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21475572 - 21475431
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475572 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 21475473  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475472 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 21475431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Original strand, 13988579 - 13988729
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988579 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 13988678  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988679 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 13988729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21923784 - 21923634
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923784 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 21923685  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923684 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 21923634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 41372783 - 41372907
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41372783 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctattgactatgcaacttaatcttct 41372882  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatcttt 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41372883 aatcatgcatgtggtaccaatcttt 41372907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 20316158 - 20316204
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20316158 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 20316204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21043659 - 21043613
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21043659 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 21043613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 22118556 - 22118602
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22118556 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 22118602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 48520036 - 48520082
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48520036 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 48520082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 127
Target Start/End: Original strand, 23967499 - 23967544
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaat 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23967499 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaat 23967544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 47190382 - 47190427
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47190382 cttgactatgcaactta-tcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 47190427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 52954694 - 52954649
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52954694 cttgactatgcaactta-tcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 52954649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 128
Target Start/End: Original strand, 20957935 - 20957979
Alignment:
Q  85 tgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20957935 tgactctgcaacttattcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 20957979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 35982211 - 35982167
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaa 126  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35982211 cttgactatgcaacttcaacttcttaatcatgcatgtggtaccaa 35982167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 571074 - 571215
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571074 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 571173  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571174 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 571215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24906125 - 24905968
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24906125 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 24906026  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24906025 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 24905968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24908600 - 24908443
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908600 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 24908501  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24908500 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 24908443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 26507529 - 26507684
Alignment:
Q  9 aatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507529 aatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaa 26507628  T
Q  101 tcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26507629 tcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 26507684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23710025 - 23709875
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710025 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 23709926  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709925 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 23709875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 32039983 - 32039842
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039983 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaactcgacaacttgataacttgacaacctgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 32039884  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039883 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 32039842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 18808612 - 18808761
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808612 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 18808711  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808712 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 18808761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24901171 - 24901014
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24901171 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 24901072  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24901071 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatatttgagcgtaaataggctccagggcatc 24901014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24903648 - 24903491
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903648 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 24903549  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24903548 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatatttgagcgtaaataggctccagggcatc 24903491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 34402992 - 34402872
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402992 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 34402893  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34402892 aatcatgcatgtggtaccaat 34402872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 39681983 - 39682140
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaac--------ttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39681983 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacctgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 39682082  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39682083 aatcttctaatcatgcatgtggtatcaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 39682140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 23135265 - 23135417
Alignment:
Q  12 cacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135265 cacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatct 23135364  T
Q  104 tctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23135365 tctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 23135417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 26505051 - 26505206
Alignment:
Q  9 aatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaa 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505051 aatcgcagttttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaa 26505150  T
Q  101 tcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26505151 tcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 26505206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24898696 - 24898531
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga----------------caacttgacaacttaacctcttgacta 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||||||||||||||    
T  24898696 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgacta 24898597  T
Q  91 tgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24898596 tgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 24898531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 45030308 - 45030198
Alignment:
Q  39 acaacttaacaactcgacaacttgacaa-cttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgt 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45030308 acaacttatcaactcgacaacttgacaatcttgacaactcgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgt 45030209  T
Q  138 aaataggctcc 148  Q
    |||||||||||    
T  45030208 aaataggctcc 45030198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 23130547 - 23130674
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgac--------aacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130547 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 23130646  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaat 127  Q
    |  | ||| || |||||||||||||||||    
T  23130647 agacctcttat-atgcatgtggtaccaat 23130674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 23133014 - 23133141
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgac--------aacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133014 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 23133113  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaat 127  Q
    |  | ||| || |||||||||||||||||    
T  23133114 agacctcttat-atgcatgtggtaccaat 23133141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24530022 - 24529917
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||||||    
T  24530022 agaatcacaactttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaact----------------tgactatgcaacttaatcttct 24529939  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24529938 aatcatgcatgtggtaccaatc 24529917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Original strand, 28576852 - 28576917
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28576852 cttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgttaataggctcc 28576917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18547323 - 18547277
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18547323 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 18547277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 34136683 - 34136729
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34136683 cttgactatgcaacttattcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 34136729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 43947705 - 43947659
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43947705 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 43947659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39828333 - 39828288
Alignment:
Q  84 ttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39828333 ttgactatgcaacttaattctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 39828288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 125
Target Start/End: Original strand, 21115485 - 21115527
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtacca 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21115485 cttgactatgcaactta-tcttcttaatcatgcatgtggtacca 21115527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 125
Target Start/End: Original strand, 21237519 - 21237558
Alignment:
Q  87 actatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtacca 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21237519 actatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtacca 21237558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 23285563 - 23285610
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaactt-aatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23285563 cttgactatgcaacttaaatcttctaaatcatgcatgcggtaccaatc 23285610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 129
Target Start/End: Original strand, 23791017 - 23791064
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatct 129  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23791017 cttgactatgcaacttagacctcttaatcatgcatgtggtaccaatct 23791064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 26392168 - 26392210
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  26392168 cttgactatgcaacttaatcttcta---atgcatatggtaccaatc 26392210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 130; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 13624 - 13765
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13624 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttaacctcttgactatgcgacttaatcttct 13723  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13724 aatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgcaaataggctcc 13765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 4e-67; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1837996 - 1837853
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaac--ctcttgactatgcaacttaatctt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1837996 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaccaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctctcttgactatgcaacttaatctt 1837897  T
Q  105 ctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837896 ctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 1837853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15118845 - 15118695
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118845 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 15118746  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118745 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 15118695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12033624 - 12033500
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12033624 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 12033525  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatcttt 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12033524 aatcatgcatgtggtaccaatcttt 12033500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18239912 - 18239763
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239912 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 18239813  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239812 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 18239763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 50222832 - 50222683
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222832 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 50222733  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222732 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 50222683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 44614957 - 44615115
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgac-tatgcaact 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44614957 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgacctatgcaact 44615056  T
Q  98 taatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44615057 taatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 44615115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14718459 - 14718310
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14718459 agaatcacaactttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 14718360  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14718359 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 14718310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 147
Target Start/End: Original strand, 3514715 - 3514848
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  3514715 agaatcacaactttaaacaatttcatgatttaactacttaacaactcgacaacttgataacttgacaa--------cttgactatgcaacttaatcttct 3514806  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatc--tttgagcgtaaataggctc 147  Q
     ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||    
T  3514807 -atcatgcatgtggtaccaaccatattgagcgtaaataggctc 3514848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 44773533 - 44773431
Alignment:
Q  47 acaactcgacaa-cttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggc 145  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773533 acaacttgacaatcttgacaactcgacaacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcaagcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggc 44773434  T
Q  146 tcc 148  Q
    |||    
T  44773433 tcc 44773431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Original strand, 29267332 - 29267433
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgac--------aacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267332 agaatcacagctttaagcaatttcatgatttaactacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 29267431  T
Q  99 aa 100  Q
    ||    
T  29267432 aa 29267433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15355759 - 15355668
Alignment:
Q  39 acaacttaacaactcgacaacttgacaa-cttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatct 129  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355759 acaacttatcaactcgacaatttgacaatcttgacaactcgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatct 15355668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7641619 - 7641526
Alignment:
Q  55 acaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    |||||||  ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641619 acaacttatcaactcgacaacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaacattgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 7641526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 15791428 - 15791474
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15791428 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 15791474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26045671 - 26045625
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26045671 cttgactatgcaacttattcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 26045625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26050852 - 26050806
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26050852 cttgactatgcaacttattcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 26050806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 15098938 - 15098982
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaa 126  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15098938 cttgactatgcaacttcaacttcttaatcatgcatgtggtaccaa 15098982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15869238 - 15869195
Alignment:
Q  106 taatcatgcatgtggtaccaatc--tttgagcgtaaataggctc 147  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  15869238 taatcatgcatgtggtaccaatcatattgagcgtaaataggctc 15869195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 19736381 - 19736425
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaa 126  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19736381 cttgactatgcaactacatcttcttaatcatgcatgtggtaccaa 19736425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 129
Target Start/End: Original strand, 17333022 - 17333068
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatct 129  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17333022 cttgactatgaaacttaa-cttcttaatcatgcatgtggtaccaatct 17333068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 40070 - 40227
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40070 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 40169  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40170 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 40227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 136350 - 136507
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136350 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 136449  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  136450 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 136507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 138819 - 138976
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138819 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 138918  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  138919 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 138976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 143757 - 143914
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143757 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 143856  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  143857 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 143914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 133881 - 134038
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133881 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttcacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 133980  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  133981 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 134038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 141288 - 141445
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141288 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttcacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 141387  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  141388 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 141445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4542865 - 4542708
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542865 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 4542766  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4542765 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 4542708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5853784 - 5853627
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttga--------caacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853784 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 5853685  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5853684 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 5853627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 14823444 - 14823601
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823444 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 14823543  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccaggacatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14823544 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctccagggcatc 14823601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 1484071 - 1484220
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484071 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 1484170  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484171 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 1484220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 20402896 - 20403045
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20402896 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 20402995  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20402996 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 20403045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Original strand, 22001426 - 22001572
Alignment:
Q  10 atcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001426 atcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaat 22001525  T
Q  102 cttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001526 cttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 22001572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Original strand, 4482981 - 4483093
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4482981 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgaca--------acttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 4483072  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4483073 aatcatgcatgtggtaccaat 4483093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18678517 - 18678390
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgac--------aacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  18678517 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaactcgacaacttaacctcttgactatgcaactt 18678418  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaat 127  Q
    |  | ||| || |||||||||||||||||    
T  18678417 agacctcttat-atgcatgtggtaccaat 18678390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18717706 - 18717579
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgac--------aacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  18717706 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaactcgacaacttaacctcttgactatgcaactt 18717607  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaat 127  Q
    |  | ||| || |||||||||||||||||    
T  18717606 agacctcttat-atgcatgtggtaccaat 18717579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20046597 - 20046495
Alignment:
Q  47 acaactcgacaa-cttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggc 145  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046597 acaacttgacaatcttgacaactcgacaacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggc 20046498  T
Q  146 tcc 148  Q
    |||    
T  20046497 tcc 20046495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26225725 - 26225636
Alignment:
Q  39 acaacttaacaactcgacaacttgacaa-cttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaat 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225725 acaacttaccaactcgacaacttgacaatcttgacaactcgacaacttgacaatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaat 26225636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 127
Target Start/End: Original strand, 26219445 - 26219534
Alignment:
Q  39 acaacttaacaactcgacaacttgacaa-cttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaat 127  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219445 acaacttatccactcgacaacttgacaatcttgacaactcgacaacttgacaatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaat 26219534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 125
Target Start/End: Original strand, 37515270 - 37515313
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtacca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37515270 cttgactatgcaacttaatcttctaaatcatgcatgtggtacca 37515313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 18833179 - 18833225
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18833179 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 18833225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20502478 - 20502432
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20502478 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 20502432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22253541 - 22253495
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22253541 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 22253495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22963789 - 22963743
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22963789 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 22963743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 28397293 - 28397339
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28397293 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 28397339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22382110 - 22382064
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttc-taatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22382110 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtgttaccaatc 22382064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 22525302 - 22525348
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22525302 cttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 22525348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 22984028 - 22984074
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttc-taatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  22984028 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatatggtaccaatc 22984074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 22995586 - 22995632
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttc-taatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  22995586 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatttggtaccaatc 22995632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 128
Target Start/End: Original strand, 23667670 - 23667714
Alignment:
Q  84 ttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23667670 ttgactatgcaactta-tcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 23667714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 122; Significance: 7e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Original strand, 37491 - 37641
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37491 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 37590  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37591 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcca 37641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 121; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 13061 - 13210
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13061 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 13160  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13161 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 13210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 121; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 20416 - 20565
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20416 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 20515  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20516 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 20565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 121; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 9418 - 9567
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgaca--------acttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9418 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 9517  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9518 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 9567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 121; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 94080 - 94229
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaact--------tgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94080 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaactt 94179  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94180 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatctttgagcgtaaataggctcc 94229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 97; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 158924 - 158795
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaact--------taacctcttgactatgcaactt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  158924 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgataacttgacaactcgacaacttaacctcttgactatgcaactt 158825  T
Q  99 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158824 aatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 158795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 92; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 147
Target Start/End: Original strand, 4393 - 4535
Alignment:
Q  7 agaatcacagctttaaacaatttcatgatttaacaacttaacaactcgacaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttct 106  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  4393 agaatcacaactttaaaaaatttcatgatttaactacttaacaactcgacaacttgacaacttgataacttgacaacttgacaatgcaacttaatcttct 4492  T
Q  107 aatcatgcatgtggtaccaatc--tttgagcgtaaataggctc 147  Q
    |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||    
T  4493 aatcatgcatgtggtaccaaccatattgagcgtaaataggctc 4535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 116154 - 116236
Alignment:
Q  47 acaactcgacaa-cttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116154 acaacttgacaatcttgacaactcaacaacttgacaacttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 116236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0853 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0853
Description:

Target: scaffold0853; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3041 - 2995
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3041 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 2995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 9915 - 9961
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9915 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 9961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 1637 - 1683
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1637 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 1683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 8633 - 8679
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8633 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 8679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 17247 - 17293
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17247 cttgactatgcaacttattcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 17293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 10882 - 10928
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10882 cttgactatgcaacttcatcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 10928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 128
Target Start/End: Original strand, 21956 - 22028
Alignment:
Q  55 acaacttgacaacttgacaacttaacctcttgactatgcaacttaatcttc-taatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21956 acaacttgacaacttaacaactt--cgactcgactatgcaacttcatcttcttaatcatgcatgttgtaccaatc 22028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 104006 - 103962
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  104006 cttgactatgcaacttaatcctcttat-atgcatgtggtaccaatc 103962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 38492 - 38446
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38492 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 38446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 6758 - 6804
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6758 cttgactatgcaacttattcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 6804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 128
Target Start/End: Original strand, 394 - 436
Alignment:
Q  87 actatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  394 actatgcaacttattcttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 497206 - 497252
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  497206 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 497252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12049 - 12002
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatct 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12049 cttgactatgcaactttatcttcttaatcatgcacgtggtaccaatct 12002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 1444 - 1490
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1444 cttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 1490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 2149 - 2195
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttc-taatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  2149 cttgactatgcaacttaatcctcttaatcatgcatgtggtagcaatc 2195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 10850 - 10805
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10850 cttgactatgcaacttaa-cttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 10805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 106064 - 106110
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  106064 cttgactatgcaacttaaacctcttaatcatgcatgtggtaccaatc 106110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 12314 - 12358
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  12314 cttgactatgcaacttaatcctcttat-atgcatgtggtaccaatc 12358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8824 - 8780
Alignment:
Q  106 taatcatgcatgtggtaccaatc--tttgagcgtaaataggctcc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8824 taatcatgcatgtggtaccaatcatattgagcgtaaataggctcc 8780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 136759 - 136715
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttctaatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  136759 cttgactatgcaacttaatcctcttat-atgcatgtggtaccaatc 136715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Original strand, 9677 - 9720
Alignment:
Q  106 taatcatgcatgtggtaccaatc--tttgagcgtaaataggctc 147  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  9677 taatcatgcatgtggtaccaatcatattgagcgtaaataggctc 9720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 816 - 769
Alignment:
Q  83 cttgactatgcaacttaatcttc--taatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  816 cttgactatgcaactttatcttccttaatcatgcaagtggtaccaatc 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 28; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 28; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5068 - 5026
Alignment:
Q  86 gactatgcaacttaatcttct-aatcatgcatgtggtaccaatc 128  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5068 gactatgcaacttaa-cttcttaatcatgcatgtggtaccaatc 5026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University