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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: Solexa-NF5873-5 (Length: 215)

Name: Solexa-NF5873-5
Description: NF5873
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] Solexa-NF5873-5
Solexa-NF5873-5
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (8-194)||(42630348-42630535)
chr4 (8-183)||(40694138-40694313)
chr4 (8-194)||(46431797-46431983)
chr4 (78-190)||(49470419-49470530)
chr4 (76-183)||(51858931-51859038)
chr4 (8-194)||(17892316-17892502)
chr4 (9-194)||(24793595-24793780)
chr4 (16-183)||(31946101-31946268)
chr4 (85-194)||(44521910-44522019)
chr4 (8-194)||(2586404-2586590)
chr4 (8-193)||(3109170-3109355)
chr4 (16-194)||(36943745-36943923)
chr4 (8-183)||(36511808-36511984)
chr4 (8-183)||(1177049-1177220)
chr4 (8-194)||(37992398-37992583)
chr4 (78-178)||(754308-754408)
chr4 (149-194)||(24784581-24784626)
chr4 (149-194)||(24823640-24823685)
chr4 (149-194)||(52721563-52721608)
chr4 (9-57)||(21637734-21637782)
chr4 (77-117)||(47607250-47607290)
chr4 (77-112)||(51858900-51858935)
chr4 (78-119)||(726495-726536)
chr4 (8-57)||(4400536-4400585)
chr4 (8-57)||(55901140-55901189)
chr4 (78-110)||(21637734-21637766)
chr4 (9-57)||(49069249-49069297)
chr4 (110-170)||(51674959-51675019)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (8-194)||(17138118-17138304)
chr5 (8-193)||(26691684-26691869)
chr5 (8-193)||(26961416-26961601)
chr5 (8-183)||(26716341-26716516)
chr5 (8-183)||(26986081-26986256)
chr5 (8-194)||(5612306-5612492)
chr5 (8-194)||(30284469-30284657)
chr5 (8-183)||(3934662-3934838)
chr5 (23-183)||(27938242-27938402)
chr5 (77-194)||(27085486-27085603)
chr5 (87-194)||(22737985-22738092)
chr5 (77-175)||(25749743-25749841)
chr5 (8-183)||(43357634-43357809)
chr5 (9-194)||(18001830-18002014)
chr5 (77-194)||(41233447-41233560)
chr5 (8-183)||(1795460-1795636)
chr5 (24-175)||(42365990-42366137)
chr5 (77-194)||(11694340-11694455)
chr5 (78-183)||(35746196-35746300)
chr5 (87-194)||(5722124-5722231)
chr5 (8-57)||(6243170-6243219)
chr5 (8-57)||(21251533-21251582)
chr5 (8-57)||(27085432-27085481)
chr5 (120-184)||(7629226-7629290)
chr5 (101-194)||(34032521-34032616)
chr5 (8-57)||(7629127-7629176)
chr5 (8-57)||(11906286-11906335)
chr5 (8-57)||(26795005-26795054)
chr5 (149-194)||(30777274-30777319)
chr5 (8-57)||(34032437-34032486)
chr5 (77-110)||(34032437-34032470)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (17-193)||(30787426-30787603)
chr3 (23-193)||(25700843-25701014)
chr3 (8-193)||(55268881-55269066)
chr3 (16-194)||(7899582-7899761)
chr3 (8-194)||(28968578-28968765)
chr3 (8-183)||(41741947-41742122)
chr3 (8-194)||(47642074-47642260)
chr3 (8-194)||(21157593-21157779)
chr3 (66-185)||(38888959-38889078)
chr3 (16-194)||(19878966-19879145)
chr3 (76-194)||(45057165-45057283)
chr3 (77-194)||(13353059-13353176)
chr3 (8-178)||(19421484-19421654)
chr3 (8-193)||(6134247-6134432)
chr3 (8-175)||(22289604-22289771)
chr3 (77-183)||(29915929-29916035)
chr3 (77-183)||(29965082-29965188)
chr3 (85-183)||(42229809-42229907)
chr3 (8-178)||(20510036-20510206)
chr3 (103-194)||(983349-983440)
chr3 (77-183)||(2122846-2122952)
chr3 (8-183)||(45347365-45347541)
chr3 (8-183)||(13748323-13748497)
chr3 (66-123)||(19349539-19349596)
chr3 (8-123)||(39664026-39664139)
chr3 (149-194)||(2567133-2567178)
chr3 (8-57)||(3983765-3983814)
chr3 (8-57)||(52684269-52684318)
chr3 (8-57)||(983262-983311)
chr3 (8-57)||(2122775-2122824)
chr3 (77-110)||(3983765-3983798)
chr3 (8-57)||(10225163-10225212)
chr3 (8-57)||(28882679-28882728)
chr3 (8-57)||(30226488-30226537)
chr3 (8-57)||(42229742-42229791)
chr3 (149-194)||(52684536-52684581)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (8-183)||(34146248-34146423)
chr2 (8-185)||(2319343-2319520)
chr2 (16-193)||(31236051-31236228)
chr2 (8-183)||(3563908-3564083)
chr2 (8-183)||(44156665-44156841)
chr2 (8-194)||(35342385-35342572)
chr2 (66-187)||(14217021-14217142)
chr2 (8-194)||(3545444-3545631)
chr2 (8-183)||(8482792-8482967)
chr2 (23-178)||(12206108-12206262)
chr2 (66-183)||(14824265-14824382)
chr2 (8-183)||(1005580-1005755)
chr2 (66-192)||(21104608-21104734)
chr2 (8-183)||(4561856-4562032)
chr2 (13-183)||(1776311-1776481)
chr2 (87-183)||(24585681-24585778)
chr2 (106-178)||(4355478-4355550)
chr2 (78-178)||(5588176-5588276)
chr2 (82-175)||(40431904-40431997)
chr2 (35-194)||(10573589-10573748)
chr2 (8-114)||(35996711-35996816)
chr2 (149-194)||(45159040-45159085)
chr2 (8-178)||(28746541-28746702)
chr2 (87-194)||(9293252-9293359)
chr2 (8-57)||(40497386-40497435)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (8-194)||(44959999-44960185)
chr7 (78-192)||(36757882-36757996)
chr7 (78-192)||(36767406-36767520)
chr7 (18-194)||(40041454-40041629)
chr7 (9-194)||(35159931-35160115)
chr7 (90-192)||(36763662-36763764)
chr7 (18-183)||(554765-554930)
chr7 (18-194)||(21179911-21180087)
chr7 (8-183)||(24956316-24956491)
chr7 (76-194)||(15878288-15878406)
chr7 (76-194)||(23078973-23079091)
chr7 (77-193)||(1400133-1400249)
chr7 (16-183)||(21409464-21409630)
chr7 (76-183)||(23970001-23970108)
chr7 (6-194)||(33454133-33454321)
chr7 (14-193)||(38064736-38064916)
chr7 (8-176)||(44269790-44269958)
chr7 (8-183)||(26973118-26973297)
chr7 (101-183)||(48153703-48153785)
chr7 (8-54)||(19820868-19820914)
chr7 (8-57)||(23311787-23311836)
chr7 (8-57)||(38064660-38064709)
chr7 (149-194)||(47719952-47719997)
chr7 (146-194)||(11058651-11058699)
chr7 (10-57)||(8056335-8056382)
chr7 (8-57)||(1043072-1043121)
chr7 (149-194)||(9283725-9283770)
chr7 (8-57)||(18113940-18113989)
chr7 (149-194)||(25969713-25969758)
chr7 (8-57)||(27398048-27398097)
chr7 (8-57)||(38263064-38263113)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (8-183)||(37372327-37372503)
chr8 (8-175)||(27886258-27886425)
chr8 (8-175)||(27944916-27945083)
chr8 (8-175)||(27968171-27968340)
chr8 (8-175)||(28025157-28025326)
chr8 (8-178)||(32424989-32425159)
chr8 (77-183)||(3892101-3892207)
chr8 (66-178)||(7411728-7411840)
chr8 (8-180)||(29355691-29355864)
chr8 (8-176)||(20182441-20182609)
chr8 (8-194)||(38388735-38388921)
chr8 (8-118)||(24100133-24100243)
chr8 (151-194)||(40412754-40412797)
chr8 (16-57)||(5818312-5818353)
chr8 (8-57)||(22201338-22201387)
chr8 (8-53)||(30804750-30804795)
chr8 (147-183)||(5818206-5818242)
chr8 (149-185)||(8170979-8171015)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (15-194)||(10894383-10894564)
chr6 (8-183)||(19128221-19128396)
chr6 (16-193)||(7254996-7255174)
chr6 (8-194)||(6707905-6708091)
chr6 (84-183)||(27084118-27084217)
chr6 (8-168)||(11105354-11105514)
chr6 (77-194)||(31079739-31079853)
chr6 (76-185)||(13045249-13045358)
chr6 (77-193)||(13607650-13607766)
chr6 (8-160)||(26327223-26327374)
chr6 (8-183)||(234374-234552)
chr6 (149-194)||(3212778-3212823)
chr6 (77-170)||(13061262-13061355)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (8-175)||(29168015-29168182)
chr1 (77-193)||(2472788-2472904)
chr1 (8-184)||(9781710-9781886)
chr1 (18-194)||(38218461-38218637)
chr1 (35-194)||(41675854-41676012)
chr1 (77-175)||(9528726-9528824)
chr1 (77-191)||(24589991-24590105)
chr1 (24-194)||(24851558-24851724)
chr1 (91-194)||(36551535-36551638)
chr1 (16-194)||(33039689-33039864)
chr1 (8-145)||(48715138-48715275)
chr1 (66-177)||(34096434-34096545)
chr1 (66-183)||(29861923-29862040)
chr1 (8-124)||(3708213-3708329)
chr1 (102-194)||(47654826-47654918)
chr1 (9-57)||(2364746-2364794)
chr1 (85-183)||(10822539-10822637)
chr1 (8-57)||(1036527-1036576)
chr1 (8-57)||(2222980-2223029)
chr1 (8-57)||(28659301-28659350)
chr1 (8-57)||(32381060-32381109)
chr1 (8-57)||(34432384-34432433)
chr1 (85-117)||(32381010-32381042)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 127; Significance: 9e-66; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42630535 - 42630348
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnn-taataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42630535 gatattttccgatacgtatcaggagaatatccgaagattaaattttattttaaaaaaataataattatccgatacttcctgatacgtatcaggtgagtat 42630436  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42630435 ccgataattatcttgcactgatatctgctccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 42630348  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 40694138 - 40694313
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||        |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40694138 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatctgaagattaaattttatttttttataaaataattatctgatacttcccgatacgtatgaggagagtatc 40694237  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40694238 caataattatcctgcactgatatctgccccaatacttcccaattaatattaactaaaataacttaactcttgagta 40694313  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 46431983 - 46431797
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||        |||||| || ||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  46431983 gatacttcccgatacgtatcaagagagtatccaaagattaaattttattttaaaaaaaaataattatccgatacttttcgatatgtatcaggagagtatc 46431884  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  46431883 cgataattatcatgcaccgatacctgccctgatatttcacaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 46431797  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 190
Target Start/End: Original strand, 49470419 - 49470530
Alignment:
Q  78 atacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactct 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49470419 atacttcccgatacgtatcaggagagtatctgataattatcctgcactgatatctgccccgatacttc-caattaatgttaactaaaataacttaactct 49470517  T
Q  178 tcagtacttatgt 190  Q
    | |||||| ||||    
T  49470518 tgagtactcatgt 49470530  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 183
Target Start/End: Original strand, 51858931 - 51859038
Alignment:
Q  76 cgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51858931 cgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcttgcactgatacctgcctcaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaact 51859030  T
Q  176 cttcagta 183  Q
    ||| ||||    
T  51859031 cttgagta 51859038  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 17892316 - 17892502
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17892316 gatacttcccgatatgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttaaaaaaaaataattatatgatacttcccaatacgtatcaggagagtatc 17892415  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    | || |||||| | |||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  17892416 caatcattatcctacaccagtatctgccccgatacttcccaattaatgttaacaaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 17892502  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24793780 - 24793595
Alignment:
Q  9 atactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatcc 108  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| ||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24793780 atacttttcgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttttaaaaaaataattatctgatacttcccaatacgtatcaggagagtatcc 24793681  T
Q  109 gataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||| |||||| | |||   || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  24793680 gatcattatcctacaccagtaactacctcgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 24793595  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31946268 - 31946101
Alignment:
Q  16 ccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataatt 115  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31946268 ccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataatt 31946169  T
Q  116 atcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||| || |   |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  31946168 atcctgtaacaatatctgccccaatacttcccaattaatgttaattaaaataacttaactcttgagta 31946101  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44522019 - 44521910
Alignment:
Q  85 ccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtac 184  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44522019 ccgatacgtatcaggagagtatccgataattatccttcattgatatctgccccgatactttccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtac 44521920  T
Q  185 ttatgtgttc 194  Q
    | ||||||||    
T  44521919 taatgtgttc 44521910  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 2586404 - 2586590
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||| |||        |||||| || | |||||||||||||| || |||| |||||||    
T  2586404 gatactttccaatacgtatcagaagagtatccgaagattaaaatttgtttttttaaaaaataattatcctatacttcccgatacataccaggagagtatc 2586503  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
     ||| |||||| | ||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  2586504 tgatcattatcctacaccggtatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttcaggactgatgtgttc 2586590  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3109355 - 3109170
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||| ||| ||||| ||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  3109355 gatatttttcgatacgtatcagaagattaatcgaagattaaattttattttttaaacaaataattatccgatacttctcgatacgtatccggagagtatc 3109256  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgtt 193  Q
    | || |||||| | ||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  3109255 caatcattatcctacaccggtatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgtt 3109170  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 36943745 - 36943923
Alignment:
Q  16 ccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataatt 115  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||        |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  36943745 ccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaaatttattttttttaaaaataattatctgatacttcctgatacgtatcaggagagtatctgatcatt 36943844  T
Q  116 atcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||| | ||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  36943845 atcctacaccggtatctgccctgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtagtgatgtgttc 36943923  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 36511984 - 36511808
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaa-taataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        || |||| || |||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  36511984 gatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaaataattatccgatacttcctgatacgtatcaggaaagtat 36511885  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    |||||||||||| || ||| ||| || |||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  36511884 ccgataattatcctgaacttatacctgccccaataattcccaattaacgttaaataaaataacttaactcttgagta 36511808  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 1177049 - 1177220
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1177049 gatactttccgatatgtatcagaagagtatccgaaattt---ttttattttttttta-aataattatccgatacttcccgatacgtatcaggaaagtatc 1177144  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||| |||||  ||| || |||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  1177145 cgataattatcctgcacctatacctgccccaataattcccaattaacgttaaataaaataacttaactcttgagta 1177220  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37992583 - 37992398
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaa-taataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||        || |||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  37992583 gatactttccgatacgtatcagaagagtatccaaagattaaattttatttttttaaaaaaataattatccgataattcccgatacatatcaggagagtat 37992484  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    | ||| |||||  ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  37992483 ctgatgattattctgcaccgatatctgccccgatatttctcaattaat--taactaaaataacttaactcttgagtaccgatgtgttc 37992398  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 754308 - 754408
Alignment:
Q  78 atacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactct 177  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  754308 atacttcctgatacgtatcaggagagtatccgatcattatcctacaccgatatccgccccgatacttaccatttaatgttaactaaactaacttaactct 754407  T
Q  178 t 178  Q
    |    
T  754408 t 754408  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 194
Target Start/End: Original strand, 24784581 - 24784626
Alignment:
Q  149 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  24784581 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 24784626  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24823685 - 24823640
Alignment:
Q  149 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  24823685 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 24823640  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 194
Target Start/End: Original strand, 52721563 - 52721608
Alignment:
Q  149 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  52721563 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 52721608  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Original strand, 21637734 - 21637782
Alignment:
Q  9 atactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21637734 atacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattt 21637782  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 117
Target Start/End: Original strand, 47607250 - 47607290
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47607250 gatacttcccgatacgtatcaggatagtatccgataattat 47607290  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 112
Target Start/End: Original strand, 51858900 - 51858935
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgata 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51858900 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgata 51858935  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 726536 - 726495
Alignment:
Q  78 atacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatct 119  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  726536 atacttcctgatacgtatcaggagagtatccgatcattatct 726495  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 4400536 - 4400585
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  4400536 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatcagaatattaaattttattt 4400585  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 55901189 - 55901140
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  55901189 gatacttctcgatacgtatcaggaaaatatccgaagattaaattttattt 55901140  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 110
Target Start/End: Original strand, 21637734 - 21637766
Alignment:
Q  78 atacttcccgatacgtatcaggtgagtatccga 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21637734 atacttcccgatacgtatcaggagagtatccga 21637766  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Original strand, 49069249 - 49069297
Alignment:
Q  9 atactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  49069249 atactttctgatatgtattaggagagtattcgaagattaaattttattt 49069297  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 170
Target Start/End: Original strand, 51674959 - 51675019
Alignment:
Q  110 ataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataact 170  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51674959 ataattatcctgcacggatatctgcttcaatatttcccaattaatgttaactaaaataact 51675019  T

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Target: chr5 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17138304 - 17138118
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||        | |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17138304 gatacttcccgatacgtatcaggagaatatccgaagattaaattttatttttttaaaaagtaattatctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatc 17138205  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  17138204 cgataattatcctgcactgatatctgccctgatatttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttc 17138118  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 193
Target Start/End: Original strand, 26691684 - 26691869
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  26691684 gatacttcccgatacgtatcaagagagtatccgaagattaaattttattttttttaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggatagtatg 26691783  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgtt 193  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || |||||| |||||||    
T  26691784 cgataattatcctgcattgatatctgctccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaagttttgagtactgatgtgtt 26691869  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 193
Target Start/End: Original strand, 26961416 - 26961601
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  26961416 gatacttcccgatacgtatcaagagagtatccgaagattaaattttattttttttaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggatagtatg 26961515  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgtt 193  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || |||||| |||||||    
T  26961516 cgataattatcctgcattgatatctgctccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaagttttgagtactgatgtgtt 26961601  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 26716341 - 26716516
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26716341 gatacttcccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatc 26716440  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||| |||||  ||| || || | ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  26716441 cgataattatcctgcaccaatacctgcctcaatacttcccaattaatgttagttaaaataacttaactcttgagta 26716516  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 26986081 - 26986256
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26986081 gatacttcccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatc 26986180  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||| |||||  ||| || || | ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  26986181 cgataattatcctgcaccaatacctgcctcaatacttcccaattaatgttagttaaaataacttaactcttgagta 26986256  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5612492 - 5612306
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5612492 gatactttctgatacgtaccaggagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcctgatacgtatcaggagagtatc 5612393  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
     |||||||||| ||||| | || || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| | ||||||||    
T  5612392 tgataattatcctgcaccgctacctgccccgatagttcccaattaatgttaattaaaataacttaactctcgagtattgatgtgttc 5612306  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30284657 - 30284469
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatac--gtatcaggtgagta 105  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  30284657 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttaaaaaaaaataattatccgatacttcccgatacacgtaccaggagagta 30284558  T
Q  106 tccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    | | ||||||||  ||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||    
T  30284557 ttcaataattattctgcaccgatatctgccctgatatttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcctgagtagtgatgtgttc 30284469  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3934838 - 3934662
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnn-taataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        ||||||| || | |||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  3934838 gatacttaccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttttaaaaataataattatccaatactttccgatacgtatcatgagagtat 3934739  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    |||||||||||| ||||  |||| || ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3934738 ccgataattatcctgcatcgatacctgcctaaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 3934662  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 183
Target Start/End: Original strand, 27938242 - 27938402
Alignment:
Q  23 gtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgc 122  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  27938242 gtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcccaatacgtatcaggagagtatccgataattatcctac 27938341  T
Q  123 actgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||  ||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  27938342 accaatatctaccctaatacttctcaattaatattaattaaaataacttaactcttaagta 27938402  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 27085486 - 27085603
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| || || |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27085486 gatacttcccaatacgtatcagaagagtatctgataattatcctgaaccgatagctcccccgatatttgccaattaatgttaactaaaataacttaactc 27085585  T
Q  177 ttcagtacttatgtgttc 194  Q
    || |||||| ||||||||    
T  27085586 ttgagtactgatgtgttc 27085603  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 194
Target Start/End: Original strand, 22737985 - 22738092
Alignment:
Q  87 gatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtactt 186  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||     
T  22737985 gatacgtatcagaagagtatctgataattatcctgcactgatacctgcctcgatacttctcaattaatgttaactaaaataatttaactcttgagcactg 22738084  T
Q  187 atgtgttc 194  Q
    ||||||||    
T  22738085 atgtgttc 22738092  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 175
Target Start/End: Original strand, 25749743 - 25749841
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25749743 gatactttccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcaccaatacctgccccaatacttcccaattaatgttaattaaaataacttaact 25749841  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 43357809 - 43357634
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  43357809 gatactttccgatacgtattaaaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggaaagtatc 43357710  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
     |||||||||| |||||  ||| || || | ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  43357709 tgataattatcctgcacctatacctgcctcaataattcccaattaacgttaaataaaataacttaactcttgagta 43357634  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18002014 - 18001830
Alignment:
Q  9 atactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatcc 108  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||        |||||| ||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  18002014 atacttcccgatacatatcaggagagtatttgaagattaaattttattttttttaaaaataattatctgatactttccgatacgtatcaagagagtatcc 18001915  T
Q  109 gataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||| ||||| |||| || | || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | || |||||| ||||||||    
T  18001914 gataattatcatgcaccgatacctgctccaata-ttctcaattaatgttaactaaaataacttaattattgagtactgatgtgttc 18001830  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 41233447 - 41233560
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    ||  |||| || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41233447 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatctgataattat----catcgatacctgccccaatatttcccaattaatgttaactaaaataacttaactg 41233542  T
Q  177 ttcagtacttatgtgttc 194  Q
    || |||||| ||||||||    
T  41233543 ttgagtactaatgtgttc 41233560  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 1795460 - 1795636
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaa-taataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        || |||| || |||||||||||||||||||||||   |||||    
T  1795460 gatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttttaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcagaaaagtat 1795559  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    |||||||||||| |||||  ||| ||  ||  ||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  1795560 ccgataattatcctgcacatatacctgtccaaataattcccaactaacgttaaataaaataacttaactcttgagta 1795636  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 42366137 - 42365990
Alignment:
Q  24 tatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgca 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||        |||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42366137 tatcaggagaatatccgaagattaattattatttttta----aataattatccaatacttcccgatatgtatcaggagagtatccgataattatcctgca 42366042  T
Q  124 ctgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    | | || || ||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  42366041 ccgttacctgcctaaatacttcccaattaatgttaactgaaataacttaact 42365990  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 11694340 - 11694455
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| ||||| | || || |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11694340 gatacttcccgatacgtatcaagagaatatctgataattatcctgcaccgctacctgccccaatagttcccaattaatgttaa-taaaataacttaactc 11694438  T
Q  177 ttcagtacttatgtgttc 194  Q
    || |||||| ||||||||    
T  11694439 tt-agtactgatgtgttc 11694455  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35746300 - 35746196
Alignment:
Q  78 atacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactct 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |    || ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35746300 atactttccgatacgtatcaggagagtatctgataattatcctgcactgata-catgtccaatacttcccaattaatgttaagtaaaataacttaactct 35746202  T
Q  178 tcagta 183  Q
    | ||||    
T  35746201 tgagta 35746196  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 194
Target Start/End: Original strand, 5722124 - 5722231
Alignment:
Q  87 gatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtactt 186  Q
    ||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||  |||  | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  5722124 gatacttatcagaagagtattcgataattatcctacacaaatacttgccccgatatttcccaattaatgttgactaaaaaaacttaactcttgagtactt 5722223  T
Q  187 atgtgttc 194  Q
    ||||||||    
T  5722224 atgtgttc 5722231  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 6243219 - 6243170
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6243219 gatactttccgatacgtatccggagagtatccgaatattaaattttattt 6243170  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 21251533 - 21251582
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  21251533 gatactttccgatacgtatcaggagagtatccgaatattaaatttaattt 21251582  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 27085432 - 27085481
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27085432 gatactttccgatacgtatcaagagagtatccggaaattaaattttattt 27085481  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 184
Target Start/End: Original strand, 7629226 - 7629290
Alignment:
Q  120 tgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtac 184  Q
    ||||| |||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  7629226 tgcaccgatacctgccccaatacttctcaattaatgttaactaaaatagcttaactcttgagtac 7629290  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Original strand, 34032521 - 34032616
Alignment:
Q  101 gagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaat--taatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||    
T  34032521 gagtatccgataattattctgcatcgatacctaccccgatattttccaatattaatgttaactaaaataatttaacttttgagtactaatgtgttc 34032616  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 7629127 - 7629176
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  7629127 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatctgaagattaaattttattt 7629176  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 11906286 - 11906335
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11906286 gatacttcccgatacgtatccggagagtatccgaatattaaattttattt 11906335  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26795054 - 26795005
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  26795054 gatactttccgatacgtatccggagagtatccaaatattaaattttattt 26795005  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30777319 - 30777274
Alignment:
Q  149 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  30777319 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtaattatgtgttc 30777274  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 34032437 - 34032486
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  34032437 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaatttttattt 34032486  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 110
Target Start/End: Original strand, 34032437 - 34032470
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34032437 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccga 34032470  T

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Target: chr3 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30787603 - 30787426
Alignment:
Q  17 cgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnn-taataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataatt 115  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        ||||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30787603 cgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttaaaaaaataataattatcctatacttcccgatacatatcaggagagtatccgataatt 30787504  T
Q  116 atcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgtt 193  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  30787503 atcatgcactgatatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgtt 30787426  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 193
Target Start/End: Original strand, 25700843 - 25701014
Alignment:
Q  23 gtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaa-taataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttg 121  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        || |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25700843 gtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttatttttaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctg 25700942  T
Q  122 cactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgtt 193  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25700943 cactgatgtctgccccgatacttcccaattaatgtttactaaaataacttaactcttgagtacttatgtgtt 25701014  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 55269066 - 55268881
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  55269066 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcccgatacgcatcaggatagtatc 55268967  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgtt 193  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  55268966 cgataattatcctgcattgatatctgccatgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaagtcttgagtactgatgtgtt 55268881  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7899761 - 7899582
Alignment:
Q  16 ccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaa-taataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataat 114  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        || |||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||    
T  7899761 ccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttacaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcgggagagtatctgatcat 7899662  T
Q  115 tatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  7899661 tatcctatactgatatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 7899582  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 28968578 - 28968765
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagta-t 106  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28968578 gatacttcccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtaat 28968677  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||||| |||||| | ||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  28968678 ccgatcattatcctacatcggtatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtaatgatgtgttc 28968765  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41742122 - 41741947
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41742122 gatacttcccgatacatatctggagagtatccgaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatccggtacttcccgatacgtatcaggagagtatc 41742023  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  41742022 cgataattatcctgcactgatacatgccccaatacttcccaattaatgttaagtaaaataacttaactcttgagta 41741947  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 47642074 - 47642260
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47642074 gatacttcccaatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttataaaaaaataattatctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatc 47642173  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||| |||||| | |||   ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  47642174 cgatcattatcctacacaagtatctgccccgatactttccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 47642260  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21157779 - 21157593
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21157779 gatactttctgatacgtaccaggagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcctgatacgtatcaggagagtatc 21157680  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
     |||||||||| ||||| | || || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| | ||||||||    
T  21157679 tgataattatcctgcaccgctacctgccccgatagttcccaattaatgttaattaaaataacttaactctcgagtattgatgtgttc 21157593  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38889078 - 38888959
Alignment:
Q  66 aataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaa 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38889078 aataattatttgatacttcccgatgcgtatcaggagagtatccgataattatcctgctctaatacctgccccgatatttctcaattaatgttaactaaaa 38888979  T
Q  166 taactgaactcttcagtact 185  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  38888978 taacttaactcttgagtact 38888959  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19879145 - 19878966
Alignment:
Q  16 ccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataatt 115  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||        |||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19879145 ccgatatgtataaggagagtatccgaagattcaattttattttttaaaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcatgagagtattcgataatt 19879046  T
Q  116 atcttgcactgatatct-accccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||| ||||| | |  ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  19879045 atcctgcaccgctgcctgcccccgatagttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 19878966  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45057283 - 45057165
Alignment:
Q  76 cgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45057283 cgatacttcccgatacgtatcatgagagtattcgataattatcctacacagatatctgccctgatatttcccaattaatgttaactaaaataacttaact 45057184  T
Q  176 cttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  45057183 cttgagtactaatgtgttc 45057165  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13353176 - 13353059
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  |||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13353176 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataataatcctgcatcgatagcgactccgatacttcggaattaatgttaactaaaataacttaactc 13353077  T
Q  177 ttcagtacttatgtgttc 194  Q
    || |||||| ||||||||    
T  13353076 ttgagtactgatgtgttc 13353059  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 19421484 - 19421654
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        | |||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  19421484 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaagtaattatccgatacttcccgatacgtatcaggagcgtata 19421583  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactctt 178  Q
     |||||||||| ||||| |||| || ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19421584 tgataattatcctgcaccgatacctgccctgatatttcccaattaatgttaaccaaaataacttaactctt 19421654  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6134432 - 6134247
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||        |||||| || |||||||||||||||  ||||||| ||||||     
T  6134432 gatacttcccgatatgtatcaggagagtatccgaagattaaatattattttttaaaaaaataattatccgatacttcccgatatttatcaggagagtatt 6134333  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgtt 193  Q
    ||||||||||| ||||  ||||  | ||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  6134332 cgataattatcctgcatcgatacatgccctgttatttcccaattaatgttgactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgtt 6134247  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22289771 - 22289604
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| ||  ||||||| |  |||||||||||| |||||||    
T  22289771 gatacttcctgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttatttctttaaaaaataatcatctgatactttctaatacgtatcaggagagtatc 22289672  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
     |||||||||| || || |||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22289671 tgataattatcatgtaccgatacctgccctaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaact 22289604  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 29915929 - 29916035
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||  ||||  | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29915929 gatacttcccgatacgtatcaggatagtatctgataattatcctgcatcgatacatgccccaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactc 29916028  T
Q  177 ttcagta 183  Q
    || ||||    
T  29916029 tttagta 29916035  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 29965082 - 29965188
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||  ||||  | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29965082 gatacttcccgatacgtatcaggatagtatctgataattatcctgcatcgatacatgccccaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactc 29965181  T
Q  177 ttcagta 183  Q
    || ||||    
T  29965182 tttagta 29965188  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 183
Target Start/End: Original strand, 42229809 - 42229907
Alignment:
Q  85 ccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  42229809 ccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcaccaatacctgccccaatacttcccaattaatgttaattaaaataacttaactcttgagta 42229907  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20510206 - 20510036
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||        |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||   |||||     
T  20510206 gatactttccaatacgtatcaagagaatatctgaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatctgatacttcccgatacttatcagaaaagtatt 20510107  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactctt 178  Q
    ||||||||||| ||||  |||| || |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20510106 cgataattatcctgcatcgatacctgccccaatatttcccaattaatgttgactaaaataacttaactctt 20510036  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 194
Target Start/End: Original strand, 983349 - 983440
Alignment:
Q  103 gtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  983349 gtatccaataattatcctgcaccgctatctgccccgatagttcccaattaatgttaactaaaacaacttaactcttgagtacttatgtgttc 983440  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 2122846 - 2122952
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| || || || | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2122846 gatacttcgcgatacgtatcagtagactatccgataattatcctgcactggtacctgcctcaatactttccaattaatgttaactaaaataacttaactc 2122945  T
Q  177 ttcagta 183  Q
    || ||||    
T  2122946 ttgagta 2122952  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 45347365 - 45347541
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaa-taataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||        || |||| || |||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  45347365 gatacttttcgatacgtatccgaagagtatccgaagattaaattttattttttttaaaaaataattatccgatacttcctgatacgtatcaggaaagtat 45347464  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    | |||||||||| |||||  |||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| || |||| ||||    
T  45347465 ctgataattatcctgcacctatatctgccccaataattctcaattaacgttaaataaaataacttaaatcttgagta 45347541  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13748497 - 13748323
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| ||  ||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  13748497 gatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttttttaa-aataattatctgatacttcccgatacgtatcagaaaagtatc 13748399  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||| || ||  ||| || |||| ||| ||  ||||||| ||||| |||||||| | ||||||| ||||    
T  13748398 cgataattatcatgtacctatacctgccccaataatttccaattaacgttaaataaaataatttaactcttgagta 13748323  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19349596 - 19349539
Alignment:
Q  66 aataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgca 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  19349596 aataattattcgatacttcccgatacgtatcaggaaagaatccgataattatcctgca 19349539  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Original strand, 39664026 - 39664139
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | ||| |||| ||||| ||||||||       ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  39664026 gatactttccgatacgtatcagaatagtattcgaagattaatttttatttttttt--taataattatctgatacttcccgatacgtatcaggaaagtatc 39664123  T
Q  108 cgataattatcttgca 123  Q
    ||||||||||| ||||    
T  39664124 cgataattatcctgca 39664139  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2567178 - 2567133
Alignment:
Q  149 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  2567178 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 2567133  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 3983765 - 3983814
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3983765 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattt 3983814  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 52684269 - 52684318
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  52684269 gatactttccgatacgtattaggagagtatccgaatattaaattttattt 52684318  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 983262 - 983311
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  983262 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccaaagattaaattttattt 983311  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 2122775 - 2122824
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2122775 gatacttcccgatacgtatcaggagagaatccgaagattaaattttattt 2122824  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 110
Target Start/End: Original strand, 3983765 - 3983798
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3983765 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccga 3983798  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10225212 - 10225163
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  10225212 gatactttccgatacgtatccggagagtatccaaatattaaattttattt 10225163  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28882728 - 28882679
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28882728 gatactttccgatacgtatcgggagagtatccaaatattaaattttattt 28882679  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 30226488 - 30226537
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30226488 gatactttctgatacgtatcaagagagtatccgaagattaaattttattt 30226537  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 42229742 - 42229791
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  42229742 gatacttcctgatacgtatcagaagagtatccgaaaattaaattttattt 42229791  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 194
Target Start/End: Original strand, 52684536 - 52684581
Alignment:
Q  149 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  52684536 attaatgttaactaaaataactcaactattgagtactaatgtgttc 52684581  T

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Target: chr2 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 34146248 - 34146423
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||        |||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34146248 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccaaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatccgatacttcctgatacgtatcaggagagtatc 34146347  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  34146348 cgataattattctgcactgatatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 34146423  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 185
Target Start/End: Original strand, 2319343 - 2319520
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2319343 gatacttcctgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacgtcccgatacgtatcaggagagtatc 2319442  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtact 185  Q
    ||||||||||| || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  2319443 cgataattatcctggattgatatctgccctgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactattgagtact 2319520  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31236228 - 31236051
Alignment:
Q  16 ccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataatt 115  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||        |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31236228 ccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttaattttttaaaaaataatcagccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatctgataatt 31236129  T
Q  116 atcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgtt 193  Q
    ||| | ||  ||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31236128 atcctacatcgatatctgcctcgatatttcacagtaaatgttaactaaaataacttaactcttcagtactgatgtgtt 31236051  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 3563908 - 3564083
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3563908 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttatttctttaaaaaataattatctgatacttcccgatacgtatcagaagagtatc 3564007  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||| ||||  |||| || || | ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  3564008 cgataattatcctgcatcgatacctgccacaatacttcccaattaatgttaagtaaaataacttaactcttgagta 3564083  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 44156665 - 44156841
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaa-taataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        || |||| || |||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  44156665 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttttttaaaaaataattatccgatacttcctgatacgtatcaggatggtat 44156764  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44156765 ccgataattatcctgcaccgatacctgacccaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 44156841  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 35342385 - 35342572
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaa-taataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||        || |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35342385 gatacttcccgatacgtatcaaaagagtatccgaagattaaattttatttttaaaaaaaaataattatctgatacttcccgatacgtatcaggagagtat 35342484  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||||| |||||| | ||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  35342485 ccgatcattatcctacacaggtatctgccctgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgattactgatgtgttc 35342572  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14217142 - 14217021
Alignment:
Q  66 aataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaa 165  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14217142 aataattatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcactgatacatgccccaatacttcccaattaatgttaagtaaaa 14217043  T
Q  166 taactgaactcttcagtactta 187  Q
    | ||| ||||||| || |||||    
T  14217042 tgacttaactcttgagcactta 14217021  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3545631 - 3545444
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnn-taataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||        ||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  3545631 gatacttctcgatatgtatcaggagagcatccgaagattaaattttattttaaaaaaataataattatcagatgcttcccgatacatatcaagagagtat 3545532  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  3545531 ctgataattatcatgcactgatatcttccccaaaacttcctaattaatgttaattaaaataacttaattcttgagtactgatgtgttc 3545444  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8482967 - 8482792
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||| |||||| ||||||  ||| |||    
T  8482967 gatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcgcgatacatatcagaagagcatc 8482868  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || || | ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  8482867 cgataattatcctgcaccgatacctgcctcaatacttcccaatcaatgttaattaaaataacttaactcttgagta 8482792  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 178
Target Start/End: Original strand, 12206108 - 12206262
Alignment:
Q  23 gtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgc 122  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||       ||||||| || |||||  |  |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  12206108 gtatcaggagagtattcgaagattaaattttatttaaaaaa-taataattatccgataaatttcgatacgtatcatgagagtatccgataattatcctgc 12206206  T
Q  123 actgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactctt 178  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12206207 actgatatatgccccgatacttcccaattaatggtaactaaaataacttaactctt 12206262  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Original strand, 14824265 - 14824382
Alignment:
Q  66 aataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaa 165  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14824265 aataattatccgatatttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcaccaataccttccccaatacttcccaattaatgttaattaaaa 14824364  T
Q  166 taactgaactcttcagta 183  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  14824365 taacttaactcttgagta 14824382  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 1005580 - 1005755
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| |||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||        |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  1005580 gatacttcccgatacgtattagaagagtatctgaagattaaattttatttattttttaaataattatctgatacttcctgatacgtatcagaagagtatc 1005679  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
     |||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  1005680 tgataattatcctgcaccaatatctgccccaatacttcccaattaatgttaattaaaataacttaactcttgagta 1005755  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Original strand, 21104608 - 21104734
Alignment:
Q  66 aataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaa 165  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21104608 aataattatccgatatttccctatacgtatcaggaaagtatccgatcattatcctacaccgatatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaa 21104707  T
Q  166 taactgaactcttcagtacttatgtgt 192  Q
    ||||| |||| || |||| | ||||||    
T  21104708 taacttaacttttgagtattgatgtgt 21104734  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 4561856 - 4562032
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaa-taataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    ||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        || |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4561856 gatacttcccgatacatatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaaataattatctgatacttcccgatacgtatcaggagagtat 4561955  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    |||||||||||| |||||  ||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  4561956 ccgataattatcatgcaccaatacctgtcccaatacttcccaattaatgttacttaaaataacttaactcttgagta 4562032  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1776481 - 1776311
Alignment:
Q  13 tttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgata 112  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        || ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  1776481 tttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttttaaaaaaaaaatcattcgatacttcccgatacgtatcagaaaagtatctgata 1776382  T
Q  113 attatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    |||||| |||||  ||| || |||| ||| ||  |||||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  1776381 attatcctgcacctatacctgccccaataatttccaattaacattaaataaaataacttaactcttgagta 1776311  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 183
Target Start/End: Original strand, 24585681 - 24585778
Alignment:
Q  87 gatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatg-ttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| || |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24585681 gatacgtatcaggagagtattcgataattatcctgcactaatacctgccctaatacttcccaattaatgtttaactaaaataacttaactcttgagta 24585778  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Original strand, 4355478 - 4355550
Alignment:
Q  106 tccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactctt 178  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4355478 tccgataattatcctacactgatacctgccccaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactctt 4355550  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 178
Target Start/End: Original strand, 5588176 - 5588276
Alignment:
Q  78 atacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactct 177  Q
    |||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| | ||| |||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5588176 atacttcctgatacatatcatgagagtatccaataattatcctacaccgatacctgccccaacacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactct 5588275  T
Q  178 t 178  Q
    |    
T  5588276 t 5588276  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 40431997 - 40431904
Alignment:
Q  82 ttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | || || |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40431997 ttcctgatacgtatcaggacagtatccgataattatcctgcaccgttacctgccccaatacttttcaattaatgtttactaaaataacttaact 40431904  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Original strand, 10573589 - 10573748
Alignment:
Q  35 tatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctac 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||        || ||| |||| ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||  ||||  |      
T  10573589 tatctgaaaattaaattttatttttttaaaaaagaattattcaatacttccatatacgtatctggagagtatccgataattattctgcatcgatacatgt 10573688  T
Q  135 cccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||| | ||||||||    
T  10573689 cccgatatttctcaattaatgttaaccaaaataacttaactattgagtagtgatgtgttc 10573748  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Original strand, 35996711 - 35996816
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  35996711 gatacttttcgatacgtatcaggagagtattcgaagattaaattttattttttaaaa-aataattatccgatacttcccgatacgtatcaggaaagtatt 35996809  T
Q  108 cgataat 114  Q
    |||||||    
T  35996810 cgataat 35996816  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45159085 - 45159040
Alignment:
Q  149 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45159085 attaatgttaactaaaataattcaactcttcagtacttatgtgttc 45159040  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28746702 - 28746541
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||        |||||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  28746702 gatacttttcgatacgtatcagaagagtatccgaagattaatttttttttttta----aataattatccgatacttcccgatacgtatcaagaaagtatc 28746607  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactctt 178  Q
    |||||||||     |||  ||| || |||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  28746606 cgataatta-----cacctatacctgccccaataattcccaattaacgttaaataaaataacttaactctt 28746541  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 194
Target Start/End: Original strand, 9293252 - 9293359
Alignment:
Q  87 gatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtactt 186  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||| |||| |  |||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||      
T  9293252 gatacgtatcaggagagtatctgatcattattctgcaccgatacccgccccaagattttccaattaatgttaactaaaataactcaactattgagtaccg 9293351  T
Q  187 atgtgttc 194  Q
    ||||||||    
T  9293352 atgtgttc 9293359  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 40497435 - 40497386
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  40497435 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccaaagattaaattttattt 40497386  T

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Target: chr7 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44960185 - 44959999
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||        |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44960185 gatacttcccgatatgtatcagaagagtatccaaagattaaattttattttttgtaaaaataattatcggatacttcccgatacatatcaggggagtatc 44960086  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  44960085 cgataattattctgcactgatacctaccccggtatttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 44959999  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36757996 - 36757882
Alignment:
Q  78 atacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactct 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36757996 atacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatctttcactgatatctgccctgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactct 36757897  T
Q  178 tcagtacttatgtgt 192  Q
    | |||||| ||||||    
T  36757896 tgagtactgatgtgt 36757882  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36767520 - 36767406
Alignment:
Q  78 atacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactct 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36767520 atacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattatctttcactgatatctgccctgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactct 36767421  T
Q  178 tcagtacttatgtgt 192  Q
    | |||||| ||||||    
T  36767420 tgagtactgatgtgt 36767406  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 40041454 - 40041629
Alignment:
Q  18 gatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattat 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40041454 gatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttaaaaaa-aataattatccgatatttcccgatacgtatcaggagagtatccgataattat 40041552  T
Q  118 cttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    | |||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||    
T  40041553 cctgcactgatacctgccccgatatttcccaattaatgttaactaaaataatttaactattgagtactgatgtgttc 40041629  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Original strand, 35159931 - 35160115
Alignment:
Q  9 atactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatcc 108  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| ||  |||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  35159931 atacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttaaaaaaaaataattatctgatagttcccgatacatatcagaagagtatcc 35160030  T
Q  109 gataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  35160031 gataat-atctttcactgatatctgccccgatacttctcaattaatgttaattaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttc 35160115  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36763764 - 36763662
Alignment:
Q  90 acgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatg 189  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  36763764 acgtatcaggagagtatccgataattatctttcactgatatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatg 36763665  T
Q  190 tgt 192  Q
    |||    
T  36763664 tgt 36763662  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 554930 - 554765
Alignment:
Q  18 gatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattat 117  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  554930 gatacgtatcaggagagtattcgaagattaaattttattttttttaaaaataattatccgatacttcccgataagtatcaggagagtatccgataattat 554831  T
Q  118 cttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    | ||||| |||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  554830 cctgcaccgatacctgccccaatacttcccaatcaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 554765  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 21179911 - 21180087
Alignment:
Q  18 gatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||       ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21179911 gatatgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattttaaaaaataataattatccgatacttcccgatacgtatcaggagagtatctgataattat 21180010  T
Q  118 cttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    | ||||   ||| || |||| ||| ||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  21180011 catgcatcaatacctgccccaatatttcccagctaatgataactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 21180087  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 24956316 - 24956491
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  24956316 gatactttccgatacgtatcaagagagtatccgaagattaaattttattttaaagaaaaataattatccgatacttcctaatacgtatcaagagagtatc 24956415  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
     |||||||||| ||||| |||| || || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24956416 tgataattatcctgcaccgatacctgccacaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 24956491  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15878406 - 15878288
Alignment:
Q  76 cgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15878406 cgatactttccgatacgtatcaggagagtatccgatcattatcctacaccggtatctgccccgatacttcccaattaatattaactaaaataacttaact 15878307  T
Q  176 cttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||| |||| | ||||||||    
T  15878306 cttgagtattgatgtgttc 15878288  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23079091 - 23078973
Alignment:
Q  76 cgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23079091 cgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgatagttatcctgtaccgatacctgtcccgatatttcccaattaatgttaattaaaataacttaact 23078992  T
Q  176 cttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  23078991 cttaagtactgatgtgttc 23078973  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1400249 - 1400133
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1400249 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgatcattatcctacacatgtatctgccccgatacttcccaattaatgttaattaaaataacttaactc 1400150  T
Q  177 ttcagtacttatgtgtt 193  Q
    || |||| | |||||||    
T  1400149 ttaagtattgatgtgtt 1400133  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 21409464 - 21409630
Alignment:
Q  16 ccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataatt 115  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||        |||||| ||  |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21409464 ccgatacgtatcaggagagtatccaaagattaaattttatttttttaaa-aataattatcggatacttcctaatacgtatcaggagagtatctgataatt 21409562  T
Q  116 atcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||| | ||| |||| || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21409563 atcctacaccgatacctgccccaatactttccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 21409630  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23970108 - 23970001
Alignment:
Q  76 cgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||  | |||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23970108 cgatactttccgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcaccaatacatgccctaatacttctcaattaatgttaattaaaataacttaact 23970009  T
Q  176 cttcagta 183  Q
    ||| ||||    
T  23970008 cttgagta 23970001  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 194
Target Start/End: Original strand, 33454133 - 33454321
Alignment:
Q  6 cagatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagta 105  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||        |||||| |   |||||||||| |||| ||| ||  |||||    
T  33454133 cagatacttctcgatacgtatcaggaaagtatccgaagattaaattttattttttaaaaaaataattagctgatacttcccaatacttattagaagagta 33454232  T
Q  106 tccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    | ||||||||||| | ||| ||||  | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33454233 ttcgataattatcctacaccgatacttgccccgatatttcccaattaatgttgactaaaaaaacttaactcttgagtacttatgtgttc 33454321  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 38064736 - 38064916
Alignment:
Q  14 ttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataa 113  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||       ||| ||| ||  |||| ||||| ||||||||| || | ||||| |||||    
T  38064736 ttccgatacgtatcaagagagtatccgaagattaaattttattttttaaaataaaaattatcagatatttcccaatacgtatctggagggtatctgataa 38064835  T
Q  114 ttatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaa-ctaaaataactgaactcttcagtacttatgtgtt 193  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  38064836 ttatcctgcaccaatacctaccccgttatttcccaattaatattaaactaaaataacttaacttttgagtactaatgtgtt 38064916  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 44269790 - 44269958
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||        |||||| |  |||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  44269790 gatacttttcgatacgtatcagtagagtatctgaagattaaattttaatttttaaaaaaataattaaccgatacttcccgatacgtatcaagaaagtatc 44269889  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
     |||||||||  | ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44269890 tgataattattctacatcgatatctgcctcgatatttcacaataaatgttaactaaaataacttaactc 44269958  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 26973118 - 26973297
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcagg----tgag 103  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||        |||||| || ||||||||||||||||||||||||    | ||    
T  26973118 gatacttttcgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaatttttttttttttttaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggaaattaag 26973217  T
Q  104 tatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||| ||  ||||||| ||||  |||||||| | ||||||| ||||    
T  26973218 tatccgataattatcatgcacctatatctgccccaataatttccaattaacgttatataaaataatttaactcttgagta 26973297  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 183
Target Start/End: Original strand, 48153703 - 48153785
Alignment:
Q  101 gagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  48153703 gagtattcgataattatcttgcaccaatacctgccccaatacttcccaattaatgttaattaaaataacttaactcttgagta 48153785  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19820914 - 19820868
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaatttta 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19820914 gatactttccgatatgtatcaggagagtatccgaagattaaatttta 19820868  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 23311787 - 23311836
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23311787 gatacttcccgatatgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattt 23311836  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 38064660 - 38064709
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  38064660 gatactttccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattatattt 38064709  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 47719997 - 47719952
Alignment:
Q  149 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  47719997 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 47719952  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Original strand, 11058651 - 11058699
Alignment:
Q  146 acaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  11058651 acaattaatgttaactaaaataacttaactcttgtgtactgatgtgttc 11058699  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 8056382 - 8056335
Alignment:
Q  10 tactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  8056382 tactttccgatacgtatcaggagagtatctgaagattaaattttattt 8056335  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1043121 - 1043072
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  1043121 gatactttccgatacgtatcgggagagtatccaaatattaaattttattt 1043072  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9283770 - 9283725
Alignment:
Q  149 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  9283770 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtaattatgtgttc 9283725  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18113989 - 18113940
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18113989 gatacttcctgatatgtatcaggagagtatctgaagattaaattttattt 18113940  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 194
Target Start/End: Original strand, 25969713 - 25969758
Alignment:
Q  149 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  25969713 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtaattatgtgttc 25969758  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27398097 - 27398048
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27398097 gatactttccaatatgtatccggagagtatccaaatattaaattttattt 27398048  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 38263064 - 38263113
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  38263064 gatactttccgatacgtatccggagagtatccaaatattaaattttattt 38263113  T

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Target: chr8 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 37372327 - 37372503
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnn-taataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37372327 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttatttaaaaataataataattattcgatacttcccaatacgtatcaggagagtat 37372426  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  37372427 ccgataattattttgcaccgatacctgccccaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaattcttgagta 37372503  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 175
Target Start/End: Original strand, 27886258 - 27886425
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||        |||| | ||  |||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  27886258 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaagtttatttttaaaaaaaatagttatctgatacttctcaatacatatcaggagagtatc 27886357  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27886358 cgataattatcttgcactgatatctgccctgatacttcacaattaatgttaacgaaaataacttaact 27886425  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 175
Target Start/End: Original strand, 27944916 - 27945083
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||        |||| | ||  |||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  27944916 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaagtttatttttaaaaaaaatagttatctgatacttctcaatacatatcaggagagtatc 27945015  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27945016 cgataattatcttgcactgatatctgccctgatacttcacaattaatgttaacgaaaataacttaact 27945083  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 175
Target Start/End: Original strand, 27968171 - 27968340
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaa--tatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagta 105  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||   |||||||| |||||| |||||||        |||||| ||  |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  27968171 gatacttcccgatacgtatcaggagatcgtatccgaagattaaagtttattttttaaaaaaataattatctgatacttctcgatacatatcaggagagta 27968270  T
Q  106 tccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27968271 tccgataattatcttgcactgatatctgccctgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaact 27968340  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 175
Target Start/End: Original strand, 28025157 - 28025326
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaa--tatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagta 105  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||   |||||||| |||||| |||||||        |||||| ||  |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  28025157 gatacttcccgatacgtatcaggagatcgtatccgaagattaaagtttattttttaaaaaaataattatctgatacttctcgatacatatcaggagagta 28025256  T
Q  106 tccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28025257 tccgataattatcttgcactgatatctgccctgatacttcacaattaatgttaacgaaaataacttaact 28025326  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 32424989 - 32425159
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32424989 gatacttcacgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatccgatacttcccgatatgtatcaggagagtatc 32425088  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactctt 178  Q
    |||| |||||| | ||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32425089 cgatcattatcctacaccggtatctgccccgatactttccaattaatgttaactaaaataacttaactctt 32425159  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 3892101 - 3892207
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3892101 gatacttctcgatacgtatcaggagagtatccgataattatcctgcaccgatacctgccccaatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactc 3892200  T
Q  177 ttcagta 183  Q
    || ||||    
T  3892201 ttgagta 3892207  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 178
Target Start/End: Original strand, 7411728 - 7411840
Alignment:
Q  66 aataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaa 165  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7411728 aataattatccgatacttctcgatacatatcaggagagtatccgatcattatcctacattgatacatgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaa 7411827  T
Q  166 taactgaactctt 178  Q
    ||||| |||||||    
T  7411828 taacttaactctt 7411840  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 29355691 - 29355864
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaa-taataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||        || |||| | ||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  29355691 gatacttcccgatacgtagcaggagagtatccgaagattaaattttaatttttaaaaaaagtaattagtcgatacttcccgatacgtataaggaaagtat 29355790  T
Q  107 ccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttca 180  Q
    | |||||||||| | |   ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29355791 ctgataattatcctacgtcgatatctgcctcgatatttcacaataaatgttaactacaataacttaactcttca 29355864  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 20182441 - 20182609
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||        |||||| |  |||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  20182441 gatacttttcgatacgtatcagtagagtatctgaagattaaattttaatttttaaaaaaataattaaccgatacttcccgatacgtatcaagaaagtatc 20182540  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
     |||||||||  | ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20182541 tgataattattctacatcgatatctgcctcgatatttcacaataaatgttaactaaaataacttaactc 20182609  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 38388735 - 38388921
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||  ||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||||||        || ||| || | |||||||| ||||| ||||||  ||||||     
T  38388735 gatacttctcgatacgtgtcaggaaagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaacaattatccaatacttcctgatacttatcagaagagtatt 38388834  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||||||||||| | ||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  38388835 cgataattatcctacaccgatacctgccccgatatttcccaattaatgttgactaaaaaaacttaactctcgagtactgatgtgttc 38388921  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24100243 - 24100133
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||        |||||| | || |||||||||||||||||||| |  |||||     
T  24100243 gatattttccgatatgtatcaggagagtatccgaagattaaattttaattttttaaaaaataattagtcaatacttcccgatacgtatcatgaaagtata 24100144  T
Q  108 cgataattatc 118  Q
     ||||||||||    
T  24100143 tgataattatc 24100133  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 194
Target Start/End: Original strand, 40412754 - 40412797
Alignment:
Q  151 taatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  40412754 taatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 40412797  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5818353 - 5818312
Alignment:
Q  16 ccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  5818353 ccgatatgtatcaggagagtatctgaagattaaattttattt 5818312  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22201387 - 22201338
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22201387 gatactttccgatacgtatccggagagtatccaaatattaaattttattt 22201338  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 30804795 - 30804750
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaatttt 53  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  30804795 gatactttccgatacgtatcaggagagtatccgaatattaattttt 30804750  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5818242 - 5818206
Alignment:
Q  147 caattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5818242 caattaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 5818206  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8171015 - 8170979
Alignment:
Q  149 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtact 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8171015 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtact 8170979  T

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Target: chr6 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10894564 - 10894383
Alignment:
Q  15 tccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaa--taataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgata 112  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||       |||  |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  10894564 tccgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttgtttttttttttaaattaattattcgatacttcctaatacgtatcaggagagtatccgata 10894465  T
Q  113 attatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | ||||||||    
T  10894464 attatcctgcaccgatacctaccccgatatttcccaattaatgttaactaaaattacttaactctcgagtattgatgtgttc 10894383  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 19128221 - 19128396
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19128221 gatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattttttttaaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggaaagtatc 19128320  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||| | |||  || ||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  19128321 cgataattatccttcacctatgtctgccccgataattcccaattaacgttaaataaaataacttaactcttgagta 19128396  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 7254996 - 7255174
Alignment:
Q  16 ccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnn-taataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataat 114  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  7254996 ccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttaaaaataataataattatctgatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgataag 7255095  T
Q  115 tatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgtt 193  Q
    |||| ||||| |||| || |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  7255096 tatcatgcaccgatacctgccccgatattttccaattaatgttaacttaaataacttaactcttgagtactgatgtgtt 7255174  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6708091 - 6707905
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||        |||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||||     
T  6708091 gatactttccaatatgtatcaggagagtatccgaagattaaatattattttaaaaaaaaataattatccgatacttcccgatacttatcagaagagtatt 6707992  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||||||||| |  |||| |||| || ||||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  6707991 cgataattacccagcaccgatacctgccccgttattccccaattaatgttgactaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttc 6707905  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 183
Target Start/End: Original strand, 27084118 - 27084217
Alignment:
Q  84 cccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27084118 cccgatacgtatcaggaaaatatctgataattattttgcactgataactgcccccatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 27084217  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Original strand, 11105354 - 11105514
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||        |||||| |||||||||||||  |||| |||||   |||||||    
T  11105354 gatactttctgatacgtatcagaagaatattcgaagattaaattttatttttttaaaaaataattattcgatacttccgtatacatatcaaaagagtatc 11105453  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataa 168  Q
    |||| |||||| | ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11105454 cgatcattatcctacaacgatatcttctccgatacttctcaattaatgttaaataaaataa 11105514  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 31079739 - 31079853
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| || | |||||| ||| ||||   ||||||||||||||||| || ||    
T  31079739 gatacttcccgatacgtatcaggagagtatccgatgattatcatgcaccgatacctgctccgatatttcccaat---tgttaactaaaataacttaaatc 31079835  T
Q  177 ttcagtacttatgtgttc 194  Q
    || | |||| ||||||||    
T  31079836 ttgaatactgatgtgttc 31079853  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13045358 - 13045249
Alignment:
Q  76 cgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    |||||||| | |||| |||||||| || |||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13045358 cgatactttctgataagtatcaggagaatatctgataactatcctgcaccgatatctgccccaatatttcccaattaatgtcaactaaaataacttaact 13045259  T
Q  176 cttcagtact 185  Q
    ||| ||||||    
T  13045258 cttgagtact 13045249  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13607766 - 13607650
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| | ||| |||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13607766 gatacttcccgatacgtatcaggatagtatatgataattatcctacaccgatacctgccccaatatttttcaattaatgttaactaaaataacttaattc 13607667  T
Q  177 ttcagtacttatgtgtt 193  Q
    || |||| | |||||||    
T  13607666 ttgagtattgatgtgtt 13607650  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 26327223 - 26327374
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| || |||||||||||||||| |||| |  ||||||     
T  26327223 gatacttcccgatacgtataag-agagtatccgaagattaaattttatttttaaaaaaaataattatccgatacttcccgatacttatctgaagagtatt 26327321  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaac 160  Q
    |||| |||||| ||||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26327322 cgatgattatcctgcaccgatacctgccccgatatttcgcaattaatgttaac 26327374  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 234374 - 234552
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataatt---cgatacttcccgatacgtatcaggtgagt 104  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||       | | |||||||   ||||||||||||||| || |||||  |||    
T  234374 gatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaactttttttttttttttttaaaataattatccgatacttcccgatatgtttcaggaaagt 234473  T
Q  105 atccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    ||||||||||||||||| |   ||| || |||| ||| ||  ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  234474 atccgataattatcttgaatctatacctgccccaataatttccaattaacgttaaataaaataacttaactcttgagta 234552  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 194
Target Start/End: Original strand, 3212778 - 3212823
Alignment:
Q  149 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  3212778 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 3212823  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13061355 - 13061262
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataact 170  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||   ||| || ||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13061355 gatactttctgatacgtattaggagagtatctgataactatcttgcagcaatacctgccccagtatttcccaattaatattaactaaaataact 13061262  T

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Target: chr1 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 175
Target Start/End: Original strand, 29168015 - 29168182
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||        |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  29168015 gatacttcccgttacgtatcaggagagtatccgaagattaaatttaatttttttaaaaaataattatctgatacttcccgatacgtatgaggagagtacc 29168114  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29168115 caataattatcctgcactgatacctaccccaatacttcccaattaatattaactaaaataacttaact 29168182  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2472904 - 2472788
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2472904 gatactttccgatacgtatcaggagagtatccgataattatccagcactgacacctgccccgatatttcccaattaatgttaactaaaataacttaactc 2472805  T
Q  177 ttcagtacttatgtgtt 193  Q
    || |||||  |||||||    
T  2472804 ttgagtacgaatgtgtt 2472788  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Original strand, 9781710 - 9781886
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||        |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9781710 gatactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaatttttttttttttttaaaataattatccgatacttcccgatacgtatcaggaaagtatc 9781809  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtac 184  Q
    ||||||||||| |||||  ||| || |||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  9781810 cgataattatcctgcacctatacctgccccaataattcccaattaacgttaaataaaataacttaactcttgagtac 9781886  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 38218461 - 38218637
Alignment:
Q  18 gatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattat 117  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  38218461 gatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattattcgatacttcccgatacatattaggagagtatccgatcattat 38218560  T
Q  118 cttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    | | |||   ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  38218561 cctacaccagtatctgccccgatacttcccaattaatattagctaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttc 38218637  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41676012 - 41675854
Alignment:
Q  35 tatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctac 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||        |||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||| | ||||| |    
T  41676012 tatccgaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccaatacttcccgatacttatcaggagagtatccgatcattatcctacaccggtatctgc 41675913  T
Q  135 cccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  41675912 cccgatac-tcccaattaatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 41675854  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9528824 - 9528726
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaact 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9528824 gatacttcccgatacgtattaggagagtatccgataattattctgcacagatacctgccccaatacttcttaattaatgttaactaaaataacttaact 9528726  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24590105 - 24589991
Alignment:
Q  77 gatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactc 176  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| | ||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24590105 gatacttcccgatacatatcaagagagtatccgatcattatcctacaccgatacatgtcccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactc 24590006  T
Q  177 ttcagtacttatgtg 191  Q
    || |||||| |||||    
T  24590005 ttgagtactgatgtg 24589991  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 24851558 - 24851724
Alignment:
Q  24 tatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgca 123  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||        |||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    ||    
T  24851558 tatcaagagagtatccaaagattaaattttatttttttaaaaaataattatccgatacttcccgatacgcatcaggagagtatccgataattat----ca 24851653  T
Q  124 ctgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    |  ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  24851654 cccatacctgccccgatattttccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtaatgatgtgttc 24851724  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 194
Target Start/End: Original strand, 36551535 - 36551638
Alignment:
Q  91 cgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgt 190  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |  |  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||    
T  36551535 cgtatcaggagagtatccgatcattatcctatatcgatatctgccccgatacttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtagtgatgt 36551634  T
Q  191 gttc 194  Q
    ||||    
T  36551635 gttc 36551638  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 33039689 - 33039864
Alignment:
Q  16 ccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataatt 115  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||        |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33039689 ccgatatatatcaagagagtatccgaaaattaaattatatttaaaaaaa-aataattatccgatacttcccgatacgtatgaggagagtatccgataatt 33039787  T
Q  116 atcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||| ||| | | |  |  ||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  33039788 atcatgcgcagttgcc--ccaatatatttcccaattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 33039864  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 48715275 - 48715138
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttatttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatc 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||         |||||| ||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  48715275 gatacttcccgatacgtatcaggagagtgtccgaagattaaattttattgttttaaaaaataattatcagatacttcccgatacatatcaagagagtatc 48715176  T
Q  108 cgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttc 145  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  48715175 tgataattatcatgtactgatatcttccccgatacttc 48715138  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34096545 - 34096434
Alignment:
Q  66 aataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaa 165  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||  ||| || |||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  34096545 aataattatccgatacttcccgatacgtatcaggaaagtatccaataattatcctgcacctatacctgccccaataattctcaattaacgttaaataaaa 34096446  T
Q  166 taactgaactct 177  Q
    ||||| ||||||    
T  34096445 taacttaactct 34096434  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Original strand, 29861923 - 29862040
Alignment:
Q  66 aataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaa 165  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||| ||  ||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  29861923 aataattatccgatacttctcgatacgtatcaggaaagtatccgataattatcctgcacctatacctgtcccaataattcccaattaacgttaaataaaa 29862022  T
Q  166 taactgaactcttcagta 183  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  29862023 taacttaactcttgagta 29862040  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3708329 - 3708213
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaatttt-atttnnnnnnntaataataattcgatacttcccgatacgtatcaggtgagtat 106  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||       || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3708329 gatacttttcgatacgtatcaggagagtattcgaatattaaatttttattttttaaaata-taattattcgatacttctcgatacgtatcaggagagtat 3708231  T
Q  107 ccgataattatcttgcac 124  Q
    || |||||||||||||||    
T  3708230 ccaataattatcttgcac 3708213  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Original strand, 47654826 - 47654918
Alignment:
Q  102 agtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttc 194  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||| || |||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  47654826 agtattcgataattatcctacaccgatacctgccccgatattttccaattaatgttgactaaaaaaacttaactcttgagtactgatgtgttc 47654918  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Original strand, 2364746 - 2364794
Alignment:
Q  9 atactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2364746 atactttccgatacgtatcagaagagtatccgaagattaaattttattt 2364794  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 183
Target Start/End: Original strand, 10822539 - 10822637
Alignment:
Q  85 ccgatacgtatcaggtgagtatccgataattatcttgcactgatatctaccccgatacttcacaattaatgttaactaaaataactgaactcttcagta 183  Q
    |||||||||||||   || ||||||||||||||| |  |  |||| || |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  10822539 ccgatacgtatcacaagaatatccgataattatccttgatcgatacctgccccaatacttctcaattgatgttaattaaaataacttaactcttgagta 10822637  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 1036527 - 1036576
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  1036527 gatactttccgatacgtatccggagagtatccaaatattaaattttattt 1036576  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2223029 - 2222980
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  2223029 gatattttccgatacgtatcaggagagtatctgaagattaaattttattt 2222980  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28659350 - 28659301
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28659350 gatactttccgatacgtatccggagagtatccaaatattaaattttattt 28659301  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 32381109 - 32381060
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32381109 gatacttcccaatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattt 32381060  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 34432433 - 34432384
Alignment:
Q  8 gatactttccgatatgtatcaggagaatatccgaaaattaaattttattt 57  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34432433 gatacttcctgatacgtatcaggagagtatccgaagattaaattttattt 34432384  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32381042 - 32381010
Alignment:
Q  85 ccgatacgtatcaggtgagtatccgataattat 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32381042 ccgatacgtatcaggagagtatccgataattat 32381010  T

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