View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: F9262-LTR4-TNT-insertion-2 (Length: 227)

Name: F9262-LTR4-TNT-insertion-2
Description: F9262-LTR4
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] F9262-LTR4-TNT-insertion-2
F9262-LTR4-TNT-insertion-2
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (15-217)||(44045276-44045478)
chr7 (15-217)||(18784336-18784538)
chr7 (15-217)||(35505059-35505261)
chr7 (15-217)||(37315808-37316010)
chr7 (15-216)||(42046817-42047018)
chr7 (15-217)||(35113575-35113776)
chr7 (15-213)||(42049534-42049731)
chr7 (16-216)||(47400482-47400681)
chr7 (15-213)||(34643536-34643733)
chr7 (15-213)||(6612879-6613076)
chr7 (15-213)||(21953896-21954095)
chr7 (15-213)||(46804988-46805185)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (15-217)||(22721026-22721228)
chr5 (15-216)||(23107254-23107455)
chr5 (15-217)||(25336283-25336485)
chr5 (15-216)||(1212401-1212602)
chr5 (15-216)||(16475804-16476005)
chr5 (15-216)||(28969271-28969472)
chr5 (15-214)||(36789412-36789611)
chr5 (15-213)||(1598385-1598582)
chr5 (15-213)||(16478405-16478602)
chr5 (15-213)||(40830704-40830901)
chr5 (15-216)||(22386640-22386840)
chr5 (13-212)||(39564941-39565139)
chr5 (15-213)||(5812261-5812458)
chr5 (15-177)||(22496721-22496882)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (15-217)||(12256380-12256582)
chr2 (15-217)||(39122224-39122426)
chr2 (15-217)||(42842742-42842944)
chr2 (21-213)||(4651171-4651362)
chr2 (15-213)||(9616588-9616785)
chr2 (15-213)||(40263648-40263845)
chr2 (15-216)||(42224279-42224479)
chr2 (15-213)||(6904662-6904859)
chr2 (15-213)||(4720442-4720639)
chr2 (16-216)||(3554717-3554908)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (15-217)||(13279472-13279674)
chr8 (15-217)||(16428379-16428581)
chr8 (15-217)||(40557628-40557830)
chr8 (16-217)||(22514046-22514247)
chr8 (15-217)||(36896283-36896485)
chr8 (44-217)||(33441580-33441753)
chr8 (15-213)||(6416810-6417007)
chr8 (15-213)||(12501404-12501601)
chr8 (15-213)||(18385332-18385529)
chr8 (15-213)||(39621834-39622031)
chr8 (61-216)||(29088873-29089028)
chr8 (16-216)||(16888327-16888516)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (15-217)||(4271340-4271542)
chr6 (15-217)||(14175637-14175839)
chr6 (15-217)||(14180173-14180375)
chr6 (15-213)||(18902852-18903049)
chr6 (15-213)||(19420820-19421017)
chr6 (15-213)||(22510490-22510687)
chr6 (15-136)||(19419903-19420023)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (15-217)||(4943406-4943608)
chr4 (15-217)||(27071249-27071451)
chr4 (15-217)||(7509681-7509883)
chr4 (15-214)||(9768320-9768519)
chr4 (15-217)||(27151335-27151550)
chr4 (15-213)||(5944092-5944289)
chr4 (15-213)||(36352930-36353127)
chr4 (15-216)||(25887634-25887834)
chr4 (15-213)||(34802275-34802472)
chr4 (15-213)||(48426158-48426355)
chr4 (15-213)||(27024246-27024443)
chr4 (15-213)||(48945492-48945689)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (15-217)||(35350532-35350734)
chr3 (15-217)||(10122408-10122610)
chr3 (15-217)||(38190186-38190388)
chr3 (15-217)||(54610379-54610581)
chr3 (15-217)||(43845023-43845225)
chr3 (15-217)||(26705844-26706045)
chr3 (15-217)||(1002740-1002942)
chr3 (15-217)||(30106880-30107082)
chr3 (15-217)||(44516573-44516775)
chr3 (15-213)||(28418085-28418282)
chr3 (16-213)||(22398048-22398243)
chr3 (16-216)||(23302437-23302636)
chr3 (15-213)||(33956918-33957114)
chr3 (15-213)||(4066434-4066631)
chr3 (15-213)||(37965013-37965210)
chr3 (15-216)||(23303082-23303282)
chr3 (15-213)||(47334133-47334329)
chr3 (61-189)||(3344759-3344888)
chr3 (61-213)||(33955613-33955766)
chr3 (15-175)||(45579849-45580009)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (15-217)||(42435883-42436085)
chr1 (15-217)||(13496754-13496956)
chr1 (15-217)||(32049976-32050178)
chr1 (15-213)||(20274634-20274831)
chr1 (15-213)||(2023274-2023471)
chr1 (15-213)||(21332576-21332773)
chr1 (15-213)||(49005103-49005300)
chr1 (17-213)||(43642904-43643098)
chr1 (21-213)||(2840581-2840772)
chr1 (21-213)||(38984278-38984469)
chr1 (15-213)||(18410452-18410649)
chr1 (15-213)||(24775677-24775873)
chr1 (15-213)||(28645511-28645708)
chr1 (15-212)||(32523704-32523900)
chr1 (16-213)||(45537100-45537295)
chr1 (15-213)||(42806949-42807146)
chr1 (15-73)||(24455177-24455235)
[»] scaffold1788 (1 HSPs)
scaffold1788 (15-214)||(1146-1358)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (15-213)||(198628-198825)
[»] scaffold0088 (6 HSPs)
scaffold0088 (15-213)||(11021-11218)
scaffold0088 (15-177)||(1087-1248)
scaffold0088 (61-177)||(8476-8592)
scaffold0088 (61-177)||(24971-25087)
scaffold0088 (61-123)||(8601-8663)
scaffold0088 (61-123)||(25096-25158)
[»] scaffold1289 (2 HSPs)
scaffold1289 (61-177)||(467-583)
scaffold1289 (61-123)||(396-458)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (181-217)||(11470-11506)
[»] scaffold0368 (1 HSPs)
scaffold0368 (15-51)||(9660-9696)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44045478 - 44045276
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44045478 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 44045379  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44045378 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 44045279  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  44045278 tta 44045276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18784538 - 18784336
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18784538 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 18784439  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18784438 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 18784339  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  18784338 tta 18784336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 35505059 - 35505261
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35505059 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 35505158  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35505159 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 35505258  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  35505259 tta 35505261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37316010 - 37315808
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37316010 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 37315911  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37315910 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 37315811  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  37315810 tta 37315808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 42046817 - 42047018
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42046817 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 42046916  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42046917 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacttactaattaaaaaa 42047016  T
Q  215 tt 216  Q
    ||    
T  42047017 tt 42047018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 35113575 - 35113776
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35113575 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 35113674  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35113675 caaaatttggtt-gttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 35113773  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  35113774 tta 35113776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 42049534 - 42049731
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  42049534 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatt 42049632  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  42049633 aaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaa 42049731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47400681 - 47400482
Alignment:
Q  16 tttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||     
T  47400681 tttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttatacgttacaa-tcaaataattattgatataattagtattcgattaacatttatacggtacatta 47400583  T
Q  116 aaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaat 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  47400582 aaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacaagaacctactaattaaaaaat 47400483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34643733 - 34643536
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  34643733 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatt 34643635  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||   || ||| ||||||||||||||    
T  34643634 aaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttggtctgttacactataacaataaactactaattaaaaa 34643536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 6612879 - 6613076
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | |||  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||    
T  6612879 gtttcgattaaaatttatatgctacattaaaaatttgtatgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaatcaacatttatatggtacatt 6612977  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || | || |||| |||||||||||||    
T  6612978 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacaatatgacagtaacatactaattaaaaa 6613076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21954095 - 21953896
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  21954095 gtttcgattataatttatatcttacatcaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacatt 21953997  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacacta--aggcattaacctactaattaaaa 212  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |  || |||||||||||||||||    
T  21953996 aaaaatttggtatgttacaaaattataataaataatttgaataaattatattttgaattttggttcgttacactatgacacagtaacctactaattaaaa 21953897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 46804988 - 46805185
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||   |||||    
T  46804988 gtttcgattaaaaattatattatacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatataatacatt 46805086  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||   ||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  46805087 aaaaatttggtaagttacaaaattataataaataacttgaataaattattttttgaattttggtctgttacactatgatagtaacctactaattaaaaa 46805185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22721228 - 22721026
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22721228 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 22721129  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22721128 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 22721029  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  22721028 tta 22721026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23107455 - 23107254
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23107455 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 23107356  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23107355 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacttactaattaaaaaa 23107256  T
Q  215 tt 216  Q
    ||    
T  23107255 tt 23107254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 25336283 - 25336485
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25336283 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattaatattcaattaacatttatatgtaacatt 25336382  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25336383 caaaatttggttggttataaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 25336482  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  25336483 tta 25336485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1212602 - 1212401
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1212602 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 1212503  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1212502 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcatttacttactaattaaaaaa 1212403  T
Q  215 tt 216  Q
    ||    
T  1212402 tt 1212401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 16475804 - 16476005
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16475804 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 16475903  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16475904 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactaaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacttaataattaaaaaa 16476003  T
Q  215 tt 216  Q
    ||    
T  16476004 tt 16476005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28969472 - 28969271
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28969472 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 28969373  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28969372 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgagacgttacactaagacattaacttactaattaaaaaa 28969273  T
Q  215 tt 216  Q
    ||    
T  28969272 tt 28969271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36789611 - 36789412
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36789611 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaatgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 36789512  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36789511 caaaattagtatagttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaatgcattaacctactaatcaaaaaa 36789412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1598582 - 1598385
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  1598582 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatt 1598484  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  1598483 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagtaacctactaattaaaaa 1598385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 16478405 - 16478602
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  16478405 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatt 16478503  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  16478504 aaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaa 16478602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 40830704 - 40830901
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  40830704 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatt 40830802  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  40830803 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacaataacctactaattaaaaa 40830901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22386840 - 22386640
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||    
T  22386840 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaataattattaatataattagtattcgattaatatttatacggtacatt 22386742  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
     ||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  22386741 aaaattttgataggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacaggaacctactaattaaaaaa 22386642  T
Q  215 tt 216  Q
    ||    
T  22386641 tt 22386640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39565139 - 39564941
Alignment:
Q  13 tggtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaaca 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  39565139 tggttttgattaaaatttatatgttacattaaaattttgtatgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatgataca 39565041  T
Q  113 ttcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaa 212  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || | || |||||||||||||||||    
T  39565040 ttaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacagtatgacagtaacctactaattaaaa 39564941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5812458 - 5812261
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||   |||||    
T  5812458 gtttcgattaaaaattatattatacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatataatacatt 5812360  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||   ||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  5812359 aaaaatttggtaagttacaaaattataataaataacttgaataaattattttttgaattttggtctgttacactatgatagtaacctactaattaaaaa 5812261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22496882 - 22496721
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||| | ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  22496882 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaattttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataatcattattcgattaacatttatatggtacatt 22496784  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgg 177  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||    
T  22496783 aaaaatttggtaagttacaaaattataacaaataacttgaataaattatattttaaattttgg 22496721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12256582 - 12256380
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12256582 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 12256483  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12256482 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 12256383  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  12256382 tta 12256380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39122426 - 39122224
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39122426 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatataacatt 39122327  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39122326 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 39122227  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  39122226 tta 39122224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42842944 - 42842742
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42842944 gtttcgattaaaatttatattttacaatcaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 42842845  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42842844 caaaattttgttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttaaattttgggacattacactaagacattaacctactaattaaaaaa 42842745  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  42842744 tta 42842742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4651362 - 4651171
Alignment:
Q  21 attaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaat 120  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  4651362 attaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaataattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaat 4651264  T
Q  121 ttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  4651263 ttggtaggttacaaaattataataaataatttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagtaacctactaattaaaaa 4651171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 9616588 - 9616785
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||    
T  9616588 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaataattattaatataattagtattcgattaacatttatacggtacatt 9616686  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     | ||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  9616687 aacaatttggttagttaaaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagtaacctactaattaaaaa 9616785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 40263648 - 40263845
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  40263648 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatt 40263746  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  40263747 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttttgtccgttacactatgacagtaatctactaattaaaaa 40263845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 42224279 - 42224479
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  42224279 gttttgattaagatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaataattattaatataattagtattcaattaacatttatacggtacatt 42224377  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  42224378 aaaaatttggtaggttacaaatttataataaataacttgaataaattatattttaaattttggtccgttacactatgacagaaacctactaattaaaaaa 42224477  T
Q  215 tt 216  Q
    ||    
T  42224478 tt 42224479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 6904662 - 6904859
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||| |  ||||     
T  6904662 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgatacaa-tcaaataattattaatatatttagtattcgattaacatctatacggtacatc 6904760  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  6904761 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttaaattttggtccgttacactatgactgtaacctactaattaaaaa 6904859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4720639 - 4720442
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| |  |||||    
T  4720639 gtttcaattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaatt-aaataattattaatatatttagtattcgattaacatttatacggtacatt 4720541  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||   || ||||||||||||||||||    
T  4720540 aaaaatttgataggttacaaaaatataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttaaaatataacagtaacctactaattaaaaa 4720442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3554908 - 3554717
Alignment:
Q  16 tttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||     
T  3554908 tttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaataattattaatataattagtattcgattaacatttatacggtacatta 3554810  T
Q  116 aaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaat 215  Q
    |||||||||| ||        |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  3554809 aaaatttggtagg--------ttataataaataacttgaataaattatattttaaattttggtgcgttacactatgacaggaacctactaattaaaaaat 3554718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13279674 - 13279472
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13279674 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 13279575  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13279574 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 13279475  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  13279474 tta 13279472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 16428379 - 16428581
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428379 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 16428478  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428479 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 16428578  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  16428579 tta 16428581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 40557628 - 40557830
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40557628 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 40557727  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40557728 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 40557827  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  40557828 tta 40557830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 22514046 - 22514247
Alignment:
Q  16 tttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22514046 tttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattc 22514145  T
Q  116 aaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22514146 aaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaat 22514245  T
Q  216 ta 217  Q
    ||    
T  22514246 ta 22514247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36896485 - 36896283
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36896485 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataactattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 36896386  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36896385 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 36896286  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  36896285 tta 36896283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 217
Target Start/End: Original strand, 33441580 - 33441753
Alignment:
Q  44 aaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33441580 aaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatataattagtattcaattaacatttatatgtaacattaaaaatttggtcggttacaaatttataat 33441679  T
Q  144 aaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaatta 217  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33441680 aaataaattaaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacttactaattaaaaaatta 33441753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 6416810 - 6417007
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  6416810 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatt 6416908  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  6416909 aaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaa 6417007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12501601 - 12501404
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  12501601 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatt 12501503  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  12501502 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttttgtccgttacactatgacagtaatctactaattaaaaa 12501404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18385529 - 18385332
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  18385529 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacatt 18385431  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  18385430 aaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaa 18385332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39622031 - 39621834
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||   |||||    
T  39622031 gtttcgattaaaaattatattatacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatataatacatt 39621933  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||   ||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  39621932 aaaaatttggtaagttacaaaattataataaataacttgaataaattattttttgaattttggtctgttacactatgatagtaacctactaattaaaaa 39621834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29089028 - 29088873
Alignment:
Q  61 aatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaat 160  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| || |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  29089028 aatcaaataattattaatataattagtattcgattaacatttttacggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataactttaataaat 29088929  T
Q  161 tctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaatt 216  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  29088928 tatattttgaattttggtccgttacactatgacaggaacctactaattaaaaaatt 29088873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16888516 - 16888327
Alignment:
Q  16 tttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||     
T  16888516 tttcgattaaaatttatgtt--acattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaataattattaatataattagtattcgattaacatttatacggtacatta 16888420  T
Q  116 aaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaat 215  Q
    |||||||||| ||        |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  16888419 aaaatttggtagg--------ttataataaataacttgaataaattatattttaaattttggtgtgttacactatgacaggaacctactaattaaaaaat 16888328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4271542 - 4271340
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4271542 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 4271443  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4271442 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 4271343  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  4271342 tta 4271340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 14175637 - 14175839
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14175637 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatctaacatt 14175736  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14175737 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 14175836  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  14175837 tta 14175839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 14180173 - 14180375
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14180173 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatctaacatt 14180272  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14180273 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 14180372  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  14180373 tta 14180375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18903049 - 18902852
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  18903049 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacatt 18902951  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  18902950 aaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaa 18902852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 19420820 - 19421017
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||   |||||    
T  19420820 gtttcgattaaaatttatattatacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatagtacatt 19420918  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  19420919 aaaaatttggtaagttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtctgttacactatgatagtaacctactaattaaaaa 19421017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 22510490 - 22510687
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||   |||||    
T  22510490 gtttcgattaaaaattatattatacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatataatacatt 22510588  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||||   ||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  22510589 aaaaatttggtaagttacaaaattataataaataacttgaataaatgattttttgaattttggtctgttacactatgatagtaacctactaattaaaaa 22510687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19420023 - 19419903
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||    
T  19420023 gtttcgattaaaatttatatgttactttaaaaatttgtacgttacaa-tcaaataattattaatataattagtattcgattaacatttatacggtacatt 19419925  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaa 136  Q
     |||||||| | ||||||||||    
T  19419924 aaaaatttgataggttacaaaa 19419903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 4943406 - 4943608
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4943406 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 4943505  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4943506 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 4943605  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  4943606 tta 4943608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 27071249 - 27071451
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27071249 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 27071348  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27071349 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 27071448  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  27071449 tta 27071451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 7509681 - 7509883
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7509681 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 7509780  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7509781 aaaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 7509880  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  7509881 tta 7509883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9768519 - 9768320
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9768519 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 9768420  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9768419 aaaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 9768320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 27151335 - 27151550
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaac-------------att 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||             |||    
T  27151335 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 27151434  T
Q  102 tatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27151435 tatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacct 27151534  T
Q  202 actaattaaaaaatta 217  Q
    ||||||||||||||||    
T  27151535 actaattaaaaaatta 27151550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 5944092 - 5944289
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  5944092 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatt 5944190  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  5944191 aaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttgatccgttacactataacagtaacctactaattaaaaa 5944289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36353127 - 36352930
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  36353127 gtttcgattaaattttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacatt 36353029  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  36353028 aaatatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagtaacctactaattaaaaa 36352930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 25887634 - 25887834
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||    
T  25887634 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaataattattaatataattagtattcgattaacatttatacggtacatt 25887732  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||   ||  ||||||||||||||||||    
T  25887733 aaaaatttgataggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttaaattttggtctgttacactataacaagaacctactaattaaaaaa 25887832  T
Q  215 tt 216  Q
    ||    
T  25887833 tt 25887834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 34802275 - 34802472
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||   |||||    
T  34802275 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatattgtacatt 34802373  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  34802374 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaattaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagtaacctattaattaaaaa 34802472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 48426158 - 48426355
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| | | |  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  48426158 gtttcgattaaaatttatatgttatattaaaaatttgtatgatagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaatcaacatttatatggaacatt 48426256  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || | || |||| |||||||||||||    
T  48426257 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacaatatgacagtaacatactaattaaaaa 48426355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27024443 - 27024246
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  27024443 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacatt 27024345  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||  | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||   || | || ||||||||||||||||||    
T  27024344 aaaaatttaataggttacaaaattaaaataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttattatatgacagtaacctactaattaaaaa 27024246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 48945492 - 48945689
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || ||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  48945492 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacattacaa-tcaaataattattaatatatttagtattcgattaacaattatatggtacatt 48945590  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     || ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||   |||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  48945591 aaatatttggtagattacaaaattataataaataacttgaataaattacattttaaattttggtctgttacactataacagtaacctactaattaaaaa 48945689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35350734 - 35350532
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35350734 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 35350635  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35350634 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 35350535  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  35350534 tta 35350532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10122610 - 10122408
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10122610 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 10122511  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10122510 caaaatttggttggttataaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 10122411  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  10122410 tta 10122408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38190388 - 38190186
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38190388 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattaatattcaattaacatttatatgtaacatt 38190289  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38190288 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 38190189  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  38190188 tta 38190186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 54610379 - 54610581
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54610379 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 54610478  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54610479 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 54610578  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  54610579 tta 54610581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 43845023 - 43845225
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43845023 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 43845122  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43845123 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgttacagtaaggcattaacctactaattaaaaaa 43845222  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  43845223 tta 43845225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26706045 - 26705844
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26706045 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttga-cgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatataacatt 26705947  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26705946 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 26705847  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  26705846 tta 26705844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1002942 - 1002740
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1002942 gttttgattaaaatttatgttttacaataaaaatttaaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatataacatt 1002843  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1002842 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacaccaaggcattaacctactaattaaaaaa 1002743  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  1002742 tta 1002740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 30106880 - 30107082
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30106880 gtttcgattaaaatttatattttataataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatataattagtattcaattaatatttatatgtaacatt 30106979  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30106980 aaaactttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 30107079  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  30107080 tta 30107082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44516775 - 44516573
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44516775 gtttcgattaaaatttatattttacaatcaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 44516676  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44516675 caaaattttgttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttaaattttgggacattacactaagacattaacctactaattaaaaaa 44516576  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  44516575 tta 44516573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28418282 - 28418085
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||    
T  28418282 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaatcaacatttatatggtacatt 28418184  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || |||| |||||||||||||    
T  28418183 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataatttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagtaacatactaattaaaaa 28418085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 22398048 - 22398243
Alignment:
Q  16 tttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||     
T  22398048 tttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatgctacatta 22398146  T
Q  116 aaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  22398147 aaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaatttt-ggtcgttacactatgacagtaacctattaattaaaaa 22398243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 23302437 - 23302636
Alignment:
Q  16 tttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||     
T  23302437 tttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaataattattaatataattagtattcgattaacatttatacggtacatta 23302535  T
Q  116 aaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaat 215  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||    ||  |||||||||||||||||||    
T  23302536 aaaatttgataggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtctgttacactttaacaggaacctactaattaaaaaat 23302635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33957114 - 33956918
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||  || |||||| |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33957114 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttatacgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattgacatttatatgta-catt 33957017  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  33957016 aaaaatttggtaggttacaaaattataataactaagttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaa 33956918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4066631 - 4066434
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | |||  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||    
T  4066631 gtttcgattaaaatttatatgctacattaaaaatttgtatgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaatcaacatttatatggtacatt 4066533  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || | || |||| |||||||||||||    
T  4066532 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacaatatgacagtaacatactaattaaaaa 4066434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 37965013 - 37965210
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | |||  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||    
T  37965013 gtttcgattaaaatttatatgctacattaaaaatttgtatgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaatcaacatttatatggtacatt 37965111  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || | || |||| |||||||||||||    
T  37965112 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacaatatgacagtaacatactaattaaaaa 37965210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 23303082 - 23303282
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||    
T  23303082 gtttcgattaaaatttatatgttacgttaaaaatttgtatgttacaa-tcaaataattattaatataattagtattcgattaacatttatacggtacatt 23303180  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||    ||  ||||||||||||||||||    
T  23303181 aaaaatttgataggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtctgttacactttaacaggaacctactaattaaaaaa 23303280  T
Q  215 tt 216  Q
    ||    
T  23303281 tt 23303282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 47334329 - 47334133
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  47334329 gtttcgattaaaatatatatgttacattaaaaatttgtatgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacatt 47334231  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  47334230 aaaaatttggtag-ttacaaaattataacaattaacttgaataaattatattttcaattttggtccgttacactatgacagtaaccaactaattaaaaa 47334133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3344888 - 3344759
Alignment:
Q  61 aatcaaataattactaatctaattagtatt-caattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaa 159  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3344888 aatcaaataattattaatataataattatttcgattaacatttatatggtacattaaaaatttggtagcttacaaaattataataaataacttgaataaa 3344789  T
Q  160 ttctattttgaattttgggacgttacacta 189  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||||    
T  3344788 ttatattttgaattttggttcgttacacta 3344759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33955766 - 33955613
Alignment:
Q  61 aatcaaataattactaatctaattagta-ttcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaa 159  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |  ||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33955766 aatcaaataattattaatataataattggttcgattaaaatttatatggtacattaaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaa 33955667  T
Q  160 ttctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
    || |||||||||||||||  ||||| | || | || ||||||||||||||||||    
T  33955666 ttatattttgaattttggtccgttatagtatgacagtaacctactaattaaaaa 33955613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 45580009 - 45579849
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttaca-ataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacat 113  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  || |    
T  45580009 gtttagattaaaatttatatgttacataaaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatagttaataatataattagtattcgattaacatttatacggtacct 45579911  T
Q  114 tcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaatttt 175  Q
    | ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  45579910 taaaattttggtatgttacaaaattataataaataacttggttaaattatattttgaatttt 45579849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 42435883 - 42436085
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42435883 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 42435982  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42435983 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 42436082  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  42436083 tta 42436085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 13496754 - 13496956
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13496754 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 13496853  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13496854 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 13496953  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  13496954 tta 13496956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 32049976 - 32050178
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32049976 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattaatattcaattaacatttatatgtaacatt 32050075  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32050076 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaaa 32050175  T
Q  215 tta 217  Q
    |||    
T  32050176 tta 32050178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 20274634 - 20274831
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  20274634 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaataattattaatataattagtattcgattaacatttatacggaacatt 20274732  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  20274733 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagaaacctactaattaaaaa 20274831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 2023274 - 2023471
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  2023274 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatt 2023372  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  2023373 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagtaacctactaattaaaaa 2023471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21332773 - 21332576
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  21332773 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatt 21332675  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  21332674 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagtaacctactaattaaaaa 21332576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 49005103 - 49005300
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  49005103 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatt 49005201  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  49005202 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagtaacctactaattaaaaa 49005300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43643098 - 43642904
Alignment:
Q  17 ttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattca 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||   |||||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |    
T  43643098 ttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttc--aatcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatgatacattaa 43643001  T
Q  117 aaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  43643000 aaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagtaacctactaattaaaaa 43642904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 2840581 - 2840772
Alignment:
Q  21 attaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaat 120  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  2840581 attaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaat 2840679  T
Q  121 ttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  2840680 ttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagtaacctactaattaaaaa 2840772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38984469 - 38984278
Alignment:
Q  21 attaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaat 120  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  38984469 attaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaac-caaataattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacattaaaaat 38984371  T
Q  121 ttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  38984370 ttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactatgacagtaacctactaattaaaaa 38984278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 18410452 - 18410649
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||   |||||    
T  18410452 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatagtacatt 18410550  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  18410551 aaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaa 18410649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 24775677 - 24775873
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  24775677 gtttcgattaaa-tttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacatt 24775774  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24775775 aaaaatttgataggttacaaaattataataaataacttgaataaattatatttttaattttggtccgttacactatgacattaacctactaattaaaaa 24775873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28645708 - 28645511
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  28645708 gtttcgattaaaaattatattatacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacatt 28645610  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  28645609 aaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaa 28645511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32523900 - 32523704
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  32523900 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacatt 32523802  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaa 212  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  32523801 aaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttgatccgttacactataacagtaacctactaattaaaa 32523704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 45537100 - 45537295
Alignment:
Q  16 tttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  || |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||     
T  45537100 tttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtatgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatggtacatta 45537198  T
Q  116 aaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  45537199 aaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttgaa-tttcggtcgttacactatgacagtaacctactaattaaaaa 45537295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 42806949 - 42807146
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||| |  ||||     
T  42806949 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgatacaa-tcaaataattattaatatatttagtattcgattaacatctatacggtacatc 42807047  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  42807048 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataatttgaataaattatattttaaattttggtccgttacactatgactgtaacctactaattaaaaa 42807146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 24455235 - 24455177
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataatta 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24455235 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataatta 24455177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1788 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1788
Description:

Target: scaffold1788; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1358 - 1146
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1358 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttacaaatcaaataattattaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 1259  T
Q  115 -------------caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacct 201  Q
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1258 tatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaattgaataaattatattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacct 1159  T
Q  202 actaattaaaaaa 214  Q
    |||||||||||||    
T  1158 actaattaaaaaa 1146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 198825 - 198628
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||    
T  198825 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattattaatataattattattcgattaacatttatatggtacatt 198727  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  198726 aaaaatttggtaggttacaaaattataataattaacttgaataaattatattttgaattttggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaa 198628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 6)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 11021 - 11218
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||  ||| |||||| ||||  |||||||||||||||  || ||    
T  11021 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtacgttacaa-tcaaatgattataaatataattattattagattaacatttatatggtacgtt 11119  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgggacgttacactaaggcattaacctactaattaaaaa 213  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  11120 aaaaatttggtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattatattttaaattttggtccgttacactataacagtaacctactaattaaaaa 11218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1248 - 1087
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttgaacgttgcaaatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||  || |||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||    
T  1248 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttgtttgttagaa-tcaaatgattattaatataattattattcaattaatatttatatgatacatt 1150  T
Q  115 caaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaattctattttgaattttgg 177  Q
     ||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  1149 aaaaatttcgtaggttacaaaattataataaataacttgaataaattacattttgaattttgg 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8592 - 8476
Alignment:
Q  61 aatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaat 160  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8592 aatcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatgatacattaaaaatttcgtaggttacaaaattataataaataacttgaataaat 8493  T
Q  161 tctattttgaattttgg 177  Q
    | |||||||||||||||    
T  8492 tatattttgaattttgg 8476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25087 - 24971
Alignment:
Q  61 aatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaat 160  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25087 aatcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatgatacattaaaaatttcgtaggttacaaaattataataaataacttgaataaat 24988  T
Q  161 tctattttgaattttgg 177  Q
    |  ||||||||||||||    
T  24987 tacattttgaattttgg 24971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8663 - 8601
Alignment:
Q  61 aatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttg 123  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  8663 aatcaaataattattaatataattattattcaattaacatttatatgctacattaaaaatttg 8601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25158 - 25096
Alignment:
Q  61 aatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttg 123  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  25158 aatcaaataattattaatataattattattcaattaacatttatatgctacattaaaaatttg 25096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1289 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1289
Description:

Target: scaffold1289; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Original strand, 467 - 583
Alignment:
Q  61 aatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttggttggttacaaaattataataaataaactgaataaat 160  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  467 aatcaaatgattattaatataattattattcaattaacatttatatgatacattaaaaatttcgtaggttacaaaattataataaataacttgaataaat 566  T
Q  161 tctattttgaattttgg 177  Q
    |  ||||||||||||||    
T  567 tacattttgaattttgg 583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1289; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 123
Target Start/End: Original strand, 396 - 458
Alignment:
Q  61 aatcaaataattactaatctaattagtattcaattaacatttatatgtaacattcaaaatttg 123  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  396 aatcaaataattattaatataattattattcaattaacatttatatgctacattaaaaatttg 458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Original strand, 11470 - 11506
Alignment:
Q  181 gttacactaaggcattaacctactaattaaaaaatta 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11470 gttacactaaggcattaacctactaattaaaaaatta 11506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 9696 - 9660
Alignment:
Q  15 gtttcgattaaaatttatattttacaataaaaatttg 51  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9696 gtttcgattaaaatttatatgttacattaaaaatttg 9660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 10470 times since January 2019
Visitors: 6827