View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: F9285J-LTR4-TNT-insertion-10 (Length: 788)

Name: F9285J-LTR4-TNT-insertion-10
Description: F9285J-LTR4
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] F9285J-LTR4-TNT-insertion-10
F9285J-LTR4-TNT-insertion-10
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (10-425)||(29518686-29519101)
chr6 (236-425)||(29518495-29518684)
chr6 (236-425)||(32741171-32741360)
chr6 (177-413)||(2378059-2378295)
chr6 (195-403)||(3409611-3409819)
chr6 (178-418)||(16454838-16455081)
chr6 (125-403)||(2578442-2578730)
chr6 (174-402)||(10073991-10074219)
chr6 (236-392)||(3409251-3409407)
chr6 (125-401)||(16107943-16108208)
chr6 (236-402)||(35210196-35210362)
chr6 (129-394)||(2579500-2579765)
chr6 (204-403)||(10074362-10074560)
chr6 (236-410)||(14748334-14748504)
chr6 (237-404)||(1846741-1846908)
chr6 (236-403)||(3058218-3058385)
chr6 (235-403)||(3415449-3415619)
chr6 (244-402)||(2579872-2580030)
chr6 (125-402)||(2579109-2579387)
chr6 (130-400)||(10073618-10073884)
chr6 (246-404)||(2377756-2377914)
chr6 (246-410)||(16454577-16454741)
chr6 (236-392)||(26544041-26544197)
chr6 (246-393)||(16107680-16107827)
chr6 (236-402)||(1127352-1127518)
chr6 (219-416)||(2578821-2579016)
chr6 (250-403)||(2843560-2843714)
chr6 (244-415)||(593694-593867)
chr6 (246-402)||(5832027-5832182)
chr6 (247-387)||(1950200-1950340)
chr6 (247-399)||(6999799-6999951)
chr6 (249-352)||(32460630-32460733)
chr6 (244-398)||(10911565-10911720)
chr6 (178-369)||(6071064-6071257)
chr6 (250-369)||(9062383-9062501)
chr6 (206-363)||(8481888-8482045)
chr6 (12-108)||(10074240-10074336)
chr6 (244-402)||(12071691-12071849)
chr6 (244-402)||(12092482-12092640)
chr6 (239-396)||(5958613-5958766)
chr6 (146-303)||(33605879-33606034)
chr6 (244-399)||(12085037-12085191)
chr6 (204-317)||(35210449-35210551)
chr6 (174-360)||(2975482-2975668)
chr6 (248-403)||(17135068-17135223)
chr6 (244-399)||(31714671-31714823)
chr6 (10-108)||(3409470-3409567)
chr6 (10-89)||(2579387-2579467)
chr6 (8-100)||(26544230-26544321)
chr6 (348-395)||(3409405-3409452)
chr6 (10-108)||(2377937-2378034)
chr6 (10-89)||(2578730-2578810)
chr6 (10-89)||(16107863-16107943)
chr6 (178-235)||(12092201-12092261)
chr6 (10-78)||(2579779-2579848)
chr6 (281-322)||(14789284-14789325)
chr6 (10-89)||(16454758-16454838)
chr6 (312-356)||(22605301-22605345)
chr6 (312-363)||(11637760-11637811)
chr6 (70-108)||(14789403-14789441)
chr6 (372-416)||(2975033-2975077)
chr6 (312-356)||(21130103-21130147)
chr6 (336-394)||(10902438-10902496)
chr6 (251-385)||(30618634-30618766)
[»] chr8 (85 HSPs)
chr8 (426-778)||(2291993-2292345)
chr8 (158-398)||(3669973-3670214)
chr8 (167-394)||(1013879-1014107)
chr8 (131-400)||(40518470-40518738)
chr8 (235-403)||(3669678-3669846)
chr8 (177-398)||(30359539-30359763)
chr8 (145-398)||(9482608-9482857)
chr8 (128-402)||(8918764-8919039)
chr8 (234-395)||(30441071-30441236)
chr8 (195-403)||(34835160-34835368)
chr8 (147-403)||(45122907-45123165)
chr8 (246-410)||(3038282-3038446)
chr8 (199-403)||(34835427-34835634)
chr8 (199-403)||(34835693-34835900)
chr8 (194-410)||(9309303-9309520)
chr8 (124-403)||(45122515-45122783)
chr8 (236-403)||(1014244-1014411)
chr8 (196-394)||(6731856-6732045)
chr8 (124-392)||(147712-147968)
chr8 (246-394)||(34834878-34835026)
chr8 (246-402)||(37544490-37544646)
chr8 (244-392)||(45122067-45122215)
chr8 (244-402)||(9608745-9608903)
chr8 (134-403)||(18371660-18371925)
chr8 (246-403)||(1513914-1514071)
chr8 (247-403)||(147454-147610)
chr8 (236-425)||(20870550-20870741)
chr8 (244-410)||(6876854-6877021)
chr8 (246-410)||(40518071-40518237)
chr8 (269-398)||(9483191-9483320)
chr8 (181-395)||(45121663-45121878)
chr8 (246-401)||(33113368-33113523)
chr8 (246-402)||(25561815-25561972)
chr8 (246-394)||(30359273-30359421)
chr8 (244-403)||(45121909-45122068)
chr8 (238-396)||(40579512-40579670)
chr8 (244-402)||(5915872-5916025)
chr8 (254-425)||(18371970-18372142)
chr8 (178-316)||(18372342-18372481)
chr8 (251-404)||(70272-70425)
chr8 (215-403)||(6651476-6651653)
chr8 (248-401)||(18380020-18380171)
chr8 (238-425)||(32305478-32305658)
chr8 (244-404)||(41972158-41972321)
chr8 (244-400)||(5420651-5420807)
chr8 (136-316)||(18372785-18372966)
chr8 (244-410)||(9308977-9309147)
chr8 (178-348)||(18372988-18373157)
chr8 (134-288)||(18372485-18372640)
chr8 (247-425)||(32640508-32640682)
chr8 (244-395)||(9507777-9507933)
chr8 (236-332)||(41416241-41416335)
chr8 (246-362)||(8794113-8794229)
chr8 (319-410)||(40579261-40579352)
chr8 (244-392)||(4154678-4154824)
chr8 (129-232)||(3038099-3038202)
chr8 (267-381)||(9609108-9609222)
chr8 (247-357)||(43274824-43274934)
chr8 (178-362)||(4154321-4154506)
chr8 (10-108)||(1014122-1014219)
chr8 (10-108)||(9309164-9309262)
chr8 (246-352)||(18372656-18372758)
chr8 (328-403)||(8919143-8919218)
chr8 (244-410)||(9620670-9620834)
chr8 (248-393)||(43398077-43398225)
chr8 (244-393)||(12283873-12284021)
chr8 (249-349)||(20130454-20130553)
chr8 (254-317)||(25561729-25561792)
chr8 (329-416)||(41129073-41129160)
chr8 (247-326)||(3037784-3037865)
chr8 (338-410)||(43274627-43274699)
chr8 (10-108)||(3669870-3669967)
chr8 (244-370)||(5274775-5274901)
chr8 (344-416)||(18372269-18372342)
chr8 (355-410)||(3037961-3038016)
chr8 (330-382)||(16524451-16524503)
chr8 (280-336)||(18373236-18373292)
chr8 (321-385)||(20995433-20995497)
chr8 (247-343)||(40991756-40991852)
chr8 (194-270)||(43274699-43274777)
chr8 (13-93)||(147637-147718)
chr8 (244-301)||(20995502-20995559)
chr8 (244-321)||(33831978-33832055)
chr8 (125-162)||(9483047-9483084)
chr8 (315-352)||(12156708-12156745)
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (112-370)||(7553891-7554151)
chr7 (211-410)||(37533003-37533201)
chr7 (167-399)||(14681431-14681663)
chr7 (181-410)||(30244204-30244436)
chr7 (124-410)||(45434514-45434802)
chr7 (244-425)||(1085593-1085774)
chr7 (236-410)||(37533356-37533530)
chr7 (244-410)||(23369-23535)
chr7 (251-410)||(11845198-11845357)
chr7 (193-410)||(30245024-30245239)
chr7 (244-402)||(7517580-7517738)
chr7 (238-399)||(29157559-29157720)
chr7 (244-404)||(40094772-40094932)
chr7 (246-409)||(6054562-6054725)
chr7 (244-415)||(22567026-22567196)
chr7 (244-394)||(36939741-36939891)
chr7 (181-363)||(22566702-22566885)
chr7 (246-403)||(45433243-45433400)
chr7 (244-403)||(24177435-24177594)
chr7 (129-370)||(1085280-1085526)
chr7 (246-391)||(45754718-45754862)
chr7 (252-392)||(19122740-19122879)
chr7 (250-410)||(34218026-34218186)
chr7 (244-415)||(8128428-8128599)
chr7 (244-402)||(118299-118459)
chr7 (249-410)||(30032572-30032733)
chr7 (246-402)||(47129097-47129253)
chr7 (247-400)||(9901648-9901799)
chr7 (244-401)||(36622960-36623117)
chr7 (244-364)||(16569196-16569316)
chr7 (244-364)||(16596346-16596466)
chr7 (174-314)||(30244628-30244771)
chr7 (137-317)||(30245385-30245567)
chr7 (244-403)||(40230290-40230449)
chr7 (265-410)||(37167808-37167947)
chr7 (244-403)||(41854635-41854793)
chr7 (247-379)||(24838724-24838857)
chr7 (215-317)||(30255308-30255412)
chr7 (10-99)||(37532897-37532986)
chr7 (247-399)||(20599317-20599471)
chr7 (286-410)||(30253534-30253654)
chr7 (244-393)||(36534795-36534942)
chr7 (10-96)||(37533253-37533339)
chr7 (174-294)||(40094502-40094621)
chr7 (328-402)||(47129453-47129527)
chr7 (244-365)||(43241495-43241616)
chr7 (146-362)||(37345819-37346036)
chr7 (247-396)||(41910592-41910749)
chr7 (290-400)||(28300255-28300366)
chr7 (332-410)||(37532743-37532821)
chr7 (244-332)||(28301613-28301701)
chr7 (125-240)||(48243241-48243356)
chr7 (10-117)||(22566905-22567013)
chr7 (244-312)||(36109007-36109075)
chr7 (249-349)||(44361517-44361616)
chr7 (328-401)||(28300569-28300643)
chr7 (13-106)||(14681323-14681415)
chr7 (113-209)||(47129343-47129439)
chr7 (198-362)||(4124128-4124293)
chr7 (174-263)||(45697841-45697929)
chr7 (311-362)||(21416181-21416232)
chr7 (8-93)||(28300470-28300554)
chr7 (178-257)||(10342192-10342271)
chr7 (313-361)||(23569043-23569091)
chr7 (345-401)||(30244453-30244509)
chr7 (345-425)||(30253671-30253751)
chr7 (60-108)||(45697752-45697800)
chr7 (238-281)||(14681281-14681324)
chr7 (312-391)||(40094424-40094503)
chr7 (345-403)||(30245256-30245314)
chr7 (339-393)||(4719305-4719359)
chr7 (246-296)||(36967335-36967385)
chr7 (311-356)||(21619091-21619136)
chr7 (124-237)||(28300365-28300476)
chr7 (336-389)||(45755019-45755072)
chr7 (10-88)||(40094664-40094742)
chr7 (27-89)||(48243356-48243419)
chr7 (365-399)||(5825587-5825621)
chr7 (299-404)||(37393114-37393218)
[»] chr1 (89 HSPs)
chr1 (171-410)||(44290450-44290690)
chr1 (167-399)||(48588491-48588724)
chr1 (154-403)||(26661521-26661773)
chr1 (137-394)||(34364816-34365075)
chr1 (125-393)||(37555990-37556260)
chr1 (234-410)||(44290816-44290993)
chr1 (124-401)||(41157254-41157532)
chr1 (177-403)||(22077494-22077719)
chr1 (178-323)||(3537226-3537372)
chr1 (236-402)||(3537599-3537765)
chr1 (236-402)||(41759475-41759641)
chr1 (244-404)||(41142372-41142533)
chr1 (217-404)||(11977251-11977440)
chr1 (246-410)||(17294579-17294744)
chr1 (236-398)||(3550712-3550871)
chr1 (244-403)||(41156991-41157150)
chr1 (142-410)||(66081-66349)
chr1 (252-404)||(14318875-14319027)
chr1 (244-394)||(34364507-34364657)
chr1 (241-387)||(38804370-38804516)
chr1 (236-410)||(50052016-50052189)
chr1 (245-394)||(40082408-40082556)
chr1 (244-403)||(29798199-29798358)
chr1 (244-403)||(31767160-31767319)
chr1 (246-404)||(34649440-34649598)
chr1 (128-403)||(22077109-22077393)
chr1 (238-371)||(32594747-32594880)
chr1 (235-403)||(45493973-45494146)
chr1 (236-402)||(32168698-32168853)
chr1 (244-403)||(45084382-45084535)
chr1 (244-402)||(5319965-5320123)
chr1 (244-425)||(3875308-3875489)
chr1 (248-402)||(9955911-9956067)
chr1 (244-402)||(37850600-37850758)
chr1 (174-392)||(30630648-30630866)
chr1 (244-398)||(66476-66630)
chr1 (246-379)||(26661921-26662054)
chr1 (247-393)||(37555733-37555878)
chr1 (244-404)||(24600312-24600472)
chr1 (244-403)||(39066200-39066358)
chr1 (244-403)||(41184407-41184583)
chr1 (171-276)||(50051777-50051883)
chr1 (254-394)||(5528762-5528902)
chr1 (235-364)||(44043810-44043944)
chr1 (250-403)||(5575110-5575261)
chr1 (244-396)||(24131994-24132143)
chr1 (244-400)||(22077831-22077986)
chr1 (245-396)||(22793279-22793431)
chr1 (246-392)||(45839629-45839779)
chr1 (315-413)||(11977015-11977113)
chr1 (244-402)||(19283455-19283613)
chr1 (174-296)||(47379891-47380012)
chr1 (22-105)||(11977141-11977224)
chr1 (13-108)||(48588739-48588833)
chr1 (244-410)||(21378051-21378199)
chr1 (10-117)||(26661766-26661873)
chr1 (244-392)||(44685456-44685605)
chr1 (10-108)||(50051902-50051999)
chr1 (314-403)||(50051688-50051776)
chr1 (129-229)||(41184198-41184298)
chr1 (175-303)||(50469180-50469306)
chr1 (178-393)||(24448212-24448426)
chr1 (10-108)||(48588364-48588461)
chr1 (10-89)||(44290720-44290798)
chr1 (244-362)||(1188628-1188746)
chr1 (286-362)||(10351202-10351278)
chr1 (244-362)||(1187404-1187522)
chr1 (259-401)||(44091909-44092051)
chr1 (271-391)||(4956218-4956340)
chr1 (10-90)||(34364690-34364771)
chr1 (10-93)||(34649622-34649705)
chr1 (164-229)||(3537495-3537562)
chr1 (244-291)||(35154150-35154197)
chr1 (174-240)||(1188392-1188457)
chr1 (244-310)||(4878803-4878869)
chr1 (14-88)||(22077392-22077466)
chr1 (343-402)||(4266798-4266855)
chr1 (13-91)||(66366-66444)
chr1 (10-99)||(3537410-3537494)
chr1 (236-309)||(4266875-4266948)
chr1 (293-338)||(41184152-41184197)
chr1 (285-401)||(9499020-9499136)
chr1 (253-312)||(30630912-30630972)
chr1 (299-359)||(35154046-35154106)
chr1 (198-262)||(47380258-47380323)
chr1 (328-362)||(12466367-12466401)
chr1 (14-92)||(22077722-22077800)
chr1 (10-47)||(9956092-9956129)
chr1 (124-193)||(34649699-34649767)
[»] chr3 (93 HSPs)
chr3 (171-403)||(22304495-22304728)
chr3 (134-409)||(37990632-37990908)
chr3 (130-403)||(54017815-54018090)
chr3 (128-403)||(21832344-21832614)
chr3 (198-400)||(42342092-42342296)
chr3 (246-400)||(43346793-43346947)
chr3 (246-403)||(35946524-35946681)
chr3 (158-403)||(41359764-41360008)
chr3 (167-385)||(4823578-4823796)
chr3 (244-403)||(29644901-29645060)
chr3 (112-376)||(3135099-3135364)
chr3 (194-403)||(29644580-29644792)
chr3 (181-396)||(15773127-15773346)
chr3 (174-402)||(32462558-32462790)
chr3 (244-403)||(12114561-12114720)
chr3 (246-401)||(37990978-37991133)
chr3 (244-403)||(42342387-42342546)
chr3 (244-410)||(32589704-32589869)
chr3 (244-400)||(15772854-15773010)
chr3 (244-403)||(33803251-33803410)
chr3 (235-394)||(39934963-39935124)
chr3 (236-393)||(39389062-39389219)
chr3 (246-410)||(52634678-52634841)
chr3 (244-403)||(25739424-25739583)
chr3 (244-403)||(54018197-54018356)
chr3 (174-395)||(9240079-9240300)
chr3 (246-399)||(32462903-32463057)
chr3 (209-403)||(22303954-22304143)
chr3 (236-403)||(50612446-50612618)
chr3 (154-412)||(11661858-11662119)
chr3 (246-404)||(25755396-25755554)
chr3 (246-403)||(3135453-3135617)
chr3 (244-402)||(31190017-31190167)
chr3 (244-413)||(53577364-53577533)
chr3 (244-399)||(45395656-45395811)
chr3 (206-299)||(22304208-22304301)
chr3 (244-391)||(39914252-39914399)
chr3 (246-402)||(45901715-45901872)
chr3 (244-403)||(1634314-1634473)
chr3 (244-411)||(8327904-8328075)
chr3 (245-403)||(53117974-53118131)
chr3 (10-119)||(22303820-22303929)
chr3 (246-394)||(49336694-49336843)
chr3 (244-403)||(44160546-44160702)
chr3 (236-404)||(37726496-37726656)
chr3 (302-399)||(22303662-22303759)
chr3 (236-398)||(51886553-51886709)
chr3 (246-415)||(33175646-33175820)
chr3 (254-397)||(42584829-42584970)
chr3 (318-403)||(41359490-41359575)
chr3 (225-376)||(47964544-47964694)
chr3 (270-368)||(33362327-33362425)
chr3 (233-351)||(3384317-3384435)
chr3 (244-403)||(39336231-39336387)
chr3 (124-233)||(8328259-8328368)
chr3 (247-336)||(7767380-7767469)
chr3 (246-311)||(11661537-11661602)
chr3 (314-403)||(54017547-54017636)
chr3 (244-300)||(43346650-43346706)
chr3 (10-78)||(53577548-53577616)
chr3 (244-403)||(47964914-47965073)
chr3 (353-403)||(22304302-22304352)
chr3 (247-352)||(46546375-46546480)
chr3 (10-108)||(22304378-22304476)
chr3 (311-362)||(53596027-53596078)
chr3 (311-362)||(53596342-53596393)
chr3 (124-193)||(8328154-8328222)
chr3 (348-401)||(8328374-8328427)
chr3 (286-370)||(39336002-39336086)
chr3 (294-354)||(52634990-52635050)
chr3 (10-108)||(41360014-41360111)
chr3 (286-391)||(12749211-12749316)
chr3 (246-362)||(25991405-25991521)
chr3 (10-92)||(15773037-15773119)
chr3 (299-356)||(17731950-17732007)
chr3 (299-356)||(19033181-19033238)
chr3 (247-376)||(25317161-25317290)
chr3 (328-410)||(43978857-43978943)
chr3 (178-276)||(12747878-12747977)
chr3 (311-362)||(53596542-53596593)
chr3 (328-362)||(11661604-11661638)
chr3 (198-240)||(52634889-52634931)
chr3 (10-64)||(53577667-53577721)
chr3 (199-268)||(2299930-2300000)
chr3 (53-108)||(4823507-4823563)
chr3 (328-403)||(7766782-7766855)
chr3 (10-93)||(33803143-33803227)
chr3 (14-89)||(54018093-54018169)
chr3 (323-362)||(48127642-48127681)
chr3 (311-358)||(48127859-48127906)
chr3 (24-73)||(29644811-29644860)
chr3 (249-310)||(36986040-36986101)
chr3 (249-310)||(37011479-37011540)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (112-393)||(5643-5931)
scaffold0734 (244-393)||(5396-5546)
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (171-410)||(5542617-5542857)
chr2 (212-400)||(37106156-37106344)
chr2 (235-410)||(36178597-36178772)
chr2 (178-399)||(40679632-40679852)
chr2 (236-410)||(14745659-14745833)
chr2 (240-410)||(37105920-37106090)
chr2 (172-395)||(14745300-14745524)
chr2 (216-410)||(15880233-15880429)
chr2 (234-398)||(5543002-5543166)
chr2 (246-410)||(6421387-6421551)
chr2 (236-403)||(41283474-41283641)
chr2 (124-403)||(6421996-6422269)
chr2 (124-397)||(7598488-7598754)
chr2 (130-400)||(28531316-28531583)
chr2 (116-403)||(3672954-3673227)
chr2 (244-404)||(962598-962758)
chr2 (177-403)||(40733813-40734041)
chr2 (244-410)||(42514649-42514815)
chr2 (201-403)||(40733472-40733676)
chr2 (262-410)||(36178163-36178311)
chr2 (112-301)||(36785664-36785854)
chr2 (244-403)||(35580723-35580881)
chr2 (211-351)||(36178320-36178460)
chr2 (246-404)||(6712978-6713137)
chr2 (251-402)||(15511495-15511646)
chr2 (246-395)||(36005887-36006035)
chr2 (194-401)||(29676851-29677065)
chr2 (249-400)||(33731653-33731804)
chr2 (244-401)||(38796619-38796778)
chr2 (136-322)||(38796298-38796487)
chr2 (244-397)||(37632602-37632755)
chr2 (236-392)||(1769884-1770040)
chr2 (257-425)||(23346250-23346417)
chr2 (248-383)||(28254258-28254391)
chr2 (246-388)||(5367457-5367599)
chr2 (178-409)||(30313110-30313342)
chr2 (244-402)||(7598228-7598386)
chr2 (255-391)||(40163383-40163520)
chr2 (128-306)||(42514899-42515078)
chr2 (178-361)||(30323396-30323581)
chr2 (224-352)||(31468800-31468926)
chr2 (306-416)||(6421793-6421903)
chr2 (178-362)||(33561491-33561675)
chr2 (244-392)||(12529038-12529186)
chr2 (244-351)||(16542449-16542556)
chr2 (252-402)||(29676543-29676687)
chr2 (247-360)||(31259658-31259774)
chr2 (178-352)||(33953821-33953994)
chr2 (244-415)||(16590888-16591054)
chr2 (246-403)||(29874022-29874179)
chr2 (247-332)||(31899496-31899581)
chr2 (178-351)||(41678419-41678593)
chr2 (204-362)||(37894732-37894889)
chr2 (10-118)||(29676711-29676819)
chr2 (208-425)||(29873514-29873732)
chr2 (252-356)||(37895107-37895211)
chr2 (316-403)||(3672773-3672860)
chr2 (306-403)||(6421688-6421785)
chr2 (247-402)||(9231252-9231407)
chr2 (10-83)||(36178508-36178581)
chr2 (297-389)||(36784273-36784365)
chr2 (10-108)||(14745544-14745641)
chr2 (8-93)||(7598409-7598494)
chr2 (260-349)||(28254165-28254254)
chr2 (245-360)||(31385738-31385853)
chr2 (334-402)||(31899102-31899170)
chr2 (199-266)||(40734231-40734300)
chr2 (247-351)||(12910231-12910335)
chr2 (10-57)||(37106107-37106154)
chr2 (10-92)||(40734067-40734149)
chr2 (246-292)||(6421306-6421352)
chr2 (117-227)||(23346489-23346594)
chr2 (308-403)||(35580438-35580534)
chr2 (247-400)||(3594180-3594333)
chr2 (286-410)||(30312831-30312956)
chr2 (10-108)||(5542876-5542973)
chr2 (187-240)||(34481588-34481642)
chr2 (174-255)||(35580532-35580616)
chr2 (298-357)||(25390313-25390372)
chr2 (311-362)||(28226404-28226455)
chr2 (178-217)||(33954064-33954103)
chr2 (10-48)||(35580661-35580699)
chr2 (286-343)||(2336666-2336723)
[»] chr5 (80 HSPs)
chr5 (112-388)||(13415774-13416051)
chr5 (171-403)||(6500749-6500981)
chr5 (132-416)||(3295001-3295287)
chr5 (124-410)||(624077-624362)
chr5 (236-403)||(6500443-6500609)
chr5 (244-403)||(40296314-40296473)
chr5 (241-401)||(36492218-36492378)
chr5 (112-393)||(26074477-26074761)
chr5 (236-425)||(27502013-27502202)
chr5 (236-403)||(32487386-32487552)
chr5 (244-410)||(15370099-15370265)
chr5 (236-398)||(18603124-18603286)
chr5 (237-403)||(41170627-41170793)
chr5 (247-416)||(3295331-3295498)
chr5 (181-401)||(24489207-24489424)
chr5 (246-410)||(42405590-42405752)
chr5 (247-415)||(25327938-25328106)
chr5 (244-403)||(41632782-41632941)
chr5 (246-403)||(1028516-1028673)
chr5 (217-393)||(26074155-26074330)
chr5 (245-404)||(299490-299649)
chr5 (251-409)||(11416970-11417128)
chr5 (235-403)||(9498654-9498821)
chr5 (254-398)||(34753029-34753173)
chr5 (246-403)||(6224198-6224355)
chr5 (193-365)||(26074818-26074993)
chr5 (244-403)||(12662651-12662810)
chr5 (236-412)||(623810-623986)
chr5 (244-415)||(36568556-36568725)
chr5 (246-395)||(26075168-26075318)
chr5 (256-398)||(33747783-33747925)
chr5 (244-402)||(35150007-35150164)
chr5 (148-394)||(38427461-38427697)
chr5 (270-400)||(15370428-15370558)
chr5 (241-379)||(29549278-29549416)
chr5 (178-352)||(36521946-36522120)
chr5 (181-373)||(36522266-36522459)
chr5 (236-382)||(5723811-5723957)
chr5 (178-362)||(31509555-31509742)
chr5 (244-403)||(26590909-26591068)
chr5 (246-400)||(300961-301107)
chr5 (246-403)||(35167837-35167994)
chr5 (247-403)||(2411010-2411166)
chr5 (236-319)||(7768842-7768925)
chr5 (330-403)||(26900016-26900089)
chr5 (247-403)||(35914852-35915008)
chr5 (246-324)||(26074320-26074398)
chr5 (246-339)||(42508614-42508707)
chr5 (331-410)||(38427306-38427385)
chr5 (174-279)||(13785732-13785837)
chr5 (11-108)||(9498534-9498629)
chr5 (328-380)||(795254-795306)
chr5 (10-106)||(6500634-6500729)
chr5 (258-376)||(31509745-31509864)
chr5 (246-325)||(39309686-39309764)
chr5 (158-239)||(9498411-9498493)
chr5 (247-369)||(41635224-41635346)
chr5 (302-402)||(13785632-13785732)
chr5 (311-362)||(13042606-13042657)
chr5 (9-96)||(32487575-32487661)
chr5 (246-362)||(13786041-13786157)
chr5 (124-233)||(35150607-35150719)
chr5 (10-92)||(38427403-38427486)
chr5 (247-304)||(6225047-6225104)
chr5 (246-339)||(42524719-42524811)
chr5 (236-284)||(5660290-5660338)
chr5 (346-398)||(24489583-24489635)
chr5 (302-362)||(32445943-32446003)
chr5 (315-382)||(9498343-9498410)
chr5 (311-358)||(13112604-13112651)
chr5 (244-286)||(35150747-35150789)
chr5 (244-286)||(35151038-35151080)
chr5 (302-400)||(42435486-42435583)
chr5 (281-369)||(19275566-19275653)
chr5 (1-92)||(26074403-26074494)
chr5 (10-85)||(26075058-26075133)
chr5 (212-256)||(15370380-15370426)
chr5 (328-362)||(13042788-13042822)
chr5 (328-362)||(13112786-13112820)
chr5 (236-293)||(22298956-22299014)
[»] chr4 (110 HSPs)
chr4 (115-401)||(39404273-39404555)
chr4 (124-392)||(54108796-54109060)
chr4 (178-416)||(44620592-44620831)
chr4 (179-401)||(36629172-36629394)
chr4 (112-397)||(20826086-20826370)
chr4 (234-400)||(50630755-50630921)
chr4 (236-403)||(55933121-55933288)
chr4 (130-353)||(2740956-2741180)
chr4 (236-404)||(41370349-41370517)
chr4 (244-399)||(25483336-25483491)
chr4 (177-404)||(18932745-18932983)
chr4 (130-410)||(49076441-49076722)
chr4 (241-404)||(50002423-50002586)
chr4 (244-399)||(54017596-54017751)
chr4 (244-392)||(52884695-52884844)
chr4 (244-399)||(3340807-3340962)
chr4 (244-401)||(1731646-1731803)
chr4 (244-403)||(10245920-10246078)
chr4 (246-400)||(39792860-39793014)
chr4 (244-402)||(49076829-49076986)
chr4 (247-401)||(50459724-50459878)
chr4 (246-415)||(39404020-39404189)
chr4 (214-392)||(52884856-52885038)
chr4 (246-402)||(36572021-36572177)
chr4 (213-401)||(22027960-22028150)
chr4 (244-403)||(22183261-22183420)
chr4 (244-403)||(36608658-36608817)
chr4 (244-385)||(4955332-4955473)
chr4 (253-402)||(44621011-44621160)
chr4 (236-364)||(49880152-49880280)
chr4 (254-404)||(54343004-54343147)
chr4 (246-401)||(34646648-34646803)
chr4 (112-401)||(45489331-45489622)
chr4 (253-402)||(44620362-44620511)
chr4 (244-395)||(32941128-32941279)
chr4 (263-410)||(54936215-54936361)
chr4 (244-403)||(22028366-22028527)
chr4 (247-402)||(49302907-49303064)
chr4 (193-402)||(3244449-3244657)
chr4 (250-403)||(20825842-20825995)
chr4 (244-415)||(2740700-2740869)
chr4 (245-402)||(16888814-16888971)
chr4 (244-425)||(34004560-34004739)
chr4 (244-399)||(4390102-4390257)
chr4 (243-403)||(54108537-54108695)
chr4 (245-410)||(16889526-16889691)
chr4 (124-310)||(44621304-44621492)
chr4 (259-370)||(45496820-45496931)
chr4 (220-398)||(43174480-43174661)
chr4 (201-403)||(3341083-3341287)
chr4 (236-367)||(6975489-6975620)
chr4 (298-403)||(23817678-23817783)
chr4 (246-362)||(41707503-41707618)
chr4 (284-404)||(43827480-43827599)
chr4 (290-410)||(18879852-18879972)
chr4 (246-390)||(19504707-19504842)
chr4 (295-396)||(31691203-31691306)
chr4 (244-399)||(51768061-51768216)
chr4 (244-362)||(54741216-54741334)
chr4 (244-413)||(3700365-3700526)
chr4 (246-381)||(40067045-40067181)
chr4 (244-403)||(28034229-28034388)
chr4 (265-404)||(48111694-48111833)
chr4 (257-352)||(54017750-54017845)
chr4 (10-88)||(45496734-45496812)
chr4 (10-103)||(3340990-3341083)
chr4 (10-119)||(10246103-10246212)
chr4 (112-240)||(16889315-16889444)
chr4 (216-325)||(10246317-10246428)
chr4 (266-403)||(3271806-3271948)
chr4 (236-296)||(50788087-50788147)
chr4 (13-108)||(18933008-18933102)
chr4 (252-310)||(44620304-44620362)
chr4 (249-362)||(760194-760306)
chr4 (250-403)||(45489711-45489864)
chr4 (286-385)||(15841383-15841482)
chr4 (13-108)||(41370543-41370637)
chr4 (269-400)||(39698944-39699077)
chr4 (336-410)||(43174233-43174307)
chr4 (178-362)||(15841023-15841208)
chr4 (228-310)||(44620926-44621011)
chr4 (124-224)||(22028163-22028263)
chr4 (247-376)||(34544107-34544239)
chr4 (244-376)||(23556890-23557022)
chr4 (311-362)||(11197293-11197344)
chr4 (358-416)||(11702283-11702341)
chr4 (215-281)||(41370673-41370738)
chr4 (14-93)||(20826024-20826104)
chr4 (354-393)||(19895406-19895445)
chr4 (244-318)||(11348410-11348484)
chr4 (10-90)||(44621182-44621263)
chr4 (174-225)||(41707340-41707392)
chr4 (311-362)||(10396198-10396249)
chr4 (311-362)||(10396483-10396534)
chr4 (328-398)||(41370742-41370812)
chr4 (320-362)||(41707279-41707321)
chr4 (357-398)||(23817457-23817498)
chr4 (10-90)||(23817572-23817652)
chr4 (125-198)||(43174405-43174477)
chr4 (311-363)||(922485-922537)
chr4 (10-89)||(2740874-2740953)
chr4 (307-403)||(11783550-11783646)
chr4 (244-292)||(45050601-45050649)
chr4 (312-351)||(1868119-1868158)
chr4 (236-267)||(18933103-18933134)
chr4 (201-231)||(5882092-5882122)
chr4 (302-360)||(11706584-11706641)
chr4 (310-356)||(51681604-51681650)
chr4 (244-285)||(11706636-11706677)
chr4 (369-410)||(45496675-45496716)
[»] scaffold0391 (5 HSPs)
scaffold0391 (112-403)||(1105-1398)
scaffold0391 (136-295)||(3092-3254)
scaffold0391 (291-362)||(1731-1802)
scaffold0391 (10-90)||(1383-1464)
scaffold0391 (129-238)||(1464-1575)
[»] scaffold0702 (3 HSPs)
scaffold0702 (177-413)||(136-367)
scaffold0702 (246-404)||(512-670)
scaffold0702 (10-108)||(392-489)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (158-364)||(5268-5477)
scaffold0078 (244-395)||(4982-5133)
scaffold0078 (60-108)||(5214-5262)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (197-360)||(17496-17663)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (244-403)||(47360-47519)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (178-369)||(39771-39963)
scaffold0113 (246-376)||(39459-39588)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (246-321)||(10192-10267)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 412; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 425
Target Start/End: Original strand, 29518686 - 29519101
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518686 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgta 29518785  T
Q  110 cggcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518786 cggcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaa 29518885  T
Q  210 ttgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518886 ttgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 29518985  T
Q  310 ggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctc 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518986 ggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctc 29519085  T
Q  410 ctctcataaccaaaca 425  Q
    ||||||||||| ||||    
T  29519086 ctctcataacccaaca 29519101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 236 - 425
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518684
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataaccaaaca 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaaca 29518684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 236 - 425
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741360
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataaccaaaca 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaaca 32741360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 177 - 413
Target Start/End: Original strand, 2378059 - 2378295
Alignment:
Q  177 taagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378059 taagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 2378157  T
Q  276 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggtt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  2378158 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggtt 2378257  T
Q  376 gttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2378258 gttctagcctcgatgtggacggtcccccgagcttctct 2378295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Original strand, 3409611 - 3409819
Alignment:
Q  195 ggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 294  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3409611 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaac 3409710  T
Q  295 accttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409711 atcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttattttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 3409810  T
Q  395 cggtccccc 403  Q
    |||||||||    
T  3409811 cggtccccc 3409819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 178 - 418
Target Start/End: Original strand, 16454838 - 16455081
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgga 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  16454838 aagagcttccgcttgaagggggagcatgctgaattgatggagtcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcaga 16454937  T
Q  275 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggt 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16454938 taaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggt 16455037  T
Q  375 tgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16455038 tgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcataa 16455081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 125 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2578730 - 2578442
Alignment:
Q  125 aagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttg---------aggggg-agcacgatgaattgat 214  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||          |||| | |||| ||||||| |||    
T  2578730 aagcagtgtcggtctgtttgcggagaaaccaacaacggcgatacaagcaa-gtaagagcttccgcttccgcttgaaaagggagcagcatgatgaatagat 2578632  T
Q  215 ggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2578631 ggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagagga 2578533  T
Q  313 cccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578532 cccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 2578442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 174 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10074219 - 10073991
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10074219 aagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatagactcgcacttgagggggagtgttg-tgtgcaagggtgagttatatatcccacatcg 10074121  T
Q  273 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 372  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |    
T  10074120 gatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtggtgtctctctcgcttatttg 10074021  T
Q  373 gttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10074020 gttgttctagcctcgacgtggacggtcccc 10073991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 236 - 392
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 3409350  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409351 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 125 - 401
Target Start/End: Original strand, 16107943 - 16108208
Alignment:
Q  125 aagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacac 224  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16107943 aagcagtgtcggtctgtttgcgaagaaaccagcaacggcgatgcaag-aaagtaagagcttccgcttgaaggggagcatgatgaattgatggactcacac 16108041  T
Q  225 ttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 322  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108042 ttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 16108141  T
Q  323 cattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    |||| ||||||||            ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16108142 cattgccttaagg------------gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 402
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210362
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaagg 35210295  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35210296 ttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccc 35210362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2579765 - 2579500
Alignment:
Q  129 agtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttg 227  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| || |||||||||||||    
T  2579765 agtgacggtccatttgcggagaaaccaacaacagagatacaaacaaagtaagagctttcgcttgaagggggaccatgatgaatagacggactcacacttg 2579666  T
Q  228 agggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatta 327  Q
    |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  2579665 agggagagtgttg-ttagcaggtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattg 2579567  T
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2579566 ccttaaggttttgggtaaaagtatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtgga 2579500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 204 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 10074560 - 10074362
Alignment:
Q  204 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10074560 gatgaattgatggactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataa 10074462  T
Q  304 gtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10074461 gtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtccccc 10074362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748334
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaagg 14748405  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748404 ttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 14748334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 237 - 404
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846908
Alignment:
Q  237 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggt 336  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  337 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 1846908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058385
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaagg 3058317  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3058318 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtccccc 3058385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 235 - 403
Target Start/End: Original strand, 3415449 - 3415619
Alignment:
Q  235 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaag 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3415449 gtgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 3415548  T
Q  335 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt--tctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3415549 gtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtccccc 3415619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579872
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2579872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 125 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2579387 - 2579109
Alignment:
Q  125 aagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgag-ggggagcac---gatgaattgatggactc 220  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||| |||||||||    
T  2579387 aagcggtgtcggtctgtttgcagagaaaccagcaacggcgatacaaacaa-gtaagagcttccgcttgaaaggggagcaacatgatgaatagatggactc 2579289  T
Q  221 acacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||| |||||    
T  2579288 acacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----aggaaccata 2579193  T
Q  319 aacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2579192 aacccataactttaaggctttggctaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtcccc 2579109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 130 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10073884 - 10073618
Alignment:
Q  130 gtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttga 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| | || ||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  10073884 gtgtcggtccgtt-gcggagaaaccatcaacagtgatacaag-aaagtaagaccttccgcttgaagggggaacatgatgaattgatggactcacacttaa 10073787  T
Q  229 gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattac 328  Q
    | ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||      
T  10073786 gagggggtgttg-tgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgg 10073690  T
Q  329 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10073689 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 10073618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 246 - 404
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377914
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccg 2377914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 246 - 410
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454741
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 16454741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 392
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaagg 26544140  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26544141 ttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 246 - 393
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16107827
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 402
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127518
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtcccc 1127518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 219 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2579016 - 2578821
Alignment:
Q  219 tcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  2579016 tcacacttgagggggagtgttg-tgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccata 2578919  T
Q  319 aacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcat 416  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  2578918 aactcattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcat 2578821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 250 - 403
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843714
Alignment:
Q  250 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattaccttaaggttttgggtaagag 348  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  349 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 2843714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 244 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593694
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  344 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctca 415  Q
    || |||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctca 593694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 246 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832027
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcccc 5832027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 247 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 387  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 247 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 249 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  249 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagag 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  349 tgtg 352  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 398
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttggg 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  343 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Original strand, 6071064 - 6071257
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 274  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  6071064 aagagcttccgtttaaggggtgagcatgatgaattgatggactcacatttgaggggaagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaa 6071162  T
Q  275 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 369  Q
    || || |||  ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6071163 tagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgt 6071257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 250 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  250 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  350 gtggtgtctctcttgcttgt 369  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 206 - 363
Target Start/End: Original strand, 8481888 - 8482045
Alignment:
Q  206 tgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| ||||||    
T  8481888 tgaattgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataa 8481985  T
Q  304 gtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 363  Q
     | ||| ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8481986 atgagatgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10074336 - 10074240
Alignment:
Q  12 gtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10074336 gtatcagagccccggttcgaagaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagtagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcattgt 10074240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071691
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccc 12071691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092482
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtcccc 12092482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 239 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958613
Alignment:
Q  239 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttt 338  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||  ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  339 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 396  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||    || | |||||||| ||||||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctctcttg----tgtgattgttctaacctcgatgtggacg 5958613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 303
Target Start/End: Original strand, 33605879 - 33606034
Alignment:
Q  146 ggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg 245  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||| || |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  33605879 ggagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gtaagagcttccgctcgaagaagggcacggtgaattgatggactcacacttgagggggagtgat-gtgtg 33605976  T
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 303  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||| ||||||    
T  33605977 caaatgtaagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtggaggttgaacactttataa 33606034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 244 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085037
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtc 12085037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 317
Target Start/End: Original strand, 35210449 - 35210551
Alignment:
Q  204 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  35210449 gatggattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgc-----------cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaa 35210537  T
Q  304 gtaagaggacccat 317  Q
    ||||||||||||||    
T  35210538 gtaagaggacccat 35210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 174 - 360
Target Start/End: Original strand, 2975482 - 2975668
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg-gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacat 270  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| || |||||||||||    
T  2975482 aagtaagagcttccgcttaaagggggaacatgatgaatagatgcactcacacttg-gggggagtgttgtgttt--aagtgtaagtaattatgtcccacat 2975578  T
Q  271 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 360  Q
    |  ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||  ||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  2975579 caaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtctct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135068
Alignment:
Q  248 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaaga 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| ||||     || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  348 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||  | |||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtccccc 17135068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 399
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714823
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    |||||||||| || | | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgt-tttttcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtc 31714823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 3409470 - 3409567
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| | ||||||  |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3409470 tggtatcagagccccggttcgacgaagtatatgaccgaggcagccggtc-gttgcgtaaaaagcagcaacggcggtacaagtagcaagtggctccttgt 3409567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 2579467 - 2579387
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggt-tagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaa 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2579467 tggtatcagagccccggttcgacgaacggtacgaccgaggcagccggtccacttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 2579387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 100
Target Start/End: Original strand, 26544230 - 26544321
Alignment:
Q  8 actggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtgg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  26544230 actggtattagagccccggttcgatgaagggtgcgaccgaggcagccgg-tatttgcgtagaaagccgcaacgctggtacaaacagcaagtgg 26544321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 395
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409452
Alignment:
Q  348 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac 3409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 2377937 - 2378034
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| | |||||| ||||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  2377937 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggtagtcgg-tcgttgcgaagaaagtcgcaacagcagtacaagcagcaagtggctccttgt 2378034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 2578810 - 2578730
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttag-ttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaa 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  | ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  2578810 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgcttgggcagaaagcagcaacggcgttacaa 2578730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 16107863 - 16107943
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggt-tagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaa 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16107863 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccatttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaa 16107943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12092261 - 12092201
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgaggggg---agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag 235  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12092261 aagagcttccgctagaggggggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggag 12092201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 2579848 - 2579779
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttag-ttgcgcagaaagcagcaa 78  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  2579848 tggtatcagagccccggttccacgaagggtacgaccgaggcagccagttcgtttgcgcagaaagcagcaa 2579779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789284
Alignment:
Q  281 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaacc 14789284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 16454758 - 16454838
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttag-ttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaa 89  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454758 tggtatcagagcccaggttcgacgaagggtacgaccgaggtaaccggtccgtttgcgcagaaagcaacaacgacggtacaa 16454838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  312 acccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 356  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  312 acccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 363  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14789441 - 14789403
Alignment:
Q  70 aagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14789441 aagcagcaacgacggtaaaagcagcaagtggctccttgt 14789403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 416
Target Start/End: Original strand, 2975033 - 2975077
Alignment:
Q  372 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  2975033 ggttgttctagcctcgatgtggcaggtcccacgcgctcctctcat 2975077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  312 acccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 356  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902438
Alignment:
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||  ||| ||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtgga 10902438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618634
Alignment:
Q  251 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtg 350  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  351 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 385  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct 30618634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 85)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 426 - 778
Target Start/End: Original strand, 2291993 - 2292345
Alignment:
Q  426 tgttataggtgtgaatcattttatcgtggcggctcaacacatcttaggaaggtgtacttaactttaagtagtagttatagttataataagaagaattgga 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291993 tgttataggtgtgaatcattttatcgtggcggctcaacacatcttaggaaggtgtacttaactttaagtagtagttatagttataataagaagaattgga 2292092  T
Q  526 tgttatgtgaatgggcgtgtaccattatttaatttggtggtacaatgcaactcaggacgacgttcctaaatgtgtgaataagcgtgtaacatttaatcct 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2292093 tgttatgtgaatgggcgtgtaccattatttaatttggtggtacaatgcaactcaggacgacgttcctaaatgtgtgaataagcgtgtaacatttaatcct 2292192  T
Q  626 tgtgtttcaatgcaagtaagtagtttagtttagagcaattagaacaattggattatgtgtccctctttgtgtccaacgagaacatttatgcttatgcggc 725  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2292193 tgtgtttcaatgcaagtaagtagtttagtttagagcaattagaacaattggattatgtgtccctctttgtgtccaacgagaacatttatgcttatgcggc 2292292  T
Q  726 atgttgagtcatcannnnnnnaattatatgacatgttcatcgtgtaattatta 778  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2292293 atgttgagtcatcatttttttaattatatgacatgttcatcgtgtaattatta 2292345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 158 - 398
Target Start/End: Original strand, 3669973 - 3670214
Alignment:
Q  158 aacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagt 256  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3669973 aacggcgatacatgcaaagtaagagcttctgcttgaagggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagt 3670072  T
Q  257 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670073 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 3670172  T
Q  357 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670173 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 3670214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 167 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1014107 - 1013879
Alignment:
Q  167 acatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1014107 acatgcaaagtaagagcttccgcttgaagggggagtatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgttc 1014008  T
Q  266 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  1014007 cacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagtaagagtgtgttgtctcttttac 1013908  T
Q  366 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1013907 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 131 - 400
Target Start/End: Original strand, 40518470 - 40518738
Alignment:
Q  131 tgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgag 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40518470 tgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gtaagagcttccacttgaggggggagcatgatgaattgatggactcacacttgag 40518568  T
Q  230 ggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacc 329  Q
    ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |    
T  40518569 ggggagtattgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgac 40518667  T
Q  330 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518668 ttaaggttttgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 235 - 403
Target Start/End: Original strand, 3669678 - 3669846
Alignment:
Q  235 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaag 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  3669678 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaag 3669777  T
Q  335 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3669778 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccccc 3669846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Original strand, 30359539 - 30359763
Alignment:
Q  177 taagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgg 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  30359539 taagagcttccgcttgaagggggagcatgataaattgatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcag 30359638  T
Q  274 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 373  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30359639 ataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcgg 30359738  T
Q  374 ttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    |||||||| | ||||||||||||||    
T  30359739 ttgttctaacttcgatgtggacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 145 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9482857 - 9482608
Alignment:
Q  145 tggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggttt 244  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |    
T  9482857 tggagaaaccagcaacggcgatacaagcaa-gtaagagcttccgcttgaagggg-gcacagtgaattgttggactcac--ttgagggggagtgttgttgt 9482762  T
Q  245 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    | |   ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||    
T  9482761 gtacaagtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtata 9482662  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482661 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 8919039 - 8918764
Alignment:
Q  128 cagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttg 227  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||| | ||||  || ||||||| ||||||||||||||||    
T  8919039 cagtgtcggtccgtttgcgaagaaatcagcaacggcgatacaagcaa-gttagagcttccgcttaaagggggacatgatgaatagatggactcacacttg 8918941  T
Q  228 agggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 325  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8918940 agggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctat 8918841  T
Q  326 taccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918840 tgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 30441071 - 30441236
Alignment:
Q  234 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattacc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  30441071 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcc 30441170  T
Q  330 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441171 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 30441236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Original strand, 34835160 - 34835368
Alignment:
Q  195 ggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 292  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34835160 ggggggcatgatgaattgatggactcac--ttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttga 34835257  T
Q  293 acaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  34835258 acaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgta 34835357  T
Q  393 gacggtccccc 403  Q
    |||||||||||    
T  34835358 gacggtccccc 34835368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 403
Target Start/End: Original strand, 45122907 - 45123165
Alignment:
Q  147 gagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtt 243  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||     
T  45122907 gagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gtaagagcttccgcttgaagggggaacatgatgaatagatggacttacacttgagggggagtgttgctgtg 45123005  T
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  45123006 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaaggttttgggt 45123103  T
Q  344 a--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45123104 aagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtccccc 45123165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 246 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038282
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctcc 3038282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 403
Target Start/End: Original strand, 34835427 - 34835634
Alignment:
Q  199 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaaca 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  34835427 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaaca 34835526  T
Q  296 ccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  34835527 ccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagac 34835626  T
Q  396 ggtccccc 403  Q
    ||||||||    
T  34835627 ggtccccc 34835634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 403
Target Start/End: Original strand, 34835693 - 34835900
Alignment:
Q  199 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaaca 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  34835693 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaaca 34835792  T
Q  296 ccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  34835793 ccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagac 34835892  T
Q  396 ggtccccc 403  Q
    ||||||||    
T  34835893 ggtccccc 34835900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 194 - 410
Target Start/End: Original strand, 9309303 - 9309520
Alignment:
Q  194 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 291  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9309303 gggggagcacgataaagtgatggactcacaattgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttg 9309402  T
Q  292 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |   | || ||||||||||||||||||||    
T  9309403 aacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggtaagagtgtggtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgt 9309501  T
Q  392 ggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  9309502 ggacggtcccccgagctcc 9309520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 124 - 403
Target Start/End: Original strand, 45122515 - 45122783
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcac 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||   || |||     |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || | ||||||    
T  45122515 caagcagtgtcggtccgtttgcggaggaaccaacaacatcgataca-----agtaagagcttccgctggaagggggagcatgatgaatagaagaactcac 45122609  T
Q  223 acttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 322  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||      ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45122610 acttgagggggagtgttg-tgtgcaagtg------atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaact 45122702  T
Q  323 cattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45122703 cattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtccccc 45122783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014244
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaag 1014312  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1014311 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggttcccc 1014244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 196 - 394
Target Start/End: Original strand, 6731856 - 6732045
Alignment:
Q  196 gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 295  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  6731856 gggagcatgatgaatagatggactcacatttgagggggagtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga--- 6731952  T
Q  296 ccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
          ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6731953 ------aagtaagagaacccataaattcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtgga 6732045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 124 - 392
Target Start/End: Original strand, 147712 - 147968
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcac 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||     ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  147712 caagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccaacaacgacgataca-----agtaagagcttccgcttaaagggggagct-gatgaattgatggactcac 147805  T
Q  223 acttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaa 320  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||         |||||||||    
T  147806 acttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatata---------acccataaa 147896  T
Q  321 cccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  147897 cctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 246 - 394
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835026
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 246 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544490
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgatcccc 37544490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 244 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608903
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccc 9608903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18371925 - 18371660
Alignment:
Q  134 cggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggg 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| || |||  ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18371925 cggttcgtttgcggagaaaccagcagcggcgatacaaacaaataaagagcttccgcttgaagggggggcacgataaagtgatggactcacacttgagggg 18371826  T
Q  233 gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctta 332  Q
    ||||| || | || |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  18371825 gagtgctgttgtgtagaagtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgcctta 18371731  T
Q  333 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  18371730 aggttttgggtaagagtgtggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtggacggttcccc 18371660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 246 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513914
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
     |||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtccccc 1513914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147610
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtccccc 147610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870550
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  334 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataaccaaaca 425  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||  ||||| ||||| ||| ||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctcatgacccaaca 20870550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 244 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876854
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttggg 342  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  343 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 6876854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 246 - 410
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518237
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccgagctcc 40518237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 269 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483191
Alignment:
Q  269 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  369 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9483191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 181 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 45121878 - 45121663
Alignment:
Q  181 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 278  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45121878 agcttccgctctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaa 45121780  T
Q  279 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgtt 378  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||    
T  45121779 agagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggttgtt 45121680  T
Q  379 ctagcctcgatgtggac 395  Q
    |||||||||||||||||    
T  45121679 ctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 246 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 246 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561815
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggtttt-gggta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccc 25561815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 246 - 394
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359421
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtgga 30359421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121909
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    || ||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtccccc 45121909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 238 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579512
Alignment:
Q  238 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggtt 337  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  338 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 396  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacg 40579512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 254 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371970
Alignment:
Q  254 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtgg 353  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  354 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcctctcataaccaaaca 425  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctcatgacccaaca 18371970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 178 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18372481 - 18372342
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 276  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18372481 aagagcttccccttgaagggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18372382  T
Q  277 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372381 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70272
Alignment:
Q  251 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  351 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    ||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtctcccg 70272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 215 - 403
Target Start/End: Original strand, 6651476 - 6651653
Alignment:
Q  215 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 314  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||    
T  6651476 ggactcacacttgaggggaggtgttgttttgcaagtg--agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacc 6651564  T
Q  315 cataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6651565 cataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtccccc 6651653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 248 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  248 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaaga 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  348 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    ||||||||   |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 238 - 425
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305658
Alignment:
Q  238 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggtt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  338 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataaccaaaca 425  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtccccctgactcccctcgtaaccaaaca 32305658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 404
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972321
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggtt---ttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  341 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtctcccg 41972321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 400
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    |||||||||  ||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18372966 - 18372785
Alignment:
Q  136 gtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttg--agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggg 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| || |||  ||||  |||||||||| | |   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |     
T  18372966 gtccgtttgcggagaaaccagcagcggcgatacaaacaaataaagagcttcccccttcaagggggagcacgataaagtgatggactcacacttgaggag- 18372868  T
Q  234 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 316  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372867 agtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 244 - 410
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309147
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  342 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 9309147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 178 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18373157 - 18372988
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgca-agtgtgagttatatgtcccacatcggat 275  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18373157 aagagcttccccttgatgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagatggagtgttgttgtgtacagtgtgatttatatgtcccacttcggat 18373058  T
Q  276 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagag 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||   ||||||||||||||||    
T  18373057 aaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18372640 - 18372485
Alignment:
Q  134 cggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgaggggga-gcacgatgaattgatggactcacacttgagggg 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||  ||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18372640 cggtccgtttgcggagaaaccagcagcggcgattcaaacaaataaagagcttccccttgaaggggaagcacgataaagtgatggactcacacttgagggg 18372541  T
Q  233 gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 288  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372540 gagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 247 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640508
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cccgcgctcctctcataaccaaaca 425  Q
    ||||| | ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtgagcggtccgccagagctcccctcatgaccaaaca 32640508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttt 338  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  339 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 395  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416241
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctta 332  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctatcacctta 41416241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 246 - 362
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  346 gagtgtggtgtctctct 362  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 319 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579261
Alignment:
Q  319 aacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccccgagctcc 40579261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 244 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154678
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtg 4154678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3038202 - 3038099
Alignment:
Q  129 agtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttga 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  3038202 agtgtcggtccgtttgaggagaaaccagcaacggcgatacaaagcaagtaagagcttccgcttgagggggagctcgatgaattgatggactcacacttta 3038103  T
Q  229 gggg 232  Q
    ||||    
T  3038102 gggg 3038099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 267 - 381
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  267 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 366  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  367 tgtgcggttgttcta 381  Q
     ||| ||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  347 agtgtggtgtc 357  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4154506 - 4154321
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 274  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  4154506 aagagcttctgcttgaggggtgagcatgaagttttgatggactcacacttgagggggaaattgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcaga 4154408  T
Q  275 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    || || |||  ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4154407 tagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaga-gacccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtgatgtctctct 4154321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1014219 - 1014122
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1014219 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgactgaggcagccggtc-gttgcgcagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgt 1014122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 9309164 - 9309262
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9309164 tggtatcagaaccccagttcgacggagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcaacaacgacggcacaagcagcaagtggctccttgt 9309262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  346 gagtgtg 352  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 328 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8919218 - 8919143
Alignment:
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8919218 ccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtccccc 8919143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 244 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620670
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||| || |||||||||  |||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcc 9620670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  248 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 244 - 393
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||   | |||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaagtc-ttaaggttttggat 12283971  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 349
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  249 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagag 348  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  254 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 329 - 416
Target Start/End: Original strand, 41129073 - 41129160
Alignment:
Q  329 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcat 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  41129073 cttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcat 41129160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037784
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatt 326  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccatt 3037784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274627
Alignment:
Q  338 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 43274627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 3669870 - 3669967
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||| ||| |||| | ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3669870 tggtatcagagccccccttcaatgaagggtacgatcgaggcagccggtc-gttgcgcagaaagccgcaacaacggtacaagcaacaagtggctccttgt 3669967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 370
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274901
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 370  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtg 5274901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372269
Alignment:
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcctctcat 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggttcccccgagctcccctcat 18372269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037961
Alignment:
Q  355 gtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 3037961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 382
Target Start/End: Original strand, 16524451 - 16524503
Alignment:
Q  330 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 382  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16524451 ttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  280 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995433
Alignment:
Q  321 cccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 385  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcct 20995433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991852
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggt 40991852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43274777 - 43274699
Alignment:
Q  194 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 270  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||||||| || |||||    
T  43274777 gggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggacagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatctcacat 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 93
Target Start/End: Original strand, 147637 - 147718
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagtt-gcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcag 93  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  147637 tatcagagccccggttcgacaaagggtacgatcgaggcagccagtccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaagcag 147718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 301  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 321
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9483084 - 9483047
Alignment:
Q  125 aagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacgg 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9483084 aagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccatcaacgg 9483047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  315 cataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtg 352  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 112 - 370
Target Start/End: Original strand, 7553891 - 7554151
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt 211  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553891 gcaatggcggtgcaagcagtgttggtccgtttgcagagaaaccagcaacggcgacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt 7553990  T
Q  212 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553991 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 7554090  T
Q  310 ggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 370  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7554091 ggatccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtg 7554151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 211 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37533201 - 37533003
Alignment:
Q  211 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533201 tgatggactcacgcttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 37533102  T
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533101 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 37533003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 167 - 399
Target Start/End: Original strand, 14681431 - 14681663
Alignment:
Q  167 acatgcaaagtaagagcttccgcttga--gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14681431 acatgcaaagtaagagcttccgcttgaaggggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtaagttatatgtc 14681530  T
Q  265 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 364  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  14681531 ccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctca-- 14681628  T
Q  365 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14681629 caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 181 - 410
Target Start/End: Original strand, 30244204 - 30244436
Alignment:
Q  181 agcttccgcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 277  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244204 agcttccgcttgaagagggagcatgatgactagatgaactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 30244303  T
Q  278 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt 377  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30244304 aagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgt 30244403  T
Q  378 tctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30244404 tcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcc 30244436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 410
Target Start/End: Original strand, 45434514 - 45434802
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaga--gcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactc 220  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| |||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45434514 caagtagtgtcggtctgtttgcggagaaactagcaacggcgatacaagcaa-gtaaaaaagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgaaggactc 45434612  T
Q  221 acacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaa 320  Q
    ||||||| ||||| ||  | || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45434613 acacttgggggggtgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaa 45434712  T
Q  321 cccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  45434713 cttactgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtccccctcgctcc 45434802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 244 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085593
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataaccaaaca 425  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctcatgacccaaca 1085593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 236 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37533530 - 37533356
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37533530 tgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaagg 37533431  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533430 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 37533356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 244 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23369
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccccgagctcc 23369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 251 - 410
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845357
Alignment:
Q  251 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtg 350  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  351 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccccgtgctcc 11845357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 193 - 410
Target Start/End: Original strand, 30245024 - 30245239
Alignment:
Q  193 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 290  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30245024 agggggagcatgatgattagatggactcgcacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggtt 30245123  T
Q  291 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatg 390  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||||||||    
T  30245124 gaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatg 30245219  T
Q  391 tggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  30245220 tggatggtcccccgagctcc 30245239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517738
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtcccc 7517738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 238 - 399
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157720
Alignment:
Q  238 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggtt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  338 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtc 29157720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 244 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094772
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccccg 40094772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 246 - 409
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054725
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctc 409  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccccgagctc 6054725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 244 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567026
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctca 22567026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 244 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 181 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22566885 - 22566702
Alignment:
Q  181 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 278  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22566885 agcttccgctctggggggagcacgataaagtgatagactaacatttgagggggagtgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaa 22566786  T
Q  279 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 363  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22566785 agagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 246 - 403
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433400
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccc 45433400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177594
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtccccc 24177594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1085526 - 1085280
Alignment:
Q  129 agtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggac--tcacact 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||  |||||||  |||||||    
T  1085526 agtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacagcgatacaagcaa-gtaagagcttccccttgaaggggtagcatgatgaaaagatggacactcacact 1085428  T
Q  226 tgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 322  Q
    ||| |||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||     
T  1085427 tgaaggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaact 1085328  T
Q  323 cattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085327 cattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 246 - 391
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  252 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgt 351  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  352 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 250 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218026
Alignment:
Q  250 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagt 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  350 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctcc 34218026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128428
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctca 415  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccccgcactcccctca 8128428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118299
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  344 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc 118299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 249 - 410
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032733
Alignment:
Q  249 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagag 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  349 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 30032733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 246 - 402
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129253
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 47129253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 401
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623117
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtccc 36623117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 364
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttg 364  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttg 364  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Original strand, 30244628 - 30244771
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 270  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30244628 aagtaagagcttccgcttcaaggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 30244727  T
Q  271 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 314  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30244728 tggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 30245385 - 30245567
Alignment:
Q  137 tccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggag 235  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||| |||||||||||||||     
T  30245385 tccgtttgcgcagagagcagcaacggcgatacaagcaa-gtaagagcttccgcttgagggggagcatgatgaaaaagacggacacacacttgagggggac 30245483  T
Q  236 tgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 317  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30245484 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230290
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||  ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggttcccc 40230290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 265 - 410
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167947
Alignment:
Q  265 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 364  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  365 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgcgctcc 37167947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854793
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | | ||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtccccc 41854793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag-aggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttc 379  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 215 - 317
Target Start/End: Original strand, 30255308 - 30255412
Alignment:
Q  215 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30255308 ggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30255407  T
Q  313 cccat 317  Q
    |||||    
T  30255408 cccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37532986 - 37532897
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37532986 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgactgtacaagcagcaagtg 37532897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 247 - 399
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta-- 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 286 - 410
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253654
Alignment:
Q  286 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 385  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  386 cgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccccgagctcc 30253654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534795
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    |||||||||| |||||||   |  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 37533339 - 37533253
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaa 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533339 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaa 37533253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40094621 - 40094502
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  40094621 aagtaagagcttccgcttgagggagagcgtgatgaatagatggactcacactttaggaggagtgtt-gtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcag 40094523  T
Q  274 ataaaatagtaaaggttgaac 294  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  40094522 ataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 328 - 402
Target Start/End: Original strand, 47129453 - 47129527
Alignment:
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47129453 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtcccc 47129527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 244 - 365
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||  ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgc 365  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 362
Target Start/End: Original strand, 37345819 - 37346036
Alignment:
Q  146 ggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggttt 244  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |    
T  37345819 ggagaaagcagcaacggcgatacaagcaa-gtaaaagcttccacttgacgggggagcacgatgaattgatgaactcacacttgaaggggagtgttg-tgt 37345916  T
Q  245 gcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttggg 342  Q
    |||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||| |||||| |    
T  37345917 gcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttgag 37346016  T
Q  343 taagagtgtggtgtctctct 362  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  37346017 taagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910592
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa--------ggttt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||        | |||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggattt 41910650  T
Q  339 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 396  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |  ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41910649 ttggtaagagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 41910592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 290 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300255
Alignment:
Q  290 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 388  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  389 tgtggacggtcc 400  Q
    ||||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcc 28300255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 332 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532743
Alignment:
Q  332 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgcgctcc 37532743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctta 332  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48243356 - 48243241
Alignment:
Q  125 aagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcaca 223  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48243356 aagcagtgtcggttcgttggcggagaaaccagcaacggcgatacaagcaa-gtaagaacttccacttgaagggggagcatgatgaattgatggattcaca 48243258  T
Q  224 cttgagggggagtgttg 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  48243257 cttgagggggagtgttg 48243241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22567013 - 22566905
Alignment:
Q  10 tggtatcagagcccc-ggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22567013 tggtatcagagcccccggtccgacgaagggtacgaccaaggccaccggttagttgtgcagaaaacagcaaagacggtacaagaagcaagtggctccttgt 22566914  T
Q  109 acggcaacg 117  Q
     | ||||||    
T  22566913 gcagcaacg 22566905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 312  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  249 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagag 348  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 328 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28300643 - 28300569
Alignment:
Q  328 ccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28300643 ccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 14681323 - 14681415
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcctt 106  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  14681323 tatcagagccccggttggatgaagggtgcgaccgaggcagccggtt-gttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaaacagcaaatggctcctt 14681415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Original strand, 47129343 - 47129439
Alignment:
Q  113 caacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttg-agggggagcacgatgaa 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47129343 caacggcggtgcaagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacaatacaagc-aagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaa 47129439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4124293 - 4124128
Alignment:
Q  198 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt-tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 296  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||| | | || ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  ||||    
T  4124293 gagcatgatgaattgatgggctcacacttgatgtgaagtttgttgtgtgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacac 4124194  T
Q  297 cttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
     |||||||| |||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4124193 tttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggataaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 263
Target Start/End: Original strand, 45697841 - 45697929
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  45697841 aagtaagagcttccgcttgaaggggagcatgatgaatagataaactcacacttgaggaggagtgtt-gtgtgcaagtgtcatttatatgt 45697929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28300554 - 28300470
Alignment:
Q  8 actggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcag 93  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| | | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28300554 actggtatcagagcct-gattcgacgaagggtacgaccgaggcagtcggtccattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcag 28300470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 257
Target Start/End: Original strand, 10342192 - 10342271
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagtt 257  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10342192 aagagcttccacttgagggggcagcatgatgaattggcggactcatacttgagggggagtg-tggtgtgcaagtgtgagtt 10342271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 313 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  313 cccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 401
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244509
Alignment:
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccc 30244509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 425
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253751
Alignment:
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataaccaaaca 425  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| ||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctcatgacccaaca 30253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 108
Target Start/End: Original strand, 45697752 - 45697800
Alignment:
Q  60 gttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  45697752 gttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagaagcaagtggctccttgt 45697800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 281
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  238 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  312 acccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 391  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 403
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245314
Alignment:
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtccccc 30245314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  339 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 356  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28300476 - 28300365
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttg-tggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga--gggggagcacgatgaattgatggactc 220  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |  ||| |||| |     ||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||    
T  28300476 caagcagtgtcggtccatttgctggagaaaccagcaacgacgttacaagcaagg-----gcttccgcttgaaaggaggagcatgatgaatagatggactc 28300382  T
Q  221 acacttgagggggagtg 237  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28300381 acacttgagagggagtg 28300365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 389
Target Start/End: Original strand, 45755019 - 45755072
Alignment:
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgat 389  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  45755019 ttttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 40094742 - 40094664
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagtt-gcgcagaaagcagcaacgacggtaca 88  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  40094742 tggtatcagagccctg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagtagcaacggcggtaca 40094664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 48243419 - 48243356
Alignment:
Q  27 ttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagtt-gcgcagaaagcagcaacgacggtacaa 89  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  48243419 ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 48243356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 365 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5825621 - 5825587
Alignment:
Q  365 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5825621 cttgtgcggttgttctagccttgatgtggacggtc 5825587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 404
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393218
Alignment:
Q  299 tataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || | |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| || ||||| |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  399 cccccg 404  Q
    ||||||    
T  37393213 cccccg 37393218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 89)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 171 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 44290690 - 44290450
Alignment:
Q  171 gcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290690 gcaaagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 44290591  T
Q  270 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44290590 tcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtgtctttcttgcttgt 44290491  T
Q  370 gcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44290490 acggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 44290450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 167 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 48588724 - 48588491
Alignment:
Q  167 acatgcaaagtaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48588724 acatgcaaaataagagcttccgcttgaaggggtagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttctatgtcc 48588625  T
Q  266 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 365  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  48588624 gacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgcggtgtctctcttac 48588525  T
Q  366 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588524 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 48588491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26661773 - 26661521
Alignment:
Q  154 cagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagt 250  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||    
T  26661773 cagcaacgacgatacatgcaaagtaagagcttccgcttgaagggagagtatgatgaatagatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagt 26661674  T
Q  251 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26661673 gtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtg 26661574  T
Q  351 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26661573 tggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtccccc 26661521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 137 - 394
Target Start/End: Original strand, 34364816 - 34365075
Alignment:
Q  137 tccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggag 235  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  34364816 tccgtttgcggaaaaaccagcaacagcgacacaagcaa-gtaagagcttccgattgagggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggag 34364914  T
Q  236 tgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa 333  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34364915 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaa 34365014  T
Q  334 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  34365015 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtgga 34365075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Original strand, 37555990 - 37556260
Alignment:
Q  125 aagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcaca 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | |||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||    
T  37555990 aagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacggcgatagaagcaa-gtaagagctttagcttgaagggggggcaggataaagtgatggactcaca 37556088  T
Q  224 cttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaa 320  Q
    ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37556089 cttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacc-ataaa 37556187  T
Q  321 cccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37556188 cccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 234 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 44290993 - 44290816
Alignment:
Q  234 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44290993 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 44290894  T
Q  334 ggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44290893 ggttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 44290816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 124 - 401
Target Start/End: Original strand, 41157254 - 41157532
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagta-agagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcac 222  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  || |||  ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41157254 caagtagtgtcagtccgtttgcggagaaaccaacaacgacgatacaaacaa-gtagagagcttccgctct-gggggagcacgataaattgatggactcac 41157351  T
Q  223 acttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaa 320  Q
    |||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157352 acttaagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaa 41157451  T
Q  321 cccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41157452 cccattgcctttaggttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccc 41157532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22077719 - 22077494
Alignment:
Q  177 taagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22077719 taagagcttccgcttgatggggagcatgatgaatacatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 22077621  T
Q  277 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 376  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  22077620 gaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttg 22077521  T
Q  377 ttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  22077520 ttcaagcatcgatatggacggtccccc 22077494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 178 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3537372 - 3537226
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 276  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537372 aagagcttccgcttgaagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 3537273  T
Q  277 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537272 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 236 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3537765 - 3537599
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  3537765 tgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaagg 3537666  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537665 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3537599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 402
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759641
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 244 - 404
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142533
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  344 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 41142533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 217 - 404
Target Start/End: Original strand, 11977251 - 11977440
Alignment:
Q  217 actcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  11977251 actcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcact 11977350  T
Q  315 cataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977351 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 11977440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 246 - 410
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294744
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgc-ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtcgcccgagctcc 17294744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 398
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157150
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 41157150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 66349 - 66081
Alignment:
Q  142 ttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 240  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  66349 ttgtggagaagccagcaacggcgatacaagcaagataagagcttccgcttgatgggggaacatgatgaatagatggactcacacttgaggggaagtgttg 66250  T
Q  241 gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttt 338  Q
     | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  66249 -tgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggttt 66151  T
Q  339 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||||| | |||||   |||||  ||||||||| |||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  66150 tgggtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatggttgttctggcctcgatgtagacaatcccccgagctcc 66081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 252 - 404
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319027
Alignment:
Q  252 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgt 351  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  352 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccg 14319027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 244 - 394
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364657
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtgga 34364657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 241 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  241 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttg 340  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  341 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 50052189 - 50052016
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  50052189 tgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaag 50052090  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50052089 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgttgttctaacctcgatgtggacagtcccccgagctcc 50052016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 394
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082556
Alignment:
Q  245 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtgga 40082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798358
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtccccc 29798358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767160
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtccccc 31767160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 246 - 404
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649598
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 34649598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 128 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22077393 - 22077109
Alignment:
Q  128 cagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttg 227  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||| || ||| |||| |||||||||| |||||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  22077393 cagtgtcggtctgtt-gcggagaaaccggcagcggcgatacaagcaa-gtaagagctttcgcttgatagcgagcatgatgaatagatggacacacacttg 22077296  T
Q  228 agggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata--aaat----------agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc 315  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22077295 agggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggaccc 22077197  T
Q  316 ataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22077196 ataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcacttatgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccc 22077109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 238 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594747
Alignment:
Q  238 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggtt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  338 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgc 32594747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493973
Alignment:
Q  235 gtgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattacc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcc 45494047  T
Q  330 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45494046 ttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccc 45493973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 32168853 - 32168698
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32168853 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgagg 32168765  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32168764 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 32168698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084535
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |   |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa---cgt---cttaaggttttgggt 45084475  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtccccc 45084535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 244 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875308
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataaccaaaca 425  Q
    |||| ||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccctcatgacctaaca 3875308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 248 - 402
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956067
Alignment:
Q  248 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccc 9956067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850600
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |   ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccc 37850600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 174 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30630866 - 30630648
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 272  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30630866 aagtaagtgcttcctcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcg 30630768  T
Q  273 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 372  Q
    ||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| || ||| || |  ||| || |    
T  30630767 gataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtggggcgtccctatcacttatgtg 30630668  T
Q  373 gttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  30630667 gttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66476
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggt 66476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 246 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661921
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttc 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 26661921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 247 - 393
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || |  |||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600312
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggacagttccccg 24600312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066200
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtccccc 39066200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184407
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaag--------- 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||             
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttcagcc 41184484  T
Q  335 -----gttttgggtaagagtgtg---gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
         ||||||||||||||||||    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41184483 ttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccc 41184407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 50051883 - 50051777
Alignment:
Q  171 gcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 269  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051883 gcaaagtaagagcttctgcttgaagggggagcatgatgaattaatggactcacacttgagggggaatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 50051784  T
Q  270 tcggata 276  Q
    |||||||    
T  50051783 tcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 254 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528762
Alignment:
Q  254 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtgg 353  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  354 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
     |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtgga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 235 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44043944 - 44043810
Alignment:
Q  235 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattac 328  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  44043944 gtgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgt 44043846  T
Q  329 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043845 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 403
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575261
Alignment:
Q  250 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagt 349  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  350 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtggaatgtccccc 5575261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 244 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131994
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 396  Q
    |  ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacg 24131994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 244 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077831
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactca-tagcctaaggtttggggt 22077888  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcc 22077831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 396
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  245 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 396  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 392
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839779
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttg 340  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | | |||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  341 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 413
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977113
Alignment:
Q  315 cataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctct 413  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcctct 11977113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283455
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtcccc 19283455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 47380012 - 47379891
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 272  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47380012 aagtaagaacttccgcttgaggggggagcacgatgaattgttggacttacatttgagggggagtgttg--atgcaagtgtgagttatatatcccacatcg 47379915  T
Q  273 gataaaatagtaaaggttgaacac 296  Q
    |||| || |||  |||||||||||    
T  47379914 gatagaaaagtggaggttgaacac 47379891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 11977141 - 11977224
Alignment:
Q  22 cccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcct 105  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977141 cccggtttgacgaagggtacgaccgaggccgtcggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcct 11977224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 48588833 - 48588739
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588833 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcgactgaggcagccggtca-ttgtgcagaaagctgcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 48588739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 244 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378051
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaaccca------------------t 21378118  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21378117 aagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccctgcgctcc 21378051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26661873 - 26661766
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgta 109  Q
    |||||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  26661873 tggtattagaacctcgattcgacgaagggtacgaccgaggccgccagtcaattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcaacaagtggctccttgtg 26661774  T
Q  110 cggcaacg 117  Q
    | ||||||    
T  26661773 cagcaacg 26661766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 244 - 392
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttggg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  343 taagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    ||| ||||||  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 50051999 - 50051902
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50051999 tggtatcagagccccggttcgacaaagggcgcgaccgaggcagccggtg-gttgggcagaaagccgcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 50051902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 314 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051688
Alignment:
Q  314 ccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgttgttctagcatcgatgtggacggtccccc 50051688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41184298 - 41184198
Alignment:
Q  129 agtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttga 228  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41184298 agtgtcggtccgtttgcggaaaaaccagcaacgacgatacaaacaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaagtgatggactcacacttga 41184199  T
Q  229 g 229  Q
    |    
T  41184198 g 41184198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 50469306 - 50469180
Alignment:
Q  175 agtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 274  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  50469306 agtaagagcttctgcttgaggaggagtatgatgaatagataaactgacact-gagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaga 50469209  T
Q  275 taaaatagtaaaggttgaacaccttataa 303  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469208 taataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 393
Target Start/End: Original strand, 24448212 - 24448426
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 277  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   |||||  | |     
T  24448212 aagagctttcgcttgagggaaagcacgatgaattgatgggctcacaattgagggggagtgtt-gtgtgcaagtgtaagttatatgttagacatctcaaag 24448310  T
Q  278 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt 377  Q
    || |||  | ||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||  |||||| |||||| ||| ||||||| || |||||  ||| || ||||||    
T  24448311 aaaagtggaagttgaacattttataagtgagagggctcataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtggcgtgtctctcacttatgaggttgt 24448410  T
Q  378 tctagcctcgatgtgg 393  Q
    ||  |||| |||||||    
T  24448411 tcaggcctagatgtgg 24448426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 48588461 - 48588364
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  48588461 tggtatcagagtcccggttcaacgaagggtgcaaccgaggcagccggtt-gttgcgcagaaagccgcaacgacgatacaaacaacaagtggctccttgt 48588364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44290798 - 44290720
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaa 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  44290798 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggtt-gttgcgcagaaagccgcaacggtggtacaa 44290720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188628
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctct 362  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctct 1188628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 286 - 362
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  286 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187404
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctct 362  Q
    || ||||||  ||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctct 1187404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 401
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  259 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 358  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | ||  ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  359 ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
     |||  |||||   |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 391
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956340
Alignment:
Q  271 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 368  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  369 tgcggttgttctagcctcgatgt 391  Q
    |||| ||| | || |||||||||    
T  4956318 tgcgattgctttaacctcgatgt 4956340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 90
Target Start/End: Original strand, 34364690 - 34364771
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttag-ttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  | ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  34364690 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgacccagacagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcgatacaag 34364771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 93
Target Start/End: Original strand, 34649622 - 34649705
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagtt-gcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcag 93  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34649622 tggtatcagagccccg-ttcgatgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcaacaacgacggtacaagcag 34649705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3537562 - 3537495
Alignment:
Q  164 gacacatgcaaagtaa-gagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgag 229  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3537562 gacacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgag 3537495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1188457 - 1188392
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1188457 aagtaagagcttccacttgaaggg-agcatgatgaattgatggactcacacttgaggatgagtgttg 1188392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 310
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 310  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22077466 - 22077392
Alignment:
Q  14 atcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtaca 88  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22077466 atcagagcccaggttcgacgaagggtacgaccaaggcagccggtccgttgcggagaaaccagcaacgacggtaca 22077392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  343 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 66444 - 66366
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagc 91  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  66444 tatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtataagc 66366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3537494 - 3537410
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagc-agcaacgacggtacaagcagcaagtg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    | | ||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3537494 tggtatcagagccacggttcgacgaagggtacgaccga----ggcagttagt--cgcagaaagcaagcaacggcggtacaagcagcaagtg 3537410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4266948 - 4266875
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 309  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266948 tgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  293 acaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttt 338  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 401
Target Start/End: Original strand, 9499020 - 9499136
Alignment:
Q  285 aaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcc 384  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||  ||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||    
T  9499020 aaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtggtgtcacttttacttgtgtggttgttttatcc 9499119  T
Q  385 tcgatgtggacggtccc 401  Q
    |  ||||||||||||||    
T  9499120 tatatgtggacggtccc 9499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  253 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 312  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  299 tataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 47380323 - 47380258
Alignment:
Q  198 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggg--gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatg 262  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| || |||||||||||||||||||    
T  47380323 gagcatgatgaattgatggattcacacttgaggggaagattgtt-gtgtgcaagtgtgagttatatg 47380258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 362
Target Start/End: Original strand, 12466367 - 12466401
Alignment:
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466367 ccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22077800 - 22077722
Alignment:
Q  14 atcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagca 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||  |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  22077800 atcagagcccaggttcgacgaagggtatgaccaaggcagccggtccgttgcggagaaaccagtaacgacgatacaagca 22077722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 47
Target Start/End: Original strand, 9956092 - 9956129
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccga 47  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9956092 tggtatcagagcctcggttcgacgaagggtacgaccga 9956129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Original strand, 34649699 - 34649767
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga 193  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  || ||| || |||||||||||| |||||||    
T  34649699 caagcagtttcggtccatttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagc-aagtaagagctttcgcttga 34649767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 93)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 171 - 403
Target Start/End: Original strand, 22304495 - 22304728
Alignment:
Q  171 gcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22304495 gcaaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagctatatgtcccaca 22304594  T
Q  270 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304595 tcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 22304694  T
Q  370 gcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22304695 gcggttgttctagtctcgatgtggacagtccccc 22304728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 134 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 37990908 - 37990632
Alignment:
Q  134 cggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggg 233  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37990908 cggttcgtttgcgcagaaaccagcaacggcgatacatgcaaagtaaaagcttccgcttgaggggg-gcatgatgaattgatggactcacagttgaggggg 37990810  T
Q  234 agtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctt 331  Q
    ||||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  37990809 agtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgcctt 37990710  T
Q  332 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctc 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37990709 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctc 37990632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 130 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 54018090 - 54017815
Alignment:
Q  130 gtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgag 229  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||| | || ||| ||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||    
T  54018090 gtgtcagtccgtttgcggagaaaccaacaacagtgatacaagcaagtaaagagcttccgcttgagggggaacatgatgaaaagatggactcacacttgag 54017991  T
Q  230 ggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatta 327  Q
    ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |       
T  54017990 ggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacg 54017891  T
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54017890 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccc 54017815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 128 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21832614 - 21832344
Alignment:
Q  128 cagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttg 227  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  || ||| |||| ||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21832614 cagtgtcggtccgtt-gcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gtatgagcttccatttgatggggagcatgatgaatagatggactcacacttg 21832517  T
Q  228 agggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatta 327  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  21832516 aggcggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatag 21832418  T
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21832417 ccttaaggttttgggtaaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtccccc 21832344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 198 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 42342296 - 42342092
Alignment:
Q  198 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||      
T  42342296 gagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatg 42342197  T
Q  296 ccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 395  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342196 ccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 42342097  T
Q  396 ggtcc 400  Q
    |||||    
T  42342096 ggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 246 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346793
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcc 43346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 246 - 403
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946681
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 35946681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 158 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41360008 - 41359764
Alignment:
Q  158 aacggagacacatgcaaagtaa-gagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtg 253  Q
    ||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  41360008 aacggcgatacaggcaaagtaaagagcttccacttgaagggagagcatgatgaatagatg-actcacacttaagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtg 41359910  T
Q  254 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtgg 353  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41359909 agttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtgg 41359814  T
Q  354 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41359813 cgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 41359764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 167 - 385
Target Start/End: Original strand, 4823578 - 4823796
Alignment:
Q  167 acatgcaaagtaaga-gcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 265  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4823578 acatgcaaagtaaaaagcttccgctctagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgaaggggagtgttggtttgcaagtgtgagttataagtct 4823676  T
Q  266 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 365  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4823677 cacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtcttttttgc 4823776  T
Q  366 ttgtgcggttgttctagcct 385  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  4823777 ttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644901
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtccccc 29644901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 112 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3135364 - 3135099
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagag-cttccgcttgagggggagcacgatgaat 210  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||  |||   ||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3135364 gcaacggcggtacaaacagtgtcggtctgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaaacaagtaaagtggcttccgctagagggggagcacgatgaat 3135265  T
Q  211 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtt-tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 309  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3135264 tgatg-actcacacttgatggtgagtgtttgttgtgtacaagtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaa 3135166  T
Q  310 ggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 376  Q
    | ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135165 gaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 194 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29644792 - 29644580
Alignment:
Q  194 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggga---gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 290  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29644792 gggggagcacgataaagtgatgaagtcacacttgaggggggaatgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggtt 29644693  T
Q  291 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatg 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  29644692 gaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatg 29644593  T
Q  391 tggacggtccccc 403  Q
    |||| ||||||||    
T  29644592 tggatggtccccc 29644580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 181 - 396
Target Start/End: Original strand, 15773127 - 15773346
Alignment:
Q  181 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 278  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15773127 agcttccgctcttgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaa 15773226  T
Q  279 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct--cttgcttgtgcggttg 376  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  15773227 agagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttg 15773326  T
Q  377 ttctagcctcgatgtggacg 396  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  15773327 ttctaacctcgatgtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 32462790 - 32462558
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacat 270  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32462790 aagtaagagctttcgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacat 32462691  T
Q  271 cggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 369  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32462690 cgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgctttaaggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgt 32462591  T
Q  370 gcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    | | ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  32462590 gggattgttttagcctcgatgtagacggccccc 32462558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114561
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtccccc 12114561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 246 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990978
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 37990978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342387
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 42342387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 244 - 410
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589869
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtccccctcgctcc 32589869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 244 - 400
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773010
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtcc 15773010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803251
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 33803251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 235 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 39935124 - 39934963
Alignment:
Q  235 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctta 332  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39935124 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgcctta 39935025  T
Q  333 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39935024 aagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 393
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| |||||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 246 - 410
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634841
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccccgagctcc 52634841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739424
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtccccc 25739424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018197
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 54018197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 174 - 395
Target Start/End: Original strand, 9240079 - 9240300
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9240079 aagtaagagtttccgcttgaggggagagcataacgaatggatggactcacacttgaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcg 9240177  T
Q  273 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 372  Q
    |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||   | |||||    
T  9240178 gatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagatttcggataagaatgtggtgtctctctcaatagtgcg 9240277  T
Q  373 gttgttctagcctcgatgtggac 395  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  9240278 gttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 246 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462903
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22304143 - 22303954
Alignment:
Q  209 attgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||    
T  22304143 attgatggactcacacttgagggagaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagta 22304051  T
Q  307 agaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22304050 agcggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggattgtccccc 22303954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612446
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattacct 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||| ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  331 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtccccc 50612446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 412
Target Start/End: Original strand, 11661858 - 11662119
Alignment:
Q  154 cagcaacggagacacatgcaaagtaaga-gcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagt 250  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||  || || ||||    
T  11661858 cagcaacggcgatacatgcaaagtaaaaagcttccgctctaggaggagcacgataaagtgatggactcacacttttgggggagtgttgttgtatgtaagt 11661957  T
Q  251 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg-ttttgggtaagagt 349  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11661958 gtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggtttttgggtaagagt 11662057  T
Q  350 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctc 412  Q
    | |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  11662058 gaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtcccacgagctcctc 11662119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 246 - 404
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755554
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccg 25755554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 246 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135453
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattaccttaaggttt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  339 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 3135453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190167
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccc 31190167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 413
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577533
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccccgaactcctct 53577533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 244 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 206 - 299
Target Start/End: Original strand, 22304208 - 22304301
Alignment:
Q  206 tgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304208 tgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 244 - 391
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914399
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 391  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgt 39914399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 246 - 402
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901872
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccc 45901872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634314
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttggg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  343 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 1634314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 244 - 411
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328075
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctct----tgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcct 411  Q
    |||||||||||||||||||     |   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgtggacgctcccctgagctcct 8328075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117974
Alignment:
Q  245 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtccccc 53117974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22303929 - 22303820
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22303929 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgacagaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggcttcttgtg 22303830  T
Q  110 cggcaacggc 119  Q
    | ||||||||    
T  22303829 cagcaacggc 22303820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 246 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  346 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160546
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 44160546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 404
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726656
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | ||||| |||| |||    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttagg 37726587  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726588 ttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 37726656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 302 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303662
Alignment:
Q  302 aagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtc 22303662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 236 - 398
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886709
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |      |    
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------g 51886646  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||| | ||||||||  ||||||||| |||||    
T  51886647 ttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggt 51886709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 246 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175646
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattaccttaaggttttggg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||  |||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  343 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctca 415  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccctca 33175646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 254 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584829
Alignment:
Q  254 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtgg 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  354 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg 397  Q
    |||  ||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacgg 42584829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 318 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359490
Alignment:
Q  318 aaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 41359490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 47964694 - 47964544
Alignment:
Q  225 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 324  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  47964694 ttgagggcgagtgttg-tgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaaccta 47964596  T
Q  325 ttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  47964595 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 270 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  270 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 368  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 233 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3384435 - 3384317
Alignment:
Q  233 gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctta 332  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||||    
T  3384435 gagtgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgcctta 3384336  T
Q  333 aggttttgggtaagagtgt 351  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3384335 aagttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336231
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| | |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtccccc 39336231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 8328259 - 8328368
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcac 222  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8328259 caagcagtgtcgatcagtttgcggagaaaccaacaacggtgatacaagcaa-gtaagagcttccgcttgaagggggagatcgatgcattgatggactcac 8328357  T
Q  223 acttgaggggg 233  Q
    |||||||||||    
T  8328358 acttgaggggg 8328368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggt 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 311
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661602
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg 11661602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 314 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017547
Alignment:
Q  314 ccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtccccc 54017547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 53577548 - 53577616
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaa 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53577548 tggtatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 53577616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964914
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  | ||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttccccc 47964914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 353 - 403
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304352
Alignment:
Q  353 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 22304352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  347 agtgtg 352  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 22304378 - 22304476
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagc-agcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||||||  | ||||||| || ||||||||||||||    
T  22304378 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccgg-tcgttgcgcagaaagcaagcaacagctgtacaagtagtaagtggctccttgt 22304476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Original strand, 8328154 - 8328222
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  8328154 caagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacggcgatacaagc-aagtaagagcttccgcttga 8328222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 401
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328427
Alignment:
Q  348 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtccc 8328427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336002
Alignment:
Q  286 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 370  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtg 39336002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 354
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  294 caccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggt 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 41360111 - 41360014
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagc--agcaagtggctccttg 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||  |  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41360111 tggtatcagagcgccggttcgacgaagagtacgaccggca--gccggtc-gttgtgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagagcaagtggctccttg 41360015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 391
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  286 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 385  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  386 cgatgt 391  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 362
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | | |||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  346 gagtgtggtgtctctct 362  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 15773037 - 15773119
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagca 92  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||  || ||||||||    
T  15773037 tggtatcagagccctgattcgacgaagggtacgatcgaggccgccggtcagttatgcagaaagcagcaacagcgatacaagca 15773119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  299 tataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 356  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  299 tataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 356  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 376
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 376  Q
    ||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43978943 - 43978857
Alignment:
Q  328 ccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43978943 ccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccccgagctcc 43978857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12747977 - 12747878
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggg-agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 275  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747977 aagagctttcgtttgaggggtgagcatgatgaatttacggactcacgcttgagaggatattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 12747879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 362
Target Start/End: Original strand, 11661604 - 11661638
Alignment:
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661604 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 240
Target Start/End: Original strand, 52634889 - 52634931
Alignment:
Q  198 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  52634889 gagcacgatgaattgattgactcacacttgagggagagtgttg 52634931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 64
Target Start/End: Original strand, 53577667 - 53577721
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgc 64  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  53577667 tggtatcagagtcccggttcgaagaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgc 53577721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 268
Target Start/End: Original strand, 2299930 - 2300000
Alignment:
Q  199 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 268  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2299930 agcatgataaattgatggactcacacttgagggggatattgttg-tgtgcaagtgtgggttatatgtcccac 2300000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 108
Target Start/End: Original strand, 4823507 - 4823563
Alignment:
Q  53 ccggttagttgcgcagaaagca-gcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  4823507 ccggtcagttgcgcagaaagcaagcaacggtggtacaagcaacaagtggctccttgt 4823563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7766855 - 7766782
Alignment:
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7766855 ccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtccccc 7766782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 33803227 - 33803143
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagtt-gcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcag 93  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| | ||| ||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33803227 tggtatcagagcctcgattcgacgaagggtacgactgaggcagccagtccgtttgcgcataaagcagcaacgacagtacaagcag 33803143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 54018169 - 54018093
Alignment:
Q  14 atcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttag-ttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaa 89  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  54018169 atcagagctccggttcaacgaagggtgcgatcgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcaatggcggtacaa 54018093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 48127681 - 48127642
Alignment:
Q  323 cattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  48127681 cattaccttaagattttgggtaagtgtgtggtgtctctct 48127642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 358  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 29644860 - 29644811
Alignment:
Q  24 cggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagc 73  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  29644860 cggttcgacgaagggtacgaccgaggccgccgttcaattgcgcagaaagc 29644811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  249 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  249 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 112 - 393
Target Start/End: Original strand, 5643 - 5931
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5643 gcaacggcggtgcaagcagtgtcggtccgtttgcagagaaaccagtaacggcgacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcaagatgaatt 5742  T
Q  212 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5743 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 5842  T
Q  310 ggacccataaacccattaccttaag-----gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    ||||||||||||||||| |||||||      ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||||||    
T  5843 ggacccataaacccattgccttaagattaaattttgagtaagagtgtggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 244 - 393
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5546
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctt-aaggttttggg 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  343 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 171 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 5542857 - 5542617
Alignment:
Q  171 gcaaagtaagagcttccgcttgaggggga-gcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 269  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5542857 gcaaagttagagcttccgcttgaaggggaagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccata 5542758  T
Q  270 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542757 tcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 5542658  T
Q  370 gcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5542657 gcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccccgagctcc 5542617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 212 - 400
Target Start/End: Original strand, 37106156 - 37106344
Alignment:
Q  212 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106156 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 37106255  T
Q  312 acccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106256 acccataaacccatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 235 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178597
Alignment:
Q  235 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaag 334  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 36178673  T
Q  335 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36178672 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccccgcgctcc 36178597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 178 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 40679852 - 40679632
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  40679852 aagagcttccgcttgagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatag 40679754  T
Q  278 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt 377  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  40679753 aaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgt 40679654  T
Q  378 tctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  40679653 tctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745659
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 14745734  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14745733 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcc 14745659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 240 - 410
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106090
Alignment:
Q  240 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggtttt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  340 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 37106090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 172 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14745524 - 14745300
Alignment:
Q  172 caaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 270  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14745524 caaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatgtactcaaacttgagggg-agtgttggtttgcaactgtgagttatatgtcccacat 14745426  T
Q  271 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt- 369  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||     
T  14745425 cgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtaagtg 14745326  T
Q  370 gcggttgttctagcctcgatgtggac 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  14745325 gtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 216 - 410
Target Start/End: Original strand, 15880233 - 15880429
Alignment:
Q  216 gactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880233 gactcacacttaaggggaagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 15880332  T
Q  314 ccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  15880333 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacgttcctccgagctcc 15880429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 234 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5543166 - 5543002
Alignment:
Q  234 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  5543166 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaa 5543067  T
Q  334 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5543066 gattttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggt 5543002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 246 - 410
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421551
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccccgagctcc 6421551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283474
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 41283542  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41283541 ttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtccccc 41283474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 403
Target Start/End: Original strand, 6421996 - 6422269
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcac 222  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | ||| || |   || | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6421996 caagtagtgtcggttcgtttgcggagaaaccagcaacgacaatacaagctagtaaaaaacttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcac 6422095  T
Q  223 acttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 322  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||      ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6422096 acttgagggggagtcttg-tgtgcaaatgtga------tgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagaggacccataaacc 6422188  T
Q  323 cattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6422189 catagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtccccc 6422269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 397
Target Start/End: Original strand, 7598488 - 7598754
Alignment:
Q  124 caagcagtgtc-ggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcac 222  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||  || ||| ||||   |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  7598488 caagcagtgtcaggtctgtttacggagaaaccaacaacgacgatacaagcaagtaaagagcttccgcttgaaggggggcatgatgaatagatggactcac 7598587  T
Q  223 acttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 322  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  7598588 acttgagagggagtgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata---- 7598683  T
Q  323 cattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg 397  Q
        ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  7598684 ----accttaacgtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacgg 7598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28531583 - 28531316
Alignment:
Q  130 gtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgag 229  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||  || ||| |||| |||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28531583 gtgtcagtccgtttatggagaaagcaacaacgacgatacaagcaa-gtaatagcttccacttgaaggg-agcatgatgaactgatggactcacacttgag 28531486  T
Q  230 ggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacc 329  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  28531485 ggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgcc 28531387  T
Q  330 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28531386 ttaagattttgggtaagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 116 - 403
Target Start/End: Original strand, 3672954 - 3673227
Alignment:
Q  116 cggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttg-agggggagcacgatgaattgat 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  3672954 cggcggtgcaagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacaatacatgcaaagtaaaagcttccgcttgaagagggagcatgatgaattgat 3673053  T
Q  215 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||                 |||||||||||||||    
T  3673054 ggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaat-----------------ttataagtaagagga 3673136  T
Q  313 cccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
     |||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3673137 tccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 3673227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 244 - 404
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962758
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctcccg 962758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 177 - 403
Target Start/End: Original strand, 40733813 - 40734041
Alignment:
Q  177 taagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgg 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  40733813 taagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcga 40733912  T
Q  274 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 373  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| |||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  40733913 ataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcat-aacctacagccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtgg 40734011  T
Q  374 ttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40734012 ttgttcaagtctcgatgtggacggtccccc 40734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 244 - 410
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514815
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 42514815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 201 - 403
Target Start/End: Original strand, 40733472 - 40733676
Alignment:
Q  201 cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  40733472 cacgatgaattgatagactcacacttgaggggaagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacacct 40733571  T
Q  299 tataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||    
T  40733572 tataagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggt 40733671  T
Q  399 ccccc 403  Q
    |||||    
T  40733672 ccccc 40733676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 262 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178163
Alignment:
Q  262 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  362 ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccccgcgctcc 36178163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 36785854 - 36785664
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt 211  Q
    |||||||| || |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||  || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36785854 gcaacggcggtacaagcagtatcgatccgtttgcagagaaaccagcaacgacgataca-accaagtaagagcttccgcttgagggggagcatgatgaatt 36785756  T
Q  212 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785755 gatggactcacactttagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580723
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 35580723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 211 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36178460 - 36178320
Alignment:
Q  211 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  36178460 tgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggg 36178361  T
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgt 351  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36178360 gactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 246 - 404
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713137
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg-ttttgggta 344  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 6713137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 251 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511495
Alignment:
Q  251 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtg 350  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  351 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 246 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005887
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 395  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 194 - 401
Target Start/End: Original strand, 29676851 - 29677065
Alignment:
Q  194 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 291  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29676851 gggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggtgtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttt 29676950  T
Q  292 aacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctc 386  Q
    ||||||||||| || ||||||     |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||    
T  29676951 aacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctttaagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctc 29677050  T
Q  387 gatgtggacggtccc 401  Q
    |||||||| ||||||    
T  29677051 gatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 249 - 400
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731804
Alignment:
Q  249 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagag 348  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  349 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcc 33731804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 244 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796619
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  344 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    |||||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccc 38796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 38796487 - 38796298
Alignment:
Q  136 gtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgaggggg 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  38796487 gtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gtaagatcttccgcttgaagggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgaggggg 38796389  T
Q  234 agtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 322  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38796388 agtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 244 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632602
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg 397  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg 37632602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 236 - 392
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770040
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | || | |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaag 1769983  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1769984 ctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtg 1770040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 257 - 425
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346417
Alignment:
Q  257 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 356  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  357 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataaccaaaca 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctcatgacccaaca 23346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 248 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  248 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaaga 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  348 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagc 383  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 246 - 388
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 388  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 409
Target Start/End: Original strand, 30313110 - 30313342
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 274  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  30313110 aagagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgttggactcacacttgaggggaagattgttg-tgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcgga 30313208  T
Q  275 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggt 374  Q
    || || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||    
T  30313209 tagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggt 30313307  T
Q  375 tgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctc 409  Q
    || ||| |||| ||| | |||| ||||||| ||||    
T  30313308 tgctctggcctggattttgacgatcccccgggctc 30313342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598386
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 7598386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 255 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163383
Alignment:
Q  255 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttaccttaaggttttgggtaagagtgtgg 353  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |  | |||||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  354 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgt 40163383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 306
Target Start/End: Original strand, 42514899 - 42515078
Alignment:
Q  128 cagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttg 227  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  42514899 cagtgtcggtccgtt-gcggagaaaccagcaacagcgatacaagcaa-gtaagagcttccgcttgagagggagcatgatgaatagatggactcacatttg 42514996  T
Q  228 agggggagtgttggtttgcaagtgtgagtta----tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 306  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42514997 agggggagtgtt-gtgtgcaggtgtgagttatatgtatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 178 - 361
Target Start/End: Original strand, 30323396 - 30323581
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 274  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  30323396 aagagcatccgcttgagggatgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcaga 30323494  T
Q  275 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 361  Q
    || || | |  ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323495 tagaaaattggaggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 224 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 31468926 - 31468800
Alignment:
Q  224 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 321  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||||    
T  31468926 cttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaac 31468831  T
Q  322 ccattaccttaaggttttgggtaagagtgtg 352  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31468830 tcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 306 - 416
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421903
Alignment:
Q  306 aagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgc 405  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccga 6421892  T
Q  406 gctcctctcat 416  Q
    ||||| |||||    
T  6421893 gctcccctcat 6421903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 178 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33561675 - 33561491
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 276  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33561675 aagaacttccccttgaggggggagtgcgatgaattgatggacacgcacttgatggggaatgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagata 33561577  T
Q  277 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
     || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33561576 gaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 244 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  344 aagagtgt 351  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 252 - 402
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  252 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgt 351  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||      ||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  352 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  344 aagagtgtggtgtctct 360  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 33953994 - 33953821
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 277  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||   |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||     
T  33953994 aagagcttcctcttgagggggagcacgatgaattaacatactcaattttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatag 33953896  T
Q  278 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtg 352  Q
    || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||    
T  33953895 aaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaattttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 244 - 415
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591054
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttggg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  343 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctca 415  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctca 16591054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874022
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||| |||| ||   |||||||||||| | | |||| ||||||| |||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtccccc 29874022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctta 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41678593 - 41678419
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagt--tatatgtcccacatcgga 274  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||| ||    
T  41678593 aagagcttccgcttgaggagagagcattatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgtt-gtgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcaga 41678495  T
Q  275 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgt 351  Q
    || || ||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||    
T  41678494 tagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaa-cctttgccttaaggttttgagtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 204 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37894889 - 37894732
Alignment:
Q  204 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 303  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || |||||||||    
T  37894889 gatgaatagatggactcatacttaagggggagtattg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataa 37894791  T
Q  304 gtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37894790 gtaagaagactcataaatccattgccttaagattttggttaaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Original strand, 29676711 - 29676819
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgta 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  29676711 tggtatcagagccccggttcaacgaagggtatgactgaggccgccgatcagttgcgcagaaagcaacaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgtg 29676810  T
Q  110 cggcaacgg 118  Q
    | |||||||    
T  29676811 cagcaacgg 29676819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29873732 - 29873514
Alignment:
Q  208 aattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||    
T  29873732 aattgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagt 29873634  T
Q  306 aagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgc 405  Q
      |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| ||| | || ||||| | |||||| ||      
T  29873633 gggaggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttgctctggtctggatgtaggcggtcctcctg 29873534  T
Q  406 gctcctctcataaccaaaca 425  Q
    ||||| ||| ||||| ||||    
T  29873533 gctcccctcgtaacccaaca 29873514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  252 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  352 ggtgt 356  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672860
Alignment:
Q  316 ataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccc 3672860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 306 - 403
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421785
Alignment:
Q  306 aagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggtacccc 6421785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 402
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231407
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||   |||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    ||||| || |||||||  ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 36178581 - 36178508
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacg 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  36178581 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccaaggccaccggtcagttgcgcagaaagcagcaatgacg 36178508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 297 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  297 cttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgat 389  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14745641 - 14745544
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||| |  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  14745641 tggtatcagagccccggttcgatgaagggtgcgaccaaggcagccgatc-gttacgcagaaagccgcaacgacagtacaagcaacaagtggctccttgt 14745544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Original strand, 7598409 - 7598494
Alignment:
Q  8 actggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcag 93  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7598409 actggtatcaaagcccaggttcgacgaagggtacgactgaggtagccggtccgttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcag 7598494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  260 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagt 349  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | || |||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 360
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385853
Alignment:
Q  245 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  345 agagtgtggtgtctct 360  Q
      ||||||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctct 31385853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899102
Alignment:
Q  334 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcccc 31899102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 266
Target Start/End: Original strand, 40734231 - 40734300
Alignment:
Q  199 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt--tggtttgcaagtgtgagttatatgtccc 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||    
T  40734231 agcacgatgaattgatggaatcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 40734300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 351
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  347 agtgt 351  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 57
Target Start/End: Original strand, 37106107 - 37106154
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggt 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37106107 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgactgaggccgccggt 37106154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 40734067 - 40734149
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagtt-gcgcagaaagcagcaacgacggtacaagca 92  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40734067 tggtatcagagccccg-ttcgtcaaagggtacgaccgaggcagccggttcgtttgcgcagaaagcagcaacaacggtacaagca 40734149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 292
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 23346489 - 23346594
Alignment:
Q  117 ggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatgg 216  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||      |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||     
T  23346489 ggcagtacaagcagtgtcggtctgtttgcggagaaaccagcaacggcgatacat-----ataagagcttctgcttgaaggggggcatgatgaatagatga 23346583  T
Q  217 actcacacttg 227  Q
    ||||| |||||    
T  23346584 actcatacttg 23346594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580438
Alignment:
Q  308 gaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | || | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggttcccc 35580438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||| | ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    |||||| | |||||| | || ||| | || ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 410
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312956
Alignment:
Q  286 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct-tgcttgtgcggttgttctagcc 384  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    ||||||||||| ||| |||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctctcaatttgtgcggttgctctggcc 30312930  T
Q  385 tcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |  ||||||  ||||||||| |||||    
T  30312931 tgaatgtgggtggtcccccgagctcc 30312956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 5542973 - 5542876
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |  ||| |||||| | | ||||  |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5542973 tggtatcagagcttcggttcgacgacgaatgcaaccgaggcagtcggtc-gttgtgcagaaagccgcaacggcggtacaagcaacaagtggctccttgt 5542876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 240
Target Start/End: Original strand, 34481588 - 34481642
Alignment:
Q  187 cgcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 240  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34481588 cgcttgaggcgggagcgtgatgaattgatggactcacacttgagggagagtgttg 34481642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35580616 - 35580532
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttgaggg-ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgag 255  Q
    |||||| ||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||    
T  35580616 aagtaaaagcttccccttgaaggaggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggagagtgctgttgtgtgcaagtgtgag 35580532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  298 ttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 357  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    ||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33954103 - 33954064
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatgga 217  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33954103 aagagcttccgtttcagggggagcacgatgaattgatgga 33954064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 35580699 - 35580661
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgag 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35580699 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgag 35580661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 343
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  286 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || | ||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 80)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 112 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 13416051 - 13415774
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaat 210  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| | || ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  13416051 gcaacggcggtgcaagcagtctcggtccgtttgcggagaaaccatcaacagcgatacaagcaa-gtaagagcttccgcttgaagggggagcatgctgaat 13415953  T
Q  211 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 308  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415952 agatggactcacacttgagggg-agtgctgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaag 13415854  T
Q  309 aggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 388  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415853 aggacccataaacctattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 13415774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 171 - 403
Target Start/End: Original strand, 6500749 - 6500981
Alignment:
Q  171 gcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6500749 gcaaagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgatggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-aca 6500847  T
Q  270 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6500848 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttacttgt 6500947  T
Q  370 gcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6500948 gcggttattctagcctcgatgtggacggtccccc 6500981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 132 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3295287 - 3295001
Alignment:
Q  132 gtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggg 231  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  3295287 gtcggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcgatacaagcaa-gtaagagcttccgcttaagggggagcacgaaaaagtgatggactcacacttgaggg 3295189  T
Q  232 ggagtgttg----gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatta 327  Q
    |||||||||    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  3295188 ggagtgttgttgtgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattg 3295090  T
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcat 416  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  3295089 ccttgaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctcat 3295001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 124 - 410
Target Start/End: Original strand, 624077 - 624362
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcaca 223  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||     ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  624077 caagtagtgtcggtccgtttgcggagaacccagcaacggcgatacaaagcgagtaagagcttccgcttaaaggggagcatgatgaatagatgga-tcaca 624175  T
Q  224 cttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 323  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  624176 cttgaggggaagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaaccc 624275  T
Q  324 attaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  624276 atagccttgaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggttccccgagctcc 624362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500609
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaagg 6500541  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500542 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 6500609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296314
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 40296314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 241 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  241 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  341 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 112 - 393
Target Start/End: Original strand, 26074477 - 26074761
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaat 210  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||| ||| ||  | |||    |||||||||||||| ||||| || | |||| ||| |||    
T  26074477 gcaacggcggtgcaagcaatgtcggtctgtttgcgaagaacccaacaatggcaatacaaagcaagtaagagcttccacttgaaggagtagcatgatcaat 26074576  T
Q  211 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074577 tgatggactcacacttgagggggagtgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaag 26074676  T
Q  309 aggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  26074677 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502013
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataaccaaaca 425  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcatgacccaaca 27502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487552
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 32487484  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32487485 ttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtccccc 32487552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 244 - 410
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370265
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 15370265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603124
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170793
Alignment:
Q  237 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggt 336  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  337 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtccccc 41170793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295331
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcat 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctcactcccctcat 3295331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 181 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24489424 - 24489207
Alignment:
Q  181 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 280  Q
    |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  24489424 agcttctggttgaggggtagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaa 24489326  T
Q  281 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 380  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  24489325 agaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttct 24489228  T
Q  381 agcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  24489227 agtctcgatgtgggcggtccc 24489207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 246 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405590
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 42405590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 247 - 415
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328106
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctca 415  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctca 25328106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632941
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccc 41632941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 246 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028516
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 1028516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 217 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26074330 - 26074155
Alignment:
Q  217 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26074330 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggaccca 26074232  T
Q  317 taaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  26074231 tgaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 404
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299649
Alignment:
Q  245 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccccg 299649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 251 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416970
Alignment:
Q  251 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtg 350  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  351 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctc 409  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtccccctcgctc 11416970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 235 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9498821 - 9498654
Alignment:
Q  235 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaag 334  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9498821 gtgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 9498722  T
Q  335 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9498721 attttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgctggtctagcctcaatgtggacggtccccc 9498654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 254 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  254 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtgg 353  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  354 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 246 - 403
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224355
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtccccc 6224355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 193 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26074993 - 26074818
Alignment:
Q  193 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 290  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26074993 agggggagcttgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtt 26074894  T
Q  291 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgc 365  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26074893 gaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgtggcgtctctcttgc 26074818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662651
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtccccc 12662651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 412
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623986
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  ||  ||||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaagg 623909  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctc 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  623910 ttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccccgagctcctc 623986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 244 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568556
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctca 415  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctca 36568556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 246 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075168
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt-a 344  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 395  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 256 - 398
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  256 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  356 tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150164
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccc 35150164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 394
Target Start/End: Original strand, 38427461 - 38427697
Alignment:
Q  148 agaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgag-ggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgc 246  Q
    ||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||| |||||  |||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||          
T  38427461 agaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gtaagagcttcctcttgaaaggggtgcatcatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttg------ 38427553  T
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
       ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||    
T  38427554 ---tgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaag 38427649  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 394  Q
    ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38427650 agtgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 270 - 400
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370558
Alignment:
Q  270 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 369  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  370 gcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 15370558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 241 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  241 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  341 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttc 379  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36522120 - 36521946
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36522120 aagagcttccgcttgaggtgggataacgatgaattgatggactcacacttgagggagagtgttg-tgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagata 36522022  T
Q  277 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtg 352  Q
     || |||  |||||||||||  | ||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36522021 gaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 36521946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36522459 - 36522266
Alignment:
Q  181 agcttccgcttgagggg--gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 278  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  36522459 agcttccgcttgaggggaggaacacgatgaattgatggatttacaattgagggggagtgttg-tatgaaagtgtgagttatatgtctcacattggataga 36522361  T
Q  279 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 373  Q
    | | |  | ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36522360 aaaatggaagttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgcgg 36522266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||  |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 382  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 362
Target Start/End: Original strand, 31509555 - 31509742
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 274  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31509555 aagagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggagagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgga 31509653  T
Q  275 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    || || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  31509654 tagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590909
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttcccc 26590909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 400
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301107
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||| ||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcc 301107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167837
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| |||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||| ||||||||   || ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtccccc 35167837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411166
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||| || ||||| || ||||   | |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtccccc 2411166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 319
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900016
Alignment:
Q  330 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtccccc 26900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915008
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||| || |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    | |||||| |||||||||||| |  | ||| || | |||| ||||||||||||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtccccc 35915008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 324
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 339
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggtttt 339  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 331 - 410
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427385
Alignment:
Q  331 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccccgagctcc 38427385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13785837 - 13785732
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttgagggggag-cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 272  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13785837 aagtaagagcttccgcttgaaggggaaacatgatgaatagatagactcacatttgagggggagtgttg-tgtggaagtgtgagttatatgtcccaaatcg 13785739  T
Q  273 gataaaa 279  Q
    |||||||    
T  13785738 gataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9498629 - 9498534
Alignment:
Q  11 ggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9498629 ggtatcagagccccg-ttcgacaaagggtacgaccgaggcagccggtc-gttgcgcagaaagctgcaacggcgctacaagcagcaagtggctccttgt 9498534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 328 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Original strand, 6500634 - 6500729
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcctt 106  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6500634 tggtatcagagttccggttcgacgaagggtgcaaccgaggcagccagtc-gttgcgcagaaagccgcaacggcggtataagcagcaagtggctcctt 6500729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 376
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509864
Alignment:
Q  258 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 356  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  357 ctctcttgcttgtgcggttg 376  Q
    |||||| |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgtacggttg 31509864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 325
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9498493 - 9498411
Alignment:
Q  158 aacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtt 239  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9498493 aacggtgatacaggcaaagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggtgtgtt 9498411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635224
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgt 369  Q
    ||||| || ||||| || |||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgt 41635224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785632
Alignment:
Q  302 aagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    |||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  402 c 402  Q
    |    
T  13785632 c 13785632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 32487575 - 32487661
Alignment:
Q  9 ctggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaa 96  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| | | |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32487575 ctggtatcagagccccgattcgacgaagggtgcgactgaggcagcc-gatcgttgtgcagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaa 32487661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13786041
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||  |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  345 agagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||| |||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctct 13786041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 35150607 - 35150719
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagt--aagagcttccgc-ttgagggggagcacgatgaattgatggactc 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||    ||||  || ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35150607 caagcagtgtcggtccgtttgcggagaacccagcaacggtgatacaaagcaagtaaaaaagcttccgctttgggggtgagcatgatgaattgatggactc 35150706  T
Q  221 acacttgaggggg 233  Q
    ||||||| |||||    
T  35150707 acacttggggggg 35150719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 38427403 - 38427486
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggt-tagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagca 92  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38427403 tggtattagagccccggttcgacgaagggtgtgaccaagacagccagtctgtttgcgcagaaaccagcaacgacgatacaagca 38427486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 304
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 304  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 339
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggtttt 339  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||  || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Original strand, 5660290 - 5660338
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660290 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 398
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 362
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  302 aagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  315 cataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 382  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 358
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 358  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 286
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 286
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 400
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435583
Alignment:
Q  302 aagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 42435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 369
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  281 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 369  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 26074403 - 26074494
Alignment:
Q  1 cccaacaactggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggt-tagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagca 92  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||  || |  |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26074403 cccaacaa-tggcatcagagccccggtttgacaaagggtacgaccgagacagctagtctgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtgcaagca 26074494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26075133 - 26075058
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagtt-gcgcagaaagcagcaacgacggt 85  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26075133 tggtatcagagcctcg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtctgtttgcgcagaaagcagcaacggcggt 26075058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 256
Target Start/End: Original strand, 15370380 - 15370426
Alignment:
Q  212 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  15370380 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagt 15370426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 362
Target Start/End: Original strand, 13042788 - 13042822
Alignment:
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042788 ccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 362
Target Start/End: Original strand, 13112786 - 13112820
Alignment:
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112786 ccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 293  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 110)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 115 - 401
Target Start/End: Original strand, 39404273 - 39404555
Alignment:
Q  115 acggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39404273 acggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccatcaacggcgataca-----agtaagagcttccgcttgagggagagcacgatgaattgat 39404367  T
Q  215 ggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 312  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39404368 ggact-acacttgaggaggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagagga 39404466  T
Q  313 cccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39404467 cccataaacctatagccttaaggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 124 - 392
Target Start/End: Original strand, 54108796 - 54109060
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcac 222  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  54108796 caagtagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggcgatacaagcaa-gtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattaatagactcac 54108894  T
Q  223 acttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 322  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108895 acttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtcagttat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 54108991  T
Q  323 cattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54108992 cattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 416
Target Start/End: Original strand, 44620592 - 44620831
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 275  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620592 aagagcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggtggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 44620691  T
Q  276 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggtt 375  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44620692 gaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaa-ccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggtt 44620790  T
Q  376 gttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcat 416  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  44620791 gttatatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcat 44620831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 179 - 401
Target Start/End: Original strand, 36629172 - 36629394
Alignment:
Q  179 agagcttccgcttgaggg-ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 277  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36629172 agagcttccgcttgaaggtggagcatgatgaattgatgggctcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcggatag 36629270  T
Q  278 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt 377  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36629271 aaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt 36629370  T
Q  378 tctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36629371 tctagcctcgatgtggacggtccc 36629394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 112 - 397
Target Start/End: Original strand, 20826086 - 20826370
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaat 210  Q
    |||||||| || |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20826086 gcaacggcggtacaagcagtgttgatccgtttgcggagaaaccagcaacggcgatacaagcaa-gtaatagcgtccgcttgaagggggagcatgatgaat 20826184  T
Q  211 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20826185 agatggactcacacttgagggggagtgttatgtagaaa-tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagag 20826283  T
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg 397  Q
     ||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20826284 aacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 50630921 - 50630755
Alignment:
Q  234 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50630921 agtgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 50630822  T
Q  334 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50630821 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtcc 50630755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933121
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 55933121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 130 - 353
Target Start/End: Original strand, 2740956 - 2741180
Alignment:
Q  130 gtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggag--cacgatgaattgatggactcacacttg 227  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  2740956 gtgtcggtccgtttgcagagaaaccagcaacggcgatacgagcaaagtaagagcttccgcttgaaggggagagcatgatgaattgatggactcacacttg 2741055  T
Q  228 agggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatta 327  Q
    | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  2741056 aaggggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattg 2741154  T
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtgg 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2741155 ccttaaggttttgggtaagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 236 - 404
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370517
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 41370517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 244 - 399
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483491
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 25483491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 177 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18932983 - 18932745
Alignment:
Q  177 taagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg-- 273  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  18932983 taagagtttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatagactcacacttgaggggg-gtgttggtttgcaagtctgagttatatgtcccacatcggtc 18932885  T
Q  274 ---------ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 364  Q
             |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18932884 ctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctctta 18932785  T
Q  365 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18932784 cttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccccg 18932745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 130 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 49076722 - 49076441
Alignment:
Q  130 gtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttg-agggggagcacgatg--aattgatggactcacactt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||  || ||||||||||||||||    
T  49076722 gtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacgacaatacaagc-aagtaagagtttccgcttgaagggggaacatgatgaaaagtgatggactcacactt 49076624  T
Q  227 gagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 324  Q
    |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49076623 gaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaaccca 49076524  T
Q  325 ttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||  ||||| | ||||||||  || | ||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49076523 ttgtcttaaag-tttgggta--agggcggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 49076441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 241 - 404
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002586
Alignment:
Q  241 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  341 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccg 50002586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 244 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017596
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 54017596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 244 - 392
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggtttt-ggg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  343 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 244 - 399
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340962
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtc 3340962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 244 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246078
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctccccc 10246078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 246 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792860
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 39792860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076829
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 49076829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 247 - 401
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaag 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  347 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 246 - 415
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404189
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctca 415  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctca 39404189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 214 - 392
Target Start/End: Original strand, 52884856 - 52885038
Alignment:
Q  214 tggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884856 tggactcacacttgagggg-agtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 52884954  T
Q  312 acccataaacccattaccttaaggtttt-gggtaagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884955 atccataaacccattgccttaaggttttggggtaagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 246 - 402
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572177
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 213 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22028150 - 22027960
Alignment:
Q  213 atggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 310  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22028150 atggactcacacttaaggaggggtgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagag 22028051  T
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22028050 gacccataaacatattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccc 22027960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183261
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 22183261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608658
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 36608658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 244 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 385  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 253 - 402
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621160
Alignment:
Q  253 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtg 352  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  353 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 44621160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 364
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880280
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagg 49880251  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 364  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49880252 ttttgggtaagagcgtggtgtctctcttg 49880280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 254 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343004
Alignment:
Q  254 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtgg 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  354 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccg 54343004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 246 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 112 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 45489622 - 45489331
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt 211  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||      
T  45489622 gcaacggcggtacaagaagtgtcggtccgtttgcggagaacccagcaatagcgatacaagcaa-gtaagagcttccgcttgaagaggagcatgatgaaaa 45489524  T
Q  212 -gatggactcacacttgaggggg-agtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 307  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45489523 cgatggactcacacttgaggggggagtgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaa 45489424  T
Q  308 gaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 401  Q
    ||| || | |||||| | |   ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489423 gagaactcttaaacctact-gtttaagatttttggtaagagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 253 - 402
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620511
Alignment:
Q  253 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtg 352  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  353 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 44620511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 395  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 263 - 410
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936361
Alignment:
Q  263 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  363 tgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
      | | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcc 54936361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028366
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgg 341  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  342 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 22028366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 247 - 402
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303064
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccc 49303064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3244657 - 3244449
Alignment:
Q  193 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 292  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  3244657 agggggaacatgatgaatagatggactcacgcttaagggagagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttga 3244559  T
Q  293 acaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  3244558 acatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagttttgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtg 3244459  T
Q  393 gacggtcccc 402  Q
    | | ||||||    
T  3244458 ggcagtcccc 3244449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 250 - 403
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20825995
Alignment:
Q  250 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagt 349  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  350 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtccccc 20825995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 415
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740869
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctca 415  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcacttgt--ggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccctca 2740869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888814
Alignment:
Q  245 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 402  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccc 16888814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004560
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataaccaaaca 425  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtctcccgagctcctctcatgacccaaca 34004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 244 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||| | ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 243 - 403
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108695
Alignment:
Q  243 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattaccttaaggttttgg 341  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  342 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtccccc 54108695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889526
Alignment:
Q  245 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccctcgagctcc 16889526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Original strand, 44621304 - 44621492
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcaca 223  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||  || |||  |||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44621304 caagtagtgtcggtccatttgcagagacaccagcaacgacgatacaaacaagtaaagagcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcaca 44621403  T
Q  224 cttgagggggagtgt--tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 310  Q
    |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621404 cttgagggggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 259 - 370
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496931
Alignment:
Q  259 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 358  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  359 ctcttgcttgtg 370  Q
    ||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtg 45496931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 398
Target Start/End: Original strand, 43174480 - 43174661
Alignment:
Q  220 cacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 316  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43174480 cacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacaca 43174579  T
Q  317 taaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    |||||| || ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43174580 taaacctatgaccttaaagtgttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggt 43174661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 201 - 403
Target Start/End: Original strand, 3341083 - 3341287
Alignment:
Q  201 cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 298  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3341083 cacgataaagtgatggactcacacttgaggcagagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactt 3341182  T
Q  299 tataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || || |||| || || ||||||||| ||||||    
T  3341183 tataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggtaagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggt 3341282  T
Q  399 ccccc 403  Q
    |||||    
T  3341283 ccccc 3341287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6975620 - 6975489
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 335  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||     
T  6975620 tgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaaga 6975521  T
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975520 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 298 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817678
Alignment:
Q  298 ttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgg 397  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  398 tccccc 403  Q
    ||||||    
T  23817683 tccccc 23817678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 246 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  346 gagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 284 - 404
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827599
Alignment:
Q  284 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagc 383  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  384 ctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccccg 43827599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 290 - 410
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879972
Alignment:
Q  290 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgat 389  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  390 gtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  18879952 gtggacggtcctccgagctcc 18879972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 246 - 390
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatg 390  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 396
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691306
Alignment:
Q  295 accttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  393 gacg 396  Q
    ||||    
T  31691303 gacg 31691306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768061
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 399  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 244 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741216
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||| || |||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct 54741216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 413
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700526
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || |||| |||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctct 413  Q
    |||||| || |||||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtctcccgaactcctct 3700526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 246 - 381
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggta 344  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  345 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 381  Q
    | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034388
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||| | |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||| | || |||||||| ||||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtccccc 28034388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 265 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111694
Alignment:
Q  265 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 364  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  365 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    |   || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccccg 48111694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  257 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtg 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 88
Target Start/End: Original strand, 45496734 - 45496812
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtaca 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45496734 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcagcaacgacgataca 45496812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Original strand, 3340990 - 3341083
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3340990 tggtatcagagccccggttcgacgaacggtacgaccgaggtcgctggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaaacaacaagtggctc 3341083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 10246103 - 10246212
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgta 109  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  10246103 tggtatcagaaccccggttcgatgaagggtacgactgaggccgcctgtcagttgtgcagaaagcagcaacgacggtacaagcaacaagtggcttcttgtg 10246202  T
Q  110 cggcaacggc 119  Q
    | ||||||||    
T  10246203 cagcaacggc 10246212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16889444 - 16889315
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaat- 210  Q
    |||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || |||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  16889444 gcaacggcggtacaagtagtgtccgtccgtttgaggagaaaccagcaacgacgatacaaacaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgattaaag 16889345  T
Q  211 tgatggactcacacttgagggggagtgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889344 tgatggactcacacttgagggggagtgttg 16889315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 325
Target Start/End: Original strand, 10246317 - 10246428
Alignment:
Q  216 gactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 313  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10246317 gactcacgcttgagggggagtgctgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggac 10246416  T
Q  314 ccataaacccat 325  Q
    ||||||||||||    
T  10246417 ccataaacccat 10246428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 266 - 403
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271948
Alignment:
Q  266 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 361  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  362 -ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
     ||  || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtccccc 3271948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18933102 - 18933008
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18933102 tatcagagccccggttcgacgaagtgtgcgaccgaggcagccggtg-gttgtgcagaaagtcgcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgt 18933008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 310
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  252 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 362
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760306
Alignment:
Q  249 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagag 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  349 tgtggtgtctctct 362  Q
    ||||||||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctct 760306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489711
Alignment:
Q  250 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagt 349  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||    |  |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  350 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatccccc 45489711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 286 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  286 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 385  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 41370543 - 41370637
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41370543 tatcagagcccccattcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggtc-gttgcacagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaagtagctccttgt 41370637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698944
Alignment:
Q  269 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 366  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  367 tgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 400  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcc 39698944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 410
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174307
Alignment:
Q  336 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccccgagctcc 43174307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15841208 - 15841023
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag-tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 275  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||| | |||| |  | || | ||| ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  15841208 aagagcttccgcttgagtggtgagaatgatgaattgatggagtcacacttgacgaggagatcgttgtgtacaaatgtgaattatatgtcccatatcagat 15841109  T
Q  276 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    | || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  15841108 agaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagtgtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 310
Target Start/End: Original strand, 44620926 - 44621011
Alignment:
Q  228 agggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 310  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620926 agggggagtgttgttgtggacaagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22028263 - 22028163
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttg-agggggagcacgatgaattgatggactcac 222  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  || || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22028263 caagtagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgattcaagc-aagtaagagctttcgcttgaagggggagcacgatgaaaagatggactcac 22028165  T
Q  223 ac 224  Q
    ||    
T  22028164 ac 22028163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 376
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544239
Alignment:
Q  247 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg-ttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 376  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctctcacttgtacggttg 34544239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556890
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  |||| |||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 376  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 358 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702283
Alignment:
Q  358 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtccccctcgctcccctcat 11702283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 281
Target Start/End: Original strand, 41370673 - 41370738
Alignment:
Q  215 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 281  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370673 ggactcacacttgagggg-agtgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 20826024 - 20826104
Alignment:
Q  14 atcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggtt-agttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcag 93  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20826024 atcagagccccaattcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccatttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagcag 20826104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 393
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  354 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348410
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata 318  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccata 11348410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 90
Target Start/End: Original strand, 44621182 - 44621263
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttag-ttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 90  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  44621182 tggtatcagagccctggtttgacgaagggtacgaccgagacagccggtccgttttcgcagaaagcagcaacggcgatacaag 44621263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41707392 - 41707340
Alignment:
Q  174 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacact 225  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41707392 aagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacact 41707340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 398
Target Start/End: Original strand, 41370742 - 41370812
Alignment:
Q  328 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    ||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370742 ccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  320 acccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817457
Alignment:
Q  357 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 398  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 23817457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23817652 - 23817572
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagtt-gcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 90  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817652 tggtatcatagcccca-ttcgacgaagggtacgatcgaggcagccggtctgtttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 23817572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 43174405 - 43174477
Alignment:
Q  125 aagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgaggggg 198  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  43174405 aagcagtgtcggtctgtttgcggagaaaccaacaacggcgatacaaac-aagtaagagcttccgcttgaagggg 43174477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 363
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  311 gacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 363  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 2740874 - 2740953
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagtt-gcgcagaaagcagcaacgacggtacaa 89  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| |  ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  2740874 tggtatcagagccccg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccgatccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaa 2740953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783550
Alignment:
Q  307 agaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    |||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||   |||| |||||||| |||||||  ||||||||    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtccccc 11783550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 292
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 292  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 351
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  312 acccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgt 351  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18933134 - 18933103
Alignment:
Q  236 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933134 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 231
Target Start/End: Original strand, 5882092 - 5882122
Alignment:
Q  201 cacgatgaattgatggactcacacttgaggg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882092 cacgatgaattgatggactcacacttgaggg 5882122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  302 aagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 360  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  310 ggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 356  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 285  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 410
Target Start/End: Original strand, 45496675 - 45496716
Alignment:
Q  369 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  45496675 tgcggttgttctagcctcgatgtagacggtccctcgagctcc 45496716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 160; Significance: 7e-85; HSPs: 5)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 112 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1398 - 1105
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaat 210  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||     
T  1398 gcaacggcggtacaagtagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gtaagagcttccgctcgaagggggagcatgatcaaa 1300  T
Q  211 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 308  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  1299 agatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaa 1200  T
Q  309 aggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1199 aggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttcccc 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3254 - 3092
Alignment:
Q  136 gtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggga 234  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||| || |||    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3254 gtccgtttgcggagaacccaacaacggcgatacaaatcaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgagttgatggactcacacttgaggggga 3155  T
Q  235 gtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 295  Q
    ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3154 gtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 291 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  291 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1464 - 1383
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttag-ttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1464 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaag 1383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1575 - 1464
Alignment:
Q  129 agtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacg--gagacacatgcaaagtaagagcttccgcttg-agggggagcacgatgaattgatggactcacact 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | || ||| || |||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  1575 agtgtaggtccgtttgcggagaaaccagcaacgttgtgatacaagc-aagtaaaagctttcgctggaagggggagcatgatgaatcgattgactcacact 1477  T
Q  226 tgagggggagtgt 238  Q
    |||||||||||||    
T  1476 tgagggggagtgt 1464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 177 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 367 - 136
Alignment:
Q  177 taagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  367 taagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 269  T
Q  276 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggtt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||  | ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  268 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaacc--atacttta--ggtttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggtt 174  T
Q  376 gttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  173 gttctagcctcgatgtggacggtcccccgagcttctct 136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 246 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 512
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  346 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 404  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccg 512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 489 - 392
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| | |||||| ||||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  489 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggtagtcgg-tcgttgcgaagaaagtcgcaacagcagtacaagcagcaagtggctccttgt 392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 158 - 364
Target Start/End: Original strand, 5268 - 5477
Alignment:
Q  158 aacggagacacatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtga 254  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||    
T  5268 aacggcgatacaggcaaagtaagagcttccgcttgaagggggagcacgatgaactgatggactcacacttgagggagagttttgttgtgtgcaagtgtga 5367  T
Q  255 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggt 354  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5368 gttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtggt 5467  T
Q  355 gtctctcttg 364  Q
    ||||||||||    
T  5468 gtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5133
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 108
Target Start/End: Original strand, 5214 - 5262
Alignment:
Q  60 gttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5214 gttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgt 5262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17663 - 17496
Alignment:
Q  197 ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 294  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17663 ggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaac 17564  T
Q  295 accttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg--ttttgggtaagagtgtggtgtctct 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17563 accttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47519
Alignment:
Q  244 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggt 343  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  344 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 403  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtccccc 47519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 369
Target Start/End: Original strand, 39771 - 39963
Alignment:
Q  178 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  | || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39771 aagagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgatgaactcacacttgagggggaattgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 39870  T
Q  277 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 369  Q
     || |||   ||||| || | |||||||| ||| ||   ||||||  ||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  39871 gaaaagtggtggttggactctttataagtgagatgagatataaacttattaccttaaaattttggttaaaaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 376
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39588
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   || |||||| |||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaa-gttttgggtaa 39556  T
Q  346 gagtg-tggtgtctctcttgcttgtgcggttg 376  Q
     |||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  246 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 4534 times since January 2019
Visitors: 6273