View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: F9302-LTR4-TNT-insertion-1 (Length: 386)

Name: F9302-LTR4-TNT-insertion-1
Description: F9302-LTR4
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] F9302-LTR4-TNT-insertion-1
F9302-LTR4-TNT-insertion-1
[»] chr3 (7 HSPs)
chr3 (35-376)||(15943014-15943355)
chr3 (35-376)||(6149272-6149613)
chr3 (36-252)||(5224953-5225169)
chr3 (48-367)||(25768604-25768923)
chr3 (74-369)||(22149204-22149499)
chr3 (153-332)||(8270936-8271115)
chr3 (130-332)||(30150781-30150983)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (35-376)||(3190-3531)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (35-376)||(23509340-23509681)
chr5 (153-332)||(24584909-24585088)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (36-376)||(6041-6381)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (35-376)||(130669-131010)
scaffold0008 (175-367)||(27565-27757)
scaffold0008 (35-140)||(27747-27852)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (35-376)||(72908-73249)
scaffold0011 (35-376)||(77289-77630)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (35-376)||(20528819-20529160)
chr1 (35-376)||(20928820-20929160)
chr1 (69-211)||(20959622-20959764)
chr1 (69-321)||(22128724-22128976)
chr1 (130-332)||(20827739-20827941)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (35-376)||(371-712)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (35-376)||(1660168-1660509)
chr6 (35-376)||(17786811-17787153)
chr6 (35-376)||(16103920-16104261)
chr6 (35-376)||(18421179-18421520)
chr6 (35-367)||(21411851-21412183)
chr6 (130-332)||(16378793-16378995)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (35-376)||(15000404-15000745)
chr4 (130-332)||(15289433-15289635)
chr4 (7-38)||(421452-421483)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (35-376)||(8572-8913)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (35-376)||(27176-27517)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (35-376)||(7619-7960)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (36-376)||(12515-12855)
scaffold0467 (232-376)||(1-145)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (36-376)||(21846961-21847301)
chr8 (121-376)||(20649064-20649319)
chr8 (35-232)||(9951000-9951197)
chr8 (130-332)||(21193270-21193472)
chr8 (343-376)||(16415902-16415935)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (43-376)||(22281487-22281803)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (35-376)||(4554-4894)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (35-314)||(11842-12121)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (35-376)||(25958-26299)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (35-367)||(3500-3832)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (35-376)||(3109-3450)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (35-308)||(16637-16910)
[»] chr7 (4 HSPs)
chr7 (35-281)||(16574962-16575208)
chr7 (35-281)||(16590454-16590700)
chr7 (130-332)||(7827684-7827886)
chr7 (130-332)||(27104058-27104260)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (35-376)||(8937-9278)
scaffold0021 (338-376)||(91282-91320)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (63-334)||(97347-97618)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (216-376)||(315-475)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (75-219)||(24924-25068)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Original strand, 15943014 - 15943355
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15943014 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 15943113  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15943114 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 15943213  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15943214 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 15943313  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15943314 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 15943355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Original strand, 6149272 - 6149613
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
6149272 aattgcgcaagccttagcgactatgcctcaagtgttggcccagtcgaatgagaatgcgatggctaatcgtaggaatgagggtgaggctgaagagaggagg 6149371  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
6149372 cttgataggttcttgaggaacaatccactgaatttcaaagggaggtttgatccatagggagcacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccgag 6149471  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| || || |||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |    
6149472 ctatggtgacaggaggtgaccagaaggtcaggctagcgactcatatgcttgctgaggaagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagat 6149571  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
6149572 gggaggtgatgtggtgacctgggcgaagtttaaggttgaatt 6149613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5225169 - 5224953
Alignment:
36 attgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggc 135  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5225169 attgcggaagctttagcagctatggcacaagttttggctcaagcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggc 5225070  T
136 tcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
5225069 tcgataggttcttgaggaacaatccaccaactttcaaggggagattcgacccagagggagcatagacttgggtgcaggggatggagcggattttccaagc 5224970  T
236 tatggttacaggagatg 252  Q
    ||||||||| |||||||    
5224969 tatggttacgggagatg 5224953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25768923 - 25768604
Alignment:
48 ttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggctcgataggttct 147  Q
    |||||| | ||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||| || || || ||| ||||||||||| ||||||    
25768923 ttagcggcgatggctcaggtgttggctcagtcgaatgagaatgtggtggctagtcgtcggaacgaaggggaagctgaggagcggaggctcgatcggttct 25768824  T
148 tgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagctatggttacagg 247  Q
    || ||||||||||  |||| ||||| || |||||| |||| ||||| || || ||||||||||| || || |||  ||| ||||| |||||||| ||  |    
25768823 tggggaacaatccgtcgacgttcaagggaaggttcaatccggagggagctcatacttgggtgcagggcatagagaggatattccgtgctatggtgacgag 25768724  T
248 agatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttggaaggtgatgtg 347  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||     
25768723 tgatgaccaaaaggtcagattggcgactcatatgcttgctgaggaggccgaacattggtggactaatgccaaaggaagacttgagttgggaggagaagtt 25768624  T
348 gtgacctgggctaagttcaa 367  Q
    ||||||||||| ||||||||    
25768623 gtgacctgggcgaagttcaa 25768604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 369
Target Start/End: Original strand, 22149204 - 22149499
Alignment:
74 ccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaa 173  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||| | |||| ||||| ||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || || |||    
22149204 ccagtcgagtgagaatgcaatggctaaccatcggaacgaaggagaggcggaggagcggatgctcgatcggttcttgaggaacaatccgcctacgttaaaa 22149303  T
174 gggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcga 273  Q
    ||||||||||| || || || || |||| ||||||| | || || |||  ||| || |  ||  |||| || || |||||||| ||||||||  |||| |    
22149304 gggaggttcgacccggaaggagctcagatttgggtgtagggcatagagaggatctttcatgcggtggtgactggcgatgaccagaaggttaggttggcta 22149403  T
274 ctcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaagg 369  Q
    |||||||| |  ||||||| || ||| | | |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| | ||||||||    
22149404 ctcatatgcttgctgaggaggcagagtattagtggactaatgccaaaggaagacttgagatggagggggaggtggtgacttgggcaaggttcaagg 22149499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 332
Target Start/End: Original strand, 8270936 - 8271115
Alignment:
153 aacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagctatggttacaggagatg 252  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || || ||||| ||| ||||||| ||||||  ||| || || |||||||| ||  | ||||    
8270936 aacaatccacctacgttcaagggaaggttcgacccggatggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatg 8271035  T
253 accaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgag 332  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||  ||| |  ||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
8271036 atcaaaaggtgaggttggctactcgcatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgag 8271115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30150983 - 30150781
Alignment:
130 ggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagatttt 229  Q
    ||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || || || || ||| ||||||| ||||||  ||| ||    
30150983 ggaggcttgatcgtttcttgcgaaacaatccacctacgttcaagggaaggttcgacccggatggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctt 30150884  T
230 ccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggctt 329  Q
     || |||||||| ||  | ||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||| |  ||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||    
30150883 tcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagactt 30150784  T
330 gag 332  Q
    |||    
30150783 gag 30150781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3531 - 3190
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3531 aattgcgcaagccttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 3432  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
3431 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgag 3332  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
3331 ctatggttacgggagatgaccagaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcagagcattggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 3232  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3231 gggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 3190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23509681 - 23509340
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23509681 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcgtgttttggcctagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 23509582  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
23509581 ctcgataggtttttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcaatccagagggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgag 23509482  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
23509481 ctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaaaggaaggcttaagtt 23509382  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23509381 gggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 23509340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24585088 - 24584909
Alignment:
153 aacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagctatggttacaggagatg 252  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || || ||||| ||| ||||||| ||||||  ||| || || |||||||| ||  | ||||    
24585088 aacaatccacctacgttcaagggaaggttcgacccggatggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatg 24584989  T
253 accaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgag 332  Q
    | || ||||| ||  |||| ||||| ||| |  ||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
24584988 atcagaaggtgaggttggctactcagatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgag 24584909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 36 - 376
Target Start/End: Original strand, 6041 - 6381
Alignment:
36 attgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggc 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6041 attgcgcaagctttagcaactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcgatggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggc 6140  T
136 tcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
6141 tcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatctagagggggcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagc 6240  T
236 tatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttg 335  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
6241 tatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttgactgaggaagcagagcactagtggaccaatgccaagggaaggcttgagttg 6340  T
336 gaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6341 ggaaatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 6381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Original strand, 130669 - 131010
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
130669 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatacggtgggtaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 130768  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||    
130769 ctcgataggttcttgaggaacaatccactgactttcaaagggaggttcgatttagagggggcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttctgag 130868  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
130869 ctattgttacggaagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcagagcactagtggaccaatgccaagggaaggcttgaatt 130968  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
130969 gggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 131010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27757 - 27565
Alignment:
175 ggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgac 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||    
27757 ggaggttcgatccagagggagcacaaacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctacggtcacgagagatgaccagaaggtcagactagcgac 27658  T
275 tcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaa 367  Q
    | ||||| |  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
27657 ttatatgcttgctgaggaagcaaagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggggacctgggctaagttcaa 27565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27852 - 27747
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||| | |||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||    
27852 aattgcactagctttagtgacgatggcacaagtgttggctcagtcgaatgagaatacagtggctaatcgtagtaacgaaggtgaggccgaggagcggagg 27753  T
135 ctcgat 140  Q
     |||||    
27752 ttcgat 27747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Original strand, 72908 - 73249
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
72908 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgtatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 73007  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | || |||||||||||    
73008 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggagcacagacttgggtgcagggtatagcgcggattttccgag 73107  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
73108 ctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagccgaggaagcagagcactggtggactaacgccaaaggaaggcttgagtt 73207  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
73208 gggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 73249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Original strand, 77289 - 77630
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
77289 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgtatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 77388  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | || |||||||||||    
77389 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggagcacagacttgggtgcagggtatagcgcggattttccgag 77488  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
77489 ctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagccgaggaagcagagcactggtggactaacgccaaaggaaggcttgagtt 77588  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
77589 gggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 77630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20529160 - 20528819
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20529160 aattgcacaagctttagcgactatggcacaagttttggcccagtcgaatgagaatgcagtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 20529061  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||    
20529060 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatctagagggatcacagacttgggtgcagaggatggagcggattttccaag 20528961  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
20528960 ctatggttacggaagatgaccagaaggttagactagcgactcatatgttgactgaggaagcagagcactggtggactaatgccaaaggaaggcttgagat 20528861  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20528860 gggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 20528819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20929160 - 20928820
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
20929160 aattgcgcaaactttagcgactatggcgcaagttttggctcagtcgaatgagaatgcggtgactaaccgtaggaatgaaggtgagaccgaagagaggagg 20929061  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||    
20929060 ctcgataggttcttgaggaacaatccagtgactttcaaagg-aggttcgatctagagggggcacagacttgggtgtagggaatggaacggattttccgag 20928962  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
20928961 ctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcataagttgactgaggaagcagagcattggtggaccaatgccaagggaaggcttgagat 20928862  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20928861 gggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 20928820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Original strand, 20959622 - 20959764
Alignment:
69 ttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactt 168  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| || || || || || ||| |||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||| |    
20959622 ttggctcagtggaatgagaatgcggtggctagtcgtcggaacgagggagaagctgaggagcggagactcgatcggttcctgcggaacaatccgccgacgt 20959721  T
169 tcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgca 211  Q
    |||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||||    
20959722 tcaaggggaggttcgacccggaaggagctcagacttgggtgca 20959764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 321
Target Start/End: Original strand, 22128724 - 22128976
Alignment:
69 ttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactt 168  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |  |   ||| |||||||||| || || || ||| ||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| || |    
22128724 ttggctcagtcgaatgagcatgcggcgattggtcgtcggaatgaaggggaagctgaggagcggaggcttgatcgtttcttgcgaaacaatccacctacgt 22128823  T
169 tcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagact 268  Q
    |||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||  ||| || ||| ||||||| ||  | ||||| |||||||| ||  |    
22128824 tcaaggggaggtttgacccggagggagctcagacgtgggtgcaaggcatggagaggatctttcgaactatggtgactagtgatgatcaaaaggtcaggtt 22128923  T
269 ggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagg 321  Q
    ||| ||||||||| |  ||||||| || ||| | |||||||| ||||| ||||    
22128924 ggctactcatatgattgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagg 22128976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 332
Target Start/End: Original strand, 20827739 - 20827941
Alignment:
130 ggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagatttt 229  Q
    ||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || || || || ||| ||||||| ||||||  ||| ||    
20827739 ggaggcttgatcgtttcttgcgaaacaatccacctacgttcaagggaaggttcgacccggatggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctt 20827838  T
230 ccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggctt 329  Q
     || |||||||| ||  | ||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||| |  ||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||    
20827839 tcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagactt 20827938  T
330 gag 332  Q
    |||    
20827939 gag 20827941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 712 - 371
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
712 aattgcgcaagctttagcgactatggcataagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaataaaggtgaggccaaagagaggagg 613  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
612 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggagcacatacttgggtgcagggtatggagcggattttccgag 513  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
512 ctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaagcagagcactgatggactaatgccaaaggaaggcttgagtt 413  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
412 gggaggttatgtggtgacgtgggctaagttcaaggttgaatt 371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Original strand, 1660168 - 1660509
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1660168 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaggttttggctcaagggaatgagaatacggcggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 1660267  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
1660268 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgag 1660367  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
1660368 ctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgtttgctgaggaagcagagtactggtggatcaatgccaagggcaggcttgagtt 1660467  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
1660468 gggcggtgatgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaatt 1660509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17787153 - 17786811
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
17787153 aattgcgcaagctttagcgactatggcacaagtgttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagatgagg 17787054  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||    
17787053 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttaaaagggaggttcgacccagagggagcacagacttgggtgcagggtatggaacggattttccgag 17786954  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaagg-ttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagt 333  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||||| |  |||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
17786953 ctatggttacgggaaatgaccagaaggctcagactagcgactcatatgctagctgaggaagaagggcactggtggactaatgccaaaggaagacttgaga 17786854  T
334 tggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
17786853 tgggaggtgatgtggtgacctaggctaagttcaaggtcgaatt 17786811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16104261 - 16103920
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
16104261 aattgcgcaagccttagcgacgatggcacaagtgttggcccagtcgaatgagaatgcagtgggtaatcgtaggaatgagggtgaggccgaggagaggaga 16104162  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||    
16104161 ctcgataggttcttgaggaacaatccatcgactttcaaagggaggttcgatccagagggagtacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccaag 16104062  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |    
16104061 ctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatgtgcttgctgaggaagcggagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgaaat 16103962  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
16103961 gggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaagctgaatt 16103920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18421520 - 18421179
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
18421520 aattgtgcaagctttagcgactatggcacaagtgttagcccaattaaatgagaatgcggtggctaatcataggaaggaaggagaggccgaagagaggagg 18421421  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||     
18421420 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccaaagggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgat 18421321  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    ||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |    
18421320 ctatggtgacgagggatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgctaaggaagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagat 18421221  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
18421220 gggaggtgatgttgtgacctgggctaagttccaggttgaatt 18421179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Original strand, 21411851 - 21412183
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| | || || || || || || ||| |||||    
21411851 aattgcacaagccttagcggcgatggctcaggtgttggttcagtcgaatgagaatgcggtggctagtcgtcgaaacgagggggaagctgaggagcggagg 21411950  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||| || || |    
21411951 ctcgatcggttcttgcggaacaatctgccgacgatcaaagggaggttcgacctagagggagctcagacttgggtgcagggcatggagcggatatttcgtg 21412050  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |  ||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| |||||  ||||| |    
21412051 ctatggtgacgggagatgaccaaaaggccagattggcgactcatatgcttgctgaggaggctgagtactggtggactaatgtcaaaggaagatttgagat 21412150  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaa 367  Q
    || ||| || || ||||||||||| ||||||||    
21412151 gggaggagaagttgtgacctgggcgaagttcaa 21412183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 332
Target Start/End: Original strand, 16378793 - 16378995
Alignment:
130 ggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagatttt 229  Q
    ||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || || || || ||| ||||||| ||||||  ||| ||    
16378793 ggaggcttgatcgtttcttgcgaaacaatccacctacgttcaagggaaggttcgacccggatggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctt 16378892  T
230 ccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggctt 329  Q
     || |||||||| ||  | ||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||| |  ||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||    
16378893 tcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagactt 16378992  T
330 gag 332  Q
    |||    
16378993 gag 16378995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15000745 - 15000404
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
15000745 aattgcgcaagctttagcgactatggcacaagttttggctcaagcgaatgagaatacggcggctaaccgtaggaatgaaggcgaggccgaagggaggagg 15000646  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
15000645 ctcgataggttcttaaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgag 15000546  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
15000545 ctatggttacgggagatgactagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagtt 15000446  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
15000445 ggggggtgatgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaatt 15000404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 332
Target Start/End: Original strand, 15289433 - 15289635
Alignment:
130 ggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagatttt 229  Q
    ||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||| ||||||| ||||||  ||| ||    
15289433 ggaggcttgatcgtttcttgcgaaacaatccacctacgttcaagggaaggttcgacccagatggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctt 15289532  T
230 ccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggctt 329  Q
     || |||||||| ||  | ||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||| |  ||||||| || ||| | ||| |||||||||| |||||||| |||    
15289533 tcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggcggaccaatgctaagggaagactt 15289632  T
330 gag 332  Q
    |||    
15289633 gag 15289635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 38
Target Start/End: Original strand, 421452 - 421483
Alignment:
7 aattcttacattgtatcagccagtgttgaatt 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
421452 aattcttacattgtatcagccagtgttgaatt 421483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Original strand, 8572 - 8913
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     
8572 aattgcgcaagccttggcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccataggaatgaaggtgaggcctaagagaggaga 8671  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||    
8672 ctagataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccaaggggggcacagacttggatgcagggtatggagcggattttccgag 8771  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| | ||||||    
8772 ctatggttacggaagatgaccagaaggtcaggctagcgactcatatgttgactgaggaggcagagcactggtggactagcgccaaaggaagacatgagtt 8871  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8872 gggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 8913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27517 - 27176
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
27517 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggctcaagcgaatgagaatacggcagctaaccataggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 27418  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
27417 ctcgatagattcttgaggaacaatccaccgactttcaatgggaggttcgatccagagggaggacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgag 27318  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
27317 ctatggttacgggagatgaccagaaggtcagattagcgactcatatgctagctgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaaaggaagacttgagat 27218  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
27217 gggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaagtttgaatt 27176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Original strand, 7619 - 7960
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7619 aattccgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggctcaagcgaatgagaatacggcggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 7718  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
7719 ctcgataggttcttaaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccaaagggagcacagacttgggtgtaggggatggagcggattttccgag 7818  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
7819 ctatggttacgggagatgaccagaaggtcaaactagcgactcatatgctagctgaggaagcatagcactagtggaccaatgccaaaggcaggcttgagtt 7918  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
7919 gggaggtgatgaggtgacctgggctatgttcaaggttgaatt 7960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 36 - 376
Target Start/End: Original strand, 12515 - 12855
Alignment:
36 attgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggc 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
12515 attgcgcaagctttagcggctatggcacaagttttggctcaagcaaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtggggccgaagagaggaggc 12614  T
136 tcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagc 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
12615 tcgatagcttcttgaggaacaatccaccgactttaaaggggagattcgatccagagggagcacagacttgggtctaggggatggagcggattttccgagc 12714  T
236 tatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttg 335  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||    
12715 tatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgctagctgaggaagcagagcactggtgggctaatgccaaaggaagacttgagatg 12814  T
336 gaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
12815 ggaggtgatgtggtgaactgggctaagttcaaggttgaatt 12855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 232 - 376
Target Start/End: Original strand, 1 - 145
Alignment:
232 gagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttga 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
1 gagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgctagctgaggaagcagagcactggtgggctaatgccaaaggaagacttga 100  T
332 gttggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
101 gatgggaggtgatgtggtgaactgggctaagttcaaggttgaatt 145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 36 - 376
Target Start/End: Original strand, 21846961 - 21847301
Alignment:
36 attgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggc 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21846961 attgcacaagctttagcgactatggcacaagttttgactcaagcgaatgagaatacggcggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggc 21847060  T
136 tcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagc 235  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||    
21847061 ttgataggttcttaaggaacaatccaccgactttcaaggggaggttcgatccagagggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccaagc 21847160  T
236 tatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttg 335  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
21847161 tatggttactggtgatgaccagaaggtcagattggcgactcatatgctagctgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcagacttgagttg 21847260  T
336 gaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
21847261 gaaggtggtgttgtgacctgggccaagttcaaggttgaatt 21847301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 121 - 376
Target Start/End: Original strand, 20649064 - 20649319
Alignment:
121 ccgaagagaggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatgga 220  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
20649064 ccgatgaggggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggagcacagacttgggtgcagggcatgga 20649163  T
221 gcagattttccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaag 320  Q
    || | |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||     
20649164 gcgggtttttcgagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgcttgctgaggaagcagagcacttgtggactaatgccaaa 20649263  T
321 ggaaggcttgagttggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
20649264 ggaagacttgagttgggaggtgatgttgtgacctgggcgaagttcaaagttgaatt 20649319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 232
Target Start/End: Original strand, 9951000 - 9951197
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
9951000 aattgcacaagctttagcgactatggcacaagtgttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtagaaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 9951099  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
9951100 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccaaagggagtacagacttgggtgcagggtatggaacagattttccg 9951197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 332
Target Start/End: Original strand, 21193270 - 21193472
Alignment:
130 ggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagatttt 229  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||||  ||| ||    
21193270 ggaggctcgatcgtttcttgcggaacaatccgccgacgtacaatgggaggttcgacccggagggagctcaaacttgggtgcagggcatggagaggatatt 21193369  T
230 ccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggctt 329  Q
      | |||||||| ||  | |||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |  ||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
21193370 ttgtgctatggtgacgagtgatgaccagaaggtcagattgacgactcatatgcttgctgaggaggccgaatattggtggaccaatgccaagggaagactt 21193469  T
330 gag 332  Q
    |||    
21193470 gag 21193472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16415935 - 16415902
Alignment:
343 atgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
16415935 atgtggtgacctcggctaagttcaaggttgaatt 16415902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 43 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22281803 - 22281487
Alignment:
43 aagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggctcgatag 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
22281803 aagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgattgagaatgtgatggttaaccgtaggaatgaaggtgaggctgaagagaggaggctcgatag 22281704  T
143 gttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagctatggtt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||                 |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
22281703 gttcttgaggaacaatccaccgaatttcaaaggg-----------------ggcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggtt 22281621  T
243 acaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttggaaggtg 342  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
22281620 acgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgaggaagcagagcactggtggaccaatgccaaaggaaggcttgagatgggaggtg 22281521  T
343 atgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
22281520 atgtggtaacctgggctaagttcaaggttgaatt 22281487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Original strand, 4554 - 4894
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
4554 aattgcgcaagctttagctactatggcgcaagtgttggcccagtcgaatgagaatgtggtggcaaatcataggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 4653  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||    
4654 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaatggaggttcaatccagagggagcacgaacttgggtgcagggcatggaacagattttctgag 4753  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||| || ||| |||| ||| |||||| ||||| |    
4754 ctgtggtcacaggagatgaccagaaggtcagactggcgactcaaatgcttgctgaggaagcagagcactagttgactaatgtcaaaggaagg-ttgagat 4852  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4853 gggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 4894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 314
Target Start/End: Original strand, 11842 - 12121
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
11842 aattgcgcaaactttagcgactatgacgcatgttttggcacagtcaaatgagaatgtggtggctaaccgtaggaatgatggtgaggccgaagagaagagg 11941  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
11942 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaggggaggttagatttagagggagcacggacttgggtgcaggggatggagcggattttccgag 12041  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaat 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
12042 ctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgaggaagcagagcactggtggaccaat 12121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26299 - 25958
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||| ||| ||||||||     
26299 aattgcgcaagccttagcgacgatggcacaagtgttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaattgcaggaacgagggtgaggtcgaggagaggaga 26200  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||    
26199 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggtttgatccagagggagcacagacttgggtgcagggtatggggtggattttccgag 26100  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |    
26099 ctatggtgacaggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgttgaggaagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagat 26000  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
25999 gggaggtaatgtggtgacttgggctaagttcaaagttgaatt 25958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3832 - 3500
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
3832 aattgcgaaagccttagcgacgatgacacaagtgttggcccagtcgaatgagaatgcgatggctaatcgtaggaatgagggtgaggccgatgagaggaga 3733  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
3732 ctcgataggttcttgacgaacaatccactgactttcaaagggaggttcgatctagagggagcacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccgag 3633  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||| |    
3632 ctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgctgaggaagcagagaactagtggactaatgccaaaggaagacttgagat 3533  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaa 367  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
3532 gggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Original strand, 3109 - 3450
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||||    
3109 aattgcacaagccttagcggcgatggctcaagtgttggcccagtctaatgagaatgcagtggctaatcgtcggaatgaaggcgaggctgaggagcggagg 3208  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  |    
3209 ctcgatcggttcttgaggaacaatccaccgattttcaaagggaggttcgatccagagggagcacagacttgggtgcagggcatggagcggatattccatg 3308  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |    
3309 ctatggtgacgggagatgaccagaaggttagattggcgactcatatgcttactgaggaagcggagcactggtggactaatgccaagggaagacttgatat 3408  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || |||||| || ||||||||||  |||||||| | ||||||    
3409 gggaggtgaagttgtgacctgggaaaagttcaaagctgaatt 3450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16910 - 16637
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
16910 aattgcggaagctttagcgactatggcacaagttttggcccaggcaaatgagaatgcagtggctaatcggaggaatgagggtgaggccaaagagaggagg 16811  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
16810 cttgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatctagagggagcacagacttgggtgcagggtatggagcggattttccgag 16711  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtgg 308  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |   |||| | |||||||||||||||    
16710 ctatggttacgggagatgaccataaggtcagactagcaactcatatgctaggtgagaaggcggagcactggtgg 16637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 4)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 281
Target Start/End: Original strand, 16574962 - 16575208
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||| ||||| |||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||| |||||    
16574962 aattgcacaagccttagtggcgatggctcaagtgttggcccagtcgaatgagaatgcagtggctaatcgtcggaacgaaggagaagccgaggagcggagg 16575061  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||  |    
16575062 ctcgatcggttcttgaggaaaaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggagcacagacttaggtgcagggcatggagcggatattccatg 16575161  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatg 281  Q
    | ||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
16575162 ccatggtgatgggagatgaccagaaggtcagactggcaactcatatg 16575208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16590700 - 16590454
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||| ||||| |||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||| |||||    
16590700 aattgcacaagccttagtggcgatggctcaagtgttggcccagtcgaatgagaatgcagtggctaatcgtcggaacgaaggagaagccgaggagcggagg 16590601  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||  |    
16590600 ctcgatcggttcttgaggaaaaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggagcacagacttaggtgcagggcatggagcggatattccatg 16590501  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatg 281  Q
    | ||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
16590500 ccatggtgatgggagatgaccagaaggtcagactggcaactcatatg 16590454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7827886 - 7827684
Alignment:
130 ggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagatttt 229  Q
    ||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || || || || ||| ||||||| ||||||  ||| ||    
7827886 ggaggcttgatcgtttcttgcgaaacaatccacctacgttcaagggaaggttcgacccggatggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctt 7827787  T
230 ccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggctt 329  Q
     || |||||||| ||  | ||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||| |  ||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||    
7827786 tcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagactt 7827687  T
330 gag 332  Q
    |||    
7827686 gag 7827684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 332
Target Start/End: Original strand, 27104058 - 27104260
Alignment:
130 ggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagatttt 229  Q
    ||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || || || || ||| ||||||| ||||||  ||| ||    
27104058 ggaggcttgatcgtttcttgcgaaacaatccacctacgttcaagggaaggttcgacccggatggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctt 27104157  T
230 ccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggctt 329  Q
     || |||||||| ||  | ||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||| |  ||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| |||    
27104158 tcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagactt 27104257  T
330 gag 332  Q
    |||    
27104258 gag 27104260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9278 - 8937
Alignment:
35 aattgcgcaagctttagcgactatggcgcaagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggagg 134  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| |||||    
9278 aattgcacaagccttaccgacgatggctcaggtgttggcccagtcgattgagaatgcagtggcgaatcgtcggaacgaaggggaggccgaggagcggagg 9179  T
135 ctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgag 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || | ||||| ||| ||| | |    
9178 ctcgatcggttcttgaggaacaatccatcgactttcagagggaggttcgatccagagggagcacaaacgtgggtgcagggcacggagcggatattcggtg 9079  T
235 ctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
    ||||||| || |||| ||| || ||||| | ||||||||||| |||| |   ||||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||  ||||| |    
9078 ctatggtgacgggaggtgatcagaaggtcaaactggcgactcgtatgcttgttgaggaagctgagcactattggactaatgccaaaggaagaattgagat 8979  T
335 ggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    || |||| | || ||||||||||| |||||||| | ||||||    
8978 gggaggtaaagttgtgacctgggcgaagttcaaagctgaatt 8937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 91320 - 91282
Alignment:
338 aggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
91320 aggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 91282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 97618 - 97347
Alignment:
63 caagttttggcccagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggctcgataggttcttgaggaacaatccac 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||| ||||| || ||| | || || ||| |||||||||||||||||||||    
97618 caagtgttggcccagtcgaatgagaatgcagtggctagtcgtcagaacgaaggggaggctgaggagcgaagtcttgatcggttcttgaggaacaatccac 97519  T
163 cgactttcaaagggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggt 262  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
97518 cgacattcgaggggaggtttgatccagagggagcccagacttgggtacagagcatggagcggatattccgtgctatggtgacgggagatgaccagaaggt 97419  T
263 tagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagtt 334  Q
     ||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
97418 cagattggcgactcatatgcttgctgaggaagctgagcagtggtggactaatgccaaaagaagacttgagtt 97347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 216 - 376
Target Start/End: Original strand, 315 - 475
Alignment:
216 atggagcagattttccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatg 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| || ||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||| || |    
315 atggagcggattttccgagctatggttacgggagatgactagaaggtcaaacttgcaactcatatgctagctgaagaagcagagcactggtggacaaacg 414  T
316 ccaagggaaggcttgagttggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaatt 376  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
415 ccaaaggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctacgttcaaggttgaatt 475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 219
Target Start/End: Original strand, 24924 - 25068
Alignment:
75 cagtcgaatgagaatgcggtggctaaccgtaggaatgaaggtgaggccgaagagaggaggctcgataggttcttgaggaacaatccaccgactttcaaag 174  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||  |||  |||||| || || || || ||| ||||||| ||| | |||||| | ||||||||||| || ||||| |    
24924 cagtccaatgaaaatgcggtagctagtcgtcagaatgagggagaagctgaggagcggaggcttgatcgtttcttgcgaaacaatccacctacgttcaagg 25023  T
175 ggaggttcgatccagagggggcacagacttgggtgcaagggatgg 219  Q
    | ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
25024 gaaggtttgacccggagggagctcagacatgggtgcaaggcatgg 25068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 46159 times since January 2019
Visitors: 6513