View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: F9311-LTR4-TNT-insertion-14 (Length: 519)

Name: F9311-LTR4-TNT-insertion-14
Description: F9311-LTR4
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] F9311-LTR4-TNT-insertion-14
F9311-LTR4-TNT-insertion-14
[»] chr1 (150 HSPs)
chr1 (9-509)||(30790257-30790757)
chr1 (151-509)||(15669253-15669608)
chr1 (8-509)||(26613101-26613604)
chr1 (35-509)||(14183462-14183923)
chr1 (41-507)||(16561418-16561885)
chr1 (8-468)||(42922150-42922608)
chr1 (31-509)||(18800430-18800910)
chr1 (9-485)||(8347157-8347633)
chr1 (8-393)||(30738598-30738990)
chr1 (256-509)||(15916562-15916814)
chr1 (35-500)||(17185996-17186465)
chr1 (9-495)||(13214999-13215496)
chr1 (9-495)||(38925350-38925841)
chr1 (151-509)||(8348912-8349266)
chr1 (175-509)||(16429048-16429380)
chr1 (41-500)||(13125327-13125787)
chr1 (9-509)||(41646838-41647348)
chr1 (164-476)||(16428733-16429043)
chr1 (33-500)||(9240951-9241425)
chr1 (9-509)||(39462437-39462949)
chr1 (90-339)||(155711-155961)
chr1 (31-337)||(43104099-43104414)
chr1 (164-509)||(11457329-11457676)
chr1 (35-474)||(50076563-50077009)
chr1 (9-509)||(51749957-51750469)
chr1 (164-500)||(6114970-6115304)
chr1 (36-478)||(18307054-18307504)
chr1 (35-509)||(18839531-18840015)
chr1 (9-365)||(10399829-10400191)
chr1 (9-509)||(28206919-28207429)
chr1 (9-500)||(15823464-15823967)
chr1 (35-365)||(50078821-50079158)
chr1 (32-509)||(2949086-2949571)
chr1 (164-365)||(6756608-6756808)
chr1 (164-509)||(47906350-47906697)
chr1 (164-509)||(50307396-50307747)
chr1 (164-509)||(39932153-39932507)
chr1 (164-509)||(40134024-40134371)
chr1 (9-365)||(28840596-28840959)
chr1 (35-509)||(31489859-31490338)
chr1 (36-509)||(17318838-17319314)
chr1 (36-509)||(25251128-25251611)
chr1 (11-509)||(9459284-9459785)
chr1 (11-509)||(9463111-9463612)
chr1 (9-509)||(16226085-16226600)
chr1 (164-508)||(16432474-16432813)
chr1 (164-500)||(31424879-31425219)
chr1 (9-365)||(6822933-6823294)
chr1 (164-478)||(25127952-25128268)
chr1 (11-509)||(28842413-28842924)
chr1 (9-365)||(27916415-27916778)
chr1 (164-500)||(14097832-14098171)
chr1 (164-365)||(17324637-17324837)
chr1 (164-502)||(2510200-2510525)
chr1 (164-509)||(4131228-4131580)
chr1 (31-305)||(31422933-31423215)
chr1 (9-365)||(47179627-47179992)
chr1 (9-365)||(51752283-51752643)
chr1 (164-507)||(15294687-15295035)
chr1 (35-509)||(50248424-50248909)
chr1 (164-355)||(2617596-2617786)
chr1 (164-500)||(12302368-12302706)
chr1 (9-365)||(13761755-13762116)
chr1 (41-398)||(26520086-26520449)
chr1 (164-500)||(27336801-27337140)
chr1 (9-365)||(47177276-47177641)
chr1 (11-365)||(3579618-3579979)
chr1 (164-509)||(25248405-25248753)
chr1 (164-493)||(17324143-17324484)
chr1 (31-442)||(49495137-49495540)
chr1 (151-509)||(28279331-28279688)
chr1 (11-354)||(20302379-20302727)
chr1 (224-509)||(23816027-23816316)
chr1 (32-509)||(6995547-6996040)
chr1 (164-356)||(16231643-16231834)
chr1 (11-509)||(31735372-31735887)
chr1 (164-365)||(24325743-24325943)
chr1 (417-509)||(26519296-26519385)
chr1 (164-500)||(27338992-27339331)
chr1 (164-365)||(46431707-46431908)
chr1 (9-85)||(47451566-47451642)
chr1 (164-329)||(21948225-21948388)
chr1 (164-308)||(48665257-48665401)
chr1 (180-365)||(23785935-23786119)
chr1 (271-478)||(13127579-13127782)
chr1 (32-298)||(28998320-28998593)
chr1 (32-298)||(29004036-29004309)
chr1 (9-85)||(6823802-6823878)
chr1 (429-509)||(13447124-13447203)
chr1 (429-501)||(50078652-50078724)
chr1 (176-354)||(51757623-51757799)
chr1 (225-308)||(46783189-46783271)
chr1 (195-356)||(47451754-47451913)
chr1 (35-108)||(11457740-11457812)
chr1 (164-280)||(20291537-20291653)
chr1 (429-509)||(3579438-3579518)
chr1 (9-93)||(16231519-16231603)
chr1 (432-509)||(51752723-51752798)
chr1 (429-509)||(2617868-2617948)
chr1 (13-85)||(14098257-14098329)
chr1 (24-108)||(20291390-20291473)
chr1 (232-365)||(21353347-21353477)
chr1 (36-108)||(25248779-25248850)
chr1 (11-85)||(48665090-48665165)
chr1 (232-365)||(2393282-2393413)
chr1 (224-320)||(8213571-8213666)
chr1 (416-509)||(13358911-13359004)
chr1 (166-308)||(14353047-14353188)
chr1 (9-85)||(16431018-16431095)
chr1 (349-490)||(26332391-26332526)
chr1 (429-509)||(51757886-51757966)
chr1 (429-501)||(13762187-13762258)
chr1 (181-263)||(14997040-14997122)
chr1 (416-509)||(16231901-16231995)
chr1 (166-296)||(26332553-26332688)
chr1 (416-478)||(28841017-28841079)
chr1 (9-47)||(49687458-49687496)
chr1 (35-108)||(2617460-2617532)
chr1 (35-108)||(17324009-17324081)
chr1 (429-509)||(20291807-20291887)
chr1 (429-509)||(23786191-23786271)
chr1 (432-509)||(30780395-30780475)
chr1 (12-85)||(40133856-40133929)
chr1 (429-509)||(46431555-46431635)
chr1 (33-85)||(6756469-6756521)
chr1 (429-509)||(10399676-10399758)
chr1 (9-108)||(16428570-16428669)
chr1 (33-108)||(12302770-12302849)
chr1 (32-107)||(17324902-17324976)
chr1 (31-103)||(15669659-15669732)
chr1 (429-509)||(20302792-20302872)
chr1 (11-71)||(24325575-24325636)
chr1 (429-509)||(24326014-24326094)
chr1 (11-83)||(46432017-46432090)
chr1 (11-83)||(47906183-47906256)
chr1 (35-108)||(50307812-50307884)
chr1 (232-300)||(10115926-10115993)
chr1 (248-283)||(6824056-6824091)
chr1 (435-509)||(10116120-10116192)
chr1 (224-294)||(13785342-13785410)
chr1 (447-509)||(43104548-43104608)
chr1 (416-500)||(47451962-47452048)
chr1 (10-65)||(49958963-49959018)
chr1 (11-64)||(2510636-2510690)
chr1 (37-83)||(15295137-15295183)
chr1 (11-49)||(46782972-46783010)
chr1 (279-324)||(11693352-11693397)
chr1 (410-502)||(13433478-13433568)
chr1 (9-107)||(8349314-8349413)
chr1 (429-500)||(47177713-47177784)
[»] chr4 (179 HSPs)
chr4 (8-509)||(12102060-12102559)
chr4 (12-509)||(18534690-18535187)
chr4 (12-509)||(18537332-18537829)
chr4 (9-509)||(8756110-8756611)
chr4 (41-509)||(19322701-19323170)
chr4 (8-497)||(16185707-16186200)
chr4 (9-500)||(25357608-25358106)
chr4 (9-509)||(28453658-28454160)
chr4 (155-500)||(38890091-38890434)
chr4 (39-500)||(41997494-41997958)
chr4 (33-509)||(36378288-36378770)
chr4 (246-509)||(15032401-15032666)
chr4 (9-509)||(22800712-22801223)
chr4 (9-509)||(22802584-22803095)
chr4 (31-386)||(31983505-31983870)
chr4 (11-461)||(24878963-24879424)
chr4 (42-500)||(10112876-10113334)
chr4 (9-509)||(5198392-5198888)
chr4 (11-509)||(40091266-40091774)
chr4 (33-497)||(40637070-40637545)
chr4 (9-365)||(48486291-48486653)
chr4 (41-500)||(9863712-9864179)
chr4 (9-509)||(36919436-36919948)
chr4 (9-461)||(24880423-24880888)
chr4 (43-427)||(47150833-47151218)
chr4 (9-509)||(24888768-24889279)
chr4 (173-509)||(2891434-2891773)
chr4 (164-509)||(16453443-16453789)
chr4 (12-509)||(38928031-38928536)
chr4 (164-510)||(36380483-36380828)
chr4 (163-509)||(16455374-16455707)
chr4 (7-508)||(619306-619810)
chr4 (9-353)||(47274699-47275047)
chr4 (36-499)||(33415352-33415821)
chr4 (164-509)||(17662099-17662444)
chr4 (164-509)||(36921345-36921692)
chr4 (164-509)||(6764978-6765328)
chr4 (9-509)||(9173994-9174507)
chr4 (9-365)||(22044390-22044751)
chr4 (9-365)||(22046685-22047046)
chr4 (93-398)||(22295218-22295533)
chr4 (9-365)||(51015218-51015579)
chr4 (9-365)||(7941291-7941657)
chr4 (166-339)||(13544095-13544268)
chr4 (166-509)||(14787281-14787628)
chr4 (9-365)||(16934142-16934504)
chr4 (164-500)||(18409210-18409546)
chr4 (180-500)||(3982045-3982362)
chr4 (246-478)||(4215522-4215752)
chr4 (35-495)||(12395712-12396180)
chr4 (9-365)||(11434927-11435288)
chr4 (151-509)||(30136670-30137026)
chr4 (9-365)||(18847125-18847486)
chr4 (9-308)||(40999005-40999308)
chr4 (9-298)||(5637530-5637830)
chr4 (164-509)||(8631267-8631618)
chr4 (9-365)||(9148223-9148586)
chr4 (9-509)||(9176322-9176835)
chr4 (164-495)||(12400674-12401006)
chr4 (164-365)||(22782737-22782937)
chr4 (164-509)||(24348352-24348685)
chr4 (164-365)||(14633453-14633652)
chr4 (9-365)||(16931788-16932150)
chr4 (164-365)||(47868535-47868735)
chr4 (9-509)||(31849447-31849960)
chr4 (9-365)||(38409171-38409538)
chr4 (165-500)||(18709021-18709361)
chr4 (178-495)||(13547302-13547621)
chr4 (165-500)||(37312941-37313264)
chr4 (36-322)||(37313107-37313400)
chr4 (164-365)||(22780372-22780572)
chr4 (32-365)||(44599837-44600176)
chr4 (409-509)||(5664615-5664715)
chr4 (9-365)||(37089371-37089735)
chr4 (164-509)||(2484722-2485071)
chr4 (180-509)||(27499195-27499529)
chr4 (164-307)||(3824627-3824769)
chr4 (164-509)||(26085825-26086175)
chr4 (164-509)||(11006101-11006436)
chr4 (164-365)||(22132391-22132590)
chr4 (35-365)||(19095880-19096217)
chr4 (164-365)||(22134617-22134815)
chr4 (164-509)||(11008415-11008765)
chr4 (224-509)||(5635325-5635614)
chr4 (151-308)||(9022423-9022583)
chr4 (9-78)||(36921787-36921856)
chr4 (278-501)||(47563009-47563231)
chr4 (380-509)||(56030812-56030938)
chr4 (248-500)||(3578549-3578786)
chr4 (246-365)||(5101145-5101262)
chr4 (416-509)||(53405525-53405619)
chr4 (35-108)||(24446842-24446914)
chr4 (176-324)||(47210792-47210939)
chr4 (151-500)||(10114448-10114781)
chr4 (36-298)||(56030443-56030712)
chr4 (9-68)||(3824875-3824934)
chr4 (224-365)||(11437558-11437696)
chr4 (35-108)||(3937472-3937543)
chr4 (8-107)||(15032800-15032899)
chr4 (9-286)||(52942536-52942808)
chr4 (292-500)||(6133098-6133308)
chr4 (342-509)||(3937133-3937296)
chr4 (432-509)||(14789280-14789358)
chr4 (232-365)||(31300475-31300606)
chr4 (429-509)||(37089219-37089300)
chr4 (35-108)||(38270249-38270321)
chr4 (440-509)||(40998877-40998946)
chr4 (429-509)||(7941728-7941807)
chr4 (429-500)||(22046544-22046614)
chr4 (9-83)||(52043716-52043791)
chr4 (35-108)||(2891314-2891387)
chr4 (181-365)||(5336779-5336964)
chr4 (268-365)||(26557823-26557920)
chr4 (32-85)||(5100992-5101045)
chr4 (429-509)||(24446509-24446590)
chr4 (181-365)||(16638827-16639010)
chr4 (236-308)||(54928704-54928776)
chr4 (164-242)||(6133006-6133085)
chr4 (33-108)||(6764835-6764909)
chr4 (33-80)||(36380370-36380417)
chr4 (429-500)||(51015650-51015720)
chr4 (360-500)||(52043428-52043564)
chr4 (251-358)||(53405356-53405460)
chr4 (223-294)||(54906782-54906852)
chr4 (232-365)||(15317009-15317140)
chr4 (429-499)||(47210655-47210724)
chr4 (416-509)||(5101301-5101397)
chr4 (35-84)||(6132871-6132920)
chr4 (429-509)||(9148640-9148720)
chr4 (35-108)||(12401070-12401142)
chr4 (33-82)||(14633316-14633365)
chr4 (429-509)||(14633723-14633803)
chr4 (232-403)||(15831192-15831362)
chr4 (11-108)||(17662497-17662598)
chr4 (429-498)||(22134476-22134544)
chr4 (429-509)||(49088956-49089037)
chr4 (416-500)||(3824466-3824553)
chr4 (9-65)||(11006546-11006602)
chr4 (429-500)||(11435359-11435430)
chr4 (432-500)||(22044249-22044316)
chr4 (181-365)||(55822265-55822446)
chr4 (164-258)||(3937314-3937408)
chr4 (9-64)||(11008876-11008931)
chr4 (429-500)||(18847558-18847627)
chr4 (236-365)||(36769534-36769662)
chr4 (32-107)||(14787695-14787771)
chr4 (429-498)||(22132248-22132317)
chr4 (250-324)||(24446681-24446754)
chr4 (214-308)||(29609526-29609619)
chr4 (429-509)||(47868806-47868887)
chr4 (429-509)||(16931638-16931718)
chr4 (11-87)||(22132682-22132759)
chr4 (416-500)||(22782594-22782678)
chr4 (222-287)||(32274014-32274079)
chr4 (429-509)||(44599687-44599766)
chr4 (440-500)||(47078686-47078744)
chr4 (33-108)||(2485135-2485210)
chr4 (429-501)||(38409609-38409680)
chr4 (11-78)||(47211038-47211106)
chr4 (11-78)||(53405100-53405168)
chr4 (232-365)||(4558362-4558493)
chr4 (279-356)||(5516244-5516323)
chr4 (232-365)||(8529318-8529450)
chr4 (33-104)||(16453305-16453375)
chr4 (195-365)||(16489364-16489531)
chr4 (232-365)||(16688939-16689071)
chr4 (33-108)||(47868397-47868471)
chr4 (429-509)||(11437767-11437848)
chr4 (421-509)||(22780219-22780308)
chr4 (358-500)||(29609362-29609498)
chr4 (181-308)||(4570094-4570219)
chr4 (440-500)||(5516104-5516162)
chr4 (232-365)||(11853600-11853731)
chr4 (35-108)||(18409610-18409681)
chr4 (11-63)||(22134937-22134990)
chr4 (232-308)||(23001459-23001533)
chr4 (11-63)||(24348187-24348240)
chr4 (9-65)||(4569924-4569980)
chr4 (445-500)||(31983401-31983454)
[»] chr5 (149 HSPs)
chr5 (35-509)||(36208524-36209000)
chr5 (40-509)||(6661044-6661512)
chr5 (213-500)||(15445135-15445417)
chr5 (151-509)||(20053910-20054259)
chr5 (33-500)||(40221464-40221946)
chr5 (33-501)||(17818351-17818826)
chr5 (164-501)||(695958-696293)
chr5 (36-509)||(9020167-9020642)
chr5 (148-427)||(15143529-15143809)
chr5 (32-509)||(18596588-18597072)
chr5 (9-508)||(2818186-2818697)
chr5 (164-509)||(18511063-18511411)
chr5 (9-509)||(21947945-21948461)
chr5 (164-509)||(658211-658552)
chr5 (9-365)||(25921472-25921834)
chr5 (9-509)||(38882023-38882518)
chr5 (164-495)||(20505709-20506040)
chr5 (164-509)||(1189461-1189808)
chr5 (9-356)||(4236547-4236900)
chr5 (9-509)||(36402177-36402688)
chr5 (151-353)||(17413176-17413380)
chr5 (35-478)||(25904047-25904498)
chr5 (9-365)||(31179370-31179732)
chr5 (35-478)||(17072827-17073282)
chr5 (164-356)||(25804105-25804295)
chr5 (33-501)||(37705643-37706117)
chr5 (164-509)||(27912616-27912968)
chr5 (164-509)||(34476901-34477253)
chr5 (164-365)||(34479417-34479618)
chr5 (164-509)||(6745148-6745500)
chr5 (164-365)||(16092198-16092399)
chr5 (164-509)||(10586912-10587245)
chr5 (9-365)||(2174837-2175198)
chr5 (9-509)||(6756412-6756920)
chr5 (35-393)||(24126800-24127165)
chr5 (9-365)||(31544998-31545360)
chr5 (75-394)||(4897710-4898039)
chr5 (38-508)||(10474176-10474655)
chr5 (9-500)||(16776075-16776577)
chr5 (35-308)||(34530721-34531001)
chr5 (9-498)||(31542653-31543153)
chr5 (164-365)||(10529098-10529298)
chr5 (164-495)||(6747385-6747721)
chr5 (164-509)||(18469091-18469441)
chr5 (164-478)||(18509201-18509517)
chr5 (164-509)||(39854563-39854914)
chr5 (151-500)||(2144438-2144778)
chr5 (164-509)||(27910530-27910865)
chr5 (164-509)||(2954497-2954842)
chr5 (164-509)||(18466764-18467116)
chr5 (252-500)||(2724061-2724310)
chr5 (32-478)||(26097674-26098126)
chr5 (164-509)||(39798127-39798461)
chr5 (164-365)||(15552325-15552525)
chr5 (35-354)||(31472622-31472948)
chr5 (164-509)||(41585587-41585943)
chr5 (9-298)||(31466044-31466339)
chr5 (151-365)||(34033565-34033783)
chr5 (164-509)||(4410103-4410451)
chr5 (9-93)||(12556200-12556284)
chr5 (9-108)||(20507725-20507823)
chr5 (180-365)||(10749796-10749980)
chr5 (164-354)||(39398003-39398192)
chr5 (180-509)||(38959979-38960314)
chr5 (180-365)||(23665140-23665323)
chr5 (180-365)||(23793264-23793447)
chr5 (213-298)||(42770940-42771024)
chr5 (429-509)||(4236979-4237058)
chr5 (35-241)||(20042994-20043208)
chr5 (164-365)||(21684451-21684650)
chr5 (222-365)||(13295878-13296018)
chr5 (151-391)||(15224735-15224983)
chr5 (35-88)||(2723911-2723964)
chr5 (197-365)||(3373136-3373301)
chr5 (180-365)||(10757273-10757456)
chr5 (276-509)||(21288953-21289186)
chr5 (429-509)||(21684301-21684380)
chr5 (272-496)||(26098152-26098380)
chr5 (9-103)||(42770691-42770785)
chr5 (335-478)||(42771028-42771165)
chr5 (196-365)||(23741858-23742023)
chr5 (9-71)||(39798006-39798068)
chr5 (180-365)||(15354574-15354757)
chr5 (32-93)||(26098528-26098589)
chr5 (429-509)||(34530566-34530647)
chr5 (226-365)||(35430322-35430462)
chr5 (429-492)||(20045332-20045395)
chr5 (32-107)||(41585970-41586044)
chr5 (151-307)||(4754220-4754377)
chr5 (9-83)||(21684748-21684822)
chr5 (429-508)||(25804375-25804455)
chr5 (8-83)||(2144878-2144955)
chr5 (180-365)||(15356850-15357033)
chr5 (429-509)||(34479266-34479346)
chr5 (416-500)||(15552584-15552667)
chr5 (429-509)||(25921322-25921401)
chr5 (41-128)||(15143437-15143527)
chr5 (35-242)||(20044954-20045169)
chr5 (10-65)||(29748260-29748315)
chr5 (33-108)||(39854426-39854499)
chr5 (181-266)||(10627364-10627449)
chr5 (232-365)||(16093291-16093422)
chr5 (328-495)||(20043234-20043402)
chr5 (35-108)||(695833-695905)
chr5 (35-108)||(1189872-1189949)
chr5 (429-501)||(10528954-10529026)
chr5 (254-303)||(20045210-20045259)
chr5 (429-509)||(31179220-31179300)
chr5 (35-108)||(39398256-39398327)
chr5 (432-496)||(2175255-2175318)
chr5 (432-496)||(12555779-12555843)
chr5 (33-108)||(10529362-10529436)
chr5 (9-64)||(34477378-34477433)
chr5 (232-365)||(42238311-42238443)
chr5 (181-266)||(31782554-31782639)
chr5 (11-79)||(3373332-3373401)
chr5 (429-509)||(10750050-10750130)
chr5 (429-509)||(10757526-10757606)
chr5 (11-83)||(15552154-15552227)
chr5 (11-83)||(27910364-27910437)
chr5 (11-83)||(27912449-27912522)
chr5 (11-78)||(10586758-10586826)
chr5 (195-365)||(22672849-22673017)
chr5 (416-500)||(31465850-31465937)
chr5 (232-365)||(17841248-17841380)
chr5 (42-85)||(21288715-21288758)
chr5 (181-263)||(26406573-26406655)
chr5 (9-64)||(34479739-34479794)
chr5 (181-365)||(35385451-35385634)
chr5 (227-339)||(1240474-1240585)
chr5 (429-509)||(3372984-3373065)
chr5 (33-108)||(4409999-4410077)
chr5 (110-162)||(15445482-15445531)
chr5 (11-64)||(25803935-25803989)
chr5 (232-365)||(1170862-1170993)
chr5 (11-108)||(18466599-18466700)
chr5 (11-63)||(18468926-18468979)
chr5 (37-107)||(18509582-18509652)
chr5 (37-107)||(18511476-18511547)
chr5 (9-78)||(23665056-23665125)
chr5 (9-78)||(23793462-23793531)
chr5 (234-365)||(28786457-28786587)
chr5 (224-292)||(32520579-32520645)
chr5 (406-500)||(5777635-5777728)
chr5 (429-500)||(15354431-15354502)
chr5 (429-500)||(15356707-15356778)
chr5 (429-500)||(23665396-23665467)
chr5 (429-500)||(23741714-23741785)
chr5 (429-500)||(23793120-23793191)
[»] chr6 (118 HSPs)
chr6 (8-502)||(19696393-19696889)
chr6 (35-500)||(26945127-26945593)
chr6 (8-398)||(12186036-12186432)
chr6 (31-500)||(3027720-3028189)
chr6 (151-433)||(22857887-22858167)
chr6 (35-509)||(24338302-24338783)
chr6 (41-509)||(17012029-17012495)
chr6 (9-509)||(9019879-9020391)
chr6 (151-509)||(15367134-15367491)
chr6 (43-383)||(25078538-25078879)
chr6 (9-384)||(16455404-16455785)
chr6 (166-509)||(14466440-14466784)
chr6 (37-509)||(3631791-3632271)
chr6 (35-509)||(3629718-3630199)
chr6 (9-509)||(11982879-11983390)
chr6 (151-509)||(15719745-15720098)
chr6 (35-509)||(13057173-13057652)
chr6 (246-509)||(25465451-25465708)
chr6 (248-509)||(15346546-15346806)
chr6 (9-388)||(12937169-12937559)
chr6 (130-365)||(28037724-28037964)
chr6 (235-500)||(28078064-28078323)
chr6 (173-477)||(1069603-1069909)
chr6 (9-354)||(32279950-32280301)
chr6 (9-500)||(30728686-30729189)
chr6 (9-509)||(14507025-14507536)
chr6 (31-324)||(3390354-3390654)
chr6 (9-298)||(15541205-15541501)
chr6 (11-356)||(12195523-12195875)
chr6 (35-365)||(13039733-13040070)
chr6 (164-500)||(26932420-26932761)
chr6 (12-321)||(15530166-15530480)
chr6 (223-360)||(30445698-30445836)
chr6 (9-345)||(15532700-15533042)
chr6 (164-500)||(4816088-4816430)
chr6 (9-388)||(12911421-12911812)
chr6 (164-365)||(19704566-19704768)
chr6 (164-509)||(2628734-2629084)
chr6 (9-108)||(1072140-1072238)
chr6 (164-365)||(1230248-1230448)
chr6 (35-293)||(25477253-25477518)
chr6 (164-365)||(30967316-30967516)
chr6 (164-365)||(5273215-5273415)
chr6 (164-365)||(20915355-20915555)
chr6 (151-308)||(20526907-20527064)
chr6 (174-365)||(14458766-14458956)
chr6 (35-393)||(12161528-12161889)
chr6 (33-509)||(28241170-28241658)
chr6 (164-365)||(26065098-26065296)
chr6 (164-365)||(26085067-26085265)
chr6 (164-355)||(3233739-3233929)
chr6 (9-108)||(8995432-8995530)
chr6 (164-365)||(30034602-30034802)
chr6 (173-310)||(22490764-22490901)
chr6 (187-384)||(11262594-11262794)
chr6 (12-92)||(15346347-15346427)
chr6 (9-242)||(19227528-19227769)
chr6 (180-365)||(26066123-26066307)
chr6 (180-365)||(26068394-26068578)
chr6 (180-365)||(33308988-33309171)
chr6 (32-107)||(17852518-17852592)
chr6 (268-509)||(22869957-22870196)
chr6 (180-365)||(29754708-29754892)
chr6 (35-108)||(32447579-32447651)
chr6 (180-365)||(33311257-33311440)
chr6 (233-308)||(3833460-3833536)
chr6 (436-502)||(6610376-6610440)
chr6 (35-86)||(10584105-10584156)
chr6 (445-507)||(22611069-22611129)
chr6 (232-365)||(3577489-3577620)
chr6 (31-109)||(25466432-25466509)
chr6 (166-302)||(11138423-11138562)
chr6 (12-92)||(15366992-15367079)
chr6 (429-509)||(29754556-29754636)
chr6 (416-509)||(30034454-30034544)
chr6 (432-500)||(18322482-18322549)
chr6 (429-509)||(30967587-30967666)
chr6 (9-83)||(4816532-4816606)
chr6 (35-93)||(22490618-22490676)
chr6 (432-509)||(1230097-1230173)
chr6 (35-108)||(3233994-3234065)
chr6 (233-294)||(7542452-7542512)
chr6 (35-108)||(14466312-14466384)
chr6 (429-509)||(26065968-26066048)
chr6 (429-509)||(26068242-26068322)
chr6 (11-108)||(30034866-30034967)
chr6 (429-509)||(33309242-33309322)
chr6 (429-509)||(33311511-33311591)
chr6 (416-509)||(12195361-12195455)
chr6 (9-64)||(20915664-20915719)
chr6 (42-108)||(14459028-14459093)
chr6 (9-79)||(26066319-26066389)
chr6 (9-79)||(26068590-26068660)
chr6 (335-393)||(26455128-26455186)
chr6 (432-500)||(5273073-5273141)
chr6 (429-499)||(19704422-19704493)
chr6 (11-63)||(28038012-28038065)
chr6 (195-312)||(5165866-5165982)
chr6 (222-308)||(6843306-6843391)
chr6 (233-312)||(17904402-17904479)
chr6 (432-500)||(20915214-20915281)
chr6 (232-396)||(35201295-35201457)
chr6 (33-108)||(1230512-1230586)
chr6 (443-509)||(8717202-8717268)
chr6 (281-355)||(10584227-10584301)
chr6 (42-85)||(13870706-13870749)
chr6 (232-365)||(25465898-25466030)
chr6 (232-365)||(25941720-25941852)
chr6 (429-509)||(3394748-3394830)
chr6 (227-339)||(22351877-22351988)
chr6 (11-83)||(2629177-2629250)
chr6 (440-500)||(3918767-3918825)
chr6 (290-500)||(7294035-7294243)
chr6 (232-365)||(13878778-13878909)
chr6 (232-365)||(16785970-16786101)
chr6 (227-365)||(22342800-22342937)
chr6 (232-365)||(26887226-26887355)
chr6 (294-365)||(30443532-30443604)
[»] chr7 (152 HSPs)
chr7 (8-500)||(7188469-7188961)
chr7 (9-509)||(27306083-27306590)
chr7 (37-509)||(24817210-24817682)
chr7 (13-501)||(31434909-31435404)
chr7 (151-507)||(24813357-24813710)
chr7 (164-509)||(27832495-27832832)
chr7 (35-501)||(24748548-24749018)
chr7 (31-382)||(6332176-6332529)
chr7 (35-495)||(44724533-44725000)
chr7 (164-509)||(20626128-20626474)
chr7 (164-509)||(20630019-20630365)
chr7 (164-509)||(20642438-20642784)
chr7 (247-500)||(26295620-26295868)
chr7 (32-509)||(42330853-42331337)
chr7 (12-398)||(20137074-20137467)
chr7 (32-509)||(13099324-13099814)
chr7 (9-365)||(44492-44854)
chr7 (36-509)||(24465503-24465968)
chr7 (9-365)||(35557-35919)
chr7 (9-298)||(20091610-20091903)
chr7 (166-507)||(9679151-9679495)
chr7 (32-496)||(443546-444021)
chr7 (35-509)||(4295788-4296271)
chr7 (246-473)||(22393894-22394119)
chr7 (9-365)||(1049295-1049656)
chr7 (101-388)||(40281358-40281643)
chr7 (166-458)||(16296932-16297222)
chr7 (35-509)||(21678020-21678499)
chr7 (12-500)||(11355189-11355687)
chr7 (35-492)||(39145856-39146322)
chr7 (87-398)||(11081517-11081835)
chr7 (164-308)||(25276231-25276375)
chr7 (164-496)||(37411988-37412326)
chr7 (9-365)||(3878499-3878867)
chr7 (164-492)||(21990240-21990570)
chr7 (9-365)||(40836742-40837103)
chr7 (164-495)||(9680910-9681243)
chr7 (35-509)||(21679981-21680465)
chr7 (164-365)||(7092212-7092411)
chr7 (164-356)||(20297452-20297643)
chr7 (164-478)||(21592028-21592342)
chr7 (11-365)||(31155910-31156271)
chr7 (164-509)||(48457743-48458093)
chr7 (31-305)||(22828691-22828972)
chr7 (164-365)||(38394076-38394276)
chr7 (224-365)||(6046644-6046785)
chr7 (37-365)||(7471979-7472317)
chr7 (37-365)||(7470021-7470359)
chr7 (164-365)||(20299550-20299750)
chr7 (203-496)||(6348912-6349215)
chr7 (164-382)||(24258553-24258774)
chr7 (11-340)||(7349296-7349639)
chr7 (164-365)||(3035811-3036014)
chr7 (164-365)||(18345631-18345831)
chr7 (164-500)||(7351509-7351851)
chr7 (164-307)||(11757320-11757462)
chr7 (9-93)||(22392401-22392485)
chr7 (9-365)||(25542459-25542818)
chr7 (164-365)||(1046924-1047123)
chr7 (164-365)||(28487643-28487843)
chr7 (164-356)||(7094468-7094659)
chr7 (326-486)||(20091036-20091193)
chr7 (19-307)||(22251602-22251893)
chr7 (232-392)||(13290445-13290605)
chr7 (164-509)||(43253365-43253716)
chr7 (164-365)||(1850071-1850271)
chr7 (180-509)||(2935374-2935709)
chr7 (13-108)||(18567545-18567639)
chr7 (164-365)||(38396725-38396924)
chr7 (164-509)||(40946418-40946770)
chr7 (31-128)||(30906292-30906389)
chr7 (164-500)||(42223248-42223583)
chr7 (180-509)||(9027041-9027376)
chr7 (9-108)||(26804501-26804595)
chr7 (151-509)||(6048946-6049303)
chr7 (164-298)||(28485656-28485790)
chr7 (180-365)||(22108173-22108356)
chr7 (180-365)||(40549933-40550116)
chr7 (180-365)||(1606486-1606669)
chr7 (197-365)||(6067197-6067365)
chr7 (180-365)||(22137184-22137367)
chr7 (180-365)||(40552211-40552394)
chr7 (429-509)||(11759488-11759568)
chr7 (429-509)||(20297723-20297803)
chr7 (429-509)||(28487914-28487994)
chr7 (429-509)||(38394347-38394427)
chr7 (429-509)||(7092061-7092141)
chr7 (429-509)||(7094308-7094388)
chr7 (164-267)||(26804662-26804765)
chr7 (433-509)||(38397004-38397079)
chr7 (429-500)||(7471838-7471908)
chr7 (429-500)||(20299821-20299891)
chr7 (429-499)||(35990-36059)
chr7 (429-509)||(44925-45005)
chr7 (432-499)||(1850345-1850411)
chr7 (36-107)||(21990106-21990175)
chr7 (151-302)||(26210616-26210770)
chr7 (36-107)||(37412392-37412462)
chr7 (429-500)||(40836601-40836671)
chr7 (35-82)||(42223110-42223157)
chr7 (11-83)||(1606399-1606472)
chr7 (429-509)||(1606740-1606820)
chr7 (429-509)||(3036085-3036165)
chr7 (429-509)||(25542889-25542969)
chr7 (429-509)||(28485926-28486006)
chr7 (416-500)||(1046775-1046861)
chr7 (416-500)||(7349135-7349218)
chr7 (232-365)||(25351404-25351534)
chr7 (9-61)||(45366474-45366526)
chr7 (416-496)||(1049151-1049232)
chr7 (155-245)||(11084456-11084547)
chr7 (258-305)||(22280397-22280444)
chr7 (151-221)||(22392539-22392609)
chr7 (41-108)||(24258423-24258489)
chr7 (232-365)||(25410181-25410313)
chr7 (228-365)||(44010749-44010885)
chr7 (429-499)||(26804867-26804937)
chr7 (232-365)||(44512525-44512656)
chr7 (11-108)||(3035646-3035747)
chr7 (232-393)||(3320022-3320181)
chr7 (232-393)||(3324770-3324929)
chr7 (429-478)||(18345902-18345951)
chr7 (35-108)||(25276095-25276167)
chr7 (232-307)||(25357098-25357169)
chr7 (11-108)||(38393911-38394012)
chr7 (11-83)||(43253811-43253884)
chr7 (9-83)||(6048599-6048675)
chr7 (35-78)||(9680768-9680812)
chr7 (41-107)||(6348778-6348845)
chr7 (236-365)||(7464518-7464646)
chr7 (432-495)||(22251452-22251515)
chr7 (429-509)||(3878939-3879020)
chr7 (37-87)||(7092462-7092512)
chr7 (11-64)||(11757153-11757207)
chr7 (11-64)||(18345466-18345520)
chr7 (181-364)||(21369642-21369824)
chr7 (11-64)||(28485491-28485545)
chr7 (11-64)||(38396215-38396269)
chr7 (9-51)||(42006493-42006535)
chr7 (448-509)||(1502823-1502883)
chr7 (11-83)||(1849894-1849967)
chr7 (36-85)||(3677235-3677284)
chr7 (429-509)||(7469871-7469950)
chr7 (9-78)||(22108089-22108158)
chr7 (9-78)||(22137100-22137169)
chr7 (232-365)||(25405444-25405575)
chr7 (9-78)||(40549849-40549918)
chr7 (9-78)||(40552127-40552196)
chr7 (32-64)||(20299405-20299437)
chr7 (429-500)||(22137439-22137510)
chr7 (429-500)||(40550189-40550260)
chr7 (429-500)||(40552466-40552537)
[»] chr8 (108 HSPs)
chr8 (8-503)||(31162185-31162686)
chr8 (66-509)||(3005493-3005931)
chr8 (12-509)||(13858341-13858842)
chr8 (151-509)||(21482434-21482791)
chr8 (11-509)||(15072686-15073195)
chr8 (12-509)||(14419042-14419549)
chr8 (151-398)||(31035240-31035490)
chr8 (246-509)||(2467986-2468247)
chr8 (31-393)||(6375985-6376354)
chr8 (35-509)||(27106754-27107232)
chr8 (151-509)||(15956081-15956436)
chr8 (151-509)||(21480626-21480983)
chr8 (151-510)||(31578139-31578491)
chr8 (9-500)||(14807725-14808234)
chr8 (9-500)||(28251428-28251928)
chr8 (164-501)||(30480364-30480702)
chr8 (9-509)||(15067955-15068465)
chr8 (36-502)||(36865538-36866014)
chr8 (164-509)||(25952656-25953003)
chr8 (31-393)||(27911011-27911376)
chr8 (31-393)||(27957430-27957795)
chr8 (247-500)||(15185581-15185831)
chr8 (9-509)||(27829271-27829783)
chr8 (9-365)||(4423992-4424354)
chr8 (9-509)||(27826960-27827472)
chr8 (151-295)||(31573794-31573939)
chr8 (164-365)||(32339445-32339645)
chr8 (164-509)||(15809354-15809704)
chr8 (232-388)||(16833753-16833909)
chr8 (33-498)||(1225164-1225626)
chr8 (164-500)||(43079738-43080079)
chr8 (164-365)||(3874146-3874346)
chr8 (9-509)||(18810682-18811195)
chr8 (9-500)||(17847502-17847985)
chr8 (164-365)||(28283220-28283418)
chr8 (11-108)||(3886181-3886277)
chr8 (9-93)||(2468375-2468459)
chr8 (35-355)||(5372185-5372512)
chr8 (195-500)||(41382830-41383137)
chr8 (164-500)||(43082109-43082450)
chr8 (164-365)||(608870-609070)
chr8 (164-365)||(43530251-43530451)
chr8 (164-365)||(22684652-22684855)
chr8 (9-365)||(44720817-44721179)
chr8 (164-460)||(41384880-41385180)
chr8 (195-391)||(3895988-3896186)
chr8 (35-274)||(14477276-14477522)
chr8 (9-324)||(18812867-18813176)
chr8 (35-108)||(35872641-35872713)
chr8 (11-108)||(12517287-12517385)
chr8 (11-340)||(24873204-24873547)
chr8 (35-108)||(33541651-33541723)
chr8 (164-509)||(24873046-24873380)
chr8 (326-398)||(31566523-31566595)
chr8 (227-302)||(33020963-33021039)
chr8 (164-298)||(181635-181771)
chr8 (33-108)||(26775199-26775273)
chr8 (32-107)||(41382670-41382744)
chr8 (32-93)||(181534-181595)
chr8 (266-500)||(33541272-33541507)
chr8 (12-108)||(5623001-5623096)
chr8 (9-80)||(15186000-15186072)
chr8 (33-88)||(14419779-14419834)
chr8 (429-500)||(43530522-43530592)
chr8 (432-509)||(14477655-14477733)
chr8 (432-509)||(28283069-28283146)
chr8 (429-509)||(4424425-4424505)
chr8 (35-108)||(25952521-25952593)
chr8 (35-108)||(30480766-30480838)
chr8 (429-509)||(32339716-32339796)
chr8 (429-509)||(35872308-35872389)
chr8 (429-500)||(3874400-3874470)
chr8 (223-382)||(33838902-33839062)
chr8 (9-83)||(21482297-21482370)
chr8 (429-509)||(3883443-3883523)
chr8 (429-498)||(44721250-44721318)
chr8 (181-365)||(17799423-17799606)
chr8 (236-365)||(23179560-23179688)
chr8 (32-107)||(41384742-41384815)
chr8 (32-108)||(43530121-43530200)
chr8 (445-509)||(16833954-16834017)
chr8 (9-78)||(31035042-31035111)
chr8 (232-368)||(33032705-33032840)
chr8 (250-324)||(35872480-35872553)
chr8 (271-324)||(14419732-14419785)
chr8 (232-365)||(28327959-28328090)
chr8 (232-365)||(28332682-28332813)
chr8 (11-108)||(32339280-32339381)
chr8 (432-509)||(609145-609223)
chr8 (232-365)||(16752523-16752653)
chr8 (181-403)||(4812449-4812669)
chr8 (164-242)||(33541508-33541587)
chr8 (181-266)||(2267120-2267205)
chr8 (464-510)||(2467886-2467932)
chr8 (11-64)||(3873981-3874035)
chr8 (418-499)||(11700834-11700913)
chr8 (181-308)||(13985136-13985262)
chr8 (11-64)||(15809190-15809244)
chr8 (31-180)||(16833612-16833753)
chr8 (429-509)||(18813288-18813369)
chr8 (33-83)||(22684953-22685003)
chr8 (11-64)||(28283531-28283585)
chr8 (232-365)||(16757267-16757398)
chr8 (232-365)||(25684694-25684825)
chr8 (435-500)||(27911486-27911550)
chr8 (435-500)||(27957905-27957969)
chr8 (470-502)||(3898939-3898971)
chr8 (429-500)||(22684510-22684581)
[»] chr3 (193 HSPs)
chr3 (35-509)||(31151271-31151747)
chr3 (151-507)||(561633-561987)
chr3 (9-509)||(23633357-23633855)
chr3 (31-509)||(53597161-53597637)
chr3 (12-509)||(28761294-28761784)
chr3 (166-500)||(36871167-36871497)
chr3 (32-500)||(53917523-53918000)
chr3 (32-509)||(53915345-53915832)
chr3 (35-501)||(1626542-1627016)
chr3 (33-509)||(4308129-4308616)
chr3 (151-509)||(17795306-17795662)
chr3 (151-509)||(19103746-19104102)
chr3 (164-509)||(36011887-36012236)
chr3 (35-500)||(880313-880785)
chr3 (33-507)||(43228213-43228696)
chr3 (35-509)||(5926616-5927097)
chr3 (164-509)||(27101029-27101378)
chr3 (32-509)||(1313331-1313815)
chr3 (117-500)||(1620329-1620707)
chr3 (9-509)||(24979605-24980119)
chr3 (9-509)||(45882837-45883350)
chr3 (246-391)||(24181522-24181668)
chr3 (35-509)||(3314608-3315093)
chr3 (9-509)||(18099017-18099529)
chr3 (9-500)||(32263898-32264402)
chr3 (36-509)||(43421267-43421747)
chr3 (151-509)||(25635428-25635781)
chr3 (151-361)||(13420186-13420395)
chr3 (35-509)||(43423315-43423796)
chr3 (9-365)||(11170302-11170664)
chr3 (9-509)||(10955874-10956386)
chr3 (9-509)||(18162562-18163073)
chr3 (164-509)||(42990364-42990710)
chr3 (11-509)||(458179-458695)
chr3 (164-509)||(43226145-43226488)
chr3 (157-509)||(14634298-14634647)
chr3 (11-509)||(455802-456318)
chr3 (164-500)||(4666574-4666911)
chr3 (11-509)||(746650-747170)
chr3 (164-509)||(9604454-9604804)
chr3 (9-509)||(18096747-18097260)
chr3 (9-298)||(22114368-22114664)
chr3 (164-509)||(6231861-6232201)
chr3 (164-500)||(6484420-6484756)
chr3 (9-365)||(10084386-10084752)
chr3 (35-509)||(28101855-28102335)
chr3 (9-187)||(1618836-1619018)
chr3 (9-365)||(10958320-10958682)
chr3 (164-500)||(32219144-32219485)
chr3 (9-365)||(38889937-38890300)
chr3 (166-501)||(53468312-53468651)
chr3 (9-365)||(3859426-3859787)
chr3 (9-365)||(5522624-5522974)
chr3 (9-356)||(6063452-6063807)
chr3 (11-500)||(12267836-12268323)
chr3 (9-509)||(6065640-6066156)
chr3 (164-354)||(51727015-51727204)
chr3 (164-365)||(25533502-25533702)
chr3 (247-509)||(25634030-25634287)
chr3 (9-509)||(5191551-5192061)
chr3 (164-509)||(1321539-1321890)
chr3 (41-307)||(6561740-6562014)
chr3 (32-478)||(51943292-51943748)
chr3 (246-501)||(27635514-27635773)
chr3 (9-478)||(26720446-26720927)
chr3 (32-187)||(11007853-11008011)
chr3 (164-356)||(25688166-25688358)
chr3 (164-298)||(39715529-39715663)
chr3 (35-356)||(889779-890104)
chr3 (164-365)||(10621527-10621727)
chr3 (246-509)||(47701527-47701786)
chr3 (9-108)||(1321339-1321437)
chr3 (163-460)||(47148795-47149092)
chr3 (246-509)||(3306903-3307169)
chr3 (11-365)||(10191307-10191670)
chr3 (9-107)||(15780758-15780855)
chr3 (9-269)||(35777319-35777587)
chr3 (9-106)||(24177177-24177274)
chr3 (164-501)||(51674625-51674963)
chr3 (164-365)||(30005901-30006101)
chr3 (9-365)||(50493897-50494259)
chr3 (31-286)||(23636947-23637205)
chr3 (164-365)||(25388966-25389165)
chr3 (164-324)||(29956746-29956905)
chr3 (164-365)||(38210430-38210630)
chr3 (164-340)||(28413053-28413229)
chr3 (9-93)||(48361945-48362029)
chr3 (11-365)||(4103893-4104257)
chr3 (9-108)||(11163048-11163146)
chr3 (163-314)||(54884214-54884364)
chr3 (164-365)||(7606585-7606784)
chr3 (35-339)||(53591119-53591418)
chr3 (151-388)||(1674019-1674248)
chr3 (164-509)||(15780931-15781286)
chr3 (164-509)||(4103743-4104092)
chr3 (416-509)||(41849371-41849463)
chr3 (165-500)||(5886261-5886599)
chr3 (165-365)||(5899734-5899931)
chr3 (225-394)||(7768692-7768861)
chr3 (168-339)||(11168165-11168336)
chr3 (164-308)||(35917997-35918140)
chr3 (224-365)||(46966647-46966787)
chr3 (35-93)||(28180948-28181006)
chr3 (227-302)||(42297721-42297798)
chr3 (195-346)||(11007538-11007680)
chr3 (35-108)||(47701856-47701928)
chr3 (433-509)||(10958170-10958245)
chr3 (421-509)||(42992704-42992792)
chr3 (9-108)||(32218993-32219091)
chr3 (431-505)||(10084240-10084313)
chr3 (9-63)||(13893291-13893345)
chr3 (416-509)||(22114150-22114243)
chr3 (237-394)||(31021130-31021286)
chr3 (431-504)||(10191164-10191236)
chr3 (429-509)||(11168432-11168512)
chr3 (436-509)||(24181669-24181742)
chr3 (35-108)||(28137556-28137628)
chr3 (429-509)||(53893900-53893980)
chr3 (36-108)||(3306724-3306795)
chr3 (33-93)||(6484307-6484367)
chr3 (151-309)||(13419926-13420085)
chr3 (33-85)||(39715392-39715444)
chr3 (9-65)||(46966938-46966994)
chr3 (35-107)||(53468717-53468788)
chr3 (33-108)||(43226008-43226082)
chr3 (164-298)||(54691637-54691771)
chr3 (9-83)||(6719396-6719470)
chr3 (36-93)||(6231374-6231431)
chr3 (233-365)||(15823646-15823778)
chr3 (236-391)||(27420784-27420938)
chr3 (35-108)||(28100302-28100374)
chr3 (35-108)||(36011751-36011823)
chr3 (164-295)||(48361737-48361868)
chr3 (36-108)||(51675016-51675087)
chr3 (429-500)||(25389238-25389308)
chr3 (36-107)||(27635889-27635959)
chr3 (232-365)||(47878170-47878302)
chr3 (33-108)||(51727267-51727341)
chr3 (409-509)||(880091-880195)
chr3 (416-509)||(5522473-5522566)
chr3 (232-365)||(54188560-54188691)
chr3 (35-85)||(54691856-54691906)
chr3 (181-365)||(4535614-4535798)
chr3 (35-72)||(4663843-4663880)
chr3 (9-66)||(5886183-5886240)
chr3 (9-66)||(5899658-5899715)
chr3 (416-509)||(10621373-10621468)
chr3 (429-509)||(25533756-25533835)
chr3 (166-242)||(28137424-28137501)
chr3 (232-365)||(29913954-29914084)
chr3 (11-83)||(41849041-41849114)
chr3 (429-509)||(50494330-50494410)
chr3 (429-509)||(51726854-51726933)
chr3 (164-259)||(28100143-28100238)
chr3 (9-85)||(53896479-53896555)
chr3 (258-301)||(4560352-4560395)
chr3 (9-64)||(25388796-25388851)
chr3 (429-500)||(28181330-28181400)
chr3 (33-108)||(35918210-35918284)
chr3 (31-93)||(4560540-4560602)
chr3 (181-365)||(16996875-16997060)
chr3 (416-509)||(28412877-28412969)
chr3 (252-365)||(42992418-42992530)
chr3 (35-89)||(54884081-54884135)
chr3 (429-509)||(7606450-7606530)
chr3 (429-509)||(11170701-11170781)
chr3 (232-382)||(10612761-10612909)
chr3 (195-308)||(13893477-13893589)
chr3 (9-65)||(26762863-26762919)
chr3 (416-500)||(5899988-5900072)
chr3 (232-365)||(10897056-10897188)
chr3 (222-308)||(26763081-26763169)
chr3 (164-242)||(28181082-28181161)
chr3 (9-64)||(38210266-38210321)
chr3 (429-499)||(38890371-38890441)
chr3 (9-70)||(562060-562122)
chr3 (11-64)||(10621846-10621900)
chr3 (222-308)||(53973733-53973819)
chr3 (232-365)||(10094074-10094205)
chr3 (232-365)||(10208000-10208131)
chr3 (232-339)||(11079568-11079674)
chr3 (31-104)||(13420437-13420509)
chr3 (232-365)||(27544324-27544455)
chr3 (8-83)||(31021431-31021508)
chr3 (429-509)||(38210702-38210782)
chr3 (11-63)||(42990181-42990234)
chr3 (429-478)||(53591509-53591558)
chr3 (235-365)||(10949259-10949388)
chr3 (227-294)||(23941887-23941952)
chr3 (32-64)||(25533355-25533387)
chr3 (10-65)||(25635318-25635374)
chr3 (195-365)||(27761985-27762153)
chr3 (432-476)||(54691457-54691501)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (151-509)||(1500-1855)
scaffold0468 (44-107)||(1895-1958)
[»] chr2 (112 HSPs)
chr2 (8-509)||(13828184-13828702)
chr2 (31-490)||(17897125-17897581)
chr2 (10-500)||(11577975-11578465)
chr2 (13-509)||(6258669-6259172)
chr2 (168-509)||(28459045-28459385)
chr2 (153-509)||(40699419-40699771)
chr2 (224-478)||(31732667-31732915)
chr2 (9-365)||(18800312-18800663)
chr2 (9-509)||(35107194-35107694)
chr2 (9-509)||(6264000-6264506)
chr2 (9-365)||(40032052-40032419)
chr2 (9-365)||(42064409-42064771)
chr2 (35-509)||(14837193-14837672)
chr2 (151-500)||(20146476-20146821)
chr2 (326-500)||(20592296-20592466)
chr2 (87-305)||(20589662-20589888)
chr2 (11-509)||(22287188-22287695)
chr2 (35-500)||(19007560-19008033)
chr2 (9-365)||(19502010-19502372)
chr2 (9-365)||(27104693-27105053)
chr2 (35-500)||(17849037-17849510)
chr2 (11-365)||(42452678-42453036)
chr2 (9-365)||(19504345-19504706)
chr2 (164-478)||(5375229-5375544)
chr2 (9-509)||(21520541-21521056)
chr2 (9-509)||(43623430-43623929)
chr2 (151-462)||(27136031-27136338)
chr2 (35-365)||(11739558-11739895)
chr2 (9-365)||(13910044-13910405)
chr2 (164-495)||(42923373-42923708)
chr2 (164-500)||(28196693-28197028)
chr2 (164-478)||(17848500-17848810)
chr2 (151-509)||(22874174-22874512)
chr2 (164-365)||(23452236-23452436)
chr2 (164-365)||(35217962-35218162)
chr2 (33-509)||(45279849-45280322)
chr2 (195-392)||(33604009-33604206)
chr2 (8-509)||(35028472-35028967)
chr2 (36-286)||(15539552-15539809)
chr2 (9-365)||(24162222-24162573)
chr2 (164-365)||(35215585-35215785)
chr2 (164-339)||(45239001-45239176)
chr2 (43-308)||(34979634-34979906)
chr2 (246-456)||(22407360-22407571)
chr2 (164-497)||(3022219-3022562)
chr2 (151-365)||(43139417-43139631)
chr2 (246-478)||(7462829-7463065)
chr2 (247-509)||(37962798-37963055)
chr2 (164-365)||(44289066-44289267)
chr2 (180-365)||(36558863-36559047)
chr2 (180-365)||(36561140-36561324)
chr2 (224-308)||(15694020-15694104)
chr2 (9-108)||(22407672-22407770)
chr2 (9-107)||(12342673-12342771)
chr2 (246-501)||(22707612-22707870)
chr2 (180-365)||(45332180-45332364)
chr2 (180-352)||(17921769-17921940)
chr2 (416-509)||(19501850-19501943)
chr2 (416-509)||(19504185-19504278)
chr2 (31-108)||(37963190-37963266)
chr2 (429-509)||(27105124-27105205)
chr2 (274-478)||(22162908-22163111)
chr2 (35-93)||(22163224-22163282)
chr2 (429-509)||(23452085-23452165)
chr2 (35-108)||(31733028-31733100)
chr2 (429-509)||(36560988-36561068)
chr2 (8-83)||(40699202-40699278)
chr2 (429-509)||(42453804-42453883)
chr2 (429-500)||(38020402-38020473)
chr2 (429-509)||(36558728-36558808)
chr2 (326-427)||(8173548-8173646)
chr2 (12-108)||(28196534-28196629)
chr2 (9-65)||(28462591-28462647)
chr2 (38-80)||(3022086-3022128)
chr2 (248-298)||(23870956-23871006)
chr2 (224-292)||(30720684-30720750)
chr2 (36-85)||(38020064-38020113)
chr2 (181-393)||(39680045-39680255)
chr2 (224-308)||(41303089-41303171)
chr2 (429-496)||(13909907-13909973)
chr2 (33-108)||(22874060-22874134)
chr2 (429-500)||(35217827-35217897)
chr2 (36-78)||(20147040-20147082)
chr2 (10-83)||(20589555-20589629)
chr2 (181-266)||(28458925-28459011)
chr2 (445-502)||(33604255-33604310)
chr2 (429-495)||(34979456-34979522)
chr2 (32-107)||(42923773-42923849)
chr2 (181-365)||(2736205-2736387)
chr2 (232-307)||(17932685-17932756)
chr2 (232-307)||(17943588-17943659)
chr2 (232-365)||(39687034-39687165)
chr2 (10-63)||(45156946-45156999)
chr2 (232-339)||(37170778-37170883)
chr2 (31-78)||(20146899-20146946)
chr2 (232-365)||(27517638-27517770)
chr2 (224-308)||(30261830-30261910)
chr2 (278-364)||(39287262-39287349)
chr2 (409-496)||(15539396-15539484)
chr2 (443-500)||(15697376-15697431)
chr2 (12-85)||(17848342-17848413)
chr2 (11-64)||(23452547-23452601)
chr2 (438-500)||(35215450-35215511)
chr2 (11-64)||(35215902-35215956)
chr2 (432-497)||(24162084-24162148)
chr2 (8-61)||(33603817-33603870)
chr2 (91-128)||(40699391-40699428)
chr2 (429-478)||(42064825-42064874)
chr2 (232-365)||(45679774-45679905)
chr2 (100-139)||(33603905-33603945)
chr2 (233-308)||(41304504-41304577)
chr2 (438-509)||(45332027-45332098)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (8-468)||(15723-16181)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (31-509)||(16508-16986)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (41-500)||(4773-5230)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (164-509)||(14238-14581)
scaffold0131 (9-308)||(14946-15251)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (9-353)||(3924-4272)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (9-509)||(69140-69656)
scaffold0025 (9-108)||(73286-73388)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (164-509)||(85319-85666)
scaffold0045 (12-82)||(85161-85231)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (32-500)||(79135-79614)
[»] scaffold0005 (6 HSPs)
scaffold0005 (166-509)||(52102-52449)
scaffold0005 (164-365)||(183640-183839)
scaffold0005 (432-509)||(50372-50450)
scaffold0005 (429-509)||(183489-183569)
scaffold0005 (33-82)||(183927-183976)
scaffold0005 (32-107)||(51959-52035)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (9-509)||(2807-3318)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (32-509)||(11321-11811)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (164-509)||(79949-80298)
scaffold0004 (12-128)||(79789-79906)
[»] scaffold0472 (2 HSPs)
scaffold0472 (9-355)||(6126-6478)
scaffold0472 (429-509)||(6558-6639)
[»] scaffold0267 (2 HSPs)
scaffold0267 (164-365)||(130-330)
scaffold0267 (429-499)||(385-455)
[»] scaffold0370 (2 HSPs)
scaffold0370 (164-365)||(1452-1651)
scaffold0370 (432-500)||(1310-1377)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (33-509)||(41332-41820)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (224-398)||(57395-57568)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (164-298)||(2130-2264)
[»] scaffold0068 (3 HSPs)
scaffold0068 (164-365)||(29260-29459)
scaffold0068 (429-509)||(29530-29609)
scaffold0068 (9-83)||(29088-29162)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (416-509)||(12722-12815)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (180-365)||(22221-22404)
scaffold0140 (180-365)||(24496-24679)
scaffold0140 (429-500)||(24751-24822)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (33-108)||(1094-1168)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (298-509)||(35816-36032)
scaffold0011 (35-64)||(35593-35622)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (429-509)||(1299-1379)
[»] scaffold0474 (1 HSPs)
scaffold0474 (222-297)||(10749-10822)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (232-393)||(16376-16534)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 501; Significance: 0; HSPs: 150)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 30790757 - 30790257
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790757 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 30790658  T
Q  109 caaacaataaactagggttttagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatgagtcttttggtt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790657 caaacaataaactagggttttagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatgagtcttttggtt 30790558  T
Q  209 acgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790557 acgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 30790458  T
Q  309 tggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790457 tggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta 30790358  T
Q  409 tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790357 tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaat 30790258  T
Q  509 t 509  Q
    |    
T  30790257 t 30790257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15669608 - 15669253
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||    
T  15669608 acactagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggag 15669510  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggac 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  15669509 acttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccgagactaggtcagttttagac 15669410  T
Q  349 cgaactggataaacaaaattcg-tgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgtttt 446  Q
     ||||||  |||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15669409 tgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttctctctttcttttctctcgctgtgtt----atacttttgtttgtgtttataacttcgatacactttgtttt 15669314  T
Q  447 ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15669313 gattgcttgattattatttgcttcacacatcaaatatttta--ggtgtgattttcatcgaatt 15669253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26613604 - 26613101
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    |||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26613604 gagatttgttccaatttttgagggattcttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttag 26613505  T
Q  106 aa---acaaacaataaactagggtttt-agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtc 200  Q
    ||   | ||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  26613504 aagaaaaaaaaaacaaattagggtttagagagatttctctaagcgggagacactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattcggattgagtc 26613405  T
Q  201 ttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 300  Q
      ||||| ||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26613404 acttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttggaaagttactaatcatta 26613305  T
Q  301 tagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtc 399  Q
    ||||||||  ||   || ||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||      
T  26613304 tagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctcgttg-- 26613207  T
Q  400 tttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt 499  Q
     |||| ||| ||||  ||||||| ||||||  ||   || ||  ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  26613206 -tttttctactttttcttgtgttaataactgtcacctac-ttaatttggttgcttgattatt--ttgctccacacgtcaagtatttcattggtgtgattt 26613111  T
Q  500 tcatcgaatt 509  Q
    | | ||||||    
T  26613110 ttaacgaatt 26613101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183462
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt---tag 131  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||   ||||  ||||||||||||   |||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaa-caagggtttagaatgcaacac-aaactagggtttgtatag 14183826  T
Q  132 agatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttg 230  Q
    || || ||||  |    | |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||  || |||||| ||||||||| ||||||||    | ||||    
T  14183825 aggttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttg 14183726  T
Q  231 tgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
     |||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||    
T  14183725 ggtagaattaggcg-gaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccca 14183627  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||           ||||||| ||    ||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  14183626 gactaggtcagttttggaccgaactgggtaaac-aaatttttttgtg----------gtctctcgttg----ttttcttcttttgcttgtgtttataact 14183542  T
Q  430 tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14183541 tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaagtattttattggtgtgatttttatcgaatt 14183462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 41 - 507
Target Start/End: Original strand, 16561418 - 16561885
Alignment:
Q  41 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggag-----ctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt-tagaga 134  Q
    ||||||||||| || || |||||||  ||||||||||| ||||| ||     ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  16561418 ctataaatataaaccttatatcagatgaaaccttgagagagaggtagagaggctgaaaacaagggattagaaacaaacaacaaactagggtttatagagg 16561517  T
Q  135 tttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgt 233  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||  |||  || |||| ||||||||| ||    
T  16561518 tttctctaagcgggagactctagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggt 16561616  T
Q  234 agaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagac 332  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | |  |||||||| ||  ||||    
T  16561617 agaaataggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagac 16561716  T
Q  333 taggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttcc 432  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    ||| ||| ||||| |||||||||||| ||      
T  16561717 taggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcgccg----ttttctacttttgcttgtgtttataa-ttgt 16561811  T
Q  433 atacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaa 507  Q
       ||| ||| | |||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16561812 tctcacgttgatattggttgcttgattatt--tttctccacacatcaagtattttattggtgtgattttcatcgaa 16561885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 468
Target Start/End: Original strand, 42922150 - 42922608
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||  ||| |||||||    
T  42922150 gagatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaat-aagggtttaga 42922248  T
Q  107 aacaaacaataaa-ctagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtct 201  Q
    |   ||||| ||| |||||||||   ||||| || |||  ||    | |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  42922249 agtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcctagcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtct 42922348  T
Q  202 tttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
     ||||| ||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42922349 cttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattag 42922447  T
Q  302 agtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtct 400  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||||| || ||       
T  42922448 agtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttatctctttctttctcccgttg--- 42922544  T
Q  401 ttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgct 468  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  42922545 -ttttctacttttgtttgtgtttataacttccatac---tttttttttttgcttgattattacttgct 42922608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18800910 - 18800430
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaa-ctagggttt- 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||| ||||||||   ||||| ||| ||| |||||     
T  18800910 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaag-gtttagaagtcaacaagaaaactacggtttg 18800812  T
Q  129 --tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
      ||||| || ||||  |    | | |||||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||| | ||| ||| | ||||||    |    
T  18800811 tatagagtttgctcttggccacaaatactagggttggggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaa 18800712  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||     
T  18800711 ctttgggtagaattaggcg-ggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctc 18800613  T
Q  326 ccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt-ctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||| ||| ||||  ||| | ||||||||    
T  18800612 ccccaaactaggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctttttgttttctctcgttgt-tttctact--tttggcttgtgttt 18800516  T
Q  424 ataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18800515 ataacttccatacactttgttttgattgcttgattattatttgctctacacatcaagtattttgttggtgtgattttcatcgaatt 18800430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8347633 - 8347157
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    ||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  8347633 agatttgttccaattttatgaggggtacttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaa-caagggtttaga 8347536  T
Q  107 aacaaacaataaa-ctagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtct 201  Q
    |   ||||| ||| |||||||||   |||||||| ||||  |    | |||| | ||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  8347535 agtcaacaagaaaactagggtttgtatagagattgctcttggcaacaaacaccaaggttagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtct 8347436  T
Q  202 tttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
     ||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8347435 cttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattat 8347337  T
Q  302 agtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtct 400  Q
    ||||||| ||| |  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  8347336 agtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaacaagggaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctatcgctg--- 8347240  T
Q  401 ttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattt 485  Q
     ||| ||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  8347239 -ttttctacttttgcttatgtttataactttcatatactttg-tttggttgcttgattattacttactccacgcatcaagtattt 8347157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30738990 - 30738598
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||| |||||| |||| ||  || ||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||    
T  30738990 gagatttattccaatttttgaggcattcttttactataaacatagtccttgtatcagatgaaaccttgagatacaggtgactgaaaacaagggtttagaa 30738891  T
Q  108 acaaacaat-aaactagggtttt-agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctttt 204  Q
    ||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  30738890 acaaaaaaacaaactagggtttagagagatttctctaagcgggagacactagggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 30738791  T
Q  205 ggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--attata 302  Q
    ||| |   |||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  30738790 ggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattata 30738691  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctc-tttctttctctc 393  Q
    ||| || ||| |  ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30738690 gtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaacaaatttcgtgtgttctctcttttctttctctc 30738598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 256 - 509
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916814
Alignment:
Q  256 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaact 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  355 ggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgctt 454  Q
    || |||||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaattttgtgcgttctctctttctttttctcgctgtttttctact--tttggcttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgctt 15916759  T
Q  455 gattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15916760 gattgttacttgctccacacatcaagta-tttattggtgtgacttttcatcgaatt 15916814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17185996
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 17186367  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || ||||| ||    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    |    
T  17186366 agagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaa 17186267  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||     
T  17186266 ctttgggtagaattagaag-ggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctc 17186168  T
Q  326 ccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||    ||| ||||||||||| ||    
T  17186167 ccccagactaggtcaattt-ggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctcgctgtttt----ctacttttgtttgtgatt 17186073  T
Q  424 ataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| || | ||||||||||||||||    
T  17186072 ataacttccatacactttgttttggttgcttgactatcacttgctccacatatcaagtttattattggtgtgatttt 17185996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 495
Target Start/End: Original strand, 13214999 - 13215496
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  13214999 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 13215097  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  13215098 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagt 13215197  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatat----ctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    || ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||    
T  13215198 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcat 13215296  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctt--tctct 392  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||  | ||| |||||| | ||| ||||||| |||  |||||    
T  13215297 cattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgcgtcaac-aaattcttttgttctctcttcctttctctct 13215394  T
Q  393 cgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattg 490  Q
    |||||| ||| |||  |||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||| || | ||||||    
T  13215395 cgctgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctccacacatcaagtttattattg 13215491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 38925841 - 38925350
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  38925841 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagagttcagaaa 38925743  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  38925742 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 38925643  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  38925642 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggct-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat- 38925545  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 398  Q
      |||  || ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||  |||    
T  38925544 --agtaaaacggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcattgt 38925448  T
Q  399 ctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg--ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgt 494  Q
     ||| |||  |||| | ||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||||||    
T  38925447 -tttctac--ttttggcttgtgtttataaatgttccatacactttgatttttggttgcctgattatcacttactccacacatcaagtttattattggtgt 38925351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8349266 - 8348912
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||| ||| ||||||||   ||||||  |||||||||||   || |    
T  8349266 acactagggttggggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcg-ggtg 8349168  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggac 348  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||    
T  8349167 acttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagac 8349068  T
Q  349 cgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttgg 448  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||   ||    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8349067 cgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctaattg----ttttctacttttgtttgtgtttataacttccatacactttg-tttgg 8348973  T
Q  449 ttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8348972 ttgcttgattattacttgttccacacgtcaagt-ttttattggtgtgatttttcatcgaatt 8348912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 175 - 509
Target Start/End: Original strand, 16429048 - 16429380
Alignment:
Q  175 cttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16429048 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaacccattgata 16429146  T
Q  274 tctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgt 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||| | |  |    
T  16429147 tctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt-ggaccgaattgggtcaacaaattctttt 16429245  T
Q  372 gtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttca 471  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||  ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  16429246 gtgttctctcttcttttctctcgctgt--tttcact--tttggtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcctgattatcacttgctcca 16429341  T
Q  472 cacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  16429342 cacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 16429380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125327
Alignment:
Q  41 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaat-aaactagggttt----tagagat 135  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||| ||| |||| | |||||  ||||||||||||    ||||| |    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaa-caagggttaagaagccaacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  136 ttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgta 234  Q
    | ||||  | |  | |||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| || ||||| | | |||||||| | ||||||| |||    
T  13125688 tgctcttggcgacaaacactagggttgaggttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggta 13125589  T
Q  235 gaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct-cttcccagact 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||| |  |||  |||    
T  13125588 gaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttact 13125489  T
Q  334 aggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctc-tttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttcc 432  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||    ||| ||| ||||| ||||||||||||||  |    
T  13125488 aggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatttcatgtgttctctcttttctttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataactgtc 13125393  T
Q  433 atacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13125392 acccac-ttgttttggttgcttgattatt-tttgctccacacatcaagtaatttattggtgtgatttt 13125327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 41646838 - 41647348
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  41646838 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaa 41646936  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||| || || |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41646937 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 41647036  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    |  ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41647037 cacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggct-ggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 41647134  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctg 397  Q
    |||||| || ||| | ||||||||| |  ||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||| | || ||||| ||||||| ||||||||  ||     
T  41647135 atagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttcctttctct--ctt 41647231  T
Q  398 tctttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtg 493  Q
     || ||| ||| |||||  ||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||| || | |||||||||    
T  41647232 gctgttttctacttttgacttgtgtttataattatttcatacactttgattttggttgtctgattatcacttgctccgcacatcaagtttgttattggtg 41647331  T
Q  494 tgattt-tcatcgaatt 509  Q
    || ||| ||||||||||    
T  41647332 tgttttctcatcgaatt 41647348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 164 - 476
Target Start/End: Original strand, 16428733 - 16429043
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16428733 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtg-ggagacttattcttgta 16428831  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||  | ||    
T  16428832 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggaccgaactgagtcaa 16428930  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattat 460  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||| ||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16428931 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgatgt-tttctac--ttttggtttgtgtttataacttctatacactttgttttggttgcctgattat 16429027  T
Q  461 tacttgcttcacacat 476  Q
     ||||||| |||||||    
T  16429028 cacttgctccacacat 16429043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 33 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 9241425 - 9240951
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga-gggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt- 128  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||     
T  9241425 tacttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctg-aaacaag-gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 9241328  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  9241327 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattg 9241228  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
     | ||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  9241227 gggctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 9241129  T
Q  323 ct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtg 420  Q
    ||  |||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||| | |  | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||     
T  9241128 ctcccccatactaggtca-atttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttctctctttctttctctcgctgt-tttctac--ttttggtttgta 9241033  T
Q  421 tttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||    
T  9241032 tttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacttcaagtttgttattggtgtgatttt 9240951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 39462437 - 39462949
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   |||||||  ||| |||||||||    
T  39462437 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaag-gtttagaaa 39462535  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||| |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39462536 tgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 39462635  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  39462636 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatca-t 39462733  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgct 396  Q
    |||||| || |||   |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  39462734 atagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgct 39462832  T
Q  397 gtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtg 493  Q
    ||  ||||   ||||| | ||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  39462833 gttgttttctaattttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttgattgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtg 39462932  T
Q  494 tga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||| |||||||||||||    
T  39462933 tgatttttcatcgaatt 39462949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 90 - 339
Target Start/End: Original strand, 155711 - 155961
Alignment:
Q  90 gaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggtttt-agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactg 188  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||     
T  155711 gaaaacaagggtttagaaacaaacaacaaactagggtttagagatatttctctaagtgggagacactacggttgagattgattcaccttgggaaacacta 155810  T
Q  189 ttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 287  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||| |||||||| | |||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  155811 ttaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaaccttttgttatctcttt-gtaaag 155909  T
Q  288 ttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  155910 ttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccaaactaggtca 155961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 337
Target Start/End: Original strand, 43104099 - 43104414
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggag-ctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggtttt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  43104099 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgtgaggtagagagtctgaaaacaatggtttagaaacaaacaacaaactagggtttg 43104198  T
Q  130 -agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgattt-----accttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
     |||| |||||||||| |||||||| || ||||| | ||| |||     ||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||  ||||| || |    
T  43104199 gagaggtttctctaagcgggagacattatggttgagattgttttggttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattg 43104298  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttatt-cttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctc 321  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||    
T  43104299 aaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctc 43104398  T
Q  322 tcttcccagactaggt 337  Q
    || |||||||||||||    
T  43104399 tcctcccagactaggt 43104414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11457676 - 11457329
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11457676 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 11457578  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||    
T  11457577 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatgtctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaa 11457480  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctct-ttctt---tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttg 455  Q
    | |||||| | |||| ||||| |||||   ||||||||||| ||| |||  |||| | ||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11457479 c-aaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgtgtttaaaattgttccatatactttgttttggttgcctg 11457384  T
Q  456 attattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  11457383 attatcacttgcttcacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 11457329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076563
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||| | ||||| ||| |||||||||   |    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaa-caaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtat 50076911  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    | || || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||    
T  50076910 aaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 50076811  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
     |||| |||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  50076810 atttgggtagaattaggcg-ggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc 50076712  T
Q  326 cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||| |||  ||||   ||||||||    
T  50076711 cccagactatgtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgttgt-tttctac--ttttaacttgtgttt 50076616  T
Q  424 ataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacac 474  Q
    ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||    
T  50076615 ataattgttccatacactttgttttagttgctttattattcattgctccacac 50076563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 51749957 - 51750469
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  51749957 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 51750055  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  51750056 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 51750155  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  51750156 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 51750253  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ct 390  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| || ||| ||||||       |    
T  51750254 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttctt 51750351  T
Q  391 ctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttatt 489  Q
    ||||| || | ||| ||| |||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||    
T  51750352 ctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttatt 51750449  T
Q  490 ggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  51750450 ggtgtgatttttatcgaatt 51750469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6114970
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggg-gacttattcttgta 6115206  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||   |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  6115205 accaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtaaa 6115107  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgatta 459  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||| ||||||    ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6115106 caaattattttgtgttctctcttcttttctctcgttgtctt----ctacttttgacttgtatttataacttccatacattttattttggttgcttgatta 6115011  T
Q  460 ttacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    | |||| || ||||||||| |||| |||  |||||||||||    
T  6115010 tcactttctccacacatcaagtatattaccggtgtgatttt 6114970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 478
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307504
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---ta 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   ||    
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18307152  T
Q  131 gagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagac 226  Q
     || || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | |    
T  18307153 aagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 18307252  T
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc 326  Q
    |||| |||||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |    
T  18307253 tttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcc 18307351  T
Q  327 ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctt--tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |  | |||||| | |  ||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||| |||  |||| | ||||||||    
T  18307352 ccagactaggtca-atttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgtgttt 18307447  T
Q  424 ataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||||||||    
T  18307448 ataattgttccatacactttgttttggttgcctaattatcatttgctccacacatca 18307504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18840015
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||  |  ||||||||||||   |    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaa-caagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtat 18839629  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | ||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||    
T  18839630 agagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgaga 18839729  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  || | ||||||| |     
T  18839730 ctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttc 18839828  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtt 422  Q
     |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||  || ||| ||| |||| | |||||||    
T  18839829 ccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattctttcgtgttctctcttcttt-tctctctcgctgttttctagttttggcttgtgtt 18839925  T
Q  423 tataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||   ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  18839926 tataattgttccatacactttgtttcgattacttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 18840015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10400191 - 10399829
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||     
T  10400191 agatttgttccaaattttaagcgaaactttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaat 10400093  T
Q  108 -acaaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
     ||||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10400092 gacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 10399993  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  10399992 ctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 10399895  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  10399894 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 10399829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28207429 - 28206919
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  28207429 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 28207331  T
Q  109 ca-aacaa-taaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgtg-gttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
     | |||||  ||||||||||||   || || || |||||  |    | ||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||    
T  28207330 gacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgt 28207231  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||  |||||||| | | |||||  || ||||| |   |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||       
T  28207230 ctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--- 28207135  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgct 396  Q
    |||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  28207134 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgct 28207036  T
Q  397 gtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggt 492  Q
    || | ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  28207035 gt-tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggt 28206937  T
Q  493 gtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  28206936 gtgttttctcatcgaatt 28206919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 500
Target Start/End: Original strand, 15823464 - 15823967
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||    
T  15823464 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaa-caagggtttagaaa 15823562  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  15823563 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagt 15823662  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  15823663 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcat- 15823760  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt--tctttctctcgc 395  Q
    |||||||||  || | ||||||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  | ||||||| |     
T  15823761 atagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttag-accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttttctcttgt 15823859  T
Q  396 tgtctttttactatttttgt-ttgtgtttataact--tccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattgg 491  Q
    |||  |||| ||| |||||  ||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||   ||| || ||||||||| || | |||||||    
T  15823860 tgttgtttt-ctacttttgccttgtgattataattgttccatacactttgattttggttgcctgattaccccttactccacacatcaagtttgttattgg 15823958  T
Q  492 tgtgatttt 500  Q
    |||||||||    
T  15823959 tgtgatttt 15823967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078821
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaa-caataaa-ctagggttt---t 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | | ||| ||| |||||||||   |    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcat 50079060  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||   ||    
T  50079059 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttgga 50078960  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||     
T  50078959 ctttgggtagaattaggag-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctc 50078861  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||    
T  50078860 ccccagactaggtca-atttggaccgaatttggtaaacaaa 50078821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2949571 - 2949086
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt- 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||  |  ||||||| ||||     
T  2949571 atacttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttg 2949473  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttg-tggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || |||||  |    | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||| |||| |    
T  2949472 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattg 2949373  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
     | ||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  || | |||||||    
T  2949372 gggctttgggtagaattaggcg-ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctct 2949275  T
Q  323 cttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctt--tctctcgctgtctttttactatttttgtttgt 419  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||| |||  |||| | ||||    
T  2949274 ctcccccgactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgt 2949179  T
Q  420 gtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  2949178 gtttataattgttccatacactttattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 2949086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 6756608 - 6756808
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  6756608 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctt--gattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 6756704  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct--tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  6756705 acctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcag-tttggaccgaactggatca 6756803  T
Q  361 acaaa 365  Q
    |||||    
T  6756804 acaaa 6756808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 47906350 - 47906697
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  47906350 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 47906448  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||    
T  47906449 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtca-atttggaccgaactgggtcaa 47906546  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47906547 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgattataattgttccatacactttggtttggttgcttgat 47906645  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  47906646 tatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 47906697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 50307747 - 50307396
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  50307747 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 50307649  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  50307648 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 50307551  T
Q  362 caaa--attcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgctt 454  Q
    ||||   ||  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |    
T  50307550 caaattctttttgtgttctctcttatttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcct 50307452  T
Q  455 gattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||  |||||| || |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  50307451 gattatcccttgctccagacatcaagtttattattggtgtgatttttcatcgaatt 50307396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 39932153 - 39932507
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  39932153 ggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcg-ggagactaattcttgta 39932251  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt--cccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||| ||| | |    
T  39932252 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtca-atttggaccgaattgggtca 39932349  T
Q  361 acaaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttg 451  Q
    || |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||| ||  |||| ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932350 ac-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgtttttctacttttggcttgtatttataacttccatacactttgttttggttg 39932448  T
Q  452 cttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  39932449 cttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 39932507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 40134024 - 40134371
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||  |||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  40134024 ggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcg-ggagacttattcttgta 40134122  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| ||| | ||||    
T  40134123 acacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggaccggactaggtaaa 40134221  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctct-ttc--tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgat- 457  Q
    | |||||| | |||| ||||| |||  ||||||||| ||| ||| |||  |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  40134222 c-aaattcttttgtgttctctattctttttctctcgttgt-tttctac--ttttggcttgagattataacttccatacactttgttttggttgcctgatt 40134317  T
Q  458 -tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
     ||| ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  40134318 atatcacttgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttcatcgaatt 40134371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 28840596 - 28840959
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || |||| | ||||| |||| |||||||    
T  28840596 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaa-caagggtttaga 28840694  T
Q  107 aac-aaacaataaa-ctagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-ga 197  Q
    ||  |||||| ||| |||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  28840695 aaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 28840794  T
Q  198 gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 297  Q
    |||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  28840795 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 28840892  T
Q  298 ttatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  28840893 -tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 28840959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490338
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt-tag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||   ||||| ||| ||||||||| ||     
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaa-caagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtat 31489957  T
Q  132 agatt-tctctaagagggagacactagggttg--tggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagact 227  Q
    || || |||||  |    | |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || | | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  31489958 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagact 31490057  T
Q  228 ttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc 327  Q
    |||  ||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| || ||| | ||||||||  ||    
T  31490058 ttggatagaattaggcg-gaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatca-tatggtgaaacggagggctgctctccccc 31490155  T
Q  328 cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttata 426  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||| |||||| | |||| ||||| |  || |||| ||  || ||| ||| |||||  |||||||||||    
T  31490156 cagactaggtca-atttggactgaactagatcaac-aaattcttttgtgttctctcttattttctctctccctgttttctacttttgacttgtgtttata 31490253  T
Q  427 a--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |   || |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  31490254 attgtttcatacactttattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-ttgtattggtgtgatttttcatcgaatt 31490338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 509
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319314
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---ta 130  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   ||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgttta 17318936  T
Q  131 gagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagac 226  Q
    ||| || |||||  |    | ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||      |||| |||||| ||||||||| ||| |||| | |||    
T  17318937 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattgggac 17319030  T
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc 326  Q
    |||| |||||||||||   | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||| | ||||||||| |    
T  17319031 tttgggtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcc 17319129  T
Q  327 ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgttta 424  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||||| |||||| |||| ||  || ||| ||| |||| | |||||||||    
T  17319130 ctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctctcttcttt-tctctctcgctattttctacttttggcttgtgttta 17319226  T
Q  425 taac--ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||  | | ||||||||| || |||||||||||||    
T  17319227 taactattccatacactttgttttggttgtttgattattccttactccacacatcaaatttgttattggtgcgatttttcatcgaatt 17319314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251128
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaa-taaactagggttt---ta 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| | |||||  ||||||||||||   ||    
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 25251513  T
Q  131 gagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagac 226  Q
      | || |||||  ||   | |||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||| | |||    
T  25251512 acgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggac 25251413  T
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc 326  Q
    |||| |||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||  || |  |||||||| |    
T  25251412 tttgggtagaattagg-cggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctcc 25251314  T
Q  327 cc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttt-tactatttttgtttgtgttt 423  Q
    || | |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| |  | |||| |||  |||| | ||||| ||    
T  25251313 ccaatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctac--ttttggcttgtgatt 25251217  T
Q  424 ataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  25251216 ataattgtttcatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 25251128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9459785 - 9459284
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga------tagagggagctgaaaacaagagttt 103  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||      ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  9459785 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaa-caagggttt 9459687  T
Q  104 agaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat 195  Q
    |||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9459686 agaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 9459587  T
Q  196 g--agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc 293  Q
       ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||    
T  9459586 tgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactc 9459489  T
Q  294 atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctct 392  Q
    |||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||         |||    
T  9459488 atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc-tttgtgttct---------tct 9459401  T
Q  393 cgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattgg 491  Q
    ||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||    
T  9459400 cgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattgg 9459303  T
Q  492 tgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  9459302 tgtgatttttcatcgaatt 9459284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9463612 - 9463111
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga------tagagggagctgaaaacaagagttt 103  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||      ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  9463612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaa-caagggttt 9463514  T
Q  104 agaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat 195  Q
    |||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9463513 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 9463414  T
Q  196 g--agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc 293  Q
       ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||    
T  9463413 tgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactc 9463316  T
Q  294 atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctct 392  Q
    |||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||         |||    
T  9463315 atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc-tttgtgttct---------tct 9463228  T
Q  393 cgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattgg 491  Q
    ||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||    
T  9463227 cgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattgg 9463130  T
Q  492 tgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  9463129 tgtgatttttcatcgaatt 9463111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 16226085 - 16226600
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  16226085 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtct-aaaacaagggtttagaaa 16226183  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gag 198  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  16226184 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 16226283  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||    
T  16226284 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat 16226381  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgt-gtgtgct-ctctttctttct----- 390  Q
     |||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||  || | |||| || ||  |||||| |         
T  16226382 -atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagatt-ggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttct 16226479  T
Q  391 -ctcgctgtctttttactatttttgt-ttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtatttta 487  Q
     ||||| ||  |||| ||| |||||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||    
T  16226480 tctcgccgttgtttt-ctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgtta 16226577  T
Q  488 ttggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  16226578 ttggtgtgatttttcatcgaatt 16226600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 508
Target Start/End: Original strand, 16432474 - 16432813
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||| ||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||| |   ||| | |||||||||||    
T  16432474 ggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcg-ggacaattattcttgta 16432572  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc--agactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||| | | |    
T  16432573 acccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtca-atttggaccgaacttggtca 16432671  T
Q  361 acaaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgatta 459  Q
    || |||||| | |||| ||||| ||||||      |||| ||| |||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  16432672 ac-aaattcttttgtgttctctcttcttt-----tctgtttttctac--ttttggtttatgtttataactttcatacactgtgttttgattgcctgatta 16432763  T
Q  460 ttacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaat 508  Q
    ||||||||| |||||||||  | | |||||||||||| ||||||||||||    
T  16432764 ttacttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgatttttcatcgaat 16432813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 31425219 - 31424879
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt---cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattctt 259  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||   || |||||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||   |||| |||||||||    
T  31425219 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggaggcttattctt 31425121  T
Q  260 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggata 359  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |     
T  31425120 gtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtc 31425022  T
Q  360 aacaaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttg 455  Q
    ||| |||||| | |||| ||||| |||||| |||| ||  || ||| ||| |||||  ||||||||||||   | ||||||| |||||| ||||||||||    
T  31425021 aac-aaattcttttgtgttctctcttcttt-tctctctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgtcccatacattttgttatggttgcttg 31424924  T
Q  456 attattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    | |||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  31424923 agtattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt 31424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 6822933 - 6823294
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  6822933 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 6823031  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt-tagaga-tttctctaagagggagaca-ctagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtc 200  Q
      |||  |  |||||||||||| || ||| ||| |||   ||| | | | |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  6823032 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaaactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtc 6823131  T
Q  201 ttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 300  Q
    | ||||||| | |||||||| | | ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||    
T  6823132 tcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatca-ta 6823229  T
Q  301 tagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  6823230 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 6823294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 478
Target Start/End: Original strand, 25127952 - 25128268
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25127952 ggttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 25128050  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||| | ||||||||| ||||| |||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  25128051 attcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtca-attaggaccgaactgggtcaa 25128149  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgatta 459  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||| || ||  || ||| ||| |||| |||||| |||||| | | || ||||||| |||||||||||||||||    
T  25128150 caaattcttttgtgttctctcttcctttctttctctcgctgttttctacttttatttgtgattataattgctatccactttgattttggttgcttgatta 25128249  T
Q  460 ttacttgcttcacacatca 478  Q
    || ||||||  ||||||||    
T  25128250 ttccttgctctacacatca 25128268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 509
Target Start/End: Original strand, 28842413 - 28842924
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  28842413 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 28842511  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  28842512 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagt 28842611  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  28842612 ctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 28842708  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgc-tctctt-----tctttctc 391  Q
    ||||||||| ||| | ||  |||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||| | | |||||| | |  ||||| | ||||||     | ||  ||    
T  28842709 atagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtca-atttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttcttctcttctttgtgttcttc 28842807  T
Q  392 tcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattg 490  Q
    |||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| || | |||||     
T  28842808 tcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagt-tgttatta 28842905  T
Q  491 gtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28842906 gtgtgattttcatcgaatt 28842924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 27916415 - 27916778
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagct-gaaaacaagagtttaga 106  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| | || ||||  ||||||||| |||||||    
T  27916415 agatttgttccaattttggagggatacttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttaga 27916514  T
Q  107 aacaaacaataaa-ctagggttt-tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttt 203  Q
    | | | ||| ||| ||||||||| ||||| || ||||  |    | ||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||| |||| || |||||| |    
T  27916515 agccagcaagaaaactagggtttgtagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggaattgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctct 27916614  T
Q  204 tggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc--cattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
    |||| ||  |||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27916615 tggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcgttat 27916713  T
Q  302 agtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||| ||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  27916714 agtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaa 27916778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14098171 - 14097832
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga-ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||    
T  14098171 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-agagctttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgt 14098074  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggata 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| || || |||||||||  ||||||||||||||| |     
T  14098073 aacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtca-atttggaccgaactgggtc 14097976  T
Q  360 aacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgctt 454  Q
    |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| |  | ||||  ||| |||||  ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14097975 aacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgtttt--ctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgctt 14097878  T
Q  455 gattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  14097877 gattatctcttgcttcacacatcaagtttgttattggtgtgttttt 14097832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17324837 - 17324637
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  17324837 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 17324739  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  17324738 actcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 17324641  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  17324640 caaa 17324637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 2510525 - 2510200
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||    
T  2510525 ggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggca--gagacttattcttgta 2510428  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  2510427 acccattgatttctctcttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 2510330  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattat 460  Q
    | |||||| | |||| |||         |||||| || | ||| |||||||||  |||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2510329 c-aaattcttttgtgttct---------tctcgccgt-tgttttctatttttgacttgtttttaattgttccatacactttgttttcgttgcttgattat 2510241  T
Q  461 tacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttca 502  Q
      ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||    
T  2510240 ctcttgcttcacatatcaagt-tgttattggtgtgattttca 2510200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4131580 - 4131228
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||   | ||||||| |||||||||||   | | |||||||||||||    
T  4131580 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaa-acttattcttgta 4131483  T
Q  263 acccattgatatct----cttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactgga 357  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||       
T  4131482 acccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggactgaactatg 4131384  T
Q  358 taaacaaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctgtctttttactattttt-gtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgct 453  Q
    | ||| |||||| | |||| ||||| |||||| |||| ||   | ||| |||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  4131383 tcaac-aaattcttttgtgttctctgttcttt-tctctctcgttgttttctatttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgct 4131286  T
Q  454 tgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga--ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||  |||||| | ||||||| || | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4131285 tgattatctcttgctccgcacatcaagtttgttattggtgtgagtttttcatcgaatt 4131228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31423215 - 31422933
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||    
T  31423215 gatacttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31423117  T
Q  129 ---tagagatt-tctctaagaggg-agacactagggttgtg---gttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagaga 219  Q
       ||||| || |||||  |     | ||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||    
T  31423116 atatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtt-tgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagaga 31423018  T
Q  220 tggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 305  Q
    | ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31423017 ttgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 31422933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 47179627 - 47179992
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggagctgaaaacaagagttta 104  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  47179627 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagggttta 47179725  T
Q  105 gaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat- 195  Q
    ||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | |  |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  47179726 gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 47179825  T
Q  196 -gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 294  Q
     |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||    
T  47179826 ggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactca 47179923  T
Q  295 tcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  47179924 tca-tatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 47179992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 51752283 - 51752643
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51752283 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctg-aaacaagagtttagaaa 51752381  T
Q  109 -caaacaa-taaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatgagtc 200  Q
       |||||  ||| ||||| ||   ||||| || |||||  |    | |||||||| ||    |||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  51752382 ggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattagattgagtc 51752481  T
Q  201 ttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 300  Q
    | ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| || ||    
T  51752482 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcacca-ta 51752578  T
Q  301 tagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  51752579 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 51752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 15295035 - 15294687
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  15295035 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtg-ggagatttattcttgta 15294937  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  15294936 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 15294839  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    | |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||| || | ||| ||| |||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  15294838 c-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgc 15294741  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaa 507  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  15294740 ttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaa 15294687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248424
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| | ||||| ||| ||| | |||   |    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaag-gtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatat 50248811  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  50248810 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgaga 50248711  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||  || |||||     
T  50248710 ctttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagatggttgttctctc 50248613  T
Q  325 tccc--agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgt 421  Q
    ||||  |||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||    |||| | |||||     
T  50248612 tcccctagactaggtca-atttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctc-gttgttttcaacttttggcttgtgg 50248515  T
Q  422 ttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50248514 ttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaaatttgttattggtgtgatttatcatcgaatt 50248424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 355
Target Start/End: Original strand, 2617596 - 2617786
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2617596 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggat-ggagacttattcttgta 2617694  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactg 355  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2617695 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactg 2617786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12302706 - 12302368
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  12302706 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcg-ggagacttattcttata 12302608  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  12302607 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 12302510  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttga 456  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  |||||||| |  | ||||  ||| |||||  ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  12302509 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgttgtttt--ctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgattttggtttcctga 12302412  T
Q  457 ttattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  12302411 ttatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttt 12302368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 13761755 - 13762116
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  13761755 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctg-aaacaagggtttagaaa 13761853  T
Q  109 -caaacaata-aactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
       ||||| | |||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||  | |||||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||    
T  13761854 ggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagt 13761953  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  13761954 ctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 13762050  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||| | || ||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||    
T  13762051 atagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtca-atttggactgaactgggtcaacaaa 13762116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520086
Alignment:
Q  41 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggag-ctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaa-ctagggttt---tagagat 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||   ||||| ||| |||||||||   ||||| |    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 26520350  T
Q  136 ttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttac------gcgaagagatggagactt 228  Q
    | ||||  |    | |||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||      | |||||||| | |||||    
T  26520349 tgctcttggcaacaaacactaagattgaggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactt 26520250  T
Q  229 tgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcc 327  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || |||||||||||| ||| |  |||||| |  ||    
T  26520249 tgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccc 26520158  T
Q  328 cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgt 398  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26520157 caaattaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaatatcgtgtgttctctctttcttttctctcgctgt 26520086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27337140 - 27336801
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||||   | ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  27337140 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcg-ggagacttattcttgta 27337042  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  27337041 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 27336945  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttg 455  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27336944 caaattcttttgtgttctctcttccttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctg 27336846  T
Q  456 attattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||  |||||| ||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  27336845 attatcccttgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttt 27336801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 47177276 - 47177641
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggagctgaaaacaagagttta 104  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  47177276 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagggttta 47177374  T
Q  105 gaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggatg 196  Q
    ||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | |  |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47177375 gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatg 47177474  T
Q  197 --agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 294  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||    
T  47177475 ggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggca-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactca 47177572  T
Q  295 tcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||    
T  47177573 tca-tatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtcag-attggatcgaactgggtcaacaaa 47177641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3579979 - 3579618
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggag--ctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| |  |||||| |||| ||| |||||    
T  3579979 atttgttccaaattttaagcgatacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaa-caagggttcagaaa 3579881  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      ||   |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  3579880 ggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagt 3579781  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||| |||||  ||||||| | | ||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3579780 ctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat- 3579683  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||| || |||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  3579682 -tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 3579618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25248753 - 25248405
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||| | ||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25248753 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 25248655  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  25248654 acccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 25248556  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttc--tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttga 456  Q
    |||| | |  |||||  | |||| |  | ||||||||||| ||| |||  ||||   || |||||||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  25248555 caaattcttttgtgttttatcttccggtgtctctcgctgt-tttctac--ttttgacttttgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttga 25248459  T
Q  457 ttattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
     |||| ||| || ||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  25248458 ctattccttactccacacatcaagtttgttattgttgtgatttttcatcgaatt 25248405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 493
Target Start/End: Original strand, 17324143 - 17324484
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  || | |||||||| |  |||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  17324143 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcg-ggagacttattcttgta 17324241  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccca-gactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| | ||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| | | ||    
T  17324242 acccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccccatgactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 17324340  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt----------ctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttgg 448  Q
    | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |          || ||| ||| |||| | ||||||||||||   || ||||||||||||| |||    
T  17324341 c-aaattcttgtgttctctcttcctttctctctctctctctctctcactgttttctacttttggcttgtgtttataattttttcatacactttgttatgg 17324439  T
Q  449 ttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtg 493  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  17324440 ttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtg 17324484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 49495540 - 49495137
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt-- 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||  ||      ||||||||||      
T  49495540 gatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttataaatcaa------actagggtttgc 49495448  T
Q  129 -tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagac 226  Q
     || || || ||||  |    | |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||  ||  | ||||||||||||| |||  ||||||| | | |    
T  49495447 atatagtttgctcttggcaacaaacactatggttgag-ttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggc 49495349  T
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc 326  Q
    |||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | ||  ||||| |    
T  49495348 tttgggtagaattagg-cgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctcc 49495250  T
Q  327 cc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttta 424  Q
    || |||||| ||||  ||| ||||||||| | |||| ||| | |  ||| | | ||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||| |||    
T  49495249 ccaagactatgtca-atttagaccgaactaggtaaagaaattcttatgtattccctctttctttctctcactgt-tttttac---ttttgtttgtgatta 49495155  T
Q  425 taacttccatacactttg 442  Q
    || |||||||||||||||    
T  49495154 tatcttccatacactttg 49495137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 28279331 - 28279688
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttgga 248  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||||| |||||||| ||||||| |||  | ||||| ||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |    
T  28279331 acactagggttgggattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaa 28279430  T
Q  249 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc--agactaggtcagttttgg 346  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    || ||| | |||  ||||||||||||| || |    
T  28279431 gactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaattgagagttgttctttccccctagactaggtcagtattag 28279530  T
Q  347 accgaactggataaacaaa-attcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttt 445  Q
    | |||||||| ||||||||  || |||||| ||||||  |||| | ||| ||    ||| ||| ||| | |||||||||||| |  ||  ||| ||| ||    
T  28279531 atcgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctctccctttttttcgttg----ttttctactttcgcttgtgtttataattgtcacccacgttgatt 28279626  T
Q  446 tggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||| ||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28279627 tggttgtttgttta--acttgctccacacatcaagtattttattggtgtgatttttaacgaatt 28279688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Original strand, 20302379 - 20302727
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa-- 108  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||      
T  20302379 atttgttccaaattttaagtgaaacttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagg 20302477  T
Q  109 caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtct 201  Q
    |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20302478 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 20302577  T
Q  202 tttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
     ||||||| | |||||||    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||  ||    
T  20302578 cttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-gat 20302674  T
Q  302 agtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaact 354  Q
    ||||||  ||| |||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20302675 agtggatcggaggactactctctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 20302727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 224 - 509
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816316
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||  ||| |  |||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-ataatggatcggagggatgctctc 23816124  T
Q  324 ttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttct---ttctctcgctgtctttttactatttttgt-tt 417  Q
    | ||| | ||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||| |   ||||||||||||  |||| ||| |||||  ||    
T  23816125 tcccccatactaggtcaattt-ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttttcttttctctcgctgttgtttt-ctacttttgactt 23816222  T
Q  418 gtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  23816223 gtgattataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 23816316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6996040 - 6995547
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||  |||||||||  |||  |  ||||||||||||     
T  6996040 atacttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccg-aaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 6995942  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  6995941 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattg 6995842  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
     | ||||| |||||||||||   ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||    
T  6995841 gggctttgggtagaattagg-cgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct 6995744  T
Q  323 cttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt------tctttctctcgctgtctttttacta-ttttt 413  Q
    || | |||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||| | |  ||||| |||||||      | ||||||||||||| | ||| ||| ||||     
T  6995743 ctcctccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttctttttctctcgctgt-tgttttctacttttg 6995646  T
Q  414 gtttgtgtttata--acttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    | |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  6995645 gcttgtgtttatagttgttccatacactttgttttgattgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 6995547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Original strand, 16231643 - 16231834
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  16231643 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 16231741  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactgg 356  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16231742 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgg 16231834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31735887 - 31735372
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacct----tgagatagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  31735887 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggct-aaaacaagggtttag 31735789  T
Q  106 aaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgtt-aggatg 196  Q
    |||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| || ||| ||    
T  31735788 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttg 31735689  T
Q  197 agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc 296  Q
    ||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  31735688 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatc 31735590  T
Q  297 attatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt----- 388  Q
    | |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| || ||| ||||||         
T  31735589 a-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgtt 31735493  T
Q  389 -ctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtatttta 487  Q
      |||||| || | ||| ||||||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||    
T  31735492 cttctcgccgt-tgttttctattttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgtta 31735395  T
Q  488 ttggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||| |||| ||||||||||    
T  31735394 ttggtgtaatttctcatcgaatt 31735372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 24325743 - 24325943
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  24325743 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 24325841  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | ||| |||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||    
T  24325842 acccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaatttt-gaccgaactgggtcaa 24325939  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  24325940 caaa 24325943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 417 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26519385 - 26519296
Alignment:
Q  417 tgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26519385 tgtgtttataacttccatacactttgttt-ggttgcttgattattacttgctccacaca--aagtattttattggtgtgattttcatcgaatt 26519296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27339331 - 27338992
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||| || |||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||    
T  27339331 ggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggcgacttattcttgta 27339233  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||    
T  27339232 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 27339136  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttg 455  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27339135 caaattcttttgtgttctctcttccttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctg 27339037  T
Q  456 attattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||  |||| | ||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  27339036 attatcccttgttccacacatcaagtttgttattgatgtgatttt 27338992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 46431908 - 46431707
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagag-atggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  46431908 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgg-gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 46431811  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct---tcccagactaggtcagttttggaccgaactggat 358  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  46431810 aacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtca-atttggaccgaactgggt 46431714  T
Q  359 aaacaaa 365  Q
     ||||||    
T  46431713 caacaaa 46431707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 47451566 - 47451642
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47451566 agatttgttccaaatattaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggg 47451642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21948388 - 21948225
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaaga-gatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21948388 ggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgg-gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 21948292  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccca 329  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  21948291 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccca 21948225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 308
Target Start/End: Original strand, 48665257 - 48665401
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttac-gcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  48665257 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 48665355  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48665356 aacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaa 48665401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786119
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc 23786033  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  23786034 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 23786119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 13127782 - 13127579
Alignment:
Q  271 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  13127782 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatttc 13127683  T
Q  370 gtgtgtgctctc-tttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgct 468  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||||  ||    ||| ||  ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13127682 atgtgttctctcttttctttatctcattg----ttttctccttttgcttgtgtttataactgtcacccac-ttgttttggttgcttgattatt-tttgct 13127589  T
Q  469 tcacacatca 478  Q
     |||||||||    
T  13127588 ccacacatca 13127579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28998593 - 28998320
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||  ||||  |  ||||||||||||     
T  28998593 atacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctg-aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 28998495  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || ||| |       | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |    
T  28998494 tatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattg 28998395  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
     | ||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  28998394 gggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcat 28998320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29004309 - 29004036
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||  ||||  |  ||||||||||||     
T  29004309 atacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctg-aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 29004211  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || ||| |       | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |    
T  29004210 tatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattg 29004111  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
     | ||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  29004110 gggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcat 29004036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 6823802 - 6823878
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6823802 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggg 6823878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13447203 - 13447124
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  13447203 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 13447124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 50078724 - 50078652
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  50078724 ttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttc 50078652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 354
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757799
Alignment:
Q  176 ttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatat 274  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||| |    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctatcgattt 51757721  T
Q  275 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaact 354  Q
    ||| ||||||| | |||||| || ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51757722 ctc-tttgtaacgatactcacca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 51757799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 46783189 - 46783271
Alignment:
Q  225 actttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46783189 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatct-ttttgtaaagaaactcatcattatagtggaa 46783271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 356
Target Start/End: Original strand, 47451754 - 47451913
Alignment:
Q  195 tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 294  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| ||| |||||||   ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47451754 tgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcg-ggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactca 47451852  T
Q  295 tcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactgg 356  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  47451853 tca-tatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgg 47451913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457740
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaa 11457740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 280
Target Start/End: Original strand, 20291537 - 20291653
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||    ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  20291537 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 20291635  T
Q  263 acccattgatatctcttt 280  Q
    |||||||||| |||||||    
T  20291636 acccattgatttctcttt 20291653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3579518 - 3579438
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  3579518 ttccatacactttattttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgtttttcatcgaatt 3579438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Original strand, 16231519 - 16231603
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  16231519 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa 16231603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 432 - 509
Target Start/End: Original strand, 51752723 - 51752798
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51752723 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacataagtta--ttattggtgtgattttcatcgaatt 51752798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 2617868 - 2617948
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  2617868 ttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgcttcacacatcaagt-tgttattggtgtggttttcatcgaatt 2617948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 14098329 - 14098257
Alignment:
Q  13 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  14098329 ttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggg 14098257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 20291390 - 20291473
Alignment:
Q  24 tttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  20291390 tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatg-aaacaagggtttagaaa 20291473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21353477 - 21353347
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccag 330  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||   |||||||||  |||||    
T  21353477 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccag 21353382  T
Q  331 actaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  21353381 actaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaa 21353347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248779
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 25248779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 48665090 - 48665165
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48665090 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagaggg 48665165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2393413 - 2393282
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctcttccca 329  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||    
T  2393413 gtagaattagatttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccca 2393318  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||||||||||||    
T  2393317 gactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaa 2393282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8213666 - 8213571
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc-attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgct 320  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8213666 gactttggatagaattaggtttgaagactaattcatgtaaccctattggaa--tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggataactgct 8213571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Original strand, 13358911 - 13359004
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  13358911 ttgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttgactatcccttactccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 13359004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 308
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353188
Alignment:
Q  166 ttgatttaccttgg-gaaacactgttaggatg-agtcttttggttacgcgaagagatg-gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| |||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaa-act-attcttgta 14353144  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    |||| |||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14353145 accctttgaaatct--tttgtaaagttattcatcattatagtggaa 14353188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 16431018 - 16431095
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16431018 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagaggg 16431095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26332526 - 26332391
Alignment:
Q  349 cgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttgg 448  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | |||||| || ||| ||    ||| ||||||||||||||||||||  ||  ||  ||||||||     
T  26332526 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgtcctctctctttttctcccgttgtttt----ctacttttgtttgtgtttataactatcacccatgttgttttga 26332431  T
Q  449 ttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattg 490  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26332430 ttgcttgattatt--ttgctccacacatcaagtattttattg 26332391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 51757886 - 51757966
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||    
T  51757886 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtcatttttcatcgaatt 51757966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Original strand, 13762187 - 13762258
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  13762187 ttccatacactttgttttggttgcttgattatccctttctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttc 13762258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997122
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 263  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagacttgg-gtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 14997122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Original strand, 16231901 - 16231995
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  16231901 ttgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttgattatccgttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 16231995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332553
Alignment:
Q  166 ttgatttaccttgggaaacactgttaggatg-agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattag----gtttggagacttattcttg 260  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||     ||||| ||||| |||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaattaattaagtttgaagactaattcttg 26332589  T
Q  261 taacccattgat-atctcttttgtaaagttactcatc 296  Q
    |||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  26332588 taaccttttgattatatcttt-gtaaagttactcatc 26332553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 478
Target Start/End: Original strand, 28841017 - 28841079
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||    
T  28841017 ttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccactcatca 28841079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 47
Target Start/End: Original strand, 49687458 - 49687496
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaa 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49687458 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaa 49687496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617532
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctg-aaacaagggtttagaaa 2617532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324081
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |||||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggct-aaaacaagggttcagaaa 17324081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 20291807 - 20291887
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  20291807 ttccatacaccttgattttggttacttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 20291887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 23786191 - 23786271
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  23786191 ttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 23786271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 509
Target Start/End: Original strand, 30780395 - 30780475
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgct--tcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  30780395 catacactttgttttggttgcttgattattccttactccacacacatcaagtttgttattggtgtgagttttcatcgaatt 30780475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 40133856 - 40133929
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    |||||||||| || | || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40133856 tttgttccaatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcagagtaaatcttgagatataggg 40133929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 46431635 - 46431555
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  46431635 ttccatacgctttgttttggttgcttgattatctcttgctccaaacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 46431555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 85
Target Start/End: Original strand, 6756469 - 6756521
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  6756469 tacttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggg 6756521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10399758 - 10399676
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg--attttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  10399758 ttccatacactttgattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatattttcatcgaatt 10399676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 16428570 - 16428669
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  16428570 agatttgttcgaattttataagggatacttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 16428668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12302849 - 12302770
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaacctt----gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  12302849 tacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 12302770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17324976 - 17324902
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  17324976 atacttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggct-aaaacaagggtttagaa 17324902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15669732 - 15669659
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagttt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||||    
T  15669732 gatacttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggttt 15669659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 20302792 - 20302872
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||| || |||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  20302792 ttccatacaccttgattttggttacttgattatctcttgctccagacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 20302872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 24325575 - 24325636
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaac 71  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24325575 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaac 24325636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 24326014 - 24326094
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| || ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  24326014 ttccatacactttactttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 24326094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 46432090 - 46432017
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  46432090 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagag 46432017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 47906183 - 47906256
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  47906183 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagag 47906256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307812
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaa-aagggtttagaaa 50307812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 300
Target Start/End: Original strand, 10115926 - 10115993
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 300  Q
    ||||||||||||||| | | | ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10115926 gtagaattaggtttgaacagtcattcttgaaaccatttgatatctcttt-gtaaagttactcatcatta 10115993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 283
Target Start/End: Original strand, 6824056 - 6824091
Alignment:
Q  248 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6824056 agacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Original strand, 10116120 - 10116192
Alignment:
Q  435 acactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10116120 acacgttgttttggttatttgattaat--ttgctccacacatcaagtattttattggtgtgatttttaacgaatt 10116192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13785410 - 13785342
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||  |  |||||||||||||||||||    
T  13785410 gactttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataaccctttggaa--tcttttgtaaagttactca 13785342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 509
Target Start/End: Original strand, 43104548 - 43104608
Alignment:
Q  447 ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43104548 ggttgcttgattatt--ttgcttcacatatcaaatattttattggtgtaattttcatcaaatt 43104608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 500
Target Start/End: Original strand, 47451962 - 47452048
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||  | | |||||| |||||||||    
T  47451962 ttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcgacacatcaaatttgttattgatgtgatttt 47452048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 65
Target Start/End: Original strand, 49958963 - 49959018
Alignment:
Q  10 gatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga 65  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  49958963 gatttgttccaaattttgtgggatgcttttgctataaatatagaccttgtatcaga 49959018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 2510690 - 2510636
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2510690 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 2510636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15295183 - 15295137
Alignment:
Q  37 tttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  15295183 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 15295137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 49
Target Start/End: Original strand, 46782972 - 46783010
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaata 49  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  46782972 atttgttccaaattttaagggttacttttactataaata 46783010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11693397 - 11693352
Alignment:
Q  279 tttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  11693397 tttgaaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctct 11693352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 502
Target Start/End: Original strand, 13433478 - 13433568
Alignment:
Q  410 ttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttca 502  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||| || | |||||||||||||||| ||||||    
T  13433478 ttttgcttgtatttataactgtcacccacgttgttttggttgcttgatta--atttgctccacagattaagtattttattggtgtggttttca 13433568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 8349413 - 8349314
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  8349413 agatttgttccaattttatgagggataattttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctg-aaacaagggtttaga 8349315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 47177713 - 47177784
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  47177713 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 47177784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 179)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Original strand, 12102060 - 12102559
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattttaagcgata-cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggag-ctgaaaacaagagtttag 105  Q
    |||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  12102060 gagatttgttccaattttttagggatttcttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttag 12102159  T
Q  106 aaacaaacaataaactagggttttagaga--tttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |     
T  12102160 aaacaaacaacaaactagggttttagagagatttctctaagcgggagaaactagggttgttgttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatc 12102259  T
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||||| | | ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12102260 ttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 12102359  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctt 401  Q
    |||||| ||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||| |||| ||    
T  12102360 gtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaatttcgtatg----ctctctctttctctcactgt-tt 12102454  T
Q  402 tttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12102455 tttac---ttttgcttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgctcggttattacttgctccacacatcaagtagtttattggtgtgattttc 12102551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18535187 - 18534690
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaa 111  Q
    |||||||||| || | || ||| ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  18535187 tttgttccaatttatgagggatgcttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaacaa 18535088  T
Q  112 acaataaactagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggt 207  Q
    |||| ||||||||||||   ||||| || ||||  |    | |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  18535087 acaacaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 18534988  T
Q  208 tacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 307  Q
     ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  18534987 cacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtgga 18534889  T
Q  308 atggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttac 406  Q
    | ||| |  |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    |    
T  18534888 acggaggggtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcgctatttt----c 18534793  T
Q  407 tatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcga 506  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18534792 tacttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattggtgtgagtttcatcga 18534693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18537829 - 18537332
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaa 111  Q
    |||||||||| || | || ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18537829 tttgttccaatttatgagtgatgcttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaacaa 18537730  T
Q  112 acaataaactagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggt 207  Q
    |||| ||||||||||||   ||||| || ||||  |    |  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  18537729 acaacaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaccactagggttggggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 18537630  T
Q  208 tacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 307  Q
     ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537629 cacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 18537531  T
Q  308 atggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttac 406  Q
    | ||| | ||||||||| ||| | | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||||||| |||   ||||     
T  18537530 acggagggctgctctctcccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaattttgtgcgttctctctttctttctctcgttgt---ttta- 18537435  T
Q  407 tatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcga 506  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  18537434 tacttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttgattgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttataggtgtgaacttcatcga 18537335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8756611 - 8756110
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||     
T  8756611 agatttgttccaaattataaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaag 8756512  T
Q  109 caaacaataaact-agggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtct-t 202  Q
      ||||| ||| | ||| |||   ||||| || ||||  |    | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| |    
T  8756511 tcaacaagaaaattaggatttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctct 8756412  T
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8756411 ttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacg-ggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattata 8756313  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctt 401  Q
    |||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  8756312 gtggaacggatggttgctctctcctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctcgttgt-tt 8756214  T
Q  402 tttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    |||||   ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8756213 tttac---ttttgcttgtgtttataactgtcacccac-ttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattgatgtgattttc 8756118  T
Q  502 atcgaatt 509  Q
    ||||||||    
T  8756117 atcgaatt 8756110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 41 - 509
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19323170
Alignment:
Q  41 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaa-ctagggttt---tagagatt 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||   ||||| ||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaa-caagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  137 tctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtag 235  Q
     ||||  |    | |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  19322800 gctcttggcaacaaacactagggtttgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtag 19322899  T
Q  236 aattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagacta 334  Q
    |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||  |||||||||    
T  19322900 aattaggcg-ggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagacta 19322998  T
Q  335 ggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgt--gtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttcc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||  | ||   ||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  19322999 ggtcagttttggaccgaactggataaac-aaattctttagtgttctctctttctttctccaggtg---tttta-tacttttgctcgtgtttataacttcc 19323093  T
Q  433 atacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19323094 atacactttattttagttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattggtgtgattttcatcgaatt 19323170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16186200 - 16185707
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaatttta--agcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  16186200 gagatttgttccaa-ttttaggagggatacttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttag 16186102  T
Q  106 aaacaaacaataaactagggtttt-agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgattt-----accttggg--aaacactgttaggat-g 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||     ||||||    ||||||||||||||| |    
T  16186101 aaacaaacaacaaactagggtttagagagatttctctaagcgggagacactaaggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattg 16186002  T
Q  197 agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc 296  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16186001 agtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatcttt-gtaaagttactcatc 16185903  T
Q  297 attatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctt-tctctcg 394  Q
    ||||||||||||  || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||    
T  16185902 attatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctcttttttgtttctcg 16185803  T
Q  395 ctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgt 494  Q
     ||    ||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  16185802 ttg----ttttctacttttgcttgtgtttataactgtcacccac-ttgttttggttgcttgatta--atttgctccatacatcaagtattttattggtgt 16185710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 500
Target Start/End: Original strand, 25357608 - 25358106
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaatttta--agcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag-----ggagctgaaaacaagagt 101  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||     || |||||||||||| ||    
T  25357608 agatttgttccaa-ttttacgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggctgaaaacaagggt 25357706  T
Q  102 ttagaaacaaacaataaactagggttt-tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  25357707 ttagaaacaaacaacaaactagggtttagagagatttctctaagtgggagacactagggttgtgattgattcaccttgggaaatactattaggattgagt 25357806  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttg----tgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    || ||||| | | |||||||| | |||||||    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357807 ctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcat 25357906  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa-attcgtgtgtgctctctttctttctctc 393  Q
    ||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  25357907 cattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctc-ttctttctctc 25358005  T
Q  394 gctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgtt-ttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattg 490  Q
    | ||    ||| ||| ||||| ||||||||||||   ||||   ||| ||||| ||||||||||||||  |  || || ||||||||| |||||||||||    
T  25358006 gttg----ttttctacttttgcttgtgtttataattgttcc---cacgttgttattggttgcttgattgct--ttcctccacacatcaagtattttattg 25358096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 28453658 - 28454160
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaat-tttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  28453658 agatttgttccaattatttgagggatatttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttaga 28453756  T
Q  107 aacaaacaataaa-ctagggtttt-agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttt 203  Q
    | | |||| |||| |||||||||  |||| || ||||  |   || |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  28453757 agccaacactaaaactagggtttgcagagtttgctcttggcaagaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctct 28453856  T
Q  204 tggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 303  Q
    |||||||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28453857 tggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggtt-gaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 28453955  T
Q  304 tggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttt 402  Q
    ||||| |||  ||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | |  | |    
T  28453956 tggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctttctccggttgt 28454055  T
Q  403 ttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttca 502  Q
    || ||| ||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28454056 tttctacttttgcttgtgtttataattgtcatccactttgttttggtttcttgattatt--ttgcttcacacatcaagtaatatattggtgtgattttca 28454153  T
Q  503 tcgaatt 509  Q
     ||||||    
T  28454154 acgaatt 28454160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 38890434 - 38890091
Alignment:
Q  155 tagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagactt 253  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    ||||||||    
T  38890434 tagggttggggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattagaag-ggagactt 38890336  T
Q  254 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaa 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  38890335 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaa 38890236  T
Q  353 ctggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttg 451  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38890235 ctgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttttctctcgctgt-tttcta--attttgccttgtgtttataacttccatacactttg-tttggttg 38890140  T
Q  452 cttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    || ||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  38890139 ctagattattccttgctccacatatcaaatattttattggtgtgatttt 38890091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 39 - 500
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997958
Alignment:
Q  39 tactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaac-aaacaataaa-ctagggttt---tagag 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||  |||||| ||| |||| ||||   |||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaa-caagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagag 41997592  T
Q  134 att-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagacttt 229  Q
     || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||||| ||| |||| |||| |||    
T  41997593 tttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagatttt 41997692  T
Q  230 gtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccca 329  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | | ||||||| ||||    
T  41997693 gggtagaattaggtg-ggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctctcccca 41997791  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt-ctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataac 428  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||||||| |||||||||| ||    ||| ||||||||||| |||||||    
T  41997792 gactaggttaattt-ggaccgaactggataaacaaatttcataagttctctctttctttgctctcgctgtttt----ctacttttgtttgtgattataac 41997886  T
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  41997887 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcactttctccacacatcaagtttattattggtgtgttttt 41997958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 33 - 509
Target Start/End: Original strand, 36378288 - 36378770
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-- 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||      
T  36378288 tacttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 36378386  T
Q  129 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagagatgga 223  Q
     ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||| || |||||| |||||||| |     
T  36378387 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgg 36378486  T
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  36378487 gactttgggtagaattaagcg-ggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctc 36378585  T
Q  324 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgt 421  Q
    |  ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |  ||||| |||||||  ||||||  ||||| ||| |||  |||| ||||||||    
T  36378586 tcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctcttcttttctcctgctgt-tttctac--ttttcgtttgtgt 36378681  T
Q  422 ttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36378682 ttataattgtttcatacactttg-tttggttgcttgattattacttgctccacatatcaagtattttattggtgtgattttcatcgaatt 36378770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 246 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15032666 - 15032401
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagtttt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   |||||||||  |||| ||||||||||| ||    
T  15032666 ggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtatt 15032567  T
Q  345 ggaccgaact-ggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtct-ttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttg 442  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||  || |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15032566 ggaccgaactagggtatacaaatttcgtgtgttctttctttctttctttctctcgctgtttttctacttttgtttatgtttataacttccatacactttg 15032467  T
Q  443 ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032466 -tttggttgcttgattattacttgctccgcacatcaagtattttattggtgtgattttcatcgaatt 15032401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22801223 - 22800712
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa- 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||     
T  22801223 agatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaat 22801125  T
Q  108 -acaaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
     ||||  |  ||||||| ||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  22801124 gacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 22801025  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||| ||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22801024 ctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 22800927  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgct 396  Q
    |||||||||  || | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  22800926 atagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgct 22800828  T
Q  397 gt--ctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggt 492  Q
    ||  |||| |||  |||| | ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  22800827 gttgctttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatatactttgttttggttgcttgactatcccttgctccccacatcaagtttgttattggt 22800730  T
Q  493 gtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22800729 gtgatttttcatcgaatt 22800712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22803095 - 22802584
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||     
T  22803095 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaat 22802997  T
Q  108 -acaaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||| |||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22802996 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 22802897  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22802896 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-t 22802799  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgct 396  Q
    ||||||||| ||| |  | ||||||  ||||||||||||||  |||| |||||||| | | |||||| | |  ||||| || |||| | |||||||||||    
T  22802798 atagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtca-atttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctttttctctcgct 22802700  T
Q  397 gt--ctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggt 492  Q
    ||  |||| |||  |||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  22802699 gttgctttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggt 22802602  T
Q  493 gtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22802601 gtgatttttcatcgaatt 22802584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31983870 - 31983505
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggag-----ctgaaaacaagagtttagaaacaaa---caataaact 121  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||     ||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||    
T  31983870 gatacttttattataattatagacattgtatcagatgtaaactttgagagagaggtagagagtctgaaaacaagggtttagaaacaaattacaacaaact 31983771  T
Q  122 agggtttta-gagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagaga 219  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||| | | |||||||    
T  31983770 agggtttaaagaggtttctccaagcgggagacattagggttgag-ttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagaga 31983672  T
Q  220 tggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgc 319  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  31983671 ttgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaaccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgc 31983572  T
Q  320 tctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttct 386  Q
    ||||| || | ||||||| ||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  31983571 tctctcccaatactaggtaagtattagaccaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctttctttct 31983505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 461
Target Start/End: Original strand, 24878963 - 24879424
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |    
T  24878963 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaa-ctagggtttagaaaga 24879061  T
Q  111 -aacaataaa-ctagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtct 201  Q
     ||||| ||| |||||||||   ||||| || |||||  |    | |||| ||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24879062 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 24879161  T
Q  202 tttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcatta 300  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||    
T  24879162 cttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatca-ta 24879259  T
Q  301 tagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctg 397  Q
    ||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | || ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  24879260 tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttccttttctctcgctg 24879358  T
Q  398 tctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattatt 461  Q
    | | ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879359 t-tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatt 24879424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 500
Target Start/End: Original strand, 10112876 - 10113334
Alignment:
Q  42 tataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaaca-ataaactagggttt-tagagatttc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||| | |||| | |||||||||||| ||||| || |    
T  10112876 tataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaagccaacacaaaaactagggtttgtagagtttgc 10112975  T
Q  139 tctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcg-aagagatggagactttgtgtaga 236  Q
    |||  |    | |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||| | |||||||   ||||||| |||||    
T  10112976 tcttggcaacaaacactagggttgagattgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtaga 10113075  T
Q  237 attaggtttggagacttattcttgtaacccatt-gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccca-gacta 334  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||    
T  10113076 attagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctcttt-gtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagacta 10113174  T
Q  335 ggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccat 434  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||    |||||||||||||| ||   | ||  ||| ||||| |||||||||||| |  ||     
T  10113175 ggttagtattggaccgaactgggtaaaaaaaattcatgtgt----tctttctttctctctctcaatgttatctacttttgcttgtgtttataaatgtcac 10113270  T
Q  435 acactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10113271 ccactttgttttggttgcttgattatt--ttgctccacacatcaaatattttattggtgtgatttt 10113334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 5198392 - 5198888
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  5198392 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 5198490  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  |||||||| |||   ||||| || |||||  |    | |||||||| ||    |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  5198491 ggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagt 5198590  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    |||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |    
T  5198591 cttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-t 5198688  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 398  Q
    |||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||  | ||| |||||| | |||| |||         |||||| ||    
T  5198689 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgtgtcaac-aaattcttttgtgttct---------tctcgccgt 5198777  T
Q  399 ctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgat 497  Q
      |||| ||| |||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  5198778 tgtttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaagt-tattattggtgtgat 5198876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40091774 - 40091266
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |    
T  40091774 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaga 40091676  T
Q  111 -aacaataaa-ctagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtct 201  Q
     ||||| ||| |||||| ||   ||||| || |||||  |    | |||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  40091675 caacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtct 40091576  T
Q  202 tttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
     ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  40091575 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tat 40091478  T
Q  302 agtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctgtc 399  Q
    |||| ||  || | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||||| |||||| |||| ||  |    
T  40091477 agtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctctcttcttt-tctctcttgc 40091381  T
Q  400 tttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
    | ||| ||| |||| | ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  40091380 tattttctacttttggcttgtgtttataattattccatacactttattttggttgcttgattatcttttgctccacacatcaagtttgttattggtgtga 40091281  T
Q  497 --ttttcatcgaatt 509  Q
      |||||||||||||    
T  40091280 atttttcatcgaatt 40091266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 33 - 497
Target Start/End: Original strand, 40637070 - 40637545
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-- 128  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||      
T  40637070 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 40637168  T
Q  129 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgga 223  Q
     ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  40637169 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattga 40637268  T
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  40637269 gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctc 40637366  T
Q  324 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgt 419  Q
    |  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||    
T  40637367 tcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgt 40637464  T
Q  420 gtttataa--cttccatacactttg--ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgat 497  Q
    | ||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  40637465 gattataattgttccatacactttgttttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgat 40637545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 48486291 - 48486653
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||     
T  48486291 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaat 48486389  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  48486390 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 48486489  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  48486490 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatca-t 48486587  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||    
T  48486588 atagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggactgaactgggtcaacaaa 48486653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 500
Target Start/End: Original strand, 9863712 - 9864179
Alignment:
Q  41 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatag-agggagctgaaaa-caagagtttagaaac---aaacaataaactagggttt-tagaga 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| |   |||||| |||||||||||| |||||     
T  9863712 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttagaagccaaaaacaa-aaactagggtttgtagagt 9863810  T
Q  135 tttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgt 233  Q
    ||  |||  |    | |||||| ||||| | |||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||    
T  9863811 ttgttcttggcaacaaacactaaggttgggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgggt 9863910  T
Q  234 agaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac---tcatcattatagtggaatggatgactgctctct---tcc 327  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||   |||||||||    ||    
T  9863911 agaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccc 9864009  T
Q  328 cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtg--tttat 425  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||    ||| ||| ||||| |||||  |||||    
T  9864010 cagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgattttat 9864105  T
Q  426 aac--ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||  ||||   |||||| |||||||| ||||||||||  ||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9864106 aactgttcc---cactttattttggtttcttgattattttttcttccacacatcaagtattttattgatgtgatttt 9864179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36919948 - 36919436
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttga--gatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||||||| |||| |||||||    
T  36919948 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaa-caagggtttaga 36919850  T
Q  107 aa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagaggg-agacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-g 196  Q
    ||  |||  |  ||||||||||||   || || || |||||  |     | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  36919849 aaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 36919750  T
Q  197 agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc 296  Q
    ||||| ||||||||| ||||||   | ||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36919749 agtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatc 36919651  T
Q  297 attatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcg 394  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||      
T  36919650 a-tatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctct-- 36919555  T
Q  395 ctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattgg 491  Q
    ||  || ||| ||| |||||  ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||    
T  36919554 ctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattgg 36919455  T
Q  492 tgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  36919454 tgtgatttttcatcgaatt 36919436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 461
Target Start/End: Original strand, 24880423 - 24880888
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| || | |||| || |||||||||    
T  24880423 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggc-gtaaactagggtttagaaa 24880521  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24880522 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagt 24880621  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcat 298  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  24880622 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatca- 24880719  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgc 395  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | || ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  24880720 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttccttttctctcgc 24880818  T
Q  396 tgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactt--tgttttggttgcttgattatt 461  Q
    ||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24880819 tgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccgtacactttgtgttttggttgcttgattatt 24880888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 47151218 - 47150833
Alignment:
Q  43 ataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatag-agggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt-tagagatttct 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||| || ||    
T  47151218 ataaatataaacattctatcagatgtaaaccttgagagattagagagctgaaaacaagggtttagaagccaacacaaaactaaggtttatagagtttgct 47151119  T
Q  140 ctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaat 238  Q
    ||  |      ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||| |||| |||| |||||||    
T  47151118 cttggtaaccaacactagggttgaaattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaat 47151019  T
Q  239 taggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggt 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||   || | ||| ||| |||||||||    
T  47151018 taggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggt 47150919  T
Q  338 cagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa 427  Q
    || | |||||||||| ||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    ||| ||||||||||||||||||    
T  47150918 caatattggaccgaattgggtaaactaatttcttgtgttctctctttctttctctcgttgtctt----ctacttttgtttgtgtttataa 47150833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 24888768 - 24889279
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  24888768 agatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 24888866  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||| ||   ||||| || |||||  |    | |||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24888867 ggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 24888966  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| |||||||    ||||||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  24888967 ctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatca-t 24889064  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgct 396  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  |||||  |||||| | |||||||||||    
T  24889065 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttctttttctctcgct 24889163  T
Q  397 gtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtg 493  Q
    || | ||| ||| |||| | ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  24889164 gt-tgttttctacttttggcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgttagattattccttgctccacacatcaagt-tgttattggtg 24889261  T
Q  494 tg--attttcatcgaatt 509  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  24889262 tgatattttcatcgaatt 24889279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 173 - 509
Target Start/End: Original strand, 2891434 - 2891773
Alignment:
Q  173 accttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||    
T  2891434 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggca-ggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  272 tatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tc 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||  ||   |||||||||||||| | |||||| | |     
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtaca-acttggaccgaactgggtcaacaaattctt 2891631  T
Q  370 gtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttt-tactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttg 466  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| |  | |||| |||  |||| | ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  2891632 ttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacactttattttggttgcttgattattctttg 2891729  T
Q  467 cttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    || ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  2891730 ctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 2891773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 16453443 - 16453789
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  16453443 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcg-ggagacttattcttgta 16453541  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    ||    
T  16453542 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgcgccaa 16453640  T
Q  362 caaaattc--gtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataac--ttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
     |||||||   ||||| |||||||  |||||||| |||| ||| |||  |||| | ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16453641 -aaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcactgt-tttctac--ttttggcttgtgattataactgtttcatacactttgttttggttgcctgat 16453736  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  16453737 tatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 16453789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38928536 - 38928031
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--c 109  Q
    |||||||||| || | || ||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |    
T  38928536 tttgttccaatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagagtttagaaaggc 38928438  T
Q  110 aaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagaggg-agacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtct 201  Q
    ||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |     | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38928437 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 38928338  T
Q  202 tttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
     ||||||||| ||| |||| | | ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  38928337 cttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tat 38928240  T
Q  302 agtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtc 399  Q
    |||  || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||| ||||| |||     
T  38928239 agtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttatctcgttgt- 38928142  T
Q  400 tttttactatttttgtttgtgtttataac--ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga- 496  Q
    ||| |||  |||| | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||     
T  38928141 tttctac--ttttggcttgtgattataactgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgat 38928044  T
Q  497 ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||    
T  38928043 ttttcatcgaatt 38928031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 164 - 510
Target Start/End: Original strand, 36380483 - 36380828
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  36380483 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 36380581  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  36380582 actcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtca-atttggagcgaactgggtaaa 36380680  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgatt 458  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||   |||| ||| |||  |||| | ||||||||||||   || ||||||||||| |||| |||||||||     
T  36380681 caaattcttttgtgttctctcttcttttctccttctgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttg-tttgattgcttgatc 36380776  T
Q  459 attacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaattg 510  Q
    ||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36380777 attacttactccacacatcaaatattttattggtgtgattttcatcgaattg 36380828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 163 - 509
Target Start/End: Original strand, 16455374 - 16455707
Alignment:
Q  163 tggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  16455374 tggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 16455472  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |    
T  16455473 aactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 16455571  T
Q  361 acaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataac--ttccatacactttgttttggttgcttgatt 458  Q
    || |||||| ||||            |||||||||||| ||| ||   |||| | || || |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16455572 ac-aaattcttgtg------------ttctctcgctgt-tttcta--gttttagcttatgattataactgttccatacactttgttttggttgcctgatt 16455655  T
Q  459 attacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    || ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  16455656 atcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 16455707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 619810 - 619306
Alignment:
Q  7 agagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |    
T  619810 agagattttttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttata 619712  T
Q  107 aaca-aacaataaa-ctagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-ga 197  Q
    || | ||||| ||| |||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  619711 aagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattga 619612  T
Q  198 gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 297  Q
     | | ||||||| | |||||||| | | ||||| |||||||||||   ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  619611 ctgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcg-ggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca 619513  T
Q  298 ttatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgct 396  Q
     ||||||| || ||||||||||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||||| |||||| |||    
T  619512 -tatagtgaaacggatgactgctctctcccctaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctttc-ttctct-gct 619417  T
Q  397 gtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
    || | ||| ||| ||||| ||||| ||||||||   || ||| |||| |||||||||||| |||  ||| || |||||||||  | | |||||||||||     
T  619416 gt-tgttttctacttttgcttgtgattataactgtgatccac-ttgtattggttgcttgactatcccttactccacacatcaaatttattattggtgtgt 619319  T
Q  497 ttt-tcatcgaat 508  Q
    ||| |||||||||    
T  619318 tttctcatcgaat 619306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 353
Target Start/End: Original strand, 47274699 - 47275047
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  47274699 agatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 47274797  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt-tagagatttctctaagagggag--acactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtc 200  Q
      |||  |  |||||||||||| || |  ||| |||    || |   |||||||||||    |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  47274798 ggcaacaacaaaactagggtttgtataagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtc 47274897  T
Q  201 ttttggttacgcgaaga-gatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    | ||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47274898 tcttggttacgggaagaagctgg-gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 47274994  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaac 353  Q
    |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47274995 atagtgaaacggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaac 47275047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415352
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---ta 130  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||   ||||| ||| |||||||||   ||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 33415723  T
Q  131 gagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagac 226  Q
    ||| || |||||  ||   | |||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
T  33415722 gagtttgtctcttggaacaa-acactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 33415624  T
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc 326  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| |    
T  33415623 tttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 33415526  T
Q  327 c-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttta 424  Q
    | ||| ||||||||  ||||||||||||||| | || ||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||  |||| | |||||||||    
T  33415525 ctcaggctaggtca-atttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgtgttta 33415430  T
Q  425 taa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt 499  Q
    |||   | |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | ||||| |||||||||    
T  33415429 taattgtcccatacactttgattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttatttgtgtgattt 33415352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17662444 - 17662099
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||  | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  17662444 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 17662346  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  17662345 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 17662248  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    | |||||| | |||| ||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| |||| |  |||| ||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17662247 c-aaattcttttgtgttctctcttctttttctcgctgt-tgttttctacttttggcatgtgattataattgttccatacactttggtttgattgcttgat 17662150  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  17662149 tatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcaacgaatt 17662099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36921692 - 36921345
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  36921692 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 36921594  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||||| | ||    
T  36921593 atccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagacta-gttaaatttggaccgaactgggtcaa 36921496  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    | |||||| | |||| ||||| |||||| |||| ||  || ||| ||| |||| | ||||||||||||   || |||||||||| |||||||||| ||||    
T  36921495 c-aaattcttttgtgttctctcttcttt-tctctcttgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttattttggttgcctgat 36921398  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  36921397 tatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 36921345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 6764978 - 6765328
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||   | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6764978 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtg-ggagacttattcttgta 6765076  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  6765077 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 6765174  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctc-tct-ttct-----ttc-tctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgct 453  Q
    | |||||| | |||| || ||| ||||     ||| |||||| || | ||| ||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6765175 c-aaattcttttgtgttcttctcttcttggtgttcttctcgccgt-tgttttctactttggcttgtatttataa-ttccatacactttgttttggttgct 6765271  T
Q  454 tgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||  ||| || ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  6765272 tgattatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 6765328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9174507 - 9173994
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  9174507 agatttgttacagtttttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 9174409  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtg-gttgatttaccttgggaaacactgttaggatg--ag 198  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | | ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||    
T  9174408 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaag 9174309  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||     
T  9174308 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacggtactcatca- 9174212  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattc-gtgtgtgc-tctctt-----tctttct 390  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| |||  ||||| | ||||||     | ||  |    
T  9174211 tatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttctttgtgttctt 9174113  T
Q  391 ctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttatt 489  Q
    ||||| ||  |||| ||| |||| | |||| ||||    || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||    
T  9174112 ctcgccgttgtttttctacttttggcttgtatttaattatttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttatt 9174014  T
Q  490 ggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
     |||||||||||||||||||    
T  9174013 agtgtgattttcatcgaatt 9173994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22044751 - 22044390
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  22044751 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 22044653  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22044652 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagt 22044553  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  22044552 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 22044456  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||| | ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  22044455 atagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 22044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22047046 - 22046685
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  22047046 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 22046948  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||| |  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22046947 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 22046848  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  22046847 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 22046751  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||| | ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  22046750 atagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 22046685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 398
Target Start/End: Original strand, 22295218 - 22295533
Alignment:
Q  93 aacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttttagaga--tttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgtt 190  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||    
T  22295218 aacaagggtttaggaacaaacaacaagctagggttttagagagatatctctaagtgggagacactagggttgtgagtgattcaccttagtaaacattgtt 22295317  T
Q  191 agga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattg------atatctcttttgt 283  Q
    |||| | ||||| ||||| |||  ||||||| || |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||      ||     ||||||    
T  22295318 aggatttagtctcttggtcacggaaagagattgaaactttgagtataattagggttgaagacttattcctgtaaccctttgagtagaattaggattttgt 22295417  T
Q  284 aaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||    
T  22295418 aaagttactcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagggcagtattggactgaactgggtaaacaaatttcatgtgttctctct 22295517  T
Q  383 ttctttctctcgctgt 398  Q
    | ||||||||||||||    
T  22295518 tcctttctctcgctgt 22295533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 51015218 - 51015579
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  51015218 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 51015316  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||| | || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51015317 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 51015416  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||| |    
T  51015417 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-t 51015513  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||| | ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  51015514 atagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 51015579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 7941291 - 7941657
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  7941291 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 7941389  T
Q  107 aa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggaga--cactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat- 195  Q
    ||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| |   | | |  |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  7941390 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 7941489  T
Q  196 gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    |||||| ||||||||  ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  7941490 gagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcat 7941588  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    || ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  7941589 ca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 7941657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 166 - 339
Target Start/End: Original strand, 13544095 - 13544268
Alignment:
Q  166 ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 264  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  13544095 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaac 13544193  T
Q  265 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc-ttcccagactaggtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13544194 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtca 13544268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 166 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14787628 - 14787281
Alignment:
Q  166 ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 264  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  14787628 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtg-ggagactttttcttgtaac 14787530  T
Q  265 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct---tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||    ||||||||||||||  |||||||| |||||| | ||    
T  14787529 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaa 14787432  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgc-tctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    | |||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||   | ||| ||| |||| | ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14787431 c-aaattcttgtgttcttctc-ttctttttctctctagttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgat 14787334  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  14787333 tatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 14787281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16934504 - 16934142
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  16934504 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgata-caagggtttagaaa 16934406  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gag 198  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | | ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||  |||    
T  16934405 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggag 16934306  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||     
T  16934305 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca- 16934209  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  16934208 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 16934142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18409546 - 18409210
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||| || ||||   |||||||| ||||||||  |||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  18409546 ggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcg-ggagatttattcttgta 18409448  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||    |||||||| || |||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||    
T  18409447 acccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctcagactaggtcaattt-ggattgaactgggtaaa 18409350  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgt-ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattat 460  Q
    |||| ||||||| |  | | ||| ||| | || ||  || ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18409349 caaatttcgtgttttttttttttttttttttctctcgctattttctacttttgtcttgtgattataacttccatacactttgttttggttgcttgactat 18409250  T
Q  461 tacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
     ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  18409249 cacttgctccacacatcaagtttattattggtgtgatttt 18409210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 180 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3982362 - 3982045
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatg-gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  3982362 gaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctc 3982263  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaa-aattcgtgtgt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || || ||||||||| | |||||||||||  | |||||||   ||| |||||    
T  3982262 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaacaaggtaaacaatttttcatgtgt 3982163  T
Q  376 gctctctttctttctctcgctgtctttttactat-ttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacac 474  Q
      ||||| ||||||||||||||    ||| ||||  |||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||  | || || |||||    
T  3982162 --tctctctctttctctcgctg----ttttctatcgtttgtttgtgtttataactgtcacccacttttttttggttgcttgatta--attttctccacac 3982071  T
Q  475 atcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  3982070 accaagtattttattggtgtgatttt 3982045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 246 - 478
Target Start/End: Original strand, 4215522 - 4215752
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagtttt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||    
T  4215522 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-attt 4215619  T
Q  345 ggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacacttt 441  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||| || ||| |||  |||| | ||||| ||||||   || ||||||||||    
T  4215620 ggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctctttcttttctctcgcagt-tttctac--ttttggcttgtgattataattgtttcatacacttt 4215715  T
Q  442 gttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4215716 gtttttgttgcttgattattccttgcttcacacatca 4215752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395712
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaa-caaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 12396082  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || ||||||      | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||    
T  12396081 agagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtga 12395982  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||  | |||||||||     
T  12395981 ctttgggtagaattaggcg-ggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctc 12395884  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttc--tctcgctgtctttttactatttttgtttgtgt 421  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||| || | |||||| | |  ||||| ||||||| |||||  ||||| |||| || |||  |||| |  |||||    
T  12395883 ccccagactaggtca-atttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttcctttctgtctcgttgtc-ttctac--ttttggcatgtgt 12395788  T
Q  422 ttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
    ||||||   ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  12395787 ttataatttttcgatactctttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 12395712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 11434927 - 11435288
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  11434927 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 11435025  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11435026 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 11435125  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    ||  |||||||  ||||||     ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  11435126 ctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 11435222  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  11435223 atagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 11435288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 30136670 - 30137026
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||| | |||| ||||| ||| ||||| || | ||||||| |||||||||||   | ||    
T  30136670 acactagggttggggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaattaggcg-gaag 30136768  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggac 348  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||| | | | |||||||||  |||||||    
T  30136769 acttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcctcaatactaggtca-atttggac 30136867  T
Q  349 cgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgtttt 446  Q
    |||| |||||||||||| | |  ||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  30136868 cgaattggataaacaaattcttttgtgttctctctttcttttctcttgttgt-tttctac--ttttggtttgtgtttataacttctatacacttt-attt 30136963  T
Q  447 ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt-catcgaatt 509  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||| ||||  || ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  30136964 ggttgtttgattattacttgttccacatatcaaata-tttattgatgtgattttacatcgaatt 30137026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 18847125 - 18847486
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||    
T  18847125 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaa-caagggtttagaaa 18847223  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gag 198  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||    
T  18847224 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggag 18847323  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||     
T  18847324 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca- 18847420  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  18847421 tatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 18847486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 40999308 - 40999005
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||      
T  40999308 agatttgttccaaattttaagggttatttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagacg 40999210  T
Q  109 caaacaataaa-ctagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttt 203  Q
      ||||| ||| |||||| ||   ||||| || ||||       | |||||||| ||| | |||||| |||| || ||||| | ||||||| |||||| |    
T  40999209 tcaacaagaaaactaggggttgtatagagtttgctcttgacaacaaacactaggattgagattgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctct 40999110  T
Q  204 tggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 303  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40999109 tggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag 40999010  T
Q  304 tggaa 308  Q
    |||||    
T  40999009 tggaa 40999005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5637830 - 5637530
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggagctgaaaacaagagttta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||    ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5637830 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagagttta 5637732  T
Q  105 gaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat- 195  Q
    ||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  5637731 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 5637632  T
Q  196 gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5637631 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggca-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 5637533  T
Q  296 cat 298  Q
    |||    
T  5637532 cat 5637530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8631618 - 8631267
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  8631618 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 8631520  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  8631519 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 8631422  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    | |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||| ||  |||| ||| |||| | |||| ||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  8631421 c-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgtttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttagttgc 8631323  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  8631322 ttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 8631267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 9148223 - 9148586
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  9148223 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaag-caagggtttaga 9148321  T
Q  107 aa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-ga 197  Q
    ||  |||  |  |||||||| |||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9148322 aaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 9148421  T
Q  198 gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 297  Q
    |||| ||||||||| ||||||   | ||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  9148422 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 9148519  T
Q  298 ttatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     |||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  9148520 -tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 9148586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9176835 - 9176322
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| ||  |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  9176835 agatttgttacagtttttaagcaagacatttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 9176737  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gag 198  Q
      |||  |  ||||||||||||   || || || ||||| ||  | |  |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  9176736 agcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 9176637  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||     
T  9176636 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca- 9176540  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattc---gtg-tgtgctc-tctttct-ttc-t 390  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |  | |||||| |||   ||| | | ||| ||||| | ||| |    
T  9176539 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgttattctcttctttgtgttctt 9176441  T
Q  391 ctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttatt 489  Q
    ||||| ||  |||| ||| |||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||    
T  9176440 ctcgccgttgtttttctacttttggcttgtatttaattattccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttatt 9176342  T
Q  490 ggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  9176341 ggtgtgattttcgtcgaatt 9176322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 12401006 - 12400674
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  12401006 ggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcg-ggagacttattgttgta 12400908  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||  | |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| || | ||    
T  12400907 acccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaacagggtcaa 12400810  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttc--tctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttga 456  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| |||||  ||||| |||| || |||  |||| |  |||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  12400809 caaactcttttgtgttctctcttcctttctgtctcgttgtc-ttctac--ttttggcatgtgtttataatttttcgatactctttgttttggttgcctga 12400713  T
Q  457 ttattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  12400712 ttatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 12400674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22782937 - 22782737
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22782937 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 22782839  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  22782838 aacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactggatca 22782742  T
Q  361 acaaa 365  Q
    |||||    
T  22782741 acaaa 22782737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 24348352 - 24348685
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||    
T  24348352 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgta 24348450  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  24348451 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 24348548  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactattttt-gtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattat 460  Q
    | |||||| | |||| |||         |||||| || | ||| |||||||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348549 c-aaattcttttgtgttct---------tctcgccgt-tgttttctatttttggcttgtatttagttgttccatacactttgttttggttgcttgattat 24348637  T
Q  461 tacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
      |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  24348638 cccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 24348685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 14633453 - 14633652
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  14633453 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 14633550  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  14633551 acccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 14633648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16932150 - 16931788
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  16932150 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgata-caagggtttagaaa 16932052  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gag 198  Q
      |||  |  ||||||||||||   |||||  | ||||| ||  | | ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||  |||    
T  16932051 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggag 16931952  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||     
T  16931951 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca- 16931855  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  16931854 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 16931788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 47868535 - 47868735
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  47868535 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 47868633  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  47868634 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactggatcaa 47868731  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  47868732 caaa 47868735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31849960 - 31849447
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  31849960 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 31849862  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgtg---gttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gag 198  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||| |||| ||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31849861 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 31849762  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||| ||||| ||||||   ||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||     
T  31849761 tctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca- 31849665  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------c 389  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||| | ||| |||||| | |||| || ||| ||||||           
T  31849664 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttgaaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttct 31849567  T
Q  390 tctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttat 488  Q
    |||||| ||  |||| ||| |||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||    
T  31849566 tctcgccgttgtttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttat 31849468  T
Q  489 tggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31849467 tggtgtgattttcatcgaatt 31849447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 38409171 - 38409538
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga------tagagggagctgaaaacaagagtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||      ||||||| ||||||| |||  |||    
T  38409171 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaa-caatggtt 38409269  T
Q  103 tagaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttagga 194  Q
    || |||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38409270 taaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 38409369  T
Q  195 t-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc 293  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||    
T  38409370 ttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggct-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactc 38409467  T
Q  294 atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||| |||||||||  ||| | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  38409468 atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 38409538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 165 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18709361 - 18709021
Alignment:
Q  165 gttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18709361 gttgattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtg-ggagacttattcttgtaa 18709263  T
Q  264 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  18709262 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaac 18709166  T
Q  363 aaaattc-gtgtgtgc-tctctttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgct 453  Q
    ||| |||  ||||| | |||  ||||||       |||||| || | ||| ||| | || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18709165 aaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctactattggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgct 18709067  T
Q  454 tgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  18709066 tgattatgccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtggtttt 18709021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 178 - 495
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547621
Alignment:
Q  178 gggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatct 276  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgtaactcattgatatat 13547400  T
Q  277 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa-attcgtgtg 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| | | || |||  ||  ||||    
T  13547401 cttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtg 13547498  T
Q  375 tgctctctttctttctctcgctgtctttt-tactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttc 470  Q
    | ||||||| ||||||||| |  |||||| |||  |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||| | |    
T  13547499 ttctctcttcctttctctctcgatcttttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgtctaattatcacttgttcc 13547596  T
Q  471 acacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
    |||||||| || | |||||||||||    
T  13547597 acacatcaagtttgttattggtgtg 13547621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 37313264 - 37312941
Alignment:
Q  165 gttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 263  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||| | || |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  37313264 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaa 37313166  T
Q  264 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | ||| |||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||    
T  37313165 cccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaattt-ggaccaaattggatcaac 37313067  T
Q  363 aaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattat 460  Q
    ||| ||| | |||          ||||||||||||| ||| ||||  ||| | || || |||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37313066 aaa-ttcttttgt----------tttctctcgctgt-tttctact--tttggcttatgattataattgtttcatacactttgttttggttgcttgactat 37312981  T
Q  461 tacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
      |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  37312980 cccttgctccacacatcaagtttattattggtgtgatttt 37312941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313107
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---ta 130  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  |||  |  ||| ||||||||   ||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 37313302  T
Q  131 gagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgtg-gttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagac 226  Q
    ||| || |||||  |    | ||||||||| ||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||| | ||     
T  37313301 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggat 37313202  T
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  37313201 tttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 37313107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22780572 - 22780372
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22780572 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 22780474  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  22780473 aacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 22780377  T
Q  361 acaaa 365  Q
    |||||    
T  22780376 acaaa 22780372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44600176 - 44599837
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||     
T  44600176 atacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 44600078  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatg 221  Q
      ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||     
T  44600077 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 44599978  T
Q  222 gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctc 321  Q
    | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  44599977 gggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctc 44599881  T
Q  322 tct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  44599880 tctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 44599837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 509
Target Start/End: Original strand, 5664615 - 5664715
Alignment:
Q  409 tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaat 508  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5664615 ttttggtttgtcattataacttccatacactttgttttggttgcttgattattaccttctccacacatcaagtattttattggtgtgattttcatcgaat 5664714  T
Q  509 t 509  Q
    |    
T  5664715 t 5664715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37089735 - 37089371
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt---gagatagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  37089735 agatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaa-caagggtttag 37089637  T
Q  106 aaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctcta-agagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat- 195  Q
    ||   |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |||   | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  37089636 aatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 37089538  T
Q  196 gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  37089537 gagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcat 37089440  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    || |||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  37089439 ca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 37089371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2485071 - 2484722
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||  ||||   |||||||||||||||||    
T  2485071 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcg-ggagacttattcttgta 2484973  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  2484972 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactggatcaa 2484876  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    | |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||| || | ||| ||| |||| | |||| ||||    ||||||||||||| ||||||||||    
T  2484875 c-aaattcctttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttattttggttgc 2484778  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  2484777 ttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 2484722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 509
Target Start/End: Original strand, 27499195 - 27499529
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctct 278  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||| ||||| ||| |||||||   ||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  27499195 gaaacactattaggattgagtctattggttacgataagagattgaggctttgggtataattaggcg-ggagacttatttttgtaaccta---atatctct 27499290  T
Q  279 tttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgc 377  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || || | | | ||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||| | |  ||||| |    
T  27499291 tttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaagggctgctctttccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 27499389  T
Q  378 tctctttctttctctcgctgtc----tttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttc 470  Q
    |||||| ||||||||| || ||    | ||| ||| |||||  ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    
T  27499390 tctcttcctttctctctctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccataaactttgttttggttgcttggttattcattgctcc 27499489  T
Q  471 acacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  27499490 acacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 27499529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3824769 - 3824627
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3824769 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 3824671  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 307  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3824670 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26086175 - 26085825
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26086175 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 26086077  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||  | ||    
T  26086076 acccattgttttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgtgtcaa 26085980  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgc-tctctt-----tctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgc 452  Q
    |||| | |  ||||| | ||||||     | ||| |||||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26085979 caaattcttttgtgttcttctcttctttgtgtttttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgattttggttgc 26085881  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||    
T  26085880 ttgactatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattctcatcgaatt 26085825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11006436 - 11006101
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  11006436 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 11006338  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| | | |    
T  11006337 aacccattgatttctc-tttgtaatggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtta 11006241  T
Q  361 acaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgatta 459  Q
    || |||||| | |||| |||         |||||| ||  |||| ||| |||||| |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006240 ac-aaattcttttgtgttct---------tctcgccgttgtttttctactttttgcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgatta 11006151  T
Q  460 ttacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc-atcgaatt 509  Q
    |  |||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11006150 tcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgtttttcgatcgaatt 11006101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22132590 - 22132391
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22132590 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 22132492  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  22132491 acccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 22132395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 365
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096217
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||  |  ||| ||||||||   |    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 19095978  T
Q  130 agagatt-tctctaagaggg-agacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggag 224  Q
    |||| || |||||  |     | |||||||||||    |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||    
T  19095979 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-ag 19096077  T
Q  225 a-ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    | ||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||   ||||||||    
T  19096078 agctttgggtagaattaggcg-ggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggagagctgctctc 19096175  T
Q  324 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |  ||||||||||||||  |||||||| |||||| | ||||||    
T  19096176 tcccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaacaaa 19096217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22134815 - 22134617
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||| ||   | ||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22134815 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 22134717  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  22134716 acccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 22134620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11008765 - 11008415
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  11008765 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 11008667  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| ||   ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| | | |    
T  11008666 aacccattgatttc---tttgtaatggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtca 11008572  T
Q  361 acaaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttg 451  Q
    || |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||| ||  |||| ||| |||||| |||| ||||    |||||||||||||||||||||||    
T  11008571 ac-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgtttttctactttttgcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttg 11008473  T
Q  452 cttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc-atcgaatt 509  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11008472 cttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgtttttcgatcgaatt 11008415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635325
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 5635517  T
Q  324 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttacta-ttttt 413  Q
    |  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||| || | ||| ||| ||||     
T  5635516 tcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctacttttg 5635420  T
Q  414 gtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  5635419 gcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgattgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 5635325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 9022423 - 9022583
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttgga 248  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||| | ||||||| || | | ||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |    
T  9022423 acactatggttgggattgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaa 9022522  T
Q  249 gacttattcttgtaac--ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    |||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9022523 gactaattcttgtaacctctattgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaa 9022583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 36921856 - 36921787
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36921856 agatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 36921787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 501
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563231
Alignment:
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccca-gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgt 375  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||| | | |||||| | |  |||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaattt-ggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 47563106  T
Q  376 gctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcaca 473  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||| ||||  ||| | || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  47563107 tctctcttcctttctctcgctgt-tttctact--tttggcttatgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccaca 47563203  T
Q  474 catcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    ||||| || | ||||||||||| |||||    
T  47563204 catcaagtttgttattggtgtggttttc 47563231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 380 - 509
Target Start/End: Original strand, 56030812 - 56030938
Alignment:
Q  380 tctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcag 479  Q
    ||||||||||||||||||| ||    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| |||| ||||     
T  56030812 tctttctttctctcgctgtttt----ctacttttgtttgtatttataacttccatacactttgttttggttgcgtgactatctcttgctccacatatcaa 56030907  T
Q  480 gtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  56030908 gtttattattggtgtgatttttcatcgaatt 56030938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 248 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578549
Alignment:
Q  248 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactg-ctctcttcccagactaggtcagttttgg 346  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||  ||||||||||| |||| || |    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctgtctctc-ccccagactaggccagtattag 3578689  T
Q  347 accgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgtttt 446  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||       || ||||||||||| ||    ||| ||| |||| |||||||||||||||  ||  ||| |||||||    
T  3578688 accgaactgggtaaacaaatttcgtgt------actctctttctctcgttg----ttttctacttttatttgtgtttataactatcacccacgttgtttt 3578599  T
Q  447 ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||  | ||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  3578598 ggttgcttgatta--atttgattcgcacatcaag--ttttattggtgtgatttt 3578549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 365
Target Start/End: Original strand, 5101145 - 5101262
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||| | ||||| ||| ||||||||||||||  ||||    
T  5101145 ggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctatctccccagactaggtca-atttg 5101242  T
Q  346 gaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  5101243 gaccgaactgggtcaacaaa 5101262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Original strand, 53405525 - 53405619
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  53405525 ttgtatttataacttccatacattttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttattattggtgtgatttttcatcgaatt 53405619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446842
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 24446842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 47210939 - 47210792
Alignment:
Q  176 ttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatat 274  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47210939 ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgattt 47210841  T
Q  275 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||    
T  47210840 ctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 47210792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 500
Target Start/End: Original strand, 10114448 - 10114781
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| | |||||| || || ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||  ||||||| |||        |||||||| ||||  ||    
T  10114448 acactagggttgggattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagattgag--------tagaattatgtttaaag 10114539  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggac 348  Q
    ||| |||| |||||||   | |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | |   ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  10114540 actaattcatgtaacc---ttatatctcttt-gtaaattaactcatcattatagttgaacgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggac 10114635  T
Q  349 cgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttgg 448  Q
    |||| | | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||    ||  |||  |||  ||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  10114636 cgaattaggtaaacaaatttcatgtgttctctctttctttctctcgttg----ttatctaccttttcttgtgtttataactatcacccactttgttttgg 10114731  T
Q  449 ttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||| || |||  ||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10114732 ttgctttataatt--ttattccacacatcaaatattttattggtgtgatttt 10114781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030712
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt---ta 130  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||  ||||  |  ||||||| ||||   ||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtata 56030541  T
Q  131 gagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagaga-tggaga 225  Q
    ||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||     
T  56030542 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggag- 56030640  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||||    
T  56030641 ctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcat 56030712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 3824934 - 3824875
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagta 68  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3824934 agatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagta 3824875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 365
Target Start/End: Original strand, 11437558 - 11437696
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||    
T  11437558 gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 11437654  T
Q  324 ttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    | ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  11437655 tcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 11437696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937472
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctg-aaacaagggtttagaaa 3937472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15032899 - 15032800
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||    
T  15032899 gagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctg-aaacaagggtttaga 15032801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 52942808 - 52942536
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattg--tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  52942808 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagaggg-gctg-aaacaagggtttaga 52942711  T
Q  107 aa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttagga-tga 197  Q
    ||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  ||   | ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  52942710 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattga 52942611  T
Q  198 gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 286  Q
    |||| ||||||||| |             |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942610 gtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 52942536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 292 - 500
Target Start/End: Original strand, 6133098 - 6133308
Alignment:
Q  292 tcatcattatagtggaatggatgactgctctctt-cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttc 389  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||| ||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||    
T  6133098 tcatcattatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaattt-ggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttc 6133196  T
Q  390 tctcgctgtctttttactatttttgt-ttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtatttt 486  Q
    |||| |  | ||||  ||| |||||  |||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||    
T  6133197 tctctcgttgtttt--ctacttttgacttgtgtttataattgtttcatacactttgtttcggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgtt 6133294  T
Q  487 attggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| |||||    
T  6133295 attggtgtaatttt 6133308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3937296 - 3937133
Alignment:
Q  342 tttggaccgaactggataaacaaaattc--gtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacact 439  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||    ||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  3937296 tttggaccgaactgggtcaac-aaattcatttgtgttctctctttctttctctcgttg----ttttctacttttgtttgtgattttatcttccatacact 3937202  T
Q  440 ttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  3937201 ttg-tttggttgcttgattatcccttgctcctcacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 3937133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 432 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14789358 - 14789280
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  14789358 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 14789280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 31300475 - 31300606
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctcttccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  31300475 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctctcccca 31300570  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  31300571 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 31300606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 37089300 - 37089219
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  37089300 ttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 37089219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270249
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||| |||||||||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctg-aaacaagggtttagaaa 38270249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 440 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40998946 - 40998877
Alignment:
Q  440 ttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  40998946 ttgttttggttgcttgattattacttgtttcacacatcaaatattttatttgtgtgatattcaacgaatt 40998877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 7941728 - 7941807
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  7941728 ttccatacactttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttgttggtgtgattttcatcgaatt 7941807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22046614 - 22046544
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  22046614 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 22046544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 52043791 - 52043716
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  52043791 agatttgttccaattttttagggatgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagag 52043716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891387
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgt-atcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 2891387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336779
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 279  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  | |||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctt 5336866  T
Q  280 ttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |   ||||  | ||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||| | | ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||    
T  5336865 tgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaa 5336779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 365
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557920
Alignment:
Q  268 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  26557823 ttgatatctcttt-gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaa 26557920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Original strand, 5100992 - 5101045
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5100992 atacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggg 5101045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24446590 - 24446509
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24446590 ttccatacactttattttggttgcttgattatcccttacttcacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaatt 24446509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16639010
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 279  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||| |    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagacttgg-gtagaatgaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tcaatatctc-t 16638923  T
Q  280 ttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||| |||||||   || ||| ||||||| ||||||||    
T  16638924 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctc-tcccagagtaggtcataattagactgaactgggtaaacaaa 16639010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 54928776 - 54928704
Alignment:
Q  236 aattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54928776 aattaagtttgaagactgattcttgtaacattttaatatctcttttgtaaagttactcatcactatagtggaa 54928704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 242
Target Start/End: Original strand, 6133006 - 6133085
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattagg 242  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6133006 ggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 6133085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 6764835 - 6764909
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||    
T  6764835 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctg-aaacaagggtttagaaa 6764909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 80
Target Start/End: Original strand, 36380370 - 36380417
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagata 80  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36380370 tacttttactataaatatggactttgtatcagagtaaaccttgagata 36380417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 51015650 - 51015720
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  51015650 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgttttt 51015720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 52043564 - 52043428
Alignment:
Q  360 aacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgtttt--ggttgcttgat 457  Q
    |||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| ||    |||  |||| ||||||||||||||  ||  ||| |||||||  |||||||||||    
T  52043564 aacaaattccgtgagttctctctttctttctctcgctgtttt----ctacgtttgcttgtgtttataactgtcacccacgttgttttttggttgcttgat 52043469  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52043468 tattc--tgctccacacatcaagtattttattggtgtgatttt 52043428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 358
Target Start/End: Original strand, 53405356 - 53405460
Alignment:
Q  251 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccg 350  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||  ||   ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  53405356 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatca-tatagtggaacagagagctgctctc-ccccagactaggtca-atttggaccg 53405452  T
Q  351 aactggat 358  Q
    ||||||||    
T  53405453 aactggat 53405460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 294
Target Start/End: Original strand, 54906782 - 54906852
Alignment:
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 294  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  54906782 agactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactctttgatatctc-tttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 15317009 - 15317140
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctcttccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||  ||   ||||||||| ||||    
T  15317009 gtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccca 15317104  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  15317105 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 15317140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 47210724 - 47210655
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  47210724 ttccatacactttgttttggttgctttattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattt 47210655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Original strand, 5101301 - 5101397
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5101301 ttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgatccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaatt 5101397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6132920
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagagg 6132920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 9148640 - 9148720
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9148640 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgttccacacatcaagt-tgttattggtgtgttttctcatcgaatt 9148720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12401070
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctg-aaacaaggatttagaaa 12401070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 14633316 - 14633365
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 82  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14633316 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga 14633365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 14633723 - 14633803
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14633723 ttccatacattttgtttcggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttctcatcgaatt 14633803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 403
Target Start/End: Original strand, 15831192 - 15831362
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctcttccc- 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||| |||     
T  15831192 gtagaattaggtttgaagactgattcttggaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 15831287  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttt 403  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||||||||||  || ||||| || ||| ||| |||||| || ||||||    
T  15831288 agactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaatatcttgtgttctttctctctctctctctctttctttt 15831362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17662598 - 17662497
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gagatagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  17662598 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctg-aaacaagggtttag 17662500  T
Q  106 aaa 108  Q
    |||    
T  17662499 aaa 17662497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22134544 - 22134476
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  22134544 ttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatt 22134476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 49088956 - 49089037
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||  |||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  49088956 ttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttactcaacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 49089037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3824553 - 3824466
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataact--tccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  3824553 ttgtgtttataactgttccatacattttgattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt 3824466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 11006602 - 11006546
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga 65  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11006602 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaga 11006546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 11435359 - 11435430
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgtttt-ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  11435359 ttccatacactttgtttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 11435430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22044316 - 22044249
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  22044316 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgttatttt 22044249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822446
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 279  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||   ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 55822359  T
Q  280 ttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   ||||||||| |||| |||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  55822360 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 55822446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3937408 - 3937314
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattct 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | || |||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  3937408 ggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattagg-tgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11008931 - 11008876
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11008931 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag 11008876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 18847558 - 18847627
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  18847558 ttccatacactttgttt-ggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 18847627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 365
Target Start/End: Original strand, 36769534 - 36769662
Alignment:
Q  236 aattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agac 332  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||| ||| ||||    
T  36769534 aattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagac 36769629  T
Q  333 taggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||   || ||||||||||||||||||||    
T  36769630 taggtcatcattagaccgaactggataaacaaa 36769662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14787771 - 14787695
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt--gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  14787771 atacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 14787695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22132317 - 22132248
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgtttt-ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatt 498  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  22132317 ttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatt 22132248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446681
Alignment:
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 24446681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29609619 - 29609526
Alignment:
Q  214 aagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||  || ||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||||    
T  29609619 aagagattgagacttcgagtagaattaggtttgtagactatttattgtaaccttttgatatct-ttttataaaattacttatcattacagtggaa 29609526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 47868806 - 47868887
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  47868806 ttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 47868887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16931718 - 16931638
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| | || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  16931718 ttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacattaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 16931638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22132759 - 22132682
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggag 87  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||| |||    
T  22132759 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagag 22132682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22782678 - 22782594
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttgtttt-ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  22782678 ttgtatttataactttcatacgctttgtttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 22782594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32274079 - 32274014
Alignment:
Q  222 gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 287  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  32274079 gagactttgagtaaaattaggtttaaagactaattcttgtaactctttcatatctcttttgtaaag 32274014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 44599766 - 44599687
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  44599766 ttccatacgctttgttttggttgcttaatta-tccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 44599687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 500
Target Start/End: Original strand, 47078686 - 47078744
Alignment:
Q  440 ttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47078686 ttgttttgattgcttgattatt--ttgctccacacattaagtattttattggtgtgatttt 47078744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 2485210 - 2485135
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatag-agggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||||    
T  2485210 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggct-aaaacaagggtttagaaa 2485135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Original strand, 38409609 - 38409680
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||    
T  38409609 ttccatacaatttgttttagttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgtttttc 38409680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 47211106 - 47211038
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 78  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  47211106 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 47211038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Original strand, 53405100 - 53405168
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 78  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  53405100 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 53405168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 4558362 - 4558493
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||    
T  4558362 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctccccc 4558457  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||| |||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  4558458 agact-ggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 4558493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5516323 - 5516244
Alignment:
Q  279 tttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc-agactaggtcagttttggaccgaactgg 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5516323 tttgtaaagttacccatcattattgtggaacagagaactgctctctctccctagactagatcagtattggaccgaactgg 5516244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 8529318 - 8529450
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||  |||    
T  8529318 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 8529413  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  8529414 agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 8529450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 104
Target Start/End: Original strand, 16453305 - 16453375
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagttta 104  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  16453305 tacttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctg-aaacaagggttta 16453375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 365
Target Start/End: Original strand, 16489364 - 16489531
Alignment:
Q  195 tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc- 293  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||  | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||     
T  16489364 tgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactca 16489458  T
Q  294 -atcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     |||| |||||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||   || ||||||||| | ||||||||    
T  16489459 tatcaatatagtggaacggagagctgctctctccctagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaa 16489531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16689071 - 16688939
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-c 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   ||||||||| || |    
T  16689071 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccac 16688976  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    | |||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  16688975 aaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 16688939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 47868397 - 47868471
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| | |||| ||| ||| |||||||||    
T  47868397 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctg-aaagaagggtttagaaa 47868471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 11437767 - 11437848
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| || |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  11437767 ttccatacactttgtttttggctgcttgattatctcttgctccatacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 11437848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 421 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22780308 - 22780219
Alignment:
Q  421 tttataacttccatacactttgtttt-ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  22780308 tttataactttgatacgctttgtttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 22780219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 358 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 29609498 - 29609362
Alignment:
Q  358 taaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||    || ||| ||||| ||| || ||||| |   || ||| ||||||||||||||||||    
T  29609498 taaaccaatttcgtgtgttctctctttctttctatcgttgt----ttcctacttttgcttgcgtatataattgttatccacgttgttttggttgcttgat 29609403  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||  ||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  29609402 tatt--ttattccacatatcaagtattttattggtgtgatttt 29609362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 308
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570219
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 279  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||| | | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 4570188  T
Q  280 ttgtaaagttactc--atcattatagtggaa 308  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  4570189 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaa 4570219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5516162 - 5516104
Alignment:
Q  440 ttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||| |||||||||||| |  || || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5516162 ttgttttagttgcttgattaat--ttactccacacatcaagtattttattggtgtgatttt 5516104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 11853600 - 11853731
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   |||||||||  ||||    
T  11853600 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 11853695  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  11853696 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 11853731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409610
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagag-gctg-aaacaagggtttagaaa 18409610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22134990 - 22134937
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatca 63  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22134990 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 22134937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23001533 - 23001459
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||  |||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23001533 gtagaattaggtttgaagaccgattattgtaaccatttgaaatct--tttgtaaagttattcatcattgtagtggaa 23001459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 24348187 - 24348240
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatca 63  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24348187 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 24348240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 4569924 - 4569980
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga 65  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  4569924 agatttgttccatattttaagggttactttcactataaatataagccttgtatcaga 4569980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 31983454 - 31983401
Alignment:
Q  445 ttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  31983454 ttggttgcttgattatt--ttgctccacacatcaaatattttattgatgtgatttt 31983401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 149)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36209000
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttttagaga 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaacaaacaacaaactagggttttagaga 36208623  T
Q  135 --tttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgt 231  Q
      |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  || ||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||     
T  36208624 gatttctctaagcgggagaaactagggttgttgttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgg 36208723  T
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccaga 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||| | |||| |    
T  36208724 gtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttccccata 36208823  T
Q  332 ctaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtg-ctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--c 428  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||  |||| | ||||| ||||||       
T  36208824 ctaggtcaattt-ggaccgaactgggtaaacaaa-ttcttttgtttctctctttctttctctcgttgt-tttctac--ttttggcttgtgattataattg 36208918  T
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  36208919 ttctatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctctacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaatt 36209000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661044
Alignment:
Q  40 actataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaact-agggttt---tagagat 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||   ||||| ||| | ||||| |   ||||| |    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaa-caagggtttagaagtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  136 ttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgta 234  Q
    |  |||  |    | ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||| || |||| |||| |||    
T  6661413 tgttcttggcaacaaacactagagttggggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggta 6661314  T
Q  235 gaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagact 333  Q
     |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  6661313 caattaggca-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagact 6661215  T
Q  334 aggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt-ctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttcc 432  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6661214 aggtcagatttggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgt--tctctttcttttctctcgttgtttt----ctacttttgcttgtgtttataacttcc 6661121  T
Q  433 atacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6661120 atacactttattttggttgcttgattattacttgctccacacatcaaatatttaattggtgtgattttcatcgaatt 6661044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 213 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15445417 - 15445135
Alignment:
Q  213 gaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatgga 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15445417 gaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaa 15445318  T
Q  313 tgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactat-tt 411  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    ||| |||| ||    
T  15445317 gggctgctctcttcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttttctctttctttctctcgatg----ttttctatctt 15445222  T
Q  412 ttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15445221 ttgcttgtgtttataattttcatccacgttgttttgattgcttgattatt--ttgctccacacatcaagtattttattggtgtgttttt 15445135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 20053910 - 20054259
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |     |||| | ||||||  ||||||||||||  ||||    
T  20053910 acactagggttgaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtttgg-----agattgggactttaagtagaattaggtg-ggag 20054003  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggac 348  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  20054004 acttattcttgtaaccc---gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggac 20054100  T
Q  349 cgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttg 447  Q
    |||||||  |||||||| | |  ||||| |||||||||||| |||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20054101 cgaactgcgtaaacaaattcttttgtgttctctctttcttt-tctctct-tcgtttt-ctacttttgtttgtgtttataactttcatacactttgttttg 20054197  T
Q  448 gttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20054198 gttgcttgattattacttgctctacacatcaagtattttattagtgtgatttttatcgaatt 20054259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 500
Target Start/End: Original strand, 40221464 - 40221946
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||   |||  |  ||||||||||||      
T  40221464 tacttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 40221562  T
Q  129 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgga 223  Q
     ||||| || |||||  |    | |||||||| ||    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||| |     
T  40221563 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgg 40221662  T
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||  |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40221663 gacttttggtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctc 40221761  T
Q  324 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt----ctttttacta-tttttgtt 416  Q
    |  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||  ||||||| ||||||||| || |    || ||| ||| |||| | |    
T  40221762 tcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgctctctcttcctttctctctctctctcgctgttttctacttttggct 40221860  T
Q  417 tgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  40221861 tgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcctttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt 40221946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 17818826 - 17818351
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-- 128  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||  |  ||||||| ||||      
T  17818826 tacttttgttataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagaggg-gctgaaa-caagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgt 17818729  T
Q  129 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggttg--tggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatgga 223  Q
     ||||| |  |||||  |    | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  17818728 atagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattga 17818629  T
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    | ||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || | || |||||    
T  17818628 ggctttgggtagaattatgcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tacagtggaacagagggcttctctc 17818531  T
Q  324 ttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctcttt--ctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtg 420  Q
      |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |||||||  ||||||||| ||  || ||| ||| |||| | |||||    
T  17818530 -ccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctcttttcctttctctctctcgctgttttctacttttggcttgtg 17818434  T
Q  421 tttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||    
T  17818433 tttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttc 17818351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 164 - 501
Target Start/End: Original strand, 695958 - 696293
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  695958 ggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 696055  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  696056 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 696154  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataac--ttccatacactttgttttgg-ttgcttgat 457  Q
    |||| | |  ||||| ||||||||||||||    |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  696155 caaattattttgtgttctctctttctttct----ctgt-tgttttctacttttgtttgtgtttataactgttccatacactttattttggttttcttgat 696249  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    |||  |||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||    
T  696250 tatctcttgctccacacatcaagtctgttattggtatgattttc 696293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 509
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020642
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt-tagag 133  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| | |   ||||  ||| |||||||| || ||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttgggaggcaacacaaaagtagggtttgtatag 9020266  T
Q  134 attt-ctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagat-ggagactttg 230  Q
    | || ||||  |    | ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||| | ||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  9020267 agttgctcttggcaacaaacactagggttgaagttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggag-ctttg 9020365  T
Q  231 tgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-cca 329  Q
     |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||    
T  9020366 ggtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctcca 9020464  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact 429  Q
     | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||| ||||  | ||  |   | ||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  9020465 aattaggtctgttttggaccgaactggataaac-caattcttttgtgttctctctcttcttttctatcgttattttctacttttgcttgtgtttataact 9020563  T
Q  430 tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9020564 tcaatacacttt-atttggttgcttgattattaattgctccacagatcaaatattttattcgtgtgattttcattgaatt 9020642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 148 - 427
Target Start/End: Original strand, 15143529 - 15143809
Alignment:
Q  148 gagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttg 246  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||   || |||| |||||||||||||||    
T  15143529 gagacactagggttgagattgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttg 15143628  T
Q  247 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttg 345  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||     
T  15143629 aagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtattt 15143728  T
Q  346 gaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttt-tactatttttgtttgtgtttataa 427  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15143729 gaccgaaatgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctacttttctctcgctattttttctac--tttttgtttgtgtttataa 15143809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 509
Target Start/End: Original strand, 18596588 - 18597072
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt--- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || || | ||||  |  ||||||||||||       
T  18596588 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaa-caagggtataaagacaacaacaaaactagggtttgta 18596686  T
Q  129 tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggag 224  Q
    ||||| || |||||  |    | ||| || ||||    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |    
T  18596687 tagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 18596786  T
Q  225 actttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18596787 actttgagtagaattaggcg-ggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct 18596885  T
Q  325 tc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgct---ctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtg 420  Q
     | |||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| | |||| | |||| |   |||||  ||||||||||||| ||| |||  ||||   |||||    
T  18596886 cctccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-agattcttttgtgttcgactcttcttttctctcgctgt-tttctac--ttttgacttgtg 18596980  T
Q  421 tttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||   ||||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||| || |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  18596981 tttataattgttccatacactttattttggatgtctgattatcacttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 18597072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 2818697 - 2818186
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  2818697 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 2818599  T
Q  109 -caaacaa-taaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt---gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgag 198  Q
       |||||  |||||| |||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||   | | |||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||    
T  2818598 ggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgag 2818499  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| ||| ||   | ||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  2818498 tctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca- 2818401  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgc 395  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  2818400 tatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgc 2818302  T
Q  396 tgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattgg 491  Q
    ||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||||| || |||||| || | |||||||    
T  2818301 tgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggatgcctgattatcccttgctccatacatcaagtttgttattgg 2818203  T
Q  492 tgtgattttcatcgaat 508  Q
    |||| ||||||||||||    
T  2818202 tgtgtttttcatcgaat 2818186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18511411 - 18511063
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18511411 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcg-ggagacttattcttgta 18511313  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| | | ||    
T  18511312 acccgttgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 18511215  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||     
T  18511214 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tgttttctactttttgcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttagttgcttgac 18511116  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    |||  |||||| ||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  18511115 tatcccttgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttatcatcgaatt 18511063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 21947945 - 21948461
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  21947945 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagaggg-gctg-aaacaagggtttagaaa 21948042  T
Q  109 ca-aacaa-taaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
     | |||||  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21948043 gacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 21948142  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||| | ||||||   | ||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21948143 ctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattagg-cgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 21948240  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttcttt----ctctc 393  Q
    |||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||    |||||    
T  21948241 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctccctctc 21948339  T
Q  394 gctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactt--tgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttat 488  Q
     ||  || ||| ||| |||| | ||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||    
T  21948340 tctcgctattttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttattttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttat 21948439  T
Q  489 tggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||| ||| ||||||||||    
T  21948440 tggtgtgttttctcatcgaatt 21948461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 658552 - 658211
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  658552 ggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 658454  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  658453 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctc--cccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 658358  T
Q  363 aaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgatta 459  Q
    ||| | |  ||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| |||  |||| | || ||||||| |   |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  658357 aaattcttttgtgttctctcttcttttctcttgctgt-tttctac--ttttggcttatgtttattattgttccgtacactttgttttggttgcctgatta 658261  T
Q  460 ttacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    || |||||| |||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  658260 ttccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgattttcatcgaatt 658211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25921834 - 25921472
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  25921834 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 25921736  T
Q  109 ca-aacaa-taaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
     | |||||  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  25921735 gacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagt 25921636  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | |||| || |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  25921635 ctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 25921538  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| |||   |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  25921537 atagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 25921472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 38882023 - 38882518
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggag-ctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  38882023 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaa-caagggtttagaa 38882121  T
Q  108 a--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gag 198  Q
    |  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  ||   | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38882122 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 38882221  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  38882222 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggca-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 38882318  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctg 397  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |||         |||||| |    
T  38882319 tatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttct---------tctcgccg 38882407  T
Q  398 tctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
    | | ||| ||| |||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  38882408 t-tgttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtga 38882505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 20506040 - 20505709
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  20506040 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 20505942  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  20505941 acacattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  363 aaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg---ttttggttgcttga 456  Q
    ||| | |  ||||| |||||||  ||||||||| ||| ||| ||   |||| | ||||||||||||   ||||||||||||||   |||||||||| |||    
T  20505844 aaattcttttgtgttctctcttattttctctcgttgt-tttcta--gttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttttggttgcctga 20505748  T
Q  457 ttattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  20505747 ttattacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 20505709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1189808 - 1189461
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  1189808 ggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 1189710  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct--tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| | |    
T  1189709 atccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctctcctcccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 1189611  T
Q  361 acaaaat-tcgtgtgtgctctctttctt--tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttg 455  Q
    ||||| | |  ||||| ||||||| |||  |||||||| || ||| |||  |||| | ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1189610 acaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgcagt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacattttgttttggtggcttg 1189514  T
Q  456 attattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||    
T  1189513 attattccttgctccacacatcaagtttgatattggtgtg-ttttcatcgaatt 1189461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 356
Target Start/End: Original strand, 4236547 - 4236900
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4236547 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaa-caagagtttagaaa 4236645  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  4236646 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 4236745  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  4236746 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 4236843  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactgg 356  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  4236844 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggaccgaactgg 4236900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36402688 - 36402177
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa- 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||     
T  36402688 agatttgttc-aaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaat 36402591  T
Q  108 -acaaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
     |||| ||  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||| ||| ||| |||||| ||| |    
T  36402590 gacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaat 36402491  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| || ||||| |  |||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36402490 ctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattagg-ctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 36402393  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgct 396  Q
    |||||| ||  |||| |||||||||  ||||||||||||||  ||| || |||||| | | |||||| | |  ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  36402392 atagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtca-atttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgct 36402294  T
Q  397 gtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggt 492  Q
    || | ||| ||| |||| | ||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  36402293 gt-tgttttctacttttagcttgtgtttataattgttctatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggt 36402195  T
Q  493 gtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||||||    
T  36402194 gtgatttttcatcgaatt 36402177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 151 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17413380 - 17413176
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |     
T  17413380 acactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaa 17413281  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggac 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||  |||||| | ||||||| ||||||    
T  17413280 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggac 17413181  T
Q  349 cgaac 353  Q
    |||||    
T  17413180 cgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 478
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904498
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||| |||||| ||   |    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtat 25904145  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||   |     
T  25904146 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattaggg 25904245  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||     
T  25904246 ctttgagtataattaggcg-ggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggatgactgctctctc 25904343  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctt--tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgt 421  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||| | |  ||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||    
T  25904344 ccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctctcttcctttctctctcgctgt-tttctac--ttttggtttgtgt 25904439  T
Q  422 ttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||  |||||||||    
T  25904440 ttataattgttccatacactttgttttcattgcttgactatcccttgcaccacacatca 25904498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31179732 - 31179370
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31179732 agatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaa-caagggtttagaaa 31179634  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gag 198  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  31179633 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 31179534  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||     
T  31179533 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatca- 31179437  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  31179436 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 31179370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 478
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073282
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||   |    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtat 17072925  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||||||| | |     
T  17072926 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattgggg 17073025  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||   ||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||| | |||||||||     
T  17073026 ctttcgatagaattaggcg-gaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctc 17073124  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtg--tgctctctt--tctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgt 419  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||  | |||||||  | ||||||||||||| | ||| ||| |||||  ||||    
T  17073125 ccccagactcggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgctttctctctttatttttctctcgctgt-tgttttctacttttgacttgt 17073221  T
Q  420 gtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  17073222 gtttataattgttccatacactttgttttagttgcttgatcatcacttgctccacacatca 17073282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Original strand, 25804105 - 25804295
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25804105 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 25804203  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactgg 356  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25804204 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgg 25804295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 37706117 - 37705643
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-- 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |||  |  || |||||||||      
T  37706117 tacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgt 37706019  T
Q  129 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgga 223  Q
     ||||  || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||       
T  37706018 atagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 37705919  T
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    |  ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||| ||  ||||    
T  37705918 ggttttggatagaattaggtg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatggctattctc 37705821  T
Q  324 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctt--tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtg 420  Q
    |  ||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||| |||||| || || ||||||| |||  ||||||||||| ||| |||  |||| | |||||    
T  37705820 tcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaac-aaattcttgcgttctctcttcctttctctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgtg 37705726  T
Q  421 tttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    ||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||    
T  37705725 tttttaattattccatatactttgttttggttgcttggttattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttc 37705643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 27912616 - 27912968
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  27912616 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 27912714  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  27912715 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 27912812  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    | |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||| || | ||| ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912813 c-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctacttttagcttgtatttataacttccatacactttgttttggttgc 27912910  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||  ||| || ||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||    
T  27912911 ttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgggatttttcatcgaatt 27912968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34477253 - 34476901
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477253 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 34477154  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |    
T  34477153 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 34477057  T
Q  361 acaaaat-tcgtgtgtgc-tctctt-----tctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttg 451  Q
    ||||| | || ||||| | ||||||     | ||  |||||| || | ||| ||| |||| | |||| ||||    |||||||||||||| |||||||||    
T  34477056 acaaattctcttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgattttggttg 34476958  T
Q  452 cttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  34476957 cttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 34476901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34479618 - 34479417
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479618 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 34479519  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |    
T  34479518 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 34479422  T
Q  361 acaaa 365  Q
    |||||    
T  34479421 acaaa 34479417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 6745148 - 6745500
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  6745148 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 6745246  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  6745247 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 6745344  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctct--ttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg---ttttggttgct 453  Q
    | |||||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||  ||||    |||| | ||||||||||||   ||||||||||||||   |||||| ||||    
T  6745345 c-aaattcttttgtgttctcttattcttttctctcgctgttgttttcgacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtttttttggctgct 6745443  T
Q  454 tgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||| |||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6745444 tgactatctcttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaatt 6745500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16092399 - 16092198
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16092399 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 16092301  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||| | | |||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||    
T  16092300 acccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtca-atttagactgaactggatcaa 16092202  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  16092201 caaa 16092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 10586912 - 10587245
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatg-agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  10586912 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggca-ggagacttattctttta 10587010  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct--tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||| | | |    
T  10587011 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtca 10587107  T
Q  361 acaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgatta 459  Q
    || |||||| | |||| |||         |||||| || | ||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10587108 ac-aaattcttttgtgttct---------tctcgccgt-tgttttctacttttgacttgtatttataacttccatacactttgttttggttgcttgatta 10587196  T
Q  460 ttacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
     | |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  10587197 -tccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttcatcgaatt 10587245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 2174837 - 2175198
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  2174837 agatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 2174935  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  2174936 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagt 2175035  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| |    
T  2175036 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatca-t 2175132  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  2175133 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 2175198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 6756412 - 6756920
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  6756412 agatttattccaaattttaagttatacttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaa-caatggtttagaaa 6756510  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  |||||| |||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    ||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6756511 ggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagt 6756610  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  6756611 atcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcatt 6756707  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctct--ttctttctctcgc 395  Q
    ||||| |||  || | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||  | |||||||| |  ||||| ||||||  || | ||||||||    
T  6756708 atagt-gaaacgagggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttctctcttcttttctctctcgc 6756805  T
Q  396 tgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtatt-ttattggt 492  Q
    ||| ||| |||  |||| | ||||||||||||   || |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||    
T  6756806 tgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttgattgcctgattatcacttgctccacacatcaagttttgttattggt 6756902  T
Q  493 gtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  6756903 gtgttttctcatcgaatt 6756920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 393
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127165
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---t 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||   |    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaa-caagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtat 24126898  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||       | | |||||||||    | |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| | ||    
T  24126899 agagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggga 24126998  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| |||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||     
T  24126999 ctttgggtagaattaggcgat-agacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 24127096  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 393  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||||||||||||    
T  24127097 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctc 24127165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 31544998 - 31545360
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||    
T  31544998 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaa-caagggtttagaaa 31545096  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gag 198  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  31545097 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagag 31545196  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||     
T  31545197 tctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatca- 31545293  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  31545294 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 31545360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Original strand, 4897710 - 4898039
Alignment:
Q  75 gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggtttt---agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatt 171  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||    
T  4897710 gagagagagagagctgaaa-caagggtttagaaacaaacaacaaactagggtttagagagagatttctctaagcgggagacagtagggttgagattgttt 4897808  T
Q  172 t-----accttgggaaa--cactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 263  Q
    |     ||||||   ||  |||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  4897809 tcattcaccttgaacaaatcactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaa 4897908  T
Q  264 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |  | ||||| |||  |||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4897909 ccatttgatatctctattgtaaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaac 4898008  T
Q  363 aaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcg 394  Q
    ||| ||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  4898009 aaattttttgtgttc-ctctttctttctctcg 4898039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474176
Alignment:
Q  38 ttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---taga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||||   ||||| ||| |||||||||   ||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaa-caaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtataga 10474557  T
Q  133 gatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactt 228  Q
    | || |||||  |    | ||||| |||||    |||||||  ||||||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||  |||||||| | |||||    
T  10474556 gtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactt 10474457  T
Q  229 tgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcc 327  Q
    || |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||  ||    
T  10474456 tgagtagaattaggcg-ggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcccc 10474359  T
Q  328 cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt-ctttttactatttttgtttgtgtttat 425  Q
    || |||||||||  ||||||||||||| | | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||| |||  |||| | ||||||||||    
T  10474358 catactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctaatttctac--ttttcgcttgtgtttat 10474262  T
Q  426 aa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaat 508  Q
    ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || | |||||| ||| | ||||||||||||    
T  10474261 aattgttccatacactttgttttggttacttgattattccttgctccacacatcaagtttattattgatgtaatttttcatcgaat 10474176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 500
Target Start/End: Original strand, 16776075 - 16776577
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactat-aaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  16776075 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttacaa 16776173  T
Q  108 a--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgag 198  Q
    |  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16776174 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 16776273  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||     
T  16776274 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatca- 16776370  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctc-----tttctttctct 392  Q
    |||||||||  ||| | ||||| |||  ||||||||| | ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||||     | | |||||||    
T  16776371 tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgcca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctcgctcttctttttctct 16776468  T
Q  393 cgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttatt 489  Q
    |||||| | ||| ||| |||| | ||||  ||||||   || |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| || | |||||    
T  16776469 cgctgt-tgttttctacttttggcttgt-attataattgtttcatacactttgttttgattgcctgattattccttgctccacacatcaagtttgttatt 16776566  T
Q  490 ggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||    
T  16776567 ggtgtgatttt 16776577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530721
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtat 34530903  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||   ||    
T  34530902 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattagga 34530803  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34530802 ctttgagtagaattaggcg-ggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaa 34530721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 498
Target Start/End: Original strand, 31542653 - 31543153
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  31542653 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 31542751  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gag 198  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  31542752 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 31542851  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||   |||||||||     
T  31542852 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctcg-aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatca- 31542947  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattc-gtgtgtgct-----ctctttctttct- 390  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||  ||||| ||      |||||  ||||     
T  31542948 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttgttcttcttttgttctc 31543046  T
Q  391 ctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttatt 489  Q
    ||||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| || | |||||    
T  31543047 ctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacgctttgttttggttgcttgattaacccttgctccacacatcaagt-tgttatt 31543144  T
Q  490 ggtgtgatt 498  Q
    |||||||||    
T  31543145 ggtgtgatt 31543153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10529298 - 10529098
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  10529298 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 10529200  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  10529199 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggaaggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 10529102  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  10529101 caaa 10529098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 495
Target Start/End: Original strand, 6747385 - 6747721
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  6747385 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 6747483  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||| | ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  6747484 actcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 6747580  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctct--ttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg---ttttggttgct 453  Q
    | |||||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||  ||||    |||| | ||||||||||||   ||||||||||||||   |||||||||||    
T  6747581 c-aaattcttttgtgttctcttcttcttttctctcgctgttgttttcgacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtgtttttggttgct 6747679  T
Q  454 tgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
    |||||||  ||||||  |||||||| || | |||||||||||    
T  6747680 tgattatctcttgctctacacatcaagtttgttattggtgtg 6747721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 18469091 - 18469441
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||  |||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  18469091 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcg-ggagactttttcttgta 18469189  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||| | |   |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  18469190 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tctagtggaacgaagagctgctctc-tcccagactaggtca-atttggaccgaactggattaac 18469286  T
Q  363 aaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgct 453  Q
     |||||| | || | || ||| ||||||       |||||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469287 -aaattcttttgcgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataacttccatacactttgttttggttgct 18469384  T
Q  454 tgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  18469385 tgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtatgatttttcatcgaatt 18469441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 18509517 - 18509201
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  18509517 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcg-ggagacttattcttgta 18509419  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||  | ||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||| | | ||    
T  18509418 actcgttgatatctattttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtca-atttgaaccgaactaggtcaa 18509321  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||     
T  18509320 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgtttgac 18509222  T
Q  458 tattacttgcttcacacatca 478  Q
    |||  |||||| |||||||||    
T  18509221 tatcccttgctccacacatca 18509201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 39854563 - 39854914
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagaga-tggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  39854563 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactgga-actttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 39854660  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||| | | |    
T  39854661 aacccattgatatctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatca-atttggaccgaactaggtca 39854758  T
Q  361 acaaaat-tcgtgtgtgctctctt--tctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacacttt-gttttggttgctt 454  Q
    ||||| | |  ||||| |||||||  | |||||||||||||  ||||    |||| | ||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||    
T  39854759 acaaattcttttgtgttctctcttcctttttctctcgctgttgttttttacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttatttttggttgctt 39854858  T
Q  455 gattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
     | |||  |||||| |||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  39854859 aactatcccttgctccacatatcaagtttattattggtgtgatttttcatcgaatt 39854914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 2144778 - 2144438
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactgttaggatg-agtcttttggttacgcgaagagatggag-actttgtgtagaattaggtttgg 247  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  || ||||||||  || |||||| || ||||||||||||     
T  2144778 acactagggttgggattgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttga 2144679  T
Q  248 agacttattcttgtaacccattg-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttg 345  Q
    ||||| ||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || || ||||   |||| |||    
T  2144678 agactaattcttgtaaccttttttatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcaaactaaaccagtattg 2144580  T
Q  346 gaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttt 445  Q
    ||||||||||       ||| || |||||| |||||||||||||||||||||    ||| ||| ||||| |||||||||||| |   |  ||| ||||||    
T  2144579 gaccgaactg-------aaattttgtgtgttctctctttctttctctcgctg----ttttctacttttgcttgtgtttataattgttacccacattgttt 2144491  T
Q  446 tggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    | ||||||||||||||  || || ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2144490 tagttgcttgattatt--ttactccacacataaagtattttattggtgtgatttt 2144438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 27910530 - 27910865
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  27910530 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 27910628  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |||   |||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  27910629 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 27910726  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattatt 461  Q
    | |||||| | |||| |||         |||||| ||  |||||   |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  27910727 c-aaattcttttgtgttct---------tctcgccgttgttttatacttttagcttgtatttataacttccatacactttattttggttgattgattatc 27910816  T
Q  462 acttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
     |||||| |||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  27910817 ccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 27910865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 2954497 - 2954842
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  2954497 ggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacgtattcttgta 2954595  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |  ||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||    
T  2954596 acccattgatatctc-tttgtaaagttactcatca-tatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaatttt-gaccgaactgggtcaa 2954692  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtt-tataa--cttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||  |||| | |||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2954693 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgtgttacataattgttccatacactttgttttggttgtctgat 2954789  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||| |||| || |||||||||  | | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2954790 tatcacttactccacacatcaaatttgttattggtgtgttttctcatcgaatt 2954842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 18466764 - 18467116
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18466764 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 18466862  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |||   |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  18466863 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 18466960  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    | |||||| | |||  || ||| ||||||       |||||| || | ||| ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466961 c-aaattcttttgttttcttctcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataacttccatacactttgttttgattgc 18467058  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  18467059 ttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattagtgtgatttttcatcgaatt 18467116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 252 - 500
Target Start/End: Original strand, 2724061 - 2724310
Alignment:
Q  252 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  2724061 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccg 2724158  T
Q  351 aactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt--tctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttt 445  Q
    |||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  | ||||| ||||||| ||| |||  |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  2724159 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttttctttcgctgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttt 2724255  T
Q  446 tggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||||| || | ||||||||||||||||    
T  2724256 tggttgcttgattatcccttgctatacacatcaagtttgttattggtgtgatttt 2724310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 478
Target Start/End: Original strand, 26097674 - 26098126
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||   |||  |  ||||||||||||     
T  26097674 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 26097772  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaaga-gatg 221  Q
      ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  26097773 gatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctg 26097871  T
Q  222 gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctc 321  Q
    | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || | ||||||    
T  26097872 g-gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacaga-ggctgctc 26097967  T
Q  322 tcttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttc--tctcgctgtctttttactatttttgttt 417  Q
    ||| | |||||||||||||  |||| |||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||| |||  |||| | |     
T  26097968 tctcctccagactaggtca-atttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctatctcgctgt-tttctac--ttttggcta 26098063  T
Q  418 gtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  26098064 gtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatca 26098126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 39798127 - 39798461
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  39798127 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 39798225  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||  |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||| ||||  |||||| |||||||| | ||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatc-gtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtca-atttggatcgaactgggtcaa 39798323  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattat 460  Q
    | |||||| | |||| |||         |||||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798324 c-aaattcttttgtgttct---------tctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattat 39798412  T
Q  461 tacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
      |||||| |||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  39798413 cccttgctccacacatcaaat-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 39798461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 15552325 - 15552525
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15552325 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 15552423  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  15552424 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 15552520  T
Q  361 acaaa 365  Q
    |||||    
T  15552521 acaaa 15552525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472622
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggct-aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31472850  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| | ||    
T  31472849 agagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga 31472750  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||  |||||||||||   |||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||     
T  31472749 cttttggtagaattaggcg-ggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctc 31472651  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaact 354  Q
     |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  31472650 ccccatactaggtca-atttggaccgaact 31472622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41585943 - 41585587
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| |||| |||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  41585943 ggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggca-ggagacttatttttgta 41585845  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  41585844 agtcattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 41585747  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctct--------ttctt---tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttg 447  Q
    |||| | |  ||||| ||||||        |||||   ||||||| ||| ||| |||  |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41585746 caaattcttttgtgttctctctgttctatcttcttttctctctcgttgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttg 41585650  T
Q  448 gttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  41585649 gttgcttgattatctcttgccccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 41585587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31466339 - 31466044
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||  |||  || | |||    
T  31466339 agatttgttccaaattttaagcgacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaa 31466240  T
Q  109 caaacaataaa-ctagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtc 200  Q
      ||| | ||| |||||||||   ||||| || |||||  |    | |||| ||||||    |||||||| |||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  31466239 gtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtc 31466140  T
Q  201 ttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    | ||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31466139 tcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcg-ggagact-attcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcat 31466044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34033783 - 34033565
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggag-actttgtgtagaattaggtttgg 247  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||  || | |||| ||||||||| |||||     
T  34033783 acactagcgttgggattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaattaagtttga 34033684  T
Q  248 agacttattcttgtaacccatt-gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttgg 346  Q
    |||||| || | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  34033683 agacttgttatggtaaccccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcattactgtggaacatagaactgctctctcccctgactaggtcagtattgg 34033584  T
Q  347 accgaactggataaacaaa 365  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  34033583 atcgaactgggtaaacaaa 34033565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 4410103 - 4410451
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  4410103 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 4410201  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||| |||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||    
T  4410202 acctattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 4410298  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt---ctc---tcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    | |||||| | |||| || ||| | ||||   |||   |||| | || ||| ||| |||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4410299 c-aaattcttttgtgttcttctctactttgtgctcttttcgccg-ctgttttctacttttggcttgtatttataacttccatacacctt-ttttggttgc 4410395  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  4410396 ttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcaacgaatt 4410451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12556284 - 12556200
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12556284 agatttgtttcaaaatttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaa 12556200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20507823 - 20507725
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  20507823 agatttgttccaagatttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 20507725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749980
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc 10749894  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  10749895 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 10749980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 39398192 - 39398003
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||| |  |||||| |||||||||||   | |||||||||||||||    
T  39398192 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggca-gtagacttattcttgta 39398094  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaact 354  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||  || | ||||||  || ||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  39398093 acccattgatatctcttttgtgacgttaccaatta-tatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtca-atttggaccgaact 39398003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38959979
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacg-ggagact-attcttgtaacccattgatttctc 38960217  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtg 376  Q
    ||| |||| |||||||||||  ||||||||  ||| | ||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||||||| | |||||| ||| | ||||    
T  38960216 ttt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagatt-ggaccgaactgggtcaacaaatttctt-tgtg 38960121  T
Q  377 ctctctttctttctctcgctgt-ctt-------tttactatttttgt-ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgc 467  Q
     |||  || ||||| | | | | |||       ||| ||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  38960120 ttcttcttttttcttttgttcttcttgtcgttgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgc 38960021  T
Q  468 ttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    | ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  38960020 tccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 38959979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665323
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagact-attcttgtaacccattgatttctc 23665237  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt-cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  23665238 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 23665323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793264
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagact-attcttgtaacccattgatttctc 23793350  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt-cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  23793349 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 23793264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 42770940 - 42771024
Alignment:
Q  213 gaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42770940 gaagagattgagactttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 42771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 4236979 - 4237058
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  4236979 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgcttcacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcaacgaatt 4237058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 241
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20043092  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  ||   | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  20043093 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 20043192  T
Q  226 ctttgtgtagaattag 241  Q
    |||||  |||||||||    
T  20043193 ctttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21684650 - 21684451
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| | | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  21684650 ggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggca-ggagacttattcttgta 21684552  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || ||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  21684551 actcattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 21684455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 365
Target Start/End: Original strand, 13295878 - 13296018
Alignment:
Q  222 gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc-atcattatagtggaatggatgactgct 320  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||    
T  13295878 gagactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaccctttgaaa--tcttttgtaaagttactcaaaaattatagtggaatggagaactgct 13295975  T
Q  321 ctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    | |  || ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  13295976 ccc--ccaagagtaggtcagtattgaaccgaactagataaacaaa 13296018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15224983 - 15224735
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagagatg-gagactttgtgtagaattaggtttgg 247  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||| | | ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||     
T  15224983 acactagggttatgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgggtaaaattaggtttga 15224884  T
Q  248 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtt---actcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttt 343  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||||  ||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||  | |  |||||||||  |||||||||||||||| |    
T  15224883 agactaatttttgtaaccatttgataattcttttgtaaacttacgactcatcattataatggaacagttagctgctctctgccccagactaggtcagtat 15224784  T
Q  344 tggaccgaactggataaa-caaaattcgtgtgtgctctctttctttctc 391  Q
    || |||||||| | |||| ||| ||  |||||| |||||| ||||||||    
T  15224783 tgaaccgaactaggtaaaccaatatatgtgtgttctctctctctttctc 15224735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 88
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723964
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagc 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagc 2723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3373301 - 3373136
Alignment:
Q  197 agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc 296  Q
    ||||| || |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||    
T  3373301 agtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 3373204  T
Q  297 attatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    | ||||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  3373203 a-tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 3373136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757456
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttttc 10757370  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||    
T  10757371 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attagaccgaactgggtcaacaaa 10757456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 509
Target Start/End: Original strand, 21288953 - 21289186
Alignment:
Q  276 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgt 373  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||| | |  |||    
T  21288953 tcttttgtaacgttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttag-accgaactgggtcaacaaattcttttgt 21289050  T
Q  374 gtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttca 471  Q
     | ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||  ||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||    
T  21289051 tttctctcttttgttctctcgttgt-tttctact--tttggcttgtgtttattattcttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctcca 21289147  T
Q  472 cacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21289148 cacatcaagtttgatattggtgtgatttttcatcgaatt 21289186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 21684380 - 21684301
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  21684380 ttccatacactttgttttgattgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 21684301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 26098380 - 26098152
Alignment:
Q  272 tatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc--agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-t 368  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||| || ||| | ||||||||| |||  | ||||||||| ||| |||||||||||  | |||||| | |    
T  26098380 tatctcttttgtaacgttactcatcat-atggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaattt-ggaccgaactgagtcaacaaattct 26098283  T
Q  369 cgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgt-ttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattattactt 465  Q
      | ||| ||||||| ||||||||| ||  || ||| ||| |||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26098282 tttatgttctctcttcctttctctctctcgctgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattcctt 26098183  T
Q  466 gcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
    ||| ||||||||| || |  |||||||||||    
T  26098182 gctccacacatcaagtttgatattggtgtga 26098152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Original strand, 42770691 - 42770785
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagttt 103  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  42770691 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatc-gagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggttt 42770785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 478
Target Start/End: Original strand, 42771028 - 42771165
Alignment:
Q  335 ggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccat 434  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||    |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  42771028 ggtcagttttgggccgaattgtgtaaacaaatttcgtgtgttctctcttcatttctcttgctgtttt----ctacctttgcttgtgtttataacttccat 42771123  T
Q  435 acactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    ||| ||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42771124 acattta--tttggttacttgattattacttgctccacacatca 42771165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23742023 - 23741858
Alignment:
Q  196 gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  23742023 gagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagact-attcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcat 23741927  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctctt-cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||  ||||||||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  23741926 ca-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 23741858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 39798006 - 39798068
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaac 71  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39798006 agatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtattagagtaaac 39798068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354574
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagact-attcttgtaacccattgatttctc 15354660  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| ||||||||| |  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  15354659 -tttgtaacgttactcatta-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 15354574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26098589 - 26098528
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26098589 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaa 26098528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34530647 - 34530566
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  34530647 ttccatacgctttgttttggttgcttgattatcacttgctcgacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 34530566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 365
Target Start/End: Original strand, 35430322 - 35430462
Alignment:
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt-gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   || || |||    
T  35430322 ctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattcttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaaagctcctatct 35430420  T
Q  325 tc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     |   ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35430421 cctttagagtaggtcagtattggactgaactggataaacaaa 35430462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 492
Target Start/End: Original strand, 20045332 - 20045395
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||    
T  20045332 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcatttgcttcacacatcaagtttgttattggt 20045395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 41586044 - 41585970
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  41586044 atacttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctg-aaacaagggtttagaa 41585970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 307
Target Start/End: Original strand, 4754220 - 4754377
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||| |||| || ||| || ||||| ||  |||||||| | |||||||  |||||||||||||| ||    
T  4754220 acactagggttgagattgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattaggtttgaag 4754319  T
Q  250 acttattcttgtaacc-cattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 307  Q
     || ||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4754320 gctaattcttgtaaccttttttatatctc-tttgtaaagttactcatcaatatagtgga 4754377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 21684822 - 21684748
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  21684822 agatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagag 21684748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 508
Target Start/End: Original strand, 25804375 - 25804455
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg--attttcatcgaat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||  |||||||||||||    
T  25804375 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatattttcatcgaat 25804455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 2144955 - 2144878
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaat-tttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagag 83  Q
    |||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2144955 gagatttgttccaattatttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagag 2144878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356850
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagact-attcttgtaacccattgatttctc 15356936  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| ||||||||| |  ||||||||  ||| | |||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  15356935 -tttgtaacgttactcatta-aatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 15356850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34479346 - 34479266
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||    
T  34479346 ttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcaaatt 34479266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 500
Target Start/End: Original strand, 15552584 - 15552667
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||    
T  15552584 ttgtatttataactttcatacactttgttttagttgcttgattatcccttacttcacgcatcaagt-tgttattggtgtgatttt 15552667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25921401 - 25921322
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||    
T  25921401 ttccatacactttattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattctcaacgaatt 25921322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 128
Target Start/End: Original strand, 15143437 - 15143527
Alignment:
Q  41 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagataga--gggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||  |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||    
T  15143437 ctataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagataggaggctgaaaacaagggtctaaaaacaaacaacaaactagggttt 15143527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 242
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045169
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagttta-gaaacaaacaa-taaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||  |||||  ||||||||||||   |    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctg-aaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 20045052  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| || |||||||| | ||    
T  20045053 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattggga 20045152  T
Q  226 ctttgtgtagaattagg 242  Q
    ||||| |||||||||||    
T  20045153 ctttgggtagaattagg 20045169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 65
Target Start/End: Original strand, 29748260 - 29748315
Alignment:
Q  10 gatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga 65  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29748260 gatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttgtatcaga 29748315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 39854426 - 39854499
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  39854426 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggg-gctg-aaacaagggtttagaaa 39854499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 266
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627449
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 266  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactagg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc 10627449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16093422 - 16093291
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctcttccca 329  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| | |   ||||||||||||||    
T  16093422 gtagaattagatttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaaaagctgctctcttccca 16093327  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     |||||||||   || ||||||||||||||||||||    
T  16093326 tactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaa 16093291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 495
Target Start/End: Original strand, 20043234 - 20043402
Alignment:
Q  328 cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttcttt-ctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttat 425  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |  ||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||| | ||||||||||    
T  20043234 cagactaggtcaattt-ggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttcttttctctcgctgt-tttctact--tttggcttgtgtttat 20043329  T
Q  426 aact--tccatacactttgttttggttgcttga-ttattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
    || |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||| || | |||||| ||||    
T  20043330 aattgttccatacactttgttttggctgcttgatttatcacttgctccacaaatcaagtttgttattgatgtg 20043402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Original strand, 695833 - 695905
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | || ||||||| |||||||||    
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatg-aaacaagggtttagaaa 695905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189872
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaacctt----gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctg-aaacaagagtttagaaa 1189872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 10529026 - 10528954
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  10529026 ttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgcttcacacatcaagt-tgttattggtgtgattttc 10528954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 303
Target Start/End: Original strand, 20045210 - 20045259
Alignment:
Q  254 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 303  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20045210 attcttttaacccattgatatcttttttgtaaagttacttatcattatag 20045259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31179300 - 31179220
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  31179300 ttccatacactttgttttggttgcttaattatcccttgctccatacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 31179220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39398256
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagaggg-gctg-aaacaagggtttagaaa 39398256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 496
Target Start/End: Original strand, 2175255 - 2175318
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  2175255 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtga 2175318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 12555843 - 12555779
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | | ||||||||||||    
T  12555843 catacactttattttggttgcttgattattccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtga 12555779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10529436 - 10529362
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | | || ||||||| |||||||||    
T  10529436 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttg-aaacaagggtttagaaa 10529362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 34477433 - 34477378
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34477433 agatttgttacagattttaagcgagacttttactataaaaatagaccttgtatcag 34477378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 42238311 - 42238443
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||  |||    
T  42238311 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 42238406  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  42238407 agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 42238443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782554
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 266  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| | || || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggaattgg-gtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccc 31782554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 3373401 - 3373332
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagat 79  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||    
T  3373401 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 10750050 - 10750130
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  10750050 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttgatcgaatt 10750130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 10757526 - 10757606
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  10757526 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttgatcgaatt 10757606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 15552154 - 15552227
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  15552154 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagag 15552227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 27910364 - 27910437
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  27910364 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagag 27910437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 27912449 - 27912522
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  27912449 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagag 27912522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Original strand, 10586758 - 10586826
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 78  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  10586758 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 10586826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 365
Target Start/End: Original strand, 22672849 - 22673017
Alignment:
Q  195 tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc- 293  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||     
T  22672849 tgagtctcttggtcacgagaagaggctgagacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactca 22672943  T
Q  294 -atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||||||||||  |||   |||||||||  ||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  22672944 tatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 22673017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 31465937 - 31465850
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataact--tccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  31465937 ttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcttaattattccttgttccacacatcaaatttgttattggtgtgatttt 31465850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17841380 - 17841248
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||   |||||||||  |||    
T  17841380 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctccccc 17841285  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  17841284 agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 17841248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 85
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21288758
Alignment:
Q  42 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagaggg 21288758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26406655 - 26406573
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 263  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26406655 aaacattgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactt-gagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 26406573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 34479794 - 34479739
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34479794 agatttgttacagattttaagcgagacctttactataaaaatagaccttgtatcag 34479739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385451
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 279  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||   | ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 35385540  T
Q  280 ttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||||  ||||||||||||||  |||   |||||||||  ||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  35385539 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 35385451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 339
Target Start/End: Original strand, 1240474 - 1240585
Alignment:
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||    
T  1240474 tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct 1240569  T
Q  325 -tcccagactaggtca 339  Q
     ||||| |||||||||    
T  1240570 ctcccaaactaggtca 1240585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3373065 - 3372984
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  3373065 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 3372984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 4409999 - 4410077
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  4409999 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 4410077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15445531 - 15445482
Alignment:
Q  110 aaacaataaactagggttttagagatttctctaagagggagacactagggttg 162  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15445531 aaacaacaaactagggt---agagatttctctaagcgggagacactagggttg 15445482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 25803935 - 25803989
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25803935 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 25803989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 1170862 - 1170993
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   |||||||||  ||||    
T  1170862 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 1170957  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  1170958 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 1170993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 18466599 - 18466700
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gagatagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  18466599 atttgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctg-aaacaagggtttag 18466697  T
Q  106 aaa 108  Q
    |||    
T  18466698 aaa 18466700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 18468926 - 18468979
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatca 63  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18468926 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 18468979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509582
Alignment:
Q  37 tttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt--gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggg-gctg-aaacaagggtttagaa 18509582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18511547 - 18511476
Alignment:
Q  37 tttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt--gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  18511547 tttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 18511476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 23665056 - 23665125
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 78  Q
    |||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  23665056 agatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23665125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23793531 - 23793462
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 78  Q
    |||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  23793531 agatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 365
Target Start/End: Original strand, 28786457 - 28786587
Alignment:
Q  234 agaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctcttccc-ag 330  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||| ||||| |||  |||||||||| ||| ||    
T  28786457 agaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattataatggaacggagaactgctctctcccccag 28786552  T
Q  331 actaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  28786553 actaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 28786587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Original strand, 32520579 - 32520645
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttact 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||    
T  32520579 gactttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgtaaccctttggaa--tcttttgtaaagttact 32520645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5777728 - 5777635
Alignment:
Q  406 ctatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc-ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  5777728 ctatttttgcttgtgtttatgactgtcacccacgttgttttggttgctttgatta--atttgctccacacatcaaatattttattgatgtgatttt 5777635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15354502 - 15354431
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  15354502 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 15354431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15356778 - 15356707
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  15356778 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 15356707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 23665396 - 23665467
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  23665396 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 23665467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23741785 - 23741714
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  23741785 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 23741714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23793191 - 23793120
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  23793191 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 23793120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 118)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 502
Target Start/End: Original strand, 19696393 - 19696889
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggag--ctgaaaacaagagtttag 105  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  19696393 gagatttgttccaatttttgaaggattcttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttag 19696492  T
Q  106 aaacaaacaataaactagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtct 201  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   ||||| || ||||  |    |  ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19696493 aaacaaacaacaaattagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaatcactagggttcaaattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtct 19696592  T
Q  202 tttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
     || || ||   ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19696593 ctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattat 19696692  T
Q  302 agtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtct 400  Q
    |||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  19696693 agtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcgctg--- 19696789  T
Q  401 ttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19696790 tttttctacttttgtttgtgtttataactgtcacccactttgtttcggttgcttgattact--ttgctccacacatcaagtattttattggtgtgatttt 19696887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 26945127 - 26945593
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagag-taaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggtttt-aga 132  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  26945127 cttttactataaatataaaccttgtatcaggtataaaccttgagatatagggggccgaaaacaagggtttagaaacaaacaacaaactaggttttagaga 26945226  T
Q  133 gatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgt 231  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||     
T  26945227 gatttctctaagcggaagacactaaggttgtggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgg 26945326  T
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct-cttcccag 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | | ||||| |  |||||    
T  26945327 gtagaattaggtttgtagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccag 26945426  T
Q  331 actaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact 429  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |||| | ||||||||||||||    
T  26945427 attatgtcaggtttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtcttctctctttcttttctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataact 26945523  T
Q  430 tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  26945524 tccttacactttg-tttgattctttgattattacttgtttcacatatcaagtgttttattggtgtgatttt 26945593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12186432 - 12186036
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattttaagcgat-acttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  12186432 gagatttgttccaattttttagcgattacttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttag 12186333  T
Q  106 aaacaaacaataaactagggttttagaga--tttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctt 202  Q
    ||||| |||| |||| | |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  12186332 aaacagacaacaaaccaaggttttagagagatttctctaagcgggagaaactagggttgttgttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 12186233  T
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12186232 ttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 12186133  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 398  Q
    |||||| ||| | ||||||||| || | ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12186132 gtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtca-atttgaaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctctttctttctctcgctgt 12186036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3028189 - 3027720
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt-- 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||| |||   ||||  ||||||||||||      
T  3028189 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaaggcaacacaaaactagggtttgt 3028090  T
Q  129 -tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagac 226  Q
     ||||| || ||||  |    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  3028089 atagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagac 3027990  T
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctc--tct 324  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||     
T  3027989 tttgagtagaattaggct-ggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcc 3027891  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttta 424  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||   |||| ||||    
T  3027890 ccccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcgttgt-tttctac--ttttgacttgtattta 3027794  T
Q  425 taacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  3027793 taacttccatacacttt-atttggttgctcgattattacttgctccacacatcaaata-tttatcggtgtgatttt 3027720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 151 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22858167 - 22857887
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||    
T  22858167 acactagggttgagattgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaag 22858068  T
Q  250 acttattcttgtaacccatt-gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttgga 347  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  22858067 actaattcttgtaacccttttgatatatcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattgga 22857969  T
Q  348 ccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttcca 433  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  22857968 ccgaactgtgtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcgctgt-tttgtac---ttttgcttgtgtttataacttcca 22857887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338302
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcat 24338685  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgtg---gttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggag 224  Q
    | || || | ||| ||    | ||||||||| | ||   ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |  |||||||  ||    
T  24338684 aaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaag 24338585  T
Q  225 actttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    |||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||     
T  24338584 actttgggtagaattag-tcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctc- 24338487  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa-attcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
     ||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||| |||  |||||  ||||||  ||||||||| ||| ||| |||  |||| ||||||||||    
T  24338486 ccccagactatgtca-atttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgttatctcttcttttctctcgttgt-tttctac--ttttggtttgtgttt 24338391  T
Q  424 ataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  24338390 ataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatctcttgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttcatcgaatt 24338302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 509
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012495
Alignment:
Q  41 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt---tagagattt 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||   || || ||     
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaagtaaacaacaaactagggtttgtataaagtttg 17012128  T
Q  138 ctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtaga 236  Q
    ||||  |    | |||||||||||| |||||||| |||||  |||||| | ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||  ||||  |||||    
T  17012129 ctcttggcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtaga 17012228  T
Q  237 attaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga-atggatgactgctctcttcccagactag 335  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | || ||   |  |||||  ||||||||||    
T  17012229 attaggcg-ggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagggaacatagagatcatctctc-ccccagactag 17012326  T
Q  336 gtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccata 435  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||   | | ||||||||||||||||| || | ||| |||  |||| | |||||||| |||| | ||||    
T  17012327 gtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatttc--atattctctctttctttctctcactat-tttctac--ttttggcttgtgttt-taacgttcata 17012420  T
Q  436 cactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17012421 cactttgttttggttgcttgattattatttgctccacacatcaagtattttattgttgtgatttttcatcgaatt 17012495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 9019879 - 9020391
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  9019879 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggct-aaaacaagggtttagaaa 9019977  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    |  ||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9019978 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 9020077  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || |||||||   |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9020078 ctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 9020175  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc--tttctctcgc 395  Q
    |||||| || ||  | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  9020176 atagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcccttttctctcgc 9020274  T
Q  396 tgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggt 492  Q
    ||| | ||| ||| |||| | |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  9020275 tgt-tgttttctacttttggcttgtatttataattgttccatacactttgttttggttgtctgattatctcttgctccacacatcaagtttgttattggt 9020373  T
Q  493 gtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9020374 gtgatttttcatcgaatt 9020391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 15367134 - 15367491
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  || |||||||| || |||||| ||| |||||  |  ||||    
T  15367134 acactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaa-tcgggag 15367231  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactg--ctctcttcccagactaggtcagttttgga 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || ||| | |||  |||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  15367232 acttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatca-tatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtca-atttgga 15367329  T
Q  348 ccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttt 445  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| | | ||| |||  |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15367330 ccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctcg-tatttttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttt 15367426  T
Q  446 tggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  15367427 tggttgcttgattatcacatgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 15367491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25078879 - 25078538
Alignment:
Q  43 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag-ggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt-tagagatttctc 140  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| || |||    
T  25078879 ataaatatagac-ttgtatcagaataaaccttgagagagagaggggccgaaaacaaaggtttagaaacatacaacaatctagggtttgtagagtttactc 25078781  T
Q  141 taagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaatt 239  Q
    |  |    | ||| ||||||||   |||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||||| |||  ||||||| |||| |||  ||||||||    
T  25078780 ttggcaacaaacattagggttgaaattgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaatt 25078682  T
Q  240 aggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtca 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25078681 aggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttcccagtctaggtca 25078582  T
Q  340 gttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctt 383  Q
    || |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||    
T  25078581 gtattggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctt 25078538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16455785 - 16455404
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggag-ctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||   || ||| ||||||||||| ||||||||    
T  16455785 agatttgttccaatttttcagggatacctttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagtctgaaaacaagggtttagaa 16455686  T
Q  108 acaaaca-ataaactagggtttt---agagatttctctaag-agggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtct 201  Q
       |||| | ||||||||||||    |||| |||||||  | |  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16455685 gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttttctcttggcaacga-acactagggttgtggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtct 16455587  T
Q  202 tttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
     ||| | |||  ||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16455586 cttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattat 16455488  T
Q  302 agtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctcttt 384  Q
    ||||||| ||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||    
T  16455487 agtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatttcgtgtgttctttcttt 16455404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 509
Target Start/End: Original strand, 14466440 - 14466784
Alignment:
Q  166 ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 264  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||| | || |||| |||||||||||    ||||| ||||||||||||    
T  14466440 ttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggagtttgagtagaattagg-cgagagacatattcttgtaac 14466538  T
Q  265 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaaca 363  Q
     |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| | |  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | | ||    
T  14466539 tcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcagca 14466637  T
Q  364 aaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattatta 462  Q
    || | || ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  14466638 aattctcttgtgttctctctttctttctctcgctg-ctgttttctacttttgtttgtgattataactttcatacattttgttttggttgcttgactatca 14466736  T
Q  463 cttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||| |||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  14466737 cttgctgcacacatcaaatttattattggtgtgatttttcatcgaatt 14466784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631791
Alignment:
Q  37 tttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---tag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3632173  T
Q  132 agatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagact 227  Q
    || || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||  ||||||| | ||||    
T  3632172 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggact 3632073  T
Q  228 ttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc 327  Q
    ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||  |||    
T  3632072 ttgggtagaattaggca-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct-gtcc 3631975  T
Q  328 cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt--tctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttta 424  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  |||||  ||||||  | ||||||||| ||| ||| |||  |||| | |||||||||    
T  3631974 cagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttcctttttctctcgatgt-tttctac--ttttggcttgtgttta 3631879  T
Q  425 taa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg-attttcatcgaatt 509  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| ||| || | |||||||||||  |||||||||||||    
T  3631878 taattgttccatacactttgttttggttgcctaattatcacttgctccacacgtcaagtttgttattggtgtgttttttcatcgaatt 3631791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629718
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaa-catcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3630101  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || ||||| ||    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||| | |     
T  3630100 agagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattgggg 3630001  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||  || | |||||||||     
T  3630000 ctttgggtagaattaggag-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaat-aatatagtgaaactgagggctgctctctc 3629903  T
Q  326 cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttta 424  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||| ||| ||| |||| |||| | |||||||||    
T  3629902 cccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgttgt-tttctact-ttttggcttgtgttta 3629806  T
Q  425 taa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3629805 taattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaatt 3629718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11983390 - 11982879
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||  ||| | |||||||    
T  11983390 agatttgtttcaaattttaaacgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaag-gcttagaaa 11983292  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11983291 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 11983192  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  11983191 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 11983094  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctct--ttctttctctcgc 395  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||  || ||||||||||    
T  11983093 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttttctctcgc 11982995  T
Q  396 tgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggt 492  Q
    ||| | ||| ||| |||| | ||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  11982994 tgt-tgttttctacttttggcttgtgattgtaattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagt-tgttattggt 11982897  T
Q  493 gtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11982896 gtgatttttcatcgaatt 11982879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 15719745 - 15720098
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| | | |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||    
T  15719745 acactagggttgag-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggag 15719842  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctc--tcttcccagactaggtcagttttgga 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    |||||  ||  |||| |||||||||  ||||||    
T  15719843 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtca-atttgga 15719941  T
Q  348 ccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacacttt-gttt 445  Q
    ||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  15719942 ccgaacttggtaaacaaatttcatgtgttctctctttcttttctctcgctg----ttttctatttttgtttgtgattataacttccatacactttatttt 15720037  T
Q  446 tggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    || |||||||| ||| |||   | ||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||    
T  15720038 tgattgcttgactatcact---tccacacatcaagtttattattgacgtgattttcatcgaatt 15720098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057652
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtat 13057271  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| | ||    
T  13057272 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggga 13057371  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||     
T  13057372 ctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctc 13057470  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
     |||| |||||||||  ||||||||||||| | | |||||| | |  ||||| ||||||||||||   || || ||| ||| ||| ||||||||||| ||    
T  13057471 ccccaaactaggtca-atttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctctctttcttt---tctctatctgttttctacttttgtttgtgatt 13057566  T
Q  424 ataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |      |||||| | ||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  13057567 ataattgttgcccacttt-tattggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 13057652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25465708 - 25465451
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagtttt 344  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  25465708 ggagacttattcttgtacccctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtatt 25465610  T
Q  345 ggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg 442  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    ||| ||| ||||| ||| ||||||||   ||||   ||| |||    
T  25465609 ggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctctttctttctctcgctg----ttttctacttttgcttgagtttataattgttcc---cacgttg 25465517  T
Q  443 -ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
     | |||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25465516 atattggttgcttgattatt--ttgctccatacatcaagtattttattggtgtgattttcatcgaatt 25465451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 248 - 509
Target Start/End: Original strand, 15346546 - 15346806
Alignment:
Q  248 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttgg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||   |||||||||  ||||||||||||||  |||||    
T  15346546 agacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatca-tatagtgaaacggaaagctgctctctcccccagactaggtca-atttgg 15346643  T
Q  347 accgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgtt 444  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||  |||| | ||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  15346644 accgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctcttgttgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatatactttgtt 15346740  T
Q  445 ttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  15346741 ttggttgcttgattatcacttgttccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 15346806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12937559 - 12937169
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatata--gacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagag-ggagctgaaaacaagagttta 104  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||| | |||||    
T  12937559 agatttattccaaatttttagggatacttttactataaatatatagacattgtatcagatgtaaaccttgagatacagaggggctgaaaacagg-gttta 12937461  T
Q  105 gaaacaaacaataaactagggtttt-agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttac-----cttggg--aaacactgttaggat- 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||| || |||||   ||| ||| |     |||     ||||||| ||| |||     
T  12937460 gaaacaaacaaaaaactagggtttagagatatttctctaagtggtagacaataaggttggtattgttttgcttcccctttaataaaacactattaagatt 12937361  T
Q  196 gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    |||||| || || ||| ||| |||| || |||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||    
T  12937360 gagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctcttt-gtaaagttactcat 12937262  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 388  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||| || |||||||||    
T  12937261 cattatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattttgtgtgttctatctttcttt 12937169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28037964 - 28037724
Alignment:
Q  130 agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||  || |||| |||||||    
T  28037964 agagatttctctaagcgggagacactagggttgtgagtgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactt 28037865  T
Q  229 tgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga---atggatgactgctctct- 324  Q
    || ||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | | | | |||||||||     
T  28037864 tgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctc 28037765  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  28037764 ccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaacaaa 28037724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 235 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 28078323 - 28078064
Alignment:
Q  235 gaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagact 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| || || |||    
T  28078323 gaattaggtttgaagacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatact 28078225  T
Q  334 aggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttc 431  Q
    |||||| |||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||     || ||| ||||| ||||||||||||  ||||    
T  28078224 aggtcaattttagaccgaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctttttctttctctcgctg-----tttctacttttgcttgtgtttataattcttc 28078130  T
Q  432 catacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |   ||| ||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28078129 c---cacgttgatattggttgcttgattatt-tttgctccacacatcaagtattttattggtgtgatttt 28078064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 1069909 - 1069603
Alignment:
Q  173 accttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1069909 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattga 1069811  T
Q  272 tatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt-cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcg 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| | |||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||     
T  1069810 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtca-atttggaccgaactgaatcaac-aaattct 1069713  T
Q  371 tgtgtgctctct-ttctt---tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattact 464  Q
    | | || ||||| |||||   ||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||    
T  1069712 tttatgttctctcttcttttctctctcgctgt-tttctac--tttttgcttgtgtttataattgttccatacactttgttttgattgcttgactatccct 1069616  T
Q  465 tgcttcacacatc 477  Q
    |||| || |||||    
T  1069615 tgctccatacatc 1069603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 354
Target Start/End: Original strand, 32279950 - 32280301
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||    
T  32279950 agatttgttccaaattttaagcgatacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagaggg-gctgaaa-caagggtttaaaaa 32280047  T
Q  109 ca-aacaataaa-ctagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
       ||||| ||| |||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||| |||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32280048 ggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 32280147  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| |||||||| | |||||   |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32280148 ctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgtt 32280246  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaact 354  Q
    |||||  || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32280247 atagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 32280301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 30729189 - 30728686
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || | ||||    
T  30729189 agatttgttccaaattttaagcggtacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtatcgaaa 30729091  T
Q  109 ca-aacaa-taaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
     | |||||  ||||| ||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  30729090 gacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgact 30728991  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    || ||||||||| ||||||   | | ||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  30728990 ctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcat 30728892  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 393  Q
     |||||||||||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||| | |  |||||  |||||| ||||||||     
T  30728891 -attatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttcctttctct- 30728795  T
Q  394 gctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattg 490  Q
     ||  || ||| ||| |||||  |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||| || | ||||||    
T  30728794 -ctcgctgttttctacttttgacttgtatttataattgttccatacactttgttttggttgtttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattg 30728696  T
Q  491 gtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||    
T  30728695 gtgtgatttt 30728686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14507536 - 14507025
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  14507536 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggct-aaaacaagggtttagaaa 14507438  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14507437 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 14507338  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||| |    
T  14507337 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatca-t 14507241  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ct 390  Q
    |||||| |  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| || ||| ||||||       |    
T  14507240 atagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttctt 14507143  T
Q  391 ctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttatt 489  Q
    ||||| || | ||| ||| |||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||    
T  14507142 ctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttatt 14507045  T
Q  490 ggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  14507044 ggtgtgatattcatcgaatt 14507025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 324
Target Start/End: Original strand, 3390354 - 3390654
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||    
T  3390354 gatacttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 3390452  T
Q  129 ---tagagattt-ctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatg 221  Q
       ||||| ||| ||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||   |||||||     
T  3390453 gtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagatt 3390552  T
Q  222 gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctc 321  Q
    | | ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||    
T  3390553 ggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctc 3390651  T
Q  322 tct 324  Q
    |||    
T  3390652 tct 3390654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15541501 - 15541205
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  15541501 agatttgttccaaattttaagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 15541403  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||| |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||    
T  15541402 ggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagt 15541303  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    || ||||| ||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15541302 ctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcg-ggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 15541205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12195875 - 12195523
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa- 108  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||     
T  12195875 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaa 12195777  T
Q  109 -caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagt 199  Q
     |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  12195776 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 12195677  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |    
T  12195676 ctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaa-tcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-t 12195580  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactgg 356  Q
    |||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12195579 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgg 12195523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 365
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040070
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||| ||||||   |    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaa-caagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtat 13039831  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  13039832 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgaga 13039931  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||     
T  13039932 ctttgcgtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctc 13040030  T
Q  326 ccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||| |||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||    
T  13040031 ccctagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaa 13040070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26932761 - 26932420
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26932761 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 26932663  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  26932662 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 26932566  T
Q  361 acaaaattcgtgtgtgctctctttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgct 453  Q
    ||||| ||| | |||| |||  ||||||       |||||| ||  |||| |||  ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26932565 acaaatttcttttgtgttcttcttctttgtgttcttctcgccgttgtttttctacctttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgct 26932466  T
Q  454 tgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  26932465 tgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 26932420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15530480 - 15530166
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--c 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||  |||| | ||||||   |    
T  15530480 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaag-caagggcttagaatggc 15530382  T
Q  110 aaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctt 202  Q
    ||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  15530381 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 15530282  T
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15530281 ttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcg-ggagacttattcttgtaacc-attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tata 15530185  T
Q  303 gtggaatggatgactgctc 321  Q
    |||||| ||| | ||||||    
T  15530184 gtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 223 - 360
Target Start/End: Original strand, 30445698 - 30445836
Alignment:
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  30445698 agactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctct 30445797  T
Q  323 cttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    || | ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30445798 ctccaccatactaggtcagtattggactgaactggataa 30445836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15533042 - 15532700
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  15533042 agatttgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 15532944  T
Q  109 ca-aacaataaa-ctagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
       ||||| ||| |||||||||   || || || | |||  |    | ||| |||||||    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  15532943 ggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 15532844  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||| | | |||||||| | ||||||  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15532843 ctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 15532746  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttg 345  Q
    |||||| || ||| | ||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  15532745 atagtgaaacggagggctgctctatccctagactaggtcaattttg 15532700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4816430 - 4816088
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  4816430 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 4816332  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  4816331 acccattgatttctcttttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 4816234  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    | |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||| ||  |||| ||| |||||  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  4816233 c-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgtttttctacttttgacttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgc 4816135  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  4816134 ttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 4816088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12911812 - 12911421
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatata--gacattgtatcagag-taaaccttgagatagag-ggagctgaaaacaagagttta 104  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| || || |||||||||| | |||||    
T  12911812 agatttattccaaatttttagggatacttttactataaatatatagacattgtatcaaatataaaccttgagatacagaggggctgaaaacagg-gttta 12911714  T
Q  105 gaaacaaacaataaactagggtttt-agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttac-----cttggg--aaacactgttaggat- 195  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||  | ||||| || |||||   ||| ||| |     ||||    ||||||| ||| |||     
T  12911713 gaaacaaacaaaaaactagggtatagagatatttctctaagtcgtagacaataaggttggtattgttttgcttccccttgaataaaacactattaagatt 12911614  T
Q  196 gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    |||||| || || |||  || |||| ||||||||  ||||| ||||||||| || || ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||    
T  12911613 gagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctcttt-gtaaagttactcat 12911515  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 388  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||| || |||||||||    
T  12911514 cattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattttgtgtgttctatctttcttt 12911421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19704768 - 19704566
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  19704768 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 19704670  T
Q  262 aacccattgatatctct-tttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggata 359  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| |     
T  19704669 aacccattgatttctctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtc 19704572  T
Q  360 aacaaa 365  Q
    ||||||    
T  19704571 aacaaa 19704566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2629084 - 2628734
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag-acttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||| | ||||||||||    
T  2629084 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg--cggagaatttattcttgt 2628987  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |    
T  2628986 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaattgggtca 2628890  T
Q  361 acaaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggtt 450  Q
    || |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2628889 ac-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataacttccatacactttgattttggtt 2628792  T
Q  451 gcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  2628791 gcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 2628734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1072238 - 1072140
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  1072238 agatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctg-aaacaagggtttagaaa 1072140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1230448 - 1230248
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||   ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  1230448 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 1230350  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  1230349 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 1230252  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  1230251 caaa 1230248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 293
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477518
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatat 25477351  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||  ||||||| | |     
T  25477352 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgggg 25477451  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc 293  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25477452 ctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc 25477518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 30967316 - 30967516
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   || |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30967316 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtg-ggagacttattcttgta 30967414  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||   |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  30967415 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 30967512  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  30967513 caaa 30967516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5273415 - 5273215
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5273415 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 5273317  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |    
T  5273316 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc-ttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 5273220  T
Q  361 acaaa 365  Q
    |||||    
T  5273219 acaaa 5273215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20915555 - 20915355
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  20915555 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 20915457  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |    
T  20915456 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 20915360  T
Q  361 acaaa 365  Q
    |||||    
T  20915359 acaaa 20915355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 20526907 - 20527064
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  20526907 acactagggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaag 20527006  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20527007 actaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaa 20527064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 174 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14458956 - 14458766
Alignment:
Q  174 ccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14458956 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgat 14458858  T
Q  273 atctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||   || | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  14458857 ttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 14458766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161528
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-tag 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  |||||||||||| ||     
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaaggg-gctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtat 12161792  T
Q  132 aga-tttctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagact 227  Q
    ||| ||| |||  |    | |||||||||||    ||||| || || |||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  12161791 agagtttgtctctggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagact 12161692  T
Q  228 ttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc 327  Q
    ||  ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||| ||    
T  12161691 ttaggtataattaagtg-ggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtaaaatggatggctgttctctccc 12161594  T
Q  328 cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc 393  Q
     | ||||||| |  |||||||||||||| || |||||| | |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  12161593 taaactaggtta-atttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttctctcttcctttctctc 12161528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28241658 - 28241170
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-- 128  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||      
T  28241658 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 28241560  T
Q  129 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgga 223  Q
     ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   |     
T  28241559 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 28241460  T
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||    
T  28241459 gactttcggtagaattagacg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaatcggagggctgctctc 28241362  T
Q  324 ttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctct------ctttct-ttctct-cgctgtctttttactatttttg 414  Q
    | ||| ||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||| |||| | |||| |||      |||| | |||| | ||| ||  |||| ||| |||||    
T  28241361 tcccccagactaggtgaattt-ggaccgaactgggtcaacaa-attcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttttcgccgttgtttt-ctacttttg 28241265  T
Q  415 t-ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
      |||| ||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  28241264 gcttgtatttaattgttccatacactttgttttgattgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 28241170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 26065098 - 26065296
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26065098 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 26065196  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    |||||||||  |||| ||||||| ||||||| | | |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  26065197 acccattgacttctc-tttgtaacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 26065293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 26085067 - 26085265
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26085067 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 26085165  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    |||||||||  |||| ||||||| ||||||| | | |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  26085166 acccattgacttctc-tttgtaacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 26085262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3233929 - 3233739
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  3233929 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcg-ggagacttattcttgta 3233831  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactg 355  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||||| || ||| | |||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  3233830 actcattgacatctcttttgtaacgttactca-ccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttt-gaccgaactg 3233739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 8995432 - 8995530
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  8995432 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggct-aaaacaagggtttagaaa 8995530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 30034802 - 30034602
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| | ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30034802 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 30034704  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||| | |||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||    
T  30034703 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtca-atttggaccgaactgggtcaa 30034606  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  30034605 caaa 30034602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Original strand, 22490764 - 22490901
Alignment:
Q  173 accttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 271  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||    
T  22490764 accttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgag-agacttattcttgtaacccattga 22490862  T
Q  272 tatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatg 310  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  22490863 tatctcttttgtaagattactcatcattatagtgtaatg 22490901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 384
Target Start/End: Original strand, 11262594 - 11262794
Alignment:
Q  187 tgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca---ttgatatctcttttg 282  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||     ||||||||||||| |    
T  11262594 tgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagatttag-gtagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatctcttt-g 11262691  T
Q  283 taaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctc 381  Q
    |||||  ||||||||||||| || || |||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||    
T  11262692 taaagaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatttcgtgtgttctctc 11262791  T
Q  382 ttt 384  Q
    |||    
T  11262792 ttt 11262794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 92
Target Start/End: Original strand, 15346347 - 15346427
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaa 92  Q
    |||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346347 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 15346427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19227769 - 19227528
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||  ||||||| |||||||||    
T  19227769 agatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggct-caaacaagggtttagaaa 19227671  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||| |  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19227670 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 19227571  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattagg 242  Q
    || ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  19227570 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 19227528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066123
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc 26066209  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||| ||||  ||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  26066208 -tttgtaacgttacttatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 26066123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068394
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc 26068480  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| ||| |||||||  ||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  26068479 -tttgtaacgttgctcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 26068394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309171
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc 33309085  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  33309086 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 33309171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Original strand, 17852518 - 17852592
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  17852518 atacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 17852592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22870196 - 22869957
Alignment:
Q  268 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa- 365  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||   || |||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||||     
T  22870196 ttgatatctcttt-gtaaagaaactcatcattatagtggaacggagagcttctctctctcccag--taggtcagtattggaccgaactgggtgaacaaat 22870100  T
Q  366 attcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactat-ttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattact 464  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||| || ||   | ||| |||| ||||  |||||||||||||   ||  ||| ||||||||||||||||||||  | |    
T  22870099 attcgtgtgtgatctctctctctctttctctcgttgttttctatctttttcttgtgtttataaccgtcacccacattgttttggttgcttgatta--att 22870002  T
Q  465 tgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    | ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22870001 ttctcaacacatcaagtattttattggtgtgatttttaacgaatt 22869957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754708
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| |||||||||  ||||||| | ||||||  |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaacccattgatttctc 29754794  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  29754793 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 29754708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447579
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 32447579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311440
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc 33311354  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  33311355 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 33311440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 308
Target Start/End: Original strand, 3833460 - 3833536
Alignment:
Q  233 tagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtt-actcatcattatagtggaa 308  Q
    |||||||| ||||| | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3833460 tagaattatgtttgaaaattgattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttaactcatcattatagtggaa 3833536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 436 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 6610440 - 6610376
Alignment:
Q  436 cactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttca 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6610440 cactttgttttggttgcttgattatt--ttgctccacacattaagtattttattggtgtgattttca 6610376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 86
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584156
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggga 86  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggga 10584156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 445 - 507
Target Start/End: Original strand, 22611069 - 22611129
Alignment:
Q  445 ttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaa 507  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22611069 ttggttgcttgattatt--ttgctccacacatcaagtattttattggtgtgattttcatcgaa 22611129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3577620 - 3577489
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctcttccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||    
T  3577620 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccca 3577525  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  3577524 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 3577489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 25466509 - 25466432
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  25466509 gatacttttactataaatatagatcttttgtcagagtaaaccttgaggtagagag-gctgaaaacaagggtttagaaac 25466432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 302
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138562
Alignment:
Q  166 ttgatttaccttgg-gaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 263  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaattatgtttgaagactaattattgtaa 11138522  T
Q  264 cccatt--gatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||  ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11138523 cctcttttgatatctcttt-gtaaagttactcgtcattata 11138562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 92
Target Start/End: Original strand, 15366992 - 15367079
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga-------gtaaaccttgagatagagggagctgaa 92  Q
    |||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15366992 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagacatcggtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 15367079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29754636 - 29754556
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  29754636 ttccatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 29754556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 30034544 - 30034454
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  30034544 ttgtatttataactttcatacactttgttt-ggttgcttgattatc-cttgctccatacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 30034454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 500
Target Start/End: Original strand, 18322482 - 18322549
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  18322482 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 18322549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 30967587 - 30967666
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  30967587 ttccatgcactttgttttggttacttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcaacgaatt 30967666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 4816606 - 4816532
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  4816606 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagag 4816532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 93
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490676
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa 22490676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1230173 - 1230097
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  1230173 catacactttattttggttgcttgattatctcttgatccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttatcgaatt 1230097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233994
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctg-aaacaaggatttagaaa 3233994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7542512 - 7542452
Alignment:
Q  233 tagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 294  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7542512 tagaattaggtttgaagactaatttttgtaaccctttgatatctc-tttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466384
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttg-aaacaagagtttagaaa 14466384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26066048 - 26065968
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  26066048 ttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 26065968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26068322 - 26068242
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  26068322 ttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 26068242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 30034967 - 30034866
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gagatagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30034967 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagct-aaaacaagggtttag 30034869  T
Q  106 aaa 108  Q
    |||    
T  30034868 aaa 30034866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 33309242 - 33309322
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  33309242 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 33309322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 33311511 - 33311591
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  33311511 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 33311591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12195455 - 12195361
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  12195455 ttgtatttataactttcatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 12195361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20915719 - 20915664
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20915719 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag 20915664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14459028
Alignment:
Q  42 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaataagggtttagaaa 14459028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 26066389 - 26066319
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagat 79  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||    
T  26066389 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26066319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 26068660 - 26068590
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagat 79  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||    
T  26068660 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26068590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26455186 - 26455128
Alignment:
Q  335 ggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  26455186 ggtcagtattggactgaactggataaacaaatttcatgtgttctctctttctttttctc 26455128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 432 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5273141 - 5273073
Alignment:
Q  432 catacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  5273141 catacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 5273073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 19704493 - 19704422
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg--ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt 499  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  19704493 ttccatacactttgatttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattt 19704422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 28038065 - 28038012
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatca 63  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28038065 atttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatca 28038012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5165982 - 5165866
Alignment:
Q  195 tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc- 293  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||  ||||     
T  5165982 tgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttgg-gtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccc-tgaatatctc-tttgtaaagaaactca 5165886  T
Q  294 -atcattatagtggaatgga 312  Q
     |||||||||||||||||||    
T  5165885 tatcattatagtggaatgga 5165866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Original strand, 6843306 - 6843391
Alignment:
Q  222 gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat-cattatagtggaa 308  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6843306 gagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaaccctttgaaa--tcctttgtaaagttactcataaattatagtggaa 6843391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17904479 - 17904402
Alignment:
Q  233 tagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatgga 312  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17904479 tagaattaggtttaaacactgattcttgtaaccctttggaatct--tttgtaaagttactcaaaattatagtggaatgga 17904402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20915281 - 20915214
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  20915281 catacactttgttttggttgcttgattaccccttgccccacacatcaagt-tattattggtgtgatttt 20915214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 35201457 - 35201295
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat-cattatagtggaatggatgactgctctcttccca- 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||   |||||||| | ||||  ||| || ||||||||||||  |||   ||||||||| ||||     
T  35201457 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctcttt-gaaaagaaactaattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaa 35201362  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgct 396  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  35201361 gactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctctctctctctctctcgct 35201295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1230586 - 1230512
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| | | || ||||||| |||||||||    
T  1230586 tactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttg-aaacaagggtttagaaa 1230512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8717268 - 8717202
Alignment:
Q  443 ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  8717268 ttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 8717202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 355
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584301
Alignment:
Q  281 tgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactg 355  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtca-atttggaccgaactg 10584301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870706
Alignment:
Q  42 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagaggg 13870706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25466030 - 25465898
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||  |||    
T  25466030 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 25465935  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||| ||   || ||||||||||| ||||||||    
T  25465934 agactaggccatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25465898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 25941720 - 25941852
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||  |||    
T  25941720 gtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 25941815  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  25941816 agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25941852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 3394748 - 3394830
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgtttt-ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   || || ||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3394748 ttccatacactttgtttttggttgcttgattatccatttctccacacatcaagatttttattggtgtgttttctcatcgaatt 3394830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22351988 - 22351877
Alignment:
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22351988 tttgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctct 22351893  T
Q  325 -tcccagactaggtca 339  Q
      ||||||||||||||    
T  22351892 cccccagactaggtca 22351877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 2629250 - 2629177
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||| ||||    
T  2629250 atttgttccaaatttattagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagag 2629177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 500
Target Start/End: Original strand, 3918767 - 3918825
Alignment:
Q  440 ttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||    
T  3918767 ttgttttggttgcttgattaat--ttgctccacaaattaagtattttattggtgtgatttt 3918825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 500
Target Start/End: Original strand, 7294035 - 7294243
Alignment:
Q  290 actcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 388  Q
    |||||||||||||||||||  ||    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||| |    
T  7294035 actcatcattatagtggaacagagagttgctctctcccccagagtaggtcagtattggaccaaactggataaacaaatttt-tgtgtgttatctttctct 7294133  T
Q  389 ctctcgctgtctttttactat-ttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtatttta 487  Q
    || || |  |  || | |||| ||||| |||  ||||||||| |||  ||| |||||||| || |||||||| |  || || ||||||||| ||||||||    
T  7294134 ctttctcctttgttgttctatcttttgcttga-tttataactgccactcacgttgttttgattccttgattaat--tttctccacacatcaagtatttta 7294230  T
Q  488 ttggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||    
T  7294231 ttggtgtgatttt 7294243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 13878778 - 13878909
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   |||||||||  ||||    
T  13878778 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 13878873  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  13878874 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 13878909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 16785970 - 16786101
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   |||||||||  ||||    
T  16785970 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 16786065  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  16786066 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 16786101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22342937 - 22342800
Alignment:
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||   |||||||||    
T  22342937 tttgggtagtattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctct 22342842  T
Q  325 tccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  22342841 cccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 22342800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26887355 - 26887226
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctcttcccag 330  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   ||||||||  |||||    
T  26887355 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctc-ccccag 26887261  T
Q  331 actaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  26887260 actaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 26887226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 365
Target Start/End: Original strand, 30443532 - 30443604
Alignment:
Q  294 atcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||||| || |||   ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30443532 atcattatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaa 30443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 152)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 500
Target Start/End: Original strand, 7188469 - 7188961
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  7188469 gagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 7188567  T
Q  107 aacaaacaataaac-tagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtct 201  Q
    |   |||||||||  ||||||||   ||| | || ||||  |    | |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  7188568 agtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 7188667  T
Q  202 tttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
     ||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7188668 cttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcg-ggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattat 7188766  T
Q  302 agtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt-ctctcgctgtc 399  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| || | ||||  ||||||||||| ||||||||||     
T  7188767 agtggaacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaattttgcgtgt--tctctttcttttctctcgctgtt 7188864  T
Q  400 tttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt 499  Q
    ||    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7188865 tt----ctacttttgcttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattgatgtgattt 7188960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27306590 - 27306083
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  27306590 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 27306492  T
Q  109 --caaacaataaactagggttttagagattt---ctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtc 200  Q
      |||  |  |||||||||||||| ||| ||   ||||  |    | | |||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27306491 ggcaacaacaaaactagggttttatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 27306392  T
Q  201 ttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 300  Q
    | ||||||||| ||||||   | ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27306391 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcg-ggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-ta 27306294  T
Q  301 tagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtc 399  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||| | ||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||     
T  27306293 tagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaac-aaattcttgtgttctctcttcttttctctcgctgtt 27306196  T
Q  400 tttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgat 497  Q
     ||||  | |||| | ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| || | |||||||||||||    
T  27306195 gttttcttcttttggcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgttccacacatcaagtttgttattggtgtgat 27306096  T
Q  498 -tttcatcgaatt 509  Q
     | ||||||||||    
T  27306095 ctctcatcgaatt 27306083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817210
Alignment:
Q  37 tttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaata-aactagggttt---tag 131  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||   ||||| | |||||||||||   |||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagaggg-gctgaaa-caagggtttagaagtcaacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  132 agatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttg 230  Q
    || || ||||  |    | |||||||||||| |||||||| ||||||| || || | ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  24817584 agtttgctctttgcaacaaacactagggttg-ggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttg 24817486  T
Q  231 tgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
     |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||    
T  24817485 ggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccca 24817387  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataac 428  Q
     |||||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||| || |||||| ||||||||| ||    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24817386 tactaggtcagttttggaccgaacttggtaaacgagtttcgtgtgttctgtctttcttttctctcgttg----ttttctaattttgtttgtgtttataac 24817291  T
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |   |  ||| ||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24817290 tgtta-ccacgttgatattgttttcttgattattacttgctccacacattaagtattttattggtgtgattttcattgaatt 24817210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 31435404 - 31434909
Alignment:
Q  13 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--ca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||| |||||||||  ||    
T  31435404 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaaggca 31435306  T
Q  111 aacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttt 203  Q
    |  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | || ||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  31435305 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 31435206  T
Q  204 tggttacgcgaagaga-tggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    |||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435205 tggttacgggaagaggctgga-actttgggtagaattaggtg-gaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 31435108  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtct 400  Q
    |||||| ||| | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||| ||| |    
T  31435107 gtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtca-atttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgttgt-t 31435010  T
Q  401 ttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatt 498  Q
    || |||  |||| | ||||||||||||   |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  31435009 ttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccttacactttattttgattgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatt 31434912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 151 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24813710 - 24813357
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||   ||||    
T  24813710 acactagggttg-ggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtctcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcg-ggag 24813613  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggac 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  24813612 acttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattatagtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggac 24813513  T
Q  349 cgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttg-tttt 446  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||| ||    ||| ||| |||||||| ||||||||| ||     ||| ||| | ||    
T  24813512 cgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctcttccttttctctcgttg----ttttctacttttgtttatgtttataa-ttgttaccacgttgatatt 24813418  T
Q  447 ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaa 507  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24813417 ggttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattgatgtgattttcatcgaa 24813357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27832832 - 27832495
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  27832832 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcg-ggagacttattcttgta 27832734  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||  |||||||||||||| |||      ||||||| ||||    
T  27832733 acccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaattt------gaactgggtaaa 27832640  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattatt 461  Q
    | |||||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27832639 c-aaattcttgtgttatctctttctttctctcactgt-tttctac--ttttggtttgtgattataacttccatacactttgttttggttacttgattatt 27832544  T
Q  462 acttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
     | |||| ||||||| | || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  27832543 tcctgctccacacattaagtttgttattggtatgatttttcatcgaatt 27832495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 501
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24749018
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---t 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||   |    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtat 24748646  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| || |||||||| | ||    
T  24748647 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattggga 24748746  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||     
T  24748747 ctttgggtagaattaggca-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctc 24748845  T
Q  326 c-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||||||||  | |||||| | |  ||||| |||||||| ||||||||| ||    ||| ||| ||||||||||| ||    
T  24748846 ctccagattaggtca-atttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctctttatttctctcgttg----ttttctacttttgtttgtgatt 24748940  T
Q  424 ataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||    
T  24748941 ataacttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttc 24749018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 382
Target Start/End: Original strand, 6332176 - 6332529
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt-t 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||| |    
T  6332176 gatacttttactataaatataaaacttgtatcagagtaa-ccttgagagagagggggctggaaacaagggtttataaacatacaacagactagggtttat 6332274  T
Q  130 agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactt 228  Q
    |||| || ||||  |    | |||||||| ||| | |||||| |  |||| ||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||| |||||||    
T  6332275 agagtttactcttggcaacaaacactaggattgagattgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactt 6332374  T
Q  229 tgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc 328  Q
    |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  6332375 taggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccc 6332474  T
Q  329 -agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct 382  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  6332475 tagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 6332529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 495
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44725000
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 44724631  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||    
T  44724632 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctggga 44724731  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||     
T  44724732 ctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 44724829  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||| ||| ||| |||  |||| | ||||||||    
T  44724830 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcatttctctcgttgt-tttctac--ttttggcttgtgttt 44724925  T
Q  424 ataa---cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
    ||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  44724926 ataatatgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 44725000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 20626128 - 20626474
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20626128 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggat-ggagacttattcttgta 20626226  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  20626227 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 20626324  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctc-tttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgatt 458  Q
    |||| | |  ||||| ||||| | | ||||||||||||| | ||| ||| |||| | || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20626325 caaattcttttgtgttctctcatctttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttatatttataacttccatacactttattttggttgcttgatt 20626423  T
Q  459 attacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  20626424 atctcttgctccacacatcaggt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 20626474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 20630019 - 20630365
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20630019 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggat-ggagacttattcttgta 20630117  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  20630118 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 20630215  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctc-tttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgatt 458  Q
    |||| | |  ||||| ||||| | | ||||||||||||| | ||| ||| |||| | || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20630216 caaattcttttgtgttctctcatctttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttatatttataacttccatacactttattttggttgcttgatt 20630314  T
Q  459 attacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  20630315 atctcttgctccacacatcaggt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 20630365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 20642438 - 20642784
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20642438 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggat-ggagacttattcttgta 20642536  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  20642537 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 20642634  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctc-tttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgatt 458  Q
    |||| | |  ||||| ||||| | | ||||||||||||| | ||| ||| |||| | || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20642635 caaattcttttgtgttctctcatctttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttatatttataacttccatacactttattttggttgcttgatt 20642733  T
Q  459 attacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  20642734 atctcttgctccacacatcaggt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 20642784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 247 - 500
Target Start/End: Original strand, 26295620 - 26295868
Alignment:
Q  247 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||||  ||||    
T  26295620 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcctccagactaggtca-atttg 26295718  T
Q  346 gaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttt 445  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||| ||| |||  |||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26295719 gactgaactggataaac-aaattcttgtgttatctctttctttctttcgttgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattttcatacactttgttt 26295814  T
Q  446 tggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    || |||||||||||| || |||| || |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26295815 tgattgcttgattatcacgtgctccatacatcaagta-tttattggtgtgatttt 26295868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 42331337 - 42330853
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||  |  |||||| |||||     
T  42331337 atacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttg 42331239  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcg--aagagat 220  Q
      ||||| || ||||| ||    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  42331238 tatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagat 42331139  T
Q  221 ggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgct 320  Q
     ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| | ||  |    
T  42331138 tgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatta-tatagtgaaacggagggctatt 42331041  T
Q  321 ctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgt 419  Q
    ||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||||| | | ||||||||||| ||| |||  |||| | ||||    
T  42331040 ctctcccccagattaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctctctttctctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgt 42330946  T
Q  420 gtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42330945 gtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaagtttattattggcgtgatttctcatcgaatt 42330853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 20137467 - 20137074
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--c 109  Q
    |||||||||| || | || ||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |    
T  20137467 tttgttccaatttatgagggattcttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggc 20137369  T
Q  110 aaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctt 202  Q
    ||  |  ||||||| ||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||     
T  20137368 aacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctc 20137269  T
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137268 ttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 20137170  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 398  Q
    ||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  20137169 gtgaaacggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt 20137074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13099814 - 13099324
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||   |||  |  ||||||||||||     
T  13099814 atacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttg-aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 13099716  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || |||||  |    | ||||||| |||    |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  13099715 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattg 13099616  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctc 321  Q
     | ||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||    
T  13099615 gggctttgggtagaattagg-cgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctc 13099517  T
Q  322 tct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttacta-tttttgttt 417  Q
    |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||    
T  13099516 tctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttccttttctctcgctgt-tgttttctacttttggctt 13099419  T
Q  418 gtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  13099418 gtgtttataattgttccatacactttgttttggttgtttgacgatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 13099324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 44492 - 44854
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  44492 agatttgtaccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 44590  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||| ||    |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  44591 ggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagt 44690  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    |||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  44691 cttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 44788  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  44789 atagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 44854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 509
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465968
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt---tag 131  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||      ||||||||||   |||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaatcaa------actagggtttgtatag 24465595  T
Q  132 agatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttg 230  Q
     | || ||||  |    | ||||||||||||   |||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| | | |||||||| | |||||||    
T  24465596 cgtttgctcttggcaacaaacactagggttgaa-ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttg 24465694  T
Q  231 tgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-a 329  Q
     ||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||| ||| |    
T  24465695 ggtagaattaggtg-ggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaagt-actcatcattataatgaaacgggtgactgctctctccccca 24465792  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt-ctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataac 428  Q
    |||||| ||| | | | |||||||||  |||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||| ||||||| |||||||    
T  24465793 gactagatcaatat-gaaccgaactgagtaaacaaatttcgtgtt--ctctctttcttttctctcgctgt-tttctact--tttggtttgtgattataac 24465886  T
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  24465887 ttccatacactttgttttggttgcttgaatatcacttgttccacacatcaaatttattattggtgtgatttttcatcgaatt 24465968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 35557 - 35919
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  35557 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggttcagaaa 35655  T
Q  109 ca-aacaataaa-ctagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
     | ||||| ||| |||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  35656 gacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagt 35755  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  35756 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 35853  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| |||   ||||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  35854 atagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtca-atttggaccgaactggatcaacaaa 35919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20091903 - 20091610
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |    
T  20091903 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga 20091804  T
Q  108 acaaacaataaactagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatgag-tcttt 203  Q
       ||||  ||||||||||||   ||||| || || |  |    | | | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  ||| |    
T  20091803 ggcaacacaaaactagggtttgtatagagtttgctattggcaacaaagattagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctct 20091704  T
Q  204 tggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091703 tggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 20091610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 507
Target Start/End: Original strand, 9679151 - 9679495
Alignment:
Q  166 ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 264  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  9679151 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaac 9679249  T
Q  265 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc-ttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaaca 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||| | ||||    
T  9679250 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtca-atttggaccagactgggtcaaca 9679347  T
Q  364 aaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgatt 458  Q
    || | |  |||||  |||||| ||||||||  ||  || ||| ||| |||||  ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9679348 aattcttttgtgttatctcttcctttctct--ctcgctgttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgatt 9679445  T
Q  459 attacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaa 507  Q
    || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||    
T  9679446 atcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaa 9679495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 496
Target Start/End: Original strand, 443546 - 444021
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||   |||  |  ||||||||||||     
T  443546 atacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagct-aaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 443644  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |    
T  443645 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattg 443744  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
     ||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || | | | |||||||    
T  443745 ggactttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctct 443842  T
Q  323 ct--tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttg 418  Q
    ||   ||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| ||  || ||| ||| |||| | |||    
T  443843 ctcccccccgactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctctcgctgttttctacttttggcttg 443941  T
Q  419 tgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
    || ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  443942 tgattataattgttcaatacactttgttttggttgcttgactattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtga 444021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4295788
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacatt-gtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt--- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||  |  ||||||||||||       
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 4296173  T
Q  129 tagagatt-tctctaagaggg-agacactagggttg--tggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgga 223  Q
    ||||| || |||||  |     | |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |     
T  4296172 tagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 4296073  T
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  || | ||||| ||    
T  4296072 gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctatc 4295975  T
Q  324 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgt 421  Q
    |  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||  | ||| |||  |||| | ||||||    
T  4295974 tcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgccat-tttctac--ttttggcttgtgt 4295879  T
Q  422 ttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4295878 ttattattgttctatacactttgttttggttgcttgatgattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 4295788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 246 - 473
Target Start/End: Original strand, 22393894 - 22394119
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagtttt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  || ||||| ||| |||||||||||  |||    
T  22393894 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctcccctagactaggtca-attt 22393992  T
Q  345 ggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgt 443  Q
    ||||| |||||| |||||||| | |  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22393993 ggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctcgttgt-tttctac--ttttggtttgtgattataacttccatacactttgt 22394089  T
Q  444 tttggttgcttgattattacttgcttcaca 473  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  22394090 tttggttgtttgactatcacttgctccaca 22394119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1049656 - 1049295
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1049656 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 1049558  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  1049557 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagt 1049458  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |    
T  1049457 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-t 1049361  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  1049360 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 1049295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 40281643 - 40281358
Alignment:
Q  101 tttagaaacaaacaataaactagggtttt---agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-g 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  40281643 tttagaaacaaacaacaaactagggtttagagagatatttctctaagcgggagacactagggttgggattaattcaccttgggaaacaccgttaggattg 40281544  T
Q  197 agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc 296  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||    
T  40281543 agtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttga-------tttgtaaagttactcatc 40281451  T
Q  297 attatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 388  Q
     || | |||||| | | |  ||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  40281450 gttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactagttcagtattggacagaactgtgtaaacaaattttgtgtgttctctctttcttt 40281358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16296932
Alignment:
Q  166 ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 264  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  265 cc-attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    ||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||  |||||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  363 aaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgatt 458  Q
    ||| |||  ||||| ||||| ||||||||||   ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  16297022 aaatttc-cgtgtgttctctctctttctctc---gtcgtttt-ctacttttgcttgtgtttataattgtcagccactttgttttggttgcttgatt 16296932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678499
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaat--aaactagggttt---t 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||   |  ||  ||||||||||||   |    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtat 21678118  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| || | ||    
T  21678119 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattggga 21678218  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||  |  | |||||||||     
T  21678219 ctttgggtagcattaggcg-ggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcat-atagtgaaacagtgggctgctctctc 21678316  T
Q  326 ccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttta 424  Q
    ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||   |||||| ||| ||||| |||||||  |||||| |||||| ||| ||||  ||| | |||||||||    
T  21678317 ccctagactaggttaattt-ggaccgaactgggacaacaaa-ttcttgtgttctctcttcttttctcccgctgt-tttctact--tttggcttgtgttta 21678411  T
Q  425 taact--tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| || | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  21678412 taattgttccttacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacaaatcaagtttgttatcggtgtgatttttcatcgaatt 21678499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 500
Target Start/End: Original strand, 11355189 - 11355687
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--c 109  Q
    |||||||||| || | || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |    
T  11355189 tttgttccaatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggc 11355287  T
Q  110 aaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctt 202  Q
    ||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  11355288 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 11355387  T
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||    
T  11355388 ttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatca-tata 11355485  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctgtct 400  Q
    ||||||  ||   ||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | | || ||||| ||  ||||||| ||   |    
T  11355486 gtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttatgttctctcttacttctctctcttgtt 11355583  T
Q  401 ttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
     ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  | | ||||||||||||    
T  11355584 gttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgtttttggttgcctgattattccttgctccacacatcaaatttattattggtgtga 11355683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39145856
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---t 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| | | ||||| ||| |||||||||   |    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaa-caagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtat 39146224  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |  |    
T  39146223 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaa 39146124  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  | ||||||| ||    
T  39146123 ctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctctttt 39146025  T
Q  326 ccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttt-tactatttttgtttgtgtt 422  Q
    ||| | |||||||||  |||| |||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| |  | |||| |||  |||| |||||||||    
T  39146024 ccctaaactaggtca-atttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgttgttttctac--ttttggtttgtgtt 39145928  T
Q  423 tataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggt 492  Q
    |||||   ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||||    
T  39145927 tataattgtttaatacaatttgttttggttgcttgattatcacttactccacacatcaagtttgttattggt 39145856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 398
Target Start/End: Original strand, 11081517 - 11081835
Alignment:
Q  87 gctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaa-ctagggttt-tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaac 184  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||  |    | |||||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  11081517 gctgaaaacaagggtttagaagccaacaacaaaactagggtttgtagagaattctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcactttgggaaac 11081616  T
Q  185 actgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt--gatatctctttt 281  Q
    ||| ||||||| |||||| ||| | ||| ||||||||   || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |    
T  11081617 actattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttgt 11081716  T
Q  282 gtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctct 380  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  11081717 gtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctct 11081816  T
Q  381 ctttcttt-ctctcgctgt 398  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  11081817 ctttttttcctctcgctgt 11081835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 308
Target Start/End: Original strand, 25276231 - 25276375
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25276231 ggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 25276329  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276330 aaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 25276375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 37412326 - 37411988
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||  | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  37412326 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 37412228  T
Q  263 acccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| |    
T  37412227 actcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtca-atttggaccgaactggatca 37412129  T
Q  361 acaaaat-tcgtgtgtgc-----tctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    | ||| | |  ||||| |     ||||||  ||||||||| ||| ||| ||   |||| | ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  37412128 ataaattcttttgtgttctcccttctcttcttttctctcgttgt-tttcta--gttttggcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgc 37412032  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||| || | ||||||||||||    
T  37412031 ttgattattccttgttccacacatcaagtttgttattggtgtga 37411988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 3878499 - 3878867
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaat----atagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggagctgaaaacaagagtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| |||| |||    
T  3878499 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaa-caagggtt 3878597  T
Q  103 tagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttagga 194  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||||   ||||| || |||||  |    | || |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  3878598 tagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattagga 3878697  T
Q  195 t-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc 293  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3878698 ttgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactc 3878796  T
Q  294 atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||||| | ||||||    
T  3878797 atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgtta-atttggaccgaactgggtcaacaaa 3878867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 492
Target Start/End: Original strand, 21990240 - 21990570
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  21990240 ggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcg-ggagactttttcttgta 21990338  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  21990339 actcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 21990436  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttga 456  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| ||||||||  ||  || ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21990437 caaattcttttgtgttctctcttcctttctct--ctcgctgtttgctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctga 21990534  T
Q  457 ttattacttgcttcacacatcaggtattttattggt 492  Q
    ||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  21990535 ttatcccttgctccacacatcaagtttattattggt 21990570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40837103 - 40836742
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  40837103 agatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaag-aagggtttagaaa 40837005  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40837004 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 40836905  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |    
T  40836904 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-t 40836808  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  40836807 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 40836742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 495
Target Start/End: Original strand, 9680910 - 9681243
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||    
T  9680910 ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgta 9681008  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| | | ||    
T  9681009 actcattgatatatcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggatcgaactaggtcaa 9681106  T
Q  362 caaa-attcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttt-tactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttga 456  Q
     |||  ||  ||||| ||||||| ||||||||| |  |||||| |||  |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||  | |    
T  9681107 taaatttttttgtgttctctcttcctttctctctcgatcttttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgtctaa 9681204  T
Q  457 ttattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
    |||| ||||| | ||||||||| || | |||||||||||    
T  9681205 ttatcacttgttccacacatcaagtttgttattggtgtg 9681243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680465
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 21680079  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||| | ||    
T  21680080 agagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattggga 21680179  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| ||||||||||    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||   |||||||||     
T  21680180 ctttgggtagaattagacg-ggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagagctgctctctc 21680277  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaa---ctggataaacaaa-attcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtg 420  Q
     |||||||||||| |  |||||||||||   |||| | |||||| | |  | ||| |||||||  ||||||||| ||| ||| |||  |||| | |||||    
T  21680278 ccccagactaggtga-atttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttctctcttcttttctctcgttgt-tttctac--ttttggcttgtg 21680373  T
Q  421 tttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgt-gattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||| | |||||||||||||    
T  21680374 tttataattgttccatacactttgtttttgttgcatgattattccttgcttcacacatcaagcttgttattggtgtgggttttcatcgaatt 21680465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7092411 - 7092212
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  7092411 ggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 7092313  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  7092312 acccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 7092215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Original strand, 20297452 - 20297643
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  20297452 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtg-ggagacttattcttgta 20297550  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactgg 356  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20297551 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgg 20297643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 21592342 - 21592028
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatg-agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| || |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21592342 ggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtg-ggagacttattcttgta 21592244  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  21592243 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 21592146  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctct-ttctt---tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttg 455  Q
    | |||||| | |||| ||||| |||||   ||||||||||| ||| |||  |||| | ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||  ||    
T  21592145 c-aaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacacttt-ttttggttgtctg 21592051  T
Q  456 attattacttgcttcacacatca 478  Q
    ||||| ||||||| |||||||||    
T  21592050 attatcacttgctccacacatca 21592028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31156271 - 31155910
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa- 108  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||     
T  31156271 atttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaag 31156173  T
Q  109 -caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagt 199  Q
     |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | | |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  31156172 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 31156073  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || |||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||  |    
T  31156072 ctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc-ct 31155976  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  31155975 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 31155910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 48457743 - 48458093
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  48457743 ggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 48457841  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  48457842 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 48457939  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    | |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||| || | ||| ||| |||||  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  48457940 c-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctacttttgacttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgc 48458037  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  48458038 ttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 48458093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22828972 - 22828691
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||  |  |||||| |||||    
T  22828972 gatacttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 22828874  T
Q  129 ---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttg--tggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatg 221  Q
       ||||| || |||||   |   | ||||||| |||   ||||||||| |  || | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||     
T  22828873 gtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagatt 22828774  T
Q  222 gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 305  Q
    ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22828773 gagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtg 22828691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 38394076 - 38394276
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  38394076 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 38394174  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  38394175 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 38394272  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  38394273 caaa 38394276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 224 - 365
Target Start/End: Original strand, 6046644 - 6046785
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  6046644 gactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctc 6046742  T
Q  324 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  6046743 tcccccagactaggtcagtattggaccgaattggatagacaaa 6046785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7471979
Alignment:
Q  37 tttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-- 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    ||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||      
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 7472219  T
Q  129 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagaga-tgg 222  Q
     |||||||| |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  7472218 atagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 7472119  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
    | |||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  7472118 a-actttgggtagaattaggcg-ggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctct 7472022  T
Q  323 ct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  7472021 ctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 7471979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7470021
Alignment:
Q  37 tttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-- 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    ||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||      
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 7470261  T
Q  129 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgga 223  Q
     |||||||| |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   ||    
T  7470260 atagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 7470161  T
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||| |    
T  7470160 gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctccc 7470063  T
Q  324 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  7470062 tcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 7470021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 20299550 - 20299750
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  20299550 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 20299648  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |  ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  20299649 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 20299746  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  20299747 caaa 20299750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 203 - 496
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349215
Alignment:
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattaca 6349010  T
Q  303 gtggaatgga----tgac---------------tgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctt 383  Q
    |||||| |||    | ||               |||||||| |||| ||||||| ||| || || |||||||| |||||||| ||| |||   |||||||    
T  6349011 gtggaacggaatcattacagtggaacggagagttgctctctcccca-actaggttagtattagatcgaactgggtaaacaaatttcctgtt--ctctctt 6349107  T
Q  384 tctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtat 483  Q
    ||||||||||||| | ||    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||     
T  6349108 tctttctctcgctatttt----ctacttttgcttgtgtttataacttccgtacactttgttttggttgcttgattattacttgctccatacgtcaagta- 6349202  T
Q  484 tttattggtgtga 496  Q
    |||||||||||||    
T  6349203 tttattggtgtga 6349215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 382
Target Start/End: Original strand, 24258553 - 24258774
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||   | | |||||||||||||    
T  24258553 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcg-gaaaacttattcttgta 24258651  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatc---attatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| | |||    
T  24258652 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtca-atttggaccgaattagat 24258750  T
Q  359 aaacaaaattcgtgtgtgctctct 382  Q
     |||||||||| | |||| |||||    
T  24258751 gaacaaaattcttttgtgttctct 24258774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7349639 - 7349296
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------gagatagagggagctgaaaacaagagttt 103  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||      ||||||||||| |||| ||||| | ||||    
T  7349639 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctg-aaacaggggttt 7349541  T
Q  104 agaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat 195  Q
    |||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7349540 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 7349441  T
Q  196 --gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc 293  Q
      |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||    
T  7349440 tggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactc 7349343  T
Q  294 atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcag 340  Q
    |||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||    
T  7349342 atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 7349296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 3035811 - 3036014
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaaga-gatg--gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattctt 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |  | ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3035811 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtg-ggagacttattctt 3035909  T
Q  260 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggat 358  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  3035910 gtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggt 3036007  T
Q  359 aaacaaa 365  Q
     ||||||    
T  3036008 caacaaa 3036014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 18345631 - 18345831
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18345631 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 18345729  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||| | ||    
T  18345730 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtca-atttggaccgagctgggtcaa 18345827  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  18345828 caaa 18345831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7351851 - 7351509
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  7351851 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 7351753  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  7351752 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcag-attggaccgaactgggtca 7351656  T
Q  361 acaaaattc-gtgtgtgc-tctctttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttg 451  Q
    ||||| |||  ||||| | |||  ||||||       |||||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7351655 acaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttg 7351557  T
Q  452 cttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||| |||||  ||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  7351556 cttaattatcccttactccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 7351509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 307
Target Start/End: Original strand, 11757320 - 11757462
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11757320 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 11757418  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 307  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11757419 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 11757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Original strand, 22392401 - 22392485
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22392401 agatttgttccaaattgtaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaa 22392485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 25542459 - 25542818
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  25542459 agatttattccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggg-gctg-aaacaaaggtttagaaa 25542556  T
Q  109 -caaacaa-taaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
       |||||  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  25542557 ggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaagactattaggattgagt 25542655  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||  |||||||  | ||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  25542656 ctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 25542752  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  |||   ||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||    
T  25542753 atagtggatcggagagctgctctctcccctagactaggtta-atttggaccgaactgggtcaacaaa 25542818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1047123 - 1046924
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  1047123 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 1047025  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  1047024 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 1046928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 28487643 - 28487843
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  28487643 ggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 28487741  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |   || |  ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  28487742 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactggatcaa 28487839  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  28487840 caaa 28487843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7094659 - 7094468
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  7094659 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 7094561  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactgg 356  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  7094560 acccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggactgaactgg 7094468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 326 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20091193 - 20091036
Alignment:
Q  326 cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttat 425  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| |  | ||||  ||| ||||  ||||| ||||    
T  20091193 cccagactaggtcagtattggaccgaactggataaa-taaattcgtgtgttctctctttctttttctctcgttgtttt--ctacttttacttgtg-ttat 20091098  T
Q  426 aacttccatacactttgt-tttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtatttt 486  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  20091097 aacttccatacactttgtatctggttgcttgattattacttgctcaacacatcaagtatttt 20091036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22251893 - 22251602
Alignment:
Q  19 caaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaat 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||  |      
T  22251893 caaattttaagcgacacttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctg-aaacaagagtttagaaaggcaacaaca 22251795  T
Q  117 aaactagggttt-tagaga-tttctctaagagg--gagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggtta 209  Q
    ||||||| |||| || ||| ||| ||||   ||   | |||||||||||    |||||||| |||||||||        |||||| |||||| |||||||    
T  22251794 aaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggtta 22251703  T
Q  210 cgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 305  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251702 cgggaagagattgaggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 22251604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 232 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13290605 - 13290445
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cag 330  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||   || | |||| || |||    
T  13290605 gtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagcggaacagagagctacactctccctcag 13290507  T
Q  331 actaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctct 392  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13290506 acttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttccttctct 13290445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43253716 - 43253365
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||  |||||   |||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  43253716 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcg-ggagacttattcttgta 43253618  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||   || | ||||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||    
T  43253617 actcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaa 43253520  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
      |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||||||  |||| ||| |||||  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  43253519 -taaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgctgttgtttttctacttttgacttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgc 43253421  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  43253420 ttgattatctcttgctccacacatcaaat-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 43253365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 1850071 - 1850271
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||| ||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  1850071 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 1850169  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  1850170 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 1850267  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  1850268 caaa 1850271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 509
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935709
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc 2935472  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaatt-cgtgtgt 375  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| || | |||||    
T  2935473 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgt 2935569  T
Q  376 gc-tctctttcttt-----ctctcgctgt--ctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgc 467  Q
     | |||  ||||||      |||||| ||   ||| |||| |||| | |||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  2935570 tcttcttcttcttttgttcttctcgccgttgttttctact-ttttggcttgtatttaattgttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgc 2935668  T
Q  468 ttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  2935669 ttcacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 2935709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 18567545 - 18567639
Alignment:
Q  13 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||    
T  18567545 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctg-aaacaagggtttagaaa 18567639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 38396725 - 38396924
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  38396725 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgta 38396823  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||  ||| | || |||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  38396824 acccattgatttctc-tttgtaactttactcatca-tatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 38396920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 40946418 - 40946770
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  40946418 ggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 40946516  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  | | | ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  40946517 acctattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaattt-ggaccgaactgggtcaa 40946614  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctc--tttctttct------ctcgctgtcttttta-ctatttttgt-ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttg 451  Q
    |||| ||| | |||| |||   ||||||| |      ||||| || |||||  |||||||||  |||| ||||    || ||||||||||||||||||||    
T  40946615 caaa-ttcttttgtgttcttcttttctttgtgttcttctcgccgtttttttttctatttttggcttgtatttaattgtttcatacactttgttttggttg 40946713  T
Q  452 cttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  40946714 cttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattgatgtgattctcatcgaatt 40946770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30906389 - 30906292
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  30906389 gatacttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaacaaataacaaactagagttt 30906292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Original strand, 42223248 - 42223583
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagat-ggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||||   | | |||||||||||     
T  42223248 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag-ctttggatagaattaggcg-gaaaacttattcttga 42223345  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | |||||||| | |    
T  42223346 aacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaattttg-atcgaactgggtca 42223443  T
Q  361 acaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    ||||| | |  ||| | |||||||  ||||||||  ||| ||| ||||  |||   |||||||||||| |  |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  42223444 acaaattcttttgttttctctcttcttttctctcattgt-tttctact--tttgccttgtgtttataattgttttatacactttattttggttgcttgat 42223540  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||  ||| || ||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  42223541 tatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgttttt 42223583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027041
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc 9027279  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattc-gtgtgt 375  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||  |||||    
T  9027278 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctatgtgt 9027182  T
Q  376 gctctctt--------tctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttg 466  Q
     || ||||        | ||  ||| || || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9027181 tct-tcttattaattatgttcttctagccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttg 9027084  T
Q  467 cttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    || ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  9027083 ctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 9027041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 26804501 - 26804595
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  26804501 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgt----gagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 26804595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 6048946 - 6049303
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttgga 248  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||  |||||||| ||||||| || ||| ||||| ||| ||||| || |||||||||  |||||||||||||| |    
T  6048946 acactaggtttgggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaa 6049045  T
Q  249 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat--tatagtggaatggatgactgctc-tcttcccagactaggtcagttttg 345  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    ||||| ||  |||| ||||| |||||  ||    
T  6049046 gacgtattcttataaccctttgatatc-cctttgtaaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccatactagctcagtaatg 6049144  T
Q  346 gaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttg-tt 444  Q
    ||||||||| | || ||||| | ||||||| |||||| | |||||||||    || ||| ||| ||||| || ||||||||| |   |  ||| ||| |     
T  6049145 gaccgaactaggtagacaaattccgtgtgttctctctctttttctctcg----ctattttctaattttgcttatgtttataattgttacccacgttgata 6049240  T
Q  445 ttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||  | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6049241 ttggttgcttgatta--atttgctccatacatcaagtattttattggtgtgatttttaacgaatt 6049303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 298
Target Start/End: Original strand, 28485656 - 28485790
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| ||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  28485656 ggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcg-ggagatttattcttgta 28485754  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28485755 atccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 28485790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108356
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-gaagact-attcttgtaacccattgatttctc 22108270  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  22108271 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 22108356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550116
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-gaagact-attcttgtaacccattgatttctc 40550030  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  40550031 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 40550116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606669
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc 1606583  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  1606584 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 1606669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6067365 - 6067197
Alignment:
Q  197 agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc 296  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||   ||||  |||| ||    
T  6067365 agtctcttggtcacgggaagagattgagactttga-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaaggaactcgtc 6067267  T
Q  297 attatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| || |||   |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  6067266 attatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaa 6067197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137367
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagact-attcttgtaacccattgatttctc 22137281  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  22137282 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 22137367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552394
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagact-attcttgtaacccattgatttctc 40552308  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  40552309 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 40552394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 11759488 - 11759568
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  11759488 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 11759568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 20297723 - 20297803
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  20297723 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 20297803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 28487914 - 28487994
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  28487914 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 28487994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 38394347 - 38394427
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  38394347 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 38394427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7092141 - 7092061
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  7092141 ttccacacactttattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttcatcgaatt 7092061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7094388 - 7094308
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  7094388 ttccacacactttattttggttgcttgactatgccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttcatcgaatt 7094308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 267
Target Start/End: Original strand, 26804662 - 26804765
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26804662 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 26804760  T
Q  263 accca 267  Q
    |||||    
T  26804761 accca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 38397004 - 38397079
Alignment:
Q  433 atacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  38397004 atacactttgttttggttgctttattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 38397079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7471908 - 7471838
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  7471908 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 7471838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 20299821 - 20299891
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  20299821 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 20299891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 499
Target Start/End: Original strand, 35990 - 36059
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  35990 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattt 36059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 44925 - 45005
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44925 ttccatacactttgttttggttgcttgattatccattgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttctcatcgaatt 45005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 499
Target Start/End: Original strand, 1850345 - 1850411
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  1850345 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattt 1850411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 107
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990175
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagaggg-gctg-aaacaagggtttagaa 21990175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 302
Target Start/End: Original strand, 26210616 - 26210770
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgg-gaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatg-gagactttgtgtagaattaggtttgg 247  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||  |||||||  | ||||||  |||||||||||||||     
T  26210616 acactagggttgtgattgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattaggtttga 26210715  T
Q  248 agacttattcttgtaaccc-attgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||| |   |||| |||||||||||||||||||    
T  26210716 agactgattcttgtaacccttttgata-catgtttggaaagttactcatcattata 26210770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412392
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctg-aaacaagggtttagaa 37412392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 40836671 - 40836601
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  40836671 ttccatacactttgttttggttgtttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 40836601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 82
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223157
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 82  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagataga 42223157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 1606399 - 1606472
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||    
T  1606399 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 1606740 - 1606820
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  1606740 ttccatacgctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 1606820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 3036085 - 3036165
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3036085 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccaaacatcaaat-tgttattggtgtgatttctcatcgaatt 3036165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 25542889 - 25542969
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  25542889 ttccatacattttgttttgattgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 25542969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 28485926 - 28486006
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  28485926 ttccatacattttgttttggttgcttgattatcccttgctccacatatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 28486006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1046861 - 1046775
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccat-acactttgtttt--ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  1046861 ttgtatttataacttccattacactttgttttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 1046775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7349218 - 7349135
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  7349218 ttgtatttataactttcatacactttattttggttgcttaattatcccttactccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 7349135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 25351404 - 25351534
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccag 330  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||   ||| |||||  |||||    
T  25351404 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccag 25351499  T
Q  331 actaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  25351500 actaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25351534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Original strand, 45366474 - 45366526
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtat 61  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  45366474 agatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtat 45366526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 1049232 - 1049151
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttgtttt--ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  1049232 ttgtatttataactttcatacactttgttttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtga 1049151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 11084456 - 11084547
Alignment:
Q  155 tagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggttt 245  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||    |||||| ||| ||||||||||    
T  11084456 tagggttgagattgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattaggttt 11084547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22280444 - 22280397
Alignment:
Q  258 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22280444 ttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttattgatcattatagtg 22280397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 221
Target Start/End: Original strand, 22392539 - 22392609
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatg 221  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  22392539 acactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatg 22392609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 108
Target Start/End: Original strand, 24258423 - 24258489
Alignment:
Q  41 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  24258423 ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 24258489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 25410181 - 25410313
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||  |||    
T  25410181 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 25410276  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  25410277 agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25410313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44010885 - 44010749
Alignment:
Q  228 ttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||     
T  44010885 ttgtgtaaaattaggtttggagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctc 44010790  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||||||||||   || ||||||||| | ||||||||    
T  44010789 ccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaa 44010749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 499
Target Start/End: Original strand, 26804867 - 26804937
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||  | | |||||||||||||||    
T  26804867 ttccatacactttgttttggttgcttgactatcctttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgattt 26804937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44512656 - 44512525
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctcttccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||||||||| |||| |||   ||||||||| || |    
T  44512656 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctctcccta 44512561  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  44512560 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 44512525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 3035646 - 3035747
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gagatagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  3035646 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctg-aaacaagggtttag 3035744  T
Q  106 aaa 108  Q
    |||    
T  3035745 aaa 3035747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3320181 - 3320022
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat-cattatagtggaatggatgactgctctcttccc-a 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||   |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  |||   ||||||||| ||| |    
T  3320181 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctcttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 3320086  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 393  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||| ||| ||||||    
T  3320085 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctctctctctctctctc 3320022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3324929 - 3324770
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat-cattatagtggaatggatgactgctctcttccc-a 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||   |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  |||   ||||||||| ||| |    
T  3324929 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctcttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 3324834  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 393  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||| ||| ||||||    
T  3324833 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctctctctctctctctc 3324770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 478
Target Start/End: Original strand, 18345902 - 18345951
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  18345902 ttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatca 18345951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276167
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggct-aaaacaataatttagaaa 25276167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Original strand, 25357098 - 25357169
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 307  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25357098 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtgga 25357169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 38393911 - 38394012
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gagatagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  38393911 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctg-aaacaagggtttag 38394009  T
Q  106 aaa 108  Q
    |||    
T  38394010 aaa 38394012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 43253884 - 43253811
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  43253884 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagag 43253811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 6048599 - 6048675
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaat-tttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  6048599 agatttgttccaattatttgagggatgcttttactataaatatagaccttgtattagatgtaaaccttgagagagag 6048675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9680812
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgaga 78  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgaga 9680812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 107
Target Start/End: Original strand, 6348778 - 6348845
Alignment:
Q  41 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  6348778 ctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaa 6348845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7464646 - 7464518
Alignment:
Q  236 aattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agac 332  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||    
T  7464646 aattaggtttgaagagtgattcttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagac 7464551  T
Q  333 taggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  7464550 taggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 7464518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 22251515 - 22251452
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||| || | |||||||||||    
T  22251515 catacactttgttttggttgtttgattatcccttgctcaacacatcaagtttgttattggtgtg 22251452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 3878939 - 3879020
Alignment:
Q  429 ttccatacacttt-gttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  3878939 ttccatacatttttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tattattgatgtgatttctcatcgaatt 3879020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7092512 - 7092462
Alignment:
Q  37 tttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggag 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  7092512 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggag 7092462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 11757153 - 11757207
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11757153 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 11757207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 18345466 - 18345520
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18345466 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 18345520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 364
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369824
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 279  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||| | ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||   |||||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggacttgg-gtaaaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctctt 21369737  T
Q  280 ttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaa 364  Q
    | ||||||  ||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||| | ||| | |||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  21369738 t-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccgccatagtaggtcatcattggaccgaactgggtaaacaa 21369824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 28485491 - 28485545
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28485491 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 28485545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 38396215 - 38396269
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38396215 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 38396269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Original strand, 42006493 - 42006535
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatata 51  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42006493 agatttgttccatattttaagggttacttttactataaatata 42006535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1502883 - 1502823
Alignment:
Q  448 gttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||    
T  1502883 gttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcattgaatt 1502823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 1849894 - 1849967
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||| ||||    
T  1849894 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagag 1849967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Original strand, 3677235 - 3677284
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  3677235 ttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagatagaggg 3677284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7469950 - 7469871
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  7469950 ttccatacactttgttttagttgcttgattatccct-gctccacacatcaaat-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 7469871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 22108089 - 22108158
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 78  Q
    |||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  22108089 agatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22108158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 22137100 - 22137169
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 78  Q
    |||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  22137100 agatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22137169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 25405444 - 25405575
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   |||||||||  ||||    
T  25405444 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 25405539  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  25405540 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25405575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 40549849 - 40549918
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 78  Q
    |||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  40549849 agatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40549918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 40552127 - 40552196
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 78  Q
    |||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  40552127 agatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40552196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 64
Target Start/End: Original strand, 20299405 - 20299437
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20299405 atacttttactataaatatagaccttgtatcag 20299437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 22137439 - 22137510
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  22137439 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 22137510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 40550189 - 40550260
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  40550189 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 40550260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 40552466 - 40552537
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  40552466 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 40552537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 108)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 503
Target Start/End: Original strand, 31162185 - 31162686
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||    
T  31162185 gagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttaga 31162284  T
Q  107 aacaaacaataaactagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctt 202  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||||   || || || ||||  |    | ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  31162285 aacaagcaacaaattagtgtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactaacgttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 31162384  T
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||||| ||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31162385 ttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtg-gaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattata 31162483  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctct---tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctcttt--ctttctctcgctg 397  Q
    ||||||  || | |||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||   ||||||||| ||    
T  31162484 gtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctcttttttcttttctctcgttg 31162583  T
Q  398 tctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgat 497  Q
    | ||| |||  |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31162584 t-tttctac--ttttggcttgtatttataacttccatacactttgttttggttacttaattattacttgctccacacatcaagtattttattggtgtgat 31162680  T
Q  498 tttcat 503  Q
    ||||||    
T  31162681 tttcat 31162686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3005931 - 3005493
Alignment:
Q  66 gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttg 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||| || |||| |     | ||| ||||||||    
T  3005931 gtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaacaaataacaaactagagtttgtatagagtttgctcttaacaacaaacaatagggttg 3005832  T
Q  163 tggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
     | |||||| || |||| ||||||| |||| || |||||| ||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3005831 -gattgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 3005734  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3005733 aatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaa 3005634  T
Q  361 acaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattat 460  Q
    || |||||| ||||| ||| ||||| |||||||| ||  ||| |||    |||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3005633 ac-aaattcttgtgttctccctttc-ttctctcgttg--tttgtac---cttttcttgtatttataacttccatacactttg-tttggttgtttgattat 3005542  T
Q  461 tacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3005541 tacttgctccacacatcaagtattttattggtgtgattttcatcgaatt 3005493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13858842 - 13858341
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--c 109  Q
    |||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||  |    
T  13858842 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaa-caagggtttagaaaggc 13858744  T
Q  110 aaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctt 202  Q
    ||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||       | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |     
T  13858743 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttc 13858644  T
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||| |   ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13858643 ttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcg-ggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattata 13858546  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctt 401  Q
    ||| ||  || | ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| |   ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||    
T  13858545 gtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaattt-ggacagaactgggtaaacaaattctttgtgttctccctttctttctctcactgt-tt 13858448  T
Q  402 tttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-tttt 500  Q
    | ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  13858447 tctact--tttggcttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtttcttattggtgtgattttt 13858350  T
Q  501 catcgaatt 509  Q
    |||||||||    
T  13858349 catcgaatt 13858341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 21482434 - 21482791
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| | |||||||| | | ||||| |||||||||||   |  |    
T  21482434 acactagggttg-ggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagt-g 21482531  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||| | |||||||||  |||| |||||||||  |||||||    
T  21482532 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggac 21482630  T
Q  349 cgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactt--tgttt 445  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||    
T  21482631 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttttctctcgctg----ttttctacttttgtttgtgattataacttccatacactttattttt 21482726  T
Q  446 tggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  21482727 tggttgcttcattatcacttgctccacacatcaagtttattattggtgtgatttttcatcgaatt 21482791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 509
Target Start/End: Original strand, 15072686 - 15073195
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa-- 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||      
T  15072686 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagg 15072784  T
Q  109 caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtct 201  Q
    |||  |  |||||| |||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  15072785 caacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 15072884  T
Q  202 tttggttacgcgaagaga-tggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 300  Q
     ||||||||| ||||||  | | ||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15072885 cttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcg-ggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-ta 15072982  T
Q  301 tagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 398  Q
     ||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  15072983 cagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctcttcttttctctcgctgt 15073081  T
Q  399 ctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
     | ||| ||| |||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  15073082 -tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttgattgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 15073180  T
Q  496 a-ttttcatcgaatt 509  Q
    | |||||||||||||    
T  15073181 atttttcatcgaatt 15073195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14419549 - 14419042
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--c 109  Q
    |||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |    
T  14419549 tttgttccaatttatgagtgatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggc 14419451  T
Q  110 aaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctt 202  Q
    ||  || ||||||||||||   ||||| || |||||  |  | | ||| | |||||    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||     
T  14419450 aacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctc 14419351  T
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14419350 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattata 14419252  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctgtct 400  Q
    ||| ||  |||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||||| |||||| |||| ||  ||    
T  14419251 gtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctctcttcttt-tctctctcgct 14419155  T
Q  401 ttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgat 497  Q
     ||| ||| |||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||||| || | ||||||||||| |    
T  14419154 gttttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgttttggtttcctgattatcacttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgtt 14419055  T
Q  498 tt-tcatcgaatt 509  Q
    || ||||||||||    
T  14419054 ttctcatcgaatt 14419042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 151 - 398
Target Start/End: Original strand, 31035240 - 31035490
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  31035240 acactatggttggggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaag 31035339  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagac--taggtcagttttgg 346  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||  ||||||||| ||||    
T  31035340 acttattcttgtaaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattgg 31035438  T
Q  347 accgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 398  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31035439 accgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcgctgt 31035490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 246 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2468247 - 2467986
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagtttt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||| ||||||| |||     
T  2468247 ggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagattaggtcaattt- 2468149  T
Q  345 ggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt-ctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgt 443  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| ||  |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2468148 ggacagaactaggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttttctctcgttgt-tttcta--attttgttttgtgattataacttccctacactttgt 2468052  T
Q  444 tttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  2468051 tttggttgcttgactatcacttgctccacacatcaagtttattattggtgtgattttcatcgaatt 2467986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 393
Target Start/End: Original strand, 6375985 - 6376354
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggtttt- 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||   |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||      
T  6375985 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgagaaagggggt--tgaaaacaagggttatgaaacaaacaacaaactagggtttag 6376082  T
Q  130 agagatttctctaagagggagacactagggttg----tggtt-gatttaccttggg--aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatg 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||     || || |||| ||||||    ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  ||||||||     
T  6376083 agagatttctctaagcgggagacactagagtttgaattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagatt 6376182  T
Q  222 gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctc 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||    
T  6376183 gagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctc 6376281  T
Q  322 tcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 393  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| || |||||| |||||| ||||||||||    
T  6376282 tctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaattttgtgtgttctctctctctttctctc 6376354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106754
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 27107134  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | ||||||| |||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||    
T  27107133 agagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtga 27107034  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| || ||| | ||||| |||     
T  27107033 ctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctatctc 27106936  T
Q  326 c-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||| | |  |||||  ||||||||||||||||| ||| ||    ||| |||||| |||| ||    
T  27106935 ctccagactaggtcaattt-ggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttttctctttctttctctcgttgtttt----ctacttttgtctgtgatt 27106841  T
Q  424 ataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27106840 ataacttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaatt 27106754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 15956081 - 15956436
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||    
T  15956081 acactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggag 15956178  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  | |||||| || |||| |||||||  |||||||    
T  15956179 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtttctctctccctcagattaggtca-atttggac 15956277  T
Q  349 cgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttg 447  Q
     ||||||| | |||||| | |  ||| | |||||||  ||||||||| ||    ||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15956278 tgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttcttttctctcgttg----ttttctactttcgtttgtgattataactttcatacactttgttttg 15956373  T
Q  448 gttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  15956374 gttgtttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattgatgtgatttttcatcgaatt 15956436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 21480626 - 21480983
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||| || | |  |||  |||||||||||   || |    
T  21480626 acactaggtttg-ggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcg-ggtg 21480723  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||     
T  21480724 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaa 21480822  T
Q  349 cgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttg--ttt 445  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  21480823 cgaactgggtaaaaaaaattcgtgtgttctctctttcttttctctcgttg----ttttcttcttttgtttgtgattataacttccatacactttgttttt 21480918  T
Q  446 tggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||| |||||| | |||| || ||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||    
T  21480919 tggttgtttgattgtcacttactccacacatcaagtttattattggtgttatttttcatcgaatt 21480983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 151 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31578491 - 31578139
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31578491 acactaaggttgagattgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaag 31578392  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggac 348  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||    
T  31578391 actaattcttgtaaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggac 31578292  T
Q  349 cgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact----tccatacactttgtt 444  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||| ||    ||| ||| ||||| |||||||||||| |     |||||   ||  |     
T  31578291 cgaactgggtaaacaaattt--tgtgtgctctc--tctttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataattgttgcccata---ttgata 31578203  T
Q  445 ttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaattg 510  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  31578202 ttggttgcttgattatt--ttgctacacacatcaagtattttattcgtgtgatttttaacgaattg 31578139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 500
Target Start/End: Original strand, 14807725 - 14808234
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  14807725 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 14807823  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14807824 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 14807923  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  14807924 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 14808021  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-----------tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct-ttctt 387  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||            ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||||| |||||    
T  14808022 atagtggaacggagggctgctctctccccctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctctcttctt 14808119  T
Q  388 ---tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggta 482  Q
       ||||||| ||| ||| |||  |||| | ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||     
T  14808120 ttctctctcgttgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgattatccgttgctccacacatcaagtt 14808216  T
Q  483 ttttattggtgtgatttt 500  Q
    | ||||||||||||||||    
T  14808217 tgttattggtgtgatttt 14808234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 28251928 - 28251428
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||     
T  28251928 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaa-caagggtttagaat 28251830  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28251829 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 28251730  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  28251729 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcg-ggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-t 28251632  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgct 396  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  28251631 atagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgct 28251533  T
Q  397 gtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtg 493  Q
    || | ||| ||| || | | ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  28251532 gt-tgttttctacttgtggcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcctgattattccttgctccacacatcaagt-tgttattggtg 28251435  T
Q  494 tgatttt 500  Q
    |||||||    
T  28251434 tgatttt 28251428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 164 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 30480702 - 30480364
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30480702 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 30480604  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  30480603 acccattgatatctcttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 30480506  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctct-ttctt---tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttg 455  Q
    | |||||| | |||| ||||| |||||   ||||||||||| ||| |||  |||| | |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  30480505 c-aaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgtatttataattgttccatacactttgttttggttgcttg 30480410  T
Q  456 attattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    |||||| ||| || |||||||||  | | |||||||||| ||||||    
T  30480409 attattccttactccacacatcaaatttgttattggtgtcattttc 30480364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 15067955 - 15068465
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||||| |||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  15067955 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaa 15068053  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  |||| |||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  15068054 ggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagt 15068153  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15068154 cttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 15068251  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctg 397  Q
    ||| ||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||   |||||| | |  ||||| | | |||  ||||||||||||    
T  15068252 ataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttcacccttcttttctctcgctg 15068350  T
Q  398 tctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgt 494  Q
    | | ||| ||| |||| | |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| || | || |||||||    
T  15068351 t-tgttttctacttttggcttgtgtttgtaattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgttccacacatcaagtttgttgttggtgt 15068449  T
Q  495 ga-ttttcatcgaatt 509  Q
    || |||||||||||||    
T  15068450 gatttttcatcgaatt 15068465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 502
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36866014
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 36865636  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | ||| |||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    ||| |||||||| |  |    
T  36865637 agagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttc---acgggaagagattggaa 36865733  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||     
T  36865734 ctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctc 36865832  T
Q  326 ccc--agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgt 421  Q
    |||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| | || ||||| || ||||| ||||| || ||   | ||| ||| |||| | || |||    
T  36865833 ccccaagactaggtca-atttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttctgtctttttttctttctctcgttgttttctacttttggcttttgt 36865931  T
Q  422 ttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttca 502  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||| |||| ||||||    
T  36865932 ttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattgatgtggttttca 36866014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 25952656 - 25953003
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||   | |||||||||||||||    
T  25952656 ggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggca-gaagacttattcttgta 25952754  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||| | | ||    
T  25952755 actcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactaggtcaa 25952853  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    |||| | |  ||||| ||||||||| |||||||||| || ||| |||  |||| | |||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  25952854 caaattcttttgtgttctctctttcttttctctcgccgt-tttctac--ttttggattgtgtttataattgcttcatacactttattttggttgcttgat 25952950  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||| |||| || ||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25952951 tatcactttctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaatt 25953003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 393
Target Start/End: Original strand, 27911011 - 27911376
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaa-ctagggttt- 128  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||     
T  27911011 gatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaggcaacaacaaaactagggtttg 27911109  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  27911110 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 27911209  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
     ||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||    
T  27911210 ggactttgggtagaattaggcg-ggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctct 27911307  T
Q  323 cttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 393  Q
    || ||||||||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  27911308 ctccccagactaagtca-atttggaccgaactgggtcaa-aaaattcttttgtgctctctctctctctctc 27911376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 393
Target Start/End: Original strand, 27957430 - 27957795
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaa-ctagggttt- 128  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||     
T  27957430 gatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaggcaacaacaaaactagggtttg 27957528  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  27957529 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 27957628  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
     ||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||    
T  27957629 ggactttgggtagaattaggcg-ggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctct 27957726  T
Q  323 cttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 393  Q
    || ||||||||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  27957727 ctccccagactaagtca-atttggaccgaactgggtcaa-aaaattcttttgtgctctctctctctctctc 27957795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 247 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15185831 - 15185581
Alignment:
Q  247 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttg 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||    
T  15185831 gagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtca-atttg 15185733  T
Q  346 gaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgtt 444  Q
    ||||||||||| | |||||| | |  | ||| |||||||||||||||||| ||    ||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15185732 gaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctctttctttctctcgttg----ttttctacttttgtttatgattataacttccatacactttgtt 15185637  T
Q  445 ttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||| |||  ||| || ||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  15185636 ttggttgcttgactatcccttactccacacatcaagtttgttattgatgtgatttt 15185581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 27829271 - 27829783
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  27829271 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 27829369  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27829370 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 27829469  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||     
T  27829470 ctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcat- 27829566  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctct------ctttct-ttct- 390  Q
    ||||||||  ||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||| | |||| |||      |||| | ||||     
T  27829567 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt-ggaccgaactgggtcaacaa-attcttttgtgttcttctcttctttgtgttctt 27829664  T
Q  391 ctcgctgtctttttactatttttgt-ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttatt 489  Q
    ||||| ||  |||| ||| |||||  || | ||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||    
T  27829665 ctcgccgttgtttt-ctacttttgacttatatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttatt 27829763  T
Q  490 ggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27829764 ggtgtgattttcatcgaatt 27829783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 4423992 - 4424354
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  4423992 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaaggatttagaaa 4424090  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || || ||  ||   | ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  4424091 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagt 4424190  T
Q  200 cttttggttacgcgaagaga-tggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||     
T  4424191 ctcttggttacgggaagagattggag-ctttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatca- 4424287  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||   || | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  4424288 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 4424354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 27826960 - 27827472
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  27826960 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 27827058  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27827059 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 27827158  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||  ||||||   | ||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||| |    
T  27827159 ctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-t 27827255  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ct 390  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| || ||| ||||||       |    
T  27827256 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttctt 27827353  T
Q  391 ctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttatt 489  Q
    ||||| || | ||| ||| |||||  |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||    
T  27827354 ctcgccgt-tgttttctacttttgacttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttatt 27827452  T
Q  490 ggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27827453 ggtgtgattttcatcgaatt 27827472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31573939 - 31573794
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31573939 acactatggttgggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaag 31573840  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573839 actaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 32339445 - 32339645
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  32339445 ggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 32339543  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  32339544 acccattgatatctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggttaa 32339641  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  32339642 caaa 32339645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 15809354 - 15809704
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |    ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15809354 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 15809452  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt-cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||   || | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  15809453 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 15809550  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    | |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||| || | ||| |||||||||  |||| ||||    || |||||||||||||||||||||    
T  15809551 c-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctatttttgccttgtatttaattgtttcatacactttgttttggttgc 15809648  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  15809649 ttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 15809704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 232 - 388
Target Start/End: Original strand, 16833753 - 16833909
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cag 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | ||||||||| || |||    
T  16833753 gtagaattaggtttgaagacttactcttgtaatcatttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacag 16833852  T
Q  331 actaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 388  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16833853 actaagtcacttttgga-cgaactgggtaaacaaaattcgtgtgttctctctctcttt 16833909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 498
Target Start/End: Original strand, 1225164 - 1225626
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggtttt- 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||      
T  1225164 tacttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 1225262  T
Q  130 --agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgga 223  Q
      |||| || |||||  |    | |||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |     
T  1225263 aaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 1225362  T
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
    | ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| | |||||    
T  1225363 ggctttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggccgctct 1225460  T
Q  323 cttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtg 420  Q
    || || || |||||||||  ||||||||||||| | | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||  ||||   |||||    
T  1225461 ctccctcatactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tttctac--ttttgacttgtg 1225556  T
Q  421 tttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatt 498  Q
    ||||||| |         ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  1225557 tttataatt--------gtttgttttggttgcttgattattccttgttccacacatcaagtatgttattggcgtgatt 1225626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Original strand, 43079738 - 43080079
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43079738 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 43079836  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  43079837 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 43079933  T
Q  361 acaaaattc-gtgtgtgct-----ctctttctttc-tctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    ||||| |||  ||||| ||      |||||  ||| |||||| || | ||| ||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43079934 acaaatttctttgtgttcttgttcttcttttgttcttctcgccgt-tgttttctacttttgacttgtatttataactttcatacactttgttttggttgc 43080032  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    || |||||   ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  43080033 ttaattatccattgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 43080079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 3874146 - 3874346
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatg-agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3874146 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 3874244  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  3874245 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 3874342  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  3874343 caaa 3874346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 18810682 - 18811195
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  18810682 agatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 18810780  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  ||   | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18810781 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 18810880  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||| ||   | ||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||     
T  18810881 ctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcat- 18810977  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctct------ctttct-ttct- 390  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||| ||| ||||||| ||| | |||||||||| | |||||| ||| | |||| |||      |||| | ||||     
T  18810978 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaattt-gaaccgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttcttctcttctttgtgttctt 18811075  T
Q  391 ctcgctgtctttttactatttttgt-ttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttat 488  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||  |||| ||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||    
T  18811076 ctcgctgtcgtttt-ctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttat 18811173  T
Q  489 tggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  18811174 tggtgtgatttttcatcgaatt 18811195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 500
Target Start/End: Original strand, 17847502 - 17847985
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagaggg-agctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||   ||||| | ||   |||||||| |||||||    
T  17847502 agatttgttccaaattttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagatgcaaaacatg---tagagagtaga--aaaacaag-gtttaga 17847595  T
Q  107 aacaaacaataaactagggttt-tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgattt-----accttgg--gaaacactgttaggat-ga 197  Q
    ||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |    | |||||| ||||| | ||| |||     ||||||   |||||||| ||||||| ||    
T  17847596 aatgaacaacaaactaaggtttatagagatttctctaggcaacaaacactatggttgggattgttttgattcaccttgaacgaaacactattaggattga 17847695  T
Q  198 gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 297  Q
     ||| ||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||       ||||    
T  17847696 atctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa-cctttgatatctcttttgtaaa-------atca 17847787  T
Q  298 ttatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac-aaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgc 395  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||  ||| ||||| |||||||| ||||||||      
T  17847788 ttatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactgggaaaactaattttcatgtgttctctctttatttctctc-- 17847885  T
Q  396 tgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
        ||||| ||| | ||| |||||||||||| |  ||   || ||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17847886 ---attttttctactcttgcttgtgtttataattgtcacctacattgttttggttgcttaatta--attttttccacacatcaagtattttattggtgtg 17847980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28283418 - 28283220
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  28283418 ggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtg-gtagacttattcttgca 28283320  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  28283319 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 28283223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3886277 - 3886181
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  3886277 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 3886181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 2468459 - 2468375
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2468459 agatttgttccaaatgttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaa 2468375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372185
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||| ||||||||   |    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagaggg-gctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatat 5372415  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  ||   | |||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||| | ||    
T  5372414 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggga 5372315  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| ||| |||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |  | ||||||     
T  5372314 ctttgagtataattaggcg-gcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctc 5372216  T
Q  325 -tcccagactaggtcagttttggaccgaactg 355  Q
      ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5372215 cccccagactaggtca-atttggaccgaactg 5372185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 500
Target Start/End: Original strand, 41382830 - 41383137
Alignment:
Q  195 tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 294  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41382830 tgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactca 41382928  T
Q  295 tcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctc 391  Q
    ||| ||||||| ||  || | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||    
T  41382929 tca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttccttttctc 41383026  T
Q  392 tcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttat 488  Q
    ||||||| | ||| ||| || | | ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||    
T  41383027 tcgctgt-tgttttctacttctggcttgtgtttataattgttccataaactttgttttgattgcttgattatctcttgctccacacatcaagtttgttat 41383125  T
Q  489 tggtgtgatttt 500  Q
    ||||||| ||||    
T  41383126 tggtgtggtttt 41383137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Original strand, 43082109 - 43082450
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||    
T  43082109 ggttgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagacttattcttgt 43082207  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  43082208 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 43082304  T
Q  361 acaaaattc-gtgtgtgc-tctctttcttt-----ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    ||||| |||  ||||| | |||  ||||||      |||||  || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43082305 acaaatttctttgtgttcttcttcttcttttgttcttctcgacgt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgttttggttgc 43082403  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    || |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  43082404 ttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 43082450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 608870 - 609070
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  608870 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 608968  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||    
T  608969 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtca-atttggaccgaactgggtcaa 609066  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  609067 caaa 609070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 43530251 - 43530451
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  43530251 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcctgta 43530349  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  43530350 acccattgatttctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 43530447  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  43530448 caaa 43530451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22684855 - 22684652
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22684855 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 22684757  T
Q  263 accc---attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggat 358  Q
    ||||   |||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| |    
T  22684756 acccaatattgatttctctattgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtca-atttggaccgaactgggt 22684659  T
Q  359 aaacaaa 365  Q
     ||||||    
T  22684658 caacaaa 22684652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 44720817 - 44721179
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  44720817 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 44720915  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaa-cactgttaggat-gag 198  Q
      |||  |  |||||| | |||   |||||  | |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  44720916 ggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgag 44721015  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||     
T  44721016 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca- 44721112  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  44721113 tatagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 44721179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 460
Target Start/End: Original strand, 41384880 - 41385180
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagat-ggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||||  ||||| || |||||||    
T  41384880 ggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag-ctttaggtagaattaggtg-ggagaatttttcttgt 41384977  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  || | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |    
T  41384978 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtca 41385075  T
Q  361 acaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacac-tttgttttggttgcttg 455  Q
    ||||| | |  | ||| ||||||| | |||||||||||||  |||||   |||| | ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  41385076 acaaattcttttctgttctctcttccatttctctcgctgttgttttatacttttggcttgtgtttataattgttccatacacttttgttttggttgtttg 41385175  T
Q  456 attat 460  Q
    |||||    
T  41385176 attat 41385180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 391
Target Start/End: Original strand, 3895988 - 3896186
Alignment:
Q  195 tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccat-tgatatctcttttgtaaagttactc 293  Q
    ||||||| || || ||| ||||| || | ||||||| ||| ||||||||||| | | | ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  3895988 tgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaactcttatgatatctcttttgtaaagttactc 3896087  T
Q  294 atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctc 391  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||  |||| | ||| ||||| ||||| |||| ||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  3896088 atcattaaagtagaacggatggctgctctctcccccatagtagatcagtattggatcgaattgagtaaacaaatttcgtgtgttctctatttctttctc 3896186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477522
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 14477374  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    | || || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  14477375 aaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 14477474  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatat 274  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14477475 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 324
Target Start/End: Original strand, 18812867 - 18813176
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  18812867 agatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaa-caagggtttagaaa 18812965  T
Q  109 --caaacaataaactagggttttagagatttctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttt 203  Q
      |||  |  ||||||| ||||        |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  18812966 ggcaacaacaaaactagagtttg-------tctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 18813058  T
Q  204 tggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 303  Q
    ||| |||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||    
T  18813059 tgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatag 18813155  T
Q  304 tggaatggatgactgctctct 324  Q
    |||| |||| | |||||||||    
T  18813156 tggattggagggctgctctct 18813176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872641
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 35872641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517287
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt--gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  12517385 atttgttccaaattttaagcgatacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 12517287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24873547 - 24873204
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------gagatagagggagctgaaaacaagagttt 103  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||      ||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  24873547 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctg-aaacaagggttt 24873449  T
Q  104 agaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat 195  Q
    |||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |  | | ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  24873448 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggat 24873349  T
Q  196 --gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc 293  Q
      |||||| |||||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |  ||||    
T  24873348 tggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc-tttgtaacgaaactc 24873251  T
Q  294 atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcag 340  Q
    |||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||| ||||||||||    
T  24873250 atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcag 24873204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541651
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 33541651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24873380 - 24873046
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  24873380 ggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 24873282  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    |||| |||||| ||||||| |||| |  ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||| ||  | |    
T  24873281 aaccgattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagatt-ggaccgaattgagtca 24873185  T
Q  361 acaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta--tttttgtttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgat 457  Q
    ||||| |||   |||| |||         |||||| ||  |||| |||  |||| | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24873184 acaaatttc---tgtgttct---------tctcgccgttgtttt-ctaccttttggcttgtatttataactttcatacactttgtttttggttgcttaat 24873098  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  24873097 tatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 24873046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31566595 - 31566523
Alignment:
Q  326 cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 398  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31566595 cccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgagttctctctttctttctctcgctgt 31566523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 33021039 - 33020963
Alignment:
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt-ttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  33021039 tttgtgtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttgatattttttgttgtaaagttactcatcattata 33020963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 298
Target Start/End: Original strand, 181635 - 181771
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgtt-aggatga-gtcttttggttacgcg--aagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattctt 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||| || ||||||||  ||||||  | ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||    
T  181635 ggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcg-gaagacttattctt 181733  T
Q  260 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  181734 gtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcat 181771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 26775199 - 26775273
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  26775199 tacttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 26775273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Original strand, 41382670 - 41382744
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  41382670 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggct-aaaacaagggtttagaa 41382744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 93
Target Start/End: Original strand, 181534 - 181595
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  181534 atacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaa 181595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 33541507 - 33541272
Alignment:
Q  266 cattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaa 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| | || ||    
T  33541507 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcat-atagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaattt-ggaccgaattgggtcaa-aa 33541411  T
Q  365 aattcgtgtgtg--ctctctttctttctctc--gctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgatt 458  Q
    | ||| | ||||  ||||||| |||||||||  ||||  ||| ||||  ||| | |||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33541410 atttcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctga-tttctact--tttggcttgtgtttataattgttccatacactttattttgattgcttgatt 33541314  T
Q  459 attacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||  ||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  33541313 atcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt 33541272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 5623096 - 5623001
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||| || | || ||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  5623096 tttgttccaatttatgagtgattcttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 5623001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15186072 - 15186000
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagata 80  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15186072 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagata 15186000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 14419834 - 14419779
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagc 88  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14419834 tacttttgctataaatatagacattgtatcagggtaaaccttgagatagagagagc 14419779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 43530522 - 43530592
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  43530522 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 43530592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 509
Target Start/End: Original strand, 14477655 - 14477733
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  14477655 catacactttgttttggttgtctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 14477733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28283146 - 28283069
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  28283146 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 28283069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 4424425 - 4424505
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgtttt-ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||||||||    
T  4424425 ttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacaccaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 4424505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952593
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 25952593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480766
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttg-aaacaagggtttagaaa 30480766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 32339716 - 32339796
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  32339716 ttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgccccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 32339796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 35872389 - 35872308
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35872389 ttccatacactttattttggttgcttgattatcccttacttcacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaatt 35872308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 3874400 - 3874470
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  3874400 ttccatacactttgttttggttgcttggttatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 3874470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 33839062 - 33838902
Alignment:
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-ttatagtggaatggatgactgctc 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||| |  | ||||||||||| |||  |||||||    
T  33839062 agactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttggaa--tcttttgtaaagttacttaaaagttatagtggaacggagaactgctc 33838965  T
Q  322 tct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa-attcgtgtgtgctctct 382  Q
    |||  |||| | || |||||| || ||||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  33838964 tctcccccataatatgtcagtattcgaccgaattgggtaaacaaattttcgtgtgttctctct 33838902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 21482297 - 21482370
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||  |||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21482297 agatttgttccagttttttag-gattcttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagag 21482370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3883523 - 3883443
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3883523 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcctttgctccacacatcaagt-tgttattgatgtgatttttcatcgaatt 3883443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 498
Target Start/End: Original strand, 44721250 - 44721318
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| || | ||||||||||||||    
T  44721250 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagt-tgttattggtgtgatt 44721318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799423
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 279  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||   ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||   |||||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt-gagtataattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctt 17799511  T
Q  280 ttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    | ||||||  ||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  17799510 t-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 17799423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23179688 - 23179560
Alignment:
Q  236 aattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagac 332  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||    
T  23179688 aattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagac 23179593  T
Q  333 taggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  23179592 taggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 23179560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Original strand, 41384742 - 41384815
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  41384742 atacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagaggg-gctg-aaacaagggtttagaa 41384815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 108
Target Start/End: Original strand, 43530121 - 43530200
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  43530121 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 43530200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 509
Target Start/End: Original strand, 16833954 - 16834017
Alignment:
Q  445 ttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16833954 ttggttgcttgattatt--ttgtttcacacatcaagtattttattggtgtgacttttcaacgaatt 16834017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 31035042 - 31035111
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgaga 78  Q
    ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  31035042 agatttgttccaattttttag-gatatttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgaga 31035111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 368
Target Start/End: Original strand, 33032705 - 33032840
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||     
T  33032705 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaatggagagctgctctctctcct 33032800  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaatt 368  Q
    |||||||||||   ||  |||||||||| |||| ||||||    
T  33032801 agactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaaaaaaatt 33032840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872480
Alignment:
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 35872480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 324
Target Start/End: Original strand, 14419732 - 14419785
Alignment:
Q  271 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  14419732 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggatggctgctctct 14419785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 28327959 - 28328090
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||   |||||||||  ||||    
T  28327959 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctccccca 28328054  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  28328055 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 28328090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 28332682 - 28332813
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctcttc-cca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| | |||    
T  28332682 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcctcca 28332777  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  28332778 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 28332813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 32339280 - 32339381
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gagatagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  32339280 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctg-aaacaagggtttag 32339378  T
Q  106 aaa 108  Q
    |||    
T  32339379 aaa 32339381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 509
Target Start/End: Original strand, 609145 - 609223
Alignment:
Q  432 catacactttgtttt--ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  609145 catacactttgttttttggttgcttgattatctcttgctccacgcatcaagt-tgttattggtgcgattttcatcgaatt 609223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16752653 - 16752523
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat-cattatagtggaatggatgactgctctcttcccag 330  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||   |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  |||   || |||||| |||||    
T  16752653 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctcttt-gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctccccag 16752558  T
Q  331 actaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  16752557 actaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 16752523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812449
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 279  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||   | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 4812575  T
Q  280 ttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgc 377  Q
    ||||||||  | ||| |||||||||||||  |||   ||||||||| ||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||||||  || ||||| |    
T  4812574 ttgtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttc 4812475  T
Q  378 tctctttctttctctcgctgtctttt 403  Q
    ||||| ||  |||||| || ||||||    
T  4812474 tctctctccctctctccctctctttt 4812449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33541587 - 33541508
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattagg 242  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  33541587 ggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg 33541508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2267205 - 2267120
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 266  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||   ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2267205 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggacttgg-gtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccc 2267120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 464 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 2467932 - 2467886
Alignment:
Q  464 ttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaattg 510  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2467932 ttgctccacacatcaagtttattattggtgtgattttcatcgaattg 2467886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 3873981 - 3874035
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3873981 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcag 3874035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 11700913 - 11700834
Alignment:
Q  418 gtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt 499  Q
    ||||||||||||  ||| ||| || |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  11700913 gtgtttataactatcatccacattattttagttgcttgattaat--ttgcttcacacatcaaatattttattagtgtgattt 11700834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985136
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatg-gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctct 278  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||  | ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||  |||||     
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttt-gaaactgattcttgtaaccctttggaatctc- 13985165  T
Q  279 tttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
     || ||||||||| | ||||||||||||||    
T  13985164 -ttataaagttacccctcattatagtggaa 13985136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 15809190 - 15809244
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15809190 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 15809244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 180
Target Start/End: Original strand, 16833612 - 16833753
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggtttt- 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||      ||||||||||||| || |   |||||||||| |||||    ||||||| ||||||||||||      
T  16833612 gatacttttactataaacatagaccttgtat------aaaccttgagataaagagta-tgaaaacaagggttta----caaacaacaaactagggtttag 16833700  T
Q  130 --agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttggg 180  Q
      ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16833701 agagacatttctctaagcgggaaacactagggttgggattgattcaccttggg 16833753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 18813288 - 18813369
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  18813288 ttccatacactttgattttggttgcttgattatctcttgctctacatatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 18813369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22685003 - 22684953
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  22685003 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 22684953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 28283585 - 28283531
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28283585 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 28283531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16757398 - 16757267
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   |||||||||  ||||    
T  16757398 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 16757303  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  16757302 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 16757267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 25684694 - 25684825
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   |||||||||  ||||    
T  25684694 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 25684789  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  25684790 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 25684825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 500
Target Start/End: Original strand, 27911486 - 27911550
Alignment:
Q  435 acactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27911486 acactttgttttagtttcta-attatcacttgctccacacatcaagttttttattggtgtgatttt 27911550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 500
Target Start/End: Original strand, 27957905 - 27957969
Alignment:
Q  435 acactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27957905 acactttgttttagtttcta-attatcacttgctccacacatcaagttttttattggtgtgatttt 27957969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 502
Target Start/End: Original strand, 3898939 - 3898971
Alignment:
Q  470 cacacatcaggtattttattggtgtgattttca 502  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3898939 cacacatcaagtattttattggtgtgattttca 3898971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22684581 - 22684510
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  22684581 ttccataaactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 22684510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 193)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151747
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaa-ctagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||   |    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaatcaacaagaaaactagggtttgtat 31151370  T
Q  130 agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactt 228  Q
    |||| || ||||  |    | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||| | |||||    
T  31151371 agagtttgctcttggcaacaaacaccagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgggactt 31151470  T
Q  229 tgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcc 327  Q
    || |||||||||||   || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||  ||    
T  31151471 tgggtagaattaggcg-ggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcccc 31151567  T
Q  328 cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttata 426  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| | || ||||| |||||||  ||||||||||||   |||| ||| | ||  |||||||||||    
T  31151568 cagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctcttcttttctctcgctg---tttttctactcttacttgtgtttata 31151664  T
Q  427 acttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31151665 acttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctccacacatcaagta-tttattggtgtgatttttcatcgaatt 31151747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 151 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 561987 - 561633
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatg-agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  561987 acactagggttcaggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtg-ggag 561889  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc--cagactaggtcagttttgga 347  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  561888 acttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttgga 561789  T
Q  348 ccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttct-ttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgtttt 446  Q
    |||||| || |||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||| ||| ||    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  561788 ccgaaccgggtaaacaaatttcacgtgttctctctttctcttctctcgatgtttt----ctacttttgcttgtgtttataacttccatacactttgttt- 561694  T
Q  447 ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaa 507  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  561693 ggttgcttgattattacttactccacacatcaagtattttattggtgtgattttcatcgaa 561633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 23633357 - 23633855
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||    
T  23633357 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggct-aaaacaaggatttagaa 23633455  T
Q  108 acaaacaataaa-ctagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctt 202  Q
     | ||||| ||| |||||||||   ||| | || ||||  |    | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||     
T  23633456 gccaacaagaaaactagggtttgtatagtgtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctc 23633553  T
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23633554 ttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaacccgatgatatctcttt-gtaaagttactcatcattata 23633651  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctt 401  Q
    ||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||| | |  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  23633652 gtgaaaaggagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctctctttctttctctcgatgt-tt 23633749  T
Q  402 tttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-tttt 500  Q
    | |||  || | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    
T  23633750 tctac--ttgtggcttgtgtttataaattccatacactttgttttggttgcttgattttcacttgcttcacacatctagta-tttattggtgtgattttt 23633846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 509
Target Start/End: Original strand, 53597161 - 53597637
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaa-ctagggttt- 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| ||   ||||| ||| |||||| ||     
T  53597161 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggg-gatgaaa-caagggtttataagtcaacaagaaaactaggggttg 53597258  T
Q  129 --tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
      ||||| |||||||  |    | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | | ||| |||| ||||    
T  53597259 tatagagttttctcttggcaacaaacactagggttgaagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgaga 53597358  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
     |||| |||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||     
T  53597359 ttttgagtagaattagg-caagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctc 53597457  T
Q  326 cc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctct-ctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
    || || ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||    ||| ||||||||| ||||||||    
T  53597458 ccacaaactaggtcagtattggaccgaattgggtaagctaatttcgtgtgttctctcctttctttctctcgttg----ttttctatttttgcttgtgttt 53597553  T
Q  424 ataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||  |||||   ||| ||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53597554 ataattcttcc---cacgttgatattggttgcttgattatt--ttgctccacacataaagtattttattggtgtgattttcatcgaatt 53597637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28761784 - 28761294
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca- 110  Q
    |||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| |     
T  28761784 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaa-caagggtttagaaagac 28761686  T
Q  111 aacaataaa-ctagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggtt-gtg-gttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttt 203  Q
    ||||| ||| |||||||||   || || || ||||  |    | |||| |||||| | | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |    
T  28761685 aacaacaaaactagggtttgtatatagtttgctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctct 28761586  T
Q  204 tggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 303  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28761585 tggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcg-ggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 28761487  T
Q  304 tggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttt 402  Q
    || || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||          ||||||||| ||    |    
T  28761486 tgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaac-aaattcttttgt----------tttctctcgttg----t 28761402  T
Q  403 ttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttc 501  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |  | |||||||||||| |||||    
T  28761401 tttctacttttgcttgtgattataatttccatacactttattttggttgtttgattatcacttgctccacacatcaagattattattggtgtgatttttc 28761302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 166 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 36871497 - 36871167
Alignment:
Q  166 ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 264  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  36871497 ttgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaac 36871398  T
Q  265 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaaca 363  Q
    || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  36871397 cctttgttatctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacg 36871299  T
Q  364 aaattcgtgtgtgctctcttt-ctttctctcgctgtctttttactat-ttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattatt 461  Q
    || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||    ||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36871298 aatttcgtgtgttctctctttattttctctcgctg----ttttctatcttttgcttgtgtttataactgtcacccac-ttgttttggttgcttgattatt 36871204  T
Q  462 acttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
     |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  36871203 -cttgctccacacatcaagta-tttatcggtgtgatttt 36871167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 53918000 - 53917523
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||  ||||  |  ||||||||||||     
T  53918000 atacttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaa-caatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 53917902  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  53917901 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 53917802  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
     || |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||    
T  53917801 ggattttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct 53917704  T
Q  323 ct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgt 419  Q
    ||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||    
T  53917703 ctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgt 53917606  T
Q  420 gtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||    
T  53917605 gtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattagtgtgatttt 53917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 53915832 - 53915345
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |  ||||  |  ||||||||||||     
T  53915832 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaa-caagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttg 53915734  T
Q  129 tagagattt---ctctaagagggagacactagggttg--tggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
    || ||||||   ||||  |    | |||||||||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  53915733 tatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 53915634  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
     ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||    
T  53915633 ggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatt-tagtgaaacggagggctgctct 53915536  T
Q  323 ct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgt 419  Q
    ||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||    
T  53915535 ctcccccagactaggtcaatttt-gactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgt 53915438  T
Q  420 gtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| || |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  53915437 gtttataattgtttcatacacttggttttggttgcttgactatcccttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 53915345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626542
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1626918  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | |||||| | ||    
T  1626917 agagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattggga 1626818  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||     
T  1626817 ctttgggtagaattaagcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 1626720  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| | ||  |||| |  ||||   ||||||||    
T  1626719 gcccagactaggtc-gatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctc-gttgtttttcacttttgacttgtgttt 1626622  T
Q  424 ataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||    
T  1626621 ataattgttccatacactttgtttttgttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttc 1626542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4308616 - 4308129
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-- 128  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||      
T  4308616 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4308518  T
Q  129 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgga 223  Q
     ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |     
T  4308517 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 4308418  T
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||    
T  4308417 gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctc 4308320  T
Q  324 ttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgt 419  Q
    | ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||    
T  4308319 tcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgt 4308222  T
Q  420 gtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg--attttcatcgaatt 509  Q
    | ||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  4308221 gattataattgttccatacactttgttttggttgttggattattccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatattttcatcgaatt 4308129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 17795306 - 17795662
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||   | ||    
T  17795306 acactagggttg-ggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcg-gaag 17795403  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggac 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||    
T  17795404 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtca-atttgaac 17795502  T
Q  349 cgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgtttt 446  Q
    |||| | | |||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||| ||    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  17795503 cgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttttctctcgttg----ttttctacttttgtttgtgattataacttccatacattttatttt 17795598  T
Q  447 ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  17795599 ggttgcttgactatcagttgctccacacatcaaatttattattggtgtgatttttcatcgaatt 17795662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 19103746 - 19104102
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||   | ||    
T  19103746 acactagggttg-ggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcg-gaag 19103843  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggac 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||    
T  19103844 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtca-atttgaac 19103942  T
Q  349 cgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgtttt 446  Q
    |||| | | |||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||| ||    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19103943 cgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttttctctcgttg----ttttctacttttgtttgtgattataacttccatacattttatttt 19104038  T
Q  447 ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19104039 ggttgcttgactatcagttgctccacacatcaaatttattattggtgtgatttttcatcgaatt 19104102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 36011887 - 36012236
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| || | | ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36011887 ggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattag-ttgggagacttattcttgta 36011985  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || | |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  36011986 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtca-atttggaccgaactggatcaa 36012083  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttga 456  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36012084 caaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgt-tgttttctacttttcgcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgtttga 36012182  T
Q  457 ttattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||  |||||| || |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  36012183 ttatcccttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 36012236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880313
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-tag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||   |||  |  |||||||||||| ||     
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaa-caagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 880687  T
Q  132 agatttc-tctaagagggag---acactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggag 224  Q
    ||| ||| |||    || |    |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||  ||||||| | |    
T  880686 agagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggg 880587  T
Q  225 actttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
     ||||| ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||    
T  880586 gctttgggtagaattagacg-ggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtaaaatggagggctgctctct 880489  T
Q  325 tccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtt 422  Q
     ||| |||||||||||  |||||||||| |||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||| |    
T  880488 cccctagactaggtca-atttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tttctac--ttttggtttgtgat 880393  T
Q  423 tataac--ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || | |||| |||||||||||    
T  880392 tataactgttccatacactttgttttggttgcttgattaatccttgctccacacatcaagtttgttatgggtgtgatttt 880313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 507
Target Start/End: Original strand, 43228213 - 43228696
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-- 128  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||  |  ||||||| ||||      
T  43228213 tactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgt 43228311  T
Q  129 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgga 223  Q
     ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   |     
T  43228312 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 43228411  T
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||    
T  43228412 gactttgggtagaattaggca-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 43228509  T
Q  324 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttcttt-ctctcgctgtctttttactatttttgtttgtg 420  Q
    |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |  ||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||   ||||| | ||||     
T  43228510 tcccccagactaggtca-atttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttactctcgctgttgttttctaattttggcttgta 43228608  T
Q  421 tttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaa 507  Q
    ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  43228609 ttt-taattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttctcatcgaa 43228696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926616
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-tag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||| |||| ||     
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtat 5926999  T
Q  132 aga-tttctctaagagggaga--cactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    ||| ||| ||||   || | |  ||||||||||    ||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||    
T  5926998 agagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 5926899  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||     
T  5926898 cttttggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatca-tataatgaaacggatgactgctctctc 5926801  T
Q  326 cc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttta 424  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| |   ||||| |||| || ||||||||| |  | ||||  ||| ||||| |||||||||    
T  5926800 ccgcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgttctcttttcctttctctctcgttgtttt--ctacttttgcttgtgttta 5926704  T
Q  425 taa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  5926703 taattgttccttacactttgttttggttacttgattattccttacttcacacatgaagtttgttattggtgtgagttttcatcgaatt 5926616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27101378 - 27101029
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||  | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27101378 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtg-ggagacttattcttgta 27101280  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  27101279 acccattgatatctcttttgcaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtca-atttggaccgaactggatcaa 27101182  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttga 456  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| | ||||||| ||||| | ||| ||| |||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27101181 caaattcttttgtgttctctcttccttttctcttgctgt-tgttttctactttttgcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcctga 27101083  T
Q  457 ttattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg--attttcatcgaatt 509  Q
    |||||  ||||| ||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  27101082 ttattcattgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatattttcatcgaatt 27101029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 509
Target Start/End: Original strand, 1313331 - 1313815
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||   |||  |  ||||||||||||     
T  1313331 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caag-gtttacaatggcaacaacaaaactagggtttg 1313428  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||| |    
T  1313429 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattg 1313528  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
     ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||    
T  1313529 ggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct 1313626  T
Q  323 ct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtg 420  Q
    ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||| ||| ||| |||  ||||   |||||    
T  1313627 ctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgttgt-tttctac--ttttgacttgtg 1313722  T
Q  421 tttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga--ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  1313723 tttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgagtttttcatcgaatt 1313815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 117 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1620707 - 1620329
Alignment:
Q  117 aaactagggtttt-agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatgag-tcttttggttacgcga 214  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||    
T  1620707 aaactagggtttagagagatttctctaggcgggagacactagggttgggattgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacggga 1620608  T
Q  215 agagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatg 314  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1620607 agagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaaccctttgatatctc-tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagg 1620509  T
Q  315 actgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttt 412  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| | | |||||| || |||||| ||||| ||| ||| |||||  |    ||| ||| |||    
T  1620508 gctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaacaaactttgtgtgttctctcattcttttatctcgtgg----ttttctacttt 1620413  T
Q  413 tgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    || ||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||  | || || |||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  1620412 tgcttgtgtttataactgtcacccac-ttgttttggttgcttgatta--attttctccacatatcaagt-ttttattggtgtgatttt 1620329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 24979605 - 24980119
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  24979605 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 24979703  T
Q  109 ca-aacaataaa-ctagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
     | ||||| ||| |||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  24979704 gacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagt 24979803  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcat 298  Q
    || |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| |||||||||||     
T  24979804 ctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatca- 24979901  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgc 395  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||  |||| |||||||||  |||||| |||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| | |||||||||     
T  24979902 tatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgt 24980000  T
Q  396 tgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattgg 491  Q
    |||  |||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||    
T  24980001 tgttgtttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattgg 24980100  T
Q  492 tgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  24980101 tgtgttttctcatcgaatt 24980119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 45882837 - 45883350
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  45882837 agatttgttgaaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 45882935  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt-tagagattt---ctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  |||||||||||| || ||||||   ||||  |    | ||| || ||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45882936 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 45883035  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45883036 ctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 45883133  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttccc--agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgc 395  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||  | || |    
T  45883134 atagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttcttttctc 45883232  T
Q  396 tgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggt 492  Q
    |  || ||| ||| || | | ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  45883233 ttgctgttttctacttctggcttgtgattataattgttccatacactttgttttggttgcttaactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggt 45883332  T
Q  493 gtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||||||    
T  45883333 gtgatttttcatcgaatt 45883350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 391
Target Start/End: Original strand, 24181522 - 24181668
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagtttt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  24181522 ggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcctccaaactaggtcagtttt 24181621  T
Q  345 ggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctc 391  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24181622 ggaccgaattgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctc 24181668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3315093
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---t 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||   ||||| ||| |||||||||   |    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtat 3314706  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||| | |     
T  3314707 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggg 3314806  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||     
T  3314807 ctttgggtaaaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctc 3314905  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctt--tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgt 421  Q
     |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||| |||   ||| | ||||||    
T  3314906 ccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgt-tttctac--gtttggcttgtgt 3315001  T
Q  422 ttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3315002 ttataattgttccatacactttgcttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttattattggtgtgttttctcatcgaatt 3315093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18099529 - 18099017
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt-gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  18099529 agatttgttccaaattttaagcgagacttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaa 18099432  T
Q  108 a--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gag 198  Q
       |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18099431 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18099332  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||     
T  18099331 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatca- 18099234  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctc-tttctt--tctctcg 394  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |||| ||||||  |||||||    
T  18099233 tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atatggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctcttttctttctctctcg 18099136  T
Q  395 ctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattg 490  Q
    |||| | ||| ||| |||| | ||||||||| ||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||    
T  18099135 ctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttacaattgttccatacactttgatttttgttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattg 18099037  T
Q  491 gtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  18099036 gtgtgatttttcatcgaatt 18099017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 32264402 - 32263898
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaa----ccttgagatagagggagctgaaaacaagagttta 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    | ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||    
T  32264402 agatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaa-caagggttta 32264304  T
Q  105 gaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat- 195  Q
    ||||  |||  |  ||||||  ||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  32264303 gaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 32264204  T
Q  196 gagtcttttggttacgcgaagaga-tggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactc 293  Q
    |||||| ||||||| | ||||||  |||| |||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32264203 gagtctcttggttatgggaagaggctgga-actttgggtagaattatgcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactc 32264106  T
Q  294 atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctt--tct 390  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||||||   |||||||| |||||||| |||||   |  ||||| ||||||| |||  |||    
T  32264105 atcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc-tatttggaccaaactggatcaacaattcttttgtgttctctcttcctttctct 32264007  T
Q  391 ctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttat 488  Q
    |||||||| ||| |||  |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||  | | ||||    
T  32264006 ctcgctgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgtctgattatcacttgctccacacatcaaatttgttat 32263910  T
Q  489 tggtgtgatttt 500  Q
    | ||||||||||    
T  32263909 tagtgtgatttt 32263898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421267
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---ta 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   ||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43421649  T
Q  131 gagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagac 226  Q
    | | || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||| |||| | |      
T  43421648 gtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattgggga 43421549  T
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-t 325  Q
    |||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||      
T  43421548 tttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagatggctgctctctcc 43421451  T
Q  326 cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttta 424  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||  |||| | |||||||||    
T  43421450 cccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tttatac--ttttggcttgtgttta 43421355  T
Q  425 taa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  43421354 taattgttccatacactttgttttggttgcttgactatatcttgctccacacatcaactttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 43421267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 25635428 - 25635781
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatg-agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   | ||    
T  25635428 acactagggttgggattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-gaag 25635526  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggac 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  || |  |||||||| |||  | ||||| ||  |||||||    
T  25635527 acttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaacagagggttgctctctcccctcggctaggcca-atttggac 25635625  T
Q  349 cgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctc-tctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttg 447  Q
    | |||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| ||    ||| ||| ||||| ||||||||||||||   |  ||| |||| |||    
T  25635626 caaactgcgtaaacaaatttcgtgtgttctcttctttctttcactcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataactgttacccac-ttgtattg 25635720  T
Q  448 gttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25635721 gttgcttgattattacttgctccacacatcaagta-tttattagtgtgattttcatcgaatt 25635781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13420395 - 13420186
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||    
T  13420395 acactagggttgag-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggag 13420298  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggacc 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13420297 acttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgctctctcaccagactaggtcagttttggacc 13420198  T
Q  350 gaactggataaa 361  Q
    ||| ||| ||||    
T  13420197 gaaatgggtaaa 13420186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423315
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 43423698  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |     
T  43423697 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 43423598  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||   |||||||||     
T  43423597 ctttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaactgagagctgctctctc 43423500  T
Q  326 cc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||  |||| | ||||||||    
T  43423499 cctgagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgtgttt 43423404  T
Q  424 ataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||  | | |||||||||| | |||||||||||||    
T  43423403 ataattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaactttgttattggtgtaatttttcatcgaatt 43423315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 11170302 - 11170664
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  11170302 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 11170400  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11170401 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 11170500  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
     | ||||||||| ||||||   | ||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  11170501 gtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 11170598  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||    
T  11170599 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttgggccgaactgggtcaacaaa 11170664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10956386 - 10955874
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||     
T  10956386 agatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaa-caagggtttagaat 10956288  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  10956287 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagt 10956188  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  10956187 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 10956090  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ct 390  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| || ||| ||||||       |    
T  10956089 atagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttctt 10955992  T
Q  391 ctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttatt 489  Q
    ||||| || | ||| ||| |||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||    
T  10955991 ctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttatt 10955894  T
Q  490 ggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10955893 ggtgtgattttcatcgaatt 10955874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 18162562 - 18163073
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatca-gagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  18162562 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaa-caagggtttagaa 18162658  T
Q  108 a--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gag 198  Q
    |  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||       | ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18162659 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18162758  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatca 297  Q
    ||| ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  18162759 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtg-ggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatca 18162857  T
Q  298 ttatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa-attcgtgtgtgctctctt-tctttctctcg 394  Q
     ||||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||  | ||||||  ||  ||||| ||||||| | |||||||||    
T  18162858 -tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctcttctttttctctcg 18162954  T
Q  395 ctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattg 490  Q
    ||| |  ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| || |||||||||  | | ||||||    
T  18162955 ctg-cagttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttactccacacatcaaatttattattg 18163053  T
Q  491 gtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  18163054 gtgtgatttttcatcgaatt 18163073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 42990364 - 42990710
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  42990364 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 42990462  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  42990463 actcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 42990560  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctctttc--tttc-tctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    | |||||| | |||| ||||| ||  |||| |||||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42990561 c-aaattcttttgtgttctctctccttttcttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataacttacatacactttgttttggttgcctgat 42990658  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  42990659 tatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttcatcgaatt 42990710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 509
Target Start/End: Original strand, 458179 - 458695
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    ||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  458179 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaa-caagggtttag 458277  T
Q  106 aaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-- 195  Q
    |||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||      
T  458278 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 458377  T
Q  196 gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||    
T  458378 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcat 458475  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa-attcgtgtgtgc-tctctttcttt---- 388  Q
    || ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||   ||||| | |||  ||||||        
T  458476 ca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-gttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgt 458573  T
Q  389 --ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattt 485  Q
       |||||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |    
T  458574 tcttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgt 458671  T
Q  486 tattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  458672 tattggtgtgattttcatcgaatt 458695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 43226145 - 43226488
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  43226145 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 43226243  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  43226244 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 43226341  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctg-tctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    | |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| | ||| |||  |||| | |||| ||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43226342 c-aaattcttgtgttctctcttccttttctctcgctgttgtttctac--ttttggcttgtattt-taattgttccatacac-ttgttttggttgcttgat 43226436  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    |||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43226437 tatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttctcatcgaatt 43226488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 157 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14634647 - 14634298
Alignment:
Q  157 gggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttat 255  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| || || ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||    
T  14634647 gggttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgat 14634548  T
Q  256 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggaccgaact 354  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||| ||  |||||||||| ||| || |||||||||    
T  14634547 tcttgtaaacctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggctaatctcatcagcagactaggttagtattagaccgaact 14634448  T
Q  355 ggataaacaaa-attcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgc 452  Q
     | ||||||||  ||||| | | |||||||||||||||||||      ||| ||| ||||   ||||||||| | || ||  ||||||| | ||||||||    
T  14634447 aggtaaacaaattttcgtattttctctctttctttctctcgc-----attttctactttttcctgtgtttattattttcacccactttgatattggttgc 14634353  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    || ||||  | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14634352 tttatta--atttgttccacacatcaagtattttattggtgtgattttcaacgaatt 14634298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 509
Target Start/End: Original strand, 455802 - 456318
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    ||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  455802 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaa-caagggtttag 455900  T
Q  106 aaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-- 195  Q
    |||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||      
T  455901 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 456000  T
Q  196 gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||    
T  456001 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcat 456098  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa-attcgtgtgtgc-tctctttcttt---- 388  Q
    || ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||| ||   ||||| | |||  ||||||        
T  456099 ca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-gggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgt 456196  T
Q  389 --ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattt 485  Q
       |||||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |    
T  456197 tcttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgt 456294  T
Q  486 tattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  456295 tattggtgtgattttcatcgaatt 456318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Original strand, 4666574 - 4666911
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggaga--cttattcttg 260  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||| ||| |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||  ||||||||||    
T  4666574 ggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagatccttattcttg 4666672  T
Q  261 taacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  4666673 taatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctc--cccagactaggtca-atttggaccgaactggatca 4666769  T
Q  361 acaaaattcgtgtgtgctctct-ttctt---tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgctt 454  Q
    || |||||| | |||| ||||| |||||   ||||||||||| ||| |||  |||| |||||| |||||||   || |||||||||| |||||||||| |    
T  4666770 ac-aaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgt-tttatac--ttttggtttgtttttataattgtttcatacactttattttggttgcat 4666865  T
Q  455 gattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||| || |||| || |||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  4666866 gataatcacttactccacacatcaaatttattattggtgtgatttt 4666911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 509
Target Start/End: Original strand, 746650 - 747170
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga------tagagggagctgaaaacaagagttt 103  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||      ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  746650 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaa-caagggttt 746748  T
Q  104 agaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat 195  Q
    |||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||||| ||  | | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  746749 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 746848  T
Q  196 --gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc 293  Q
      |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  746849 tggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactc 746946  T
Q  294 atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattc-gtgtgtgc-tctctttcttt-- 388  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||  ||||| | |||  ||||||      
T  746947 atca-tatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgt 747044  T
Q  389 ----ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggta 482  Q
         |||||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||     
T  747045 gttcttctcgcagt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt- 747142  T
Q  483 ttttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||    
T  747143 tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 747170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9604804 - 9604454
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  9604804 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 9604706  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||| | | ||    
T  9604705 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttagaccgaactaggtcaa 9604608  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctct--ttc-tttctctcgctgtctttttactattttt-gtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgctt 454  Q
    |||| | |  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |  |||| ||||||   || ||||||||||| ||||||| |||    
T  9604607 caaattcttttgtgttctctcttcttcttttctctcgctgt-tgttttctatttttggcctgtgattataattgtttcatacactttggtttggttactt 9604509  T
Q  455 gattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  9604508 gattattccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 9604454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18097260 - 18096747
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt-gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  18097260 agatttgtttcaaattttaagcgagacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaa-caagggtttagaa 18097162  T
Q  108 a--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gag 198  Q
       |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18097161 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18097062  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||     
T  18097061 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatca- 18096964  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct-ttctt--tctctcg 394  Q
    |||||||||| |||   ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| | | |||  ||||| | |||| ||||| |||||  |||||||    
T  18096963 tatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaac-gaattcttttgtgttctctcttctttctctctcg 18096866  T
Q  395 ctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattg 490  Q
    |||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||    
T  18096865 ctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattg 18096767  T
Q  491 gtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  18096766 gtgtaatttttcatcgaatt 18096747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22114664 - 22114368
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  22114664 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaa 22114566  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||| |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22114565 ggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 22114466  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    || ||||||||| ||||||   | || |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22114465 ctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 22114368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 6231861 - 6232201
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttag-gatgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||||||| | || |||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  6231861 ggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 6231958  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| | ||||| |||  ||| || |||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  6231959 acccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 6232056  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    | |||||| | |||| ||||| ||||||||||| |  | |||||  ||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6232057 c-aaattcttttgtgttctctcttctttctctctcgctgttttt--tatttttgacttgtgtttataattgttccatacactttattttggttgcttgat 6232153  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||    || |||||||||  | | ||||| |||||||||||||||||||    
T  6232154 tatta----ctccacacatcaaatttgttattagtgtgattttcatcgaatt 6232201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Original strand, 6484420 - 6484756
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||| | |  |||| |||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  6484420 ggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaagagattggggttttgggtagaattaggcg-ggaaacttattcttgta 6484518  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  6484519 acccattgatatcttttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 6484616  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgat 457  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  | ||||||||||| ||| |||  ||||   ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6484617 caaattcttttgtgttctctcttattctctctcgctgt-tttctac--ttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgcttaat 6484713  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||| |||||| |||||||||  | | ||||| ||||||||||    
T  6484714 tattccttgctccacacatcaaatttgttattagtgtgatttt 6484756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10084752 - 10084386
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggagctgaaaacaagagttta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    ||||||| |||| || |||| |||||    
T  10084752 agatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaa-caagggttta 10084654  T
Q  105 gaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat- 195  Q
    ||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  10084653 gaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatc 10084554  T
Q  196 gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10084553 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggag-ggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcat 10084455  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    || |||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  10084454 ca-tatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 10084386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28101855
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   |    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 28102237  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |     
T  28102236 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 28102137  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||     
T  28102136 ctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatca-tatagtggaacggatggctgctctctc 28102039  T
Q  326 cccaga-ctaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctt--tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgt 421  Q
    |||| | ||||||||  |||||||| |||| | | |||||| | |  ||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||| |||  |||| | ||||||    
T  28102038 cccaaagctaggtca-atttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgt-tttctac--ttttgggttgtgt 28101943  T
Q  422 ttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |  ||| | | || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||    
T  28101942 t--taattgctatccactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttattattggtgtaatttttcatcgaatt 28101855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1619018 - 1618836
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagata--gagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1619018 agatttgttccaattttatgagggatactttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttag 1618919  T
Q  106 aaacaaacaataaactagggttt-tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacact 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  1618918 aaacaaacaacaaactagggtttatagagatttctctaaacgggagacactagggttgggattgattcaccttggaaaacact 1618836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10958682 - 10958320
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||     
T  10958682 agatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaa-caagggtttagaat 10958584  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10958583 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 10958484  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||| | ||||||   || |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |    
T  10958483 ctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttca-t 10958386  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  10958385 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 10958320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Original strand, 32219144 - 32219485
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| || |||||||| | ||||||| | |||||||||   | ||||||||| |||||    
T  32219144 ggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcg-gaagacttatttttgta 32219242  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||| | |    
T  32219243 acccattgatatcttttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgcca-atttggaccgaactgggtca 32219340  T
Q  361 acaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgctt 454  Q
    ||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32219341 acaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgctt 32219439  T
Q  455 gattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||  |||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||    
T  32219440 gattatcccttgctccacacatcaagtttgttatttgtgtgatttt 32219485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 38889937 - 38890300
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggagctgaaaacaagagttta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   || |||| ||||||    ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  38889937 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat---agcaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagggttta 38890032  T
Q  105 gaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat- 195  Q
    ||||  |||  |  ||| ||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  38890033 gaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 38890132  T
Q  196 gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  38890133 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 38890231  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    || |||||||||  ||| | ||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  38890232 ca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 38890300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 53468651 - 53468312
Alignment:
Q  166 ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 264  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| | |||||| | ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  53468651 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcg-ggagacttattcttgtaac 53468553  T
Q  265 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct-cttcccag--actaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| |  |||||  |||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  53468552 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 53468454  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    |||| | |  ||||| ||||||| ||||||||  ||  || ||| ||| |||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  53468453 caaattcttttgtgttctctcttcctttctct--ctcgctattttctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgttttggctgctccat 53468356  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    ||||  ||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||    
T  53468355 tattcattgctccacacatcaagtttgttattggtgtggttttc 53468312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 3859426 - 3859787
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  3859426 agatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 3859524  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3859525 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 3859624  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| |    
T  3859625 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-t 3859721  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  | | | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  3859722 atagtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 3859787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5522974 - 5522624
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  5522974 agatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 5522876  T
Q  109 --caaacaataaactagggttttagagatttctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttt 203  Q
      |||  |  ||||||||||||        |||||  |    | ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  5522875 ggcaacaacaaaactagggtttg-------tctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctct 5522783  T
Q  204 tggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 303  Q
    |||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  5522782 tggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatag 5522686  T
Q  304 tggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||  ||| | ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  5522685 tggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 5522624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6063807 - 6063452
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  6063807 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 6063709  T
Q  107 aa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--g 196  Q
    ||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || ||| | ||  | | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |    
T  6063708 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 6063609  T
Q  197 agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc 296  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||    
T  6063608 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 6063511  T
Q  297 attatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactgg 356  Q
    | ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6063510 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgg 6063452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12268323 - 12267836
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12268323 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctg-aaacaagagtttagaaaga 12268225  T
Q  111 -aaca--ataaactagggttt---tagagatt-tctc-taagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
     ||||  | ||||||||||||   ||||| || |||| |  |    | |||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  12268224 caacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagt 12268125  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||||| |    
T  12268124 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatca-t 12268038  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctcgctg 397  Q
    |||||| ||  || | |||||||||  |||| ||||| |||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| ||||| ||||||||||| |      
T  12268037 atagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctctcttctttctctctcgt 12267940  T
Q  398 tctttt-tactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgt 494  Q
    | |||| |||  |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||  | | ||||||||||    
T  12267939 tgttttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgactattccctgctccacacatcaaatttgttattggtgt 12267842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6066156 - 6065640
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggag-ctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  6066156 agatttgttacagattttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaa-caagggtttagaa 6066058  T
Q  108 a--caaacaataaactagggttt-tagagattt---ctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--ga 197  Q
    |  |||  |  |||||||||||| || ||||||   ||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  6066057 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 6065958  T
Q  198 gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 297  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||    
T  6065957 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca 6065860  T
Q  298 ttatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattc-gtgtgtgc-tctctttcttt------ 388  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||| | |||||| |||  ||||| | |||| ||||||          
T  6065859 -tatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcag-attggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctccttctttgtgttc 6065762  T
Q  389 ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtatttt 486  Q
     |||||| || | ||| ||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||    
T  6065761 ttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgtt 6065664  T
Q  487 attggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  6065663 attggtgtgatttttcatcgaatt 6065640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 51727204 - 51727015
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  51727204 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 51727106  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaact 354  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51727105 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 51727015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 25533502 - 25533702
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25533502 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 25533600  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||| | ||    
T  25533601 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggactgaactgggtcaa 25533698  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  25533699 caaa 25533702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 247 - 509
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634287
Alignment:
Q  247 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttg 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||| | |||||||||| ||  ||||    
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggaca-atttg 25634128  T
Q  346 gaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctct-ctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgtt 444  Q
     |||||||| | |||||||| || |||||| |||| ||||||| |||| | ||    ||| ||| ||||| |||||||||||| |   |  ||| ||||     
T  25634129 caccgaactaggtaaacaaattttgtgtgttctctcctttcttactcttgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataattgttacccac-ttgta 25634223  T
Q  445 ttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25634224 ttggttgcttgattattacttgctccccacattaagta-tttattggtgtgattttcatcgaatt 25634287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 5191551 - 5192061
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  5191551 agatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 5191649  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5191650 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 5191749  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||     
T  5191750 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagactcattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcat- 5191846  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctct------ctttct-ttct-c 391  Q
    ||||||||   || | ||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||| | |||| |||      |||| | |||| |    
T  5191847 atagtggatcagagggctgttctctccccagactaggtcaattt-ggaccgaactgggtcaacaa-attcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttc 5191944  T
Q  392 tcgctgtctttttactatttttgt-ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattg 490  Q
    ||||  |  |||| ||| |||||  |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||    
T  5191945 tcgccattgtttt-ctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattg 5192042  T
Q  491 gtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5192043 gtgtgattttcatcgaatt 5192061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 1321539 - 1321890
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  1321539 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 1321637  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  1321638 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 1321735  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt------ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    | |||||| | |||| || ||| ||||||       |||||| || | ||| ||| |||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  1321736 c-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttaattgttccatacactttgttttggttgc 1321833  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
     |||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  1321834 ctgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttcatcgaatt 1321890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6562014
Alignment:
Q  41 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---tagagat 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| |    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 6561838  T
Q  136 t-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgt 231  Q
    | |||||  |    | ||||| |||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||     
T  6561839 tgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 6561938  T
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgga 307  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6561939 gtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtgga 6562014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 478
Target Start/End: Original strand, 51943292 - 51943748
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||     
T  51943292 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaag-gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 51943390  T
Q  129 --tagagatt-tctcta-agagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatg 221  Q
      ||||| || |||||  |||   | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||     
T  51943391 tatagagtttgtctctttagaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 51943489  T
Q  222 gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctc 321  Q
    | | ||||  |||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  51943490 ggggctttaggtagaattaggcg-ggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctc 51943586  T
Q  322 tct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tc----tttctctcgctgtctttttactatttttg 414  Q
    |||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | || ||||| ||||||| ||    ||||||||||||| ||| |||  |||| |    
T  51943587 tctcccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttctcttcttttctctcgctgt-tttctac--ttttgg 51943682  T
Q  415 tttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
     ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  51943683 cttgtgtttataattgttccaaacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatca 51943748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 246 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 27635773 - 27635514
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagtttt 344  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||| ||| ||||||||||| |||     
T  27635773 ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt- 27635676  T
Q  345 ggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt----tcttt-ctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact--tccatac 436  Q
    |||||||||||| | |||||| | |  ||||| |||||||    ||||| |||||||||| ||| ||||  ||| | |||||||||||| |  |||||||    
T  27635675 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttcttttctctcgctgt-tttctact--tttggcttgtgtttataattgttccatac 27635579  T
Q  437 actttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  27635578 actttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgattttc 27635514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 478
Target Start/End: Original strand, 26720446 - 26720927
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  26720446 agatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaa 26720544  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt-tagaga-tttctctaagagggaga--cactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  |||||||||||| || ||| ||| ||||   || | |  ||||||||||    |||||||| ||||||||  | ||| ||||||| ||||    
T  26720545 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagt 26720643  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
     | ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||     
T  26720644 ttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcat- 26720741  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctct------ctttct-ttct- 390  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| | | |||| ||| | |||| |||      |||| | ||||     
T  26720742 atagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaattt-ggaccgaactgggtcaccaaa-ttcttttgtgttcttctcttctttgtgttctt 26720839  T
Q  391 ctcgctgtctttttactatttttgt-ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    ||||  ||  |||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  26720840 ctcgtcgttctttt-ctacttttggcttgtatttataacttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatca 26720927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11008011 - 11007853
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggag-ctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggtttta 130  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11008011 atacttttactataaatataaaccttgtatcagatgaaaccttgagaggtagagagtctgaaagcaagggtttagaaacaaacaacaaactagggtttta 11007912  T
Q  131 gaga--tttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacact 187  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  11007911 gagagttttctctaagcgggagacacaagggttgtgagtgattcaccttgggaaacact 11007853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25688358 - 25688166
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25688358 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 25688260  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactgg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25688259 acccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgg 25688166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 298
Target Start/End: Original strand, 39715529 - 39715663
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  39715529 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgca 39715627  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715628 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 39715663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889779
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaactagggttt-taga 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    ||||| || ||||||||| || |    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaa-caagggtttagaatggcaacaa-aacctagggtttgtata 890007  T
Q  133 ga-tttctctaagagggag---acactagggttg--tggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    || ||| ||||   || |    ||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |     
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagttgggg- 889908  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||| | |||     
T  889907 ctttgggtagaattaggca-ggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgatttctc 889810  T
Q  326 cc-cagactaggtcagttttggaccgaactgg 356  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  889809 ccgcagactaggtca-atttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10621727 - 10621527
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  10621727 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 10621629  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||| | |    
T  10621628 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcag-attggaccgaactgggtca 10621532  T
Q  361 acaaa 365  Q
    |||||    
T  10621531 acaaa 10621527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 246 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 47701786 - 47701527
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagtttt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||  |||||| |||||||  |||    
T  47701786 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtca-attt 47701689  T
Q  345 ggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctcttt-ctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacacttt 441  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||| | || | ||||||| |||||||||  ||| ||| |||  |||| | ||||||| ||||   |||||||||||||    
T  47701688 ggatcgaactggatcaac-aaattcttttgcgttctctttcctttctctcattgt-tttctac--ttttggcttgtgttcataattgttccatacacttt 47701593  T
Q  442 gttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  47701592 gttttcgttgcttgattattacttgat---cacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 47701527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 1321339 - 1321437
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  1321339 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 1321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 47149092 - 47148795
Alignment:
Q  163 tggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  47149092 tggttgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 47148995  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||||  ||||||||| ||||  ||||| ||||||| | | |    
T  47148994 aacccattgatatctcttttgtatcgttactcatca-tatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtca-atttggcccgaactaggtca 47148897  T
Q  361 acaaa--attcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttg 455  Q
    |||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||| |  | ||||  ||| |||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  47148896 acaaattattc-tgtgttctctcttcctttctctctcgttgtttt--ctacttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgtttg 47148800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 509
Target Start/End: Original strand, 3306903 - 3307169
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttg 345  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||| |||||||||||  ||||    
T  3306903 ggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctc-tcctagactaggtca-atttg 3307000  T
Q  346 gaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctc--tcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactt 440  Q
    ||||||||| | | |||||| | |  ||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||| |||  |||| | ||||||||||||   || |||||||||    
T  3307001 gaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctttcgctgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattgtttcatacactt 3307097  T
Q  441 tg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtatt-ttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    || ||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3307098 tgtttttgattgtttgattatcccttgcttcatacatcaagttttgttattggtgtgttttctcatcgaatt 3307169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10191670 - 10191307
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga----gggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||    ||| |||| || |||| |||||||    
T  10191670 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaa-caagggtttaga 10191572  T
Q  107 aa--caaacaataaactagggtttt---agagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-ga 197  Q
    ||  |||  |  |||||||||||||   |||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10191571 aaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcga 10191472  T
Q  198 gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 297  Q
    |||| ||||||||  ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||    
T  10191471 gtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggag-ggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatca 10191374  T
Q  298 ttatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     |||||||||  ||| | ||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  10191373 -tatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 10191307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Original strand, 15780758 - 15780855
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  15780758 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 15780855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Original strand, 35777319 - 35777587
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  35777319 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 35777417  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gag 198  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  35777418 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 35777517  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 269  Q
    ||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  35777518 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Original strand, 24177177 - 24177274
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24177177 agatttgttccaaattttaagggatacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttaga 24177274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 51674963 - 51674625
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | || ||||  ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  51674963 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattaggcg-ggagacttattcttgta 51674865  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||  |||| || ||||||  ||||||||||||| | | ||    
T  51674864 atccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatactgaaatggagggctgctctctcccccataccaggtca-atttggaccgaacttggtcaa 51674767  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctct-ttctt---tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttata--acttccatacactttgttttggttgcttg 455  Q
    | |||||| | |||| ||||| |||||   ||||||||||| ||| |||  |||| | |||||||||||    |||||||| |  |  ||||||||||||    
T  51674766 c-aaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgtgtttatatttgttccatacccacttgtttggttgcttg 51674671  T
Q  456 attattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    |||||| |||||| || |||||| || | |||||||||||||||||    
T  51674670 attattccttgctccatacatcaagtttgttattggtgtgattttc 51674625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 30005901 - 30006101
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30005901 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 30005999  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||| ||| |||  ||||||||||||||| | ||    
T  30006000 actcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatca-atttggaccgaactgggtcaa 30006097  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  30006098 caaa 30006101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 50493897 - 50494259
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  50493897 agatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 50493995  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gag 198  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  50493996 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 50494095  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||     
T  50494096 tctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcg-gaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca- 50494192  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  50494193 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 50494259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 286
Target Start/End: Original strand, 23636947 - 23637205
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaa-ctagggttt- 128  Q
    |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||     
T  23636947 gataattttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggct-aaaacaagggtttagaagccaacaagaaaactagggtttg 23637045  T
Q  129 --tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
      |||||  | ||||  |    | |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| | | | ||||| ||   ||    
T  23637046 tatagagtctgctcttggcaacaaacactagggtttgggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattagga 23637145  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 286  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23637146 ctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttataaa 23637205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 25388966 - 25389165
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||    
T  25388966 ggttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacatattcttgt 25389063  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |    
T  25389064 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 25389160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 324
Target Start/End: Original strand, 29956746 - 29956905
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29956746 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 29956844  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||    
T  29956845 actcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctct 29956905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 38210430 - 38210630
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  38210430 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 38210528  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||   |||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  38210529 aactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcag-attggaccgaactgggtca 38210625  T
Q  361 acaaa 365  Q
    |||||    
T  38210626 acaaa 38210630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28413229 - 28413053
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatg--agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  28413229 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 28413131  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcag 340  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||    
T  28413130 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 28413053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 48362029 - 48361945
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  48362029 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaa 48361945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4104257 - 4103893
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gagatagagggagctgaaaacaagagtttag 105  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  4104257 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctg-aaacaagggtttag 4104159  T
Q  106 aaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tg 196  Q
    |||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  4104158 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 4104059  T
Q  197 agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc 296  Q
    ||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  4104058 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatc 4103961  T
Q  297 attatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    | |||||||||  ||| | ||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  4103960 a-tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 4103893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 11163048 - 11163146
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  11163048 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 11163146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 314
Target Start/End: Original strand, 54884214 - 54884364
Alignment:
Q  163 tggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||   ||||||| || ||||||  ||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  54884214 tggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggag-ggagacttatt-ttgt 54884311  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatg 314  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54884312 aatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatg 54884364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7606784 - 7606585
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  7606784 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 7606686  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || ||||||| |||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  7606685 acacattgatttct-atttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 7606589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591418
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttttaga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||        
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaa-caagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg--- 53591214  T
Q  133 gatttctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagacttt 229  Q
      | ||| ||  |   | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| || | || |||||| ||||||||| ||| ||||   || |||    
T  53591215 --tctctttagaac--aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggatttt 53591310  T
Q  230 gtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccca 329  Q
    | |||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || | | |  |||||||| ||||    
T  53591311 gggtagaattaggcg-ggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggatgctctctcccca 53591408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 388
Target Start/End: Original strand, 1674019 - 1674248
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||| |||||||| | ||||||| |||||| |||    ||||    
T  1674019 acactagggttaggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacg-ggag 1674117  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggac 348  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     ||    ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || |||    
T  1674118 acttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact-----tt----tggaacggatggctgctctctccaccagactaggtcagtattagac 1674208  T
Q  349 cgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttcttt 388  Q
    |||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||    
T  1674209 cgaactgggtaaacaaattttgtgtattctctctttcttt 1674248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 15780931 - 15781286
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||   ||||||||  |||||||||||   | |||||||||||||||    
T  15780931 ggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcg-gaagacttattcttgta 15781029  T
Q  263 acccattgata----tctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga---atggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaact 354  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   | ||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  15781030 acccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtca-atttggaccgaact 15781128  T
Q  355 ggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataac--ttccatacactttgttttggtt 450  Q
    || | |||||| | |  ||| | |||||||  |||||||| |  | ||||  ||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||  |    
T  15781129 gggtcaacaaattcttttgttttctctcttcttttctctctcgttgtttt--ctacttttgacttgtgtttataactgttccatacactttattttgcct 15781226  T
Q  451 gcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt-catcgaatt 509  Q
    ||||||||||  ||| || ||||||||| || | ||||||||||| |||| |||||||||    
T  15781227 gcttgattatcccttactccacacatcaagtttgttattggtgtgtttttccatcgaatt 15781286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4104092 - 4103743
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  4104092 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 4103994  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||  ||| | ||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  4103993 acccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcat-atagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaattt-ggaccgaactgggtcaa 4103897  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctct------ctttct-ttct-ctcgctgtctttttactatttttgtt-tgtgtttataacttccatacactttgttttggttgc 452  Q
    |||| ||| | |||| |||      |||| | |||| ||||| ||  ||||  || |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  4103896 caaa-ttcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctcgccgttgttttt-tacttttgacatgtatttataacttccatacactttttttcggttgt 4103799  T
Q  453 ttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||  |||||| ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  4103798 ttgactatc-cttgctccacgcatcaagtttgttattggtgtgattttcatcgaatt 4103743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Original strand, 41849371 - 41849463
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  41849371 ttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 41849463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 500
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886599
Alignment:
Q  165 gttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 263  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaa 5886358  T
Q  264 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    ||||||||| | ||||| | || |||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | |||    
T  5886359 cccattgatttgtcttt-gaaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt-ggaccgaactgggtcaac 5886455  T
Q  363 aaaattcgtgtgtgctctct-ttctttctctc---gctgtcttt--ttactatttttgt-ttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgct 453  Q
    ||| ||| | |||| ||||| |||||| |||    |||||  ||  || ||| |||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  5886456 aaa-ttcttttgtgttctctattctttttcttcttgctgttgttgttttctacttttggcttgtgattataactgttccatacactttgttt-ggttgct 5886553  T
Q  454 tgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    || ||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  5886554 tgtttatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 5886599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 365
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899931
Alignment:
Q  165 gttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 263  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||| ||| | | ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaa 5899831  T
Q  264 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 362  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  5899832 cccattgatttctc-tttgcaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 5899928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 394
Target Start/End: Original strand, 7768692 - 7768861
Alignment:
Q  225 actttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | | |  | ||| ||    
T  7768692 actttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttaatat-acctttgtaaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccct 7768790  T
Q  325 -tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcg 394  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7768791 cccccatactaggtcagtattggatcgaattgggtaaaaaaaattcgtgtcttctctctttctttctctcg 7768861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 168 - 339
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168336
Alignment:
Q  168 gatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 266  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||||||   | || |||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaaccc 11168263  T
Q  267 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtca 339  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  11168264 attgatttctcttttgtaacgttacttatca-tatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 11168336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35918140 - 35917997
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||  | || |||| |||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  35918140 ggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggag-ggagacttattcttgta 35918042  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  35918041 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatta-tatagtggaa 35917997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 46966787 - 46966647
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  ||   |||| |||    
T  46966787 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgccctc 46966689  T
Q  324 ttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    | |||||| ||||||| | |||||| ||| ||||||||||||    
T  46966688 tccccagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaa 46966647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 93
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181006
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa 28181006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 42297798 - 42297721
Alignment:
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt--ttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  42297798 tttgtgtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttgatatctttttgttgtaaagttactcatcattata 42297721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11007680 - 11007538
Alignment:
Q  195 tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 294  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||          ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11007680 tgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattaggttt----------tcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttactca 11007591  T
Q  295 tcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttgg 346  Q
    |||||||||||||||||  | || |||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  11007590 tcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtcagtattgg 11007538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701856
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctg-aaacaagggtttagaaa 47701856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10958245 - 10958170
Alignment:
Q  433 atacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  10958245 atacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 10958170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 509
Target Start/End: Original strand, 42992704 - 42992792
Alignment:
Q  421 tttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||  |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||    
T  42992704 tttataacttccatacactttgttttggttgtctgattatcccttgctctacacatcaagtttgttattagtgtgattttcatcgaatt 42992792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 32218993 - 32219091
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||    
T  32218993 agatttgttccaaattttaagtaatactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggttcagaaa 32219091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 10084313 - 10084240
Alignment:
Q  431 ccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  10084313 ccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcg 10084240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Original strand, 13893291 - 13893345
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatca 63  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13893291 agatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatatagacattgtatca 13893345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22114243 - 22114150
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  22114243 ttgtatttataactttcatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgctattggtgtgattttcatcgaatt 22114150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31021286 - 31021130
Alignment:
Q  237 attaggtttggagacttattcttgtaacccattgat-atctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactag 335  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||  ||||||||||    
T  31021286 attaggtttgaagactaattcttgtaacccttttaacatctcttt-gtaaagttactcatcattatattg-aacggagggctgctctcaccccagactag 31021189  T
Q  336 gtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcg 394  Q
    |||||| | ||| |||||| | |||| |||||||||||   |||||| ||| |||||||    
T  31021188 gtcagtataggatcgaactaggtaaaaaaaattcgtgttctctctctctctctctctcg 31021130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 10191236 - 10191164
Alignment:
Q  431 ccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  10191236 ccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatc 10191164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 11168432 - 11168512
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  11168432 ttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 11168512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 509
Target Start/End: Original strand, 24181669 - 24181742
Alignment:
Q  436 cactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24181669 cactttattttggttgcttgattattaatttctccacacatcaagtattttattagtgtgattttcttcgaatt 24181742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137556
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 28137556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 53893980 - 53893900
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc-atcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53893980 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcgatcgaatt 53893900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 108
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306795
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctg-aaacaagggtttagaaa 3306795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 93
Target Start/End: Original strand, 6484307 - 6484367
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6484307 tacttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa 6484367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Original strand, 13419926 - 13420085
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| |||  |||||||  | | |||| |||||||| |||| | ||    
T  13419926 acactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaag 13420025  T
Q  250 acttattcttgtaacccatt-gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaat 309  Q
    | | ||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13420026 aataatttttgtaacatttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaat 13420085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 85
Target Start/End: Original strand, 39715392 - 39715444
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39715392 tacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 39715444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 46966994 - 46966938
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga 65  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46966994 agatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaacattgtatcaga 46966938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468717
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctg-aaacaagggtttagaa 53468717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 43226008 - 43226082
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  43226008 tactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 43226082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 54691771 - 54691637
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| | ||||||||   | ||||| || ||||||||   |||||||||||||||||    
T  54691771 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcg-ggagacttattcttgta 54691673  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
       |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  54691672 tttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcat 54691637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6719470 - 6719396
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  6719470 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 93
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231431
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaa 6231431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15823778 - 15823646
Alignment:
Q  233 tagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccaga 331  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| | |   ||||||||| ||| |||    
T  15823778 tagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgacatctc-tttgtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaaga 15823680  T
Q  332 ctaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     || |||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  15823679 gtaagtcaatattggaccgaattgggtaaacaaa 15823646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 391
Target Start/End: Original strand, 27420784 - 27420938
Alignment:
Q  236 aattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagacta 334  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||   |    ||||||||  |||| | ||    
T  27420784 aattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttggaatct--tttgtaaagttactcatcattataatggaacatagagttgctctctcccccatagta 27420881  T
Q  335 ggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctc 391  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | | ||||| |||||| | ||||||    
T  27420882 ggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaattccatgtgttctctctctttttctc 27420938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100302
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 28100302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36011823
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctg-aaacaaggatttagaaa 36011823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48361868 - 48361737
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||| | | ||||  |||||||||||   | |||||| ||||||||    
T  48361868 ggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcg-gaagactttttcttgta 48361770  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    || |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  48361769 actcattgacatctcttttgcaacgttactcat 48361737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51675016
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 51675016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 25389238 - 25389308
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  25389238 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtatgatttt 25389308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635889
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 27635889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47878302 - 47878170
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctcttc-cc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   ||||||||| | ||    
T  47878302 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctcc 47878207  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  47878206 agactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaa 47878170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 51727341 - 51727267
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||    
T  51727341 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctg-aaacaagggtttagaaa 51727267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 409 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 880195 - 880091
Alignment:
Q  409 tttttgtttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga--ttttcatc 504  Q
    |||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| || | ||||||||||||  ||||||||    
T  880195 ttttggtttgtgattataactgtttcatacactttgttttctttgcttgattattccttactccacacatcaagtttattattggtgtgactttttcatc 880096  T
Q  505 gaatt 509  Q
    |||||    
T  880095 gaatt 880091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5522566 - 5522473
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  5522566 ttgtatttataactttcttacactttgattttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcaacgaatt 5522473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 54188560 - 54188691
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctcttccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||  |||   ||||||||| ||||    
T  54188560 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccca 54188655  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  54188656 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 54188691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691856
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggg 54691856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 4535614 - 4535798
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 279  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| | | || || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  4535614 aaacaccgttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggaattgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 4535708  T
Q  280 ttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct--tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||   |||||||||  |||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  4535709 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 4535798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 4663843 - 4663880
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacc 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4663843 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacc 4663880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 5886183 - 5886240
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagag 66  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5886183 agatttgttacagattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttttatcagag 5886240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 5899658 - 5899715
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagag 66  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5899658 agatttgttacagattttaagcgagacttttactataaatatagaccttttatcagag 5899715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10621468 - 10621373
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttg--ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  10621468 ttgtatttataactttcatacactttggtttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 10621373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 25533756 - 25533835
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  25533756 ttccatacactttgttttggttgcttga-tatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 25533835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28137501 - 28137424
Alignment:
Q  166 ttgatttaccttgggaaacactgttaggatg-agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattagg 242  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  28137501 ttgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 28137424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29914084 - 29913954
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatga-ctgctctct-tccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| || || || |||||||||  ||||    
T  29914084 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtgg-atcgaagagctgctctctccccca 29913990  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  29913989 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 29913954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 41849041 - 41849114
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  41849041 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagacattgtatcaggctaaactttgagagagag 41849114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 50494330 - 50494410
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  50494330 ttccatacgctttgttttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 50494410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 51726933 - 51726854
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  51726933 ttccatacactttgattttggttgcctgattatt-cttgccccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 51726854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28100238 - 28100143
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattctt 259  Q
    |||||||| ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  28100238 ggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 53896555 - 53896479
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  53896555 agatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 53896479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4560395 - 4560352
Alignment:
Q  258 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4560395 ttgtaacccattaatatctcttttgcaaagttactcatcattat 4560352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Original strand, 25388796 - 25388851
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25388796 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag 25388851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 28181330 - 28181400
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  28181330 ttccatacactttgttttggttgtttgatt-gtccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt 28181400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 35918284 - 35918210
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  35918284 tactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 35918210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 4560602 - 4560540
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4560602 gatactttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaa 4560540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16997060
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 279  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||  |||| || | || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |  | |||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattaggtttgaagactaattcttataattctctaatatctctt 16996973  T
Q  280 ttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |   ||||  || |||||||||||||||| |||  ||||||| ||  |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  16996974 tgtaaaagaaacacatcattatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggtaagtatgggactgaactgggtaaacaaa 16997060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28412969 - 28412877
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg-attttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||  |||||||||||||    
T  28412969 ttgtatttataactttcatacactt-gttttggttacttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgttttttcatcgaatt 28412877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 365
Target Start/End: Original strand, 42992418 - 42992530
Alignment:
Q  252 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccg 350  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |  ||  | |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  42992418 ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccg 42992515  T
Q  351 aactggataaacaaa 365  Q
    |||||| | ||||||    
T  42992516 aactgggtcaacaaa 42992530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 89
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884135
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagct 89  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagct 54884135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7606530 - 7606450
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||||    
T  7606530 ttccatacactttgattttggttgcttgactatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtatttttcatcgaatt 7606450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 11170701 - 11170781
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||    
T  11170701 ttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagt-tgttattaatgtgattttcatcgaatt 11170781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10612909 - 10612761
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||  |||    
T  10612909 gtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 10612814  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct 382  Q
    |||||||||||   || ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  10612813 agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaac-aaattcttgtgttctctct 10612761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 308
Target Start/End: Original strand, 13893477 - 13893589
Alignment:
Q  195 tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc- 293  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||  ||||     
T  13893477 tgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttgg-gtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tcaatatctc-tttgtaaagaaactca 13893573  T
Q  294 -atcattatagtggaa 308  Q
     |||||||||||||||    
T  13893574 tatcattatagtggaa 13893589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 26762863 - 26762919
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga 65  Q
    ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26762863 agatttgttccaattttttagggatgcttttactataaatataaaccttgtatcaga 26762919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 500
Target Start/End: Original strand, 5899988 - 5900072
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  5899988 ttgtgattataactgttccatacactttgttt-ggttgcttgtttatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 5900072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 10897056 - 10897188
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||  |||   |||||||||  |||    
T  10897056 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccc 10897151  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  10897152 agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 10897188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Original strand, 26763081 - 26763169
Alignment:
Q  222 gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt---gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26763081 gagacttcgggtagaattaggtttgaagtttaattattgtaacccttttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattataatggaa 26763169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 242
Target Start/End: Original strand, 28181082 - 28181161
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattagg 242  Q
    |||||||| || |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  28181082 ggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattagg 28181161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Original strand, 38210266 - 38210321
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38210266 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataggccttgtatcag 38210321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 499
Target Start/End: Original strand, 38890371 - 38890441
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt 499  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  38890371 ttccatacgctttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattt 38890441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 562122 - 562060
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaa 70  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  562122 agatttgttccatttttataagggataattttactataaatatagactttgtattagagtaaa 562060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 10621900 - 10621846
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10621900 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 10621846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 53973819 - 53973733
Alignment:
Q  222 gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||  ||||  ||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  53973819 gagactttaggtagaattatgtttaaagaccgattcttgtatccatttaatatcttttttgtaaagttactcatcaatgtagtggaa 53973733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10094205 - 10094074
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   |||||||||  ||||    
T  10094205 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 10094110  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  10094109 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 10094074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10208131 - 10208000
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-ca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   ||||||||| || ||    
T  10208131 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgca 10208036  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  10208035 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 10208000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 339
Target Start/End: Original strand, 11079568 - 11079674
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||  |||    
T  11079568 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 11079663  T
Q  329 agactaggtca 339  Q
    |||||||||||    
T  11079664 agactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13420509 - 13420437
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagttta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||    
T  13420509 gatacttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctg-aaacaagggttta 13420437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 27544324 - 27544455
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-ca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   ||||||||| || ||    
T  27544324 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctca 27544419  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  27544420 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 27544455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31021508 - 31021431
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaat-tttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagag 83  Q
    |||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  31021508 gagatttgttccaattatttgagagatggttttactataaatatagaccttgtatcaaatgtaaaccttgagagagag 31021431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 38210702 - 38210782
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  38210702 ttccatacgctttgttttgtttgtttgataatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 38210782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 42990181 - 42990234
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatca 63  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42990181 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 42990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 478
Target Start/End: Original strand, 53591509 - 53591558
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  53591509 ttccatacattttgttttggttgcttgattatcccttgttccacacatca 53591558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10949388 - 10949259
Alignment:
Q  235 gaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccaga 331  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||| |||   |||||||||  ||||||    
T  10949388 gaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattataatggaacggagagctgctctctcccccaga 10949293  T
Q  332 ctaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||   || ||| ||||||||||||||||    
T  10949292 ctaggtcatcattagactgaactggataaacaaa 10949259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Original strand, 23941887 - 23941952
Alignment:
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 294  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||  |  |||||||||||||||||||    
T  23941887 tttgggtagaattaggtttgaatacttattcttgtaaccgtttggaa--tcttttgtaaagttactca 23941952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 64
Target Start/End: Original strand, 25533355 - 25533387
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25533355 atacttttactataaatatagaccttgtatcag 25533387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 65
Target Start/End: Original strand, 25635318 - 25635374
Alignment:
Q  10 gatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga 65  Q
    |||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25635318 gatttgttccaattttatgagggatgcttttactataaatatagactttgtatcaga 25635374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27762153 - 27761985
Alignment:
Q  195 tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc- 293  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||| | | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||     
T  27762153 tgagtctcttggtcacgggaagaggttgggacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactca 27762059  T
Q  294 -atcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||||||||||| |||  || ||||| |  |||| |||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  27762058 tatcattatagtggaacggagaaccgctctatcccccaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 27761985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 54691501 - 54691457
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacat 476  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  54691501 catacattttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacat 54691457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1855 - 1500
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||| ||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||    
T  1855 acactagggttgtggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggag 1757  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggac 348  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||  |||| |||||||||||||| |||    
T  1756 agttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgac 1657  T
Q  349 cgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttg 447  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||| |||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1656 cgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttcttttctctcattgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataacttccatacactttg-tttg 1561  T
Q  448 gttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||    
T  1560 gttgcttgattattacttgctccacacatcaaata-tttattggtgtgattttcattgaatt 1500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1895
Alignment:
Q  44 taaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||    
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctg-aaacaagggtttagaa 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 112)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13828702 - 13828184
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    |||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  13828702 gagatttgttccaattttttagggattcttttactataaatatagaagttgtatgagatgaaaccttgagagagaggg-gctgaaaacaaggatttagaa 13828604  T
Q  108 acaaacaataaactagggttttaga--gatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgtt-aggatgag--tctt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |  | |||  ||||    
T  13828603 acaaacaataaactagggttttagagggatttctctaagcgagagacattagggttgtgagtgattcaccttaggaaacactgttaattaggagtctctt 13828504  T
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattata 13828404  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgt-------------gctctctttcttt 388  Q
    ||||||  | |  || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||             ||||||| ||| |    
T  13828403 gtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttcttttttctttggctctctctctct 13828304  T
Q  389 ctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtatttta 487  Q
    ||||| |    | ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||  ||| ||| | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||    
T  13828303 ctctctcccgttgttttctacttttgtttgtgtttataactgtcacccacgttgatattggttgcttgattatt--ttgctccacacatcaaatatttta 13828206  T
Q  488 ttggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  13828205 ttggtgtgatttttaacgaatt 13828184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 17897581 - 17897125
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaa-ctagggttt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| |  |||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  17897581 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaagtcaacaataaaactagggttt 17897483  T
Q  129 ---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggag 224  Q
       ||||| || ||||  |    | |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | | ||| |||| |||    
T  17897482 gtatagagtttgctcttcgcaacaaacactagg-ttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgag 17897384  T
Q  225 actttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct 324  Q
    | |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  17897383 attttgagtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctct 17897285  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttta 424  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||    ||| ||| ||||| |||||||||    
T  17897284 ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgttta 17897189  T
Q  425 taacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattg 490  Q
    |||||  |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17897188 taactgtcatcaactttgttttggttgcttgattatt--ttgctccacacatcaagtattttattg 17897125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11578465 - 11577975
Alignment:
Q  10 gatttgttccaaattttaagcgata-cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||     
T  11578465 gatttgttccaatttttgagggattgcttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaa-caagggtttagaag 11578367  T
Q  109 caaacaataaa-ctagggttt-tagaga-tttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctttt 204  Q
      ||||| ||| ||||||||| || ||| ||| |||    |  | | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  11578366 tcaacaaaaaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaactagggttggggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctctt 11578267  T
Q  205 ggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 304  Q
    ||| ||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11578266 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagt 11578168  T
Q  305 ggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctc-tttctttctctcgctgtcttt 402  Q
     ||| ||| | ||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| ||| |||    
T  11578167 cgaacggagggctgctctttcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatttcgtgtgttttctcttttctttctctcgttgt-ttt 11578069  T
Q  403 ttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
     |||  |||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  11578068 ctac--ttttggcttgtgttta-aacttccatatactttattttggttgcttgattattacttgttccacacatcaagt-ttttattaatgtgatttt 11577975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6259172 - 6258669
Alignment:
Q  13 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-a 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||   |    
T  6259172 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaa-caagagtttagaaaggca 6259074  T
Q  112 acaataaa-ctagggttt-tagaga-tttctctaagagggaga--cactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttt 203  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||   || | |  ||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  6259073 acaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 6258974  T
Q  204 tggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 303  Q
    |||||||| |||||  | | | ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6258973 tggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatag 6258877  T
Q  304 tggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctt--tctctcgctgtct 400  Q
    || || ||| | ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| |||  ||||||||||| |    
T  6258876 tgaaacggagggctgctctctccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgt-t 6258779  T
Q  401 ttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatt 498  Q
    || |||  |||| | ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||| || ||    
T  6258778 ttctac--ttttagcttgtgtttataattgttccagacactttgttttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttattggtatgttt 6258681  T
Q  499 t-tcatcgaatt 509  Q
    | ||||||||||    
T  6258680 tctcatcgaatt 6258669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 168 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28459385 - 28459045
Alignment:
Q  168 gatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 266  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| | | | |||   ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28459385 gattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtttggggcttcaggtataattaggtg-ggagacttattcttgtaaccc 28459287  T
Q  267 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaa 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||| || ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||     
T  28459286 attgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggcttctctctacctagactaggtcaattt-ggatcgaactagataaacaaat 28459188  T
Q  367 t-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattattac 463  Q
    | |  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||  ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28459187 tcttttgtgttctctctttctttctctccctgt-tttctact--tttggtttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattatcac 28459091  T
Q  464 ttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28459090 ttgctccacacatcaagtgttttattggtgtgattttcatcgaatt 28459045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 509
Target Start/End: Original strand, 40699419 - 40699771
Alignment:
Q  153 actagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagac 251  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40699419 actagggtt-tggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagac 40699517  T
Q  252 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccg 350  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  |||||| |  |||||||||||||||| || |||||    
T  40699518 ttatttttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccg 40699617  T
Q  351 aactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact-tccatacactttgttttggt 449  Q
    |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    |||| ||| ||||| |||||||||||| | | |  ||| ||  | |||||    
T  40699618 aactaggtaaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctctcgct---atttttctacttttgcttgtgtttataattgttctcaca-ttgatattggt 40699713  T
Q  450 tgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  40699714 tacttgattatt--ttgctccacacatcaagtaatttattgatgtgatttccatcgaatt 40699771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 224 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 31732915 - 31732667
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  31732915 gactttgggtagaattaggtg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctc 31732817  T
Q  324 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtt 422  Q
    |  ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||| |    
T  31732816 tcccccagactaggtca-atttggaccgagctgggtaaac-aaattcgtgtgttctctatct-tttctctcgctgt-tttctac--ttttggtttgtgat 31732723  T
Q  423 tataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31732722 tataacttccatacactctgttttggttgcttgattataacttgcttcacacatca 31732667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18800663 - 18800312
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||    
T  18800663 agatttgttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaa-caagggtttagaaa 18800565  T
Q  109 caaacaataaactagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctttt 204  Q
      ||       |||||||||   ||||| || ||||  |    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  18800564 tcaag------ctagggtttgtatagaggttgctcttggcaacaaacactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 18800472  T
Q  205 ggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 304  Q
    ||| ||  |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18800471 ggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggag-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagt 18800373  T
Q  305 ggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    | || ||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18800372 gaaacggagggctactctctccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaa 18800312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 35107194 - 35107694
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  || ||| |||||||||||||     
T  35107194 agatttgttccaaattttaagggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttagaag 35107292  T
Q  109 caaacaataaa-ctagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttt 203  Q
      ||||| ||| |||||||||   ||||| || ||||  |    | |||   |||||| | |||||| |||||| |||||| | ||||||| |||||| |    
T  35107293 tcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaaca---gggttgggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctct 35107389  T
Q  204 tggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttgga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    |||| ||| |||||||| | ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35107390 tggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaacct-ttgttatctcttttgtaatgttactcatcattata 35107488  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctc-ttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa-attcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtc 399  Q
    |||||| |||||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||      
T  35107489 gtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttctctctttcttttctctcgctg-- 35107586  T
Q  400 tttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt 499  Q
    ||||| |||  |||  || ||||||||| |  ||  ||| || ||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  35107587 ttttttctacctttacttatgtttataattgtcactcac-ttattttaattgcttgattattacttgcaccacatatcaagta-tttattggtgtgattt 35107684  T
Q  500 tcatcgaatt 509  Q
    ||| ||||||    
T  35107685 tcaacgaatt 35107694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6264506 - 6264000
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  6264506 agatttgttccaaattttaagcgatatttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaag-gtttagaaa 6264408  T
Q  109 ca-aacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtc 200  Q
       ||||| |||   ||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  6264407 ggcaacaacaaa---gggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtc 6264311  T
Q  201 ttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 300  Q
    | |||||||||  || |||| | | |||||  |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264310 tcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 6264212  T
Q  301 tagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 398  Q
    ||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| |  |    
T  6264211 tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgtt 6264113  T
Q  399 ctttt-tactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
     |||| |||  |||  | ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||| || | ||||| |||||    
T  6264112 gttttctac--tttcggcttgtgttaataattgttccatacactttgttttggttgcctgatagtcacttgctccacacatcaagtttgttattagtgtg 6264015  T
Q  496 attt-tcatcgaatt 509  Q
     ||| ||||||||||    
T  6264014 ttttctcatcgaatt 6264000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40032419 - 40032052
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  40032419 agatttgttccaagttttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 40032321  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40032320 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 40032221  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    || ||||||||  |||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  40032220 ctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgt-gagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcat 40032122  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||| || ||| | | ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  40032121 cattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 40032052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 42064409 - 42064771
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42064409 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctg-aaacaagggtttagaaa 42064507  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42064508 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 42064607  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   |||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||| |    
T  42064608 ctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-t 42064704  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  42064705 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 42064771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837672
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggtttt--- 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||| | ||||| ||| |||||||||        
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaa-caagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtac 14837291  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    | || || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||      |||||||| ||||    
T  14837292 atagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgaga 14837385  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||  |||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||     
T  14837386 ctttaagtagaattaggcgggg-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctc 14837484  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctt--tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgt 421  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||||| | |  ||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||| |||  |||| | ||||||    
T  14837485 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgctgt-tttatac--ttttggcttgtgt 14837580  T
Q  422 ttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtatt-ttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  14837581 ttataattgttctatacactttgttttggttgcttgattatcacttgctccacacatcaagtattgttattgatgtgatttctcatcgaatt 14837672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20146821 - 20146476
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||| ||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||   ||||    
T  20146821 acactatggttgggattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcg-ggag 20146723  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggac 348  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  20146722 acttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggac 20146623  T
Q  349 cgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-tt 444  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||    ||| ||| ||||| ||||||||||||   ||||   ||  ||| |     
T  20146622 cgaactgggtaaacgaatttcgtgtgatctctctttcttttctctcgttg----ttttctacttttgcttgtgtttataattgttcc---catgttgata 20146530  T
Q  445 ttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20146529 ttggttgcttgattact--ttacttcacacatcaagtattttattggtgtgatttt 20146476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 326 - 500
Target Start/End: Original strand, 20592296 - 20592466
Alignment:
Q  326 cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttat 425  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | | ||    ||| ||||| ||||| ||||    
T  20592296 cccagactaggtcagtattggaccgaattggataaacaaatttcgtgtgttctctctttctttctcttgatatttt----ctacttttgcttgtgattat 20592391  T
Q  426 aacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20592392 aacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctctacacatcacgtattttattggtgtgatttt 20592466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 305
Target Start/End: Original strand, 20589662 - 20589888
Alignment:
Q  87 gctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggtttt-agagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgattt-----accttggg 180  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||| |||     ||||||      
T  20589662 gctgaaaacaatggtttagaaacaaagaataaactagggtttagagagatttctcta-gcgggaggcactatggttgtgattgttttggttcaccttgaa 20589760  T
Q  181 --aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
      ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20589761 caaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctc 20589860  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtg 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20589861 ttttgtgaagttactcatcattatagtg 20589888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22287695 - 22287188
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa-- 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||      
T  22287695 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaa-caagggtttagaaagg 22287597  T
Q  109 caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtct 201  Q
    |||  |  ||||||||||||   |||||  | |||||  |    | ||| |||||||    |||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  22287596 caacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtct 22287497  T
Q  202 tttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
     || |||||| |||||||| || |||| | |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22287496 cttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcg-ggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatca-tat 22287399  T
Q  302 agtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtc 399  Q
    |||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||  ||  |    
T  22287398 agtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctct--ctcgc 22287302  T
Q  400 tttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
    | ||| |||  ||||  |||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||     
T  22287301 tgttttctacgtttgacttgtttttataattgttccatacactatgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgt 22287202  T
Q  497 ttt-tcatcgaatt 509  Q
    ||| ||||||||||    
T  22287201 tttctcatcgaatt 22287188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19008033
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---t 129  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||| || |||||   |    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtat 19007658  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||| | |||||||| | |     
T  19007659 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattgggg 19007758  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | | | |||||||||     
T  19007759 ctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctc 19007856  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct-ttc-tttctctcgctgtctttt-tactatttttgtttgtgt 421  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||| |||||| | |||| ||||| ||| |||||||| |  | |||| |||  |||| | ||||||    
T  19007857 ccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaac-aaattcttttgtgttctctattcatttctctctcgttgttttctac--ttttggcttgtgt 19007952  T
Q  422 ttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  19007953 ttataattgttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt 19008033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19502372 - 19502010
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19502372 agatttgatccaaattttaagggaaaattttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaa-caagagtttagaaa 19502274  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19502273 ggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 19502174  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |    
T  19502173 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-t 19502076  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  | | | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  19502075 atagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 19502010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 27104693 - 27105053
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  27104693 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggttcagaaa 27104791  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  ||   | | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27104792 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 27104890  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |    
T  27104891 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatca-t 27104987  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  27104988 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 27105053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849510
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggttt---t 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||| |||| |||    |    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtat 17849135  T
Q  130 agagatttc-tctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
    |||| || | |||  |   || |||||||||||    |||||||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||    
T  17849136 agagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgaga 17849235  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctctt 325  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||     
T  17849236 ctttgggtagaattaggcg-ggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctc 17849333  T
Q  326 cc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttt-tactatttttgtttgtgtt 422  Q
    || || |||||||||  |||||||   ||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| |  | |||| |||  |||| | |||||||    
T  17849334 ccacatactaggtca-atttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctcccgttgttttctac--ttttggcttgtgtt 17849430  T
Q  423 tataa--cttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    || ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  17849431 taaaattgttccatacactttgttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt 17849510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Original strand, 42452678 - 42453036
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa- 108  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||     
T  42452678 atttgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaag 42452776  T
Q  109 -caaacaataaactagggttt-tagaga-tttctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtctt 202  Q
     |||  |  ||||||| |||| || | | ||| |||  |    | ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  42452777 gcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctctgtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 42452876  T
Q  203 ttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 302  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42452877 ttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tata 42452974  T
Q  303 gtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  42452975 gtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 42453036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19504706 - 19504345
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  19504706 agatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 19504608  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttg--tggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19504607 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 19504508  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |    
T  19504507 ctcttggttacg-gaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-t 19504411  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||| | ||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  19504410 atagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 19504345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5375544 - 5375229
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  5375544 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc--ggagacttattcttgta 5375447  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  5375446 acccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 5375349  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctc--gctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttga 456  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||  ||||| |||||||  ||||   |||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5375348 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcttgctgtttttttac--ttttgacttgtatttataattgttccatacactttgttttgattgcttga 5375251  T
Q  457 ttattacttgcttcacacatca 478  Q
    ||||  ||| || |||||||||    
T  5375250 ttatcccttactccacacatca 5375229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 21521056 - 21520541
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||  |||| || ||||||| |||| |||||||    
T  21521056 agatttgttccaaaatttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaa-caagggtttaga 21520958  T
Q  107 aa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-ga 197  Q
    ||  |||  |  ||||||||| ||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  21520957 aaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattga 21520858  T
Q  198 gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 297  Q
    |||| ||||||||  ||||||     ||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21520857 gtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcg-ggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca 21520759  T
Q  298 ttatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt--tctttctctc 393  Q
     ||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||   | |||||| | |  ||||| |||||||  | | ||||||    
T  21520758 -tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttctctcttcgtttctctctc 21520661  T
Q  394 gctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacacttt-gttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttatt 489  Q
    ||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||    
T  21520660 gctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataattgttccatacactttaattttggttgcctgattatcacttgctccacacatcaagtttgttatt 21520562  T
Q  490 ggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  21520561 ggtgtgttttctcatcgaatt 21520541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43623929 - 43623430
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||| |||  |||||||||    
T  43623929 agatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaa-caatggtttagaaa 43623831  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt-tagaga-tttctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtct 201  Q
      |||  |  |||||||||||| || ||| ||| |||          ||||||| ||    |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  43623830 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct----------cactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtct 43623741  T
Q  202 tttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
     ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43623740 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tat 43623643  T
Q  302 agtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtc 399  Q
    ||||||| ||| | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||| | | |||||| | |  ||||| |||||||  |||||||||||||     
T  43623642 agtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt- 43623545  T
Q  400 tttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacacttt-gttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
    | ||| ||| |||| | || || ||||||   |||||||||||||  |||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| ||   |||||||||||    
T  43623544 tgttttctacttttggcttatgattataattgttccatacactttaattttggttgcctgattatctattgctccacacatcaagttagttattggtgtg 43623445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 27136338 - 27136031
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||| |||  |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27136338 acactagggttggggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattaggtttggag 27136239  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggac 348  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||  || |  || ||||| ||| | |||| |||||| ||||||    
T  27136238 acttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc-------tagtagaacagagggttgttctctccccaaaactaagtcagtattggac 27136146  T
Q  349 cgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttt--- 445  Q
    |||||||  |||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| ||   ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||       
T  27136145 cgaactgagtaaacaaattttatgtgttctctttttctttctctcgttgttttttcac---ttttgcttgtgtttataactgtaatacactttgtttgtt 27136049  T
Q  446 -tggttgcttgattatta 462  Q
     |||||||||||||||||    
T  27136048 ctggttgcttgattatta 27136031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739558
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaa-taaactagggttt---t 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| | |||||  ||| ||||||||   |    
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctg-gaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtat 11739797  T
Q  130 agagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
     ||| || |||||  |    | || ||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||   |||||||| | ||    
T  11739796 ggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattggga 11739697  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  11739696 ctttgggtagaattagg-cgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc 11739598  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  11739597 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 11739558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13910405 - 13910044
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  13910405 agatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 13910307  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  13910306 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagt 13910207  T
Q  200 cttttggttacgcgaagaga-tggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    || ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||     
T  13910206 ctcttggttacgggaagagactgga-actttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca- 13910111  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||   |||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  13910110 tatagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 13910044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 42923708 - 42923373
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  42923708 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 42923610  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| | ||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  42923609 atccattgatatctcttttgtaaagttactcgtca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 42923512  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttga 456  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  |||||||| ||   | ||| ||| |||||  ||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42923511 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctctctcgttgttttctacttttgacttgtgtttataattgtttcatacactttgtttttggttgcttga 42923412  T
Q  457 ttattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
    ||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  42923411 ttatctcttgctccacacatcaagtttgttattggtgtg 42923373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 500
Target Start/End: Original strand, 28196693 - 28197028
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||    
T  28196693 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcg-gaagatttattcttgta 28196791  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||    
T  28196792 acccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtcaatt---gaccgaactgggtcaa 28196887  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctct-ttctt---tctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttg 455  Q
    | |||||| | |||| ||||| |||||   ||||||||||| ||| |||  |||| | ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |    
T  28196888 c-aaattcttttgtgttctctcttcttttctctctcgctgt-tttctac--ttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgctgg 28196983  T
Q  456 attattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    | |||  |||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  28196984 actatcccttgctccacacatcaaatttgttattggtgtgatttt 28197028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 478
Target Start/End: Original strand, 17848500 - 17848810
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||   ||    ||||||||||||||||    
T  17848500 ggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaaggcgg----gagacttattcttgta 17848595  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| ||||||| | ||    
T  17848596 acc-attgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtca-atttggactgaactgggtcaa 17848692  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgat 457  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||   || ||||||||  | |||||||||||||||    
T  17848693 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgctgt-tttctac--tttttgtttgcgtttataattgtttcatacactgcgattttggttgcttgat 17848789  T
Q  458 tattacttgcttcacacatca 478  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  17848790 tatcacttgctccacacatca 17848810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 509
Target Start/End: Original strand, 22874174 - 22874512
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||| || || ||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||||  ||||    
T  22874174 acactatggttg-ggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtg-ggag 22874271  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggac 348  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||   ||||||||| || || |||||||||  |||||||    
T  22874272 acttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccctcatactaggtca-atttggac 22874370  T
Q  349 cgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgtttt 446  Q
    |||| ||| |||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||| |||                      ||||||||||||||||||||||||||    
T  22874371 cgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctctctttcttttctctcgttgt----------------------tttataacttccatacactttgtttt 22874448  T
Q  447 ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
     ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  22874449 agttgcttgactatcacttgctccacacatcaagtttattattggtgtgatttttcatcgaatt 22874512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23452436 - 23452236
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23452436 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtg-ggagacttattcttgta 23452338  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  23452337 acccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 23452240  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  23452239 caaa 23452236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 35218162 - 35217962
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35218162 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgt 35218064  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  35218063 aacccgttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 35217967  T
Q  361 acaaa 365  Q
    |||||    
T  35217966 acaaa 35217962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45280322 - 45279849
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca--aacaa-taaactagggttt- 128  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |  |||||  ||||||||||||     
T  45280322 tactttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttg 45280224  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || |||||  |    | |||||||| ||    |||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||   |    
T  45280223 tatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 45280124  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
     ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||    
T  45280123 ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 45280026  T
Q  323 ct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtg 420  Q
    ||  ||||||||||||||  |||||||| |||||| | ||| |||||| | |||| |||         |||||| || | ||| ||| |||| | ||||     
T  45280025 ctcccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaac-aaattcttttgtgttct---------tctcgccgt-tgttttctacttttggcttgta 45279938  T
Q  421 tttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  45279937 tttaattgttccatacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttctcatcgaatt 45279849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 392
Target Start/End: Original strand, 33604009 - 33604206
Alignment:
Q  195 tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 294  Q
    ||||||||||||| | | |||| ||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33604009 tgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaaccttttgatatatcttt-gtaaagttactca 33604107  T
Q  295 tcattatagtggaatggatgactgctctcttccc--agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctct 392  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||| || || ||||| | |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  33604108 tcattatagtggaacggatgactgctctctcccccaaga-tagatcggtattggaacaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttatctctttctttctct 33604206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Original strand, 35028472 - 35028967
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |  | |||||  || |||||||    
T  35028472 gagatttgttccaattttttagggatacttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttgaattagagag-ccggaaaaacagggtttaga 35028570  T
Q  107 aacaaacaat-aaactagggttt-tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttt 203  Q
    | | |||||| ||| | |||||| ||||| || ||||  |    | |||||||||||| | ||||||  | |||| ||||||| ||| || ||||||| |    
T  35028571 atccaacaataaaatttgggtttgtagagtttgctcttggtaacaaacactagggttgagattgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctct 35028670  T
Q  204 tggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 303  Q
    || | ||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||    
T  35028671 tgatcacgagaagagattgacactttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctcttttctaaaattactcatcattgcag 35028770  T
Q  304 tggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtcttt 402  Q
    ||||| |||   |||||||||  |||  ||||||||||| |   | |||||||| |||||||| ||  ||| | |||||||||||||| || |||| |||    
T  35028771 tggaacggagagctgctctctcccccttactaggtcagtat---atcgaactggctaaacaaattttttgtattctctctttctttctttcactgt-ttt 35028866  T
Q  403 ttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttca 502  Q
     ||    ||||| |||| ||||||| |   || ||| |||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| |    
T  35028867 cta----ttttgcttgtttttataattgttatccacgttgttttgattgtttgattatt--ttgctccacacattaaatattttattggtgtgattttta 35028960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539552
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt---ta 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||  ||||  |  ||| ||||||||   ||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 15539711  T
Q  131 gagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagac 226  Q
    ||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  15539710 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagac 15539611  T
Q  227 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 286  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15539610 tttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaa 15539552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24162573 - 24162222
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  24162573 agatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 24162475  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||    
T  24162474 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagt 24162375  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||         | ||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |    
T  24162374 ctcttggtt---------gctgg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatca-t 24162288  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||    
T  24162287 atagtggattggatggctgctctctcccccggactaggtca-atttggaccgaattgggtcaacaaa 24162222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 35215785 - 35215585
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35215785 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtg-ggagacttattcttgt 35215687  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  35215686 aactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 35215590  T
Q  361 acaaa 365  Q
    |||||    
T  35215589 acaaa 35215585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 45239176 - 45239001
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |  |||  ||||||||| |   ||| |||||||||||||    
T  45239176 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcg-ggatacttattcttgta 45239078  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  45239077 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 45239001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979634
Alignment:
Q  43 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaac--aaacaataaactagggttt---tagagatt- 136  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||   ||  || ||||||||||||   || || ||     
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttg 34979808  T
Q  137 tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgt 233  Q
    |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||   ||||||  ||    
T  34979807 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggt 34979708  T
Q  234 agaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34979707 agaattaggcg-ggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaa 34979634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22407571 - 22407360
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagtttt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||    
T  22407571 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-attt 22407474  T
Q  345 ggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttt-tactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactt 440  Q
    |||||||||| | | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| |  | |||| |||  |||| | ||||||||||||   ||||||||||||    
T  22407473 ggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctctctcgatgttttctac--ttttggcttgtgtttataattgttccatacactt 22407376  T
Q  441 tgttttggttgcttga 456  Q
    ||||||||||||||||    
T  22407375 tgttttggttgcttga 22407360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 497
Target Start/End: Original strand, 3022219 - 3022562
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3022219 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 3022317  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca---------ttatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaa 352  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||         ||||| || ||  |||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  3022318 acccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaa 3022415  T
Q  353 ctggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggt 449  Q
    |||| | |||||| | |  ||||| ||||||| |||| |||| | ||  ||||    |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  3022416 ctgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttttctctc-gttgttttctgcttttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggt 3022514  T
Q  450 tgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgat 497  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||    
T  3022515 tgcttgattatcacttgctccacacatcaagtttgttatttgtgtgat 3022562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 365
Target Start/End: Original strand, 43139417 - 43139631
Alignment:
Q  151 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 249  Q
    |||||||||||| | |||||| | ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||| |  ||    
T  43139417 acactagggttgagattgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaag 43139516  T
Q  250 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggac 348  Q
    ||| ||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||| ||||| | ||||||||||| || |||    
T  43139517 actaattattgtaaccttttgatttctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggtacagaggactgttcttttccctatactaggtcagtattagac 43139615  T
Q  349 cgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||| ||||||||    
T  43139616 cgaactgg-taaacaaa 43139631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 7463065 - 7462829
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagtttt 344  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  7463065 ggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccatta-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttt 7462967  T
Q  345 ggaccgaactggat-aaacaaaattcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacact 439  Q
    |||||||||||| | ||| ||||    ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||| ||||||   || ||||||||    
T  7462966 ggaccgaactgggtcaaaaaaaaaaattgtgttctctcttctctttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgattataattgtttcatacact 7462868  T
Q  440 ttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  7462867 ttgttttggttgcttgattatcctttgctccacacatca 7462829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 37963055 - 37962798
Alignment:
Q  247 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttg 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||| | ||| |    
T  37963055 gagacttattcttgtaatccattgattt---ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaattt-g 37962960  T
Q  346 gaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttt 445  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||    | ||||  ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  37962959 gaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctttttcttt-tctcaagttgtttt--ctacttttatttgtgattataacttctatacactctgttt 37962863  T
Q  446 tggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    || || ||| ||||| |||| || ||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  37962862 tgattacttaattatcacttactccacacatcaagtttattattgatgtgatttttcatcgaatt 37962798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44289267 - 44289066
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||||| ||  | | |||||||||||||    
T  44289267 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtg-gaaaacttattcttgta 44289169  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||  |||||| |  |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  44289168 acccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 44289070  T
Q  362 caaa 365  Q
    ||||    
T  44289069 caaa 44289066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558863
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc 36558949  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  36558948 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 36558863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561140
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc 36561226  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  36561225 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 36561140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 308
Target Start/End: Original strand, 15694020 - 15694104
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15694020 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattttagtggaa 15694104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22407770 - 22407672
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||    
T  22407770 agatttgttcaaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctg-aaacaagggtttagaaa 22407672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12342771 - 12342673
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||    
T  12342771 agatttgttccaatttttttaggatacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 22707870 - 22707612
Alignment:
Q  246 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tc--ccagactaggtcagtt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  || | ||||||||| ||  |||||||||||||  |    
T  22707870 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtca-at 22707773  T
Q  343 ttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttg-tttgtgtttataa--cttccatacac 438  Q
    |||||| ||||| | | |||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||  ||  || ||| ||| || ||  ||||||||||||   ||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcctttctct--ctcgctgttttctacttctgccttgtgtttataattgttccatacac 22707675  T
Q  439 tttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttc 501  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||  | | ||||||||||| |||||    
T  22707674 tttgttttggttgcttgattgttccttactccacacatcaaatttgttattggtgtggttttc 22707612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332180
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattattgtaacccattgatttctc 45332266  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  45332265 -tttgtaaaggtactcatca-tatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 45332180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 352
Target Start/End: Original strand, 17921769 - 17921940
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatg-gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||| |||||   ||    
T  17921769 gaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgcaaccctttgat---tc 17921865  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaa 352  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  17921866 tttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctctacccagactaggtcagtatttgaccgaa 17921940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19501943 - 19501850
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  19501943 ttgtatttataacttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 19501850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19504278 - 19504185
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  19504278 ttgtatttataacttccatacactttgtttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 19504185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 37963266 - 37963190
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  37963266 gatacttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 37963190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 27105124 - 27105205
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  27105124 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 27105205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22162908
Alignment:
Q  274 tctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgt 371  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||   ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||| | |  |    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaattt-ggatcgaactgggtcaacaaattctttt 22163014  T
Q  372 gtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgctt 469  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||| ||| ||||  ||| | ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22163013 gtgttctctcttcttttctctcgttgt-tttctact--tttggcttgtgcttataactgttccatacaatttgttttggttgcttgattatcccttgctt 22162917  T
Q  470 cacacatca 478  Q
    |||||||||    
T  22162916 cacacatca 22162908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163224
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaa 22163224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 23452165 - 23452085
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  23452165 ttccatacactttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 23452085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31733028
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 31733028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36561068 - 36560988
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  36561068 ttccatacgctttgttttggttgcttgattattccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 36560988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 83
Target Start/End: Original strand, 40699202 - 40699278
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40699202 gagatttgttccaattttctgagggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 42453804 - 42453883
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  42453804 ttccatacattttattttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 42453883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 38020402 - 38020473
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  | | ||||||||||||||||    
T  38020402 ttccatacactttgttttggttgcttgattattccttgctccatacatcaaatttgttattggtgtgatttt 38020473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36558808 - 36558728
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  36558808 ttccatacgctttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tattattggtgtgatttttcatcgaatt 36558728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 427
Target Start/End: Original strand, 8173548 - 8173646
Alignment:
Q  326 cccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttta 424  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| |||||||    ||||||||||||||    
T  8173548 cccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttcactctttcttttctctcgttgt-tttttac---ctttgtttgtgttta 8173643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Original strand, 28196534 - 28196629
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||| || | || ||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  28196534 tttgttccaatttatgagggattcttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctg-aaacaaaggtttagaaa 28196629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 28462647 - 28462591
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcaga 65  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28462647 agatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtatcaga 28462591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022128
Alignment:
Q  38 ttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagata 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagata 3022128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 298
Target Start/End: Original strand, 23870956 - 23871006
Alignment:
Q  248 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23870956 agacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcat 23871006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30720750 - 30720684
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttact 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  30720750 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgaaa--tcttttgtaaagttact 30720684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020113
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagaggg 38020113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 393
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680255
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 279  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||   ||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||   |||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagacttgg-gtagaattaggtttgaagattgattcttgaaactcatt---atctctt 39680140  T
Q  280 ttgtaaagttactcat-cattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgc 377  Q
    | ||||||  |||||| ||||||||||||| |||   ||||||||| ||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||||||  || ||||| |    
T  39680141 t-gtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttc 39680239  T
Q  378 tctctttctttctctc 393  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  39680240 tctctctctctctctc 39680255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41303171 - 41303089
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||  |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41303171 gactttgggtagaattatgtttgaagactgattcatgtaaccttttggaatct--tttgtaaagttactcatcattatagtggaa 41303089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13909973 - 13909907
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| || | ||||||||||||    
T  13909973 ttccatacactttgttttggttgcttgattatcccttactccacacatcaagt-tgttattggtgtga 13909907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 22874060 - 22874134
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  22874060 tacttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 22874134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 35217897 - 35217827
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  35217897 ttccatacgctttgttttggttgcttaattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 35217827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20147082 - 20147040
Alignment:
Q  36 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 78  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20147082 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 20589555 - 20589629
Alignment:
Q  10 gatttgttccaaattttaagcgata-cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    |||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  20589555 gatttgttccaatttttgagggattgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagagag 20589629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458925
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 266  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||  |||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc 28458925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 502
Target Start/End: Original strand, 33604255 - 33604310
Alignment:
Q  445 ttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttca 502  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33604255 ttggttgcttgattaat--ttgcttcacacatcaagtattttattggtgtgatcttca 33604310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 34979522 - 34979456
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg 495  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| || | |||||||||||    
T  34979522 ttccatacactttattttggttgctttattattccttactccacacatcaagtttgttattggtgtg 34979456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 42923849 - 42923773
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt--gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||    
T  42923849 atacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctg-aaacaagggtttagaa 42923773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736387
Alignment:
Q  181 aaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 279  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||   | ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 2736299  T
Q  280 ttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   |||||||||  ||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  2736300 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 2736387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Original strand, 17932685 - 17932756
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 307  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17932685 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtgga 17932756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 307
Target Start/End: Original strand, 17943588 - 17943659
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 307  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17943588 gtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtgga 17943659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 39687034 - 39687165
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||   |||||||||  ||||    
T  39687034 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctccccca 39687129  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  39687130 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 39687165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 45156946 - 45156999
Alignment:
Q  10 gatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatca 63  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  45156946 gatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttatatca 45156999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37170883 - 37170778
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cattatagtggaatggatgactgctctcttccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||    
T  37170883 gtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccca 37170788  T
Q  330 gactaggtca 339  Q
    ||||||||||    
T  37170787 gactaggtca 37170778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20146946 - 20146899
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 78  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  20146946 gatatttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaaga 20146899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27517770 - 27517638
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||  |||    
T  27517770 gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 27517675  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    |||||||||||   || ||||||||| | ||||||||    
T  27517674 agactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaa 27517638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30261910 - 30261830
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||    ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  30261910 gactttgggtagaattaggtttcaagactaattcttgtaactctttgata----ttttgtaaagaaactcatcattgtagtggaa 30261830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 364
Target Start/End: Original strand, 39287262 - 39287349
Alignment:
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaa 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |   ||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  39287262 ttttgtaaaattactcatcattatagtggaacgaagagctgctctctccctcatactaggtcagtgttggaccaaacttgttaaacaa 39287349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 15539484 - 15539396
Alignment:
Q  409 tttttgtttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga 496  Q
    |||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  15539484 tttttgcttgtgtttataattgttcaatacactttgttttgattgcttga-taatccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtga 15539396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 500
Target Start/End: Original strand, 15697376 - 15697431
Alignment:
Q  443 ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||||||  | |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15697376 ttttggttgcttgatta--aattgctctacacatcaagtattttattggtgtgatttt 15697431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 17848342 - 17848413
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 85  Q
    |||||||||| || | || ||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  17848342 tttgttccaatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatc--agtaatccttgagatagaggg 17848413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23452601 - 23452547
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23452601 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 23452547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 438 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 35215511 - 35215450
Alignment:
Q  438 ctttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  35215511 ctttgttttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 35215450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 35215956 - 35215902
Alignment:
Q  11 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35215956 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 35215902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24162148 - 24162084
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgat 497  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| || | |||||||||||||    
T  24162148 catacacttttttttggttgcttgattatctctttctccacacatcaagt-tgttattggtgtgat 24162084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Original strand, 33603817 - 33603870
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtat 61  Q
    |||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33603817 gagatttgttccaatttgttagggatacttttactataaatataaaccttgtat 33603870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 128
Target Start/End: Original strand, 40699391 - 40699428
Alignment:
Q  91 aaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt 128  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40699391 aaaacaatggtttagaaacaaacaataaactagggttt 40699428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 478
Target Start/End: Original strand, 42064825 - 42064874
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatca 478  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  42064825 ttccatacactttgttttagttgcttgatcatcccttgctccacacatca 42064874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 365
Target Start/End: Original strand, 45679774 - 45679905
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcattatagtggaatggatgactgctctct-tccca 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||   |||||||||  ||||    
T  45679774 gtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccca 45679869  T
Q  330 gactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
    ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  45679870 gactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa 45679905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 139
Target Start/End: Original strand, 33603905 - 33603945
Alignment:
Q  100 gtttagaaacaaacaataaactagggttt-tagagatttct 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33603905 gtttagaaacaaacaacaaactagggtttatagagatttct 33603945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41304577 - 41304504
Alignment:
Q  233 tagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 308  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||  |  |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41304577 tagaattatgtttgaagactgattcttgtaaccttttggaa--tcttttctaaagttactcatcgttatagtggaa 41304504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 45332098 - 45332027
Alignment:
Q  438 ctttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  45332098 ctttgttttggttgcttaattatcccttgttccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 45332027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16181 - 15723
Alignment:
Q  8 gagatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 106  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||  ||| |||||||    
T  16181 gagatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaat-aagggtttaga 16083  T
Q  107 aacaaacaataaa-ctagggttt---tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtct 201  Q
    |   ||||| ||| |||||||||   ||||| || |||  ||    | |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  16082 agtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcctagcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtct 15983  T
Q  202 tttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 301  Q
     ||||| ||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15982 cttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattag 15884  T
Q  302 agtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtct 400  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||||| || ||       
T  15883 agtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttatctctttctttctcccgttg--- 15787  T
Q  401 ttttactatttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgct 468  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  15786 -ttttctacttttgtttgtgtttataacttccatac---tttttttttttgcttgattattacttgct 15723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16986 - 16508
Alignment:
Q  31 gatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaactagggttt- 128  Q
    |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||  ||||||||||||     
T  16986 gataattttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaacacaaaactagggtttg 16888  T
Q  129 --tagagatttctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggaga 225  Q
      ||||| || ||||  |    | |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||    
T  16887 tatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgaga 16788  T
Q  226 ctttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct- 324  Q
    ||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |  |  |||||     
T  16787 ctttgggtagaattagg-ccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctc 16689  T
Q  325 tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttc-tttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgttt 423  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||| ||    ||| ||||||||| |||| |||    
T  16688 ccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttttctctttcttttctctcgttg----ttttctatttttgcttgtattt 16593  T
Q  424 ataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16592 ataacttccatgcactttg-tttagttgcttgattattacttgctccacacatcaagtattttattggtataatttttatcgaatt 16508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 500
Target Start/End: Original strand, 4773 - 5230
Alignment:
Q  41 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaataaactagggttt---tagagattt 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||||  || ||| ||||||||||||   ||| | |||    
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaagtaagcaacaaactagggtttatatagcgtttt 4872  T
Q  138 ctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtaga 236  Q
    |||| ||    | ||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | | |||||||| ||  ||||  |||||    
T  4873 ctctcagcaacaaacactagagttgagtttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtaga 4972  T
Q  237 attaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agacta 334  Q
    ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |  |||||||||| ||| ||||||    
T  4973 attaggcg-ggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagacta 5071  T
Q  335 ggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataacttccat 434  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||| | ||| ||||||||| |||||    
T  5072 ggtcagtattggaccgaattgggtaaaaaaaatt---gtgttctctctttcttcctctcgctgt--ttttact--tttggcttgcgtttataacgtccat 5164  T
Q  435 acactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5165 acacttttattttgttgcttgattattacttgtttgatacatcaagtattttaatggtgtgatttt 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14581 - 14238
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatg-agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  14581 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 14483  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  14482 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt-ggaccgaactgggtcaa 14385  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc--gctgtctttttactatttttgtttgtgtttataact--tccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||  ||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14384 caaa-ttcttgtgttctctcttcctttctctctcgctgt-tttctact--tttggcttgtgtttataattgttccatacactttgttttggttgcttgat 14289  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  14288 tatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 14238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 308
Target Start/End: Original strand, 14946 - 15251
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||  | || ||||||||    
T  14946 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatga-tttagaaa 15044  T
Q  109 --caaacaataaactagggtttt---agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagt 199  Q
      |||  |  |||||||||||||   | || || |||||  |    | ||||||| |||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15045 ggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 15144  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || |||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15145 ctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 15242  T
Q  300 atagtggaa 308  Q
    |||||||||    
T  15243 atagtggaa 15251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 353
Target Start/End: Original strand, 3924 - 4272
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  3924 agatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 4022  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt-tagagatttctctaagagggag--acactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtc 200  Q
      |||  |  |||||||||||| || |  ||| |||    || |   |||||||||||    |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4023 ggcaacaacaaaactagggtttgtataagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtc 4122  T
Q  201 ttttggttacgcgaaga-gatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    | ||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4123 tcttggttacgggaagaagctgg-gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 4219  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaac 353  Q
    |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4220 atagtgaaacggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaac 4272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 69656 - 69140
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggagctgaaaacaagagttta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  69656 agatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagggttta 69558  T
Q  105 gaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat- 195  Q
    ||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  69557 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 69458  T
Q  196 gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 295  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  69457 gagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcat 69360  T
Q  296 cattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctc-tct-ttcttt---- 388  Q
    || |||||||||  |||   |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| || ||| ||||||        
T  69359 ca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttcttctcttctttgtgt 69263  T
Q  389 --ctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattt 485  Q
       |||||| || | ||| ||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| || | |    
T  69262 tcttctcgccgt-tgttttctacttttggcttgtatttataacttccatacattttgttttggttgcctgattatcccttgctccacacatcaagtttgt 69164  T
Q  486 tattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  69163 tattggtgtgattttcatcgaatt 69140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 73388 - 73286
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gagatagagggagctgaaaacaagagttta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||    ||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  73388 agatttgttccaaattttaagagatacttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctg-aaacaagggttta 73290  T
Q  105 gaaa 108  Q
    ||||    
T  73289 gaaa 73286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 85319 - 85666
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||| ||    |||||||||||||||||    
T  85319 ggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacg-ggagacttattcttgta 85417  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||  | ||||    
T  85418 acccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtca-atttgaactgaaccaggtaaa 85516  T
Q  362 caaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgtctttttactatttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgat 457  Q
    |||| | |  ||||| |||||||  ||||||||| ||| ||| |||  ||||   ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  85517 caaattcttttgtgttctctcttcttttctctcgttgt-tttctac--ttttgacttgtgtttataattgttccatacactttgattttggttgtttgat 85613  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||  |||||| ||||||| | |  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  85614 tatctcttgctccacacattaagattgttattggtgtgatttttcatcgaatt 85666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 85161 - 85231
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 82  Q
    |||||||||| || | || ||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  85161 tttgttccaatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagataga 85231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 500
Target Start/End: Original strand, 79135 - 79614
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt- 128  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||     
T  79135 atacctttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggct-aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 79233  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   |    
T  79234 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 79333  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
    ||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  79334 agaatttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 79431  T
Q  323 ct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttg 418  Q
    ||  ||||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||| ||||| | ||| ||| |||| | |||    
T  79432 ctcccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttctctcttctttttctcttgctgt-tgttttctacttttggcttg 79529  T
Q  419 tgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    || ||||||   |||||||||||||| |||||||||| | |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  79530 tgattataattgttccatacactttgattttggttgcctaattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttt 79614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 6)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 166 - 509
Target Start/End: Original strand, 52102 - 52449
Alignment:
Q  166 ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 264  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  52102 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtg-ggagactttttcttgtaac 52200  T
Q  265 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct---tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||    ||||||||||||||  |||||||| |||||| | ||    
T  52201 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaa 52298  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgc-tctctttctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttgttttggttgcttgat 457  Q
    | |||||| ||||| | |||| |||||| |||| ||   | ||| ||| |||| | ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  52299 c-aaattcttgtgttcttctc-ttctttttctctctagttgttttctacttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgttttggttgcttgat 52396  T
Q  458 tattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  52397 tatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 52449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 183839 - 183640
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  183839 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 183742  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcc-cagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  183741 acccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 183644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 432 - 509
Target Start/End: Original strand, 50372 - 50450
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  50372 catacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgatttttcatcgaatt 50450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 183569 - 183489
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  183569 ttccatacattttgtttcggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttctcatcgaatt 183489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 183976 - 183927
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 82  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  183976 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga 183927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Original strand, 51959 - 52035
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaacctt--gagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  51959 atacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 52035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Original strand, 2807 - 3318
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  2807 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 2905  T
Q  109 --caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagt 199  Q
      |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  2906 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 3005  T
Q  200 cttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 299  Q
    || ||||||| | ||||||     ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |    
T  3006 ctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-t 3102  T
Q  300 atagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgc-tctctt-----tctttctc 391  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||  | |||||||| |  ||||| | ||||||     | ||  ||    
T  3103 atagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtca-atttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttcttctcttctttgtgttcttc 3201  T
Q  392 tcgctgtctttttacta-tttttg-tttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttatt 489  Q
    |||| || | ||| ||| ||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||    
T  3202 tcgccgt-tgttttctactttttgacttgtatttataactttcatacactttg-tttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttatt 3298  T
Q  490 ggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3299 ggtgtgattttcatcgaatt 3318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11811 - 11321
Alignment:
Q  32 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt- 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  |||||||  ||||  |  ||||||||||||     
T  11811 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctg-aaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 11713  T
Q  129 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatgg 222  Q
      ||||| || |||||       | |||||||||||    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  11712 tatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 11613  T
Q  223 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 322  Q
     ||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||    
T  11612 ggactttgggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagagctgctct 11515  T
Q  323 ct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctt-tctttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttg 418  Q
    ||  ||||||||||||||  |||||||||||| || | |||||| | |  ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| |||| | |||    
T  11514 ctcccccagactaggtca-atttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttg 11417  T
Q  419 tgtttataa--cttccatacactt--tgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtg--attttcatcgaatt 509  Q
    || ||||||   ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11416 tgattataattgttccatacactttattttttcgttgcttaattattccttactccacacatcaagt-tgttattggtgtgatattttcatcgaatt 11321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 79949 - 80298
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggatga-gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| |||||   |||||||||||| ||||    
T  79949 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaga-ttaggca-ggagacttattcctgta 80046  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||  ||||||| | ||    
T  80047 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggattgaactgggtcaa 80144  T
Q  362 caaaattcgtgtgtgctctct-ttc--tttctctcgctgtctttttacta-tttttgtttgtgtttataa--cttccatacactttg-ttttggttgctt 454  Q
    | |||||| | |||| ||||| |||  ||||||||||||| | ||| ||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||| |    
T  80145 c-aaattcttttgtgatctctcttccttttctctcgctgt-tgttttctacttttggcttgtgtttataatttttccatacactttgattttcgttgcct 80242  T
Q  455 gattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt-tcatcgaatt 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  80243 gattattacttgctccacacatcaagtttgttattggtgtgttttctcatcgaatt 80298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 128
Target Start/End: Original strand, 79789 - 79906
Alignment:
Q  12 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca- 110  Q
    |||||||||| || | || ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |     
T  79789 tttgttccaatttatgagggattcttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagac 79887  T
Q  111 aacaat-aaactagggttt 128  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  79888 aacaataaaactagggttt 79906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 355
Target Start/End: Original strand, 6126 - 6478
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    ||||||||| ||  ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  6126 agatttgttacagtttttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 6224  T
Q  109 ca-aacaataaa-ctagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggatg--ag 198  Q
       ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||   ||    
T  6225 agcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaag 6324  T
Q  199 tcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  6325 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 6421  T
Q  299 tatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactg 355  Q
     ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6422 aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactg 6478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 6558 - 6639
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  6558 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 6639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 130 - 330
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  130 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggaaacttattcttgt 228  T
Q  262 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataa 360  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | |    
T  229 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 325  T
Q  361 acaaa 365  Q
    |||||    
T  326 acaaa 330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 499
Target Start/End: Original strand, 385 - 455
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattt 499  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  385 ttccatacgctttgattttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattt 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1651 - 1452
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  1651 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 1553  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  1552 acccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 1456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1377 - 1310
Alignment:
Q  432 catacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  1377 catacactttgttttggttgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41820 - 41332
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt-- 128  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||      
T  41820 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 41722  T
Q  129 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgga 223  Q
     ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   |     
T  41721 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 41622  T
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||    
T  41621 gactttcggtagaattagacg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaatcggagggctgctctc 41524  T
Q  324 ttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctct------ctttct-ttctct-cgctgtctttttactatttttg 414  Q
    | ||| ||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||| |||| | |||| |||      |||| | |||| | ||| ||  |||| ||| |||||    
T  41523 tcccccagactaggtgaattt-ggaccgaactgggtcaacaa-attcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttttcgccgttgtttt-ctacttttg 41427  T
Q  415 t-ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
      |||| ||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  41426 gcttgtatttaattgttccatacactttgttttgattgcttgattatctcttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 41332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 57568 - 57395
Alignment:
Q  224 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctc 323  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||  ||   ||||||||    
T  57568 gactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctc 57469  T
Q  324 t-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctcgctgt 398  Q
    |  |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| | || ||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  57468 tcccccagactaggtcagtattggacggaactaggtaaaaacaaatcgtgtgt--tctctctctttctctcactgt 57395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 298
Target Start/End: Original strand, 2130 - 2264
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||   | ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  2130 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggaaacttattcttgta 2228  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 298  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||    
T  2229 acccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcat 2264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 29260 - 29459
Alignment:
Q  164 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 262  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| | | | ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29260 ggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggca-ggagacttattcttgta 29358  T
Q  263 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 361  Q
    || ||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  29359 actcattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 29455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Original strand, 29530 - 29609
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgattttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  29530 ttccatacactttgttttgattgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgattttcatcgaatt 29609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 29088 - 29162
Alignment:
Q  9 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 83  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  29088 agatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagag 29162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 416 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12815 - 12722
Alignment:
Q  416 ttgtgtttataacttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||    
T  12815 ttgtatttataactttcatacactttgttttggttgcttgattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtcatttttcatcgaatt 12722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22404
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagact-attcttgtaactcattgatttctc 22318  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  22319 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 22404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 365
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24679
Alignment:
Q  180 gaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc 277  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-gaagact-attcttgtaactcattgatttctc 24593  T
Q  278 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 365  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  24594 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 24679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 500
Target Start/End: Original strand, 24751 - 24822
Alignment:
Q  429 ttccatacactttg-ttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtgatttt 500  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  24751 ttccatacgctttgattttggttgcttaattatcccttgctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttt 24822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1168 - 1094
Alignment:
Q  33 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||    
T  1168 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctg-aaacaagggtttagaaa 1094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 509
Target Start/End: Original strand, 35816 - 36032
Alignment:
Q  298 ttatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaat-tcgtgtgtgctctctttctttctctcgc 395  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||| | |  ||||| |||||||  ||||||||||    
T  35816 ttatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaattt-ggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctctcttcttttctctcgc 35914  T
Q  396 tgtctttttactatttttgtttgtgtttataact--tccatacactttgtttt-ggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggt 492  Q
    |||  ||||    |||| | |||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  35915 tgttgttttcgagttttggcttgtgtttataattgtttcatacactttgtttttggttgcttgactatcccttgctccacacatcaagtttgttattggt 36014  T
Q  493 gtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    || | |||||||||||||    
T  36015 gtaatttttcatcgaatt 36032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 64
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35622
Alignment:
Q  35 cttttactataaatatagacattgtatcag 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcag 35622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1379 - 1299
Alignment:
Q  429 ttccatacactttgttttggttgcttgattattacttgcttcacacatcaggtattttattggtgtga-ttttcatcgaatt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  1379 ttccatacactttgttttggttgcttgattatctttttctccacacatcaagt-tgttattggtgtgatttttcatcgaatt 1299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0474 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 297
Target Start/End: Original strand, 10749 - 10822
Alignment:
Q  222 gagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 297  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  10749 gagactttgggtagacttaagtttaaagactaattcttgtaaccctttgaaa--tcttttgtaaagttactcatca 10822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 393
Target Start/End: Original strand, 16376 - 16534
Alignment:
Q  232 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||   |||||||||  |||    
T  16376 gtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctccccc 16471  T
Q  329 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctctttctttctctc 393  Q
    |||||||||||   || ||||||||||| ||||||||  || |||||  ||| ||||||||||||    
T  16472 agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgt--tctttttctttctctc 16534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 9257 times since January 2019
Visitors: 6877