View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: J5_11_93 (Length: 677)

Name: J5_11_93
Description: Pascalseqs
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] J5_11_93
J5_11_93
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (148-596)||(11174-11621)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (148-596)||(12259-12706)
scaffold0028 (148-596)||(21787-22234)
scaffold0028 (148-539)||(55868-56258)
scaffold0028 (148-198)||(47840-47890)
scaffold0028 (148-198)||(135731-135781)
scaffold0028 (148-198)||(138200-138250)
scaffold0028 (148-198)||(140669-140719)
scaffold0028 (148-198)||(143138-143188)
[»] chr2 (60 HSPs)
chr2 (148-596)||(24873338-24873784)
chr2 (148-577)||(23115642-23116072)
chr2 (148-564)||(27374710-27375125)
chr2 (148-564)||(24713475-24713890)
chr2 (148-550)||(16931962-16932362)
chr2 (148-550)||(17002455-17002855)
chr2 (148-564)||(24265811-24266225)
chr2 (148-522)||(41605671-41606043)
chr2 (148-564)||(10872291-10872705)
chr2 (148-550)||(16984695-16985095)
chr2 (148-564)||(22321930-22322344)
chr2 (152-564)||(44382160-44382572)
chr2 (148-550)||(9487671-9488072)
chr2 (148-550)||(9339037-9339438)
chr2 (148-539)||(22462064-22462455)
chr2 (148-497)||(24656241-24656591)
chr2 (148-564)||(23028046-23028461)
chr2 (148-489)||(22741550-22741891)
chr2 (148-564)||(21319587-21320002)
chr2 (148-564)||(20321424-20321846)
chr2 (148-564)||(24678931-24679346)
chr2 (148-496)||(23104316-23104659)
chr2 (148-481)||(23065901-23066233)
chr2 (148-481)||(23075351-23075683)
chr2 (148-562)||(24704092-24704479)
chr2 (148-481)||(22732360-22732691)
chr2 (264-496)||(23030272-23030504)
chr2 (148-229)||(27381727-27381808)
chr2 (315-496)||(24816590-24816771)
chr2 (148-225)||(24646324-24646401)
chr2 (290-363)||(23039346-23039419)
chr2 (148-198)||(6484399-6484449)
chr2 (148-198)||(12571700-12571750)
chr2 (148-198)||(12578182-12578232)
chr2 (148-198)||(21240351-21240401)
chr2 (148-198)||(23096592-23096642)
chr2 (148-198)||(23296862-23296912)
chr2 (148-198)||(27790297-27790347)
chr2 (148-198)||(31504972-31505022)
chr2 (148-199)||(19664421-19664472)
chr2 (148-198)||(19715588-19715638)
chr2 (148-198)||(19720151-19720201)
chr2 (148-198)||(24644140-24644190)
chr2 (148-198)||(28351698-28351748)
chr2 (264-496)||(21902048-21902280)
chr2 (148-204)||(23132389-23132445)
chr2 (148-204)||(23710593-23710649)
chr2 (148-204)||(24899264-24899320)
chr2 (148-204)||(24901741-24901797)
chr2 (148-204)||(24904218-24904274)
chr2 (148-204)||(24906693-24906749)
chr2 (151-198)||(1066294-1066341)
chr2 (148-183)||(20320332-20320367)
chr2 (151-198)||(20849410-20849457)
chr2 (262-325)||(23003763-23003826)
chr2 (151-198)||(31833201-31833248)
chr2 (148-196)||(19802971-19803019)
chr2 (148-196)||(19818620-19818668)
chr2 (148-204)||(26506903-26506959)
chr2 (148-196)||(45535315-45535363)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (152-564)||(22351661-22352072)
chr5 (148-564)||(29472303-29472717)
chr5 (148-564)||(27681630-27682044)
chr5 (148-564)||(22138410-22138824)
chr5 (148-564)||(27614098-27614513)
chr5 (148-564)||(19773702-19774117)
chr5 (148-550)||(22329105-22329517)
chr5 (148-564)||(41774585-41774999)
chr5 (148-564)||(27664733-27665147)
chr5 (148-564)||(37287727-37288140)
chr5 (148-550)||(16360258-16360659)
chr5 (148-550)||(34570250-34570648)
chr5 (148-550)||(40712536-40712936)
chr5 (148-549)||(14995981-14996368)
chr5 (189-550)||(27522162-27522522)
chr5 (148-562)||(18782861-18783275)
chr5 (148-485)||(23536441-23536778)
chr5 (149-568)||(21883518-21883936)
chr5 (148-562)||(20804344-20804762)
chr5 (148-564)||(23461649-23462057)
chr5 (148-481)||(25430247-25430580)
chr5 (148-310)||(41768264-41768425)
chr5 (149-460)||(26733722-26734032)
chr5 (262-487)||(21331329-21331554)
chr5 (263-496)||(23475006-23475239)
chr5 (418-496)||(23529086-23529164)
chr5 (151-198)||(22233418-22233465)
chr5 (148-198)||(16257248-16257298)
chr5 (148-198)||(17265545-17265595)
chr5 (148-198)||(22590967-22591017)
chr5 (148-198)||(22594522-22594572)
chr5 (148-198)||(23562384-23562434)
chr5 (148-198)||(43123571-43123621)
chr5 (1-38)||(1203315-1203352)
chr5 (151-198)||(20346389-20346436)
chr5 (148-199)||(22338176-22338227)
chr5 (151-198)||(24795905-24795952)
chr5 (151-198)||(25852180-25852227)
chr5 (148-198)||(316-366)
chr5 (148-198)||(21676339-21676389)
chr5 (148-198)||(23077132-23077182)
chr5 (148-202)||(24618514-24618568)
chr5 (148-202)||(24747773-24747827)
chr5 (148-196)||(6555111-6555159)
chr5 (264-460)||(21560370-21560566)
chr5 (148-204)||(21981810-21981865)
chr5 (148-196)||(30344073-30344121)
chr5 (151-198)||(22506774-22506821)
chr5 (148-179)||(23670760-23670791)
chr5 (151-194)||(37540876-37540919)
chr5 (148-178)||(20771256-20771286)
chr5 (148-178)||(20780031-20780061)
chr5 (148-178)||(20825574-20825604)
chr5 (148-202)||(24714745-24714799)
chr5 (148-178)||(28891162-28891192)
chr5 (148-177)||(20311820-20311849)
chr5 (151-179)||(14883205-14883233)
chr5 (148-196)||(16641826-16641874)
chr5 (148-176)||(22466070-22466098)
chr5 (148-204)||(29347507-29347563)
chr5 (148-204)||(29349980-29350036)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (148-596)||(41962-42409)
scaffold0109 (149-564)||(12179-12586)
[»] chr3 (97 HSPs)
chr3 (152-564)||(12890138-12890549)
chr3 (148-587)||(15398805-15399243)
chr3 (148-564)||(15359481-15359894)
chr3 (148-564)||(15712343-15712757)
chr3 (148-564)||(3689372-3689786)
chr3 (148-564)||(15344532-15344946)
chr3 (148-550)||(5421217-5421617)
chr3 (148-550)||(13249487-13249887)
chr3 (148-550)||(13256133-13256533)
chr3 (148-564)||(5107826-5108240)
chr3 (148-564)||(20058341-20058755)
chr3 (148-564)||(26789700-26790114)
chr3 (148-550)||(48428890-48429290)
chr3 (148-564)||(15585679-15586093)
chr3 (148-550)||(16639216-16639617)
chr3 (148-550)||(43166118-43166519)
chr3 (148-564)||(10009029-10009443)
chr3 (148-572)||(6597475-6597897)
chr3 (148-564)||(16752989-16753402)
chr3 (148-564)||(6604164-6604577)
chr3 (148-571)||(53381308-53381728)
chr3 (148-564)||(10909639-10910055)
chr3 (189-564)||(5109736-5110110)
chr3 (148-539)||(16695621-16696011)
chr3 (148-539)||(23414069-23414463)
chr3 (148-413)||(24186732-24186997)
chr3 (148-497)||(11861850-11862198)
chr3 (148-564)||(14872869-14873283)
chr3 (148-489)||(23078293-23078634)
chr3 (148-329)||(16490610-16490790)
chr3 (148-481)||(15458712-15459042)
chr3 (148-481)||(17498205-17498535)
chr3 (33-153)||(26709007-26709127)
chr3 (148-409)||(12502483-12502737)
chr3 (148-496)||(15066567-15066913)
chr3 (148-280)||(14125438-14125570)
chr3 (262-496)||(15263120-15263354)
chr3 (262-496)||(15263932-15264166)
chr3 (148-225)||(15966658-15966735)
chr3 (148-225)||(15970582-15970659)
chr3 (262-466)||(14577818-14578022)
chr3 (148-243)||(18437616-18437712)
chr3 (451-521)||(24186662-24186731)
chr3 (148-225)||(7111404-7111481)
chr3 (348-496)||(19728258-19728406)
chr3 (148-198)||(15937645-15937695)
chr3 (148-237)||(4109592-4109681)
chr3 (148-198)||(8743646-8743696)
chr3 (148-198)||(12356785-12356835)
chr3 (148-198)||(13945850-13945900)
chr3 (148-198)||(13969659-13969709)
chr3 (148-198)||(14089201-14089251)
chr3 (148-198)||(15935795-15935845)
chr3 (148-198)||(16383636-16383686)
chr3 (148-198)||(16824540-16824590)
chr3 (148-198)||(16830786-16830836)
chr3 (148-198)||(18130605-18130655)
chr3 (148-198)||(19445100-19445150)
chr3 (148-198)||(31691443-31691493)
chr3 (148-198)||(31942724-31942774)
chr3 (148-198)||(41180003-41180053)
chr3 (148-198)||(54974761-54974811)
chr3 (148-198)||(54977371-54977421)
chr3 (151-198)||(10409790-10409837)
chr3 (148-199)||(14577740-14577791)
chr3 (148-198)||(2036174-2036224)
chr3 (148-198)||(2039915-2039965)
chr3 (402-460)||(12842648-12842706)
chr3 (148-198)||(13314720-13314770)
chr3 (148-198)||(14040563-14040613)
chr3 (148-198)||(35983998-35984048)
chr3 (148-204)||(16455333-16455389)
chr3 (148-196)||(36526748-36526796)
chr3 (417-512)||(12857054-12857148)
chr3 (148-179)||(13027661-13027692)
chr3 (148-199)||(19728549-19728600)
chr3 (151-198)||(28758141-28758188)
chr3 (151-194)||(47127770-47127813)
chr3 (148-178)||(10416311-10416341)
chr3 (148-198)||(11957439-11957489)
chr3 (402-468)||(12508091-12508157)
chr3 (148-198)||(12856775-12856825)
chr3 (148-198)||(13304044-13304094)
chr3 (148-178)||(14289793-14289823)
chr3 (148-198)||(15011235-15011285)
chr3 (148-198)||(15231404-15231454)
chr3 (148-198)||(15237272-15237322)
chr3 (148-206)||(15263420-15263478)
chr3 (148-206)||(15264232-15264290)
chr3 (417-467)||(35983719-35983769)
chr3 (264-333)||(15231275-15231344)
chr3 (264-333)||(15237143-15237212)
chr3 (149-198)||(17190189-17190238)
chr3 (149-198)||(24191118-24191167)
chr3 (365-481)||(2245159-2245275)
chr3 (148-196)||(10953037-10953085)
chr3 (148-204)||(13152836-13152892)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (149-587)||(21843013-21843450)
chr1 (148-564)||(16346714-16347128)
chr1 (148-564)||(16353363-16353777)
chr1 (148-564)||(19110194-19110609)
chr1 (150-564)||(21834127-21834541)
chr1 (148-564)||(33387149-33387563)
chr1 (148-550)||(51329612-51330012)
chr1 (148-521)||(41349791-41350160)
chr1 (148-564)||(17041131-17041547)
chr1 (148-564)||(22832275-22832690)
chr1 (148-540)||(24783979-24784369)
chr1 (148-564)||(21177195-21177604)
chr1 (192-568)||(22459240-22459615)
chr1 (192-568)||(22469669-22470044)
chr1 (148-539)||(22434868-22435249)
chr1 (381-596)||(22401113-22401327)
chr1 (33-153)||(9791680-9791800)
chr1 (32-153)||(45995141-45995262)
chr1 (148-454)||(20247155-20247461)
chr1 (148-243)||(22359636-22359731)
chr1 (264-489)||(21044386-21044611)
chr1 (148-240)||(27251669-27251761)
chr1 (262-496)||(16379989-16380224)
chr1 (148-243)||(21753126-21753221)
chr1 (342-496)||(22117609-22117763)
chr1 (148-213)||(39245988-39246053)
chr1 (263-467)||(18273722-18273926)
chr1 (151-198)||(20073813-20073860)
chr1 (148-202)||(23196358-23196412)
chr1 (148-198)||(31536110-31536160)
chr1 (149-198)||(38908928-38908977)
chr1 (404-496)||(20922334-20922426)
chr1 (148-199)||(22117911-22117962)
chr1 (151-198)||(37681288-37681335)
chr1 (151-198)||(48427112-48427159)
chr1 (148-198)||(19858512-19858562)
chr1 (148-198)||(21738141-21738191)
chr1 (148-198)||(41311482-41311532)
chr1 (365-489)||(19858207-19858331)
chr1 (151-198)||(20298610-20298657)
chr1 (151-198)||(20397703-20397750)
chr1 (148-195)||(21044266-21044313)
chr1 (151-198)||(21962268-21962315)
chr1 (151-198)||(36212815-36212862)
chr1 (151-198)||(52989979-52990026)
chr1 (148-178)||(20046663-20046693)
chr1 (148-196)||(37192025-37192073)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (148-564)||(11233270-11233684)
chr7 (148-564)||(13689840-13690254)
chr7 (148-564)||(8711404-8711819)
chr7 (148-564)||(15157114-15157528)
chr7 (148-521)||(11549158-11549530)
chr7 (148-550)||(44787408-44787808)
chr7 (148-564)||(18586227-18586642)
chr7 (148-564)||(10874251-10874665)
chr7 (148-521)||(12691343-12691715)
chr7 (148-521)||(14958350-14958722)
chr7 (148-564)||(18181541-18181944)
chr7 (148-539)||(9592191-9592580)
chr7 (148-415)||(14336318-14336584)
chr7 (148-564)||(16725508-16725918)
chr7 (148-564)||(17702522-17702932)
chr7 (33-153)||(35926929-35927049)
chr7 (149-496)||(15144977-15145324)
chr7 (148-481)||(14043579-14043911)
chr7 (148-481)||(14353609-14353941)
chr7 (262-539)||(11526524-11526800)
chr7 (438-564)||(14336195-14336320)
chr7 (148-229)||(73141-73222)
chr7 (148-225)||(12716518-12716595)
chr7 (148-229)||(12721425-12721506)
chr7 (148-229)||(18281186-18281267)
chr7 (148-237)||(16115945-16116035)
chr7 (148-198)||(12460800-12460850)
chr7 (148-198)||(10306204-10306254)
chr7 (148-198)||(13677622-13677672)
chr7 (148-198)||(18049968-18050018)
chr7 (148-198)||(19615564-19615614)
chr7 (148-198)||(29798226-29798276)
chr7 (151-198)||(11300514-11300561)
chr7 (151-202)||(21756591-21756642)
chr7 (151-198)||(26090817-26090864)
chr7 (151-198)||(26114621-26114668)
chr7 (151-198)||(49156484-49156531)
chr7 (148-198)||(11311611-11311661)
chr7 (148-198)||(13025526-13025576)
chr7 (148-198)||(15098741-15098791)
chr7 (148-198)||(15811388-15811438)
chr7 (363-481)||(16946718-16946836)
chr7 (148-204)||(24703750-24703806)
chr7 (148-179)||(11384633-11384664)
chr7 (420-463)||(15115056-15115099)
chr7 (148-179)||(19151208-19151239)
chr7 (148-179)||(20750607-20750638)
chr7 (151-198)||(40923836-40923883)
chr7 (148-198)||(12202850-12202900)
chr7 (369-483)||(12801516-12801630)
chr7 (148-178)||(13005661-13005691)
chr7 (148-198)||(14145843-14145893)
chr7 (149-187)||(14220968-14221006)
chr7 (148-178)||(16928752-16928782)
chr7 (264-334)||(19151040-19151110)
chr7 (264-334)||(20750439-20750509)
chr7 (430-487)||(11984870-11984927)
chr7 (151-199)||(11769832-11769880)
chr7 (150-198)||(12693936-12693984)
chr7 (148-200)||(41524447-41524499)
chr7 (148-196)||(43746623-43746671)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (148-564)||(12480410-12480824)
chr4 (148-564)||(14299758-14300181)
chr4 (148-564)||(23959557-23959971)
chr4 (148-550)||(8390236-8390636)
chr4 (148-550)||(17090937-17091337)
chr4 (148-564)||(8049411-8049825)
chr4 (148-564)||(40476850-40477252)
chr4 (148-564)||(16232780-16233194)
chr4 (148-539)||(13514188-13514579)
chr4 (148-539)||(18223254-18223648)
chr4 (148-564)||(18603609-18604018)
chr4 (148-351)||(14684187-14684390)
chr4 (252-487)||(16247564-16247799)
chr4 (198-568)||(15143783-15144152)
chr4 (148-469)||(16240894-16241215)
chr4 (148-387)||(16349583-16349825)
chr4 (148-566)||(14822-15238)
chr4 (148-241)||(14306355-14306447)
chr4 (148-248)||(16244276-16244376)
chr4 (262-487)||(14163359-14163584)
chr4 (262-496)||(16220068-16220302)
chr4 (365-489)||(14700346-14700470)
chr4 (231-282)||(14306455-14306506)
chr4 (148-198)||(14992416-14992466)
chr4 (148-198)||(16151827-16151877)
chr4 (148-198)||(16155973-16156023)
chr4 (148-198)||(18270591-18270641)
chr4 (148-198)||(20894224-20894274)
chr4 (148-198)||(51602812-51602862)
chr4 (148-198)||(53749490-53749540)
chr4 (150-198)||(27904577-27904625)
chr4 (151-198)||(7358460-7358507)
chr4 (151-198)||(11203264-11203311)
chr4 (262-325)||(17332225-17332288)
chr4 (264-334)||(8709712-8709782)
chr4 (148-198)||(13742039-13742089)
chr4 (148-206)||(14187475-14187533)
chr4 (148-198)||(15074547-15074597)
chr4 (148-198)||(16229908-16229958)
chr4 (148-198)||(18260628-18260678)
chr4 (148-204)||(13880284-13880340)
chr4 (148-179)||(8709869-8709900)
chr4 (152-195)||(15267972-15268015)
chr4 (155-198)||(44657902-44657945)
chr4 (152-198)||(3260827-3260873)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (151-564)||(106828-107239)
scaffold0029 (148-496)||(9123-9470)
scaffold0029 (148-178)||(116190-116220)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (148-550)||(22116666-22117066)
chr8 (148-564)||(20014754-20015168)
chr8 (148-550)||(19116290-19116690)
chr8 (189-564)||(22125490-22125864)
chr8 (148-564)||(18860453-18860868)
chr8 (148-564)||(17670513-17670927)
chr8 (148-521)||(19480566-19480935)
chr8 (148-521)||(19497234-19497603)
chr8 (148-564)||(17829456-17829872)
chr8 (148-563)||(32604025-32604440)
chr8 (148-487)||(22043773-22044113)
chr8 (148-497)||(15537328-15537678)
chr8 (148-539)||(30309626-30310021)
chr8 (148-563)||(19981847-19982261)
chr8 (148-564)||(21163018-21163432)
chr8 (148-587)||(22113897-22114331)
chr8 (148-460)||(21390379-21390691)
chr8 (148-460)||(21779705-21780017)
chr8 (148-460)||(18880144-18880456)
chr8 (148-564)||(17354391-17354800)
chr8 (148-496)||(21672461-21672807)
chr8 (33-153)||(26767405-26767525)
chr8 (148-306)||(23777784-23777942)
chr8 (148-481)||(6518331-6518662)
chr8 (148-460)||(22420375-22420692)
chr8 (148-241)||(21919880-21919973)
chr8 (148-229)||(21974921-21975002)
chr8 (262-460)||(22524395-22524593)
chr8 (404-487)||(22994633-22994716)
chr8 (147-198)||(21929682-21929733)
chr8 (148-198)||(21323030-21323080)
chr8 (148-198)||(21981444-21981494)
chr8 (148-198)||(21986363-21986413)
chr8 (148-198)||(31568571-31568621)
chr8 (264-357)||(20392171-20392264)
chr8 (149-198)||(21968605-21968654)
chr8 (369-481)||(21330530-21330642)
chr8 (151-198)||(16267699-16267746)
chr8 (148-199)||(22524660-22524711)
chr8 (148-198)||(19986383-19986433)
chr8 (148-198)||(22003571-22003621)
chr8 (148-198)||(22026754-22026804)
chr8 (148-198)||(22176748-22176798)
chr8 (148-198)||(29299899-29299949)
chr8 (151-194)||(28985173-28985216)
chr8 (148-179)||(44478317-44478348)
chr8 (148-178)||(22049623-22049653)
chr8 (148-178)||(22055141-22055171)
chr8 (405-467)||(22242174-22242236)
chr8 (148-198)||(31413086-31413136)
chr8 (148-177)||(22709756-22709785)
chr8 (148-196)||(19806766-19806814)
chr8 (148-180)||(22176672-22176704)
chr8 (365-481)||(31413305-31413421)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (148-572)||(24291973-24292397)
chr6 (148-564)||(2870995-2871409)
chr6 (148-522)||(25116276-25116648)
chr6 (148-564)||(16575564-16575979)
chr6 (148-564)||(16619401-16619816)
chr6 (148-564)||(28259392-28259804)
chr6 (148-564)||(28286112-28286524)
chr6 (148-564)||(28338141-28338553)
chr6 (148-550)||(29588631-29589032)
chr6 (148-564)||(28313304-28313716)
chr6 (148-564)||(27206296-27206708)
chr6 (148-564)||(27242520-27242932)
chr6 (148-562)||(5835421-5835833)
chr6 (150-562)||(21765491-21765902)
chr6 (148-387)||(27554483-27554723)
chr6 (148-496)||(22437613-22437955)
chr6 (148-424)||(19872004-19872280)
chr6 (268-539)||(25755919-25756189)
chr6 (148-481)||(18404125-18404458)
chr6 (262-484)||(23082179-23082401)
chr6 (148-328)||(25607415-25607601)
chr6 (446-564)||(22828876-22828993)
chr6 (396-539)||(27558253-27558395)
chr6 (149-328)||(19667346-19667524)
chr6 (315-496)||(23084181-23084362)
chr6 (148-234)||(16960965-16961051)
chr6 (420-496)||(18181848-18181924)
chr6 (264-489)||(25958058-25958283)
chr6 (396-496)||(19667190-19667290)
chr6 (148-198)||(8719884-8719934)
chr6 (148-198)||(8761207-8761257)
chr6 (148-198)||(10465033-10465083)
chr6 (148-198)||(21475594-21475644)
chr6 (148-237)||(22950843-22950932)
chr6 (148-237)||(23873287-23873376)
chr6 (402-489)||(21475284-21475371)
chr6 (148-198)||(5295388-5295438)
chr6 (148-198)||(16828760-16828810)
chr6 (148-198)||(18798740-18798790)
chr6 (148-198)||(19457016-19457066)
chr6 (148-198)||(19467161-19467211)
chr6 (438-496)||(19868362-19868420)
chr6 (148-204)||(33863323-33863379)
chr6 (148-178)||(15463404-15463434)
chr6 (148-237)||(19004058-19004147)
chr6 (148-198)||(25771900-25771950)
chr6 (148-178)||(34641768-34641798)
chr6 (262-351)||(18178748-18178837)
chr6 (148-176)||(18318399-18318427)
chr6 (148-196)||(18451212-18451260)
chr6 (150-178)||(20009686-20009714)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (148-564)||(691-1107)
scaffold0008 (148-539)||(138645-139036)
scaffold0008 (148-460)||(15661-15971)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (148-487)||(486-832)
scaffold0403 (148-460)||(15856-16168)
[»] scaffold0010 (5 HSPs)
scaffold0010 (148-539)||(22055-22446)
scaffold0010 (148-484)||(15345-15682)
scaffold0010 (263-496)||(5824-6057)
scaffold0010 (148-198)||(38368-38418)
scaffold0010 (148-178)||(179879-179909)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (252-587)||(425117-425452)
scaffold0003 (148-539)||(138553-138944)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (148-487)||(18078-18417)
scaffold0044 (148-477)||(6920-7221)
scaffold0044 (473-564)||(4263-4353)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (148-487)||(13070-13416)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (148-480)||(3780-4112)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (148-562)||(16113-16526)
scaffold0017 (148-562)||(20635-21048)
scaffold0017 (147-489)||(193914-194256)
scaffold0017 (148-198)||(3487-3537)
scaffold0017 (365-483)||(3718-3836)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (148-487)||(228898-229238)
scaffold0009 (148-198)||(252841-252891)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (148-562)||(580-993)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (148-562)||(275-691)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (148-564)||(6049-6464)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (148-549)||(23274-23673)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (149-564)||(35868-36282)
scaffold0042 (402-466)||(27291-27355)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (148-562)||(140-552)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (148-564)||(37870-38286)
scaffold0081 (148-564)||(22446-22862)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (148-521)||(14635-15007)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (148-487)||(1059-1386)
scaffold0410 (148-189)||(11269-11310)
[»] scaffold0261 (5 HSPs)
scaffold0261 (148-563)||(82-496)
scaffold0261 (151-198)||(11450-11497)
scaffold0261 (151-198)||(19630-19677)
scaffold0261 (365-489)||(11678-11802)
scaffold0261 (365-489)||(19858-19982)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (148-539)||(32746-33136)
scaffold0080 (148-420)||(9330-9597)
scaffold0080 (148-454)||(20770-21075)
scaffold0080 (322-564)||(55479-55721)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (148-562)||(14095-14501)
[»] scaffold0490 (4 HSPs)
scaffold0490 (148-460)||(836-1149)
scaffold0490 (148-198)||(4053-4103)
scaffold0490 (264-334)||(3904-3974)
scaffold0490 (417-489)||(3781-3853)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (148-564)||(65577-65992)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (148-564)||(149-559)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (148-496)||(751-1099)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (148-496)||(31196-31543)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (148-562)||(632-1038)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (152-481)||(9931-10260)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (148-453)||(9376-9681)
scaffold0273 (396-568)||(869-1040)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (148-460)||(679-991)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (262-539)||(121329-121605)
scaffold0034 (148-198)||(71594-71644)
scaffold0034 (405-489)||(1255-1339)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (149-564)||(721-1128)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (147-481)||(9871-10205)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (148-481)||(30046-30379)
scaffold0090 (148-359)||(1779-1994)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (148-481)||(15008-15341)
scaffold0120 (156-481)||(12187-12510)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (148-481)||(3149-3479)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (198-568)||(33869-34238)
scaffold0022 (148-481)||(42556-42884)
scaffold0022 (148-481)||(76276-76604)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (284-539)||(49529-49783)
scaffold0007 (148-232)||(49785-49869)
scaffold0007 (148-196)||(83729-83777)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (148-496)||(11477-11819)
scaffold0297 (402-539)||(6958-7094)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (149-481)||(16397-16729)
scaffold0114 (148-198)||(41280-41330)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (148-387)||(37456-37698)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (332-564)||(23086-23317)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (332-564)||(8075-8306)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (148-489)||(49392-49733)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (152-460)||(9356-9668)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (148-496)||(1012-1354)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (284-539)||(171986-172240)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (148-345)||(28047-28235)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (148-274)||(17912-18037)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (148-469)||(39644-39965)
scaffold0122 (148-243)||(22572-22666)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (190-481)||(2636-2924)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (148-481)||(7200-7532)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (433-596)||(734-896)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (148-460)||(9168-9480)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (324-539)||(5865-6078)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (279-481)||(23904-24106)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (343-563)||(7021-7240)
scaffold0130 (148-282)||(6881-7023)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (148-496)||(54520-54867)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (148-323)||(29673-29848)
scaffold0023 (264-481)||(41174-41391)
scaffold0023 (396-564)||(29869-30036)
scaffold0023 (149-243)||(41056-41149)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (262-496)||(56816-57050)
scaffold0077 (148-198)||(18949-18999)
scaffold0077 (148-198)||(56697-56747)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (148-481)||(4475-4806)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (148-460)||(3596-3906)
scaffold0207 (148-196)||(12544-12592)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (342-564)||(11-231)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (148-481)||(941-1272)
scaffold0621 (148-481)||(5358-5689)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (148-240)||(8762-8854)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (148-243)||(6995-7090)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (148-243)||(12370-12465)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (262-497)||(105103-105338)
scaffold0006 (148-200)||(105401-105453)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (262-496)||(1174-1408)
scaffold0447 (148-199)||(1050-1101)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (262-496)||(4038-4272)
scaffold0383 (148-199)||(3914-3965)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (262-487)||(12759-12984)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (148-496)||(17026-17372)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (148-361)||(104603-104820)
scaffold0040 (315-413)||(21125-21223)
scaffold0040 (420-460)||(18790-18830)
[»] scaffold0293 (3 HSPs)
scaffold0293 (262-484)||(16331-16553)
scaffold0293 (306-496)||(9239-9429)
scaffold0293 (148-204)||(16621-16677)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (316-487)||(13480-13651)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (315-496)||(8564-8745)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (148-302)||(5836-5990)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (148-241)||(21116-21207)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (315-477)||(442580-442742)
scaffold0001 (148-198)||(452528-452578)
scaffold0001 (148-179)||(442883-442914)
scaffold0001 (151-198)||(513388-513435)
scaffold0001 (155-199)||(164194-164238)
[»] scaffold0243 (3 HSPs)
scaffold0243 (226-334)||(23321-23429)
scaffold0243 (148-198)||(8809-8859)
scaffold0243 (148-212)||(11061-11124)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (366-478)||(35480-35592)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (346-485)||(7031-7170)
scaffold0074 (148-200)||(7309-7361)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (221-454)||(11717-11949)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (262-487)||(22694-22919)
scaffold0011 (148-199)||(22576-22627)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (315-422)||(20079-20186)
[»] scaffold1274 (2 HSPs)
scaffold1274 (365-487)||(535-657)
scaffold1274 (148-200)||(821-873)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (342-400)||(1-59)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (148-198)||(336-386)
[»] scaffold1600 (2 HSPs)
scaffold1600 (148-198)||(1262-1312)
scaffold1600 (402-496)||(966-1060)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (152-198)||(679-725)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (148-198)||(626-676)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (148-198)||(5315-5365)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (148-198)||(781-831)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (148-198)||(16241-16291)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (148-198)||(3841-3891)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (148-198)||(21328-21378)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (148-198)||(32405-32455)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (148-198)||(293-343)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (148-198)||(15147-15197)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (148-198)||(26681-26731)
[»] scaffold0067 (5 HSPs)
scaffold0067 (148-198)||(30845-30895)
scaffold0067 (148-198)||(48214-48264)
scaffold0067 (148-198)||(57248-57298)
scaffold0067 (148-198)||(63634-63684)
scaffold0067 (365-481)||(30548-30664)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (148-198)||(28557-28607)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (148-198)||(62575-62625)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (148-198)||(43747-43797)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (148-198)||(71325-71375)
scaffold0046 (417-496)||(71017-71096)
scaffold0046 (148-179)||(79157-79188)
scaffold0046 (342-488)||(846-992)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (148-198)||(116845-116895)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (148-198)||(52870-52920)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (315-496)||(14217-14398)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (264-357)||(30223-30316)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (148-197)||(320417-320466)
scaffold0004 (291-340)||(320305-320354)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (148-199)||(859-910)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (151-198)||(13090-13137)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (151-198)||(1683-1730)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (151-198)||(31132-31179)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (148-198)||(354-404)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (148-198)||(22-72)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (148-198)||(2933-2983)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (148-198)||(66-116)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (148-198)||(4937-4987)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (148-198)||(12199-12249)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (148-198)||(21987-22037)
scaffold0222 (405-489)||(21682-21766)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (148-198)||(3117-3167)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (148-194)||(17156-17202)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (148-198)||(35538-35588)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (417-467)||(42735-42785)
scaffold0104 (149-183)||(15593-15627)
scaffold0104 (149-183)||(17613-17647)
scaffold0104 (148-198)||(42456-42506)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (148-198)||(31003-31053)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (148-198)||(55267-55317)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (148-198)||(33779-33829)
scaffold0069 (264-357)||(33607-33700)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (148-198)||(66140-66190)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (148-198)||(61807-61857)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (148-198)||(177195-177245)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (148-198)||(175676-175726)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (148-194)||(264454-264500)
[»] scaffold0848 (2 HSPs)
scaffold0848 (420-481)||(4330-4391)
scaffold0848 (148-198)||(4067-4117)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (150-199)||(9531-9580)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (148-241)||(15593-15685)
scaffold0395 (262-310)||(15711-15759)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (148-204)||(19791-19847)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (148-196)||(6209-6257)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (264-467)||(8495-8698)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (151-198)||(12626-12673)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (402-457)||(723-778)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (149-196)||(1313-1360)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (462-564)||(9097-9197)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (148-195)||(6277-6324)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (148-199)||(1184-1235)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (415-486)||(6990-7061)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (148-198)||(880-930)
[»] scaffold0751 (2 HSPs)
scaffold0751 (417-467)||(6118-6168)
scaffold0751 (148-196)||(6397-6445)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (369-451)||(3886-3968)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (148-198)||(5221-5271)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (148-198)||(800-850)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (148-198)||(30731-30781)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (148-194)||(16835-16881)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (148-178)||(17168-17198)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (148-178)||(16656-16686)
scaffold0058 (148-198)||(23342-23392)
[»] scaffold1336 (1 HSPs)
scaffold1336 (148-177)||(1622-1651)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (148-177)||(699-728)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (405-478)||(37865-37938)
[»] scaffold1256 (1 HSPs)
scaffold1256 (148-196)||(1332-1380)
[»] scaffold0947 (1 HSPs)
scaffold0947 (148-196)||(582-630)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (148-196)||(13005-13053)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (148-204)||(4604-4659)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (148-196)||(14718-14766)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (148-204)||(28816-28871)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (154-198)||(18449-18493)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (148-196)||(20650-20698)


Alignment Details
Target: scaffold0431 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 11621 - 11174
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11621 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattaccatcttatgttgttgttgctactt 11522  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11521 ttatagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaataacctaacgcaaatgct 11422  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11421 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctta 11322  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || |||    
T  11321 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtacggtttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgactggtggg 11223  T
Q  548 ttggncttctaccta-ccttgggcaaaaaggncctgttgtggacctgggc 596  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  11222 ttggccttctacctacccttgggcaagaaggagctgttgt-gacctgggc 11174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 12706 - 12259
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12706 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 12607  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12606 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcctaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 12507  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12506 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctta 12407  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||| |||||||| || | |||| ||||||| || |||    
T  12406 aagagattgagaggattttccgtgttatgtagtgcactgaggatcag-aaagtgcagtttgatactcatcagctagctgaggaagttgatgactggtggg 12308  T
Q  548 ttggncttctaccta-ccttgggcaaaaaggncctgttgtggacctgggc 596  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  12307 ttggccttctacctacccatgggcaagaaggagctgttgt-gacctgggc 12259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 22234 - 21787
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22234 caattggtatcatagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 22135  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaatgatgatgcgttagctgctgcactacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 22035  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22034 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatcgagcccagacgtggctta 21935  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||| || | |||| ||||||| || |||    
T  21934 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcagtttggtactcatcagctagctgaggaagttgatgactggtggg 21836  T
Q  548 ttggncttctaccta-ccttgggcaaaaaggncctgttgtggacctgggc 596  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  21835 ttggccttctacctacccttgggcaagaaggagctgttgt-gacctgggc 21787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 56258 - 55868
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56258 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgatactt 56159  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  56158 ttgtagaatctcagtaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctttacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacccaacgcgaatgct 56059  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  56058 ggtgcaaatgctgagatgaggatgttggagactttctcgaggaagaaccctccaaccttcaaggggagatatgacccggatggagcccagacgtggctta 55959  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  55958 aagagatagagaggatcttccgtgtgatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcgattcggtactcatcagctagctgaggaagctgatga 55868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 47840 - 47890
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  47840 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 47890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 135781 - 135731
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  135781 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgt 135731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 138250 - 138200
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  138250 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgt 138200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 140719 - 140669
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  140719 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgt 140669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 143188 - 143138
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  143188 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgt 143138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 596
Target Start/End: Original strand, 24873338 - 24873784
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24873338 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgcttctt 24873437  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873438 ttgtagaatatcaggaatggctggaagaaatgatgttgcgttagctgctgcactacaagctgtt-cccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 24873536  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24873537 ggtgcgaatgctgagactaggatgttggagactttcatgaataagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctta 24873636  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || |||    
T  24873637 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgactggtggg 24873735  T
Q  548 ttggncttctaccta-ccttgggcaaaaaggncctgttgtggacctgggc 596  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  24873736 ttggccttctacctacccttgggcaagaaggagctgttgt-gacctgggc 24873784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 148 - 577
Target Start/End: Original strand, 23115642 - 23116072
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23115642 caattggtatcatagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatttttgtattactatcttatgttgttgttgcaactt 23115741  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23115742 gttgtagaatatcagcaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgttgctctacaagctattgcccaagctgtgggacaacaacctaatgcagatgc 23115841  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23115842 tggtgcgaatgctgagacgaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 23115941  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||    
T  23115942 aaagagattgagaggatcttccgtgttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgactggtgg 23116040  T
Q  547 gttggncttctaccta-ccttgggcaaaaagg 577  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||| ||||    
T  23116041 gttagccttctacctacccttgggcaagaagg 23116072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 27375125 - 27374710
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27375125 caattggtatcagagcaggttgatccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttattgctactt 27375026  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27375025 ttgtagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgttgcgtcagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 27374926  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27374925 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 27374826  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  27374825 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 27374727  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||||||||||    
T  27374726 ttgctcttctacctacc 27374710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 24713890 - 24713475
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713890 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 24713791  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24713790 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtcggacaacaacctaacgcaaatgct 24713691  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| || ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24713690 ggtgcgaacgcggaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 24713591  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  24713590 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcgatttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 24713492  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  24713491 ttgctcttctgcctacc 24713475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 16932362 - 16931962
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16932362 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgctgttgctactt 16932264  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16932263 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 16932164  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16932163 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 16932064  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  16932063 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgangaagctgatgactggtggg 16931965  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  16931964 ttg 16931962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 17002855 - 17002455
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17002855 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgctgttgctactt 17002757  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17002756 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 17002657  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17002656 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 17002557  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  17002556 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 17002458  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  17002457 ttg 17002455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 24266225 - 24265811
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24266225 caattggtatcagagcaggtcgatccgttcggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatctaatgttgttgttgctactt 24266127  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24266126 ttgaagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgtgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgtt 24266027  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266026 ggtgcgaacgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 24265927  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  24265926 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcattgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 24265828  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  24265827 ttgctcttctgcctacc 24265811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 148 - 522
Target Start/End: Original strand, 41605671 - 41606043
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41605671 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 41605769  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| | ||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41605770 ttgtaaaatctcggtaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgcg 41605869  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41605870 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaagggcgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 41605969  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagcta 522  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||    
T  41605970 aggggattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagcta 41606043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 10872705 - 10872291
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872705 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 10872607  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10872606 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 10872507  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10872506 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 10872407  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  10872406 aggagattgagaggatttaccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcgatttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 10872308  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  10872307 ttgctcttctgcctacc 10872291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 16985095 - 16984695
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16985095 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgctgttgctactt 16984997  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16984996 ttgtagaatatccgaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctcttcaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 16984897  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16984896 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 16984797  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  16984796 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtggg 16984698  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  16984697 ttg 16984695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 22321930 - 22322344
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321930 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagttgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 22322028  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22322029 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 22322128  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| || ||   || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22322129 ggtgcgaacgcggaagctatgatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagatgtggctta 22322228  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  22322229 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 22322327  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  22322328 ttgctcttctgcctacc 22322344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 152 - 564
Target Start/End: Original strand, 44382160 - 44382572
Alignment:
Q  152 tggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttga 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44382160 tggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgt 44382258  T
Q  252 agaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtg 351  Q
    ||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||     
T  44382259 agaatctcggaaatggctggaaggaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaacgccggtt 44382358  T
Q  352 cgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaaga 451  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44382359 cgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaagga 44382458  T
Q  452 gattgagaggattttcc--gtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggtt 549  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||||    
T  44382459 gattgagaggattttccgagtgttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtgggtt 44382557  T
Q  550 ggncttctacctacc 564  Q
    |  ||||| ||||||    
T  44382558 gctcttctgcctacc 44382572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 9488072 - 9487671
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttg-ttgttgctact 246  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9488072 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgattgttgctact 9487974  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  9487973 tttgtagaatatccgaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgc 9487874  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9487873 tggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctt 9487774  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || ||    
T  9487773 aaggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtgg 9487675  T
Q  547 gttg 550  Q
    ||||    
T  9487674 gttg 9487671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 9339438 - 9339037
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttg-ttgttgctact 246  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9339438 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgattgttgctact 9339340  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  9339339 tttgtagaatatccgaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgagacaacaacctaacgtgaatgc 9339240  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9339239 tggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctt 9339140  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || ||    
T  9339139 aaggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtgg 9339041  T
Q  547 gttg 550  Q
    ||||    
T  9339040 gttg 9339037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Original strand, 22462064 - 22462455
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22462064 caattggtatcagagaaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttttattactatcttatgttgttgttgctgctt 22462163  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462164 gttgtagaatatcaggaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 22462263  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  22462264 tggagtgaatgctgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccacgatggagcccagacgtggctt 22462363  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||| ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  22462364 aaagagattgaaaggattttccgtgtgatgcagtgcactgaggtccag-aaagtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatga 22462455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 148 - 497
Target Start/End: Original strand, 24656241 - 24656591
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24656241 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctactt 24656340  T
Q  248 t-tgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
      || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24656341 gatgtagaatatcagaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatac 24656440  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  | ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24656441 tgttgtgaatgctgagactaggatgttggagaatttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctt 24656540  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaa 497  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  24656541 aaggagattgagaggattttccgtgtgatgcagtgcactgaggttcagaaa 24656591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 23028046 - 23028461
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |   ||    
T  23028046 caattggtatcagagcaggtcggttcgtccggccaattagaagagtcatgtcaagtcttagtaatatttgttttactatcttatgttgttgttacctatt 23028145  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23028146 gtgtagaatatcagaaatggctggaagaaaagatggtgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgct 23028245  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | ||||| ||||||| |||  | ||| | |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  23028246 ggtgtgaatgctgagacgaggatgcttgagaccttcatgaggaatcatcctgctactttcaagggaagatatgaccctgacggagcctagtcgtggctta 23028345  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||  || ||||  || | |||||||||||  || |||    
T  23028346 aggagatcgagagagttttccgtgtgatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcgatttggtacacattagctggctgaggaagctgatgattggtggg 23028444  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | ||||||||||||    
T  23028445 ttagtcttctacctacc 23028461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 148 - 489
Target Start/End: Original strand, 22741550 - 22741891
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  22741550 caattggtatcagagcaggtcggtccgtcctgccaattggaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 22741649  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22741650 gtgtagaatctcagagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacaacctaatgcaaatgct 22741749  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||||||||   |||||| | ||||| ||| ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22741750 ggtgcgaatgctgagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctta 22741849  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  22741850 aagagattgagagagttttccgtgtgatgcaatgcaccgaag 22741891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 21319587 - 21320002
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||    
T  21319587 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagaatcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgcctgtt 21319686  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||||||||  |||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| || ||  | |||| |    
T  21319687 gtgtagaatatcagagatggccagaagagatgatgatgcgttagctgctgcacttcaagctatagctcaagctgtgggacaacagccgaatacgaatgtt 21319786  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    || | |||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21319787 ggagtgaatgctgagacgaggatgctagagactttcatgaggaatcatcctccaactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctca 21319886  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || | |||| || |||||  |||||||  |||||||  || | |||| ||||||  || |||    
T  21319887 aggagatcgaaaggattttccgtgtgatgcagtgcaccgaggttcag-aaggtgcgatttggtacagatcagctggctgaggaagttgatgattggtggg 21319985  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | ||||||||||||    
T  21319986 ttagtcttctacctacc 21320002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 20321846 - 20321424
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  20321846 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagttgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttgttgttgcttgat 20321747  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacct------aacgca 341  Q
     || ||||  | ||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||      || |||    
T  20321746 gtgtagaaactaagagatggctggaagaaacgacgttgcgttagctgctgcactacaagcagtagcttaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgca 20321647  T
Q  342 aatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaa-ggacgatatgaccctgatggagcccaaacg 440  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||| | ||||| ||| ||| |||  | ||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||    
T  20321646 aatgctggtgcgaatgctgagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcatcctcctacttttaaagggaagatatgaccccgatggatcccagacg 20321547  T
Q  441 tggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgac 540  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||  |||||||  ||||| |  || | |||||||||||     
T  20321546 tggcttaaagagattgaaagagttttccgtgttatgcaatgcactgaagttcag-aaggtgcgatttggtacacatcagttggctgaggaagctgatgat 20321448  T
Q  541 cggggggttggncttctacctacc 564  Q
     || ||||| | ||||||||||||    
T  20321447 tggtgggttagtcttctacctacc 20321424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 24679346 - 24678931
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  24679346 caattggtatcagagcaggtcggtccgtctggccagttagaagagtcgtgtcgagtcttaataatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 24679247  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24679246 gtgtagaaactaagagatggccagaagagacgatgttgcgttagctgctgcactacaagccgtagcacaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgct 24679147  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | ||||| || || | |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  24679146 ggtgtgaatgctgagacgaggatgcttgagacctttattaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtgactta 24679047  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| |||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||  |||||||  |||||||  |  | |||||||||||  || |||    
T  24679046 aggagatcgagagagttttccgtgttatgcaatgcattgaagatcag-aaggtgcgatttggtacacatcagcttgccgaggaagctgatgattggtggg 24678948  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | ||||||||||||    
T  24678947 ttagtcttctacctacc 24678931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 148 - 496
Target Start/End: Original strand, 23104316 - 23104659
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  23104316 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttgttgttgcttgat 23104415  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  ||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  23104416 gtgtagaaactcagagatggctggtagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagttgtgggacaacagccaaatgcaaatgct 23104515  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||||||     ||  || | ||||| ||| ||| |||  | ||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23104516 ggtgcgaatgctg-----agtctgcttgagaccttcctgaggaatcatcctcttactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctta 23104610  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    ||||||  || ||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23104611 aagagacagaaagagttttccgtgttatgcagtgcattgaagttcagaa 23104659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 23066233 - 23065901
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  23066233 caattggtatcagagcaggtcggtccgtcaggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttg-tgttgcttgtt 23066135  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23066134 gtgtagaaattaagagatggctggaagaaccgacgctgccttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgct 23066035  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| | || |||    |||||| | ||||| ||  ||| |||  | ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23066034 ggtgcaagtgttgaagtgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcttactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctca 23065935  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||    
T  23065934 aagagattgagagagtgttcagtgtaatgcagtg 23065901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 23075683 - 23075351
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  23075683 caattggtatcagagcaggtcggtccgtcaggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttg-tgttgcttgtt 23075585  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23075584 gtgtagaaattaagagatggctggaagaaccgacgctgccttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgct 23075485  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| | || |||    |||||| | ||||| ||  ||| |||  | ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23075484 ggtgcaagtgttgaagtgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcttactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctca 23075385  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| ||||||||    
T  23075384 aagagattgagagagtgttcagtgtaatgcagtg 23075351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 562
Target Start/End: Original strand, 24704092 - 24704479
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||    
T  24704092 caattggtatcagagtaggtcggtccgcccggctaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttttacctg-tt 24704190  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||            ||| |||||||||||              
T  24704191 gtgtagaatatcat-aatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgttgcactacaagctgt------------ggggcaacaacctaa---------- 24704267  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
      ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24704268 --tgcgaatgctgagacgaggatgctagagactttcatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcctagacgtggctta 24704365  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| | |||| ||||||||  |||||||  |||||||| || | |||||||||||  || |||    
T  24704366 aggagatcgagaggattttccgtgtgatgcagtaaactgaggttcag-aaagtgcgttttggtacgcatcagctagctgaggaagctgatgattggtggg 24704464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Original strand, 22732360 - 22732691
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |     
T  22732360 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttgatgttgct--tg 22732457  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||   | ||  |||||| ||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22732458 ttgtagagactaagagatggctagaagagacgacactgcgttagctgatgcactacaagtcgtagcttaagctgtgggacaacaacctgatgcaaatgct 22732557  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||    |||||| | ||||| ||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  22732558 ggtgcgaatgctgaagtgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcc 22732657  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  22732658 aagagatggagagagtgttccgtgtgatgcagtg 22732691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 264 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23030504 - 23030272
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 363  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23030504 atggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagtcgtagctcaagctgttggacaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgctgagt 23030405  T
Q  364 ataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggat 463  Q
      |||||| | || || ||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||  |    
T  23030404 cgaggatgcttgatacctttttgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgactccgatggagcccagatgtggcttaaggagatagaaagagt 23030305  T
Q  464 tttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23030304 tttccgtgttatacagtgcactgaagttcagaa 23030272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 229
Target Start/End: Original strand, 27381727 - 27381808
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatctt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  27381727 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaattagaagagtcgtgttgagttttagtaatagttataatactatctt 27381808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 315 - 496
Target Start/End: Original strand, 24816590 - 24816771
Alignment:
Q  315 caagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggac 414  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| |||||  ||| |||  | ||||| ||||||||||||     
T  24816590 caagttgtggggcaacagcctaatgctaatgctggtgctaatgccgaagttaggatgttggaaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaa 24816689  T
Q  415 gatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | ||||| || |||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||    
T  24816690 ggtatgatccagatgtagctcagacgtggctcaaagaggttgagaggattttccgagttatgcaatgcaatgaggttcagaa 24816771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24646401 - 24646324
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattacta 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  24646401 caattggtatcagagctggtcggtctgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttggtaatagttatattacta 24646324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 363
Target Start/End: Original strand, 23039346 - 23039419
Alignment:
Q  290 agctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 363  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23039346 agctgctgcactacaagtcgtagcacaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgatggtgcgaatgctgaga 23039419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6484449 - 6484399
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  6484449 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaaatagtagagtcgtgt 6484399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12571750 - 12571700
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  12571750 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 12571700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12578232 - 12578182
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  12578232 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 12578182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 21240351 - 21240401
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  21240351 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 21240401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 23096592 - 23096642
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  23096592 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 23096642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23296912 - 23296862
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  23296912 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 23296862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27790347 - 27790297
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  27790347 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 27790297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31505022 - 31504972
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  31505022 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 31504972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Original strand, 19664421 - 19664472
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  19664421 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtc 19664472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 19715588 - 19715638
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  19715588 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccgagtagtagagtcgtgt 19715638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 19720151 - 19720201
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  19720151 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccgagtagtagagtcgtgt 19720201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24644190 - 24644140
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  24644190 caattgatatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 24644140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28351748 - 28351698
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  28351748 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccgagtagtagagtcgtgt 28351698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21902280 - 21902048
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 363  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||  ||||| | || |||||||| |||||||| || || ||   ||||||||| |||| || ||    
T  21902280 atggctggaagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaagctatagctcaagctgtaggacaacatccgaatgctggtgctggtgcaaatgatg-ga 21902182  T
Q  364 at-aggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagga 462  Q
     | ||| ||||||| |||||  |||  ||  | || || |||||||||||| |||| || ||||| ||||| || | ||||||||||||| | |||||||    
T  21902181 gtgaggttgttggaaacttttctgagaaatcatccaccaactttcaaaggaagatacgatcctgacggagctcagaagtggcttaaagaggtggagagga 21902082  T
Q  463 ttttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | ||| | || ||||| |||| ||||| ||||||    
T  21902081 tcttcagggtcatgcaatgcagtgaagttcagaa 21902048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23132445 - 23132389
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  23132445 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 23132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 23710593 - 23710649
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  23710593 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 23710649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 24899264 - 24899320
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24899264 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaaatagttgagtcgtgtcaagtc 24899320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 24901741 - 24901797
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24901741 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 24901797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 24904218 - 24904274
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24904218 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 24904274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 24906693 - 24906749
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24906693 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 24906749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1066341 - 1066294
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  1066341 ttggtatcagagcaggttggtccgtccgaccaagtagtagagtcgtgt 1066294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 183
Target Start/End: Original strand, 20320332 - 20320367
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaa 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20320332 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaa 20320367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20849457 - 20849410
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20849457 ttggtatcaaagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 20849410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23003826 - 23003763
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtggg 325  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  23003826 gaatggctggacgaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagttgtggctcaagctgtggg 23003763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31833248 - 31833201
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  31833248 ttggtatcagagcaggttggtccgtccgaccaagtagtagagtcgtgt 31833201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19803019 - 19802971
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||    
T  19803019 caattggtatcagagcaggttggtccatccggccaagtagttgagtcgt 19802971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19818668 - 19818620
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  19818668 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 19818620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26506959 - 26506903
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  |||||||||| ||||    
T  26506959 caattggtatcagagcaggtcggtccgtctggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 26506903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 45535363 - 45535315
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  45535363 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagtcgagtcgt 45535315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22352072 - 22351661
Alignment:
Q  152 tggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttga 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22352072 tggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgt 22351973  T
Q  252 agaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtg 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22351972 agaatatcaggaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtg 22351873  T
Q  352 cgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaaga 451  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22351872 cgaatgctgagactaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctctaactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaaga 22351773  T
Q  452 gattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttgg 551  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| | || ||| |||||||| || | |||||||||||| || |||||||    
T  22351772 gattgagaggattttccgggttatgcagtgcactaaggatcag-aaagtgcggttcggcactcatcagctagctgaggaagctgatgactggtgggttgg 22351674  T
Q  552 ncttctacctacc 564  Q
     ||||| ||||||    
T  22351673 tcttctgcctacc 22351661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 29472303 - 29472717
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472303 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 29472401  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472402 ttgtagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctttacaagctgttgcctaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 29472501  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29472502 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 29472601  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  29472602 aggagattgagaggatttttcgggttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcggtttggtattcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 29472700  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  29472701 ttgctcttctgcctacc 29472717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 27681630 - 27682044
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27681630 caattggtatcagagcaggttgatccgttcggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 27681728  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27681729 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 27681828  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27681829 ggtgcgaatgctgaagccaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 27681928  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  27681929 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 27682027  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  27682028 ttgctcttctgcctacc 27682044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22138824 - 22138410
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138824 caattggtatcagagcaggtcagtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 22138726  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138725 ttgtagaatatcataaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 22138626  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22138625 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 22138526  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  22138525 aggagattgagagaattttccgggttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcagtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 22138427  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  22138426 ttgctcttctgcctacc 22138410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 27614513 - 27614098
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagca-ggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctact 246  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27614513 caattggtatcaaagcctggttggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctact 27614415  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27614414 tttgtagaatatcagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgc 27614315  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27614314 tggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctt 27614215  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || ||    
T  27614214 aaggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtgg 27614116  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||||  ||||| ||||||    
T  27614115 gttgctcttctgcctacc 27614098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 19774117 - 19773702
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774117 caattggtatcagagcaggtcggtcggtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 19774018  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  19774017 ttgtagaatcttggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgcc 19773918  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19773917 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 19773818  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  19773817 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggttcggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 19773719  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  19773718 ttgctcttctgcctacc 19773702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Original strand, 22329105 - 22329517
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgtt------------g 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |    
T  22329105 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgttgttg 22329203  T
Q  236 ttgttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacct 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22329204 ttgttgctacttttgtagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacct 22329303  T
Q  336 aacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagccc 435  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22329304 aacacaaatgctggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagccc 22329403  T
Q  436 aaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctg 535  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||    
T  22329404 agacgtggcttaaggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctg 22329502  T
Q  536 atgaccggggggttg 550  Q
    ||||| || ||||||    
T  22329503 atgactggtgggttg 22329517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 41774999 - 41774585
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41774999 caattggtatcagagcagggtggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 41774901  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41774900 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 41774801  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| || |    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  41774800 ggtgcgaacgcgggagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttc 41774701  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  41774700 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcgatttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 41774602  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  41774601 ttgctcttctgcctacc 41774585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 27664733 - 27665147
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27664733 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 27664831  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  27664832 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgcc 27664931  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27664932 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 27665031  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||||| |||||| || |||    
T  27665032 aggagattgagaggattttctggattatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagccgatgactggtggg 27665130  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  27665131 ttgctcttctgcctacc 27665147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 37287727 - 37288140
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37287727 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 37287825  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37287826 ttgtagaatctcag-aatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaaattgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 37287924  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37287925 ggtgcgaacgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 37288024  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||| ||||| || |  | |||||||||||| || | |    
T  37288025 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaggatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagttagccgaggaagctgatgactggtgag 37288123  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  37288124 ttgctcttctgcctacc 37288140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 16360659 - 16360258
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttg-ttgttgctact 246  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16360659 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgattgttgctact 16360561  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16360560 tttgtagaatatccgaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgc 16360461  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16360460 tggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctt 16360361  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || ||    
T  16360360 aaggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtgg 16360262  T
Q  547 gttg 550  Q
    ||||    
T  16360261 gttg 16360258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 34570648 - 34570250
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34570648 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 34570551  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34570550 ttgaagaatatcag-aatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 34570452  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34570451 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 34570352  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  34570351 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtggg 34570253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 40712936 - 40712536
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40712936 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 40712838  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  40712837 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctcttcaagctgttgcccaagctgtgggacaacaatctaacgtgaatgct 40712738  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40712737 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgattttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 40712638  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  40712637 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 40712539  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  40712538 ttg 40712536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 148 - 549
Target Start/End: Original strand, 14995981 - 14996368
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14995981 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 14996079  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||            |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996080 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaag------------ctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 14996167  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14996168 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 14996267  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  14996268 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcagtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 14996366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 189 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 27522522 - 27522162
Alignment:
Q  189 agagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || |||| |||||    
T  27522522 agagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgtagaatctcagaaatggctggaaggaatgatgctgcgt 27522423  T
Q  289 tagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaa 388  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  27522422 tagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaa 27522323  T
Q  389 gaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaa 488  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27522322 gaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaa 27522223  T
Q  489 gatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttg 550  Q
    |||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || ||||||    
T  27522222 gatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtgggttg 27522162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 148 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 18783275 - 18782861
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18783275 caattggtatcagagcaggtcggtctgtccggtcaattcgaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctgctt 18783176  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18783175 gttgtagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 18783076  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||  | | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18783075 tggtgtgaacgctgagactaggatgttggagaccttcgtgagaaatcatcatccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctt 18782976  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||| ||||| ||  |||||| | | |||||| || | |||||||||||| || ||    
T  18782975 aaagagattgagaggattttccgtgtgatgcagtgcaccgaggtccag-aaagtacgatttggtattcaccagctagctgaggaagctgatgactggagg 18782877  T
Q  547 gttggncttctaccta 562  Q
    ||| | || |||||||    
T  18782876 gttagtctgctaccta 18782861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 148 - 485
Target Start/End: Original strand, 23536441 - 23536778
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23536441 caatttgtattagagcaggtcggtctgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttttattactatcttatgttgttgttgctactt 23536540  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23536541 gttgtagaatatcag-aatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgc 23536639  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23536640 tggtgtgaatgctgagaccaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 23536739  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcact 485  Q
    || |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  23536740 aaggagattgagaggattttctgtgtgatgtagtgcact 23536778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 149 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 21883936 - 21883518
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttt 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||     
T  21883936 aattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgttg 21883837  T
Q  249 tgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctg 348  Q
    || ||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  21883836 tgtagaatctcataaatgactggaagaaacgatgttgcgttagctgctgcactacaggccgtagcacaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctg 21883737  T
Q  349 gtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaa 448  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||| || ||||||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21883736 gtgcgaatgctgagtcgaggatgctggaaaccttcatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaa 21883637  T
Q  449 agagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggt 548  Q
     || ||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||| |||| || |||||  |||||||| |||||||  || | |||||||||||  || || |    
T  21883636 ggatattgagagagttttccttgtgatgcagtgcaccgaagttcag-aaggtgcgttttggtactcatcagctggctgaggaagctgatgattggtggat 21883538  T
Q  549 tggncttctacctaccttgg 568  Q
    | | ||||||||||| ||||    
T  21883537 tagccttctacctacgttgg 21883518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 148 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20804762 - 20804344
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgct---a 244  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |   |    
T  20804762 caattggtattagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactaccttatgttgttgttgttgtta 20804663  T
Q  245 c---ttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgca 341  Q
    |   || || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||||| ||||| ||     
T  20804662 cctgttgtgtagaatatcag-aatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcagtacaagctgtagctcaacctatgggacaacagcctaatgcg 20804564  T
Q  342 aatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgt 441  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||||||   ||||| ||||||| |||  | ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20804563 aatgctggagtgaatgctgagacgaggatgcacgagaccttcatgaggaatcatcctcctattttcaagggtagatatgaccctgatggagcccatacgt 20804464  T
Q  442 ggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgacc 541  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||  |||||||  |||| ||| || | |||||||||||      
T  20804463 ggcttaaggagatcgagaggattttccgtgttatgtagtgcactgaggttcag-aaagtgcgttttggtacacatcaactagctgaggaagctgatgatt 20804365  T
Q  542 ggggggttggncttctaccta 562  Q
    || ||||| | ||||||||||    
T  20804364 ggtgggttagccttctaccta 20804344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 23462057 - 23461649
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |     
T  23462057 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttacctgtg 23461958  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || || || ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || |||| || |||||| | ||||| || |||      ||||||    
T  23461957 atgtagtatttca-gaatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaaactgtagcacaagctattggacatcagcct------aatgct 23461865  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    || | |||||||||||  |||||| | ||||| ||||||| |||  | |||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  23461864 ggagtgaatgctgagacgaggatgcttgagaccttcatgaggaatcatcctccggttttcaaaggaagatacgaccctgatggagcccaggcgtggctta 23461765  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||  | |||||  || | |||||||||||  || |||    
T  23461764 aggagatcgagaggattttccatgttatgcagtgcactgaggttcag-aaagtgcgttttggtacacaacagctggctgaggaagctgatgattggtggg 23461666  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | ||||||||||||    
T  23461665 ttagccttctacctacc 23461649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25430580 - 25430247
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  25430580 caattggtatcagagcaggtcagtccgtccggccaattagaagagtcgtgacgagttttagtaatagttatattactatcttatgttgttgttgcttgct 25430481  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  |||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25430480 gtgtagaaactaagagatggctagaagagacgacactgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgct 25430381  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| | ||||||    |||||| | | ||| ||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  25430380 ggtgcaagtgctgaagcgaggatgctagggacctttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatattaccctgatggagcccagacgtggctca 25430281  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  25430280 aagagattgagagagtgttccgtgtaatgcagtg 25430247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41768425 - 41768264
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41768425 caattggtatcagagcagggtggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 41768327  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgt 310  Q
    ||| | ||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41768326 ttgtacaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgt 41768264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 149 - 460
Target Start/End: Original strand, 26733722 - 26734032
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttt 248  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||  || | | ||| | || || || | ||||||||||||||||||  ||     
T  26733722 aattggtataagagcaggtcggtccgtccggccaagtagatgagtcgtgtcttgt-tgattaacagttgtaatattgtcttatgttgttgttgcttgttg 26733820  T
Q  249 tgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctg 348  Q
    || |||  |  | |||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||||| ||| | | || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||    
T  26733821 tgtagagaactaagaatggttggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagaagttttggctcaagctgtaggacatcagcctaatgctaatgctg 26733920  T
Q  349 gtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaa 448  Q
    |||| ||||||||    ||||||||||||||||| |||| |||  | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  26733921 gtgcaaatgctgaagtgaggatgttggagacttttatgaggaatcaacctcctacttttaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaa 26734020  T
Q  449 agagattgagag 460  Q
    ||||||||||||    
T  26734021 agagattgagag 26734032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 487
Target Start/End: Original strand, 21331329 - 21331554
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||   ||||||||| |  ||||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||| || || ||||||||    
T  21331329 gaatggctggaagaaacgacgctgcgactgctgctgcattggaagctgtggctcaagctgtggggcatcagcctaatgctaatgcgggagctaatgctga 21331428  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
        |||||||||||||||||  ||| | |  | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  21331429 agtgaggatgttggagacttttctgaggtatcatcctcctaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagaga 21331528  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
     | ||||| |||||||||||||||||    
T  21331529 gtgttccgggttatgcagtgcactga 21331554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23475239 - 23475006
Alignment:
Q  263 aatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgag 362  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||  |  ||| ||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||     
T  23475239 aatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcgttggaagatgtggctcaagctgtggagcaacagcctaatgctaacgcgggtgctaatgctgaa 23475140  T
Q  363 aataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagga 462  Q
      ||||||||||||||| ||  ||| |||  | || || ||||| |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||      
T  23475139 gttaggatgttggagacctttttgaggaatcatccgcctactttgaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagag 23475040  T
Q  463 ttttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  23475039 tgttccgtgttatgcaatgcactgatgttcagaa 23475006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 418 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23529164 - 23529086
Alignment:
Q  418 atgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23529164 atgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgagagtgttttccgtgttatgcaatgcactgaagttcagaa 23529086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 22233418 - 22233465
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22233418 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaagtagtagagtcgtgt 22233465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 16257248 - 16257298
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16257248 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 16257298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 17265545 - 17265595
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  17265545 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 17265595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 22590967 - 22591017
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  22590967 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 22591017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 22594522 - 22594572
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  22594522 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 22594572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 23562384 - 23562434
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  23562384 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 23562434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 43123621 - 43123571
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  43123621 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 43123571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 1203315 - 1203352
Alignment:
Q  1 ttgtcaaggcctgcaacatctcttcaataatggaattc 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1203315 ttgtcaaggcctgcaacatctcttcaataatggaattc 1203352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20346436 - 20346389
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20346436 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 20346389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22338227 - 22338176
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  22338227 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtc 22338176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 24795905 - 24795952
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  24795905 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 24795952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25852227 - 25852180
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  25852227 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 25852180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 316 - 366
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  316 caattggtatcagagcaggttggtccgtctggccaagtagtagagtcgtgt 366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 21676339 - 21676389
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  21676339 caattggtatcaaagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 21676389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 23077132 - 23077182
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  23077132 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgaccaagtagtagagtcgtgt 23077182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 202
Target Start/End: Original strand, 24618514 - 24618568
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgag 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||    
T  24618514 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagtagagtcgtatcgag 24618568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 202
Target Start/End: Original strand, 24747773 - 24747827
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgag 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||    
T  24747773 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagtagagtcgtatcgag 24747827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6555159 - 6555111
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  6555159 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 6555111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 460
Target Start/End: Original strand, 21560370 - 21560566
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 363  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||  ||||||| || |||| |||||||||||| || || ||   ||||||||  |||| ||       
T  21560370 atggctggaagaaacgatgttgctattgctgctgcacttgaagctgtagctcaagttgtgggacaacagccgaatgctggtgctggtgtaaatgatggag 21560469  T
Q  364 ataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagag 460  Q
      ||||||||||| |||||  |||  ||  | || || |||||||||||| | || || ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||    
T  21560470 ccaggatgttggaaacttttttgagaaatcatccaccaactttcaaaggaaggtacgatcctgatggagctcaaaggtggctcaaagaggttgagag 21560566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 21981810 - 21981865
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||    
T  21981810 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaagtag-tgagtcgtgttgagtc 21981865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Original strand, 30344073 - 30344121
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  30344073 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 30344121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22506821 - 22506774
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  22506821 ttggtatcagagcaggttggtccgtctggccaagtagtagagtcgtgt 22506774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23670791 - 23670760
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23670791 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 23670760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 194
Target Start/End: Original strand, 37540876 - 37540919
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  37540876 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtc 37540919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20771286 - 20771256
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20771286 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 20771256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20780061 - 20780031
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780061 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 20780031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20825604 - 20825574
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20825604 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 20825574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 202
Target Start/End: Original strand, 24714745 - 24714799
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgag 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||    
T  24714745 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagtagagttgtatcgag 24714799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Original strand, 28891162 - 28891192
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28891162 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 28891192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20311849 - 20311820
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtcc 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20311849 caattggtatcagagcaggttggtccgtcc 20311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 179
Target Start/End: Original strand, 14883205 - 14883233
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccgg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14883205 ttggtatcagagcaggttggtccgtccgg 14883233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16641874 - 16641826
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  16641874 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 16641826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22466098 - 22466070
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22466098 caattggtatcagagcaggttggtccgtc 22466070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29347563 - 29347507
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  29347563 caattggtatcagagcaggtcggtccatccggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 29347507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29350036 - 29349980
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  29350036 caattggtatcagagcaggtcggtccatccggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 29349980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 148 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 42409 - 41962
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42409 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 42310  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42309 ttgaagaatatcagaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggataacaacctaacgcaaatgct 42210  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42209 ggtgcgaatgctgagactagaatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaacgaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctta 42110  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||| |||||||| ||   |||||||||||| || |||    
T  42109 aagagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgtggttcggtactcatcagctagctgtggaagctgatgactggtggg 42011  T
Q  548 ttggncttctaccta-ccttgggcaaaaaggncctgttgtggacctgggc 596  Q
    || | |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  42010 ttagccttctacctacccttgggcaagaaggagctgttgt-gacctgggc 41962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 149 - 564
Target Start/End: Original strand, 12179 - 12586
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt- 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  12179 aattggtatcagagcaggtcggtctgtccggtcaattagaagagtcttgttgagtcttagtaatatttatattactatgttatgttgttgttgctgcttg 12278  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |  |||| || |||||| | |||||      |||  | ||||||    
T  12279 ttgtagaatatcagaaatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcacaagctattggaca------taagcctaatgct 12372  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||  |||||     |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  12373 ggtgtgactgcagagactaggatgttggagaccttcatgaggaatcaccct--agttttcaaaggaagatatgaccctgatggatcccagacgtggcata 12470  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||   || || ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||  || |||    
T  12471 aggagatagagaggattttccatgtgatgcagtgcact-aaggtccagaaggtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgattggtggg 12569  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | ||||||||||||    
T  12570 ttagtcttctacctacc 12586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 97)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 152 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 12890549 - 12890138
Alignment:
Q  152 tggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttga 251  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12890549 tggtatcagagcaggtcggtctgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgt 12890450  T
Q  252 agaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtg 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890449 agaatatcaggaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtg 12890350  T
Q  352 cgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaaga 451  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12890349 cgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaagga 12890250  T
Q  452 gattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttgg 551  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || ||||||     
T  12890249 gattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtgggttgc 12890151  T
Q  552 ncttctacctacc 564  Q
     ||||| ||||||    
T  12890150 tcttctgcctacc 12890138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 148 - 587
Target Start/End: Original strand, 15398805 - 15399243
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15398805 caattggtattagagcaggttggtccgtccggtcaattagaggagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgatgttgttgctactt 15398904  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15398905 ttgtagaatatcagaaatggctggcagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 15399004  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15399005 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctga 15399104  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || |||    
T  15399105 aagagactgagaggatttt-cgggttatgcagtgcactgaagatca-aaaagtgcggtttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgactggtggg 15399202  T
Q  548 ttggncttctaccta-ccttgggcaaaaaggncctgttgtg 587  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||    
T  15399203 ttggtcttctacctacccttggacaagaaggagctgttgtg 15399243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 15359894 - 15359481
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15359894 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattataggagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgatgttgttgctactt 15359795  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15359794 ttgtagaatatcagaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 15359695  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||      
T  15359694 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagttatgaccctgatggagcccagacgtggct-- 15359597  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || |||    
T  15359596 aagagactaagaggattttccgggttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgactggtggg 15359498  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||| ||||||||||||    
T  15359497 ttggtcttctacctacc 15359481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 15712343 - 15712757
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15712343 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 15712441  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15712442 ttgtagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgttgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 15712541  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15712542 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcctactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 15712641  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  15712642 aggagattgagaggattttctgggttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 15712740  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  15712741 ttgctcttctgcctacc 15712757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 3689786 - 3689372
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3689786 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 3689688  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3689687 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 3689588  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3689587 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 3689488  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||| ||| || |||    
T  3689487 aggagatggagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaagaagctgacgactggtggg 3689389  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  3689388 ttgctcttctgcctacc 3689372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 15344532 - 15344946
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15344532 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 15344630  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15344631 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 15344730  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| || ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15344731 ggtgcgaacgcggaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgaccttcaaaggacattatgaccctgatggagcccagacgtggctta 15344830  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| || |  | |||||||||||| || |||    
T  15344831 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagatagccgaggaagctgatgactggtggg 15344929  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  15344930 ttgctcttctgcctacc 15344946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Original strand, 5421217 - 5421617
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5421217 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 5421315  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  5421316 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgcc 5421415  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5421416 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 5421515  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  5421516 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 5421614  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  5421615 ttg 5421617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 13249887 - 13249487
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13249887 caattggtatcagagcaggttgatctgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 13249789  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13249788 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 13249689  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13249688 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 13249589  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  13249588 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 13249490  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  13249489 ttg 13249487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 13256533 - 13256133
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13256533 caattggtatcagagcaggttgatctgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 13256435  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13256434 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 13256335  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13256334 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 13256235  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  13256234 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 13256136  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  13256135 ttg 13256133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 5107826 - 5108240
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5107826 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 5107924  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  5107925 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgcc 5108024  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5108025 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 5108124  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  5108125 aggagattgagaggatttttcgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 5108223  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  5108224 ttgctcttctgcctacc 5108240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 20058341 - 20058755
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20058341 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 20058439  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20058440 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 20058539  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20058540 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 20058639  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  20058640 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcgatttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 20058738  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  20058739 ttgctcttctgcctacc 20058755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 26789700 - 26790114
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789700 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 26789798  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  26789799 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgcc 26789898  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26789899 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 26789998  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  26789999 aggagattgagaggatgttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 26790097  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  26790098 ttgctcttctgcctacc 26790114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 48429290 - 48428890
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48429290 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgctgttgctactt 48429192  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  48429191 ttgtagaatatccgaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctcttcaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 48429092  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48429091 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 48428992  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  48428991 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtggg 48428893  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  48428892 ttg 48428890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 15585679 - 15586093
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15585679 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 15585777  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15585778 ttgtagaatctcgaaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 15585877  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15585878 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 15585977  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  15585978 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcgatttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 15586076  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  15586077 ttgctcttctgcctacc 15586093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 16639617 - 16639216
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttg-ttgttgctact 246  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16639617 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgattgttgctact 16639519  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16639518 tttgtagaatatccgaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgc 16639419  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16639418 tggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctt 16639319  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || ||    
T  16639318 aaggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtgg 16639220  T
Q  547 gttg 550  Q
    ||||    
T  16639219 gttg 16639216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 43166519 - 43166118
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttg-ttgttgctact 246  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43166519 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgattgttgctact 43166421  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  43166420 tttgtagaatatccgaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgc 43166321  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43166320 tggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctt 43166221  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || ||    
T  43166220 aaggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtgg 43166122  T
Q  547 gttg 550  Q
    ||||    
T  43166121 gttg 43166118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 10009443 - 10009029
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10009443 caattggtatcagagcaggttgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 10009345  T
Q  248 ttga-agaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10009344 ttggtagaatatcag-aatggctggaaggaatgatgctgcattagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 10009246  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||||||| || ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10009245 tggtgcgaacgcggaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgaccttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctt 10009146  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || ||    
T  10009145 aaggagcttgagaggattttccgagttatgcagtgcactaaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtgg 10009047  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||||  ||||| ||||||    
T  10009046 gttgctcttctgcctacc 10009029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 148 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 6597897 - 6597475
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6597897 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 6597800  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6597799 ttgtagaatatcagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 6597700  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6597699 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccggctttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 6597600  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||| |||||||  |  | |||||||||||  || |||    
T  6597599 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggttcggtactcatcagctggccgatgaagctgatgattggtggg 6597501  T
Q  548 ttggncttctaccta-ccttgggcaa 572  Q
    |||  ||||| |||| ||||||||||    
T  6597500 ttgctcttctgcctacccttgggcaa 6597475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 16752989 - 16753402
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  16752989 caattggtatcagagcaggtcggtctgtccgatcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatt-atattactatcttttactgttgtcgctactt 16753086  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16753087 ttgtagaatatcagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 16753186  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16753187 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccggctttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 16753286  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  16753287 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 16753385  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  16753386 ttgctcttctgcctacc 16753402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 6604577 - 6604164
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6604577 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtctagtcttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 6604480  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6604479 ttgtagaatatcacaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagttgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 6604380  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6604379 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccggctttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 6604280  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||| |||||||  |  | |||||||||||  || |||    
T  6604279 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggttcggtactcatcagctggccgatgaagctgatgattggtggg 6604181  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  6604180 ttgctcttctgcctacc 6604164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 148 - 571
Target Start/End: Original strand, 53381308 - 53381728
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  53381308 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagttgtgtcgagtcttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 53381405  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  53381406 ttgtagaatatcag-aatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 53381504  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53381505 ggtgcaaatgctgaagctagaatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgattttcaaaggacgctatgaccctgatggagcccagacgtggctta 53381604  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | ||||||||||||  | |||    
T  53381605 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactagtggg 53381703  T
Q  548 ttggncttctacctac-cttgggca 571  Q
    |||  ||||| ||||| ||||||||    
T  53381704 ttgctcttctgcctactcttgggca 53381728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 10910055 - 10909639
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttg---cta 244  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  10910055 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcagttaga-gagtcgtgtcaagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgttgcta 10909957  T
Q  245 cttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaat 344  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| || |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  10909956 cttttgtagaatatcag-aatggctggaaggaatgatgctacgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaat 10909858  T
Q  345 gctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggc 444  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10909857 gctggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggc 10909758  T
Q  445 ttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggg 544  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| |      
T  10909757 ttaaggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcacttaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactgat 10909659  T
Q  545 gggttggncttctacctacc 564  Q
    ||||||  ||||| ||||||    
T  10909658 gggttgctcttctgcctacc 10909639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 189 - 564
Target Start/End: Original strand, 5109736 - 5110110
Alignment:
Q  189 agagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||    
T  5109736 agagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgtagaatctcggaaatggctggaagaaatgatgctgcgt 5109835  T
Q  289 tagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaa 388  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  5109836 tagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgccggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaa 5109935  T
Q  389 gaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaa 488  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||     
T  5109936 gaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcctagacgtggcttaaggagattgagaggatttttcgggttatgcagtgcacggag 5110035  T
Q  489 gatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttggncttctacctacc 564  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||    
T  5110036 gatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtgggttgctcttctgcctacc 5110110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 16696011 - 16695621
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16696011 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttttattactatcttatgttgttgt-gctgctt 16695913  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16695912 gttgtagaatatcagaaatgtctagaagaaacgatgctgcgttaggtgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 16695813  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||  | ||||  |||||||||||   ||||||||| || ||||| || || ||| ||    
T  16695812 tggtgtgaatgctgagaccaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctctaactttcaaagggatatatgaccccgacggagctcagacttggatt 16695713  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||| ||||| ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  16695712 aaggagatggagaggattttccgtgtgatgcagtgcaccgaggtccag-aaagtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatga 16695621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Original strand, 23414069 - 23414463
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||     
T  23414069 caattggtatccgagcaggtcggtccgtctggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattattatcttatgtttttgttgctgcta 23414168  T
Q  248 tt----gaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaa 343  Q
    ||    | |||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23414169 tttgttgtagaatatcagaaatggctagatggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccatgctgtgggacaacaacctaacgcaaa 23414268  T
Q  344 tgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtgg 443  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23414269 tgctggtgtgaatgctgagaccaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccaatggagcccagacgtgg 23414368  T
Q  444 cttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |  ||| ||||| ||  |||||||| |||||||| || | || ||||||||    
T  23414369 ctaaaagagattgaaaggattttccgtgtgatgcagtgcaccgaggtccag-aaagtacgatttggtactcatcagctagctgaggaggctgatga 23414463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 148 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24186997 - 24186732
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24186997 caattggtatcagagcaggtcggttcgtccgatcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgctgttgctactt 24186898  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24186897 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaactatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtggaacaacaacctaacgcgaatgct 24186798  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaagga 413  Q
    ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24186797 ggtgttaatgctgagacgaggatgttggagactttcatgaggaagaaccctccaactttcaaagga 24186732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 148 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11862198 - 11861850
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |   ||    
T  11862198 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcatgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatattgttgttacctgtt 11862099  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11862098 atatagaatatcag-aatggctggaagaaacgatgatgtgttagctgctgcactacaagccgtagcccaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgct 11862000  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    || | |||||||||||  |||||| | ||||| ||||||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11861999 ggagtgaatgctgagacgaggatgcttgagaccttcatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatcgagcccagacgtggctta 11861900  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaa 497  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||    
T  11861899 aggagatcgagaggattttccgtgtgatgtagtgcactgaggttcagaaa 11861850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 14872869 - 14873283
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  14872869 caattggtattagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 14872968  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14872969 gtgtagaatctcagaaatggctggaagaaacgatgctgcattagctgctaaactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacaacctaatgcaaatgct 14873068  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | |||||||| | || |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14873069 ggtgtgaatgctgagacgaggatgcttgagacttt-acgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctta 14873167  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||  |||||||  |||||||| |  | |||||||||||  || |||    
T  14873168 aggagatcgagagagtttttcgtgttatgcaatgcactgaagttcag-aaggtgcgatttggtacacatcagctagccgaggaagctgatgattggtggg 14873266  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | ||| ||||||||    
T  14873267 ttagtcttatacctacc 14873283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 148 - 489
Target Start/End: Original strand, 23078293 - 23078634
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||    
T  23078293 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccagccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgactgtt 23078392  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| |||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23078393 gtgtagaatctcaaaaatgggtggaagaaatgatgttgcgttagctgctgcactataagccgtagcacaagtcgtgggacaacagcctaatgcaaatgct 23078492  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | |||||||| |||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23078493 ggtgtgaatgctgagacgaggatgcttgagacttttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctta 23078592  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    |  |||| |||||  || |||| |||||||| ||||| ||||    
T  23078593 agaagatcgagagagttatccgggttatgcaatgcaccgaag 23078634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 148 - 329
Target Start/End: Original strand, 16490610 - 16490790
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16490610 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactgtcttatgttgatgttgctactt 16490708  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaa 329  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16490709 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaa 16490790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Original strand, 15458712 - 15459042
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |     
T  15458712 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaataattttattactatcttatgttgttgttgct--tg 15458809  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| || | || | ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||    
T  15458810 ttgtag-agattaagaatggctggaagaaacgatgttgtgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgttggacatcagcctaatgcgaatgct 15458908  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| | ||||||    |||||| | ||||| ||   || |||  | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15458909 ggtgcaagtgctgaagcgaggatgctagagacctttcggaggaatcatcctcctactctcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctca 15459008  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  15459009 aagagattgagagggttttccgcgtgatgcagtg 15459042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 17498535 - 17498205
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |     
T  17498535 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttattgttgct--tg 17498438  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| || | || | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||| ||| ||||| || ||||||    
T  17498437 ttgtag-agattaagaatggctggaagaaacgacactgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagttgtgggacgacagcctaatgcgaatgct 17498339  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||  | || |||    |||||| | ||||| ||  ||| | |  | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17498338 ggtggaagtgttgaagggaggatgctagagacctttctgagggatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctca 17498239  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    | |||||| ||| | ||||| | || ||||||||    
T  17498238 aggagatttagaaggttttctgcgtgatgcagtg 17498205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26709127 - 26709007
Alignment:
Q  33 gaattcattgctgctgttgcagctgtnaatcaagttctatggctgagaaaaattctagttgatctacagatgactcaagcagaaccaactagggtgtttg 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26709127 gaattcattgctgctgctgcagctgttaatcaagttctgtggctgagaaaaattctagttgatctacaaatgactcaagcagaaccaactagggtgtttg 26709028  T
Q  133 tagataatcaagcagcaattg 153  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26709027 tagataatcaagcagcaattg 26709007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12502737 - 12502483
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  12502737 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccagccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 12502638  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |  |||| || |||||| | ||||| || |||      ||||||    
T  12502637 gtgtagaatctca-gaatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactatatactgtagcacaagctattggacatcagcct------aatgct 12502545  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaa 409  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||  | ||||| ||||||||    
T  12502544 ggtgtgaatgctgagacgaggatgcttgagactttcatgaggaatcatcctcctactttcaa 12502483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 15066913 - 15066567
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcg-----agtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgc 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  15066913 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcgagtcttagtagtaattgtattactatcttatgttgttgttac 15066814  T
Q  243 tacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaa 342  Q
       || || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||| || |||| || |||||| | ||||| || |||      |    
T  15066813 ctgttgtgtagaatctca-gaatggctggaaggaacgatgctgctattgctgctgcactagaaactgtagcacaagctattggacatcagcct------a 15066721  T
Q  343 atgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtg 442  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||  | ||||| || ||||| ||  ||||||| || |||||||| || |||||    
T  15066720 atgctggtgtgaatgctgagacgaggatgcttgagactttcatgaggaatcatcctcctaccttcaaggggagatatgatccagatggagctcagacgtg 15066621  T
Q  443 gcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  15066620 gcttaaggtgattgagagagttttccgtgtgatgcagtgcatcgaagttcagaa 15066567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 280
Target Start/End: Original strand, 14125438 - 14125570
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14125438 caattggtatcagagcaggtcggtccgtctggccaattagaagagtcttgttgagtcttagtaatatttggattactatcttatgttgttgttgctactt 14125537  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacga 280  Q
     ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14125538 gttgtaaaatatca-gaatggctggaaggaacga 14125570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 262 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 15263354 - 15263120
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |  ||| |||    |||||||||||||| || |||||  | || || ||||| ||||||||    
T  15263354 gaatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcattggaagttgtgtttcaagctgtgggacatcagcctaatactaacgcgggtgctaatgctga 15263255  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||| |||  | || || |||||||||||| | || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  15263254 ggttaggatgttggagacttttctgaggaatcatccgcctactttcaaaggaaggtacgaccctgatggagctcagacgtggctgaaagagattgagaga 15263155  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
     | |||| ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  15263154 gtgttccatgttatgcaatgcactgaggttcagaa 15263120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 262 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 15264166 - 15263932
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |  ||| |||    |||||||||||||| || |||||  | || || ||||| ||||||||    
T  15264166 gaatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcattggaagttgtgtttcaagctgtgggacatcagcctaatactaacgcgggtgctaatgctga 15264067  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||| |||  | || || |||||||||||| | || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  15264066 ggttaggatgttggagacttttctgaggaatcatccgcctactttcaaaggaaggtacgaccctgatggagctcagacgtggctgaaagagattgagaga 15263967  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
     | |||| ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  15263966 gtgttccatgttatgcaatgcactgaggttcagaa 15263932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15966735 - 15966658
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattacta 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15966735 caattggtatcagagctggtcggtctgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattacta 15966658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15970659 - 15970582
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattacta 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15970659 caattggtatcagagctggtcggtctgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattacta 15970582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 466
Target Start/End: Original strand, 14577818 - 14578022
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    |||||||||| |||||||| | | || | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  14577818 gaatggctggtagaaacgacgctacgattgctgctgcactggaagctgttgctcaagctgtgggacaacagcctaatgctaatgcgggtgcaaatgctga 14577917  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
        |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||     ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  14577918 tgtgaggatgctagagacttttttgaggaatcatcctcttgtgttcaaaggaaggtatgaccctgatgtagctcaaacgtggctcaaggagatcgagagg 14578017  T
Q  462 atttt 466  Q
    |||||    
T  14578018 atttt 14578022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18437712 - 18437616
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagca-ggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgct 243  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  18437712 caattcgtatcagagcctggttggtccgtccggcaaattagatgagtcgtgtcgagttttagtaatagttgtattactatcttatgttgctgttgct 18437616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 451 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24186731 - 24186662
Alignment:
Q  451 agattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagct 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  24186731 agattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtacgcatcagct 24186662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7111481 - 7111404
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattacta 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7111481 caattggtatcagagctggtcggtctgtccggccaattagaagagttgtgtcgagttttagtaatagttatattacta 7111404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 348 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19728406 - 19728258
Alignment:
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| || ||| ||| |||  | || || |||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  19728406 ggtgctaatgctgaggttaggatgttggaaacgttcttgaggaatcatccgcctactttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctca 19728307  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    |||||||||||||  | || || |||||||| |||||||| | ||||||    
T  19728306 aagagattgagagagtgtttcgggttatgcaatgcactgaggttcagaa 19728258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 15937645 - 15937695
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15937645 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaagtagtagagtcgtgt 15937695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 237
Target Start/End: Original strand, 4109592 - 4109681
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatc-ttatgttgtt 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||||| | || ||||||| || ||||||||||    
T  4109592 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcgagt-ttagtaacaattgtattactgtctttatgttgtt 4109681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 8743646 - 8743696
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  8743646 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 8743696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 12356785 - 12356835
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  12356785 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 12356835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13945900 - 13945850
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  13945900 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 13945850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 13969659 - 13969709
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  13969659 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 13969709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14089251 - 14089201
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  14089251 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 14089201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 15935795 - 15935845
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15935795 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 15935845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 16383636 - 16383686
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16383636 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 16383686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 16824540 - 16824590
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16824540 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 16824590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 16830786 - 16830836
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16830786 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 16830836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 18130605 - 18130655
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  18130605 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 18130655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19445150 - 19445100
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  19445150 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 19445100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 31691443 - 31691493
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  31691443 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 31691493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31942774 - 31942724
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  31942774 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 31942724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41180053 - 41180003
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  41180053 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 41180003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 54974811 - 54974761
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  54974811 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 54974761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 54977421 - 54977371
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  54977421 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 54977371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10409837 - 10409790
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  10409837 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 10409790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Original strand, 14577740 - 14577791
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14577740 caattggtatcagagcaggtcggttcgtccggccaattagatgagtcgtgtc 14577791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 2036174 - 2036224
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  2036174 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccacgtagtagagtcgtgt 2036224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 2039915 - 2039965
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  2039915 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccacgtagtagagtcgtgt 2039965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 460
Target Start/End: Original strand, 12842648 - 12842706
Alignment:
Q  402 actttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagag 460  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||    
T  12842648 actttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcatggagattgagag 12842706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 13314720 - 13314770
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  13314720 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggacgagtagtagagtcgtgt 13314770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14040613 - 14040563
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  14040613 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccacgtagtagagtcgtgt 14040563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35984048 - 35983998
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  35984048 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgtccaagtagtagagtcgtgt 35983998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 16455333 - 16455389
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  16455333 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 16455389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 36526796 - 36526748
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  36526796 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagatgagtcgt 36526748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 512
Target Start/End: Original strand, 12857054 - 12857148
Alignment:
Q  417 tatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtac 512  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||| | || ||||| |||| ||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  12857054 tatgaccttgatggagcccaaaagtggctcaaggaggttgagagaattttcagggtgatgcaatgcagtgatgttcag-aaagtgcggtttggtac 12857148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 179
Target Start/End: Original strand, 13027661 - 13027692
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13027661 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 13027692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19728600 - 19728549
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  19728600 caattggtatcagagaaggttggtccgtccagccaagtagatgagtcgtgtc 19728549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28758188 - 28758141
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  28758188 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagttgtgt 28758141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 47127813 - 47127770
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  47127813 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtc 47127770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Original strand, 10416311 - 10416341
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10416311 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 10416341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 11957439 - 11957489
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||    
T  11957439 caattggtatcagagcaggttggtccatccggccacgtagtagagtcgtgt 11957489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 402 - 468
Target Start/End: Original strand, 12508091 - 12508157
Alignment:
Q  402 actttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttcc 468  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || |||||||    
T  12508091 actttcaaaggaaggtgtgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagaggttgaaagaattttcc 12508157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 12856775 - 12856825
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  12856775 caattggtatccaagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 12856825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 13304044 - 13304094
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  13304044 caattggtatcaaagcaggttggtccgtccggacgagtagtagagtcgtgt 13304094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Original strand, 14289793 - 14289823
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14289793 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 14289823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 15011235 - 15011285
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  15011235 caattggtatcagagtaggttggtccgtccggccacatagtagagtcgtgt 15011285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15231454 - 15231404
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  15231454 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgt 15231404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15237322 - 15237272
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  15237322 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgt 15237272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15263478 - 15263420
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtctt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| |||| |||||    
T  15263478 caattggtatcagagcaggttggttcgtccggccaagtagttgagtcgagtcgtgtctt 15263420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15264290 - 15264232
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtctt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| |||| |||||    
T  15264290 caattggtatcagagcaggttggttcgtccggccaagtagttgagtcgagtcgtgtctt 15264232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 417 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 35983769 - 35983719
Alignment:
Q  417 tatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttc 467  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35983769 tatgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagaggttgagaggattttc 35983719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15231344 - 15231275
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaac 333  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  15231344 atggctggaaggaacgatgctgctattgctgctgcactgcaagctgtagctcaagctgtaggacagcaac 15231275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15237212 - 15237143
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaac 333  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  15237212 atggctggaaggaacgatgctgctattgctgctgcactgcaagctgtagctcaagctgtaggacagcaac 15237143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17190238 - 17190189
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  17190238 aattggtatcagagcaagttggtccgtccggccaagtagtagtgtcgtgt 17190189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24191167 - 24191118
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  24191167 aattggtatcagagcaagttggtccgtccggccaagtagtagtgtcgtgt 24191118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 481
Target Start/End: Original strand, 2245159 - 2245275
Alignment:
Q  365 taggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggatt 464  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | || || || || |||||  | ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || |||    
T  2245159 taggatgttggagactttcttgaggaatcaaccaccaacatttaaagggaggtatgatcctgatggcgcccagaagtggcttaaggagattgaaagaatt 2245258  T
Q  465 ttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||| | || ||||||||    
T  2245259 ttcagggtaatgcagtg 2245275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Original strand, 10953037 - 10953085
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  10953037 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 10953085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 13152836 - 13152892
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  13152836 caattggtatcagagcatgtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 13152892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 149 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 21843450 - 21843013
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttt 248  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21843450 aattggtatcagagcaggtcagtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttt 21843352  T
Q  249 tgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctg 348  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21843351 tgtagaatatcagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctttacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctg 21843252  T
Q  349 gtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaa 448  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21843251 gtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaa 21843152  T
Q  449 agagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggt 548  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||    
T  21843151 ggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgactggtgggt 21843053  T
Q  549 tggncttctaccta-ccttgggcaaaaaggncctgttgtg 587  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||    
T  21843052 tggtcttctacctacccttggacaagaaggagctgttgtg 21843013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 16346714 - 16347128
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16346714 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 16346812  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16346813 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 16346912  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16346913 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 16347012  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||| ||| || |||    
T  16347013 aggagatggagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaagaagctgacgactggtggg 16347111  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  16347112 ttgctcttctgcctacc 16347128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 16353363 - 16353777
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353363 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 16353461  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353462 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 16353561  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16353562 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 16353661  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||| ||| || |||    
T  16353662 aggagatggagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaagaagctgacgactggtggg 16353760  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  16353761 ttgctcttctgcctacc 16353777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 19110609 - 19110194
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19110609 caattggtatcagagcaggtcggtccgtctggtcaattagaagagtcgtgttgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 19110510  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  19110509 ttgtagactatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgtt 19110410  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19110409 ggtgtgaatgatgaaactaggatgttggagactttcatgaggaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctta 19110310  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||  || |||    
T  19110309 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagaacag-aaagtgcgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgattggtggg 19110211  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | |||| |||||||    
T  19110210 ttagccttcaacctacc 19110194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 150 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 21834541 - 21834127
Alignment:
Q  150 attggtatcagagca-ggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttt 248  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21834541 attggtatcagagcctggttgatccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttt 21834442  T
Q  249 tgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctg 348  Q
    || ||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21834441 tgtagaatgtcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctatacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgttg 21834342  T
Q  349 gtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaa 448  Q
    ||||||| || ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21834341 gtgcgaacgcggaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaa 21834242  T
Q  449 agagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggt 548  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || ||||    
T  21834241 ggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtgggt 21834143  T
Q  549 tggncttctacctacc 564  Q
    ||  ||||| ||||||    
T  21834142 tgctcttctgcctacc 21834127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 33387149 - 33387563
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33387149 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 33387247  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33387248 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 33387347  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| || ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33387348 ggtgcgaacgcggaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgaccttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 33387447  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  33387448 aggagattgagaggattttccgggttgtgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcgttttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 33387546  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  33387547 ttgctcttctgcctacc 33387563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Original strand, 51329612 - 51330012
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51329612 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 51329710  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| || || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51329711 ttgtagaatatcagaaatggctgggaggaatgatgctgcgttagctgctgctatacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 51329810  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| || ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51329811 ggtgcgaacgcggaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 51329910  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  51329911 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 51330009  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  51330010 ttg 51330012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 148 - 521
Target Start/End: Original strand, 41349791 - 41350160
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41349791 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 41349888  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41349889 ttgtagaatatcag-aatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgttgctctacaagctattgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 41349987  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41349988 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 41350087  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagct 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  41350088 aggagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcacggaggatcag-aaagttcggtttggtactaatcagct 41350160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 17041131 - 17041547
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17041131 caattggtatcagagcatgtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctactt 17041230  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17041231 gttgtagaatatcagaaatggcgggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttacccaagctgtgggacaacaacctaatgtaaatgc 17041330  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
     |||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17041331 cggtgtgactgatgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcaccctctaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 17041430  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| || || ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||  || ||    
T  17041431 aaggagattgagaggatattccgtgttatgcagtgcactgaggtccag-aaggtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgattggtgg 17041529  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||| | |||| |||||||    
T  17041530 gttagtcttcaacctacc 17041547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 22832275 - 22832690
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  22832275 caattggtatcagagcaagtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatattaatattactatcttatgttgttgttacctgtt 22832374  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22832375 gtgtagaatctcagaaatggctggaagaaacgatattgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacaacctaatgcaaatgct 22832474  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | |||||||| |||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  22832475 ggtgtgaatgctgagacgaggatgcttgagacttttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgacctcgatggagcccagacgtggctta 22832574  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | | || || |||||  ||||| |  |||||||| || | |||||||||||| || |||    
T  22832575 aggagatcgagagaattttccgtgtgatgcagtgcattgaggtttag-aaggtgcgatttggtgcacatcagctagctgaggaagctgatgactggtggg 22832673  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | ||||||||||||    
T  22832674 ttagtcttctacctacc 22832690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 148 - 540
Target Start/End: Original strand, 24783979 - 24784369
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24783979 caattggtatcagaacaggtcggtccgtccagtcaattaga-gagtcttgtcgagtctgagtaatatttgtattactatctcatgttgttgttgctactt 24784077  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24784078 gttgtagaatatcag-aatggctggaaggaatgatgctgggttagctgctgctctacaagctgttgcctaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 24784176  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| |||| ||||||  || |||||||||| |||||||| |||  | ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  24784177 tggtgtgaatactgagacaagaatgttggagaatttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgacccagatggagcccaggcgtggctt 24784276  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgac 540  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| || |||||  | |||||  |||||||| || | ||||||||||||    
T  24784277 aaggagattgagaggatcttccgtgtgatgcagtgcactgaggttcag-aaggtgcgattcggtacacatcagctagctgaggaagctgatgac 24784369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 21177604 - 21177195
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21177604 caattggtatcagagcaggtcggttcgtccggccaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatacttgtattactatcttatgttcttgttgctactt 21177505  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |   ||| || |||||| | ||||| || |||      ||| |    
T  21177504 gttgtagaatatca-gaatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagagattgtagcacaagctattggacatcagcct------aattc 21177412  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||  | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21177411 tggtgtgaatgttgagacaaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 21177312  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||  |||||||  |||||||| || | |||||||||||  || ||    
T  21177311 aaggagatcgagaggattttccgtgtgatgaagtgcactgaggttcag-aaagtgcgatttggtacgcatcagctagctgaggaagctgatgattggtgg 21177213  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  21177212 gttagccttctacctacc 21177195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 192 - 568
Target Start/End: Original strand, 22459240 - 22459615
Alignment:
Q  192 gtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttag 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   || || ||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22459240 gtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgttgtgtagaatctcagagatggctggaagaaacgatgttgcgttag 22459339  T
Q  292 ctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaa 391  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||| ||| ||| |||    
T  22459340 ctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgctgagtcgaggatgcttgagaccttcttgaggaa 22459439  T
Q  392 gaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagat 491  Q
      | ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||| |    
T  22459440 tcatcctcctactttcaaggggagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgagagagttttccatgtgatgcagtgcaccgaagtt 22459539  T
Q  492 cagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttggncttctacctaccttgg 568  Q
    ||| || |||||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||  || || || | ||||||||||| ||||    
T  22459540 cag-aaggtgcgttttggtacacatcagctgactgaggaagctgatgattggtggattagtcttctacctactttgg 22459615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 192 - 568
Target Start/End: Original strand, 22469669 - 22470044
Alignment:
Q  192 gtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttag 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   || || ||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22469669 gtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgttgtgtagaatctcagagatggctggaagaaacgatgttgcgttag 22469768  T
Q  292 ctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaa 391  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||| ||| ||| |||    
T  22469769 ctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgctgagtcgaggatgcttgagaccttcttgaggaa 22469868  T
Q  392 gaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagat 491  Q
      | ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||| |    
T  22469869 tcatcctcctactttcaaggggagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgagagagttttccatgtgatgcagtgcaccgaagtt 22469968  T
Q  492 cagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttggncttctacctaccttgg 568  Q
    ||| || |||||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||  || || || | ||||||||||| ||||    
T  22469969 cag-aaggtgcgttttggtacacatcagctgactgaggaagctgatgattggtggattagtcttctacctactttgg 22470044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Original strand, 22434868 - 22435249
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcg---tgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgcta 244  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |      
T  22434868 caattggtatcagagctggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgccgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacct 22434967  T
Q  245 cttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaat 344  Q
     || || ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  22434968 gttgtgtagaatctcagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcacta------------caagctgtggggcaacagcccaatgcaaat 22435055  T
Q  345 gctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggc 444  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||   |||||||| || | |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22435056 gctggtgtgaatgctgagacgaggatgcgcgagacttttattaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggc 22435155  T
Q  445 ttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||    
T  22435156 ttaaggagatcgagaggattttccgtgtgatgcagtgcactgaggttcag-aaagtgcgttttggtacacatcagctggctaaggaagctgatga 22435249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 381 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 22401327 - 22401113
Alignment:
Q  381 ttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagt 480  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22401327 ttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgggaggattttccgtgttatgtagt 22401228  T
Q  481 gcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttggncttctaccta-ccttgggcaaaaaggnc 579  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| || | ||||| |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||      
T  22401227 gcactgaagatca-aaaagtgcggttcggtactcatcagctagctgaggaagccgatgactggtgggttggccttctacctacccttgggcaagaagggg 22401129  T
Q  580 ctgttgtggacctgggc 596  Q
    ||||||| |||||||||    
T  22401128 ctgttgt-gacctgggc 22401113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9791800 - 9791680
Alignment:
Q  33 gaattcattgctgctgttgcagctgtnaatcaagttctatggctgagaaaaattctagttgatctacagatgactcaagcagaaccaactagggtgtttg 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9791800 gaattcattgctgctgctgcagctgttaatcaagttctatggctgagaaaaattctagttgatctacagatgactcaagcagaaccaactagggtgtttg 9791701  T
Q  133 tagataatcaagcagcaattg 153  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9791700 tagataatcaagcagcaattg 9791680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45995262 - 45995141
Alignment:
Q  32 ggaattcattgctgctgttgcagctgtnaatcaagttctatggctgagaaaaattctagttgatctacagatgactcaagcagaaccaactagggtgttt 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||    
T  45995262 ggaattcattgctgctgctgcagctgttaatcaagctttgtggctgagaaaaattctagttgatttacagatggctcaaggaggaccaactaaggtgttt 45995163  T
Q  132 gtagataatcaagcagcaattg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45995162 gtagataatcaagcagcaattg 45995141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20247461 - 20247155
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||| ||||||  | || || |||| || |||||||||||||||  ||    
T  20247461 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagttgagtcgggtcgagt-ttagtagcagttgtaatactgtcctatgttgttgttgcttgtt 20247363  T
Q  248 ttgaagaatatcagga-atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     || |||| |  | || ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  20247362 gtgtagaaaactaagagatggctggaagaaacgacgctacgttagctgctgcactacatgttgtggctcaagctgtgggacaacagcctaatgcgaatgc 20247263  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||| || | ||||||    ||||||||||||| |||  ||| |||  | ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||| || || | |||     
T  20247262 tggagcaagtgctgaagcgaggatgttggagagttttgtgaggaatcatcctcctaatttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacttagctc 20247163  T
Q  447 aaagagat 454  Q
    ||||||||    
T  20247162 aaagagat 20247155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 243
Target Start/End: Original strand, 22359636 - 22359731
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgct 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22359636 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccgaccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttgttgttgct 22359731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 264 - 489
Target Start/End: Original strand, 21044386 - 21044611
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 363  Q
    ||||||||||||||| |   |||| | ||||||||| |  ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||      
T  21044386 atggctggaagaaacaacactgcgattgctgctgcattggaagctgtggctcaagctgtggagcaacaacctaatgctaatgctggtgctaatgctgaag 21044485  T
Q  364 ataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggat 463  Q
     |||||||||||||| |||  ||| |||  | || || || ||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |    
T  21044486 ttaggatgttggagatttttgtgaggaatcatccacctaccttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagagt 21044585  T
Q  464 tttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||    
T  21044586 tttccgggttatgcaatgcactgaag 21044611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 240
Target Start/End: Original strand, 27251669 - 27251761
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgtt 240  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27251669 caattggtattagagcaggttggcccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttgttgtt 27251761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 262 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16380224 - 16379989
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct-ggtgcgaatgctg 360  Q
    ||||| ||||||||||||| | || | | ||||||||| |  ||| ||| || |||||||||||||| || ||||| || |||| | ||||| |||||||    
T  16380224 gaatgactggaagaaacgacgctgtgattgctgctgcattggaagttgtggctcaagctgtgggacatcagcctaatgctaatgtttggtgcaaatgctg 16380125  T
Q  361 agaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagag 460  Q
    ||  | | |||||||||||||| |||| |||  | || || |||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16380124 aggtttgaatgttggagacttttatgaggaatcatccgcctactttcaaagggaggtatgaccctgatggagctcagacgtggcttaaagagattgagag 16380025  T
Q  461 gattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
      |||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  16380024 agtttttcgtgtgatgcaatgcactgaggttcagaa 16379989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21753221 - 21753126
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgct 243  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | | ||||||||||||||||||    
T  21753221 caattagtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttgtatgattgtcttatgttgttgttgct 21753126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 22117763 - 22117609
Alignment:
Q  342 aatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgt 441  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||  ||| |||  | || || |||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  22117763 aatgctggtgctaatgctgaagttaggatgttggagacctttttgaggaatcatccgcctactttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgt 22117664  T
Q  442 ggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    |||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  22117663 ggctcaaagagattgagagagtgttccgtgttatgcaatgtactgaggttcagaa 22117609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Original strand, 39245988 - 39246053
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaata 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39245988 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcaagttttagtaata 39246053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 18273926 - 18273722
Alignment:
Q  263 aatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgag 362  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||| || |    ||||||||| ||||||||     
T  18273926 aatggctggaagaaatgatgttgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgtaggacaacaaccgaatgttggtgctggtgcaaatgctgaa 18273827  T
Q  363 aataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagga 462  Q
      ||||||||| ||||||||  ||| |||  | || || |||||||||||  ||||||| ||||||||||| || | |||||| || ||| ||||||| |    
T  18273826 gttaggatgttagagacttttctgaggaatcatccaccaactttcaaaggtagatatgatcctgatggagctcagaagtggctcaaggaggttgagagaa 18273727  T
Q  463 ttttc 467  Q
    |||||    
T  18273726 ttttc 18273722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 20073813 - 20073860
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20073813 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagaagagtcgtgt 20073860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 202
Target Start/End: Original strand, 23196358 - 23196412
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgag 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  23196358 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgtcgag 23196412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 31536110 - 31536160
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  31536110 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 31536160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 198
Target Start/End: Original strand, 38908928 - 38908977
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  38908928 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 38908977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 20922426 - 20922334
Alignment:
Q  404 tttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20922426 tttcaaaggaaggtatgatccagatggagcacagacgtggctcaaggagattcaaagagttttccgtgttatgcaatgcactgaagttcagaa 20922334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22117962 - 22117911
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  22117962 caattggtatcagagcaagttggtccgtccggccaagtagatgagtcgtgtc 22117911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37681335 - 37681288
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  37681335 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 37681288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48427159 - 48427112
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  48427159 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 48427112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19858562 - 19858512
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  19858562 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaactagtagagtcgtgt 19858512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 21738141 - 21738191
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  21738141 caattggtatcagagcaggttggttcgtccggccaagtagtagagtcgtgt 21738191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41311532 - 41311482
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  41311532 caattggtatcatagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 41311482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19858331 - 19858207
Alignment:
Q  365 taggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggatt 464  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||  | || || |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||    
T  19858331 taggatgttggacactttcctgagaaatcatccaccaactttcaaaggaaggtatgatcctgatggtgcccagaagtggcttaaggaagttgaaaggatt 19858232  T
Q  465 ttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    ||| | |||||||| || |||||||    
T  19858231 ttcagggttatgcaatgtactgaag 19858207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20298657 - 20298610
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  20298657 ttggtatcagagcaggttggtccgtccgaccaagtagtagagtcgtgt 20298610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 20397703 - 20397750
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  20397703 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagcagtagagtcgtgt 20397750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 195
Target Start/End: Original strand, 21044266 - 21044313
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcg 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  21044266 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagtagagtcg 21044313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21962315 - 21962268
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  21962315 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagactcgtgt 21962268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 36212815 - 36212862
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  36212815 ttggtatcatagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 36212862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 52990026 - 52989979
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  52990026 ttggtatctgagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 52989979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Original strand, 20046663 - 20046693
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046663 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 20046693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 37192073 - 37192025
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  37192073 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaaatagttgagtcgt 37192025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 11233270 - 11233684
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11233270 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 11233368  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11233369 ttgtagaatatcagaaatggccggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 11233468  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11233469 ggtgcgaatactgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 11233568  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  11233569 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 11233667  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  11233668 ttgctcttctgcctacc 11233684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 13690254 - 13689840
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13690254 caattggtatcagagcaggtcgatccgttcggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 13690156  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13690155 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 13690056  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13690055 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 13689956  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  13689955 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 13689857  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  13689856 ttgctcttctgcctacc 13689840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 8711819 - 8711404
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8711819 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 8711720  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  8711719 ttgtagaatatcagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 8711620  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8711619 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccggctttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 8711520  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  8711519 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 8711421  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  8711420 ttgctcttctgcctacc 8711404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 15157114 - 15157528
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15157114 caattggtatcagagcaggtcgatccgttcggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 15157212  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15157213 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 15157312  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15157313 ggtgcgaacgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 15157412  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  15157413 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 15157511  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||||||||||    
T  15157512 ttgctcttctacctacc 15157528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 148 - 521
Target Start/End: Original strand, 11549158 - 11549530
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549158 caattggtatcagagcaggtcggtctgtccggtaaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 11549257  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11549258 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgct 11549357  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11549358 ggtgttaatgctgagacgaggatgttggagactttcatgaggaggaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctta 11549457  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagct 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  11549458 aggagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtacgcatcagct 11549530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Original strand, 44787408 - 44787808
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44787408 caattggtatcagagcaggtcgatctgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 44787506  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  44787507 ttgtagaatatccgaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaggctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 44787606  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44787607 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 44787706  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  44787707 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtggg 44787805  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  44787806 ttg 44787808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 18586227 - 18586642
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18586227 caattggtatcagaccaggtcgatccatccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatactgttgttgctactt 18586326  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18586327 ttgtagaatatcagaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 18586426  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18586427 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccggctttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 18586526  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| || |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  18586527 aagagattgagaggattttccgagttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgtggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 18586625  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  18586626 ttgctcttctgcctacc 18586642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 10874665 - 10874251
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10874665 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gattcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatggtgttgttgctactt 10874567  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  10874566 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgcc 10874467  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10874466 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgacccttatggagcccagacgtggctta 10874367  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||  |  | ||||||| |||| || |||    
T  10874366 aggagattgagaggatttttcgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagttcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctggtgactggtggg 10874268  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  10874267 ttgctcttctgcctacc 10874251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 148 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 12691715 - 12691343
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12691715 caattggtattagagcaggtcggttcgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtgatatttatattactatcttatgttgctgttgctactt 12691616  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||||  |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12691615 ttgtagaatatcagaaatggctagaagggacgatgctccgttagctgctactctacaagctgttgcccaaactgtgggacaacaacctaacgcgaatgtt 12691516  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12691515 ggtgttaatgctgagacgaggatgttggagactttcatcaggaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctta 12691416  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagct 521  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  12691415 aagagattgagaggatttttcgtgttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtacgcatcagct 12691343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 148 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 14958722 - 14958350
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14958722 caattggtatcagagcaggtcggttcgtccggtcaattagaagagtcgtatcgagtcttagtgatatttatattactatcttatgttgctgttgctactt 14958623  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14958622 gtgtagaatatcagaaatggctagaagggacgatgctgcattagctgctactctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 14958523  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  14958522 ggtgttaatgctgagacgaggatgttggagacttttatgaggaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatgtagccctgacgtggctta 14958423  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagct 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  14958422 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtacgcatcagct 14958350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 18181944 - 18181541
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagca-ggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctact 246  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18181944 caattggtatcagagcctggttggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgttgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctact 18181846  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  18181845 tttgtagaatatcagaaatggctggaagaaacaatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaac-------- 18181754  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
        |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18181753 ----gcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccaattttcaaaggacgttatgaccctggtggagcccagacgtggctt 18181658  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |  | |||||||||||| || ||    
T  18181657 aaggagattgagagaatttttcgggttatgcagtgcattgaggatcag-aaagtgcggtttggtactcaacagctaaccgaggaagctgatgactggtgg 18181559  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||||  ||||| ||||||    
T  18181558 gttgctcttctgcctacc 18181541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 9592580 - 9592191
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9592580 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctgctt 9592481  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
          |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9592480 gctgtcaatatcag-aatggctggaagaaacgatgctgcattaggtgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaccaacctaacgcgaatgct 9592382  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    || | ||||| |||||  | |||||||||||| ||||||  |||  | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9592381 ggagtgaatgttgagaccatgatgttggagaccttcatggggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctta 9592282  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||   ||||| ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  9592281 aagagattgagaggattttccgtgtgatgtagtgcact-aaggtccagaaagtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatga 9592191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 148 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 14336584 - 14336318
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14336584 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagg-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 14336486  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  14336485 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgcc 14336386  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacg 415  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14336385 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacg 14336318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 16725508 - 16725918
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16725508 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgatgctt 16725607  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |  |||| || |||||| | ||||| || |||      |||||    
T  16725608 gttgtagaatataagagatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcacaagctattggacatcagcct------aatgc 16725701  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16725702 tggtgtgaatgctgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtgactt 16725801  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||| || || ||  |||||||| || ||||| || | |||||||||||  || ||    
T  16725802 aaggagattgaaaggatattccgtgtgatgcagtgcactgaggtccag-aaggtacgatttggtactcattagctagctgaggaagctgatgattggtgg 16725900  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  16725901 gttagtcttctacctacc 16725918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 17702522 - 17702932
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17702522 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctgctt 17702621  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |  |||| || |||||| | ||||| || |||      |||||    
T  17702622 gttgtagaatattagagatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcacaagctattggacatcagcct------aatgc 17702715  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17702716 tggtgtgactgctgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtgactt 17702815  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||| || || ||  |||||||| || ||||| || | |||||||||||  || ||    
T  17702816 aaggagattgaaaggatattccgtgtgatgcagtgcactgaggtccag-aaggtacgatttggtactcattagctagctgaggaagctgatgattggtgg 17702914  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  17702915 gttagtcttctacctacc 17702932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35927049 - 35926929
Alignment:
Q  33 gaattcattgctgctgttgcagctgtnaatcaagttctatggctgagaaaaattctagttgatctacagatgactcaagcagaaccaactagggtgtttg 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35927049 gaattcattgctgctgctgcagctgttaatcaagttctatggctgagaaaaattctagttgatctacagatgactcaagcagaaccaactagggtgtttg 35926950  T
Q  133 tagataatcaagcagcaattg 153  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35926949 tagataatcaagcagcaattg 35926929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 149 - 496
Target Start/End: Original strand, 15144977 - 15145324
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttt 248  Q
    ||||||||| |||| || | | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||   |     
T  15144977 aattggtattagagaagatcgatccgtccggctaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttgtattactatcttatgttgttgctacttgatg 15145076  T
Q  249 tgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctg 348  Q
    || ||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || |||   |  |||||||    
T  15145077 tgtagaatctaagagatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtaggacatcagcctgttgggaatgctg 15145176  T
Q  349 gtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaa 448  Q
    |||  ||||||||    |||||| | ||||| ||  ||| |||  | ||||| | || ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15145177 gtgtaaatgctgaagtgaggatgctagagacgtttctgaggaatcatcctcctatttgcaaaggaaggtatgaccctgatggagcccagacgtggcttaa 15145276  T
Q  449 agagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
     |||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  15145277 ggagattgagagagtgttccgcgtgatgcagtgcactgaagttcagaa 15145324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14043911 - 14043579
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||  ||||||||||| || ||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||  ||    
T  14043911 caattggtatcagagcaggtcggtccatctggccaagtagttgagtcgtgtcgtgt-ttagtaacagttgtaatactgtcttatgttgttgttgcttgtt 14043813  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||| |  | ||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||| | ||| ||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  14043812 ctgtagaaaactaagaatggctggaaggaacgacgctgcgattgctgctgcacgagaagttgtggctcaagctgtgggacatcagcctaatgcaaatgct 14043713  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    | ||| ||||||||    ||||||||  | |||||  ||| |||  | ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| |    
T  14043712 gatgcaaatgctgatgtgaggatgttataaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatatgaccttgatggagctcagacgtggctca 14043613  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||||||| |||||  | || || |||||||||||    
T  14043612 aagagatagagagagtgtttcgggttatgcagtg 14043579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 14353941 - 14353609
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||  ||||||||||| || ||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||  ||    
T  14353941 caattggtatcagagcaggtcggtccatctggccaagtagttgagtcgtgtcgtgt-ttagtaacagttgtaatactgtcttatgttgttgttgcttgtt 14353843  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||| |  | ||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||| | ||| ||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  14353842 ctgtagaaaactaagaatggctggaaggaacgacgctgcgattgctgctgcacgagaagttgtggctcaagctgtgggacatcagcctaatgcaaatgct 14353743  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    | ||| ||||||||    ||||||||  | |||||  ||| |||  | ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| |    
T  14353742 gatgcaaatgctgatgtgaggatgttataaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatatgaccttgatggagctcagacgtggctca 14353643  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||||||| |||||  | || || |||||||||||    
T  14353642 aagagatagagagagtgtttcgggttatgcagtg 14353609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 262 - 539
Target Start/End: Original strand, 11526524 - 11526800
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| | |  ||||||| ||  |||||||||| || || ||||| || || | |||||| ||||||||    
T  11526524 gaatggctggaagaaacgacgatgcgattgctgctgtattggaagctgtggcttaagctgtggggcatcagcctaatgctaacgttggtgctaatgctga 11526623  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
        |||||||||||||||||  ||| |||  | ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  11526624 agtgaggatgttggagacttttctgaggaatcatcctcctacttttaaaggaaaatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagaga 11526723  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
     | |||||||||||||| ||| |||| | |||| || |||||  |||||||  ||  |||| || |||||||||||||    
T  11526724 gtgttccgtgttatgcaatgccctgaggttcag-aaggtgcgttttggtacacatatgctagctgaagaagctgatga 11526800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 438 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 14336320 - 14336195
Alignment:
Q  438 acgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgat 537  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||    
T  14336320 acgtggcttaaggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgat 14336222  T
Q  538 gaccggggggttggncttctacctacc 564  Q
    ||| || ||||||  ||||| ||||||    
T  14336221 gactggtgggttgctcttctgcctacc 14336195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 229
Target Start/End: Original strand, 73141 - 73222
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatctt 229  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  73141 caattggtatcagagctggtcggtccgtccggccaattagaagagttgtgtcgagttttagtaatagttatattactatctt 73222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12716595 - 12716518
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattacta 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12716595 caattggtatcagagctggtcggtctgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattacta 12716518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12721506 - 12721425
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatctt 229  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  12721506 caattggtatcagagctggtcggtctgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttggtaatagttatattactatctt 12721425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18281267 - 18281186
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatctt 229  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  18281267 caattggtatcagagttggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttggtaatagttatattactatctt 18281186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16116035 - 16115945
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatc-ttatgttgtt 237  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  16116035 caattggtatcagagctggtcggtctgtccggccaattagaaaagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactacctttatgttgtt 16115945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12460850 - 12460800
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12460850 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagaagagtcgtgt 12460800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 10306204 - 10306254
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  10306204 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 10306254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13677672 - 13677622
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  13677672 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 13677622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 18049968 - 18050018
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  18049968 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 18050018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19615614 - 19615564
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  19615614 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 19615564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29798276 - 29798226
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  29798276 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaaatagtagagtcgtgt 29798226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 11300514 - 11300561
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  11300514 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 11300561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21756642 - 21756591
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgag 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21756642 ttggtatcagagcaggttggtccgttcggccaagtagtagagtcgtgtcgag 21756591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 26090817 - 26090864
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26090817 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 26090864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 26114621 - 26114668
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26114621 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 26114668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 49156531 - 49156484
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  49156531 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 49156484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11311661 - 11311611
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  11311661 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagattcgtgt 11311611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13025576 - 13025526
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  13025576 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagaatcgtgt 13025526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 15098741 - 15098791
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15098741 caattggtatcagagcaggttggtccatccggccaagtagtagagtcgtgt 15098791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15811438 - 15811388
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15811438 caattggcatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 15811388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 481
Target Start/End: Original strand, 16946718 - 16946836
Alignment:
Q  363 aataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagga 462  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  | |  || || ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  16946718 aataggatgttggagactttcttgaggaatcatcaaccaacattcaaaggtagatatgatcctgatggtgcccaaaagtggcttaaggaggttgaaagaa 16946817  T
Q  463 ttttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||||| | || ||||||||    
T  16946818 ttttcagggtcatgcagtg 16946836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24703806 - 24703750
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24703806 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 24703750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 179
Target Start/End: Original strand, 11384633 - 11384664
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11384633 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 11384664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 15115099 - 15115056
Alignment:
Q  420 gaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggat 463  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15115099 gaccctgatggagctcaaaagtggctcaaagagattgagaggat 15115056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19151239 - 19151208
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19151239 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 19151208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20750638 - 20750607
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20750638 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 20750607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 40923836 - 40923883
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  40923836 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgt 40923883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 12202850 - 12202900
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  12202850 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgt 12202900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 483
Target Start/End: Original strand, 12801516 - 12801630
Alignment:
Q  369 atgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttcc 468  Q
    ||||||||||||||| | | |||  | || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| || | |||||| || ||| ||||||||||||||     
T  12801516 atgttggagactttcctaatgaaccatccaccaactttcaaagggaggtatgaccctgacggagctcagaagtggctcaaggaggttgagaggattttca 12801615  T
Q  469 gtgttatgcagtgca 483  Q
    | || ||||||||||    
T  12801616 gagtcatgcagtgca 12801630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13005691 - 13005661
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13005691 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 13005661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14145893 - 14145843
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  14145893 caattgctatcagagcaggttggtccgtccgaccaagtagtagagtcgtgt 14145843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 187
Target Start/End: Original strand, 14220968 - 14221006
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattag 187  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14220968 aattggtatcagagcaggtcggttcgtccggtcaattag 14221006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Original strand, 16928752 - 16928782
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16928752 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 16928782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19151110 - 19151040
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacc 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19151110 atggctggaagaaacgatgctgatattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacaacaacc 19151040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20750509 - 20750439
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacc 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20750509 atggctggaagaaacgatgctgatattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacaacaacc 20750439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 11984927 - 11984870
Alignment:
Q  430 gagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  11984927 gagcccagacgtggattaaggagatggagaggatttttcatgtgatgcagtgcactga 11984870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 199
Target Start/End: Original strand, 11769832 - 11769880
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||    
T  11769832 ttggtatcagagcaggttggtccgtctggccaagtagttgagtcgtgtc 11769880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12693984 - 12693936
Alignment:
Q  150 attggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  12693984 attggtatcagagcaggttggtttgtccggccaagtagtagagtcgtgt 12693936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 41524499 - 41524447
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||| ||||    
T  41524499 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgagtcg 41524447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43746671 - 43746623
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  43746671 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 43746623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 12480824 - 12480410
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12480824 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 12480726  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12480725 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgatgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 12480626  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12480625 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 12480526  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  12480525 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 12480427  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  12480426 ttgctcttctgcctacc 12480410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 14299758 - 14300181
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgtt---------gttg 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||    
T  14299758 caattggtatcagagcaggtcggtcggtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatgtatattactatcttatgttgttgttgttgttg 14299856  T
Q  239 ttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaac 338  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299857 ttgctacttttgtagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaac 14299956  T
Q  339 gcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14299957 gcaaatgctggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccaga 14300056  T
Q  439 cgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatg 538  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||||||||||    
T  14300057 cgtggcttaaggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatg 14300155  T
Q  539 accggggggttggncttctacctacc 564  Q
    || || ||||||  ||||| ||||||    
T  14300156 actggtgggttgctcttctgcctacc 14300181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 23959971 - 23959557
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23959971 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 23959873  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23959872 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 23959773  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| || ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23959772 ggtgcgaacgcggaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 23959673  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  23959672 aggaaattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 23959574  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  23959573 ttgctcttctgcctacc 23959557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 8390636 - 8390236
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8390636 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 8390538  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  8390537 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 8390438  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8390437 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 8390338  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  8390337 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtggg 8390239  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  8390238 ttg 8390236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Original strand, 17090937 - 17091337
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17090937 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgctgttgctactt 17091035  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17091036 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 17091135  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17091136 ggtgcaaatgctgaagctacgatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 17091235  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  17091236 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtggg 17091334  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  17091335 ttg 17091337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 8049411 - 8049825
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8049411 caattggtatccgagcaggttggtccgtccggtcaatttga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgtttctactt 8049509  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  8049510 ttgtagaatctcggaaatagctggaagaaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgcc 8049609  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8049610 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 8049709  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  8049710 aggagattgagaggatattccgggttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 8049808  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  8049809 ttgctcttctgcctacc 8049825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 40477252 - 40476850
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40477252 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccgatcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 40477154  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||            |||||||||||||||||||||||||    
T  40477153 ctgtagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgt------------gggacaacaacctaacgcaaatgct 40477066  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40477065 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccgattttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 40476966  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  40476965 aggaaattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 40476867  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  40476866 ttgctcttctgcctacc 40476850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 16232780 - 16233194
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232780 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 16232878  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  16232879 ttgtagaatatcagaaatggctagaaggaatgatgctgcgttagccgctgctctacaagctgttgcccaagctgtggggcaacaacctaacgtgaatgct 16232978  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16232979 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttgtgaccctgatggagcccagacgtggctta 16233078  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||  |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  16233079 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggaccag-aaagtgcgatttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 16233177  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  16233178 ttgctcttctgcctacc 16233194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13514579 - 13514188
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13514579 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctactt 13514480  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13514479 gttgtagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaccaacctaacgcgaatgc 13514380  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||| | ||||| |||||  | |||||||||||| ||||||  |||  | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13514379 tggagtgaatgttgagaccatgatgttggagaccttcatggggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctt 13514280  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| ||||| ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  13514279 aaagagattgagaggattttccgtgttatgtagtgcacttaggttcag-aaagttcgttttggtactcatcagctagctgaggaagctgatga 13514188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Original strand, 18223254 - 18223648
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttg---cta 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||     
T  18223254 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgttgctg 18223353  T
Q  245 ctt-ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaa 343  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18223354 cttgttgtagaatatcagaaatggctggaaagaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaa 18223453  T
Q  344 tgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtgg 443  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18223454 tgctggtgtaaatgctgagaccaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcgaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtgg 18223553  T
Q  444 cttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||| ||||| ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  18223554 ctaaaagagatttagaggattttccgtgtgatgcagtgcaccgaggtccag-aaagtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatga 18223648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 18603609 - 18604018
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603609 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctactt 18603708  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |  || | || |||| | | ||||| || |||      |||||    
T  18603709 gttgtagaatatca-gaatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagagactatagcacaagttattggacatcagcct------aatgc 18603801  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||| | || |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18603802 tggagtgactgctgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 18603901  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||| || || ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||  || ||    
T  18603902 aaggagattgagaggatattccgtgtgatgcagtgcactgaggtccag-aaggtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgattggtgg 18604000  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||| | |||| |||||||    
T  18604001 gttagtcttcaacctacc 18604018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 148 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14684390 - 14684187
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14684390 caattggtatcagagcaggtcggttcgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgctgttgctactt 14684291  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14684290 ttgtagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctagaagttgttgcccaagcagtgggacaacaacctaacgcgaatgct 14684191  T
Q  348 ggtg 351  Q
    ||||    
T  14684190 ggtg 14684187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 252 - 487
Target Start/End: Original strand, 16247564 - 16247799
Alignment:
Q  252 agaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtg 351  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16247564 agaatatcagaaatggctggaaggaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaccctaacgcaaatgctggtg 16247663  T
Q  352 cgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaaga 451  Q
      ||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16247664 taaatgctgggactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaaga 16247763  T
Q  452 gattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16247764 gattgagaggattttccgtgtgatgcagtgcactga 16247799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 198 - 568
Target Start/End: Original strand, 15143783 - 15144152
Alignment:
Q  198 tcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || || ||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  15143783 tcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttacctgttgtgtagaatcttagagatggctggaagaaacgacgctgcgttagttgctg 15143882  T
Q  298 cactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccc 397  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||| | ||||| ||| ||| |||  | ||    
T  15143883 cactacaagctgtagatcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgtgaatgctgagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcatcc 15143982  T
Q  398 tcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaa 497  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||    
T  15143983 tcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggaggttgagagagttttccgtgtgatgcagtgcaccgaagtacag-aa 15144081  T
Q  498 agtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttggncttctacctaccttgg 568  Q
     |||||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||  || || || | ||||||||||| ||||    
T  15144082 ggtgcgttttggtacacatcagctggctgaggaagctgatgattggtggattagtcttctacctactttgg 15144152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 469
Target Start/End: Original strand, 16240894 - 16241215
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||    
T  16240894 caattggtatcagagcaggtctgtccgtccgaccaattagaagagtcatgtcgagttttagtaatagttatactactatcttatgttgttgttacttatt 16240993  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  16240994 gtgtagaaactaagagatggttggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctgatgcaaatgct 16241093  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| | ||||||    |||||| | ||||| ||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  16241094 ggtgcaagtgctgaagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagatgtggctca 16241193  T
Q  448 aagagattgagaggattttccg 469  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  16241194 aagagattgagagggttttccg 16241215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 387
Target Start/End: Original strand, 16349583 - 16349825
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctac-- 245  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||      
T  16349583 caattggtatcagggcaggtcggtccgtccgaccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatattttcattactatcttatgttgttgttgttacct 16349682  T
Q  246 -ttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaat 344  Q
     || || ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||| || |||    
T  16349683 gttgtgtagaatctcagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgaactacaagccgtagctcaagctgtggggcaataacctaatgcgaat 16349782  T
Q  345 gctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatga 387  Q
    | ||||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  16349783 gttggtgtgaatgctgagacgaggatgctcgagactttcatga 16349825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 566
Target Start/End: Original strand, 14822 - 15238
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||  ||    
T  14822 caattggtatcagagcaggccggtctgtccggccaattagatgagtcgtgacgagt-ttagtaacagttgtaatactgtcttatgttgttgttgcttgtt 14920  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||| |  | |||||||||||||||| |||| || | | |||| ||||||| ||| ||| || |||| ||||||||| || |||   |||||||||    
T  14921 gtgtagaaaactaagaatggctggaagaaatgatgttgtgattgctgttgcactagaagttgtagctcaagttgtgggacatcagcctgctgcaaatgct 15020  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||    |||||| | || |||||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  15021 ggtgctaatgctgaagtgaggatgctagaaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctca 15120  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| | |||| || |||||  |||| ||  ||  |||| || | |||||||||||| || |||    
T  15121 aggagattgagagagtgtttcgagttatgcagtgtactgagggtcag-aaggtgcgttttggaacgcatatgctagctgaggaagctgatgactggtggg 15219  T
Q  548 ttggncttctacctacctt 566  Q
    |  | ||||||||||||||    
T  15220 tgagtcttctacctacctt 15238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 241
Target Start/End: Original strand, 14306355 - 14306447
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttg 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14306355 caattggtatcagagcaggtcggtcggtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatgtatattactatcttatgttgttgttg 14306447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 248
Target Start/End: Original strand, 16244276 - 16244376
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16244276 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccgatcagttagaagagtcttgtcaagttttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgtttctactt 16244375  T
Q  248 t 248  Q
    |    
T  16244376 t 16244376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14163584 - 14163359
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||    
T  14163584 gaatggctgggagaaacgacgttgcgatcgctgctgcactgcaagctgttgctcaagctgtggggcaacaacctaatgcgaatgtgggtgctaatgctga 14163485  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
        |||||| |||| |||||  ||| |||  | ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||    
T  14163484 agtgaggatgctggaaacttttctgaggaatcatcctcctaccttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagatcgaaagg 14163385  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
     | || || |||||| |||| |||||    
T  14163384 gtgtttcgagttatgtagtgtactga 14163359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16220302 - 16220068
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | ||| ||||| |  ||| |||  | |||| |||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||    
T  16220302 gaatggctggaagaaacgacgttgcgattgctactgcattggaagttgtgactcaagatgtggggcatcagcctaatgctaacgcgggtgctaatgctga 16220203  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
        |||||||||||||||||  ||| |||  | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||     
T  16220202 agtgaggatgttggagacttttctgaggaatcatcctcctaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcgaagagattgagaga 16220103  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
     | || ||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  16220102 gtgtttcgtgtgatgcaatgcactgaggttcagaa 16220068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 365 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 14700470 - 14700346
Alignment:
Q  365 taggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggatt 464  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||  | || || ||||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||    
T  14700470 taggatgttggagacctttttgaggaatcatccacctacttttaaagtaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagagtt 14700371  T
Q  465 ttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14700370 ttccgggttatgcaatgcactgaag 14700346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 282
Target Start/End: Original strand, 14306455 - 14306506
Alignment:
Q  231 tgttgttgttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatg 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14306455 tgttgttgttgctacttttgtagaatatcaggaatggctggaagaaacgatg 14306506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 14992416 - 14992466
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  14992416 caattggtatcagagcaggttggtctgtccggtcaagtagtagagtcgtgt 14992466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16151877 - 16151827
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16151877 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaaatagtagagtcgtgt 16151827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16156023 - 16155973
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16156023 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaaatagtagagtcgtgt 16155973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18270641 - 18270591
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  18270641 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 18270591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20894274 - 20894224
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20894274 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 20894224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 51602812 - 51602862
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  51602812 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 51602862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 53749490 - 53749540
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  53749490 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 53749540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27904625 - 27904577
Alignment:
Q  150 attggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  27904625 attggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 27904577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7358507 - 7358460
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  7358507 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 7358460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 11203264 - 11203311
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  11203264 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 11203311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17332288 - 17332225
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtggg 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| | || |||||||||||    
T  17332288 gaatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctatggctcaagctgtggg 17332225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8709782 - 8709712
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacc 334  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  8709782 atggctggaagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaagttgttgctcaagttgtgggacaacaacc 8709712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13742089 - 13742039
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  13742089 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccacgtagtagagtcgtgt 13742039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14187533 - 14187475
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtctt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| |||| |||||    
T  14187533 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagttgagtcgagtcgtgtctt 14187475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15074597 - 15074547
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  15074597 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagttgtgt 15074547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 16229908 - 16229958
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16229908 caattggtattagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 16229958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18260678 - 18260628
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  18260678 caattggtatcatagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 18260628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13880340 - 13880284
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||    
T  13880340 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgttgagtc 13880284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8709900 - 8709869
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709900 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 8709869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15268015 - 15267972
Alignment:
Q  152 tggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  15268015 tggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcg 15267972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Original strand, 44657902 - 44657945
Alignment:
Q  155 tatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  44657902 tatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 44657945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 198
Target Start/End: Original strand, 3260827 - 3260873
Alignment:
Q  152 tggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  3260827 tggtatcagagcaggttggtccgtccgaccaaatagtagagtcgtgt 3260873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 151 - 564
Target Start/End: Original strand, 106828 - 107239
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttg 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106828 ttggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttg 106926  T
Q  251 aagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggt 350  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106927 tagaatatcagaaatggctggaagaaacgatgttgtgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggt 107026  T
Q  351 gcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaag 450  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  107027 gcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttaatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctaatggagcccagacgtggcttaaag 107126  T
Q  451 agattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttg 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||| ||    
T  107127 agattgagaggattttctgtgttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgactggtgggctg 107225  T
Q  551 gncttctacctacc 564  Q
      ||||| ||||||    
T  107226 ctcttctgcctacc 107239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 148 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 9470 - 9123
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |   ||    
T  9470 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcaagtcttagtaatatttgtattactatcttatgctgttgttacctgtt 9371  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  9370 gtgtagaatttca-gaatggctggaagtaacgatgctgcgttagttgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaatggcctaatgcaaatgct 9272  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| || ||||||||  |||||| | ||||| || |||| ||   | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9271 ggtgtgactgctgagatgaggatgctagagacctttatgaggactcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctta 9172  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | |||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  9171 aggagattgagagagttttccgcgtgatgcagtacactgaagatcagaa 9123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 116220 - 116190
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116220 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 116190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Original strand, 22116666 - 22117066
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22116666 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggttaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 22116764  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22116765 ttgtagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgttgctttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 22116864  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||    
T  22116865 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcctagacatggctta 22116964  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  22116965 aagagactgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 22117063  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  22117064 ttg 22117066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 20014754 - 20015168
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20014754 caattggtatcagagtaggttggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 20014852  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  20014853 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgcc 20014952  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20014953 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 20015052  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |  |  | |||||||||||| || |||    
T  20015053 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagttggccgaggaagctgatgactggtggg 20015151  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  20015152 ttgctcttctgcctacc 20015168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 19116690 - 19116290
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19116690 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 19116592  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19116591 ttgtagaatatcagaaatggctgggaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 19116492  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19116491 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 19116392  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  19116391 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 19116293  T
Q  548 ttg 550  Q
    |||    
T  19116292 ttg 19116290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 189 - 564
Target Start/End: Original strand, 22125490 - 22125864
Alignment:
Q  189 agagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22125490 agagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgtagaatatccggaatggctggaagaaacgatgctgcgt 22125589  T
Q  289 tagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaa 388  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  22125590 tagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaa 22125689  T
Q  389 gaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaa 488  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  22125690 gaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgacccttatggagcccagacgtggcttaaagagactgagaggatattccgggttatgcagtgcactgag 22125789  T
Q  489 gatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttggncttctacctacc 564  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||    
T  22125790 gatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtgggttgctcttctgcctacc 22125864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 18860868 - 18860453
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttg-ttgctact 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18860868 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccagtcaattaga-gagtcgtgttgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgattgctact 18860770  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18860769 tttgtagaatatcagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctactgctctacaagctgttgcccaagctatgggacaacaacctaacgcaaatgc 18860670  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18860669 tggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcataaagaagaactgtccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctt 18860570  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||||| |||||| || ||    
T  18860569 aaggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcactgaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagccgatgactggtgg 18860471  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||||  ||||| ||||||    
T  18860470 gttgctcttcttcctacc 18860453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 17670513 - 17670927
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17670513 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccgatcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 17670611  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17670612 ttgtagaatctcggaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 17670711  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| || ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17670712 ggtgcgaacgcggaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgaccttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 17670811  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  17670812 aggagattgagaggatcttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcgatttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 17670910  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  17670911 ttgctcttctgcctacc 17670927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 148 - 521
Target Start/End: Original strand, 19480566 - 19480935
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19480566 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 19480663  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19480664 ttgtagaatatcag-aatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgttgctctacaagctattgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 19480762  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19480763 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 19480862  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagct 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  19480863 aggagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcacggaggatcag-aaagttcggtttggtactaatcagct 19480935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 148 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 19497603 - 19497234
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19497603 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 19497506  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19497505 ttgtagaatatcag-aatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgttgctctacaagctattgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 19497407  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19497406 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 19497307  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagct 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  19497306 aggagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcacggaggatcag-aaagttcggtttggtactaatcagct 19497234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 17829456 - 17829872
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17829456 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagactcttgtcgagtcttagtaatagttgtattactttcttatgttgttgtttctactt 17829555  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17829556 gttgaagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgc 17829655  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  | ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17829656 tggtgtgactgctgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctcgaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 17829755  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || | |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |  ||| || || ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||  || ||    
T  17829756 aaggcgattgagaggatattccgtctgatgcagtgcactgaggtccag-aaggtacgatttggtactcatcagctagctgatgaagctgatgattggtgg 17829854  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||| | |||| |||||||    
T  17829855 gttagtcttcaacctacc 17829872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 148 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 32604440 - 32604025
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32604440 caattggtatcagagcaggtcggttcgtccggtcaattaaaacagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctactt 32604341  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  32604340 gttgtagaatatcagaaatggcgggaagaaacgatgctgtgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgt 32604241  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  32604240 tggtgtgactgctgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctaatggaggccagacgtggctt 32604141  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||| || || ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||  |||||    
T  32604140 aaggagattgagaggatattccgtgtgatgcagtgcactgaggtccag-aaggtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgattggggg 32604042  T
Q  547 gttggncttctacctac 563  Q
    ||| | |||| ||||||    
T  32604041 gttagtcttcaacctac 32604025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 148 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22044113 - 22043773
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22044113 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgtttctactt 22044014  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  22044013 gttgtagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgatgcgttagctgcagctctacaagctgttgcccaggctgtgggacaacaacctaacgcaaatgt 22043914  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| ||| | ||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||  | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22043913 tggtgtgaacgttgagactagaatgttagagaccttcatgaggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgacccagatggagcccagacgtggctt 22043814  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
    |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  22043813 aaagagatggagaggattttcagagtgatgcagtgcactga 22043773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 148 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15537678 - 15537328
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15537678 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgttgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctgatt 15537579  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||  |||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15537578 gttgtagaatatcaaaaatggctggaaggaactttgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgt 15537479  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15537478 tggagtgaatgctgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 15537379  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaa 497  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||    
T  15537378 aaggagatcgagaggattttccttgtgatgcagtgcactgaggttcagaaa 15537328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Original strand, 30309626 - 30310021
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttg------ 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||          
T  30309626 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagttttgtcgagtcttagtaatattg-tattactatcttatgttgttgttgttgctg 30309724  T
Q  242 ctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgca 341  Q
    ||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30309725 ctattgttgtagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcg 30309824  T
Q  342 aatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgt 441  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30309825 aatgctggtgtgaatgctgagaccaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgt 30309924  T
Q  442 ggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | || ||  |||||| ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  30309925 ggctaaaagagattgagaggatttttcgtgtgatgcagtgcaccg-aggtccaaaaagtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatga 30310021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 148 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 19982261 - 19981847
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |     
T  19982261 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattacatgagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtg 19982162  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  19982161 gtgtagaatctcagagatggctggaagaaacgatgttgcgttaggtgctgcactaccagccgtagctcaagctgtggggcaatagcctaatgcaaatgct 19982062  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||||||||   |||||| |||| || ||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19982061 ggtgcgaatgctgagtcgaggatgctggaaacctttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgagggagcccagacgtggctta 19981962  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||  |||||||| |||||||  || | |||||||||||  || ||     
T  19981961 aggagattgagagagttttccgtgtgatgcagtgcaccgaagttcag-aaggtgcgttttggtactcatcagctggctgaggaagctgatgattggtgga 19981863  T
Q  548 ttggncttctacctac 563  Q
    || | |||||||||||    
T  19981862 ttagtcttctacctac 19981847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 21163018 - 21163432
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |   ||    
T  21163018 caattggtatcagagcaggtcggtcggtccggccaattagaagagtcatgtcgagtgttagtaatatttgtattactatcttattttgttgttacatgtt 21163117  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21163118 gtgtagaatctcagaaatggctg-aagaaacgatgctgcgttagctgctgcactgcaagccgtagctcaagctatggggcaacagcctaatgcaaatgct 21163216  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||| || |||| |||  |  |||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  21163217 ggtgcgaatgctgagacgaggatgcttgagacctttatgaggaatcattctcctactttcaagggaagatattaccccgatggagcccaggcgtggctta 21163316  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||  || |||    
T  21163317 aggagatcgacagagttttccgtgttatgcaatgcactgaagttcag-aaggtgcgatttggtacacatcagctggctgaggaagctgatgatgggtggg 21163415  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | ||||||||||||    
T  21163416 ttagtcttctacctacc 21163432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 148 - 587
Target Start/End: Original strand, 22113897 - 22114331
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  22113897 caattggtatcagagcaggtcggtccatccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttatattacaatcttatgttgttattgctgctt 22113996  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||| ||   ||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||||| |  |||| || ||| || | ||||| || |||      |||||    
T  22113997 gttgtagaataccaaagatggctggaaggaacgacgctgcgattgctgctgcactagagactgtggcacaatctattggacatcagcct------aatgc 22114090  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22114091 tggtgtgactgccgagactaggatgttggagactttcatgaggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctt 22114190  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |  ||| || || ||  |||||||| |||||||| || |  |||| |||||| || ||    
T  22114191 aaggagatagagaggattctccgtttgatgcagtgcactgaggtccag-aaggtacgatttggtactcatcagctagctgagcaagccgatgactggtgg 22114289  T
Q  547 gttggncttctaccta-ccttgggcaaaaaggncctgttgtg 587  Q
    ||| | |||||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||    
T  22114290 gttagtcttctacctacccttgagcaagaaggagctgttgtg 22114331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 148 - 460
Target Start/End: Original strand, 21390379 - 21390691
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||   |    
T  21390379 caattggtatcagagcaggtcggtccgtctggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttaagttactatcttatgttattgttgcttaat 21390478  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  21390479 gtgtagaaactaagagatggatgggagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgat 21390578  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||||||||   |||||| | ||||| ||| ||| |||  ||||||  |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21390579 ggtgcgaatgctgagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcaccctcttactttcaagggaagatacgaccccgatggagcccagacgtggctta 21390678  T
Q  448 aagagattgagag 460  Q
    |||||||||||||    
T  21390679 aagagattgagag 21390691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 148 - 460
Target Start/End: Original strand, 21779705 - 21780017
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||   |    
T  21779705 caattggtatcagagcaggtcggtccgtctggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttaagttactatcttatgttattgttgcttaat 21779804  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  21779805 gtgtagaaactaagagatggatgggagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgat 21779904  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||||||||   |||||| | ||||| ||| ||| |||  ||||||  |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21779905 ggtgcgaatgctgagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcaccctcttactttcaagggaagatacgaccccgatggagcccagacgtggctta 21780004  T
Q  448 aagagattgagag 460  Q
    |||||||||||||    
T  21780005 aagagattgagag 21780017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 148 - 460
Target Start/End: Original strand, 18880144 - 18880456
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   |    
T  18880144 caattggtatcagatcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttgtattactatcttatgttgatgttgcttgct 18880243  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18880244 gtgtagaaactaagagatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagttgtgggacaacagcctaatgcaaatgct 18880343  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| | ||||||    |||||| | ||||| ||  ||| |||  | ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18880344 ggtgcaagtgctgaagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcatactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctca 18880443  T
Q  448 aagagattgagag 460  Q
    |||||||||||||    
T  18880444 aagagattgagag 18880456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 17354391 - 17354800
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  17354391 caattggtatcaaagcaggtcggtctgtccggccaattagaagagtcgtgttgagttttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 17354490  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || |||      ||||||    
T  17354491 atgtagaatctcagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagcacaagctgttggacatcagcct------aatgct 17354584  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||||||||   |||||| |  |||| || |||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17354585 ggtgcgaatgctgagtcgaggatgcttaagacctttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctta 17354684  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| || ||  |||||||||||||||| || || |||| |||| || |||||  |||||||  |||||||| || | |||||||||||  || |||    
T  17354685 aggagatcgaaagagttttccgtgttatgcaatgtaccgaagttcag-aaggtgcgttttggtacacatcagctagctgaggaagctgatgattggtggg 17354783  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | ||||||||||||    
T  17354784 ttagtcttctacctacc 17354800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21672807 - 21672461
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||||| | || || || | ||||||||||||||||||  ||    
T  21672807 caattggtatcagagaaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcgagt-ttagtaacagttgtaatattgtcttatgttgttgttgcttgtt 21672709  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||  || | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21672708 gtgtagag-attaagaatggctggaagaaaggacgatgcgttagctgctgcactacaagttgtggctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgct 21672610  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||| |||    |||||| | |||||||| |||| |||  | ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  21672609 ggtgcgaatgatgaagtgaggatgctagagacttttatgaggaatcatcctcctattttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctca 21672510  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    |||||||||||||  | |||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  21672509 aagagattgagagagtgttccgtgtgaagcagtgtactgaaggtcagaa 21672461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 153
Target Start/End: Original strand, 26767405 - 26767525
Alignment:
Q  33 gaattcattgctgctgttgcagctgtnaatcaagttctatggctgagaaaaattctagttgatctacagatgactcaagcagaaccaactagggtgtttg 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26767405 gaattcattgctgctgctgcagctgttaatcaagttctgtggctgagaaaaattctagttgatctacaaatgactcaagcagaaccaactagggtgtttg 26767504  T
Q  133 tagataatcaagcagcaattg 153  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26767505 tagataatcaagcagcaattg 26767525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 306
Target Start/End: Original strand, 23777784 - 23777942
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  23777784 caattggtataagagcagatcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 23777883  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaag 306  Q
     || ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23777884 gtgtagaatctcagaaatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaag 23777942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 6518662 - 6518331
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||| ||||||| | ||  | |||||||||||||||||||||||  ||    
T  6518662 caattggaatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtttcgagt-ttagtaacagttgcaatactatcttatgttgttgttgcttgtt 6518564  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||  || | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  6518563 gtgtagag-attaagaatggctagaagaaacgatgttgcgttagctgctgcactacaagccgtggctcaagctgtgggacagcagcctaatgcgaatgct 6518465  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||    |||||| | ||||||||  ||| |||  | |||||  ||||||| ||  ||||||  ||||||||||| || ||| |||| |    
T  6518464 ggtgcaaatgctgaagcgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctgctttcaagggtagatatgttcctgatggagctcagacgaggctca 6518365  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    | ||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  6518364 aggagatagagagagtgttccgtgtgatgcagtg 6518331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 460
Target Start/End: Original strand, 22420375 - 22420692
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgtt------gttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || | ||||| | || || || | ||||||||||||      ||||    
T  22420375 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaagtagatgagtcgtgtcttgt-tgagtaacagttgtaatattgtcttatgttgtttcgattgttg 22420473  T
Q  242 ctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgca 341  Q
     |  || || ||   |  | ||||||||||||||||||| | |||  | |||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||| || || ||||| ||     
T  22420474 tttgttgtgtagtgaactaagaatggctggaagaaacgacgttgcaattgctgttgcactagaagttgtggctcaagctgtggggcatcagcctaatgct 22420573  T
Q  342 aatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgt 441  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  22420574 aatgctggtgctaatgctgaggtgaggatgttggagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgt 22420673  T
Q  442 ggcttaaagagattgagag 460  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  22420674 ggctcaaagagattgagag 22420692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 241
Target Start/End: Original strand, 21919880 - 21919973
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttg 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  21919880 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattaagagagtcgtgtcgagttttagtaatagttgtattactatcttatgttgatgttg 21919973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 229
Target Start/End: Original strand, 21974921 - 21975002
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatctt 229  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21974921 caattggtatcagagctggtcggtctgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatctt 21975002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 22524593 - 22524395
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |  |||||| | |  ||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||   |||| ||||||||    
T  22524593 gaatggctggaagaaacgacgctgcgatttctgctgaattggaagctgtggctcaagctgtggggcatcaacctaatgctaatgtgagtgctaatgctga 22524494  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagag 460  Q
        ||||||||||||||||| |||||| |  | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  22524493 agtgaggatgttggagacttttatgaagtatcatcctcctaccttcaaaggaagatatgaccctgatgaagctcagacgtggctcaaagagatagagag 22524395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22994716 - 22994633
Alignment:
Q  404 tttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||||    
T  22994716 tttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagagtgtttcgggttatgcaatgcactga 22994633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21929733 - 21929682
Alignment:
Q  147 gcaattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  21929733 gcaattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 21929682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 21323030 - 21323080
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  21323030 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 21323080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 21981444 - 21981494
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  21981444 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 21981494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 21986363 - 21986413
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  21986363 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaactagtagagtcgtgt 21986413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 31568571 - 31568621
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  31568571 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 31568621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20392264 - 20392171
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatg 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||| || || |||  ||||||||||||||    
T  20392264 atggctggaagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaagctgtagcccaagctgtgaaacaacagccgaatgcaggtgctggtgcgaatg 20392171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 198
Target Start/End: Original strand, 21968605 - 21968654
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  21968605 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 21968654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21330642 - 21330530
Alignment:
Q  369 atgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttcc 468  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  | || || || ||||| ||| | || |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||     
T  21330642 atgttggagactttcttgaggaatcatccaccaacattcaacggaaggtacgaccctgatggagctcagaagtggcttaaagagattgagaggatcttca 21330543  T
Q  469 gtgttatgcagtg 481  Q
    | || ||||||||    
T  21330542 gagtgatgcagtg 21330530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 16267699 - 16267746
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16267699 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 16267746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22524711 - 22524660
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  22524711 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagatgagtcgtgtc 22524660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19986433 - 19986383
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  19986433 caattggtatcatagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 19986383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 22003571 - 22003621
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  22003571 caattggtatcagagcaggttggtccgtccagccaagtagtagagtcgtgt 22003621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 22026754 - 22026804
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  22026754 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccgagtagtagagtcgtgt 22026804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 22176748 - 22176798
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  22176748 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccgagtagtagagtcgtgt 22176798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 29299899 - 29299949
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  29299899 caattggtatcagagccggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 29299949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28985216 - 28985173
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  28985216 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtc 28985173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44478348 - 44478317
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44478348 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 44478317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22049653 - 22049623
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22049653 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 22049623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22055171 - 22055141
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22055171 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 22055141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 22242236 - 22242174
Alignment:
Q  405 ttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttc 467  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  22242236 ttcaaaggaaggtatgaccctgattgagctcaaacgtggctcaaagaggttgaaagaattttc 22242174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 31413086 - 31413136
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  31413086 caattggtatcagagcaagttggtccgtccgaccaagtagtagagtcgtgt 31413136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 177
Target Start/End: Original strand, 22709756 - 22709785
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtcc 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709756 caattggtatcagagcaggttggtccgtcc 22709785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Original strand, 19806766 - 19806814
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  19806766 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 19806814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 180
Target Start/End: Original strand, 22176672 - 22176704
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22176672 caattggtatcagagcaggttggtccatccggt 22176704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 481
Target Start/End: Original strand, 31413305 - 31413421
Alignment:
Q  365 taggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggatt 464  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||  | ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| || |||    
T  31413305 taggatgttggagactttcttgaggaatcatccaccatcattcaaaggtagatatgatcctgatggtgcccagaagtggcttaaggaggttgaaagaatt 31413404  T
Q  465 ttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||| | || ||||||||    
T  31413405 ttcagggtcatgcagtg 31413421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 148 - 572
Target Start/End: Original strand, 24291973 - 24292397
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24291973 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttaagttgttgttgctactt 24292072  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24292073 ttgtagaatctcggacatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 24292172  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| || ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24292173 ggtgcgaacgcggaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 24292272  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  24292273 aggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 24292371  T
Q  548 ttggncttctaccta-ccttgggcaa 572  Q
    |||  ||||| |||| ||||||||||    
T  24292372 ttgctcttctgcctacccttgggcaa 24292397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 2870995 - 2871409
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2870995 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgttgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttattgctactt 2871093  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2871094 ttgtagaatatcaggaatggccggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgct 2871193  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2871194 ggtgcgaacgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 2871293  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||||||||| || |||    
T  2871294 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcattgaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactggtggg 2871392  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  2871393 ttgctcttctgcctacc 2871409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 148 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 25116648 - 25116276
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116648 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcagttagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 25116549  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116548 ttgtagaatatcag-aatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgctctacaagctgttgtccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 25116450  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25116449 ggtgcgaatgctgatgctaggatgttggagactatcatgaagaagaaccgtccaactctctaaggacgttatgaccgtgatggagcccagacgtggctta 25116350  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagcta 522  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | |||||| || |||||    
T  25116349 aagagattgagaggattttccgggttatgcaatgcactgaggatcag-aaagtgcggttcggtactcataagcta 25116276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 16575979 - 16575564
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16575979 caattggtatcagagcaggttgatccgtccggtcaattagaagagtcatgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 16575880  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16575879 ttgtagaatctcggttatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaggctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 16575780  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16575779 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 16575680  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  16575679 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 16575581  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  16575580 ttgctcttctgcctacc 16575564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 16619401 - 16619816
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16619401 caattggtatcagagcaggttgatccgtccggtcaattagaagagtcatgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 16619500  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| ||||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16619501 ttgtagaatctcggttatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaggctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 16619600  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16619601 ggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 16619700  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  16619701 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 16619799  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  16619800 ttgctcttctgcctacc 16619816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 28259392 - 28259804
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28259392 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagttgtgtcgagtcttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 28259489  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28259490 ttgtagaatatcag-aatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 28259588  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28259589 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 28259688  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  28259689 aagagatagagaggattttccgggttatgcagtgcacggaagatcag-aaagttcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 28259787  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||||||||||    
T  28259788 ttgctcttctacctacc 28259804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28286524 - 28286112
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28286524 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagttgtgtcgagtcttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 28286427  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28286426 ttgtagaatatcag-aatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 28286328  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28286327 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 28286228  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  28286227 aagagatagagaggattttccgggttatgcagtgcacggaagatcag-aaagttcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 28286129  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||||||||||    
T  28286128 ttgctcttctacctacc 28286112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 28338141 - 28338553
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28338141 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagttgtgtcgagtcttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 28338238  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28338239 ttgtagaatatcag-aatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 28338337  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28338338 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 28338437  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  28338438 aagagatagagaggattttccgggttatgcagtgcacggaagatcag-aaagttcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 28338536  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||||||||||    
T  28338537 ttgctcttctacctacc 28338553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 148 - 550
Target Start/End: Original strand, 29588631 - 29589032
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttg-ttgttgctact 246  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29588631 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgattgttgctact 29588729  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  29588730 tttgtagaatatccgaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctcttcaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgc 29588829  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29588830 tggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 29588929  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || ||    
T  29588930 aaggagattgagaggattttccgagttatgcagtgcactgaagatcag-aaggtgcggtttggtactcatcagctggccgatgaagctgatgactggtgg 29589028  T
Q  547 gttg 550  Q
    ||||    
T  29589029 gttg 29589032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28313716 - 28313304
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28313716 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagttgtgtcgagccttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 28313619  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28313618 ttgtagaatatcag-aatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 28313520  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28313519 ggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctta 28313420  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  28313419 aagagatagagaggattttccgggttatgcagtgcacggaagatcag-aaagttcggtttggtactcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 28313321  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||   |||||||||||    
T  28313320 ttgctattctacctacc 28313304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 27206708 - 27206296
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27206708 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagttgtgtcgagtcttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 27206611  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27206610 ttgtagaatatcag-aatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 27206512  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27206511 ggtgcaaatgctgaggctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccagctttcaaaggacattatgaccctgatggagcccagacgtggctca 27206412  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||  || |||    
T  27206411 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatca-taaagtgcggtttggtactcatcagctggcagaggaagctgatgattggtggg 27206313  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  27206312 ttgctcttctgcctacc 27206296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 27242520 - 27242932
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27242520 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagttgtgtcgagtcttagtaatatt-atattactatcttatactgttgttgctactt 27242617  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27242618 ttgtagaatatcag-aatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgct 27242716  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27242717 ggtgcaaatgctgaggctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccagctttcaaaggacattatgaccctgatggagcccagacgtggctca 27242816  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||||||||||  || |||    
T  27242817 aggagattgagaggattttccgggttatgcagtgcacggaggatca-taaagtgcggtttggtactcatcagctggcagaggaagctgatgattggtggg 27242915  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  27242916 ttgctcttctgcctacc 27242932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 148 - 562
Target Start/End: Original strand, 5835421 - 5835833
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |   ||    
T  5835421 caattggtatcagagcaggtcggtctgcccgatcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactaccttatgttattgttacctgtt 5835520  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5835521 gtgtggaatatcag-aatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctttacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgct 5835619  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  5835620 ggtgtgaacgctgagacgaggatgttggagactttcatgaggaatcatcctccaactttcaagggaagatatgaccccgatggagctcagacttggctca 5835719  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||  |  | |||||||||||| || |||    
T  5835720 aggagattgagaggatctttcgtgttatgcaatgcactgaagatcag-aaagtgcgttttggtacgcatcagctggccgaggaagctgatgactggtggg 5835818  T
Q  548 ttggncttctaccta 562  Q
    || | || |||||||    
T  5835819 ttagtctgctaccta 5835833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 150 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21765902 - 21765491
Alignment:
Q  150 attggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactttt 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   || |    
T  21765902 attggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaatttgaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgttgt 21765803  T
Q  250 gaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctgg 349  Q
    | ||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| || | ||||||||||| || ||||||||    
T  21765802 gtagaatctcagaaatggctagaagtaacgatgttgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctatgaggcaacaacctaatgcgaatgctgg 21765703  T
Q  350 tgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaa 449  Q
    || ||||| ||||  ||||||| | ||||| ||||||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  21765702 tgtgaatgttgagtctaggatgcttgagaccttcatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaag 21765603  T
Q  450 gagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggtt 549  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||  || |||||    
T  21765602 gagatcgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaggttcag-aaagtgcgttttggtacacatcagctggctgaggaagctgatgattggtgggtt 21765504  T
Q  550 ggncttctaccta 562  Q
     | ||||||||||    
T  21765503 agccttctaccta 21765491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 148 - 387
Target Start/End: Original strand, 27554483 - 27554723
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27554483 caattggtatcagagcaagtcggtccgtccggccaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctactt 27554582  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27554583 gttgtagaatatcagaaatggctggaggaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaacgc 27554682  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatga 387  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27554683 tggtgtgaatgctgagactaagatgttggagactttcatga 27554723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 148 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 22437955 - 22437613
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22437955 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacttgtt 22437856  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || || || |||   ||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||| || || |||| |||  ||||||| |||      ||||||    
T  22437855 gtgtagcatctcatagatgactggaagaaacgatgctgcgctagctgctacaatataagccgtagctcaagttgtttgacaacagcct------aatgct 22437762  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||||||||   |||||| | ||||| || |||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22437761 ggtgcgaatgctgagtcgaggatgcttgagacctttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccgaacgtggctta 22437662  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | |||||  | |   |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22437661 aggagatcaaaatagttttccgtgtgatgcaatgcactgaagttcagaa 22437613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 148 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 19872280 - 19872004
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  19872280 caattggtatcagagcacgtcggtccgttcggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 19872181  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |    
T  19872180 gtgtagaatctcagagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaaaccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgtt 19872081  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccc 424  Q
    |||||||||| ||||   |||||| | ||||| ||| ||| |||  | ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  19872080 ggtgcgaatgttgagtcgaggatgcttgagaccttcttgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccc 19872004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 268 - 539
Target Start/End: Original strand, 25755919 - 25756189
Alignment:
Q  268 ctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaatag 367  Q
    ||||||| || |||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||  ||    
T  25755919 ctggaaggaatgatgttgcgttagctactactctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacatgaatgatggtgtgaatgctgagacgag 25756018  T
Q  368 gatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttc 467  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||  | ||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25756019 aatgttagagaccttcatgaggaatcatcctccaaacttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagatgtggctcaaagagattgagaggattttc 25756118  T
Q  468 cgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||  ||||||||  | | |||||||||||    
T  25756119 cgtgtgatgcagtgcactgaagttcag-aaagtgcgattcggtacgcatcagctagatgaggaagctgatga 25756189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Original strand, 18404125 - 18404458
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagca-ggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctact 246  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||       
T  18404125 caattggtattagagcctggttggtccgtccagccaattagaagagtcatgtcgagttttagtaatagttgtattactatcttatgttgttgttgcttgc 18404224  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    | || ||||  | ||  ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  18404225 tgtgtagaac-taagagatggctggaagaaacgatgttgcgattgctgctgcactagaagttgtagctcaagctgttggacatcagcctaatgcgaatgc 18404323  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||| | ||||||    |||||| | ||||| || |||| |||  | ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  18404324 tggtgcaagtgctgaagcgaggatgctagagacctttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctaatggagcccagacgtggctc 18404423  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||    
T  18404424 aaagagattgagagagtgttccgtgtaatgtagtg 18404458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 262 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 23082401 - 23082179
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    |||||| |||||||||| | | |||| | |||||||||||  ||||||| || |||| |||||| || || ||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  23082401 gaatggttggaagaaacaacgctgcgattgctgctgcactggaagctgtggctcaagttgtggggcatcagcctaatgcaaatgttggtgctaattctga 23082302  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
        |||||||||||||| ||  ||| |||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  23082301 agtgaggatgttggagacctttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggcttaaagagattgagaga 23082202  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcac 484  Q
     | |||||||| |||||||||||    
T  23082201 gtgttccgtgtgatgcagtgcac 23082179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 328
Target Start/End: Original strand, 25607415 - 25607601
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctact- 246  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |     
T  25607415 caattggtatcagagcaggtcagtccgtccgaccaattagaagagtcgtgtcgggttttagtaatagttatattactatcttatgttgttgttgttgttg 25607514  T
Q  247 tttgaagaata----tcag-gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggaca 328  Q
    ||||| |  ||    | || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  25607515 tttgatgtgtagaactaagtgaatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagcccaagctgttggaca 25607601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 446 - 564
Target Start/End: Original strand, 22828876 - 22828993
Alignment:
Q  446 taaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggg 545  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||  || |    
T  22828876 taaagagattgagaggattttcggtgttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgattggtg 22828974  T
Q  546 ggttggncttctacctacc 564  Q
    |||| | |||| |||||||    
T  22828975 ggttagtcttcaacctacc 22828993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 396 - 539
Target Start/End: Original strand, 27558253 - 27558395
Alignment:
Q  396 cctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcaga 495  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||     
T  27558253 cctccaaccttcaaaggaagatatgaccttgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggattttccgtgtgatgtagtgcactgaggttcag- 27558351  T
Q  496 aaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    ||||||||  | |||||  |||||||| || | |||||||||||    
T  27558352 aaagtgcgattcggtacgcatcagctagctgaggaagctgatga 27558395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19667524 - 19667346
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttt 248  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||  ||     
T  19667524 aattggtattagagcaggtcggttcgtccgaccaattagatgagtcgtgtcgagt-ttagtaacagttgtaatactgtcttatgttgttgttgcttgttg 19667426  T
Q  249 tgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggaca 328  Q
    |  |||| |  | ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||    
T  19667425 tttagaaaactaagaatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcattagaagctgtagctcaagctgtgggaca 19667346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 496
Target Start/End: Original strand, 23084181 - 23084362
Alignment:
Q  315 caagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggac 414  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||  ||| ||| || || || ||||||||||||     
T  23084181 caagctgtggggcaacagcctaatgctgatgctggtgctaatgctgatgttagaatgttggagacttttctgaggaataatccacctactttcaaaggaa 23084280  T
Q  415 gatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | ||||| || |||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||    
T  23084281 ggtatgatccagatggagctcagacgtggctcaaagaggtagagaggattttccgagttatgcaatgcaatgaggttcagaa 23084362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 234
Target Start/End: Original strand, 16960965 - 16961051
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgtt 234  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16960965 caattggtatcaaagcaggtcggtccgtccggccatatagaatagtcgtgtccagtcgtagtaatatttgtattactatcttatgtt 16961051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 420 - 496
Target Start/End: Original strand, 18181848 - 18181924
Alignment:
Q  420 gaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18181848 gaccctgatgaagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttccgtgttatgcaatgcactgaagttcagaa 18181924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 489
Target Start/End: Original strand, 25958058 - 25958283
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 363  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| |  ||  ||| || |||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||  ||||||||      
T  25958058 atggctggaagaaacgatgttgctattgctgctgcattggaatatgtggctcaagctatgggacaacagcctaatgctagtgctggtgttaatgctgaag 25958157  T
Q  364 ataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggat 463  Q
      ||||||||||| ||||| |||| |||  | || || | |||||||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||| ||    
T  25958158 tgaggatgttggaaacttttatgaggaatcatccgcctattttcaaaggaaggtatgatccagatggagctcaatcgtggctcaaagaggtagagagaat 25958257  T
Q  464 tttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
     ||||| |||||||| |||| |||||    
T  25958258 cttccgagttatgcaatgcaatgaag 25958283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19667290 - 19667190
Alignment:
Q  396 cctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcaga 495  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||  | || || ||||||||||||||||| | |||||    
T  19667290 cctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtgcctcaaggagattgagagagtgtttcgagttatgcagtgcactgagggtcaga 19667191  T
Q  496 a 496  Q
    |    
T  19667190 a 19667190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 8719884 - 8719934
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  8719884 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 8719934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 8761207 - 8761257
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  8761207 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 8761257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 10465033 - 10465083
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  10465033 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 10465083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21475644 - 21475594
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  21475644 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 21475594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22950932 - 22950843
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatc-ttatgttgtt 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||||| | || ||||||| || ||||||||||    
T  22950932 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcgagt-ttagtaacaattgtattactgtctttatgttgtt 22950843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23873376 - 23873287
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatc-ttatgttgtt 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||||| | || ||||||| || ||||||||||    
T  23873376 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcgagt-ttagtaacaattgtattactgtctttatgttgtt 23873287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 402 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21475371 - 21475284
Alignment:
Q  402 actttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    |||||||||||  ||||| | ||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    
T  21475371 actttcaaaggtagatataatcctgatggagcacagaagtggctcaaagaggttgagaggattttcagggttatgcaatgcaatgaag 21475284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 5295388 - 5295438
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  5295388 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 5295438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16828810 - 16828760
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16828810 caattggtatcagagcaggttggttcgtccggccaagtagtagagtcgtgt 16828760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18798790 - 18798740
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  18798790 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccgattagtagagtcgtgt 18798740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19457066 - 19457016
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  19457066 caattgctatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 19457016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19467211 - 19467161
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  19467211 caattgctatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 19467161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19868420 - 19868362
Alignment:
Q  438 acgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||    
T  19868420 acgtggcttaaagagattgagagagttttccgtgtgatgcagggcaccgaagttcagaa 19868362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33863379 - 33863323
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  33863379 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 33863323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15463434 - 15463404
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15463434 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 15463404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19004147 - 19004058
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatc-ttatgttgtt 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||| || | |||  ||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  19004147 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgagttgtgtc-gagtaatagttgtattactatctttatgttgtt 19004058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25771950 - 25771900
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||    
T  25771950 caattggtatcagagcaggttggtccatccggccatgtagtagagtcgtgt 25771900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Original strand, 34641768 - 34641798
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34641768 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 34641798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 351
Target Start/End: Original strand, 18178748 - 18178837
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtg 351  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |  ||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||    
T  18178748 gaatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcattgaaagttgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgctaatgttggtg 18178837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18318427 - 18318399
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18318427 caattggtatcagagcaggttggtccgtc 18318399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18451260 - 18451212
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  18451260 caattggtatcagagaaggttggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 18451212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 178
Target Start/End: Original strand, 20009686 - 20009714
Alignment:
Q  150 attggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20009686 attggtatcagagcaggttggtccgtccg 20009714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 1107 - 691
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1107 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaaaagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctactt 1008  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1007 gttgtagaatatcagaaatggctgggagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtggaacaacaacctaatgcaaatgc 908  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
     |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  907 gggtgtgactgctgagactaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 808  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| | |||| || || ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||  || ||    
T  807 aaggagattgagaggatatttcgtgtgatgcagtgcattgaggttcag-aaggtacgatttggtactcatcagctagctgacgaagctgatgattggtgg 709  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||| | |||| |||||||    
T  708 gttagtcttcaacctacc 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Original strand, 138645 - 139036
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  138645 caattggtatcagagcaggtcggttcgtccggtcaattagaatagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattattatcttatgttgttgttgctactt 138744  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  138745 gttgtagaatatcagaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaatctaatgcaaatgc 138844  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||||  ||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  138845 tggtgtgactgctgagactaggttgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 138944  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |  ||| || || ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  138945 aaggagattgagaggatattccgtgtgaaatagtgcactgatgtccag-aaggtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatga 139036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 460
Target Start/End: Original strand, 15661 - 15971
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | || || || | ||||||||||||||||||  ||    
T  15661 caattggtataagagcaggtcggtccgtccggccaattagatgagtcatgtcgagt-ttagtaacagttgtaatattgtcttatgttgttgttgcttgtt 15759  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||  || | |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |  || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  15760 gtgtagag-attaagaatggttggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcacaacaggtcgtggctcaagctgtggggcaacaacctaatgcgaatgct 15858  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| | ||||||    |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||  |||| |    
T  15859 ggtgcaagtgctgaagcgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatatgaccctgatagagctcagactgggctca 15958  T
Q  448 aagagattgagag 460  Q
    ||||||| |||||    
T  15959 aagagatagagag 15971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 148 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 832 - 486
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttg------ 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          
T  832 caattggtatcagagcaggttggtctgtccggccaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgttgttg 733  T
Q  242 ctactt-ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgc 340  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  732 ctacttgttgtagaatatcagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaactc 633  T
Q  341 aaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacg 440  Q
     ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  632 gaatgcgggtgtgaatgctgagactaggatgttggagactttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccaaacg 533  T
Q  441 tggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  532 tggcttaaggagattgagaggattttccgtgtgatgcagtgcactga 486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 148 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16168 - 15856
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |    
T  16168 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagccgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttgttgttacttgat 16069  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  |||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||| |    
T  16068 gtgtagaaactaagagatggccagaagagatgatgatgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggataacagcctaatgcaaatgtt 15969  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||  ||||| || ||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||| |    
T  15968 ggtgcgaatgctgagacgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcttacttttaagggaagatataaccatgatggagcctagacgtggctca 15869  T
Q  448 aagagattgagag 460  Q
    | |||||||||||    
T  15868 aggagattgagag 15856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 5)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 22446 - 22055
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22446 caattggtatcaaagcaggtcggtccgtccgatcaattagaagagtcttgtcgagtcatagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctgctt 22347  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22346 gttgtagaatatcagaaatggctggaaagaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgctaatgc 22247  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22246 tggtgtgaatgctgagaccaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccaaacgtggctt 22147  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||| ||||| ||  |||||||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  22146 aaagagattgagaggattttccgtgtgatgcagtgcaccgaggtccag-aaagtacgatttggtactcatcagctagctgagaaagctgatga 22055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 148 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 15682 - 15345
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15682 caattggtatcaaagcaggtcggtccgtccgatcaattagaagagtcttgtcgagtcatagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctgctt 15583  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15582 gttgtagaatatcagaaatggctggaaagaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgctaatgc 15483  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15482 tggtgttaatgctgagaccaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccaaacgtggctt 15383  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcac 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15382 aaagagattgagaggattttccgtgtgatgcagtgcac 15345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 6057 - 5824
Alignment:
Q  263 aatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgag 362  Q
    |||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||| |  ||| ||| || ||||||||||| ||||| | ||| |  |||  |||||| ||||||||     
T  6057 aatggctggatgaaacgacgttgcgattgctgctgcattggaagttgtggctcaagctgtggggcaacagcttaatgttaatattggtgctaatgctgaa 5958  T
Q  363 aataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagga 462  Q
      ||||||||||||||||||  ||| |||  | || ||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||      
T  5957 gttaggatgttggagacttttctgaggaatcatccacccaccttcaaaggaaggtatgatcttgatggagctcatacgtggctcaaagagattgagagag 5858  T
Q  463 ttttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  5857 tgttccatgttatgcaatgcactgaggttcagaa 5824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 38368 - 38418
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  38368 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 38418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Original strand, 179879 - 179909
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  179879 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 179909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 252 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 425452 - 425117
Alignment:
Q  252 agaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtg 351  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  425452 agaatatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgctggtg 425353  T
Q  352 cgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaaga 451  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  425352 cgaatgctgagactaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaaga 425253  T
Q  452 gattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttgg 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || | ||| |||||||  || ||||| |    
T  425252 gattgagaggattttccgtgttatgcaatgcactcaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagctgaggaaactgatgattggtgggttag 425154  T
Q  552 ncttctaccta-ccttgggcaaaaaggncctgttgtg 587  Q
     |||||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||    
T  425153 tcttctacctacccttgagcaagaaggagctgttgtg 425117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 138944 - 138553
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  138944 caattggtatcagagtaggtcggtccgaccagtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttggtgttgctgatt 138845  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  138844 gttgtagaatatcagaaatggctgggaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgt 138745  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  138744 tggtgtgattgttgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctt 138645  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||| ||||| ||  |||||||| |||||||| || | || ||||||||    
T  138644 aaagagactgagaggattttccgtgtgatgcagtgcaccgaggtccag-aaagtacgatttggtactcatcagctagctgaggaggctgatga 138553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 148 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18417 - 18078
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  18417 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgctgctgctt 18318  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18317 gttgtacaatatcag-aatggctggaaggaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagttgttacccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgc 18219  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||  | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18218 tggtgtgaatgctgagaccaggatgttggagacattcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 18119  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18118 aaggagattgagaggattttccatgtgatgcagtgcactga 18078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 148 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 7221 - 6920
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7221 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 7123  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||               ||||||||||||||||||||| ||||||             
T  7122 ttgtagaataacaggaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgc---------------tgcccaagctgtgggacaacaccctaac--------- 7047  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
       |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7046 ---gcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacattatgaccctgatggagcccagacgtggctta 6950  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgc 477  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6949 aggagattgagaggattttccgggttatgc 6920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 4353 - 4263
Alignment:
Q  473 tatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttggncttctacctacc 564  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||||||||||||  | ||||||  ||||| ||||||    
T  4353 tatgcagtgcaccgaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagccgaggaagctgatgactagtgggttgctcttctgcctacc 4263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 148 - 487
Target Start/End: Original strand, 13070 - 13416
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttg------ 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          
T  13070 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggacaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgttgttg 13169  T
Q  242 ctactt-ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgc 340  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13170 ctacttgttgtagaatatcagaaatggctggaaggaacgatgctgcattagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgc 13269  T
Q  341 aaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacg 440  Q
     |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||  | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  13270 gaatgctggtgtgaatgatgagaccaggatgttggagacgttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacg 13369  T
Q  441 tggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13370 tggcttaaagagatagagaggattttccgtgtgatgcagtgcactga 13416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 148 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 3780
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4112 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctactt 4013  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||| || |||| | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4012 gttgtagaatatcag-aatggctggaagtaatgatgcttcgttagcttctgctctacaagctgtttcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgc 3914  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||  | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  3913 tggtgtgaatgatgagactaggttgttggagactttcataaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctc 3814  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3813 aaagagattgagaggattttccgtgtgatgcagt 3780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 148 - 562
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16526
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16113 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaattagaagagtcgtgttgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctactt 16212  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||  |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16213 gttttagaatatcaa-aatggctggaaggaacgatgttgcattagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtggggcaacaacctaacgcaaatgc 16311  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||  | ||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16312 tggtgtgaatgctgagacaagaatgttggagactttcatgaggaatcatcctccaaccttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctt 16411  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||| |||||  |  | |||||  |||||||| || | |||||| ||||| || ||    
T  16412 aaggagatcgagaggatttttcgagtgatgcagtgcactgaggttcag-aaagtatgattcggtacgcatcagctagctgaggaagctaatgactggtgg 16510  T
Q  547 gttggncttctaccta 562  Q
    ||| | ||||||||||    
T  16511 gttagccttctaccta 16526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 148 - 562
Target Start/End: Original strand, 20635 - 21048
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20635 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaattagaagagtcgtgttgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctactt 20734  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||  |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20735 gttttagaatatcaa-aatggctggaaggaacgatgttgcattagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtggggcaacaacctaacgcaaatgc 20833  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| |||||||||||  || |||||| |||||||||||| |||  | ||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20834 tggtgtgaatgctgagacaagaatgttgtagactttcatgaggaatcatcctccaaccttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctt 20933  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||| |||||  |  | |||||  |||||||| || | |||||| ||||| || ||    
T  20934 aaggagatcgagaggatttttcgagtgatgcagtgcactgaggttcag-aaagtatgattcggtacgcatcagctagctgaggaagctaatgactggtgg 21032  T
Q  547 gttggncttctaccta 562  Q
    ||| | ||||||||||    
T  21033 gttagccttctaccta 21048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 147 - 489
Target Start/End: Original strand, 193914 - 194256
Alignment:
Q  147 gcaattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctact 246  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     |    
T  193914 gcaattggtatcagagcaggtccgtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttatctgt 194013  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||| |||||||| ||||| || |||||    
T  194014 tgtgtagaatatcagagatggccagaagagacgatgttgcgttagctgctgcactacaagccatagctcaagttgtaggacaacagcctaatgcgaatgc 194113  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||| ||||||||  ||   |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||| |  || || ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||     
T  194114 tggagcgaatgccaagtcgaggatgcttgagacttttctgaggaatcatcctcctaggtttaagggaagatacgaccctgatggagcccagacatggctc 194213  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  194214 aaagagattgagagagtcttccgtgtgatgcagtgcactgaag 194256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 3487 - 3537
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  3487 caattggtgtcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 3537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 483
Target Start/End: Original strand, 3718 - 3836
Alignment:
Q  365 taggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggatt 464  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||  | || || ||||| |||||| | || |||||||| ||||| || | |||||| || ||| ||||||| |||    
T  3718 taggatgttggagactttcctgagaaatcatccaccaacttttaaaggaaggtacgaccctgacggagctcagaagtggctcaaggaggttgagagaatt 3817  T
Q  465 ttccgtgttatgcagtgca 483  Q
    ||| | |||||||||||||    
T  3818 ttcagagttatgcagtgca 3836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 148 - 487
Target Start/End: Original strand, 228898 - 229238
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  228898 caattggtatcagagcaggtcggttcgtctggtcaattagaagagtcttgtcgagtcttaataatatttgtattactatcttatgttgttgttgctactt 228997  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  228998 gttgtagaatatcagaagtggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgc 229097  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| |||  | ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  229098 tggtgtgaatgctaagaccaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaactttcacaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 229197  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  229198 aaggagatcgaaaggatttttcgagtgatgcagtgcactga 229238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 252891 - 252841
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  252891 caattggtattagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 252841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 148 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 993 - 580
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  993 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaactagaagagtcttgtcgagtcatagtaatatttgtattactatctaatgttgttgttgctactt 894  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  893 gttgtagaatatcag-aatggctggaagaaacgatgctgcattagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtggggcaacaacctaatgcgaatgc 795  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  | ||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  794 tggtgtgaatgctgagacgaggatgttggagactttcatgaggaatcatcctcctaccttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgttgctt 695  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||  || ||    
T  694 aaggagatcgagaggatttttcgagtgatgcagtgcactgaggttcag-aaagtgcgatttggtacacatcagctggctgaggaagctgatgattggtgg 596  T
Q  547 gttggncttctaccta 562  Q
    ||| | ||||||||||    
T  595 gttagccttctaccta 580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 148 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 691 - 275
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctac-- 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      
T  691 caattggtatcagagcaggtcggtctgtccggccaattagaagagttgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgttacct 592  T
Q  246 -ttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaat 344  Q
     || || ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  591 gttgtgtagaatctcagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcgaat 492  T
Q  345 gctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggc 444  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| | ||||| ||||||| |||  | ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  491 gctggtgtgaatgctgagacgaggatgcttgagaccttcatgaggaatcatcctcctaccttcaagggaagatatgaccctgatggagcccatatgtggc 392  T
Q  445 ttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggg 544  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||  |||||||  || | ||||| |||||  ||     
T  391 ttaaggagatcgagaggattttccgtgtgatgcagtgcactgaggttcag-aaagtgcgatttggtacacatcagctggctgaggaagccgatgattggt 293  T
Q  545 gggttggncttctaccta 562  Q
    ||||| | ||||||||||    
T  292 gggttagccttctaccta 275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 6049 - 6464
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  6049 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactaccttatgttgttgttgcttgat 6148  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6149 gtgtagaaactaagagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgct 6248  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||||||||   |||||| | ||||| ||| ||| |||  | ||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6249 ggtgcgaatgctgagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcatcctcctacttttaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctta 6348  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||  |||||||  ||||| |  || | |||||||||||  || |||    
T  6349 aagagattgaaagagttttccgtgttatgcaatgcactgaagttcag-aaggtgcgatttggtacatatcagttggctgaggaagctgatgattggtggg 6447  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | ||||||||||||    
T  6448 ttagtcttctacctacc 6464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 148 - 549
Target Start/End: Original strand, 23274 - 23673
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  23274 caattgctatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaaaagtcgtgttgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 23373  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  23374 gtgtagattatcat-aatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgcactacaagctgtagctaaagatgtggggcaacaacctaatgcgaatgct 23472  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||  | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23473 ggtgtgaatgctgagacgaggatgctagagactttcatgaggaatcatcctcctaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggatta 23572  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||   |||||||  |||||||| || | |||||||||||| || |||    
T  23573 aggagatcgagaggattttccgtgtgatgcagtgcactgaggtacag-aaagtgcattttggtacacatcagctagctgaggaagctgatgactggtggg 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 149 - 564
Target Start/End: Original strand, 35868 - 36282
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttt 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||     
T  35868 aattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgttg 35967  T
Q  249 tgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctg 348  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  35968 tgtagaatctcagaaatggctagaaggaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctg 36067  T
Q  349 gtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaa 448  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||| |  |||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  36068 gtgcgaatgctgagacgaggatgcttgagacctgtatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgacctcgatggagccgagacgtggcttaa 36167  T
Q  449 agagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggt 548  Q
     ||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||  || ||||    
T  36168 ggagatcgagagagttttccatgttatgcaatgcactgaagatcag-aaggtgcgatttggtacacatcagctggctgaggaagctgatgattggtgggt 36266  T
Q  549 tggncttctacctacc 564  Q
    | | ||||||||||||    
T  36267 tagtcttctacctacc 36282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27355 - 27291
Alignment:
Q  402 actttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggatttt 466  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| ||| || |||||    
T  27355 actttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtagctcaaagagaatgaaagaatttt 27291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 148 - 562
Target Start/End: Original strand, 140 - 552
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  140 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggacaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 239  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  240 gtgtagaatatctg-aatggccggaagaaacgatgctgcgatagctgctgcactacaagctgtagctcaagctatggggcaacaacctaatgcgaatgct 338  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    || | |||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||  | ||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  339 ggagtgaatgctgagacgaggatgctagagactttcatgaggaatcatcctcctaccttcaagggaagatatgaccttgatggagctcagacgtggctta 438  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    |  |||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||| |||||||   |||||||  |||||||| || | |||||||||||| || |||    
T  439 agaagatcgagaggatctaccgtgtgatgcagtgcactgaggttcag-aaagtgcattttggtacgcatcagctagctgaggaagctgatgactggtggg 537  T
Q  548 ttggncttctaccta 562  Q
    || |  |||||||||    
T  538 ttagctttctaccta 552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 38286 - 37870
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  38286 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 38187  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  38186 gtgtagaatcttagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgct 38087  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgat-ggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| | ||||| || |||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||  | ||||||    
T  38086 ggtgcgaatgcggagacgaggatgcttgagacctttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgataagagcccaggcatggctt 37987  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||  ||||||   |||||||  || | |||||||||||  || ||    
T  37986 aaggagatcgagagagttttccgtgttatgcaatgcactgaagttcag-aaggtgcgatttggtatacatcagctggctgaggaagctgatgattggtgg 37888  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  37887 gttagtcttctacctacc 37870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22862 - 22446
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  22862 caattggtatcagagcaggtcggtttttcttgccaatttgaagagtcgtgtcgagttttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 22763  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  22762 gtgtagaatcttagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgct 22663  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgat-ggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||| || |||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||  | ||||||    
T  22662 ggtgcgaatgctgagacgaggatgcttgagacctttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgataagagcccaggcatggctt 22563  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||  ||||||   |||||||  || | |||||||||||  || ||    
T  22562 aaggagatcgagagagttttccgtgttatgcaatgcactgaagttcag-aaggtgcgatttggtatacatcagctggctgaggaagctgatgattggtgg 22464  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  22463 gttagtcttctacctacc 22446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 148 - 521
Target Start/End: Original strand, 14635 - 15007
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  14635 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgttgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacgtgtt 14734  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  14735 gtgtagaatctcagaaatggctggaagaaacgatgttgtgttagctgctgcactacaagtcgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcgaatgct 14834  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| |||||||||||   ||||  | ||||| ||||||| |||  | ||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14835 ggtgtgaatgctgagacgtggattcttgagaccttcatgaggaatcatcctcctattttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctta 14934  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagct 521  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||  |||||||  |||||||    
T  14935 aggagatcgagaggattttccgtgtgatgcagtgcattgaggttcag-aaagtgcgatttggtacacatcagct 15007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 148 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 1386 - 1059
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1386 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcttgtcaagtcttagtaataattgtattactatcttttgttgttgttgatactt 1287  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||            
T  1286 gttgtagaatatca-gaatggctggaaggaatgatgttgcgttagctgctactctacaagctgttgcccaagctctgggacaacaacctaac-------- 1196  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
        | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||  | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1195 ----gtgaatgctgagacaaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 1100  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1099 aaatatattgagaggattttccgtgtgatgcagtgcactga 1059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11310 - 11269
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaa 189  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  11310 caattggtatcagagctggtcggtccgtccggccaattagaa 11269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 148 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 496 - 82
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  496 caattggtatcagagcaggtccgtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagttatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 397  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| |||   |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  396 gtgtagaatctcaaagatggctggaaaaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagtcgtagctcaagctgtggggcaacaacctaatgcaaatgct 297  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| ||||| ||||   |||||| | ||||| ||| ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  296 ggtgtgaatgatgagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctta 197  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||  |||||||| |||||||  || | |||||||||||  || ||     
T  196 aagatattgagagagttttccgtgtgatgcagtgcaccgaagttcag-aaggtgcgttttggtactcatcagctggctgaggaagctgatgattggtgga 98  T
Q  548 ttggncttctacctac 563  Q
    || | |||||||||||    
T  97 ttagtcttctacctac 82  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 11450 - 11497
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  11450 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 11497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 19630 - 19677
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  19630 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 19677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 489
Target Start/End: Original strand, 11678 - 11802
Alignment:
Q  365 taggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggatt 464  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||  | || || ||||| |||||  | ||||||||||| ||||| || | |||||| || ||| |||||||||||    
T  11678 taggatgttggacactttcctgaggaatcatccaccaacttttaaagggaggtatgaccctgacggagctcagaagtggctcaaggaggttgagaggatt 11777  T
Q  465 ttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    ||| | |||||||| |||| |||||    
T  11778 ttcagagttatgcaatgcagtgaag 11802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 489
Target Start/End: Original strand, 19858 - 19982
Alignment:
Q  365 taggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggatt 464  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||  | || || ||||| |||||  | ||||||||||| ||||| || | |||||| || ||| |||||||||||    
T  19858 taggatgttggacactttcctgaggaatcatccaccaacttttaaagggaggtatgaccctgacggagctcagaagtggctcaaggaggttgagaggatt 19957  T
Q  465 ttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    ||| | |||||||| |||| |||||    
T  19958 ttcagagttatgcaatgcagtgaag 19982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 148 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33136 - 32746
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |   ||    
T  33136 caattggtattagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatattatgttgttgttacctgtt 33037  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  33036 gtgtagaatctcagaaatggctggaagaaatgatgctgcgttagctgctgcacgacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgct 32937  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | ||||||||  | | |||  | ||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  32936 ggtgtgaatgctgagacgaggatgcttgagacttttttaaggaatcatcctcctaccttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttc 32837  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    | ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||    
T  32836 aggagatcgagagagttttccatgtgatgcagtgcactgaagttcag-aaggtgcgatttggtacacatcagcttgctgaggaagctgatga 32746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 420
Target Start/End: Original strand, 9330 - 9597
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9330 caattggtatcagagcaggtcggtctgtccggtcaattagaagagtcttgttgagtcttactaatatttatattactatcttatgttgtcgttgctgctt 9429  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     | | ||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |  |||| || |||||| | ||||| || |||      ||||     
T  9430 gtcgtagaatatcagagatggcaggaaggaacgatgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcacaagctattggacatcatcct------aatga 9523  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatg 420  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||    |||||||||| ||||||    
T  9524 tggtgtgactgctgagactaggatgttggagaccttcatgaggaatcaccctctagttttcaaaggaagatatg 9597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 454
Target Start/End: Original strand, 20770 - 21075
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||  ||||||||||  || ||||||| | || || |||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  20770 caattggtatcagagcaggtcggtccgaccggccaagtagttgagtcgtgtcatgt-ttagtaacagttgtaatactgtcttatgttgttgttccttgtt 20868  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||| |  | |||||||| |||||||||| | |||| | |||| ||||||| ||| ||| || |||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  20869 gtgtagaaaactaagaatggctagaagaaacgacgctgcgattgctgttgcactaaaagttgtagctcaagttgtgggacatcagcctaatgcaaatgct 20968  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||    |||||| | ||||||||  | | |||  | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  20969 ggtgcaaatgctgaagtgaggatgctagagacttttcttaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagatcagacgtggctca 21068  T
Q  448 aagagat 454  Q
    |||||||    
T  21069 aagagat 21075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 322 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 55721 - 55479
Alignment:
Q  322 tgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatga 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |   |||||| | || || ||| | | |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  55721 tgggacaacaacctaatgcaaatgctggtgcgaatgctttgtcgaggatgcttgaaaccttcctaaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatga 55622  T
Q  422 ccctgatggagcccaaacgtgg-cttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagc 520  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| || || ||  |||||||  |||||     
T  55621 ccccgatggagcccagacgtggacttaaagagattgaaagagttttccgtgttatgcaatgcactgaagttcag-aaggtacgatttggtacacatcagt 55523  T
Q  521 tanctnaagaagctgatgaccggggggttggncttctacctacc 564  Q
    || || | |||||||||||  || ||||| | ||||||||||||    
T  55522 tagctgaggaagctgatgattggtgggttagtcttctacctacc 55479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 148 - 562
Target Start/End: Original strand, 14095 - 14501
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14095 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccagttagaagagtcttgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatg-tgttgttgctactt 14193  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |  |||| || |||||| | ||||| || |||      |||||    
T  14194 gttgtataatatca-gaatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcacaagctattggacatcagcct------aatgc 14286  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    | ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||  | ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14287 tagtgtgaatgctgagacaaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagacatgaccctgatggagcctagacgtggctt 14386  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||  | |||||  |||||||| || | |||||||||||| || ||    
T  14387 aaggagatcgagaggattttccgtgtgatgcagtgcactgaggttcag-aaagtgcgattcggtacgcatcagctagctgaggaagctgatgactggtgg 14485  T
Q  547 gttggncttctaccta 562  Q
    ||| | || |||||||    
T  14486 gttagtctgctaccta 14501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 148 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 1149 - 836
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttg-ttgctact 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  1149 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttgatggttgcttgt 1050  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    | || ||||  | ||  ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1049 tgtgtagaaactaagagatggctggaagaaacgacgctgtgttggctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgc 950  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||||||||||||||  |||||| | ||||| ||| ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  949 tggtgcgaatgctgagatgaggatgctagagaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctc 850  T
Q  447 aaagagattgagag 460  Q
    ||||||||||||||    
T  849 aaagagattgagag 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4103 - 4053
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  4103 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 4053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3974 - 3904
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacc 334  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  3974 atggctggaagaaacgacgctgcaatagctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 3904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 3853 - 3781
Alignment:
Q  417 tatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| |||| |||||    
T  3853 tatgaccctgatggagctcagaattggctcaaagaggttgagaggattttcagagtcatgcaatgcagtgaag 3781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Original strand, 65577 - 65992
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  65577 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccgaccaattaaaagagttgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 65676  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  65677 gtgtagaatctcagaaatggctggaaggaacgatgtggcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgct 65776  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | ||||| || |||| |||  | ||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  65777 ggtgtgaatgctgagacgaggatgcttgagacctttatgaggaatcatcctcttactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctta 65876  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | |||||  ||||  ||||||| || |||||||||||| | | |||| ||||||||  ||| |||  |||||||  || | |||| ||||||  || |||    
T  65877 aggagatcaagagagttttccgagtgatgcagtgcactaaggttcag-aaagtgcgatttgatacacatcagctggctgaggaagttgatgattggtggg 65975  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | ||||||||||||    
T  65976 ttagtcttctacctacc 65992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 148 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 559 - 149
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  559 caattggtatcagagcaggtcggtctgtccagtcaattagaagagtcttgttgagtcttagtaatatttatattactatcttacgttgttgttgctgctt 460  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
     |||  ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||||| |  |||| || |||||| | ||| | || |||      |||||    
T  459 gttgtggaatatcagaaatggttggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcgcaagctattggatatcagcct------aatgc 366  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  365 tggtgtgactgctgagactaggatgctggagaccttcatgaggaatcaccctccagttttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctt 266  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggg 546  Q
    || ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |  ||| || |||||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||    
T  265 aaggagatagagaggattttccgggtgatgtagtgcactgaggtccag-aaggtgcgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgactggtgg 167  T
Q  547 gttggncttctacctacc 564  Q
    ||| | ||| ||||||||    
T  166 gttagtcttttacctacc 149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 148 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 1099 - 751
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |    
T  1099 caattggtattagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcaagttttagtaatatttgtattactatcttatgttgttattgcttgat 1000  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || || |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  999 gtgtagaaactaagagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgttgcactacaagccgtagctcaagttgtgggacaacagcctaatgcaaatgct 900  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||||||||   |||||| | ||||| ||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  899 ggtgcgaatgctgagtcgaggatgcttgagacctttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggatcccagacgtggctta 800  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  799 aggagatagaaagagttttccgtgttatgcagtgcactgaagttcagaa 751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 148 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 31543 - 31196
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |    
T  31543 caattggtatctgagcaggtcggtctgtcttgtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttttattactatcttatgttgttgttgcttgat 31444  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || | ||  | ||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31443 gtgta-aaactaagagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgct 31345  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
     ||||||||||| ||   | |||| |||| || ||| ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31344 agtgcgaatgctaagtcgaagatgctggaaaccttcttgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctta 31245  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  31244 aggagatcgagagagttttccgtgtgatgcagtgcactgaggttcagaa 31196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 148 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 1038 - 632
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  1038 caattggtattagagcaggtcggttcgtccagccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 939  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |  |||| || |||||| | ||||| || |||||      ||||    
T  938 atgtagaatctcag-aatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgccgcactagagactgtagcacaagctattggacatcagcctaa------tgct 846  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  845 ggtgtgaatgctgagacgaggatggttgagactttcatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatacgaccctgatggagcccaaacgtggctta 746  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||| ||||||||  |||||||  |||||||| || | |||||||||||  || |||    
T  745 aggagatcgagaggatttttcgagtgatgtagtgcactgaagttcag-aaagtgcgttttggtacacatcagctagctgaggaagctgatgattggtggg 647  T
Q  548 ttggncttctaccta 562  Q
    || | ||||||||||    
T  646 ttagccttctaccta 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 152 - 481
Target Start/End: Original strand, 9931 - 10260
Alignment:
Q  152 tggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttga 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   | ||     
T  9931 tggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttgttgttacttgatgtgt 10030  T
Q  252 agaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtg 351  Q
    ||||  | ||  |||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  10031 agaaactaagagatggccagaagagatgatgatgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgctggta 10130  T
Q  352 cgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaaga 451  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  10131 cgaatgctgagacgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctacttttaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaagga 10230  T
Q  452 gattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  10231 gattgagagagtgttccgcgtgatgcagtg 10260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 148 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9681 - 9376
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  9681 caattggtatcagagcaggtcggtttgtcttgtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctatt 9582  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  9581 gtgtagaatctcagagatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgcattacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgct 9482  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| ||||||||||   |||||| |||| || ||| ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9481 ggtgggaatgctgagtcgaggatgctggaaaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctta 9382  T
Q  448 aagaga 453  Q
    | ||||    
T  9381 aggaga 9376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 1040 - 869
Alignment:
Q  396 cctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcaga 495  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||     
T  1040 cctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagagagttttccgtgtgatgcagtgcaccgaagttcag- 942  T
Q  496 aaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttggncttctacctaccttgg 568  Q
    || |||||  |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || || | ||||||||||| ||||    
T  941 aaggtgcgttttggtactcatcagttggctgaggaagctgatgattggtggattagtcttctacctactttgg 869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 148 - 460
Target Start/End: Original strand, 679 - 991
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |    
T  679 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttgttgttacttaat 778  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  779 gtgtagaaactaagagatggctggaagaaacgacgatgtgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgct 878  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    | |||||||| |||||  |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  879 gatgcgaatgttgagatgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctacttttaagggaagatatgaccctgatagagcccagacgtggctca 978  T
Q  448 aagagattgagag 460  Q
    | |||||||||||    
T  979 aggagattgagag 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 262 - 539
Target Start/End: Original strand, 121329 - 121605
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  121329 gaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcgaatgctggtgtgaatgctga 121428  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
    ||  |||||| | ||||||||||||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  121429 gacgaggatgcttgagactttcatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgagagg 121528  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||    
T  121529 attttccgtgttaagcagtgcactgaggttcag-aaagtgcgatttggtacacatcagctggctgaggaagctgatga 121605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 71644 - 71594
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||    
T  71644 caattggtatcagagcaggttggtccatccggccaagtagtagagtcgtgt 71594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 489
Target Start/End: Original strand, 1255 - 1339
Alignment:
Q  405 ttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||  | || ||||||||| | |||||||| |||| |||||    
T  1255 ttcaaaggaaggtatgatcctgatggcgaccaaacgtggcttaaggaagtagaaaggattttcagggttatgcaatgcagtgaag 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 149 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 721
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt- 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  1128 aattggtatcagagcaggtcggtctgtccggtcaattagaagagtcttgttgagtcttagtaatatttatattactatgttatgttgttgttgctgcttg 1029  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |  |||| || |||||| | |||||      |||  | ||||||    
T  1028 ttgtagaatatcagaaatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcacaagctattggaca------taagcctaatgct 935  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||  |||||     |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  934 ggtgtgactgcagagactaggatgttggagaccttcatgaggaatcaccct--agttttcaaaggaagatatgaccctgatggatcccagacgtggcata 837  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccgggggg 547  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||   || || ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||  || |||    
T  836 aggagatagagaggattttccatgtgatgcagtgcact-aaggtccagaaggtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgattggtggg 738  T
Q  548 ttggncttctacctacc 564  Q
    || | ||||||||||||    
T  737 ttagtcttctacctacc 721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 147 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 10205 - 9871
Alignment:
Q  147 gcaattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctact 246  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       
T  10205 gcaattggtatcagagcaggtccgtccgtccggccaattggaagtttcgtgtcgaattatagtaatagttatattactatcttatgttgttgttgcttgc 10106  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    | || ||||  | ||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10105 tgtgtagaaactaagagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgc 10006  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    | |||||||||||||||  |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||  ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  10005 tcgtgcgaatgctgagacgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcatacttttaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctc 9906  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    || |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  9905 aaggagattgagagggtgttccgcgtgatgcagtg 9871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Original strand, 30046 - 30379
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  30046 caattggtatcagagcaggtcggtccgtacggccaattagaagagtcgtgtcgagtgttagtaatagttatattactatcttatgttgttgttgcttgat 30145  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  |||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30146 gtgtagaaactaagagatggccagaagagacgacgttgcgttagctgctgcactacaagacgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgct 30245  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | ||||| ||| ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||| | |||||||| |    
T  30246 ggtgtgaatgctgagacgaggatgctagagaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgacctcgatggagcctagacgtggctca 30345  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    |||||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  30346 aagagattgagagagtgttccgcgtgatgcagtg 30379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1994 - 1779
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgtt------gttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||| | || ||| ||| ||||| ||||||      ||||    
T  1994 caattggtatcagagcaggtcagtccgtccggccaagtagatgagtcgtgtcgtgt-ttagtaacagttgtat-actgtcttaagttgtttcgattgttg 1897  T
Q  242 ctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgca 341  Q
     |  || || |||| |  | ||||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||||  ||||||| || | |||||||||||| || |||||  ||    
T  1896 tttgttgtgtagaaaacaaagaatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctacacttgaagctgtggctccagctgtgggacatcagcctaatcca 1797  T
Q  342 aatgctggtgcgaatgct 359  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  1796 aatgctggtgcaaatgct 1779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 15341 - 15008
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagca-ggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctact 246  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15341 caattggtatcagagcctggttggtccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagtgatattactatcttatgttgttgttgcttgt 15242  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    | || ||||  | ||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  15241 tgtgtagaa-ctaagagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagccgtaggtcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaattc 15143  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    |||||| | ||||||    |||||| | ||||| ||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15142 tggtgcaagtgctgaagcgaggatgctagagacctttctgaggaaccatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagatgtggctt 15043  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    |||| |||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  15042 aaagtgattgagagagtgttccgtgtaatgcagtg 15008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 156 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 12510 - 12187
Alignment:
Q  156 atcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgaagaa 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |   | || ||||    
T  12510 atcagagcaggtcggtccgtccggccaattagatgagtcgtgtcgagt-ttagtaatagttgtattactatcttatgttgttgttgatttctgtgtagaa 12412  T
Q  256 tatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaa 355  Q
     |  | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |     
T  12411 -actaagaatggctggaagaaacgacgttgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaatagcctaatgcgaatgctggtgcaag 12313  T
Q  356 tgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagatt 455  Q
    ||||||    |||||| | ||||| ||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12312 tgctgaagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgatcctgatggagcccagacgtggctcaaagagatt 12213  T
Q  456 gagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    |||||  | |||||||| ||||||||    
T  12212 gagagagtgttccgtgtaatgcagtg 12187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 3479 - 3149
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |     
T  3479 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaataattttattactatcttatgttgttgttgct--tg 3382  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
    ||| || | || | ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||    
T  3381 ttgtag-agattaagaatggctggaagaaacgatgttgtgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgttggacatcagcctaatgcgaatgct 3283  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| | ||||||    |||||| | ||||| ||   || |||  | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3282 ggtgcaagtgctgaagcgaggatgctagagacctttcggaggaatcatcctcctactctcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctca 3183  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  3182 aagagattgagagggttttccgcgtgatgcagtg 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 198 - 568
Target Start/End: Original strand, 33869 - 34238
Alignment:
Q  198 tcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || || ||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  33869 tcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttacctgttgtgtagaatcttagagatggctggaagaaacgacgctgcgttagttgctg 33968  T
Q  298 cactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccc 397  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||| | ||||| ||| ||| |||  | ||    
T  33969 cactacaagctgtagatcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgtgaatgctgagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcatcc 34068  T
Q  398 tcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaa 497  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||    
T  34069 tcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggaggttgagagagttttccgtgtgatgcagtgcaccgaagtacag-aa 34167  T
Q  498 agtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttggncttctacctaccttgg 568  Q
     |||||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||  || || || | ||||||||||| ||||    
T  34168 ggtgcgttttggtacacatcagctggctgaggaagctgatgattggtggattagtcttctacctactttgg 34238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 42884 - 42556
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||||||    || ||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||||| | || || |||| |||||| || ||||||||  ||    
T  42884 caattggtatcagagcaggt----ccatccggccaagtagttgagtcgtgtcgtgt-ttagtaacagttgtaatactgtcttatttttttgttgcttgtt 42790  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||| |  | ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  || ||| ||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||| |    
T  42789 gtgtagaaaactaagaatggctggaagaaacgatgttgcgattgctgctgccgtagaagttgtggctcaagctgtggtacatcagcctaatgcaaatgtt 42690  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||    |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  42689 ggtgctaatgctgaagtgaggatgctagagacttttctgaggaaccatcctcctactttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacttggctca 42590  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||||||| |||||  | ||||| || ||||||||    
T  42589 aagagatagagagagtgttccgggtcatgcagtg 42556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 76604 - 76276
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||||||||||||    || ||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||||| | || || |||| |||||| || ||||||||  ||    
T  76604 caattggtatcagagcaggt----ccatccggccaagtagttgagtcgtgtcgtgt-ttagtaacagttgtaatactgtcttatttttttgttgcttgtt 76510  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||| |  | ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  || ||| ||| || |||||||||| ||| || ||||| ||||||| |    
T  76509 gtgtagaaaactaagaatggctggaagaaacgatgttgcgattgctgctgccgtagaagttgtggctcaagctgtggtacatcagcctaatgcaaatgtt 76410  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||    |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  76409 ggtgctaatgctgaagtgaggatgctagagacttttctgaggaaccatcctcctactttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacttggctca 76310  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||||||| |||||  | ||||| || ||||||||    
T  76309 aagagatagagagagtgttccgggtcatgcagtg 76276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 284 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 49783 - 49529
Alignment:
Q  284 tgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttc 383  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  49783 tgcgttagctgctgctcgacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaaagcgaatgctggtgcaaatgctgagacgaggatgttggacactttc 49684  T
Q  384 atgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgca 483  Q
      || |||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  49683 tcgaggaagaaccctccaaccttcaagggaagatatgacccggatggagcccagacgtggcttaaagagatagagaggatcttccgtgtgatgcagtgca 49584  T
Q  484 ctgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    | || ||||| ||||||| |  | |||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  49583 ccgaggatca-aaaagtgtgattcggtactcatcagctagctgaggaagctgatga 49529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49869 - 49785
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatg 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49869 caattggtatcagagcaggtcggtctgtcaagacaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatg 49785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Original strand, 83729 - 83777
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||    
T  83729 caattggtatcagagcaggttggtccgtgcggccaagtagtcgagtcgt 83777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 496
Target Start/End: Original strand, 11477 - 11819
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  11477 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggacaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 11576  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| ||||  ||||||||||||||| | | |||| | |||||||||||| ||||||  || |||| ||| ||||| || |||      ||||||    
T  11577 gtgtagaatctcagagatggctggaagaaacaaagctgcgattgctgctgcactagaagctggagcacaagttgttggacatcagcct------aatgct 11670  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    |||||||||||||||   |||||| | ||||| || |||| |||  | ||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11671 ggtgcgaatgctgagtcgaggatgcttgagacctttatgaggaatcatcctgctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctta 11770  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    ||||||| || ||  ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11771 aagagatagaaagagttttcagtgttatgcaatgcactgaagttcagaa 11819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 402 - 539
Target Start/End: Original strand, 6958 - 7094
Alignment:
Q  402 actttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtg 501  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||    
T  6958 actttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgaaagagttttctgtgttatgcaatgcactgaagttcag-aaggtg 7056  T
Q  502 cgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    ||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||    
T  7057 cgatttggtacacatcagctggctgaggaagctgatga 7094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 149 - 481
Target Start/End: Original strand, 16397 - 16729
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttt 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |     
T  16397 aattggtatcagagcaggtcggtccgtccagccaattagaagagtcgtgtcgagttttactaatagttatattactatcttatgttgttgttacttgatg 16496  T
Q  249 tgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctg 348  Q
    || ||||  | ||  |||||  | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16497 tgtagaaactaagagatggccaggagagatgatgctgcgttagctgctgcactacaagtcgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgctg 16596  T
Q  349 gtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaa 448  Q
     ||||||| ||||||  |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16597 ctgcgaatactgagacgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctacttttaatggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaa 16696  T
Q  449 agagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
     |||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  16697 ggagattgagagagtgttccgtgtgatgcagtg 16729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41330 - 41280
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  41330 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccgagtagtagagtcgtgt 41280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 37698 - 37456
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctac-- 245  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||      
T  37698 caattggtatcagggcaggtcggtccgtccgaccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatattttcattactatcttatgttgttgttgttacct 37599  T
Q  246 -ttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaat 344  Q
     || || ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||| || |||    
T  37598 gttgtgtagaatctcagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgaactacaagccgtagctcaagctgtggggcaataacctaatgcgaat 37499  T
Q  345 gctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatga 387  Q
    | ||||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  37498 gttggtgtgaatgctgagacgaggatgctcgagactttcatga 37456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 332 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 23317 - 23086
Alignment:
Q  332 acctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatgga 431  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23317 acctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatgga 23218  T
Q  432 gcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaa 531  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||    
T  23217 gcccagacgtggcttaaagagattgagaggattttccgagttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaa 23119  T
Q  532 gctgatgaccggggggttggncttctacctacc 564  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||| ||||||    
T  23118 gctgatgactggtgggttgctcttctgcctacc 23086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 332 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 8306 - 8075
Alignment:
Q  332 acctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatgga 431  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8306 acctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatgga 8207  T
Q  432 gcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaa 531  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |  | |||    
T  8206 gcccagacgtggcttaaagagattgagaggattttccgagttatgcagtgcacggaggatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctggccgaggaa 8108  T
Q  532 gctgatgaccggggggttggncttctacctacc 564  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||| ||||||    
T  8107 gctgatgactggtgggttgctcttctgcctacc 8075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 148 - 489
Target Start/End: Original strand, 49392 - 49733
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |   ||    
T  49392 caattggtatcagagcaggtcggtccgtacggccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactgtcttatgctgttgttacctgtt 49491  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||| ||||  |||||  ||||| | || | |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||    
T  49492 gtgtagaatctcagagatggccagaagagaggacgctgcgttagctgctgcattacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgtgaatgct 49591  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||    |||||| ||||||| ||  ||| |||  | |||||   |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| |    
T  49592 ggtgcgaatgctgaagtgaggatgctggagacctttctgaggaatcatcctccggttttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagatgtggctca 49691  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  49692 aagagattgagagagttttccgtgtgatgcagtgcaccgaag 49733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 9668 - 9356
Alignment:
Q  152 tggtatcagagcaggttggtccgtc----cggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |    
T  9668 tggtaccagagcaggtcggtccgtctgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttgttgtttcttgat 9569  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  |||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9568 gtgtagaaactaagagatggccagaagagatgatgctgcgttagctgctgcactacaagtcgtagcttaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgct 9469  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||  ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  9468 ggtgcgaatgctgagacgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcttacttttaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctca 9369  T
Q  448 aagagattgagag 460  Q
    | |||||||||||    
T  9368 aggagattgagag 9356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 1354 - 1012
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttg-ttgctact 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |    
T  1354 caattggtatcagagcaggtcggttcgtctagccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgattacctgt 1255  T
Q  247 tttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgc 346  Q
    | || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || |||| || |||||| | ||||| || |||      |||||    
T  1254 tgtgtagaatctca-gaatggctggaaggaacgatgatgcgattgctgctgcactagaaactgtagcacaagctattggacatcagcct------aatgc 1162  T
Q  347 tggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctt 446  Q
    ||| | |||||||||||  |||||| | ||||| ||||||| |||  | ||||| || ||||| | | ||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  1161 tggggtgaatgctgagacgaggatgcttgagacattcatgaggaatcatcctcctaccttcaaggaaagatatgatccagatggagcccggacgtggctt 1062  T
Q  447 aaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    || |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  1061 aaggagattgagagagtttttcgtgtgatgcagtgcaccgaagttcagaa 1012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 284 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 172240 - 171986
Alignment:
Q  284 tgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttc 383  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  || |||  |||||||||||||| |||    
T  172240 tgcgttagctgctgctctacaaggtgttgcccaaggtctgggacaacaacctaacgcgaatgctagtgtgaacactaagaccaggatgttggagaccttc 172141  T
Q  384 atgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgca 483  Q
    ||||  ||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  172140 atgagaaatcaccctccaactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagattgataggattttccgtgtgatgcagtgca 172041  T
Q  484 ctgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatga 539  Q
    || ||| ||   ||||| ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  172040 ct-aaggtccagaaagtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatga 171986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 345
Target Start/End: Original strand, 28047 - 28235
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28047 caattggtatcaaagtaggtcggtccgtccggccaattagaagagtc----------ttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttgctactt 28136  T
Q  248 -ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatg 345  Q
     ||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28137 gttgtagactatctgaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatg 28235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 274
Target Start/End: Original strand, 17912 - 18037
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaattaga-gagtcgtgtcgagtcttagtaatatatatattactatcttatgttgttgttgctactt 18010  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaag 274  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18011 ttgtagaatatcagaaatggctggaag 18037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 148 - 469
Target Start/End: Original strand, 39644 - 39965
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  39644 caattggtatcagagcaggtcggtccgttcggccaattagatgagtcgtgtcgagttttagtaatattcgtattactatcttatgttgttgttgcttgtt 39743  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     | |||||  | ||  ||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || |||    ||||||||    
T  39744 gttaagaaactaagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgatgcactagaagctgtagctcaagctgttggacatcagcctggttcaaatgct 39843  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| | ||||||    |||||| | ||||| ||  | | |||  | ||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  39844 ggtgcaagtgctgaagcgaggatgctagagacctttctaaggaatcatcctcctactttcaagggaatatatgacccttatggagctcagacgtggctca 39943  T
Q  448 aagagattgagaggattttccg 469  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  39944 aagagattgagagggttttccg 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 243
Target Start/End: Original strand, 22572 - 22666
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgct 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22572 caattggtatcagagcaagttggtccgtccggccaattagatgagtcgtgtcgagt-ttagtaatagttgtattactatcttatgttgttgttgct 22666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 190 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 2924 - 2636
Alignment:
Q  190 gagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgtt 289  Q
    |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  || |  ||| ||  ||  |||||||||||||||||||||| | |    
T  2924 gagtcgtgtcgaga-ttagtaatagttgtattactatcttatgttgttgttgcttgttgtagagattaagag--atggctggaagaaacgatgatgtgat 2828  T
Q  290 agctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaag 389  Q
     |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||   |||||||||||||| ||||||||    |||||| | ||||||||  |||      
T  2827 tgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacatcagcctgctgcaaatgctggtgctaatgctgaagtgaggatgcttgagacttttctgaga 2728  T
Q  390 aagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||  | ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2727 aatcatcctcctacttttaagggaagatatgaccctgatggagctcaaacgtggctcaaagagattgagaggattttccgtgtgatgcagtg 2636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Original strand, 7200 - 7532
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | || || |||| ||||| ||||||||||||  ||    
T  7200 caattggtatcggagcaggtcggtccgtccggccaattagatgagtcgtgtcgagt-ttagtaacagttgtaatactgtcttacgttgttgttgcttgtt 7298  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||  |  | |||||| |||||||||||| | |||| | || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| | ||||| |    
T  7299 gtgtagagaactaagaatggatggaagaaacgacgctgcgattgcagctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacatcagcctaatgaaaatgtt 7398  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||    ||||||||||| |||||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  7399 ggtgctaatgctgaagtgaggatgttggaaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctca 7498  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    |||||||| ||||  | |||| ||| ||||||||    
T  7499 aagagattcagagagtgttccatgtgatgcagtg 7532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 433 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 896 - 734
Alignment:
Q  433 cccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaag 532  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || | ||||    
T  896 cccagacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcag-aaagtgcggtttggtactcatcagctagctgaggaag 798  T
Q  533 ctgatgaccggggggttggncttctaccta-ccttgggcaaaaaggncctgttgtggacctgggc 596  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  797 ctgatgactggtgggttggccttctaactacccttgggcaagaaggagctgttgt-gacctgggc 734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9168
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   |    
T  9480 caattggtatcagagcaggtcggtcggtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttgtattactatcttatgttgatgttgctcgct 9381  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || ||||  | ||  |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||| ||  ||||||| ||||| || |||   |||||| ||    
T  9380 gtgtagaaactaagagatggctggaagaaacgatgatgcgattgttgctgcactagaagttgtagctaaagctgttggacatcagcctgctgcaaatact 9281  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||  | ||||||    |||||| | ||||| ||  ||| |||  | ||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9280 ggtgtaagtgctgaagcaaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcctacttttaagggaagttatgaccctgatggagcccagacgtggctca 9181  T
Q  448 aagagattgagag 460  Q
    |||||||||||||    
T  9180 aagagattgagag 9168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 324 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 6078 - 5865
Alignment:
Q  324 ggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgacc 423  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||  | | ||| || || |||||| |||||||||    
T  6078 ggacaacaacctaacgcgaatgctggtctgaatgctgagaccaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcatccaacctttaaaggaagatatgacc 5979  T
Q  424 ctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctan 523  Q
    |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||| ||||||||     
T  5978 ccaatggagcccagacgtggcttaaa-agattgagaggattttccgtgtgatgcagtgcactgaagttcag-aaagtgcgattcggtactcatcagctag 5881  T
Q  524 ctnaagaagctgatga 539  Q
    || | |||||| ||||    
T  5880 ctgaggaagctaatga 5865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 279 - 481
Target Start/End: Original strand, 23904 - 24106
Alignment:
Q  279 gatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggaga 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || || |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||    
T  23904 gatgatgcgttagctgctgcactacaagtcgtagctcaagttgtgggacaatagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgctgagacgaggatgctagaga 24003  T
Q  379 ctttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgca 478  Q
    ||||  ||| |||  | ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||| || |||||    
T  24004 cttttttgaggaatcatcctcctacttttaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaggagattgagagggtgttccgcgtgatgca 24103  T
Q  479 gtg 481  Q
    |||    
T  24104 gtg 24106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 343 - 563
Target Start/End: Original strand, 7021 - 7240
Alignment:
Q  343 atgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtg 442  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7021 atgctggagtgactgctgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgacggagcccagacgtg 7120  T
Q  443 gcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccg 542  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||| || || ||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||  |    
T  7121 gcttaaggagattgagaggatattccgtgtgatgcagtgcactgaggtccag-aaggtacgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgattg 7219  T
Q  543 gggggttggncttctacctac 563  Q
    | ||||| | |||||||||||    
T  7220 gtgggttagtcttctacctac 7240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 282
Target Start/End: Original strand, 6881 - 7023
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcga-gtcttagtaatatttatattactatctta------tgttgttgtt 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||    
T  6881 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaagagtcttgttgatgtcttagtagtatttatattactatcttatgatgttgttgttgtt 6980  T
Q  241 gctactt-ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatg 282  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6981 gctacttgttgtagaatatcagagatggctggaagaaacgatg 7023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 496
Target Start/End: Original strand, 54520 - 54867
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||  ||    
T  54520 caattggtatcagagcaggccggtctgtccggccaattagatgagtcgtgacgagt-ttagtaacagttgtaatactgtcttatgttgttgttgcttgtt 54618  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||| |  | |||||||||||||||| |||| || | | |||| ||||||| ||| ||| || |||| ||||||||| || |||   |||||||||    
T  54619 gtgtagaaaactaagaatggctggaagaaatgatgttgtgattgctgttgcactagaagttgtagctcaagttgtgggacatcagcctgctgcaaatgct 54718  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| ||||||||    |||||| | || |||||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  54719 ggtgctaatgctgaagtgaggatgctagaaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctca 54818  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  54819 aggagattgagagagtgtttcgagttatgcagtgtactgagggtcagaa 54867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 323
Target Start/End: Original strand, 29673 - 29848
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  29673 caattggtatcagagcaggtcggtttttcttgccaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgttacctgtt 29772  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtg 323  Q
     || ||||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  29773 gtgtagaatctgagaaattgctggaagaaactatgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtg 29848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 264 - 481
Target Start/End: Original strand, 41174 - 41391
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 363  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||      
T  41174 atggctgaaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagccgtcgctcaagctgtggggcaacagcctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgaag 41273  T
Q  364 ataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggat 463  Q
      |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||  |    
T  41274 cgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacttggctcaaagagatagagagagt 41373  T
Q  464 tttccgtgttatgcagtg 481  Q
     || ||||| ||||||||    
T  41374 gtttcgtgtgatgcagtg 41391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 396 - 564
Target Start/End: Original strand, 29869 - 30036
Alignment:
Q  396 cctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcaga 495  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||| | ||||     
T  29869 cctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagtccagacgtggcttaaggagatcgagagagttttccgtgtgatgcattgcactgatgttcag- 29967  T
Q  496 aaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttggncttctacctacc 564  Q
    || |||||  |||||||  |||||||  || | |||||||||||  || ||||| |  |||||||||||    
T  29968 aaggtgcgatttggtacacatcagctggctgaggaagctgatgattggtgggttagttttctacctacc 30036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 243
Target Start/End: Original strand, 41056 - 41149
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgct 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||| ||||||| | || || |||| |||  |||||||||||||    
T  41056 aattggtataagagcaggtcggtccgttcggccaagtagttgagtcgtgtcgagt-ttagtaacagttgtaatactgtctattgttgttgttgct 41149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 262 - 496
Target Start/End: Original strand, 56816 - 57050
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| |  ||||||| || |||||| |||| ||||| || || || |||| |||||| ||||||||    
T  56816 gaatggctggaagaaacgacgatgtgattgctgctgcattggaagctgtcgctcaagctatggggcaacagccaaatgctaatgttggtgctaatgctga 56915  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
       |||||||||||||||||| |||| |||  | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  56916 agttaggatgttggagacttttatgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatacgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagaga 57015  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
     | |||| ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  57016 gtgttccatgttatgcaatgcactgaggttcagaa 57050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 18949 - 18999
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  18949 caattggtatcagagcaggttggtccgtacggccaagtagtagagtcgtgt 18999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 56697 - 56747
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  56697 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgt 56747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 4806 - 4475
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||| ||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||  ||    
T  4806 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcatgtcgagt-ttagtaacagttgtaatactgtcttatgttgttgttgcttgtt 4708  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||  || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  4707 gtgtagag-attaagaatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaggccgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgcgaatgct 4609  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| | | ||||    |||||| |  || ||||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  4608 ggtgcaagtactgaagcgaggatgctacagtcttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgacccagatggagctcagacttggctca 4509  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||||||| |||||  |||| | ||| ||||||||    
T  4508 aagagatagagagagtttttcatgtgatgcagtg 4475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 460
Target Start/End: Original strand, 3596 - 3906
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||||||| | ||||||| | || || || | ||||||||||||||||||  ||    
T  3596 caattggtatcagatcaggtcggtccatccggccaagtagttgagtcgtgtcgatt-ttagtaacagttgtaatattgtcttatgttgttgttgcttgtt 3694  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||| || | |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3695 atgtagaa-attaagaattgctggaagaaacgacgttgcgttagctgctgcactacaggccgtggctcaagctgtggggcaacaacctaatgcgaatgct 3793  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| | || |||    |||||| | ||||||||  ||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  3794 ggtgcaagtgttgaagcgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagctcagacttggctca 3893  T
Q  448 aagagattgagag 460  Q
    ||||||| |||||    
T  3894 aagagatagagag 3906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Original strand, 12544 - 12592
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  12544 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 12592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 342 - 564
Target Start/End: Original strand, 11 - 231
Alignment:
Q  342 aatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgt 441  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11 aatgctggtgtgactgctgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaacattcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgt 110  T
Q  442 ggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgacc 541  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||| ||||||||  | |||||  |||| ||| || | |||||||||||      
T  111 ggcttaaggagatcgagaggattttccgtgtgatgcagtgca-tgggggtcag-aaagtgcgattcggtacacatcaactagctgaggaagctgatgatt 208  T
Q  542 ggggggttggncttctacctacc 564  Q
    || ||||| | ||||||||||||    
T  209 ggtgggttagccttctacctacc 231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 1272 - 941
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||| ||||||| | || || || | ||||||||||||||||||  ||    
T  1272 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccgtccaagtagttgagtcgtgtcgagt-ttagtaacagttgtaatattgtcttatgttgttgttgcttgtt 1174  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||  || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  1173 gtgtagag-attaagaatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaggccgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgcgaatgct 1075  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||| | | ||||||    |||||| |  |||||||  ||| |||  | ||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||| || || ||||| |    
T  1074 ggttcaagtgctgaagcgaggatgctatagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaatatatgaccctaatggagctcagacttggctca 975  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||||||| |||||  | || ||||| ||||||||    
T  974 aagagatagagagagtgtttcgtgtgatgcagtg 941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 5689 - 5358
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||| ||||||| | || || || | ||||||||||||||||||  ||    
T  5689 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccgaccaagtagttgagtcgtgtcgagt-ttagtaacagttgtaatattgtcttatgttgttgttgcttgtt 5591  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || |||  || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  5590 gtgtagag-attaagaatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaggccgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgcgaatgct 5492  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||| | | ||||||    |||||| |  |||||||  ||| |||  | ||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||| || || ||||| |    
T  5491 ggttcaagtgctgaagcgaggatgctatagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaatatatgaccctaatggagctcagacttggctca 5392  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||||||| |||||  | || ||||| ||||||||    
T  5391 aagagatagagagagtgtttcgtgtgatgcagtg 5358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 240
Target Start/End: Original strand, 8762 - 8854
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgtt 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8762 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaattaaaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttgtattactatcttatgttgttgtt 8854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 243
Target Start/End: Original strand, 6995 - 7090
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgct 243  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6995 caattggtatcagagcaagtcggtccgtccgaccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgct 7090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 243
Target Start/End: Original strand, 12370 - 12465
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgct 243  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12370 caattggtatcagagcaggtcgggccgtccggccaattagaagagtcgtgtcgagttttagtaatagttatattactatcttatgttgttgttgct 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 262 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 105338 - 105103
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| ||| ||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  105338 gaatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactaaaagttgtggctcaagctgtgtggcatcagcctaatgcaaatgctggtgcaaatgttga 105239  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
        |||||| ||||||||||   || |||  | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  105238 agtaaggatgatggagacttttccgaggaaccatcctcctactttcagaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagaga 105139  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaa 497  Q
     | |||||||| ||||||||||| || | |||||||    
T  105138 gtgttccgtgtcatgcagtgcacagaggttcagaaa 105103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 105453 - 105401
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| |||||||||||    
T  105453 caattggtatcagagcaggtcggtctgtccgaccaagtagatgagtcgtgtcg 105401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 262 - 496
Target Start/End: Original strand, 1174 - 1408
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    |||||||||||||||| || | |||| | |||||||||| | ||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1174 gaatggctggaagaaatgacgctgcgattgctgctgcaccagaagctgtggctcaagctgtagggcatcagcctaatgcaaatgctggtgctaatgctga 1273  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
        ||||||||||| |||||  ||| |||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||     
T  1274 agtgaggatgttggatacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagaaattgagaga 1373  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
     | || || ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  1374 gtgtttcgggttatgcagtgtactgaggttcagaa 1408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Original strand, 1050 - 1101
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||    
T  1050 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgaccaagtagtcgagtcgtgtc 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 262 - 496
Target Start/End: Original strand, 4038 - 4272
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    |||||||||||||||| || | |||| | |||||||||| | ||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4038 gaatggctggaagaaatgacgctgcgattgctgctgcaccagaagctgtggctcaagctgtagggcatcagcctaatgcaaatgctggtgctaatgctga 4137  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
        ||||||||||| |||||  ||| |||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||     
T  4138 agtgaggatgttggatacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagaaattgagaga 4237  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
     | || || ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  4238 gtgtttcgggttatgcagtgtactgaggttcagaa 4272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Original strand, 3914 - 3965
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||    
T  3914 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgaccaagtagtcgagtcgtgtc 3965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 487
Target Start/End: Original strand, 12759 - 12984
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |  ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  12759 gaatggctggaagaaacgacgttgcgattgctgctgcattggaagttgtggctcaagctgtgggacaacagcctaatgctaacgctggtgctaatgctga 12858  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
       ||||||||||||||||||   || |||    ||  | || ||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  12859 agttaggatgttggagacttttcagaggaatcttccatctaccttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagaga 12958  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
     | |||||||||||||| ||||||||    
T  12959 gtgttccgtgttatgcaatgcactga 12984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 496
Target Start/End: Original strand, 17026 - 17372
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| | || || |||| |||||||||||||||||| |||    
T  17026 caattggtatcagagcatatccgtccgtccggccaattagatgagtcgtgttgagt-ttagtaacaattgtaatactgtcttatgttgttgttgcttctt 17124  T
Q  248 ttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgct 347  Q
     || | || |  | |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| || | |   |||||||||    
T  17125 gtgcaaaaaactaagaatggctagaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagttgtagctcaagctgtgggacatcagcatgctgcaaatgct 17224  T
Q  348 ggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggctta 447  Q
    ||||| |||| |||    |||||| | || |||||  ||  |||  | ||||| | |||||| |||  |||||||||||||||||| || || |||||||    
T  17225 ggtgctaatgttgaagtgaggatgctagaaacttttctg-ggaatcatcctcctaatttcaagggaaaatatgaccctgatggagctcagacttggctta 17323  T
Q  448 aagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  17324 atgagattgagagagtgtttcgagttatgcagtgtactgagggtcagaa 17372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 361
Target Start/End: Original strand, 104603 - 104820
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttg------ 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||  |||||| | || || |||| ||||||||||||||||          
T  104603 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcgagt--tagtaacagttgtaatactgtcttatgttgttgttgttgttg 104700  T
Q  242 ctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgca 341  Q
    ||  || || |||| |  | ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||    
T  104701 cttgttgtgtagaaaactaagaatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgtactagaagctgtagctcaagctgtgggacatcagcctaatgca 104800  T
Q  342 aatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  104801 agtgctggtgcaaatgctga 104820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21223 - 21125
Alignment:
Q  315 caagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaagga 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||| |||| |||  | || || ||||||||||||    
T  21223 caagctgtgggacaacagcctaatgcgaatgctggtgctaatgctgaagttagaatgttggagaattttatgaggaatcatccacctactttcaaagga 21125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 18830 - 18790
Alignment:
Q  420 gaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagag 460  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  18830 gaccctgatggagcacagacgtggctcaaagagattgagag 18790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 262 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 16553 - 16331
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |  ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||||||    
T  16553 gaatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcattggaagctgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgttaatgcgggtgctaatgctga 16454  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
       ||||||||||||||| ||| ||| |||  | || |  || ||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  16453 agttaggatgttggagaccttcttgaggaatcatccgcgtaccttcaagggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagaga 16354  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcac 484  Q
     | |||| ||||||||| |||||    
T  16353 gtgttccatgttatgcaatgcac 16331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 9429 - 9239
Alignment:
Q  306 gctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactt 405  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  || || |||| ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||  ||| |||  | || ||   ||    
T  9429 gctgtagctcaagctgtaggacaacaactaaatgctaatgttggtgcgaatgctgaggttagaatgttagagacttttctgaggaaccatccccctgttt 9330  T
Q  406 tcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    |||||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9329 tcaaaggaaggtatgatccagacggagcacagacgtggctcaaggagattgaaagagttttccgtgttatgcaatgcactgaagttcagaa 9239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16677 - 16621
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||    
T  16677 caattggtatcagagcacgtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgagtcgagtc 16621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 316 - 487
Target Start/End: Original strand, 13480 - 13651
Alignment:
Q  316 aagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacg 415  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | | |||  | || || ||||| |||||| |    
T  13480 aagctttggggcaacaacctaatgctaatgctggtgctaatgctgaagataggatgttggagacttttctaaggaatcatccacctacttttaaaggaag 13579  T
Q  416 atatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
     ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||    
T  13580 gtatgaccctaatggagctcaaacatggctcaaagagattgagagagcgttccgtgttatgcaatgcactga 13651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 496
Target Start/End: Original strand, 8564 - 8745
Alignment:
Q  315 caagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggac 414  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| |||||  ||| |||  | ||||| ||||||||||||     
T  8564 caagttgtggggcaacagcctaatgctaatgctggtgctaatgccgaagttaggatgttggaaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaa 8663  T
Q  415 gatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | ||||| || |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||    
T  8664 ggtatgatccagatgtagctcagacgtggctcaaagagattgagaggattttccgagttatgcaatgcaatgaggttcagaa 8745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5990 - 5836
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttgctactt 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  ||    
T  5990 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcgagt-ttagtaatagttgtaatactgtcttatgttgttgttgcttgtt 5892  T
Q  248 ttgaagaata-tcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcacta 302  Q
     || |||| | | ||  ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  5891 gtgtagaaaactaagagatggctggaagaaacgacgctgtgttagctgttgcacta 5836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21207 - 21116
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttg 241  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21207 caattggtatcagagctggtcggtctgtccggccaattataagagtcgtgtcgag--ttagtaatagttgtattactatcttatgttgttgttg 21116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 442742 - 442580
Alignment:
Q  315 caagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggac 414  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||   |||||||||||| |||||  ||| |||  | || || ||||||||||||     
T  442742 caagctgtggggcaacagcctaatgctaatgttggtgctaatgctgaagttaggatgttggaaacttttctgaggaatcatccacctactttcaaaggaa 442643  T
Q  415 gatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgc 477  Q
    | ||||| || |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  442642 ggtatgatccagatggagctcagacgtggctcaaagaggttgagaggattttccgggttatgc 442580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 452528 - 452578
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  452528 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagttgtgt 452578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 442914 - 442883
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  442914 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 442883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 513388 - 513435
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  513388 ttggtatcagagcaggttggtccgtccagccaagtagtagagtcgtgt 513435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 199
Target Start/End: Original strand, 164194 - 164238
Alignment:
Q  155 tatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  164194 tatcagagcaggtcggtccgtccggccaattagaggagttgtgtc 164238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 334
Target Start/End: Original strand, 23321 - 23429
Alignment:
Q  226 tcttatgttgttgttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtggg 325  Q
    ||||||||||||||||||  || || |||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  23321 tcttatgttgttgttgcttgttgtgtagaaaactaagaatggctggaagaaacgaagctgcgttagctgctgcactacaagtcgtggctcaagctgtggg 23420  T
Q  326 acaacaacc 334  Q
    |||||||||    
T  23421 acaacaacc 23429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 8809 - 8859
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  8809 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 8859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 11061 - 11124
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaat 212  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  11061 caattgatatcagagcaggtcggtccgcacggccaattagttgagtcgtgtcgagt-ttagtaat 11124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 366 - 478
Target Start/End: Original strand, 35480 - 35592
Alignment:
Q  366 aggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattt 465  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||  | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  | |    
T  35480 aggatgttagagaattttatgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatacgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagagtgt 35579  T
Q  466 tccgtgttatgca 478  Q
    |||||||||||||    
T  35580 tccgtgttatgca 35592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7170 - 7031
Alignment:
Q  346 ctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggct 445  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||  ||| |||  | || || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7170 ctggtgctaatgctgaagttaggatgttggagacctttttgaggaatcatccacctactttcaagggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggct 7071  T
Q  446 taaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcact 485  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  7070 caaagagattgagaggatttttcggattatgcaatgcact 7031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7361 - 7309
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  7361 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggacaagtagtagagtcgagtcg 7309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 11949 - 11717
Alignment:
Q  221 tactatcttatgttgttgttgctacttttgaagaatatcaggaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagct 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||  || || |||  || | |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||  ||||||| || ||||||    
T  11949 tactgtcttatgttgttgttgcttgttgtgtagag-attaagaatggctggaagaaacgatgatgtgattgctgttgcacttgaagctgtagctcaagct 11851  T
Q  321 gtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatg 420  Q
    |||||||| || |||   ||||||| |||||| ||||||||    |||||| | || |||||  ||| |||    ||||| ||||| || ||| ||||||    
T  11850 gtgggacatcagcctgctgcaaatgttggtgctaatgctgaagtgaggatgctagaaacttttttgaggaattgtcctcctacttttaagggaagatatg 11751  T
Q  421 accctgatggagcccaaacgtggcttaaagagat 454  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  11750 accctgatggagcttagacgtggctcaaagagat 11717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 487
Target Start/End: Original strand, 22694 - 22919
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctga 361  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  | ||||||||| |  ||| ||| ||  ||||||| || || || ||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  22694 gaatggctggaagaaacgacgctgcaattgctgctgcattggaagttgtggctaaagctgtagggcatcagcctaatgctaatgttggtgctaatgctga 22793  T
Q  362 gaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagagg 461  Q
    |  |||||||||||| | |||| ||| |||  | || || |||||||||||| | ||||||||| |||||||  | |||||||| ||| ||||||||||     
T  22794 ggttaggatgttggaaaatttcttgaggaatcatccgcctactttcaaaggaaggtatgaccctaatggagcttagacgtggctcaaatagattgagaga 22893  T
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
     | || || |||||||| ||||||||    
T  22894 gtgtttcgggttatgcaatgcactga 22919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Original strand, 22576 - 22627
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  22576 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagatgagtcgtgtc 22627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20186 - 20079
Alignment:
Q  315 caagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggac 414  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| ||| ||| |||  | ||||| |||||||| |||     
T  20186 caagttgtgggacaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgctgagacgaggatgctagagaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaa 20087  T
Q  415 gatatgac 422  Q
    ||||||||    
T  20086 gatatgac 20079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 657 - 535
Alignment:
Q  365 taggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggatt 464  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||  | || || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||  ||    
T  657 taggatgttggagacctttttgaggaatcatccacctacttttaaaggaagatatgatcctgatggagctcggacgtggctcaaagagattgagagagtt 558  T
Q  465 ttccgtgttatgcagtgcactga 487  Q
    ||||| |||||||| ||||||||    
T  557 ttccgggttatgcaatgcactga 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 873 - 821
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||    
T  873 caattggaatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagttgagtcgagtcg 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 59 - 1
Alignment:
Q  342 aatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcc 400  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59 aatgctggtgtgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 336 - 386
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  336 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1600 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold1600
Description:

Target: scaffold1600; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1312 - 1262
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  1312 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagatgagtcgtgt 1262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1600; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 402 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 1060 - 966
Alignment:
Q  402 actttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||  | |||||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||| |||| ||||| ||||||    
T  1060 actttcaaaggaaggtatgaccatgatggagctgagacgtggctcaaagaggttgaaagaattttacgggtcatgcaatgcaatgaagttcagaa 966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 198
Target Start/End: Original strand, 679 - 725
Alignment:
Q  152 tggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  679 tggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaagtagtagagtcgtgt 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 676 - 626
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  676 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 5315 - 5365
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  5315 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 5365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 781
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  831 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 16241 - 16291
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16241 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 16291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3891 - 3841
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  3891 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 3841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 21328 - 21378
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  21328 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 21378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 32405 - 32455
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  32405 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 32455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 293
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  343 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15197 - 15147
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15197 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 15147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26731 - 26681
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26731 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 26681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 5)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30895 - 30845
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  30895 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 30845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 48214 - 48264
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  48214 caattggtatcagagcaggttggtccgtccagccaagtagcagagtcgtgt 48264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 57248 - 57298
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  57248 caattggtatcagagcaggttggtccgtccagccaagtagcagagtcgtgt 57298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 63634 - 63684
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  63634 caattggtatcagagcaggttggtccgtccagccaagtagcagagtcgtgt 63684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 30664 - 30548
Alignment:
Q  365 taggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggatt 464  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||  | || || |||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || | |||||| || ||| |||| || |||    
T  30664 taggatgttggagactttcttgagaaatcatccaccaactttcaaaggaaggtatgaccatgacggagctcagaagtggctcaaggaggttgaaagaatt 30565  T
Q  465 ttccgtgttatgcagtg 481  Q
    ||| | |||||||||||    
T  30564 ttcagagttatgcagtg 30548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 28557 - 28607
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  28557 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 28607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 62575 - 62625
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  62575 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 62625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 43747 - 43797
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  43747 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 43797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 71375 - 71325
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  71375 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 71325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 71096 - 71017
Alignment:
Q  417 tatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| |||| ||| | ||||||    
T  71096 tatgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagaggttgagaggattttcagagtcatgcaatgcagtgaggttcagaa 71017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 179
Target Start/End: Original strand, 79157 - 79188
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79157 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgg 79188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 992 - 846
Alignment:
Q  342 aatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgt 441  Q
    |||| ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||  ||| |||  | |||||   |||||||||| | ||||| || || ||||| || ||||    
T  992 aatgttggtgcgaatgctgaggtcagaatgttagagacttttctgaggaaccatcctcctgttttcaaaggaaggtatgatccagacggagcacagacgt 893  T
Q  442 ggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaa 488  Q
    |||| || |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  892 ggctcaaggagattgaaagagtttttcgtgttatgcaatgcactgaa 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 116895 - 116845
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  116895 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 116845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 52920 - 52870
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  52920 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 52870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 496
Target Start/End: Original strand, 14217 - 14398
Alignment:
Q  315 caagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgagaataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggac 414  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| ||   ||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||| |||| |||  | ||  | ||||||||||||     
T  14217 caagctgtggggcaatagcctaatgctggtgctggtgctaatgctgaggttagaatgttggaaacttttatgaggaatcatccatctactttcaaaggaa 14316  T
Q  415 gatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaa 496  Q
    | ||||| || |||||||| || | |||||| ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||||    
T  14317 ggtatgatccagatggagctcagatgtggctcaaagagattaagaggattttacgaggtatgcaatgcaatgaggttcagaa 14398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 357
Target Start/End: Original strand, 30223 - 30316
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatg 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||  |||| || || |||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||    
T  30223 atggctggaagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaagccgtagctcaagctgtgggacaacaaccgaatgctggtgctggtgcgaatg 30316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 320466 - 320417
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  320466 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtg 320417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 320354 - 320305
Alignment:
Q  291 gctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgc 340  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  320354 gctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtgggacaacaaccgaacgc 320305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Original strand, 859 - 910
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  859 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtc 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 13090 - 13137
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  13090 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 13137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1730 - 1683
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  1730 ttggtatcagagcaggttggtccgtccgtccaattagtagagtcgtgt 1683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31179 - 31132
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  31179 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 31132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 354 - 404
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  354 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagcagtagagtcgtgt 404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 22 - 72
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  22 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaaatagtagagttgtgt 72  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2983 - 2933
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  2983 caattgatatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 2933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 66 - 116
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||    
T  66 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtaaagtcgtgt 116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 4937 - 4987
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  4937 caattggtatcagagcagattggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 4987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12249 - 12199
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  12249 caattggtattagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 12199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22037 - 21987
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  22037 caattggtatcatagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 21987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21766 - 21682
Alignment:
Q  405 ttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactgaag 489  Q
    ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||||||| | |||||||| |||| |||||    
T  21766 ttcaaaggaaggtatgatcccgatggtgcccagaagtggcttaaagaggtggaaaggattttcagggttatgcaatgcagtgaag 21682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 3117 - 3167
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  3117 caattggtataagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 3167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17202 - 17156
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  17202 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtc 17156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35588 - 35538
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  35588 caattggtatcagagtaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 35538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 467
Target Start/End: Original strand, 42735 - 42785
Alignment:
Q  417 tatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttc 467  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  42735 tatgaccctgatggagctcaaaagtggctcaaagaggttgagaggattttc 42785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15627 - 15593
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaa 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15627 aattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaa 15593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17647 - 17613
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaa 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17647 aattggtatcagagcaggtcggtccgtccggtcaa 17613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 42456 - 42506
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  42456 caattggtatcagagcaggttgatccgtccggccatgtagtagagtcgtgt 42506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 31003 - 31053
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  31003 caattggtatcagagcaggttggtcagtccggccaagtagtagagtcgtgt 31053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 55317 - 55267
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  55317 caattggtatcagagcagattggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 55267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33829 - 33779
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  33829 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagggtcgtgt 33779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33700 - 33607
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatg 357  Q
    |||||||| |||||||||| |||  | |||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  33700 atggctgggagaaacgatgttgctattgctgttgcactgcaagctgtagctcaggctgtaggacaacaaccgaatgctagtgctggtgcaaatg 33607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 66140 - 66190
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  66140 caattggtatcagagcaggttggtccgtcaggccaagtagtagagtcgtgt 66190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 61807 - 61857
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  61807 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagttgtgt 61857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 177245 - 177195
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  177245 caattgatatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 177195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 175676 - 175726
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  175676 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagatgagtcgtgt 175726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 264500 - 264454
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  264500 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtc 264454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 481
Target Start/End: Original strand, 4330 - 4391
Alignment:
Q  420 gaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtg 481  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  4330 gaccctgatggagctcagaagtggctcaaagagattgagaggatcttcagagttatgcagtg 4391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 4067 - 4117
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  4067 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccgggcaagtagttgagtcgtgt 4117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 199
Target Start/End: Original strand, 9531 - 9580
Alignment:
Q  150 attggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  9531 attggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtc 9580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 241
Target Start/End: Original strand, 15593 - 15685
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtcttagtaatatttatattactatcttatgttgttgttg 241  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||| | || || || | ||||| ||||||||||    
T  15593 caattggtatcagagcaggacggtccatctggccaattagatgagtcgtgtcgagt-ttagtaacagttgtaatattgtcttacgttgttgttg 15685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 310
Target Start/End: Original strand, 15711 - 15759
Alignment:
Q  262 gaatggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgt 310  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| |||||||    
T  15711 gaatggctggaagaaacaatgttgcgatcgctgctgcactagaagctgt 15759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19847 - 19791
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  19847 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgtgtcaagtc 19791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6257 - 6209
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  6257 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 6209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8698 - 8495
Alignment:
Q  264 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 363  Q
    ||||||| |||||| |||| |||  | |||||||||||  | ||||| || |||||||| || |||||||| || |    ||||||||| ||||||||      
T  8698 atggctgaaagaaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgtagggcaacaaccaaatgttggtgctggtgcaaatgctgaag 8599  T
Q  364 ataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggat 463  Q
     ||||||||| || ||||| ||||  ||  |||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||| || | |||||| || ||| |||| || ||    
T  8598 ttaggatgttagaaacttttatgagaaatcacccaccaactttcaaaggtagatatgatcctgatggagctcagaagtggctcaaggaggttgaaagaat 8499  T
Q  464 tttc 467  Q
    ||||    
T  8498 tttc 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12673 - 12626
Alignment:
Q  151 ttggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  12673 ttggtatcaaagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgtgt 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 457
Target Start/End: Original strand, 723 - 778
Alignment:
Q  402 actttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattga 457  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  723 actttcaagggaagatatgaccctgatggagcttaatcgtggctcaaagagattga 778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1360 - 1313
Alignment:
Q  149 aattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  1360 aattagtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcgt 1313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 9197 - 9097
Alignment:
Q  462 attttccgtgttatgcagtgcactgaagatcagaaaagtgcgggttggtactnatcagctanctnaagaagctgatgaccggggggttggncttctacct 561  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |  |||||  |||||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||| | ||| |||||    
T  9197 attttccgagtgatgcagtgcactgaggtccagaa--gtgcgatttggtactcatcagctagctgaggaagctgatgactggtgggttagtcttttacct 9100  T
Q  562 acc 564  Q
    |||    
T  9099 acc 9097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6324 - 6277
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcg 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  6324 caattagtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtagtagagtcg 6277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1235 - 1184
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||    
T  1235 caattggtatcagagcaggttggtccgtccgaccaagtagttgagtcgtgtc 1184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 7061 - 6990
Alignment:
Q  415 gatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgcagtgcactg 486  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  7061 gatatgatcctgatggagctcaaacatggctcaatgaggttgagaggatctttcgggttatgcagtgtactg 6990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 880 - 930
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  880 caattggtatcaaagcaggttggtccgtccggccaagtagtagtgtcgtgt 930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 417 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 6168 - 6118
Alignment:
Q  417 tatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttc 467  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6168 tatgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagaggttgagaggattttc 6118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6445 - 6397
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  6445 caattgatatcagagcaggttggtccgtccggccatgtagtagagtcgt 6397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 3968 - 3886
Alignment:
Q  369 atgttggagactttcatgaagaagaaccctcccactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaaga 451  Q
    ||||| |||||||| |||| |||  | || || |||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  3968 atgttagagacttttatgaggaatcatccacctactttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaaga 3886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 5221 - 5271
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  5221 caatttgtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagatgagtcgtgt 5271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 800 - 850
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||    
T  800 caattggtatcagagcaggttggtccgtacggcaaagtagtagagtcgtgt 850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30781 - 30731
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  30781 caattggtattagagcaggttggtccgtctggccaagtagcagagtcgtgt 30731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 194
Target Start/End: Original strand, 16835 - 16881
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||    
T  16835 caattggtatcagagcaggttggtccgtccagccaagtagtagagtc 16881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Original strand, 17168 - 17198
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17168 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 17198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16686 - 16656
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16686 caattggtatcagagcaggttggtccgtccg 16656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23392 - 23342
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||    
T  23392 caattggtatcagagcaggttggttcgtccggccgagtagtagagtcgtgt 23342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1336
Description:

Target: scaffold1336; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 177
Target Start/End: Original strand, 1622 - 1651
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtcc 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1622 caattggtatcagagcaggttggtccgtcc 1651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 699
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtcc 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  728 caattggtatcagagcaggttggtccgtcc 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37938 - 37865
Alignment:
Q  405 ttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgagaggattttccgtgttatgca 478  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||  |||| ||||||||| | ||||||||    
T  37938 ttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagaagtggcttaaggaagttgaaaggattttcagggttatgca 37865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1256
Description:

Target: scaffold1256; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Original strand, 1332 - 1380
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||||||    
T  1332 caattggtatcagagcaggtcgatccgtccggtcaagtagttgagtcgt 1380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0947 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0947
Description:

Target: scaffold0947; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Original strand, 582 - 630
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||    
T  582 caattggtatcagagcaggttggttcgtccggctaagtagtagagtcgt 630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13053 - 13005
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  13053 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 13005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4659 - 4604
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||    
T  4659 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtag-tgagtcgtgttgagtc 4604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14766 - 14718
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  14766 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 14718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 28816 - 28871
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgtcgagtc 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||    
T  28816 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtag-tgagtcgtgttgagtc 28871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18493 - 18449
Alignment:
Q  154 gtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  18493 gtatcagagcaggttggtccgtccggccaagtattagagtcgtgt 18449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Original strand, 20650 - 20698
Alignment:
Q  148 caattggtatcagagcaggttggtccgtccggtcaattagaagagtcgt 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  20650 caattggtatcagagcaggtcggtccgtccggccaagtagttgagtcgt 20698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 9153 times since January 2019
Visitors: 7893