View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0304_low_21 (Length: 224)

Name: NF0304_low_21
Description: NF0304
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0304_low_21
NF0304_low_21
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-120)||(31378-31497)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-120)||(41347-41466)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (1-120)||(35015255-35015374)
chr6 (1-100)||(23994981-23995080)
chr6 (1-98)||(18583377-18583474)
chr6 (1-100)||(18002594-18002693)
chr6 (1-100)||(26089793-26089892)
chr6 (1-100)||(15742318-15742417)
chr6 (1-120)||(19983390-19983508)
chr6 (29-119)||(25744331-25744421)
chr6 (24-119)||(22440973-22441068)
chr6 (24-119)||(32898829-32898924)
chr6 (24-119)||(13014822-13014917)
chr6 (24-119)||(31628307-31628402)
chr6 (24-100)||(18777204-18777280)
chr6 (24-84)||(18570353-18570413)
chr6 (24-119)||(18432682-18432777)
chr6 (24-119)||(16106555-16106650)
chr6 (24-119)||(16086056-16086151)
chr6 (5-69)||(15005008-15005072)
chr6 (5-68)||(15889808-15889871)
chr6 (5-68)||(22585648-22585711)
chr6 (5-68)||(22590479-22590542)
chr6 (31-120)||(18381803-18381892)
chr6 (31-119)||(18398977-18399065)
chr6 (21-120)||(22361874-22361974)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (1-120)||(30152980-30153099)
chr3 (1-119)||(54685399-54685517)
chr3 (1-120)||(17956082-17956201)
chr3 (1-119)||(33341920-33342038)
chr3 (1-119)||(45581670-45581788)
chr3 (1-119)||(54038222-54038340)
chr3 (1-119)||(7854021-7854139)
chr3 (1-100)||(53771099-53771198)
chr3 (3-100)||(16261511-16261608)
chr3 (3-100)||(3992608-3992705)
chr3 (1-100)||(2844249-2844348)
chr3 (24-119)||(16996172-16996267)
chr3 (1-100)||(23492431-23492530)
chr3 (24-119)||(317621-317716)
chr3 (24-119)||(19570801-19570896)
chr3 (24-119)||(50112164-50112259)
chr3 (24-119)||(12349843-12349938)
chr3 (1-100)||(38167972-38168071)
chr3 (24-119)||(6154444-6154539)
chr3 (24-119)||(22144385-22144480)
chr3 (24-119)||(13817554-13817646)
chr3 (24-116)||(6146859-6146951)
chr3 (31-119)||(16182065-16182153)
chr3 (1-58)||(28558271-28558328)
chr3 (24-119)||(12349652-12349747)
chr3 (24-119)||(35123735-35123830)
chr3 (24-100)||(17100711-17100787)
chr3 (24-100)||(17101396-17101472)
chr3 (24-100)||(19260952-19261028)
chr3 (24-119)||(53898568-53898663)
chr3 (19-81)||(34439451-34439513)
chr3 (24-94)||(54424076-54424146)
chr3 (24-119)||(17523002-17523098)
chr3 (24-119)||(14298460-14298555)
chr3 (24-119)||(14304087-14304182)
chr3 (37-98)||(12560362-12560423)
chr3 (31-119)||(11329081-11329169)
chr3 (24-119)||(14295477-14295573)
chr3 (24-119)||(14301104-14301200)
chr3 (24-119)||(17139547-17139643)
chr3 (21-119)||(12488835-12488934)
chr3 (24-117)||(14528124-14528218)
chr3 (5-45)||(18970034-18970074)
chr3 (4-45)||(39656453-39656494)
chr3 (58-119)||(55440996-55441057)
chr3 (24-116)||(17938616-17938708)
chr3 (5-45)||(48421690-48421730)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (1-119)||(41506907-41507025)
chr8 (1-120)||(24716960-24717079)
chr8 (1-119)||(39115314-39115432)
chr8 (1-100)||(16038979-16039078)
chr8 (24-119)||(22234916-22235011)
chr8 (1-100)||(274501-274600)
chr8 (1-100)||(641249-641348)
chr8 (1-100)||(827055-827154)
chr8 (24-119)||(19993167-19993262)
chr8 (24-119)||(41246697-41246792)
chr8 (24-119)||(37611707-37611802)
chr8 (24-117)||(20481646-20481739)
chr8 (1-65)||(24385850-24385914)
chr8 (24-119)||(20573305-20573400)
chr8 (20-117)||(20647938-20648035)
chr8 (24-117)||(20654018-20654111)
chr8 (1-44)||(22321544-22321587)
chr8 (20-84)||(20561740-20561804)
chr8 (24-116)||(39446878-39446971)
chr8 (24-94)||(21681066-21681137)
chr8 (76-119)||(25122575-25122618)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (1-119)||(2031849-2031967)
chr5 (1-120)||(11342722-11342842)
chr5 (1-100)||(21204984-21205083)
chr5 (1-100)||(21650753-21650852)
chr5 (24-119)||(28261560-28261655)
chr5 (24-119)||(11584090-11584188)
chr5 (24-119)||(4865302-4865397)
chr5 (24-119)||(21646852-21646947)
chr5 (24-119)||(21397128-21397226)
chr5 (24-119)||(1168317-1168412)
chr5 (24-119)||(24475622-24475712)
chr5 (24-117)||(20712117-20712210)
chr5 (24-119)||(11337299-11337394)
chr5 (24-119)||(21906759-21906851)
chr5 (24-98)||(24183245-24183319)
chr5 (31-98)||(3673922-3673989)
chr5 (31-119)||(7728459-7728547)
chr5 (37-120)||(23493957-23494040)
chr5 (24-84)||(19405611-19405672)
chr5 (58-119)||(23466496-23466557)
chr5 (21-120)||(5450952-5451052)
chr5 (20-84)||(22053957-22054021)
chr5 (5-45)||(25004929-25004969)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (1-120)||(6181-6300)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (1-120)||(126453-126572)
chr7 (1-119)||(111367-111485)
chr7 (1-119)||(32494144-32494262)
chr7 (1-110)||(42056387-42056496)
chr7 (1-100)||(2190284-2190383)
chr7 (28-119)||(39046740-39046831)
chr7 (3-100)||(2028979-2029076)
chr7 (1-100)||(3049641-3049740)
chr7 (4-120)||(1937113-1937217)
chr7 (24-119)||(35094856-35094950)
chr7 (24-100)||(44865288-44865364)
chr7 (24-119)||(11287456-11287551)
chr7 (24-119)||(12759026-12759121)
chr7 (24-119)||(47289820-47289915)
chr7 (24-100)||(3895083-3895159)
chr7 (24-119)||(15822544-15822639)
chr7 (24-94)||(143703-143773)
chr7 (24-116)||(7284173-7284265)
chr7 (24-119)||(26070377-26070472)
chr7 (24-119)||(26094164-26094259)
chr7 (24-98)||(12369953-12370027)
chr7 (24-120)||(13274825-13274922)
chr7 (50-119)||(45452305-45452374)
chr7 (24-119)||(12248233-12248329)
chr7 (24-114)||(13863042-13863133)
chr7 (24-98)||(16570118-16570193)
chr7 (24-98)||(16595469-16595544)
chr7 (5-42)||(39291611-39291648)
chr7 (24-119)||(49047786-49047882)
chr7 (50-120)||(13377567-13377637)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (1-120)||(14951800-14951919)
chr4 (1-116)||(25119305-25119420)
chr4 (1-120)||(5682625-5682744)
chr4 (1-100)||(15272410-15272509)
chr4 (24-119)||(53704846-53704941)
chr4 (24-119)||(8872584-8872682)
chr4 (24-119)||(21959576-21959671)
chr4 (24-119)||(30457942-30458037)
chr4 (24-119)||(820029-820121)
chr4 (24-119)||(34395296-34395391)
chr4 (24-119)||(44055954-44056049)
chr4 (24-119)||(44346866-44346961)
chr4 (24-119)||(53907812-53907904)
chr4 (28-119)||(23270051-23270142)
chr4 (28-119)||(55376714-55376805)
chr4 (24-119)||(16732208-16732303)
chr4 (24-100)||(30232609-30232685)
chr4 (24-100)||(12837313-12837389)
chr4 (24-115)||(45458968-45459059)
chr4 (21-120)||(15044866-15044966)
chr4 (20-98)||(10104374-10104452)
chr4 (31-120)||(52265628-52265717)
chr4 (24-119)||(13809622-13809718)
chr4 (20-100)||(15675213-15675293)
chr4 (51-119)||(27961010-27961078)
chr4 (20-100)||(31115688-31115768)
chr4 (50-117)||(18494467-18494534)
chr4 (50-120)||(15109488-15109558)
chr4 (20-98)||(40885678-40885756)
chr4 (5-42)||(16225264-16225301)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (1-120)||(21860049-21860168)
chr1 (1-120)||(44035069-44035188)
chr1 (1-120)||(15861524-15861641)
chr1 (1-120)||(22367057-22367175)
chr1 (24-119)||(22403223-22403318)
chr1 (24-119)||(49967689-49967784)
chr1 (24-119)||(41212108-41212206)
chr1 (24-119)||(35522432-35522527)
chr1 (24-119)||(21718267-21718362)
chr1 (24-100)||(27329868-27329944)
chr1 (24-100)||(35054814-35054890)
chr1 (24-98)||(9784177-9784248)
chr1 (50-119)||(9784239-9784308)
chr1 (50-120)||(17608966-17609036)
chr1 (20-84)||(20445754-20445818)
chr1 (20-84)||(20531519-20531583)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (1-120)||(22274760-22274879)
chr2 (1-120)||(22283993-22284112)
chr2 (1-119)||(23836794-23836913)
chr2 (1-100)||(21274147-21274246)
chr2 (1-100)||(9652994-9653093)
chr2 (24-119)||(25876032-25876127)
chr2 (24-119)||(32465897-32465992)
chr2 (28-119)||(6879476-6879567)
chr2 (24-119)||(271209-271304)
chr2 (24-119)||(28974088-28974183)
chr2 (24-119)||(36890798-36890893)
chr2 (24-119)||(4448246-4448341)
chr2 (24-119)||(25602063-25602158)
chr2 (24-119)||(24571404-24571500)
chr2 (20-100)||(24341513-24341593)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (1-119)||(12618-12736)
scaffold0039 (51-119)||(19049-19117)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (1-119)||(79903-80021)
scaffold0034 (24-120)||(46203-46299)
scaffold0034 (24-120)||(40696-40792)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (5-120)||(162280-162396)
scaffold0016 (5-97)||(166366-166458)
scaffold0016 (24-117)||(164256-164349)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-120)||(549-668)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (1-100)||(1076-1175)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (1-100)||(13484-13583)
scaffold0251 (1-100)||(21458-21557)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (1-100)||(17502-17601)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-119)||(30130-30251)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (3-100)||(55639-55736)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (1-119)||(32242-32360)
scaffold0091 (1-119)||(41943-42061)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (1-100)||(6641-6740)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (1-100)||(9605-9704)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-100)||(15007-15106)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-100)||(186624-186722)
scaffold0004 (1-100)||(193586-193684)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (24-119)||(132363-132458)
scaffold0021 (24-100)||(88333-88409)
scaffold0021 (25-119)||(11726-11821)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (24-119)||(70735-70830)
scaffold0001 (31-119)||(60845-60933)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (24-119)||(14916-15008)
scaffold0083 (87-119)||(14256-14288)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (24-119)||(6958-7056)
scaffold0673 (24-119)||(935-1030)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (24-100)||(15584-15660)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (24-119)||(5359-5454)
scaffold0480 (24-119)||(8994-9090)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (24-119)||(38337-38432)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (15-98)||(95035-95118)
scaffold0037 (24-100)||(24841-24917)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (24-119)||(22730-22825)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (24-119)||(11821-11916)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (1-100)||(126-225)
scaffold0303 (1-49)||(4545-4593)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (24-119)||(7608-7703)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (24-119)||(254927-255022)
scaffold0011 (24-119)||(261533-261628)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (24-119)||(85371-85466)
scaffold0014 (20-98)||(159359-159438)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (24-119)||(253102-253197)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (24-119)||(11767-11859)
scaffold0359 (24-119)||(1356-1451)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (24-100)||(146659-146735)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (24-119)||(183-278)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (24-119)||(689-784)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (24-119)||(9976-10071)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (31-100)||(10094-10163)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (19-119)||(48186-48286)
scaffold0068 (19-119)||(61634-61734)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (31-119)||(109582-109670)
scaffold0035 (24-119)||(118076-118171)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (24-119)||(631-726)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (24-119)||(21551-21646)
scaffold0120 (24-119)||(31250-31345)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (24-119)||(4980-5075)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (24-92)||(4351-4419)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (20-120)||(33700-33800)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (24-116)||(112658-112750)
scaffold0022 (50-119)||(109629-109698)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (24-119)||(9026-9121)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (24-119)||(60-155)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (24-119)||(24997-25092)
scaffold0158 (24-119)||(25250-25345)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (24-119)||(11681-11776)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (50-119)||(3338-3407)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (20-97)||(89578-89655)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (24-119)||(227-322)
scaffold0310 (24-94)||(6521-6591)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (24-95)||(70676-70748)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (24-116)||(33840-33933)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (24-119)||(1420-1515)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (5-45)||(219-259)


Alignment Details
Target: scaffold0184 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 31378 - 31497
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31378 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 31477  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
31478 tagtcatattgttgatgatg 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 41466 - 41347
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41466 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 41367  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
41366 tagtcatattgttgatgatg 41347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 35015255 - 35015374
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35015255 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 35015354  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
35015355 tagtcatattgttgatgatg 35015374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23995080 - 23994981
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
23995080 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 23994981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18583474 - 18583377
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
18583474 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttg 18583377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 18002594 - 18002693
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
18002594 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 18002693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26089892 - 26089793
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
26089892 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 26089793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 15742318 - 15742417
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
15742318 atgaaaatgggtaatttgtatattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 15742417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 19983390 - 19983508
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
19983390 atgaaaatgggtagttta-aaactatgctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgttgtt 19983488  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
19983489 tagtcatattgttgatgatg 19983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744421
Alignment:
29 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 25744421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22441068 - 22440973
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
22441068 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 22440973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 32898924 - 32898829
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
32898924 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 32898829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 13014822 - 13014917
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||| |||||||||||    
13014822 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatgttaagtcatgttgttgatgat 13014917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 31628402 - 31628307
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
31628402 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 31628307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 18777280 - 18777204
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
18777280 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgtt 18777204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18570413 - 18570353
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 84  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
18570413 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 18570353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18432777 - 18432682
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||| |  || || |||||||||||    
18432777 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgttatgttgttgatgat 18432682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16106650 - 16106555
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||    
16106650 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgat 16106555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16086151 - 16086056
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||    
16086151 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgat 16086056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 69
Target Start/End: Original strand, 15005008 - 15005072
Alignment:
5 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgata 69  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
15005008 aaatgggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaattatgacat-gttgttgttgaattgtgata 15005072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 15889808 - 15889871
Alignment:
5 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 68  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
15889808 aaatgggtagtttgtgaattatgttcaactgatgaattatgacat-gttgttgatgaattgtgat 15889871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 22585648 - 22585711
Alignment:
5 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 68  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
22585648 aaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgaagaattatgacat-gttgttgttgaattgtgat 22585711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 22590479 - 22590542
Alignment:
5 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattgtgat 68  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
22590479 aaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgaagaattatgacat-gttgttgttgaattgtgat 22590542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 120
Target Start/End: Original strand, 18381803 - 18381892
Alignment:
31 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |||||| |||||    
18381803 aattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatg 18381892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398977
Alignment:
31 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |||||||||||    
18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 18398977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 120
Target Start/End: Original strand, 22361874 - 22361974
Alignment:
21 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||    
22361874 aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 22361973  T
120 g 120  Q
    |    
22361974 g 22361974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 30153099 - 30152980
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30153099 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 30153000  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
30152999 tagtcatattgttgatgatg 30152980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 54685399 - 54685517
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
54685399 atgaaaatgggtagttggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 54685498  T
101 tagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
54685499 tagtcatatggttgatgat 54685517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 17956082 - 17956201
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17956082 atgaaaatgagtagtttgtaaattatactcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 17956181  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
17956182 tagtcatattgttgatgatg 17956201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 33342038 - 33341920
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33342038 atgaaaatgggtagttggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 33341939  T
101 tagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
33341938 tagtcatatggttgatgat 33341920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 45581788 - 45581670
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
45581788 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtt 45581689  T
101 tagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
45581688 tagtcatatggttgatgat 45581670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 54038222 - 54038340
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
54038222 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtt 54038321  T
101 tagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
54038322 tagtcatatagttgatgat 54038340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 7854139 - 7854021
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7854139 atgaaaatggataattggtaaattatgttcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 7854040  T
101 tagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
7854039 tagtcatatggttgatgat 7854021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 53771198 - 53771099
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
53771198 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 53771099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16261608 - 16261511
Alignment:
3 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
16261608 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 16261511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 3992705 - 3992608
Alignment:
3 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
3992705 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 3992608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 2844348 - 2844249
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
2844348 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 2844249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 16996172 - 16996267
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
16996172 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 16996267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23492530 - 23492431
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
23492530 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 23492431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 317621 - 317716
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
317621 tatgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 317716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 19570801 - 19570896
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
19570801 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 19570896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 50112164 - 50112259
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
50112164 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 50112259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 12349843 - 12349938
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
12349843 tatgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 12349938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 38168071 - 38167972
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
38168071 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 38167972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 6154444 - 6154539
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
6154444 tatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaagtcatgttgttgatgat 6154539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 22144385 - 22144480
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
22144385 tatgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagccatgttgttgatgat 22144480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13817646 - 13817554
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
13817646 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgt---tgtttagtcatgttgttgatgat 13817554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 116
Target Start/End: Original strand, 6146859 - 6146951
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgat 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||    
6146859 tatgctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgttgat 6146951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Original strand, 16182065 - 16182153
Alignment:
31 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
16182065 aattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgttttttagtcatgttgttgatgat 16182153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 28558328 - 28558271
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28558328 atgaaaatgggtagtttgtaaatgatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 28558271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 12349652 - 12349747
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||| ||||||    
12349652 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgtagatgat 12349747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 35123830 - 35123735
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
35123830 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 35123735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17100787 - 17100711
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||    
17100787 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgtt 17100711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17101472 - 17101396
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||    
17101472 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgtt 17101396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 19260952 - 19261028
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
19260952 tatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 19261028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 53898568 - 53898663
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||| |||||| ||||    
53898568 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgttgatatgtcatgttgttggtgat 53898663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Original strand, 34439451 - 34439513
Alignment:
19 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatc 81  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
34439451 taaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 54424146 - 54424076
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
54424146 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 54424076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 17523002 - 17523098
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtc-atattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | |||| || |||||||||||    
17523002 tatgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgat 17523098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14298555 - 14298460
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |||||||||||    
14298555 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgat 14298460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14304182 - 14304087
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |||||||||||    
14304182 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgat 14304087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 98
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560423
Alignment:
37 tgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 98  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttg 12560423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Original strand, 11329081 - 11329169
Alignment:
31 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |||||||||||    
11329081 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 11329169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14295573 - 14295477
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |||||||||||    
14295573 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgat 14295477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14301200 - 14301104
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |||||||||||    
14301200 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgat 14301104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 17139643 - 17139547
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |||||||||||    
17139643 tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 17139547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Original strand, 12488835 - 12488934
Alignment:
21 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |||||||||||    
12488835 aattatgctcaaattgatgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 12488934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Original strand, 14528124 - 14528218
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 117  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |||||||||    
14528124 tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatg 14528218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 18970074 - 18970034
Alignment:
5 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 45  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
18970074 aaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaattatg 18970034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 39656494 - 39656453
Alignment:
4 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 45  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
39656494 aaaatgggtagtttgtgaattatattcaattggtgaattatg 39656453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 119
Target Start/End: Original strand, 55440996 - 55441057
Alignment:
58 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || | ||| || |||||||||||    
55440996 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgat 55441057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 17938708 - 17938616
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgat 116  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||| || |||||| |   ||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
17938708 tatgcttaattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgat 17938616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 48421730 - 48421690
Alignment:
5 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 45  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
48421730 aaatgggtagtttgagaattatgttcaattggtgaattatg 48421690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 41506907 - 41507025
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41506907 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 41507006  T
101 tagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
41507007 tagtcatattgttgatgat 41507025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 24716960 - 24717079
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
24716960 atgaaaatggatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtt 24717059  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
24717060 tagtcatattgttgatgatg 24717079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 39115432 - 39115314
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39115432 atgaaaatgggtaatttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 39115333  T
101 tagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
39115332 tagtcatatggttgatgat 39115314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 16038979 - 16039078
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
16038979 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 16039078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 22234916 - 22235011
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
22234916 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 22235011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 274600 - 274501
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
274600 atgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgtt 274501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 641249 - 641348
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
641249 atgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgtt 641348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 827055 - 827154
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
827055 atgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgtt 827154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 19993167 - 19993262
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
19993167 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 19993262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 41246792 - 41246697
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
41246792 tatgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 41246697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 37611802 - 37611707
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
37611802 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgat 37611707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20481739 - 20481646
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||    
20481739 tatgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatg 20481646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 24385850 - 24385914
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgt 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
24385850 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaattgt 24385914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 20573305 - 20573400
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
20573305 tatgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 20573400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Original strand, 20647938 - 20648035
Alignment:
20 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 117  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |||||||||    
20647938 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatg 20648035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Original strand, 20654018 - 20654111
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |||||||||    
20654018 tatgcttaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatg 20654111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 22321544 - 22321587
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22321544 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 22321587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Original strand, 20561740 - 20561804
Alignment:
20 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 84  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
20561740 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20561804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 116
Target Start/End: Original strand, 39446878 - 39446971
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgat 116  Q
    |||||| ||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||||||    
39446878 tatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgat 39446971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21681137 - 21681066
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaa-ttatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 94  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||    
21681137 tatgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgtt 21681066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25122618 - 25122575
Alignment:
76 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
25122618 atgatcaatagatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 25122575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 2031967 - 2031849
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2031967 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 2031868  T
101 tagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||    
2031867 tagtcatattgttgatgat 2031849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11342842 - 11342722
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
11342842 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgt 11342743  T
100 ttagtcatattgttgatgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||    
11342742 ttagtcatattgttgatgatg 11342722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21205083 - 21204984
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
21205083 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgtt 21204984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21650852 - 21650753
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
21650852 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 21650753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 28261655 - 28261560
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
28261655 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgctgatgat 28261560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11584188 - 11584090
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgc---atggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
11584188 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgat 11584090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 4865397 - 4865302
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||    
4865397 tatgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgttgatgat 4865302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 21646852 - 21646947
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
21646852 tatgttcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgttgtttagtcatgatgttgatgat 21646947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 21397226 - 21397128
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttg---ttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| |||||||||||    
21397226 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttgttaagtcatgttgttgatgat 21397128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 1168317 - 1168412
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
1168317 tatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 1168412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 24475712 - 24475622
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
24475712 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgtttcatgatcaa---ttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 24475622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20712210 - 20712117
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||    
20712210 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatg 20712117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 11337299 - 11337394
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| | |||||||||    
11337299 tatgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgat 11337394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 21906851 - 21906759
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
21906851 tatgttcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgatgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 21906759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 98
Target Start/End: Original strand, 24183245 - 24183319
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | || ||||||||    
24183245 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttg 24183319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3673989 - 3673922
Alignment:
31 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 98  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
3673989 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 3673922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 7728547 - 7728459
Alignment:
31 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |||||||||||    
7728547 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 7728459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493957
Alignment:
37 tgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || ||||||||||||    
23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatg 23493957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 19405672 - 19405611
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 84  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
19405672 tatgctcaattagttgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 19405611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23466557 - 23466496
Alignment:
58 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| ||  ||||||||||    
23466557 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgat 23466496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 120
Target Start/End: Original strand, 5450952 - 5451052
Alignment:
21 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||   |||||| ||||  | ||||||||||| | ||| || |||||||||||    
5450952 aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataaaattcatgttcaactgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 5451051  T
120 g 120  Q
    |    
5451052 g 5451052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Original strand, 22053957 - 22054021
Alignment:
20 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 84  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||    
22053957 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaat 22054021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 25004969 - 25004929
Alignment:
5 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 45  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
25004969 aaatgggtagtttgagaattatgctcaattggtgatttatg 25004929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 6181 - 6300
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6181 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 6280  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    |||| |||||||||||||||    
6281 tagtaatattgttgatgatg 6300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 126572 - 126453
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
126572 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 126473  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    |||||||| |||||||||||    
126472 tagtcatactgttgatgatg 126453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 111367 - 111485
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
111367 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 111466  T
101 tagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
111467 tagtcatatggttgatgat 111485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 32494144 - 32494262
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
32494144 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtt 32494243  T
101 tagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||  ||||||||    
32494244 tagtcatatgattgatgat 32494262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 42056387 - 42056496
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
42056387 atgaaaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 42056486  T
101 tagtcatatt 110  Q
     ||| |||||    
42056487 aagtgatatt 42056496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 2190284 - 2190383
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
2190284 atgaaaatggatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgtt 2190383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 119
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046831
Alignment:
28 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 39046831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 2029076 - 2028979
Alignment:
3 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||    
2029076 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtcgttgtt 2028979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 3049740 - 3049641
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
3049740 atgaatatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 3049641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 1937113 - 1937217
Alignment:
4 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||||||||||||||||| |||||||    
1937113 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgtatggttgttgatgaatt------------atgatcaatggttgttgttgatgtttag 1937200  T
104 tcatattgttgatgatg 120  Q
    |||||||||||||||||    
1937201 tcatattgttgatgatg 1937217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 35094950 - 35094856
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
35094950 tatgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaat-gttgctgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 35094856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 44865364 - 44865288
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
44865364 tatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgttgtt 44865288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11287551 - 11287456
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
11287551 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 11287456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12759121 - 12759026
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
12759121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgat 12759026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 47289915 - 47289820
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||    
47289915 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctgttaagtcatgttgatgatgat 47289820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 3895159 - 3895083
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
3895159 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 3895083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 15822544 - 15822639
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
15822544 tatgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 15822639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 143773 - 143703
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
143773 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgtt 143703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 116
Target Start/End: Original strand, 7284173 - 7284265
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgat 116  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
7284173 tatgcttaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgat 7284265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 26070377 - 26070472
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |||| ||||||    
26070377 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgat 26070472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 26094164 - 26094259
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |||| ||||||    
26094164 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgat 26094259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 98
Target Start/End: Original strand, 12369953 - 12370027
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||    
12369953 tatgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttg 12370027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13274922 - 13274825
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatg 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||||||||||    
13274922 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatg 13274825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 119
Target Start/End: Original strand, 45452305 - 45452374
Alignment:
50 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |  ||||| |||||||||||    
45452305 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 45452374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 12248233 - 12248329
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |||| ||||||    
12248233 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgat 12248329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 114
Target Start/End: Original strand, 13863042 - 13863133
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttg 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||    
13863042 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgttgttgctaagtgatattgttg 13863133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 98
Target Start/End: Original strand, 16570118 - 16570193
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||    
16570118 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 16570193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16595544 - 16595469
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||    
16595544 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 16595469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 42
Target Start/End: Original strand, 39291611 - 39291648
Alignment:
5 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 42  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
39291611 aaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaatt 39291648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 49047786 - 49047882
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |||||| ||||    
49047786 tatgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgat 49047882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13377637 - 13377567
Alignment:
50 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || ||||||||||||    
13377637 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatg 13377567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14951919 - 14951800
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
14951919 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttatt 14951820  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
14951819 tagtcatattgttgatgatg 14951800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 25119305 - 25119420
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25119305 atgaaaatggatagtttgtaaattatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 25119404  T
101 tagtcatattgttgat 116  Q
    ||||||||||||||||    
25119405 tagtcatattgttgat 25119420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 5682625 - 5682744
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
5682625 atgaaattgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattattggttgttgttgttttt 5682724  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    || |||||||||||||||||    
5682725 tattcatattgttgatgatg 5682744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 15272410 - 15272509
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
15272410 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgtt 15272509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 53704846 - 53704941
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
53704846 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 53704941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 8872584 - 8872682
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
8872584 tatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 8872682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 21959576 - 21959671
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
21959576 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 21959671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 30458037 - 30457942
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
30458037 tatgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgat 30457942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 820029 - 820121
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
820029 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 820121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 34395391 - 34395296
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
34395391 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 34395296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 44056049 - 44055954
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
44056049 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgttgatgat 44055954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 44346961 - 44346866
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||||||    
44346961 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtgatgtcgttgatgat 44346866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 53907812 - 53907904
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
53907812 tatgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaa---ttgttgttgttgattagtcatgttgttgatgat 53907904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 119
Target Start/End: Original strand, 23270051 - 23270142
Alignment:
28 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
23270051 ctcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 23270142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 119
Target Start/End: Original strand, 55376714 - 55376805
Alignment:
28 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | || |||||||||||    
55376714 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaaattatgttgttgatgat 55376805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16732303 - 16732208
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||| |||||||||||    
16732303 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 16732208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 30232609 - 30232685
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
30232609 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgtt 30232685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 12837313 - 12837389
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
12837313 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgtt 12837389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 115
Target Start/End: Original strand, 45458968 - 45459059
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttga 115  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||    
45458968 tatgttcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttga 45459059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15044966 - 15044866
Alignment:
21 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |||||||||||    
15044966 aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 15044867  T
120 g 120  Q
    |    
15044866 g 15044866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 10104374 - 10104452
Alignment:
20 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
10104374 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttg 10104452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 120
Target Start/End: Original strand, 52265628 - 52265717
Alignment:
31 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| |||||| || |||||    
52265628 aattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatg 52265717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 13809622 - 13809718
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | | | || |||||||||||    
13809622 tatgctcaattagttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgat 13809718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Original strand, 15675213 - 15675293
Alignment:
20 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||    
15675213 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgtt 15675293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27961078 - 27961010
Alignment:
51 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |||||||||||    
27961078 ttgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgat 27961010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 31115768 - 31115688
Alignment:
20 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||    
31115768 aaattatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgtt 31115688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 117
Target Start/End: Original strand, 18494467 - 18494534
Alignment:
50 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 117  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||    
18494467 gttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgatgttgttgatg 18494534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Original strand, 15109488 - 15109558
Alignment:
50 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || ||||||||||||    
15109488 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatg 15109558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 40885678 - 40885756
Alignment:
20 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||   ||| ||| ||||||| |||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
40885678 aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttg 40885756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 42
Target Start/End: Original strand, 16225264 - 16225301
Alignment:
5 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 42  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
16225264 aaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaatt 16225301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21860168 - 21860049
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
21860168 atgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtt 21860069  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
21860068 tagtcatattgttgatgatg 21860049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 44035069 - 44035188
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44035069 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 44035168  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||| ||||||||||    
44035169 tagtcatatagttgatgatg 44035188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 15861524 - 15861641
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
15861524 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgt--ttgtt 15861621  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
15861622 tagtcatattgttgatgatg 15861641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22367175 - 22367057
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22367175 atgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaat-atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 22367077  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
22367076 tagtcatattgttgatgatg 22367057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 22403223 - 22403318
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
22403223 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 22403318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 49967784 - 49967689
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
49967784 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 49967689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 41212206 - 41212108
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt---tgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
41212206 tatgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 41212108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522527
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgat 35522527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 21718362 - 21718267
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
21718362 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 21718267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 27329868 - 27329944
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
27329868 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgtt 27329944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 35054890 - 35054814
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
35054890 tatgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgtt 35054814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 98
Target Start/End: Original strand, 9784177 - 9784248
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 98  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
9784177 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 9784248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 119
Target Start/End: Original strand, 9784239 - 9784308
Alignment:
50 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
9784239 gttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 9784308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17609036 - 17608966
Alignment:
50 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
17609036 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatg 17608966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20445818 - 20445754
Alignment:
20 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 84  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||    
20445818 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaat 20445754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20531583 - 20531519
Alignment:
20 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 84  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||    
20531583 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaat 20531519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22274879 - 22274760
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
22274879 atgaaaatgggttgtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtt 22274780  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
22274779 tagtcatattgttgatgatg 22274760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22284112 - 22283993
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
22284112 atgaaaatgaatagttagtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttgatgtt 22284013  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    ||||| ||||||||||||||    
22284012 tagtcttattgttgatgatg 22283993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 23836794 - 23836913
Alignment:
1 atgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgt 99  Q
    ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
23836794 atgaaaatgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgt 23836893  T
100 ttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||| |||||||||||    
23836894 ttagtcattttgttgatgat 23836913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 21274147 - 21274246
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
21274147 atgaaaatgggtagtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 21274246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 9652994 - 9653093
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||    
9652994 atgaaaatgggtagtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttgatgttgtt 9653093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 25876032 - 25876127
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
25876032 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagtcatgttgttgatgat 25876127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 32465992 - 32465897
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
32465992 tatgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 32465897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6879567 - 6879476
Alignment:
28 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
6879567 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgttatttagtcatgttgttgatgat 6879476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 271304 - 271209
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
271304 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 271209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 28974183 - 28974088
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
28974183 tatgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 28974088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 36890798 - 36890893
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || |||| ||||||    
36890798 tatgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgat 36890893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 4448246 - 4448341
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
4448246 tatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 4448341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25602158 - 25602063
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||    
25602158 tatgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgat 25602063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 24571404 - 24571500
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||| ||| ||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |||||||||||    
24571404 tatgctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgat 24571500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Original strand, 24341513 - 24341593
Alignment:
20 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||    
24341513 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgtt 24341593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 12618 - 12736
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
12618 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtt 12717  T
101 tagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
12718 tagtcatatggttgatgat 12736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 119
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19117
Alignment:
51 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgat 19117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 80021 - 79903
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
80021 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtt 79922  T
101 tagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
79921 tagtcatatggttgatgat 79903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 46299 - 46203
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||| |||||    
46299 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatg 46203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 40792 - 40696
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||    
40792 tatgctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatg 40696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 162280 - 162396
Alignment:
5 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgtttag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
162280 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttag 162379  T
104 tcatattgttgatgatg 120  Q
    |||||||||||||||||    
162380 tcatattgttgatgatg 162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Original strand, 166366 - 166458
Alignment:
5 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
166366 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 166458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 164349 - 164256
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
164349 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatg 164256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 549 - 668
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
549 atgaaaatgaatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatt 648  T
101 tagtcatattgttgatgatg 120  Q
    || |||||||||||||||||    
649 tactcatattgttgatgatg 668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 1076 - 1175
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
1076 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 1175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 13484 - 13583
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
13484 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 13583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 21458 - 21557
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
21458 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 21557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 17502 - 17601
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
17502 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 17601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 30251 - 30130
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatta---tgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30251 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgttgtttgaaattgtatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 30152  T
98 gtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||    
30151 gtttagtcatattgttgatgat 30130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 55736 - 55639
Alignment:
3 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
55736 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 55639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 32360 - 32242
Alignment:
1 atgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgt 99  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
32360 atgaaaatgggtatgtttgaaaat-atgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgt 32262  T
100 ttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||| |||||||||||    
32261 ttagtcatgttgttgatgat 32242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 41943 - 42061
Alignment:
1 atgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgt 99  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
41943 atgaaaatgggtatgtttg-aaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgt 42041  T
100 ttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||| |||||||||||    
42042 ttagtcatgttgttgatgat 42061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 6641 - 6740
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||    
6641 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgtt 6740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 9605 - 9704
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
9605 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 9704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 15106 - 15007
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
15106 atgaaaatgtttattttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 15007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 186624 - 186722
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
186624 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 186722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 193586 - 193684
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
193586 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 193684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 132363 - 132458
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
132363 tatgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 132458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 88409 - 88333
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||    
88409 tatgatcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgtt 88333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11821 - 11726
Alignment:
25 atgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |  |||||||||||    
11821 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgat 11726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 70735 - 70830
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
70735 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 70830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 60933 - 60845
Alignment:
31 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
60933 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 60845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15008 - 14916
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
15008 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgt---tgtttagtcatgttgttgatgat 14916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14288 - 14256
Alignment:
87 ttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
14288 ttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 14256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 6958 - 7056
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
6958 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 7056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 935 - 1030
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
935 tatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 1030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 15584 - 15660
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
15584 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtt 15660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 5359 - 5454
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
5359 tatgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 5454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 8994 - 9090
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |||||||||||    
8994 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 9090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 38432 - 38337
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
38432 tatgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 38337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 95118 - 95035
Alignment:
15 tttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
95118 tttgtaaattatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttg 95035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 24841 - 24917
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
24841 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 24917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22825 - 22730
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
22825 tatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgttgatgat 22730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 11821 - 11916
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
11821 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 11916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 126 - 225
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
126 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatgatcaataaatgttgttgttgtt 225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4593
Alignment:
1 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatg 49  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4545 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatg 4593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 7703 - 7608
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
7703 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 7608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 254927 - 255022
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
254927 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 255022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 261533 - 261628
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
261533 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 261628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 85466 - 85371
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
85466 tatgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 85371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 159438 - 159359
Alignment:
20 aaattatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||| || |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
159438 aaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 159359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 253102 - 253197
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
253102 tatgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgat 253197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 11767 - 11859
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
11767 tatgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 11859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1451 - 1356
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
1451 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 1356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 146735 - 146659
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
146735 tatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 146659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 183
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
278 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 689 - 784
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
689 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 10071 - 9976
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
10071 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 9976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10163
Alignment:
31 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
10094 aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgtt 10163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 48286 - 48186
Alignment:
19 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
48286 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatga 48187  T
119 t 119  Q
    |    
48186 t 48186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 61734 - 61634
Alignment:
19 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatga 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
61734 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatga 61635  T
119 t 119  Q
    |    
61634 t 61634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109670
Alignment:
31 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 109670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 118076 - 118171
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
118076 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 118171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 631 - 726
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||||| |||||||||||    
631 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgttgttgatgat 726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 21646 - 21551
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
21646 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 21551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 31345 - 31250
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||| | |||||| |||||||||||    
31345 tatgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgat 31250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 5075 - 4980
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
5075 tatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 4980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4419 - 4351
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttg 92  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
4419 tatgttcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 33800 - 33700
Alignment:
20 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||    
33800 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 33701  T
120 g 120  Q
    |    
33700 g 33700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 116
Target Start/End: Original strand, 112658 - 112750
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgat 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||    
112658 tatgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtcatgttgttgat 112750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 109698 - 109629
Alignment:
50 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||| | | ||||||||||| | ||| || |||||||||||    
109698 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 109629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 9121 - 9026
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | | ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
9121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 9026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 60
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
155 tatgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgat 60  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25092 - 24997
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |||||||||||    
25092 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgat 24997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25345 - 25250
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |||||||||||    
25345 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgat 25250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 11681 - 11776
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
11681 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 11776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3338
Alignment:
50 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 3338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 97
Target Start/End: Original strand, 89578 - 89655
Alignment:
20 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 97  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
89578 aaattgtgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttgtt 89655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Original strand, 227 - 322
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||| |||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
227 tatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgat 322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 94
Target Start/End: Original strand, 6521 - 6591
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 94  Q
    |||||| |||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
6521 tatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgtt 6591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 70748 - 70676
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 95  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
70748 tatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 70676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 116
Target Start/End: Original strand, 33840 - 33933
Alignment:
24 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgat 116  Q
    |||||| ||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||||||    
33840 tatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgat 33933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1515 - 1420
Alignment:
24 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 119  Q
    |||||||||||| |||||||||    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||    
1515 tatgctcaattgttgaattatgttatgtgattgatgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgttgatgat 1420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 259 - 219
Alignment:
5 aaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 45  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
259 aaatgtgtagtttgtgaattatgctcaattgttgaattatg 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 17138 times since January 2019
Visitors: 3779