View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1311_high_11 (Length: 281)

Name: NF1311_high_11
Description: NF1311
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1311_high_11
NF1311_high_11
[»] chr5 (183 HSPs)
chr5 (1-273)||(20215695-20215966)
chr5 (1-266)||(40033323-40033588)
chr5 (9-273)||(40227953-40228217)
chr5 (1-266)||(1914732-1914998)
chr5 (2-273)||(23477665-23477933)
chr5 (3-266)||(36096219-36096480)
chr5 (3-266)||(36097676-36097937)
chr5 (3-266)||(13522514-13522775)
chr5 (3-266)||(20168634-20168895)
chr5 (36-266)||(23487875-23488102)
chr5 (3-266)||(35543695-35543957)
chr5 (3-236)||(13533271-13533502)
chr5 (3-266)||(20417501-20417758)
chr5 (3-266)||(32753351-32753608)
chr5 (3-266)||(106717-106974)
chr5 (19-273)||(32160053-32160307)
chr5 (3-266)||(20625363-20625621)
chr5 (3-266)||(21420168-21420425)
chr5 (59-273)||(25112456-25112670)
chr5 (59-273)||(25171547-25171761)
chr5 (45-273)||(11208588-11208817)
chr5 (154-266)||(13403701-13403813)
chr5 (47-266)||(7031604-7031819)
chr5 (70-266)||(17446169-17446358)
chr5 (20-266)||(43043093-43043334)
chr5 (70-266)||(20798293-20798483)
chr5 (47-266)||(27204389-27204604)
chr5 (70-266)||(34063219-34063408)
chr5 (47-266)||(40390954-40391169)
chr5 (47-266)||(40401616-40401831)
chr5 (47-266)||(5290023-5290239)
chr5 (47-266)||(5300594-5300810)
chr5 (70-266)||(23407043-23407233)
chr5 (70-266)||(36229336-36229526)
chr5 (47-266)||(1121350-1121565)
chr5 (47-266)||(9336552-9336767)
chr5 (47-266)||(9347139-9347354)
chr5 (20-266)||(10755089-10755329)
chr5 (47-266)||(16003339-16003554)
chr5 (47-266)||(22157703-22157917)
chr5 (47-266)||(23362708-23362923)
chr5 (47-266)||(27602866-27603081)
chr5 (47-266)||(36582005-36582220)
chr5 (47-266)||(36592560-36592775)
chr5 (47-266)||(39353085-39353300)
chr5 (47-266)||(39365078-39365293)
chr5 (47-253)||(1108592-1108795)
chr5 (70-253)||(17456785-17456962)
chr5 (91-266)||(34052558-34052726)
chr5 (70-266)||(23392998-23393188)
chr5 (47-266)||(30069351-30069567)
chr5 (70-266)||(42395581-42395771)
chr5 (52-266)||(21702578-21702787)
chr5 (47-266)||(6131388-6131603)
chr5 (70-266)||(8522438-8522629)
chr5 (47-266)||(15992777-15992992)
chr5 (47-266)||(22147120-22147334)
chr5 (47-266)||(23296874-23297091)
chr5 (47-266)||(23307442-23307659)
chr5 (47-266)||(23708039-23708256)
chr5 (47-266)||(27622215-27622430)
chr5 (47-266)||(30226942-30227159)
chr5 (47-266)||(30237469-30237686)
chr5 (47-266)||(33951246-33951463)
chr5 (47-266)||(34772507-34772722)
chr5 (47-266)||(34783452-34783667)
chr5 (20-266)||(37728674-37728915)
chr5 (20-266)||(37739990-37740231)
chr5 (47-266)||(40513435-40513652)
chr5 (47-266)||(42043381-42043598)
chr5 (47-266)||(42053956-42054173)
chr5 (70-266)||(22560034-22560224)
chr5 (70-266)||(36085058-36085248)
chr5 (64-266)||(37407245-37407440)
chr5 (72-266)||(6976406-6976596)
chr5 (72-266)||(6986896-6987086)
chr5 (20-266)||(14446423-14446664)
chr5 (20-266)||(14457035-14457276)
chr5 (47-266)||(14557463-14557680)
chr5 (47-266)||(14568100-14568317)
chr5 (47-266)||(17607656-17607872)
chr5 (47-266)||(17618271-17618487)
chr5 (72-266)||(22676714-22676904)
chr5 (72-266)||(22686605-22686795)
chr5 (47-266)||(23697381-23697598)
chr5 (47-266)||(31419260-31419475)
chr5 (47-266)||(31449151-31449366)
chr5 (47-266)||(31834080-31834299)
chr5 (47-266)||(31844558-31844777)
chr5 (47-266)||(35216103-35216319)
chr5 (47-266)||(35226687-35226903)
chr5 (72-266)||(39490423-39490613)
chr5 (72-266)||(39501613-39501803)
chr5 (70-266)||(19464568-19464759)
chr5 (70-266)||(20552412-20552603)
chr5 (70-266)||(43621366-43621557)
chr5 (52-182)||(21705418-21705543)
chr5 (70-266)||(24925610-24925802)
chr5 (70-266)||(24982891-24983083)
chr5 (47-266)||(9376909-9377125)
chr5 (47-266)||(14030641-14030857)
chr5 (47-266)||(14041194-14041410)
chr5 (47-266)||(15693479-15693695)
chr5 (47-266)||(15740565-15740781)
chr5 (47-266)||(15769725-15769941)
chr5 (47-266)||(17719514-17719730)
chr5 (47-266)||(17730166-17730382)
chr5 (73-266)||(20562922-20563110)
chr5 (47-266)||(24567686-24567902)
chr5 (47-266)||(24816333-24816549)
chr5 (47-266)||(24826921-24827137)
chr5 (47-266)||(27460758-27460974)
chr5 (47-266)||(27471157-27471373)
chr5 (70-266)||(19478598-19478789)
chr5 (47-266)||(24808509-24808725)
chr5 (88-266)||(27041702-27041875)
chr5 (88-266)||(27052326-27052499)
chr5 (88-266)||(31349130-31349303)
chr5 (88-266)||(31359744-31359917)
chr5 (47-266)||(36688291-36688507)
chr5 (47-266)||(36698857-36699073)
chr5 (43-141)||(7746404-7746502)
chr5 (55-145)||(26056193-26056282)
chr5 (65-141)||(21659563-21659640)
chr5 (70-244)||(28464950-28465118)
chr5 (70-244)||(10848128-10848297)
chr5 (79-157)||(13546216-13546293)
chr5 (55-244)||(30116449-30116632)
chr5 (89-141)||(31117254-31117306)
chr5 (65-238)||(4886314-4886482)
chr5 (55-141)||(9399326-9399413)
chr5 (1-59)||(13403639-13403698)
chr5 (55-141)||(22000737-22000824)
chr5 (55-135)||(6498653-6498735)
chr5 (45-141)||(17814295-17814392)
chr5 (55-136)||(26766550-26766632)
chr5 (79-136)||(90138-90195)
chr5 (76-141)||(25097536-25097601)
chr5 (76-141)||(25155506-25155571)
chr5 (213-266)||(32160277-32160330)
chr5 (65-136)||(35932720-35932793)
chr5 (213-273)||(12078360-12078420)
chr5 (34-141)||(23413684-23413790)
chr5 (77-141)||(31589651-31589715)
chr5 (79-141)||(26120531-26120593)
chr5 (65-141)||(28138955-28139033)
chr5 (213-266)||(11208565-11208618)
chr5 (89-141)||(11993265-11993318)
chr5 (225-266)||(23477915-23477956)
chr5 (76-141)||(23880428-23880493)
chr5 (225-266)||(25112433-25112474)
chr5 (225-266)||(25171524-25171565)
chr5 (76-141)||(26783716-26783781)
chr5 (225-266)||(40228199-40228240)
chr5 (55-141)||(6513140-6513228)
chr5 (225-265)||(20215673-20215713)
chr5 (90-141)||(643410-643461)
chr5 (89-132)||(21199719-21199762)
chr5 (65-205)||(3246091-3246227)
chr5 (92-141)||(26764883-26764933)
chr5 (65-141)||(29139112-29139190)
chr5 (65-141)||(33932619-33932697)
chr5 (77-141)||(13736782-13736847)
chr5 (79-136)||(20968613-20968670)
chr5 (68-125)||(26119272-26119329)
chr5 (65-136)||(30742333-30742406)
chr5 (225-273)||(16607020-16607068)
chr5 (55-141)||(31487578-31487666)
chr5 (90-141)||(33022040-33022092)
chr5 (72-141)||(15516329-15516400)
chr5 (90-141)||(19537007-19537058)
chr5 (79-141)||(21100412-21100475)
chr5 (45-136)||(9088300-9088394)
chr5 (76-141)||(12353504-12353570)
chr5 (65-205)||(35986883-35987019)
chr5 (205-262)||(17263226-17263283)
chr5 (225-266)||(20968750-20968791)
chr5 (213-266)||(22586540-22586593)
chr5 (99-135)||(16606901-16606937)
chr5 (225-273)||(20567315-20567363)
chr5 (71-123)||(22185435-22185487)
chr5 (93-136)||(23392318-23392362)
chr5 (213-265)||(39799434-39799486)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (11-273)||(61031-61294)
scaffold0010 (225-266)||(61276-61317)
[»] chr4 (161 HSPs)
chr4 (1-266)||(14711257-14711523)
chr4 (1-266)||(14778921-14779187)
chr4 (9-273)||(19241543-19241805)
chr4 (1-266)||(36210589-36210853)
chr4 (18-273)||(18007562-18007815)
chr4 (19-266)||(23508677-23508922)
chr4 (30-266)||(16819829-16820063)
chr4 (29-273)||(18775156-18775398)
chr4 (3-266)||(49002464-49002721)
chr4 (2-273)||(33377696-33377966)
chr4 (3-266)||(11514554-11514811)
chr4 (9-266)||(55650848-55651099)
chr4 (29-232)||(18775514-18775715)
chr4 (3-266)||(31267275-31267532)
chr4 (3-266)||(11535364-11535621)
chr4 (3-266)||(10300053-10300311)
chr4 (1-136)||(17994362-17994494)
chr4 (29-162)||(18775913-18776046)
chr4 (3-185)||(10290144-10290321)
chr4 (20-266)||(40454832-40455073)
chr4 (20-266)||(40471070-40471311)
chr4 (45-181)||(39532269-39532401)
chr4 (70-266)||(47152532-47152721)
chr4 (20-265)||(5022273-5022512)
chr4 (21-253)||(24712964-24713191)
chr4 (52-251)||(3370281-3370477)
chr4 (70-266)||(10695228-10695417)
chr4 (47-266)||(18763582-18763797)
chr4 (47-266)||(27815428-27815643)
chr4 (47-266)||(48370693-48370908)
chr4 (20-266)||(25656671-25656912)
chr4 (70-266)||(10908994-10909184)
chr4 (47-266)||(450138-450353)
chr4 (47-266)||(4947899-4948114)
chr4 (47-266)||(15561562-15561777)
chr4 (47-266)||(18752972-18753187)
chr4 (70-248)||(19143504-19143677)
chr4 (47-266)||(19955445-19955660)
chr4 (47-266)||(21995975-21996190)
chr4 (47-266)||(22006573-22006788)
chr4 (47-266)||(30926977-30927192)
chr4 (70-266)||(16304693-16304883)
chr4 (70-266)||(16316917-16317107)
chr4 (47-266)||(17917613-17917829)
chr4 (47-266)||(17928261-17928477)
chr4 (70-266)||(25008482-25008672)
chr4 (69-266)||(5872957-5873147)
chr4 (73-266)||(19580830-19581016)
chr4 (47-266)||(460719-460934)
chr4 (52-251)||(3390021-3390217)
chr4 (47-266)||(14844136-14844351)
chr4 (47-266)||(16255428-16255642)
chr4 (47-266)||(16266021-16266235)
chr4 (72-266)||(18078389-18078579)
chr4 (47-266)||(18130723-18130940)
chr4 (47-266)||(19944810-19945025)
chr4 (20-266)||(24639784-24640025)
chr4 (47-266)||(27656160-27656377)
chr4 (47-266)||(27666733-27666950)
chr4 (20-266)||(29042139-29042380)
chr4 (47-266)||(30937555-30937770)
chr4 (47-266)||(52703350-52703565)
chr4 (47-266)||(24028568-24028786)
chr4 (47-266)||(55745735-55745951)
chr4 (47-266)||(55756346-55756562)
chr4 (70-266)||(14836585-14836775)
chr4 (73-266)||(15207871-15208057)
chr4 (47-266)||(10741077-10741293)
chr4 (47-266)||(10954846-10955062)
chr4 (47-266)||(36017897-36018113)
chr4 (47-266)||(36028450-36028666)
chr4 (47-266)||(49517696-49517912)
chr4 (47-265)||(10751652-10751867)
chr4 (47-265)||(10965421-10965636)
chr4 (175-266)||(17994271-17994360)
chr4 (74-184)||(19570607-19570711)
chr4 (70-186)||(8183503-8183613)
chr4 (47-145)||(9920972-9921072)
chr4 (47-145)||(28050125-28050225)
chr4 (108-266)||(4986893-4987045)
chr4 (47-145)||(49509539-49509639)
chr4 (20-132)||(3188988-3189100)
chr4 (70-145)||(17199087-17199162)
chr4 (54-141)||(19889665-19889751)
chr4 (65-244)||(16939349-16939522)
chr4 (17-132)||(20649445-20649561)
chr4 (20-130)||(29030156-29030266)
chr4 (76-265)||(18473427-18473607)
chr4 (65-124)||(15475850-15475910)
chr4 (70-141)||(13693201-13693272)
chr4 (90-141)||(16476064-16476115)
chr4 (55-141)||(23749862-23749949)
chr4 (72-244)||(55731203-55731369)
chr4 (231-273)||(1671899-1671941)
chr4 (89-266)||(9752106-9752277)
chr4 (208-266)||(18775133-18775191)
chr4 (76-141)||(19884093-19884159)
chr4 (55-132)||(37986307-37986385)
chr4 (155-247)||(8997740-8997830)
chr4 (80-141)||(11900555-11900616)
chr4 (55-141)||(16852841-16852930)
chr4 (76-141)||(17788726-17788791)
chr4 (76-141)||(22089646-22089711)
chr4 (66-141)||(36470318-36470395)
chr4 (76-141)||(41115443-41115508)
chr4 (34-141)||(3394969-3395075)
chr4 (69-136)||(11915053-11915121)
chr4 (76-136)||(20571685-20571745)
chr4 (55-141)||(22676207-22676295)
chr4 (34-141)||(6516805-6516914)
chr4 (90-141)||(12600134-12600185)
chr4 (64-141)||(17701440-17701519)
chr4 (55-141)||(55379648-55379735)
chr4 (65-141)||(14154680-14154758)
chr4 (55-141)||(14903098-14903183)
chr4 (76-141)||(16631800-16631866)
chr4 (55-141)||(16847885-16847974)
chr4 (76-141)||(19665725-19665791)
chr4 (79-141)||(29681202-29681264)
chr4 (76-141)||(54679288-54679354)
chr4 (225-266)||(1671923-1671964)
chr4 (65-244)||(3106007-3106181)
chr4 (65-244)||(17399263-17399437)
chr4 (225-266)||(19241787-19241828)
chr4 (225-266)||(33377948-33377989)
chr4 (55-141)||(14605590-14605678)
chr4 (89-141)||(15015072-15015124)
chr4 (94-145)||(7221924-7221975)
chr4 (90-141)||(8686129-8686180)
chr4 (68-141)||(14190096-14190171)
chr4 (91-141)||(56033948-56033999)
chr4 (76-130)||(10661863-10661917)
chr4 (76-130)||(10876008-10876062)
chr4 (76-141)||(15135089-15135155)
chr4 (76-150)||(17527021-17527095)
chr4 (66-144)||(24619069-24619147)
chr4 (89-141)||(13576800-13576853)
chr4 (76-141)||(18773455-18773520)
chr4 (76-129)||(19912577-19912630)
chr4 (69-136)||(27189333-27189402)
chr4 (89-141)||(37436217-37436270)
chr4 (65-136)||(40860019-40860092)
chr4 (90-141)||(8103659-8103711)
chr4 (213-265)||(9266802-9266854)
chr4 (226-266)||(18007539-18007579)
chr4 (76-136)||(18393940-18394000)
chr4 (89-136)||(20976831-20976879)
chr4 (90-141)||(6641059-6641109)
chr4 (79-133)||(10072297-10072352)
chr4 (34-141)||(45832704-45832813)
chr4 (65-205)||(22190194-22190330)
chr4 (79-132)||(2651212-2651265)
chr4 (213-262)||(7222034-7222083)
chr4 (91-136)||(10249309-10249354)
chr4 (92-141)||(16325181-16325230)
chr4 (213-266)||(19889518-19889571)
chr4 (55-121)||(10328987-10329055)
chr4 (225-273)||(19912468-19912516)
chr4 (213-269)||(24619178-24619234)
chr4 (89-136)||(38513281-38513329)
chr4 (90-141)||(39420389-39420441)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-266)||(60543-60809)
scaffold0005 (55-141)||(211700-211788)
[»] chr6 (169 HSPs)
chr6 (1-273)||(19453109-19453381)
chr6 (1-273)||(7586744-7587014)
chr6 (1-273)||(21127523-21127792)
chr6 (3-273)||(11234944-11235211)
chr6 (3-266)||(18554745-18555006)
chr6 (3-266)||(11205421-11205681)
chr6 (2-273)||(17608894-17609162)
chr6 (3-266)||(31930898-31931159)
chr6 (4-266)||(12953590-12953849)
chr6 (3-266)||(25687238-25687498)
chr6 (2-273)||(20635013-20635283)
chr6 (1-266)||(25518132-25518394)
chr6 (2-273)||(22386096-22386366)
chr6 (18-266)||(17047049-17047295)
chr6 (1-187)||(21119101-21119286)
chr6 (3-266)||(18835121-18835378)
chr6 (3-236)||(9934131-9934359)
chr6 (3-266)||(17742193-17742451)
chr6 (3-266)||(22308238-22308496)
chr6 (17-265)||(17063692-17063935)
chr6 (45-266)||(18826726-18826942)
chr6 (3-266)||(17746272-17746530)
chr6 (3-266)||(31571865-31572123)
chr6 (3-266)||(27166930-27167187)
chr6 (3-204)||(22292343-22292538)
chr6 (19-273)||(14070660-14070915)
chr6 (3-173)||(25678860-25679028)
chr6 (62-266)||(29765045-29765244)
chr6 (70-266)||(26043730-26043920)
chr6 (72-260)||(5844605-5844788)
chr6 (64-266)||(32756912-32757106)
chr6 (47-266)||(3671540-3671755)
chr6 (47-266)||(9112983-9113198)
chr6 (47-266)||(9123620-9123835)
chr6 (70-266)||(20030392-20030582)
chr6 (47-266)||(3660876-3661091)
chr6 (47-266)||(27383926-27384142)
chr6 (47-266)||(27474310-27474526)
chr6 (47-266)||(27503808-27504024)
chr6 (47-266)||(28252050-28252265)
chr6 (47-266)||(28357197-28357412)
chr6 (47-266)||(32962422-32962637)
chr6 (20-266)||(27505409-27505650)
chr6 (70-266)||(20063143-20063333)
chr6 (70-249)||(10404043-10404217)
chr6 (70-253)||(12827210-12827388)
chr6 (47-266)||(12717324-12717541)
chr6 (47-266)||(12727973-12728190)
chr6 (47-266)||(12865040-12865255)
chr6 (19-273)||(14051979-14052224)
chr6 (64-266)||(16124024-16124220)
chr6 (47-266)||(17982989-17983206)
chr6 (47-266)||(17985198-17985415)
chr6 (70-266)||(18926252-18926441)
chr6 (70-266)||(25787220-25787409)
chr6 (47-266)||(25985573-25985790)
chr6 (47-266)||(34818280-34818497)
chr6 (143-266)||(19289841-19289962)
chr6 (20-266)||(27372299-27372540)
chr6 (20-266)||(27462649-27462890)
chr6 (47-266)||(34807648-34807866)
chr6 (47-266)||(7751723-7751940)
chr6 (47-266)||(32973041-32973257)
chr6 (47-266)||(31983114-31983330)
chr6 (47-250)||(12353076-12353277)
chr6 (49-236)||(11147708-11147890)
chr6 (3-100)||(19289957-19290055)
chr6 (47-266)||(4630363-4630579)
chr6 (47-266)||(12854514-12854729)
chr6 (47-266)||(16929943-16930159)
chr6 (47-266)||(16959114-16959330)
chr6 (47-266)||(26024951-26025167)
chr6 (47-266)||(26035525-26035741)
chr6 (47-266)||(26864278-26864494)
chr6 (47-266)||(26874902-26875118)
chr6 (47-266)||(27341186-27341402)
chr6 (47-266)||(27401926-27402142)
chr6 (47-266)||(27412585-27412801)
chr6 (47-266)||(29384244-29384460)
chr6 (47-266)||(32301531-32301747)
chr6 (47-266)||(32312220-32312436)
chr6 (70-266)||(7376246-7376437)
chr6 (47-266)||(33198820-33199036)
chr6 (20-145)||(1902202-1902327)
chr6 (57-269)||(14757727-14757930)
chr6 (70-185)||(25583430-25583539)
chr6 (70-145)||(30120496-30120571)
chr6 (76-141)||(3680479-3680544)
chr6 (47-145)||(12416959-12417059)
chr6 (76-145)||(15551392-15551461)
chr6 (34-141)||(25929807-25929909)
chr6 (47-145)||(27819068-27819168)
chr6 (47-136)||(12575773-12575864)
chr6 (47-136)||(18720206-18720297)
chr6 (79-150)||(15478455-15478525)
chr6 (65-205)||(19482106-19482242)
chr6 (55-136)||(19623323-19623405)
chr6 (76-141)||(20113355-20113420)
chr6 (65-244)||(33352849-33353022)
chr6 (55-157)||(21624435-21624538)
chr6 (76-136)||(29537978-29538038)
chr6 (65-237)||(12422618-12422784)
chr6 (54-141)||(24719451-24719537)
chr6 (79-141)||(14101156-14101218)
chr6 (79-141)||(17927161-17927223)
chr6 (4-122)||(27720820-27720937)
chr6 (79-136)||(12347461-12347518)
chr6 (76-141)||(13435251-13435316)
chr6 (45-141)||(15301550-15301646)
chr6 (89-141)||(17380956-17381009)
chr6 (76-141)||(29917393-29917458)
chr6 (69-150)||(30372715-30372796)
chr6 (89-141)||(24116206-24116258)
chr6 (55-273)||(25591966-25592180)
chr6 (79-141)||(16528679-16528742)
chr6 (79-141)||(18377811-18377874)
chr6 (90-244)||(19066639-19066787)
chr6 (76-157)||(9717209-9717290)
chr6 (65-141)||(15954052-15954130)
chr6 (225-266)||(7586721-7586762)
chr6 (225-266)||(11235193-11235234)
chr6 (77-141)||(12041218-12041283)
chr6 (213-266)||(14051956-14052009)
chr6 (213-266)||(14070637-14070690)
chr6 (65-141)||(17303990-17304067)
chr6 (225-266)||(17608871-17608912)
chr6 (89-141)||(19952287-19952340)
chr6 (225-266)||(20635265-20635306)
chr6 (225-266)||(21127774-21127815)
chr6 (89-141)||(21234538-21234591)
chr6 (225-266)||(22386348-22386389)
chr6 (78-132)||(7763020-7763075)
chr6 (82-145)||(7811381-7811444)
chr6 (79-141)||(10631503-10631566)
chr6 (90-141)||(15395340-15395391)
chr6 (90-141)||(19625190-19625241)
chr6 (82-141)||(21034403-21034462)
chr6 (76-141)||(13601532-13601598)
chr6 (91-141)||(18434919-18434969)
chr6 (65-133)||(21617600-21617670)
chr6 (45-141)||(25593403-25593500)
chr6 (69-141)||(26588956-26589030)
chr6 (89-141)||(12716140-12716193)
chr6 (76-132)||(14732844-14732901)
chr6 (225-266)||(19453086-19453127)
chr6 (55-141)||(20731421-20731509)
chr6 (213-266)||(23006571-23006624)
chr6 (213-266)||(23781742-23781795)
chr6 (77-145)||(18027396-18027464)
chr6 (79-141)||(15532342-15532405)
chr6 (90-141)||(18172939-18172990)
chr6 (90-141)||(18226811-18226862)
chr6 (90-133)||(19470047-19470090)
chr6 (66-144)||(24471074-24471153)
chr6 (54-120)||(31720295-31720359)
chr6 (79-129)||(32543634-32543685)
chr6 (76-133)||(15986719-15986777)
chr6 (90-132)||(24729246-24729288)
chr6 (65-136)||(17317216-17317289)
chr6 (76-141)||(17446367-17446431)
chr6 (213-266)||(18027284-18027337)
chr6 (80-141)||(23230594-23230655)
chr6 (76-141)||(23296152-23296217)
chr6 (76-141)||(32335208-32335273)
chr6 (206-266)||(14923777-14923837)
chr6 (70-141)||(14923893-14923964)
chr6 (225-265)||(17446221-17446261)
chr6 (226-266)||(24719304-24719344)
chr6 (225-265)||(32335379-32335419)
[»] chr3 (228 HSPs)
chr3 (1-273)||(41045032-41045304)
chr3 (9-273)||(31114461-31114723)
chr3 (2-273)||(22150537-22150807)
chr3 (1-266)||(17017320-17017584)
chr3 (1-273)||(51989620-51989890)
chr3 (1-273)||(17006484-17006755)
chr3 (18-266)||(10528679-10528929)
chr3 (1-266)||(29947824-29948085)
chr3 (1-266)||(29996978-29997239)
chr3 (2-273)||(49989552-49989822)
chr3 (3-266)||(13199724-13199984)
chr3 (2-273)||(15832699-15832969)
chr3 (1-266)||(29934038-29934299)
chr3 (1-266)||(29983192-29983453)
chr3 (2-266)||(13147583-13147849)
chr3 (3-266)||(2245860-2246122)
chr3 (9-273)||(15848440-15848703)
chr3 (35-273)||(13953587-13953824)
chr3 (10-236)||(21735672-21735896)
chr3 (10-266)||(1053215-1053466)
chr3 (3-266)||(15663214-15663474)
chr3 (3-266)||(17281912-17282168)
chr3 (68-265)||(27172426-27172622)
chr3 (38-266)||(37411961-37412190)
chr3 (3-266)||(15651579-15651839)
chr3 (3-266)||(1063637-1063895)
chr3 (3-261)||(8996439-8996691)
chr3 (45-273)||(12753220-12753449)
chr3 (2-266)||(45862164-45862432)
chr3 (55-273)||(11909639-11909857)
chr3 (3-266)||(16076427-16076686)
chr3 (19-273)||(51340289-51340542)
chr3 (1-266)||(29906659-29906919)
chr3 (3-261)||(9006991-9007243)
chr3 (3-266)||(8740603-8740859)
chr3 (47-261)||(27882926-27883135)
chr3 (3-236)||(14580637-14580865)
chr3 (70-273)||(4433328-4433524)
chr3 (20-266)||(9994370-9994610)
chr3 (20-266)||(12249916-12250156)
chr3 (70-273)||(4403841-4404037)
chr3 (20-266)||(23635226-23635467)
chr3 (20-266)||(12238090-12238330)
chr3 (70-253)||(19887843-19888021)
chr3 (72-266)||(6490826-6491014)
chr3 (72-266)||(6501480-6501668)
chr3 (47-266)||(9982362-9982577)
chr3 (64-266)||(13262150-13262346)
chr3 (47-266)||(29472542-29472757)
chr3 (70-266)||(1794961-1795151)
chr3 (64-266)||(11163392-11163587)
chr3 (64-266)||(14322169-14322364)
chr3 (70-266)||(48336809-48336999)
chr3 (48-266)||(39673360-39673573)
chr3 (47-266)||(4175234-4175449)
chr3 (47-266)||(5537498-5537713)
chr3 (47-266)||(5548082-5548297)
chr3 (47-266)||(6181005-6181220)
chr3 (47-266)||(6221179-6221394)
chr3 (47-266)||(10655741-10655956)
chr3 (47-266)||(13121205-13121420)
chr3 (47-266)||(13557117-13557332)
chr3 (47-266)||(14475764-14475979)
chr3 (45-236)||(17960943-17961133)
chr3 (47-266)||(23767437-23767652)
chr3 (47-266)||(24383996-24384213)
chr3 (70-262)||(24707036-24707223)
chr3 (47-266)||(37865988-37866203)
chr3 (47-266)||(37885121-37885336)
chr3 (70-266)||(933194-933385)
chr3 (70-266)||(17910482-17910673)
chr3 (70-266)||(9391681-9391871)
chr3 (70-266)||(11206551-11206741)
chr3 (70-266)||(11217202-11217392)
chr3 (70-266)||(19788590-19788780)
chr3 (47-266)||(23647291-23647507)
chr3 (47-266)||(5866173-5866390)
chr3 (47-266)||(5876772-5876989)
chr3 (20-266)||(8774174-8774415)
chr3 (47-266)||(11272861-11273078)
chr3 (47-266)||(13131447-13131662)
chr3 (20-266)||(18483561-18483802)
chr3 (47-266)||(20684256-20684470)
chr3 (47-266)||(20720654-20720871)
chr3 (47-266)||(23756841-23757056)
chr3 (20-266)||(28314710-28314951)
chr3 (20-266)||(28325324-28325565)
chr3 (47-266)||(29461690-29461905)
chr3 (20-266)||(38194241-38194482)
chr3 (20-266)||(39382207-39382448)
chr3 (70-266)||(7804995-7805186)
chr3 (90-253)||(14258555-14258712)
chr3 (70-266)||(1784548-1784738)
chr3 (72-266)||(5580111-5580301)
chr3 (20-266)||(8784788-8785030)
chr3 (88-266)||(9381135-9381307)
chr3 (47-266)||(10098610-10098826)
chr3 (72-266)||(12297279-12297469)
chr3 (91-251)||(18857426-18857580)
chr3 (88-266)||(19777971-19778143)
chr3 (70-266)||(38314262-38314451)
chr3 (20-266)||(39371570-39371811)
chr3 (70-247)||(13601801-13601973)
chr3 (69-266)||(28168677-28168869)
chr3 (70-185)||(19121399-19121508)
chr3 (20-266)||(38204776-38205018)
chr3 (47-266)||(504645-504861)
chr3 (47-266)||(527011-527227)
chr3 (47-266)||(4743280-4743496)
chr3 (47-266)||(4753867-4754083)
chr3 (47-266)||(5510238-5510454)
chr3 (47-266)||(5520416-5520632)
chr3 (72-266)||(12287457-12287647)
chr3 (47-266)||(13373143-13373360)
chr3 (47-266)||(13394331-13394548)
chr3 (47-266)||(24659442-24659658)
chr3 (47-266)||(24670022-24670238)
chr3 (47-266)||(35186919-35187135)
chr3 (47-266)||(37759212-37759427)
chr3 (47-266)||(41683220-41683436)
chr3 (47-266)||(41693789-41694005)
chr3 (70-266)||(7795084-7795275)
chr3 (70-266)||(9535176-9535367)
chr3 (70-266)||(15194516-15194707)
chr3 (70-266)||(10627419-10627609)
chr3 (47-266)||(20673671-20673886)
chr3 (72-266)||(5628495-5628684)
chr3 (47-185)||(11530340-11530474)
chr3 (47-266)||(13383737-13383954)
chr3 (47-266)||(16385617-16385833)
chr3 (76-145)||(22804747-22804816)
chr3 (47-185)||(33650743-33650877)
chr3 (70-145)||(13076460-13076535)
chr3 (153-266)||(16671639-16671752)
chr3 (43-141)||(2560518-2560616)
chr3 (70-145)||(7608864-7608939)
chr3 (79-141)||(20724456-20724518)
chr3 (197-266)||(18006010-18006079)
chr3 (47-145)||(35579015-35579115)
chr3 (213-273)||(51340512-51340572)
chr3 (55-136)||(26418410-26418492)
chr3 (76-141)||(3238057-3238122)
chr3 (197-266)||(14580858-14580927)
chr3 (76-141)||(23538892-23538957)
chr3 (76-145)||(27849590-27849659)
chr3 (225-273)||(15848715-15848763)
chr3 (76-136)||(17239656-17239716)
chr3 (57-132)||(29952174-29952250)
chr3 (57-132)||(30001328-30001404)
chr3 (55-141)||(6090070-6090157)
chr3 (65-141)||(50299588-50299666)
chr3 (213-266)||(12753197-12753250)
chr3 (45-141)||(13939230-13939326)
chr3 (213-266)||(13953794-13953847)
chr3 (45-141)||(20645488-20645584)
chr3 (55-244)||(2025432-2025615)
chr3 (76-132)||(10849956-10850012)
chr3 (55-141)||(14063718-14063801)
chr3 (225-273)||(15848685-15848733)
chr3 (79-145)||(6252789-6252856)
chr3 (55-141)||(52919808-52919895)
chr3 (76-141)||(11189378-11189444)
chr3 (220-266)||(11909616-11909662)
chr3 (76-150)||(12410418-12410492)
chr3 (55-141)||(13410766-13410851)
chr3 (76-141)||(28581471-28581537)
chr3 (76-141)||(49554224-49554290)
chr3 (45-141)||(49643490-49643587)
chr3 (91-244)||(49669121-49669267)
chr3 (70-205)||(2782837-2782968)
chr3 (88-145)||(13931373-13931430)
chr3 (76-141)||(19889642-19889706)
chr3 (225-266)||(22150789-22150830)
chr3 (88-185)||(24393380-24393471)
chr3 (225-266)||(31114438-31114479)
chr3 (65-136)||(40850330-40850403)
chr3 (89-141)||(47207083-47207136)
chr3 (225-266)||(49989804-49989845)
chr3 (225-266)||(51989597-51989638)
chr3 (89-141)||(53057456-53057509)
chr3 (89-141)||(11078134-11078186)
chr3 (55-141)||(12726963-12727051)
chr3 (54-136)||(16305782-16305862)
chr3 (68-269)||(17769562-17769756)
chr3 (68-269)||(19070863-19071057)
chr3 (65-273)||(46796999-46797201)
chr3 (79-141)||(4243844-4243906)
chr3 (45-141)||(13781314-13781411)
chr3 (76-141)||(13823432-13823498)
chr3 (79-141)||(21316922-21316984)
chr3 (65-141)||(21639000-21639078)
chr3 (91-136)||(22463765-22463811)
chr3 (91-136)||(22465223-22465269)
chr3 (76-141)||(31302714-31302780)
chr3 (65-136)||(1728748-1728821)
chr3 (76-141)||(6174701-6174766)
chr3 (69-136)||(9700770-9700839)
chr3 (92-141)||(12396450-12396499)
chr3 (76-141)||(12963814-12963879)
chr3 (225-266)||(15832951-15832992)
chr3 (225-266)||(15848745-15848786)
chr3 (88-141)||(19198602-19198655)
chr3 (89-141)||(20628160-20628213)
chr3 (225-266)||(22770437-22770478)
chr3 (79-136)||(22770590-22770647)
chr3 (89-141)||(29854784-29854837)
chr3 (89-141)||(30054907-30054960)
chr3 (225-266)||(41045286-41045327)
chr3 (225-266)||(51340554-51340595)
chr3 (225-265)||(17006737-17006777)
chr3 (79-139)||(19250082-19250142)
chr3 (89-136)||(40799276-40799324)
chr3 (73-136)||(1463748-1463811)
chr3 (226-265)||(14072240-14072279)
chr3 (82-133)||(14078051-14078102)
chr3 (89-136)||(15647152-15647199)
chr3 (77-136)||(19264096-19264154)
chr3 (89-157)||(11222193-11222263)
chr3 (89-157)||(11222941-11223011)
chr3 (76-141)||(17667771-17667837)
chr3 (77-150)||(932249-932322)
chr3 (213-266)||(932376-932429)
chr3 (76-141)||(13698770-13698835)
chr3 (80-136)||(38178375-38178432)
chr3 (205-265)||(11078211-11078271)
chr3 (205-261)||(13292159-13292215)
chr3 (225-273)||(23538763-23538811)
chr3 (225-273)||(26418276-26418324)
[»] chr1 (166 HSPs)
chr1 (1-273)||(19170846-19171117)
chr1 (1-266)||(20251094-20251359)
chr1 (1-273)||(28379280-28379555)
chr1 (2-273)||(26548777-26549047)
chr1 (22-273)||(22018642-22018892)
chr1 (3-266)||(45071121-45071382)
chr1 (2-273)||(22642153-22642425)
chr1 (3-273)||(5929002-5929269)
chr1 (55-273)||(23926406-23926624)
chr1 (3-266)||(22610496-22610757)
chr1 (3-266)||(46181371-46181633)
chr1 (28-273)||(17370358-17370602)
chr1 (3-266)||(674875-675131)
chr1 (1-165)||(23058884-23059048)
chr1 (17-266)||(41133140-41133382)
chr1 (3-266)||(14388649-14388907)
chr1 (1-163)||(19037297-19037459)
chr1 (11-266)||(11195589-11195838)
chr1 (3-266)||(18311494-18311752)
chr1 (110-266)||(28473660-28473814)
chr1 (3-266)||(12944638-12944895)
chr1 (3-273)||(34256037-34256307)
chr1 (3-266)||(20196213-20196471)
chr1 (1-136)||(52351269-52351402)
chr1 (18-270)||(7745575-7745825)
chr1 (111-262)||(44200443-44200596)
chr1 (20-266)||(51629708-51629950)
chr1 (20-266)||(51656969-51657212)
chr1 (47-266)||(154809-155025)
chr1 (70-266)||(18382425-18382614)
chr1 (130-266)||(20884374-20884508)
chr1 (47-266)||(35012399-35012614)
chr1 (20-266)||(5973203-5973444)
chr1 (70-273)||(7677339-7677537)
chr1 (47-266)||(4177386-4177601)
chr1 (47-266)||(5640231-5640446)
chr1 (47-266)||(5650788-5651003)
chr1 (47-266)||(12898502-12898717)
chr1 (47-266)||(19178430-19178645)
chr1 (47-266)||(19187309-19187524)
chr1 (47-266)||(21863132-21863347)
chr1 (47-266)||(23580817-23581032)
chr1 (70-267)||(47194699-47194890)
chr1 (20-266)||(3171067-3171308)
chr1 (20-266)||(3181669-3181910)
chr1 (47-266)||(10998305-10998520)
chr1 (47-266)||(12614837-12615052)
chr1 (47-266)||(12624302-12624517)
chr1 (47-266)||(12730018-12730233)
chr1 (47-266)||(12740611-12740826)
chr1 (45-153)||(21541137-21541246)
chr1 (47-266)||(21877237-21877452)
chr1 (70-266)||(33084057-33084248)
chr1 (47-266)||(35404913-35405130)
chr1 (47-266)||(35638559-35638774)
chr1 (47-266)||(35649212-35649429)
chr1 (47-266)||(36236950-36237167)
chr1 (47-266)||(36247497-36247714)
chr1 (47-266)||(38094545-38094762)
chr1 (47-266)||(38105170-38105387)
chr1 (70-253)||(39586467-39586644)
chr1 (70-266)||(4251085-4251279)
chr1 (70-253)||(20441849-20442027)
chr1 (47-266)||(5832688-5832904)
chr1 (47-266)||(5843290-5843506)
chr1 (72-266)||(7506798-7506988)
chr1 (72-266)||(7517395-7517585)
chr1 (70-266)||(7689980-7690173)
chr1 (20-266)||(47608452-47608693)
chr1 (20-266)||(47619060-47619301)
chr1 (64-266)||(17956728-17956925)
chr1 (47-266)||(2538006-2538222)
chr1 (96-250)||(9050994-9051143)
chr1 (175-266)||(52351178-52351267)
chr1 (3-145)||(36099969-36100111)
chr1 (47-185)||(4717602-4717736)
chr1 (20-145)||(9749854-9749979)
chr1 (20-145)||(13223499-13223624)
chr1 (47-185)||(16710304-16710438)
chr1 (177-266)||(21543534-21543622)
chr1 (47-145)||(24049133-24049233)
chr1 (47-145)||(25218056-25218156)
chr1 (47-145)||(36551173-36551273)
chr1 (76-145)||(22202380-22202449)
chr1 (225-273)||(22654989-22655037)
chr1 (70-133)||(7309177-7309240)
chr1 (43-141)||(22427988-22428086)
chr1 (207-273)||(19037501-19037567)
chr1 (34-141)||(22600835-22600943)
chr1 (213-266)||(19170823-19170876)
chr1 (79-136)||(23975504-23975561)
chr1 (77-141)||(12625203-12625267)
chr1 (225-273)||(22642407-22642455)
chr1 (93-266)||(39194614-39194783)
chr1 (79-141)||(12283790-12283852)
chr1 (76-141)||(26702779-26702845)
chr1 (225-266)||(19037549-19037590)
chr1 (65-136)||(21215330-21215403)
chr1 (89-244)||(21121617-21121766)
chr1 (55-141)||(21192514-21192602)
chr1 (116-266)||(148734-148879)
chr1 (76-150)||(31358730-31358804)
chr1 (65-141)||(44824408-44824486)
chr1 (77-141)||(1577233-1577298)
chr1 (225-266)||(5929251-5929292)
chr1 (55-144)||(8698239-8698327)
chr1 (225-266)||(17370584-17370625)
chr1 (76-141)||(18614282-18614347)
chr1 (89-205)||(21983974-21984085)
chr1 (76-141)||(22465460-22465525)
chr1 (225-266)||(22642437-22642478)
chr1 (213-266)||(23926594-23926647)
chr1 (225-266)||(28379537-28379578)
chr1 (76-141)||(28492932-28492996)
chr1 (76-141)||(48703628-48703693)
chr1 (89-244)||(23024171-23024320)
chr1 (90-141)||(23037154-23037206)
chr1 (89-136)||(25449212-25449260)
chr1 (90-141)||(29215175-29215227)
chr1 (89-244)||(42284019-42284168)
chr1 (90-141)||(10756803-10756854)
chr1 (227-266)||(22018876-22018915)
chr1 (54-141)||(22601233-22601318)
chr1 (70-141)||(26702972-26703043)
chr1 (65-141)||(10250342-10250420)
chr1 (33-244)||(19214932-19215141)
chr1 (66-144)||(22639672-22639750)
chr1 (76-141)||(36133569-36133635)
chr1 (89-157)||(2328069-2328137)
chr1 (192-266)||(4166870-4166945)
chr1 (89-244)||(21702193-21702341)
chr1 (225-266)||(22655019-22655060)
chr1 (225-266)||(26548754-26548795)
chr1 (225-266)||(34256014-34256055)
chr1 (89-205)||(37640387-37640498)
chr1 (65-244)||(46088342-46088516)
chr1 (70-141)||(48570877-48570950)
chr1 (90-150)||(2819913-2819973)
chr1 (229-273)||(7745602-7745645)
chr1 (77-141)||(17017957-17018021)
chr1 (225-273)||(17025484-17025532)
chr1 (89-136)||(21205526-21205574)
chr1 (76-136)||(21684612-21684672)
chr1 (90-141)||(16233773-16233824)
chr1 (213-272)||(22639780-22639839)
chr1 (54-135)||(24218706-24218786)
chr1 (228-266)||(20867345-20867383)
chr1 (77-146)||(20908777-20908847)
chr1 (76-141)||(22153220-22153286)
chr1 (76-141)||(32786587-32786653)
chr1 (76-141)||(33257000-33257066)
chr1 (76-141)||(33277172-33277238)
chr1 (76-141)||(38281750-38281816)
chr1 (225-266)||(8698399-8698440)
chr1 (76-141)||(9346143-9346208)
chr1 (89-141)||(14293273-14293326)
chr1 (76-129)||(23053740-23053793)
chr1 (225-266)||(26280549-26280590)
chr1 (76-141)||(30892459-30892523)
chr1 (213-266)||(31358858-31358911)
chr1 (205-273)||(8698349-8698417)
chr1 (225-265)||(10153580-10153620)
chr1 (226-266)||(14263931-14263971)
chr1 (226-266)||(17025461-17025501)
chr1 (225-273)||(23037060-23037108)
chr1 (206-266)||(35895683-35895743)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (1-273)||(32280-32553)
scaffold0185 (225-266)||(32535-32576)
[»] chr7 (188 HSPs)
chr7 (1-273)||(11087601-11087872)
chr7 (1-273)||(8999491-8999763)
chr7 (18-273)||(13175162-13175416)
chr7 (3-266)||(24882949-24883210)
chr7 (3-266)||(29589477-29589733)
chr7 (3-266)||(8933048-8933305)
chr7 (3-260)||(12734729-12734980)
chr7 (3-266)||(26210107-26210364)
chr7 (3-266)||(15215801-15216058)
chr7 (3-266)||(18440680-18440937)
chr7 (1-273)||(4433138-4433410)
chr7 (1-273)||(4412565-4412838)
chr7 (3-266)||(38403769-38404027)
chr7 (45-266)||(3476899-3477114)
chr7 (3-266)||(13681806-13682061)
chr7 (3-266)||(48381671-48381929)
chr7 (3-266)||(17064087-17064344)
chr7 (79-266)||(18418674-18418856)
chr7 (17-144)||(6044957-6045083)
chr7 (64-266)||(31117068-31117264)
chr7 (47-266)||(3165262-3165477)
chr7 (47-266)||(20490534-20490749)
chr7 (47-266)||(21003566-21003781)
chr7 (64-253)||(40055323-40055507)
chr7 (70-266)||(588765-588955)
chr7 (70-266)||(15888886-15889076)
chr7 (47-266)||(166422-166637)
chr7 (47-266)||(177014-177229)
chr7 (47-266)||(468139-468354)
chr7 (47-266)||(9084811-9085026)
chr7 (47-266)||(9094525-9094740)
chr7 (47-266)||(9432791-9433006)
chr7 (47-266)||(20989180-20989395)
chr7 (47-266)||(26653883-26654098)
chr7 (47-266)||(26700212-26700427)
chr7 (47-266)||(48711049-48711264)
chr7 (70-266)||(1367182-1367372)
chr7 (74-266)||(21770500-21770686)
chr7 (47-266)||(26294587-26294803)
chr7 (70-266)||(30049072-30049262)
chr7 (64-250)||(38594256-38594436)
chr7 (47-266)||(14746227-14746443)
chr7 (20-266)||(1987041-1987282)
chr7 (20-266)||(1997662-1997903)
chr7 (47-266)||(2706170-2706387)
chr7 (47-266)||(5685046-5685261)
chr7 (20-266)||(8002623-8002864)
chr7 (20-266)||(8013268-8013509)
chr7 (47-266)||(9443387-9443602)
chr7 (47-266)||(17950676-17950893)
chr7 (47-266)||(17961282-17961499)
chr7 (47-266)||(22099265-22099480)
chr7 (70-266)||(24931161-24931352)
chr7 (47-266)||(26390654-26390871)
chr7 (47-266)||(26401296-26401513)
chr7 (47-266)||(37343727-37343942)
chr7 (47-266)||(40042666-40042883)
chr7 (47-266)||(40053215-40053432)
chr7 (20-266)||(42865328-42865569)
chr7 (20-266)||(42875954-42876195)
chr7 (70-266)||(9169738-9169928)
chr7 (70-266)||(6867783-6867973)
chr7 (70-266)||(6878415-6878605)
chr7 (70-266)||(9159283-9159473)
chr7 (47-266)||(540640-540856)
chr7 (47-266)||(2716774-2716991)
chr7 (47-266)||(4211565-4211781)
chr7 (47-266)||(11004711-11004927)
chr7 (47-266)||(22088650-22088865)
chr7 (72-266)||(24734305-24734495)
chr7 (72-266)||(24744252-24744442)
chr7 (47-266)||(8627474-8627691)
chr7 (47-266)||(8616912-8617128)
chr7 (47-266)||(4222134-4222350)
chr7 (47-185)||(19986159-19986293)
chr7 (47-250)||(44280051-44280251)
chr7 (55-244)||(4820826-4821008)
chr7 (70-183)||(20967221-20967328)
chr7 (64-185)||(25212489-25212604)
chr7 (47-185)||(457631-457765)
chr7 (65-141)||(19711742-19711819)
chr7 (20-136)||(23643169-23643285)
chr7 (89-266)||(602139-602314)
chr7 (74-150)||(1878942-1879018)
chr7 (70-181)||(11015356-11015463)
chr7 (82-141)||(7488634-7488693)
chr7 (88-150)||(11572881-11572943)
chr7 (55-136)||(13302200-13302282)
chr7 (79-141)||(19237766-19237828)
chr7 (76-141)||(13259133-13259198)
chr7 (76-141)||(13266473-13266538)
chr7 (70-236)||(1292445-1292606)
chr7 (55-145)||(11318744-11318836)
chr7 (76-136)||(13645812-13645872)
chr7 (34-141)||(33604227-33604333)
chr7 (89-244)||(48806513-48806662)
chr7 (55-141)||(10883902-10883989)
chr7 (79-141)||(11792274-11792336)
chr7 (65-205)||(19339920-19340056)
chr7 (79-145)||(25806794-25806860)
chr7 (225-266)||(11087578-11087619)
chr7 (76-141)||(13261346-13261411)
chr7 (80-141)||(16308440-16308501)
chr7 (1-57)||(1559820-1559876)
chr7 (55-141)||(2914341-2914429)
chr7 (34-141)||(14187009-14187115)
chr7 (66-141)||(23280682-23280757)
chr7 (82-141)||(28623089-28623149)
chr7 (70-133)||(16105668-16105731)
chr7 (76-135)||(16310644-16310703)
chr7 (47-126)||(1251598-1251679)
chr7 (65-141)||(8182309-8182387)
chr7 (76-133)||(13879531-13879589)
chr7 (76-142)||(16464385-16464451)
chr7 (45-141)||(24787691-24787788)
chr7 (79-141)||(29936077-29936138)
chr7 (65-244)||(33421101-33421274)
chr7 (79-141)||(39285234-39285296)
chr7 (76-141)||(44466455-44466521)
chr7 (76-133)||(4493936-4493993)
chr7 (76-141)||(5001557-5001622)
chr7 (225-266)||(8999468-8999509)
chr7 (67-144)||(12223124-12223201)
chr7 (65-136)||(15705221-15705294)
chr7 (77-150)||(15871759-15871832)
chr7 (76-141)||(16317286-16317350)
chr7 (80-141)||(16411374-16411435)
chr7 (76-141)||(21211275-21211340)
chr7 (76-136)||(22579917-22579978)
chr7 (65-244)||(27871067-27871241)
chr7 (76-141)||(41843155-41843220)
chr7 (65-244)||(48063445-48063619)
chr7 (76-136)||(12367473-12367533)
chr7 (55-141)||(13034568-13034656)
chr7 (55-141)||(19328741-19328829)
chr7 (55-141)||(21284104-21284192)
chr7 (82-141)||(30946088-30946148)
chr7 (65-244)||(331000-331175)
chr7 (55-125)||(3779382-3779450)
chr7 (93-136)||(14425926-14425969)
chr7 (55-141)||(16315270-16315356)
chr7 (65-134)||(21382165-21382236)
chr7 (76-141)||(2499424-2499490)
chr7 (88-150)||(2501667-2501729)
chr7 (79-141)||(5034659-5034721)
chr7 (76-141)||(13138626-13138692)
chr7 (74-136)||(21019382-21019443)
chr7 (88-150)||(23125356-23125418)
chr7 (70-124)||(23303859-23303913)
chr7 (213-266)||(602291-602344)
chr7 (225-266)||(4412542-4412583)
chr7 (76-141)||(9098961-9099026)
chr7 (76-141)||(9099767-9099832)
chr7 (89-141)||(9710533-9710586)
chr7 (66-123)||(9802567-9802624)
chr7 (225-266)||(13263319-13263360)
chr7 (89-205)||(14424891-14425002)
chr7 (89-141)||(16546065-16546118)
chr7 (89-141)||(16619544-16619597)
chr7 (65-136)||(24795449-24795522)
chr7 (89-141)||(35954634-35954687)
chr7 (89-141)||(48237570-48237623)
chr7 (218-269)||(1878832-1878883)
chr7 (195-266)||(455357-455429)
chr7 (65-141)||(2266243-2266321)
chr7 (82-136)||(13173084-13173138)
chr7 (45-141)||(13731405-13731502)
chr7 (94-136)||(13902348-13902390)
chr7 (80-141)||(15087916-15087978)
chr7 (54-135)||(30025273-30025355)
chr7 (65-133)||(32265457-32265527)
chr7 (225-266)||(4433115-4433156)
chr7 (72-129)||(4549712-4549769)
chr7 (89-141)||(9069134-9069187)
chr7 (225-266)||(9802686-9802727)
chr7 (47-117)||(12220350-12220422)
chr7 (225-266)||(13172932-13172973)
chr7 (225-266)||(13175139-13175180)
chr7 (55-115)||(13681634-13681695)
chr7 (89-141)||(16557318-16557371)
chr7 (89-141)||(16608291-16608344)
chr7 (213-266)||(25806920-25806973)
chr7 (20-112)||(1775636-1775728)
chr7 (226-266)||(5034924-5034964)
chr7 (73-145)||(8309860-8309931)
chr7 (209-265)||(11095740-11095795)
chr7 (55-141)||(13027629-13027717)
chr7 (90-141)||(15467293-15467345)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (1-273)||(59407-59676)
scaffold0017 (1-273)||(40861-41132)
scaffold0017 (3-185)||(174862-175039)
scaffold0017 (225-266)||(40838-40879)
scaffold0017 (225-266)||(59384-59425)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (1-266)||(1529-1792)
[»] chr8 (137 HSPs)
chr8 (1-266)||(8031338-8031604)
chr8 (3-266)||(17519662-17519924)
chr8 (3-266)||(19460504-19460765)
chr8 (3-266)||(19558182-19558443)
chr8 (1-266)||(29378890-29379155)
chr8 (3-266)||(23271691-23271952)
chr8 (2-273)||(40002509-40002781)
chr8 (17-266)||(22136370-22136617)
chr8 (3-266)||(7018928-7019189)
chr8 (3-266)||(22167535-22167796)
chr8 (3-266)||(22211873-22212134)
chr8 (3-266)||(23363639-23363900)
chr8 (2-273)||(28902752-28903021)
chr8 (3-266)||(3843034-3843290)
chr8 (45-261)||(20260135-20260345)
chr8 (45-261)||(21046765-21046975)
chr8 (2-273)||(45568514-45568785)
chr8 (9-173)||(15969492-15969657)
chr8 (35-273)||(21287719-21287957)
chr8 (1-273)||(21298265-21298537)
chr8 (2-273)||(21540246-21540507)
chr8 (70-266)||(23469972-23470162)
chr8 (70-266)||(18153316-18153505)
chr8 (20-266)||(31214540-31214781)
chr8 (70-266)||(6319027-6319217)
chr8 (70-266)||(30315212-30315402)
chr8 (47-266)||(20161742-20161957)
chr8 (47-266)||(26110785-26111000)
chr8 (47-266)||(32078207-32078422)
chr8 (47-266)||(32088780-32088995)
chr8 (47-265)||(43247879-43248093)
chr8 (70-266)||(3220211-3220401)
chr8 (70-266)||(9856988-9857178)
chr8 (47-266)||(210664-210881)
chr8 (47-266)||(241376-241593)
chr8 (47-266)||(251961-252178)
chr8 (47-266)||(724287-724504)
chr8 (47-266)||(794731-794948)
chr8 (47-266)||(849478-849695)
chr8 (47-266)||(6150623-6150837)
chr8 (47-266)||(6160578-6160792)
chr8 (70-266)||(18157835-18158024)
chr8 (47-266)||(19128302-19128517)
chr8 (20-266)||(36077465-36077706)
chr8 (20-266)||(36088051-36088292)
chr8 (47-266)||(36292473-36292690)
chr8 (47-266)||(36303076-36303293)
chr8 (47-266)||(15791810-15792026)
chr8 (70-266)||(40213680-40213870)
chr8 (47-266)||(3349138-3349354)
chr8 (47-266)||(3359735-3359951)
chr8 (47-266)||(13689079-13689296)
chr8 (47-266)||(13697190-13697407)
chr8 (70-266)||(15781221-15781412)
chr8 (47-266)||(18448924-18449139)
chr8 (70-266)||(26120485-26120678)
chr8 (47-266)||(29076284-29076500)
chr8 (47-266)||(29086535-29086751)
chr8 (20-266)||(19224462-19224703)
chr8 (70-185)||(23270531-23270640)
chr8 (47-266)||(19138834-19139049)
chr8 (47-250)||(20195539-20195739)
chr8 (47-266)||(44480644-44480860)
chr8 (47-266)||(44491260-44491476)
chr8 (70-266)||(19417930-19418121)
chr8 (70-266)||(19428505-19428696)
chr8 (70-185)||(15998808-15998917)
chr8 (70-266)||(16746579-16746769)
chr8 (88-266)||(9340740-9340913)
chr8 (88-266)||(9367884-9368057)
chr8 (20-145)||(23290429-23290554)
chr8 (70-182)||(26735573-26735679)
chr8 (77-145)||(12541041-12541109)
chr8 (43-141)||(15934389-15934483)
chr8 (70-266)||(18769649-18769839)
chr8 (55-141)||(19942572-19942659)
chr8 (76-141)||(20383065-20383130)
chr8 (70-244)||(22673151-22673319)
chr8 (76-141)||(26832434-26832499)
chr8 (65-145)||(16376058-16376137)
chr8 (213-273)||(21298507-21298567)
chr8 (76-141)||(29692670-29692736)
chr8 (45-141)||(18772020-18772115)
chr8 (76-141)||(19706874-19706939)
chr8 (76-141)||(19957065-19957130)
chr8 (213-266)||(21287927-21287980)
chr8 (213-266)||(45568491-45568544)
chr8 (68-144)||(24498795-24498871)
chr8 (34-141)||(25163388-25163494)
chr8 (76-131)||(12758474-12758529)
chr8 (55-141)||(18557387-18557473)
chr8 (34-136)||(36104661-36104759)
chr8 (65-244)||(14990111-14990284)
chr8 (55-144)||(17687359-17687445)
chr8 (47-126)||(21547621-21547702)
chr8 (45-141)||(20256240-20256336)
chr8 (213-266)||(21298537-21298590)
chr8 (213-266)||(21540477-21540530)
chr8 (76-141)||(24679115-24679180)
chr8 (225-266)||(28903003-28903044)
chr8 (225-266)||(40002763-40002804)
chr8 (89-141)||(43773491-43773544)
chr8 (65-238)||(18152313-18152480)
chr8 (76-136)||(18679172-18679232)
chr8 (76-136)||(18718361-18718421)
chr8 (76-141)||(16206629-16206694)
chr8 (76-141)||(18121835-18121901)
chr8 (89-244)||(22662458-22662607)
chr8 (55-144)||(24634724-24634811)
chr8 (65-136)||(1744533-1744606)
chr8 (55-141)||(15336815-15336904)
chr8 (55-141)||(15425880-15425969)
chr8 (55-141)||(15517184-15517273)
chr8 (209-266)||(18557550-18557607)
chr8 (76-141)||(25850716-25850781)
chr8 (89-141)||(33560941-33560994)
chr8 (89-145)||(45539159-45539215)
chr8 (225-273)||(18772196-18772244)
chr8 (77-141)||(22707703-22707767)
chr8 (89-136)||(39692907-39692955)
chr8 (94-141)||(40846115-40846163)
chr8 (54-141)||(17928426-17928511)
chr8 (55-141)||(19153370-19153456)
chr8 (70-141)||(19506068-19506139)
chr8 (79-141)||(23264350-23264413)
chr8 (90-141)||(43644269-43644320)
chr8 (65-141)||(6407104-6407182)
chr8 (90-136)||(18321889-18321935)
chr8 (76-141)||(21932241-21932307)
chr8 (3-77)||(23800926-23800999)
chr8 (89-141)||(17796793-17796846)
chr8 (89-141)||(30422127-30422180)
chr8 (89-141)||(1210435-1210487)
chr8 (213-269)||(17687506-17687562)
chr8 (79-123)||(17879063-17879107)
chr8 (218-266)||(24678973-24679021)
chr8 (225-273)||(26832579-26832627)
[»] scaffold0002 (6 HSPs)
scaffold0002 (1-273)||(475801-476072)
scaffold0002 (1-273)||(482321-482592)
scaffold0002 (70-181)||(100167-100272)
scaffold0002 (225-266)||(475778-475819)
scaffold0002 (225-266)||(482298-482339)
scaffold0002 (79-141)||(111776-111838)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (3-266)||(2229-2491)
scaffold0570 (1-266)||(8-268)
[»] chr2 (142 HSPs)
chr2 (3-266)||(19313486-19313747)
chr2 (18-273)||(20647101-20647354)
chr2 (9-266)||(38033300-38033556)
chr2 (3-266)||(19302920-19303182)
chr2 (3-266)||(19498459-19498722)
chr2 (2-273)||(23393212-23393482)
chr2 (3-266)||(17970766-17971023)
chr2 (3-266)||(22773830-22774090)
chr2 (2-273)||(24802092-24802363)
chr2 (3-266)||(22763125-22763386)
chr2 (9-205)||(38040521-38040715)
chr2 (3-273)||(19355790-19356058)
chr2 (3-266)||(24274501-24274757)
chr2 (3-266)||(968000-968257)
chr2 (88-266)||(22754872-22755050)
chr2 (22-273)||(24815059-24815310)
chr2 (3-261)||(1041624-1041876)
chr2 (9-166)||(22615179-22615336)
chr2 (3-266)||(36785295-36785553)
chr2 (61-273)||(1083358-1083570)
chr2 (64-253)||(27978890-27979074)
chr2 (64-253)||(28065419-28065603)
chr2 (47-266)||(16768460-16768675)
chr2 (47-266)||(22915360-22915575)
chr2 (70-266)||(26866614-26866803)
chr2 (20-266)||(30489320-30489560)
chr2 (47-266)||(43082171-43082386)
chr2 (70-253)||(26879203-26879380)
chr2 (70-266)||(24428082-24428272)
chr2 (47-266)||(1099691-1099906)
chr2 (47-266)||(2561005-2561220)
chr2 (47-266)||(4099331-4099546)
chr2 (47-266)||(4209406-4209621)
chr2 (47-266)||(7006303-7006518)
chr2 (47-266)||(9773800-9774015)
chr2 (47-266)||(11389305-11389520)
chr2 (47-266)||(22960828-22961043)
chr2 (47-266)||(24328230-24328445)
chr2 (47-266)||(24338900-24339115)
chr2 (47-266)||(40250710-40250925)
chr2 (47-266)||(43092780-43092995)
chr2 (70-266)||(28721812-28722002)
chr2 (70-266)||(28732398-28732588)
chr2 (47-266)||(34477445-34477661)
chr2 (47-266)||(4219998-4220213)
chr2 (47-266)||(9763264-9763479)
chr2 (47-266)||(17857933-17858148)
chr2 (47-266)||(18393133-18393350)
chr2 (70-266)||(18769401-18769590)
chr2 (20-266)||(27220872-27221113)
chr2 (47-266)||(29243739-29243954)
chr2 (47-266)||(29254318-29254533)
chr2 (20-266)||(35252473-35252714)
chr2 (20-266)||(35263082-35263323)
chr2 (20-266)||(35273707-35273948)
chr2 (70-266)||(24415517-24415707)
chr2 (70-266)||(32217414-32217606)
chr2 (47-266)||(11395668-11395885)
chr2 (47-266)||(11405984-11406201)
chr2 (47-266)||(34790713-34790928)
chr2 (47-266)||(34804856-34805071)
chr2 (64-266)||(38586583-38586781)
chr2 (47-266)||(40221849-40222064)
chr2 (47-266)||(9908658-9908876)
chr2 (70-266)||(21172962-21173154)
chr2 (71-266)||(36252340-36252529)
chr2 (47-266)||(10266510-10266726)
chr2 (47-266)||(10277087-10277303)
chr2 (47-266)||(21651001-21651217)
chr2 (175-266)||(19300479-19300568)
chr2 (47-266)||(9898070-9898288)
chr2 (88-266)||(39170591-39170764)
chr2 (47-266)||(43344924-43345140)
chr2 (47-266)||(43354539-43354755)
chr2 (70-185)||(30794351-30794461)
chr2 (45-141)||(21537860-21537956)
chr2 (91-150)||(22682807-22682866)
chr2 (76-141)||(22257562-22257627)
chr2 (76-133)||(22271491-22271548)
chr2 (76-137)||(40781837-40781898)
chr2 (65-244)||(44839782-44839956)
chr2 (55-145)||(19321030-19321121)
chr2 (82-141)||(24843572-24843631)
chr2 (72-244)||(34322510-34322676)
chr2 (45-141)||(10010426-10010518)
chr2 (213-266)||(1083540-1083593)
chr2 (65-141)||(23184976-23185053)
chr2 (65-141)||(23596239-23596316)
chr2 (76-133)||(24376467-24376524)
chr2 (89-141)||(18431612-18431664)
chr2 (34-141)||(19539736-19539842)
chr2 (55-141)||(22316931-22317019)
chr2 (89-141)||(24851337-24851389)
chr2 (213-269)||(27939513-27939569)
chr2 (55-141)||(25828501-25828587)
chr2 (90-141)||(28141276-28141327)
chr2 (65-266)||(40331136-40331332)
chr2 (79-141)||(18702104-18702166)
chr2 (65-141)||(22782288-22782366)
chr2 (65-141)||(22786328-22786406)
chr2 (76-141)||(23234370-23234436)
chr2 (77-141)||(13964647-13964712)
chr2 (57-141)||(22382826-22382911)
chr2 (225-266)||(24802069-24802110)
chr2 (225-266)||(24815036-24815077)
chr2 (65-244)||(40331459-40331632)
chr2 (55-141)||(20569424-20569512)
chr2 (55-136)||(31328641-31328725)
chr2 (55-136)||(31335362-31335446)
chr2 (94-141)||(44880654-44880701)
chr2 (65-238)||(45087565-45087733)
chr2 (79-141)||(10899185-10899247)
chr2 (79-145)||(14794461-14794526)
chr2 (55-141)||(21845503-21845588)
chr2 (76-141)||(24575395-24575461)
chr2 (65-141)||(28551592-28551670)
chr2 (89-141)||(6574770-6574823)
chr2 (65-136)||(16494696-16494769)
chr2 (225-266)||(19356040-19356081)
chr2 (213-266)||(21911386-21911439)
chr2 (65-244)||(22801820-22801994)
chr2 (225-266)||(23393189-23393230)
chr2 (89-141)||(25188772-25188825)
chr2 (76-141)||(26367082-26367147)
chr2 (226-266)||(20647078-20647118)
chr2 (66-141)||(21911503-21911579)
chr2 (226-266)||(22383018-22383058)
chr2 (77-141)||(26623128-26623192)
chr2 (90-141)||(39038315-39038367)
chr2 (66-132)||(17963950-17964014)
chr2 (76-141)||(22455633-22455699)
chr2 (55-141)||(22797768-22797853)
chr2 (80-134)||(24110046-24110099)
chr2 (76-141)||(25037935-25038001)
chr2 (55-123)||(27747147-27747214)
chr2 (72-136)||(31968460-31968526)
chr2 (65-141)||(24778721-24778798)
chr2 (205-266)||(25918231-25918292)
chr2 (89-141)||(28701885-28701938)
chr2 (89-141)||(30557996-30558049)
chr2 (90-141)||(6392038-6392090)
chr2 (225-273)||(18702247-18702295)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (3-266)||(152-413)
scaffold0090 (3-266)||(4532-4793)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (3-266)||(127122-127385)
scaffold0012 (3-266)||(16082-16343)
[»] scaffold0655 (2 HSPs)
scaffold0655 (2-273)||(4407-4679)
scaffold0655 (225-266)||(4661-4702)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (3-266)||(709-972)
scaffold0752 (138-266)||(1461-1587)
[»] scaffold0050 (3 HSPs)
scaffold0050 (3-273)||(34911-35178)
scaffold0050 (225-273)||(35160-35208)
scaffold0050 (225-266)||(35190-35231)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (30-266)||(251-485)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (3-192)||(1876-2065)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (3-266)||(57842-58103)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (3-261)||(5323-5579)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (20-266)||(10279-10523)
[»] scaffold0422 (3 HSPs)
scaffold0422 (2-273)||(11024-11292)
scaffold0422 (225-273)||(11274-11322)
scaffold0422 (225-266)||(11304-11345)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (4-266)||(29286-29546)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (3-266)||(28950-29211)
scaffold0163 (55-141)||(25804-25891)
[»] scaffold1321 (2 HSPs)
scaffold1321 (34-273)||(1485-1724)
scaffold1321 (225-266)||(1462-1503)
[»] scaffold1263 (2 HSPs)
scaffold1263 (34-273)||(1678-1917)
scaffold1263 (225-266)||(1655-1696)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (2-273)||(20923-21193)
scaffold0177 (225-266)||(20900-20941)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (3-266)||(4778-5034)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (3-266)||(35017-35276)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (3-266)||(15208-15466)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (11-266)||(39991-40240)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (17-265)||(38487-38732)
[»] scaffold0207 (5 HSPs)
scaffold0207 (2-264)||(19853-20115)
scaffold0207 (213-273)||(20124-20184)
scaffold0207 (230-273)||(10240-10283)
scaffold0207 (225-266)||(10265-10306)
scaffold0207 (225-266)||(20166-20207)
[»] scaffold0084 (5 HSPs)
scaffold0084 (9-266)||(57300-57553)
scaffold0084 (35-273)||(937-1175)
scaffold0084 (55-141)||(31930-32018)
scaffold0084 (76-141)||(48698-48764)
scaffold0084 (213-266)||(914-967)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (22-273)||(7033-7284)
scaffold0018 (225-273)||(7003-7051)
scaffold0018 (225-266)||(6980-7021)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (3-266)||(12634-12892)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (2-266)||(2340-2604)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (1-273)||(38634-38907)
scaffold0132 (213-266)||(38611-38664)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (79-266)||(1551-1732)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (2-273)||(165181-165452)
scaffold0011 (213-266)||(165158-165211)
scaffold0011 (65-136)||(145133-145206)
scaffold0011 (89-244)||(65988-66136)
scaffold0011 (77-150)||(251037-251110)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (55-273)||(26-244)
scaffold0211 (213-266)||(3-56)
[»] scaffold2071 (1 HSPs)
scaffold2071 (106-266)||(959-1117)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (35-236)||(5727-5927)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (55-273)||(9312-9530)
scaffold0297 (213-266)||(9500-9555)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (22-153)||(17-149)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (74-266)||(10805-10992)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (1-205)||(1124-1329)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (20-266)||(7401-7641)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (47-266)||(14107-14322)
scaffold0028 (47-266)||(54640-54855)
scaffold0028 (34-244)||(24360-24563)
scaffold0028 (79-141)||(80765-80827)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (82-205)||(16338-16461)
scaffold0269 (225-266)||(6825-6866)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (70-266)||(37251-37441)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (47-266)||(11881-12096)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (47-266)||(7359-7574)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (116-266)||(13934-14084)
scaffold0349 (4-122)||(10238-10355)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (52-266)||(11123-11332)
scaffold0068 (52-182)||(8367-8492)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (47-266)||(30654-30871)
scaffold0133 (70-145)||(43157-43232)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (47-266)||(7483-7700)
scaffold0105 (47-266)||(37475-37692)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (47-266)||(40970-41185)
scaffold0047 (70-266)||(33419-33609)
[»] scaffold0908 (2 HSPs)
scaffold0908 (166-273)||(4448-4554)
scaffold0908 (213-266)||(4425-4478)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (47-266)||(2214-2429)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (70-266)||(2735-2926)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (70-185)||(15-124)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (70-185)||(8667-8776)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (47-145)||(1735-1835)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (70-230)||(1-155)
scaffold0171 (55-141)||(28106-28194)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (70-145)||(1437-1512)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (47-145)||(4251-4351)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (72-185)||(23322-23429)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (47-145)||(155711-155811)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (47-136)||(52374-52465)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (34-244)||(16299-16501)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (47-145)||(61149-61249)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (55-141)||(9250-9337)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (70-133)||(21367-21430)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (70-145)||(4459-4534)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (50-141)||(76586-76677)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (79-141)||(20149-20211)
scaffold0035 (90-135)||(29176-29221)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (76-141)||(73948-74014)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (44-136)||(10792-10884)
scaffold0161 (44-136)||(15456-15548)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (76-141)||(32465-32530)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (76-136)||(14484-14544)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (72-205)||(5889-6018)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (76-141)||(9330-9396)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (79-141)||(16808-16870)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (76-141)||(2064-2129)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (76-141)||(2027-2092)
scaffold0622 (76-141)||(4041-4106)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (76-141)||(2696-2760)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (70-127)||(7217-7274)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (76-141)||(37425-37490)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (76-141)||(6815-6880)
scaffold0040 (76-141)||(2739-2804)
scaffold0040 (213-266)||(4538-4591)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (66-141)||(87764-87841)
scaffold0004 (76-132)||(244969-245025)
scaffold0004 (32-141)||(219561-219671)
scaffold0004 (90-141)||(378226-378277)
scaffold0004 (225-273)||(244831-244879)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (77-145)||(3934-4001)
scaffold0498 (225-273)||(824-872)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (34-136)||(2777-2875)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (55-141)||(18545-18632)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (65-157)||(11551-11644)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (65-141)||(3346-3424)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (76-141)||(2597-2663)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (79-141)||(59449-59511)
scaffold0026 (65-141)||(7280-7356)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (79-141)||(268152-268214)
scaffold0009 (76-141)||(83759-83825)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (76-141)||(2460-2525)
scaffold0598 (225-273)||(2344-2392)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (76-141)||(9666-9731)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (76-136)||(335-396)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (80-136)||(18402-18459)
scaffold0217 (76-127)||(606-658)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (65-136)||(35429-35502)
scaffold0056 (65-131)||(26340-26408)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (72-141)||(2441-2510)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (76-136)||(102936-102997)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (80-141)||(86-147)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (194-266)||(59779-59851)
scaffold0007 (34-244)||(63663-63869)
scaffold0007 (89-141)||(46044-46097)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (93-136)||(1340-1383)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (227-266)||(908-947)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (1-117)||(17812-17929)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (88-145)||(18774-18833)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (79-141)||(691-753)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (79-141)||(658-720)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (76-141)||(5581-5647)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (65-205)||(1441-1576)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (89-141)||(2361-2414)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (89-141)||(7420-7473)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (217-266)||(19609-19658)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (89-141)||(24010-24063)
[»] scaffold0273 (3 HSPs)
scaffold0273 (225-266)||(22555-22596)
scaffold0273 (76-136)||(5056-5116)
scaffold0273 (82-141)||(22390-22449)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (89-141)||(618-671)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (76-141)||(13410-13475)
scaffold0081 (225-273)||(13555-13603)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (89-133)||(144285-144329)
[»] scaffold1026 (1 HSPs)
scaffold1026 (219-266)||(2619-2666)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (45-141)||(7998-8091)
[»] scaffold1339 (1 HSPs)
scaffold1339 (219-265)||(1764-1810)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (76-141)||(6368-6434)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (76-141)||(9323-9389)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (65-205)||(88221-88357)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (79-141)||(36799-36861)
scaffold0022 (79-141)||(134859-134921)
[»] scaffold1657 (1 HSPs)
scaffold1657 (76-141)||(1209-1273)
[»] scaffold0758 (2 HSPs)
scaffold0758 (76-141)||(3675-3740)
scaffold0758 (213-266)||(3803-3856)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (89-141)||(19301-19354)
[»] scaffold0067 (2 HSPs)
scaffold0067 (76-145)||(17009-17078)
scaffold0067 (213-265)||(16899-16951)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (79-115)||(7181-7217)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (89-141)||(44541-44593)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (206-266)||(111210-111270)
scaffold0036 (89-145)||(111326-111382)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (93-136)||(106-150)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 183)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20215966 - 20215695
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20215966 attgcttctgatgtgtagttcagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccac 20215867  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20215866 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 20215768  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20215767 cttcacaaatgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 20215695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40033588 - 40033323
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40033588 attgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaatagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccac 40033489  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40033488 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 40033389  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40033388 cttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 40033323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 40227953 - 40228217
Alignment:
Q  9 tgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccgga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  40227953 tgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagaagagagaagaaagaaagacacaagcaattatactggttccttccacaaactaga 40228052  T
Q  109 agtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40228053 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa 40228152  T
Q  209 atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40228153 atgctcaagcacgcaggcaagagactccctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 40228217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 1914732 - 1914998
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaa-acagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1914732 attgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttcca 1914831  T
Q  100 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1914832 taaaccggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 1914931  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| || | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1914932 acttcacaaatgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 1914998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 23477665 - 23477933
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    |||||| |||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23477665 ttgcttctgatgtgcagttcagaaaaggatatgcagcggagtaaaa-cagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccaca 23477763  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23477764 aaccggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagac 23477862  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23477863 ttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 23477933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36096480 - 36096219
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36096480 tgcttctgatgtgatgttcagaattggatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaacagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 36096381  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  36096380 atcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagact 36096283  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36096282 tcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 36096219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36097937 - 36097676
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36097937 tgcttctgatgtgatgttcagaattggatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaacagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 36097838  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  36097837 atcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagact 36097740  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36097739 tcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 36097676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 13522514 - 13522775
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13522514 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaataaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 13522613  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  13522614 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagact 13522711  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13522712 tcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 13522775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20168895 - 20168634
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20168895 tgcttctgatgtgatgttcaaaatccgatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagagagacataagcaattatcctggttccttccacaa 20168796  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  20168795 accggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagact 20168698  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20168697 tcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 20168634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 266
Target Start/End: Original strand, 23487875 - 23488102
Alignment:
Q  36 agcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23487875 agcggagtaaaa-cagagtagagagaataaagagagacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 23487973  T
Q  136 atgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagactt 235  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  23487974 aggagatttccactaagt-ttaatcacgcagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagactt 23488071  T
Q  236 cctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23488072 cctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 23488102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35543957 - 35543695
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaac-agagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35543957 tgcttctgatgtgatgttcagaattagatacgcaacggaataaaaaatagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccaca 35543858  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  35543857 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagac 35543760  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| |||| ||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35543759 ttcccaaatgctcaagcatgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 35543695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Original strand, 13533271 - 13533502
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13533271 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 13533370  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||    
T  13533371 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgaaact 13533468  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttc 236  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  13533469 tcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 13533502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20417758 - 20417501
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||| | |||| |||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20417758 tgcttctgatgtgatgttcagagtcagatatgcagcggaatgaaaatagaacagagaaaagaaagagagacataagcaattatcctggttccttccacaa 20417659  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  20417658 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagact 20417565  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| || || ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20417564 tctcaaatgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 20417501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 32753351 - 32753608
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || | ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  32753351 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcagaatgaaaacagaacagagaaaagaaggagagacacaagcaattatcctgattccttccacaa 32753450  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||    
T  32753451 actggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaa----aatcacacagattacagatgctcaatactct--ctagtatgagact 32753544  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32753545 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 32753608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 106974 - 106717
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  106974 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 106876  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    |||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  106875 tccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatctcaaagattacaaatgctcaatact-ctcttagtatgagact 106781  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||  |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  106780 tctcaaattctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 106717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 32160053 - 32160307
Alignment:
Q  19 ttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtcc 116  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32160053 ttcagaattggatgcacagcggagtaaaa-cagagtaagagagaagaaagaaagacacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcc 32160151  T
Q  117 agtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttca 215  Q
     || |||||||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||    
T  32160152 tgttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattactca 32160249  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32160250 agcacacaggcaagagatttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgct 32160307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20625621 - 20625363
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20625621 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 20625523  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    |||||||| || ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  20625522 accggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatctcaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 20625428  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20625427 tctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 20625363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 21420168 - 21420425
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21420168 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcaacggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 21420266  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    |||||||| || |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  21420267 tccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatctcaaagattacaaatgctcaattct-ctcttagtatgagact 21420361  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21420362 tctcaaatggtcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 21420425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25112670 - 25112456
Alignment:
Q  59 agaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaata 157  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||||| |||||||| |||| || ||||||||  ||    
T  25112670 agaagaaagaaagacacaagcaattatacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtt-ta 25112572  T
Q  158 atcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagc 256  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25112571 atcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagc 25112473  T
Q  257 aagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||||||    
T  25112472 aagagacttcctatgct 25112456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25171761 - 25171547
Alignment:
Q  59 agaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaata 157  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||||| |||||||| |||| || ||||||||  ||    
T  25171761 agaagaaagaaagacacaagcaattatacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtt-ta 25171663  T
Q  158 atcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagc 256  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25171662 atcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagc 25171564  T
Q  257 aagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||||||    
T  25171563 aagagacttcctatgct 25171547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11208817 - 11208588
Alignment:
Q  45 aaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  11208817 aaaacagagtaagagaaaagaaagaaagacacatgcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggaga 11208718  T
Q  142 tttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     || ||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  11208717 gtttcactaagta-taatcacaactgattacaactgctcaatactacaactagtatgagacttca-aaatgctcaagcacaca-gcaagatacttccttt 11208621  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
     |||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  11208620 actcaagcacacaagcaagagacttcttatgct 11208588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 154 - 266
Target Start/End: Original strand, 13403701 - 13403813
Alignment:
Q  154 aataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13403701 aataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacgaa 13403800  T
Q  254 agcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||    
T  13403801 agcaagagacttc 13403813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 7031604 - 7031819
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7031604 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 7031703  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  7031704 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 7031796  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  7031797 tcaagcact-aagcaagagacttc 7031819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 17446169 - 17446358
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  17446169 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 17446262  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17446263 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 17446358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 43043093 - 43043334
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43043093 tcagaatcagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 43043191  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||    
T  43043192 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctca 43043284  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  43043285 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaat-aagcaagagacttc 43043334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20798483 - 20798293
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||     ||||||||| |||||    
T  20798483 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggatattt-cact-----ataatcacaaagatt 20798390  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20798389 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 20798293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27204604 - 27204389
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaaga--gagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27204604 aacagagcagagaaaagaaagacagagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27204505  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||    
T  27204504 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgc 27204412  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||| ||||||||||||||    
T  27204411 tcaaacact-aagcaagagacttc 27204389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34063408 - 34063219
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  34063408 agacacaaacagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 34063315  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34063314 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 34063219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40391169 - 40390954
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40391169 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttacacttccaaggagattt 40391070  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  40391069 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 40390977  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  40390976 tcaagcact-aagcaagagacttc 40390954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40401831 - 40401616
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40401831 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagattt 40401732  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  40401731 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 40401639  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  40401638 tcaagcact-aagcaagagacttc 40401616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 5290023 - 5290239
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5290023 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5290122  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  5290123 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 5290215  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  5290216 ctcaagcact-aagcaagagacttc 5290239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 5300594 - 5300810
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5300594 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5300693  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  5300694 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 5300786  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  5300787 ctcaagcact-aagcaagagacttc 5300810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23407233 - 23407043
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  23407233 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 23407140  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23407139 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 23407043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36229526 - 36229336
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  36229526 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 36229433  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36229432 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 36229336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 1121350 - 1121565
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1121350 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 1121449  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  1121450 -cact-----ataatcacaaagattacaaatactcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 1121542  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  1121543 tcaagcact-aagcaagagtcttc 1121565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9336767 - 9336552
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9336767 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 9336668  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  9336667 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9336575  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9336574 tcaagcact-aagcaagagacttc 9336552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9347354 - 9347139
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9347354 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 9347255  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  9347254 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9347162  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9347161 tcaagcact-aagcaagagacttc 9347139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10755329 - 10755089
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  10755329 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcctttcacaacacggaagtagtcca 10755232  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  || |||    
T  10755231 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctca 10755139  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
      |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10755138 cgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagaact-aagcaagagacttc 10755089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 16003339 - 16003554
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16003339 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 16003438  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  16003439 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 16003531  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  16003532 tcaagcact-aagcaagagacttc 16003554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22157917 - 22157703
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22157917 aacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 22157818  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  22157817 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 22157726  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  22157725 tcaagcact-aagcaagagacttc 22157703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23362923 - 23362708
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23362923 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 23362824  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  23362823 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 23362731  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  23362730 tcaagcact-aagcaagagacttc 23362708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 27602866 - 27603081
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27602866 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27602965  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  27602966 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 27603058  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  27603059 tcaagcact-aagcaagagacttc 27603081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 36582005 - 36582220
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36582005 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 36582104  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  36582105 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 36582197  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  36582198 tcaagcact-aagcaagagacttc 36582220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 36592560 - 36592775
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36592560 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 36592659  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  36592660 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 36592752  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  36592753 tcaagcact-aagcaagagacttc 36592775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39353300 - 39353085
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39353300 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 39353201  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  39353200 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 39353108  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  39353107 tcaagcact-aagcaagagacttc 39353085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39365293 - 39365078
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39365293 aacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 39365194  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  39365193 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 39365101  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  39365100 tcaagcact-aagcaagagacttc 39365078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 253
Target Start/End: Original strand, 1108592 - 1108795
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1108592 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 1108691  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  1108692 -cact-----ataatcacaaagattacaaatactcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 1108784  T
Q  243 tcaagcactaa 253  Q
    |||||||||||    
T  1108785 tcaagcactaa 1108795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 253
Target Start/End: Original strand, 17456785 - 17456962
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||      ||||||||| |||||    
T  17456785 agacacaagcagttatcctggttccttccataaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac-----gataatcacaaagatt 17456878  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  17456879 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 17456962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34052726 - 34052558
Alignment:
Q  91 ttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacc 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |     
T  34052726 ttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctct 34052634  T
Q  191 tagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34052633 aagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 34052558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23393188 - 23392998
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  23393188 agacacaagcagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 23393095  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||| |||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23393094 acaaatgctcaatact-ctctaagtttgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaaagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 23392998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 30069351 - 30069567
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30069351 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 30069450  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||   ||||| |||  |||||| ||||||| |||||  ||    
T  30069451 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatg 30069543  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  30069544 ctcaagcact-aagcaagagacttc 30069567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42395771 - 42395581
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  42395771 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagattt-cact-----ataatcacaaagatt 42395678  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||  ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42395677 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 42395581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 266
Target Start/End: Original strand, 21702578 - 21702787
Alignment:
Q  52 agtagagagaagaaaga-gagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  21702578 agtagagaaaagaaaaacgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact- 21702675  T
Q  151 agtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagc 248  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||||||  ||| ||||| |||  |||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  21702676 ----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 21702770  T
Q  249 actaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  21702771 act-aagcaagagtcttc 21702787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6131603 - 6131388
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6131603 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 6131504  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  6131503 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtaagagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 6131411  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  6131410 tcaagcact-aagcaagagacttc 6131388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8522629 - 8522438
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  8522629 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 8522536  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc---acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||||   | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  8522535 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca-ttaagcaagagtcttc 8522438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 15992777 - 15992992
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15992777 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcattccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 15992876  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  15992877 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 15992969  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  15992970 tcaagcact-aagcaagagacttc 15992992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22147334 - 22147120
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22147334 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 22147235  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  22147234 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 22147143  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  22147142 tcaagcact-aagcaagagacttc 22147120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23297091 - 23296874
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23297091 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 23296992  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  23296991 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 23296899  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23296898 gctcaagcact-aagcaagagacttc 23296874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23307659 - 23307442
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23307659 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 23307560  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  23307559 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 23307467  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23307466 gctcaagcact-aagcaagagacttc 23307442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23708256 - 23708039
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23708256 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 23708157  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  23708156 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 23708064  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708063 gctcaagcact-aagcaagagacttc 23708039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 27622215 - 27622430
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27622215 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27622314  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc--acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||  | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  27622315 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcataaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 27622407  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  27622408 tcaagcact-aagcaagagacttc 27622430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 30226942 - 30227159
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30226942 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 30227041  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  30227042 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 30227134  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30227135 gctcaagcact-aagcaagagacttc 30227159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 30237469 - 30237686
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30237469 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 30237568  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  30237569 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 30237661  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30237662 gctcaagcact-aagcaagagacttc 30237686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 33951246 - 33951463
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33951246 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 33951345  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  33951346 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 33951438  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33951439 gctcaagcact-aagcaagagacttc 33951463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34772722 - 34772507
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34772722 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactaccaaggagattt 34772623  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| | |||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  34772622 -cact-----ataatcacaaaaattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 34772530  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  34772529 tcaagcact-aagcaagagacttc 34772507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34783667 - 34783452
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34783667 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactaccaaggagattt 34783568  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| | |||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  34783567 -cact-----ataatcacaaaaattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 34783475  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  34783474 tcaagcact-aagcaagagacttc 34783452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 37728674 - 37728915
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37728674 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 37728771  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  37728772 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 37728863  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37728864 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 37728915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 37739990 - 37740231
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37739990 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 37740087  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  37740088 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 37740179  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37740180 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 37740231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 40513435 - 40513652
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40513435 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 40513534  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  40513535 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 40513627  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40513628 gctcaagcact-aagcaagagacttc 40513652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42043598 - 42043381
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42043598 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 42043499  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  42043498 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 42043406  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42043405 gctcaagcact-aagcaagagacttc 42043381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42054173 - 42053956
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42054173 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 42054074  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  42054073 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 42053981  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42053980 gctcaagcact-aagcaagagacttc 42053956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22560224 - 22560034
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||| | |||||    
T  22560224 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcataaagatt 22560131  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22560130 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 22560034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36085248 - 36085058
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||| || |||||    
T  36085248 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcgcaaagatt 36085155  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||| |||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36085154 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 36085058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37407440 - 37407245
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||    
T  37407440 aaagcgagacacaagcagttatcctcgttccttccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca 37407347  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 262  Q
     |||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||     
T  37407346 aagattacaaatgttcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagt 37407249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6976596 - 6976406
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  6976596 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 6976503  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6976502 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 6976406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6987086 - 6986896
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  6987086 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 6986993  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6986992 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 6986896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 14446423 - 14446664
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14446423 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 14446520  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgtt 213  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |    
T  14446521 gtcccccttgcactttcaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgct 14446612  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14446613 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 14446664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 14457035 - 14457276
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14457035 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 14457132  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgtt 213  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |    
T  14457133 gtcccccttgcactttcaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgct 14457224  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14457225 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 14457276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 14557463 - 14557680
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14557463 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 14557562  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||      |||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  14557563 -cact-----ttaatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 14557655  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14557656 gctcaagcact-aagcaagagacttc 14557680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 14568100 - 14568317
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14568100 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 14568199  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||      |||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  14568200 -cact-----ttaatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 14568292  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14568293 gctcaagcact-aagcaagagacttc 14568317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17607872 - 17607656
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17607872 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatactggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 17607773  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  17607772 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 17607681  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17607680 gctcaagcact-aagcaagagacttc 17607656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17618487 - 17618271
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17618487 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatactggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 17618388  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  17618387 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 17618296  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17618295 gctcaagcact-aagcaagagacttc 17618271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22676904 - 22676714
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  22676904 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 22676811  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22676810 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 22676714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22686795 - 22686605
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  22686795 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 22686702  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22686701 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 22686605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23697598 - 23697381
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23697598 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 23697499  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||  |||||| ||||||| |||||  |    
T  23697498 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcacgcacacacgcaagagtcttccaat 23697406  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23697405 gctcaagcact-aagcaagagacttc 23697381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31419475 - 31419260
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| | ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31419475 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagaagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 31419376  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     |||||||||  |||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  31419375 -cact-----ataatcacaaggattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 31419283  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  31419282 tcaagcact-aagcaagagacttc 31419260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31449366 - 31449151
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31449366 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 31449267  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     |||||||||  |||||||| || ||||||||   |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  31449266 -cact-----ataatcacaaggattacaactgatcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaaccacacacgcaagagtcttccaatgc 31449174  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  31449173 tcaagcact-aagcaagagacttc 31449151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31834299 - 31834080
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31834299 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 31834200  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac------aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcct 238  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||      ||||| |||| |||||| ||||||| |||||     
T  31834199 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 31834107  T
Q  239 ttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31834106 atgctcaagcact-aagcaagagacttc 31834080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31844777 - 31844558
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31844777 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 31844678  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac------aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcct 238  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||      ||||| |||| |||||| ||||||| |||||     
T  31844677 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 31844585  T
Q  239 ttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31844584 atgctcaagcact-aagcaagagacttc 31844558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35216319 - 35216103
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35216319 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 35216220  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  35216219 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 35216128  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35216127 gctcaagcact-aagcaagagacttc 35216103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35226903 - 35226687
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35226903 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 35226804  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  35226803 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 35226712  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35226711 gctcaagcact-aagcaagagacttc 35226687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Original strand, 39490423 - 39490613
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  39490423 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 39490516  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39490517 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 39490613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Original strand, 39501613 - 39501803
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  39501613 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 39501706  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39501707 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 39501803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19464759 - 19464568
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||  |||||    
T  19464759 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacgaagatt 19464666  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19464665 acaaaatgctcaatact-ctctaagtatgagactactcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 19464568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20552603 - 20552412
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  20552603 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 20552510  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  20552509 acaaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtact-aagcaagagtcttc 20552412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 43621366 - 43621557
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  43621366 agacacaagcagttatcctggttccttccacagatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 43621459  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43621460 acaaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 43621557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 182
Target Start/End: Original strand, 21705418 - 21705543
Alignment:
Q  52 agtagagagaagaaaga-gagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  21705418 agtagagaaaagaaaaacgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact- 21705515  T
Q  151 agtaataatcacacagattacaaatgctcaat 182  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21705516 ----ataatcacaaagattacaaatgctcaat 21705543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 24925610 - 24925802
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  24925610 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 24925703  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa---atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    || |||||||||||||| | |  ||||||||| ||| |||   ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||    
T  24925704 acaaaatgctcaatact-ctctaagtatgagatttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtctt 24925801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 24982891 - 24983083
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  24982891 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 24982984  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa---atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    || |||||||||||||| | |  || |||||||||| |||   ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||    
T  24982985 acaaaatgctcaatact-ctctaagcatgagacttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtctt 24983082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 9376909 - 9377125
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9376909 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 9377008  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  9377009 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 9377100  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9377101 gctcaagcact-aagcaagagacttc 9377125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14030857 - 14030641
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14030857 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 14030758  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  14030757 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 14030666  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14030665 gctcaagcact-aagcaagagacttc 14030641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14041410 - 14041194
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14041410 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 14041311  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  14041310 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 14041219  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14041218 gctcaagcact-aagcaagagacttc 14041194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 15693479 - 15693695
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15693479 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 15693578  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  15693579 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 15693670  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15693671 gctcaagcact-aagcaagagacttc 15693695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15740781 - 15740565
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15740781 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 15740682  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  15740681 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 15740590  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15740589 gctcaagcact-aagcaagagacttc 15740565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15769941 - 15769725
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15769941 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 15769842  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  15769841 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 15769750  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15769749 gctcaagcact-aagcaagagacttc 15769725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17719730 - 17719514
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17719730 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 17719631  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  17719630 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 17719539  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17719538 gctcaagcact-aagcaagagacttc 17719514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17730382 - 17730166
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17730382 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 17730283  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  17730282 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 17730191  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17730190 gctcaagcact-aagcaagagacttc 17730166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20563110 - 20562922
Alignment:
Q  73 cacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac- 171  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||     
T  20563110 cacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattaca 20563017  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  20563016 aaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagtact-aagcaagagtcttc 20562922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24567902 - 24567686
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24567902 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 24567803  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  24567802 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 24567711  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24567710 gctcaagcact-aagcaagagacttc 24567686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 24816333 - 24816549
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24816333 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 24816432  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  24816433 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 24816524  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24816525 gctcaagcact-aagcaagagacttc 24816549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 24826921 - 24827137
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24826921 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 24827020  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  24827021 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 24827112  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24827113 gctcaagcact-aagcaagagacttc 24827137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27460974 - 27460758
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27460974 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27460875  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  27460874 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 27460783  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27460782 gctcaagcact-aagcaagagacttc 27460758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27471373 - 27471157
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27471373 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27471274  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  27471273 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 27471182  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27471181 gctcaagcact-aagcaagagacttc 27471157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19478789 - 19478598
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||  |||||    
T  19478789 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacgaagatt 19478696  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || ||||| |||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19478695 acaaaatgttcaatact-ctctaagtatgagactactcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 19478598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24808725 - 24808509
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24808725 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacatgcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 24808626  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||      |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  24808625 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-tttaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 24808534  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24808533 gctcaagcact-aagcaagagacttc 24808509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Original strand, 27041702 - 27041875
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||      
T  27041702 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-t 27041793  T
Q  188 acctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27041794 tcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 27041875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Original strand, 27052326 - 27052499
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||      
T  27052326 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-t 27052417  T
Q  188 acctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27052418 tcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 27052499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31349303 - 31349130
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||      
T  31349303 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-t 31349212  T
Q  188 acctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31349211 tcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 31349130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31359917 - 31359744
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||      
T  31359917 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-t 31359826  T
Q  188 acctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31359825 tcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 31359744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36688507 - 36688291
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36688507 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 36688408  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||  ||||||| |||||  |    
T  36688407 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtcttccaat 36688316  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36688315 gctcaagcact-aagcaagagacttc 36688291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36699073 - 36698857
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36699073 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 36698974  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||  ||||||| |||||  |    
T  36698973 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtcttccaat 36698882  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36698881 gctcaagcact-aagcaagagacttc 36698857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7746502 - 7746404
Alignment:
Q  43 taaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  7746502 taaaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 7746404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26056282 - 26056193
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26056282 agagagaagagaaagacaca-aagcaattatcttggttccttccacaatccagaagtagtccagtcccccttgaacttccaatgatatttc 26056193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 21659563 - 21659640
Alignment:
Q  65 aagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  21659563 aagagagacacaaatcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcactttcaaggaga 21659640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28465118 - 28464950
Alignment:
Q  70 agacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacaga 167  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||      | ||    
T  28465118 agacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata-----tctga 28465025  T
Q  168 ttacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  28465024 ttacaaatgctcactactaaacttagtaagagactt--caaatgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 28464950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 10848128 - 10848297
Alignment:
Q  70 agacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacaga 167  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||      | ||    
T  10848128 agacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata-----tctga 10848221  T
Q  168 ttacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| || || |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  10848222 ttacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttca-aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 10848297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13546293 - 13546216
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaata 157  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  13546293 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaagtaata 13546216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30116632 - 30116449
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaag 152  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |||| || ||||| |    
T  30116632 agagagagggaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcatttccaaggagagtt-cactatg 30116534  T
Q  153 taataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    |||||      | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  30116533 taata-----tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 30116449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 31117254 - 31117306
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31117254 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 31117306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 238
Target Start/End: Original strand, 4886314 - 4886482
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||         
T  4886314 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagtt-cactatgtaata----- 4886407  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcct 238  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| || || |||||||||   ||||||||||||||    
T  4886408 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttca-aattgctcaaacacaattgcaagagacttcct 4886482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9399413 - 9399326
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  9399413 agagagaaagaagagagacacaaaacaattatacaagttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 9399326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 13403639 - 13403698
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagt-aaaaacagagtagaga 59  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13403639 attgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagaga 13403698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22000824 - 22000737
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  22000824 agagagaaggaagaaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaaaccagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 22000737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 135
Target Start/End: Original strand, 6498653 - 6498735
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttcca 135  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6498653 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttcca 6498735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Original strand, 17814295 - 17814392
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  17814295 aaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgctcttccaaggaga 17814392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26766632 - 26766550
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  26766632 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcatttccaa 26766550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 90195 - 90138
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  90195 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaa 90138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25097601 - 25097536
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  25097601 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttccaaggaga 25097536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25155571 - 25155506
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  25155571 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttccaaggaga 25155506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 32160277 - 32160330
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32160277 tcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 32160330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35932793 - 35932720
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35932793 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 35932720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 273
Target Start/End: Original strand, 12078360 - 12078420
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12078360 tcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgct 12078420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23413790 - 23413684
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  23413790 gcagcgga-taaaaacaggg-agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttacacaaaccggaagtagtcttgtccccctttcactt 23413693  T
Q  133 ccaatgaga 141  Q
    |||| ||||    
T  23413692 ccaaggaga 23413684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 31589715 - 31589651
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31589715 agcaattatacaggttcattccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 31589651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26120593 - 26120531
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  26120593 caattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgtacttccaaggaga 26120531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 28138955 - 28139033
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28138955 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaaaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgaga 28139033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11208618 - 11208565
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11208618 tcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttc 11208565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 11993265 - 11993318
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11993265 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 11993318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 23477915 - 23477956
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23477915 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 23477956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 23880428 - 23880493
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  23880428 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccggatgtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 23880493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25112474 - 25112433
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25112474 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 25112433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25171565 - 25171524
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25171565 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 25171524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 26783716 - 26783781
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  26783716 aagcaattatacaggttccttcaacaaaccggaagtagtattgtcccccttgcacttccaaagaga 26783781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 40228199 - 40228240
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40228199 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 40228240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 6513228 - 6513140
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6513228 agagagaaagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 6513140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20215713 - 20215673
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20215713 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 20215673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 643461 - 643410
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  643461 gttccttctacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 643410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21199762 - 21199719
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21199762 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcactt 21199719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3246227 - 3246091
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||         
T  3246227 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaacggaagtcggtcctgtcctccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata----- 3246134  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca 205  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  3246133 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttca 3246091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 141
Target Start/End: Original strand, 26764883 - 26764933
Alignment:
Q  92 tccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26764883 tccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 26764933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29139190 - 29139112
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  29139190 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggaga 29139112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 33932619 - 33932697
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  33932619 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcttgtcccccttgcacttccaaggaga 33932697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13736847 - 13736782
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  13736847 agcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 13736782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Original strand, 20968613 - 20968670
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  20968613 caattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcctccttgcacttccaa 20968670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26119329 - 26119272
Alignment:
Q  68 agagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccct 125  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26119329 agagacacgatcaattatcatggttccttccacaatccggaagtagtctagtccccct 26119272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Original strand, 30742333 - 30742406
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30742333 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaccaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 30742406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 16607020 - 16607068
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16607020 gcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgct 16607068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 31487578 - 31487666
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  31487578 agagagaaaaaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacagaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 31487666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 33022040 - 33022092
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  33022040 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggaga 33022092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 141
Target Start/End: Original strand, 15516329 - 15516400
Alignment:
Q  72 acacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15516329 acacaagcaatttatacaggttcctaccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 15516400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19537058 - 19537007
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  19537058 gttccttccacaaatcggaagtagtcatgtcctccttgcacttccaaggaga 19537007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21100475 - 21100412
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||||||||    
T  21100475 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtcattactgtcccccttgcatttccaatgaga 21100412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 136
Target Start/End: Original strand, 9088300 - 9088394
Alignment:
Q  45 aaaacagag-tagagagaagaaagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||    
T  9088300 aaaacagagatagagagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaatcggaaatcagtcttgtcccccttgcacttccaa 9088394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12353570 - 12353504
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  12353570 aagcaattatacatgttccttccacaagccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 12353504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35987019 - 35986883
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| ||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| | || || ||||| ||||||         
T  35987019 aagaaagacacaagcagtttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcactaccaaggggagtt-cactatgtaata----- 35986926  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca 205  Q
     | ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  35986925 tctgattacaaatgttcactactaaacttagtatgagacttca 35986883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17263283 - 17263226
Alignment:
Q  205 acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||  ||||||||||    
T  17263283 acaaatgttcaaacacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagaga 17263226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 20968750 - 20968791
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20968750 gcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 20968791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22586593 - 22586540
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22586593 tcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaaccaagagacttc 22586540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 135
Target Start/End: Original strand, 16606901 - 16606937
Alignment:
Q  99 acaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 135  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16606901 acaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttcca 16606937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 20567315 - 20567363
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  20567315 gcaagaggtttcctttgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgct 20567363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 123
Target Start/End: Original strand, 22185435 - 22185487
Alignment:
Q  71 gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccc 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||    
T  22185435 gacacaagcaattatactggttccttacacaaaccgagagtagtatagtcccc 22185487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23392362 - 23392318
Alignment:
Q  93 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  23392362 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccctgcacttccaa 23392318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 39799486 - 39799434
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    |||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39799486 tcaagcacacaaacaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagactt 39799434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 61031 - 61294
Alignment:
Q  11 atgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  61031 atgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaag 61130  T
Q  111 tagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  61131 tagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattataactgctcaatactacacctagtatgagacttcgcaaat 61230  T
Q  211 gttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac-taaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  61231 gctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacaaaaagcaagagacttcctatgct 61294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 61276 - 61317
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  61276 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 61317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 161)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14711523 - 14711257
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaa-cagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14711523 attgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttcca 14711424  T
Q  100 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14711423 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 14711324  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14711323 acttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 14711257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14779187 - 14778921
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaa-cagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14779187 attgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttcca 14779088  T
Q  100 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14779087 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 14778988  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14778987 acttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 14778921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 19241543 - 19241805
Alignment:
Q  9 tgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccgga 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19241543 tgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagataaacacaagcaattatactggttccttccacaaaccgga 19241642  T
Q  109 agtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19241643 agtagtccagtcctccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagacttcacaa 19241740  T
Q  209 atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19241741 atgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 19241805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36210853 - 36210589
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  36210853 attgcttctgatgtgtagttcagaattggatacacagcggagtaaaaacagagtagagagaataaagagagacacaaacaattatactggttcgttccac 36210754  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36210753 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcacacagattacaactgctcaagactacacctagtatgaga 36210655  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36210654 attcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 36210589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18007815 - 18007562
Alignment:
Q  18 gttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18007815 gttcagaatcggatacgcatcggtgtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaggcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtcca 18007716  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||  || || ||||     
T  18007715 gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgcttaatact--acctagtatgagacttccaaattgctcaag 18007618  T
Q  218 cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18007617 cacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaatcaagagacttcctatgct 18007562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 266
Target Start/End: Original strand, 23508677 - 23508922
Alignment:
Q  19 ttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccag 118  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23508677 ttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttcattccacaaaccggaagtagtcaag 23508776  T
Q  119 tcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaac 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  23508777 tcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagacttctcaaatgctcaagc 23508874  T
Q  219 acacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23508875 acgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 23508922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16820063 - 16819829
Alignment:
Q  30 atacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgca 129  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16820063 atacgcagcggaataaaaacatagtagagaaaagaaacagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgca 16819964  T
Q  130 cttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaag 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||    
T  16819963 cttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--aactagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgag 16819866  T
Q  230 agacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16819865 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 16819829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18775398 - 18775156
Alignment:
Q  29 gatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgc 128  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775398 gatacgcagcggaataaaagttgagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgc 18775299  T
Q  129 acttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaa 228  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||  |||||||| |||||| |||| ||| ||||| |    
T  18775298 acttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatact--gcctagtgggagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcga 18775201  T
Q  229 gagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  18775200 gagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgct 18775156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49002721 - 49002464
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  49002721 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagagagacacaaccaattattctggttccttccacaa 49002622  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||    
T  49002621 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatcacacagattacagatgctcaatact--ctctagtatgagact 49002528  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| || || ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  49002527 tctcaaatgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 49002464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 33377696 - 33377966
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33377696 ttgcttctgatgtgcagttcagaattgtatatgcagcggagtaaat-cagagtaagatagaagatagaaagacacaggcaattatactggttccttccac 33377794  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33377795 aaaccggaagtagtccagtccccattacacttccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaacttctcaatactacacctagtatgag 33377893  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33377894 acttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 33377966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 11514554 - 11514811
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  11514554 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgtagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagatgcaagcaattatcctggttccttccacaa 11514652  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  11514653 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 11514747  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11514748 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 11514811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 55650848 - 55651099
Alignment:
Q  9 tgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccgga 108  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  55650848 tgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaatagaacagagaaaagaaagagagacacaaacaattatcctggttccttctacaaaccgga 55650947  T
Q  109 agtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||| |||    
T  55650948 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaa----aatcacacagattacagatgctcaatactct--ctagtatgagacttctcaa 55651041  T
Q  209 atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  55651042 atgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 55651099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18775715 - 18775514
Alignment:
Q  29 gatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgc 128  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18775715 gatacgcagcggaataaaagtagagtagagaaaagaaagagagacacaaacaattatcctggttccttccacgaaccggaagtagtccagtcccccttgc 18775616  T
Q  129 acttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaa 228  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||    
T  18775615 acttccaacgagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatact--gcctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcaa 18775518  T
Q  229 gaga 232  Q
    ||||    
T  18775517 gaga 18775514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31267532 - 31267275
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31267532 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 31267434  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| || ||||||||||||||||||| | | |  |||||||||||    
T  31267433 accggaagtagtccagt-ccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatctcaaagattacaaatgctcaata-ttctctaagtatgagact 31267340  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31267339 tctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 31267275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 11535364 - 11535621
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11535364 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagtagagaaaggaaagaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 11535462  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  11535463 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 11535556  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11535557 tctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 11535621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 10300053 - 10300311
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaa-gagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    ||||| ||||||| || | | |||| |||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10300053 tgcttctgatgtgatgataataatcagatatgcagcggaataaaa-cagcgcagagaaaagaaaagcgagacacaagcaattatcctggttccttccaca 10300151  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||    
T  10300152 aatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagac 10300245  T
Q  202 ttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| | ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10300246 ttctcaaaatgctcaagcacgcaggctagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 10300311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17994494 - 17994362
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17994494 attgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcaacggagtaaaaacag--tagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttctac 17994397  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17994396 aaaccggaagtagtccagtccccc-tgcacttccaa 17994362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18776046 - 18775913
Alignment:
Q  29 gatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgc 128  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18776046 gatacgcagcggaataaaagtagagtagagaaaagaaagagagacacaaacaattatcctggttccttccacgaaccggaagtagtccagtcccccttgc 18775947  T
Q  129 acttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  18775946 acttccaacgagatttccactatgaaataatcac 18775913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Original strand, 10290144 - 10290321
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaa-gagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10290144 tgcttctgatgtgatgatcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcaattatcctggttccttccaca 10290242  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatact 185  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10290243 aatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact 10290321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40455073 - 40454832
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40455073 tcagaatcagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca 40454975  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||    
T  40454974 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctca 40454882  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  40454881 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 40454832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40471311 - 40471070
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40471311 tcagaatcagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca 40471213  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||    
T  40471212 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctca 40471120  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  40471119 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 40471070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 39532401 - 39532269
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  39532401 aaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttacaaggagattt 39532302  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaa 181  Q
     ||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  39532301 tcactaaa----aatcacacagattacaaatgctcaa 39532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47152721 - 47152532
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  47152721 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 47152628  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  47152627 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 47152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 5022273 - 5022512
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5022273 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 5022370  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  || |||    
T  5022371 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataattacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctca 5022463  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  5022464 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 5022512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 24712964 - 24713191
Alignment:
Q  21 cagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaa-gagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagt 119  Q
    ||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24712964 cagaatcagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagt 24713062  T
Q  120 cccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaac 218  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  | ||||| |||| |    
T  24713063 ccccattgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttttcaaaatgctcaagc 24713156  T
Q  219 acacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
    || |||| ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  24713157 acgcaggaaagagtcttccaatgctcaagcactaa 24713191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Original strand, 3370281 - 3370477
Alignment:
Q  52 agtagagagaagaaaga-gagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  3370281 agtagagaaaagaaacacgagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact- 3370378  T
Q  151 agtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc---acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaag 247  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||   | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  3370379 ----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 3370473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 10695228 - 10695417
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  10695228 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 10695321  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10695322 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 10695417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18763797 - 18763582
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18763797 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 18763698  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  18763697 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 18763605  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  18763604 tcaagcact-aagcaagagacttc 18763582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27815643 - 27815428
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27815643 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27815544  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  27815543 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 27815451  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  27815450 tcaagcact-aagcaagagacttc 27815428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 48370693 - 48370908
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48370693 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 48370792  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  48370793 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 48370885  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  48370886 tcaagcact-aagcaagagacttc 48370908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 25656671 - 25656912
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25656671 tcagaatcagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca 25656769  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||  ||| ||||| |||    
T  25656770 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctca 25656862  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25656863 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 25656912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 10908994 - 10909184
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  10908994 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 10909087  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10909088 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 10909184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 450138 - 450353
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  450138 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 450237  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  450238 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 450330  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  450331 tcaagcact-aagcaagagacttc 450353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 4947899 - 4948114
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4947899 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4947998  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  4947999 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 4948091  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  4948092 tcaagcact-aagcaagagacttc 4948114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15561777 - 15561562
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15561777 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 15561678  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  15561677 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 15561585  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  15561584 tcaagcact-aagcaagagacttc 15561562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18753187 - 18752972
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18753187 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgctcttccaaggagattt 18753088  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  18753087 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 18752995  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  18752994 tcaagcact-aagcaagagacttc 18752972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19143677 - 19143504
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  19143677 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 19143584  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagc 248  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  19143583 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 19143504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19955660 - 19955445
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19955660 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 19955561  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  19955560 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 19955468  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  19955467 tcaagcact-aagcaagagacttc 19955445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 21995975 - 21996190
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21995975 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 21996074  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  21996075 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 21996167  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  21996168 tcaagcact-aagcaagagacttc 21996190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 22006573 - 22006788
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22006573 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 22006672  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  22006673 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 22006765  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  22006766 tcaagcact-aagcaagagacttc 22006788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30927192 - 30926977
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30927192 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 30927093  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  30927092 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 30927000  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  30926999 tcaagcact-aagcaagagacttc 30926977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 16304693 - 16304883
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  16304693 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 16304786  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16304787 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 16304883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 16316917 - 16317107
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  16316917 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 16317010  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16317011 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 16317107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 17917613 - 17917829
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17917613 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 17917712  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||||   || |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  17917713 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 17917805  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  17917806 ctcaagcact-aagcaagagacttc 17917829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 17928261 - 17928477
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17928261 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 17928360  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||||   || |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  17928361 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 17928453  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  17928454 ctcaagcact-aagcaagagacttc 17928477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 25008482 - 25008672
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  25008482 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 25008575  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25008576 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 25008672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 266
Target Start/End: Original strand, 5872957 - 5873147
Alignment:
Q  69 gagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagat 168  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||    
T  5872957 gagacacaagcagttatcctggttcctcccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagat 5873050  T
Q  169 tacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||  |||| ||| |||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5873051 tacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 5873147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 266
Target Start/End: Original strand, 19580830 - 19581016
Alignment:
Q  73 cacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattaca 172  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||    
T  19580830 cacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattaca 19580923  T
Q  173 aatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19580924 aatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggaaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 19581016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 460719 - 460934
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  460719 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 460818  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||| | |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  460819 -cact-----ataatcacaaagattactactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 460911  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  460912 tcaagcact-aagcaagagacttc 460934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Original strand, 3390021 - 3390217
Alignment:
Q  52 agtagagagaagaaaga-gagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  3390021 agtagagaaaagaaacacgagacacgagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact- 3390118  T
Q  151 agtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc---acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaag 247  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||   | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  3390119 ----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 3390213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14844351 - 14844136
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14844351 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 14844252  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||| ||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  14844251 -cact-----ataatcacaaagattacaactgcttaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 14844159  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  14844158 tcaagcact-aagcaagagacttc 14844136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 16255428 - 16255642
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16255428 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 16255527  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  16255528 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 16255619  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  16255620 tcaagcact-aagcaagagacttc 16255642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 16266021 - 16266235
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16266021 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 16266120  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  16266121 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 16266212  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  16266213 tcaagcact-aagcaagagacttc 16266235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18078579 - 18078389
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  18078579 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 18078486  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18078485 aaatgctcaatacta-tctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagaggcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 18078389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18130940 - 18130723
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18130940 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 18130841  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  18130840 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 18130748  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18130747 gctcaagcact-aagcaagagacttc 18130723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19945025 - 19944810
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  ||||||| || ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19945025 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaaacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 19944926  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  19944925 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 19944833  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  19944832 tcaagcact-aagcaagagacttc 19944810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 24639784 - 24640025
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24639784 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 24639881  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  24639882 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 24639973  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24639974 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 24640025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 27656160 - 27656377
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27656160 aacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27656259  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  27656260 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 27656352  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27656353 gctcaagcact-aagcaagagacttc 27656377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 27666733 - 27666950
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27666733 aacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27666832  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  27666833 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 27666925  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27666926 gctcaagcact-aagcaagagacttc 27666950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29042380 - 29042139
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29042380 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 29042283  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  29042282 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 29042191  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29042190 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 29042139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30937770 - 30937555
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30937770 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagttccccttgcacttccaaggagattt 30937671  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  30937670 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 30937578  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  30937577 tcaagcact-aagcaagagacttc 30937555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 52703350 - 52703565
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  52703350 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagattt 52703449  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  52703450 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 52703542  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  52703543 tcaagcact-aagcaagagacttc 52703565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24028786 - 24028568
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24028786 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaatacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 24028687  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctt 239  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||     ||||| |||| |||||| ||||||| |||||      
T  24028686 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 24028594  T
Q  240 tgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24028593 tgctcaagcact-aagcaagagacttc 24028568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 55745951 - 55745735
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55745951 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 55745852  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  55745851 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 55745760  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  55745759 gctcaagcact-aagcaagagacttc 55745735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 55756562 - 55756346
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55756562 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 55756463  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  55756462 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 55756371  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  55756370 gctcaagcact-aagcaagagacttc 55756346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14836775 - 14836585
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  14836775 agacacaagcatttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 14836682  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||  | || |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14836681 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 14836585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15208057 - 15207871
Alignment:
Q  73 cacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattaca 172  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |      ||||||||  ||||||||    
T  15208057 cacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacc------ataatcactaagattaca 15207964  T
Q  173 aatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| ||  |||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15207963 aatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 15207871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10741293 - 10741077
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10741293 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 10741194  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  10741193 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 10741102  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10741101 gctcaagcact-aagcaagagacttc 10741077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10955062 - 10954846
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10955062 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 10954963  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  10954962 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 10954871  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10954870 gctcaagcact-aagcaagagacttc 10954846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 36017897 - 36018113
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36017897 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 36017996  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  36017997 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 36018088  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36018089 gctcaagcact-aagcaagagacttc 36018113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 36028450 - 36028666
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36028450 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 36028549  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  36028550 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 36028641  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36028642 gctcaagcact-aagcaagagacttc 36028666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 49517696 - 49517912
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49517696 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 49517795  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  49517796 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 49517887  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49517888 gctcaagcact-aagcaagagacttc 49517912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10751867 - 10751652
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10751867 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 10751768  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  10751767 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 10751676  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  10751675 gctcaagcact-aagcaagagactt 10751652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10965636 - 10965421
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10965636 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 10965537  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  10965536 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 10965445  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  10965444 gctcaagcact-aagcaagagactt 10965421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17994360 - 17994271
Alignment:
Q  175 tgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17994360 tgctcaatactac--ctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 17994271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 184
Target Start/End: Original strand, 19570607 - 19570711
Alignment:
Q  74 acaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaa 173  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||||    
T  19570607 acaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaa 19570700  T
Q  174 atgctcaatac 184  Q
    |||||||||||    
T  19570701 atgctcaatac 19570711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8183613 - 8183503
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  8183613 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 8183520  T
Q  170 acaaatgctcaatacta 186  Q
    |||||||||||||||||    
T  8183519 acaaatgctcaatacta 8183503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9921072 - 9920972
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9921072 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 9920973  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  9920972 c 9920972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Original strand, 28050125 - 28050225
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28050125 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 28050224  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  28050225 c 28050225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4987045 - 4986893
Alignment:
Q  108 aagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||     |||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||    
T  4987045 aagtagtccagtcccccttacacttccaagcagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctca 4986953  T
Q  208 aa--tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||  || ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4986952 aaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 4986893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Original strand, 49509539 - 49509639
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49509539 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 49509638  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  49509639 c 49509639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3189100 - 3188988
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3189100 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 3189003  T
Q  118 gtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||||||||||    
T  3189002 gtcccccttgcactt 3188988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17199162 - 17199087
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17199162 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttc 17199087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19889751 - 19889665
Alignment:
Q  54 tagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||| | ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19889751 tagagagaagagaaagacaca-aagaaattatataggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 19889665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 16939349 - 16939522
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||         
T  16939349 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata----- 16939442  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     | |||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  16939443 tctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 16939522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20649561 - 20649445
Alignment:
Q  17 tgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagt 114  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  20649561 tgttcagaattagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagt 20649463  T
Q  115 ccagtcccccttgcactt 132  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20649462 ccagtcccccttgcactt 20649445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 29030266 - 29030156
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29030266 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 29030169  T
Q  118 gtcccccttgcac 130  Q
    |||||||||||||    
T  29030168 gtcccccttgcac 29030156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 265
Target Start/End: Original strand, 18473427 - 18473607
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaat 175  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| |  |  | ||||||||||    
T  18473427 aagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttc-actaa--aatcaatat-ctgattacaaat 18473522  T
Q  176 gctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    ||||||   ||||   || | |||||||||  |||  |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18473523 gctcaagcataca---agcaagagacttca--aatactcaaccacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagactt 18473607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15475910 - 15475850
Alignment:
Q  65 aagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccc 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15475910 aagagagacacaaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagcccccc 15475850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 141
Target Start/End: Original strand, 13693201 - 13693272
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  13693201 agacacaagcaattatacaggttccttccataatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 13693272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16476115 - 16476064
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16476115 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaatgaga 16476064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 23749862 - 23749949
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  23749862 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacagattccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 23749949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 244
Target Start/End: Original strand, 55731203 - 55731369
Alignment:
Q  72 acacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||      | ||||    
T  55731203 acacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata-----tctgatt 55731296  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||    
T  55731297 acaaatgttcactactaaacttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaaatgcaagagacttcctatgctc 55731369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 273
Target Start/End: Original strand, 1671899 - 1671941
Alignment:
Q  231 gacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1671899 gacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 1671941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9752277 - 9752106
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtag-tccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   || ||| |||| ||||||      | |||||||||||||||||||||     
T  9752277 ggttccttccacaaaccggaagtcggtcctgtcccccttgcacttccaagaggagttc-actatgtaatat-----ctgattacaaatgctcaatactaa 9752184  T
Q  188 acctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || ||||||||||||||| || || |||| ||||   ||||||||| |||| |||||||| || | | |||||||||||    
T  9752183 acttagtatgagacttca-aattgctcaagcacaactgcaagagacatcctatgctcaagaacaagatcaagagacttc 9752106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18775191 - 18775133
Alignment:
Q  208 aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18775191 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 18775133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 19884093 - 19884159
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19884093 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 19884159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 37986385 - 37986307
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    ||||||||  |||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37986385 agagagaaataagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcactt 37986307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8997830 - 8997740
Alignment:
Q  155 ataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaag 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  8997830 ataatcacacagattacaattgctcaatact--atctagtacgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 8997740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Original strand, 11900555 - 11900616
Alignment:
Q  80 aattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  11900555 aattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 11900616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 16852841 - 16852930
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16852841 agagagaaggaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 16852930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17788791 - 17788726
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  17788791 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcatttccaaggaga 17788726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 22089646 - 22089711
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  22089646 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaattagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 22089711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 36470318 - 36470395
Alignment:
Q  66 agagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  36470318 agagagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 36470395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 41115508 - 41115443
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  41115508 aagcaattatacaggttccttcctcaaaccggaagtagccctgtcccccttgcacttccaaggaga 41115443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Original strand, 3394969 - 3395075
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  3394969 gcagcgga-taaaaatagag-agagagaaggaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtagtcatgtccctcttgcactt 3395066  T
Q  133 ccaatgaga 141  Q
    |||| ||||    
T  3395067 ccaaggaga 3395075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Original strand, 11915053 - 11915121
Alignment:
Q  69 gagacaca-agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11915053 gagacacagagcaattatacaggttccttccacaaaccagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaa 11915121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20571745 - 20571685
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20571745 aagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaa 20571685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22676295 - 22676207
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||  ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22676295 agagagagaaaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggaga 22676207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Original strand, 6516805 - 6516914
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagaga-aga-aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgca 129  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  6516805 gcagcgga-taaaaacagag-agagagagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgca 6516902  T
Q  130 cttccaatgaga 141  Q
    ||||||| ||||    
T  6516903 cttccaaggaga 6516914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 12600134 - 12600185
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12600134 gttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgaacttccaaggaga 12600185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17701519 - 17701440
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17701519 aaagaaagacacaggcaatttatacaggttccttcaacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgaga 17701440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 55379648 - 55379735
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  55379648 agagagaaagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaacggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 55379735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14154758 - 14154680
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  14154758 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 14154680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14903183 - 14903098
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  14903183 agagagaagagaaagacaca-aagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagtagtcctgtctcccttgcacttccaaggaga 14903098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 16631800 - 16631866
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  16631800 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 16631866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 16847885 - 16847974
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaa--ttatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16847885 agagagaaggaagaaagacacaaagaaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 16847974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 19665725 - 19665791
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  19665725 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 19665791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29681264 - 29681202
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  29681264 caattatacaggttccttccacaaaccagaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 29681202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 54679288 - 54679354
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  54679288 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 54679354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 1671923 - 1671964
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1671923 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 1671964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3106181 - 3106007
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||         
T  3106181 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagttatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata----- 3106088  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     | ||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||| || || |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  3106087 tctgattacaaatgttcactactaaacttagtaagagacttca-aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 3106007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17399437 - 17399263
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||         
T  17399437 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata----- 17399344  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||| || || |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  17399343 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagtcttca-aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 17399263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 19241787 - 19241828
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19241787 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19241828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 33377948 - 33377989
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33377948 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 33377989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14605678 - 14605590
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14605678 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggaga 14605590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15015124 - 15015072
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  15015124 ggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccctttgcacttccaaggaga 15015072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 145
Target Start/End: Original strand, 7221924 - 7221975
Alignment:
Q  94 cttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7221924 cttccacaatctggaagtagtccagtccgccttgcactttcaatgagatttc 7221975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 8686180 - 8686129
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  8686180 gttccttccacaaaccggaagtagtcctgccccccttgcactttcaaggaga 8686129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14190171 - 14190096
Alignment:
Q  68 agagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14190171 agagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 14190096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 141
Target Start/End: Original strand, 56033948 - 56033999
Alignment:
Q  91 ttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  56033948 ttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgaga 56033999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10661917 - 10661863
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcac 130  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  10661917 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccacttgcac 10661863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10876062 - 10876008
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcac 130  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  10876062 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccacttgcac 10876008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 15135089 - 15135155
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaag-tagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  15135089 aagcagttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtccagtcccccttgcgcatccaaggaga 15135155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17527095 - 17527021
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  | | | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17527095 aagcaattattctggttccttccatgatcggaaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattttcacta 17527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 144
Target Start/End: Original strand, 24619069 - 24619147
Alignment:
Q  66 agagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| | ||||||||||  || ||||||||| ||   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24619069 agagagaaagaagcaattatcctgattccttccataatttggaagtagtctagtcccccatgcacttccaatgagattt 24619147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13576853 - 13576800
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  13576853 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagaga 13576800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 18773455 - 18773520
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18773455 aagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgccctttcaaggaga 18773520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19912630 - 19912577
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgca 129  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19912630 aagcaattatacaggttccttctacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgca 19912577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27189402 - 27189333
Alignment:
Q  69 gagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  27189402 gagacacaagcaatttatacaggttccttccacaagccggaagtcagtcctgtccctcttgcacttccaa 27189333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37436270 - 37436217
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  37436270 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 37436217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Original strand, 40860019 - 40860092
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  40860019 aagaaagacacaagcaatttatacaggctccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaa 40860092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 8103659 - 8103711
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  8103659 gttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggaga 8103711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Original strand, 9266802 - 9266854
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9266802 tcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagactt 9266854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18007579 - 18007539
Alignment:
Q  226 caagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18007579 caagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttc 18007539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 18393940 - 18394000
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  18393940 aagcaattattatggttccttccacaattcggaagtagtttactcccccttgcacttccaa 18394000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 136
Target Start/End: Original strand, 20976831 - 20976879
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  20976831 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 20976879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 6641059 - 6641109
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  6641059 gttccttccacaaaccg-aagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 6641109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 10072297 - 10072352
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  10072297 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttc 10072352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Original strand, 45832704 - 45832813
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagaga-aga-aagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgca 129  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  45832704 gcagcgga-taaaaacaga-tagagagacagagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccaaaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgca 45832801  T
Q  130 cttccaatgaga 141  Q
    ||||||| ||||    
T  45832802 cttccaaggaga 45832813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 205
Target Start/End: Original strand, 22190194 - 22190330
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||| | || || ||||| ||||||         
T  22190194 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgttcccgttgcacttccaaggggagtt-cactatgtaata----- 22190287  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca 205  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  22190288 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttca 22190330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 132
Target Start/End: Original strand, 2651212 - 2651265
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    ||||||||  |||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2651212 caattatacaggtttcttccataatccggaagtagtcctgtcccccttgcactt 2651265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 262
Target Start/End: Original strand, 7222034 - 7222083
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 262  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7222034 tcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagaga 7222083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 136
Target Start/End: Original strand, 10249309 - 10249354
Alignment:
Q  91 ttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  10249309 ttccttccacaaaccggaactagtcatgtcccccttgcacctccaa 10249354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16325230 - 16325181
Alignment:
Q  92 tccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  16325230 tccttccataatccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 16325181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19889571 - 19889518
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19889571 tcaagcacaaagacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 19889518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 10329055 - 10328987
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcc 121  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| || | |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10329055 agagagaagagagagagacacaaagcaatttatctcggttccttccacaatccagaagtaatccagtcc 10328987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19912516 - 19912468
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19912516 gcaagagacttcaaatgctcaagcactactgcaagagacttcctatgct 19912468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 269
Target Start/End: Original strand, 24619178 - 24619234
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttccta 269  Q
    |||| |||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24619178 tcaagcacacaagcaagagactttaaatgctcaagcacaaaagcaagagacttccta 24619234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 136
Target Start/End: Original strand, 38513281 - 38513329
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||    
T  38513281 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttacacttccaa 38513329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 39420441 - 39420389
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  39420441 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttacaaggaga 39420389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 60543 - 60809
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaa-acagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  60543 attgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttcca 60642  T
Q  100 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  60643 caaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 60742  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60743 acttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 60809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 211700 - 211788
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  211700 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcattcctgtcccccttgcacttccaaggaga 211788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 169)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19453381 - 19453109
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19453381 attgcttctgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattataccggttccttccac 19453282  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19453281 aaaccggaagtagtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaaaaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 19453182  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453181 cttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagatacttcttttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 19453109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7587014 - 7586744
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7587014 attgcttctgatgtattgtttagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccac 7586915  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  7586914 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacactgattacaactgctcaatact--acctagtatgaga 7586817  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7586816 cttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 7586744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 21127523 - 21127792
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21127523 attgcttttgatgtattgttcagaatcagacacgcagcggagtaaaaacagag-agagaaaagaaagagagacataagcaattatactggttccttccac 21127621  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21127622 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgaga 21127719  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21127720 cttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 21127792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 11234944 - 11235211
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  11234944 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactgattccttccacaa 11235042  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  11235043 accggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatact--atctagtatgagact 11235140  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235141 tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 11235211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 18554745 - 18555006
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18554745 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 18554844  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  18554845 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagact 18554942  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18554943 tcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 18555006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 11205421 - 11205681
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11205421 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccacaa 11205519  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  11205520 accagaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatact--atctagtatgagact 11205617  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11205618 tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 11205681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17609162 - 17608894
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17609162 ttgcttctgatgtgcagttcagaattggatatgcagcggagtaaaa-cagagaagagagaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccaca 17609064  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  17609063 aaccggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagattttcactaagt-ttaatcacacagattacaactactcaataccacacctagtataagac 17608965  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17608964 ttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 17608894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 31930898 - 31931159
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31930898 tgcttctgatgtgatgttcagaattagatatgcagcggaataaaaacaaagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 31930997  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  31930998 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagact 31931095  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31931096 tcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 31931159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12953849 - 12953590
Alignment:
Q  4 gcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaa 103  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  12953849 gcttctgatgtgatgttcagaattggatatgcagcggaataaaa-cagagtagagaaaagaaagagagacacaaacaattatcctggttccttccacaaa 12953751  T
Q  104 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagactt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  12953750 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaattgctcaatact--atctagtatgagactt 12953653  T
Q  204 cacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12953652 ctcaaatgctcaagcacgcaggctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaggcttc 12953590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25687498 - 25687238
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  25687498 tgcttctgatgtgatgttcataatcaaatatgcagcggaataaaaa-agagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatcctggttctttccacaa 25687400  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  25687399 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 25687302  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25687301 tcacaaatgctcaagcactcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 25687238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 20635013 - 20635283
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20635013 ttgcttctgatgtgcagttcagaataggataagcagcggaataaaa-cagagtaagagagaagaaagaaagacacaggcaattatactggttccttccac 20635111  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20635112 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgag 20635210  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||| || || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20635211 acttca-aactgctcaagcacgcaggcaagagacttcatttgctcaagtactaaagcaagagacttcctatgct 20635283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 25518132 - 25518394
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  25518132 attgcttctgatgtattgttcagaattagatacgcagcggagtaataacagagtagggaaaagaaagagagacacaaatagttatactggttccttccac 25518231  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  25518232 aacccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttccactaa-aaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgaga 25518328  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| ||||  || ||||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25518329 cttctcaaatgctcaagtacgcaggcaaaagactttcaatgctcaagcactacagcaagagtcttc 25518394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 22386096 - 22386366
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  22386096 ttgcttctgatgtgcagttcagaataggataagcagcggagtaaaa-cagagtaagagaaaagaaagaaagacacaggcaattatactggtttcttccac 22386194  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22386195 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatattacacctagtatgag 22386293  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||| || || ||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22386294 acttca-aattgctcaagtacgcaggcatgagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 22386366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 266
Target Start/End: Original strand, 17047049 - 17047295
Alignment:
Q  18 gttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17047049 gttcagaattagatatgcagcggaataagaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagtcca 17047148  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||     
T  17047149 gtcccccttgcacttccaaggagattttcactaaaaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atcaagtatgagacttctcaaatgctcaag 17047246  T
Q  218 cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17047247 catgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 17047295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 21119101 - 21119286
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21119101 attgcttatgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagag-agagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccac 21119199  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    | || ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21119200 atactggaagtagttcagtcccccttacacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactac 21119286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18835378 - 18835121
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18835378 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaat-agagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 18835280  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  18835279 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 18835186  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18835185 tctcaaaatgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 18835121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9934359 - 9934131
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9934359 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 9934260  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  9934259 accggaagtagtccagtccccctcgcacttccaaggagatttccac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact-ctcttagtacgagact 9934165  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttc 236  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| |||| ||||    
T  9934164 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttc 9934131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17742451 - 17742193
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  17742451 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctagttccttccacaa 17742352  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcac-ttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  17742351 accggaagtagtccagtcccccttgcactttttaaggagatttccac----taataatcgcacagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagac 17742258  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| |||| ||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17742257 ttctcaaatgctcaagcacgcaggcgggagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 17742193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 22308238 - 22308496
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22308238 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 22308336  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    | | |||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  22308337 tccgtaagtagtccagtcccccttgcacttcgaaggagattt----tcaataataatctcaaagattacaaatgctcaatact-ctcttagtatgagact 22308431  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22308432 tctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 22308496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 17063692 - 17063935
Alignment:
Q  17 tgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcc 116  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  17063692 tgttcagaattagatatgcagcggaataagaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagtct 17063791  T
Q  117 agtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagt-aataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttca 215  Q
    |    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||  | |  |||||||||||| |||||| |||    
T  17063792 a----cccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctcacagattacaattgttcaatact--atcatgtatgagacttctcaaatgctca 17063885  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17063886 aacacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 17063935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18826942 - 18826726
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18826942 aaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccataaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 18826843  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgct 243  Q
    |     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||    
T  18826842 c-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagatttctcaaaatgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgct 18826749  T
Q  244 caagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  18826748 caagcactaaagcaagagtcttc 18826726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17746530 - 17746272
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaa-gagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17746530 tgcttctgatgtgatgatcagaatcagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcaattatcctggttccttccaca 17746432  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||    
T  17746431 aatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagac 17746338  T
Q  202 ttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| | ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17746337 ttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 17746272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 31571865 - 31572123
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaa-gagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31571865 tgcttctgatgtgatgatcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcaattatcctggttccttccaca 31571963  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  31571964 aatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tctaagtatgagac 31572057  T
Q  202 ttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| | ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31572058 ttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 31572123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27167187 - 27166930
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||| |||| |||||||| |||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27167187 tgcttctgatgtgatgatcaaaatcagatatgcagcggaataaaat-agagtagagaaaagagagaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 27167089  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  27167088 atcggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 27166995  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27166994 tctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 27166930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 22292343 - 22292538
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22292343 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 22292441  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    |||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  22292442 tccggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagattttcac----taataatctcaaagattacaaatgctcaatact-ctcttagtatgagact 22292536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14070915 - 14070660
Alignment:
Q  19 ttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtc 115  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14070915 ttcagaatcagatgcacagcggagtacaaacagagtaagagagaaagaagaaagacacaggcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtc 14070816  T
Q  116 cagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttc 214  Q
      ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||| ||    
T  14070815 ttgtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagta-taatcacaactgattacaactgctcaatacttcaacaagtacgagacttca-aaatgctc 14070718  T
Q  215 aaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    || ||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  14070717 aagcacacaa-caagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgct 14070660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 25678860 - 25679028
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||  ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  25678860 tgcttctgatgtgatgtttagaatcaaatatgcagcagaataaaa-cagagtagagagaagaaagagagacacacgcaattatcctggttccttccacaa 25678958  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaa 173  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  25678959 accagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacatattacaa 25679028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 266
Target Start/End: Original strand, 29765045 - 29765244
Alignment:
Q  62 agaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     | |||||||||    
T  29765045 agaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcctccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatca 29765139  T
Q  162 cacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaaga 260  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  29765140 caaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaaga 29765238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 26043730 - 26043920
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  26043730 agacacaagcaattatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 26043823  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26043824 acaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaagctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 26043920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 260
Target Start/End: Original strand, 5844605 - 5844788
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| |||||||    
T  5844605 acacaagcaattatcctgcttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattac 5844699  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaaga 260  Q
    ||||||||||||||   |  ||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  5844700 aaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaaga 5844788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 32756912 - 32757106
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||    
T  32756912 aaagcgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca 32757005  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagag 261  Q
     |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  32757006 aagattacaaatgctcaatact---ctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagag 32757101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 3671540 - 3671755
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3671540 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 3671639  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  3671640 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatacttc-ctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 3671732  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  3671733 tcaagcac-aaagcaagagacttc 3671755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9113198 - 9112983
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9113198 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagattt 9113099  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  9113098 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9113006  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9113005 tcaagcact-aagcaagagacttc 9112983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9123835 - 9123620
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9123835 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 9123736  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  9123735 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9123643  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9123642 tcaagcact-aagcaagagacttc 9123620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20030582 - 20030392
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  20030582 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 20030489  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20030488 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 20030392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 3660876 - 3661091
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3660876 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgaaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 3660975  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  3660976 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatacttc-ctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 3661068  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  3661069 tcaagcac-aaagcaagagacttc 3661091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 27383926 - 27384142
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27383926 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27384025  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     |||||||   ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||  |||    
T  27384026 tcact-----ataatcaacaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgc 27384119  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  27384120 tcaagcact-aagcaagagacttc 27384142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 27474310 - 27474526
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27474310 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27474409  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     |||||||   ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||  |||    
T  27474410 tcact-----ataatcaacaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgc 27474503  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  27474504 tcaagcact-aagcaagagacttc 27474526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 27503808 - 27504024
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27503808 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27503907  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     |||||||   ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||  |||    
T  27503908 tcact-----ataatcaacaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgc 27504001  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  27504002 tcaagcact-aagcaagagacttc 27504024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28252265 - 28252050
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28252265 aacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 28252166  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     |||||||   ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||  |||    
T  28252165 -cact-----ataatcaacaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgc 28252073  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  28252072 tcaagcact-aagcaagagacttc 28252050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28357412 - 28357197
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28357412 aacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 28357313  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     |||||||   ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||  |||    
T  28357312 -cact-----ataatcaacaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgc 28357220  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  28357219 tcaagcact-aagcaagagacttc 28357197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32962637 - 32962422
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32962637 aacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 32962538  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  32962537 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 32962445  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  32962444 tcaagcact-aagcaagagacttc 32962422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 27505409 - 27505650
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27505409 tcagaattggatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 27505507  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttca 215  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||||||||||  ||| |||    
T  27505508 gtcccccttgtacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tctaagtgtgagacttcacaaagatgctca 27505600  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27505601 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 27505650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20063333 - 20063143
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  20063333 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 20063240  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  20063239 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtact-aagcaagagtcttc 20063143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10404217 - 10404043
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  10404217 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 10404124  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagca 249  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  10404123 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 10404043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 253
Target Start/End: Original strand, 12827210 - 12827388
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||     ||||||||| |||||    
T  12827210 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-aact-----ataatcacaaagatt 12827303  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  12827304 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 12827388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12717541 - 12717324
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12717541 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 12717442  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  12717441 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 12717349  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12717348 gctcaagcact-aagcaagagacttc 12717324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12728190 - 12727973
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12728190 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 12728091  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  12728090 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 12727998  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12727997 gctcaagcact-aagcaagagacttc 12727973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 12865040 - 12865255
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12865040 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 12865139  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc--acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||  | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  12865140 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 12865232  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  12865233 tcaagcact-aagcaagagacttc 12865255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14052224 - 14051979
Alignment:
Q  19 ttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtc 115  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14052224 ttcagaatcagatgcccagcggagtaaaaacagagtaagagagaaagaagaaagacacagacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtc 14052125  T
Q  116 cagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttca 215  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||         |||| ||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||  |||    
T  14052124 ctgtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagt-ataatc---------acaactgctcaatacttcaacaagtacgagacttca-aaattctca 14052036  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    | ||||||  |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  14052035 agcacaca-acaagagacatcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgct 14051979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16124220 - 16124024
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||    
T  16124220 aaagcgagacacaagcagttatcatggttccttccacaaatcggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca 16124127  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagag 261  Q
     ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  16124126 aagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctaaagcact-aagcaagag 16124029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17983206 - 17982989
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17983206 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 17983107  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  17983106 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 17983014  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17983013 gctcaagcact-aagcaagagacttc 17982989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17985415 - 17985198
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17985415 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 17985316  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  17985315 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 17985223  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17985222 gctcaagcact-aagcaagagacttc 17985198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18926441 - 18926252
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  18926441 agacacaagcagttatcctggtttcttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 18926348  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18926347 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaattctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 18926252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 25787220 - 25787409
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  25787220 agacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 25787313  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||| ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25787314 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgacacttctcaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 25787409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 25985573 - 25985790
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25985573 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 25985672  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  25985673 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 25985765  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25985766 gctcaagcact-aagcaagagacttc 25985790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34818497 - 34818280
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34818497 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 34818398  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  34818397 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 34818305  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34818304 gctcaagcact-aagcaagagacttc 34818280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19289962 - 19289841
Alignment:
Q  143 ttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||    
T  19289962 ttccactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactat--ctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgc 19289865  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  19289864 tcaagcactaaaggaagagacttc 19289841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 27372299 - 27372540
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| | ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27372299 tcagaattggatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 27372397  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttca 215  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||||||||||  ||| |||    
T  27372398 gtcccccttgtacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tctaagtgtgagacttcacaaagatgctca 27372490  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27372491 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 27372540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 27462649 - 27462890
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| | ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27462649 tcagaattggatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 27462747  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttca 215  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||||||||||  ||| |||    
T  27462748 gtcccccttgtacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatacta-tctaagtgtgagacttcacaaagatgctca 27462840  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27462841 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 27462890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34807866 - 34807648
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34807866 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 34807767  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctt 239  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||     ||||| |||| |||||| ||||||| |||||      
T  34807766 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 34807674  T
Q  240 tgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34807673 tgctcaagcact-aagcaagagacttc 34807648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7751940 - 7751723
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtc-ccccttgcacttccaatgagatt 143  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7751940 aacagagtagagaaaagaaagacaaagaaacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaagagatt 7751841  T
Q  144 tccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
    | ||||     |||||||   ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  7751840 ttcact-----ataatcaacaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatg 7751747  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  7751746 ctcaagcact-aagcaagagacttc 7751723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32973257 - 32973041
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtc-ccccttgcacttccaatgagatt 143  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32973257 aacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatt 32973158  T
Q  144 tccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
    | ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  32973157 t-cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 32973065  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  32973064 ctcaagcact-aagcaagagacttc 32973041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31983330 - 31983114
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31983330 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 31983231  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  31983230 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 31983139  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31983138 gctcaagcact-aagcaagagacttc 31983114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 250
Target Start/End: Original strand, 12353076 - 12353277
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| | ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12353076 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 12353175  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||   || |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  12353176 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 12353268  T
Q  242 ctcaagcac 250  Q
    |||||||||    
T  12353269 ctcaagcac 12353277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11147890 - 11147708
Alignment:
Q  49 cagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccac 148  Q
    ||||| ||||| |||||||| | | ||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  11147890 cagagcagagaaaagaaagacaaagacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 11147792  T
Q  149 taagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttc 236  Q
    |     ||||||||| |||||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  11147791 t-----ataatcacaaagattacaaatgcttaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 11147708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 19290055 - 19289957
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaa-cagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19290055 tgcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcggaataaaaaacagagtagagaaaagaaacagagacacaagcaattatcatggttccttccac 19289957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 4630363 - 4630579
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaag--agagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||  | ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4630363 aacagagcagagaaaagaaagtcaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4630462  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  4630463 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 4630554  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4630555 gctcaagcact-aagcaagagacttc 4630579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 12854514 - 12854729
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||| ||||| ||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12854514 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacataagcagttatcctggttccttccacaacatggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 12854613  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc--acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||  | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  12854614 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 12854706  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  12854707 tcaagcact-aagcaagagacttc 12854729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 16929943 - 16930159
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16929943 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 16930042  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  16930043 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 16930134  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16930135 gctcaagcact-aagcaagagacttc 16930159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 16959114 - 16959330
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16959114 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagattt 16959213  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  16959214 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 16959305  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16959306 gctcaagcact-aagcaagagacttc 16959330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 26024951 - 26025167
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26024951 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 26025050  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  26025051 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 26025142  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26025143 gctcaagcact-aagcaagagacttc 26025167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 26035525 - 26035741
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26035525 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 26035624  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  26035625 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 26035716  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26035717 gctcaagcact-aagcaagagacttc 26035741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 26864278 - 26864494
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26864278 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 26864377  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||| ||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  26864378 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 26864469  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26864470 gctcaagcact-aagcaagagacttc 26864494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 26874902 - 26875118
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26874902 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 26875001  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||| ||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  26875002 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 26875093  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26875094 gctcaagcact-aagcaagagacttc 26875118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 27341186 - 27341402
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27341186 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27341285  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  27341286 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 27341377  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27341378 gctcaagcact-aagcaagagacttc 27341402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 27401926 - 27402142
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27401926 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27402025  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  27402026 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 27402117  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27402118 gctcaagcact-aagcaagagacttc 27402142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 27412585 - 27412801
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27412585 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27412684  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  27412685 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 27412776  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27412777 gctcaagcact-aagcaagagacttc 27412801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 29384244 - 29384460
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29384244 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 29384343  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  29384344 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 29384435  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29384436 gctcaagcact-aagcaagagacttc 29384460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32301747 - 32301531
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32301747 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 32301648  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  32301647 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 32301556  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32301555 gctcaagcact-aagcaagagacttc 32301531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32312436 - 32312220
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32312436 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 32312337  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  32312336 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 32312245  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32312244 gctcaagcact-aagcaagagacttc 32312220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7376437 - 7376246
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||  |||||    
T  7376437 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacgaagatt 7376344  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| | || |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7376343 acaaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 7376246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 33198820 - 33199036
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33198820 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttattctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagattt 33198919  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
      |||     ||||||||  ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  33198920 -gact-----ataatcaccaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 33199012  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  33199013 ctcaagcact-aagcaagagacttc 33199036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 145
Target Start/End: Original strand, 1902202 - 1902327
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1902202 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 1902299  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1902300 gtcccccttgcacttccaaggagatttc 1902327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 269
Target Start/End: Original strand, 14757727 - 14757930
Alignment:
Q  57 agagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga-tttccactaagtaa 155  Q
    ||||| || ||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||     |    
T  14757727 agagacgagagagagagacaaacaattatcatggttccttccacaattcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttttcact-----a 14757821  T
Q  156 taatcacac-agattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaa 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  | |||   || | |||||||  |||||  |||| |||||| |||||||| || || ||||||||||| |||    
T  14757822 taatcacacaagattacaaatgctcaa-gccaca---agcaagagactt--caaatactcaagcacacaagcaagagattttctatgctcaagcacaaaa 14757915  T
Q  255 gcaagagacttccta 269  Q
    |||||||||||||||    
T  14757916 gcaagagacttccta 14757930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 185
Target Start/End: Original strand, 25583430 - 25583539
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  25583430 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 25583523  T
Q  170 acaaatgctcaatact 185  Q
    |||| |||||||||||    
T  25583524 acaactgctcaatact 25583539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 30120571 - 30120496
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30120571 agacacaagtagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 30120496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 3680479 - 3680544
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3680479 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 3680544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12417059 - 12416959
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12417059 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 12416960  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  12416959 c 12416959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 145
Target Start/End: Original strand, 15551392 - 15551461
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15551392 aagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttc 15551461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Original strand, 25929807 - 25929909
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |   |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25929807 gcagcgga-taaaaacagag-agagagaagaaagacaca---aagcaattatacaggttccttcaacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttc 25929901  T
Q  134 caatgaga 141  Q
    ||| ||||    
T  25929902 caaggaga 25929909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27819168 - 27819068
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27819168 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 27819069  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  27819068 c 27819068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12575864 - 12575773
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12575864 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 12575773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Original strand, 18720206 - 18720297
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18720206 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 18720297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15478525 - 15478455
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15478525 caattatcttggttccttccacaatccggaagtagtccagt-ccccttgcacttccaaggagattttcacta 15478455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 205
Target Start/End: Original strand, 19482106 - 19482242
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||         
T  19482106 aagaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata----- 19482199  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca 205  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  19482200 tctgattacaaatgctcattactaaacttagtatgagacttca 19482242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Original strand, 19623323 - 19623405
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19623323 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaa 19623405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20113420 - 20113355
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20113420 aagcaattatacaggttacttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 20113355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33353022 - 33352849
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||       
T  33353022 aagaaagacacaagcaatttatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcatatcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaa-aat--- 33352928  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  33352927 -ctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 33352849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 157
Target Start/End: Original strand, 21624435 - 21624538
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaag 152  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  21624435 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaag 21624533  T
Q  153 taata 157  Q
    |||||    
T  21624534 taata 21624538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 29537978 - 29538038
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29537978 aagcaattatataggttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaa 29538038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 12422618 - 12422784
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||         
T  12422618 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcactcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata----- 12422711  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcc 237  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  12422712 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcc 12422784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24719537 - 24719451
Alignment:
Q  54 tagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24719537 tagagagaagagaaagacaca-aagcaattatacaggttccttccacaatccagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 24719451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14101218 - 14101156
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  14101218 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 14101156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 17927161 - 17927223
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17927161 caattatacaggttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 17927223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 27720820 - 27720937
Alignment:
Q  4 gcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaa 103  Q
    |||| ||||||| |||||| |||  |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||     
T  27720820 gcttctgatgtgatgttcaaaattagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagatagacagaaacagttatactggttccttccacaat 27720918  T
Q  104 ccggaagtagtccagtccc 122  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  27720919 ccggaagtagcccagtccc 27720937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Original strand, 12347461 - 12347518
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12347461 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtccccattgcacttccaa 12347518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 13435251 - 13435316
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  13435251 aagcaattatgcaggttccttccacaaaccggaagtagtcctttcccccttgcacttccaaggaga 13435316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Original strand, 15301550 - 15301646
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  15301550 aaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccagaagtagacctgtcccccttgcacttccaaggaga 15301646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 17380956 - 17381009
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17380956 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgaga 17381009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 29917393 - 29917458
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  29917393 aagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtagtctagtccccgttgcacttccaaggaga 29917458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Original strand, 30372715 - 30372796
Alignment:
Q  69 gagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  30372715 gagacacaagcaataatcttggttccttatacaatccggaagtagtccaatcccacttgcatttccaaggagattttcacta 30372796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 24116206 - 24116258
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24116206 ggttccttccacaaaccagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 24116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 273
Target Start/End: Original strand, 25591966 - 25592180
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacaca-agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagt 153  Q
    ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||      
T  25591966 agagagaaagaagaaagacacatagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaa-- 25592062  T
Q  154 aataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
    |||||   ||| |||||||| |||||| | ||| | |||| | ||||||||| || |  |||| ||||   |||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  25592063 aataa-atcactgattacaattgctcattgctaaaactagcaagagacttca-aactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaacaaa 25592160  T
Q  254 agcaagagacttcctatgct 273  Q
      ||||||||||||||||||    
T  25592161 ttcaagagacttcctatgct 25592180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 16528679 - 16528742
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16528679 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 16528742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 18377811 - 18377874
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18377811 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtccggtcccccttgcacttccaaggaga 18377874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19066787 - 19066639
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactaca 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||      | ||||||||||||||| ||||| |    
T  19066787 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgtaata-----tctgattacaaatgctcactactaaa 19066694  T
Q  189 cctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    | ||||||||||||||| || || |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  19066693 cttagtatgagacttca-aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 19066639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 157
Target Start/End: Original strand, 9717209 - 9717290
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaata 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  9717209 aagcaattatataggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagtt-cactaagtaata 9717290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 15954052 - 15954130
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15954052 aagaaagacaaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 15954130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7586762 - 7586721
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7586762 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 7586721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 11235193 - 11235234
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11235193 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 11235234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Original strand, 12041218 - 12041283
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  12041218 agcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 12041283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14052009 - 14051956
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14052009 tcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttc 14051956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14070690 - 14070637
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14070690 tcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttc 14070637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17304067 - 17303990
Alignment:
Q  65 aagagagacaca-agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17304067 aagaaagacacatagcaattatatagatttcttccacaaaccggaagtagtcatgtctcccttgcacttccaaggaga 17303990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17608912 - 17608871
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17608912 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 17608871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19952340 - 19952287
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19952340 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 19952287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 20635265 - 20635306
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20635265 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 20635306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 21127774 - 21127815
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21127774 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 21127815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 21234538 - 21234591
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21234538 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 21234591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 22386348 - 22386389
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22386348 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22386389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 132
Target Start/End: Original strand, 7763020 - 7763075
Alignment:
Q  78 gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7763020 gcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcccgtcccccttgcactt 7763075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 7811381 - 7811444
Alignment:
Q  82 ttatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  || ||||||||    
T  7811381 ttatagtggttccttccacaaaccggaagtagtccactcctcattgcacttataaggagatttc 7811444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 10631503 - 10631566
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  10631503 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 10631566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15395391 - 15395340
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  15395391 gttccttccacaatccggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggaga 15395340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 19625190 - 19625241
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19625190 gttcctttcacaaactggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 19625241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Original strand, 21034403 - 21034462
Alignment:
Q  82 ttatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21034403 ttatagtggttccttccacaatacagaagtagtccactcccccttgcacttccaaggaga 21034462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 13601532 - 13601598
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  13601532 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 13601598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 141
Target Start/End: Original strand, 18434919 - 18434969
Alignment:
Q  91 ttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18434919 ttccttccacaaatcggaagtactcctgtcccccttgcacttccaaggaga 18434969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Original strand, 21617600 - 21617670
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21617600 aagaaagacacaaacaatttatactggttcattccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttc 21617670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Original strand, 25593403 - 25593500
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  25593403 aaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaaatcagtcctgccccccttgcatttccaaggaga 25593500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 141
Target Start/End: Original strand, 26588956 - 26589030
Alignment:
Q  69 gagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  26588956 gagacacaggcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 26589030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12716193 - 12716140
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  12716193 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 12716140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14732901 - 14732844
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaag-tagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14732901 aagcaattatacaggttccttccacaaactggaagttagtcctgtcccccttgcactt 14732844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19453127 - 19453086
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19453127 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaatcaagagacttc 19453086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20731509 - 20731421
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  20731509 agagagaaaaaagaaagacacaaagcaatttatataggttccttccacaaaccggaaatcagtcctgt-ccccttgcacttccaacgaga 20731421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23006624 - 23006571
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23006624 tcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttc 23006571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 23781742 - 23781795
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23781742 tcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttc 23781795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18027464 - 18027396
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    |||||||||  || || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  18027464 agcaattatcctgatttcttccacaatctggaagtagtccagtctcccttgcacttctaaggagatttc 18027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15532405 - 15532342
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15532405 caattatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 15532342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18172990 - 18172939
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  18172990 gttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccgcttgcacttccaaggaga 18172939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 18226811 - 18226862
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  18226811 gttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccgcttgcacttccaaggaga 18226862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 133
Target Start/End: Original strand, 19470047 - 19470090
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  19470047 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttc 19470090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24471153 - 24471074
Alignment:
Q  66 agagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccc-cttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| | || |||||||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  24471153 agagagagagaaacaattatcatggttccttctacaatccgaaagtagtccagtcccctcttgcacttctaaggagattt 24471074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 31720359 - 31720295
Alignment:
Q  54 tagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtc 120  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||| |||||    
T  31720359 tagagagaagaaagaga--cacaagcaattatcctggttcattccacaacctggaagtagttcagtc 31720295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 129
Target Start/End: Original strand, 32543634 - 32543685
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgca 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32543634 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgca 32543685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 133
Target Start/End: Original strand, 15986719 - 15986777
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  15986719 aagcaattatacagtttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttc 15986777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24729288 - 24729246
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24729288 gttccttccacaatccggaagtagtcttgtcccccttgcactt 24729246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17317289 - 17317216
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  17317289 aagaaagacacaggcaatttatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcctgtccccctagcacttccaa 17317216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17446431 - 17446367
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  17446431 aagcaattatagtggtttcttccacaatccgaaagtagtcca-caccccttgcacttccaaggaga 17446367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18027337 - 18027284
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18027337 tcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 18027284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Original strand, 23230594 - 23230655
Alignment:
Q  80 aattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  23230594 aattataaaggttccttccacaatccgaaagtagtcttgtcccctttgcactttcaatgaga 23230655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 23296152 - 23296217
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  || ||| | |||||||||| ||||    
T  23296152 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtattcttgttcccttagcacttccaaggaga 23296217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 32335208 - 32335273
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||| |||||| ||||    
T  32335208 aagcaattatacaggttccttccacaatccggaaatagtcatgtcccctttgcatttccaaggaga 32335273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14923837 - 14923777
Alignment:
Q  206 caaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  14923837 caaatattcaagcacacaagcaatagatttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttc 14923777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14923964 - 14923893
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcc-cccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  14923964 agacacaaacaattatacatgttccttccacaatccggaagtagt-cattcctcccttgcacttccaaggaga 14923893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17446261 - 17446221
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17446261 gcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagactt 17446221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24719344 - 24719304
Alignment:
Q  226 caagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24719344 caagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 24719304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 265
Target Start/End: Original strand, 32335379 - 32335419
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32335379 gcaatagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagactt 32335419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 228)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 41045032 - 41045304
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  41045032 attgcttctgatgtattgttcagaatcagatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaaacaattatactagttccttctac 41045131  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41045132 aaactggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 41045231  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41045232 cttcacaaatgttcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 41045304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31114723 - 31114461
Alignment:
Q  9 tgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccgga 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31114723 tgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccacaaaccgga 31114624  T
Q  109 agtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  |    
T  31114623 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagacttcaata 31114526  T
Q  209 atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31114525 atgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 31114461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 22150537 - 22150807
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  22150537 ttgcttctgatgtgcagttcagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacatgcaattatactggttcctttcaca 22150636  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22150637 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagac 22150735  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22150736 ttcacaaatgctcaagcacgcaggaaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 22150807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 17017320 - 17017584
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17017320 attgcttctgatgtgaagttcagaatcggatacacagcggattaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcgattatactggttccttccac 17017419  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17017420 aaaccggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 17017518  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17017519 cttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 17017584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 51989890 - 51989620
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  51989890 attgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcaacggagtaaaaacagagtaaagaaaagaaagagagacacaagcaattatactgattccttccac 51989791  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  51989790 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcatacagattacaactgctcaatact--acctagtatgaga 51989693  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51989692 cttcacaaatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgct 51989620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 17006484 - 17006755
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  17006484 attgcttctgatatgaagttcagaatcggatacgcagcggattaaaaacatagtagagagaagaaagagagacacaagcgattatactggtttcttccac 17006583  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17006584 aaactggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 17006682  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17006683 cttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcttatgct 17006755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 266
Target Start/End: Original strand, 10528679 - 10528929
Alignment:
Q  18 gttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagaga--gaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtc 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10528679 gttcagaattggatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaagaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtc 10528778  T
Q  116 cagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttca 215  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10528779 cagtcccccttgaacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcataaatgctca 10528878  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10528879 agcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 10528929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29948085 - 29947824
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagc-aattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  29948085 attgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaaattatcctggttccttcca 29947986  T
Q  100 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||    
T  29947985 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatctcacagattacaaatgttcaatact-ctctaagtatgag 29947891  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29947890 acttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttc 29947824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29997239 - 29996978
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagc-aattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  29997239 attgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaaattatcctggttccttcca 29997140  T
Q  100 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||    
T  29997139 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatctcacagattacaaatgttcaatact-ctctaagtatgag 29997045  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29997044 acttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttc 29996978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 49989552 - 49989822
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  49989552 ttgcttctgatgtgcagttcagaattggatatgcagcggagtaaaa-cagagtaagagagaagaaagaaagacacagacaattatactggttccttccac 49989650  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  49989651 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaattgctcaatactgcacctagtatgag 49989749  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49989750 acttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 49989822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13199984 - 13199724
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13199984 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 13199885  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||    
T  13199884 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa-aaataatcacacagattacaaatgcttaatact--ctctagtatgagact 13199788  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13199787 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 13199724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 15832699 - 15832969
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| | | | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15832699 ttgcttctgatgtgcagttcagaattgaaaatgcagcggagtaaag-cagagtaagagagaagaaagaaagacacaggcaattatactggttccttccac 15832797  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15832798 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgag 15832896  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15832897 acttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 15832969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29934299 - 29934038
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaa-ttatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||    
T  29934299 attgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaatagagtagagagaagaaagagagacacgagcaaattatcctggatccttcca 29934200  T
Q  100 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||    
T  29934199 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatctcacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgag 29934105  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29934104 acttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 29934038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29983453 - 29983192
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaa-ttatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||    
T  29983453 attgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaatagagtagagagaagaaagagagacacgagcaaattatcctggatccttcca 29983354  T
Q  100 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||    
T  29983353 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatctcacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgag 29983259  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29983258 acttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 29983192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Original strand, 13147583 - 13147849
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13147583 ttgcttctgatgtgcaattcataattggatacgcagcggagtaaaaacagagtaagagagaagaaagaaagacacatgcaattatactggttccttccac 13147682  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaa-atgctcaatactacacctagtatga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13147683 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaacttgctcaatactacacctagtatga 13147781  T
Q  199 gacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||| || || |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13147782 gacttcaaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttactttgatcaagcactaaagcaagagacttc 13147849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 2245860 - 2246122
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaa-gaaagagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2245860 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagagcagagaaaaaggaagagagacacaagcaattatcatggttccttccaca 2245959  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    | ||||||||||    
T  2245960 aaccggaagtagtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--ctcaagtatgagac 2246057  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2246058 ttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 2246122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 15848440 - 15848703
Alignment:
Q  9 tgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccgg 107  Q
    |||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15848440 tgatgtgcagttcagaattggaaatgcagcggagtaaag-cagagtaagagagaagaaagaaagacacagacaattatactggttccttccacaaatcgg 15848538  T
Q  108 aagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15848539 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca- 15848636  T
Q  207 aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    || || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15848637 aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgct 15848703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Original strand, 13953587 - 13953824
Alignment:
Q  35 cagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13953587 cagcggagtaaaa-caaagtaagagaaaagaaagaaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 13953685  T
Q  134 caatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagaga 232  Q
    ||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||    
T  13953686 caaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaagcaagaga 13953783  T
Q  233 cttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13953784 cttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgct 13953824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Original strand, 21735672 - 21735896
Alignment:
Q  10 gatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaa 109  Q
    |||||| ||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  21735672 gatgtgatgttcagaattagatatgcagcggaatgaaaacagagcaaagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaa 21735771  T
Q  110 gtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  21735772 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatact--atctagtatgagacttcccaaa 21735869  T
Q  210 tgttcaaacacacaggcaagagacttc 236  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||    
T  21735870 tgctcaagcacgcaggcaagagacttc 21735896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Original strand, 1053215 - 1053466
Alignment:
Q  10 gatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaa 109  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1053215 gatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaa 1053313  T
Q  110 gtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||    
T  1053314 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaa 1053408  T
Q  209 atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1053409 atgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 1053466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15663474 - 15663214
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15663474 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagataagcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagatagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 15663376  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    || | |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  15663375 actgaaagtagaccagtcccccttgcactttcaaggagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagact 15663278  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15663277 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 15663214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17282168 - 17281912
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  || |||||||| |||| ||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17282168 tgcttctgatgtaatgctcagaatcagatatgcagcggat--aaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 17282071  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  17282070 atcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact-ctcttagtatgagact 17281976  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17281975 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 17281912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 27172426 - 27172622
Alignment:
Q  68 agagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagt-aataatcacacag 166  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27172426 agagacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaatcaataatcacacag 27172525  T
Q  167 attacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    ||||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27172526 attacaactgctcaatact--ctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 27172622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 266
Target Start/End: Original strand, 37411961 - 37412190
Alignment:
Q  38 cggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttcca 135  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  37411961 cggaataaaaacagagtaagagagaagaaagaaagacacaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttcca 37412060  T
Q  136 atgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagact 234  Q
    | |||| || ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||    
T  37412061 aggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaagcaagagact 37412158  T
Q  235 tcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412159 tcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 37412190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15651839 - 15651579
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  15651839 tgcttctgatgtgatgttcagaatcaaataagcagcggaataaaa-cagatcagagaaaagaaagatagacgcaagcaattatcctggttccttccacaa 15651741  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  15651740 accggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagact 15651643  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| |||  |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  15651642 tctcaaatgctcaagcacgtaggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttc 15651579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 1063637 - 1063895
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1063637 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcagaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 1063735  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  1063736 accagaagttgtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 1063830  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1063831 tctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 1063895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8996691 - 8996439
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8996691 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagaaagacacaagcaattattttggttccttccacaa 8996593  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  8996592 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 8996499  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagag 261  Q
    || | ||||| |||| ||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8996498 tctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagttttccaatgctcaagcactaaagcaagag 8996439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12753449 - 12753220
Alignment:
Q  45 aaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagat 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  12753449 aaaacagagtaagagagaagaaagaaagacacaggtaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagag 12753350  T
Q  143 ttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
    || ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12753349 tttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttg 12753252  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  12753251 ctcaagcacacaggaaagagacttcctatgct 12753220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45862432 - 45862164
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagaga----cacaagcaattatattggttcctt 96  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    |||| |||||||||  ||||||||    
T  45862432 ttgcttctgatgtgcagttcagaattggatgcacagcggagtaaaa-cagagtaagagagaagaaagaaagaaagacacaggcaattatacaggttcctt 45862334  T
Q  97 ccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagt 194  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45862333 ccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactgcacctagt 45862235  T
Q  195 atgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45862234 atgagacttca-aattgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 45862164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11909857 - 11909639
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagt 153  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11909857 agagagaagaaagaaatacacaggcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagt 11909758  T
Q  154 aataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 252  Q
      |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |      
T  11909757 t-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagaaacttcctttgctcaagcccac 11909660  T
Q  253 aagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11909659 aagcaagagacttcctatgct 11909639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 16076427 - 16076686
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaa-gagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16076427 tgcttctgatgtgatgatcagaatcaaatatgcagcagaataaaa-cagagcagagagaagaaaagcgagacacaagcaattatcctggttccttccaca 16076525  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||    
T  16076526 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagac 16076620  T
Q  202 ttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| | ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16076621 ttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 16076686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Original strand, 51340289 - 51340542
Alignment:
Q  19 ttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtcca 117  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| |||||     
T  51340289 ttcagaattggatgcacagcggagtaaaa-cagagaagagagaagaaagaaggacacaagcaattatacaggttcctttcacaaaacggaagtcagtcct 51340387  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaa 216  Q
     |||||||||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||    
T  51340388 ctcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagatttca-aattgctcaa 51340485  T
Q  217 acacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  51340486 gcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgct 51340542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29906919 - 29906659
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaa-gagagacacaagcaattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  || | || || ||||| |||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29906919 attgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaaaagtaagacacaagcagttatcctggttccttcca 29906821  T
Q  100 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||    
T  29906820 caaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatctcacagattacaaatgttcaatact-ctctaagtatgag 29906726  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29906725 acttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttc 29906659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9007243 - 9006991
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9007243 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataata-catagtagagaaaagaaagaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 9007145  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  9007144 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctgagtatgagact 9007051  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagag 261  Q
    || | ||||| |||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  9007050 tctcaaaatgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagctctaaagcaagag 9006991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8740859 - 8740603
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8740859 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagaagagaaaggaaagaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 8740761  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  8740760 atcgaaagtagtccagtctcccttgctcttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 8740667  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8740666 tctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 8740603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 261
Target Start/End: Original strand, 27882926 - 27883135
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcc 146  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27882926 aacagagcagagaaaagaaagaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc- 27883024  T
Q  147 actaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctca 245  Q
        | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||  ||||||    
T  27883025 ----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctca 27883119  T
Q  246 agcactaaagcaagag 261  Q
    ||||||||||||||||    
T  27883120 agcactaaagcaagag 27883135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Original strand, 14580637 - 14580865
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  14580637 tgcttctgatgtgatgttcagaataagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 14580736  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagt-aataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
     |||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||    | ||||||||||    
T  14580737 tccggaagtagtcta----cccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctcacagattacaactgctcaatact--ttcaagtatgagac 14580830  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttc 236  Q
    ||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  14580831 ttctcaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 14580865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 273
Target Start/End: Original strand, 4433328 - 4433524
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  4433328 agacacaagcagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 4433421  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 268  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||     
T  4433422 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcca 4433519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9994610 - 9994370
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9994610 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 9994513  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  || |||    
T  9994512 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctca 9994420  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9994419 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 9994370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12250156 - 12249916
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12250156 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 12250059  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  || |||    
T  12250058 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctca 12249966  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12249965 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 12249916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 273
Target Start/End: Original strand, 4403841 - 4404037
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  4403841 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 4403934  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 268  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||     
T  4403935 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcca 4404032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 23635226 - 23635467
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23635226 tcagaatcagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 23635324  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||    
T  23635325 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctca 23635417  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23635418 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 23635467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12238330 - 12238090
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12238330 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 12238233  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  || |||    
T  12238232 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctca 12238140  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |  ||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12238139 agaacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 12238090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19888021 - 19887843
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  19888021 agacacaagcagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 19887928  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  19887927 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19887843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6491014 - 6490826
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  6491014 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 6490921  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6490920 aaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 6490826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6501668 - 6501480
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  6501668 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 6501575  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6501574 aaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 6501480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9982577 - 9982362
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9982577 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 9982478  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  9982477 -cact-----ataatcataaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9982385  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9982384 tcaagcact-aagcaagagacttc 9982362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13262346 - 13262150
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||    
T  13262346 aaagcgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtccccgttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca 13262253  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagag 261  Q
     ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  13262252 aagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagag 13262155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29472757 - 29472542
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472757 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 29472658  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  29472657 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 29472565  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  29472564 tcaagcact-aagcaagagtcttc 29472542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1795151 - 1794961
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  1795151 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 1795058  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1795057 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 1794961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 11163392 - 11163587
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||    
T  11163392 aaagcgagacacaagcagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca 11163485  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 262  Q
     ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||     
T  11163486 aagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagt 11163583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14322364 - 14322169
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||    
T  14322364 aaagcgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagattt-cact-----ataatcaca 14322271  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 262  Q
     ||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||     
T  14322270 aagattacaaatgctcaatact-ctctaactatgagacttctcaaaatgctcaaccacacaggcaagagtcttctaatgctcaagcact-aagcaagagt 14322173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 48336809 - 48336999
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  48336809 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 48336902  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48336903 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 48336999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39673573 - 39673360
Alignment:
Q  48 acagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcc 146  Q
    |||||| ||||| |||||||| | | |||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  39673573 acagagcagagaaaagaaagacaaagacaaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc- 39673475  T
Q  147 actaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    ||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||    
T  39673474 acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctc 39673381  T
Q  245 aagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  39673380 aagcact-aagcaagagacttc 39673360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4175449 - 4175234
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4175449 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4175350  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  4175349 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 4175257  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  4175256 tcaagcact-aagcaagagacttc 4175234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5537713 - 5537498
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5537713 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5537614  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  5537613 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 5537521  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  5537520 tcaagcact-aagcaagagacttc 5537498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5548297 - 5548082
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5548297 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5548198  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  5548197 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 5548105  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  5548104 tcaagcact-aagcaagagacttc 5548082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6181220 - 6181005
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6181220 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 6181121  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  6181120 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 6181028  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  6181027 tcaagcact-aagcaagagacttc 6181005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6221394 - 6221179
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6221394 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 6221295  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  6221294 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 6221202  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  6221201 tcaagcact-aagcaagagacttc 6221179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10655956 - 10655741
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10655956 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 10655857  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     |||||||||  |||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||    
T  10655856 -cact-----ataatcacaacgattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgc 10655764  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  10655763 tcaagcact-aagcaagagacttc 10655741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 13121205 - 13121420
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13121205 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 13121304  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  13121305 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 13121397  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  13121398 tcaagcact-aagcaagagacttc 13121420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 13557117 - 13557332
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13557117 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 13557216  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  13557217 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 13557309  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  13557310 tcaagcact-aagcaagagacttc 13557332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 14475764 - 14475979
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14475764 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 14475863  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  14475864 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 14475956  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  14475957 tcaagcact-aagcaagagacttc 14475979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 236
Target Start/End: Original strand, 17960943 - 17961133
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatt 143  Q
    ||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17960943 aaaacagagcagagaaaagaagatgagacacaagcaatttatactggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagatt 17961042  T
Q  144 tccactaagt-aataatcacacagattacaaatgctcaa-tactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttc 236  Q
    | |||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||     || | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17961043 ttcactaactcaataatctctcagattacaaatgctcaagcacta----aagcaagagacttctcaaatgctcaagcacacaggcaagagacttc 17961133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 23767437 - 23767652
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23767437 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 23767536  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  23767537 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 23767629  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  23767630 tcaagcact-aagcaagagacttc 23767652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24384213 - 24383996
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24384213 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcttggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 24384114  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  24384113 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 24384021  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24384020 gctcaagcact-aagcaagagacttc 24383996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24707223 - 24707036
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  24707223 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 24707130  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc---acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 262  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||||||||   | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  24707129 acaaatgctcaatacta-tctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 24707036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 37865988 - 37866203
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37865988 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 37866087  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  37866088 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 37866180  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  37866181 tcaagcact-aagcaagagacttc 37866203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 37885121 - 37885336
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37885121 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 37885220  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  37885221 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 37885313  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  37885314 tcaagcact-aagcaagagacttc 37885336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 933194 - 933385
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  933194 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 933287  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  933288 acaaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 933385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17910673 - 17910482
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  17910673 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 17910580  T
Q  170 acaaa-tgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17910579 acaaactgctcaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 17910482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9391871 - 9391681
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  9391871 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagaagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 9391778  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9391777 acaaatgctcaatacta-tctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcccatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 9391681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11206741 - 11206551
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  11206741 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 11206648  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||| | ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11206647 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacatacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 11206551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11217392 - 11217202
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  11217392 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 11217299  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| ||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11217298 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcactcacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 11217202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 19788590 - 19788780
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  19788590 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 19788683  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19788684 acaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 19788780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 23647291 - 23647507
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23647291 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 23647390  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  23647391 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 23647483  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  23647484 ctcaagcact-aagcaagagacttc 23647507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5866390 - 5866173
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5866390 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5866291  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  5866290 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 5866198  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5866197 gctcaagcact-aagcaagagacttc 5866173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5876989 - 5876772
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5876989 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5876890  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  5876889 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 5876797  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5876796 gctcaagcact-aagcaagagacttc 5876772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 8774174 - 8774415
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8774174 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 8774271  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  8774272 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 8774363  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8774364 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 8774415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11273078 - 11272861
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11273078 aacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 11272979  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  11272978 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 11272886  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11272885 gctcaagcact-aagcaagagacttc 11272861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 13131447 - 13131662
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||  ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13131447 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagctgttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 13131546  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  13131547 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 13131639  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  13131640 tcaagcact-aagcaagagacttc 13131662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 18483561 - 18483802
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18483561 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 18483658  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  18483659 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaactatgct 18483750  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18483751 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 18483802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20684470 - 20684256
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20684470 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 20684371  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  20684370 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 20684279  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  20684278 tcaagcact-aagcaagagacttc 20684256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 20720654 - 20720871
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20720654 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 20720753  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  20720754 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 20720846  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20720847 gctcaagcact-aagcaagagacttc 20720871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 23756841 - 23757056
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| || |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23756841 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttgtcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 23756940  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  23756941 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 23757033  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  23757034 tcaagcact-aagcaagagacttc 23757056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28314951 - 28314710
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28314951 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 28314854  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  28314853 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 28314762  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28314761 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 28314710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28325565 - 28325324
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28325565 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 28325468  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  28325467 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 28325376  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28325375 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 28325324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29461905 - 29461690
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29461905 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 29461806  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  29461805 -cact-----ataataacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 29461713  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  29461712 tcaagcact-aagcaagagtcttc 29461690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 38194241 - 38194482
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38194241 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 38194338  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  38194339 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 38194430  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38194431 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 38194482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 39382207 - 39382448
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39382207 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 39382304  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  39382305 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 39382396  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39382397 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 39382448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7805186 - 7804995
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  7805186 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 7805093  T
Q  170 aca-aatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| | ||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7805092 acacagtgctcaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 7804995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14258712 - 14258555
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacac 189  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||||||||| |||||| | |    
T  14258712 gttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctgaatact-ctc 14258620  T
Q  190 ctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
      ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  14258619 taagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 14258555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1784738 - 1784548
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  1784738 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaatggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 1784645  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1784644 acaaatgctcgatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 1784548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5580301 - 5580111
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  5580301 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 5580208  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5580207 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 5580111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 8784788 - 8785030
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8784788 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 8784885  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  8784886 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 8784977  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  8784978 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 8785030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9381307 - 9381135
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  9381307 tggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcagtacta- 9381215  T
Q  188 acctagtatgagacttc--acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |  |||||||||||||  | || || |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9381214 tctaagtatgagacttcttaaaagtgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 9381135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 10098610 - 10098826
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10098610 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 10098709  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  10098710 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 10098801  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10098802 gctcaagcact-aagcaagagacttc 10098826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12297469 - 12297279
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  12297469 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 12297376  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12297375 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 12297279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18857580 - 18857426
Alignment:
Q  91 ttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacc 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||     |||||||| ||||||||||||||||||||| | |     
T  18857580 ttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctct 18857488  T
Q  191 tagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcact 251  Q
     ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  18857487 aagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact 18857426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Original strand, 19777971 - 19778143
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||      
T  19777971 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-t 19778063  T
Q  188 acctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19778064 tctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 19778143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 38314262 - 38314451
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||     |||| |||| |||||    
T  38314262 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcagttccaaggagattt-cact-----ataaccacaaagatt 38314355  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38314356 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacagacaagagtctaccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 38314451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 39371570 - 39371811
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39371570 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 39371667  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  39371668 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 39371759  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39371760 caagcatacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 39371811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 13601801 - 13601973
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  13601801 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 13601894  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaag 247  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  13601895 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 13601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 266
Target Start/End: Original strand, 28168677 - 28168869
Alignment:
Q  69 gagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagat 168  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||    
T  28168677 gagacacaagtagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagat 28168770  T
Q  169 tacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| ||| || ||||||| ||||   |||||||||||  | ||||||||||||    
T  28168771 tacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttc 28168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19121508 - 19121399
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  19121508 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 19121415  T
Q  170 acaaatgctcaatact 185  Q
    ||||||||||||||||    
T  19121414 acaaatgctcaatact 19121399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 38204776 - 38205018
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38204776 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 38204873  T
Q  118 gt-cccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgt 212  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    |||     
T  38204874 gtccccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgc 38204965  T
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38204966 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 38205018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 504861 - 504645
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  504861 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 504762  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  504761 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 504670  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  504669 gctcaagcact-aagcaagagacttc 504645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 527227 - 527011
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  527227 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 527128  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  527127 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 527036  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  527035 gctcaagcact-aagcaagagacttc 527011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 4743280 - 4743496
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4743280 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4743379  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  4743380 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 4743471  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4743472 gctcaagcact-aagcaagagacttc 4743496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 4753867 - 4754083
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4753867 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4753966  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  4753967 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 4754058  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4754059 gctcaagcact-aagcaagagacttc 4754083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 5510238 - 5510454
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5510238 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5510337  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  5510338 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 5510429  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5510430 gctcaagcact-aagcaagagacttc 5510454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 5520416 - 5520632
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5520416 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5520515  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  5520516 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 5520607  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5520608 gctcaagcact-aagcaagagacttc 5520632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12287647 - 12287457
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  12287647 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 12287554  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  12287553 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aaccaagagacttc 12287457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13373360 - 13373143
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13373360 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 13373261  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||| ||||   |  |||||||||||||||    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  13373260 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcagtact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 13373168  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13373167 gctcaagcact-aagcaagagacttc 13373143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13394548 - 13394331
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13394548 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 13394449  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||| ||||   |  |||||||||||||||    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  13394448 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcagtact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 13394356  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13394355 gctcaagcact-aagcaagagacttc 13394331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 24659442 - 24659658
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24659442 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 24659541  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  24659542 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 24659633  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24659634 gctcaagcact-aagcaagagacttc 24659658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 24670022 - 24670238
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24670022 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 24670121  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  24670122 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 24670213  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24670214 gctcaagcact-aagcaagagacttc 24670238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 35186919 - 35187135
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35186919 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 35187018  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  35187019 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 35187110  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35187111 gctcaagcact-aagcaagagacttc 35187135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 37759212 - 37759427
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37759212 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcatggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagattt 37759311  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| | |||||||||   |  ||| |||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  37759312 -cact-----ataatcacaaagattacaactcctcaatact-ttctaagtgtgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 37759404  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  37759405 tcaagcact-aagcaagagacttc 37759427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 41683220 - 41683436
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41683220 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 41683319  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  41683320 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 41683411  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41683412 gctcaagcact-aagcaagagacttc 41683436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 41693789 - 41694005
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41693789 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 41693888  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  41693889 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 41693980  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41693981 gctcaagcact-aagcaagagacttc 41694005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7795275 - 7795084
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  7795275 agacacaagtagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttcgaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 7795182  T
Q  170 aca-aatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| | ||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7795181 acacagtgctcaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 7795084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 9535176 - 9535367
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  9535176 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 9535269  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagacttc--acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||||| | |  |||||||||||||  | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||| ||||    
T  9535270 acaaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgct-aagcaagagtcttc 9535367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15194707 - 15194516
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  15194707 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcctaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 15194614  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15194613 acaaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacacaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 15194516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10627609 - 10627419
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||  ||||    
T  10627609 agacacaagcagttttcctggttccttccacaacacggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaacgatt 10627516  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10627515 acaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 10627419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20673886 - 20673671
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20673886 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagattt 20673787  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  20673786 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 20673695  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||    
T  20673694 ctcaagcact-aagtaagagacttc 20673671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5628684 - 5628495
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  5628684 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagt-ccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 5628592  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5628591 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 5628495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Original strand, 11530340 - 11530474
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11530340 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 11530439  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatact 185  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11530440 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact 11530474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13383954 - 13383737
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13383954 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 13383855  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||| ||||   |  |||||||||||||||    ||||| |||| |||||| | ||||| |||||  |    
T  13383854 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcagtact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagtaagagtcttccaat 13383762  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13383761 gctcaagaact-aagcaagagacttc 13383737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 16385617 - 16385833
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16385617 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 16385716  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
      |||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  16385717 -tact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 16385808  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16385809 gctcaagcact-aagcaagagacttc 16385833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22804816 - 22804747
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22804816 aagcaattatattacttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaatgagatttc 22804747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Original strand, 33650743 - 33650877
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33650743 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 33650842  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatact 185  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33650843 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact 33650877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Original strand, 13076460 - 13076535
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13076460 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 13076535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16671752 - 16671639
Alignment:
Q  153 taataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcact 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  16671752 taataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctctaaatgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcact 16671654  T
Q  252 aaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||    
T  16671653 aaagcaagagtcttc 16671639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 141
Target Start/End: Original strand, 2560518 - 2560616
Alignment:
Q  43 taaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  2560518 taaaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 2560616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7608939 - 7608864
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7608939 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtactccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 7608864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 20724456 - 20724518
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20724456 caattatataggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 20724518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 266
Target Start/End: Original strand, 18006010 - 18006079
Alignment:
Q  197 gagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18006010 gagacttctcagatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 18006079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35579115 - 35579015
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35579115 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 35579016  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  35579015 c 35579015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 273
Target Start/End: Original strand, 51340512 - 51340572
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51340512 tcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttcctatgct 51340572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26418492 - 26418410
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||  ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26418492 agagagagaaaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtgccccttgcacttccaa 26418410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 3238057 - 3238122
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  3238057 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 3238122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 266
Target Start/End: Original strand, 14580858 - 14580927
Alignment:
Q  197 gagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14580858 gagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 14580927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23538957 - 23538892
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  23538957 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtccccattgcacttccaaggaga 23538892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 145
Target Start/End: Original strand, 27849590 - 27849659
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27849590 aagcaattatcctcgttccttccacaatccggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttc 27849659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 15848715 - 15848763
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15848715 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 15848763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17239716 - 17239656
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17239716 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaa 17239656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29952250 - 29952174
Alignment:
Q  57 agagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29952250 agagaaaaaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccctttgcactt 29952174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30001404 - 30001328
Alignment:
Q  57 agagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  30001404 agagaaaaaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccctttgcactt 30001328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 6090070 - 6090157
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  6090070 agagagaaagaagaaagacacaaagccattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 6090157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 50299588 - 50299666
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  50299588 aagaaagacataagcaatttatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 50299666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12753250 - 12753197
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12753250 tcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 12753197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Original strand, 13939230 - 13939326
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  13939230 aaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagttgtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 13939326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 13953794 - 13953847
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13953794 tcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 13953847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Original strand, 20645488 - 20645584
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  20645488 aaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacatgtttcttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 20645584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 2025432 - 2025615
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaag 152  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  2025432 agagagaaagaagaaagacacaaacaatttatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatg 2025530  T
Q  153 taataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    |||||      | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  2025531 taata-----tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaattgcaagagacttcctatgctc 2025615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 132
Target Start/End: Original strand, 10849956 - 10850012
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10849956 aagcaattatagtggttccttccacaatccggaagtagtccactcctccttgcactt 10850012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14063801 - 14063718
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||| |   || ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  14063801 agagagaagaaagagaca---aaacaattataaaggttccttccacaaactggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 14063718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 15848685 - 15848733
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15848685 gcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 15848733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Original strand, 6252789 - 6252856
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtag-tccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6252789 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtttctgtcccccttgcacttccaaggagatttc 6252856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 52919808 - 52919895
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  52919808 agagagaaaaaagaaagacaaaaagcaattatacaggtttcttccacaaatcggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 52919895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 11189378 - 11189444
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaag-tagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11189378 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaacgaga 11189444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11909662 - 11909616
Alignment:
Q  220 cacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11909662 cacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 11909616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12410492 - 12410418
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  12410492 aagcaattatcttggttccttccacaatccagaagtagtccagcttcccttacacttccaaggagattttcacta 12410418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13410851 - 13410766
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13410851 agagagaagagaaagacaca-aagcaattatacatgttccttccacaattcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 13410766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 28581471 - 28581537
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  28581471 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 28581537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 49554290 - 49554224
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  49554290 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 49554224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 49643587 - 49643490
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  49643587 aaaacagag-agagagaaggaagaaagacacaaagcaattatacagattccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggaga 49643490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 49669267 - 49669121
Alignment:
Q  91 ttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacac 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||| |    |||||||||||| | ||||| ||    
T  49669267 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaat-atctc----attacaaatgctaactactaaac 49669174  T
Q  190 ctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     ||||| |||||||  |||||||| || ||||   |||||||||||||| |||||    
T  49669173 ttagtaagagactt--caaatgttaaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 49669121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Original strand, 2782837 - 2782968
Alignment:
Q  70 agacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacaga 167  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||      | ||    
T  2782837 agacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagtt-cactatgtaata-----tctga 2782930  T
Q  168 ttacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca 205  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  2782931 ttacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttca 2782968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 13931373 - 13931430
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  13931373 tggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccctttgcacatctaaggagatttc 13931430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19889706 - 19889642
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||    
T  19889706 aagcaattatgtaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgt-ccccttgcacttcgaatgaga 19889642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 22150789 - 22150830
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22150789 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22150830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24393471 - 24393380
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatact 185  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24393471 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcaatacaaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact 24393380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31114479 - 31114438
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31114479 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 31114438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Original strand, 40850330 - 40850403
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  40850330 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 40850403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 47207083 - 47207136
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  47207083 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 47207136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 49989804 - 49989845
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49989804 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 49989845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 51989638 - 51989597
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51989638 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaaacaagagacttc 51989597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 53057509 - 53057456
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53057509 ggttccttccacgaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgaga 53057456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 11078134 - 11078186
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  11078134 ggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 11078186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12727051 - 12726963
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  12727051 agagagaaagaagaaagacacaaaacaattatataggttccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggaga 12726963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16305862 - 16305782
Alignment:
Q  54 tagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||  || |||| |||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16305862 tagagagaaga--gaaagacgcaagaaattatacaggttccttccacaattcggaagtagacctgtcccccttgcacttccaa 16305782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17769756 - 17769562
Alignment:
Q  68 agagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccag-tcccccttgcacttccaatgaga-tttccactaagtaataatcacac- 164  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||| ||||     ||||||||||     
T  17769756 agagacacaaacaattatcctagttccttccacaatccggaaatagtccagttcccatttgcacttccaaggagatttttcact-----ataatcacaca 17769662  T
Q  165 agattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 264  Q
    ||||||||| |||||||    |||   || |||||||||  |||||  || | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  17769661 agattacaattgctcaagcacaca---agcatgagactt--caaatactcgagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacg 17769567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19071057 - 19070863
Alignment:
Q  68 agagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccag-tcccccttgcacttccaatgaga-tttccactaagtaataatcacac- 164  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||| ||||     ||||||||||     
T  19071057 agagacacaaacaattatcctagttccttccacaatccggaaatagtccagttcccatttgcacttccaaggagatttttcact-----ataatcacaca 19070963  T
Q  165 agattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 264  Q
    ||||||||| |||||||    |||   || |||||||||  |||||  || | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  19070962 agattacaattgctcaagcacaca---agcatgagactt--caaatactcgagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacg 19070868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46797201 - 46796999
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||         
T  46797201 aagaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagtt-cactatgtaata----- 46797108  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 262  Q
     | |||||||| || ||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||| ||||   ||||||||||||   ||||||||||| |  ||||||||    
T  46797107 tctgattacaattgatcactactaaacttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcaaatgctcaagcacaactgcaagaga 46797010  T
Q  263 cttcctatgct 273  Q
    ||| |||||||    
T  46797009 ctttctatgct 46796999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4243906 - 4243844
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||    
T  4243906 caattatataggttccttccacaatccggaagtaatattgtcccccttgcacttccaaagaga 4243844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13781411 - 13781314
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||    
T  13781411 aaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacatccaaggaga 13781314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 13823432 - 13823498
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  13823432 aagcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 13823498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 21316922 - 21316984
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21316922 caattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcttgtctcccttgcacttccaaggaga 21316984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21639078 - 21639000
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  21639078 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttcctcaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 21639000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22463811 - 22463765
Alignment:
Q  91 ttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22463811 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 22463765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22465269 - 22465223
Alignment:
Q  91 ttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22465269 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 22465223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 31302714 - 31302780
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  31302714 aagcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggaga 31302780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1728821 - 1728748
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  1728821 aagagagacacagacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 1728748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 6174701 - 6174766
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  6174701 aagcaattatacatgtttcttccataaaccggaagtagttctgtcccccttgcacttccaaggaga 6174766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9700839 - 9700770
Alignment:
Q  69 gagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9700839 gagacacaagcaatttatacaggttccttccacaagccggaagtcagtcctgtccctcttgcacttccaa 9700770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 141
Target Start/End: Original strand, 12396450 - 12396499
Alignment:
Q  92 tccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  12396450 tccttccacaaaccggaagtagtcctatctcccttgcacttccaaggaga 12396499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12963879 - 12963814
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  12963879 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtaatcatgtcccccttacacttccaaggaga 12963814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 15832951 - 15832992
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15832951 gcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttc 15832992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 15848745 - 15848786
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15848745 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttc 15848786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19198655 - 19198602
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  19198655 tggttccttccacaatccgggagtagtccactcccccttgaacttccaaggaga 19198602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20628213 - 20628160
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  20628213 ggttccttccacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggaga 20628160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22770478 - 22770437
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22770478 gcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 22770437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22770647 - 22770590
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22770647 caattatacaggttccttccacaattcggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaa 22770590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 29854784 - 29854837
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  29854784 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagaga 29854837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30054960 - 30054907
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  30054960 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 30054907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 41045286 - 41045327
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  41045286 gcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttc 41045327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 51340554 - 51340595
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  51340554 gcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttc 51340595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 265
Target Start/End: Original strand, 17006737 - 17006777
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17006737 gcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagactt 17006777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19250142 - 19250082
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatga 139  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19250142 caattatacaggtttcttccacaaatcaaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaatga 19250082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 136
Target Start/End: Original strand, 40799276 - 40799324
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40799276 ggttccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 40799324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 136
Target Start/End: Original strand, 1463748 - 1463811
Alignment:
Q  73 cacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1463748 cacaagcaattatcatggtttcttccacaatcaagaattagtctagtcccccttgcacttccaa 1463811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Original strand, 14072240 - 14072279
Alignment:
Q  226 caagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14072240 caagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagactt 14072279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14078102 - 14078051
Alignment:
Q  82 ttatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    ||||| |||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14078102 ttatagtggttccttccataatctggaagtagtccactcccccttgcacttc 14078051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 136
Target Start/End: Original strand, 15647152 - 15647199
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15647152 ggttccttccacaatgcggaagtactccagtaccccttgcacttccaa 15647199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 136
Target Start/End: Original strand, 19264096 - 19264154
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||    
T  19264096 agcaattatattggttcctcccataaactgggagtagtctag-cccccttgcacttccaa 19264154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Original strand, 11222193 - 11222263
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga-tttccactaagtaata 157  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  11222193 ggttccttcctcaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttttcactatgtaata 11222263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Original strand, 11222941 - 11223011
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga-tttccactaagtaata 157  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  11222941 ggttctttcctcaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttttcactatgtaata 11223011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 17667771 - 17667837
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  17667771 aagcaattatacaggttccttccacaaaccgtaagtcagtcatgtcctccttgcacttccaaggaga 17667837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Original strand, 932249 - 932322
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  932249 agcaattatcatggttccttccacaatacagaagtaacccagtccccctcgtacttccaaagagattttcacta 932322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 932376 - 932429
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  932376 tcaatcacacaagcaagagatttcttatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 932429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 13698770 - 13698835
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  13698770 aagcaataatacaggttccttccacaatccggtagtagtcttgtccctcttgcacttccaaggaga 13698835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38178432 - 38178375
Alignment:
Q  80 aattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  38178432 aattatacaggttcattccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 38178375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 265
Target Start/End: Original strand, 11078211 - 11078271
Alignment:
Q  205 acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  11078211 acaaatgctcaagcacacaagcaagatatttcctatgctcaagcataaaagcaagagactt 11078271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13292215 - 13292159
Alignment:
Q  205 acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagag 261  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  13292215 acaaatgctcaaggacacagccaagagacttccaatgctcaagcacaaaagcaagag 13292159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23538811 - 23538763
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23538811 gcaagagatttcttatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgct 23538763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26418324 - 26418276
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  26418324 gcaagagatttcctatgctcaagaaataaatcaagagacttcctatgct 26418276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 166)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19171117 - 19170846
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19171117 attgcttctgatgtgttgttcagaataggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 19171018  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19171017 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 19170918  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||| || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  19170917 cttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgct 19170846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 20251094 - 20251359
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20251094 attgcttctgatgtattgttcagaattggatacgcagcggagtaaaaatagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccac 20251193  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20251194 aaaccggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 20251293  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20251294 cttcaaaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 20251359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 28379280 - 28379555
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaa---acagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttc 97  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28379280 attgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcgaagtaaaaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttc 28379379  T
Q  98 cacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatg 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28379380 cacaaaccggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagattttcactaagtaataatcacacagattacaactgttcaatactacacctagtatg 28379479  T
Q  198 agacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28379480 agacttcacaaatgctcaagcacacaaacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 28379555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26549047 - 26548777
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26549047 ttgcttctgatgtgtagtttagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacatgcaattatactggttccttccaca 26548948  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26548947 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcactcttattacaactgctcaatactacacctagtatgagac 26548849  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26548848 ttcacaaatgctcaagcacgcagtcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 26548777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 273
Target Start/End: Original strand, 22018642 - 22018892
Alignment:
Q  22 agaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcc 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22018642 agaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcc 22018741  T
Q  122 cccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacaca 221  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  22018742 cccttgcacttccaaggatattttcactaagt-ttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacg 22018840  T
Q  222 caggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22018841 caggcaagacacttcctttgctcaagcactaaagaaagagacttcctatgct 22018892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45071382 - 45071121
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  45071382 tgcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaaacaattatcctggttccttccacaa 45071283  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  45071282 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatact--acgtagtatgagact 45071185  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45071184 tcccaaatgctcaagcacgcaggctagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 45071121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 22642153 - 22642425
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22642153 ttgcttctgatgtgcagttcaaaattggatacgcagcgaagtaaaaacagagtaagagagaagaaagaaagacacaggcaattatactggttccttccac 22642252  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22642253 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgag 22642351  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22642352 acttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactcaagcaagagacttcctatgct 22642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 5929002 - 5929269
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  5929002 tgcttctgatgtgatgttcaaaatctgatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaaacaattatcctggtttcttccacaa 5929101  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  5929102 accggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagatta-aactgctcaatact--acctagtatgagact 5929198  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5929199 tcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 5929269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 273
Target Start/End: Original strand, 23926406 - 23926624
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagta 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23926406 agagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaa 23926505  T
Q  155 ataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaa 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  23926506 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctcaattgctcaaggacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcag 23926605  T
Q  255 gcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  23926606 gcaagagacttccaatgct 23926624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22610757 - 22610496
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  22610757 tgcttctgatgtgatgttcataatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctcgttccttccacaa 22610658  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||    
T  22610657 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--ttctagtatgagact 22610560  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22610559 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaggagacttc 22610496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 46181633 - 46181371
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||   ||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46181633 tgcttctgatgtgatgttcagaattatatatgcagcggaatagaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 46181534  T
Q  103 accggaagtagtccagtc-ccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  46181533 atcggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagac 46181436  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| |||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  46181435 ttcccaaatgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 46181371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 273
Target Start/End: Original strand, 17370358 - 17370602
Alignment:
Q  28 ggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccctt 126  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17370358 ggatatgcagcggagtaaaa-cagagtaagagagaagaaagagagacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtcgagtccccatt 17370456  T
Q  127 gcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacagg 225  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||    
T  17370457 gcacttccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacgcagg 17370554  T
Q  226 caagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17370555 caagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 17370602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 674875 - 675131
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  674875 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 674973  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  674974 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----aaataatcacacagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagact 675067  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  675068 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 675131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 23058884 - 23059048
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23058884 attgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaactatactggttccttccac 23058983  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacaca 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23058984 aaaccggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacaca 23059048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41133382 - 41133140
Alignment:
Q  17 tgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcc 116  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41133382 tgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtcc 41133284  T
Q  117 agtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaa 216  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41133283 agtcccccttgtacttccaaggagatttccac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagacttctcaaatgctcaa 41133190  T
Q  217 acacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     ||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41133189 gcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttc 41133140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14388907 - 14388649
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  14388907 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttcattccacaa 14388809  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  14388808 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 14388714  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14388713 tctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 14388649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 19037297 - 19037459
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19037297 attgcttctgatgtattgttcagaatcagatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccac 19037396  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19037397 aaatcggaagtagtccagtccaccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcaca 19037459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11195838 - 11195589
Alignment:
Q  11 atgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaag 110  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11195838 atgtggtgttcagaatcagatacgcagcggat--aaaacagagcagagaaaagaaagcgagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaag 11195741  T
Q  111 tagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | |||    
T  11195740 tagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt----tcattaaaaatcacacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaa 11195646  T
Q  210 tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||    
T  11195645 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgatcaagcactaaagcaagagtcttc 11195589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18311752 - 18311494
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  18311752 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctaattccttccacaa 18311654  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  18311653 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatcacacatattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 18311559  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18311558 tctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 18311494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 266
Target Start/End: Original strand, 28473660 - 28473814
Alignment:
Q  110 gtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28473660 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatactac--ctagtatgagacttcacaaa 28473757  T
Q  210 tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28473758 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 28473814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 12944638 - 12944895
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12944638 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcagaataaaa-cagagcagagaaaagaaagaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 12944736  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  12944737 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 12944830  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||  |||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12944831 tctcaaaatactcaagcacgcaggcaagagacttacaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 12944895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34256307 - 34256037
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta--gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||| |||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  34256307 tgcttctgatgtgcagttcagattcagatgcacagcggagtaaaa-cagagtaaagagagaagaaagaaggacacaggcaattatacaggttccttccac 34256209  T
Q  101 aaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatga 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34256208 aaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaagtagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatga 34256110  T
Q  199 gacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  34256109 gacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac-acagcaagagacttcttatgct 34256037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20196471 - 20196213
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaa-gagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20196471 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaat-agagcagagaaaagaaaagtgagacacaagcaattatcctggttccttccaca 20196373  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||    
T  20196372 aatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagac 20196279  T
Q  202 ttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| | ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20196278 ttctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 20196213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 52351402 - 52351269
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  52351402 attgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcaacggagtaaaaacag--tagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttctac 52351305  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52351304 aaaccggaagtagtccagtcccccctgcacttccaa 52351269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7745825 - 7745575
Alignment:
Q  18 gttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagag-acacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagtagtc 115  Q
    ||||||| || ||| | ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  7745825 gttcagagtcagatgcacagcggaataagaacagagaagagataagaaagaaaggacgcaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtagcc 7745726  T
Q  116 cagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttca 215  Q
      ||||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||  |   || |||    
T  7745725 atgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaaa-aataatcacacagattacaattgctcaatactacaacaagtatgagactt--cctttgctca 7745629  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctat 270  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  7745628 agcacaca-gcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagtcttcctat 7745575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 262
Target Start/End: Original strand, 44200443 - 44200596
Alignment:
Q  111 tagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaat 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44200443 tagttcagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagacttcacaaat 44200540  T
Q  211 gttcaaaca----cacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 262  Q
    | |||| ||    | || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44200541 gctcaagcatgcgcgcacgcaagagacttcatatgctcaagcactaaagcaagaga 44200596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 51629950 - 51629708
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51629950 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 51629853  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||    |||| |    
T  51629852 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacaatgct 51629760  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  51629759 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 51629708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 51657212 - 51656969
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51657212 tcagaatcagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 51657114  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||    |||| |    
T  51657113 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaacaatgct 51657021  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  51657020 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 51656969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 155025 - 154809
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  155025 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 154926  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc---acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||    
T  154925 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatg 154833  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||    
T  154832 ctcaagcact-aagcaagagtcttc 154809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18382614 - 18382425
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  18382614 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagattt-cact-----ataatcacaaagatt 18382521  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18382520 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 18382425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20884508 - 20884374
Alignment:
Q  130 cttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaag 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||    
T  20884508 cttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactat--ctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgag 20884411  T
Q  230 agacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20884410 agaattccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 20884374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 35012399 - 35012614
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35012399 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 35012498  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  35012499 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 35012591  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  35012592 tcaagcact-aagcaagagacttc 35012614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 5973203 - 5973444
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5973203 tcagaatcagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtcca 5973301  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||    
T  5973302 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctca 5973394  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5973395 agcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 5973444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 273
Target Start/End: Original strand, 7677339 - 7677537
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattat-attggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagat 168  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||    
T  7677339 agacacaagcagttatcattggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagat 7677432  T
Q  169 tacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| ||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7677433 tacgaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagttttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 7677530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 4177386 - 4177601
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4177386 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4177485  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  4177486 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 4177578  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  4177579 tcaagcact-aagcaagagacttc 4177601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5640446 - 5640231
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5640446 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5640347  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  5640346 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 5640254  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  5640253 tcaagcact-aagcaagagacttc 5640231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5651003 - 5650788
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5651003 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5650904  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca--aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  5650903 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 5650811  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  5650810 tcaagcact-aagcaagagacttc 5650788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12898717 - 12898502
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12898717 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 12898618  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  12898617 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 12898525  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  12898524 tcaagcact-aagcaagagacttc 12898502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 19178430 - 19178645
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19178430 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 19178529  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  19178530 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 19178622  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  19178623 tcaagcact-aagcaagagacttc 19178645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 19187309 - 19187524
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19187309 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 19187408  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  19187409 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 19187501  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  19187502 tcaagcact-aagcaagagacttc 19187524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 21863132 - 21863347
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21863132 aacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 21863231  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  21863232 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 21863324  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  21863325 tcaagcact-aagcaagagacttc 21863347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23581032 - 23580817
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23581032 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 23580933  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| | || |||||| ||||||| |||||  |||    
T  23580932 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 23580840  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  23580839 tcaagcact-aagcaagagacttc 23580817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 267
Target Start/End: Original strand, 47194699 - 47194890
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  47194699 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 47194792  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcc 267  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||| |||||    
T  47194793 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcacataggcaagagtcttcc 47194890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 3171067 - 3171308
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3171067 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 3171164  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  3171165 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 3171256  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3171257 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 3171308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 3181669 - 3181910
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3181669 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 3181766  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  3181767 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 3181858  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3181859 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 3181910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10998520 - 10998305
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10998520 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccggtcccccttgcacttccaaggagattt 10998421  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  10998420 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 10998328  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  10998327 tcaagcact-aagcaagagacttc 10998305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12615052 - 12614837
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12615052 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagattt 12614953  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  12614952 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 12614860  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  12614859 tcaagcact-aagcaagagacttc 12614837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12624517 - 12624302
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12624517 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagattt 12624418  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  12624417 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 12624325  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  12624324 tcaagcact-aagcaagagacttc 12624302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 12730018 - 12730233
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12730018 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacgacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagattt 12730117  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  12730118 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 12730210  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  12730211 tcaagcact-aagcaagagacttc 12730233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 12740611 - 12740826
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12740611 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacgacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagattt 12740710  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  12740711 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 12740803  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  12740804 tcaagcact-aagcaagagacttc 12740826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Original strand, 21541137 - 21541246
Alignment:
Q  45 aaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatt 143  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  21541137 aaaacagagtaagagaaaagaaagaaggacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagt 21541236  T
Q  144 tccactaagt 153  Q
    | ||||||||    
T  21541237 ttcactaagt 21541246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 21877237 - 21877452
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21877237 aacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagattt 21877336  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  21877337 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 21877429  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  21877430 tcaagcact-aagcaagagacttc 21877452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 33084057 - 33084248
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  33084057 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 33084150  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33084151 acaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 33084248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35405130 - 35404913
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35405130 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 35405031  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  35405030 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 35404938  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35404937 gctcaagcact-aagcaagagacttc 35404913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35638774 - 35638559
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  35638774 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagattt 35638675  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  35638674 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 35638582  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  35638581 tcaagcact-aagcaagagacttc 35638559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35649429 - 35649212
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35649429 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 35649330  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  35649329 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 35649237  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35649236 gctcaagcact-aagcaagagacttc 35649212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36237167 - 36236950
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36237167 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 36237068  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  36237067 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 36236975  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36236974 gctcaagcact-aagcaagagacttc 36236950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36247714 - 36247497
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36247714 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 36247615  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  36247614 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 36247522  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36247521 gctcaagcact-aagcaagagacttc 36247497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 38094545 - 38094762
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38094545 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 38094644  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  38094645 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 38094737  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38094738 gctcaagcact-aagcaagagacttc 38094762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 38105170 - 38105387
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38105170 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 38105269  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  38105270 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 38105362  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38105363 gctcaagcact-aagcaagagacttc 38105387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 253
Target Start/End: Original strand, 39586467 - 39586644
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    |||||||| || ||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  39586467 agacacaaccagttatcctggttcattccataaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 39586560  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  39586561 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 39586644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4251279 - 4251085
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  4251279 agacacaagcagttatcatggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 4251186  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc------acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagac 263  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||||      | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  4251185 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctaaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtc 4251088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20442027 - 20441849
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  20442027 agacaaaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccactcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 20441934  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  20441933 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 20441849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 5832688 - 5832904
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5832688 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5832787  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  5832788 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 5832879  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5832880 gctcaagcact-aagcaagagacttc 5832904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 5843290 - 5843506
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5843290 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5843389  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  5843390 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 5843481  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5843482 gctcaagcact-aagcaagagacttc 5843506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Original strand, 7506798 - 7506988
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  7506798 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 7506891  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7506892 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 7506988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Original strand, 7517395 - 7517585
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  7517395 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 7517488  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7517489 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 7517585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7690173 - 7689980
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  7690173 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 7690080  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca-----aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 264  Q
    |||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||     |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  7690079 acaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 7689982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47608693 - 47608452
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47608693 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 47608596  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |    
T  47608595 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgct 47608504  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  47608503 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaat-aagcaagagacttc 47608452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47619301 - 47619060
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47619301 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 47619204  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |    
T  47619203 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgct 47619112  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  47619111 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaat-aagcaagagacttc 47619060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 17956728 - 17956925
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| ||||||||| || ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||    
T  17956728 aaagcgagacacaaacagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca 17956821  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaa-cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaaga 260  Q
     ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  17956822 aagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacact-aagcaaga 17956919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 2538006 - 2538222
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2538006 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 2538105  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  2538106 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 2538197  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2538198 gctcaagcact-aagcaagagacttc 2538222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9051143 - 9050994
Alignment:
Q  96 tccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagta 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||    
T  9051143 tccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagta 9051051  T
Q  196 tgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 250  Q
    |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  9051050 tgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 9050994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 52351267 - 52351178
Alignment:
Q  175 tgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52351267 tgctcaatactac--ctagtatgagacttcacaaatgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 52351178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 36099969 - 36100111
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||||||||   || |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  36099969 tgcttatgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 36100066  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36100067 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 36100111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Original strand, 4717602 - 4717736
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4717602 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4717701  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatact 185  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4717702 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact 4717736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9749979 - 9749854
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9749979 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 9749882  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9749881 gtcccccttgcacttccaaggagatttc 9749854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 145
Target Start/End: Original strand, 13223499 - 13223624
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13223499 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 13223596  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13223597 gtcccccttgcacttccaaggagatttc 13223624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Original strand, 16710304 - 16710438
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16710304 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 16710403  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatact 185  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16710404 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact 16710438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 266
Target Start/End: Original strand, 21543534 - 21543622
Alignment:
Q  177 ctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21543534 ctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 21543622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24049233 - 24049133
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24049233 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 24049134  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  24049133 c 24049133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25218156 - 25218056
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25218156 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 25218057  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  25218056 c 25218056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 36551273 - 36551173
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36551273 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 36551174  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  36551173 c 36551173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22202449 - 22202380
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22202449 aagcaattatacagcttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttc 22202380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 22654989 - 22655037
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22654989 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 22655037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Original strand, 7309177 - 7309240
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7309177 agacacaagcaattatataggttccttccacaaatcggaagtagtactgtcccccttgcacttc 7309240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22428086 - 22427988
Alignment:
Q  43 taaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  22428086 taaaaacaga-tagagagaaataagaaagacacaaatcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 22427988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 273
Target Start/End: Original strand, 19037501 - 19037567
Alignment:
Q  207 aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19037501 aaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgct 19037567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22600943 - 22600835
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagaga-agaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcac 130  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  22600943 gcagcgga-taaaaacagag-agagagagagagagagagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcac 22600846  T
Q  131 ttccaatgaga 141  Q
    |||||| ||||    
T  22600845 ttccaaggaga 22600835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19170876 - 19170823
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19170876 tcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 19170823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23975561 - 23975504
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23975561 caattatcatggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23975504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12625267 - 12625203
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  12625267 agcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 12625203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 22642407 - 22642455
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22642407 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 22642455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39194783 - 39194614
Alignment:
Q  93 ccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac-aaatgctcaatactacacct 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||     | ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |      
T  39194783 ccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccagctagattt-cact-----acaatcacaaagattacaaaatgctcaatact-ctcta 39194691  T
Q  192 agtatgagacttc---acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39194690 agtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 39194614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 12283790 - 12283852
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  12283790 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 12283852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26702845 - 26702779
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26702845 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 26702779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 19037549 - 19037590
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19037549 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 19037590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21215403 - 21215330
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21215403 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 21215330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21121766 - 21121617
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||      | ||||||||||||||| |||||     
T  21121766 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgtaata-----tctgattacaaatgctcactactaa 21121673  T
Q  188 acctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    || ||||| ||||||||| || || |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  21121672 acttagtaagagacttca-aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 21121617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21192602 - 21192514
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  21192602 agagagagaaaagaaagacacaaagcaattatactggttccttcaacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 21192514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 148879 - 148734
Alignment:
Q  116 cagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc---acaaatgt 212  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||     |||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||   | |||||     
T  148879 cagtcctccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaaatgc 148787  T
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  148786 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 148734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 150
Target Start/End: Original strand, 31358730 - 31358804
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  31358730 aagcaattatcctggttccttccacaatctagaagtagtccaatcccccctgcacttccaaggagattttcacta 31358804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 44824486 - 44824408
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44824486 aagaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 44824408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Original strand, 1577233 - 1577298
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  1577233 agcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggaga 1577298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 5929251 - 5929292
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5929251 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 5929292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 144
Target Start/End: Original strand, 8698239 - 8698327
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8698239 agagagaagagaaagagaca-aagtaattatcctcgttccttccacaatccagaagtagtctagtccccattgcacttccaaggagattt 8698327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 17370584 - 17370625
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17370584 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 17370625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 18614282 - 18614347
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  18614282 aagcaattataatgattcattccacaatccggaagtagtccactcccccttgaacttccaaggaga 18614347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Original strand, 21983974 - 21984085
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||      | ||||||||||||||| |||||     
T  21983974 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgtaata-----tctgattacaaatgctcactactaa 21984067  T
Q  188 acctagtatgagacttca 205  Q
    || ||||| |||||||||    
T  21984068 acttagtaagagacttca 21984085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22465525 - 22465460
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  22465525 aagcaattatacatgtttcttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 22465460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 22642437 - 22642478
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22642437 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22642478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 23926594 - 23926647
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23926594 tcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 23926647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 28379537 - 28379578
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28379537 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 28379578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28492996 - 28492932
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  28492996 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctat-ccccttgcacttccaaggaga 28492932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 48703628 - 48703693
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||    
T  48703628 aagcaattatataagttccttccacaaaccggaagtagtcatgcccccattgcacttccaaggaga 48703693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Original strand, 23024171 - 23024320
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||      | ||||||||||||||| |||||     
T  23024171 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata-----tctgattacaaatgctcactactaa 23024264  T
Q  188 acctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    || |||||||||| |||| || || |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  23024265 acttagtatgagaattca-aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 23024320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23037206 - 23037154
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23037206 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 23037154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25449260 - 25449212
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25449260 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 25449212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 29215175 - 29215227
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29215175 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgaga 29215227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Original strand, 42284019 - 42284168
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||      | ||||||||||||||| |||||     
T  42284019 ggttccttccacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttc-actatgtaatat-----ctgattacaaatgctcactactaa 42284112  T
Q  188 acctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    || ||||||||||||||| || || |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  42284113 acttagtatgagacttca-aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 42284168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 10756803 - 10756854
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  10756803 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggaga 10756854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 266
Target Start/End: Original strand, 22018876 - 22018915
Alignment:
Q  227 aagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22018876 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22018915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22601318 - 22601233
Alignment:
Q  54 tagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  22601318 tagagagaagagaaagacaca-aagcaattatacaggttccttccacaatc-ggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 22601233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 141
Target Start/End: Original strand, 26702972 - 26703043
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  26702972 agacacaagcaattatacaagttccttccacaatctggaagtagttctgtccctcttgcacttccaaagaga 26703043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 10250342 - 10250420
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  10250342 aagaaagacacaaacaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 10250420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 244
Target Start/End: Original strand, 19214932 - 19215141
Alignment:
Q  33 cgcagcggagtaaaaacagagt-agagagaagaaagagagacacaa-gcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgc 128  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||| |||     
T  19214932 cgcagcgga-taaaaacagagagagagagaaggaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaaatcaatcctgtcccctttgt 19215030  T
Q  129 acttccaatgagatttccactaa--gtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggc 226  Q
    |||||||| |||| ||| |||||  ||||||      | |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||   ||    
T  19215031 acttccaaggagagttc-actaaaagtaatat-----ctgattacaattgctcaatactaaacttagtatgagacttca-aaatgctcaagcacaactgc 19215123  T
Q  227 aagagacttcctttgctc 244  Q
    ||||||||| || |||||    
T  19215124 aagagactttctatgctc 19215141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 144
Target Start/End: Original strand, 22639672 - 22639750
Alignment:
Q  66 agagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| | ||||||||||  |  |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  22639672 agagagagagaagcaattatcctatttccttccacaacctggaagtagtccagttccccttgcacttcaaaggagattt 22639750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 36133569 - 36133635
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaag-tagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||||    
T  36133569 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttagccctggcccccttgcacttccaaggaga 36133635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2328137 - 2328069
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaata 157  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  2328137 ggttccttccacaaattggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaagtaata 2328069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 266
Target Start/End: Original strand, 4166870 - 4166945
Alignment:
Q  192 agtatgagacttcacaaa--tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4166870 agtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 4166945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Original strand, 21702193 - 21702341
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||      | |||||||| |||||| |||||     
T  21702193 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctatccctcttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata-----tctgattacaattgctcactactaa 21702286  T
Q  188 acctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    || ||||| |||||||  |||||| |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  21702287 acttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 21702341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 22655019 - 22655060
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22655019 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagagacttc 22655060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26548795 - 26548754
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26548795 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagagacttc 26548754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34256055 - 34256014
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34256055 gcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttc 34256014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Original strand, 37640387 - 37640498
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||   | ||||| ||||||      | |||||||| ||||||||||||     
T  37640387 ggttccttccacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaa-gaggagttcactatgtaata-----tctgattacaactgctcaatactat 37640480  T
Q  188 acctagtatgagacttca 205  Q
    || |||||||||||||||    
T  37640481 acttagtatgagacttca 37640498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 46088342 - 46088516
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||         
T  46088342 aagaaagacacaagcaatttatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagtt-cactatgtaata----- 46088435  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     | ||||||| ||||||| | ||| || ||||| ||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  46088436 tctgattacacatgctcacttctaaacttagtaagagacttca-aattgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 46088516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 48570950 - 48570877
Alignment:
Q  70 agacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  48570950 agacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggaga 48570877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2819973 - 2819913
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2819973 gttcattctacaatccggaagtagtccacttccccttgcactttcaatgagattttcacta 2819913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7745645 - 7745602
Alignment:
Q  229 gagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7745645 gagacttcctttgctcaagcac-acagcaagagacttcctatgct 7745602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Original strand, 17017957 - 17018021
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  17017957 agcaattatacaggttccttccataaatcagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 17018021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17025532 - 17025484
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17025532 gcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgct 17025484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21205574 - 21205526
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21205574 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 21205526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21684672 - 21684612
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  21684672 aagcaattatataggttccttccacaattcggaagtagccatgtcccccttgcaattccaa 21684612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16233824 - 16233773
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||    
T  16233824 gttccttccacaatccggaagtagtcttgtcccccttgcgcttccaaggaga 16233773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 272
Target Start/End: Original strand, 22639780 - 22639839
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgc 272  Q
    |||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22639780 tcaagcacacaagcaagagacttcaaatgctcaagcacaaaagcaagagactttctatgc 22639839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 135
Target Start/End: Original strand, 24218706 - 24218786
Alignment:
Q  54 tagagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 135  Q
    |||||||||||  || ||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  24218706 tagagagaaga--gaaagacacaaggcaattattctggttccttccacgatccggaagtagtccagtcctcctttctcttcca 24218786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867345
Alignment:
Q  228 agagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 20867345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Original strand, 20908777 - 20908847
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccc-ttgcacttccaatgagatttcc 146  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  20908777 agcaattatacaggttccttccacaaatctgaagtagtcttgtccccctttgcacttccaaggagagttcc 20908847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 22153220 - 22153286
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  22153220 aagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtcggtcctgtccctcttgcacttccaaggaga 22153286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 32786653 - 32786587
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  32786653 aagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtcaatcctgtctcccttgcacttccaaggaga 32786587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33257066 - 33257000
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  33257066 aagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccctcttgtacttccaaggaga 33257000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33277238 - 33277172
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  33277238 aagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccctcttgtacttccaaggaga 33277172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 38281750 - 38281816
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  38281750 aagcaattataaaggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggaga 38281816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 8698399 - 8698440
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8698399 gcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 8698440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 9346143 - 9346208
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  9346143 aagcaattatacatgttccttccacaatccgtaagtagtcatgtcccctttgcacttccaaggaga 9346208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14293326 - 14293273
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  14293326 ggttccttccacaaaccggaaataagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 14293273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 129
Target Start/End: Original strand, 23053740 - 23053793
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgca 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||    
T  23053740 aagcaattatagtggttccttccacaatctaggagtagtccactcccccttgca 23053793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26280590 - 26280549
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26280590 gcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 26280549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 30892459 - 30892523
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  30892459 aagcaattatacagattccttccacaaaccagaagtagtcatgt-ccccttgcacttccaaggaga 30892523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 31358858 - 31358911
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  31358858 tcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcgcaaaagcaagagacttc 31358911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 273
Target Start/End: Original strand, 8698349 - 8698417
Alignment:
Q  205 acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||| |||||| | || |||||||   | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8698349 acaaatgttcaagcacacaagaaaaagacttcaaatactcaagcacaaaagcaagagatttcctatgct 8698417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 265
Target Start/End: Original strand, 10153580 - 10153620
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  10153580 gcaagagacttcctatgttcaagcacaaaagcaagagactt 10153620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14263971 - 14263931
Alignment:
Q  226 caagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14263971 caagagacttctattgctcaagcacaaaagcaagagacttc 14263931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17025501 - 17025461
Alignment:
Q  226 caagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  17025501 caagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 17025461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23037108 - 23037060
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23037108 gcaagagacttcaaatgctcaagcacaacagcaagagacttcctatgct 23037060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 266
Target Start/End: Original strand, 35895683 - 35895743
Alignment:
Q  206 caaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||| |||| |||||| | |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  35895683 caaatggtcaatcacacaagaaagagacttccaatgctcaagcacacaagcaagagacttc 35895743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 32280 - 32553
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaa-acagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280 attgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttcca 32379  T
Q  100 caaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32380 caaaccggaagtagttcagtccccctggcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaatttacaactgctcaatactacacctagtatgag 32479  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32480 acttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 32553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 32535 - 32576
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32535 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 32576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 188)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11087872 - 11087601
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11087872 attgcttctgatgtaaagttcagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 11087773  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11087772 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggcgatttccgctaagt-ttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 11087674  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11087673 cttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgct 11087601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8999763 - 8999491
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8999763 attgcttctgatatattgttcaaaatcggatacgcaacagagtaaaaacagagtacataaaagaaagagagacacaagcaattatactgattccttccac 8999664  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8999663 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 8999564  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8999563 cttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagaaacttcaaatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 8999491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13175416 - 13175162
Alignment:
Q  18 gttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175416 gttcagaatcggatacgcagcagattaacaacagattagggagaagaaagagaaacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtcca 13175317  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  13175316 gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcacacagattacaactgctcagtactacacctagtctgagacttcacaaatgctcaag 13175218  T
Q  218 cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175217 cacgcaggctatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 13175162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24883210 - 24882949
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24883210 tgcttctgatgtgatgttcataattagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcccggttccttccacaa 24883111  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  24883110 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagact 24883013  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24883012 tcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 24882949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 29589477 - 29589733
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29589477 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagaa-----aagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 29589571  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  29589572 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatcacaaatgctcaatact--atctagtatgagact 29589669  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29589670 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 29589733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 8933048 - 8933305
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8933048 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 8933147  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  8933148 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagact 8933241  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8933242 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 8933305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12734980 - 12734729
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12734980 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagccgaatgaaaacagaacagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 12734881  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  12734880 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatcacaaagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagact 12734787  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaaga 260  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12734786 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaaga 12734729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26210364 - 26210107
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26210364 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaaagaaaacagaacagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 26210265  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||    
T  26210264 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattcccac----taataatcacacagattacagatgctcaatact--ctctagtatgagact 26210171  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26210170 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 26210107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 15215801 - 15216058
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15215801 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagtagagaaaagaaagaaggacacaagcaattatcctggttccttccacaa 15215899  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  15215900 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttaacta---aataatcacacagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagact 15215994  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15215995 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctaaagcactaaagcaagagtcttc 15216058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 18440680 - 18440937
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18440680 tgcttctgatgtgatgttcagaattagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 18440778  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    |||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  18440779 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatctcaaagattacaaatgctcaatact-ctcttagtatgagact 18440873  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18440874 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 18440937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4433410 - 4433138
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  4433410 attgcttctgatgtgcagttcagattcagatgcacagcggagtaaaa-cagagtaagagagaagaaagaaagacacaggcaattatacaggttccttcca 4433312  T
Q  100 caaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatg 197  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || | || ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4433311 caaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaaatgctcaatactacacctagtatg 4433213  T
Q  198 agacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4433212 agacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagaatttctatgct 4433138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4412838 - 4412565
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| || ||| | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  4412838 attgcttctgatgtgcagttcagattcagatgcacaacggagtaaaa-cagagtaagagagaagaaagaaagacacaggcaattatacaggttccttcca 4412740  T
Q  100 caaaccggaagt--agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtat 196  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4412739 caaaccggaagttcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtat 4412641  T
Q  197 gagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4412640 gagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgct 4412565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38404027 - 38403769
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38404027 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-catagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 38403929  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  38403928 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 38403834  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||  |||| ||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38403833 tctcaaaatactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 38403769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3477114 - 3476899
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3477114 aaaacagagtagagaaaagaaagaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 3477015  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||     
T  3477014 tcac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctt 3476921  T
Q  245 aagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  3476920 aagcactaaagcaagagtcttc 3476899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 13681806 - 13682061
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13681806 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcagaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 13681904  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  13681905 accggaagtagtccag-accccttgcacttcgaaggagatttccac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagact 13681997  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13681998 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 13682061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 48381671 - 48381929
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  48381671 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctagttcctttcacaa 48381769  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  48381770 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 48381864  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48381865 tctcaaaatgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 48381929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17064344 - 17064087
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17064344 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 17064246  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  17064245 aacggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 17064152  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||| || ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17064151 tctcaaaatgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 17064087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 266
Target Start/End: Original strand, 18418674 - 18418856
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgct 178  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    |||||||| || ||||||||||||||    
T  18418674 caattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatctcaaagattacaaatgct 18418769  T
Q  179 caatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18418770 caatact-ctcttagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 18418856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6045083 - 6044957
Alignment:
Q  17 tgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcc 116  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6045083 tgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcatggttccttccacaaaccggaagtagtcc 6044985  T
Q  117 agtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6044984 agtcccccttgcacttccaaggagattt 6044957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31117264 - 31117068
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||    
T  31117264 aaagcgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca 31117171  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagag 261  Q
     ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  31117170 aagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaat-aagcaagag 31117073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 3165262 - 3165477
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3165262 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 3165361  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  3165362 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 3165454  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  3165455 tcaagcact-aagcaagagtcttc 3165477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 20490534 - 20490749
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20490534 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 20490633  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  20490634 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 20490726  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  20490727 tcaagcact-aagcaagagtcttc 20490749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21003781 - 21003566
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21003781 aacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 21003682  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||| ||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  21003681 -cact-----ataataacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 21003589  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  21003588 tcaagcact-aagcaagagacttc 21003566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40055507 - 40055323
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||    
T  40055507 aaagcgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca 40055414  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
     ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  40055413 aagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 40055323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 588765 - 588955
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  588765 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 588858  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||    
T  588859 acaaatgctcaatacta-tctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgttcaagcact-aagcaagagacttc 588955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15889076 - 15888886
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  15889076 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 15888983  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15888982 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 15888886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 166422 - 166637
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  166422 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 166521  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  166522 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 166614  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  166615 tcaagcact-aagcaagagacttc 166637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 177014 - 177229
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  177014 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 177113  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  177114 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 177206  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  177207 tcaagcact-aagcaagagacttc 177229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 468354 - 468139
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  468354 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttccaaggagattt 468255  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  468254 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatacttc-ctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 468162  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  468161 tcaagcact-aagcaagagacttc 468139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 9084811 - 9085026
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9084811 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 9084910  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  9084911 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9085003  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9085004 tcaagcact-aagcaagagacttc 9085026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 9094525 - 9094740
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9094525 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 9094624  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  9094625 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9094717  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9094718 tcaagcact-aagcaagagacttc 9094740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 9432791 - 9433006
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9432791 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 9432890  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagactt--cacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  9432891 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9432983  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9432984 tcaagcact-aagcaagagacttc 9433006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 20989180 - 20989395
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20989180 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 20989279  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| |||||||| ||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  20989280 -cact-----ataatcacaaagattacagatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 20989372  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  20989373 tcaagcact-aagcaagagacttc 20989395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26654098 - 26653883
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26654098 aacagagcagagaaaagaaagacaaggacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 26653999  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  26653998 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 26653906  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  26653905 tcaagcact-aagcaagagacttc 26653883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26700427 - 26700212
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26700427 aacagagcagagaaaagaaagacaaggacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 26700328  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  26700327 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 26700235  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  26700234 tcaagcact-aagcaagagacttc 26700212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 48711264 - 48711049
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48711264 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 48711165  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  48711164 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 48711072  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  48711071 tcaagcact-aagcaagagacttc 48711049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 1367182 - 1367372
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  1367182 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaatggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 1367275  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1367276 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 1367372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21770686 - 21770500
Alignment:
Q  74 acaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaa 173  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||||    
T  21770686 acaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaa 21770593  T
Q  174 atgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21770592 atgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 21770500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26294803 - 26294587
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26294803 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 26294704  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  26294703 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 26294611  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  26294610 ctcaagcact-aagcaagagacttc 26294587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 30049072 - 30049262
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  30049072 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacgaaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 30049165  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30049166 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 30049262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38594436 - 38594256
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||    
T  38594436 aaagcgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca 38594343  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 250  Q
     ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| ||||   |||||||||||    
T  38594342 aagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaatgctcaagcac 38594256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14746443 - 14746227
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14746443 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 14746344  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaa-cacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  14746343 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatg 14746251  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  14746250 ctcaaacact-aagcaagagacttc 14746227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 1987041 - 1987282
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1987041 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 1987138  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  1987139 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 1987230  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1987231 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 1987282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 1997662 - 1997903
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1997662 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 1997759  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  1997760 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 1997851  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1997852 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 1997903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2706387 - 2706170
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2706387 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 2706288  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  2706287 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 2706195  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2706194 gctcaagcact-aagcaagagacttc 2706170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 5685046 - 5685261
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5685046 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 5685145  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||| |||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  5685146 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagatttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 5685238  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  5685239 tcaagcact-aagcaagagacttc 5685261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8002864 - 8002623
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8002864 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 8002767  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  8002766 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaacactatgct 8002675  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8002674 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 8002623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8013509 - 8013268
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8013509 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 8013412  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  8013411 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaacactatgct 8013320  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8013319 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 8013268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 9443387 - 9443602
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9443387 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagattt 9443486  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagactt--cacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  9443487 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9443579  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9443580 tcaagcact-aagcaagagacttc 9443602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17950893 - 17950676
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17950893 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 17950794  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  17950793 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 17950701  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17950700 gctcaagcact-aagcaagagacttc 17950676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17961499 - 17961282
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17961499 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 17961400  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  17961399 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 17961307  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17961306 gctcaagcact-aagcaagagacttc 17961282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 22099265 - 22099480
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22099265 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 22099364  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||| |||||  |||    
T  22099365 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacgcatgcaagagtcttccaatgc 22099457  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  22099458 tcaagcact-aagcaagagacttc 22099480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24931352 - 24931161
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  24931352 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 24931259  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa---tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||||   || |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24931258 acaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 24931161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26390871 - 26390654
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26390871 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 26390772  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  26390771 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 26390679  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26390678 gctcaagcact-aagcaagagacttc 26390654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26401513 - 26401296
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26401513 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 26401414  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  26401413 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 26401321  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26401320 gctcaagcact-aagcaagagacttc 26401296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 37343727 - 37343942
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37343727 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagattt 37343826  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  37343827 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 37343919  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  37343920 tcaagcact-aagcaagagacttc 37343942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40042883 - 40042666
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40042883 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 40042784  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  40042783 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 40042691  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40042690 gctcaagcact-aagcaagagacttc 40042666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40053432 - 40053215
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40053432 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 40053333  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  40053332 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 40053240  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40053239 gctcaagcact-aagcaagagacttc 40053215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 42865328 - 42865569
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42865328 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 42865425  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  42865426 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 42865517  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  42865518 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 42865569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 42875954 - 42876195
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42875954 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 42876051  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  42876052 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 42876143  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  42876144 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 42876195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 9169738 - 9169928
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  9169738 agacacaancagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 9169831  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||| |||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9169832 acaaatgatcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaggcttc 9169928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6867973 - 6867783
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||  ||||    
T  6867973 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaggatt 6867880  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6867879 acaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 6867783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6878605 - 6878415
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||  ||||    
T  6878605 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaggatt 6878512  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6878511 acaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 6878415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 9159283 - 9159473
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  9159283 agacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 9159376  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||| |||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9159377 acaaatgatcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaggcttc 9159473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 540640 - 540856
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  540640 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 540739  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
    |      |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  540740 c------gctataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 540832  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  540833 tcaagcacgcaggcaagagacttc 540856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2716991 - 2716774
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2716991 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 2716892  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  2716891 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 2716799  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||    
T  2716798 ggtcaagcact-aagcaagagacttc 2716774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 4211565 - 4211781
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4211565 aacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4211664  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  4211665 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 4211756  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4211757 gctcaagcact-aagcaagagacttc 4211781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 11004711 - 11004927
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11004711 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 11004810  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  11004811 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 11004902  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11004903 gctcaagcact-aagcaagagacttc 11004927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 22088650 - 22088865
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22088650 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 22088749  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| ||  || ||||||| |||||  |||    
T  22088750 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcatgcatgcaagagtcttccaatgc 22088842  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  22088843 tcaagcact-aagcaagagacttc 22088865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Original strand, 24734305 - 24734495
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  24734305 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 24734398  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24734399 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 24734495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Original strand, 24744252 - 24744442
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  24744252 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 24744345  T
Q  172 aaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24744346 aactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 24744442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 8627474 - 8627691
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8627474 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 8627573  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattaca-aatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| |||||||| | |||||||||||   |  |||||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  8627574 -cact-----ataatcacaaagattacatactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 8627666  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8627667 gctcaagcact-aagcaagagacttc 8627691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 8616912 - 8617128
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8616912 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccagaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 8617011  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||   ||||  |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  8617012 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 8617104  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  8617105 ctcaagcact-aagcaagagacttc 8617128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 4222134 - 4222350
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||   ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4222134 aacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcccggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4222233  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  4222234 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 4222325  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4222326 gctcaagcact-aagcaagagacttc 4222350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19986293 - 19986159
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19986293 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 19986194  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatact 185  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19986193 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 19986159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 250
Target Start/End: Original strand, 44280051 - 44280251
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44280051 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 44280150  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
      |||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||   |||    
T  44280151 -aact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgc 44280243  T
Q  243 tcaagcac 250  Q
    ||||||||    
T  44280244 tcaagcac 44280251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 4820826 - 4821008
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagt 153  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  4820826 agagagaaggaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactaagt 4820924  T
Q  154 aataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    | || |      |||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  4820925 agtatt-----tgattacaattgctcactactatacttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 4821008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 183
Target Start/End: Original strand, 20967221 - 20967328
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  20967221 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 20967314  T
Q  170 acaaatgctcaata 183  Q
    ||||||||||||||    
T  20967315 acaaatgctcaata 20967328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25212604 - 25212489
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||    
T  25212604 aaagtgagacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca 25212511  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatact 185  Q
     ||||||||| |||||||||||    
T  25212510 aagattacaactgctcaatact 25212489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 457765 - 457631
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  457765 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttccaaggagattt 457666  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatact 185  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  457665 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact 457631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19711819 - 19711742
Alignment:
Q  65 aagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19711819 aagagagacacaaagcaattatactggttccttccataaaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 19711742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Original strand, 23643169 - 23643285
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23643169 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaatgacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 23643266  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23643267 gtcccccttgcacttccaa 23643285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 266
Target Start/End: Original strand, 602139 - 602314
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacac-agattacaaatgctcaatacta 186  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  602139 ggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt-ataatcacacaagattacaactgctcaatactt 602237  T
Q  187 cacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     | | ||||||||||||||  | || |||| |||||| ||||||||||| || ||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  602238 aaacaagtatgagacttca-gattgctcaagcacaca-gcaagagactt-ctatgctcaaacacacaagtaagagacttc 602314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1879018 - 1878942
Alignment:
Q  74 acaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1879018 acaagcaattatcctggttccttccacaattcggaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattttcacta 1878942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 181
Target Start/End: Original strand, 11015356 - 11015463
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacaca-gat 168  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||     |||||||| | |||    
T  11015356 agacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagttcagttccccttgcacttccaaggagattttcacta-----taatcacaaatgat 11015450  T
Q  169 tacaaatgctcaa 181  Q
    |||||||||||||    
T  11015451 tacaaatgctcaa 11015463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7488693 - 7488634
Alignment:
Q  82 ttatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7488693 ttatagtggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttacacttccaaggaga 7488634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 11572943 - 11572881
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11572943 tggttccttccacattccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcacta 11572881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Original strand, 13302200 - 13302282
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13302200 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaa 13302282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19237828 - 19237766
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19237828 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaatgaga 19237766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13259198 - 13259133
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13259198 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 13259133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13266538 - 13266473
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13266538 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 13266473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 1292445 - 1292606
Alignment:
Q  70 agacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacaga 167  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||      | ||    
T  1292445 agacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata-----tctga 1292538  T
Q  168 ttacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttc 236  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||| || || |||||||||   ||||||||||||    
T  1292539 ttacaaatgctaactactaaacttagtaagagacttca-aattgctcaaacacaactgcaagagacttc 1292606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 145
Target Start/End: Original strand, 11318744 - 11318836
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11318744 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttc 11318836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 13645812 - 13645872
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13645812 aagcaattatacaggttccttccacaaaccgtaagtagtcctgtcccccttgcacttccaa 13645872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Original strand, 33604227 - 33604333
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  33604227 gcagcgga-taaaaacggag-agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttccactt 33604324  T
Q  133 ccaatgaga 141  Q
    |||| ||||    
T  33604325 ccaaggaga 33604333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 48806662 - 48806513
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||   || ||| |||| ||||||      | |||||||||||||||||||||     
T  48806662 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaagaggagttc-actatgtaatat-----ctgattacaaatgctcaatactaa 48806569  T
Q  188 acctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  48806568 acttagtatgagacttca-aattgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 48806513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10883989 - 10883902
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  10883989 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 10883902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 11792274 - 11792336
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  11792274 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 11792336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19340056 - 19339920
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaag-tagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||         
T  19340056 aagaaagacacaggcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgtaata----- 19339963  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca 205  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  19339962 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtatgagacttca 19339920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Original strand, 25806794 - 25806860
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25806794 caattatcttggttccttccacaatccggaagtagtttagtccctcttgcacttccaacgagatttc 25806860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11087619 - 11087578
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11087619 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 11087578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13261411 - 13261346
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13261411 aagcaattatacatgttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 13261346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16308501 - 16308440
Alignment:
Q  80 aattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16308501 aattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagaga 16308440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1559876 - 1559820
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtaga 57  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1559876 attgcttctgatgtattgttcagaatctgatatgcagcggagtaaaaacagagtaga 1559820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2914429 - 2914341
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  2914429 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggaga 2914341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Original strand, 14187009 - 14187115
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||  |||| |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  14187009 gcagcgga-taaaaacaaag-agagagaaagaagaaagacacaaagaaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcttgtcccccttgcactt 14187106  T
Q  133 ccaatgaga 141  Q
    |||| ||||    
T  14187107 ccaaggaga 14187115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23280757 - 23280682
Alignment:
Q  66 agagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23280757 agagagaca-aagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 23280682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28623149 - 28623089
Alignment:
Q  82 ttatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28623149 ttatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 28623089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16105731 - 16105668
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||    
T  16105731 agacacaagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgccctccttgcacttc 16105668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16310703 - 16310644
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 135  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  16310703 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcaattcca 16310644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1251679 - 1251598
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccctt 126  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1251679 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 1251598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 8182309 - 8182387
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  8182309 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 8182387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 133
Target Start/End: Original strand, 13879531 - 13879589
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13879531 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttc 13879589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 142
Target Start/End: Original strand, 16464385 - 16464451
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagat 142  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16464385 aagcaattatactagttccttccataatctggaagtagtccagtcccccttgcaattccaaggagat 16464451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Original strand, 24787691 - 24787788
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacaca-agcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24787691 aaaacagag-agagagaaagaagaaagacacacaacaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 24787788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29936138 - 29936077
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  29936138 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgt-ccccttgcacttccaaggaga 29936077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 33421101 - 33421274
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||         
T  33421101 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata----- 33421194  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     | |||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  33421195 tctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 33421274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 39285296 - 39285234
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  39285296 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtctcccttccacttccaaagaga 39285234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 44466455 - 44466521
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  44466455 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 44466521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 133
Target Start/End: Original strand, 4493936 - 4493993
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4493936 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtattcctgtcccccttgcacttc 4493993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5001622 - 5001557
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  5001622 aagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 5001557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8999509 - 8999468
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8999509 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 8999468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12223201 - 12223124
Alignment:
Q  67 gagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12223201 gagatacacaagcaattatcctggtttcatccacaatccagaagtggtccagtcccccttgcacttctaaggagattt 12223124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15705294 - 15705221
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15705294 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 15705221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15871832 - 15871759
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||| |||||    
T  15871832 agcaattatcctggttccttccacaatctggaagtagtccagtcccctttgtacttccaaggatattttcacta 15871759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16317350 - 16317286
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16317350 aagcaatcatacaggttccttccacaaacaggaagtagtcc-gtcccccttgcacttccaaggaga 16317286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Original strand, 16411374 - 16411435
Alignment:
Q  80 aattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  16411374 aattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccacttgcacttccaaggaga 16411435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21211340 - 21211275
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21211340 aagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttgcaaggaga 21211275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22579978 - 22579917
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22579978 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 22579917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 27871067 - 27871241
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||         
T  27871067 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgtaata----- 27871160  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| || || |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  27871161 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttca-aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 27871241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 41843220 - 41843155
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  41843220 aagcaattatacaagttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 41843155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 48063619 - 48063445
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaa-ttatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||         
T  48063619 aagaaagacacaagcaaattatacaggtttcttccacaaaccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttc-actatgtaatat---- 48063525  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || || |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  48063524 -ctgattacaaatgctcactactaaacttagtatgagacttca-aattgctcaatcacaactgcaagagacttcctatgctc 48063445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12367533 - 12367473
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  12367533 aagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtagttatgtcccccttgcacttccaa 12367473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13034656 - 13034568
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  13034656 agagagaaagaagaaagacacaaagaaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggaga 13034568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19328829 - 19328741
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaag-tagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  19328829 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacagattccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 19328741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21284192 - 21284104
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21284192 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacatgttccttccacaaaccgggagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 21284104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30946148 - 30946088
Alignment:
Q  82 ttatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30946148 ttatataggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 30946088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 331000 - 331175
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc-cactaagtaataatca 161  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||| ||| |  |||||||||        
T  331000 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctggcacttccaaggagagttcactataagtaata---- 331095  T
Q  162 cacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
      | ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||||||  |||||| |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  331096 -tctgattacaaatgctcactgctaaacctagcaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 331175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3779450 - 3779382
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccct 125  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  3779450 agagagaagaaa--gagacacaaacaattatcttggttctttccacaatccagaagtagttcagtccccct 3779382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 136
Target Start/End: Original strand, 14425926 - 14425969
Alignment:
Q  93 ccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14425926 ccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaa 14425969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16315356 - 16315270
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  16315356 agagagaatgaagaaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtagt-catgcccccttgcacttccaaggaga 16315270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21382236 - 21382165
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttcc 134  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  21382236 aagagagacacaatcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttcc 21382165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 2499424 - 2499490
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  2499424 aagcatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggaga 2499490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2501729 - 2501667
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2501729 tggttccttccataatttggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagattttcacta 2501667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 5034659 - 5034721
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5034659 caattatacaggttccttccacaatccggaggtagtcctgtcccccttggacttccaaggaga 5034721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13138692 - 13138626
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  13138692 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaacgaga 13138626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 136
Target Start/End: Original strand, 21019382 - 21019443
Alignment:
Q  74 acaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||| ||||||||    
T  21019382 acaagcaattatattggttccttccacaaaccgagagtagttcagt-tcccttgtacttccaa 21019443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 150
Target Start/End: Original strand, 23125356 - 23125418
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  23125356 tggttccttccacaatccggaagtagtccaatctcacttgcacttccaaggggattttcacta 23125418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23303913 - 23303859
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccc 124  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23303913 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc 23303859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 602291 - 602344
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  602291 tcaaacacacaagtaagagacttcagatgctcaagcactaaagcaagagacttc 602344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4412583 - 4412542
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4412583 gcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 4412542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9099026 - 9098961
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||||| ||||    
T  9099026 aagcaattatagaggttccttccacaaaccggaagtagtcatattcctcttgcacttccaaggaga 9098961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9099832 - 9099767
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||||| ||||    
T  9099832 aagcaattatagaggttccttccacaaaccggaagtagtcatattcctcttgcacttccaaggaga 9099767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9710586 - 9710533
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  9710586 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagaga 9710533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 123
Target Start/End: Original strand, 9802567 - 9802624
Alignment:
Q  66 agagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccc 123  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9802567 agagagacacaaacaattatcctggttgcttccataatccggaagtagtccagtcccc 9802624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 13263319 - 13263360
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13263319 gcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 13263360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Original strand, 14424891 - 14425002
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||      | ||||||||||||||| |||||     
T  14424891 ggttccttccacaaactggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagagtt-cactatgtaata-----tctgattacaaatgctcactactaa 14424984  T
Q  188 acctagtatgagacttca 205  Q
    || ||||| |||||||||    
T  14424985 acttagtaagagacttca 14425002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16546118 - 16546065
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaag-tagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  16546118 ggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggaga 16546065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 16619544 - 16619597
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaag-tagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  16619544 ggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggaga 16619597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24795522 - 24795449
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  24795522 aagagaaacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 24795449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35954687 - 35954634
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  35954687 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 35954634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 48237623 - 48237570
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  48237623 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 48237570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1878883 - 1878832
Alignment:
Q  218 cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttccta 269  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1878883 cacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaacagacttccta 1878832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 455429 - 455357
Alignment:
Q  195 atgagacttcacaaa--tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  455429 atgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 455357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2266321 - 2266243
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  2266321 aagaaagacacaatcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagccttgtcccccttgcacttccaaggaga 2266243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13173138 - 13173084
Alignment:
Q  82 ttatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13173138 ttatagtggttcattccacaatctggaagaagtccactcccccttgcacttccaa 13173084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13731502 - 13731405
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  13731502 aaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaagctggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 13731405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13902390 - 13902348
Alignment:
Q  94 cttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13902390 cttccacaaaccagaagtagtcctgtcccccttgtacttccaa 13902348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Original strand, 15087916 - 15087978
Alignment:
Q  80 aattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  15087916 aattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggaga 15087978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 135
Target Start/End: Original strand, 30025273 - 30025355
Alignment:
Q  54 tagagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 135  Q
    |||||||||  |||| ||||||||  ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  30025273 tagagagaaagaagaaagacacaaaacaattatacatgttccttcaacaaaccggaagtagtcttgtcccccttccacttcca 30025355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32265527 - 32265457
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  32265527 aagaaagacacaagcaatttatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttc 32265457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4433156 - 4433115
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4433156 gcaagagaatttctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 4433115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 129
Target Start/End: Original strand, 4549712 - 4549769
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgca 129  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  4549712 acacaaacaactatactggttccttccacaacccgaaagtagttaagtcccccttgca 4549769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 9069134 - 9069187
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  9069134 ggttctttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 9069187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 9802686 - 9802727
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  9802686 gcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 9802727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Original strand, 12220350 - 12220422
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12220350 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 12220422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13172973 - 13172932
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  13172973 gcaagagacttcctatactcaagcacaaaagcaagagacttc 13172932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13175180 - 13175139
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  13175180 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaattaagagacttc 13175139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 115
Target Start/End: Original strand, 13681634 - 13681695
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtc 115  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13681634 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccatccacaaaccggaagtagtc 13681695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16557371 - 16557318
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  16557371 ggttccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggaga 16557318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 16608291 - 16608344
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  16608291 ggttccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggaga 16608344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 25806920 - 25806973
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25806920 tcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttc 25806973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Original strand, 1775636 - 1775728
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagta 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  1775636 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 1775728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 5034924 - 5034964
Alignment:
Q  226 caagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5034924 caagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagatacttc 5034964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8309931 - 8309860
Alignment:
Q  73 cacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  8309931 cacatgcatttatatttgttcctcccacaaaccgagagtagtccaatcccc-ttgcacttccaaagggatttc 8309860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 265
Target Start/End: Original strand, 11095740 - 11095795
Alignment:
Q  209 atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  11095740 atgttcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 11095795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13027717 - 13027629
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13027717 agagagaaagaagaaagacacaaagcaagtatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcactttcaaggaga 13027629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 15467293 - 15467345
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15467293 gttccttccacaaaccagaaatcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 15467345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 59676 - 59407
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  59676 attgcttttgatgtattgttcagaatctgatacgcagcggagtaaaa-cagagtagagagaagaaagagagacacaaacaattatactggttccttccac 59578  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  59577 aaaccagaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatact--acctagtatgaga 59480  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59479 cttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 59407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41132 - 40861
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41132 attgcttatgatgtattgttcagaatctgatacgcagcggagtaaaa-cagagtagcgaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccac 41034  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41033 aaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatattacacctagtatgaga 40934  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40933 cttcacaaatgctcaagcacgtaggcaagagacttcctttgctcaagcaataaagcaagagacttcctatgct 40861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Original strand, 174862 - 175039
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  174862 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagaggaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 174960  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatact 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  174961 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaaa----aatcacacagattacaaatgctcaatact 175039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40879 - 40838
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40879 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 40838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 59425 - 59384
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  59425 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 59384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1792 - 1529
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1792 attgcttctgatgtattgttcagaatctaatacgcagcgcagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccac 1693  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  1692 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgaga 1595  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1594 cttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 1529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 137)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 8031338 - 8031604
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8031338 attgcttctgatgtattgttcagaatctgatacgcagtggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagaggcacaagcaattatattggttccttccac 8031437  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8031438 gaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 8031537  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagca-ctaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8031538 cttcacaaatgctcaagcacgcagaaaagagacttcctttgctcaagcagctaaagcaagagacttc 8031604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17519924 - 17519662
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  17519924 tgcttatgatgtgtagttcagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccaaaa 17519825  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17519824 accggaagtagttcagttccccttgcacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcacacagattacaactgatcaatactacacctagtatgagact 17519726  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17519725 tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctaaagcactaaagcaaaagacttc 17519662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 19460504 - 19460765
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19460504 tgcttctgatgtgatgttcaaaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcttggttcctttcacaa 19460603  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  19460604 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagact 19460701  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  19460702 tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttc 19460765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 19558182 - 19558443
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19558182 tgcttctgatgtgatgttcaaaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcttggttcctttcacaa 19558281  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  19558282 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagact 19558379  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  19558380 tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttc 19558443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 29378890 - 29379155
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29378890 attgcttcttatgtgaagttcagaatcggatacgcagtggattaacaacagagtagagagaagaaagagaaacacaagcaattatactggttccttccac 29378989  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29378990 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcacaccagattacaactgctcaatactacacctagtatgag 29379088  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29379089 acttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 29379155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23271952 - 23271691
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  23271952 tgcttctgatatgatgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaaacaattaaactagttccttccacaa 23271853  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||    
T  23271852 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatact--acctagtatgagact 23271755  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23271754 tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 23271691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 40002509 - 40002781
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagt-agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40002509 ttgcttctgatgtgcaattcagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtgagagagaagaaagaaagacacaaacaattatactggttccttccac 40002608  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40002609 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagagttccattaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgag 40002707  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40002708 acttcaaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 40002781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22136617 - 22136370
Alignment:
Q  17 tgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcc 116  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136617 tgttcagaatcagataagcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtcc 22136518  T
Q  117 agtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaa 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22136517 agtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagacttctcaaatgctcaa 22136420  T
Q  217 acacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22136419 gcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7019189 - 7018928
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7019189 tgcttctgatgtgatgttcagcatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccacaa 7019090  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  7019089 accggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagact 7018992  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7018991 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 7018928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22167796 - 22167535
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22167796 tgcttctgatgtgatgtttagaatgagataagcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 22167697  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  22167696 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagact 22167599  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22167598 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22167535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22212134 - 22211873
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  22212134 tgcttctgatatgatgttcagaatcagatatgcaacggaataaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaaacaattatcctggttccttccacaa 22212035  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||    
T  22212034 accggaagtagtccagtcccctttgcactttcaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--ctctagtatgagact 22211937  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||  ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22211936 tcccaaatgctcaggcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22211873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 23363639 - 23363900
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  23363639 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaatcaattatcctagttccttccacaa 23363738  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  23363739 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa-aaataatcacacagattacaaatgttcaatact-ctcttagtatgagact 23363836  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| | | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23363837 tctcaaatgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 23363900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 28902752 - 28903021
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagt-agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  28902752 ttgcttctgatgtgcagttcagaatagaataagcagcggagtaaaa-cagagtgagagagaagaaagaaagacacagacaattatatcggttccttccac 28902850  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28902851 agatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagt-ttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagcatgaga 28902949  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||| | || || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28902950 cttta-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttactcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 28903021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 3843034 - 3843290
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3843034 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 3843132  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  3843133 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcc----agaaataatcacacagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagact 3843226  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3843227 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 3843290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20260345 - 20260135
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20260345 aaaacagagtagagaaaagaaagaaggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 20260246  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    ||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  20260245 ccac----taataatcacacagattacaaatgctcagtact-ca-ctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctc 20260152  T
Q  245 aagcactaaagcaagag 261  Q
    |||||||||||||||||    
T  20260151 aagcactaaagcaagag 20260135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21046975 - 21046765
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21046975 aaaacagagtagagaaaagaaagaaggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 21046876  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    ||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  21046875 ccac----taataatcacacagattacaaatgctcagtact-ca-ctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctc 21046782  T
Q  245 aagcactaaagcaagag 261  Q
    |||||||||||||||||    
T  21046781 aagcactaaagcaagag 21046765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 45568785 - 45568514
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  45568785 ttgcttctgatgtgcagttcagaattggatgcacagcggagtaaaa-cagagtaagagagaagaaagaaagacacaggtaattatacaggttccttccac 45568687  T
Q  101 aaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatga 198  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45568686 aaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatga 45568588  T
Q  199 gacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  45568587 gacttca-aattgctcaagcacacaggcaaaagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgct 45568514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15969657 - 15969492
Alignment:
Q  9 tgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaa-cagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccgg 107  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15969657 tgatgtattgttcagaatctgatacgcaacggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatactggttccttccacaaaccgg 15969558  T
Q  108 aagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaa 173  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15969557 aagtagtccggtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaa 15969492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Original strand, 21287719 - 21287957
Alignment:
Q  35 cagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcactt 132  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  21287719 cagcggagtaaaa-cagagtaagagagaagaaagaaatacacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactt 21287817  T
Q  133 ccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagag 231  Q
    |||| |||| || ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  |||||||||||||    
T  21287818 ccaacgagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagtacacaggcaagag 21287915  T
Q  232 acttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21287916 acttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgct 21287957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 21298265 - 21298537
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  | ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  21298265 attgcttctgatgtgcagttcagatacagatgcacagcggagtaaaa-cagagtaagagagaagaaagaaagacacagacaattatacaggttccttcca 21298363  T
Q  100 caaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatg 197  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21298364 caaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatg 21298462  T
Q  198 agacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||| || || |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  21298463 agacttca-aattgctacagcacaaaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgct 21298537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 21540246 - 21540507
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  21540246 ttgcttctgatgtgcagttcagaataggatgcatagcggagtaaaa-cagagtacgaaagaagaaagaaagacacatgcaattatacaagttccttccac 21540344  T
Q  101 aaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||         | |||||||||| ||||||||||||||    
T  21540345 aaaccggaagtcagtcatgtcacccttgcacttccaaggagagttccactaagtt-taatcaca---------actgctcaatacgacacctagtatgag 21540434  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||| || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  21540435 acttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgct 21540507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23470162 - 23469972
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  23470162 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 23470069  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23470068 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 23469972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 18153316 - 18153505
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  18153316 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 18153409  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18153410 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 18153505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 31214540 - 31214781
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||| ||||| ||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  31214540 tcagaatcagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacataagcagttatcctggttcattccacaacacggaagtagtcca 31214638  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |||    
T  31214639 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttcacaaaaatgctca 31214731  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31214732 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 31214781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6319217 - 6319027
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  6319217 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 6319124  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6319123 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 6319027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30315402 - 30315212
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  30315402 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtactccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 30315309  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa--atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||  ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30315308 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccgatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 30315212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20161957 - 20161742
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20161957 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 20161858  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  20161857 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 20161765  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  20161764 tcaagcact-aagcaagagtcttc 20161742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 26110785 - 26111000
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26110785 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 26110884  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  26110885 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 26110977  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  26110978 tcaagcact-aagcaagagacttc 26111000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32078422 - 32078207
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32078422 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcatggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 32078323  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  32078322 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 32078230  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  32078229 tcaagcact-aagcaagagacttc 32078207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32088995 - 32088780
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32088995 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 32088896  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  32088895 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 32088803  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  32088802 tcaagcact-aagcaagagacttc 32088780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Original strand, 43247879 - 43248093
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43247879 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 43247978  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  43247979 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 43248071  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  43248072 tcaagcact-aagcaagagactt 43248093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 3220211 - 3220401
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  3220211 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 3220304  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3220305 acaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 3220401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9857178 - 9856988
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  9857178 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 9857085  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9857084 acaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 9856988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 210881 - 210664
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  210881 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 210782  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  210781 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 210689  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  210688 gctcaagcact-aagcaagagacttc 210664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 241376 - 241593
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  241376 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 241475  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  241476 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 241568  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  241569 gctcaagcact-aagcaagagacttc 241593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 251961 - 252178
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  251961 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 252060  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  252061 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 252153  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  252154 gctcaagcact-aagcaagagacttc 252178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 724504 - 724287
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  724504 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 724405  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  724404 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 724312  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  724311 gctcaagcact-aagcaagagacttc 724287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 794731 - 794948
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  794731 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 794830  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  794831 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 794923  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  794924 gctcaagcact-aagcaagagacttc 794948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 849695 - 849478
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  849695 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 849596  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  849595 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 849503  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  849502 gctcaagcact-aagcaagagacttc 849478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 6150623 - 6150837
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6150623 aacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 6150722  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  6150723 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 6150814  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  6150815 tcaagcact-aagcaagagacttc 6150837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 6160578 - 6160792
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6160578 aacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 6160677  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  6160678 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 6160769  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  6160770 tcaagcact-aagcaagagacttc 6160792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 18157835 - 18158024
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  18157835 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 18157928  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18157929 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 18158024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 19128302 - 19128517
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19128302 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 19128401  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  19128402 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 19128494  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  19128495 tcaagcact-aagcaagagacttc 19128517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 36077465 - 36077706
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36077465 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 36077562  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  36077563 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 36077654  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36077655 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 36077706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 36088051 - 36088292
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36088051 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 36088148  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  36088149 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 36088240  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36088241 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 36088292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 36292473 - 36292690
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36292473 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 36292572  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  36292573 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 36292665  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36292666 gctcaagcact-aagcaagagacttc 36292690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 36303076 - 36303293
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36303076 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 36303175  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  36303176 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 36303268  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36303269 gctcaagcact-aagcaagagacttc 36303293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15792026 - 15791810
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15792026 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 15791927  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||| ||||   |  |||||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  15791926 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcagtact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatg 15791834  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  15791833 ctcaagcact-aagcaagagacttc 15791810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40213870 - 40213680
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||| | |||||    
T  40213870 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcagaaagatt 40213777  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| ||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40213776 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcaggcaaaagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 40213680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3349354 - 3349138
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3349354 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 3349255  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  3349254 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 3349163  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3349162 gctcaagcact-aagcaagagacttc 3349138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3359951 - 3359735
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3359951 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 3359852  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  3359851 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 3359760  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3359759 gctcaagcact-aagcaagagacttc 3359735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13689296 - 13689079
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13689296 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagattt 13689197  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  13689196 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 13689104  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13689103 gctcaagcact-aagcaagagacttc 13689079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13697407 - 13697190
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13697407 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagattt 13697308  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  13697307 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 13697215  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13697214 gctcaagcact-aagcaagagacttc 13697190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15781412 - 15781221
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  15781412 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt-cact-----ataatcacaaagatt 15781319  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     ||| |||||| ||||   |  |||||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15781318 gcaactgctcagtact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 15781221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 18448924 - 18449139
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18448924 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccagaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 18449023  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| ||| |||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  18449024 -cact-----ataatcacaaagattacaactgcgcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 18449116  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  18449117 tcaagcact-aagcaagagacttc 18449139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 26120485 - 26120678
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  26120485 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 26120578  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa-----tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 264  Q
    |||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||||     || |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26120579 acaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 26120676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 29076284 - 29076500
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29076284 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 29076383  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  29076384 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 29076475  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29076476 gctcaagcact-aagcaagagacttc 29076500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 29086535 - 29086751
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29086535 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 29086634  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  29086635 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 29086726  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29086727 gctcaagcact-aagcaagagacttc 29086751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 19224462 - 19224703
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaag--agagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| ||||| |  | |||||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19224462 tcagaatcagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaagggcaaagacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtcca 19224560  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||||||  ||| ||||| | |    
T  19224561 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctttaagtatgagacttctcaaaaatgctta 19224653  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19224654 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 19224703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23270640 - 23270531
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  23270640 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 23270547  T
Q  170 acaaatgctcaatact 185  Q
    ||||||||||||||||    
T  23270546 acaaatgctcaatact 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 19138834 - 19139049
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  19138834 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagattt 19138933  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||  |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  19138934 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 19139026  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||| || ||||||||||||||    
T  19139027 tcaagcgct-aagcaagagacttc 19139049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 250
Target Start/End: Original strand, 20195539 - 20195739
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20195539 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 20195638  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
      |||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||   |||    
T  20195639 -aact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgc 20195731  T
Q  243 tcaagcac 250  Q
    ||||||||    
T  20195732 tcaagcac 20195739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 44480644 - 44480860
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44480644 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 44480743  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  44480744 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 44480835  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44480836 gctcaagcact-aagcaagagacttc 44480860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 44491260 - 44491476
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44491260 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 44491359  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  44491360 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 44491451  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44491452 gctcaagcact-aagcaagagacttc 44491476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 19417930 - 19418121
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  19417930 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 19418023  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19418024 acaaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 19418121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 19428505 - 19428696
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  19428505 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 19428598  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19428599 acaaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 19428696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15998917 - 15998808
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  15998917 agacacaagcagttattctggttccttctacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 15998824  T
Q  170 acaaatgctcaatact 185  Q
    ||||||||||||||||    
T  15998823 acaaatgctcaatact 15998808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 16746579 - 16746769
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||     ||||||||| |||||    
T  16746579 agacaccagcagttattctggttccttccacaaaatggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagattt-tact-----ataatcacaaagatt 16746672  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16746673 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 16746769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Original strand, 9340740 - 9340913
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||      
T  9340740 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-t 9340831  T
Q  188 acctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9340832 tcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 9340913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Original strand, 9367884 - 9368057
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||      
T  9367884 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-t 9367975  T
Q  188 acctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9367976 tcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 9368057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 145
Target Start/End: Original strand, 23290429 - 23290554
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23290429 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 23290526  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23290527 gtcccccttgcacttccaaggagatttc 23290554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26735679 - 26735573
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  26735679 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 26735586  T
Q  170 acaaatgctcaat 182  Q
    |||||||||||||    
T  26735585 acaaatgctcaat 26735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Original strand, 12541041 - 12541109
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12541041 agcaattatcttggttccttccacaatccggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttc 12541109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15934483 - 15934389
Alignment:
Q  43 taaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15934483 taaaaacagag-agagagaagaaagacaca---aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 15934389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18769839 - 18769649
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||  |      ||||||||| |||||    
T  18769839 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcaatttcaaggagatttcacc------ataatcacaaagatt 18769746  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | ||||| |||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||| | ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18769745 aaaaatgttcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacagacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 18769649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 19942572 - 19942659
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19942572 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 19942659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20383130 - 20383065
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  20383130 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 20383065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 22673151 - 22673319
Alignment:
Q  70 agacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacaga 167  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||      | ||    
T  22673151 agacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata-----tctga 22673244  T
Q  168 ttacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    ||||||||||||| ||||| || || || |||||||  |||||| |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  22673245 ttacaaatgctcactactaaacttattaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 22673319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 26832434 - 26832499
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26832434 aagcaattatacaggttccttccacaaacaggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagaga 26832499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16376137 - 16376058
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16376137 aagaaagacacaa-caattatataggtttcttccacaaaccggaagtagtcatgacccccttgcacttccaaggagatttc 16376058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 273
Target Start/End: Original strand, 21298507 - 21298567
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21298507 tcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgct 21298567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 29692670 - 29692736
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  29692670 aagcaattatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 29692736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Original strand, 18772020 - 18772115
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagaga-agaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18772020 aaaacagag-agagagagagagagagagaca-aagcaattatacaggttcctttcacaaaccagaagtagtcctgtccccctcgcacttccaaggaga 18772115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 19706874 - 19706939
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19706874 aagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19957130 - 19957065
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19957130 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagccctatcccccttgcacttccaaggaga 19957065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 21287927 - 21287980
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21287927 tcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 21287980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45568544 - 45568491
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45568544 tcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 45568491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24498871 - 24498795
Alignment:
Q  68 agagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  24498871 agagacacaggaaattatcctggttccttccacaatccagaagtagtccagtcccccttgcatttcgaaggagattt 24498795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Original strand, 25163388 - 25163494
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  25163388 gcagcgga-taaaaacagag-agagagaaagaagaacgacacaaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagacttgtcccccttgcactt 25163485  T
Q  133 ccaatgaga 141  Q
    |||| ||||    
T  25163486 ccaaggaga 25163494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12758529 - 12758474
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcact 131  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12758529 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcact 12758474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 18557387 - 18557473
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  18557387 agagagaaagaatagagacacaaagcaattatagtggtttcttccacaatccggaagtagtccact-ccccttgcacttccaaggaga 18557473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Original strand, 36104661 - 36104759
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcact 131  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  36104661 gcagcgga-taaaaacagag-agagagaagaaaga----cacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcact 36104754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14990284 - 14990111
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||||         
T  14990284 aagaaagacacaagcaatttatacagattccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatataata----- 14990191  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  14990190 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 14990111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 144
Target Start/End: Original strand, 17687359 - 17687445
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||  |||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17687359 agagagaagaaagaga--cacaagcaattatcctggttccttacacaattcgga-gtagtcaagtctcccttgcacttccaaagagattt 17687445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Original strand, 21547621 - 21547702
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccctt 126  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21547621 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 21547702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20256336 - 20256240
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  20256336 aaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaaatagtcatgtctcccttgcacttccaaggaga 20256240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 21298537 - 21298590
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21298537 tcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcgagcactaaagcaagagacttc 21298590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 21540477 - 21540530
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21540477 tcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagagacttc 21540530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24679180 - 24679115
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  24679180 aagcaattatacaggttccttccacaatctggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 24679115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 28903003 - 28903044
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28903003 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 28903044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 40002763 - 40002804
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40002763 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 40002804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 43773491 - 43773544
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43773491 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 43773544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18152480 - 18152313
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||         
T  18152480 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata----- 18152387  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcct 238  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||| ||||   ||||||||||||||    
T  18152386 tctgattacaaatgctcattactaaacttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcct 18152313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 18679172 - 18679232
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  18679172 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacatccaa 18679232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 18718361 - 18718421
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  18718361 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacatccaa 18718421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 16206629 - 16206694
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  16206629 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctg-cccccttgcacttccaaggaga 16206694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18121901 - 18121835
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  18121901 aagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 18121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Original strand, 22662458 - 22662607
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||      | ||||||||||||||| |||||     
T  22662458 ggttccttccacaaaccgtaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata-----tctgattacaaatgctcactactaa 22662551  T
Q  188 acctagtatgagacttcacaaatgttcaaa-cacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    || ||||| |||||||  |||||| ||||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  22662552 acttagtaagagactt--caaatgctcaaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 22662607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 144
Target Start/End: Original strand, 24634724 - 24634811
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||   ||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  24634724 agagagaagaaagaga--catatgcaattatccaggtcccttccacaacccagaagtagtccagtctcccttgcccttccaaggagattt 24634811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Original strand, 1744533 - 1744606
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaa-ttatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||    
T  1744533 aagagagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaa 1744606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15336904 - 15336815
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15336904 agagagaaggaagaaagacacaaagcaatttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 15336815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15425969 - 15425880
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15425969 agagagaaggaagaaagacacaaagcaatttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 15425880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15517273 - 15517184
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15517273 agagagaaggaagaaagacacaaagcaatttatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 15517184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 266
Target Start/End: Original strand, 18557550 - 18557607
Alignment:
Q  209 atgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18557550 atgttcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 18557607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25850781 - 25850716
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  25850781 aagcaattatacatgttccttccacaatccggaagttgtcatgtcccccttgcacttccaaagaga 25850716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33560994 - 33560941
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33560994 ggttccttgcacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 33560941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 45539215 - 45539159
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  45539215 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgt-ccccttgcacttccaaggagatttc 45539159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 18772196 - 18772244
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18772196 gcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgct 18772244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Original strand, 22707703 - 22707767
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  22707703 agcaattatacacgttccttccacaaacctgaagtagtcctgacccccttacactttcaatgaga 22707767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 136
Target Start/End: Original strand, 39692907 - 39692955
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  39692907 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 39692955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40846163 - 40846115
Alignment:
Q  94 cttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40846163 cttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 40846115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 141
Target Start/End: Original strand, 17928426 - 17928511
Alignment:
Q  54 tagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  17928426 tagagagaagagaaagacaca-aagcaattatacatgttccttc-acaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 17928511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 19153370 - 19153456
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19153370 agagagaaataagaaagacacaaagcaattatacaacttccttccacaaactg-aagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 19153456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19506139 - 19506068
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||||||  || || ||||||||||||| ||||    
T  19506139 agacacaagcaattatacaggttacttcgacaatccggaagtagtcatgttccacttgcacttccaaggaga 19506068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23264413 - 23264350
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  23264413 caattatataggttccatccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaacgaga 23264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 43644269 - 43644320
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  43644269 gttccttccacaatccggaagtagtcctgccccccttgcaattccaaggaga 43644320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 6407104 - 6407182
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  6407104 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacataccgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 6407182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18321935 - 18321889
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  18321935 gttcctttcacaaaccggaagtagttatgtcccccttgcacttccaa 18321889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 21932241 - 21932307
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21932241 aagcaattatagaggttactttcacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggaga 21932307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 23800926 - 23800999
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa 77  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| | | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23800926 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcgaaat-aaaatagagcagagaaaagaaagagagacacaa 23800999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 17796793 - 17796846
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  17796793 ggtttcttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 17796846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30422180 - 30422127
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  30422180 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 30422127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1210487 - 1210435
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  1210487 ggttactttcacaatccggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggaga 1210435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 269
Target Start/End: Original strand, 17687506 - 17687562
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttccta 269  Q
    |||| || ||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17687506 tcaagcatacaagcaagagatttcctatgcccaagcacaaaagcaagagacttccta 17687562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 123
Target Start/End: Original strand, 17879063 - 17879107
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccc 123  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17879063 caattatcctggttccttccacaatccggaagtaatccagtcccc 17879107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24679021 - 24678973
Alignment:
Q  218 cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24679021 cacacacgcaagagtcttcctatgctcaagcaaaaaagcaagagacttc 24678973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 26832579 - 26832627
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26832579 gcaagagatttcctatgctcaagaactaagtcaagagacttcctatgct 26832627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 6)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 476072 - 475801
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  476072 attgcttctgatgtgaagtttagaatcagatacgcagcggattaacaacagagtagagagaagaaagagaaacacaagcaattatactggttccttccac 475973  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  475972 aaactggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 475874  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  475873 cttcacaaatgctcaagcacgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 475801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 482592 - 482321
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  482592 attgcttctgatgtgaagtttagaatcagatacgcagcggattaacaacagagtagagagaagaaagagaaacacaagcaattatactggttccttccac 482493  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  482492 aaactggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 482394  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  482393 cttcacaaatgctcaagcacgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 482321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 181
Target Start/End: Original strand, 100167 - 100272
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  100167 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 100260  T
Q  170 acaaatgctcaa 181  Q
    ||||||||||||    
T  100261 acaaatgctcaa 100272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 475819 - 475778
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  475819 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 475778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 482339 - 482298
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  482339 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 482298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 111776 - 111838
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  111776 caattatataggttccttccacaatccgaaagtagtcctgtctcccttgtacttccaaggaga 111838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2491 - 2229
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2491 tgcttctgatgtgtagttcagaattggatacacagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaaacaattatactggttccttccacaa 2392  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2391 atcggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagt-ttaatcacactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagact 2293  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2292 tcacaaatgctcaagcatgcatgcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaggcttc 2229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 8
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  268 attgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagtggaataaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatcctggttctttccac 169  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |  |||||||||    
T  168 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatctcacagattacaaatgttcaatact-ctctaagtatgaga 74  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  73 cttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttc 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 142)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19313747 - 19313486
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19313747 tgcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaaaaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 19313648  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  19313647 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattataactgctcaatact--accgagtatgagact 19313550  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19313549 tcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19313486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20647354 - 20647101
Alignment:
Q  18 gttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20647354 gttcagaatcggatacgcatcggtgtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaggcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtcca 20647255  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||  || || ||||     
T  20647254 gtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgcttaatact--acctagtatgagacttccaaattgctcaag 20647157  T
Q  218 cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20647156 cacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaatcaagagacttcctatgct 20647101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38033556 - 38033300
Alignment:
Q  9 tgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccgga 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  38033556 tgatgtattgttcagaatcggatacacagcagagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaaacaattatactggttccttccacaaaccaga 38033457  T
Q  109 agtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc-aca 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | |    
T  38033456 agtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagacttcaaaa 38033359  T
Q  208 aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38033358 aatgctcaagcacgcaggcaaaagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 38033300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19303182 - 19302920
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaa-tcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  19303182 tgcttctgatgtgatgttcagaaatcggatacgcagcggaataaaaacagtgtagagaaaaaaaagagagacacaagcaattatcctggttccctccaca 19303083  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  19303082 aatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagac 19302985  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19302984 ttcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19302920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19498722 - 19498459
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaa--gaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19498722 tgcttctgatgtgatgttcaaaatctgatatgcagcggaataaaaacagagtaaagagaaaagaaagagagacacaagcagttatactggttccttccac 19498623  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  19498622 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgaga 19498525  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19498524 cttcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19498459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23393482 - 23393212
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtaga-gagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23393482 ttgcttctgatgtgcaattcagaattggatatgcagcggagtaaaaacatagtaaaagagaagaaagaaggacacaagcaattatactggttccttccac 23393383  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23393382 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt--taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgag 23393285  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393284 acttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 23393212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17971023 - 17970766
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17971023 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagagaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 17970924  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||    
T  17970923 accggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact--aactagtatgaaact 17970830  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17970829 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 17970766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 22773830 - 22774090
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  22773830 tgcttctgatgtgatgttcagaattagatatgcagcggaataaaa-cagagtagagagaagaaagagagacacaagcatttatcctggttccttccacaa 22773928  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  22773929 accggaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 22774026  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22774027 tcacaaatgctcaagcacacaggaaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 22774090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24802363 - 24802092
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||   |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  24802363 ttgcttctgatgtgcaattcagaattggatatacagcggagtaaaaacagagtaagagagaagaaagaaggacacatgcaattatactggttctttccac 24802264  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24802263 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacaaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgag 24802165  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24802164 acttca-aaatgctcatgcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 24802092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 22763125 - 22763386
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22763125 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 22763224  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  22763225 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttacactaagaaataatc-cacatattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 22763322  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22763323 tcacaaatgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 22763386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38040715 - 38040521
Alignment:
Q  9 tgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccgga 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38040715 tgatgtattgttcagaatcggatacacagcagagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaaacaattatactggttccttccacaaaccgga 38040616  T
Q  109 agtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38040615 agtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagacttca 38040521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 19355790 - 19356058
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||  |||| | |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  19355790 tgcttctgatgagatgttcagaattagatatgtagcggaataaaagcagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggtttcttccacaa 19355889  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  19355890 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagact 19355987  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19355988 tcctaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaggcactaaagcaagagacttccaatgct 19356058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 24274501 - 24274757
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24274501 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagtagagaaaagaaagaaggacacaagcaattatcctggttccttccacaa 24274599  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24274600 accggaagtagtccagtccccctcgcacttccaaggagatttccac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact-ca-ctagtatgagact 24274693  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24274694 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 24274757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 968257 - 968000
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  968257 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 968159  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  968158 tccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttgctc----taataatcacacagattacaaatgctcaatact-ctcttagtatgagact 968064  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  968063 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 968000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Original strand, 22754872 - 22755050
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  22754872 tggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaacttctcaacactac 22754971  T
Q  188 acctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22754972 acctagtatgagacttcacagatgcttaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 22755050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24815310 - 24815059
Alignment:
Q  22 agaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtag-agagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtc 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24815310 agaattggatatgcagcggagtaaaaatagagtaacagagaagaaagaaggacacaaacaattataccggttccttccacaaatcggaagtagtccagtc 24815211  T
Q  121 ccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaaca 219  Q
    |||||| ||||| ||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||    
T  24815210 ccccttacactttcaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagca 24815113  T
Q  220 cacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24815112 cgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 24815059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Original strand, 1041624 - 1041876
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1041624 tgcttatgatgtaatgtttagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 1041722  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||  | ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  1041723 tccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa----taatcttatagattacaaatgctcaatact-ctcttagtatgagact 1041817  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagag 261  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1041818 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 1041876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Original strand, 22615179 - 22615336
Alignment:
Q  9 tgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccgga 108  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22615179 tgatgtattgttcagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagagagatacaagaaattatactggttcattccacaaaccgga 22615278  T
Q  109 agtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacag 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22615279 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacag 22615336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36785553 - 36785295
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36785553 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaca-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 36785455  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    ||||||| | ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  36785454 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaag----aatcacaaaaattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 36785360  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||    
T  36785359 tctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatggtcaagcactaaagcaagagtcttc 36785295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 273
Target Start/End: Original strand, 1083358 - 1083570
Alignment:
Q  61 aagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataat 159  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||    
T  1083358 aagaaagaaggacacaagcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taat 1083456  T
Q  160 caca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaa 258  Q
    |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  1083457 cacaacttattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaa 1083555  T
Q  259 gagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||||    
T  1083556 gagacttcctatgct 1083570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27979074 - 27978890
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | |||||||||||    
T  27979074 aaagcgagacacaagcagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcaca 27978980  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
     ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  27978979 aagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 27978890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28065603 - 28065419
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | |||||||||||    
T  28065603 aaagcgagacacaagcaattatcatagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actaataatcaca 28065509  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
     ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  28065508 aagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 28065419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 16768460 - 16768675
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16768460 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 16768559  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  16768560 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 16768652  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  16768653 tcaagcact-aagcaagagacttc 16768675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22915575 - 22915360
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22915575 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 22915476  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  22915475 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 22915383  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  22915382 tcaagcact-aagcaagagacttc 22915360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 26866614 - 26866803
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  26866614 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 26866707  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  26866708 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatcctcaagcact-aagcaagagtcttc 26866803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30489560 - 30489320
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30489560 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 30489463  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca--aatgttca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |  | || |||    
T  30489462 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcaaaagactgctca 30489370  T
Q  216 aacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30489369 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 30489320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 43082171 - 43082386
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43082171 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 43082270  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  43082271 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 43082363  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  43082364 tcaagcact-aagcaagagacttc 43082386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 253
Target Start/End: Original strand, 26879203 - 26879380
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  26879203 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 26879296  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 253  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  26879297 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 26879380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24428272 - 24428082
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  24428272 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 24428179  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24428178 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 24428082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1099906 - 1099691
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1099906 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 1099807  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  1099806 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 1099714  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  1099713 tcaagcact-aagcaagagacttc 1099691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 2561005 - 2561220
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2561005 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 2561104  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
      |||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  2561105 -aact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 2561197  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  2561198 tcaagcact-aagcaagagtcttc 2561220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 4099331 - 4099546
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4099331 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4099430  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  4099431 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 4099523  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  4099524 tcaagcact-aagcaagagacttc 4099546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 4209406 - 4209621
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4209406 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4209505  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  4209506 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 4209598  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  4209599 tcaagcact-aagcaagagacttc 4209621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7006518 - 7006303
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7006518 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 7006419  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  7006418 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 7006326  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  7006325 tcaagcact-aagcaagagacttc 7006303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9774015 - 9773800
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9774015 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 9773916  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  9773915 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9773823  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9773822 tcaagcact-aagcaagagacttc 9773800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11389520 - 11389305
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11389520 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 11389421  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  11389420 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 11389328  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  11389327 tcaagcact-aagcaagagacttc 11389305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22961043 - 22960828
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22961043 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 22960944  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  22960943 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 22960851  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  22960850 tcaagcact-aagcaagagacttc 22960828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24328445 - 24328230
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24328445 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 24328346  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  24328345 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 24328253  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  24328252 tcaagcact-aagcaagagacttc 24328230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24339115 - 24338900
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24339115 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 24339016  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||||  || |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  24339015 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 24338923  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  24338922 tcaagcact-aagcaagagacttc 24338900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 40250710 - 40250925
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40250710 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 40250809  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  40250810 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 40250902  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  40250903 tcaagcact-aagcaagagacttc 40250925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 43092780 - 43092995
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43092780 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 43092879  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  43092880 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 43092972  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  43092973 tcaagcact-aagtaagagacttc 43092995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28722002 - 28721812
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  28722002 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 28721909  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     ||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28721908 gcaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 28721812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28732588 - 28732398
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  28732588 agacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 28732495  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28732494 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 28732398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 34477445 - 34477661
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34477445 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 34477544  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac---aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttg 241  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||    
T  34477545 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 34477637  T
Q  242 ctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  34477638 ctcaagcact-aagcaagagacttc 34477661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 4219998 - 4220213
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4219998 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4220097  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| | |||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  4220098 -cact-----ataatcacaaagattacaactactcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 4220190  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  4220191 tcaagcact-aagcaagagacttc 4220213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9763479 - 9763264
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9763479 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 9763380  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  | |||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  9763379 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaaatatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9763287  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9763286 tcaagcact-aagcaagagacttc 9763264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17858148 - 17857933
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17858148 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 17858049  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||| |   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  17858048 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaata-ttttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 17857956  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  17857955 tcaagcact-aagcaagagacttc 17857933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18393350 - 18393133
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18393350 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 18393251  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  18393250 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 18393158  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18393157 gctcaagcact-aagcaagagacttc 18393133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18769590 - 18769401
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  18769590 agacacaagcagttatcctggtttcttccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 18769497  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||| || | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18769496 acaaatgctcaatgct-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 18769401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 27220872 - 27221113
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27220872 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 27220969  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  27220970 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 27221061  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27221062 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 27221113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 29243739 - 29243954
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29243739 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 29243838  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  29243839 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 29243931  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  29243932 tcaagcact-aagaaagagacttc 29243954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 29254318 - 29254533
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29254318 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 29254417  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||| ||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  29254418 -cact-----ataataacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 29254510  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  29254511 tcaagcact-aagcaagagacttc 29254533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 35252473 - 35252714
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35252473 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 35252570  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  35252571 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 35252662  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35252663 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 35252714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 35263082 - 35263323
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35263082 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 35263179  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  35263180 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 35263271  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35263272 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 35263323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Original strand, 35273707 - 35273948
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcca 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35273707 tcagaatcagatatgcagcgga--aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 35273804  T
Q  118 gtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |    
T  35273805 gtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgct 35273896  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35273897 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 35273948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24415707 - 24415517
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  24415707 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagttgtccagtcacccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 24415614  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24415613 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 24415517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 32217414 - 32217606
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  32217414 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 32217507  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||||||    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  32217508 acaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 32217605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11395885 - 11395668
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11395885 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 11395786  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  11395785 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 11395693  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11395692 gctcaagcact-aagcaagagacttc 11395668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11406201 - 11405984
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11406201 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 11406102  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  11406101 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 11406009  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11406008 gctcaagcact-aagcaagagacttc 11405984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34790928 - 34790713
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34790928 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacaccagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 34790829  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||| ||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  34790828 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcagtact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgc 34790736  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  34790735 tcaagcact-aagcaagagacttc 34790713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34805071 - 34804856
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34805071 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacaccagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 34804972  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||| ||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  34804971 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcagtact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgc 34804879  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  34804878 tcaagcact-aagcaagagacttc 34804856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38586781 - 38586583
Alignment:
Q  64 aaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca 163  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     |||||||||    
T  38586781 aaagcgagacacaagcagttatcctggttcattccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca 38586688  T
Q  164 cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc----acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaag 259  Q
     ||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||    | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||    
T  38586687 aagattacaagtgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaag 38586590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 40221849 - 40222064
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40221849 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagattt 40221948  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||| |||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  40221949 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtataagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 40222041  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  40222042 tcaagcact-aagcaagagacttc 40222064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9908876 - 9908658
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9908876 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttacacttccaaggagattt 9908777  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctt 239  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||     ||||| |||| |||||| ||||||| |||||      
T  9908776 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 9908684  T
Q  240 tgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9908683 tgctcaagcact-aagcaagagacttc 9908658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21173154 - 21172962
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  21173154 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 21173061  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagacttc---acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    || |||||||||||||| | |  |||||||||||||   | ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||    
T  21173060 acaaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtctt 21172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36252529 - 36252340
Alignment:
Q  71 gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatta 170  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||    
T  36252529 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatta 36252436  T
Q  171 caaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36252435 caactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgtaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 36252340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 10266510 - 10266726
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10266510 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 10266609  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  10266610 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 10266701  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10266702 gctcaagcact-aagcaagagacttc 10266726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 10277087 - 10277303
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10277087 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 10277186  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  10277187 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 10277278  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10277279 gctcaagcact-aagcaagagacttc 10277303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21651217 - 21651001
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21651217 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 21651118  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  21651117 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 21651026  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21651025 gctcaagcact-aagcaagagacttc 21651001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19300568 - 19300479
Alignment:
Q  175 tgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19300568 tgctcaatactac--ctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19300479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9898288 - 9898070
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9898288 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccataacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagattt 9898189  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-----aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctt 239  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||     ||||| |||| |||||| ||||||| |||||      
T  9898188 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 9898096  T
Q  240 tgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9898095 tgctcaagcact-aagcaagagacttc 9898070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39170764 - 39170591
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||      
T  39170764 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-t 39170673  T
Q  188 acctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39170672 tcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 39170591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 43344924 - 43345140
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43344924 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 43345023  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||| |||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  43345024 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 43345115  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43345116 gctcaagcact-aagcaagagacttc 43345140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 43354539 - 43354755
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43354539 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 43354638  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||| |||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  43354639 -cact-----ataatcaca-agattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 43354730  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43354731 gctcaagcact-aagcaagagacttc 43354755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 185
Target Start/End: Original strand, 30794351 - 30794461
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  30794351 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 30794444  T
Q  170 ac-aaatgctcaatact 185  Q
    || ||||||||||||||    
T  30794445 acaaaatgctcaatact 30794461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21537956 - 21537860
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  21537956 aaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 21537860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 22682807 - 22682866
Alignment:
Q  91 ttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22682807 ttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcacta 22682866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 22257562 - 22257627
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  22257562 aagcaattatataggttccttccacaaatcggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 22257627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 133
Target Start/End: Original strand, 22271491 - 22271548
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22271491 aagcaattatataggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttggacttc 22271548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Original strand, 40781837 - 40781898
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaat 137  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40781837 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaat 40781898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 44839782 - 44839956
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||         
T  44839782 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagaatt-cactatgtaata----- 44839875  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| || |||||||  |||   |||||||||||||| |||||    
T  44839876 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttca-aattgttcaagtacaactgcaagagacttcctatgctc 44839956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19321121 - 19321030
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    |||||||  ||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19321121 agagagagaaaagaaagacacaaaacaattatcatggttccttccacaattcggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttc 19321030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Original strand, 24843572 - 24843631
Alignment:
Q  82 ttatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24843572 ttatagtggttccttccacaaaccggaagtagtccactccaccttgcacttccaaggaga 24843631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34322676 - 34322510
Alignment:
Q  72 acacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||      | ||||    
T  34322676 acacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagagtt-cactatgtaata-----tctgatt 34322583  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  34322582 acaattgctcactactaaacttagtaagagactt--caaatgttcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 34322510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10010518 - 10010426
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  10010518 aaaacagag-agagagaagaaagacaca---aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttacactttcaaggaga 10010426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 1083540 - 1083593
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1083540 tcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 1083593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23185053 - 23184976
Alignment:
Q  65 aagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  23185053 aagagagacacaaagcaattatataggtctcttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggaga 23184976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23596316 - 23596239
Alignment:
Q  65 aagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  23596316 aagagagacacaaagcaattatataggtctcttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggaga 23596239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 133
Target Start/End: Original strand, 24376467 - 24376524
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24376467 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttc 24376524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18431664 - 18431612
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  18431664 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtccccgttgcacttccaatgaga 18431612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Original strand, 19539736 - 19539842
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  19539736 gcagcgga-taaaaacagag-agagaggaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaaatagtcctgtcccgcttgaactt 19539833  T
Q  133 ccaatgaga 141  Q
    |||| ||||    
T  19539834 ccaaggaga 19539842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 22316931 - 22317019
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaag-tagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22316931 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaatgaga 22317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24851389 - 24851337
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24851389 ggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 24851337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 269
Target Start/End: Original strand, 27939513 - 27939569
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttccta 269  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27939513 tcaaacacacaagcaagggatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttccta 27939569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 25828501 - 25828587
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagc-aattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  25828501 agagagaaagaagaaagacacaaaccaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctg-cccccttgcacttccaaggaga 25828587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28141327 - 28141276
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  28141327 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 28141276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 266
Target Start/End: Original strand, 40331136 - 40331332
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||         
T  40331136 aagaaagacacaagcaatttatacagattccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata----- 40331229  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 262  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| || || |||| ||||   |||||||||||||| |||||| | ||  || |||||||    
T  40331230 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttca-aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcatgaacacaatcaagaga 40331328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 18702104 - 18702166
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  18702104 caattatacaggttccttccacaaaccgaaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 18702166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22782366 - 22782288
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| ||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22782366 aagaaagacacatgcaatttatacaggttccatccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgaga 22782288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22786406 - 22786328
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22786406 aagaaagacacatgcaatttatatgggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgtacttccaaggaga 22786328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 23234370 - 23234436
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23234370 aagcaattatacaggttccttctacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgaga 23234436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13964712 - 13964647
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  13964712 agcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 13964647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 141
Target Start/End: Original strand, 22382826 - 22382911
Alignment:
Q  57 agagaagaaagagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  22382826 agagaacaaagaaagacacaaaacaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgtccccctggctcttccaaggaga 22382911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24802110 - 24802069
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24802110 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 24802069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24815077 - 24815036
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24815077 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 24815036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 40331459 - 40331632
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||         
T  40331459 aagaaagacacaagcaatttatacaggttcctcccacaaaccggaagtcagtcctgt-ccccttgcacttccaaggagagtt-cactatgtaata----- 40331551  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| || || |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  40331552 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttca-aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 40331632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20569512 - 20569424
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  20569512 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctagcacttccaaggaga 20569424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31328725 - 31328641
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  31328725 agagagaagaaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaacgggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaa 31328641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31335446 - 31335362
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  31335446 agagagaagaaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaacgggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaa 31335362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 141
Target Start/End: Original strand, 44880654 - 44880701
Alignment:
Q  94 cttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44880654 cttccacaaaccagaagtagtcatgtcccccttgcacttccaatgaga 44880701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45087733 - 45087565
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||         
T  45087733 aagaaagacacaagcaatttatacaggtttcttccacaaaccggaagacagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtt-cactacgtaata----- 45087640  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcct 238  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| || || |||| ||||   ||||||||||||||    
T  45087639 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttca-aattgctcaagcacaacagcaagagacttcct 45087565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10899247 - 10899185
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  10899247 caattatagtgtttccttccacaatccgaaagtagtccactcctccttgcacttccaaggaga 10899185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14794526 - 14794461
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    |||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14794526 caattatcctggttccttcaacaattcggaagtagtccagt-ccccttgcacttccaaggagatttc 14794461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 21845503 - 21845588
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||||||||   ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21845503 agagagaagagaaagataca-aagcaattatacaagttccttccacaatcgagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 21845588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 24575395 - 24575461
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaag-tagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  24575395 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagccagtcctctcccctttgcacttccaaggaga 24575461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28551670 - 28551592
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  28551670 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgcaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggaga 28551592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 6574823 - 6574770
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  6574823 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggaga 6574770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Original strand, 16494696 - 16494769
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  16494696 aagaaagacacaagcaatttatacaggttcctttcacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 16494769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 19356040 - 19356081
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19356040 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19356081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21911439 - 21911386
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21911439 tcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 21911386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 22801820 - 22801994
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||         
T  22801820 aagaaagacacaatcaatttatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggag-tgttcactatgtaata----- 22801913  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| || || |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  22801914 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagacttca-aattgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 22801994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23393230 - 23393189
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23393230 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttc 23393189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 25188772 - 25188825
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  25188772 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 25188825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26367147 - 26367082
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  26367147 aagcaattatacaagttccttccacaaatcgaaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 26367082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20647118 - 20647078
Alignment:
Q  226 caagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20647118 caagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttc 20647078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21911579 - 21911503
Alignment:
Q  66 agagagacacaag-caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  21911579 agagagacacaaatcaattatacatgttcattccacaatccggaagtagtcctgtcctccttgcacttccaaggaga 21911503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 22383018 - 22383058
Alignment:
Q  226 caagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22383018 caagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 22383058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26623192 - 26623128
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  26623192 agcaattatacatgttctttccacaaactggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 26623128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 39038367 - 39038315
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  39038367 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccgcttgcacttccaaggaga 39038315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17964014 - 17963950
Alignment:
Q  66 agagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17964014 agagagaca-aagcaattatacaggttccttccataa-ccggaagtagtcttgtcccccttgcactt 17963950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22455699 - 22455633
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  22455699 aagcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcaattccaaggaga 22455633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 22797768 - 22797853
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| ||| ||| || ||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  22797768 agagagaagaaaaagacacaaaa-caattatacaggttccttccacaatccaaaagtagtcatatcccccttgcacttccaaggaga 22797853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24110099 - 24110046
Alignment:
Q  80 aattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24110099 aattatattggttcctcccacaaaccaagagtagtccagt-ccccttgcacttcc 24110046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25038001 - 25037935
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  25038001 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaaatcagtcatgtcacccttgcacttccaaggaga 25037935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27747214 - 27747147
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaa-ttatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27747214 agagagaagaaagaga--cacaagcaatttatcctggttctttccacaatccggaagtactccagtcccc 27747147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31968526 - 31968460
Alignment:
Q  72 acacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||    
T  31968526 acacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcctgtccccattgcacttccaa 31968460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 24778721 - 24778798
Alignment:
Q  65 aagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24778721 aagagagacacaaagtaattatatagattctttccacaaactggaaatagtcttgtcccccttgcactttcaaggaga 24778798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 266
Target Start/End: Original strand, 25918231 - 25918292
Alignment:
Q  205 acaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25918231 acaaatgctcaagcacacaagcaagagatctactatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 25918292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28701938 - 28701885
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  28701938 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggaga 28701885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30558049 - 30557996
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  30558049 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 30557996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 6392038 - 6392090
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  6392038 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggaga 6392090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 18702247 - 18702295
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18702247 gcaagagatttcttgtgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgct 18702295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 152 - 413
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  152 tgcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcagaataaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcttggttccttccacaa 251  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  252 accagaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatact--acctagtatgagact 349  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  350 tcccaaatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttc 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 4532 - 4793
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4532 tgcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcagaataaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcttggttccttccacaa 4631  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  4632 accagaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatact--acctagtatgagact 4729  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4730 tcccaaatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttc 4793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 127122 - 127385
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaa-cagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  127122 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaaacagattagagagaagaaagagagacacgagcaattatcctggttccttccaca 127221  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  127222 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagac 127320  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  127321 ttctcaaatgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 127385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 16082 - 16343
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16082 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggcataaaaatagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 16181  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  16182 accggaactagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa-agataatcacacagattacaaatgctcaatact-ctcttagtatgagact 16279  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| | | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16280 tctcaaatgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 16343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 4407 - 4679
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  4407 ttgcttctgatgtgcaattcagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtaagagagaagaaagaaagacagaggcaattatactggttccttccac 4506  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4507 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgag 4605  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||| || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4606 acttcaaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcattaaagcaagagacttcctatgct 4679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 4661 - 4702
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4661 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 4702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 709 - 972
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaa--aaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  709 tgcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcggaataacaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccac 808  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  809 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgaga 906  T
Q  201 cttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     | | |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  907 atgcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgttcaaggactaaagcaagagacttc 972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 266
Target Start/End: Original strand, 1461 - 1587
Alignment:
Q  138 gagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcc 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  1461 gagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagaatgcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcc 1558  T
Q  238 tttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  1559 tatgatcaagaactaaagcaagagacttc 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 34911 - 35178
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34911 tgcttctgatgtgcagttcagaattggatatgcagcggagtaaaa-cagagtagagagaagaaagagagacacaggcaattatactggttccttccacaa 35009  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35010 accgaaagtagtccagtttcccttgcacttccaaggagattttcactaagt-ttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagact 35108  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||| || || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35109 tca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgct 35178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 35160 - 35208
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35160 gcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 35208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 35190 - 35231
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35190 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 35231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 251 - 485
Alignment:
Q  30 atacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgca 129  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  251 atacgcagcggaataaaaacatagtagagaaaagaaacagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgca 350  T
Q  130 cttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaag 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||    
T  351 cttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--acctagtatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgag 448  T
Q  230 agacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  449 agacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2065 - 1876
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  2065 tgcttctgatgtgttgttcagaatcagatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatactgttttcttccacaa 1966  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacaccta 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1965 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacaccta 1876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 57842 - 58103
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  57842 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacaaagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccataa 57941  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||    
T  57942 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattataactgctcaatact--atctagtatgagact 58039  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||   |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  58040 tcccaaatgctcaagcatgtaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 58103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5579 - 5323
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5579 tgcttctgatgtgatgttcagaatcatatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 5480  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||    
T  5479 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--ctctagtatgagact 5382  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagag 261  Q
    || |||||  |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5381 tcccaaattctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagag 5323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10523 - 10279
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagt 119  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10523 tcagattcagatacgcagcggaataaaaacaaagtagagaaaagaaagagagacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagt 10424  T
Q  120 cccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaaca 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  10423 cccccttgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagacttcccaaatgctcaagca 10326  T
Q  220 cacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10325 cgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 10279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 11024 - 11292
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11024 ttgcttctgatgtgcagttcagaattggatatgcagcggagtaaaa-cagataagagagaaaaaagagagacacaagcaattatactggttccttccaca 11122  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11123 aatcggaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagattttcactcagt-ttaatcacacagattacaactgctcaataccacacctagtatgagac 11221  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11222 ttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaatagacttcctttgct 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 11274 - 11322
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11274 gcaatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 11322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 11304 - 11345
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11304 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaatagacttc 11345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29546 - 29286
Alignment:
Q  4 gcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaa 103  Q
    |||| |||| || |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29546 gcttctgatatgatgttcagaatcatatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 29447  T
Q  104 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagactt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  29446 ccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaatgagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagactt 29349  T
Q  204 cacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||||| |||| ||  || || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29348 cccaaatgctcaagcatgcatgctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 29286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 28950 - 29211
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaa-cagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccaca 101  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28950 tgcttctgatatgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaaacaaagtagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccaca 29049  T
Q  102 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||    
T  29050 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaa---tacatctagtatgagac 29146  T
Q  202 ttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| |||||| |||| ||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29147 ttcccaaatgctcaagcacgcaggagagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 29211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 25804 - 25891
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  25804 agagagaaggaaaaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgt-ccccttgcacttccaaggaga 25891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1724 - 1485
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1724 gcagcggagtaaaaacagagtaagagagaagaaagaatgacacatgcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 1625  T
Q  133 ccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagag 231  Q
    |||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||| ||| ||||||||||    
T  1624 ccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtacgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagag 1527  T
Q  232 acttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1526 actttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1503 - 1462
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1503 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttc 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1917 - 1678
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1917 gcagcggagtaaaaacagagtaagagagaagaaagaatgacacatgcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 1818  T
Q  133 ccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagag 231  Q
    |||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||| ||| ||||||||||    
T  1817 ccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtacgagacttca-aattgctcaagcacgcaggcaagag 1720  T
Q  232 acttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1719 actttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 1678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1696 - 1655
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1696 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21193 - 20923
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  21193 ttgcttctgatgtgcagttcagaataggataagcagcggagtaaaa-cagagtaagagagaagaaagaaagacacatacaattatactggttccttccac 21095  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21094 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagtgtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactactcaatactacacctagtatgag 20996  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20995 acttca-aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 20923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20941 - 20900
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20941 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 20900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 4778 - 5034
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4778 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 4876  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  4877 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----aaataatcacacagattacaaatgctcaatact--ctctagtatgagact 4970  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4971 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 35017 - 35276
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35017 tgcttttgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 35115  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||    
T  35116 accagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttctactaa-aaataatcacacagattacaaatgttcaatact--ctctagtatgagact 35212  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35213 tctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 35276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 15208 - 15466
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15208 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcaacggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaaagacacaagcaattattctggttccttccacaa 15307  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15308 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatcacacagattacagatgctcaatact-ctcttagtatgagact 15402  T
Q  203 tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||| | || ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15403 tctcaaatgctgaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 15466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 39991 - 40240
Alignment:
Q  11 atgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaag 110  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39991 atgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaag 40089  T
Q  111 tagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||||    
T  40090 tagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaat 40184  T
Q  211 gttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  40185 gctcaagcacgcaggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttc 40240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38732 - 38487
Alignment:
Q  17 tgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtcc 116  Q
    |||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38732 tgtttagaattggatatgtagcggaataaaaacagatcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccgtaagtagtcc 38633  T
Q  117 agtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaa 216  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  38632 agttccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtataagacttcccaaatgctcaa 38535  T
Q  217 acacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
     ||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38534 gcacgcaggcgagagactt-caatgctcaagcactaaagcaagagactt 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 5)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 264
Target Start/End: Original strand, 19853 - 20115
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||   |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19853 ttgcttctgatgtgcaattcataattggatatgcagcggagtaaaaacagagtaagagagaagaaagaaggacacatgcaattatactggttccttccac 19952  T
Q  101 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgag 199  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19953 aaactggaagtagtccagttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgag 20051  T
Q  200 acttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 264  Q
    |||||| || || |||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20052 acttca-aattgctcaagcacgcaagcaagagacttccttttctcaagcactaaagcaagagact 20115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 273
Target Start/End: Original strand, 20124 - 20184
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20124 tcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgct 20184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 273
Target Start/End: Original strand, 10240 - 10283
Alignment:
Q  230 agacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10240 agacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 10283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 10265 - 10306
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10265 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 10306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 20166 - 20207
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20166 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 20207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 5)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 57553 - 57300
Alignment:
Q  9 tgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccgga 108  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  57553 tgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccgga 57454  T
Q  109 agtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-a 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||| | |    
T  57453 agtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatcacacagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgatacttctcaa 57359  T
Q  208 aatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  57358 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaatgcaagagtcttc 57300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1175 - 937
Alignment:
Q  35 cagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcactt 132  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1175 cagcggagtaaaa-cagagtaagagagaagaaagaaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactt 1077  T
Q  133 ccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagag 231  Q
    |||| |||| || ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||| ||||||    
T  1076 ccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattactcaagcacacagacaagag 979  T
Q  232 acttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  978 acttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgct 937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 31930 - 32018
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31930 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 32018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 48698 - 48764
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  48698 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 48764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 967 - 914
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  967 tcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaattaagagacttc 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7284 - 7033
Alignment:
Q  22 agaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtag-agagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtc 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7284 agaattggatatgcagcggagtaaaaatagagtaacagagaagaaagaaggacacaaacaattataccggttccttccacaaatcggaagtagtccagtc 7185  T
Q  121 ccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaaca 219  Q
    |||||| ||||| ||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||    
T  7184 ccccttacactttcaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagca 7087  T
Q  220 cacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7086 cgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 7033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7051 - 7003
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7051 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 7003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7021 - 6980
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7021 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 6980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12892 - 12634
Alignment:
Q  3 tgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12892 tgcttctgatgtgatgttcagaattatatatgcagcggaataaaa-cagagcagagaaaagaaagagagacacaagcaattatcctggttccttccacaa 12794  T
Q  103 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  12793 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaag----aatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagact 12699  T
Q  203 tcac-aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12698 tctcaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaaggactaaagcaagagtcttc 12634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2604 - 2340
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||| | || | ||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2604 ttgcttctgatgtgtagttcagaattggatgcacaacagagtaaaat-agagtaagagagaagaaagaaatacacaggcaattatactggttccttccac 2506  T
Q  101 aaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatga 198  Q
    |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2505 aaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagtt-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatga 2407  T
Q  199 gacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  2406 gacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 2340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38907 - 38634
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| |||||||  ||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  38907 attgcttctgatgtggagttaagattcagatgcacagcggagtaaaaacagagtaagagagaagaaagaaagacacaggcaattatacaggttccttcca 38808  T
Q  100 caaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatg 197  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38807 caaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacatccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatg 38709  T
Q  198 agacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    | |||||| || |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  38708 acacttca-aatttctcaggcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagactttctatgct 38634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38664 - 38611
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  38664 tcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 38611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 266
Target Start/End: Original strand, 1551 - 1732
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgct 178  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1551 caattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac----taataatcacacagattacaaatgct 1646  T
Q  179 caatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1647 caatact-ca-ctagtatgagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 1732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 165452 - 165181
Alignment:
Q  2 ttgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccac 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  165452 ttgcttctgatgtgcagttcagaattggatgcacagcggagtaaaat-agagtaagatagaagaaagaaagacacaggcaattatacaagttccttccac 165354  T
Q  101 aaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacaca-gattacaaatgctcaatactacacctagtatga 198  Q
    ||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  165353 aaaccggaagtcactcctgtctcccttgcacttccaaggagagtttcactaagtt-taatcacaaatgattacaactgctcaatactacacctagtatga 165255  T
Q  199 gacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  165254 gacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgct 165181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 165211 - 165158
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  165211 tcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 165158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 145206 - 145133
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  145206 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 145133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 66136 - 65988
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactac 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||      | ||||||||||||||| |||||     
T  66136 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttccacttccaaggagagtt-cactatgtaata-----tctgattacaaatgctcactactaa 66043  T
Q  188 acctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctc 244  Q
    || ||| | |||||||  |||||| |||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  66042 acttagcaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctc 65988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Original strand, 251037 - 251110
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  251037 agcaattattctggttccttccacaatctggaagtagtcaaatctcccttgcactttcaaggagattttcacta 251110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 244 - 26
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagt 153  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  244 agagagaagaaagaaagagacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt 145  T
Q  154 aataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 252  Q
      |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  144 t-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtttgacacttca-aattgctcaagcacacagacaagagacttcctttgctcaagcacac 47  T
Q  253 aagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  46 aagcaagagacttcctatgct 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 56 - 3
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56 tcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1117 - 959
Alignment:
Q  106 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||     
T  1117 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatact--atctagtatgagacttcc 1020  T
Q  206 caaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1019 caaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Original strand, 5727 - 5927
Alignment:
Q  35 cagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727 cagcggagtaaaa-caaagtaagagaaaagaaagaaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 5825  T
Q  134 caatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagaga 232  Q
    ||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||    
T  5826 caaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaagcaagaga 5923  T
Q  233 cttc 236  Q
    ||||    
T  5924 cttc 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 273
Target Start/End: Original strand, 9312 - 9530
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagt 153  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| |   ||||||     
T  9312 agagagaagaaagaaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtataactaagc 9411  T
Q  154 aataatcaca-cagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacta 252  Q
      |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  9412 t-taatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaggcaagagactccctttgctcaagcacac 9509  T
Q  253 aagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  9510 agacaagagacttcctatgct 9530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 9500 - 9555
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcact--aaagcaagagacttc 266  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9500 tcaagcacacagacaagagacttcctatgctcaagcactaaaaagcaagagacttc 9555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 149 - 17
Alignment:
Q  22 agaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtc 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149 agaattggatacgcagcggagtaaaaatagagtaagagagaagaaagaaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtc 50  T
Q  121 ccccttgcacttccaatgagatttccactaagt 153  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  49 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt 17  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 74 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10992 - 10805
Alignment:
Q  74 acaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaa 173  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    |||||||| || |||||||||    
T  10992 acaatcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac----taataatctcaaagattacaa 10897  T
Q  174 atgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10896 atgctcaatact-ctcttagtatgagacttctcagatgctcaagcacgcaggtgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttc 10805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1329
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagta-gagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttcca 99  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  | ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  1124 attgcttctgatgtgcagttcagatacagatgcacagcggagtaaaa-cagagtaagagagaagaaagaaagacacagacaattatacaggttccttcca 1222  T
Q  100 caaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctcaatactacacctagtatg 197  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1223 caaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatg 1321  T
Q  198 agacttca 205  Q
    ||||||||    
T  1322 agacttca 1329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7641 - 7401
Alignment:
Q  20 tcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaa-gagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccag 118  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7641 tcagaatcagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccag 7543  T
Q  119 tcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaa 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  7542 tcccccttgcacttccaaggagattt-gact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtaagagacttcacaaaaatgctcaa 7450  T
Q  217 acacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
     |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7449 gcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 7401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 14107 - 14322
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14107 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 14206  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  14207 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 14299  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  14300 tcaagcact-aagcaagagtcttc 14322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 54855 - 54640
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54855 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 54756  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  54755 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 54663  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  54662 tcaagcact-aagcaagagtcttc 54640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24563 - 24360
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacaca-agcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcac 130  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  24563 gcagcgga-taaaaacagag-atagagaaggaagaaagacacagagcaatttatacagattccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcac 24466  T
Q  131 ttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaaga 230  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||      |  ||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||||||||   ||||||    
T  24465 ttccaatgagagtt-cactatgtaata-----tcttattacaattgctcactactaaacttagtaagagactt--caaatgctcaaacacaactgcaaga 24374  T
Q  231 gacttcctttgctc 244  Q
    |||||||| |||||    
T  24373 gacttcctatgctc 24360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 80765 - 80827
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||    
T  80765 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcctcattgtacttccaaggaga 80827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 205
Target Start/End: Original strand, 16338 - 16461
Alignment:
Q  82 ttatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac-acagattacaaatgctca 180  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||    
T  16338 ttatactggttccttccacaaaccggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagt-ttaatcacaactgattacaactgctca 16436  T
Q  181 atactacacctagtatgagacttca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16437 atactacacctagtatgagacttca 16461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 6825 - 6866
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6825 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 6866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37441 - 37251
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  37441 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 37348  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37347 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 37251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 11881 - 12096
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11881 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 11980  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  11981 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 12073  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  12074 tcaagcact-aagcaagagacttc 12096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7574 - 7359
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  7574 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagattt 7475  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  7474 -cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-gtctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 7382  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  7381 tcaagcact-aagcaagagacttc 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 266
Target Start/End: Original strand, 13934 - 14084
Alignment:
Q  116 cagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagt--aataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||  |||||| |    
T  13934 cagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaatcaataatcacacagattacagatgctcaatactct--ctagtatgagacttatcaaatgct 14031  T
Q  214 caaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  14032 caagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 14084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 10238 - 10355
Alignment:
Q  4 gcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaa 103  Q
    |||| ||||||| |||||| |||  |||| ||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||     
T  10238 gcttctgatgtgatgttcaaaattagatatgcagcggaa-aagaacagagcagagaaaagaaagatagacagaaacagttatactggttccttccacaat 10336  T
Q  104 ccggaagtagtccagtccc 122  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  10337 ccggaagtagcccagtccc 10355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11332 - 11123
Alignment:
Q  52 agtagagagaagaaaga-gagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  11332 agtagagaaaagaaaaacgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact- 11235  T
Q  151 agtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagc 248  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||||||  ||| ||||| |||  |||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  11234 ----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 11140  T
Q  249 actaaagcaagagacttc 266  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  11139 act-aagcaagagtcttc 11123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8492 - 8367
Alignment:
Q  52 agtagagagaagaaaga-gagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccacta 150  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  8492 agtagagaaaagaaaaacgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact- 8395  T
Q  151 agtaataatcacacagattacaaatgctcaat 182  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8394 ----ataatcacaaagattacaaatgctcaat 8367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 30654 - 30871
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30654 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 30753  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcaca----aatgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  30754 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 30846  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30847 gctcaagcact-aagcaagagacttc 30871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 43232 - 43157
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43232 agacacaagcagttatcttggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttc 43157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 7483 - 7700
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7483 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 7582  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  7583 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 7675  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7676 gctcaagcact-aagcaagagacttc 7700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37692 - 37475
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37692 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 37593  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaa----atgttcaaacacacaggcaagagacttccttt 240  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||||||    ||| |||| |||||| ||||||| |||||  |    
T  37592 -cact-----ataatcacaaagattacaactgctcaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 37500  T
Q  241 gctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37499 gctcaagcact-aagcaagagacttc 37475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41185 - 40970
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41185 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 41086  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||| ||||||||| |||| ||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  41085 -cact-----ataatcacaaagattacaactgcttaatact-ttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 40993  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  40992 tcaagcact-aagcaagagacttc 40970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33609 - 33419
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  33609 agacacaagcatttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 33516  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||  | || |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33515 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 33419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4554 - 4448
Alignment:
Q  166 gattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  4554 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-aattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagattt 4456  T
Q  266 cctatgct 273  Q
    ||||||||    
T  4455 cctatgct 4448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4478 - 4425
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4478 tcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 4425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 266
Target Start/End: Original strand, 2214 - 2429
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2214 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttattctggttccttgcacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 2313  T
Q  145 ccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac--aaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgc 242  Q
     ||||     ||||||||  |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||    
T  2314 -cact-----ataatcaccaagattacaaatgctcaatact-ttcaaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 2406  T
Q  243 tcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||| | ||||||||||||    
T  2407 tcaagcact-atgcaagagacttc 2429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2926 - 2735
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  2926 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 2833  T
Q  170 ac-aaatgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    || |||||||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2832 acaaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 2735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 124 - 15
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  124 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 31  T
Q  170 acaaatgctcaatact 185  Q
    ||||||||||||||||    
T  30 acaaatgctcaatact 15  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8776 - 8667
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  8776 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 8683  T
Q  170 acaaatgctcaatact 185  Q
    ||||||||||||||||    
T  8682 acaaatgctcaatact 8667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Original strand, 1735 - 1835
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1735 aacagagaagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 1834  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  1835 c 1835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 1
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  155 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcaattccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 62  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcac-aaatgttcaaacacacaggcaaga 230  Q
    |||||||||||||||| | |  ||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||    
T  61 acaaatgctcaatact-ctctaagtatgagacttctcaaaatgctcaagcacataggcaaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28194 - 28106
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28194 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 28106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Original strand, 1437 - 1512
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1437 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 1512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Original strand, 4251 - 4351
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4251 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 4350  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  4351 c 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Original strand, 23322 - 23429
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattac 171  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||||    
T  23322 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattac 23415  T
Q  172 aaatgctcaatact 185  Q
    || |||||||||||    
T  23416 aactgctcaatact 23429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 155811 - 155711
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  155811 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 155712  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  155711 c 155711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 52465 - 52374
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52465 aacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 52374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16501 - 16299
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcact 131  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16501 gcagcgga-taaaaacagag-agagagagagaagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcact 16404  T
Q  132 tccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagag 231  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||||      | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||  |||||| |||| ||||   |||||||    
T  16403 tccaaggagagtt-cactatgtaata-----tctgattacaaatgctcactactaaacttagtaagagattt--caaatgctcaagcacaactgcaagag 16312  T
Q  232 acttcctttgctc 244  Q
    ||||||| |||||    
T  16311 acttcctatgctc 16299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 61249 - 61149
Alignment:
Q  47 aacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagattt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  61249 aacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 61150  T
Q  145 c 145  Q
    |    
T  61149 c 61149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 9250 - 9337
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  9250 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 9337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Original strand, 21367 - 21430
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21367 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4534 - 4459
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4534 agacacaaacagttatcatggttccttccacaaatcggaaatagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 141
Target Start/End: Original strand, 76586 - 76677
Alignment:
Q  50 agagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||  |||| | ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  76586 agagtagagtgaaagaagaaaaacataagcaattctacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagaga 76677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20211 - 20149
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20211 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagaga 20149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 135
Target Start/End: Original strand, 29176 - 29221
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  29176 gttccttccataaaccggaagtagtcttgtcgcccttgcacttcca 29221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 73948 - 74014
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  73948 aagcaattatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 74014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10792
Alignment:
Q  44 aaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10884 aaaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaatgcaattatacaggttccttccacaaaccaaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaa 10792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15548 - 15456
Alignment:
Q  44 aaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15548 aaaaacagag-agagagaaagaagaaagacacaatgcaattatacaggttccttccacaaaccaaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaa 15456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 32530 - 32465
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  32530 aagcaattatataggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcatttccaaggaga 32465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 14484 - 14544
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14484 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaa 14544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6018 - 5889
Alignment:
Q  72 acacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagatt 169  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||      | ||||    
T  6018 acacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactaagtaata-----tctgatt 5925  T
Q  170 acaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca 205  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  5924 acaaacgctcactactaaacttagtatgagacttca 5889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 9330 - 9396
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  9330 aagcaattatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttacaaggaga 9396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16870 - 16808
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  16870 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcacgtcccccttgcacttccaaggaga 16808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2129 - 2064
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2129 aagcaattatacatgtttcttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 2064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 2027 - 2092
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  2027 aagcaattatataggttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccatttgcacttccaaggaga 2092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4106 - 4041
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  4106 aagcaattatacaggttccttacacaatccagaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 4041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2760 - 2696
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  2760 aagcaattatataggttccttccacaaaccggaagtagtcctgt-gcccttgcacttccaaggaga 2696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 127
Target Start/End: Original strand, 7217 - 7274
Alignment:
Q  70 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttg 127  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7217 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttg 7274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37490 - 37425
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  37490 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgctcttccaaggaga 37425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 6880 - 6815
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6880 aagcaattatacaggttcctttcacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 6815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2804 - 2739
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  2804 aagcaattatacaagttccttccacaatccggaagtagtcatgtccccctttcacttccaaggaga 2739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4591 - 4538
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4591 tcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcaccaaagcaagagacttc 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 87764 - 87841
Alignment:
Q  66 agagagacacaa-gcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  87764 agagagacacaaagcaatttatagtggttccttccacaatccggaagtagttcactcccccttgcacttccaaggaga 87841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 245025 - 244969
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactt 132  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  245025 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcgtgtcccccttgcactt 244969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 141
Target Start/End: Original strand, 219561 - 219671
Alignment:
Q  32 acgcagcggagtaaaaacagagtagagaga-aga-aagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgc 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  219561 acgcagcgga-taaaaacagag-agagagagagagaagaaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaaatcggaagtagtcatgtcccccttgc 219658  T
Q  129 acttccaatgaga 141  Q
    |||| ||| ||||    
T  219659 actttcaaggaga 219671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 378277 - 378226
Alignment:
Q  90 gttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  378277 gttccttccacaaactggaagtagtcatgccccccttgcacttccaaggaga 378226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 244879 - 244831
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  244879 gcaagaaatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgct 244831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4001 - 3934
Alignment:
Q  77 agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4001 agcaattatcttggttccttgcacaatccggaagtagttcagt-ccctttgcacttccaatgagatttc 3934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 872 - 824
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  872 gcaagagatttcctatgcttaagaactaaatcaagagacttcctatgct 824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Original strand, 2777 - 2875
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcact 131  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  2777 gcagcgga-taaaaacagag-agagagaagaaaga----cacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcact 2870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 18545 - 18632
Alignment:
Q  55 agagagaagaaagagagacacaa-gcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||    
T  18545 agagagaaagaagaaagacacaaagcaattatagtggttccttccacaatccggaagtggtccactcctccttgcactttcaaagaga 18632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 157
Target Start/End: Original strand, 11551 - 11644
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaata 157  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||    
T  11551 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagtt-cactaagtaata 11644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3424 - 3346
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3424 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 3346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 2597 - 2663
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaa-ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  2597 aagcaattatataggttccttccacaaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttacaaggaga 2663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 59449 - 59511
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  59449 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtaccccttgcacttccaaggaga 59511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 7280 - 7356
Alignment:
Q  65 aagagagacaca-agcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  7280 aagaaagacacatagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtagtcctat-ccccttgcacttccaaggaga 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 268152 - 268214
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  268152 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctattccccttgcacttccaaggaga 268214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 83759 - 83825
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  83759 aagcaattatacaggtaccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 83825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2525 - 2460
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  2525 aagcaattatacaggttccttccacaattcggaagtagtcctgtcctccttgcacttccaaggaga 2460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2392 - 2344
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  2392 gcaagagatttcctatgctcgagaactaaatcaagagacttcctatgct 2344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9731 - 9666
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9731 aagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagtagtcctgtcccccttgtacttccaaggaga 9666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 396 - 335
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaag-tagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  396 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaa 335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 136
Target Start/End: Original strand, 18402 - 18459
Alignment:
Q  80 aattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  18402 aattatataggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaa 18459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 658 - 606
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttg 127  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  658 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttg 606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35502 - 35429
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35502 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaa 35429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26408 - 26340
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcact 131  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  26408 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccccctttcact 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2510 - 2441
Alignment:
Q  72 acacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  2510 acacaagaaattatacaggttccttccacaatccggaagtagacctatcctccttgcacttccaatgaga 2441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 102936 - 102997
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  102936 aagcaattatataagttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaa 102997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Original strand, 86 - 147
Alignment:
Q  80 aattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  86 aattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccacttgcacttccaaggaga 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 59851 - 59779
Alignment:
Q  194 tatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  59851 tatgagacttcccaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaaaaaagagacttc 59779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 244
Target Start/End: Original strand, 63663 - 63869
Alignment:
Q  34 gcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagagagacacaa-gcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcac 130  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  63663 gcagcgga-taaaaacaggg-agaaagaaggaagaaagacacaaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcac 63760  T
Q  131 ttccaatgagatttccactaagtaataatcacacagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaatgttcaaacacacaggcaaga 230  Q
    ||  || |||| || ||||||  ||||||    | |||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| |||| ||||   ||||||    
T  63761 tttgaaggagagtt-cactaaaaaataat--atctgattacaattgctcactactaaacttagtaagagactt--caaatgctcaagcacaactgcaaga 63855  T
Q  231 gacttcctttgctc 244  Q
    |||||||| |||||    
T  63856 gacttcctatgctc 63869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 46044 - 46097
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  46044 ggttccttctacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggaga 46097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1383 - 1340
Alignment:
Q  93 ccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1383 ccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaa 1340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 266
Target Start/End: Original strand, 908 - 947
Alignment:
Q  227 aagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  908 aagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 17812 - 17929
Alignment:
Q  1 attgcttatgatgtgttgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttcc 98  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||  |||  ||||||||  || ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17812 attgcttctgatgaattgttcagaattagatgtgcagcggaa-aagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 17910  T
Q  99 acaaaccggaagtagtcca 117  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  17911 acaacacggaagtagtcca 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 18774 - 18833
Alignment:
Q  88 tggttccttccacaaaccggaagtagt-ccagt-cccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18774 tggttccttccacaaatcggaagtagtcccagtccccccttgcacttccaaggagatttc 18833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 691 - 753
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  691 caattatacaggttctttccacaaaccgaaagtagtcctatcccccttgcacttccaaggaga 753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 658
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  720 caattatacaggttctttccacaaaccgaaagtagtcctatcccccttgcacttccaaggaga 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 5581 - 5647
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  5581 aagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaacgaga 5647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1576 - 1441
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| | || || ||||| ||||||         
T  1576 aagaaagacacaagcaatttatttaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgt-ccccttgcacttccaaggggagtt-cactatgtaata----- 1484  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca 205  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  1483 tctgattacaaatgctcactactaaacttagtatgagacttca 1441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 2361 - 2414
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaag-tagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  2361 ggttccttccacaaaccggaagttagtactgtcccccttgcacttccaaggaga 2414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7473 - 7420
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  7473 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 7420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 266
Target Start/End: Original strand, 19609 - 19658
Alignment:
Q  217 acacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19609 acacacacgcatgagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 19658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 24010 - 24063
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  24010 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 24063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 22555 - 22596
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22555 gcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 22596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 5056 - 5116
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||    
T  5056 aagcaattataaaggttctttccacaaactgaaactagtcctgtcccccttgcacttccaa 5116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Original strand, 22390 - 22449
Alignment:
Q  82 ttatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  22390 ttatagtggttccttccacaatccgagagtagtccactcccccttgcactttcaaggaga 22449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 671 - 618
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  671 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 13410 - 13475
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  13410 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagttgtcctgtcccccttacactaccaaggaga 13475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 13555 - 13603
Alignment:
Q  225 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgct 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  13555 gcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcttatgct 13603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Original strand, 144285 - 144329
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttc 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  144285 ggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttc 144329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1026 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1026
Description:

Target: scaffold1026; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 266
Target Start/End: Original strand, 2619 - 2666
Alignment:
Q  219 acacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  2619 acacacgcaagagacttcctgtgctcaagaacaaaagcaagagacttc 2666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8091
Alignment:
Q  45 aaaacagagtagagagaagaaagagagacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |   |||||||||||   ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7998 aaaacagag-agagagaagaaagacaca---aagcaattatacatgttccttccaataaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 8091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1339 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1339
Description:

Target: scaffold1339; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 265
Target Start/End: Original strand, 1764 - 1810
Alignment:
Q  219 acacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1764 acacaagcaagcgacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagactt 1810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 6434 - 6368
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  6434 aagcaattatacaggttccttccacaaaatggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 6368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 9323 - 9389
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  9323 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccagaagtcagtcctgttccccttgcacttccaaggaga 9389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 88357 - 88221
Alignment:
Q  65 aagagagacacaagcaatt-atattggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgagatttccactaagtaataatcac 162  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||| | || || || || ||||||         
T  88357 aagaaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagacatgtcccctttgcacttccaaggggagtt-caatatgtaata----- 88264  T
Q  163 acagattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca 205  Q
     | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  88263 tctgattacaaatgctcactactaaacgtagtatgagacttca 88221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 36799 - 36861
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||    
T  36799 caattatacaggttccttccacaaaccagaagtagtcctatcccctttgcacttacaaggaga 36861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Original strand, 134859 - 134921
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||    
T  134859 caattatacaggttccttccacaaaccagaagtagtcctatcccctttgcacttacaaggaga 134921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1657 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1657
Description:

Target: scaffold1657; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 1209 - 1273
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||    
T  1209 aagcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtagt-catatccccttgcacttccaaggaga 1273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 3675 - 3740
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||    
T  3675 aagcaattatacatgttccttccacaatccggaagtagtcttctcccccttgtacttccaaggaga 3740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 3803 - 3856
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3803 tcaagcacacaagcaaaagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 3856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19354 - 19301
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  19354 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcatccttgcacttccaaggaga 19301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17078 - 17009
Alignment:
Q  76 aagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| | | |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  17078 aagcaattatactgatttcttccacaatctgaaagtagtccaatctcctttgcacttccaaggagatttc 17009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16951 - 16899
Alignment:
Q  213 tcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 265  Q
    |||| |||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16951 tcaatcacacaagcaagagattttctatgctcaagcacaaaagcaagagactt 16899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 7217 - 7181
Alignment:
Q  79 caattatattggttccttccacaaaccggaagtagtc 115  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7217 caattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtc 7181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 44593 - 44541
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgaga 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||    
T  44593 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcgcctttgcactttcaaggaga 44541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 111270 - 111210
Alignment:
Q  206 caaatgttcaaacacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 266  Q
    |||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||    
T  111270 caaatgctcaaacacaactgcaagagacttcctatgctcaagaacaaaatcaagagacttc 111210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 111382 - 111326
Alignment:
Q  89 ggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttc 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  111382 ggttccttccacaaaccggtagtcatcttgtccctcttgcacttccaaggagatttc 111326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 136
Target Start/End: Original strand, 106 - 150
Alignment:
Q  93 ccttccacaaaccggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  106 ccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccctgcacttccaa 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 12871 times since January 2019
Visitors: 8269