View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1312_low_4 (Length: 527)

Name: NF1312_low_4
Description: NF1312
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1312_low_4
NF1312_low_4
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (1-498)||(26143673-26144170)
chr6 (1-498)||(25483864-25484361)
chr6 (1-498)||(25580527-25581024)
chr6 (1-498)||(25539348-25539845)
chr6 (1-498)||(25511697-25512193)
chr6 (1-498)||(26056727-26057224)
chr6 (1-498)||(26076697-26077194)
chr6 (1-449)||(26647284-26647732)
chr6 (1-449)||(26753252-26753700)
chr6 (1-441)||(26884875-26885312)
chr6 (1-449)||(26656770-26657215)
chr6 (1-449)||(26762741-26763186)
chr6 (1-441)||(26862385-26862825)
chr6 (60-485)||(27530197-27530619)
chr6 (1-424)||(27337049-27337472)
chr6 (1-424)||(27397789-27398212)
chr6 (15-441)||(31285378-31285804)
chr6 (109-455)||(27591944-27592290)
chr6 (109-441)||(27426549-27426881)
chr6 (109-455)||(27676543-27676889)
chr6 (16-441)||(27717436-27717861)
chr6 (120-441)||(27679874-27680195)
chr6 (1-441)||(26624076-26624516)
chr6 (1-441)||(26730053-26730493)
chr6 (120-413)||(27697551-27697844)
chr6 (16-441)||(27610057-27610482)
chr6 (121-482)||(25492215-25492576)
chr6 (1-449)||(26803251-26803699)
chr6 (16-449)||(28787058-28787491)
chr6 (60-449)||(28793223-28793612)
chr6 (108-498)||(27215364-27215754)
chr6 (109-449)||(26824732-26825072)
chr6 (16-449)||(27603633-27604066)
chr6 (231-441)||(27705191-27705401)
chr6 (16-289)||(28781921-28782194)
chr6 (109-273)||(28326391-28326555)
chr6 (109-273)||(28504027-28504191)
chr6 (1-196)||(27705586-27705781)
chr6 (162-361)||(28182084-28182283)
chr6 (111-361)||(28235480-28235730)
chr6 (162-273)||(28227918-28228029)
chr6 (171-273)||(28240329-28240431)
chr6 (185-267)||(29477176-29477258)
chr6 (109-272)||(28296846-28297009)
chr6 (109-272)||(28515064-28515227)
chr6 (235-273)||(27664310-27664348)
chr6 (371-441)||(28140710-28140780)
chr6 (179-273)||(28243778-28243872)
chr6 (163-273)||(28490661-28490771)
chr6 (163-273)||(29469086-29469196)
chr6 (163-273)||(29803071-29803181)
chr6 (108-240)||(2185738-2185870)
chr6 (219-273)||(29827009-29827063)
chr6 (332-388)||(28186530-28186586)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (1-449)||(28126604-28127052)
chr1 (60-449)||(28163305-28163693)
chr1 (120-441)||(267277-267598)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (109-441)||(60482-60814)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (109-441)||(18074674-18075006)
chr4 (60-455)||(18654396-18654791)
chr4 (16-450)||(18698324-18698758)
chr4 (16-450)||(18730428-18730862)
chr4 (16-455)||(18678479-18678918)
chr4 (60-455)||(18723004-18723399)
chr4 (116-441)||(5089887-5090212)
chr4 (344-419)||(18688581-18688656)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (16-441)||(2476-2901)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (1-449)||(29272767-29273215)
chr8 (171-273)||(35984274-35984376)
chr8 (163-273)||(12589639-12589749)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (16-449)||(3641-4074)
scaffold0277 (16-449)||(12604-13037)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (16-449)||(8307-8740)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (109-387)||(57285-57563)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (111-361)||(35642-35892)
scaffold0038 (162-273)||(28416-28527)
scaffold0038 (171-273)||(40491-40593)
scaffold0038 (179-273)||(43940-44034)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (233-289)||(16691904-16691960)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (173-244)||(3468258-3468329)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (1-46)||(3280464-3280509)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 470; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 26143673 - 26144170
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143673 tcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 26143772  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143773 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 26143872  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26143873 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgg 26143972  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143973 gattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 26144072  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattg 498  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26144073 gaagaaattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattg 26144170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 25483864 - 25484361
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || || ||||||    
T  25483864 tcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaa-aagatgctcctttcaaaaatagttaa 25483962  T
Q  100 attgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaa 199  Q
    |||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25483963 atttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattgttgatgatgttgacaaa 25484062  T
Q  200 ctggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25484063 ctggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatg 25484162  T
Q  300 ggattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagtta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484163 ggattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagtta 25484262  T
Q  400 tgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattg 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484263 tgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattg 25484361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 25580527 - 25581024
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||  |  |||||||||||| || |||||||    
T  25580527 tcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagatttcaattcttaataacttgaaacatctccattattatctccttttaataatagttaaa 25580626  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    ||  ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25580627 ttttactttaagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgatttttgatgatgttgacaaac 25580726  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25580727 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagtgtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgg 25580826  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25580827 gattacaagtacacatgcagtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaatttat 25580926  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattg 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580927 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctgggctgcccttagcaatagtaacaataggggataatttgtttggaaggaaggtagaagattg 25581024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 25539348 - 25539845
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |  | ||||||| || || |||||||    
T  25539348 tcaatttgaagttgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacttgaaacatctccaaaagaagctcctttcaaaaatagttaaa 25539447  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539448 tttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataacaatcataaaggaaagactatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 25539547  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  25539548 tagagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgatacacatttattagcctgtcatgg 25539647  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25539648 gattacaagtacacatgtagtaaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcgtttaaaaatgacaaagttccttcgagttat 25539747  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattg 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539748 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctacccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattg 25539845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 25511697 - 25512193
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||    
T  25511697 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaa 25511796  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    ||  ||  | || ||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25511797 tttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaac 25511896  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25511897 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgactggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgg 25511996  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25511997 -attacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagatagaagctcttattttgttgaggcgaatggcttttaaacatgacaaagttccttcaagttat 25512095  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattg 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25512096 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggccttccgttagctatagtaacaataggggccaatttgtttggaaggaaggtagaagattg 25512193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 26056727 - 26057224
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||    
T  26056727 tcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaa 26056826  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    ||  ||  | |||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26056827 tttgacggtcagttagaagatgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaac 26056926  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||     
T  26056927 tggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgt 26057026  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26057027 gaatacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 26057126  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattg 498  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26057127 gaagatattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggccttccgttagctatagtaacaataggggccaatttgattggaaggaaggtagaagattg 26057224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 26076697 - 26077194
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||    
T  26076697 tcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaa 26076796  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    ||  ||  | || ||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26076797 tttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaac 26076896  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||     
T  26076897 tggagcagctagacgctttggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgt 26076996  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26076997 gaatacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 26077096  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattg 498  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26077097 gaagatattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggccttccgttagctatagtaacaataggggccaatttgattggaaggaaggtagaagattg 26077194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 449
Target Start/End: Original strand, 26647284 - 26647732
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||    
T  26647284 tcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagagaattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaa 26647383  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
     |||||  |||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  26647384 gtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaac 26647483  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26647484 tggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgg 26647583  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    |||   ||| ||| ||||||||  |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| ||  ||||||||    
T  26647584 gatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttat 26647683  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    |||||  |||||||||||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  26647684 gaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttag 26647732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 449
Target Start/End: Original strand, 26753252 - 26753700
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||    
T  26753252 tcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagagaattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaa 26753351  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
     |||||  |||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  26753352 gtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaac 26753451  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26753452 tggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgg 26753551  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    |||   ||| ||| ||||||||  |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| ||  ||||||||    
T  26753552 gatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttat 26753651  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    |||||  |||||||||||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  26753652 gaagacgttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttag 26753700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 26884875 - 26885312
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||    
T  26884875 tcaatttgaatgtgtatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataacttgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaa 26884974  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26884975 ttaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactacatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaaa 26885074  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| |    
T  26885075 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatag 26885174  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    | |    || ||| ||| |||||||||| |  ||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||||   ||||||||||||| | |||||    
T  26885175 ggtagatagaacatatgaagtagaagggatatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaaa---gacaaagttcctttaggttat 26885271  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||    
T  26885272 gaagagattttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggcct 26885312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 449
Target Start/End: Original strand, 26656770 - 26657215
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||| |    
T  26656770 tcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttaga 26656869  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
     ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26656870 gtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaac 26656969  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||  |||||| ||    
T  26656970 tggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgg 26657069  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    |||   ||  ||| |||| ||| ||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |   ||||| ||||||||| |||||    
T  26657070 gatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttgagatggatggcttttaga---gacaatgttccttcaggttat 26657166  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| | ||||| || || || |||||||    
T  26657167 gaagaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttag 26657215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 449
Target Start/End: Original strand, 26762741 - 26763186
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||| |    
T  26762741 tcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttaga 26762840  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
     ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26762841 gtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaac 26762940  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||  |||||| ||    
T  26762941 tggagcagctagaggctttggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgg 26763040  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    |||   ||  ||| |||| ||| ||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |   ||||| ||||||||| |||||    
T  26763041 gatagaaataacatatgccgtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttgagatggatggcttttaga---gacaatgttccttcaggttat 26763137  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| | ||||| || || || |||||||    
T  26763138 gaagaaattttaagccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttag 26763186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 26862385 - 26862825
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||||    
T  26862385 tcaatttgaaggtgtatgttttcttcataaagttagagagaattcaactcataatagcttgaaacatctccagaaggagcttcttttaaaaacagttaaa 26862484  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || | || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26862485 ttgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccacttataaaggaaagactaaatagaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaac 26862584  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||    
T  26862585 tggaacagctagaggcattagctggaggacttgattggtttggtcatggaagtagagtcatcattaccactcgagataaacacttactaacatgccatgg 26862684  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    |||   ||| ||| |||| ||| | ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  26862685 gatagaaagaacatatgcggtaaacgggctacatgagacagaagcttttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatggtgaagttccttcgagttat 26862784  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
     | ||  |||||||||||| |||| | ||||| || |||||    
T  26862785 aacgatgttttaaaccgtgcagttgcatatgcttccggcct 26862825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 60 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27530619 - 27530197
Alignment:
Q  60 tgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatc 159  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||     
T  27530619 tgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacagttagattggacattaagttaggaggtgttagtcagggaattccaatcattaagcaaaggctatg 27530520  T
Q  160 tagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtc 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  27530519 tagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggccttggctggaggacttgattggttcggtcctgggagtagagtc 27530420  T
Q  260 atcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttga 359  Q
    |||||||| |||||  | || |||||||||     |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27530419 atcattactactcgaaacaaacacttactaaagattcatgggatagaaagtacacatgcagtagaagggttgaatgcgacagaagctctcgaattgttga 27530320  T
Q  360 ggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaac 459  Q
    || | |||||||| |||   || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| || ||||| || ||||     
T  27530319 ggtggatggctttcaaa---gaaaatgttccttcaagtcatgaagacattttaaaccgtgcacttacttatgcttctggccttccattagctattgtaat 27530223  T
Q  460 aatagggggcaatttgtttggaagga 485  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||    
T  27530222 aatagggtccaatttggttggaagga 27530197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 27337472 - 27337049
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||  |||||||||||||| | || ||||||| || ||||||| ||    
T  27337472 tcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaa 27337373  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
     |||||  ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  27337372 ctgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaac 27337273  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27337272 tggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgg 27337173  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    |||   ||| ||| ||||||||  |||| |  ||| ||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||    
T  27337172 gatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttat 27337073  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagtt 424  Q
    |||||  |||||||||||| ||||    
T  27337072 gaagatgttttaaaccgtgcagtt 27337049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 27398212 - 27397789
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||  |||||||||||||| | || ||||||| || ||||||| ||    
T  27398212 tcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaa 27398113  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
     |||||  ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  27398112 ctgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaac 27398013  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27398012 tggatcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgg 27397913  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    |||   ||| ||| ||||||||  |||| |  ||| ||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||    
T  27397912 gatagaaagaacatatgcagtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttat 27397813  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagtt 424  Q
    |||||  |||||||||||| ||||    
T  27397812 gaagatgttttaaaccgtgcagtt 27397789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 441
Target Start/End: Original strand, 31285378 - 31285804
Alignment:
Q  15 tatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagtt 114  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||| ||  | |||||||| | |||| ||  |||| |   ||||||    
T  31285378 tatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagtt 31285477  T
Q  115 aggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagag 214  Q
    ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||  |     
T  31285478 agaccatgttagtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgcat 31285577  T
Q  215 gctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    |||||||||| | ||||||||    
T  31285578 gctttggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacac 31285677  T
Q  315 atgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  31285678 atgcagtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttacgaagacattttaaa 31285777  T
Q  415 ccgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
    ||||| |||| | ||| | ||||||||    
T  31285778 ccgtgcagttgcatattcttctggcct 31285804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 109 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 27592290 - 27591944
Alignment:
Q  109 taagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcag 208  Q
    ||||||||||  |||||| || |||||| | |  || |||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27592290 taagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcag 27592191  T
Q  209 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaa 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||   ||    
T  27592190 ctagatgctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaa 27592091  T
Q  309 gtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagat 408  Q
      ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27592090 aaacatatgcagtagaagagttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacat 27591991  T
Q  409 tttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatag 455  Q
    |||||| |||| ||||   ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  27591990 tttaaagcgtgcagttgtatatgcttctggccttccattagcgatag 27591944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 109 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27426881 - 27426549
Alignment:
Q  109 taagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcag 208  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||     
T  27426881 taagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaa 27426782  T
Q  209 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaa 308  Q
    ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||   ||    
T  27426781 ctgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaa 27426682  T
Q  309 gtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagat 408  Q
      ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27426681 aaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaagat 27426582  T
Q  409 tttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
    ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27426581 tttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggcct 27426549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 109 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 27676889 - 27676543
Alignment:
Q  109 taagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcag 208  Q
    ||||||||||  |||||| || |||||| | |  || |||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27676889 taagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcag 27676790  T
Q  209 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaa 308  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||   ||    
T  27676789 ctagaggctttggctggaagactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaa 27676690  T
Q  309 gtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagat 408  Q
      ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27676689 aaacatatgcagtagaagagttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacat 27676590  T
Q  409 tttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatag 455  Q
    |||||| |||| ||||   ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  27676589 tttaaagcgtgcagttgtatatgcttctggccttccattagcgatag 27676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27717861 - 27717436
Alignment:
Q  16 atgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa-ttgaaccataagtt 114  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| | || |||||||||| |||| || || |||||   ||||||    
T  27717861 atgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcagaaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaat-taagtt 27717763  T
Q  115 aggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagag 214  Q
     |||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |     
T  27717762 tggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacat 27717663  T
Q  215 gctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacac 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| | |||||  |    
T  27717662 gctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgc 27717563  T
Q  315 atgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 414  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27717562 atgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaa 27717463  T
Q  415 ccgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  27717462 ccgtgcagttgcatatgcttctggcct 27717436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 120 - 441
Target Start/End: Original strand, 27679874 - 27680195
Alignment:
Q  120 atgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggcttt 219  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||  | |||||    
T  27679874 atgttagtgagggaattccagtcataaaggaaagattatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaagcaactgcatgcttt 27679973  T
Q  220 ggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||  | ||||||| ||   |||||||||||||    
T  27679974 ggctggaggacttgattggttcggatgtggaagcagagtcatcattaccactcgaaacaaagacttactaagcagtcatggcatagaaagtacacatgca 27680073  T
Q  320 gtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtg 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  27680074 gtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacattttaaaccgtg 27680173  T
Q  420 tagttacttatgcatctggcct 441  Q
     |||| | ||||| | ||||||    
T  27680174 cagttgcatatgcttttggcct 27680195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 26624076 - 26624516
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||| ||  | |||||||| | ||||  |  |    
T  26624076 tcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactgga 26624175  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    ||| |   |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||       
T  26624176 ttggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagta 26624275  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    |   ||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||| |||||  |  ||||||    
T  26624276 taaggcaactggatgctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgg 26624375  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26624376 gataaaaagcacacatgcagtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttat 26624475  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  26624476 gaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 26624516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 26730053 - 26730493
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||| ||  | |||||||| | ||||  |  |    
T  26730053 tcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactgga 26730152  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    ||| |   |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||       
T  26730153 ttggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagta 26730252  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    |   ||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||| |||||  |  ||||||    
T  26730253 taaggcaactggatgctttggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgg 26730352  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26730353 gataaaaagcacacatgcagtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttat 26730452  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  26730453 gaagacattttaaaccgtgcagttgcatatgcttctggcct 26730493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27697844 - 27697551
Alignment:
Q  120 atgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggcttt 219  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27697844 atgttagtgacggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgacgatgttgacaaactggatcagctacaggcttt 27697745  T
Q  220 ggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgca 319  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |  |||||||||   ||  ||  |||||    
T  27697744 ggctggaggactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagaccatcatgggatagaaaaaacgtatgca 27697645  T
Q  320 gtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaa 413  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  27697644 gtaaaagggttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccatcaaggtacaaagagattttaa 27697551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27610482 - 27610057
Alignment:
Q  16 atgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa-ttgaaccataagtt 114  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||| || || |||||   ||||||    
T  27610482 atgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaat-taagtt 27610384  T
Q  115 aggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagag 214  Q
     |||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |     
T  27610383 tggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacat 27610284  T
Q  215 gctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacac 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| | |||||  |    
T  27610283 gctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattgccactcgagacaaacacttgctaacctgtcatgggataaaaagtatgc 27610184  T
Q  315 atgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 414  Q
    ||  ||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27610183 ataaagtggaagggctgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaa 27610084  T
Q  415 ccgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
    |||||  ||| | ||||| ||||||||    
T  27610083 ccgtgctgttgcatatgcttctggcct 27610057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 121 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25492576 - 25492215
Alignment:
Q  121 tgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttg 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25492576 tgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaggactatgtagagagaagattcttttgattctcgatgatgttgacagactggagcagctagaggatttg 25492477  T
Q  221 gctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcag 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || || ||| ||||| || ||||||||||   |||||  |||||||    
T  25492476 gctgaaggacttgattggttcggtcgtggaagcggagttatcattaccactcgagacaaacacatactaaccagtcatgggatagaaagtatgcatgcag 25492377  T
Q  321 tagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgt 420  Q
    |||||| |||| ||| |  |||||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||     
T  25492376 tagaagagttgcatggggaagaagctcttgaattgcttatgtggatggcttttaaaaatgacagagttccttcaatttatgaagacattttaacacttgc 25492277  T
Q  421 agttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaa 482  Q
    | |||| ||||| |||||||| || |||||  |||||| |||||||   |||||||||||||    
T  25492276 aattacctatgcttctggccttccattagctttagtaataatagggtcaaatttgtttggaa 25492215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 449
Target Start/End: Original strand, 26803251 - 26803699
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||| ||  | || ||| ||| ||||  |  |    
T  26803251 tcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactgga 26803350  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    |||||    |||||||   ||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |      
T  26803351 ttgaaaatcaagttagatcatgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgata 26803450  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||  || ||||||     
T  26803451 tggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatga 26803550  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
     ||   ||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26803551 tatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccttcaagttat 26803650  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| | ||||| || || || |||||||    
T  26803651 gaagacattttaaatcgtgcagtttcatatgcttcaggtcttcccttag 26803699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 449
Target Start/End: Original strand, 28787058 - 28787491
Alignment:
Q  16 atgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagtta 115  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| |||| || || ||||   |||||||    
T  28787058 atgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagtta 28787157  T
Q  116 ggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagagg 215  Q
    |||| |||||||||||||||| |    || |||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  || |||| ||| | |    
T  28787158 ggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatg 28787257  T
Q  216 ctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacaca 315  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||    ||||||||||   |||||||||    
T  28787258 ctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacaca 28787357  T
Q  316 tgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaac 415  Q
    || |||  ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||     
T  28787358 tgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaat 28787457  T
Q  416 cgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  28787458 cgtgcagtttcttatgcttcgggccttcccttag 28787491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 449
Target Start/End: Original strand, 28793223 - 28793612
Alignment:
Q  60 tgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatc 159  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| |||| || || ||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||      
T  28793223 tgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctaca 28793322  T
Q  160 tagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtc 259  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || |||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||    
T  28793323 tacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtc 28793422  T
Q  260 atcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttga 359  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||    ||||||||||   ||||||||||| |||  ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28793423 atcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacacatgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttga 28793522  T
Q  360 ggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    |  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  28793523 gatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaatcgtgcagtttcgtatgcttcgggccttcccttag 28793612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 498
Target Start/End: Original strand, 27215364 - 27215754
Alignment:
Q  108 ataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagca 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||  || ||  |||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27215364 ataagttaggaggtgttagtgaggggattacaaagataaaaaaaatgctatgtcaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagca 27215463  T
Q  208 gctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattaca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||  | |  || |||||| ||| |||||||||   |    
T  27215464 gctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtggtggaagtagagtcatcattacgactcgaaacagacagttactaacctatcatgggatagaa 27215563  T
Q  308 agtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagaga 407  Q
    ||    |||   |||   ||  |  ||||   |||||||| | |||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||  |    
T  27215564 agattgcatcacgtaagcggtctatatgacgaagaagctcataaattgttgaggttgatggcatttaaaaatggtgaagttccttcaagttatgaaggca 27215663  T
Q  408 ttttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatagtaacaatagggggcaatttgtttggaaggaaggtagaagattg 498  Q
    |||| || |||| | |||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27215664 tttttaatcgtgcacttacttatgtttctggccttccattagctatagtaacaatagggtccaatttgtttggaaggagtgtagaagattg 27215754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 449
Target Start/End: Original strand, 26824732 - 26825072
Alignment:
Q  109 taagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcag 208  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||  |||||| || || ||||||   ||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||     
T  26824732 taagttaggaggtgttagtcaaggtattcaaatcataaaagatagactacgcagaaagaaagttcttctgattctcgatgacattgacaaactggagcaa 26824831  T
Q  209 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaa 308  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||  ||  ||||| || || ||    
T  26824832 ctagatgctttggctggaggatttgattggttcggtaatggcagcagagtcatcattacaactcgagacaaacaattacttaccaatcatgaga-tagaa 26824930  T
Q  309 gt-acacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagaga 407  Q
     | |   ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |    
T  26824931 ttaatgtatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccgtcaagttatgaacaca 26825030  T
Q  408 ttttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  26825031 ttttaaaccgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 26825072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27604066 - 27603633
Alignment:
Q  16 atgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa-ttgaaccataagtt 114  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || || |||||   ||||||    
T  27604066 atgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaat-taagtt 27603968  T
Q  115 aggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    || |||||||| ||   |  || |||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||| ||| ||    
T  27603967 aggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggggcaactacag 27603868  T
Q  215 gctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacac 314  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||| || ||||||  ||   ||| |       
T  27603867 gctttggcaggagaacctgattggtttgggcttggaagcagggtcatcattaccactcgagacagacacttactaaccagtcatgatatagaaagaaagt 27603768  T
Q  315 atgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 414  Q
    ||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||  |||||||    
T  27603767 atgcattagaagggttgtgtaggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcagtttatgaagacgttttaaa 27603668  T
Q  415 ccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    ||||| |||| | ||||| || || || |||||||    
T  27603667 ccgtgcagtttcatatgcttcaggacttcccttag 27603633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 231 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27705401 - 27705191
Alignment:
Q  231 ttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagggtt 330  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||   ||  ||| || |||||||||||||    
T  27705401 ttgattggtttggccctggaagcagagttatcatcaccactcgaaataaacacttactagcctctcataggatagaaaaaacatatccagtagaagggtt 27705302  T
Q  331 gaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttat 430  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||    
T  27705301 gaatgggatagatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaacgttccttcaggttatgaagacattttaaaccgtgcagttgcatat 27705202  T
Q  431 gcatctggcct 441  Q
    || ||||||||    
T  27705201 gcttctggcct 27705191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 289
Target Start/End: Original strand, 28781921 - 28782194
Alignment:
Q  16 atgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagtta 115  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | || || || ||||   |||||||    
T  28781921 atgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaagcacttcaactgaaaattaagtta 28782020  T
Q  116 ggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagagg 215  Q
    |||| |||||||||||||||| |    || |||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||| | |    
T  28782021 ggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatg 28782120  T
Q  216 ctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttacta 289  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  28782121 ctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttacta 28782194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 273
Target Start/End: Original strand, 28326391 - 28326555
Alignment:
Q  109 taagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcag 208  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| || ||||||| ||| |||| ||     |||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||     
T  28326391 taagttaggagatgtcaatgatggagttccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagcaa 28326490  T
Q  209 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcg 273  Q
     |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  28326491 ttgcaggttttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgatcgttaccactcg 28326555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 273
Target Start/End: Original strand, 28504027 - 28504191
Alignment:
Q  109 taagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcag 208  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| || ||||||| ||| |||| ||     |||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||     
T  28504027 taagttaggagatgtcaatgatggagttccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagcaa 28504126  T
Q  209 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcg 273  Q
     |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  28504127 ttgcaggttttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgatcgttaccactcg 28504191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27705781 - 27705586
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||||||| ||  | || ||| ||| ||||  |  |    
T  27705781 tcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaatgacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactgga 27705682  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgac 196  Q
    | |||    |||||||   ||||| ||||||| ||| || |||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27705681 tcgaaaataaagttagatcatgtttgtgaggggattccattcataaaggaaaggctgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgac 27705586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 361
Target Start/End: Original strand, 28182084 - 28182283
Alignment:
Q  162 gaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcat 261  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||  |  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || | ||| ||    
T  28182084 gaaagaaggttctattgattctagatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggaattgattggtttggtcctggtagtaaagtgat 28182183  T
Q  262 cattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgagg 361  Q
    |||||||||||| ||  | || || ||||   |||||||||||  |||  || ||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28182184 cattaccactcgagacgaacaattgctagtaggtcatgggattgaaagagcatatgaaatagataagttaaatgagaaagaagctcttgaattgttgagg 28182283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 361
Target Start/End: Original strand, 28235480 - 28235730
Alignment:
Q  111 agttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagct 210  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||| ||     |||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||  ||||  |    
T  28235480 agttaggagatgtcaatgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaatt 28235579  T
Q  211 agaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagt 310  Q
      ||| |||||| |||| | |||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||| || || || || |||||  |||||||||||  |||     
T  28235580 gcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaaga 28235679  T
Q  311 acacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgagg 361  Q
    ||  | | | ||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28235680 acgtacgaaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgttgagg 28235730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 273
Target Start/End: Original strand, 28227918 - 28228029
Alignment:
Q  162 gaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcat 261  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||  |   || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| ||    
T  28227918 gaaagaaagttctattgattctcgatgatgttcacaaactaaagcaattgcgggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgat 28228017  T
Q  262 cattaccactcg 273  Q
    ||||||||||||    
T  28228018 cattaccactcg 28228029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Original strand, 28240329 - 28240431
Alignment:
Q  171 ttcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccac 270  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||  ||||| |||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  28240329 ttcttttgattctagataatatggatgaactgaagcaactgcagggtttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccac 28240428  T
Q  271 tcg 273  Q
    |||    
T  28240429 tcg 28240431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29477258 - 29477176
Alignment:
Q  185 gatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattac 267  Q
    |||||||| |||| ||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||||||    
T  29477258 gatgatgtggacagactagagcaaatggaggctttggctggaggacttgattggtttggtcctggtagcagagttgtcattac 29477176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28297009 - 28296846
Alignment:
Q  109 taagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcag 208  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||| |||| ||     |||||||| || | |||||||| ||||||||| |  ||||| ||||     
T  28297009 taagttaggagatgtcaacgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctagatgatgttcatgaactgaagcaa 28296910  T
Q  209 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactc 272  Q
     |  | | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  28296909 ttgcaagttttggctggacgacttgattggtttggtcttggaagtaaagtgatcattaccactc 28296846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 272
Target Start/End: Original strand, 28515064 - 28515227
Alignment:
Q  109 taagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcag 208  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||| |||| ||     |||||||| || | |||||||| ||||||||| |  ||||| ||||     
T  28515064 taagttaggagatgtcaacgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctagatgatgttcatgaactgaagcaa 28515163  T
Q  209 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactc 272  Q
     |  | | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  28515164 ttgcaagttttggctggacgacttgattggtttggtcttggaagtaaagtgatcattaccactc 28515227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27664348 - 27664310
Alignment:
Q  235 ttggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcg 273  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27664348 ttggttcggtcaaggaagcagagtcatcattaccactcg 27664310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 441
Target Start/End: Original strand, 28140710 - 28140780
Alignment:
Q  371 tttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
    ||||||||| | ||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28140710 tttaaaaataataaagttgattcaagttatgagcacattttaaaccgtgcagttacttatgcctctggcct 28140780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 273
Target Start/End: Original strand, 28243778 - 28243872
Alignment:
Q  179 attcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcg 273  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||  |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  28243778 attctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttagctggaggacttgattggttcggtcctggtagtagagtgatcgttaccactcg 28243872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28490771 - 28490661
Alignment:
Q  163 aaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatc 262  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||  | |||||| ||   | |||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  28490771 aaagaagattcttttgcttctagatgatgttgacaatttggagcaattagaggccattgctggaagatccgtttggtttggtccaggaagtagagtcatc 28490672  T
Q  263 attaccactcg 273  Q
    ||||| |||||    
T  28490671 attacgactcg 28490661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 273
Target Start/End: Original strand, 29469086 - 29469196
Alignment:
Q  163 aaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatc 262  Q
    ||||||| |||||||| |||| || |||||||||||   ||||||  |||||||| | |||||| ||  ||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  29469086 aaagaaggttcttttgcttctagacgatgttgacaaggaggagcaattagaggctattgctggaagatctgattggtttggtcgtggcagtagagtcatc 29469185  T
Q  263 attaccactcg 273  Q
    || ||||||||    
T  29469186 atcaccactcg 29469196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29803181 - 29803071
Alignment:
Q  163 aaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatc 262  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||  | |||||| ||   | |||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  29803181 aaagaagattcttttgcttctagatgatgttgacaatttggagcaattagaggccattgctggaagatccgtttggtttggtccaggaagtagagtcatc 29803082  T
Q  263 attaccactcg 273  Q
    ||||| |||||    
T  29803081 attacgactcg 29803071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Original strand, 2185738 - 2185870
Alignment:
Q  108 ataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctaga-aagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagc 206  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||| | | | |||||| || | ||||||||||||||||||||| |||  || |    
T  2185738 ataagctaggacatgtcagtgagggaattcaattcataaaggaaagacta-caacagaagaaggttttgttgattcttgatgatgttgaccaaccagacc 2185836  T
Q  207 agctagaggctttggctggaggacttgattggtt 240  Q
    ||||  |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  2185837 agctgaaggctttggctggagatcttaattggtt 2185870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Original strand, 29827009 - 29827063
Alignment:
Q  219 tggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcg 273  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  29827009 tggcgggaggacttgattggtttggtcctggcagcatagtgatcattaccactcg 29827063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 332 - 388
Target Start/End: Original strand, 28186530 - 28186586
Alignment:
Q  332 aatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagtt 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||| ||||||||    
T  28186530 aatgagaaagaagctcttgaattgttgacgtggaaggctttaaaaaataacaaagtt 28186586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28127052 - 28126604
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |  |||| ||||||| ||||| ||   ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||  |    
T  28127052 tcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgagagagatttcaactccatataatttgaaacatctccaagaaaagctccttttgaaaacagttgga 28126953  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28126952 ttggacattaagttaggaggtgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtcgacaaac 28126853  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  28126852 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagagaaacacttactaacctgtcatgg 28126753  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    |||   |||||| ||||| ||| |||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28126752 gatagaaagtacgcatgcggtaaaagggttgtatgtaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttat 28126653  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    || ||  |||||||||| | |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  28126652 gatgatgttttaaaccgggcagtttcatatgcttcaggccttcccttag 28126604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 60 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28163693 - 28163305
Alignment:
Q  60 tgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatc 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| || | ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||      
T  28163693 tgaaacatctccaggaagagctctttttga-aacagttagatcggacattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctaca 28163595  T
Q  160 tagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtc 259  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28163594 tagaaataaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagggtc 28163495  T
Q  260 atcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttga 359  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||   |||||  ||| | |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  28163494 atcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcattcggtagaagggttgtatgggacggaagcgcttgaattgttga 28163395  T
Q  360 ggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
     | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  28163394 cgtggatggcttttaaaaataacaaagttccttcaagttatgaagatgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcaggccttcccttag 28163305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 120 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 267598 - 267277
Alignment:
Q  120 atgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggcttt 219  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  |  | ||  |  | |||||    
T  267598 atgttagtgagggcattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaacgatataaaacaattgcatgcttt 267499  T
Q  220 ggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||| || || || |||||| |||||||||||||   |||||| |||| |    
T  267498 ggctggaggacttgattggttcggctatggaagcagagtcgtcgttaccactcgagacaagcaattactaacctgtcatgggatagaaagtacgcatgaa 267399  T
Q  320 gtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtg 419  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||   |||||| |||| |||  | ||||||||||  ||||    
T  267398 gtagaagggttgtatgggaccgaagctcttgaattgttgagttggatggcttttaaaaatgatccagttccatcaatttacaatgagattttaattcgtg 267299  T
Q  420 tagttacttatgcatctggcct 441  Q
     |||| ||||||| ||||||||    
T  267298 cagttgcttatgcttctggcct 267277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 109 - 441
Target Start/End: Original strand, 60482 - 60814
Alignment:
Q  109 taagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcag 208  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||     
T  60482 taagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaa 60581  T
Q  209 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaa 308  Q
    ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||   ||    
T  60582 ctgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaa 60681  T
Q  309 gtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagat 408  Q
      ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60682 aaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaagat 60781  T
Q  409 tttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
    ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  60782 tttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggcct 60814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 109 - 441
Target Start/End: Original strand, 18074674 - 18075006
Alignment:
Q  109 taagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcag 208  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||     
T  18074674 taagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaa 18074773  T
Q  209 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaa 308  Q
    ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||   ||    
T  18074774 ctgaatgctttggctggaggagttgattggttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaa 18074873  T
Q  309 gtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagat 408  Q
      ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18074874 aaacatatgcagtaaaagggttgaatgtgacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaaaagat 18074973  T
Q  409 tttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
    ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18074974 tttgaatcgtgtagttgcttatgcttctggcct 18075006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 18654791 - 18654396
Alignment:
Q  60 tgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatc 159  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  | ||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||      
T  18654791 tgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctaca 18654692  T
Q  160 tagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtc 259  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| |  ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||     
T  18654691 tacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtggacaatttggaaccactgcatgctttggctggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagtt 18654592  T
Q  260 atcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttga 359  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||  |  ||||| |||   || ||  |||| |||| ||||| ||  |  |  | | ||||||||||||||||    
T  18654591 atcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttga 18654492  T
Q  360 ggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatag 455  Q
    || | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  18654491 ggtggatggcttttaaaatttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatag 18654396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18698758 - 18698324
Alignment:
Q  16 atgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagtta 115  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   ||| || |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |   | ||||   |||||||    
T  18698758 atgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagtta 18698659  T
Q  116 ggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagagg 215  Q
    |||| |||||||||||||||| |    || |||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||  | |    
T  18698658 ggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatg 18698559  T
Q  216 ctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacaca 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||| ||  ||||| |||   || ||  ||    
T  18698558 ctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatcca 18698459  T
Q  316 tgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaac 415  Q
    || |||| ||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18698458 tgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaagagatttttaac 18698359  T
Q  416 cgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagc 450  Q
    | || ||||   ||||| |||||||| || |||||    
T  18698358 catgcagttgtgtatgcttctggccttccattagc 18698324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18730862 - 18730428
Alignment:
Q  16 atgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagtta 115  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   ||| || |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |   | ||||   |||||||    
T  18730862 atgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagtta 18730763  T
Q  116 ggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagagg 215  Q
    |||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||  | |    
T  18730762 ggaggtgttagtgagggaattccctatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatg 18730663  T
Q  216 ctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacaca 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||||| ||  ||||| |||   || ||  ||    
T  18730662 ctttggctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcatagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatcca 18730563  T
Q  316 tgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaac 415  Q
    || |||| ||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18730562 tgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaagagatttttaac 18730463  T
Q  416 cgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagc 450  Q
    | || ||||   ||||| |||||||| || |||||    
T  18730462 catgcagttgtgtatgcttctggccttccattagc 18730428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 18678918 - 18678479
Alignment:
Q  16 atgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagtta 115  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   ||| || |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  | ||||   |||||||    
T  18678918 atgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagtta 18678819  T
Q  116 ggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagagg 215  Q
    |||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||| || ||  | |    
T  18678818 ggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtgcacaatttggaacaactgcatg 18678719  T
Q  216 ctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacaca 315  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||  |  ||||| |||   || ||  ||    
T  18678718 ctttggccggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgca 18678619  T
Q  316 tgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaac 415  Q
    || |||| ||||| ||  |  |  | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18678618 tgaagtaaaagggatgtctagggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaa 18678519  T
Q  416 cgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatag 455  Q
    |||| ||||   ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  18678518 cgtgcagttgtgtatgcttctggccttccattagctatag 18678479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 18723399 - 18723004
Alignment:
Q  60 tgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatc 159  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  | ||||   ||| ||||||| |||||||||| ||||| |    || ||| |||| |||      
T  18723399 tgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaacttaggaggtgttagtgagagaattccttatataaagaaaaggctaca 18723300  T
Q  160 tagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtc 259  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | || ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||     
T  18723299 tacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaaacaactgcatgctttggctggaggacctgattggttcggctctggaagcagagtt 18723200  T
Q  260 atcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttga 359  Q
    ||||||||||||||| | || || |||||| ||  ||||| | |   || ||  |||| |||| ||||| ||  |  |  | | ||||||||||||||||    
T  18723199 atcattaccactcgtaacaaacaattactaaccaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttga 18723100  T
Q  360 ggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttagcaatag 455  Q
    || | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  18723099 ggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgagcagttgcgtatgcttctggccttccattagctatag 18723004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 5090212 - 5089887
Alignment:
Q  116 ggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagagg 215  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||   ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | || ||| |||    
T  5090212 ggagatatcagtgagggaattccaatcataaagaaaaggctacaaagaaagaaagttcttttgattctcgatgatattgacaaactgaaacaactacagg 5090113  T
Q  216 ctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacaca 315  Q
     |||||| |||| || ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||   ||||||||||||   |  ||| |    
T  5090112 ttttggccggagaacctgattggtttggtcttggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaaaatgtcatgggattgatataacata 5090013  T
Q  316 tgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaac 415  Q
     | |||||| || || |||||||  ||||||||| |||| || ||| | | |||||||||||||   |  |||  | ||||||||||||  |||||||||    
T  5090012 cgaagtagatggtttaaatgagaacgaagctcttcaattattaaggtggaaggcttttaaaaatagtactgttaatccaagttatgaaggaattttaaac 5089913  T
Q  416 cgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||    
T  5089912 cgtgtggtaacttatgcttctggcct 5089887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 344 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18688656 - 18688581
Alignment:
Q  344 gctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtg 419  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18688656 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagattttaaaccgtg 18688581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2901 - 2476
Alignment:
Q  16 atgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa-ttgaaccataagtt 114  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||| |||   || |||||||||| |||| || || |||||   ||||||    
T  2901 atgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttcagttggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaat-taagtt 2803  T
Q  115 aggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagag 214  Q
     |||| |||||||||||||||| |    || |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |     
T  2802 tggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacat 2703  T
Q  215 gctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacac 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| | |||||  |    
T  2702 gctttggctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgc 2603  T
Q  315 atgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 414  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2602 atgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagattttaaa 2503  T
Q  415 ccgtgtagttacttatgcatctggcct 441  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  2502 ccgtgcagttgcatatgcttctggcct 2476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 29273215 - 29272767
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa 100  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||  |  |    
T  29273215 tcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactgga 29273116  T
Q  101 ttgaaccataagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaac 200  Q
    ||| |   ||||||||   ||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||      
T  29273115 ttggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaattataaaggagaggctaagtagaaagaaaattcttttgattctcgatgatgttgataatt 29273016  T
Q  201 tggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgg 300  Q
    || |||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||| | ||||||||    
T  29273015 tgaagcaactacatgctttggctggaggacatgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattactactcgagacaaacacttgctaacttgtcatgg 29272916  T
Q  301 gattacaagtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttat 400  Q
    ||| | |||||  |||| |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  29272915 gataaaaagtatgcatgaagtagaagggctgtatgggacaaaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaatttat 29272816  T
Q  401 gaagagattttaaaccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    |||||  ||||||| |||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  29272815 gaagacgttttaaatcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 29272767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Original strand, 35984274 - 35984376
Alignment:
Q  171 ttcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccac 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||| ||||||  |||||||| | |||  ||| |||||||| |||||||| ||    
T  35984274 ttcttttgattctagatgatgttgacaaaatagaacagctagaggccttggttggagggtttgattggcttggttctggcagcagagttatcattacaac 35984373  T
Q  271 tcg 273  Q
    |||    
T  35984374 tcg 35984376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 273
Target Start/End: Original strand, 12589639 - 12589749
Alignment:
Q  163 aaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatc 262  Q
    ||||||| |||||||| |||| || |||||||||||  |||||||  |||||||  | |||||| ||  || |||||| || || || ||||||||||||    
T  12589639 aaagaaggttcttttgcttctagacgatgttgacaatttggagcaattagaggccgttgctggaagatctgtttggtttggacaaggcagcagagtcatc 12589738  T
Q  263 attaccactcg 273  Q
    ||||| |||||    
T  12589739 attacgactcg 12589749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4074 - 3641
Alignment:
Q  16 atgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaa-ttgaaccataagtt 114  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || || |||||   ||||||    
T  4074 atgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaat-taagtt 3976  T
Q  115 aggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    || |||||||| ||   |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||| ||    
T  3975 aggaggtgttagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacag 3876  T
Q  215 gctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacac 314  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||    ||||||||||   |||||| |    
T  3875 gctttggcaggagaacctgattggtttggccttggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaagaagtcatgggatagaaagtacgc 3776  T
Q  315 atgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaa 414  Q
    ||| |||  ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  3775 atgaagtgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaa 3676  T
Q  415 ccgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
     |||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  3675 tcgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 3641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13037 - 12604
Alignment:
Q  16 atgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagtta 115  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||  |||   |||||||    
T  13037 atgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagtta 12938  T
Q  116 ggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagagg 215  Q
    |||  |||||||||||||||| |    || |||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  || |||| ||| | |    
T  12937 ggaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatg 12838  T
Q  216 ctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacaca 315  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||    |||||||||| | |||||| ||    
T  12837 ctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgca 12738  T
Q  316 tgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaac 415  Q
    || |||  ||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||     
T  12737 tgaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaat 12638  T
Q  416 cgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    |||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  12637 cgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 12604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 449
Target Start/End: Original strand, 8307 - 8740
Alignment:
Q  16 atgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataaactgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagtta 115  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||  |||   |||||||    
T  8307 atgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagtta 8406  T
Q  116 ggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagagg 215  Q
    |||  |||||||||||||||| |    || |||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  || |||| ||| | |    
T  8407 ggaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatg 8506  T
Q  216 ctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagtacaca 315  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||    |||||||||| | |||||| ||    
T  8507 ctttggcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgca 8606  T
Q  316 tgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagattttaaac 415  Q
    || |||  ||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||     
T  8607 tgaagtgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgttttaaat 8706  T
Q  416 cgtgtagttacttatgcatctggcctgcccttag 449  Q
    |||| |||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  8707 cgtgcagtttcatatgcttcgggccttcccttag 8740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 57563 - 57285
Alignment:
Q  109 taagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcag 208  Q
    |||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||| ||| |||| ||     |||||||| || | |||||||| ||||||||| || | ||| ||||     
T  57563 taagttagtagatgtcaacgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctcgatgatgttcacgagctgaagcaa 57464  T
Q  209 ctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaa 308  Q
     || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || | ||| |||||||||||||| ||  | || || |||||  |||||||||||  ||    
T  57463 ttacaggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggtagtaaagtgatcattaccactcgagacgaacaattgctagcaggtcatgggattgaaa 57364  T
Q  309 gtacacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagt 387  Q
    |  || ||| | ||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||||| |||||||    
T  57363 gagcatatgaaatagataagttaaatgagaaagaagctcttgaattgttgaggtggaatgctttcaaaaataacaaagt 57285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 361
Target Start/End: Original strand, 35642 - 35892
Alignment:
Q  111 agttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagct 210  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||| ||     |||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||  ||||  |    
T  35642 agttaggagatgtcaatgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaatt 35741  T
Q  211 agaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttactagcctgtcatgggattacaagt 310  Q
      ||| |||||| |||| | |||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||| || || || || |||||  |||||||||||  |||     
T  35742 gcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaaga 35841  T
Q  311 acacatgcagtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgagg 361  Q
    ||  | | | ||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35842 acgtacgaaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgttgagg 35892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 273
Target Start/End: Original strand, 28416 - 28527
Alignment:
Q  162 gaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcat 261  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||  |   || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| ||    
T  28416 gaaagaaagttctattgattctcgatgatgttcacaaactaaagcaattgcgggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgat 28515  T
Q  262 cattaccactcg 273  Q
    ||||||||||||    
T  28516 cattaccactcg 28527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Original strand, 40491 - 40593
Alignment:
Q  171 ttcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccac 270  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||  ||||| |||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  40491 ttcttttgattctagataatatggatgaactgaagcaactgcagggtttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccac 40590  T
Q  271 tcg 273  Q
    |||    
T  40591 tcg 40593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 273
Target Start/End: Original strand, 43940 - 44034
Alignment:
Q  179 attcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcg 273  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||  |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  43940 attctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttagctggaggacttgattggttcggtcctggtagtagagtgatcgttaccactcg 44034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 289
Target Start/End: Original strand, 16691904 - 16691960
Alignment:
Q  233 gattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaccacttacta 289  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  16691904 gattggtttggtcctggaagtagagtcatcattaccactcgagacaaacacttacta 16691960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3468329 - 3468258
Alignment:
Q  173 cttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggctttggctggaggacttgattggttcggt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  | || || || ||||||| |||||||||||||    
T  3468329 cttttgattcttgatgatgttgacaaattggaacagattcaagcattagccggaggacgtgattggttcggt 3468258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 3280464 - 3280509
Alignment:
Q  1 tcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 46  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  3280464 tcaatttgaatgtgtatgttttcttcacaatgtgagagaaaattca 3280509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 7687 times since January 2019
Visitors: 7737