View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1373_high_14 (Length: 356)

Name: NF1373_high_14
Description: NF1373
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1373_high_14
NF1373_high_14
[»] chr3 (91 HSPs)
chr3 (14-246)||(44927470-44927702)
chr3 (14-246)||(13895850-13896082)
chr3 (23-246)||(19453209-19453432)
chr3 (14-227)||(34472075-34472288)
chr3 (14-227)||(51013277-51013490)
chr3 (14-246)||(34693270-34693502)
chr3 (14-227)||(55206883-55207096)
chr3 (14-246)||(2646856-2647088)
chr3 (14-227)||(34647266-34647479)
chr3 (14-227)||(46414333-46414546)
chr3 (14-227)||(51015284-51015497)
chr3 (14-246)||(24702252-24702483)
chr3 (14-246)||(39416928-39417160)
chr3 (23-227)||(41577922-41578126)
chr3 (14-227)||(30192545-30192758)
chr3 (14-246)||(2268474-2268706)
chr3 (14-246)||(3495009-3495241)
chr3 (14-246)||(4004067-4004299)
chr3 (14-227)||(2428494-2428707)
chr3 (14-246)||(36135015-36135246)
chr3 (14-246)||(46403010-46403242)
chr3 (14-246)||(49140034-49140266)
chr3 (14-246)||(49610496-49610728)
chr3 (14-246)||(54390449-54390681)
chr3 (14-227)||(41803909-41804122)
chr3 (14-227)||(45100464-45100677)
chr3 (14-246)||(25576572-25576803)
chr3 (14-246)||(34049734-34049966)
chr3 (14-246)||(47065694-47065926)
chr3 (14-246)||(48087532-48087764)
chr3 (14-246)||(51695586-51695818)
chr3 (14-246)||(53826676-53826908)
chr3 (24-246)||(42950000-42950222)
chr3 (14-222)||(43569917-43570125)
chr3 (14-227)||(10053274-10053483)
chr3 (14-227)||(14631452-14631665)
chr3 (34-227)||(37281479-37281672)
chr3 (14-227)||(47759890-47760103)
chr3 (14-246)||(43477064-43477296)
chr3 (14-246)||(49218716-49218948)
chr3 (37-227)||(7246124-7246314)
chr3 (23-229)||(42382287-42382493)
chr3 (72-246)||(50997453-50997627)
chr3 (37-227)||(52569408-52569597)
chr3 (14-225)||(36721390-36721601)
chr3 (23-246)||(42383067-42383290)
chr3 (14-227)||(49273406-49273619)
chr3 (14-226)||(6754211-6754423)
chr3 (15-226)||(6464345-6464556)
chr3 (50-227)||(42323388-42323565)
chr3 (14-246)||(44835467-44835699)
chr3 (14-227)||(8633358-8633571)
chr3 (14-227)||(50458690-50458903)
chr3 (14-227)||(33449150-33449351)
chr3 (14-227)||(7954210-7954424)
chr3 (42-227)||(774337-774522)
chr3 (14-227)||(27186955-27187168)
chr3 (106-226)||(46346612-46346732)
chr3 (31-227)||(20375881-20376077)
chr3 (235-317)||(43570659-43570741)
chr3 (14-227)||(14265415-14265625)
chr3 (40-226)||(25887611-25887796)
chr3 (241-317)||(46345950-46346026)
chr3 (235-317)||(30193329-30193411)
chr3 (235-317)||(45099813-45099895)
chr3 (235-317)||(46413659-46413741)
chr3 (235-317)||(49274201-49274283)
chr3 (135-233)||(18440873-18440971)
chr3 (135-233)||(19485947-19486045)
chr3 (235-317)||(10052724-10052806)
chr3 (235-317)||(41578704-41578785)
chr3 (14-101)||(15637031-15637118)
chr3 (235-290)||(7246892-7246947)
chr3 (235-285)||(13895256-13895306)
chr3 (259-317)||(14632258-14632316)
chr3 (235-285)||(41804701-41804751)
chr3 (257-314)||(34646566-34646623)
chr3 (235-289)||(2429286-2429340)
chr3 (235-285)||(44928259-44928309)
chr3 (235-285)||(55268431-55268481)
chr3 (264-317)||(34471429-34471482)
chr3 (264-317)||(42322751-42322804)
chr3 (264-317)||(51016082-51016135)
chr3 (14-64)||(11378906-11378956)
chr3 (235-285)||(19452517-19452567)
chr3 (264-317)||(27187883-27187936)
chr3 (14-59)||(46346747-46346792)
chr3 (273-317)||(14265743-14265787)
chr3 (273-317)||(25887058-25887102)
chr3 (14-54)||(42328288-42328328)
chr3 (241-285)||(51012657-51012701)
[»] chr2 (60 HSPs)
chr2 (14-227)||(35491632-35491845)
chr2 (14-227)||(27130505-27130718)
chr2 (14-226)||(10364634-10364846)
chr2 (14-227)||(19471630-19471843)
chr2 (14-227)||(34521680-34521893)
chr2 (14-246)||(5420466-5420698)
chr2 (16-246)||(10360176-10360406)
chr2 (14-227)||(37312491-37312704)
chr2 (14-246)||(3941734-3941966)
chr2 (14-246)||(42241076-42241308)
chr2 (14-227)||(41499090-41499303)
chr2 (14-242)||(12968283-12968511)
chr2 (14-246)||(16581819-16582053)
chr2 (9-227)||(2919361-2919579)
chr2 (14-227)||(6976835-6977046)
chr2 (14-246)||(3937041-3937273)
chr2 (14-246)||(17424786-17425018)
chr2 (14-246)||(29067726-29067958)
chr2 (14-246)||(43982853-43983085)
chr2 (23-246)||(42120018-42120241)
chr2 (14-246)||(29111155-29111387)
chr2 (14-246)||(39393888-39394120)
chr2 (34-246)||(22001851-22002063)
chr2 (14-227)||(33404012-33404225)
chr2 (14-246)||(22493268-22493500)
chr2 (23-246)||(29906588-29906811)
chr2 (14-246)||(32734644-32734876)
chr2 (14-219)||(6901963-6902168)
chr2 (71-227)||(40677371-40677527)
chr2 (14-227)||(20148115-20148328)
chr2 (14-227)||(17796103-17796313)
chr2 (14-170)||(39799895-39800051)
chr2 (35-159)||(18392055-18392179)
chr2 (37-145)||(34638985-34639093)
chr2 (235-317)||(24108137-24108219)
chr2 (15-135)||(16253474-16253594)
chr2 (241-317)||(23408506-23408582)
chr2 (235-317)||(19470964-19471046)
chr2 (235-317)||(43492238-43492320)
chr2 (167-227)||(43491600-43491660)
chr2 (251-317)||(17538283-17538349)
chr2 (154-246)||(18393486-18393578)
chr2 (123-227)||(27650423-27650527)
chr2 (264-317)||(10359553-10359606)
chr2 (235-289)||(10364057-10364111)
chr2 (235-285)||(35492375-35492425)
chr2 (248-317)||(2918708-2918777)
chr2 (264-317)||(34521096-34521149)
chr2 (120-172)||(17112399-17112451)
chr2 (14-81)||(31770360-31770427)
chr2 (235-285)||(5420927-5420977)
chr2 (235-285)||(16582610-16582660)
chr2 (274-317)||(40676761-40676804)
chr2 (165-227)||(15891643-15891705)
chr2 (165-227)||(16253603-16253665)
chr2 (165-227)||(31991932-31991994)
chr2 (268-317)||(37312008-37312057)
chr2 (14-56)||(27650603-27650645)
chr2 (14-75)||(40678763-40678824)
chr2 (206-246)||(39799846-39799886)
[»] chr1 (82 HSPs)
chr1 (14-246)||(35576332-35576564)
chr1 (14-246)||(12791254-12791486)
chr1 (34-246)||(49427400-49427612)
chr1 (14-227)||(14173758-14173971)
chr1 (14-227)||(36909554-36909767)
chr1 (14-246)||(13635278-13635510)
chr1 (14-246)||(39856887-39857119)
chr1 (14-228)||(35586928-35587142)
chr1 (14-246)||(21484624-21484856)
chr1 (14-246)||(39224178-39224410)
chr1 (14-227)||(6435765-6435978)
chr1 (14-219)||(24270371-24270576)
chr1 (14-227)||(38046434-38046647)
chr1 (14-246)||(29435966-29436198)
chr1 (14-246)||(29762202-29762434)
chr1 (14-227)||(13972917-13973130)
chr1 (14-227)||(17686361-17686574)
chr1 (37-246)||(27486671-27486880)
chr1 (22-246)||(3658474-3658698)
chr1 (14-246)||(42571757-42571989)
chr1 (14-246)||(51269795-51270027)
chr1 (14-244)||(44337302-44337532)
chr1 (25-227)||(49926380-49926582)
chr1 (14-246)||(45689114-45689344)
chr1 (14-227)||(49396697-49396910)
chr1 (34-246)||(19160330-19160542)
chr1 (11-231)||(48215188-48215408)
chr1 (14-227)||(18170018-18170231)
chr1 (14-227)||(23342634-23342847)
chr1 (14-246)||(44597694-44597926)
chr1 (14-246)||(48568385-48568617)
chr1 (5-227)||(35184954-35185177)
chr1 (23-246)||(47488018-47488241)
chr1 (14-246)||(49262969-49263201)
chr1 (14-246)||(50068240-50068472)
chr1 (14-227)||(17697039-17697252)
chr1 (51-227)||(37778109-37778285)
chr1 (14-246)||(27035299-27035531)
chr1 (43-246)||(46180261-46180465)
chr1 (14-215)||(35526189-35526390)
chr1 (14-220)||(18842432-18842638)
chr1 (14-246)||(30309813-30310039)
chr1 (14-233)||(13283698-13283917)
chr1 (14-245)||(41874866-41875097)
chr1 (14-227)||(41780686-41780899)
chr1 (18-227)||(5765203-5765412)
chr1 (14-227)||(17372720-17372933)
chr1 (24-227)||(24363800-24364003)
chr1 (14-181)||(49598921-49599087)
chr1 (14-227)||(16532090-16532303)
chr1 (31-184)||(16081295-16081448)
chr1 (145-244)||(29707524-29707623)
chr1 (137-227)||(40533286-40533376)
chr1 (67-152)||(13148365-13148450)
chr1 (235-317)||(23343425-23343507)
chr1 (242-317)||(13973716-13973791)
chr1 (235-317)||(35525536-35525618)
chr1 (241-317)||(14173097-14173173)
chr1 (235-317)||(49397429-49397511)
chr1 (253-318)||(49261045-49261110)
chr1 (235-317)||(17685698-17685780)
chr1 (250-313)||(35586266-35586329)
chr1 (247-317)||(15356156-15356225)
chr1 (14-81)||(16098078-16098145)
chr1 (267-317)||(6436529-6436579)
chr1 (259-317)||(12790622-12790680)
chr1 (259-317)||(36910359-36910417)
chr1 (259-317)||(40532754-40532812)
chr1 (258-314)||(42571134-42571190)
chr1 (259-317)||(35185782-35185840)
chr1 (275-317)||(46142794-46142836)
chr1 (235-285)||(49925752-49925802)
chr1 (201-246)||(49598872-49598917)
chr1 (194-246)||(22527680-22527732)
chr1 (123-210)||(19262430-19262517)
chr1 (14-124)||(14772644-14772754)
chr1 (235-285)||(29436754-29436804)
chr1 (14-207)||(48706929-48707131)
chr1 (259-315)||(17373280-17373336)
chr1 (242-285)||(51270620-51270665)
chr1 (280-317)||(37778951-37778988)
chr1 (285-317)||(18974144-18974176)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (14-246)||(2262-2494)
scaffold0589 (259-317)||(5083-5141)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (34-246)||(15032303-15032515)
chr8 (14-227)||(44943079-44943292)
chr8 (14-246)||(26452328-26452560)
chr8 (14-246)||(38033904-38034136)
chr8 (14-246)||(41275397-41275629)
chr8 (14-227)||(41856972-41857185)
chr8 (14-246)||(41363659-41363891)
chr8 (5-244)||(40415251-40415490)
chr8 (14-227)||(18440293-18440506)
chr8 (14-246)||(43693140-43693372)
chr8 (23-246)||(33799530-33799753)
chr8 (14-246)||(24861346-24861578)
chr8 (14-246)||(42168939-42169171)
chr8 (23-246)||(43638656-43638879)
chr8 (16-246)||(2416920-2417150)
chr8 (14-227)||(19242160-19242373)
chr8 (14-227)||(19315344-19315557)
chr8 (14-246)||(485237-485469)
chr8 (14-246)||(34614956-34615188)
chr8 (34-227)||(42603477-42603670)
chr8 (14-246)||(40414613-40414843)
chr8 (14-246)||(28706121-28706353)
chr8 (34-220)||(40702383-40702569)
chr8 (14-190)||(26484580-26484756)
chr8 (14-227)||(3589264-3589477)
chr8 (14-227)||(31171814-31172027)
chr8 (14-156)||(16575695-16575837)
chr8 (14-128)||(22548266-22548380)
chr8 (235-317)||(26487225-26487307)
chr8 (235-317)||(28167577-28167659)
chr8 (161-246)||(22549232-22549314)
chr8 (235-317)||(38033265-38033347)
chr8 (259-317)||(18439642-18439700)
chr8 (259-317)||(42168309-42168367)
chr8 (235-285)||(42604246-42604296)
chr8 (241-285)||(40703162-40703206)
chr8 (242-285)||(22549877-22549922)
chr8 (131-207)||(26140264-26140340)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (14-246)||(7212-7444)
chr5 (14-246)||(8537946-8538178)
chr5 (14-227)||(1400304-1400517)
chr5 (37-246)||(3601356-3601565)
chr5 (14-246)||(541618-541850)
chr5 (14-246)||(8576124-8576356)
chr5 (14-246)||(11346701-11346933)
chr5 (37-227)||(4724076-4724266)
chr5 (14-246)||(1971357-1971589)
chr5 (14-246)||(11027769-11028001)
chr5 (14-246)||(19036657-19036889)
chr5 (14-246)||(19400355-19400587)
chr5 (14-227)||(18308252-18308465)
chr5 (14-246)||(28880983-28881215)
chr5 (34-246)||(30709610-30709822)
chr5 (14-246)||(38854150-38854381)
chr5 (14-240)||(40009520-40009746)
chr5 (14-227)||(35565264-35565476)
chr5 (14-246)||(27661360-27661592)
chr5 (14-219)||(33370646-33370851)
chr5 (14-227)||(36350316-36350520)
chr5 (14-227)||(6793388-6793601)
chr5 (14-185)||(3169596-3169766)
chr5 (14-196)||(35927470-35927652)
chr5 (92-227)||(1694859-1694994)
chr5 (14-230)||(17366735-17366950)
chr5 (137-246)||(7082336-7082445)
chr5 (14-190)||(2599211-2599387)
chr5 (235-317)||(18309043-18309125)
chr5 (14-127)||(3458828-3458941)
chr5 (235-317)||(3602127-3602209)
chr5 (235-317)||(6792817-6792899)
chr5 (241-317)||(1972152-1972228)
chr5 (235-317)||(1399646-1399728)
chr5 (22-100)||(1693381-1693459)
chr5 (172-246)||(3458940-3459014)
chr5 (14-106)||(12742707-12742799)
chr5 (249-317)||(35566069-35566137)
chr5 (155-246)||(22283704-22283795)
chr5 (235-317)||(20196861-20196942)
chr5 (14-111)||(12805525-12805622)
chr5 (254-317)||(4723420-4723483)
chr5 (168-227)||(12742818-12742877)
chr5 (254-317)||(34683271-34683334)
chr5 (256-317)||(1695590-1695651)
chr5 (123-227)||(18920835-18920939)
chr5 (264-317)||(36349679-36349732)
chr5 (249-309)||(25498880-25498940)
chr5 (165-227)||(17195361-17195423)
chr5 (14-65)||(7082284-7082335)
chr5 (168-227)||(12805636-12805695)
chr5 (123-233)||(25360579-25360690)
chr5 (165-233)||(13131074-13131142)
[»] chr4 (82 HSPs)
chr4 (14-246)||(14330676-14330908)
chr4 (24-246)||(20778851-20779073)
chr4 (14-227)||(22436904-22437117)
chr4 (14-246)||(21017159-21017391)
chr4 (14-246)||(40353755-40353987)
chr4 (14-246)||(51428174-51428406)
chr4 (16-246)||(55796738-55796968)
chr4 (14-227)||(43889500-43889713)
chr4 (14-246)||(25762591-25762823)
chr4 (14-246)||(33163526-33163758)
chr4 (14-242)||(51027753-51027981)
chr4 (23-246)||(1226161-1226384)
chr4 (14-230)||(6282321-6282537)
chr4 (14-226)||(34153288-34153500)
chr4 (14-246)||(41794544-41794776)
chr4 (14-246)||(49063972-49064204)
chr4 (23-246)||(31824611-31824834)
chr4 (14-227)||(34529797-34530010)
chr4 (14-246)||(37866399-37866632)
chr4 (14-246)||(242398-242630)
chr4 (14-246)||(6177297-6177529)
chr4 (14-246)||(32937884-32938116)
chr4 (14-246)||(56138903-56139135)
chr4 (14-227)||(957456-957669)
chr4 (14-227)||(47657356-47657569)
chr4 (14-246)||(49094738-49094970)
chr4 (40-246)||(21711549-21711755)
chr4 (14-246)||(28082231-28082463)
chr4 (14-246)||(39588922-39589154)
chr4 (41-246)||(1042769-1042974)
chr4 (14-227)||(26591686-26591899)
chr4 (14-227)||(36776520-36776733)
chr4 (14-227)||(49791937-49792150)
chr4 (14-227)||(49817645-49817858)
chr4 (14-246)||(20901650-20901882)
chr4 (14-246)||(45939518-45939750)
chr4 (14-224)||(2773002-2773212)
chr4 (14-227)||(21169444-21169657)
chr4 (14-246)||(9489672-9489903)
chr4 (14-227)||(44560181-44560394)
chr4 (14-246)||(46816507-46816737)
chr4 (14-227)||(49423759-49423972)
chr4 (68-244)||(27759374-27759550)
chr4 (14-227)||(17211259-17211472)
chr4 (14-226)||(11288288-11288499)
chr4 (14-219)||(3393297-3393502)
chr4 (14-227)||(4785423-4785636)
chr4 (14-227)||(24606745-24606958)
chr4 (14-227)||(42886256-42886472)
chr4 (14-227)||(10312265-10312478)
chr4 (14-227)||(18412588-18412801)
chr4 (14-219)||(31324167-31324372)
chr4 (14-227)||(13850742-13850955)
chr4 (14-227)||(13866256-13866469)
chr4 (241-317)||(25763359-25763435)
chr4 (235-317)||(49423097-49423179)
chr4 (235-317)||(21170235-21170317)
chr4 (235-317)||(34152627-34152709)
chr4 (235-317)||(36775859-36775941)
chr4 (249-317)||(44559668-44559736)
chr4 (235-314)||(956798-956877)
chr4 (235-317)||(20901048-20901130)
chr4 (14-106)||(21412647-21412739)
chr4 (235-317)||(51027160-51027242)
chr4 (258-317)||(49571907-49571966)
chr4 (254-317)||(2773808-2773871)
chr4 (258-317)||(45940321-45940380)
chr4 (259-317)||(51427542-51427600)
chr4 (264-317)||(43888856-43888909)
chr4 (252-317)||(47870854-47870918)
chr4 (259-317)||(42887079-42887137)
chr4 (259-317)||(49791286-49791344)
chr4 (165-226)||(17292106-17292167)
chr4 (142-227)||(49817198-49817283)
chr4 (259-317)||(4784721-4784779)
chr4 (235-285)||(6281877-6281927)
chr4 (235-285)||(37867276-37867326)
chr4 (256-285)||(9490291-9490320)
chr4 (273-318)||(13866713-13866758)
chr4 (280-317)||(17054795-17054832)
chr4 (273-317)||(9718031-9718075)
chr4 (273-317)||(10315261-10315305)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (14-227)||(21187298-21187511)
chr7 (34-227)||(41048798-41048991)
chr7 (14-227)||(48270643-48270856)
chr7 (14-246)||(34140860-34141092)
chr7 (23-227)||(48315179-48315383)
chr7 (14-227)||(36393823-36394036)
chr7 (26-246)||(18237571-18237791)
chr7 (14-246)||(20564754-20564986)
chr7 (14-246)||(30360512-30360743)
chr7 (16-246)||(39477220-39477450)
chr7 (14-246)||(17839318-17839551)
chr7 (14-224)||(46862196-46862406)
chr7 (14-246)||(17183207-17183442)
chr7 (14-227)||(43351099-43351311)
chr7 (14-246)||(20378683-20378915)
chr7 (14-246)||(40588544-40588776)
chr7 (34-227)||(30354814-30355007)
chr7 (14-227)||(42735258-42735470)
chr7 (14-227)||(15337904-15338117)
chr7 (14-246)||(41217609-41217841)
chr7 (14-246)||(47268894-47269125)
chr7 (23-246)||(48220724-48220945)
chr7 (14-227)||(21614759-21614972)
chr7 (18-207)||(28114412-28114601)
chr7 (14-246)||(10523063-10523296)
chr7 (14-227)||(2356284-2356497)
chr7 (14-230)||(21650519-21650735)
chr7 (14-188)||(28979060-28979234)
chr7 (14-227)||(1642586-1642799)
chr7 (14-246)||(45363232-45363455)
chr7 (14-166)||(26603265-26603417)
chr7 (103-246)||(9367100-9367243)
chr7 (111-246)||(2206017-2206152)
chr7 (241-317)||(22291621-22291697)
chr7 (14-135)||(13916828-13916949)
chr7 (165-246)||(26601758-26601839)
chr7 (147-246)||(13920434-13920533)
chr7 (235-317)||(41622865-41622947)
chr7 (235-317)||(46861537-46861619)
chr7 (14-115)||(42682951-42683052)
chr7 (235-317)||(10224853-10224935)
chr7 (247-317)||(48271447-48271517)
chr7 (155-246)||(17320181-17320272)
chr7 (235-317)||(21186637-21186717)
chr7 (235-317)||(36393163-36393245)
chr7 (185-246)||(34139332-34139393)
chr7 (123-227)||(28066359-28066463)
chr7 (259-317)||(42683211-42683269)
chr7 (235-285)||(43350756-43350806)
chr7 (165-227)||(11824839-11824901)
chr7 (264-317)||(42735777-42735830)
chr7 (259-314)||(28113745-28113800)
chr7 (259-317)||(20877400-20877458)
chr7 (14-107)||(8726337-8726430)
chr7 (130-221)||(18149638-18149729)
chr7 (213-246)||(28979032-28979065)
chr7 (123-227)||(150192-150296)
chr7 (130-210)||(12083042-12083122)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (14-246)||(1785-2017)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (14-246)||(801163-801394)
chr6 (14-246)||(11692448-11692680)
chr6 (14-227)||(13402530-13402743)
chr6 (14-227)||(32027627-32027840)
chr6 (14-227)||(32037686-32037899)
chr6 (14-246)||(6205481-6205713)
chr6 (14-246)||(27640177-27640409)
chr6 (14-246)||(29066550-29066782)
chr6 (14-246)||(29075563-29075795)
chr6 (14-246)||(29108137-29108369)
chr6 (14-227)||(34802895-34803108)
chr6 (37-246)||(29110558-29110767)
chr6 (31-246)||(35058715-35058930)
chr6 (14-227)||(14115034-14115247)
chr6 (14-201)||(22305793-22305980)
chr6 (34-227)||(12396793-12396986)
chr6 (76-227)||(30257578-30257729)
chr6 (147-246)||(3765767-3765867)
chr6 (155-246)||(24021077-24021168)
chr6 (235-317)||(12397565-12397647)
chr6 (155-246)||(2192535-2192626)
chr6 (241-317)||(32026966-32027042)
chr6 (241-317)||(32037025-32037101)
chr6 (235-317)||(4495670-4495752)
chr6 (264-317)||(13403623-13403676)
chr6 (249-317)||(13617242-13617310)
chr6 (179-226)||(35021237-35021284)
chr6 (235-285)||(35020607-35020657)
chr6 (264-317)||(30256936-30256989)
chr6 (147-233)||(17465328-17465414)
chr6 (264-317)||(7821390-7821443)
chr6 (259-311)||(34802536-34802588)
chr6 (123-189)||(2402306-2402372)
chr6 (14-124)||(28051355-28051465)
chr6 (167-227)||(34134801-34134861)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (23-244)||(17899-18119)
scaffold0192 (264-317)||(17299-17352)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (14-190)||(24900-25076)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (14-139)||(63971-64095)
scaffold0004 (168-246)||(64098-64176)
[»] scaffold0618 (1 HSPs)
scaffold0618 (241-317)||(4907-4983)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (155-246)||(85462-85553)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (155-246)||(14604-14695)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (123-220)||(5453-5550)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (130-215)||(36775-36860)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (273-317)||(107847-107891)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 91)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 44927470 - 44927702
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44927470 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 44927569  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44927570 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 44927669  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44927670 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 44927702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13896082 - 13895850
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13896082 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtg 13895983  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13895982 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgctag 13895883  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13895882 aagatcgtcattagttaaggtaaggtgcattcc 13895850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19453432 - 19453209
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453432 gagggtggaacacgttcgatataaacgtccaatgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 19453333  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  19453332 ttatgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcatc 19453233  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  19453232 attagttagggtaaggtgcattcc 19453209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34472288 - 34472075
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34472288 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34472189  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34472188 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttttattccgccag 34472089  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  34472088 aagatcgtcattag 34472075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51013490 - 51013277
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013490 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 51013391  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51013390 acgagcatgttttgggaacacaacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 51013291  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  51013290 aagatcgtcattag 51013277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34693502 - 34693270
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34693502 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagggttgagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 34693403  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  34693402 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaactttgattccgccag 34693303  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34693302 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 34693270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 55207096 - 55206883
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55207096 agacagaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 55206997  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55206996 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 55206897  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  55206896 aagatcgtcattag 55206883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2647088 - 2646856
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2647088 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2646989  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2646988 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctag 2646889  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2646888 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 2646856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34647479 - 34647266
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34647479 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34647380  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34647379 acgagcatgtttcgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgctag 34647280  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  34647279 aagatcgtcattag 34647266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46414546 - 46414333
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46414546 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 46414447  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46414446 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 46414347  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  46414346 aagatcgtcattag 46414333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 51015284 - 51015497
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015284 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagtgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 51015383  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51015384 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggaaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 51015483  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  51015484 aagatcgtcattag 51015497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24702483 - 24702252
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24702483 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaatta-cgaacgacgaaaacgtg 24702385  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  24702384 acggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgccag 24702285  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24702284 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 24702252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39417160 - 39416928
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39417160 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 39417061  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||    
T  39417060 atgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgatttcgccag 39416961  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39416960 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 39416928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Original strand, 41577922 - 41578126
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41577922 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 41578021  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41578022 ttttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcatc 41578121  T
Q  223 attag 227  Q
    |||||    
T  41578122 attag 41578126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 30192545 - 30192758
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30192545 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 30192644  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
     | ||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30192645 tctagcatgttttgggagtacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 30192744  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  30192745 aagatcgtcattag 30192758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2268706 - 2268474
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2268706 agacacaaggatggtggaacaagtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2268607  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2268606 acgggcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 2268507  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2268506 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 2268474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3495241 - 3495009
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3495241 agacacaaggatggtggaacacgtttgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 3495142  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3495141 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgtttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 3495042  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3495041 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 3495009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4004299 - 4004067
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4004299 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacgtgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtg 4004200  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4004199 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 4004100  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4004099 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 4004067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 2428494 - 2428707
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428494 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2428593  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2428594 acgaacatgttttgggagcacaacattttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctag 2428693  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  2428694 aagatcgtcattag 2428707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 36135015 - 36135246
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36135015 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgagggga-agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 36135113  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36135114 acgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 36135213  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  36135214 aagattgtcattagttagagtaagatgcattcc 36135246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 46403010 - 46403242
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46403010 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 46403109  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  46403110 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 46403209  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46403210 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 46403242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 49140266 - 49140034
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49140266 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 49140167  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  49140166 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 49140067  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49140066 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 49140034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 49610496 - 49610728
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49610496 agacacaaggagggtggaacaccttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 49610595  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  49610596 acgagcatgttttgggagcacagtatgttccagtgggtcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 49610695  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49610696 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 49610728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 54390449 - 54390681
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54390449 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 54390548  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  54390549 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 54390648  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54390649 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 54390681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 41803909 - 41804122
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41803909 agacaaaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 41804008  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  41804009 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagagtgacgttgatgagatcaaatgaagatataatcaaaagtttgattccgccag 41804108  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  41804109 aagatcgtcattag 41804122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45100677 - 45100464
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||    
T  45100677 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaatgtg 45100578  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  45100577 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 45100478  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    || |||||||||||    
T  45100477 aatatcgtcattag 45100464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25576803 - 25576572
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25576803 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagattatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 25576704  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||    
T  25576703 acgagcatgttttgggagcacagcatgttcc-atggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgtcag 25576605  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25576604 aagatcgtcattatttagggtaaggtgcattcc 25576572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 34049734 - 34049966
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34049734 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34049833  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  34049834 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 34049933  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34049934 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 34049966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 47065694 - 47065926
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||    
T  47065694 agacacaaggagggtggaatacgttcagtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgaggaaaatgtg 47065793  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||    
T  47065794 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgccag 47065893  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47065894 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 47065926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48087764 - 48087532
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48087764 agacacaaggatggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 48087665  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||    
T  48087664 acgagcatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccag 48087565  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48087564 aagatcgtcattaattagggtaaggtgcattcc 48087532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51695818 - 51695586
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51695818 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaaaagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaatacgtg 51695719  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  51695718 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 51695619  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  51695618 aagatcatcattagttagggtaaggtgcattcc 51695586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 53826908 - 53826676
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||    
T  53826908 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaatgtg 53826809  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  53826808 atgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 53826709  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53826708 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 53826676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42950222 - 42950000
Alignment:
Q  24 agggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  42950222 agggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagggaagagtatcattcacttggatggagttaaagaatgacgaaaacgtgacgagcatgt 42950123  T
Q  124 tttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtca 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||    
T  42950122 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggtttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 42950023  T
Q  224 ttagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  42950022 ttagttagggtaaggtgcattcc 42950000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 43569917 - 43570125
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43569917 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaactaacgaacgacgaaaacgtg 43570016  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  43570017 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccag 43570116  T
Q  214 aagatcgtc 222  Q
    |||||||||    
T  43570117 aagatcgtc 43570125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10053483 - 10053274
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10053483 agacacaaggagggtggaatacattcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 10053384  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  10053383 atgagcatgttttgggagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaa-atatcatcaaaagtttgattccgccag 10053288  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  10053287 aagatcgtcattag 10053274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 14631452 - 14631665
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14631452 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagtaaagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtg 14631551  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14631552 acgagcatgttttgggagcaaaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 14631651  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  14631652 aagatcgtcattag 14631665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 37281479 - 37281672
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37281479 acgttcggtataaacgtccaacactcgacgagggtagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 37281578  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37281579 caacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacggaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattag 37281672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47760103 - 47759890
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47760103 agacacaaggagggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 47760004  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47760003 acaaacatgttttgggaacacagcatgttccagtggatcgatgtacgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 47759904  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  47759903 aagatcgtcattag 47759890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 43477064 - 43477296
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43477064 agacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 43477163  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  43477164 acgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 43477263  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  43477264 aagatcgtcattaattagggtaatgtgcattcc 43477296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 49218948 - 49218716
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  49218948 agacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacaaacggcgaaaacgtg 49218849  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||    
T  49218848 acgaacatgttttgggagcgcaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacaacttgattccgccag 49218749  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  49218748 aagatcgtcattagttagggtaaagtgcattcc 49218716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Original strand, 7246124 - 7246314
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  7246124 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggattataa 7246223  T
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7246224 catgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 7246314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 42382287 - 42382493
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42382287 gagggtggactacgttcagtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg 42382386  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  42382387 ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgccagaagatcgtc 42382486  T
Q  223 attagtt 229  Q
    |||||||    
T  42382487 attagtt 42382493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 246
Target Start/End: Original strand, 50997453 - 50997627
Alignment:
Q  72 gtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  50997453 gtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgaagttgc 50997552  T
Q  172 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50997553 ttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 50997627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52569597 - 52569408
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52569597 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaa-gtgacgagcatgttttgggagcacaa 52569499  T
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52569498 catgttccggtgaatcgatatgcgggtgacattgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtttgattccgccagaagatcgtcattag 52569408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36721601 - 36721390
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  36721601 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgattggaataaacgaacgacgaaaacgtg 36721502  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36721501 acgagcaatgtttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 36721402  T
Q  214 aagatcgtcatt 225  Q
    ||||||||||||    
T  36721401 aagatcgtcatt 36721390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Original strand, 42383067 - 42383290
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42383067 gagggtggactacgttcagtataaacttccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg 42383166  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  42383167 ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgccagaagatcgtc 42383266  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||| |   ||||||||||||    
T  42383267 attagttgggacaaggtgcattcc 42383290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 49273406 - 49273619
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49273406 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgagggcagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtg 49273505  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||    
T  49273506 acgagcatgttctgggagcacaacatgttccagttgatcaatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattcttccag 49273605  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    || |||||||||||    
T  49273606 aatatcgtcattag 49273619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 6754211 - 6754423
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754211 agacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 6754310  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || ||    
T  6754311 acgatcatgttttgggagtacaacatgttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgctag 6754410  T
Q  214 aagatcgtcatta 226  Q
    |||||||| ||||    
T  6754411 aagatcgtgatta 6754423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6464556 - 6464345
Alignment:
Q  15 gacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtga 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6464556 gacacaaagagggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtga 6464457  T
Q  115 cgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgaga 214  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || |||    
T  6464456 caatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcaaga 6464357  T
Q  215 agatcgtcatta 226  Q
    ||||||| ||||    
T  6464356 agatcgtgatta 6464345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42323565 - 42323388
Alignment:
Q  50 tccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatgg 149  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||    
T  42323565 tccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagctcaaaatgtttcagtgg 42323466  T
Q  150 atcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  42323465 atcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccactggaagatcgtcattag 42323388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44835699 - 44835467
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44835699 agacgcaaggagggtggaatacgttcgatataaacattcaacgttcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 44835600  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||    
T  44835599 acgagcatgttttgggagcatagaatgttccagtggatggatatgcgggtaaggttgttgagatcaactgaaaatatcatcaacagcttgattccgtcag 44835500  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44835499 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 44835467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8633571 - 8633358
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8633571 agacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 8633472  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||  || ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  8633471 acgaatattttttgggatgacaacgtgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgcgatcatctgaagatattatcaacagtctgattccgccag 8633372  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  8633371 aagatcgtcattag 8633358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 50458903 - 50458690
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||  | ||| ||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  50458903 agacacaaggagggtgggacacggtcgatataagtgtccaacgctcgacgaggggagagtatcgtttaattgggtggaatctacgaacgacgaaaacttg 50458804  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  50458803 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatagatatgcgggtgacgttgttgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcctg 50458704  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  50458703 aagatcgtcattag 50458690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33449351 - 33449150
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33449351 agacacaaggagggtgaaatacgttcgatataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33449252  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33449251 aagaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgata------------tgctgagatcaactgaagatatcatccaaagtttgattccgccag 33449164  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  33449163 aagatcgtaattag 33449150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 7954210 - 7954424
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaagggg-agagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7954210 agacacaaggagggtggaatacgttcggcataaacgtccaacactcgatgagggggagggtatcatttagttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgt 7954309  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| |    
T  7954310 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaaagttgctaagatcaactgaagatattatcaacaatctgattccgcta 7954409  T
Q  213 gaagatcgtcattag 227  Q
    |||||||||||||||    
T  7954410 gaagatcgtcattag 7954424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 774522 - 774337
Alignment:
Q  42 tataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgt 141  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||  |||||    
T  774522 tataaacgtccaacgctcgacgacgggagaatatcattcagttggatggaattaacgaacgatgaaaacgtgaagaacatgttttcggagcactgcatgt 774423  T
Q  142 tccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  774422 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattccaccagaagatcgtgattag 774337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 27186955 - 27187168
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27186955 agacacaaggagggtggaatacgtttagtataaatgtccaatgctcgtagaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatg 27187054  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||| |     
T  27187055 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatctgattccgccat 27187154  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    || ||||| |||||    
T  27187155 aatatcgtgattag 27187168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46346732 - 46346612
Alignment:
Q  106 aaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46346732 aaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 46346633  T
Q  206 tccgcgagaagatcgtcatta 226  Q
    ||||| ||||||| |||||||    
T  46346632 tccgccagaagattgtcatta 46346612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20376077 - 20375881
Alignment:
Q  31 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 130  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||| || | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  20376077 aatatgttcggtataaacgtctaatgctcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgaggagtatgttttgaga 20375978  T
Q  131 gcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||  | |||  |||||||||||| | || ||||| |||||    
T  20375977 gcacaacatgttcaagtagatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaatttaagataataacaactgtttgattccgccaaaatatcgtgattag 20375881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 43570659 - 43570741
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43570659 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 43570741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 14265415 - 14265625
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||| || || | ||| || ||||||||| |||| || |||||| |||||||||   ||||    
T  14265415 agacacaaggaaggtggaatacgttcggtataaacatccaacgttcgacgatgggtgaatatcattcagttggatgaaattaaggaacgacga---cgtg 14265511  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| || | || ||||| ||||||| |||| |||||||  || | |||||||||||||  |    
T  14265512 acgaacatgttttgggaccacaacatgttaccgtggatcgatttgtgtgtaacgttactgagattaactaaagatattctccagagtttgattccgcctg 14265611  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  14265612 aagatcgtgattag 14265625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25887796 - 25887611
Alignment:
Q  40 ggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 139  Q
    ||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||    
T  25887796 ggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcactcagttgggtggaattaacaaacgacgaggatgtgaggaccatgttttgggagcacaacat 25887697  T
Q  140 gttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcatta 226  Q
    ||||   |||||| ||||| | |  |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  25887696 gttctcgtggatc-atatgtgtggaacgttgttgagatcaactgaagatattctccacagtttgattccgctagaatatcgtgatta 25887611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 46346026 - 46345950
Alignment:
Q  241 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46346026 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaataagcataatacattttgttttgaa 46345950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 30193329 - 30193411
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30193329 aaggtacattccggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatacataatacattttgttttgaa 30193411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 45099895 - 45099813
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  45099895 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacacgttgttttgaa 45099813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 46413741 - 46413659
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46413741 aaggtacattccgtaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 46413659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 49274201 - 49274283
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49274201 aaggtacattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 49274283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Original strand, 18440873 - 18440971
Alignment:
Q  135 aacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  18440873 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagag 18440971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Original strand, 19485947 - 19486045
Alignment:
Q  135 aacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  19485947 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagag 19486045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10052806 - 10052724
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10052806 aaggtacattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatgtatagttgaatgtgcataatacattttgttttgaa 10052724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 41578704 - 41578785
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41578704 aaggtacattctggaatgtaatgtaatgctatg-aatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 41578785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Original strand, 15637031 - 15637118
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaac 101  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15637031 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacactcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaac 15637118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 290
Target Start/End: Original strand, 7246892 - 7246947
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagtta 290  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7246892 aaggtacattccgaaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagtta 7246947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13895306 - 13895256
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13895306 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatatgataacatatat 13895256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Original strand, 14632258 - 14632316
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14632258 aatgtaatgtaatgtgataacgtatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 14632316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Original strand, 41804701 - 41804751
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41804701 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 41804751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34646623 - 34646566
Alignment:
Q  257 gtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgtttt 314  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34646623 gtaatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgtttt 34646566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 289
Target Start/End: Original strand, 2429286 - 2429340
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagtt 289  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2429286 aaggtacattccagaatgtaatgtaatgcaatgtgatgtgataacatatatagtt 2429340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Original strand, 44928259 - 44928309
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44928259 aaggtacatttcggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 44928309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 55268481 - 55268431
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  55268481 aaggtacattccggaatgtaatttaatgcaatgtaatgtgataacatatat 55268431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34471482 - 34471429
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  34471482 aatgtaatgtgataacatatacagttgaatatgcgtaatacattttgttttgaa 34471429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 42322804 - 42322751
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42322804 aatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcatgatacatgttgttttgaa 42322751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Original strand, 51016082 - 51016135
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  51016082 aatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacaagttgttttgaa 51016135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11378956 - 11378906
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaa 64  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11378956 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 11378906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19452567 - 19452517
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19452567 aaggtacattctagaatataatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 19452517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Original strand, 27187883 - 27187936
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | | | |||||||||| ||||||||||    
T  27187883 aatgtaatgtgataacatatatagttgattctacataatacatgttgttttgaa 27187936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 46346792 - 46346747
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctc 59  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  46346792 agacacaaggagggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctc 46346747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 317
Target Start/End: Original strand, 14265743 - 14265787
Alignment:
Q  273 tgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  14265743 tgataacatatatagttgattctgcataatacatgttgttttgaa 14265787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25887102 - 25887058
Alignment:
Q  273 tgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  25887102 tgataacatatatagttgattttgcataatacatgttgttttgaa 25887058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 42328328 - 42328288
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaa 54  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42328328 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaa 42328288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51012701 - 51012657
Alignment:
Q  241 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  51012701 catttcggaatgtaatgtaatgcaatgcaatgtaataacatatat 51012657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 35491632 - 35491845
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35491632 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 35491731  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35491732 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 35491831  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  35491832 aagatcgtcattag 35491845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27130718 - 27130505
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130718 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 27130619  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27130618 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 27130519  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||| ||||||||    
T  27130518 aagatagtcattag 27130505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10364846 - 10364634
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10364846 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 10364747  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10364746 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 10364647  T
Q  214 aagatcgtcatta 226  Q
    |||||||||||||    
T  10364646 aagatcgtcatta 10364634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19471843 - 19471630
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471843 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 19471744  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19471743 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 19471644  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  19471643 aagatcgtcattag 19471630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34521893 - 34521680
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34521893 agacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtcaaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34521794  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |     
T  34521793 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccctcat 34521694  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  34521693 aagatcgtcattag 34521680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 5420466 - 5420698
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5420466 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 5420565  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  5420566 acgaacatgttttgtgagcacagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgatatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccacctg 5420665  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5420666 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 5420698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10360406 - 10360176
Alignment:
Q  16 acacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 115  Q
    |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10360406 acacaaggagggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgac 10360307  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||    
T  10360306 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactgaagatttcatcaacagcttgattccgccagaa 10360207  T
Q  216 gatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10360206 gatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 10360176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37312704 - 37312491
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37312704 agacacaaggaggatggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagattatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 37312605  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  37312604 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 37312505  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  37312504 aagatcgtcattag 37312491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 3941734 - 3941966
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3941734 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 3941833  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  3941834 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 3941933  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3941934 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 3941966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42241308 - 42241076
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42241308 agacacaaggagggtgaaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacaacgaaaacgtg 42241209  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |     
T  42241208 acgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaccaaaagtttgattctgccat 42241109  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42241108 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 42241076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41499303 - 41499090
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41499303 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 41499204  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41499203 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 41499104  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  41499103 aagatcgtcattag 41499090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12968511 - 12968283
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  12968511 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtt 12968412  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  12968411 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccag 12968312  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgca 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12968311 aagatcgtcattagttagggtaaggtgca 12968283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 16581819 - 16582053
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  16581819 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaatgtg 16581918  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatc--gatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcg 211  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16581919 tcgagcatgttttgggagcacatcatgttccattggatcgagatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgct 16582018  T
Q  212 agaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16582019 agaagatcttcattagttagggtaaggtgcattcc 16582053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2919579 - 2919361
Alignment:
Q  9 accacagacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaa 108  Q
    |||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2919579 accagagacacaaggagggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaa 2919480  T
Q  109 acgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2919479 acgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaaaagtttgattcc 2919380  T
Q  209 gcgagaagatcgtcattag 227  Q
    || | ||||||||||||||    
T  2919379 gccaaaagatcgtcattag 2919361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 6976835 - 6977046
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6976835 agacacaaggagggtggaacatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagg--agtgtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtg 6976932  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976933 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 6977032  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  6977033 aagatcgtcattag 6977046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3937273 - 3937041
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3937273 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 3937174  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  3937173 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 3937074  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937073 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 3937041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 17424786 - 17425018
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17424786 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 17424885  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  17424886 acgaccatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 17424985  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17424986 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 17425018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 29067726 - 29067958
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  29067726 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtgcaattaacgaatgacgaaaatgtg 29067825  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29067826 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 29067925  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29067926 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 29067958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 43982853 - 43983085
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43982853 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 43982952  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  43982953 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 43983052  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43983053 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 43983085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Original strand, 42120018 - 42120241
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42120018 gagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatg 42120117  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  42120118 ttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtc 42120217  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  42120218 attagttagggtaaggtgcattcc 42120241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 29111155 - 29111387
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29111155 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 29111254  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  29111255 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaccgaagatatcatcaaaaatttaattccgccag 29111354  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    || | ||||| ||| ||| |||| |||||||||    
T  29111355 aataacgtcactaggtagggtaaagtgcattcc 29111387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 39393888 - 39394120
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39393888 agacacaaggagggtgtaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaatcaacaaacgacgaaaacgtg 39393987  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||  ||    
T  39393988 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgtcag 39394087  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39394088 aagatcgtcattagttaggataaggtgcattcc 39394120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 22001851 - 22002063
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22001851 acgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggaggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagct 22001950  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |    
T  22001951 cagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattagttattg 22002050  T
Q  234 taaggtgcattcc 246  Q
    |||| ||||||||    
T  22002051 taagttgcattcc 22002063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 33404012 - 33404225
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33404012 agacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaatagtatcattcagttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33404111  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||| ||    
T  33404112 acgagcatgttttgggagcacaagatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatgtcgccag 33404211  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  33404212 aagatcgtgattag 33404225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 22493268 - 22493500
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  22493268 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacggcgaaaacgtg 22493367  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  22493368 acgagcatgttttgggagtacagaatgttccagtggattgatatgcgggtaacgttcctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccag 22493467  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22493468 aagatcgtcattagttagggtaagatgcattcc 22493500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Original strand, 29906588 - 29906811
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  29906588 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgtggggagagtatcattcacttgggtgaagttaaagaacgacgaaaacgtgacaaacatg 29906687  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| || ||||||||  |    
T  29906688 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattctgccagaagatcagc 29906787  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  29906788 attagttagggtaaggtgcattcc 29906811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 32734644 - 32734876
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||    
T  32734644 agacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaactacgaaaatgtg 32734743  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |     
T  32734744 acaagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgatatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccaa 32734843  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  32734844 aagatagtcattagttaaggtaaggtgcattcc 32734876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 6901963 - 6902168
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||  || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6901963 agacacaaggagggttgaacacattcggcataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 6902062  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  6902063 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtgaatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcgag 6902162  T
Q  214 aagatc 219  Q
    ||||||    
T  6902163 aagatc 6902168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40677527 - 40677371
Alignment:
Q  71 agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttg 170  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40677527 agtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacgacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttg 40677428  T
Q  171 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40677427 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattag 40677371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 20148115 - 20148328
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  20148115 agacacaaggagggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcatttagttggggggaattaaagaacgacgaaaacatg 20148214  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||    
T  20148215 actagcatgttttaggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtaacgttgctgagattagctgaagatattttcaacagtctgattccgccag 20148314  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  20148315 aagatcgtgattag 20148328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17796313 - 17796103
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||  ||||||| || |||||  |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17796313 agacacagggagggtggaacacgttaagtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 17796214  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  17796213 aagagcatgttttgggagc---acatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttggttccgtcag 17796117  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||| ||||||||||    
T  17796116 aagctcgtcattag 17796103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39800051 - 39799895
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39800051 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 39799952  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttg 170  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39799951 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttg 39799895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Original strand, 18392055 - 18392179
Alignment:
Q  35 cgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392055 cgttcggtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcatttacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 18392154  T
Q  135 aacatgttccaatggatcgatatgc 159  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  18392155 atcatgttccagtggatcgatatgc 18392179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 145
Target Start/End: Original strand, 34638985 - 34639093
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34638985 ttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacag 34639084  T
Q  137 catgttcca 145  Q
    |||||||||    
T  34639085 catgttcca 34639093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24108219 - 24108137
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24108219 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 24108137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 16253474 - 16253594
Alignment:
Q  15 gacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtga 114  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16253474 gacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgcccaacacttaacgatgggagaatatcattaagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtga 16253573  T
Q  115 cgagcatgttttgggagcaca 135  Q
      |||||||||||||||||||    
T  16253574 gcagcatgttttgggagcaca 16253594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Original strand, 23408506 - 23408582
Alignment:
Q  241 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23408506 catttcggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 23408582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19471046 - 19470964
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19471046 aaggtacattccggaatgtaatgtaaagcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataataaattttgttttgaa 19470964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 43492238 - 43492320
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43492238 aaggtacatttcagaatgtaatgtaatgcaatgtagtttgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 43492320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 227
Target Start/End: Original strand, 43491600 - 43491660
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43491600 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 43491660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17538349 - 17538283
Alignment:
Q  251 tgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17538349 tgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 17538283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 246
Target Start/End: Original strand, 18393486 - 18393578
Alignment:
Q  154 atatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18393486 atatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcataaacaacttgattctgccagaagatcgtcattagtgagggtaaggtgcattcc 18393578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27650527 - 27650423
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    |||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  27650527 ttttggcaacacaacatgttaccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtg 27650428  T
Q  223 attag 227  Q
    |||||    
T  27650427 attag 27650423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10359606 - 10359553
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10359606 aatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 10359553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10364111 - 10364057
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagtt 289  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10364111 aaggtacattccgaaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagtt 10364057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Original strand, 35492375 - 35492425
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35492375 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 35492425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2918777 - 2918708
Alignment:
Q  248 gaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2918777 gaatataatgtaaaacaatgcaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 2918708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34521149 - 34521096
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34521149 aatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 34521096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 172
Target Start/End: Original strand, 17112399 - 17112451
Alignment:
Q  120 atgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgct 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17112399 atgttttgggagcacaatatgttctaatggattgatatgcgggtgacgttgct 17112451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 31770360 - 31770427
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattca 81  Q
    |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  31770360 agacacaaggaggatgtaatatgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagagtatcattca 31770427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Original strand, 5420927 - 5420977
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5420927 aaggtacattccgaaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 5420977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Original strand, 16582610 - 16582660
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16582610 aaggtacattccgaaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 16582660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40676804 - 40676761
Alignment:
Q  274 gataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40676804 gataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 40676761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15891705 - 15891643
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  15891705 acgttgcggagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgctagaatatcgtgattag 15891643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 16253603 - 16253665
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  16253603 acgttgctgagatcaactaaagatattatcgacagtttgattccaccagaagatcgtgattag 16253665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31991994 - 31991932
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31991994 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattag 31991932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37312057 - 37312008
Alignment:
Q  268 taatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37312057 taatgtgataacatatatagttgaatatgcatgatacatgttgttttgaa 37312008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27650645 - 27650603
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacg 56  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  27650645 agacacaaagagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacg 27650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 40678824 - 40678763
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtat 75  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||    
T  40678824 agacacaaggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagagtat 40678763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39799886 - 39799846
Alignment:
Q  206 tccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  39799886 tccgccagaagatcgtcattagttagggtaatgtgcattcc 39799846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 82)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 35576332 - 35576564
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35576332 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 35576431  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35576432 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccggtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 35576531  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35576532 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 35576564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12791486 - 12791254
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12791486 agacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 12791387  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12791386 acgagcatttttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgtttttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 12791287  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12791286 aagatcgtcattagttaggataaggtgcattcc 12791254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 49427400 - 49427612
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49427400 acgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 49427499  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  49427500 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttaggg 49427599  T
Q  234 taaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||    
T  49427600 taaggtgcattcc 49427612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14173971 - 14173758
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14173971 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 14173872  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14173871 acgagcatgttttgggaggacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 14173772  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  14173771 aagatcgtcattag 14173758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 36909554 - 36909767
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909554 agacataaggagggtggaatacgttcggtgtaaacgtccaacgctcgacgagggaagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 36909653  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36909654 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 36909753  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  36909754 aagatcgtcattag 36909767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13635510 - 13635278
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13635510 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 13635411  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13635410 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 13635311  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13635310 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 13635278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39857119 - 39856887
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857119 agacacaagaagggtggaacatgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 39857020  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  39857019 acgatcatgttttgggagcacgacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 39856920  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39856919 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 39856887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35587142 - 35586928
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35587142 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 35587043  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35587042 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaccttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 35586943  T
Q  214 aagatcgtcattagt 228  Q
    |||||||||||||||    
T  35586942 aagatcgtcattagt 35586928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21484856 - 21484624
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21484856 agacacaaggagggtgaaacttgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 21484757  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  21484756 acgagcatgtttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcaccag 21484657  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21484656 aagatcgtcattaggtagggtaaggtgcattcc 21484624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39224410 - 39224178
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  39224410 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcaacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaatgacgaaaacgtg 39224311  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||| ||    
T  39224310 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaatatatcatcaacaacttgattccgccag 39224211  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39224210 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 39224178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 6435765 - 6435978
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6435765 agacacaaggagggtggaaaacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 6435864  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6435865 acgagcaagttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgagtgacgttgttgagatcaagtgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 6435964  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  6435965 aagatcgtcattag 6435978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24270576 - 24270371
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24270576 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 24270477  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24270476 acgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 24270377  T
Q  214 aagatc 219  Q
    ||||||    
T  24270376 aagatc 24270371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38046647 - 38046434
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38046647 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 38046548  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  38046547 acaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtcgatcaatatgccggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccag 38046448  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  38046447 aagatcgtcattag 38046434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 29435966 - 29436198
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29435966 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 29436065  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  || ||    
T  29436066 acgagcatgttttgggagtacagcatgttccagtggatcgatacgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattaagccag 29436165  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29436166 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 29436198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29762434 - 29762202
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29762434 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 29762335  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||    
T  29762334 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatacgggtgacgttgatgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattccgccag 29762235  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29762234 aagatcatcattagttagggtaaggtgcattcc 29762202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 13972917 - 13973130
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13972917 agacgcaaggagggtggaatacgttcagtataaacgtccaacactcgactaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 13973016  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  13973017 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtgacattgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 13973116  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  13973117 aagatcgtcattag 13973130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17686574 - 17686361
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17686574 agacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacgaaaacgtg 17686475  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17686474 aagagcatgttttgggagcacaacatcttccagtggatcgatatgcgggtgacgtagctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 17686375  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  17686374 aagatcgtcattag 17686361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27486880 - 27486671
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27486880 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttaattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 27486781  T
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaa 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  27486780 catgttccattggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcctgaagatcgtcattagttagggtaa 27486681  T
Q  237 ggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||    
T  27486680 ggtgcattcc 27486671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 246
Target Start/End: Original strand, 3658474 - 3658698
Alignment:
Q  22 agagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcat 121  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  3658474 agagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacgt 3658573  T
Q  122 gttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3658574 gttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcaagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgt 3658673  T
Q  222 cattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||    
T  3658674 cattaggtagggtaaggtgcattcc 3658698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42571989 - 42571757
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42571989 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 42571890  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  42571889 aagagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 42571790  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  42571789 aagatcgtcattacttaaggtaaggtgcattcc 42571757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 51269795 - 51270027
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51269795 agacacaaggagggtggaacaccttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 51269894  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  51269895 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgggatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 51269994  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51269995 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 51270027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 44337532 - 44337302
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44337532 agacacaaggatggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattcacaaacgacgaaaacgtg 44337433  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||    
T  44337432 acgagcatgttttgggtgcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaatatgattccgccag 44337333  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcatt 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44337332 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcatt 44337302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 49926582 - 49926380
Alignment:
Q  25 gggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtt 124  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49926582 gggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtgtcattcacttgtgcggaattaacgaacgacgaaaacgtgaggagcatgtt 49926483  T
Q  125 ttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcat 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49926482 ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcat 49926383  T
Q  225 tag 227  Q
    |||    
T  49926382 tag 49926380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 45689114 - 45689344
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| |||   |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45689114 agacacaaggagggtggaatatgtttggtt--aacgtccaacgctcgacggggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 45689211  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |     
T  45689212 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatggatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccat 45689311  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45689312 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 45689344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 49396697 - 49396910
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  49396697 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgatttacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacaacgaaaacgtg 49396796  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  49396797 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaacaaaagtttgattccgccag 49396896  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  49396897 aagatcgtcattag 49396910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 19160330 - 19160542
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  19160330 acgtttggtataaacgtccaacgcttgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgactatgttttgggaaca 19160429  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  19160430 cagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattagttaggg 19160529  T
Q  234 taaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||    
T  19160530 taaggtgcattcc 19160542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Original strand, 48215188 - 48215408
Alignment:
Q  11 cacagacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48215188 cacagacacaaggatggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaac 48215287  T
Q  111 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48215288 atgacgagcatatttttggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 48215387  T
Q  211 gagaagatcgtcattagttag 231  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  48215388 cagaagatagtcattagttag 48215408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 18170018 - 18170231
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18170018 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 18170117  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18170118 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgacattgctgagctcaactgaagatatcatcaaaggtttgattccgccag 18170217  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  18170218 aagatcgtcattag 18170231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 23342634 - 23342847
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23342634 agacacaaggaaggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaacgacgaaaacgtg 23342733  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23342734 acgagcatgtttttggagcacattatgttcgagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattcctccag 23342833  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  23342834 aagatcgtcattag 23342847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 44597694 - 44597926
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44597694 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 44597793  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |    
T  44597794 atgagtatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgtgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccgg 44597893  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44597894 aagatcgtcattagttagggtaaagtgcattcc 44597926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48568617 - 48568385
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  48568617 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaatgatgaaaacgtg 48568518  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||    
T  48568517 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccag 48568418  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  48568417 aagattgtcattagttagggtaaggtgcattcc 48568385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 35184954 - 35185177
Alignment:
Q  5 cagcaccacagacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgac 104  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35184954 cagccccaaagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgatggaattaacgaacgac 35185053  T
Q  105 gaaaacgtgacgagcatgtttt-gggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35185054 gaaaacgtgacgaacatgttttggggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgaaatcaattgaagatatcatcaaaagtttg 35185153  T
Q  204 attccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  35185154 attccgccagaagatcgtcattag 35185177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47488241 - 47488018
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47488241 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg 47488142  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    |||||||||||||| || ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||||    
T  47488141 ttttgggagcacaatattttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatgtcatcaacagcttgatttcgccagaagatcgtc 47488042  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||  ||||||||||||||    
T  47488041 attagttatggtaaggtgcattcc 47488018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 49263201 - 49262969
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  49263201 agacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacaaaagacgaaaacgtg 49263102  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  49263101 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatctatatgctggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacatcttgattcctctag 49263002  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  49263001 aatatcttcattagttatggtaaggtgcattcc 49262969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 50068472 - 50068240
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||| ||||||||| || ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||    
T  50068472 agacgcaaggagggtggaatatgttcggtatgaaggtccaacactcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggatttaaagaacgacaaaaatgtg 50068373  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||    
T  50068372 acgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcgtcaacagcttgattccgccag 50068273  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50068272 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 50068240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 17697039 - 17697252
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  17697039 agacataaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaatgctcgacaagggtagggtatcattcacttgggtggagttaaagtacgacgaaaacgtg 17697138  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  17697139 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgccag 17697238  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  17697239 aagatcgtgattag 17697252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Original strand, 37778109 - 37778285
Alignment:
Q  51 ccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatgga 150  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  37778109 ccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaggacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagaacaacatgttccagttga 37778208  T
Q  151 tcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37778209 tcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 37778285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27035531 - 27035299
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  27035531 agacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaacgctcgacgagggaagggtatcattcacttgggtggagttaaagaatgacgaaaacgtg 27035432  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  27035431 acgagtatgttttgggagaacaccatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaacaacttgattccaccag 27035332  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27035331 aagatcgtcattagttaggataaggtgcattcc 27035299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 46180465 - 46180261
Alignment:
Q  43 ataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcact-tgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgt 141  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46180465 ataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgt 46180366  T
Q  142 tccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgc 241  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46180365 tccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgc 46180266  T
Q  242 attcc 246  Q
    |||||    
T  46180265 attcc 46180261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35526390 - 35526189
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  35526390 agacacagggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgtcgaaaacgag 35526291  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35526290 acgaccatgttttgggagcacagaatgttgcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctag 35526191  T
Q  214 aa 215  Q
    ||    
T  35526190 aa 35526189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 18842432 - 18842638
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18842432 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 18842531  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||| ||    
T  18842532 acgagcatgttttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattgtcaagagtctgatcccgccag 18842631  T
Q  214 aagatcg 220  Q
    |||||||    
T  18842632 aagatcg 18842638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30310039 - 30309813
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30310039 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacggggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 30309940  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||    
T  30309939 acgagcatgttttgggagcacaggacgtttcagtggatcgatatgcgggtgac------gagatcaactgaatatatcatcaacagcttgattccgccag 30309846  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30309845 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 30309813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Original strand, 13283698 - 13283917
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  13283698 agacacgaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttagttgggtgaaattaacgaacgatgaaaacatg 13283797  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  13283798 acgagcatgttttgggagcgcagcatgttctagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacagtctgattccgccag 13283897  T
Q  214 aagatcgtcattagttagag 233  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  13283898 aagatcgtgattaggtagag 13283917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41875097 - 41874866
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||    
T  41875097 agacacaaggagggtggaattagttcggtatcaacgtccaatgctcgaagaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaataacgacgaaaatgtg 41874998  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |  |  |||||||||| ||    
T  41874997 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactaaagatatcattagcaacttgattccgccag 41874898  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattc 245  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41874897 aagatcgttattagttagggtaaggtgcattc 41874866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 41780686 - 41780899
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41780686 agacacaagaagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 41780785  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||  || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  41780786 acgaatatattttgggagcacagcatgttccagtagatagatatgcaggtgacgttgctaagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgatttcgccag 41780885  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||| ||||||||||    
T  41780886 aagttcgtcattag 41780899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Original strand, 5765203 - 5765412
Alignment:
Q  18 acaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacga 117  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  5765203 acaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacttgatga 5765302  T
Q  118 gcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaaga 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||    
T  5765303 gcatgttttgggagcagaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaatgaagatattatcaaccgtctgattccgccagaaga 5765402  T
Q  218 tcgtcattag 227  Q
    |||| |||||    
T  5765403 tcgtgattag 5765412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 17372720 - 17372933
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17372720 agacgcaaagagggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatataatccacttaggtggaattagcgaacgacgaaaatgtg 17372819  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||    
T  17372820 aagaacatgttttgggagcacaccatattccagtggatcgatatacgtgtaacgttgatgagatcaactgaagatatcatcgaaagtttaatttcgccag 17372919  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  17372920 aagatcgtcattag 17372933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24364003 - 24363800
Alignment:
Q  24 agggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  24364003 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcaatcacttgggtagaattaatgaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 24363904  T
Q  124 tttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtca 223  Q
    |||||| |||||  |||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |    
T  24363903 tttgggggcacagtatgttctagtggatcgatatgcggttaacgttgttgagagcaactgaagatattatcaagagtttgattccgttagaagatcgtga 24363804  T
Q  224 ttag 227  Q
    ||||    
T  24363803 ttag 24363800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 49599087 - 49598921
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  49599087 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggagttaaagaatgacgaaa-cgtg 49598989  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaac 181  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49598988 acaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaac 49598921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16532303 - 16532090
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16532303 agacacaaggaggatggaatacgttcgatataaacgtacaacgctcgatgaggagagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 16532204  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||| || |||||||| | |||| || ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||    
T  16532203 atgagcatattatgggagcagagcatgctctaatggattgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaatagtctgatttcgctag 16532104  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  16532103 aagatcgtgattag 16532090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 184
Target Start/End: Original strand, 16081295 - 16081448
Alignment:
Q  31 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 130  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||    
T  16081295 aatacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggaggatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacatgaggagcatgtttttgga 16081394  T
Q  131 gcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactga 184  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  16081395 gcacaacatgttctagttgatcgatatgcgtgtaacgttgctgcaatcaactga 16081448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29707623 - 29707524
Alignment:
Q  145 aatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcatt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  29707623 aatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcataagttagggcaaggtgcatt 29707524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40533376 - 40533286
Alignment:
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  40533376 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgccgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattag 40533286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 13148365 - 13148450
Alignment:
Q  67 ggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatc 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13148365 ggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgagagcacaacatgttccagtggatc 13148450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 23343425 - 23343507
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23343425 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 23343507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Original strand, 13973716 - 13973791
Alignment:
Q  242 attccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13973716 attccagaatgtaatataatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 13973791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35525618 - 35525536
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  35525618 aaggtacattccggaatgtaatgtaaagcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttattttgaa 35525536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14173173 - 14173097
Alignment:
Q  241 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14173173 cattctggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcatgatacatgttgttttgaa 14173097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 49397429 - 49397511
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  49397429 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatacatagttgaatatgaatagtacatgttgttttgaa 49397511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 49261110 - 49261045
Alignment:
Q  253 taatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaaa 318  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49261110 taatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaaa 49261045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17685780 - 17685698
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||    
T  17685780 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtgatgtgataacatatatagttgaatatgtacaaaacatattgttttgaa 17685698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35586329 - 35586266
Alignment:
Q  250 atgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttt 313  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  35586329 atgtaatgtaatgcaatgcaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttt 35586266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15356225 - 15356156
Alignment:
Q  247 ggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15356225 ggaatgtaatgtaatacaatgtaatt-gataacatatatagttgaatatgcataatatattttcttttgaa 15356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16098145 - 16098078
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattca 81  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  16098145 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca 16098078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 317
Target Start/End: Original strand, 6436529 - 6436579
Alignment:
Q  267 gtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6436529 gtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 6436579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12790680 - 12790622
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12790680 aatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 12790622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Original strand, 36910359 - 36910417
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36910359 aatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 36910417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40532812 - 40532754
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40532812 aatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 40532754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42571190 - 42571134
Alignment:
Q  258 taatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgtttt 314  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42571190 taatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatattgtttt 42571134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Original strand, 35185782 - 35185840
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35185782 aatgtaatgtaatgtgacaacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 35185840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 46142836 - 46142794
Alignment:
Q  275 ataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46142836 ataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 46142794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49925802 - 49925752
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49925802 aaggtacattccagaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 49925752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 49598917 - 49598872
Alignment:
Q  201 ttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49598917 ttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 49598872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 246
Target Start/End: Original strand, 22527680 - 22527732
Alignment:
Q  194 caaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22527680 caaaagtttgatttcgccagaagatcatcattagttagggtaaggtgcattcc 22527732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19262517 - 19262430
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    |||||| |||||| ||||||||   ||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  19262517 ttttggcagcacatcatgttcccgaggatcaatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgc 19262430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14772754 - 14772644
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  |||| |||||| |||| |||| | || | ||||||| |||||||||  | |||    
T  14772754 agacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacaacgggagaatatcgttcagtcggctagaattaaagaacgacgacgatgtg 14772655  T
Q  114 acgagcatgtt 124  Q
    | |||||||||    
T  14772654 aggagcatgtt 14772644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Original strand, 29436754 - 29436804
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29436754 aaggtacattctggaatgtgatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 29436804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48707131 - 48706929
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  | ||| |||||| |||||| |||| | || | ||||||| ||||||| |  || ||    
T  48707131 agacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccaacattgaacgaggggaaagtatcgttcagtcggctagaattaatgaacgacaacgacatg 48707032  T
Q  114 acgagcatgtt---------ttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttga 204  Q
    | ||| |||||         |||| ||||| || |||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  48707031 aagagtatgttctcgattttttggcagcaccacttgttcccatggatcgatatgtatgttacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaagagtttga 48706932  T
Q  205 ttc 207  Q
    |||    
T  48706931 ttc 48706929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 315
Target Start/End: Original strand, 17373280 - 17373336
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttg 315  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  17373280 aatgtaatgtaatgtgataacatatatagtagattatgcataatacatgttgttttg 17373336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 285
Target Start/End: Original strand, 51270620 - 51270665
Alignment:
Q  242 attccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  51270620 attccggaatgtaatgtgcaatgcaatgtaatgtgataacatatat 51270665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 317
Target Start/End: Original strand, 37778951 - 37778988
Alignment:
Q  280 atatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37778951 atatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 37778988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 317
Target Start/End: Original strand, 18974144 - 18974176
Alignment:
Q  285 tagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18974144 tagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 18974176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 2262 - 2494
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2361  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |     
T  2362 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgatgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgccaa 2461  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2462 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Original strand, 5083 - 5141
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5083 aatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 5141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15032515 - 15032303
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032515 acgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 15032416  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15032415 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttaggg 15032316  T
Q  234 taaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||    
T  15032315 taaggtgcattcc 15032303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44943292 - 44943079
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44943292 agacacaaggatggtgtaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 44943193  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44943192 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 44943093  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||| ||||||||    
T  44943092 aagattgtcattag 44943079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 26452328 - 26452560
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26452328 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 26452427  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  26452428 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctag 26452527  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26452528 aagatcgtcattagttagggtaaggtgtattcc 26452560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38034136 - 38033904
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38034136 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctctacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 38034037  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  38034036 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgccgg 38033937  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38033936 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 38033904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 41275397 - 41275629
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41275397 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 41275496  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  41275497 acgagcatgttttgagagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 41275596  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41275597 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 41275629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41857185 - 41856972
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41857185 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 41857086  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41857085 acgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 41856986  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  41856985 aagatcgtcattag 41856972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 41363659 - 41363891
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41363659 agacacaaggagggtggaacacgttcggtatacacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 41363758  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  41363759 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccag 41363858  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41363859 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 41363891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Original strand, 40415251 - 40415490
Alignment:
Q  5 cagcaccacagacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgac 104  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40415251 cagcaccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgac 40415350  T
Q  105 gaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  40415351 gaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcccgtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaacttaagatatcatcaacagcttga 40415450  T
Q  205 ttccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcatt 244  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40415451 ttccgtcagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcatt 40415490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18440506 - 18440293
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18440506 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgaacgatgaaaacgtg 18440407  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18440406 acgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgcgag 18440307  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  18440306 aagatcgtcattag 18440293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 43693140 - 43693372
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43693140 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcggcgaggggaggatatcattcatttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 43693239  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  43693240 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccag 43693339  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43693340 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 43693372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33799753 - 33799530
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33799753 gagggtggaatatgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg 33799654  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  33799653 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggataacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtc 33799554  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  33799553 attagttagggtaaggtgcattcc 33799530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 24861346 - 24861578
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24861346 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtg 24861445  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||    
T  24861446 acgagcatgttttgggagcacaacatgttcaattggattgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattctgccag 24861545  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24861546 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 24861578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42169171 - 42168939
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42169171 agacacgaggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcccttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtg 42169072  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  42169071 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgcagagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccag 42168972  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  42168971 aagatcgtcattagttaggataagatgcattcc 42168939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43638879 - 43638656
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  43638879 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatccttcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatg 43638780  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  43638779 ttttgggagcacaacatgttccagtgcatcgatatgcgcgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagatcgtc 43638680  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  43638679 attagttagggtaaggtgcattcc 43638656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Original strand, 2416920 - 2417150
Alignment:
Q  16 acacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 115  Q
    |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2416920 acacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacattcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 2417019  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| | ||||    
T  2417020 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccaccagaa 2417119  T
Q  216 gatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2417120 gatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 2417150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19242373 - 19242160
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19242373 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtg 19242274  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19242273 acgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacgag 19242174  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||| ||||||||    
T  19242173 aagattgtcattag 19242160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19315557 - 19315344
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19315557 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtg 19315458  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19315457 acgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacgag 19315358  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||| ||||||||    
T  19315357 aagattgtcattag 19315344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 485469 - 485237
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  485469 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 485370  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  485369 acgaccatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcggatgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 485270  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  485269 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 485237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 34614956 - 34615188
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34614956 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtg 34615055  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  34615056 acgaacatgttttgggagcacaacatgatccagtggattgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccag 34615155  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  34615156 aagatagtaattagttagggtaaggtgcattcc 34615188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 42603477 - 42603670
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42603477 acgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 42603576  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42603577 catcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgaaatcaaccgaatatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcgtcattag 42603670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 40414613 - 40414843
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40414613 agacacaaggaaggtggaacacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 40414712  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||    
T  40414713 acgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccag 40414812  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  40414813 aagatcgtcattag--agggtaaggtgcattcc 40414843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28706353 - 28706121
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  28706353 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgagtggagttaaagaacaacgaaaacgtg 28706254  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||    
T  28706253 acgagcatgttttgggagcacaacatgttttagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaccgcttgattccgccag 28706154  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28706153 aagattgtcattagttagggtaaggtgcattcc 28706121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 40702383 - 40702569
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40702383 acgttcagtataaacgtccaacgttcgacgaagggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggaaca 40702482  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcg 220  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  40702483 aaacatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcg 40702569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 26484580 - 26484756
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484580 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 26484679  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatat 190  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  26484680 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgcataacattgctgagatcaactgaagatat 26484756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3589477 - 3589264
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |   | | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3589477 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcaaacgattgtctatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgataacgtg 3589378  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||    
T  3589377 atgggcatgttttgggagcacaggatgttccagtggatcgatatgcgtgtaacattgttgagatcaactgaagacattatcaacagtttgattccgccag 3589278  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  3589277 aagatcgtgattag 3589264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31172027 - 31171814
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||    
T  31172027 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgacgacatg 31171928  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || | ||| |||  | |||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  31171927 acaaacatttttcagaagcacagcatgttaccgtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaaaatattatcaacagtttgattccgccag 31171828  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  31171827 aagatcgtgattag 31171814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Original strand, 16575695 - 16575837
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16575695 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtttcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaacggg 16575794  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgata 156  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  16575795 atgagcatgttttgggaccacaacatgttccagtgcatcgata 16575837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 128
Target Start/End: Original strand, 22548266 - 22548380
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22548266 agacacaaggagggtggaacacattcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtg 22548365  T
Q  114 acgagcatgttttgg 128  Q
    |||||||||||||||    
T  22548366 acgagcatgttttgg 22548380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 26487225 - 26487307
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26487225 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtagtgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 26487307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 28167577 - 28167659
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  28167577 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttattttgaa 28167659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 246
Target Start/End: Original strand, 22549232 - 22549314
Alignment:
Q  161 ggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22549232 ggtgacgttgctgacatcaactgaagatatcatcaac---ttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgtattcc 22549314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38033347 - 38033265
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38033347 aaggtacattctcgaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgacaacatatatggttgaatatgcataatatattttgttttgaa 38033265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18439700 - 18439642
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18439700 aatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataataaattttgttttgaa 18439642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 42168367 - 42168309
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42168367 aatgtaatgtaatgtgataacatatatggttgaatatgcataatacattttgttttgaa 42168309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Original strand, 42604246 - 42604296
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42604246 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 42604296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 285
Target Start/End: Original strand, 40703162 - 40703206
Alignment:
Q  241 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40703162 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaacgtgataacatatat 40703206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 285
Target Start/End: Original strand, 22549877 - 22549922
Alignment:
Q  242 attccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22549877 attccggaatgtaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 22549922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 207
Target Start/End: Original strand, 26140264 - 26140340
Alignment:
Q  131 gcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattc 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   || |||||| |||||||  ||||||||||  | || ||||||||||    
T  26140264 gcacaacatgttcccatggatcgatatgtatgttacgttgttgagatcgcctgaagatattcttaagagtttgattc 26140340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7444 - 7212
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7444 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 7345  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7344 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 7245  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7244 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 7212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 8537946 - 8538178
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8537946 agacacaaggatggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatg 8538045  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8538046 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 8538145  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8538146 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 8538178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1400517 - 1400304
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1400517 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 1400418  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1400417 acgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatccatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 1400318  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  1400317 aagatcgtcattag 1400304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Original strand, 3601356 - 3601565
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3601356 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttaagagcacaa 3601455  T
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaa 236  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3601456 catgttccagtgtttcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgtcagaagatcgtcattagttagagtaa 3601555  T
Q  237 ggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||    
T  3601556 ggtgcattcc 3601565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 541850 - 541618
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  541850 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacggg 541751  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||| ||    
T  541750 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactggagatatcatcaacaacttgatttcgccag 541651  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  541650 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 541618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8576356 - 8576124
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8576356 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtg 8576257  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8576256 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccggtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 8576157  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8576156 aagattgtcattagttagggtaaggtgcattcc 8576124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 11346701 - 11346933
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11346701 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgaaattaatgaacgacgaaaacgtg 11346800  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11346801 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 11346900  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11346901 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 11346933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4724266 - 4724076
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724266 ttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 4724167  T
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4724166 catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 4724076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 1971357 - 1971589
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1971357 agacacaaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttcggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 1971456  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  1971457 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccag 1971556  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  1971557 aaaatcatcattagttatggtaaggtgcattcc 1971589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 11027769 - 11028001
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11027769 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 11027868  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11027869 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcgaaagtttgattccgccag 11027968  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11027969 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 11028001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19036889 - 19036657
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19036889 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 19036790  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19036789 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 19036690  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19036689 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 19036657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 19400355 - 19400587
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19400355 agacacaaggatggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtgtcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 19400454  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  19400455 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 19400554  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19400555 aatatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 19400587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 18308252 - 18308465
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18308252 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatg 18308351  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18308352 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 18308451  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
     |||| | ||||||    
T  18308452 tagattgacattag 18308465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 28880983 - 28881215
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28880983 agacacaaggatggtggaaaacatttggtacaaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 28881082  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  28881083 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 28881182  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28881183 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 28881215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 246
Target Start/End: Original strand, 30709610 - 30709822
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30709610 acgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagca 30709709  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  30709710 cagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaagatcgtcattagttaggg 30709809  T
Q  234 taaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||    
T  30709810 taaggtgcattcc 30709822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 38854150 - 38854381
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38854150 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 38854249  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38854250 acgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 38854349  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38854350 aagaccgtcattagttag-gtaaggtgcattcc 38854381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 40009520 - 40009746
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40009520 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 40009619  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||    
T  40009620 acgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagacatcatcaacagcttgattccacaag 40009719  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtg 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40009720 aagatcgtcattagttagggtaaggtg 40009746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 35565264 - 35565476
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  35565264 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaa-cgtg 35565362  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  35565363 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcagaagtttgattccgccag 35565462  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  35565463 aagatcgtcattag 35565476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27661592 - 27661360
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || |||||  |||||||| ||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27661592 agacacaaggatggtggaacacgtttagtataaacttccattgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 27661493  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27661492 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 27661393  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27661392 aagattgtcattagttagggtaaggtgcattcc 27661360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 33370646 - 33370851
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370646 agacacaaggagggtggaatacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33370745  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  33370746 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccag 33370845  T
Q  214 aagatc 219  Q
    ||||||    
T  33370846 aagatc 33370851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36350520 - 36350316
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36350520 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtg 36350421  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||         ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  36350420 acgagcat---------gcacaacatgttccagtggatcgatatgtaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccag 36350330  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  36350329 aagatcgtcattag 36350316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6793601 - 6793388
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||| || || || ||||||||||||| | ||||||| || ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6793601 agacacaaggaggatggaacacattcggtataaacgcctaacgctcgacgaggagtgagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 6793502  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6793501 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtgaatcgatatgcggatgaggttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattcagccag 6793402  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  6793401 aagatcgtcattag 6793388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 185
Target Start/End: Original strand, 3169596 - 3169766
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3169596 agacataaagagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 3169694  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaa 185  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3169695 acgagcatattttaagagcacaacatgttccagtggatcggtatgcgggtgacgttgctgagatcagctgaa 3169766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35927652 - 35927470
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35927652 agacacaattagggtgtaacacgttcgttataaacgtccaatgctcgacgagggaagagtatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 35927553  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaa 196  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35927552 acgaacatgttttgggagcacatcatctttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaa 35927470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 227
Target Start/End: Original strand, 1694859 - 1694994
Alignment:
Q  92 attaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatc 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1694859 attaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgtttcactggaacgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatc 1694958  T
Q  192 atcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1694959 atcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 1694994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17366950 - 17366735
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |  |||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17366950 agacacaaggagggtggaata-gttcgatataaacgtccaaccctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 17366852  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| || ||    
T  17366851 acaaacatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtaccgttgttgagatcaactaaagatattatcaagagtctgattctgccag 17366752  T
Q  214 aagatcgtcattagtta 230  Q
    || ||||| ||||||||    
T  17366751 aatatcgtgattagtta 17366735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Original strand, 7082336 - 7082445
Alignment:
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaa 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  7082336 catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttatggtaa 7082435  T
Q  237 ggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||    
T  7082436 ggtgcattcc 7082445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 2599211 - 2599387
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || | | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||   || ||    
T  2599211 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacattcgacgatgagagaatatcattcagttgggtggaattagcgaacaacggcgacatg 2599310  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatat 190  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  2599311 aagagcatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagattaactgatgatat 2599387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 18309043 - 18309125
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18309043 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 18309125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 3458828 - 3458941
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  3458828 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggttgagttaaagaacgacgaaaacgtg 3458927  T
Q  114 acgagcatgttttg 127  Q
    ||||| ||||||||    
T  3458928 acgagtatgttttg 3458941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 3602127 - 3602209
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3602127 aaggtacattccagaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataatatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 3602209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6792899 - 6792817
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6792899 aaggtacattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 6792817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Original strand, 1972152 - 1972228
Alignment:
Q  241 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1972152 cattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 1972228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1399728 - 1399646
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1399728 aaggtacattctggaatgtaatgtaaagcaatataatgtgataacatatatagttgaatatgcataattcattttgttttgaa 1399646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 100
Target Start/End: Original strand, 1693381 - 1693459
Alignment:
Q  22 agagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaa 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1693381 agagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcactcacttgggtggaattaacgaa 1693459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 246
Target Start/End: Original strand, 3458940 - 3459014
Alignment:
Q  172 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3458940 tgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 3459014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 12742707 - 12742799
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacga 106  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12742707 agacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacga 12742799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Original strand, 35566069 - 35566137
Alignment:
Q  249 aatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35566069 aatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataacacatgttgttttgaa 35566137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 246
Target Start/End: Original strand, 22283704 - 22283795
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  22283704 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccaccataaaatcgtccttagttaggataaggtgcattcc 22283795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 20196861 - 20196942
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20196861 aaggtacattccgaaatgtaatgtaatgcaatgtaatatgatatcatatatagttgaatatgc-taatacatttttttttgaa 20196942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 111
Target Start/End: Original strand, 12805525 - 12805622
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12805525 agacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaatgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacg 12805622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4723483 - 4723420
Alignment:
Q  254 aatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4723483 aatgtaatgtaatctaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 4723420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Original strand, 12742818 - 12742877
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  12742818 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattag 12742877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34683334 - 34683271
Alignment:
Q  254 aatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34683334 aatgaaatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 34683271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 317
Target Start/End: Original strand, 1695590 - 1695651
Alignment:
Q  256 tgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1695590 tgtaatgtaatataatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 1695651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Original strand, 18920835 - 18920939
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatg-ttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgt 221  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18920835 ttttggcagcacaacatggttccgatg-atcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgt 18920933  T
Q  222 cattag 227  Q
     |||||    
T  18920934 gattag 18920939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36349732 - 36349679
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36349732 aatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 36349679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 309
Target Start/End: Original strand, 25498880 - 25498940
Alignment:
Q  249 aatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacatttt 309  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25498880 aatgtaatgtcatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatggataatacatttt 25498940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17195423 - 17195361
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17195423 acgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattag 17195361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Original strand, 7082284 - 7082335
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaag 65  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7082284 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 7082335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Original strand, 12805636 - 12805695
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||| |||||    
T  12805636 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattatgccagaagatcgtgattag 12805695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25360690 - 25360579
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgtt-gctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgt 221  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||   || ||||| |||||||||  |||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25360690 ttttggcagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgtttgctgagatcgcctgaagatgttttcaacagtttgattccgtcagaagatcgt 25360591  T
Q  222 cattagttagag 233  Q
     ||||| |||||    
T  25360590 gattaggtagag 25360579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13131142 - 13131074
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||  || |||||||||| ||||| |||||    
T  13131142 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacattttgattttgctagaagatcgtgattagctagag 13131074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 82)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14330908 - 14330676
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14330908 agacacaaggagggtggaacactttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 14330809  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14330808 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 14330709  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14330708 aagatcgtcattagttaaggtaaggtgcattcc 14330676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20779073 - 20778851
Alignment:
Q  24 agggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 123  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779073 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 20778974  T
Q  124 tttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20778973 tttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtttcgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcgtca 20778874  T
Q  224 ttagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||| ||| ||||||||||||||    
T  20778873 ttaggtagggtaaggtgcattcc 20778851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 22436904 - 22437117
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22436904 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtg 22437003  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22437004 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccgg 22437103  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  22437104 aagatcgtcattag 22437117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21017391 - 21017159
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017391 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 21017292  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21017291 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 21017192  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21017191 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 21017159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40353987 - 40353755
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40353987 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 40353888  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40353887 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 40353788  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  40353787 aagattgtcattagttagggtaaggtgcattcc 40353755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51428406 - 51428174
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  51428406 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgtgtggagttaacgaacgacgaaaacgtg 51428307  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  51428306 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcaag 51428207  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51428206 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 51428174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Original strand, 55796738 - 55796968
Alignment:
Q  16 acacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 115  Q
    |||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55796738 acacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 55796837  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaa 215  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  55796838 gaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaa 55796937  T
Q  216 gatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55796938 gatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 55796968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43889713 - 43889500
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43889713 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 43889614  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  43889613 acgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatataatcaaaagtttgattccgccag 43889514  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  43889513 aagatcgtcattag 43889500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 25762591 - 25762823
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25762591 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 25762690  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  25762691 acgaacatgttttgggagcacaacatgttctggtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 25762790  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25762791 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 25762823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33163758 - 33163526
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  33163758 agacgcaatgagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtaacattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtg 33163659  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  33163658 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccag 33163559  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33163558 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 33163526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 51027981 - 51027753
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51027981 agacacaaggagagtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 51027882  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | |     
T  51027881 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccat 51027782  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgca 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51027781 aagatcgtcattagttagggtaaggtgca 51027753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Original strand, 1226161 - 1226384
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1226161 gagggtggaatacgtttgctataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgtgtggaattaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatg 1226260  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1226261 ttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtc 1226360  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  1226361 attagttagggtaaggtgcattcc 1226384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6282537 - 6282321
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6282537 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacaaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtg 6282438  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6282437 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 6282338  T
Q  214 aagatcgtcattagtta 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  6282337 aagatcgtcattagtta 6282321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34153500 - 34153288
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34153500 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34153401  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  34153400 acgatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcggatgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 34153301  T
Q  214 aagatcgtcatta 226  Q
    |||||||||||||    
T  34153300 aagatcgtcatta 34153288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41794776 - 41794544
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41794776 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 41794677  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  41794676 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 41794577  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41794576 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 41794544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 49063972 - 49064204
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49063972 agacacaaggagagtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtgtcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 49064071  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49064072 acgagcatgtttttggagcacaacatgtttccgtggatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 49064171  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49064172 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 49064204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31824834 - 31824611
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31824834 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg 31824735  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  31824734 ttttgggagcacaacatgttctagtggatcaatatgcgggtaacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtc 31824635  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  31824634 attagttagggtaaggtgcattcc 31824611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34530010 - 34529797
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  34530010 agacacaagaagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtg 34529911  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34529910 acgagcattttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 34529811  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  34529810 aagatcgtcattag 34529797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 37866399 - 37866632
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || || |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37866399 agacacaagaagggtggaacacattcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtg 37866498  T
Q  114 acgagcatgtttt-gggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcga 212  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |    
T  37866499 atgagcatgttttcgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatatcttgattccgcta 37866598  T
Q  213 gaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37866599 gaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 37866632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 242630 - 242398
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||    
T  242630 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagcatcattcacttaggtggagttaaagaacgatgaaaacgtg 242531  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  242530 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccag 242431  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  242430 aagatcgtcattagttaaagtaaggtgcattcc 242398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6177529 - 6177297
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177529 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 6177430  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6177429 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 6177330  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6177329 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 6177297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32938116 - 32937884
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32938116 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 32938017  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  32938016 acgagcatgtttcgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 32937917  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32937916 aagatcgtcattagatagggtaaggtgcattcc 32937884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 56138903 - 56139135
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56138903 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 56139002  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  56139003 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 56139102  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  56139103 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 56139135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 957669 - 957456
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957669 agacataaggagggtggaatatgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 957570  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  957569 acgagcatgttttaggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 957470  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  957469 aagatcgtcattag 957456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47657569 - 47657356
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47657569 agacacaaggtgggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgaccaaaacgtg 47657470  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  47657469 acgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccag 47657370  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  47657369 aagatcgtcattag 47657356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 49094738 - 49094970
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49094738 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtg 49094837  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  49094838 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcgtcaaaagtttgattccgccac 49094937  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49094938 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 49094970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 246
Target Start/End: Original strand, 21711549 - 21711755
Alignment:
Q  40 ggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 139  Q
    ||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711549 ggtataaacatctaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 21711648  T
Q  140 gttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggt 239  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21711649 gttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggt 21711748  T
Q  240 gcattcc 246  Q
    |||||||    
T  21711749 gcattcc 21711755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 28082231 - 28082463
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28082231 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatg 28082330  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  28082331 acgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtggatcaatatgcaggtgaagttacttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 28082430  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28082431 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 28082463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 39588922 - 39589154
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  39588922 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtg 39589021  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  39589022 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctag 39589121  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  39589122 aagatcgtcattagttggggtaaggtgcattcc 39589154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 246
Target Start/End: Original strand, 1042769 - 1042974
Alignment:
Q  41 gtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatg 140  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1042769 gtataaacgtccaacgctagacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacagcatg 1042868  T
Q  141 ttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtg 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  1042869 ttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatataatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggta 1042968  T
Q  241 cattcc 246  Q
    ||||||    
T  1042969 cattcc 1042974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26591899 - 26591686
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26591899 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtg 26591800  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  26591799 acgaacatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 26591700  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  26591699 aagatcgtcattag 26591686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36776733 - 36776520
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36776733 agacacaaggagggtggaacacgttaggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtattattcacttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtg 36776634  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  36776633 acgagcatggtttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctga 36776534  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  36776533 aagatcgtcattag 36776520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 49792150 - 49791937
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49792150 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtattattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtg 49792051  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |     
T  49792050 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccaa 49791951  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||| |||||||    
T  49791950 aagatcatcattag 49791937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 49817858 - 49817645
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49817858 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtaacattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtt 49817759  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  49817758 acgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccag 49817659  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  49817658 aagatcgtcattag 49817645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20901882 - 20901650
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901882 agacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagtggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 20901783  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |  |    
T  20901782 acgagcatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacactgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacctg 20901683  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20901682 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 20901650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 45939518 - 45939750
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  45939518 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagaggagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgataatgtg 45939617  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  | |     
T  45939618 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcttccat 45939717  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45939718 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 45939750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 2773002 - 2773212
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2773002 agacacaaggatggtggaacacgttcgttataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2773101  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| ||    
T  2773102 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttattgagatcaactgaagataccatcaacaacttgattccgccag 2773201  T
Q  214 aagatcgtcat 224  Q
    |||||||||||    
T  2773202 aagatcgtcat 2773212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 21169444 - 21169657
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| |    
T  21169444 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtcgaattaacggacgatgaatacgcg 21169543  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21169544 acgagcatgttttgggagcacagcatgtaccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 21169643  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  21169644 aagatcgtcattag 21169657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 9489672 - 9489903
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  9489672 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtg 9489771  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  9489772 acgagcatgtttt-ggagcacagcatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttattgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 9489870  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9489871 aagatcgtcattagttagggtaaagtgcattcc 9489903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44560394 - 44560181
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44560394 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 44560295  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |       
T  44560294 acaagcatgttttgggagcaaagcatgttccagtgtattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttctcctt 44560195  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  44560194 aagatcgtcattag 44560181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 46816737 - 46816507
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  46816737 agacgcaaggagggtggaatacgttcagtatacacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaacgtg 46816638  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  46816637 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgttgagatca--tgaagatatcatcaatagcttgattccgccag 46816540  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  46816539 aagatcgtcattagttagggcaaggtgcattcc 46816507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 49423972 - 49423759
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49423972 agacacaaggagggtggaacatgttcggtataaatgtccagcgctcgacgaggggagattatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 49423873  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |     
T  49423872 acgagcatgttctgggagcacggcatgttcaagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagaaatcatcaaaagtttgattctgccat 49423773  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  49423772 aagatcgtcattag 49423759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 244
Target Start/End: Original strand, 27759374 - 27759550
Alignment:
Q  68 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  27759374 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 27759473  T
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcatt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27759474 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcatt 27759550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 17211259 - 17211472
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  17211259 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagggaagaatatcattcatttgagtcgaattaacgaacgataaaaacgtg 17211358  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  17211359 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacagtctgattccgccag 17211458  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  17211459 aagatcgtgattag 17211472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 11288288 - 11288499
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11288288 agacacaaggagggtggaatacgttccgtataaacgtccaacggtcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 11288387  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |  ||    
T  11288388 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcacaa-tttgattctgttag 11288486  T
Q  214 aagatcgtcatta 226  Q
    |||||||| ||||    
T  11288487 aagatcgtgatta 11288499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 3393297 - 3393502
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3393297 agacacaaggagggtggaatacgttcgatataaacgtccaacgctcgaggatgggagattatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 3393396  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  3393397 aggagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccag 3393496  T
Q  214 aagatc 219  Q
    ||||||    
T  3393497 aagatc 3393502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4785636 - 4785423
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| ||| ||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4785636 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtcaaacccttgacgaggggagagcatcattcactttggtggaattaacgaacgacaaaaacgtg 4785537  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |     
T  4785536 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggggaacgttgctgatatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgccac 4785437  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  4785436 aagatcgtcattag 4785423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 24606745 - 24606958
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24606745 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaatgtccaacgctcgacaagcggagagtattattcagttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtg 24606844  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  24606845 acgagcatgtattgggagcacatcatgttcccgtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgccag 24606944  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  24606945 aagatcgtgattag 24606958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 42886256 - 42886472
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagta---tcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42886256 agacacaaggagggtggaacacgttcgttataaacttccaacgctcgacgaggggagagtactatcattcacttgggtggaattaaccaacgacgaaaac 42886355  T
Q  111 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  42886356 atgacgagcatgctttgagagcacaacattttctagtggatcgatacgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgc 42886455  T
Q  211 gagaagatcgtcattag 227  Q
     |||||||| |||||||    
T  42886456 cagaagatcatcattag 42886472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 10312265 - 10312478
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| | |||| ||| || | |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10312265 agacacaaggagtgtggaatatgttcggtataaacatacaacactcgacgatgggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 10312364  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| | | | |||||||  |    
T  10312365 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttaagatcaactgaagatattatcaacaatctaattccgctgg 10312464  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  10312465 aagatcgtgattag 10312478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 18412588 - 18412801
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18412588 agacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttcggtggaattaatgaacgacgataacgtg 18412687  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| || ||    
T  18412688 aggagcatgttttgggagcacaccatgtttcagtggatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacaatttgattctgccag 18412787  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  18412788 aagatcgtgattag 18412801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 31324167 - 31324372
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||| || |||| |||| |||||||||||||||| || || | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  31324167 agacacaatgaggatggaataggttcagtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatattattcagttgggtggaattaacgaacgacaatgacgtg 31324266  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||    
T  31324267 acgagcatgtttttggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaaagttgctgagatcaactgaagacattctcaacagtttgattccgctag 31324366  T
Q  214 aagatc 219  Q
    ||||||    
T  31324367 aagatc 31324372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 13850742 - 13850955
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || | |||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||  |||||    
T  13850742 agacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgtttgacgatgggagaatatcattcagttggatgaaattaacaaacgacgacgacgtg 13850841  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||   || || ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||    
T  13850842 acgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtatgtaacattgctgagatcaactaaagatattctcaacagtttgattccgccag 13850941  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||| ||| |||||    
T  13850942 aagaccgtgattag 13850955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 13866256 - 13866469
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  |  || | |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||    
T  13866256 agacacaaggagggtggaatgcgtttggtataaacgtccaacatttgacgatgggagaatatcattcagttggatggaattaacaaacgacgacgacgtg 13866355  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||    
T  13866356 acgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggattgatatgtatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccag 13866455  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||| ||| |||||    
T  13866456 aagaccgtgattag 13866469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Original strand, 25763359 - 25763435
Alignment:
Q  241 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25763359 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 25763435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 49423179 - 49423097
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49423179 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 49423097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 21170235 - 21170317
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21170235 aaggtacattccggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatatattttgttttgaa 21170317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34152709 - 34152627
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34152709 aaggtacatttcggaatgtaatgtaatgcaatataatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 34152627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36775941 - 36775859
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36775941 aaggtacattccggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatgtatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 36775859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44559736 - 44559668
Alignment:
Q  249 aatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44559736 aatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 44559668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 956877 - 956798
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgtttt 314  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  956877 aaggtacattctgaaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgtttt 956798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20901130 - 20901048
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  20901130 aaggtacattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaacgtgcataatacattttgttttgaa 20901048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21412739 - 21412647
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacga 106  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  21412739 agacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaatgttcaacgaggggagaatatcatttagttggatggaattaacgaacgacga 21412647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51027242 - 51027160
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  51027242 aaggtacattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgtgtagtacattttgttttgaa 51027160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 317
Target Start/End: Original strand, 49571907 - 49571966
Alignment:
Q  258 taatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49571907 taatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 49571966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Original strand, 2773808 - 2773871
Alignment:
Q  254 aatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2773808 aatgtaatgtaatgcaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 2773871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 317
Target Start/End: Original strand, 45940321 - 45940380
Alignment:
Q  258 taatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45940321 taatgtaatgtaatgtgataacatttatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 45940380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51427600 - 51427542
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51427600 aatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 51427542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43888909 - 43888856
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43888909 aatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 43888856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 317
Target Start/End: Original strand, 47870854 - 47870918
Alignment:
Q  252 gtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  47870854 gtaatgtaatgcaatgtaacgtgataacatatata-ttgaatatgcataatacaatttgttttgaa 47870918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Original strand, 42887079 - 42887137
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42887079 aatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataacacatgttgttttgaa 42887137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 49791344 - 49791286
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49791344 aatgtaatataatatgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 49791286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 17292106 - 17292167
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcatta 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17292106 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgatta 17292167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 49817283 - 49817198
Alignment:
Q  142 tccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| || | |||||||| |||||    
T  49817283 tccagtggatcgatatgcgtgtaacgttgatgagatcaaatgaagatattatcaacagtctgattctgccaaaagatcgtgattag 49817198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4784779 - 4784721
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4784779 aatgtaatgtaatgtgataacacatataattgaatatgcataatacatgttgttttgaa 4784721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6281927 - 6281877
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6281927 aaggtacattccggaataaaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 6281877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Original strand, 37867276 - 37867326
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37867276 aaggtacattctggaatgtaatgtaatgcaatgtagtgtgataacatatat 37867326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 285
Target Start/End: Original strand, 9490291 - 9490320
Alignment:
Q  256 tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9490291 tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 9490320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 318
Target Start/End: Original strand, 13866713 - 13866758
Alignment:
Q  273 tgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaaa 318  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||    
T  13866713 tgataacatatatagttgattctgcataatacatgttgttttgaaa 13866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17054832 - 17054795
Alignment:
Q  280 atatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17054832 atatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 17054795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 317
Target Start/End: Original strand, 9718031 - 9718075
Alignment:
Q  273 tgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  9718031 tgataacatatatagttgattctgcataatacatgttgttttgaa 9718075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 317
Target Start/End: Original strand, 10315261 - 10315305
Alignment:
Q  273 tgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  10315261 tgataacatatctagttgattatgcataatacattgtgttttgaa 10315305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21187511 - 21187298
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  21187511 agacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgattgacgaaaacgtg 21187412  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21187411 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgtcag 21187312  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  21187311 aagatcgtcattag 21187298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 41048798 - 41048991
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41048798 acgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcgacgagcatgttttgggagca 41048897  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41048898 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 41048991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 48270643 - 48270856
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48270643 agacaaaaggagggtggaacacgttcggtatagacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 48270742  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48270743 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 48270842  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||| ||||    
T  48270843 aagatcgtcgttag 48270856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 34140860 - 34141092
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34140860 agacacaaggagggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 34140959  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  34140960 acggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccat 34141059  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34141060 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 34141092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48315383 - 48315179
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48315383 gagggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcaacgagaggagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 48315284  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  48315283 ttttgggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcgtc 48315184  T
Q  223 attag 227  Q
    |||||    
T  48315183 attag 48315179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36394036 - 36393823
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36394036 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagaatatcattcacttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 36393937  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  36393936 acgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 36393837  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||| |||||||    
T  36393836 aagatcttcattag 36393823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 18237571 - 18237791
Alignment:
Q  26 ggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttt 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18237571 ggtggaatacgttcggtataaacgtctaacgctcgacaaggggagaggatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacatgacgagcatattt 18237670  T
Q  126 tgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcatt 225  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18237671 tgggagcacatcatgttccagtggatcggtatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtttgattccgccagaagatcgtcatt 18237770  T
Q  226 agttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  18237771 agttagggtaaggtgcattcc 18237791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 20564754 - 20564986
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20564754 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 20564853  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20564854 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 20564953  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20564954 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 20564986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 30360512 - 30360743
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  30360512 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaatgtacaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaaaacgacgaaaacgta 30360611  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  30360612 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtg-cgttgctgagatcaactgaagatatcataaaaagtttgattccgccag 30360710  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30360711 aagatcgtcattagttagggtaatgtgcattcc 30360743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39477450 - 39477220
Alignment:
Q  16 acacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 115  Q
    |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  39477450 acacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggaggatatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacatgac 39477351  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||| ||||    
T  39477350 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcattaacaacttgattccgccagaa 39477251  T
Q  216 gatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39477250 gatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 39477220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 17839318 - 17839551
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17839318 agacacaaggatggtggaagacgtttggaataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 17839417  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccg-cga 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  17839418 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaa 17839517  T
Q  213 gaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17839518 aaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 17839551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 46862406 - 46862196
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46862406 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 46862307  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  46862306 acgagcttgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagattaactgaagatatgatcaaaagtttgattccgccag 46862207  T
Q  214 aagatcgtcat 224  Q
    |||||||||||    
T  46862206 aagatcgtcat 46862196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 17183207 - 17183442
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17183207 agacacaaggagggtgtaacacgtttggtataaacgtccaacactcgacgagggaagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 17183306  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17183307 acgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 17183406  T
Q  214 aag---atcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||   ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17183407 aagatcatcgtcattagttagggtgaggtgcattcc 17183442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43351311 - 43351099
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43351311 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatg 43351212  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||    
T  43351211 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatg-gggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaatgtctgattccaccag 43351113  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  43351112 aagatcgtcattag 43351099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20378915 - 20378683
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20378915 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgcacaacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 20378816  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||| ||    
T  20378815 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggacagatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatataattaacaacttgattccgccag 20378716  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20378715 aagatcatcattagttagagtaaggtgcattcc 20378683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 40588544 - 40588776
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40588544 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatg 40588643  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||    
T  40588644 atgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcggccag 40588743  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40588744 aagatcgtcattagtcagggtaaggtgcattcc 40588776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30355007 - 30354814
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30355007 acgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 30354908  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  30354907 caacatgttccagtggatcgatatgtggatgacgttgctgagatcagctgaagatatcatcaaaagtttgattctgccaaaagatcgtcattag 30354814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 42735258 - 42735470
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42735258 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatg-gggaagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 42735356  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42735357 acgagcatgttttgggagcacaacatattctagtgaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcaag 42735456  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  42735457 aagatcgtcattag 42735470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15338117 - 15337904
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15338117 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 15338018  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||    
T  15338017 atgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattataaacagtctgattccgccag 15337918  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  15337917 aagatcgtcattag 15337904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 41217609 - 41217841
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  41217609 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaaaattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaaagtg 41217708  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  41217709 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccag 41217808  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41217809 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 41217841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 47268894 - 47269125
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47268894 agacgcaaggagggtggaatacgttcg-tataaacgtccagcgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 47268992  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||||| |     
T  47268993 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagattaactaaaaatatcatcaacaatttgattccgccaa 47269092  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  47269093 aagatcgtcattaattagggtaagatgcattcc 47269125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48220945 - 48220724
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48220945 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg 48220846  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||||||    
T  48220845 tt--gggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcaggtgacggtgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccataagatcgtc 48220748  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  48220747 attagttagggtaaggtgcattcc 48220724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21614972 - 21614759
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21614972 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagggaagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcg 21614873  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21614872 acgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaattttgattccgccag 21614773  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||| |||| |||||    
T  21614772 aagttcgtgattag 21614759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28114601 - 28114412
Alignment:
Q  18 acaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacga 117  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28114601 acaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgcccgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacga 28114502  T
Q  118 gcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattc 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28114501 gcatgttttaggagcacaacatgttccaatggatcgaaatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattc 28114412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 10523063 - 10523296
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10523063 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgttggaattaacgaacgacgaaaacgtg 10523162  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatg-ttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcga 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  10523163 acgagcatgttttgggagcaccacatgtttcttgtggatcgatatgcgggtgaagtttcttagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgcct 10523262  T
Q  213 gaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10523263 gaaaatcgtcattagttagggtaaggtgtattcc 10523296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 2356284 - 2356497
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  2356284 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgaagaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacaaaaatgtg 2356383  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  2356384 acgagcatgttttgggagaacagcatgttccaatggatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgctat 2356483  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||| ||| |||||    
T  2356484 aagaccgtgattag 2356497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 21650519 - 21650735
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  21650519 agacacaaggagggtggaacacgttcattataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggaggaattaacgaacgacgaaaatgtg 21650618  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |     
T  21650619 acgagcatgttatgggatcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccat 21650718  T
Q  214 aagatcgtcattagtta 230  Q
    |||||| ||||||||||    
T  21650719 aagatcatcattagtta 21650735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28979234 - 28979060
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  28979234 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgggtgaaattaacgagcgacaaaaacgtg 28979135  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagat 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28979134 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagat 28979060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1642799 - 1642586
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1642799 agacacaaggagggtggaatacgtttgatataaacgttcaacactcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtg 1642700  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  1642699 aggagcatgttttgggagcacaacatgttcaagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgccag 1642600  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  1642599 aagatcgtgattag 1642586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45363455 - 45363232
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  45363455 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagcagagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtg 45363356  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  45363355 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgat---------acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 45363265  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45363264 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 45363232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26603417 - 26603265
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26603417 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagggtatcattcacttgggtggaattaaagagcgacgaaaacgtg 26603318  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgac 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26603317 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtgac 26603265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9367243 - 9367100
Alignment:
Q  103 acgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367243 acgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 9367144  T
Q  203 gattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9367143 gattccgccacaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 9367100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 111 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2206152 - 2206017
Alignment:
Q  111 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2206152 gtgacgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 2206053  T
Q  211 gagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2206052 cagaagatcgtcattagttaggataaggtgcattcc 2206017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Original strand, 22291621 - 22291697
Alignment:
Q  241 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22291621 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 22291697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 13916828 - 13916949
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||    
T  13916828 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacaaaaatgtg 13916927  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcaca 135  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  13916928 atgaccatgttttgggagcaca 13916949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26601839 - 26601758
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26601839 acgttgttgagatcaactgaagatatcatcaatagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 26601758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Original strand, 13920434 - 13920533
Alignment:
Q  147 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13920434 tggatcgatatgcaggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgatttcgccataagatcgtcattagttagggtaagatgcattcc 13920533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 41622865 - 41622947
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41622865 aaggtacattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 41622947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 46861619 - 46861537
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  46861619 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagatgaatatgcattatacattttgttttgaa 46861537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Original strand, 42682951 - 42683052
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42682951 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgaacgacgaggggagaatatcattcactttggtggaattaacgaacaacgaaaacgtg 42683050  T
Q  114 ac 115  Q
    ||    
T  42683051 ac 42683052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 10224853 - 10224935
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10224853 aaggtacattccgcaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatattgatttgaa 10224935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 247 - 317
Target Start/End: Original strand, 48271447 - 48271517
Alignment:
Q  247 ggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48271447 ggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttctgaa 48271517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17320272 - 17320181
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17320272 tatgcggttgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 17320181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21186717 - 21186637
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21186717 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtactatga--acatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 21186637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36393245 - 36393163
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36393245 aaggtacattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgcgataacatatatagttgaatatgtataatacattttgttttgaa 36393163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 246
Target Start/End: Original strand, 34139332 - 34139393
Alignment:
Q  185 agatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34139332 agatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 34139393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Original strand, 28066359 - 28066463
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||     
T  28066359 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaaaagtttgattccgccagaacatcgtg 28066458  T
Q  223 attag 227  Q
    |||||    
T  28066459 attag 28066463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Original strand, 42683211 - 42683269
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42683211 aatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcatgatacattttgttttgaa 42683269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43350806 - 43350756
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43350806 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 43350756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 11824839 - 11824901
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11824839 acgttgcagagatcaactgaagatattttcaacagtttgattccgctagaagatcgtgattag 11824901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Original strand, 42735777 - 42735830
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42735777 aatgtaatgtgataaaatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 42735830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28113800 - 28113745
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgtttt 314  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  28113800 aatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgtataatacatgttgtttt 28113745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20877458 - 20877400
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  20877458 aatgtaatgtaatgtgataccatatatagttgaatatgcataatacatgctgttttgaa 20877400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 8726430 - 8726337
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaa 107  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||  | |||| ||  ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  8726430 agacacaaggagggtggaataagttcggtataaacgtccatcgttcgacactgagagaatactattcagttaggtggaattaacaaacgacgaa 8726337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 221
Target Start/End: Original strand, 18149638 - 18149729
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgt 221  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||    | | ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  18149638 agcacaacatgttcccgtggatcgatttgtttttcaagttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattgcgccagaagatcgt 18149729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28979065 - 28979032
Alignment:
Q  213 gaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28979065 gaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 28979032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Original strand, 150192 - 150296
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||    || |||||| |||||||  ||||||||||  |||| | |||||||| || ||||||||||     
T  150192 ttttggcagcacatcatgttcccgtggatcgatatatttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattctgctagaagatcgtg 150291  T
Q  223 attag 227  Q
    |||||    
T  150292 attag 150296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 12083042 - 12083122
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||   || || |||||||||||  ||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  12083042 agcacaacatgttcccatggatggatatgtttgtcacattgctgagatcgcctgaagatattctcaacagtttggttccgc 12083122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 1785 - 2017
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1785 agacacaaggagggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 1884  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  1885 acggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccat 1984  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1985 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 2017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 801163 - 801394
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  801163 agacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgtccaaagctcgacgaggggag-gtgtcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaacgtg 801261  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  801262 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 801361  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  801362 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 801394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 11692448 - 11692680
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692448 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacaaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 11692547  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  11692548 acgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 11692647  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11692648 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 11692680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 13402530 - 13402743
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13402530 agacacaaggagggtggaacacgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 13402629  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13402630 acgagcatgttttgggagcccaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 13402729  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  13402730 aagatcgtcattag 13402743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32027840 - 32027627
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32027840 agacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtg 32027741  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32027740 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 32027641  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  32027640 aagatcgtcattag 32027627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32037899 - 32037686
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32037899 agacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtg 32037800  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32037799 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 32037700  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  32037699 aagatcgtcattag 32037686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 6205481 - 6205713
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205481 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 6205580  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6205581 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 6205680  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6205681 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 6205713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 27640177 - 27640409
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27640177 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 27640276  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  27640277 acgaccatgttttggaagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 27640376  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27640377 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 27640409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 29066550 - 29066782
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29066550 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 29066649  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||    
T  29066650 aagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccag 29066749  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29066750 tagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 29066782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 29075563 - 29075795
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29075563 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 29075662  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||    
T  29075663 aagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccag 29075762  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29075763 cagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 29075795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 29108137 - 29108369
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29108137 agacacaaggagggtggaacacctgtggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 29108236  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||    
T  29108237 aagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccag 29108336  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29108337 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 29108369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34803108 - 34802895
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34803108 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34803009  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  34803008 atgagcatgttcagggagcacaacatgttccagtaaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccaa 34802909  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  34802908 aagatcgtcattag 34802895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Original strand, 29110558 - 29110767
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29110558 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacag 29110657  T
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaa 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  29110658 catgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagcagatcgtcattagttagggtaa 29110757  T
Q  237 ggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||    
T  29110758 ggtgcattcc 29110767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35058930 - 35058715
Alignment:
Q  31 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35058930 aatacgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttggga 35058831  T
Q  131 gcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagtta 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  35058830 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacatcttaattccacaagaagatcgtcattagtta 35058731  T
Q  231 gagtaaggtgcattcc 246  Q
    | ||||||| ||||||    
T  35058730 gggtaaggtacattcc 35058715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 14115034 - 14115247
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14115034 agacacaaggagggtgcaaaacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaagtaaagaacgacgaaaacgtg 14115133  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||    
T  14115134 acgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattctgccag 14115233  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||| || |||||    
T  14115234 aagatagtgattag 14115247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 22305793 - 22305980
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22305793 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 22305892  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22305893 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtt 22305980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 12396793 - 12396986
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12396793 acgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagca 12396892  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  12396893 cagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatctactgaagatatcatcaacaacttgattccgccaaaagatcgtcattag 12396986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 76 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30257729 - 30257578
Alignment:
Q  76 cattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgag 175  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30257729 cattcagttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgag 30257630  T
Q  176 atcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30257629 atcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattag 30257578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3765867 - 3765767
Alignment:
Q  147 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttt-gattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3765867 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaaattccaccagaagatcatcattagttagggtaaggtgcattc 3765768  T
Q  246 c 246  Q
    |    
T  3765767 c 3765767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24021168 - 24021077
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24021168 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 24021077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 12397565 - 12397647
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12397565 aaggtacattccggaatgtaatgcaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 12397647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 246
Target Start/End: Original strand, 2192535 - 2192626
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2192535 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaattttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 2192626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32027042 - 32026966
Alignment:
Q  241 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32027042 cattccggaatgtaatgttatgcaatgtaatgttataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 32026966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32037101 - 32037025
Alignment:
Q  241 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32037101 cattccggaatgtaatgttatgcaatgtaatgttataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 32037025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 4495670 - 4495752
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4495670 aaggtacattccggaatgtagtgtaatgtaatgtgatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 4495752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Original strand, 13403623 - 13403676
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403623 aatgtaatgtgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 13403676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13617310 - 13617242
Alignment:
Q  249 aatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  13617310 aatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatacatagttgaatatgaatagtacatgttgttttgaa 13617242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35021284 - 35021237
Alignment:
Q  179 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcatta 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35021284 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 35021237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35020657 - 35020607
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35020657 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 35020607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30256989 - 30256936
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30256989 aatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 30256936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17465414 - 17465328
Alignment:
Q  147 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    ||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  17465414 tggatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagatcgtgattaggtagag 17465328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Original strand, 7821390 - 7821443
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7821390 aatgtaatgtgacaacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 7821443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34802588 - 34802536
Alignment:
Q  259 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgt 311  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34802588 aatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgt 34802536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Original strand, 2402306 - 2402372
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagata 189  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||   || ||||||||||||||  |||||||||    
T  2402306 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagata 2402372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 28051355 - 28051465
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  || | |||||| || | |||| | || | ||||||| ||||||||| |||||     
T  28051355 agacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgacgggagaataacgttcagtcggctagaattaaagaacgacgacaacgtc 28051454  T
Q  114 acgagcatgtt 124  Q
    | |||||||||    
T  28051455 aggagcatgtt 28051465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 227
Target Start/End: Original strand, 34134801 - 34134861
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  34134801 gttgcagagatcaactgaagaaattctcaacagtttgattccgctaaaagatcgtgattag 34134861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18119 - 17899
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18119 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgagcatg 18021  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  18020 ttttgggagcacaacatgttatagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtc 17921  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcatt 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  17920 attagttagggtaaggtgcatt 17899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17352 - 17299
Alignment:
Q  264 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17352 aatgtaatgtgatcacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 17299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 24900 - 25076
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24900 agacacaaggagggtggaatacgttcggtatagacgtacaacgctcgaggaggggagagtagcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaatgtg 24999  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| | || ||||| |||||||||||||||||    
T  25000 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatctatttgcggataacattgctaagatcaactgaagatat 25076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 63971 - 64095
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  63971 agacacaaggagggtggagcacgttcggtataaatgtccaacgctcgacaaggg-agagtatcattcagttgagtggaatcaatgaacgacgaaaacgtg 64069  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  64070 acgagcatgttttgggagcacaacat 64095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 246
Target Start/End: Original strand, 64098 - 64176
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  64098 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtagggtaaggtacattcc 64176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0618 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0618
Description:

Target: scaffold0618; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4983 - 4907
Alignment:
Q  241 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4983 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaataagcataatacattttgttttgaa 4907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 246
Target Start/End: Original strand, 85462 - 85553
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  85462 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattcagccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattcc 85553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 246
Target Start/End: Original strand, 14604 - 14695
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14604 tatgtgggtgaagttgcttagatcaacttaagatttcatcaaaagtatgataccgccataagatcgtcgttagttagggtaacgtgcattcc 14695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 220
Target Start/End: Original strand, 5453 - 5550
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||   || |||||| |||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  5453 ttttggcagcacaacatgttcccatggatcaatatgtttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacagtttgatttcgccagaagatcg 5550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 36775 - 36860
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaa 215  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||  || |||||| |||||||  ||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||    
T  36775 agcacatcatgttcccgtggatcgatatgcttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaagagtttaattccgctagaa 36860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 107891 - 107847
Alignment:
Q  273 tgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 317  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  107891 tgataacatatatagttgattatgcataacacatgttgttttgaa 107847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2290 times since January 2019
Visitors: 8474