View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1631_low_1 (Length: 574)

Name: NF1631_low_1
Description: NF1631
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1631_low_1
NF1631_low_1
[»] chr4 (205 HSPs)
chr4 (36-561)||(26866637-26867160)
chr4 (8-249)||(20454930-20455173)
chr4 (1-249)||(625708-625958)
chr4 (1-249)||(37776475-37776725)
chr4 (1-249)||(14793764-14794014)
chr4 (1-249)||(33988536-33988783)
chr4 (2-249)||(36900852-36901100)
chr4 (1-249)||(30049823-30050075)
chr4 (1-246)||(46950041-46950288)
chr4 (1-249)||(13620595-13620845)
chr4 (1-249)||(17339124-17339376)
chr4 (7-249)||(48030359-48030603)
chr4 (1-249)||(26625743-26625993)
chr4 (1-196)||(30523764-30523961)
chr4 (1-249)||(36990960-36991212)
chr4 (1-249)||(23777543-23777792)
chr4 (1-249)||(55014706-55014957)
chr4 (1-249)||(55562865-55563117)
chr4 (4-289)||(37518011-37518298)
chr4 (4-289)||(37522227-37522514)
chr4 (1-244)||(40809607-40809854)
chr4 (4-249)||(13389654-13389900)
chr4 (1-249)||(36129830-36130081)
chr4 (1-229)||(47683155-47683386)
chr4 (1-249)||(54623847-54624098)
chr4 (1-249)||(37842221-37842471)
chr4 (28-249)||(38899812-38900034)
chr4 (1-249)||(45096906-45097156)
chr4 (1-249)||(54877755-54878003)
chr4 (1-245)||(56432568-56432817)
chr4 (1-299)||(25123983-25124286)
chr4 (1-164)||(54535921-54536087)
chr4 (1-248)||(29460444-29460695)
chr4 (1-249)||(37173879-37174133)
chr4 (12-249)||(18003989-18004228)
chr4 (5-249)||(16545727-16545974)
chr4 (1-249)||(20767955-20768207)
chr4 (1-249)||(31937122-31937374)
chr4 (1-246)||(38027181-38027430)
chr4 (1-249)||(375470-375722)
chr4 (1-139)||(49489880-49490019)
chr4 (1-164)||(50450964-50451130)
chr4 (10-244)||(55876431-55876667)
chr4 (12-245)||(41620564-41620799)
chr4 (1-229)||(6462430-6462661)
chr4 (1-164)||(41191275-41191441)
chr4 (4-229)||(50602840-50603068)
chr4 (12-249)||(51717849-51718089)
chr4 (1-241)||(52850193-52850437)
chr4 (1-249)||(45921477-45921726)
chr4 (3-244)||(15500353-15500598)
chr4 (28-249)||(18706411-18706633)
chr4 (4-229)||(34963450-34963678)
chr4 (4-249)||(39114631-39114880)
chr4 (1-247)||(49373434-49373682)
chr4 (1-240)||(1173616-1173860)
chr4 (1-249)||(20788977-20789229)
chr4 (1-164)||(32898978-32899144)
chr4 (1-218)||(20761564-20761785)
chr4 (1-163)||(23623769-23623933)
chr4 (1-163)||(39670858-39671023)
chr4 (1-249)||(51335839-51336093)
chr4 (8-120)||(55777071-55777183)
chr4 (10-136)||(4143549-4143676)
chr4 (1-249)||(29519904-29520155)
chr4 (36-249)||(36391900-36392116)
chr4 (1-246)||(37639627-37639875)
chr4 (1-229)||(48241389-48241621)
chr4 (1-120)||(5734387-5734507)
chr4 (8-120)||(55841251-55841363)
chr4 (61-249)||(9808398-9808589)
chr4 (3-249)||(28298111-28298362)
chr4 (7-156)||(49793231-49793381)
chr4 (27-296)||(34948419-34948688)
chr4 (31-225)||(47311360-47311556)
chr4 (36-249)||(9328015-9328231)
chr4 (28-164)||(18882485-18882623)
chr4 (36-249)||(35675695-35675911)
chr4 (1-164)||(45850463-45850629)
chr4 (1-118)||(39879917-39880035)
chr4 (36-249)||(47806906-47807122)
chr4 (1-249)||(55631999-55632250)
chr4 (36-249)||(54676593-54676810)
chr4 (1-249)||(1028564-1028816)
chr4 (36-249)||(10588120-10588336)
chr4 (36-249)||(15241525-15241741)
chr4 (36-249)||(32032766-32032982)
chr4 (44-249)||(33413564-33413772)
chr4 (36-249)||(43387768-43387984)
chr4 (36-249)||(47299013-47299229)
chr4 (36-246)||(50533932-50534145)
chr4 (36-249)||(53276961-53277177)
chr4 (29-156)||(18018798-18018926)
chr4 (36-242)||(30771575-30771784)
chr4 (36-249)||(6753571-6753787)
chr4 (1-249)||(20285760-20286012)
chr4 (36-249)||(20391213-20391429)
chr4 (36-249)||(24754124-24754340)
chr4 (36-249)||(49228493-49228709)
chr4 (36-249)||(52978028-52978244)
chr4 (36-244)||(29427540-29427751)
chr4 (1-249)||(4035871-4036122)
chr4 (36-248)||(422704-422918)
chr4 (29-154)||(46480788-46480915)
chr4 (36-249)||(34272994-34273210)
chr4 (36-249)||(37352589-37352805)
chr4 (36-249)||(44294835-44295051)
chr4 (36-249)||(5375333-5375548)
chr4 (1-299)||(39184270-39184568)
chr4 (1-249)||(2615683-2615936)
chr4 (1-249)||(4416011-4416262)
chr4 (1-249)||(5743399-5743650)
chr4 (38-164)||(49329622-49329750)
chr4 (36-248)||(4455108-4455324)
chr4 (36-229)||(37364583-37364779)
chr4 (36-249)||(45742581-45742797)
chr4 (36-249)||(47228503-47228719)
chr4 (44-249)||(50424637-50424845)
chr4 (36-249)||(51536213-51536429)
chr4 (36-249)||(17609797-17610012)
chr4 (1-249)||(29014064-29014315)
chr4 (46-249)||(37357488-37357694)
chr4 (62-249)||(50352110-50352300)
chr4 (1-249)||(25708420-25708670)
chr4 (1-246)||(39144453-39144701)
chr4 (44-150)||(6807492-6807600)
chr4 (1-249)||(20747216-20747467)
chr4 (82-249)||(41191449-41191619)
chr4 (11-249)||(52870690-52870931)
chr4 (1-164)||(6656485-6656649)
chr4 (36-249)||(8343953-8344167)
chr4 (1-164)||(25474948-25475112)
chr4 (44-164)||(19281874-19281996)
chr4 (36-249)||(30745575-30745790)
chr4 (36-164)||(33501704-33501834)
chr4 (1-246)||(4549629-4549877)
chr4 (103-249)||(49490011-49490158)
chr4 (36-152)||(3168211-3168326)
chr4 (6-245)||(53629842-53630084)
chr4 (7-249)||(1859190-1859434)
chr4 (27-246)||(6083333-6083554)
chr4 (1-163)||(17468023-17468185)
chr4 (67-164)||(41333857-41333955)
chr4 (1-164)||(28501127-28501292)
chr4 (36-154)||(36211399-36211519)
chr4 (28-122)||(27009608-27009704)
chr4 (1-163)||(30868539-30868704)
chr4 (79-164)||(38405643-38405730)
chr4 (1-100)||(48148663-48148763)
chr4 (67-163)||(28495517-28495615)
chr4 (47-249)||(39184037-39184240)
chr4 (67-154)||(20783330-20783416)
chr4 (67-164)||(47109627-47109725)
chr4 (4-124)||(20180660-20180780)
chr4 (67-164)||(26889708-26889804)
chr4 (67-164)||(37780022-37780118)
chr4 (67-140)||(42598519-42598592)
chr4 (68-164)||(6629284-6629379)
chr4 (67-164)||(13138858-13138956)
chr4 (67-164)||(13498293-13498391)
chr4 (67-164)||(23390155-23390253)
chr4 (67-164)||(30010659-30010757)
chr4 (1-110)||(51329521-51329631)
chr4 (67-164)||(32684729-32684825)
chr4 (1-154)||(53564096-53564251)
chr4 (67-124)||(54158710-54158767)
chr4 (47-123)||(4094759-4094834)
chr4 (71-164)||(8418156-8418251)
chr4 (67-154)||(35909784-35909872)
chr4 (68-144)||(38615983-38616058)
chr4 (4-231)||(52966159-52966389)
chr4 (67-153)||(29508948-29509035)
chr4 (5-123)||(50649100-50649219)
chr4 (83-154)||(52181009-52181079)
chr4 (68-154)||(5840103-5840188)
chr4 (67-152)||(13549123-13549209)
chr4 (67-164)||(18872849-18872947)
chr4 (1-151)||(43456297-43456447)
chr4 (204-249)||(2738832-2738877)
chr4 (67-164)||(3085576-3085672)
chr4 (1-42)||(6629468-6629509)
chr4 (29-122)||(10497542-10497635)
chr4 (98-164)||(20286182-20286249)
chr4 (77-164)||(22130324-22130412)
chr4 (204-249)||(23621504-23621549)
chr4 (204-249)||(36040908-36040953)
chr4 (68-164)||(48801427-48801524)
chr4 (31-140)||(49613931-49614040)
chr4 (68-164)||(20128636-20128732)
chr4 (1-124)||(24072222-24072345)
chr4 (116-163)||(2507746-2507793)
chr4 (137-249)||(42528469-42528582)
chr4 (1-42)||(13548980-13549022)
chr4 (67-164)||(19596248-19596346)
chr4 (204-246)||(32899165-32899207)
chr4 (204-249)||(468451-468496)
chr4 (67-124)||(7776751-7776807)
chr4 (204-249)||(11469182-11469227)
chr4 (204-249)||(11522234-11522279)
chr4 (204-249)||(19282027-19282072)
chr4 (83-151)||(50621563-50621632)
chr4 (204-249)||(51329712-51329757)
chr4 (204-249)||(52181130-52181175)
chr4 (204-248)||(39670771-39670815)
chr4 (128-164)||(53906149-53906185)
[»] chr6 (98 HSPs)
chr6 (1-249)||(15498675-15498925)
chr6 (1-249)||(31091491-31091741)
chr6 (1-249)||(8670181-8670431)
chr6 (1-249)||(402362-402612)
chr6 (1-249)||(31149987-31150237)
chr6 (1-249)||(1729842-1730093)
chr6 (1-249)||(13866641-13866891)
chr6 (1-249)||(20449920-20450172)
chr6 (9-249)||(390369-390610)
chr6 (1-187)||(20373144-20373331)
chr6 (1-249)||(925674-925924)
chr6 (1-249)||(34915282-34915534)
chr6 (1-249)||(31487110-31487362)
chr6 (1-249)||(16272707-16272957)
chr6 (1-249)||(34126187-34126437)
chr6 (1-249)||(11847617-11847869)
chr6 (6-249)||(19097547-19097792)
chr6 (1-249)||(25045382-25045634)
chr6 (1-245)||(15355295-15355541)
chr6 (7-229)||(33773643-33773871)
chr6 (1-249)||(1147008-1147258)
chr6 (1-249)||(9341884-9342136)
chr6 (1-249)||(13647868-13648120)
chr6 (1-289)||(2090665-2090957)
chr6 (1-249)||(7772222-7772474)
chr6 (29-153)||(23578194-23578320)
chr6 (1-245)||(23604512-23604760)
chr6 (10-245)||(31711598-31711835)
chr6 (1-249)||(12143825-12144075)
chr6 (1-247)||(16122302-16122551)
chr6 (1-249)||(19418863-19419115)
chr6 (1-225)||(13010859-13011087)
chr6 (1-244)||(15966900-15967148)
chr6 (1-249)||(17227267-17227519)
chr6 (1-249)||(34301571-34301823)
chr6 (2-148)||(11104699-11104850)
chr6 (44-249)||(6147429-6147637)
chr6 (1-249)||(13690471-13690723)
chr6 (43-249)||(30248693-30248902)
chr6 (36-245)||(33487881-33488093)
chr6 (36-246)||(17175240-17175453)
chr6 (36-246)||(25024281-25024494)
chr6 (36-249)||(10195769-10195985)
chr6 (36-248)||(25197199-25197414)
chr6 (1-248)||(23397879-23398129)
chr6 (36-249)||(230882-231097)
chr6 (36-249)||(287189-287405)
chr6 (1-249)||(1779784-1780035)
chr6 (1-249)||(9388529-9388782)
chr6 (4-88)||(9660136-9660221)
chr6 (1-249)||(34741512-34741763)
chr6 (27-249)||(12105830-12106055)
chr6 (1-164)||(32615119-32615284)
chr6 (8-248)||(344911-345158)
chr6 (43-164)||(8175787-8175910)
chr6 (8-244)||(15287190-15287428)
chr6 (27-151)||(2746310-2746436)
chr6 (46-246)||(5457461-5457664)
chr6 (61-228)||(5576180-5576348)
chr6 (89-249)||(9660505-9660668)
chr6 (36-249)||(8743233-8743448)
chr6 (27-249)||(345513-345737)
chr6 (1-110)||(29036262-29036372)
chr6 (71-164)||(6840082-6840175)
chr6 (36-161)||(15126601-15126724)
chr6 (68-164)||(33012473-33012570)
chr6 (68-164)||(4823103-4823198)
chr6 (28-78)||(17950510-17950560)
chr6 (61-154)||(235899-235993)
chr6 (67-164)||(11161983-11162083)
chr6 (69-164)||(17952167-17952264)
chr6 (67-164)||(8217528-8217624)
chr6 (27-244)||(3177232-3177449)
chr6 (1-124)||(6418045-6418168)
chr6 (67-164)||(22998852-22998950)
chr6 (67-164)||(23789454-23789552)
chr6 (67-164)||(27581518-27581616)
chr6 (84-164)||(6418476-6418557)
chr6 (83-164)||(22710398-22710478)
chr6 (88-249)||(11656172-11656337)
chr6 (1-164)||(23282543-23282711)
chr6 (77-164)||(9299246-9299335)
chr6 (83-164)||(11200726-11200808)
chr6 (60-249)||(22852131-22852322)
chr6 (67-164)||(28980662-28980762)
chr6 (67-164)||(27310566-27310662)
chr6 (67-154)||(13321135-13321223)
chr6 (83-154)||(14630045-14630115)
chr6 (204-246)||(6417924-6417966)
chr6 (83-164)||(9038772-9038854)
chr6 (36-110)||(18105947-18106021)
chr6 (84-164)||(4175374-4175455)
chr6 (67-124)||(8345404-8345460)
chr6 (204-249)||(11104618-11104663)
chr6 (67-124)||(17992163-17992219)
chr6 (204-249)||(29036171-29036216)
chr6 (36-124)||(5186271-5186358)
chr6 (95-163)||(7762068-7762136)
[»] chr7 (168 HSPs)
chr7 (1-249)||(1574765-1575015)
chr7 (1-246)||(23919781-23920028)
chr7 (1-249)||(11647575-11647825)
chr7 (1-249)||(27529274-27529524)
chr7 (1-244)||(12930371-12930616)
chr7 (1-249)||(43279751-43280000)
chr7 (1-249)||(6799285-6799535)
chr7 (1-249)||(32759604-32759854)
chr7 (1-249)||(35569393-35569643)
chr7 (1-249)||(3024630-3024878)
chr7 (1-249)||(47323268-47323520)
chr7 (11-245)||(10475751-10475989)
chr7 (1-249)||(9998333-9998586)
chr7 (1-249)||(45907291-45907541)
chr7 (1-164)||(20950779-20950942)
chr7 (1-249)||(28016285-28016537)
chr7 (6-249)||(42298172-42298417)
chr7 (1-163)||(44780132-44780297)
chr7 (1-249)||(2289755-2290007)
chr7 (1-249)||(7607373-7607625)
chr7 (29-249)||(787979-788202)
chr7 (8-246)||(19920612-19920851)
chr7 (1-249)||(9140272-9140524)
chr7 (1-244)||(21119609-21119856)
chr7 (27-249)||(47657432-47657655)
chr7 (1-249)||(4856852-4857107)
chr7 (1-164)||(41803209-41803375)
chr7 (1-249)||(43081298-43081549)
chr7 (1-231)||(19619097-19619331)
chr7 (4-249)||(30895606-30895855)
chr7 (1-249)||(21870075-21870327)
chr7 (1-164)||(23109199-23109365)
chr7 (1-123)||(26842946-26843069)
chr7 (9-249)||(37913121-37913365)
chr7 (1-281)||(26736494-26736784)
chr7 (31-163)||(32117995-32118127)
chr7 (1-248)||(38736499-38736748)
chr7 (1-164)||(27325908-27326073)
chr7 (1-244)||(27881827-27882074)
chr7 (1-122)||(33381358-33381480)
chr7 (1-164)||(16957767-16957932)
chr7 (1-245)||(23364064-23364312)
chr7 (1-164)||(24299943-24300109)
chr7 (34-249)||(48008980-48009200)
chr7 (1-245)||(41444252-41444500)
chr7 (29-249)||(43093176-43093399)
chr7 (36-248)||(7703596-7703810)
chr7 (1-164)||(12130180-12130344)
chr7 (36-249)||(25247466-25247682)
chr7 (1-246)||(30737751-30738001)
chr7 (36-249)||(32872150-32872366)
chr7 (36-249)||(39871388-39871604)
chr7 (36-249)||(1275508-1275724)
chr7 (36-249)||(6387371-6387587)
chr7 (36-249)||(8612350-8612566)
chr7 (36-249)||(17491561-17491777)
chr7 (36-249)||(17561437-17561653)
chr7 (1-152)||(21870831-21870985)
chr7 (36-249)||(31200139-31200355)
chr7 (36-249)||(34978852-34979068)
chr7 (36-249)||(36646412-36646628)
chr7 (47-249)||(25950876-25951083)
chr7 (36-249)||(7449315-7449530)
chr7 (36-249)||(41252137-41252352)
chr7 (4-123)||(17878119-17878239)
chr7 (42-248)||(36697912-36698121)
chr7 (36-249)||(8290949-8291165)
chr7 (36-249)||(29064232-29064448)
chr7 (36-249)||(31458043-31458259)
chr7 (36-249)||(32814479-32814695)
chr7 (36-249)||(33858642-33858857)
chr7 (36-249)||(40300276-40300492)
chr7 (36-249)||(41025871-41026087)
chr7 (36-249)||(44547472-44547688)
chr7 (1-245)||(48521076-48521324)
chr7 (1-249)||(9036669-9036920)
chr7 (36-248)||(36711074-36711288)
chr7 (27-164)||(38361283-38361419)
chr7 (1-244)||(41787302-41787542)
chr7 (36-249)||(26255141-26255357)
chr7 (36-249)||(29285812-29286028)
chr7 (36-249)||(29642919-29643134)
chr7 (36-249)||(39197764-39197980)
chr7 (1-249)||(21295197-21295448)
chr7 (36-249)||(34012294-34012509)
chr7 (1-249)||(38858344-38858595)
chr7 (42-248)||(2006522-2006731)
chr7 (42-249)||(7400174-7400387)
chr7 (1-151)||(40120994-40121147)
chr7 (61-249)||(43440910-43441101)
chr7 (1-249)||(29176992-29177243)
chr7 (36-249)||(41002930-41003145)
chr7 (36-164)||(17327003-17327133)
chr7 (36-163)||(23320788-23320917)
chr7 (1-249)||(34895903-34896155)
chr7 (1-249)||(38428194-38428444)
chr7 (47-163)||(10538917-10539033)
chr7 (8-154)||(31802869-31803015)
chr7 (28-110)||(12616178-12616260)
chr7 (49-249)||(18112955-18113158)
chr7 (55-160)||(2470870-2470977)
chr7 (3-249)||(44719173-44719418)
chr7 (36-164)||(47534679-47534806)
chr7 (60-164)||(21587539-21587645)
chr7 (1-247)||(28060766-28061014)
chr7 (36-249)||(31581724-31581940)
chr7 (1-154)||(27813642-27813797)
chr7 (27-164)||(3775961-3776099)
chr7 (67-164)||(21135380-21135478)
chr7 (67-164)||(42887887-42887985)
chr7 (29-164)||(45777987-45778124)
chr7 (90-156)||(3796060-3796128)
chr7 (1-164)||(19845407-19845574)
chr7 (67-164)||(30534837-30534933)
chr7 (1-164)||(46148563-46148728)
chr7 (4-138)||(5524740-5524878)
chr7 (128-249)||(17317487-17317609)
chr7 (1-124)||(20075021-20075144)
chr7 (60-164)||(49110826-49110932)
chr7 (118-249)||(26299361-26299493)
chr7 (119-249)||(9233436-9233567)
chr7 (1-249)||(9299143-9299398)
chr7 (1-249)||(9303692-9303947)
chr7 (67-164)||(32699513-32699609)
chr7 (67-164)||(35888444-35888540)
chr7 (44-164)||(46266159-46266282)
chr7 (63-164)||(7400523-7400626)
chr7 (47-249)||(18751774-18751975)
chr7 (83-164)||(32964218-32964300)
chr7 (77-164)||(33342269-33342356)
chr7 (36-110)||(10071842-10071916)
chr7 (67-164)||(23801990-23802088)
chr7 (67-164)||(49044927-49045025)
chr7 (204-249)||(33381520-33381565)
chr7 (67-163)||(45722140-45722237)
chr7 (67-164)||(47648985-47649083)
chr7 (88-164)||(19292970-19293047)
chr7 (36-154)||(22991521-22991639)
chr7 (90-163)||(3881371-3881445)
chr7 (67-152)||(9682745-9682831)
chr7 (1-164)||(18312321-18312485)
chr7 (67-164)||(24504816-24504914)
chr7 (36-138)||(29629875-29629976)
chr7 (83-164)||(33683007-33683089)
chr7 (204-249)||(12129723-12129768)
chr7 (204-249)||(20074935-20074980)
chr7 (79-164)||(20182099-20182184)
chr7 (204-248)||(12616329-12616373)
chr7 (1-52)||(26299493-26299545)
chr7 (79-122)||(25530750-25530793)
chr7 (1-42)||(9682602-9682644)
chr7 (1-110)||(32643544-32643654)
chr7 (70-140)||(33682869-33682938)
chr7 (60-110)||(34900779-34900829)
chr7 (83-164)||(37915274-37915356)
chr7 (46-156)||(43008251-43008360)
chr7 (68-163)||(46415103-46415199)
chr7 (67-124)||(6910622-6910678)
chr7 (67-124)||(19497419-19497475)
chr7 (204-249)||(22991690-22991735)
chr7 (204-249)||(32699650-32699695)
chr7 (67-163)||(34693534-34693631)
chr7 (96-164)||(44510179-44510248)
chr7 (204-249)||(44510289-44510334)
chr7 (204-249)||(45778168-45778213)
chr7 (204-249)||(47534850-47534894)
chr7 (71-123)||(31137214-31137266)
chr7 (204-248)||(31769278-31769322)
[»] chr5 (161 HSPs)
chr5 (1-249)||(20142000-20142250)
chr5 (1-289)||(14913655-14913945)
chr5 (4-249)||(32964178-32964425)
chr5 (1-249)||(7940498-7940748)
chr5 (1-249)||(9020741-9020991)
chr5 (1-249)||(20987954-20988204)
chr5 (1-249)||(16440977-16441227)
chr5 (1-249)||(4194728-4194976)
chr5 (11-249)||(27873094-27873336)
chr5 (1-249)||(13759188-13759438)
chr5 (1-249)||(3028059-3028313)
chr5 (1-249)||(23285081-23285335)
chr5 (1-249)||(40643140-40643392)
chr5 (1-249)||(10511211-10511462)
chr5 (1-245)||(21239149-21239396)
chr5 (12-245)||(14649235-14649472)
chr5 (1-164)||(14435934-14436100)
chr5 (1-249)||(20186547-20186799)
chr5 (1-249)||(23285815-23286067)
chr5 (1-249)||(9064953-9065205)
chr5 (1-249)||(43060150-43060402)
chr5 (1-164)||(20517976-20518139)
chr5 (1-230)||(31507360-31507593)
chr5 (1-297)||(12743820-12744122)
chr5 (1-249)||(34889017-34889269)
chr5 (1-247)||(34332266-34332516)
chr5 (8-245)||(14619299-14619540)
chr5 (1-249)||(40951782-40952034)
chr5 (1-248)||(9268032-9268283)
chr5 (1-249)||(4976028-4976281)
chr5 (1-164)||(8144459-8144625)
chr5 (1-249)||(18615801-18616057)
chr5 (1-249)||(39121429-39121681)
chr5 (28-245)||(28140687-28140907)
chr5 (1-249)||(35039043-35039294)
chr5 (1-249)||(38371713-38371964)
chr5 (1-249)||(23092379-23092631)
chr5 (44-249)||(24307924-24308132)
chr5 (44-249)||(24365191-24365399)
chr5 (1-249)||(35547307-35547559)
chr5 (7-245)||(39984819-39985063)
chr5 (1-249)||(7734880-7735133)
chr5 (3-248)||(21749977-21750226)
chr5 (1-164)||(30182972-30183138)
chr5 (1-164)||(41418440-41418606)
chr5 (1-224)||(39758958-39759185)
chr5 (4-163)||(17714700-17714863)
chr5 (1-249)||(9264019-9264271)
chr5 (1-249)||(8283851-8284099)
chr5 (6-249)||(22657814-22658061)
chr5 (1-122)||(26889593-26889715)
chr5 (36-249)||(1265995-1266211)
chr5 (1-249)||(6672967-6673219)
chr5 (1-249)||(15190554-15190806)
chr5 (36-249)||(31888939-31889155)
chr5 (1-153)||(42030339-42030493)
chr5 (28-154)||(15774830-15774958)
chr5 (4-244)||(40738461-40738704)
chr5 (1-249)||(16152994-16153246)
chr5 (36-249)||(17674433-17674649)
chr5 (36-249)||(22527738-22527954)
chr5 (36-249)||(28041126-28041342)
chr5 (36-249)||(34662250-34662466)
chr5 (29-164)||(11780886-11781023)
chr5 (1-249)||(19571669-19571929)
chr5 (1-164)||(37034279-37034443)
chr5 (7-249)||(7951607-7951852)
chr5 (36-249)||(10734296-10734512)
chr5 (1-249)||(13862734-13862986)
chr5 (44-249)||(15521725-15521933)
chr5 (45-249)||(5528020-5528227)
chr5 (1-249)||(9828439-9828690)
chr5 (46-249)||(32617561-32617767)
chr5 (36-246)||(25600835-25601048)
chr5 (28-248)||(13703577-13703797)
chr5 (36-249)||(32478184-32478400)
chr5 (36-249)||(42561124-42561340)
chr5 (36-249)||(41641141-41641361)
chr5 (36-249)||(3686529-3686745)
chr5 (36-249)||(4752993-4753209)
chr5 (36-249)||(4984891-4985107)
chr5 (1-243)||(41383912-41384157)
chr5 (8-249)||(3497547-3497791)
chr5 (8-249)||(16127305-16127549)
chr5 (1-224)||(17592541-17592767)
chr5 (1-249)||(40004149-40004400)
chr5 (1-88)||(12807132-12807220)
chr5 (1-249)||(13660907-13661156)
chr5 (1-223)||(186170-186395)
chr5 (27-249)||(31158194-31158415)
chr5 (36-156)||(15674917-15675037)
chr5 (1-88)||(20988252-20988340)
chr5 (88-249)||(12806692-12806856)
chr5 (1-249)||(22581475-22581726)
chr5 (87-249)||(20987793-20987958)
chr5 (67-164)||(41686922-41687018)
chr5 (36-163)||(8100169-8100297)
chr5 (4-164)||(35495014-35495174)
chr5 (36-110)||(33639478-33639552)
chr5 (47-156)||(9438877-9438989)
chr5 (67-163)||(25837141-25837238)
chr5 (60-162)||(26076188-26076292)
chr5 (36-249)||(26605391-26605614)
chr5 (1-249)||(38161520-38161771)
chr5 (1-124)||(23286221-23286344)
chr5 (36-249)||(3160302-3160518)
chr5 (68-163)||(35784728-35784822)
chr5 (1-164)||(13335419-13335585)
chr5 (67-164)||(27834076-27834174)
chr5 (83-164)||(28414507-28414589)
chr5 (1-249)||(32147339-32147588)
chr5 (1-164)||(18251148-18251317)
chr5 (36-244)||(14789604-14789814)
chr5 (67-154)||(16926595-16926682)
chr5 (4-164)||(37700225-37700388)
chr5 (68-164)||(39692462-39692557)
chr5 (1-154)||(23259878-23260033)
chr5 (67-164)||(5283179-5283277)
chr5 (83-164)||(6328626-6328708)
chr5 (68-122)||(7408872-7408926)
chr5 (3-163)||(8356281-8356443)
chr5 (79-164)||(16099360-16099448)
chr5 (67-164)||(24857687-24857785)
chr5 (67-164)||(31657816-31657914)
chr5 (67-164)||(3629035-3629132)
chr5 (67-164)||(13236073-13236169)
chr5 (29-110)||(13958620-13958701)
chr5 (60-136)||(2328422-2328498)
chr5 (67-154)||(8949957-8950045)
chr5 (4-110)||(10561253-10561356)
chr5 (67-154)||(39971156-39971244)
chr5 (67-153)||(7001445-7001532)
chr5 (61-249)||(14571333-14571521)
chr5 (1-164)||(15559665-15559834)
chr5 (71-164)||(26699448-26699543)
chr5 (71-164)||(26969181-26969276)
chr5 (83-164)||(1303400-1303480)
chr5 (84-140)||(9264756-9264811)
chr5 (71-119)||(10116761-10116809)
chr5 (83-154)||(31642329-31642401)
chr5 (60-164)||(12098693-12098798)
chr5 (68-249)||(16284998-16285181)
chr5 (60-115)||(39181902-39181957)
chr5 (36-110)||(4902969-4903043)
chr5 (67-164)||(11432442-11432546)
chr5 (47-117)||(11937204-11937274)
chr5 (1-42)||(24857556-24857598)
chr5 (68-153)||(24875941-24876027)
chr5 (206-248)||(26894821-26894863)
chr5 (1-42)||(39971014-39971056)
chr5 (204-249)||(4902853-4902898)
chr5 (90-163)||(9727504-9727577)
chr5 (204-249)||(11432356-11432401)
chr5 (172-249)||(23286387-23286465)
chr5 (204-249)||(26674550-26674595)
chr5 (204-249)||(26946156-26946201)
chr5 (204-249)||(30182129-30182174)
chr5 (60-109)||(37331007-37331056)
chr5 (204-249)||(41687059-41687104)
chr5 (204-244)||(13735701-13735741)
chr5 (128-164)||(21252222-21252258)
[»] chr3 (212 HSPs)
chr3 (1-249)||(15996514-15996764)
chr3 (1-249)||(14758884-14759132)
chr3 (1-249)||(20621425-20621675)
chr3 (1-249)||(8321971-8322221)
chr3 (1-249)||(10015530-10015780)
chr3 (1-249)||(43158477-43158727)
chr3 (1-249)||(19897577-19897827)
chr3 (1-249)||(31186804-31187054)
chr3 (1-249)||(48213798-48214048)
chr3 (28-248)||(45323856-45324077)
chr3 (5-244)||(52044540-52044781)
chr3 (1-249)||(17698773-17699023)
chr3 (1-249)||(28673035-28673285)
chr3 (1-229)||(43978226-43978456)
chr3 (1-249)||(45513376-45513626)
chr3 (1-246)||(52291168-52291415)
chr3 (1-249)||(42390643-42390895)
chr3 (1-249)||(50433128-50433380)
chr3 (28-249)||(27688032-27688253)
chr3 (1-249)||(47066980-47067232)
chr3 (8-246)||(50726532-50726772)
chr3 (8-246)||(50786076-50786316)
chr3 (7-249)||(49383389-49383635)
chr3 (1-249)||(46049727-46049977)
chr3 (1-249)||(17753274-17753526)
chr3 (1-249)||(19054594-19054846)
chr3 (1-249)||(46845231-46845483)
chr3 (4-249)||(48909918-48910165)
chr3 (28-249)||(2993305-2993527)
chr3 (1-249)||(35711321-35711571)
chr3 (8-249)||(53361601-53361846)
chr3 (1-249)||(10656737-10656989)
chr3 (1-249)||(13809548-13809800)
chr3 (1-249)||(46862105-46862357)
chr3 (28-249)||(48887713-48887937)
chr3 (1-249)||(1450288-1450540)
chr3 (1-249)||(12906151-12906403)
chr3 (4-164)||(37144228-37144393)
chr3 (1-154)||(32978623-32978777)
chr3 (1-249)||(38071241-38071494)
chr3 (10-246)||(12050143-12050381)
chr3 (4-249)||(21459028-21459277)
chr3 (4-249)||(33212442-33212691)
chr3 (1-249)||(1084693-1084945)
chr3 (1-249)||(6784509-6784760)
chr3 (1-249)||(8546950-8547202)
chr3 (1-249)||(4759088-4759342)
chr3 (1-249)||(51489413-51489664)
chr3 (1-154)||(25879281-25879436)
chr3 (1-225)||(40919024-40919252)
chr3 (6-249)||(50517266-50517513)
chr3 (54-249)||(46861666-46861864)
chr3 (29-246)||(43557221-43557441)
chr3 (1-249)||(43686547-43686799)
chr3 (1-249)||(53164209-53164461)
chr3 (1-249)||(53686736-53686988)
chr3 (48-249)||(10220978-10221180)
chr3 (1-124)||(39625197-39625320)
chr3 (1-151)||(41750927-41751079)
chr3 (1-242)||(41992279-41992509)
chr3 (1-120)||(18658168-18658288)
chr3 (4-164)||(24087080-24087243)
chr3 (36-249)||(9499272-9499488)
chr3 (36-249)||(23700560-23700776)
chr3 (36-249)||(23719015-23719231)
chr3 (36-249)||(23737471-23737687)
chr3 (1-249)||(42801521-42801773)
chr3 (1-229)||(33976549-33976777)
chr3 (4-249)||(50730371-50730621)
chr3 (4-249)||(50782233-50782483)
chr3 (1-249)||(23776236-23776486)
chr3 (36-249)||(22103704-22103920)
chr3 (1-245)||(36005553-36005801)
chr3 (36-249)||(45745824-45746040)
chr3 (4-249)||(35572200-35572446)
chr3 (1-249)||(16434977-16435228)
chr3 (58-164)||(33361498-33361606)
chr3 (1-249)||(44543828-44544079)
chr3 (36-249)||(7181396-7181612)
chr3 (36-249)||(26221334-26221550)
chr3 (36-249)||(43868149-43868365)
chr3 (29-156)||(23308078-23308207)
chr3 (36-249)||(49126973-49127189)
chr3 (1-164)||(54866405-54866570)
chr3 (9-164)||(19350123-19350282)
chr3 (1-249)||(14428656-14428906)
chr3 (36-249)||(7051495-7051711)
chr3 (36-249)||(31531186-31531402)
chr3 (36-249)||(43701224-43701440)
chr3 (1-249)||(45048761-45049013)
chr3 (36-249)||(45252819-45253035)
chr3 (36-249)||(54782692-54782908)
chr3 (45-249)||(7251066-7251273)
chr3 (36-249)||(1641875-1642090)
chr3 (1-249)||(9779979-9780230)
chr3 (27-249)||(25148505-25148726)
chr3 (36-249)||(30040792-30041008)
chr3 (36-249)||(32467471-32467687)
chr3 (36-249)||(35165738-35165953)
chr3 (36-249)||(46703073-46703289)
chr3 (36-249)||(52673233-52673449)
chr3 (36-249)||(54107399-54107615)
chr3 (1-151)||(29383159-29383312)
chr3 (1-249)||(4024098-4024348)
chr3 (1-249)||(10044887-10045137)
chr3 (1-249)||(33868494-33868745)
chr3 (1-249)||(50647684-50647935)
chr3 (1-249)||(52058985-52059236)
chr3 (75-249)||(43408542-43408720)
chr3 (36-245)||(20656085-20656297)
chr3 (36-249)||(21756532-21756748)
chr3 (36-249)||(26593540-26593756)
chr3 (36-249)||(46878214-46878430)
chr3 (1-249)||(17591285-17591536)
chr3 (1-164)||(27646046-27646211)
chr3 (36-249)||(37728759-37728974)
chr3 (36-243)||(54604363-54604573)
chr3 (36-249)||(25148897-25149113)
chr3 (48-249)||(32569043-32569247)
chr3 (1-249)||(20862242-20862494)
chr3 (1-249)||(36099011-36099261)
chr3 (36-249)||(36317432-36317646)
chr3 (6-249)||(39952317-39952563)
chr3 (1-164)||(1111388-1111553)
chr3 (36-249)||(32962880-32963095)
chr3 (68-164)||(49383640-49383738)
chr3 (1-164)||(54927830-54927996)
chr3 (90-249)||(12683011-12683173)
chr3 (1-76)||(43408192-43408268)
chr3 (36-249)||(35867858-35868074)
chr3 (36-118)||(12675198-12675280)
chr3 (7-88)||(46557660-46557742)
chr3 (48-118)||(52177980-52178050)
chr3 (45-164)||(54849495-54849616)
chr3 (90-164)||(44542303-44542379)
chr3 (1-164)||(44561436-44561601)
chr3 (1-245)||(53271642-53271888)
chr3 (68-164)||(38341082-38341177)
chr3 (67-164)||(41392686-41392785)
chr3 (36-248)||(41824155-41824369)
chr3 (36-144)||(20848984-20849094)
chr3 (67-164)||(28810928-28811026)
chr3 (1-153)||(47008242-47008396)
chr3 (4-163)||(21497554-21497715)
chr3 (36-164)||(25916535-25916664)
chr3 (1-164)||(29719451-29719616)
chr3 (36-149)||(26058685-26058800)
chr3 (4-123)||(49791413-49791533)
chr3 (1-249)||(20877679-20877927)
chr3 (1-111)||(25130832-25130943)
chr3 (7-164)||(49543925-49544084)
chr3 (67-164)||(17589683-17589781)
chr3 (36-244)||(26806156-26806366)
chr3 (4-153)||(33290489-33290638)
chr3 (67-164)||(34021802-34021900)
chr3 (1-249)||(51283802-51284054)
chr3 (60-249)||(1572377-1572567)
chr3 (1-164)||(8379809-8379974)
chr3 (60-249)||(26306407-26306598)
chr3 (119-249)||(49543723-49543854)
chr3 (67-143)||(31397930-31398006)
chr3 (67-164)||(42526432-42526530)
chr3 (35-122)||(35938537-35938624)
chr3 (83-153)||(4836516-4836585)
chr3 (67-164)||(12918645-12918743)
chr3 (67-164)||(15095330-15095428)
chr3 (62-244)||(22832411-22832595)
chr3 (66-124)||(38364342-38364400)
chr3 (67-164)||(42044061-42044159)
chr3 (36-106)||(46879210-46879280)
chr3 (67-164)||(48904070-48904168)
chr3 (1-145)||(8503240-8503387)
chr3 (83-151)||(22494483-22494552)
chr3 (67-164)||(24813718-24813814)
chr3 (67-164)||(28875059-28875156)
chr3 (1-164)||(32968966-32969131)
chr3 (1-69)||(33360885-33360954)
chr3 (36-154)||(34265500-34265625)
chr3 (128-242)||(46557752-46557867)
chr3 (68-163)||(4564370-4564466)
chr3 (43-110)||(9582397-9582464)
chr3 (68-115)||(23650639-23650686)
chr3 (67-164)||(31541154-31541252)
chr3 (67-152)||(45404518-45404604)
chr3 (28-66)||(46861882-46861920)
chr3 (67-164)||(48902516-48902614)
chr3 (7-64)||(49543866-49543924)
chr3 (1-121)||(16776486-16776607)
chr3 (71-120)||(20084697-20084746)
chr3 (67-164)||(36584839-36584935)
chr3 (28-123)||(16776653-16776749)
chr3 (67-152)||(29447602-29447688)
chr3 (83-164)||(40215052-40215134)
chr3 (96-164)||(30820010-30820079)
chr3 (1-42)||(24813602-24813644)
chr3 (83-164)||(42755473-42755555)
chr3 (6-74)||(7462845-7462914)
chr3 (204-249)||(7462943-7462988)
chr3 (204-249)||(7886455-7886500)
chr3 (204-249)||(9582289-9582334)
chr3 (204-245)||(16776833-16776874)
chr3 (204-249)||(26058592-26058637)
chr3 (204-249)||(30819924-30819969)
chr3 (204-249)||(33361639-33361684)
chr3 (204-245)||(46879068-46879109)
chr3 (204-249)||(47008448-47008493)
chr3 (1-58)||(49383277-49383334)
chr3 (67-123)||(19667366-19667422)
chr3 (204-244)||(20919133-20919173)
chr3 (204-244)||(20928095-20928135)
chr3 (204-248)||(22527567-22527611)
chr3 (128-164)||(53589530-53589566)
[»] chr1 (189 HSPs)
chr1 (1-249)||(41317640-41317890)
chr1 (1-249)||(4102455-4102705)
chr1 (1-249)||(34931125-34931375)
chr1 (1-249)||(40614646-40614896)
chr1 (1-249)||(52602037-52602287)
chr1 (1-249)||(6089781-6090031)
chr1 (2-249)||(9413067-9413316)
chr1 (1-240)||(229147-229388)
chr1 (1-249)||(7763491-7763740)
chr1 (1-249)||(8923407-8923659)
chr1 (1-249)||(38530891-38531141)
chr1 (1-249)||(48853864-48854114)
chr1 (1-249)||(8472095-8472344)
chr1 (1-231)||(43395412-43395644)
chr1 (1-249)||(21630845-21631098)
chr1 (1-249)||(36694900-36695152)
chr1 (1-249)||(36711001-36711253)
chr1 (1-163)||(44529414-44529577)
chr1 (1-249)||(27530343-27530593)
chr1 (1-249)||(3549078-3549327)
chr1 (13-249)||(41855226-41855464)
chr1 (1-225)||(45285551-45285777)
chr1 (1-249)||(15763361-15763613)
chr1 (1-245)||(9378841-9379090)
chr1 (34-249)||(25509254-25509470)
chr1 (1-229)||(26549857-26550086)
chr1 (1-248)||(19792603-19792852)
chr1 (1-249)||(28052235-28052487)
chr1 (1-249)||(31238765-31239016)
chr1 (1-249)||(12814526-12814778)
chr1 (7-229)||(14089997-14090223)
chr1 (28-249)||(1767631-1767853)
chr1 (1-249)||(15100402-15100660)
chr1 (1-249)||(23530591-23530843)
chr1 (1-164)||(25283938-25284104)
chr1 (7-249)||(36674043-36674289)
chr1 (28-249)||(26544550-26544772)
chr1 (1-289)||(42275900-42276191)
chr1 (1-249)||(9715406-9715658)
chr1 (1-249)||(38261386-38261638)
chr1 (1-249)||(48067634-48067886)
chr1 (1-229)||(5765730-5765961)
chr1 (1-249)||(2489141-2489391)
chr1 (1-156)||(44454565-44454724)
chr1 (1-249)||(27037315-27037567)
chr1 (1-249)||(28888162-28888414)
chr1 (1-151)||(51561070-51561220)
chr1 (1-164)||(14171663-14171827)
chr1 (1-249)||(37584999-37585249)
chr1 (1-249)||(15892303-15892555)
chr1 (1-249)||(28885842-28886094)
chr1 (1-249)||(38613521-38613773)
chr1 (28-225)||(37589011-37589210)
chr1 (11-249)||(15111627-15111873)
chr1 (1-230)||(25271256-25271486)
chr1 (1-230)||(14347187-14347420)
chr1 (4-296)||(24855281-24855576)
chr1 (4-248)||(27575379-27575627)
chr1 (4-134)||(26544377-26544508)
chr1 (1-164)||(896792-896957)
chr1 (28-229)||(31086690-31086894)
chr1 (1-245)||(15289984-15290221)
chr1 (1-124)||(32906705-32906830)
chr1 (1-244)||(9202245-9202491)
chr1 (4-156)||(13343913-13344068)
chr1 (1-243)||(51422165-51422414)
chr1 (36-164)||(51811008-51811138)
chr1 (1-249)||(52430913-52431165)
chr1 (1-249)||(11906967-11907219)
chr1 (1-164)||(25228328-25228494)
chr1 (1-124)||(26547679-26547802)
chr1 (28-163)||(45038130-45038267)
chr1 (28-247)||(3934653-3934875)
chr1 (44-249)||(11741443-11741651)
chr1 (36-249)||(16456682-16456898)
chr1 (36-249)||(45794390-45794606)
chr1 (8-163)||(38175008-38175163)
chr1 (60-244)||(39324576-39324763)
chr1 (36-244)||(50246705-50246916)
chr1 (36-249)||(943412-943628)
chr1 (36-249)||(42872109-42872325)
chr1 (1-246)||(39750121-39750369)
chr1 (1-249)||(30289602-30289853)
chr1 (1-249)||(44649675-44649926)
chr1 (47-230)||(43668188-43668374)
chr1 (36-246)||(47300668-47300881)
chr1 (5-164)||(1837316-1837484)
chr1 (36-249)||(2280000-2280215)
chr1 (36-249)||(16575867-16576083)
chr1 (1-164)||(27974895-27975061)
chr1 (36-249)||(30290311-30290527)
chr1 (46-249)||(32169740-32169945)
chr1 (28-249)||(34503282-34503506)
chr1 (64-245)||(39873488-39873672)
chr1 (8-249)||(15810979-15811223)
chr1 (1-249)||(23542025-23542276)
chr1 (1-249)||(39362934-39363185)
chr1 (1-249)||(44646317-44646568)
chr1 (7-249)||(46075613-46075858)
chr1 (54-249)||(50937824-50938022)
chr1 (1-124)||(35693238-35693362)
chr1 (1-249)||(1039121-1039372)
chr1 (1-249)||(1046027-1046278)
chr1 (1-249)||(45039458-45039709)
chr1 (1-248)||(1047992-1048242)
chr1 (43-249)||(49907067-49907276)
chr1 (1-245)||(31635870-31636117)
chr1 (36-245)||(50008258-50008470)
chr1 (36-248)||(4592625-4592840)
chr1 (1-249)||(7784037-7784291)
chr1 (1-152)||(18172460-18172609)
chr1 (36-249)||(10383817-10384034)
chr1 (1-249)||(37951689-37951940)
chr1 (1-249)||(39497479-39497730)
chr1 (36-164)||(32149086-32149216)
chr1 (36-249)||(45335931-45336147)
chr1 (1-164)||(9424899-9425062)
chr1 (1-99)||(11351441-11351541)
chr1 (1-164)||(36880362-36880525)
chr1 (1-164)||(1427331-1427497)
chr1 (44-229)||(8104073-8104261)
chr1 (46-246)||(10433369-10433573)
chr1 (8-249)||(35984409-35984653)
chr1 (90-164)||(41619998-41620071)
chr1 (36-249)||(18237138-18237353)
chr1 (1-164)||(39425570-39425735)
chr1 (1-150)||(33336947-33337097)
chr1 (54-245)||(50008024-50008217)
chr1 (1-164)||(18114211-18114377)
chr1 (1-249)||(22567115-22567366)
chr1 (1-164)||(27479730-27479895)
chr1 (36-247)||(47296342-47296556)
chr1 (1-164)||(47754457-47754623)
chr1 (8-248)||(47068835-47069078)
chr1 (51-243)||(46506204-46506398)
chr1 (36-164)||(32153569-32153699)
chr1 (44-163)||(1197950-1198073)
chr1 (68-122)||(2606722-2606776)
chr1 (67-164)||(2636993-2637091)
chr1 (36-163)||(13698744-13698872)
chr1 (1-163)||(45810122-45810287)
chr1 (1-110)||(47263645-47263755)
chr1 (27-246)||(31465714-31465936)
chr1 (1-154)||(37850177-37850332)
chr1 (67-154)||(4389751-4389839)
chr1 (36-249)||(7212334-7212550)
chr1 (62-164)||(9700552-9700655)
chr1 (68-164)||(23893505-23893602)
chr1 (50-249)||(47429177-47429378)
chr1 (68-154)||(4371574-4371659)
chr1 (60-154)||(9413516-9413610)
chr1 (28-118)||(27255465-27255555)
chr1 (67-164)||(52429019-52429117)
chr1 (29-164)||(46083998-46084135)
chr1 (67-163)||(49549134-49549231)
chr1 (36-124)||(15616310-15616397)
chr1 (67-164)||(48363821-48363919)
chr1 (84-154)||(29437678-29437749)
chr1 (67-164)||(15302551-15302649)
chr1 (15-124)||(15624646-15624756)
chr1 (67-164)||(17483864-17483962)
chr1 (1-153)||(22940561-22940714)
chr1 (67-164)||(27669974-27670071)
chr1 (61-124)||(31338946-31339011)
chr1 (204-249)||(5858301-5858346)
chr1 (68-109)||(23932941-23932982)
chr1 (204-249)||(39867602-39867647)
chr1 (67-153)||(46271159-46271246)
chr1 (67-112)||(52001528-52001573)
chr1 (128-249)||(11352933-11353055)
chr1 (65-151)||(33163201-33163284)
chr1 (204-248)||(47754065-47754109)
chr1 (60-119)||(8946442-8946501)
chr1 (71-122)||(26768560-26768611)
chr1 (68-164)||(30996876-30996973)
chr1 (83-164)||(4279951-4280033)
chr1 (1-122)||(5966749-5966869)
chr1 (204-246)||(18172377-18172419)
chr1 (1-42)||(29437849-29437891)
chr1 (83-152)||(38920378-38920448)
chr1 (10-154)||(39626985-39627131)
chr1 (67-129)||(47420668-47420730)
chr1 (67-164)||(51467280-51467378)
chr1 (36-97)||(27530946-27531007)
chr1 (204-249)||(32908332-32908377)
chr1 (67-154)||(1867262-1867350)
chr1 (68-116)||(10332367-10332415)
chr1 (95-123)||(10758451-10758479)
chr1 (4-51)||(13274569-13274617)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-249)||(6351-6601)
[»] chr8 (158 HSPs)
chr8 (1-249)||(23487110-23487360)
chr8 (1-244)||(9035280-9035525)
chr8 (1-249)||(18111716-18111966)
chr8 (1-249)||(23687905-23688155)
chr8 (1-249)||(32522584-32522834)
chr8 (1-249)||(33865283-33865532)
chr8 (1-249)||(26016615-26016865)
chr8 (1-249)||(5783886-5784139)
chr8 (1-249)||(33980510-33980759)
chr8 (1-249)||(2944013-2944263)
chr8 (1-249)||(5162350-5162602)
chr8 (1-249)||(39406605-39406857)
chr8 (1-249)||(32474972-32475218)
chr8 (1-249)||(44888726-44888978)
chr8 (1-299)||(8566199-8566498)
chr8 (1-164)||(31886803-31886967)
chr8 (1-249)||(11482859-11483111)
chr8 (1-244)||(257277-257524)
chr8 (1-244)||(658396-658643)
chr8 (1-244)||(844132-844379)
chr8 (1-249)||(44580616-44580870)
chr8 (1-245)||(44747098-44747345)
chr8 (1-230)||(25058107-25058338)
chr8 (1-249)||(39029224-39029473)
chr8 (1-249)||(8072868-8073120)
chr8 (1-164)||(30140214-30140380)
chr8 (5-249)||(40784936-40785184)
chr8 (1-249)||(7683303-7683554)
chr8 (4-249)||(24992561-24992810)
chr8 (1-243)||(7682777-7683022)
chr8 (1-249)||(5774094-5774347)
chr8 (7-249)||(26980722-26980967)
chr8 (28-249)||(35143289-35143511)
chr8 (1-164)||(12825078-12825244)
chr8 (1-249)||(38780881-38781132)
chr8 (1-246)||(45283531-45283778)
chr8 (1-246)||(4778640-4778887)
chr8 (1-249)||(38967189-38967441)
chr8 (1-164)||(45260355-45260520)
chr8 (1-246)||(44021055-44021304)
chr8 (28-164)||(42985283-42985421)
chr8 (36-249)||(8948126-8948342)
chr8 (1-249)||(16448492-16448744)
chr8 (7-121)||(28965643-28965758)
chr8 (28-249)||(34490563-34490787)
chr8 (1-163)||(110203-110370)
chr8 (1-249)||(8797028-8797288)
chr8 (36-249)||(50870-51086)
chr8 (28-249)||(18455766-18455990)
chr8 (76-249)||(29806038-29806214)
chr8 (36-249)||(32675532-32675748)
chr8 (1-249)||(41615952-41616208)
chr8 (36-249)||(8251708-8251924)
chr8 (28-123)||(14625702-14625797)
chr8 (36-249)||(28191950-28192166)
chr8 (36-249)||(38878767-38878983)
chr8 (8-249)||(4631300-4631544)
chr8 (1-244)||(35504319-35504566)
chr8 (1-249)||(40741311-40741561)
chr8 (27-249)||(42218113-42218335)
chr8 (44-164)||(35202970-35203089)
chr8 (36-249)||(4076218-4076434)
chr8 (1-249)||(18641116-18641368)
chr8 (36-249)||(29598270-29598486)
chr8 (36-249)||(36176878-36177094)
chr8 (36-249)||(42598491-42598706)
chr8 (1-94)||(17851249-17851343)
chr8 (1-249)||(29321034-29321285)
chr8 (1-249)||(13153974-13154225)
chr8 (42-249)||(28579685-28579894)
chr8 (1-249)||(29279242-29279493)
chr8 (1-249)||(43653943-43654194)
chr8 (96-249)||(5951164-5951318)
chr8 (36-246)||(41014553-41014766)
chr8 (36-249)||(8951203-8951419)
chr8 (36-249)||(14699498-14699714)
chr8 (42-231)||(16125491-16125683)
chr8 (42-230)||(16117232-16117423)
chr8 (8-249)||(18754190-18754436)
chr8 (1-249)||(28864247-28864498)
chr8 (44-249)||(33745680-33745887)
chr8 (36-249)||(1774388-1774604)
chr8 (36-229)||(38183341-38183537)
chr8 (1-249)||(11798651-11798902)
chr8 (36-247)||(16999045-16999259)
chr8 (1-249)||(17856517-17856768)
chr8 (9-249)||(44502665-44502912)
chr8 (36-246)||(36661701-36661914)
chr8 (55-245)||(44748257-44748450)
chr8 (1-99)||(5952482-5952581)
chr8 (36-249)||(34568536-34568752)
chr8 (36-248)||(5268016-5268230)
chr8 (29-164)||(35203134-35203261)
chr8 (1-249)||(2151980-2152231)
chr8 (36-249)||(12255141-12255356)
chr8 (36-249)||(12260684-12260899)
chr8 (1-249)||(44250859-44251112)
chr8 (36-164)||(21652257-21652387)
chr8 (34-145)||(42747359-42747472)
chr8 (1-164)||(43292738-43292901)
chr8 (1-249)||(45425081-45425330)
chr8 (1-164)||(12802742-12802904)
chr8 (1-164)||(11293785-11293950)
chr8 (84-153)||(13141602-13141670)
chr8 (1-164)||(36941400-36941565)
chr8 (44-153)||(21136998-21137109)
chr8 (44-163)||(28740988-28741108)
chr8 (36-112)||(42885356-42885432)
chr8 (1-120)||(19700749-19700868)
chr8 (8-249)||(13568656-13568895)
chr8 (70-164)||(23894718-23894811)
chr8 (67-164)||(36786599-36786697)
chr8 (1-164)||(17336550-17336714)
chr8 (67-149)||(25056707-25056791)
chr8 (1-151)||(19176836-19176987)
chr8 (1-163)||(23497863-23498027)
chr8 (42-249)||(36245694-36245904)
chr8 (1-87)||(34070971-34071058)
chr8 (90-164)||(31089751-31089825)
chr8 (60-153)||(2767775-2767868)
chr8 (30-164)||(11113911-11114049)
chr8 (36-249)||(14548464-14548679)
chr8 (1-144)||(5449586-5449729)
chr8 (42-153)||(39112543-39112655)
chr8 (67-164)||(39463117-39463215)
chr8 (10-124)||(24260702-24260817)
chr8 (62-244)||(5593470-5593654)
chr8 (71-164)||(30512900-30512991)
chr8 (7-122)||(42486236-42486351)
chr8 (4-116)||(16894062-16894175)
chr8 (1-164)||(31618992-31619154)
chr8 (67-153)||(35179743-35179830)
chr8 (36-113)||(40855981-40856058)
chr8 (67-152)||(5110025-5110111)
chr8 (60-164)||(29738159-29738262)
chr8 (61-137)||(44056870-44056945)
chr8 (67-154)||(44165276-44165364)
chr8 (1-164)||(5244366-5244532)
chr8 (67-164)||(23995708-23995806)
chr8 (60-143)||(41388545-41388630)
chr8 (204-249)||(7758855-7758900)
chr8 (204-249)||(14584077-14584122)
chr8 (1-152)||(23424953-23425106)
chr8 (204-249)||(42885100-42885145)
chr8 (127-164)||(44580921-44580958)
chr8 (1-110)||(19715581-19715692)
chr8 (83-154)||(26625935-26626007)
chr8 (95-164)||(45145376-45145446)
chr8 (113-164)||(29073756-29073807)
chr8 (1-107)||(40530336-40530443)
chr8 (102-164)||(3381970-3382032)
chr8 (36-118)||(7758704-7758785)
chr8 (72-122)||(15021169-15021219)
chr8 (1-245)||(26990567-26990815)
chr8 (1-42)||(35179600-35179642)
chr8 (1-42)||(41898491-41898533)
chr8 (83-120)||(25162652-25162689)
chr8 (67-164)||(36409728-36409826)
[»] chr2 (162 HSPs)
chr2 (1-249)||(11851927-11852177)
chr2 (1-249)||(38214526-38214776)
chr2 (1-248)||(40680404-40680652)
chr2 (1-249)||(8912615-8912865)
chr2 (1-249)||(12889949-12890199)
chr2 (1-249)||(22182664-22182914)
chr2 (1-249)||(41003989-41004239)
chr2 (1-249)||(34944158-34944403)
chr2 (28-248)||(17665571-17665792)
chr2 (1-249)||(40788829-40789079)
chr2 (1-245)||(41834456-41834705)
chr2 (1-249)||(11385909-11386159)
chr2 (1-249)||(23465181-23465431)
chr2 (1-164)||(30779740-30779906)
chr2 (1-247)||(13336496-13336744)
chr2 (12-249)||(20643528-20643767)
chr2 (28-249)||(32712553-32712775)
chr2 (1-249)||(19318794-19319046)
chr2 (1-249)||(18375238-18375490)
chr2 (1-289)||(2060323-2060614)
chr2 (1-249)||(15227890-15228140)
chr2 (1-245)||(2200029-2200277)
chr2 (11-248)||(7531650-7531889)
chr2 (1-249)||(1142997-1143249)
chr2 (1-249)||(24345463-24345715)
chr2 (1-249)||(34113577-34113823)
chr2 (28-249)||(40607748-40607972)
chr2 (1-245)||(11865026-11865275)
chr2 (1-249)||(31751115-31751370)
chr2 (1-243)||(19034465-19034708)
chr2 (1-249)||(19353237-19353489)
chr2 (1-249)||(28840684-28840935)
chr2 (1-227)||(7933488-7933718)
chr2 (1-289)||(25523507-25523797)
chr2 (1-249)||(44573629-44573874)
chr2 (4-249)||(26322035-26322284)
chr2 (1-249)||(1748381-1748633)
chr2 (28-249)||(1859594-1859817)
chr2 (44-224)||(41967987-41968170)
chr2 (1-249)||(24973846-24974098)
chr2 (1-164)||(30466257-30466423)
chr2 (1-249)||(6007618-6007868)
chr2 (1-249)||(38121250-38121502)
chr2 (1-164)||(40173142-40173308)
chr2 (1-249)||(45628620-45628872)
chr2 (1-225)||(7418564-7418792)
chr2 (1-249)||(10399201-10399453)
chr2 (1-246)||(5255583-5255831)
chr2 (36-249)||(20727633-20727849)
chr2 (1-143)||(8295461-8295606)
chr2 (1-249)||(15917820-15918070)
chr2 (1-134)||(16636362-16636496)
chr2 (30-249)||(7666324-7666546)
chr2 (61-249)||(15435677-15435867)
chr2 (36-249)||(25624778-25624991)
chr2 (1-164)||(12619939-12620107)
chr2 (36-249)||(34062440-34062656)
chr2 (36-249)||(34883623-34883839)
chr2 (7-249)||(37229486-37229732)
chr2 (36-249)||(15404483-15404698)
chr2 (29-156)||(3060390-3060518)
chr2 (1-249)||(1359837-1360088)
chr2 (1-244)||(8030758-8030992)
chr2 (1-249)||(16108215-16108466)
chr2 (1-249)||(16805531-16805782)
chr2 (1-249)||(16844813-16845064)
chr2 (54-249)||(18374496-18374693)
chr2 (1-249)||(23789015-23789266)
chr2 (64-246)||(8782515-8782700)
chr2 (43-249)||(13197427-13197636)
chr2 (36-245)||(1943624-1943836)
chr2 (36-249)||(8716667-8716883)
chr2 (36-249)||(32120990-32121206)
chr2 (8-249)||(17408041-17408285)
chr2 (42-249)||(5664684-5664894)
chr2 (1-249)||(8841397-8841648)
chr2 (1-249)||(39833739-39833990)
chr2 (36-249)||(42629418-42629626)
chr2 (36-245)||(20252260-20252472)
chr2 (36-249)||(36130803-36131019)
chr2 (36-249)||(41450562-41450778)
chr2 (44-249)||(4711773-4711980)
chr2 (36-249)||(8990250-8990466)
chr2 (36-229)||(45474381-45474577)
chr2 (1-246)||(11201732-11201980)
chr2 (1-249)||(2438271-2438522)
chr2 (1-249)||(7491890-7492141)
chr2 (1-249)||(22897437-22897688)
chr2 (1-249)||(27560252-27560503)
chr2 (29-164)||(5070440-5070575)
chr2 (36-249)||(16669672-16669888)
chr2 (36-249)||(40680773-40680989)
chr2 (28-98)||(26334652-26334722)
chr2 (28-164)||(8867717-8867850)
chr2 (11-244)||(43701021-43701246)
chr2 (1-119)||(14493555-14493673)
chr2 (60-249)||(9697941-9698132)
chr2 (1-249)||(29239333-29239584)
chr2 (1-164)||(44436224-44436390)
chr2 (60-249)||(7116099-7116290)
chr2 (36-164)||(15353239-15353365)
chr2 (44-244)||(36021033-36021235)
chr2 (1-196)||(1422163-1422360)
chr2 (6-249)||(16456617-16456863)
chr2 (36-247)||(23083541-23083759)
chr2 (1-164)||(13598649-13598814)
chr2 (1-154)||(40544468-40544623)
chr2 (62-164)||(7461290-7461391)
chr2 (67-164)||(28566283-28566381)
chr2 (46-249)||(45151794-45152002)
chr2 (1-164)||(6028474-6028639)
chr2 (61-154)||(29830909-29831002)
chr2 (67-164)||(3904578-3904677)
chr2 (7-123)||(11083431-11083548)
chr2 (44-249)||(12360502-12360708)
chr2 (44-140)||(16809000-16809097)
chr2 (44-140)||(16848281-16848378)
chr2 (1-164)||(30858070-30858235)
chr2 (1-164)||(31633587-31633752)
chr2 (67-154)||(2788145-2788233)
chr2 (67-164)||(4408584-4408682)
chr2 (28-124)||(12296195-12296291)
chr2 (4-71)||(15435587-15435655)
chr2 (67-154)||(18970536-18970624)
chr2 (36-224)||(19630966-19631156)
chr2 (36-224)||(19827867-19828057)
chr2 (67-164)||(21838748-21838846)
chr2 (68-164)||(36556204-36556305)
chr2 (87-164)||(13215646-13215724)
chr2 (66-124)||(16807067-16807125)
chr2 (66-124)||(16846348-16846406)
chr2 (67-164)||(30830150-30830248)
chr2 (28-164)||(8056089-8056226)
chr2 (36-249)||(15571232-15571447)
chr2 (71-144)||(11121136-11121211)
chr2 (67-152)||(11944445-11944531)
chr2 (1-52)||(12970032-12970084)
chr2 (61-121)||(18223700-18223760)
chr2 (61-125)||(29830556-29830619)
chr2 (66-164)||(3095431-3095530)
chr2 (28-123)||(4897421-4897516)
chr2 (28-123)||(4944815-4944910)
chr2 (67-118)||(22302593-22302644)
chr2 (204-246)||(30466153-30466195)
chr2 (1-110)||(32511188-32511298)
chr2 (67-164)||(34432008-34432106)
chr2 (1-164)||(43700750-43700918)
chr2 (204-249)||(10757924-10757969)
chr2 (204-249)||(24300297-24300342)
chr2 (67-164)||(9701202-9701300)
chr2 (116-164)||(12873121-12873169)
chr2 (1-52)||(18374429-18374481)
chr2 (83-164)||(41494445-41494527)
chr2 (84-164)||(41422644-41422725)
chr2 (122-164)||(7446997-7447039)
chr2 (11-68)||(12873177-12873235)
chr2 (77-122)||(26273372-26273417)
chr2 (204-249)||(44436767-44436812)
chr2 (68-137)||(18294150-18294220)
chr2 (67-140)||(18741736-18741811)
chr2 (95-164)||(36750719-36750789)
chr2 (204-244)||(44017791-44017831)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-246)||(48704-48951)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-249)||(45717-45967)
[»] scaffold0907 (1 HSPs)
scaffold0907 (1-248)||(4316-4565)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (1-249)||(4404-4654)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (1-249)||(164260-164510)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (1-249)||(3525-3774)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-249)||(18542-18793)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (1-249)||(3483-3735)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (1-245)||(285-531)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (1-249)||(355042-355292)
scaffold0002 (60-153)||(92321-92416)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-249)||(5196-5446)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (1-249)||(9924-10174)
[»] scaffold0883 (1 HSPs)
scaffold0883 (31-249)||(1766-1987)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (31-249)||(45559-45780)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-249)||(19698-19951)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (9-249)||(4808-5049)
scaffold0443 (204-249)||(4726-4771)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-245)||(9166-9413)
[»] scaffold0280 (3 HSPs)
scaffold0280 (1-143)||(13303-13448)
scaffold0280 (32-88)||(8078-8134)
scaffold0280 (87-223)||(8407-8545)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-164)||(40606-40772)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (36-249)||(31462-31678)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (1-164)||(93917-94083)
scaffold0039 (2-110)||(103804-103913)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (5-249)||(24265-24501)
[»] scaffold0308 (2 HSPs)
scaffold0308 (42-249)||(5067-5277)
scaffold0308 (36-249)||(14124-14339)
[»] scaffold0649 (1 HSPs)
scaffold0649 (36-249)||(4073-4289)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-249)||(47686-47937)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (13-164)||(18486-18640)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-249)||(12110-12361)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (36-249)||(51457-51673)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (36-249)||(258897-259113)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (36-218)||(9529-9714)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (36-249)||(6915-7131)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (36-249)||(61628-61844)
[»] scaffold0368 (1 HSPs)
scaffold0368 (36-249)||(8264-8479)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (1-249)||(65378-65629)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (36-245)||(24407-24617)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (60-249)||(117892-118083)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (36-123)||(13101-13187)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (116-249)||(1304-1438)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (1-154)||(11402-11555)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (67-164)||(17596-17694)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (28-110)||(34290-34372)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (67-164)||(246587-246685)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (44-110)||(156185-156251)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (60-153)||(13693-13788)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (38-124)||(1912-1998)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (44-110)||(9067-9133)
scaffold0311 (204-248)||(9612-9656)
[»] scaffold2116 (1 HSPs)
scaffold2116 (204-249)||(7-52)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (68-154)||(647-733)
scaffold0407 (68-154)||(7111-7197)
[»] scaffold0086 (2 HSPs)
scaffold0086 (68-121)||(22066-22119)
scaffold0086 (62-110)||(32965-33013)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 205)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 36 - 561
Target Start/End: Original strand, 26866637 - 26867160
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatt----ta 131  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||    ||    
T  26866637 aaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcctt-aagagagagatagttagttta 26866735  T
Q  132 tgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaag 230  Q
    ||||||| | ||  ||||||||||| ||  |||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26866736 tgttttccatatgctatttattgctgatacaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaag 26866835  T
Q  231 gtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacggatatagtactatatattgggctgtacggttgaagtaaaaaac 330  Q
    |  |||||||||||| |||         ||||||||| ||||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26866836 gggtcttataaaaagagacaaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagtactatatattgggttgtacagttgaagtaaaaaac 26866934  T
Q  331 gttggctcaacaggatttgtcctaattatatatacattttcgctttgaagcgttagctaacaagtaacaacttcgattatgatagaatatccctatacca 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26866935 gttggctcaacaggatttgtcctaattatatatacattttcg-----aagcgttagctaacaagtaacaacttcgattttgatagaatatccctatacca 26867029  T
Q  431 gaatatttttatatttaatgtaaagatattctaatcaagtataggaatattttatcagactaatcgggttaaacttctaaattatcatgttgacgccaac 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26867030 gaatatttttatatttaatgtaaagatattctaatcaagtataggaatattttatcagactaatcgggttaaacttctaaattatcatgcagacgccaac 26867129  T
Q  531 gaccaatacagattagttaaccaactctttg 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26867130 gaccaatacagattagttaaccaactctttg 26867160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 20454930 - 20455173
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454930 tccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 20455029  T
Q  107 tatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnnta 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||       ||    
T  20455030 tatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaata 20455129  T
Q  206 attaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  20455130 attaatgtagttggaaatggcaaaggggtcttataaaaagggac 20455173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 625708 - 625958
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  625708 tactacctccgtccctaattataggatctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 625807  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  625808 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 625907  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  625908 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 625958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 37776475 - 37776725
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37776475 tactacctccgttcttaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgttttt 37776574  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||      
T  37776575 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggagcatgtatgtaa 37776674  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  37776675 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 37776725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 14793764 - 14794014
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14793764 tactacctccgttcctaattatagggcccttttcaaaaaacaacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 14793863  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  14793864 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 14793963  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  14793964 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaatggac 14794014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 33988536 - 33988783
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33988536 tactacctccatccctaattataggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 33988635  T
Q  101 caattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnn 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||       
T  33988636 caattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt--a 33988733  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33988734 aaaataattaatatagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 33988783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 36900852 - 36901100
Alignment:
Q  2 actacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36900852 actacctccgtccctaattatagggccattttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 36900951  T
Q  101 caattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnn 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||       
T  36900952 caattttatc-cttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaa 36901050  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  36901051 gaaataattaatgtagttggaaatagcaagggagtcttacaaaaagggac 36901100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 30049823 - 30050075
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30049823 tactaccttcgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 30049922  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  30049923 acaattttatcctttaagagagagagttgctttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 30050022  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  30050023 aaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 30050075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 46950288 - 46950041
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctt-ttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  46950288 tactacctccgtccctaattatagggccctcttaaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttctaattagtattgttttc 46950189  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  46950188 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 46950089  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  46950088 ataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 46950041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 13620595 - 13620845
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13620595 tactatctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 13620694  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||      
T  13620695 acaattttatcctttaagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaa 13620794  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13620795 aaaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 13620845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17339376 - 17339124
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17339376 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 17339277  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||       ||||| || |||| ||||||||||||    
T  17339276 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtatgt 17339177  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17339176 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 17339124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48030603 - 48030359
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48030603 ctccgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 48030504  T
Q  106 ttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnnt 204  Q
    ||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||       |    
T  48030503 ttatcctttaagagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat 48030404  T
Q  205 aattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  48030403 aattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 48030359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 26625743 - 26625993
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26625743 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 26625842  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    | ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||      
T  26625843 ataattttatcctttaagagagaattgatttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 26625942  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26625943 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 26625993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 30523764 - 30523961
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30523764 tactacctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 30523863  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30523864 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatgtatgt 30523961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36991212 - 36990960
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttt-tgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36991212 tactacctccgtccctaattataggacccttctgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 36991113  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||       ||||| || |||| ||||||||||||    
T  36991112 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtatgt 36991013  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  36991012 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 36990960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 23777543 - 23777792
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23777543 tactacctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgttataaatatgtttgtaattagtatt-ttttt 23777641  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| |||||||||| |      
T  23777642 acaattttatcctttaagagagatatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatataa 23777741  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  23777742 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggac 23777792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 55014706 - 55014957
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55014706 tactacctccatctctaattataggatccttttgaaaaaataacgg-aattaaaataatgcatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 55014804  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  55014805 acaattttatcttttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 55014904  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  55014905 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttataaaaatggac 55014957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 55562865 - 55563117
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55562865 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 55562964  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  55562965 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 55563064  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  55563065 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 55563117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37518298 - 37518011
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37518298 tacctctgtctctaattataagacctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtttttaca 37518199  T
Q  103 attttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnn 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | || ||||       ||||||||||||| ||||||| ||||         
T  37518198 attttatcctttaagagagagatgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaatgtaaaga 37518099  T
Q  202 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacgga 289  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||          |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37518098 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagtgacaaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaggaacgga 37518011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37522514 - 37522227
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37522514 tacctctgtctctaattataagacctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtttttaca 37522415  T
Q  103 attttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnn 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | || ||||       ||||||||||||| ||||||| ||||         
T  37522414 attttatcctttaagagagagatgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaatgtaaaga 37522315  T
Q  202 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacgga 289  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||          |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37522314 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagtgacaaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaggaacgga 37522227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40809854 - 40809607
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40809854 tactacctccgtccataattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 40809755  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       ||||| || ||||||| |||||||||    
T  40809754 acaattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtattataaatagggacatgtatgt 40809655  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
           ||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  40809654 aaataaataattaatgtagttaaaaatagcaaaagaatcttataaaaa 40809607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 13389654 - 13389900
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13389654 tacctccgtccttaattatatggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtagttagtattgtttttaca 13389753  T
Q  103 attttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnn 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||        ||||||||||||| ||||||||||||         
T  13389754 attttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaga 13389852  T
Q  202 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  13389853 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaaaggac 13389900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 36129830 - 36130081
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36129830 tactacctccgtcc-taattataggatccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattactattgttttt 36129928  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  36129929 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgtttccaacatgttatctattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 36130028  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  36130029 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 36130081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47683386 - 47683155
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  47683386 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatattagtattaaatatgtttgcaattactattattttt 47683287  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47683286 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaggtgtataa-taataggggcatgtatgt 47683188  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
           ||||||||||||||||||||||||||    
T  47683187 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 47683155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54624098 - 54623847
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| || || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54624098 tactacctccgtccctaattatatggccattttgaaaaaaaaatggaaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 54623999  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaaca-tattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||     
T  54623998 acaattttatcctttaagagaaagatggtttatgttttcaacattgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtatgta 54623899  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          |||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  54623898 aataaataattaatgtaggtggaaatagcaagtgagtcttataaaaagggac 54623847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37842471 - 37842221
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaa-taacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37842471 tacttcctccgtctttaattataggacctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 37842372  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||      
T  37842371 acaattttatcctttaagagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 37842272  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37842271 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 37842221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Original strand, 38899812 - 38900034
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38899812 cttttaaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatatttgtaattaatgttgtttttacaattttatcctttaagagagagatga 38899911  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       | ||||||||||| |||||||||| |       |||||||||||||||||||||||    
T  38899912 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatataaaggaataattaatgtagttggaaatagc 38900011  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||   ||||||||||||||||    
T  38900012 aaagtgatcttataaaaagggac 38900034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 45096906 - 45097156
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttga-aaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45096906 tactccctccgttcctaattataggacccttttataaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 45097005  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||| |||| ||| ||||      
T  45097006 acaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaatcatgtataataaataagggtatgcatgtaa 45097105  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45097106 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 45097156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 54877755 - 54878003
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  54877755 tactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagagagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactattattttt 54877854  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnn 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||        |||||||| ||| |||||||||||||      
T  54877855 acaattttatcttttaagagagtgttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa--aaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaa 54877952  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  54877953 agaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 54878003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 56432817 - 56432568
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56432817 tactatctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 56432718  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag-nnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatg 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||        ||||| || ||| ||||||||||||    
T  56432717 acaattttatcctttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtattataaataagggcatgtatg 56432618  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  56432617 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaag 56432568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 25123983 - 25124286
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaa-aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25123983 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 25124082  T
Q  99 tacaattttatctttta--agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatg 195  Q
    |||||||||||| ||||  | |||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||||||||    
T  25124083 tacaattttatcctttaataaagagggttgacttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 25124182  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacggatatagt 295  Q
    |       ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||| |         ||||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||    
T  25124183 taaataaataattaatgaagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggtcaaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 25124282  T
Q  296 acta 299  Q
    ||||    
T  25124283 acta 25124286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 54535921 - 54536087
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54535921 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 54536020  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  54536021 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 54536087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 29460444 - 29460695
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29460444 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattagatatgtttgtaattattattgttttt 29460543  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  29460544 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 29460643  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  29460644 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaaggga 29460695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37174133 - 37173879
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagg-atctttt--gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37174133 tactacctccgtccctaattataggcctcttttaaaaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 37174034  T
Q  98 ttacaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtat 194  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||    
T  37174033 ttacagttttatcctttaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtat 37173934  T
Q  195 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  37173933 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 37173879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18004228 - 18003989
Alignment:
Q  12 tccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18004228 tccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatc 18004129  T
Q  111 ttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaatta 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  18004128 ttttaagagagagatgttttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataatta 18004029  T
Q  210 atgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    | ||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  18004028 aggtagttgaaaataacaaaaggatcttataaaaagggac 18003989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 16545727 - 16545974
Alignment:
Q  5 acctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaa 103  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16545727 accttcgtccttaattatatgatcattttaaaaaaataacgagaattaaaatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaa 16545826  T
Q  104 ttttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtnnnnn 201  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||||||||||||         
T  16545827 ttttatcttttaagagagaaggttggtttatcttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaatagggcatgtatgtaaaga 16545926  T
Q  202 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
      ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  16545927 aataattaatgtaattggaaatatcaaatgattcttataaaaaaggac 16545974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20767955 - 20768207
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc--ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20767955 tactacctccgtccctaattataag-tcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 20768053  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatg 195  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| ||||||||    
T  20768054 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 20768153  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       ||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  20768154 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagagatcttataaaaagggac 20768207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31937374 - 31937122
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31937374 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31937275  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgat---ttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatg 195  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || |   |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| || | |||||||||||    
T  31937274 acaattttatcatttaagaaagag-tgttagattatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatg 31937176  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       ||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  31937175 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggac 31937122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38027430 - 38027181
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38027430 tactacctccatccctaattatatgacccttttggaaaaataactggaattaagatagtggatatttatattaaatatttttgtaattactattgttttt 38027331  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  38027330 acaattttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 38027231  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38027230 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 38027181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 375722 - 375470
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  375722 tactacatccgtccataattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 375623  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||       | |||||| |||| ||||||||||||    
T  375622 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcagcattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgt 375523  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  375522 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 375470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 49489880 - 49490019
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49489880 tactacctccgtccctaattataggacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 49489979  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttca 139  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  49489980 acaattttatcctttaagagagtgttgatttattttttca 49490019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 50450964 - 50451130
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50450964 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatctgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 50451063  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  50451064 acaattttatcctttaagagtgaggaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 50451130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 55876667 - 55876431
Alignment:
Q  10 cgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 108  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55876667 cgtccttaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 55876568  T
Q  109 tcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaat 207  Q
    || ||||| |||||  || |||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||||||| ||||       ||||    
T  55876567 tcctttaaaagagaattggtttatgttttcatcatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataagggcatgcatgtaaaaaaataat 55876468  T
Q  208 taatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  55876467 taatgtagttggaaatagcaaaggaatcttataaaaa 55876431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41620799 - 41620564
Alignment:
Q  12 tccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41620799 tccctaattatagagtcattttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattttatc 41620700  T
Q  111 ttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaatta 209  Q
     ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||| | | |||||||||       ||||||    
T  41620699 ctttaagagatagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatgaagacatgtatgtaaagaaataatta 41620600  T
Q  210 atgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  41620599 atgtagttggaaatagcaaaaatgtcttataaaaag 41620564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 6462430 - 6462661
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6462430 tactacctccgtccataattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 6462529  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||       ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6462530 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataa-taataggggcatgtatgt 6462628  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6462629 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaa 6462661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 41191275 - 41191441
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41191275 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 41191374  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  41191375 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 41191441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 50602840 - 50603068
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50602840 tacctccgtccctaattatataacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 50602939  T
Q  103 attttatcttttaagagag--agatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnn 199  Q
    |||||||  ||||||||||  || ||  ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||       
T  50602940 attttattctttaagagagatagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaa 50603038  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
        ||||||||||||||||||||||||||    
T  50603039 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 50603068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 249
Target Start/End: Original strand, 51717849 - 51718089
Alignment:
Q  12 tccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatct 111  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  51717849 tccctaattataggacctttttgaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtatgtaattactattgtttttacaattttatcc 51717948  T
Q  112 ttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaatt 208  Q
    |||  || |||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||       |||||||  |||| || |||||||||       |||||    
T  51717949 tttaaaaaagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatggacatgtatgtaaagaaataatt 51718048  T
Q  209 aatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  51718049 aatgtagttgaaaatagcaaaggggtattataaaaagggac 51718089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 52850193 - 52850437
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  52850193 tactacatccatccttaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 52850292  T
Q  100 acaattttatcttttaagagag--agatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  52850293 acaattttatcctttaagagagatagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 52850392  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataa 241  Q
           |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52850393 aaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataa 52850437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45921726 - 45921477
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45921726 tactacctctgtccctaattataaggcttttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgctttt 45921627  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||        |||||||| ||| |||||||||||||    
T  45921626 acaattttatcctttaagagagagggttaatttatgtttt---catgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 45921530  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  45921529 aaataaataattaatgtagttgcaaataggaaatgagtcttataaaaagggac 45921477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Original strand, 15500353 - 15500598
Alignment:
Q  3 ctacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttac 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  15500353 ctacctccgtccttaattataggacttttttgaaaaaataacgggaattaagatactagatattcatattaaatatgtttataattactattatttttac 15500452  T
Q  102 aattttatctttta--agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||| ||||  |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||       |||||||| ||| || |||||| |||      
T  15500453 aattttatcctttatgagagaggggtggtttatgttttcaacatgttatttattactaattgaagaaaaagatgtataataaatcggagcatgtgtgtaa 15500552  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  15500553 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaa 15500598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Original strand, 18706411 - 18706633
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 127  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||      
T  18706411 cttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattattattatatttacaattttatcctttaagagagagatcg 18706510  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||  |||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  18706511 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 18706610  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |  ||||||||||||||||    
T  18706611 aaaagagtcttataaaaagggac 18706633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34963678 - 34963450
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc--ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttac 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  34963678 tacctccgtccttaattataggatcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattattattggttttac 34963579  T
Q  102 aattttatcttttaagagagaga-tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnn 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||       ||||||| |||||| |||||||||||       
T  34963578 aattttatcctttaagagagagagttgtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataa-taatagaggcatgtatgtaaa 34963480  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
        ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34963479 gaaataattaatgtagttggaaataacaaa 34963450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 39114631 - 39114880
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39114631 tacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttaca 39114730  T
Q  103 attttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnn 199  Q
    |||||||| ||||||| |||  | ||  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| ||| || ||||||||||       
T  39114731 attttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagagcatgtatgtaaa 39114830  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  39114831 gaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 39114880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 49373434 - 49373682
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  49373434 tactacatccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatctgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 49373533  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  | || |||||||| |||| || |||||||| ||| |||||||       |||| ||| |||| ||||||||||||    
T  49373534 acaattttatcctttaagagatatggttggtttatgttatcaagatgttatttatagctgattgaag--aaaaatgtacaataaataggggcatgtatgt 49373631  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggg 247  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49373632 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 49373682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1173860 - 1173616
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaat-aacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1173860 tactacctccgtctctaattataaggctcttttgaaaaaattaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttt 1173761  T
Q  99 tacaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatg 195  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||| ||||    
T  1173760 tacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaggatgtataataaataggggcatatatg 1173661  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttata 240  Q
    |       ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||    
T  1173660 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 1173616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20789229 - 20788977
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| || |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20789229 tactacctccgttcctaattatagaacccttttgaaaaaataatggaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattgttttt 20789130  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| || |    
T  20789129 acaactttatcctttaagagagataattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcatat 20789030  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20789029 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 20788977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 32898978 - 32899144
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32898978 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 32899077  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  32899078 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 32899144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20761564 - 20761785
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc--ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20761564 tactacctccgtccctaattataag-tcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 20761662  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatg 195  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||||||||    
T  20761663 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 20761762  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttg 218  Q
    |       |||||||||||||||    
T  20761763 taaagaaataattaatgtagttg 20761785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23623933 - 23623769
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23623933 tactacctccgtccctaattatatgactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg-tttt 23623835  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |  || ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23623834 acaattttatcctttaagaaagataattggtttatatttttaacatgttatttattgctgattgaa 23623769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39671023 - 39670858
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39671023 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 39670924  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  39670923 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa 39670858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 51336093 - 51335839
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacg--ggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  51336093 tactacctccctccctaattatagagcccttttaaaaaaataaagaaggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttt 51335994  T
Q  98 ttacaattttatcttttaagaga--gagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtat 194  Q
    |||||| |||||| || ||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       || ||||| ||| |||||||||||    
T  51335993 ttacaaatttatccttcaagagagggagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtat 51335894  T
Q  195 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||       ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  51335893 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 51335839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 55777183 - 55777071
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55777183 tccgtccctaattataggaccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttt 55777084  T
Q  108 atcttttaagaga 120  Q
    ||| |||||||||    
T  55777083 atcatttaagaga 55777071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4143676 - 4143549
Alignment:
Q  10 cgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 108  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4143676 cgtccttaattataggatccttttgaaaaaataacgagaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaatttta 4143577  T
Q  109 tcttttaagagagagatgatttatgttt 136  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  4143576 tcctttaagagagagatgatttatgttt 4143549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 29519904 - 29520155
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29519904 tactacatccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggataaa-gtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 29520002  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| || ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       | |||||| |||| ||||||||||||    
T  29520003 acaattttatcctttaagaaagaaagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgt 29520102  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  29520103 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 29520155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36392116 - 36391900
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||    
T  36392116 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatg 36392017  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||     
T  36392016 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 36391917  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  36391916 gtcttataaaaagggac 36391900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 37639627 - 37639875
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37639627 tactacatccgtctctaattataagtcctttttgaaaaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 37639726  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||        |||||||| |||||| |||||||||     
T  37639727 acaattttatcttttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgccgattgaacaaaaatatgtataataaataggacatgtatgta 37639826  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
          |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  37639827 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 37639875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 48241389 - 48241621
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48241389 tactaccatcgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 48241488  T
Q  100 acaattttatctttta--agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| | || |||||||||||||||| ||||||| || | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||    
T  48241489 acaattttatcctttatgagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttactggtgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgt 48241588  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
           |||||||| |||||||||||||||||    
T  48241589 aaagaaataattaatatagttggaaatagcaaa 48241621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 5734387 - 5734507
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5734387 tactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5734486  T
Q  100 acaattttatcttttaagaga 120  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  5734487 acaattttatcctttaagaga 5734507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 55841363 - 55841251
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55841363 tccgtccctaattataggaccttttaaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttt 55841264  T
Q  108 atcttttaagaga 120  Q
    ||| |||||||||    
T  55841263 atcatttaagaga 55841251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 249
Target Start/End: Original strand, 9808398 - 9808589
Alignment:
Q  61 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaa 158  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  9808398 atatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctga 9808497  T
Q  159 ttgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||       || ||||| ||| |||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9808498 ttgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 9808589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 28298111 - 28298362
Alignment:
Q  3 ctacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttac 101  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28298111 ctacctccgtccctaattataaggctcttttaaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttac 28298210  T
Q  102 aattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattg-aagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||   |||| ||        |||||||| ||||| |||||||||||     
T  28298211 aattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgtcgattgaaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 28298310  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  28298311 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggac 28298362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 49793381 - 49793231
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |    
T  49793381 ctccgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttctaattacaattgtttttacaaat 49793282  T
Q  106 ttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgct 156  Q
    ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49793281 ttatccttcaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgct 49793231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 296
Target Start/End: Original strand, 34948419 - 34948688
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatg 126  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| | | |  ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34948419 tcttttgctaaaattacgggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgtttttacaattttatcttttaagagagagttg 34948518  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
    ||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||    
T  34948519 atttatgttttccgtatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatag 34948618  T
Q  226 caaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacggatatagta 296  Q
     ||||   ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34948619 taaagtgatcttataaaaagggac-aaaaaatattctcaaaatggtcttataattaggaacggatgtagta 34948688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47311556 - 47311360
Alignment:
Q  31 ttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta--agagagagatgat 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | |||| | ||      
T  47311556 ttgaaaaaataacgggaattaagata-tggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaggaaagagggttggc 47311458  T
Q  129 ttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  47311457 ttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 47311360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 9328015 - 9328231
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  9328015 aaaatcacgggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 9328114  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  9328115 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 9328214  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  9328215 atcttataaaaagggac 9328231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18882623 - 18882485
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |    
T  18882623 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagtt 18882524  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  18882523 ggcttatgttttcaacattatatttattgttgattgaag 18882485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 35675695 - 35675911
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  35675695 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 35675794  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  35675795 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagga 35675894  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  35675895 gtcttataaaaagggac 35675911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 45850463 - 45850629
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  45850463 tactaccaccgttcctaattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 45850562  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  45850563 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 45850629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 39880035 - 39879917
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39880035 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatacttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 39879936  T
Q  100 acaattttatcttttaaga 118  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  39879935 acaattttatcctttaaga 39879917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47807122 - 47806906
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagag-agatga-tttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| | ||||||    
T  47807122 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagattagtttatg 47807023  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  47807022 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 47806923  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  47806922 gtcttataaaaagggac 47806906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 55631999 - 55632250
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  55631999 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaaaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 55632098  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| || ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  55632099 acaattttatccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 55632198  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  55632199 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 55632250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54676810 - 54676593
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||  | |  ||||||    
T  54676810 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatg 54676711  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc-aaagg 231  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  54676710 ttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 54676611  T
Q  232 tttcttataaaaagggac 249  Q
      ||||||||||||||||    
T  54676610 ggtcttataaaaagggac 54676593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1028816 - 1028564
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||| |||||    
T  1028816 tactccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatttatttgtaatcactattattttt 1028717  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  1028716 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 1028617  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  1028616 aaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggac 1028564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10588336 - 10588120
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  10588336 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 10588237  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10588236 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagga 10588137  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  10588136 gtcttataaaaagggac 10588120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15241741 - 15241525
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  15241741 aaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 15241642  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  15241641 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaagga 15241542  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  15241541 gtcttataaaaagggac 15241525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 32032766 - 32032982
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  32032766 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 32032865  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||| |||||||| ||||||     
T  32032866 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctggaaataacaaaggg 32032965  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  32032966 gtcttataaaaagggac 32032982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33413772 - 33413564
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||    
T  33413772 gggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaac 33413673  T
Q  142 atattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttata 240  Q
    || |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  33413672 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttata 33413573  T
Q  241 aaaagggac 249  Q
    |||| ||||    
T  33413572 aaaaaggac 33413564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 43387768 - 43387984
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  43387768 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 43387867  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||||||||| || ||||||     
T  43387868 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaagtaacaaaggg 43387967  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  43387968 gtcttataaaaagggac 43387984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 47299013 - 47299229
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  47299013 aaaatcacgggaattaagatagtaaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 47299112  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  47299113 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 47299212  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  47299213 gtcttataaaaagggac 47299229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 50534145 - 50533932
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagag-agatga-tttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || || | | ||||||    
T  50534145 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagtttagtttatg 50534046  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  50534045 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 50533946  T
Q  233 ttcttataaaaagg 246  Q
     |||||||||||||    
T  50533945 gtcttataaaaagg 50533932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 53276961 - 53277177
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  53276961 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 53277060  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  53277061 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 53277160  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  53277161 gtcttataaaaagggac 53277177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18018926 - 18018798
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagatg 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||    
T  18018926 ttttgaaaaaataacgg-aattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttg 18018828  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgct 156  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||    
T  18018827 acttatgttttcaacattctatttattgct 18018798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30771784 - 30771575
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  30771784 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 30771685  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  30771684 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 30771585  T
Q  233 ttcttataaa 242  Q
     |||||||||    
T  30771584 gtcttataaa 30771575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6753787 - 6753571
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  6753787 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 6753688  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||      
T  6753687 tttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagag 6753588  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  6753587 gtcttataaaaagggac 6753571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20285760 - 20286012
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |  ||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  20285760 tactccctccgtccctaattataaagcccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgttttt 20285859  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |  |  |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  20285860 acaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 20285959  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||    
T  20285960 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaagagggtcttataaaaagggac 20286012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 20391213 - 20391429
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  20391213 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 20391312  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||| || |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  20391313 ttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgg 20391412  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  20391413 gtcttataaaaagggac 20391429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24754340 - 24754124
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  24754340 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttattacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 24754241  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||      
T  24754240 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagag 24754141  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  24754140 gtcttataaaaagggac 24754124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 49228493 - 49228709
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | |  ||||||    
T  49228493 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaataaggttagtttatg 49228592  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  49228593 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtttgaaataacaaaggg 49228692  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  49228693 gtcttataaaaagggac 49228709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52978244 - 52978028
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||  | || ||||||    
T  52978244 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttggtttatg 52978145  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  52978144 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaggatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagga 52978045  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  52978044 gtcttataaaaagggac 52978028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29427751 - 29427540
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  29427751 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 29427652  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||| | |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  29427651 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 29427552  T
Q  233 ttcttataaaaa 244  Q
     |||||||||||    
T  29427551 gtcttataaaaa 29427540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4036122 - 4035871
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  4036122 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 4036023  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  4036022 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 4035923  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4035922 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 4035871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Original strand, 422704 - 422918
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga-gatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | | | |  |||||||    
T  422704 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaatgttagtttatgt 422803  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    ||||||||| |||||||||| | || ||||       |||||||| |||| |||||| |||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  422804 tttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggg 422903  T
Q  234 tcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||    
T  422904 tcttataaaaaggga 422918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 154
Target Start/End: Original strand, 46480788 - 46480915
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatg 126  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||    
T  46480788 ttttaaaaaaataacatgaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatggttg 46480887  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46480888 gtttatgttttcaacatgttatttattg 46480915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 34272994 - 34273210
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  34272994 aaaatcacgggaactaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 34273093  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||| || |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  34273094 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 34273193  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  34273194 gtcttataaaaagggac 34273210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37352805 - 37352589
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||  | |  ||||||    
T  37352805 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatg 37352706  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||       
T  37352705 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaag 37352606  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  37352605 gtcttataaaaagggac 37352589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44295051 - 44294835
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  44295051 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 44294952  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  44294951 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggg 44294852  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||| ||||    
T  44294851 gtcttataaaaaaggac 44294835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 5375333 - 5375548
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||| |||  | |  ||||||    
T  5375333 aaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccgttaagaaagaaggttagtttatg 5375432  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||||||   ||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||      
T  5375433 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcagtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 5375532  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  5375533 tcttataaaaagggac 5375548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39184568 - 39184270
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | |||||  |||||  |||||||||| | ||| ||||||| |||||||  ||||||| || | ||||||||||    
T  39184568 tactacctccgtccttaattatatgacttttttgctaaaatcgcgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtgatcactattgttttt 39184469  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnn 198  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||       |||||||| ||||||| |||||| ||      
T  39184468 acaattttatc-cttaaaagagagttagtttatgttttccatatattatttattgctagttgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtaggtaa 39184370  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacggatatagtact 298  Q
         ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||    
T  39184369 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaagggac-aaaaaaatttctcaaaatggtcttataattagggacggagttagtact 39184271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 2615683 - 2615936
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  2615683 tactccctccgtccctaattataaggcccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 2615782  T
Q  100 acaattttatctttta---agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatg 195  Q
    ||||||||||| || |   |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| ||||||||    
T  2615783 acaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 2615882  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       ||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  2615883 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaaaagggac 2615936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4416262 - 4416011
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  4416262 tactacctccgtccctatatataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtattattgttttt 4416163  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtn 197  Q
    ||| ||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| ||| |||       |||||||| ||||||| |||||||||     
T  4416162 acagttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 4416063  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4416062 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 4416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 5743399 - 5743650
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||    
T  5743399 tactccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtctgtaatcactattgttttt 5743498  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | | |||||| |  ||||||||||  | || ||| |||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  5743499 acaattttatccttaagaaagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 5743598  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  5743599 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 5743650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 49329750 - 49329622
Alignment:
Q  38 aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagatgatttatgtt 135  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  || | | ||| |||||||    
T  49329750 aataacagaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttgtttttacaattttatcatttaagaaagtgggttgacttatgtt 49329651  T
Q  136 ttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  49329650 ttcaacattctatttattgctgattgaag 49329622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4455324 - 4455108
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  4455324 aaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 4455225  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattg-aagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagg 231  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||| ||        |||||||| ||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4455224 ttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 4455125  T
Q  232 tttcttataaaaaggga 248  Q
      |||||||||||||||    
T  4455124 ggtcttataaaaaggga 4455108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37364779 - 37364583
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||  | |  ||||||    
T  37364779 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatg 37364680  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37364679 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 37364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 45742581 - 45742797
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  45742581 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 45742680  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | || ||||       |||||||| |||||||  ||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||| |     
T  45742681 ttttcaacatgttatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagg 45742780  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  45742781 gtcttataaaaagggac 45742797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 47228503 - 47228719
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  47228503 aaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 47228602  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  47228603 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaatga 47228702  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||| ||||    
T  47228703 gtcttataaaaatggac 47228719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Original strand, 50424637 - 50424845
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  |  ||||||||||||||    
T  50424637 gggaattaagatagtggatatgtgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaac 50424736  T
Q  142 atattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttata 240  Q
    || |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||    
T  50424737 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttata 50424836  T
Q  241 aaaagggac 249  Q
    |||||||||    
T  50424837 aaaagggac 50424845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 51536429 - 51536213
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  51536429 aaaatcacaggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 51536330  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||  ||||      
T  51536329 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataataaagag 51536230  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  51536229 gtcttataaaaagggac 51536213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 17609797 - 17610012
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga-tttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| | |  | | |||||||    
T  17609797 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgcttgtaatcactattgtttttacaattttattctttaagaaaaatgttagtttatgt 17609896  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  17609897 tttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggag 17609996  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  17609997 tcttataaaaagggac 17610012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 29014064 - 29014315
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  29014064 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 29014163  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  29014164 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 29014263  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  29014264 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggac 29014315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37357694 - 37357488
Alignment:
Q  46 gaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacat 143  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||  | |  ||||||||||||||||    
T  37357694 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 37357595  T
Q  144 attatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaa 242  Q
     |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||    
T  37357594 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaa 37357495  T
Q  243 aagggac 249  Q
    |||||||    
T  37357494 aagggac 37357488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50352300 - 50352110
Alignment:
Q  62 tatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaat 159  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  50352300 tatttgtaataaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgat 50352201  T
Q  160 tgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  50352200 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 50352110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 25708420 - 25708670
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||    
T  25708420 tactccctccgtccctaattataagaccctttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttta 25708519  T
Q  101 caattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    |||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  25708520 caattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 25708619  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  25708620 acaaaaaatcaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 25708670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39144701 - 39144453
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  39144701 tactccctccgtctctaattataagacctttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 39144602  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  |||||||||||   ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  39144601 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccgtatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 39144502  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  39144501 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagg 39144453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 6807600 - 6807492
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||||    
T  6807600 gggaattaaaatagtggatatttgtattaaaaatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 6807501  T
Q  142 atattattt 150  Q
    || ||||||    
T  6807500 atgttattt 6807492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20747467 - 20747216
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| | ||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  20747467 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaattatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 20747368  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  20747367 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 20747268  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20747267 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagggac 20747216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 249
Target Start/End: Original strand, 41191449 - 41191619
Alignment:
Q  82 gtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataat 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       ||||||||    
T  41191449 gtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 41191548  T
Q  180 taataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  41191549 aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 41191619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52870931 - 52870690
Alignment:
Q  11 gtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 109  Q
    ||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52870931 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 52870832  T
Q  110 cttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaa 206  Q
    |  ||||||||||||  |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||| ||       |||    
T  52870831 c-cttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaataa 52870733  T
Q  207 ttaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  52870732 ttaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 52870690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 6656485 - 6656649
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  6656485 tactaccttcgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattaatattgttttt 6656584  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  6656585 acaattttatcttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 6656649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8344167 - 8343953
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  8344167 aaaattacggtaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 8344068  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| ||||  |||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  8344067 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggca--tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaga 8343970  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     | ||||||||||||||    
T  8343969 gttttataaaaagggac 8343953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25475112 - 25474948
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||   |||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  25475112 tactacctccgtccctgtatataagatccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttactttaaagttgtttgtaatcactattgttttt 25475013  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  25475012 acaattttatcctttaagagataattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 25474948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 164
Target Start/End: Original strand, 19281874 - 19281996
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||||    
T  19281874 gggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaac 19281973  T
Q  142 atattatttattgctaattgaag 164  Q
    || |||||||||| | |||||||    
T  19281974 atgttatttattgttgattgaag 19281996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 30745575 - 30745790
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||| | |  | |  ||||||    
T  30745575 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatca-ttttgtttttacaattttatcctttaagaaataatgttagtttatg 30745673  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  30745674 ttttcaacctgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggg 30745773  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  30745774 gtcttataaaaagggac 30745790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 164
Target Start/End: Original strand, 33501704 - 33501834
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  33501704 aaaatcacaggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 33501803  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  33501804 ttttcaacatgttatttattgttgattgaag 33501834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 4549629 - 4549877
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||    
T  4549629 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgttttt 4549728  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  4549729 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 4549828  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
          ||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||    
T  4549829 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaagg 4549877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 249
Target Start/End: Original strand, 49490011 - 49490158
Alignment:
Q  103 attttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnn 201  Q
    ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||       |||||||| ||| |||||||||||||         
T  49490011 attttttcatttaagagagtgttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 49490110  T
Q  202 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  49490111 aataattaatgtagttggaaataggaaaggggtcttataaaaagggac 49490158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 152
Target Start/End: Original strand, 3168211 - 3168326
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgtt 135  Q
    ||||| ||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  3168211 aaaatcacgagaattaagaaagttgatatttatattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagag-ttatttatgtt 3168309  T
Q  136 ttcaacatattatttat 152  Q
    ||||||||| |||||||    
T  3168310 ttcaacatactatttat 3168326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53630084 - 53629842
Alignment:
Q  6 cctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 104  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  53630084 cctccgtccctaaatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 53629985  T
Q  105 tttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnn 202  Q
    |||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||          
T  53629984 tttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 53629885  T
Q  203 ntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  53629884 ataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaag 53629842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1859434 - 1859190
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||| | |   |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1859434 ctccgttcctaattataagactcttttgctaaaatcacaggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 1859335  T
Q  106 ttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnn 203  Q
    ||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || ||||||||  ||||||       |||||||| |||| ||||||||||||           
T  1859334 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgatacttattgct-gttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 1859236  T
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  1859235 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 1859190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6083554 - 6083333
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagat 125  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |    
T  6083554 tcttttgttaaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatctttaagagagagagtt 6083455  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggc-atgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
      ||||||||||| | ||  ||||||||| | ||| |||       |||||||| ||||| || ||||||||       ||||||||||||||| |||||    
T  6083454 agtttatgttttccatatgctatttattgttgattcaagaaaaagatgtataataaatagagctatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 6083355  T
Q  225 gcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  6083354 gcaaaggggtcttataaaaagg 6083333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17468185 - 17468023
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| | | | |||||| ||||||||||    
T  17468185 tactacctccgtccctaaatataggagcatttttcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttatatataattactattgttttt 17468086  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17468085 acaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaa 17468023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 41333857 - 41333955
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  41333857 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatctttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 41333955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 28501127 - 28501292
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| || |  ||||| | ||| | |  | | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  28501127 tactacctccgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacagagattaagaaagttggttgtagcattaaatttgtatgtaattactattgttttt 28501226  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  28501227 acaattttatccttaagagagcgagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 28501292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36211519 - 36211399
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga--gagagatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  | |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||    
T  36211519 aaaatcacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaaattatttgaaatcactgttgtttttacaattttatcttttaagatcgagagttagtttatg 36211420  T
Q  134 ttttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  36211419 ttttcaacatattattcattg 36211399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Original strand, 27009608 - 27009704
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaa-tatgtttgtaatt-agtattgtttttacaattttatcttttaagagaga 122  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27009608 cttttgaaaaaataataagaattaagatagtggatatttatattaaaatatgtttgtaatttactattgtttttacaattttatcctttaagagaga 27009704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 30868539 - 30868704
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||| | ||| ||| || ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  30868539 tactacctacgttcttaattataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttgat-ttagtattaaatttgtatataattactattgttttt 30868637  T
Q  100 acaattttatctttta---agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||||| || |   |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30868638 acaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaa 30868704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 164
Target Start/End: Original strand, 38405643 - 38405730
Alignment:
Q  79 tttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  38405643 tttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaag 38405730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 48148663 - 48148763
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  48148663 tactacctccgtccttaattatagtgcccttttgaaaaaataatataaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 48148762  T
Q  100 a 100  Q
    |    
T  48148763 a 48148763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28495615 - 28495517
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  28495615 gtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctttaagagagagatttagtttatattttcaacataatatttattgttgattgaa 28495517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 249
Target Start/End: Original strand, 39184037 - 39184240
Alignment:
Q  47 aattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacata 144  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||    
T  39184037 aattaaaaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctttaagatagagaattagtttatgttttcaacata 39184136  T
Q  145 ttatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaa 243  Q
     |||||| ||   |||||||       | |||||| |||| ||||||||||||       || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||    
T  39184137 atatttactgtcgattgaagaaaaatatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaatagttaatgtagttggaaatagcaaggg--tcttatacaa 39184234  T
Q  244 agggac 249  Q
    ||||||    
T  39184235 agggac 39184240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20783416 - 20783330
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20783416 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattg 20783330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 47109627 - 47109725
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  47109627 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 47109725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 20180660 - 20180780
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| ||| ||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  20180660 tacctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgagaattaaaaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaattaatattgtttttaca 20180759  T
Q  103 attttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  20180760 attttatc-cttaagagagaga 20180780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 26889708 - 26889804
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  26889708 gtattaaatttatatgtaattactattgtttttacaattttatc-cttaagagggagttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattgaag 26889804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 37780022 - 37780118
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  37780022 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 37780118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 140
Target Start/End: Original strand, 42598519 - 42598592
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaa 140  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  42598519 gtattaaatttgtttgtagttactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttagtttatggtttcaa 42598592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 6629284 - 6629379
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  6629284 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 6629379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13138956 - 13138858
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta--agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  13138956 gtattaaatatgtttgtaattattattgttttttcaattatatcttttacgagatagagttggtttatatttt-aacataatatttatcgttaattgaag 13138858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 13498293 - 13498391
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga-gagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||| || || | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  13498293 gtattaaatttgtatataattactattgtatttacaattttatccttaaaaaagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 13498391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 23390155 - 23390253
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||    
T  23390155 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaag 23390253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 30010659 - 30010757
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  30010659 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttgagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 30010757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 51329521 - 51329631
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| | ||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  51329521 tactacctccgtccctatatataagaccattttgctaaaattatgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 51329620  T
Q  100 acaattttatc 110  Q
    |||||||||||    
T  51329621 acaattttatc 51329631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 32684825 - 32684729
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  32684825 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatc-cttaagaaagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 32684729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 53564096 - 53564251
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||| | ||| | |  | ||||||||  ||| | |||||| ||||||||||    
T  53564096 tactacatccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaagttgtgtataattactattgttttt 53564195  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53564196 acaattttatc-cttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattg 53564251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Original strand, 54158710 - 54158767
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  54158710 gtattaaatttgtttgtaattactattatttttacaattttatccttttagagagaga 54158767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 4094759 - 4094834
Alignment:
Q  47 aattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag 123  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4094759 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatc-cttaagagagag 4094834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 164
Target Start/End: Original strand, 8418156 - 8418251
Alignment:
Q  71 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagag--agatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |  ||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||    
T  8418156 taaatctgttagtaattagtattgtttttacaattctatcctttaagagagtaagttagtttatattttcaacatactatttaatgttgattgaag 8418251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 35909872 - 35909784
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  35909872 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattg 35909784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38616058 - 38615983
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacata 144  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||||    
T  38616058 tattaaatttgtttataattactattatttttacaattttatc-tttaagggagaattaatttatgttttcaacata 38615983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52966389 - 52966159
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||| |||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||  | ||||||||   |||| ||||||||    
T  52966389 tacctctgtccctatatataagatcattttgctaaaatcacgggaaataagaaagtggatatttgtattaaagttatttgtaatccctattatttttaca 52966290  T
Q  103 attttatcttttaa-gagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnn 200  Q
    |||||||| || || |||  || |  ||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||       |||||||| ||||||| |||||||||        
T  52966289 attttatccttaaaagaggaagttagtttatgttttacatatgatatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaag 52966190  T
Q  201 nnntaattaatgtagttggaaatagcaaagg 231  Q
       ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52966189 aaataattaatgtagttggaaataacaaagg 52966159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29509035 - 29508948
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat-cttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    ||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29509035 gtattaaatttgtatatagttactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaatataatatttatt 29508948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 50649219 - 50649100
Alignment:
Q  5 acctccgtccctaattataggatcttttga-aaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaa 103  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | | || | | | | ||||| | ||| |||||  ||||||||||||||    
T  50649219 acctctgtctctaattataggatctttttagaaaaataacgggaattaagaaaattgaaagtagaaataaatttatttataattgctattgtttttacaa 50649120  T
Q  104 ttttatcttttaagagagag 123  Q
    ||||||| ||||||| ||||    
T  50649119 ttttatcctttaagaaagag 50649100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Original strand, 52181009 - 52181079
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  52181009 taattactattgtttttacaattttatc-cttgagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattg 52181079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 154
Target Start/End: Original strand, 5840103 - 5840188
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||| |||||  |||||||||    
T  5840103 tattaaatttgtttataattattattatttttacaattttatc-cttaagagagagttagtttatgtttttaacatgatatttattg 5840188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13549209 - 13549123
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttat 152  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||    
T  13549209 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttat 13549123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18872947 - 18872849
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||    
T  18872947 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaag 18872849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 43456447 - 43456297
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||| | |  | | |  || ||||| |||| ||||||  ||||| |||||    
T  43456447 tactacctttgtccctaattataggtccttttgaaaaaataatagagattaaaaaaattaaaagtgataataaatttgttcgtaattgttattgctttta 43456348  T
Q  101 caattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    |||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||||||    
T  43456347 caattttataatttaagagagagttaatgtatgttttcaatataatattta 43456297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2738877 - 2738832
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  2738877 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtattataaaaagggac 2738832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3085672 - 3085576
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||   ||||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||    
T  3085672 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttgagagagagtaaatttatgtttttaatataatatttattgttgattgaag 3085576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 6629509 - 6629468
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6629509 tactacctccgtccctaattataagaccttttgaaaaaataa 6629468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10497635 - 10497542
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | | | || | |  || ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10497635 ttttgaaaaaataatgggaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttataattactattatttttacaattttatcctttaagagaga 10497542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20286249 - 20286182
Alignment:
Q  98 ttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  20286249 ttacaattttat-ttttaagagagagagttgatttatgttttccatatgttatttattgctgattgaag 20286182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 164
Target Start/End: Original strand, 22130324 - 22130412
Alignment:
Q  77 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga-gatgatt-tatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||| || | |||||||    
T  22130324 tgtttgtaattataattgtttt-acaattttatctttgaagagagaggattattgtatgttttcaacatagtatttaatgttgattgaag 22130412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23621549 - 23621504
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23621549 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggac 23621504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 36040908 - 36040953
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36040908 taattaatgtagttgaaaatagcaaaggaatcttataaaaagggac 36040953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 48801427 - 48801524
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  48801427 tattaaatttgtatataattattatagtttttacaattttatccttaagagaaagagttagtttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 48801524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 140
Target Start/End: Original strand, 49613931 - 49614040
Alignment:
Q  31 ttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgattt 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | | |||| | ||| ||||| ||||   || || ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  |||    
T  49613931 ttgaaaaaacaacgggaattaaaaaatttgataatggtaataaatttgttcaaaaatactattgtttttacaattttatccttgaagagagagttatttt 49614030  T
Q  131 atgttttcaa 140  Q
    || |||||||    
T  49614031 atattttcaa 49614040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20128732 - 20128636
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| ||||||||| || | ||| |||| || ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||| | ||||||||| | |||||||    
T  20128732 tattaaatttgtttgtaactactcttggtttttcagttttatcttctaagatagagttcatttatgtttttaacaaaatatttattgttgattgaag 20128636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 24072222 - 24072345
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| ||||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||    
T  24072222 tactacctccgtccctaaatatatgagccttttgaaaaaattacggagattaagaaagttggttgtggtattaaatttgtatataattactatggttttt 24072321  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  24072322 acaattttatc-cttaagagagaga 24072345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 163
Target Start/End: Original strand, 2507746 - 2507793
Alignment:
Q  116 agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2507746 agagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaa 2507793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 42528469 - 42528582
Alignment:
Q  137 tcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttc 235  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||       |||||||| | ||||| |||||||||       ||||||||||||||| |||||||||| |  ||    
T  42528469 tcaacatactatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataattaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtc 42528568  T
Q  236 ttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||    
T  42528569 ttataaaaagggac 42528582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 13548980 - 13549022
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13548980 tactacctccgtccctaattataagactcttttgaaaaaataa 13549022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 19596248 - 19596346
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | ||| || ||||| ||||||||||||||| || | ||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  19596248 gtattaaatttgtatataactactattgcttttacaattttatccttaagagagatagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 19596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 32899165 - 32899207
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  32899165 taattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 32899207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 468451 - 468496
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  468451 taattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttttaaaaagggac 468496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Original strand, 7776751 - 7776807
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7776751 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagaga 7776807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 11469182 - 11469227
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  11469182 taattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 11469227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11522279 - 11522234
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  11522279 taattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 11522234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 19282027 - 19282072
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  19282027 taattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 19282072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 151
Target Start/End: Original strand, 50621563 - 50621632
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttat-cttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||| | ||||||||||| |||||| ||||||    
T  50621563 taattattattgtttttacaattttatccttaaaaaagagagttaatttatgttttgaacataatattta 50621632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 51329712 - 51329757
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  51329712 taattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggac 51329757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 52181130 - 52181175
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  52181130 taattaatgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggac 52181175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39670815 - 39670771
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  39670815 taattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaaggga 39670771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 53906185 - 53906149
Alignment:
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  53906185 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 53906149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 153; Significance: 8e-81; HSPs: 98)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15498925 - 15498675
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15498925 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 15498826  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  15498825 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 15498726  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  15498725 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaagggac 15498675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31091741 - 31091491
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31091741 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 31091642  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||       |||||| |||||| ||||||||||||      
T  31091641 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaa 31091542  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  31091541 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggac 31091491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8670431 - 8670181
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8670431 tactacctccgtccctaattatagtacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8670332  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  8670331 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 8670232  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8670231 agaaataattaatgcagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 8670181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 402362 - 402612
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  402362 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 402461  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  402462 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 402561  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  402562 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 402612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 31149987 - 31150237
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31149987 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtttatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31150086  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  31150087 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 31150186  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31150187 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 31150237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1729842 - 1730093
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaa-aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1729842 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 1729941  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||     
T  1729942 tacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 1730041  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  1730042 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggac 1730093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13866891 - 13866641
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13866891 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 13866792  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  13866791 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacttgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaa 13866692  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  13866691 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggac 13866641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20449920 - 20450172
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20449920 tactacctccgtccctaattaaaggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttg 20450019  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  20450020 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 20450119  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20450120 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 20450172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 390610 - 390369
Alignment:
Q  9 ccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 108  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  390610 ccgtccttaattatagggccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 390511  T
Q  109 tcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag-nnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaa 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||        ||||||||||||| ||||||||||||       |||    
T  390510 t-ttttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtataattaatatgggcatgtatgtaaagaaataa 390412  T
Q  207 ttaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  390411 ttaatatagttggaaatagcaaagatgtcttataaaaagggac 390369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20373331 - 20373144
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20373331 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 20373232  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       ||||||||||||||||    
T  20373231 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggg 20373144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 925674 - 925924
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  925674 tactccctccgttcctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 925773  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||      
T  925774 acaattttatcctttaagagagaattgttttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 925873  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  925874 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 925924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 34915282 - 34915534
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34915282 tactaccttcgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattgagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34915381  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  34915382 acaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 34915481  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  34915482 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggacttataaaaagggac 34915534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 31487110 - 31487362
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31487110 tactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31487209  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  31487210 acaatttaatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 31487309  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  31487310 aaagaaataattaatgtagttggaaattgcaaaggggtcttataaaaaaggac 31487362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16272707 - 16272957
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16272707 tacttcctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattattttt 16272806  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  16272807 acaattttatcctttaacaaagagttgatttttgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 16272906  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  16272907 agaaataattgatgtagttggaaatagcaaaggggtcttttaaaaagggac 16272957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34126437 - 34126187
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34126437 tactccctccgtccttaaatataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34126338  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||| ||| ||||      
T  34126337 acaattttatcttttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggtatgcatgtaa 34126238  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  34126237 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagccttataaaaagggac 34126187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11847869 - 11847617
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11847869 tactccctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 11847770  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||       |||||||| |||||||  ||||||||    
T  11847769 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgt 11847670  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  11847669 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 11847617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Original strand, 19097547 - 19097792
Alignment:
Q  6 cctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 104  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19097547 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaat 19097646  T
Q  105 tttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnn 203  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| || |           
T  19097647 tttatcctttaagagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaagaaa 19097746  T
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  19097747 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggac 19097792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 25045382 - 25045634
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25045382 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25045481  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  25045482 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 25045581  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  25045582 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 25045634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 15355295 - 15355541
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15355295 tactacctccgtccctaattatagggccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgttttta 15355394  T
Q  101 caattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||     
T  15355395 caattttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgt- 15355493  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
          ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  15355494 aaagaataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaag 15355541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33773871 - 33773643
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33773871 ctccgtctctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaatt 33773772  T
Q  106 ttatcttttaagagagaga----tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnn 200  Q
    ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||       |||||||| |||||||  ||||||||        
T  33773771 ttatcatttaagagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtagag 33773672  T
Q  201 nnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
       ||||||||||||||||||||||||||    
T  33773671 aaataattaatgtagttggaaatagcaaa 33773643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1147008 - 1147258
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1147008 tactccctctgtccttaattataggacccttttgaaaaaacaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 1147107  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||      
T  1147108 acaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 1147207  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  1147208 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggac 1147258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9342136 - 9341884
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9342136 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 9342037  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  9342036 acaattttatcctttaagaaagaaggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 9341937  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  9341936 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggac 9341884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 13647868 - 13648120
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13647868 tactccctccgtcccttattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 13647967  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       | |||||| |||| ||||||||||||    
T  13647968 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatttataataaataggggcatgtatgt 13648067  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  13648068 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggac 13648120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2090957 - 2090665
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2090957 tactacctacgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 2090858  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  2090857 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 2090758  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacgga 289  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||         ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  2090757 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttgtaaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 2090665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7772474 - 7772222
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7772474 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 7772375  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  7772374 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 7772275  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  7772274 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaatggac 7772222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Original strand, 23578194 - 23578320
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23578194 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttg 23578293  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
     |||||||||||||||| |||||||||    
T  23578294 gtttatgttttcaacatgttatttatt 23578320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23604760 - 23604512
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23604760 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtgaatatttgtattagatatgtttgtaattactattgttttt 23604661  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  23604660 acaattttatcttttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtgtaataaataagggcatatatgt 23604561  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  23604560 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaag 23604512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 31711598 - 31711835
Alignment:
Q  10 cgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 108  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31711598 cgtccctaattacagggctcttttaaaaaaataacaggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattagtattgtatttacaatttta 31711697  T
Q  109 tcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaat 207  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||       | ||||||||||| ||||||||||||       ||||    
T  31711698 ttctttaagagagagatgatttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatgtaaagaaataat 31711797  T
Q  208 taatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31711798 taatatagttggaaatagcaaagggatcttataaaaag 31711835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12144075 - 12143825
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12144075 tactccctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattgttttt 12143976  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||       |||||||| |||| ||||||| ||||      
T  12143975 acaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattaaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 12143876  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  12143875 agaaataattaatatagttgaaaatagcaaaggggttttataaaaagggac 12143825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16122551 - 16122302
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16122551 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttttaattactattgttttta 16122452  T
Q  101 caattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||| | |||||||||     
T  16122451 caattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgta 16122352  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggg 247  Q
          |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  16122351 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaggg 16122302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 19418863 - 19419115
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19418863 tactacatctgtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19418962  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||        |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  19418963 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaagagatgtacaataaatagggacatgtatgt 19419062  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  19419063 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 19419115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 13010859 - 13011087
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13010859 tactacctccgtccctaattacaaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatgactattgttttt 13010958  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  13010959 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 13011058  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
           ||||||| ||||||||||||||    
T  13011059 aaagaaataattaacgtagttggaaatag 13011087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 15966900 - 15967148
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaattaaa-atagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15966900 tactacttccgtccctaattataagtttcttttgaaaaaataacgagaatttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 15966999  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatg 195  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||| ||||    
T  15967000 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatg 15967099  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
    |       |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  15967100 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 15967148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17227267 - 17227519
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||  |||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17227267 tactacctccgtctttaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattgaatatgtttgtaattactattgttttt 17227366  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  17227367 acaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 17227466  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||    
T  17227467 aaagaaataattaatgtagttagaaatagaaaataggtcttataaaaagggac 17227519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 34301571 - 34301823
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  34301571 tactccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 34301670  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  34301671 acaattttatcctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 34301770  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  34301771 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 34301823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11104850 - 11104699
Alignment:
Q  2 actacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgt---attaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11104850 actacctccgtccctaattatagggtcattttaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttgttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 11104751  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattat 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||    
T  11104750 tacaattttatcatttaagagagagaattggtttatgttttaaacatgttat 11104699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6147637 - 6147429
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||||    
T  6147637 gggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaac 6147538  T
Q  142 atattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttata 240  Q
    ||||||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  6147537 atattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttata 6147438  T
Q  241 aaaagggac 249  Q
    |||||||||    
T  6147437 aaaagggac 6147429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 13690471 - 13690723
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||  |||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13690471 tactaccttcgtccctaattataaggttcttttaaaaaaataagaggaattaagataatgaatatttatattaaatgtgtttgtaattactattgttttt 13690570  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  13690571 acaattttatcttttaagaaagagggttggcttatgttttcatcattatatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 13690670  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||    
T  13690671 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaataagtcttataaaaagggac 13690723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30248902 - 30248693
Alignment:
Q  43 cgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaa 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||| |||||||    
T  30248902 cgggaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaa 30248803  T
Q  141 catattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttat 239  Q
    ||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||    
T  30248802 catgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttat 30248703  T
Q  240 aaaaagggac 249  Q
    ||||||||||    
T  30248702 aaaaagggac 30248693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33488093 - 33487881
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  33488093 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 33487994  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||       |||||||| |||| |||||| |||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  33487993 ttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 33487894  T
Q  233 ttcttataaaaag 245  Q
     ||||||||||||    
T  33487893 gtcttataaaaag 33487881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Original strand, 17175240 - 17175453
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || || ||||||    
T  17175240 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaagttggtttatg 17175339  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||| ||||| |||||||||  | |||||||       |||||||| |||| |||||||||| |       |||||||||| |||||||||| |||| |     
T  17175340 ttttgaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgttgttggaaataacaaatgg 17175439  T
Q  233 ttcttataaaaagg 246  Q
     |||||||||||||    
T  17175440 atcttataaaaagg 17175453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Original strand, 25024281 - 25024494
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  25024281 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacatttttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 25024380  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  25024381 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 25024480  T
Q  233 ttcttataaaaagg 246  Q
     |||||||||||||    
T  25024481 atcttataaaaagg 25024494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 10195769 - 10195985
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  10195769 aaaatcacgagaattaacatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 10195868  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||       | |||||| ||| | |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10195869 ttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataatggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 10195968  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||| ||||||    
T  10195969 gtcttataaagagggac 10195985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25197414 - 25197199
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  25197414 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 25197315  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| ||| |||||| | |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  25197314 ttttcaacatgttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 25197215  T
Q  233 ttcttataaaaaggga 248  Q
     |||||||||||||||    
T  25197214 gtcttataaaaaggga 25197199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 23397879 - 23398129
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | | |  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  23397879 tactccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 23397978  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||     
T  23397979 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgta 23398078  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  23398079 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 23398129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 230882 - 231097
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |  ||||||    
T  230882 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaataaggttagtttatg 230981  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | | |||||       |||||||| |||| ||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||| |||| |     
T  230982 ttttcaacatgttatttattgttgactgaagaaaaagatgtataataaatacgggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatg- 231080  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  231081 gtcttataaaaagggac 231097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 287189 - 287405
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  287189 aaaatcacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 287288  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||        |||||||| |||| ||||||||||||       ||| | ||||||||||||||| ||||||     
T  287289 ttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataactgatgtagttggaaataacaaaggg 287388  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  287389 atcttataaaaagggac 287405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1779784 - 1780035
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||    
T  1779784 tactccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaattacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgttttt 1779883  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||| ||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  |||||||| || |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  1779884 acaatattatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 1779983  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  1779984 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 1780035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 9388529 - 9388782
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |   |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  9388529 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 9388628  T
Q  100 acaattttatctttta---agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatg 195  Q
    ||||||||||| || |   |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||||||||    
T  9388629 acaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatg 9388728  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  9388729 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 9388782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Original strand, 9660136 - 9660221
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaatta 88  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9660136 tacctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 9660221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34741763 - 34741512
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||    
T  34741763 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtcaatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgttttt 34741664  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||| ||     
T  34741663 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtaggta 34741564  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  34741563 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 34741512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 12105830 - 12106055
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--ga 124  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||||||| |||  |     
T  12105830 tcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttattctttaagaaagaaggt 12105929  T
Q  125 tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaat 223  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| |||| |||||||       |||||||| |||||||||||    
T  12105930 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaat 12106029  T
Q  224 agcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||    
T  12106030 aacaaaggggtcttataaaaagggac 12106055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 32615284 - 32615119
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||| | | | |||| |  |||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  32615284 tactacctccgtctctaattatatgactcttttgtcaaaatcacggaaattaagaaaattgataataatattaaatttgtttataattactattgttttt 32615185  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  32615184 acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 32615119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 345158 - 344911
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaatta----gtattgtttttaca 102  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  ||||| || |||||||| | || |||||||| |||||||  |||||||||| |    ||||||||||||||    
T  345158 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacaggaattaagaaagcagatatttatattaaagttgtttgtaatcactacgtattgtttttaca 345059  T
Q  103 attttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnn 200  Q
    |||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||        
T  345058 attttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaag 344959  T
Q  201 nnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
       ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  344958 aaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 344911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8175910 - 8175787
Alignment:
Q  43 cgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaa 140  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |  ||||||||||| |    
T  8175910 cgggaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttcaagagagagagttagtttatgttttcca 8175811  T
Q  141 catattatttattgctaattgaag 164  Q
     ||| ||||||||||| |||||||    
T  8175810 tatactatttattgctgattgaag 8175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15287428 - 15287190
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    |||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15287428 tccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatctctattgtttttacaattt 15287329  T
Q  107 tatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtnnnnnnnta 205  Q
    |||| || | | |||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       | |||||| |||||| |||||||||       ||    
T  15287328 tatccttaatatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatatataataaataggacatgtatgtaaagaaata 15287229  T
Q  206 attaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  15287228 attaatgtagttggaaataacaaatggatcttataaaaa 15287190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 151
Target Start/End: Original strand, 2746310 - 2746436
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga-- 124  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| | | |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||      
T  2746310 tcttttgaaaaaataatggaaattaaaaaaattgatagttgtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaaatttatcctttaagagagagaat 2746409  T
Q  125 tgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    |   |||||||||||||||| ||||||    
T  2746410 tagcttatgttttcaacatagtattta 2746436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5457664 - 5457461
Alignment:
Q  46 gaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacat 143  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||||||    
T  5457664 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 5457565  T
Q  144 attatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaa 242  Q
     |||||||||| | |||||||       |||||||| |||||   |||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  5457564 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 5457465  T
Q  243 aagg 246  Q
    ||||    
T  5457464 aagg 5457461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Original strand, 5576180 - 5576348
Alignment:
Q  61 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaatt 160  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  5576180 atatttgtattgaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagtgagagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatt 5576279  T
Q  161 gaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaa 228  Q
    ||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||| |||||||||    
T  5576280 gaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaatagcaa 5576348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 249
Target Start/End: Original strand, 9660505 - 9660668
Alignment:
Q  89 gtattgtttttacaattttatctttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-g 185  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||       |||||||| |||| |    
T  9660505 gtattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtataataaatagg 9660604  T
Q  186 ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  9660605 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggac 9660668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8743448 - 8743233
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |  |||||||    
T  8743448 aaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 8743349  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||  | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  8743348 ttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtacttggaaataacaaagggg 8743249  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  8743248 tcttataaaaagggac 8743233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 345513 - 345737
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagat 125  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||| | | ||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  345513 tcttttgctaaaatcatgggaattaaaaaattcgatatttatattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtt 345612  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
      ||||||||||| | ||  |||||||||||  ||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       || ||||||||||||||||||    
T  345613 agtttatgttttccatatgctatttattgctggttgaagaaagagatgtataataaataggcgcatgtatgtaaagaaatagttaatgtagttggaaata 345712  T
Q  225 gcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||   |||||||| |||||||    
T  345713 gcaaagaagtcttataagaagggac 345737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 29036372 - 29036262
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  29036372 tactccctccgtccctatatataagatccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 29036273  T
Q  100 acaattttatc 110  Q
    |||||||||||    
T  29036272 acaattttatc 29036262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 164
Target Start/End: Original strand, 6840082 - 6840175
Alignment:
Q  71 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| | | || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6840082 taaatttgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcctataagagagtgttaatgtatgttttcaacatattatttaatgctgattgaag 6840175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15126724 - 15126601
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgtt 135  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  || ||||||||    
T  15126724 aaaattacgggaattaagaaagt-gatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttcatccttt-agagagaattggtttatgtt 15126627  T
Q  136 ttcaacatattatttattgctaattg 161  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  15126626 ttcaacatgctatttattgctgattg 15126601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 33012473 - 33012570
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttt-taagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  33012473 tattaaatttgtttataattaatattgtttttacaattttgtctttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 33012570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 4823198 - 4823103
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  4823198 tattaaatttgtatgtaattactattgtttttataattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 4823103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 17950510 - 17950560
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatg 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17950510 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatg 17950560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 235993 - 235899
Alignment:
Q  61 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga-tttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  235993 atatttgtattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttgtcatttaagagaaatattagtttatgttttcaacatgttatttattg 235899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11162083 - 11161983
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta---agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  11162083 gtattaaatttctatgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 11161984  T
Q  164 g 164  Q
    |    
T  11161983 g 11161983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 164
Target Start/End: Original strand, 17952167 - 17952264
Alignment:
Q  69 attaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  17952167 attaaatatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacaatctatttattgctgattgaag 17952264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 8217528 - 8217624
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  8217528 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 8217624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3177449 - 3177232
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatg 126  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |     
T  3177449 tcttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgcattaaagttgtttgtaaccactattttttttacaattttatc-cttaagagagagtta 3177351  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
     || || ||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||| ||       ||||||||||| ||| ||||||    
T  3177350 gttcatattttccatatgatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtacgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatag 3177251  T
Q  226 caaaggtttcttataaaaa 244  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  3177250 caaagggatcttataaaaa 3177232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6418168 - 6418045
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||| | |   |||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||    
T  6418168 tactccctccgtccctaattataagacctttttgttaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattggtttt 6418069  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  6418068 acaattttatc-cttaagagagaga 6418045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 22998852 - 22998950
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  22998852 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 22998950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23789552 - 23789454
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  23789552 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 23789454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27581616 - 27581518
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||    
T  27581616 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaag 27581518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Original strand, 6418476 - 6418557
Alignment:
Q  84 aattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  6418476 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 6418557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22710478 - 22710398
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  22710478 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 22710398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 11656172 - 11656337
Alignment:
Q  88 agtattgtttttacaattttatcttt-taagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  || ||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||       |||||||| ||||    
T  11656172 agtattgtttttacaattttatccttatgagagagagagttggtttatgttttccatatgctatttattgtttattgaagaaaaagatgtataataaata 11656271  T
Q  185 gg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
       ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11656272 aaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 11656337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 23282543 - 23282711
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt--gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||||||||||||||| | | | |||| |  || ||||| |||| |||||||  |||| |||    
T  23282543 tactacctccgtccctaattatagggccctttagaaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattaccattggttt 23282642  T
Q  99 tacaattttatctttta---agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||| || |   | |||||| | |||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||    
T  23282643 tacaattttatccttaagagaaagagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaag 23282711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 164
Target Start/End: Original strand, 9299246 - 9299335
Alignment:
Q  77 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta--agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||  ||||| || |  |||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||    
T  9299246 tgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaacagagatagtttgtttatgttttaaacatgttatttattgttgattgaag 9299335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11200808 - 11200726
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  11200808 taattactattgattttacaattgtatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 11200726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 249
Target Start/End: Original strand, 22852131 - 22852322
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaa 158  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |  ||||| ||||  | ||| ||||||||||| |    
T  22852131 gatatttgtttaaaat-tgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatatttttcatatactatttattgctga 22852229  T
Q  159 ttgaagnnnnnnn-tgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||         |||||||  ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22852230 ttgaaaaaaaaaaatgtataacaaatagggacatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttataaaaagggac 22852322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 28980662 - 28980762
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta---agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || |   ||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  28980662 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttgagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 28980761  T
Q  164 g 164  Q
    |    
T  28980762 g 28980762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27310662 - 27310566
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||    
T  27310662 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttataattttatcctt-aagagagatttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaag 27310566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Original strand, 13321135 - 13321223
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||   |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13321135 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagatagtaaatttatgttttcaatataatatttattg 13321223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14630115 - 14630045
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14630115 taattattattatttttacaattttatcctt-aagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattg 14630045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6417966 - 6417924
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  6417966 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 6417924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9038854 - 9038772
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  9038854 taattactattgtttttataattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 9038772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 110
Target Start/End: Original strand, 18105947 - 18106021
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  18105947 aaaattacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatc 18106021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 4175455 - 4175374
Alignment:
Q  84 aattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| || | |||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  4175455 aattactattatttttacaattttatccttaagagagagagttaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 4175374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 8345460 - 8345404
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8345460 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatc-tttaagagagaga 8345404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11104663 - 11104618
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  11104663 taattaatgtagttggaaatagcaaaagagtattataaaaagggac 11104618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 17992219 - 17992163
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17992219 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-tcttaagagagaga 17992163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29036216 - 29036171
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  29036216 taattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttataaaaagggac 29036171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 124
Target Start/End: Original strand, 5186271 - 5186358
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||||  |||||||||| | | ||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  5186271 aaaatcacgggaattaagaaagtaaatatttctattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttagaaatttatc-cttaagagagaga 5186358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7762136 - 7762068
Alignment:
Q  95 tttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||| ||| ||||| ||| | ||||||    
T  7762136 tttttacaattttatgttttaagaaagagttaatttatattttcaagatagtattttttgttgattgaa 7762068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 168)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1575015 - 1574765
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1575015 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 1574916  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||| |||||| ||||||||||||      
T  1574915 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaataatatgtatatttaataggggcatgtatgtaa 1574816  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1574815 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggac 1574765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23920028 - 23919781
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23920028 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 23919929  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  23919928 acaattttatcttttaagagaaagatggtttatgttttcaacatattatttattgttgatggaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 23919829  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
         ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  23919828 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaaaagg 23919781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 11647575 - 11647825
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11647575 tactacctccctccttaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 11647674  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||       |||||||||||| |||||||||||||      
T  11647675 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataagggcatgtatgtaa 11647774  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11647775 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 11647825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27529524 - 27529274
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27529524 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 27529425  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  27529424 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 27529325  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  27529324 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 27529274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12930616 - 12930371
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12930616 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 12930517  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  12930516 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 12930417  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12930416 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 12930371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43280000 - 43279751
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43280000 tactacatccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 43279901  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtnnn 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||||||||||||       
T  43279900 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggcatgtatgtaaa 43279801  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  43279800 gaaataattaatgtagtaggaaatagtaaaggggtcttataaaaagggac 43279751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 6799285 - 6799535
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6799285 tactacctccgtcccaaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 6799384  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||       |||||||||||||||| ||| |||||      
T  6799385 acaattttatcctttaagagagagatagtttatgctttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgtaa 6799484  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  6799485 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttataaaaagggac 6799535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32759854 - 32759604
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32759854 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 32759755  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  32759754 acaattttatcctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 32759655  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  32759654 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 32759604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 35569393 - 35569643
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35569393 tactacatccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 35569492  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  35569493 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 35569592  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  35569593 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggac 35569643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3024878 - 3024630
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3024878 tactacctccgtccttaattatagggcccttttaaaaaataacgggaattaagatagtgaatgtttgtattaaatatatttgtaattagtattgtttt-a 3024780  T
Q  101 caattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnn 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||||||||||| ||| |||||       
T  3024779 caattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatatatgtaaa 3024680  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3024679 gaaataattaatatagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaagggac 3024630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 47323268 - 47323520
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47323268 tactacctccgtccctaattatagggtctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 47323367  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||    
T  47323368 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgt 47323467  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||  ||||   | ||||||||||||||    
T  47323468 aaagaaataattaatgtagttgaaaataagaaagagattttataaaaagggac 47323520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10475989 - 10475751
Alignment:
Q  11 gtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 109  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10475989 gtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 10475890  T
Q  110 cttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaa 206  Q
    | ||||||||||||   || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||       ||||||||  |||||| |||||||||       |||    
T  10475889 cctttaagagagagtattggtttatgttttcaacatgtcatttattgctaattgaagaaaaagatgtataatatatagggtcatgtatgtaaataaataa 10475790  T
Q  207 ttaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10475789 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 10475751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9998586 - 9998333
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaa-taacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9998586 tactacatccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttt 9998487  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatg 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||||||||    
T  9998486 tacaattttatcctttaagagagagggatgaataatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 9998387  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  9998386 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttgtaaaaagggac 9998333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45907541 - 45907291
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45907541 tactccctccgttcctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 45907442  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||  ||||      
T  45907441 acaattttatcctttaagagagaattgatttatgtttccaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgtaa 45907342  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  45907341 aaaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggac 45907291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 20950779 - 20950942
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20950779 tactacccccgtccctaattataggacccttttgaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttta 20950878  T
Q  101 caattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20950879 caattttatcctttaagagagaattgatttatgttttcaacatgttatttattgcttattgaag 20950942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 28016285 - 28016537
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28016285 tactacttccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28016384  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  28016385 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaaggtgtataataaataggggcatgtatgt 28016484  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  28016485 aaagaaataattaatgtagttggaaatataaaaggaatcttataaaaagggac 28016537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Original strand, 42298172 - 42298417
Alignment:
Q  6 cctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  42298172 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattatttttacaat 42298271  T
Q  105 tttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnn 203  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||           
T  42298272 tttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaa 42298371  T
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  42298372 taattaatatagttggaaatagcaaaggggtcttatgaaaagggac 42298417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 44780132 - 44780297
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44780132 tactacctccgtccttaattatatggctcttttaaaaaaataacgagaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 44780231  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  44780232 acaattttatcttttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaa 44780297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 2289755 - 2290007
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  2289755 tactacctccgtccgtaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatattt 2289854  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||        |||||||| |||| ||||||||||||    
T  2289855 acaattttatcttttaagagagagagttcgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 2289954  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  2289955 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttagaaaaagggac 2290007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 7607373 - 7607625
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7607373 tactacctccgtccctaattatagggtccttttaaaaaaataatgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7607472  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  7607473 acaattttatcatttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 7607572  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||| ||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  7607573 aaagaaataattcatgcagttggaaatagcaaagaggtctcataaaaagggac 7607625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 788202 - 787979
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta--agagagagatg 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | ||    
T  788202 ttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaggagagagggttg 788103  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||| ||| |||||||||||||       |||||||| |||||||||||||    
T  788102 atttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagaagtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaatag 788003  T
Q  226 caaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||| |  ||||||||||||||||    
T  788002 caaatgagtcttataaaaagggac 787979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19920851 - 19920612
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  19920851 tccgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttac-attt 19920753  T
Q  107 tatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnnta 205  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||       ||    
T  19920752 tatcctttaagagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaata 19920653  T
Q  206 attaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19920652 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 19920612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 9140272 - 9140524
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9140272 tactacctctgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 9140371  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| || | ||||||||||||    
T  9140372 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaagaggggcatgtatgt 9140471  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  9140472 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 9140524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21119856 - 21119609
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21119856 tactacctccgtccctaattacaggatccttttgaaaaaataaaggaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 21119757  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  21119756 acaattttatcatttaagagagataattagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaacaatgtataataaataggggcatgcatgt 21119657  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
           ||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  21119656 aaagaaataattaatgtaattggaaataacaaacgagtcttataaaaa 21119609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 47657432 - 47657655
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatg 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  47657432 tcttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttataattactattgtttttacaattttatcttttaagacagaattg 47657531  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||    
T  47657532 atttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 47657631  T
Q  226 caaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||   ||||||||||||||||    
T  47657632 caaagtggtcttataaaaagggac 47657655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4857107 - 4856852
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaata---acgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4857107 tactacctccgtccctaattataggaccattttggaaaaatattaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtt 4857008  T
Q  97 tttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgta 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  | || |||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||| |||||    
T  4857007 tttacaattttatcctttaagagagatggttggtttaggttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggaatgta 4856908  T
Q  194 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  4856907 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaaaagggac 4856852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 41803209 - 41803375
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41803209 tactacctctgtcctttattataggaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 41803308  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  41803309 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 41803375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43081549 - 43081298
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43081549 tactacctccgtccctaattataaggctttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 43081450  T
Q  101 caattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||| ||||||  | || | ||  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  43081449 caattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 43081350  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  43081349 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 43081298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19619331 - 19619097
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19619331 tactacctccgtccctaattatagagctcttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaaatactattgttttt 19619232  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | || ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  19619231 acaattttatcctttaagagagagggttggtttatatttgcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 19619132  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagg 231  Q
           |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19619131 aaaaaaataattaatgtagttggaaattgcaaagg 19619097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30895855 - 30895606
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30895855 tacctccgtccctaattatagcgcccttttgaaaaaataacaggaattaagataatggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttaca 30895756  T
Q  103 attttatcttt--taagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnn 199  Q
    | |||||| ||   ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       || ||||| ||| |||||||||||||       
T  30895755 aatttatccttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaa 30895656  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30895655 gaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 30895606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 21870075 - 21870327
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21870075 tactacttccgtccttaattatagggctcttttggaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 21870174  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| | | |||||||       || ||||| ||| |||||||||||||    
T  21870175 acaaatttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 21870274  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  21870275 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttatagaaggggac 21870327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23109365 - 23109199
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctt-ttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  23109365 tactacctccgtccctaattataggaccctattgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaatttttttt 23109266  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23109265 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaag 23109199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 26843069 - 26842946
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26843069 tactacctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 26842970  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagag 123  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||    
T  26842969 acaattttatcctttaagaaagag 26842946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37913365 - 37913121
Alignment:
Q  9 ccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 107  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37913365 ccgtccttaattataaggctcttttgaaaaaataacggtaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaatttt 37913266  T
Q  108 atcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnnt 204  Q
    ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       |    
T  37913265 atcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaat 37913166  T
Q  205 aattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  37913165 aattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagggac 37913121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26736784 - 26736494
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26736784 tactacctccatccctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 26736685  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--------tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcat 190  Q
    |||||| |||| || ||||||||||        || |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||    
T  26736684 acaattatatccttgaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcat 26736585  T
Q  191 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatca 281  Q
    ||||||       ||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||    
T  26736584 gtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatca 26736494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 163
Target Start/End: Original strand, 32117995 - 32118127
Alignment:
Q  31 ttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgattt 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  32117995 ttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttattacaattttatcctttaagagagagttggttt 32118094  T
Q  131 atgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  32118095 atgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 32118127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38736748 - 38736499
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaa-taacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38736748 tactacctttgttcctaattataggatccttttgaaaaaaataacaggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattatcattgtttt 38736649  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||     
T  38736648 tacaattttattctttaagagaaggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgta 38736549  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
          ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  38736548 aagaaataattaatgtagttgaaaatag-aaaagagtcttataaaaaggga 38736499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 27325908 - 27326073
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27325908 tactacctccgtcactaattatagggcccttttgaaaaaataacgg-aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatttctattgttttt 27326006  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    | ||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27326007 ataattttatcctttaagatagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 27326073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 27881827 - 27882074
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27881827 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgttttt 27881926  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       | |||||| ||||| | |||||||||    
T  27881927 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaatagagacatgtatgt 27882026  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
           |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  27882027 aaaaaaataattaatgtagttagaaatataaaaggtgtcttataaaaa 27882074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 33381358 - 33381480
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33381358 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 33381457  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  33381458 acaattttatcctttaagagaga 33381480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16957932 - 16957767
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16957932 tactaccttcgtccctaattatagagcccttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 16957833  T
Q  100 acaattttatc-ttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  16957832 acaattttatcgtttaaagagatggttgatttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaag 16957767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23364312 - 23364064
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  23364312 tactatctccgtccctaattatagggccctttttaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtagttactattgttttt 23364213  T
Q  100 acaattttatcttttaagagag--agatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    |||| |||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||       || ||||| ||| || ||||||||||    
T  23364212 acaaatttatcctttaagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgatcgaagaaaaagatgaataataaataagagcatgtatgt 23364113  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  23364112 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttataaaaag 23364064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 24299943 - 24300109
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24299943 tactacctccgtctctaattatagagcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 24300042  T
Q  100 acaattttatctttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    | ||||||||| |||  ||||||| | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24300043 ataattttatcctttaaaagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttgttgctaattgaag 24300109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48009200 - 48008980
Alignment:
Q  34 aaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga----tgatt 129  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     |||||    
T  48009200 aaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtatttaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtgagttgatt 48009101  T
Q  130 tatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaa 228  Q
    |||| |||||| || |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||| ||||||||| |||    
T  48009100 tatgctttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaaataacaa 48009001  T
Q  229 aggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |||||||||||| ||||    
T  48009000 agggttcttataaaaaaggac 48008980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41444500 - 41444252
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41444500 tactacctccgtccctaattataagatccttttgaaaaaataacgggaattgagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 41444401  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    |||| |||||  || ||||||||  | |  |||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||        || ||||| ||| |||||||||||||    
T  41444400 acaaatttattattcaagagagagtgttagtttatgttttcaacatgttatttattgctggtataataaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 41444301  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41444300 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 41444252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 249
Target Start/End: Original strand, 43093176 - 43093399
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tg 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||    
T  43093176 ttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattataattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttg 43093275  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||       || ||||| ||| |||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||    
T  43093276 gtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaatag 43093375  T
Q  226 caaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||| |  | ||||||||||||||    
T  43093376 caaatgagttttataaaaagggac 43093399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Original strand, 7703596 - 7703810
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagag-agatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || || || | | ||||||    
T  7703596 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaggaaagaaggttagttatgt 7703695  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||      
T  7703696 tttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 7703795  T
Q  234 tcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||    
T  7703796 tcttataaaaaggga 7703810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12130344 - 12130180
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctt-ttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  | | |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12130344 tactatctccgtccctaattatagggccctattgagaaaataacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 12130245  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||  | ||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12130244 acaa--tgatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 12130180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 25247466 - 25247682
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  25247466 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 25247565  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  25247566 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 25247665  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  25247666 gtcttataaaaagggac 25247682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 30737751 - 30738001
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30737751 tactatctccgtccttaattataaggtcattttaaaaaaataacgggaactaagatagtagatatttgtattaaatacgtttgtaattactattgttttt 30737850  T
Q  100 acaattttatcttttaag-------agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgt 192  Q
    ||||||||||| ||||||       |||| | || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||||||   ||    
T  30737851 acaattttatcctttaagaaaaaaaagagggttggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg---gt 30737947  T
Q  193 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    ||||       |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||    
T  30737948 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagg 30738001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 32872150 - 32872366
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  32872150 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 32872249  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  32872250 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 32872349  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  32872350 atcttataaaaagggac 32872366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 39871388 - 39871604
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  39871388 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 39871487  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  39871488 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 39871587  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  39871588 gtcttataaaaagggac 39871604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 1275508 - 1275724
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  1275508 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 1275607  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||| |||||||||||| ||||||     
T  1275608 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggg 1275707  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  1275708 gtcttataaaaagggac 1275724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6387587 - 6387371
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  6387587 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 6387488  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||||      
T  6387487 ttttcaacattttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagag 6387388  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  6387387 gtcttataaaaagggac 6387371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 8612350 - 8612566
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  8612350 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 8612449  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||      
T  8612450 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtcaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagag 8612549  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  8612550 gtcttataaaaagggac 8612566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17491777 - 17491561
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  17491777 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 17491678  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17491677 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 17491578  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  17491577 gtcttataaaaagggac 17491561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 17561437 - 17561653
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  17561437 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 17561536  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17561537 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 17561636  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  17561637 gtcttataaaaagggac 17561653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 21870831 - 21870985
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21870831 tactactttcgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 21870930  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttat 152  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  21870931 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttat 21870985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 31200139 - 31200355
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  31200139 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 31200238  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31200239 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 31200338  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  31200339 gtcttataaaaagggac 31200355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 34978852 - 34979068
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  34978852 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 34978951  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||| |||||||||||| ||||||     
T  34978952 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaataacaaaggg 34979051  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  34979052 gtcttataaaaagggac 34979068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 36646412 - 36646628
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  36646412 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 36646511  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  36646512 tttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 36646611  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  36646612 gtcttataaaaagggac 36646628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25951083 - 25950876
Alignment:
Q  47 aattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga-gatga-tttatgttttcaacata 144  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||     
T  25951083 aattaagatagtggatatttgtattaacgttatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattagtttatgttttcaacatg 25950984  T
Q  145 ttatttattgctaattgaag--nnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataa 241  Q
    ||||||||||||||||||||         |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  25950983 ttatttattgctaattgaagaaaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggatatagcaaaggggtcttataa 25950884  T
Q  242 aaagggac 249  Q
    ||||||||    
T  25950883 aaagggac 25950876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7449530 - 7449315
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga-gatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | | |  |||||||    
T  7449530 aaaattacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcctttaagaaaaatgttagtttatgt 7449431  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  7449430 tttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggg 7449331  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  7449330 tcttataaaaagggac 7449315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 41252137 - 41252352
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga-tttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||   || | | |||||||    
T  41252137 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaataaggttagtttatgt 41252236  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||||| || |||||||||| | |||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  41252237 tttcaagatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaagggg 41252336  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  41252337 tcttataaaaagggac 41252352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Original strand, 17878119 - 17878239
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17878119 tacctccatccctaattatagggttcttttgaaaatataacgggaattaagatggtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttata 17878218  T
Q  103 attttatcttttaagagagag 123  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  17878219 attttatcctttaagagagag 17878239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 248
Target Start/End: Original strand, 36697912 - 36698121
Alignment:
Q  42 acgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttca 139  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||    
T  36697912 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttca 36698011  T
Q  140 acatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttctta 238  Q
    |||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||   |||||    
T  36698012 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagtggtctta 36698111  T
Q  239 taaaaaggga 248  Q
    ||||||||||    
T  36698112 taaaaaggga 36698121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8291165 - 8290949
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  8291165 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 8291066  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||| |     
T  8291065 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgg 8290966  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  8290965 gtcttataaaaagggac 8290949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 29064232 - 29064448
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  29064232 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgaaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 29064331  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  29064332 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 29064431  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  29064432 gtcttataaaaagggac 29064448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31458259 - 31458043
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  31458259 aaaatcacgggaattaagatagtggatgtctgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 31458160  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31458159 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 31458060  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  31458059 gtcttataaaaagggac 31458043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32814695 - 32814479
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | |  ||||||    
T  32814695 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatg 32814596  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  32814595 ttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggtcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgg 32814496  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  32814495 gtcttataaaaagggac 32814479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 33858642 - 33858857
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  33858642 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 33858741  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||| |||||||||||||||| ||||||     
T  33858742 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatcaatgtagttggaaataacaaagg- 33858840  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  33858841 gtcttataaaaagggac 33858857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40300492 - 40300276
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  40300492 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 40300393  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  40300392 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 40300293  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  40300292 gtcttataaaaagggac 40300276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 41025871 - 41026087
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  41025871 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 41025970  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||| |     
T  41025971 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgg 41026070  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  41026071 gtcttataaaaagggac 41026087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44547688 - 44547472
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  |  ||||||    
T  44547688 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatg 44547589  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||      
T  44547588 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagag 44547489  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  44547488 atcttataaaaagggac 44547472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48521324 - 48521076
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  | |||||||| | ||||||||||    
T  48521324 tactccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgcattaaagttatttgtaatcactattgttttt 48521225  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  48521224 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 48521125  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
           ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  48521124 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaag 48521076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 9036669 - 9036920
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  9036669 tacttcctccgttcctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 9036768  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  9036769 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 9036868  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  9036869 aacaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 9036920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Original strand, 36711074 - 36711288
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagag-agatga-tttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || || | | ||||||    
T  36711074 aaaatcacggtaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggtcagtttatg 36711173  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||        |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  36711174 ttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagga 36711272  T
Q  233 ttcttataaaaaggga 248  Q
     |||||||||||||||    
T  36711273 gtcttataaaaaggga 36711288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38361419 - 38361283
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatg 126  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||    
T  38361419 tcttttaaaaaaataatgggaattaagacagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatc-attgagagagagttg 38361321  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  38361320 gtttatgttttcaacatgttatttatagctgattgaag 38361283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41787542 - 41787302
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |  ||  || |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41787542 tactacctccgttcctaattacaggacacttttgaaaaaataatg--aa--aagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 41787447  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||| |  | || |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||      
T  41787446 acaattttatcctttaagaaaaggttggtttatgttttaaacatgttatttattgccgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgt-a 41787348  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  41787347 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaa 41787302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26255357 - 26255141
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  26255357 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactaatgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 26255258  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||       
T  26255257 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaatg 26255158  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  26255157 gtcttataaaaagggac 26255141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 29285812 - 29286028
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  29285812 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttagaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 29285911  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||  | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  29285912 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 29286011  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  29286012 gtcttataaaaagggac 29286028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 29642919 - 29643134
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  29642919 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 29643018  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||| || |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| | ||||     
T  29643019 ttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataac-aaggg 29643117  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  29643118 gtcttataaaaagggac 29643134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39197980 - 39197764
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  39197980 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 39197881  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||| |     
T  39197880 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaga 39197781  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  39197780 gtcttataaaaagggac 39197764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21295448 - 21295197
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  21295448 tactccctccgtccctaattataagaactttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 21295349  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  21295348 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 21295249  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  21295248 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 21295197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 34012294 - 34012509
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat-cttttaagagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |  |||||||    
T  34012294 aaaatcacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttagtttatgt 34012393  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||| | || |||||||||||| |||||||       |||||||  |||| |||| |||||||       ||||||||||| |||||||||||||| |      
T  34012394 tttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataacaaataggggcttgtatgtaaagaaataattaatgtacttggaaatagcaaaagag 34012493  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  34012494 tcttataaaaagggac 34012509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38858595 - 38858344
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || | |||||  ||||| | ||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  38858595 tacttcctccgtcccttattataagacccttttgctaaaatcaagggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 38858496  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||  | || |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  38858495 acaattttatccttaagagagagagttcgtttatgtttttcatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 38858396  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  38858395 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 38858344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2006731 - 2006522
Alignment:
Q  42 acgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttca 139  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||    
T  2006731 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttca 2006632  T
Q  140 acatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttctta 238  Q
    |||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||    
T  2006631 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagcctta 2006532  T
Q  239 taaaaaggga 248  Q
    ||||||||||    
T  2006531 taaaaaggga 2006522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7400387 - 7400174
Alignment:
Q  42 acgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-----agagagagatgatttatgttt 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||     ||||| || || ||||| |||    
T  7400387 acgggaattaagatagtggatatttgcattaaagttgtttgtaatccttattgtttttacaattttatcctttaattagagagaaagttggtttatattt 7400288  T
Q  137 tcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttc 235  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7400287 tcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtc 7400188  T
Q  236 ttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||    
T  7400187 ttataaaaagggac 7400174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 40120994 - 40121147
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | | | |||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  40120994 tactacctccgtctctaattatagggcccttttggaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtggtaataaatttgtttgtaattactattgtattt 40121093  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  40121094 acaattttatcctttaagagagagaaatagtttatgttttcaacatagtattta 40121147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 249
Target Start/End: Original strand, 43440910 - 43441101
Alignment:
Q  61 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  43440910 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 43441009  T
Q  159 ttgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||       |||||||| ||| ||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  43441010 ttgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagataatgagtcttataaaaagggac 43441101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 29176992 - 29177243
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  29176992 tactccctccgtctctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 29177091  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||       |||||||| |||| |||| |||||||     
T  29177092 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgta 29177191  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  29177192 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 29177243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 41002930 - 41003145
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||  |||||||    
T  41002930 aaaattacaggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagatagtttatgt 41003029  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |      
T  41003030 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgga 41003129  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  41003130 tcttataaaaagggac 41003145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17327133 - 17327003
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | | |||||||    
T  17327133 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaggttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatg 17327034  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17327033 ttttcaacatgttatttattgttgattgaag 17327003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23320917 - 23320788
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  23320917 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 23320818  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  23320817 ttttcaacatgttatttattgttgattgaa 23320788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34896155 - 34895903
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||    
T  34896155 tactacctccgtccttaattataggacttttttgctaaaatcacgggaattaagaaaataaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattattttt 34896056  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag-nnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||        |||||||| ||| |||  ||||||||    
T  34896055 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgaagaaaattgatgtataataaataaggatatgtatgt 34895956  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  34895955 acagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaagggac 34895903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38428444 - 38428194
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  38428444 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 38428345  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| || | ||||||||||||     
T  38428344 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgta 38428245  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||    
T  38428244 aagaaataattaatgtagttagaaataacaaagg-atcttgtaaaaagggac 38428194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 163
Target Start/End: Original strand, 10538917 - 10539033
Alignment:
Q  47 aattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatatt 146  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||  |    
T  10538917 aattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaatagagagttagtttatgttttcaacatgct 10539016  T
Q  147 atttattgctaattgaa 163  Q
    |||||||||| ||||||    
T  10539017 atttattgctgattgaa 10539033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 31802869 - 31803015
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||  |||||||| |||  ||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31802869 tccgtccctagttataggatctttttgccaaaatcacgaaaattaaaaaagttaataatagtattaaatttgtttataattactattgtttttacaattt 31802968  T
Q  107 tatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31802969 tatc-cttaagagagagttagtttatgttttcaacataatatttattg 31803015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 110
Target Start/End: Original strand, 12616178 - 12616260
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  12616178 cttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactaatgtttttacaaatttatc 12616260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Original strand, 18112955 - 18113158
Alignment:
Q  49 ttaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatatt 146  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||| ||    
T  18112955 ttaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgtt 18113054  T
Q  147 atttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    ||||| || | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||| |  | ||||||||||    
T  18113055 atttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggttttataaaaag 18113154  T
Q  246 ggac 249  Q
    ||||    
T  18113155 ggac 18113158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 160
Target Start/End: Original strand, 2470870 - 2470977
Alignment:
Q  55 tagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga--gagagatgatttatgttttcaacatattatttat 152  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  2470870 tagtggatatttgtattaaatatatttataattactattgtttttataatattatcctttaagagtgagagttgatttctgttttcaacatgttacttat 2470969  T
Q  153 tgctaatt 160  Q
    ||||||||    
T  2470970 tgctaatt 2470977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44719418 - 44719173
Alignment:
Q  3 ctacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttac 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| || ||||| || | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||     
T  44719418 ctacctccgtccataattataggatccttttgttaaaatcactggaatgaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttat 44719319  T
Q  102 aattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnn 200  Q
    ||||||||| ||    |||||| || ||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||       | || ||| |||| ||||||||||||        
T  44719318 aattttatcctt---aagagagttggtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatttacaataaatatgggcatgtatgtaaag 44719222  T
Q  201 nnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
       |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  44719221 aaataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaaaagggac 44719173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 164
Target Start/End: Original strand, 47534679 - 47534806
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgtt 135  Q
    ||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||    
T  47534679 aaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattgttgtttttacaattttatc-cttaagagagagttattttatgtt 47534777  T
Q  136 ttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  47534778 ttccatatgttatttattgctaattgaag 47534806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21587645 - 21587539
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgcta 157  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||| |     
T  21587645 gatatttatattaaatttgtttgcaattactattgtttttacaattttattttttaaaagagagaatttgtttatgttttcaacatgttatttattgttg 21587546  T
Q  158 attgaag 164  Q
    |||||||    
T  21587545 attgaag 21587539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28061014 - 28060766
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| | ||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  28061014 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 28060915  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | | |||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||| ||     
T  28060914 acaattttatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggta 28060815  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggg 247  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  28060814 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg-gtcttataaaaaggg 28060766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31581940 - 31581724
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |  ||||| |    
T  31581940 aaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttataattttatctttaagagagagagttagtttatat 31581841  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc-aaaggt 232  Q
    |||| | |  ||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||  ||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  31581840 tttccatacgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggg 31581741  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||| ||||    
T  31581740 gtcttataaaaaaggac 31581724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27813797 - 27813642
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||  |||  ||||| | ||| |||  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  27813797 tactacctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagtggattgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 27813698  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  27813697 acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattg 27813642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3776099 - 3775961
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagat 125  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||||| ||| |||  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |    
T  3776099 tcttttgcaaaaattacggagattaaaaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatattatccttaagagagagagtt 3776000  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  3775999 aatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 3775961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21135478 - 21135380
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  21135478 gtattaaatttgtatgtaattaccattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 21135380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 42887887 - 42887985
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  42887887 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 42887985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 164
Target Start/End: Original strand, 45777987 - 45778124
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tg 126  Q
    |||| ||||||| |||  |||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  |     
T  45777987 ttttaaaaaaatcacgaaaattaagaaagttgaaatttgtattaaagatgtttgtaatcactattatttttataattttatcttttaagagaaagaatta 45778086  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  45778087 gtttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaag 45778124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 156
Target Start/End: Original strand, 3796060 - 3796128
Alignment:
Q  90 tattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgct 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3796060 tattgtttttacaattttatcttttaaaagagagaattaatttatgtttttaacatattatttattgct 3796128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 19845407 - 19845574
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||| | |||   |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  19845407 tactacctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattacggagattaagaaagttagttgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 19845506  T
Q  100 acaattttatctttta---agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || |   |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  19845507 acaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 19845574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30534933 - 30534837
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  30534933 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 30534837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 46148728 - 46148563
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| | | | |||| |  || ||||| ||||  |||||| ||||| ||||    
T  46148728 tactacctccgtccctaattataaggtcttttataaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttgataattactattggtttt 46148629  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | ||| |||| | |||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||    
T  46148628 acaattttatccttaagagatagagttaatttatgttttcaatatagaatttaatgttaattgaag 46148563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Original strand, 5524740 - 5524878
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| |  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  5524740 tacctccgtccctatatataagatctttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 5524839  T
Q  103 attttatctttta---agagagagatgatttatgttttc 138  Q
    |||||||| || |   |||||||| ||||||||||||||    
T  5524840 attttatccttaagagagagagagttgatttatgttttc 5524878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17317609 - 17317487
Alignment:
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| |    
T  17317609 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 17317510  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  17317509 aaaggggtcttataaaaagggac 17317487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20075144 - 20075021
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  20075144 tactccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 20075045  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  20075044 acaattttatc-cttaagagagaga 20075021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 164
Target Start/End: Original strand, 49110826 - 49110932
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagaga--gagatgatttatgttttcaacatattatttattgcta 157  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  49110826 gatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcacttaagagagtgagctattttatgtttttaacatgttatttattgcca 49110925  T
Q  158 attgaag 164  Q
    |||||||    
T  49110926 attgaag 49110932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26299493 - 26299361
Alignment:
Q  118 agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagt 216  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||| |||||       |||||||||||||    
T  26299493 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagt 26299394  T
Q  217 tggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    | ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  26299393 tagaaatagtaaaggggtcttataaaaagggac 26299361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 249
Target Start/End: Original strand, 9233436 - 9233567
Alignment:
Q  119 gagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagtt 217  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| ||| || ||       ||||||||||||||    
T  9233436 gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatatacgtaaataaataattaatgtagtt 9233535  T
Q  218 ggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9233536 ggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 9233567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9299398 - 9299143
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  9299398 tactacctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcatgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgttttt 9299299  T
Q  100 acaattttatcttt-----taagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgta 193  Q
    ||| ||||||| ||      || |||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| ||| |||       |||||||| |||| ||| |||||    
T  9299298 acagttttatccttaagagaaatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggtatgta 9299199  T
Q  194 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||       ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  9299198 tgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggacttataaaaagggac 9299143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9303947 - 9303692
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  9303947 tactacctccgtccttatatataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgttttt 9303848  T
Q  100 acaattttatcttt-----taagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgta 193  Q
    ||| ||||||| ||      || |||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| ||| |||       |||||||| |||| ||| |||||    
T  9303847 acagttttatccttaagagaaatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggtatgta 9303748  T
Q  194 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||       ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  9303747 tgtaaagaaataattaatgtagttgtaaatagcaaaggggacttataaaaagggac 9303692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 32699513 - 32699609
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||    
T  32699513 gtattaaatttgtataaaattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaag 32699609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 35888540 - 35888444
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  35888540 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 35888444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 164
Target Start/End: Original strand, 46266159 - 46266282
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta---agagagagatgatttatgttttcaa 140  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||   | |||||| |  |||||||||||||    
T  46266159 gggaattaagatagtgaatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgtttttacaatttaatcctttatatatagagagttagtttatgttttcaa 46266258  T
Q  141 catattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||  ||||||| ||| |||||||    
T  46266259 catgatatttatagctgattgaag 46266282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 164
Target Start/End: Original strand, 7400523 - 7400626
Alignment:
Q  63 atttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaatt 160  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||  | |||||||||||||||||  ||||||||| | |||    
T  7400523 atttgtattgaagatgtttgtaatcactattgtttttacaagtttatcctttaaaagaaagaattaatttatgttttcaacatgctatttattgttgatt 7400622  T
Q  161 gaag 164  Q
    ||||    
T  7400623 gaag 7400626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 249
Target Start/End: Original strand, 18751774 - 18751975
Alignment:
Q  47 aattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatatt 146  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  ||| | |||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||| || || ||||||||||| | ||  |    
T  18751774 aattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatttaatcactattatttttacaattttat-tcttaagagatagttggtttatgttttccatatgct 18751872  T
Q  147 atttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    |||||||| |||||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||     
T  18751873 atttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgt-aaaaaataattaatgtagttgaaaatagcagagtggtcttataaaaat 18751971  T
Q  246 ggac 249  Q
    ||||    
T  18751972 ggac 18751975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 32964218 - 32964300
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  32964218 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 32964300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33342356 - 33342269
Alignment:
Q  77 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  33342356 tgtttataattactattgtttttacaattaaatcatttaagagagagttagtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaag 33342269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 110
Target Start/End: Original strand, 10071842 - 10071916
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    ||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10071842 aaaattacgggaattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgtaattattatggtttttacaattttatc 10071916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 23801990 - 23802088
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  23801990 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 23802088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 49044927 - 49045025
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  49044927 gtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 49045025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 33381520 - 33381565
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33381520 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 33381565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45722237 - 45722140
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  45722237 gtattaaatttgtatataattaccattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 45722140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 47648985 - 47649083
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  47648985 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-tcttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 47649083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19293047 - 19292970
Alignment:
Q  88 agtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  19293047 agtattgtttttacaattttat-tcttaagagagatagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 19292970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 154
Target Start/End: Original strand, 22991521 - 22991639
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |  ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |  | |||||||| |  |||||||    
T  22991521 aaaattacgggaattaagaaagttggaattagtattaaatttgtttataattactattgtttttac-attttatcctaaagagagagagttagtttatgt 22991619  T
Q  135 tttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22991620 tttcaacataatatttattg 22991639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Original strand, 3881371 - 3881445
Alignment:
Q  90 tattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  3881371 tattgtttttaaaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 3881445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9682831 - 9682745
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttat 152  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||    
T  9682831 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttat 9682745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18312485 - 18312321
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagta---ttgtt 96  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| | | | || ||| |||| |||| |||||||||||| ||   |||||    
T  18312485 tactatctctgtccttaattatagaactcttttagaaaaataacgggaattaagaaaattgaaattagtat-aaatttgtttgtaattactactattgtt 18312387  T
Q  97 tttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||  |  | ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  18312386 tttacaattttatcattta--agagatttagtgtatgttttcaacacaatatttaatgctaattgaag 18312321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24504914 - 24504816
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  24504914 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagcgagagagttaatttctattttcaacataatatttattgttgattgaag 24504816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 29629976 - 29629875
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgtt 135  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  || |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  29629976 aaaattacgggaattaagaaagtgaatgtttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttgcaattttatc-cttaaaagagagttgatttatgtt 29629878  T
Q  136 ttc 138  Q
    |||    
T  29629877 ttc 29629875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 33683007 - 33683089
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
T  33683007 taattaatattgcttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacctaatatttattgttgattgaag 33683089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12129768 - 12129723
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  12129768 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaagagggac 12129723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20074980 - 20074935
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20074980 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 20074935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 164
Target Start/End: Original strand, 20182099 - 20182184
Alignment:
Q  79 tttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  |  | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  20182099 tttgtaattactattgtttttacaatcttatccttacagagagatttagtgtatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 20182184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 12616329 - 12616373
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  12616329 taattaatgtagttggaaatagtaaagggatcttataaaaaggga 12616373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 26299545 - 26299493
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaa 52  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  26299545 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaacaataacgggaattaa 26299493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25530793 - 25530750
Alignment:
Q  79 tttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga 122  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25530793 tttgtaattacaattgtttttataattttatcttttaagagaga 25530750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 9682602 - 9682644
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9682602 tactacctccgtccctaattataagactcttttgaaaaaataa 9682644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 32643544 - 32643654
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| | | | |||||| ||||||||||    
T  32643544 tactacctcagtccctaaatataggagtcttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttatatataattactattgttttt 32643643  T
Q  100 acaattttatc 110  Q
    |||||||||||    
T  32643644 acaattttatc 32643654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33682938 - 33682869
Alignment:
Q  70 ttaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaa 140  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||    
T  33682938 ttaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagagtaaatttatgttttcaa 33682869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 110
Target Start/End: Original strand, 34900779 - 34900829
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  34900779 gatatttgtattaaaattgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatc 34900829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37915356 - 37915274
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  37915356 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 37915274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43008360 - 43008251
Alignment:
Q  46 gaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatat 145  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||| | || ||||||||||| |||||  ||||||||| || |  |||| |||||||||||      
T  43008360 gaattaagaaagttgatatttgtattaaagatatttgtaatcactactgtttttacaa-tttatactttaagagaaagttagtttaagttttcaacatga 43008262  T
Q  146 tatttattgct 156  Q
    || ||||||||    
T  43008261 taattattgct 43008251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 163
Target Start/End: Original strand, 46415103 - 46415199
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaa--gagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  46415103 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttat-tcttaagggagagagttagtttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 46415199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Original strand, 6910622 - 6910678
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6910622 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagaga 6910678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19497475 - 19497419
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19497475 gtattaaatttgtttataattcctattgtttttacaattttatc-cttaagagagaga 19497419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 22991690 - 22991735
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22991690 taattaatgtaattggaaatagcaaatggatcttataaaaagggac 22991735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 32699650 - 32699695
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  32699650 taattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 32699695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34693631 - 34693534
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||||||    
T  34693631 gtattaaatttgtatacaattactattatttttacaattttatccttaagagatagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaa 34693534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Original strand, 44510179 - 44510248
Alignment:
Q  96 ttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  44510179 ttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 44510248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 44510289 - 44510334
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  44510289 taattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 44510334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 45778168 - 45778213
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  45778168 taattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 45778213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 47534850 - 47534894
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  47534850 taattaatgtagttgaaaatagcaaagggtt-ttataaaaagggac 47534894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 123
Target Start/End: Original strand, 31137214 - 31137266
Alignment:
Q  71 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag 123  Q
    ||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31137214 taaatttgtttgtaattgttatttcttttacaattttatcctttaagagagag 31137266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 31769278 - 31769322
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  31769278 taattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaaggga 31769322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 161)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20142000 - 20142250
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20142000 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 20142099  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||| |||||| ||||||||||||      
T  20142100 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaa 20142199  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20142200 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 20142250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14913945 - 14913655
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14913945 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 14913846  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  14913845 acaattttatcctttaagagatagatgatttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 14913746  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacgga 289  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  14913745 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 14913655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32964425 - 32964178
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32964425 tacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 32964326  T
Q  103 attttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnn 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       || ||||||||||||| |||||||||         
T  32964325 attttatcctttaagagagtgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgcataattaatagggacatgtatgtaaaga 32964226  T
Q  202 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32964225 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggac 32964178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7940748 - 7940498
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7940748 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7940649  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||      
T  7940648 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaa 7940549  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  7940548 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 7940498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9020991 - 9020741
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020991 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 9020892  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  9020891 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 9020792  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9020791 agaaataattaatgtagatggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggac 9020741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20987954 - 20988204
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20987954 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaatagcgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 20988053  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  20988054 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 20988153  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  20988154 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaagggac 20988204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16441227 - 16440977
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16441227 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 16441128  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||       |||||||||||||| |||||||||||      
T  16441127 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggcatgtatgtaa 16441028  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  16441027 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaagagggac 16440977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4194976 - 4194728
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  4194976 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaat--gtttgtaattactattattttt 4194879  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  4194878 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacattttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 4194779  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  4194778 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttacaaaaagggac 4194728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Original strand, 27873094 - 27873336
Alignment:
Q  11 gtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 109  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27873094 gtccctaattatagggtcattttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 27873193  T
Q  110 cttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaa 206  Q
    | |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||| |||||||| ||||       |||    
T  27873194 cctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgcatgtaaagaaataa 27873293  T
Q  207 ttaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  27873294 ttaatgtagttggaaataggaaaagggtcttataaaaagggac 27873336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 13759188 - 13759438
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13759188 tactacctccgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatggtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 13759287  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  13759288 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 13759387  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  13759388 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaagggac 13759438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3028313 - 3028059
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028313 tactacctccgtcccttattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 3028214  T
Q  100 acaattttatcttttaagaga----gagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtat 194  Q
    ||||||||||  |||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||    
T  3028213 acaattttattctttaagagagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtat 3028114  T
Q  195 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||       |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  3028113 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 3028059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23285335 - 23285081
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23285335 tactacatccgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23285236  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga----tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtat 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||    
T  23285235 acaattttatcctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtat 23285136  T
Q  195 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||       |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  23285135 gtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 23285081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40643392 - 40643140
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattat-aggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40643392 tactacctccgtccctaattatcagggccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 40643293  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  40643292 acaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 40643193  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  40643192 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggac 40643140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 10511211 - 10511462
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10511211 tactacctccgtccctaattatagggccattttaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 10511310  T
Q  101 caattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||| || ||||||||||     
T  10511311 caattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgta 10511410  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  10511411 aagaaataattaatgtagttgaaaataggaaatgagtcttataaaaagggac 10511462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21239396 - 21239149
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21239396 tactacctccgtctctaattataggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgcattaaatatgttcgtaattactattgttttta 21239297  T
Q  101 caattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||       |||||||| || | ||||||||||||     
T  21239296 caattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgta 21239197  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21239196 aagaagtaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 21239149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14649472 - 14649235
Alignment:
Q  12 tccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14649472 tccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatc 14649373  T
Q  111 ttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaat 207  Q
     |||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||        |||||||| |||| ||||||||||||       ||||    
T  14649372 ctttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 14649273  T
Q  208 taatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14649272 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 14649235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 14436100 - 14435934
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14436100 tactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 14436001  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14436000 acaattttatcttttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 14435934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20186799 - 20186547
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20186799 tacttcctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20186700  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||       ||||| || |||| ||| ||||||||    
T  20186699 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggtatgtatgt 20186600  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  20186599 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggac 20186547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 23285815 - 23286067
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc--ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23285815 tactacctccgtctctaattatagggccctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttt 23285914  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagaga-gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgt 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23285915 tacaattttatcctttaagagagatgattgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgt 23286014  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  23286015 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagatgtcttataaatagggac 23286067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9065205 - 9064953
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9065205 tactatctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 9065106  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  9065105 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 9065006  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  9065005 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 9064953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 43060150 - 43060402
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43060150 tactaccttcgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 43060249  T
Q  100 acaattttatctttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||        |||||||| |||| ||||||||||||    
T  43060250 acaattttatcctttaaaagagagggatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 43060349  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  43060350 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggac 43060402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20518139 - 20517976
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20518139 tactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20518040  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    | ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20518039 ataattttatccttt-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag 20517976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 31507360 - 31507593
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31507360 tactacctccatctctaattataaggtccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatcactattgttttt 31507459  T
Q  100 acaattttatctttta--agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  31507460 acaattttatcctttaatagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 31507559  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaag 230  Q
           |||||||||||||||||||||||||||    
T  31507560 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaag 31507593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12744122 - 12743820
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12744122 tactacctctgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 12744023  T
Q  100 acaattttatctttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||  ||||||| |||||||||    
T  12744022 acaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacatgtatgt 12743923  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttc--tcaaaatggtcttataatcaggaacggatatag 294  Q
           ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||         |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12743922 aaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaagggacaatttttttttctttcaaaatggtcttataattaggaacggagatag 12743823  T
Q  295 tac 297  Q
    |||    
T  12743822 tac 12743820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 34889017 - 34889269
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34889017 tactacatccgtccttaattatagagtctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34889116  T
Q  100 acaattttatctttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||        |||||||| ||| |||||||||||||    
T  34889117 acaattttatcctttaaaagagagagttgatttatgtattcaacatgttatttattgctggttgaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 34889216  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  34889217 aaagaaataattaatgtagttggaaataggaaagatgtcttataaaaagggac 34889269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34332516 - 34332266
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34332516 tactacctccgtccctaattataagaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34332417  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    |||||| |||  || ||||||||||  || |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  34332416 acaattatattcttgaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgt 34332317  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggg 247  Q
           ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  34332316 aaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaggg 34332266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14619540 - 14619299
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14619540 tccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 14619441  T
Q  107 tatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnn 203  Q
    |||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||           
T  14619440 tatcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 14619341  T
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  14619340 taattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 14619299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 40951782 - 40952034
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40951782 tactacctccgttcctaattatacgatccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 40951881  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||       || ||||| ||| |||||||||||||    
T  40951882 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 40951981  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  40951982 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaaaggac 40952034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 9268032 - 9268283
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9268032 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 9268131  T
Q  100 acaattttatctttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||  || | || | ||  |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  9268132 acaattttatcctttaaaaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 9268231  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  9268232 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 9268283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 4976028 - 4976281
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4976028 tactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgctttt 4976127  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga----tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtat 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    || |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||        |||||||| ||||| |||||||||    
T  4976128 acaattttatcctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataataaatagaggcatgtat 4976226  T
Q  195 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||       |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  4976227 gtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaagagatcttataaaaggggac 4976281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 8144459 - 8144625
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8144459 tactacctccgtccctaattataaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 8144558  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | ||  ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  8144559 acaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgtttttaacattctatttattgctgattgaag 8144625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 18615801 - 18616057
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  18615801 tactccctctgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaatttt 18615900  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga------tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgt 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||      || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       ||||| || |||| || |||||    
T  18615901 acaattttatcctttaagagagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgt 18616000  T
Q  193 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||       |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18616001 atgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 18616057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 39121429 - 39121681
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39121429 tactacctccgtccctaattataaggctcttttaaaaaaatagcgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 39121528  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  39121529 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgatttaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 39121628  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  39121629 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 39121681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 28140687 - 28140907
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| | ||    
T  28140687 cttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagtgttg 28140786  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttat-tgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
     |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  28140787 gtttatgttttcaacatgttatttatccgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 28140886  T
Q  225 gcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  28140887 gcaaaggggtcttataaaaag 28140907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35039294 - 35039043
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  | ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35039294 tactacctccgtcgctaattataaggcccttttaaaaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 35039195  T
Q  101 caattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtn 197  Q
    ||| |||||| || ||||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||       || ||||| ||| ||| ||| |||||     
T  35039194 caaatttatcattcaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaggacatatatgta 35039095  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  35039094 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaatatcttataaaaagggac 35039043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 38371713 - 38371964
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| || |||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38371713 tactatctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataatggaaattaagattgtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattaatattattttt 38371812  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  38371813 acaattttattctttaatagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 38371912  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagc-aaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||    
T  38371913 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggatcttataaaaagggac 38371964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 23092379 - 23092631
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  23092379 tactacctccgtccctaatcatatgacctttttgaaaaaataacgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttgtt 23092478  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||  |||| ||||||| ||||    
T  23092479 acaattttatcctttaagagacataattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtataaaaaataggggcatgcatgt 23092578  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  23092579 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtattataaaaagggac 23092631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Original strand, 24307924 - 24308132
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagag--agagatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  24307924 gggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaac 24308023  T
Q  142 atattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttata 240  Q
    || ||||||||| || |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  24308024 atgttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttata 24308123  T
Q  241 aaaagggac 249  Q
    |||||||||    
T  24308124 aaaagggac 24308132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24365399 - 24365191
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagag--agagatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  24365399 gggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaac 24365300  T
Q  142 atattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttata 240  Q
    || ||||||||| || |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  24365299 atgttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttata 24365200  T
Q  241 aaaagggac 249  Q
    |||||||||    
T  24365199 aaaagggac 24365191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35547559 - 35547307
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  35547559 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtaattactattattttt 35547460  T
Q  100 acaattttatcttttaaga--gagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  35547459 acaattttatcctttaagaatgagggttggcttatgttttcaacattttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 35547360  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  35547359 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggac 35547307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39985063 - 39984819
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39985063 ctccgtccctaattataaggaccttttgaaaaaataacgagaattaagatagcggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 39984964  T
Q  106 ttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag---ggcatgtatgtnnnn 200  Q
    ||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||||   || ||||||||        
T  39984963 ttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagaggtatgtatgtaaag 39984864  T
Q  201 nnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
       |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  39984863 aaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaag 39984819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7735133 - 7734880
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaa-taacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7735133 tactacctccgtccctaattatatggcccttttgaaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 7735034  T
Q  99 tacaattttatctttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatg 195  Q
    |||||||||||| |||  || | || | ||  |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||||||||    
T  7735033 tacaattttatcctttaaaaaatagggttgggttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 7734934  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       ||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  7734933 taaagaaataattaatgtagttgaaaataaaaaaggggtcttataaaaagggac 7734880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21750226 - 21749977
Alignment:
Q  3 ctacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttac 101  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  21750226 ctacctccgtccttaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttat 21750127  T
Q  102 aattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnn 198  Q
    ||||||||| ||||| | ||||   ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||      
T  21750126 aattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaa 21750027  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
         |||| |||||||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||||    
T  21750026 agaaataatcaatgtagttgaaaatagaaaatgaatctcataaaaaggga 21749977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30183138 - 30182972
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30183138 tactacctccgtctctaattataagactcttctgaaaaaataacgggaattaagatagatgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 30183039  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  30183038 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 30182972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 41418606 - 41418440
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattat-aggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41418606 tactacctccgtccctaattatgaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 41418507  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||    
T  41418506 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaatattctatttattgttgattgaag 41418440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39759185 - 39758958
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39759185 tactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatgtttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 39759086  T
Q  100 acaattttatcttttaagagag--agatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    |||| |||||| || |||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||       || ||||| ||| |||||||||||||    
T  39759085 acaaatttatccttcaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 39758986  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
           |||||||||||||||||||||    
T  39758985 aaagaaataattaatgtagttggaaata 39758958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17714863 - 17714700
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||    
T  17714863 tacctccgtccctaattatagaacctttttgaaaaaattatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttctgattactattgttttgaca 17714764  T
Q  103 attttatcttttaagagagagatga---tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  17714763 attttattttttaagagagagatgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 17714700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9264271 - 9264019
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9264271 tactacctccgtctttaattataaggtctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 9264172  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| ||| || |||||||| |    
T  9264171 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatat 9264072  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||    
T  9264071 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaacgggac 9264019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 8283851 - 8284099
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||     ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8283851 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaag----ataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 8283946  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| | |   |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||        |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  8283947 acaattttatcctttaagaaagagggttagcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 8284046  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  8284047 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 8284099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22658061 - 22657814
Alignment:
Q  6 cctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 104  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22658061 cctccgtctctaattataagatctttttgaaaaaattaaagaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaat 22657962  T
Q  105 tttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnn 201  Q
    |||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||         
T  22657961 tttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 22657862  T
Q  202 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  22657861 aataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 22657814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 26889593 - 26889715
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26889593 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 26889692  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga 122  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  26889693 acaattttatcctttaaaagaga 26889715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1266211 - 1265995
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  1266211 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 1266112  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  1266111 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 1266012  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  1266011 gtcttataaaaagggac 1265995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 6672967 - 6673219
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  6672967 tactccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 6673066  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  6673067 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 6673166  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  6673167 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 6673219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 15190554 - 15190806
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||    
T  15190554 tactccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttataatcactattgttttt 15190653  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  15190654 acaattttatcatttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 15190753  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  15190754 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 15190806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31889155 - 31888939
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  31889155 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 31889056  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31889055 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 31888956  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  31888955 gtcttataaaaagggac 31888939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 42030339 - 42030493
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42030339 tactacctccgtccctagttataaggccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 42030438  T
Q  101 caattttatcttttaaga--gagagatgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |   |||||||||||||||  ||||||||    
T  42030439 caattttatcctttaagaaggagagttagcttatgttttcaacattctatttatt 42030493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Original strand, 15774830 - 15774958
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagat 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | |    
T  15774830 cttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggtt 15774929  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||    
T  15774930 gacttatgttttcaacattctatttattg 15774958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40738704 - 40738461
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  40738704 tacctccgtctttaattataggatatttttgctaaaattacgggaattaaaaaagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttaca 40738605  T
Q  103 attttat-cttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnn 200  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |  ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||       |||||||| ||||| || ||||||||        
T  40738604 attttatccttatgagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctcattgaagaaaaagatgtataataaatagaggtatgtatgtaaag 40738505  T
Q  201 nnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
       ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  40738504 aaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaa 40738461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16152994 - 16153246
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  16152994 tactccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 16153093  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||    
T  16153094 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgt 16153193  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  16153194 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 16153246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 17674433 - 17674649
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  17674433 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 17674532  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  17674533 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 17674632  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  17674633 gtcttataaaaagggac 17674649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22527954 - 22527738
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||  | |  ||||||    
T  22527954 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatg 22527855  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22527854 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 22527755  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  22527754 gtcttataaaaagggac 22527738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 28041126 - 28041342
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  28041126 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattacagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 28041225  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  28041226 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 28041325  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  28041326 gtcttataaaaagggac 28041342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34662466 - 34662250
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  34662466 aaaatcacgggaaataagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 34662367  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34662366 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 34662267  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  34662266 gtcttataaaaagggac 34662250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11781023 - 11780886
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||    
T  11781023 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttg 11780924  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
      |||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  11780923 gcttatattttcaacattctatttattgttgattgaag 11780886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 19571669 - 19571929
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaa--------tagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagta 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |        ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19571669 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaatttaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacca 19571768  T
Q  92 ttgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggc 188  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||    
T  19571769 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 19571868  T
Q  189 atgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||| |||       |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  19571869 atgtgtgtaaagaaataattaatatagttggaaatagtaaatgggtcttataaaaagggac 19571929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37034443 - 37034279
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||    
T  37034443 tactacctccgtccctaattataaggaccttttgaaaaaataaccgaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtgtgtaa--actattgttttt 37034346  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  37034345 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaag 37034279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7951852 - 7951607
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7951852 ctccctccctaattataagatcattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 7951753  T
Q  106 ttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnn 203  Q
    ||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||           
T  7951752 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 7951653  T
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  7951652 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 7951607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 10734296 - 10734512
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  10734296 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 10734395  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10734396 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 10734495  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  10734496 gtcttataaaaagggac 10734512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 13862734 - 13862986
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  13862734 tactccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 13862833  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  13862834 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgacagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 13862933  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  13862934 aaagaattaattaatgtagttggaaataacaaaggagttttataaaaagggac 13862986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Original strand, 15521725 - 15521933
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||||    
T  15521725 gggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaac 15521824  T
Q  142 atattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttata 240  Q
    || |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  15521825 atgttatttattgttgattgaaggaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttata 15521924  T
Q  241 aaaagggac 249  Q
    |||| ||||    
T  15521925 aaaaaggac 15521933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5528227 - 5528020
Alignment:
Q  45 ggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaaca 142  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| |||  | | ||||||||||||||||    
T  5528227 ggaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactactgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaaca 5528128  T
Q  143 tattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataa 241  Q
    | |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  5528127 tgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataa 5528028  T
Q  242 aaagggac 249  Q
    ||| ||||    
T  5528027 aaaaggac 5528020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9828690 - 9828439
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  9828690 tactccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 9828591  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  9828590 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 9828491  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  9828490 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 9828439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 249
Target Start/End: Original strand, 32617561 - 32617767
Alignment:
Q  46 gaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacat 143  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||    
T  32617561 gaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttgtcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacat 32617660  T
Q  144 attatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaa 242  Q
      ||||||||||| |||||||       |||||| | |||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  32617661 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaa 32617760  T
Q  243 aagggac 249  Q
    |||||||    
T  32617761 aagggac 32617767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Original strand, 25600835 - 25601048
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  25600835 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 25600934  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||        |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||  |||||     
T  25600935 ttttcaacatattatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggg 25601034  T
Q  233 ttcttataaaaagg 246  Q
     |||||||||||||    
T  25601035 gtcttataaaaagg 25601048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 13703577 - 13703797
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 127  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||     
T  13703577 cttttgaaaaaatattaggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttacaattttattttttaaaagagagttgg 13703676  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||| |||||  |||||||    
T  13703677 tttat-ttttcaacatgttatttattgttgtttgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttaaaaatagc 13703775  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
    ||| |  |||||||| ||||||    
T  13703776 aaaagaatcttataacaaggga 13703797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32478400 - 32478184
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||  | |  |||||     
T  32478400 aaaatcacgggaattaatataatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttata 32478301  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  32478300 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 32478201  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  32478200 gtcttataaaaagggac 32478184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 42561124 - 42561340
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  |  ||||||    
T  42561124 aaaattacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatg 42561223  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||        |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  42561224 ttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgg 42561323  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  42561324 gtcttataaaaagggac 42561340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41641361 - 41641141
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  41641361 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 41641262  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt----nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaa 228  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||    
T  41641261 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaattaatgtagttggaaataacaa 41641162  T
Q  229 aggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  41641161 aggggtcttataaaaagggac 41641141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 3686529 - 3686745
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | |  |||||     
T  3686529 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaataaggttagtttata 3686628  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  3686629 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 3686728  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||| ||||    
T  3686729 gtcttataaaaatggac 3686745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 4752993 - 4753209
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  4752993 aaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 4753092  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| || || ||||  |    
T  4753093 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaattaacaaaaat 4753192  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  4753193 gtcttataaaaagggac 4753209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 4984891 - 4985107
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  4984891 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattatagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 4984990  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||  | |||||||       | |||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  4984991 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatctataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 4985090  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  4985091 gtcttataaaaagggac 4985107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 41383912 - 41384157
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  41383912 tactccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 41384011  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||| || || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  41384012 acaattttgtccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 41384111  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaa 243  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41384112 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 41384157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 3497547 - 3497791
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    |||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  3497547 tccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatat 3497646  T
Q  107 tatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnnt 204  Q
    |||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |    
T  3497647 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 3497746  T
Q  205 aattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  3497747 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 3497791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16127549 - 16127305
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    |||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16127549 tccgtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 16127450  T
Q  107 tatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnnt 204  Q
    |||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       |    
T  16127449 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaat 16127350  T
Q  205 aattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  16127349 aattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 16127305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 17592541 - 17592767
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  17592541 tactccctccgtttctaattataggacacttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 17592640  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  17592641 acaattttatc-tttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgt 17592739  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
           |||||||||||||||||||||    
T  17592740 aaagaaataattaatgtagttggaaata 17592767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 40004149 - 40004400
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  40004149 tactccctccgtccctaaatataagatccttttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 40004248  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       | |||||| |||| ||||||||||||     
T  40004249 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgta 40004348  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  40004349 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 40004400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 12807220 - 12807132
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaatta 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12807220 tactacctccgtccctaattatagagtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaatta 12807132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13661156 - 13660907
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaa-aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||| |  ||||| |||| |||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  13661156 tactccctccgtccctaattataagacctttttattaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 13661057  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||| || |||||      
T  13661056 acaattttatc-cttaagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatatatgtaa 13660958  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  13660957 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 13660907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 186395 - 186170
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  186395 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgttttt 186296  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  186295 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 186196  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaat 223  Q
          ||||||||||||||||||||    
T  186195 aagaaataattaatgtagttggaaat 186170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 31158194 - 31158415
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatg 126  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||    
T  31158194 tcttttgttaaaattacgggaattaagaaagt-gatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttataattttatc-cttaagagagagttg 31158291  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
     ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||| ||| ||||||    
T  31158292 gtttatgttttccatatgctatttattgcttattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatag 31158391  T
Q  226 caaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||   ||||||||||||||||    
T  31158392 aaaagtggtcttataaaaagggac 31158415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15675037 - 15674917
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgtt 135  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  15675037 aaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatcttttaagagagagttagtttatatt 15674938  T
Q  136 ttcaacatattatttattgct 156  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  15674937 ttcaacatgttatttattgct 15674917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 20988340 - 20988252
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaatta 88  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20988340 tactacattcgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 20988252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12806856 - 12806692
Alignment:
Q  88 agtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata- 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||  ||||     
T  12806856 agtattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatag 12806757  T
Q  185 gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  12806756 gggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaagggac 12806692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 22581475 - 22581726
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |  ||||||||| || ||||||||||    
T  22581475 tactacctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaataaagtggatatttatattacagttgtttgtaagtactattgttttt 22581574  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtn 197  Q
    ||| ||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | || |||||||||||| ||| ||        |||||||| ||||| |||||||||||     
T  22581575 acagttttatccttaagagagagagttcgtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 22581674  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22581675 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaaatcttataaaaagggac 22581726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20987958 - 20987793
Alignment:
Q  87 tagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||    
T  20987958 tagtattgtttttacaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 20987859  T
Q  185 ggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  20987858 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 20987793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 41686922 - 41687018
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  41686922 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 41687018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 163
Target Start/End: Original strand, 8100169 - 8100297
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag-atgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| || | || || | ||||||    
T  8100169 aaaattacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaatttgtttgtaatccctattggttttacaattttatcatttaggataaagaattagttatgt 8100268  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  8100269 tttcaacatgttatttattgatgattgaa 8100297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 35495014 - 35495174
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaa 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||| |||||||| | | | |||| | ||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  35495014 tacctccgtccctaattatgggcctttttaaaaaaataacaggaattaagaaaattgataatggtaataaatttatttgtaattactattgattttacaa 35495113  T
Q  104 ttttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||| ||||||||| || | || ||| ||||||| ||| |||||| || | |||||||    
T  35495114 ttttatcctttaagagaaaggtaatgtatattttcaaaatagtatttaatgttgattgaag 35495174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 33639552 - 33639478
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33639552 aaaatcacgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatc 33639478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Original strand, 9438877 - 9438989
Alignment:
Q  47 aattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaa-ttttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacat 143  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||    
T  9438877 aattaagaaagttgatatttttattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaatttttttcttttaagagagagaattagtttgtgttttcaacat 9438976  T
Q  144 attatttattgct 156  Q
      |||||||||||    
T  9438977 gctatttattgct 9438989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25837238 - 25837141
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaa-gagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  25837238 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 25837141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 162
Target Start/End: Original strand, 26076188 - 26076292
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgcta 157  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||||||  |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  26076188 gatatctgtattaaatttgtttctaattattattatttttacaattttattctttaagaaagagagttagtttgtgttttcaacatattatttattgctg 26076287  T
Q  158 attga 162  Q
    |||||    
T  26076288 attga 26076292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 26605391 - 26605614
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta---------agagagagatg 126  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || |         |||||||| |     
T  26605391 aaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagagagagagtta 26605490  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
     ||||||||||| | || |||||||||||| ||| |||       |||||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||     
T  26605491 gtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatat 26605590  T
Q  226 caaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||  ||||||||||||||||    
T  26605591 caaaggggtcttataaaaagggac 26605614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 38161520 - 38161771
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| ||||||||  |||| || |||||||  ||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||  |||||| ||| |   ||| ||||    
T  38161520 tactaccttcgtccctatatataagactcttttgccaaaattacgggaatcaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgcaatcaccgttgatttt 38161619  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||| |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||| | | || ||||||||||||     
T  38161620 acaattttatcctttagagatagagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtatagtaagtaggggcatgtatgta 38161719  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  38161720 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggac 38161771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 23286221 - 23286344
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  23286221 tacttcctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 23286320  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  23286321 acaattttatc-cttaagagagaga 23286344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 3160302 - 3160518
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||| |||| || |||||  |||||||| |||||  | |||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |  ||||||    
T  3160302 aaaatcacgagaatcaagatagtgaatatttgtgttaaagttttttgtaaacactattgtttttacaaatttatcctttaagagagatggttagtttatg 3160401  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| | |||||||||        |||||||||| ||| ||||||||||||     
T  3160402 ttttcaacatactatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaaaaattaatgtaattgaaaatagcaaagga 3160501  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  3160502 atcttataaaaagggac 3160518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 163
Target Start/End: Original strand, 35784728 - 35784822
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  35784728 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatc-cttaagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 35784822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13335585 - 13335419
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| | | | || | |  || ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13335585 tactacatccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgaaaaataagaaaatggaaagtgataataaatttgtttgtaattaatattgctttt 13335486  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga-gatgatt-tatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||| ||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  13335485 acaattttatcctttacgagagatgattattgtatgctttgaacatagtatttaatgctgattgaag 13335419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27834174 - 27834076
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  27834174 gtattaaatttgtatataattatcattgtttttacaattttatcattaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 27834076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 28414507 - 28414589
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  28414507 taattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 28414589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32147588 - 32147339
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | || |  |||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||    
T  32147588 tactccctccgtctctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagca--tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgctttt 32147491  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | || ||||| |  ||||||||||  | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  32147490 acaattttatccttaagagtgagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 32147391  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  32147390 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 32147339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18251317 - 18251148
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||||| ||| | || |  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  18251317 tactacctccgtccctaaatatatgatccttttgtcaaaatcacgagaattaaaaaagttggtagtaatattaaatttgtatataattactattgttttt 18251218  T
Q  100 acaattttatcttt-----taagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||      ||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  18251217 acaattttatccttaagagaaagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttattgttgattgaag 18251148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14789814 - 14789604
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||  || |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| | | ||||||||    
T  14789814 aaaatcacgggaattaagaaagtggatcattatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagggttaatttatgt 14789715  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||| ||| |||||||| ||       
T  14789714 tttctatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcagagagg 14789615  T
Q  234 tcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||    
T  14789614 tcttataaaaa 14789604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16926682 - 16926595
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagag-agagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16926682 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagaagagttaatttatgttttcaacataatatttattg 16926595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37700388 - 37700225
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | | | ||   |  || ||||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  37700388 tacctccgtctctaattatatggcacttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaggtgataataaatttgtttgtaatcaccattgtttttaca 37700289  T
Q  103 attttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |  | ||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  37700288 attttatcctttaagagagaaaattagtatatgttttcaatatagtatttaatgctgattgaag 37700225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 39692462 - 39692557
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  39692462 tattaaatttgtatataattattgttgtttttacaattttat-tcttaagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 39692557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 23259878 - 23260033
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||| ||||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  23259878 tactacctccgtccctaaatatagaagtcttttgccaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattaatattgttttt 23259977  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||||| || | ||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23259978 acaattttatccttaagagaaagtgttaatttatgttttcaacataatatttattg 23260033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5283277 - 5283179
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||| || | || ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  5283277 gtattaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttatccttaagaaagatagttaatctatgttttcaacatagtatttattgttgattgaag 5283179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 6328626 - 6328708
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  6328626 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 6328708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7408926 - 7408872
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga 122  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7408926 tattaaatttgtttgtaattactattgtttatacaattttatcttttaagtgaga 7408872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 8356281 - 8356443
Alignment:
Q  3 ctacctccgtccctaattataggatcttttgaa-aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttac 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||| |  ||||| || |||||||| | ||| |||| |  |||||||| | | | |||||| | ||||||||||    
T  8356281 ctacctccgtccctaaatataggagcattttatcaaaattactggaattaagaaagttgatagtaatattaaatttatatataattactgttgtttttac 8356380  T
Q  102 aattttat-cttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    |||||||| |||  |||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  8356381 aattttatacttaaaagatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 8356443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16099448 - 16099360
Alignment:
Q  79 tttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttat---tgctaattgaag 164  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  | ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  16099448 tttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaagagagggttagtgtatgttttcaacatagtatttatcaatgctaattgaag 16099360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24857785 - 24857687
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  24857785 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 24857687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31657914 - 31657816
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  31657914 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 31657816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3629132 - 3629035
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  3629132 gtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatcctttaagctagagttagtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaag 3629035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13236169 - 13236073
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  13236169 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 13236073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 110
Target Start/End: Original strand, 13958620 - 13958701
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    |||||| ||||| | | ||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13958620 ttttgataaaatcatgagaattaaaaaagtgaatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatc 13958701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 136
Target Start/End: Original strand, 2328422 - 2328498
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttt 136  Q
    |||||||| ||||||  |||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  2328422 gatatttgcattaaagttgttagtaatcactattgattttacaattttatcctttaagagagagttaatttatgttt 2328498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8950045 - 8949957
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  8950045 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattg 8949957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 10561356 - 10561253
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaa 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||   ||| |||||| | | | ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10561356 taccttcgtccataattataggatcctttaaaaaaa---cggaaattaagaaaattgatatttctaataaatttgtttgtaattattattgtttttataa 10561260  T
Q  104 ttttatc 110  Q
    |||||||    
T  10561259 ttttatc 10561253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39971244 - 39971156
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39971244 gtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattg 39971156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7001532 - 7001445
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7001532 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatt 7001445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14571521 - 14571333
Alignment:
Q  61 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaatt 160  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||  | || ||||| |||| | |||    
T  14571521 atatttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttacaattttatc-cttaagagagagttagtttatgttttgcatatgttattcattgttgatt 14571423  T
Q  161 gaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||       |||||||| | || ||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||    
T  14571422 gaagaaaaatatgtataataagtaggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttatgaaaagggac 14571333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15559834 - 15559665
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| || | ||||| |||||| ||||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||  | |||||| ||||||||||    
T  15559834 tactacctccgtccctaaatataagagccttttgtaaaaattacggagattaagaaagttggttctagtattaaatttgcatataattactattgttttt 15559735  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga------tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||| | ||||||||||||      | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  15559734 acaattttat-tcttaagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 15559665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26699543 - 26699448
Alignment:
Q  71 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga-gatgatt-tatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||| || | |||||||    
T  26699543 taaatttgtttgtaattaatattgtttttataattttatgctttaagagagatgattattgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaag 26699448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26969276 - 26969181
Alignment:
Q  71 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga-gatgatt-tatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||| || | |||||||    
T  26969276 taaatttgtttgtaattaatattgtttttataattttatgctttaagagagatgattattgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaag 26969181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 1303400 - 1303480
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||    
T  1303400 taattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagttagtttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaag 1303480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 140
Target Start/End: Original strand, 9264756 - 9264811
Alignment:
Q  84 aattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaa 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  9264756 aattattattgtttttacaattttat-ttttaagagagagttagtttatgttttcaa 9264811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 10116809 - 10116761
Alignment:
Q  71 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagag 119  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10116809 taaatttgtttgtaataactattgtttttacaattttatcatttaagag 10116761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31642401 - 31642329
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  31642401 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattg 31642329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12098798 - 12098693
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgcta 157  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |  ||||| |||| |||||  |||||||||||     
T  12098798 gatatttgtattaaagttgtttgta-tcacaattgtttttacaattttatcctttaagagagatagctagtttatatttttaacattctatttattgctc 12098700  T
Q  158 attgaag 164  Q
    |||||||    
T  12098699 attgaag 12098693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Original strand, 16284998 - 16285181
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagn 165  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  16284998 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagagattgaattaatttatgttttcaacataatatttattgtttattgaaga 16285096  T
Q  166 nnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          || | ||| |||| ||| ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  16285097 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 16285181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 39181957 - 39181902
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta 115  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39181957 gatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcattta 39181902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4903043 - 4902969
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    ||||| |||||||||||   ||| ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  4903043 aaaattacgggaattaaggaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatc 4902969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11432546 - 11432442
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-------agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaat 159  Q
    ||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||| || |       |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  11432546 gtattaaatttgtatatatttactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgat 11432447  T
Q  160 tgaag 164  Q
    |||||    
T  11432446 tgaag 11432442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Original strand, 11937204 - 11937274
Alignment:
Q  47 aattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag 117  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| | ||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11937204 aattaagaaagttgatatttgtattaaatttatttataatcacaattgtttttacaattttatcatttaag 11937274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 24857556 - 24857598
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24857556 tactacctccgtccctaattataagactcttttgaaaaaataa 24857598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 153
Target Start/End: Original strand, 24875941 - 24876027
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaatt-agtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    |||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||| || |  |||||||||| ||| || ||||||||    
T  24875941 tatttaatttgtttgtaattcattattgtttttacaattttattttttaaaagaaagttagtttatgttttaaacttagtatttatt 24876027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 248
Target Start/End: Original strand, 26894821 - 26894863
Alignment:
Q  206 attaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26894821 attaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaaggga 26894863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 39971014 - 39971056
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39971014 tactacctccgtccctaattataagactcttttgaaaaaataa 39971056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4902898 - 4902853
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4902898 taattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 4902853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9727577 - 9727504
Alignment:
Q  90 tattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||    
T  9727577 tattatttttataattatatcttttaagagagagttagtttatgtttttaacatgctatttattgttgattgaa 9727504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11432401 - 11432356
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  11432401 taattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaagggac 11432356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 23286387 - 23286465
Alignment:
Q  172 tgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  23286387 tgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggac 23286465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 26674550 - 26674595
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  26674550 taattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 26674595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 26946156 - 26946201
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  26946156 taattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 26946201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30182174 - 30182129
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  30182174 taattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagggac 30182129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 109
Target Start/End: Original strand, 37331007 - 37331056
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  37331007 gatatttgtcttaaatttgtttgtaattactgatgtttttacaattttat 37331056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 41687059 - 41687104
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  41687059 taattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaagggac 41687104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13735741 - 13735701
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  13735741 taattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 13735701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 164
Target Start/End: Original strand, 21252222 - 21252258
Alignment:
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21252222 tttatgttttcaacataatatttattgttaattgaag 21252258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 212)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 15996514 - 15996764
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15996514 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 15996613  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||| |||||| ||||||||||||      
T  15996614 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaa 15996713  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15996714 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 15996764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14759132 - 14758884
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14759132 tactacctccgttcataattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 14759033  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnn 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||   ||||      
T  14759032 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggca--aatgtaa 14758935  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  14758934 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggac 14758884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20621425 - 20621675
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20621425 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20621524  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  20621525 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 20621624  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20621625 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 20621675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8322221 - 8321971
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8322221 tactacctccgtccttaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8322122  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  8322121 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 8322022  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8322021 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 8321971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 10015530 - 10015780
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10015530 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10015629  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  10015630 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacgtgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 10015729  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10015730 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 10015780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 43158477 - 43158727
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagg--atcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43158477 tactacctccgtccttaattatagggcat-ttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 43158575  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtn 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||||||||||| |||||||||     
T  43158576 tacaattttatcctttaagagagaaatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgta 43158675  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43158676 aaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 43158727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 19897577 - 19897827
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19897577 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19897676  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  19897677 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 19897776  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  19897777 agaaataattaaagtagttggaaatagtaaaggagtcttataaaaagggac 19897827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31187054 - 31186804
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31187054 tactatctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 31186955  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  31186954 acaattttatcctttaagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaa 31186855  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31186854 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 31186804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48214048 - 48213798
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48214048 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattattttt 48213949  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||| |||||| |||||      
T  48213948 acaagtttatcctttaagagagaaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatatatgtaa 48213849  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  48213848 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcctataaaaaaggac 48213798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 45323856 - 45324077
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 127  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  45323856 cttttgaaaaattaacggaaattaagatagaagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagagatgg 45323955  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  45323956 tttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 45324055  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  45324056 aaaggggtcttataaaaaggga 45324077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 52044781 - 52044540
Alignment:
Q  5 acctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52044781 acctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaa 52044682  T
Q  104 ttttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnn 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||||||||||| ||| |||||          
T  52044681 ttttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatatatgtaaagaa 52044582  T
Q  203 ntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  52044581 ataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 52044540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17698773 - 17699023
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17698773 tactacctccatccttaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 17698872  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||       ||| ||||||||| |||| |||||||      
T  17698873 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacacgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtttaattaataggggcgtgtatgtaa 17698972  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  17698973 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaaaggac 17699023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 28673035 - 28673285
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28673035 tactacctccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactgttgttttt 28673134  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  28673135 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctggttgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaa 28673234  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  28673235 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaagggac 28673285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43978456 - 43978226
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43978456 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 43978357  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  43978356 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 43978257  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
         ||||||||||||||||||||||||||    
T  43978256 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 43978226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 45513376 - 45513626
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45513376 tactacctccgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactatcgttttt 45513475  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  45513476 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 45513575  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45513576 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 45513626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 52291168 - 52291415
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52291168 tactaccttcgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataaagggaattaagatagtggatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 52291267  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  52291268 acaattttattctttaagagagagataatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgtatgtaa 52291367  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  52291368 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagg 52291415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 42390643 - 42390895
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42390643 tactacctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 42390742  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
     |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  42390743 gcaattttatcatttaagagagagagttagtttatgttttcaacatgtaatttattgcaaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgt 42390842  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  42390843 aaataaataattaatgcagttggagataacaaagatgtcttataaaaagggac 42390895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 50433128 - 50433380
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50433128 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 50433227  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  50433228 acaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 50433327  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||    
T  50433328 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaataggggtcttataaaaagggac 50433380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27688253 - 27688032
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||     
T  27688253 cttttgaaaaaataacgggaattaagacagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagggttgg 27688154  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagca 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||       |||||||| |  |||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  27688153 tttatgttttcaacatgttatttattactaattgaagaaaaatatgtataataataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagca 27688054  T
Q  228 aaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    || |  ||||||||||||||||    
T  27688053 aatgagtcttataaaaagggac 27688032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47067232 - 47066980
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47067232 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 47067133  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       || ||||| ||| |||||||||||||    
T  47067132 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaatgatgaataataaataagggcatgtatgt 47067033  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  47067032 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggac 47066980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 50726532 - 50726772
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50726532 tccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 50726631  T
Q  107 tatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnnta 205  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||       ||    
T  50726632 tatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaata 50726731  T
Q  206 attaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  50726732 attaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 50726772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 50786316 - 50786076
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50786316 tccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 50786217  T
Q  107 tatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnnta 205  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||       ||    
T  50786216 tatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaata 50786117  T
Q  206 attaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  50786116 attaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 50786076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49383635 - 49383389
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49383635 ctccgtcccttattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 49383536  T
Q  106 ttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnn 202  Q
    ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||          
T  49383535 ttatcctttaagaaagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 49383436  T
Q  203 ntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  49383435 ataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 49383389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 46049727 - 46049977
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46049727 tactccctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 46049826  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||  ||||      
T  46049827 acaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgtaa 46049926  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  46049927 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaaggac 46049977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17753274 - 17753526
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17753274 tactatctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 17753373  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  17753374 acaattttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 17753473  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  17753474 aaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 17753526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 19054594 - 19054846
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19054594 tactatctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19054693  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  19054694 acaattttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 19054793  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  19054794 aaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 19054846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 46845231 - 46845483
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46845231 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 46845330  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  46845331 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 46845430  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  46845431 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 46845483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48910165 - 48909918
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48910165 taccttcgtccctaattataggattcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 48910066  T
Q  103 attttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnn 201  Q
    |||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||         
T  48910065 attttattatttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaaga 48909966  T
Q  202 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
      ||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||    
T  48909965 aataattaatgtagttggaaataacaagtaggtcttataaaaagggac 48909918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2993527 - 2993305
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 127  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2993527 cttttaaaaaaataacgggaactaaggtagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagagatga 2993428  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||       ||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||| ||| ||||| |    
T  2993427 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaataac 2993328  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |  ||||||||||||||||    
T  2993327 aaatgagtcttataaaaagggac 2993305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35711571 - 35711321
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35711571 tactccctccgttcctaattataggacccttttaaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 35711472  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||      
T  35711471 acaattttatcctttaagagagaattcatttgtgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 35711372  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35711371 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 35711321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 53361601 - 53361846
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53361601 tccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 53361700  T
Q  107 tatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnn 203  Q
    |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||           
T  53361701 tatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaa 53361800  T
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  53361801 taattaatgtagttagaaataacaaaagagtcttataaaaagggac 53361846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10656989 - 10656737
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10656989 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10656890  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  10656889 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 10656790  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  10656789 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 10656737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 13809548 - 13809800
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13809548 tactacctccatccttaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 13809647  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||  || |||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  13809648 acaattttattcttcaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 13809747  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  13809748 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatgatcttataaaaagggac 13809800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 46862105 - 46862357
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  46862105 tactaccttcgtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattactgttttt 46862204  T
Q  100 acaattttatcttttaaga--gagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| | ||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  46862205 acaattttatcctttaagaaggagggttgacttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 46862304  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  46862305 aaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggac 46862357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Original strand, 48887713 - 48887937
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--t 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  48887713 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaagtattattgtttttacaattttatcctttaagagagagagtt 48887812  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||| || || | ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||    
T  48887813 ggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 48887912  T
Q  225 gcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||   ||||||||||||||||    
T  48887913 gcaaagcagtcttataaaaagggac 48887937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1450540 - 1450288
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| || ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1450540 tactacatctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 1450441  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  1450440 acaattttagcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 1450341  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  1450340 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 1450288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 12906151 - 12906403
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12906151 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgttttt 12906250  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  12906251 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 12906350  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||| |||||||    
T  12906351 aaagaaataattaatgtagttggaaatggaaaaggggtcttataagaagggac 12906403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 37144228 - 37144393
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc--ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaa-tatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37144228 tacctccgtccctaattataagaacccttttgaaaaattaacgggaattaagatagtggatatttttattaaaatatgtttgtaattactattgttttta 37144327  T
Q  101 caattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37144328 caattttatcttttaagagagagagttgatttatgttttcaacatattatttattgctgattgaag 37144393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 32978777 - 32978623
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32978777 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 32978678  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  32978677 acaattttatcctttaagagagaattgatttatgttttcaatatgatatttattg 32978623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38071494 - 38071241
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt--gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38071494 tactacctccgttcctaattataggatccttttagaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttt 38071395  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| ||||||||    
T  38071394 tacaattttatcttttaagagagaggattggtttatgctttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatg 38071295  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  38071294 taaagaaataattaatatagttagaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggac 38071241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 246
Target Start/End: Original strand, 12050143 - 12050381
Alignment:
Q  10 cgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12050143 cgtccctaattataggacctttttgaaaaaattacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 12050242  T
Q  109 tcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaat 207  Q
    || ||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||       ||||    
T  12050243 tcctttgagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataat 12050342  T
Q  208 taatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  12050343 taatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagg 12050381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21459277 - 21459028
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21459277 tacctccttccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttgaca 21459178  T
Q  103 attttatctttta--agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnn 199  Q
    |||||||| ||||  | | |||| || |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||        |||||||| |||| ||||||||||||       
T  21459177 attttatcctttacgatatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 21459078  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  21459077 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggtgtcctataaaaagggac 21459028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33212691 - 33212442
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33212691 tacctccgtccctaattataagatccttttaaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 33212592  T
Q  103 attttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnn 199  Q
    |||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       
T  33212591 attttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 33212492  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        |||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  33212491 gaaataattaatgtagatggaaatagaaaagaaatcttataaaaagggac 33212442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1084693 - 1084945
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1084693 tactacctccgtccctaactatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatctttgtaattactattgttttt 1084792  T
Q  100 acaattttatctttta--agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||| | ||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  1084793 acaattttaccctttaagagagagagatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgt 1084892  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  1084893 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagtaaaaggatcttataaaaagggac 1084945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6784760 - 6784509
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6784760 tactatctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgttttt 6784661  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||    
T  6784660 acaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgt 6784561  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  6784560 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagg-gtcttataaaaagggac 6784509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8547202 - 8546950
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  8547202 tactacctccgtccctaagtataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgcgtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttg 8547103  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||       |||||| | ||||||| |||||||||    
T  8547102 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtatagtaaatagggacatgtatgt 8547003  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  8547002 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 8546950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 4759088 - 4759342
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaa-aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4759088 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 4759187  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagag---atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtat 194  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||    ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||    
T  4759188 tacaattttatcctttaagaaagagggtttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 4759287  T
Q  195 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||       |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  4759288 gtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaggatcttataaaaagggac 4759342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 51489664 - 51489413
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51489664 tactatctctgtccctaattatagggccttttgaaaaaataatgggaattaagataggggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 51489565  T
Q  101 caattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||       |||||||| ||| |  ||||||||||     
T  51489564 caattttatcctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatggaagaaaaagatgtataataaataaatgcatgtatgta 51489465  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||    
T  51489464 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaacaagtcttataaaaagggac 51489413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25879436 - 25879281
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25879436 tactacctccgtccctaattatggacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgcattaaatatgtttgcaattactattgttttta 25879337  T
Q  101 caattttatcttttaagag--agagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25879336 caattttatcttttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattg 25879281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40919252 - 40919024
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40919252 tactacatccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 40919153  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga-gatgat-ttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | | || |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       | |||||| |||| ||||||||||||    
T  40919152 acaattttatcctttaagaaagagggttatcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgt 40919053  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
           ||||||||||||||||||||||    
T  40919052 aaaaaaataattaatgtagttggaaatag 40919024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Original strand, 50517266 - 50517513
Alignment:
Q  6 cctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 104  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50517266 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 50517365  T
Q  105 tttatcttttaa--gagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnn 201  Q
    |||||| |||||  | ||| | || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| ||| |||||||||         
T  50517366 tttatcctttaagggggagggttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaaga 50517465  T
Q  202 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||    
T  50517466 aataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtattataaaaagggac 50517513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 46861864 - 46861666
Alignment:
Q  54 atagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||    
T  46861864 atagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttattatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttattta 46861765  T
Q  152 ttgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| |||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46861764 ttgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 46861666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 43557221 - 43557441
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||  | ||    
T  43557221 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttattatttaagagagaaggttg 43557320  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       | ||||||||||||| ||||||    
T  43557321 gtttatgttttcaacatgttatttattggtaattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaatgattaatgtagttgaaaatag 43557420  T
Q  226 caaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  43557421 caaatggatcttataaaaagg 43557441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43686799 - 43686547
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43686799 tactacctccgtccctaattataaggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 43686700  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  43686699 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 43686600  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||    
T  43686599 aaataaataattaatgtagttggaaatagaaaaaaggtcttataaaaagggac 43686547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 53164461 - 53164209
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53164461 tactacatccgtccctaattataatgtccttttgaaaaaataatgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 53164362  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       || ||||| ||||| |||||||||||    
T  53164361 acaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatgt 53164262  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  53164261 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaagtcttataaaaagggac 53164209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 53686736 - 53686988
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53686736 tactacctctgtccctaattataaaacccttttgaaaaaacaacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 53686835  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       || ||||| ||||| |||||||||||    
T  53686836 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatgt 53686935  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  53686936 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 53686988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10221180 - 10220978
Alignment:
Q  48 attaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatatta 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  ||    
T  10221180 attaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgata 10221081  T
Q  148 tttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    ||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||| || |       |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  10221080 tttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaagg 10220981  T
Q  247 gac 249  Q
    |||    
T  10220980 gac 10220978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 39625197 - 39625320
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39625197 tactacctccgtccctaattataggcccttaagaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 39625296  T
Q  101 caattttatcttttaagagagaga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  39625297 caattttatcctttaagagagaga 39625320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 41750927 - 41751079
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41750927 tactacctccgtccttaattatatgatccttttgaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttta 41751026  T
Q  101 caattttatcttttaagagag--agatgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    |||||||||| ||| ||||||  || || |||||||||||||||| |||||||    
T  41751027 caattttatcctttgagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttattta 41751079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 41992279 - 41992509
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41992279 tactacctccgtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 41992378  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    |||||||||||              || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| |||||| |||||      
T  41992379 acaattttatc-------------ctggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgtaa 41992465  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaa 242  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  41992466 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 41992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 18658168 - 18658288
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18658168 tactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 18658267  T
Q  100 acaattttatcttttaagaga 120  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  18658268 acaattttatcctttaagaga 18658288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 24087080 - 24087243
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24087080 tacctccgtccctaattataagactcctttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 24087179  T
Q  103 attttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| ||||||| |||  | ||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24087180 attttatcctttaagaaagaaggttggcctatgttttcaacattttatttattgctgattgaag 24087243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 9499272 - 9499488
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |  ||||||    
T  9499272 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagagagaaggttagtttatg 9499371  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  9499372 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 9499471  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  9499472 gtcttataaaaagggac 9499488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 23700560 - 23700776
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  23700560 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 23700659  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  23700660 ttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 23700759  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  23700760 gtcttataaaaagggac 23700776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 23719015 - 23719231
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  23719015 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 23719114  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  23719115 ttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 23719214  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  23719215 gtcttataaaaagggac 23719231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 23737471 - 23737687
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  23737471 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 23737570  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  23737571 ttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 23737670  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  23737671 gtcttataaaaagggac 23737687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 42801521 - 42801773
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42801521 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 42801620  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    | ||||||||| ||||||  |||| | |   |||| ||||||| ||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  42801621 ataattttatcctttaagaaagagggttagcttatattttcaatattctatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 42801720  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||    
T  42801721 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagttttataaaaagggac 42801773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33976777 - 33976549
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  33976777 tactacctccatcccgaattataggacccttttaaaaaaataacagaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgctttt 33976678  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    | ||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  33976677 ataattttatccttt--gagatggatgatttatgttttcaacatgttatttatggctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaa 33976580  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33976579 agaaataattaatgtagttggaaataacaaa 33976549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50730621 - 50730371
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaa-taacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttac 101  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  50730621 tacctccgttcttaattataagatccttttgaaaaaaataatgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttat 50730522  T
Q  102 aattttatcttttaagagag--agatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||       |||||||| ||||| | |||||||||      
T  50730521 aattttatcctttaagagagatagatggtttatgttttcaacatgttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaa 50730422  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  50730421 agaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaagggac 50730371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 50782233 - 50782483
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaa-taacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttac 101  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  50782233 tacctccgttcttaattataagatccttttgaaaaaaataatgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttat 50782332  T
Q  102 aattttatcttttaagagag--agatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||       |||||||| ||||| | |||||||||      
T  50782333 aattttatcctttaagagagatagatggtttatgttttcaacatgttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaa 50782432  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  50782433 agaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaagggac 50782483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 23776236 - 23776486
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23776236 tactaccttcgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23776335  T
Q  100 acaattttatctttta--agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||  ||||  |||||| | ||  |||||||||||||   |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23776336 acaattttattctttaatagagagggttggattatgttttcaac--gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgt 23776433  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
            |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||    
T  23776434 aaagaaacaattaatgtagttgtaaataacaaaggagtcttataacaagggac 23776486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 22103704 - 22103920
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  22103704 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 22103803  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22103804 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 22103903  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  22103904 gtcttataaaaagggac 22103920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36005801 - 36005553
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  36005801 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 36005702  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  36005701 acaattttatcttttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 36005602  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  36005601 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 36005553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45746040 - 45745824
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  45746040 aaaattacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 45745941  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||| || |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  45745940 ttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 45745841  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  45745840 gtcttataaaaagggac 45745824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 35572200 - 35572446
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  35572200 tacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataaagggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttataattactattgattttaca 35572299  T
Q  103 attttatctttta----agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtnn 198  Q
    |||||||| ||||    |||||||| || |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||       |||||||| ||||||     |||||      
T  35572300 attttatcctttaagggagagagagttggtttatgttttcaacatgtcatttactgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg----ttatgtaa 35572395  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  35572396 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 35572446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16434977 - 16435228
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  16434977 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaaaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 16435076  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| || ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  16435077 acaattttatccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 16435176  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  16435177 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 16435228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 164
Target Start/End: Original strand, 33361498 - 33361606
Alignment:
Q  58 tagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33361498 tagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgc 33361597  T
Q  156 taattgaag 164  Q
    | |||||||    
T  33361598 tgattgaag 33361606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44544079 - 44543828
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  44544079 tactcccttcgtcccttattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 44543980  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  44543979 acaattttatccttaagagagagagttcgtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 44543880  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  44543879 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 44543828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7181612 - 7181396
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  7181612 aaaatcacgggaattaagataggggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 7181513  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||     
T  7181512 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 7181413  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  7181412 gtcttataaaaagggac 7181396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26221550 - 26221334
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  26221550 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 26221451  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  26221450 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 26221351  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  26221350 gtcttataaaaagggac 26221334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43868365 - 43868149
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  43868365 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 43868266  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||      
T  43868265 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagag 43868166  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  43868165 gtcttataaaaagggac 43868149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23308207 - 23308078
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |     
T  23308207 ttttgaaaaaataacgggaattaagacagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagagagggtta 23308108  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgct 156  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23308107 gtttatgttttcaacatgttatttattgct 23308078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 49126973 - 49127189
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagag-agatga-tttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| | ||||||    
T  49126973 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaagattagtttatg 49127072  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||| |||||||||||||| ||||||     
T  49127073 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaagga 49127172  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  49127173 gtcttataaaaagggac 49127189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 54866570 - 54866405
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| || |||||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54866570 tactacctccgtccctaattataagatccttttgaaaaataatggaaattaagatagtgaatatttatattaattatgtttgtaattactattgttttta 54866471  T
Q  101 caattttatctttta--agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||||||  | |||| | ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  54866470 caattttatcttttaataaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 54866405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Original strand, 19350123 - 19350282
Alignment:
Q  9 ccgtccctaattataggatcttttgaaaa--aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  19350123 ccgtccctaattataggacccttttaaaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttataaatt 19350222  T
Q  107 tatcttt--taagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||| ||   ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19350223 tatccttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 19350282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14428906 - 14428656
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  14428906 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 14428807  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| ||||||||||||||||      
T  14428806 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggcatgtatgtaa 14428707  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  14428706 agaaataattaatgtagttggaaataagaaaggggtcttataaaaagggac 14428656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 7051495 - 7051711
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  7051495 aaaatcacgggaattaagatagtgggtatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 7051594  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  7051595 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 7051694  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  7051695 gtcttataaaaagggac 7051711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 31531186 - 31531402
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  31531186 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 31531285  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  31531286 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaat 31531385  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  31531386 gtcttataaaaagggac 31531402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43701440 - 43701224
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||     
T  43701440 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttata 43701341  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||| ||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  43701340 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaagga 43701241  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  43701240 gtcttataaaaagggac 43701224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 45048761 - 45049013
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||    
T  45048761 tactccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattattttt 45048860  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  45048861 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 45048960  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  45048961 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 45049013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45253035 - 45252819
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  45253035 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 45252936  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  45252935 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 45252836  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  45252835 gtcttataaaaagggac 45252819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 54782692 - 54782908
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | |  ||||||    
T  54782692 aaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaggttagtttatg 54782791  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  54782792 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 54782891  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  54782892 gtcttataaaaagggac 54782908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 249
Target Start/End: Original strand, 7251066 - 7251273
Alignment:
Q  45 ggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaaca 142  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||    
T  7251066 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 7251165  T
Q  143 tattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataa 241  Q
    | |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||    
T  7251166 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataa 7251265  T
Q  242 aaagggac 249  Q
    ||||||||    
T  7251266 aaagggac 7251273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 1641875 - 1642090
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga-gatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | | | |  |||||||    
T  1641875 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaatgttagtttatgt 1641974  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||||       
T  1641975 tttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaag 1642074  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  1642075 tcttataaaaagggac 1642090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 9779979 - 9780230
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  9779979 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattattattgttttt 9780078  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||| ||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  |||||||| || |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  9780079 acaatattatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 9780178  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  9780179 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 9780230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25148726 - 25148505
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga-- 124  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |      
T  25148726 tcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaaat 25148627  T
Q  125 tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||||||   | ||||       |||||||||||||||||||||    
T  25148626 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg---gcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 25148530  T
Q  225 gcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||  ||||||||||||||||    
T  25148529 acaaaggggtcttataaaaagggac 25148505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 30040792 - 30041008
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  30040792 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 30040891  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||       
T  30040892 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaatg 30040991  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  30040992 gtcttataaaaagggac 30041008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32467687 - 32467471
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || |||  | |  |||||     
T  32467687 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttacgaaagaaggttagtttata 32467588  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  32467587 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 32467488  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  32467487 gtcttataaaaagggac 32467471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 35165738 - 35165953
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  35165738 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtagtcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 35165837  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||  | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  35165838 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg- 35165936  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  35165937 gtcttataaaaagggac 35165953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 46703289 - 46703073
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  | | || |  ||||||    
T  46703289 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaagttagtttatg 46703190  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||||  ||||||||||       |||||||||||||| |||||| ||||||     
T  46703189 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaataacaaaggg 46703090  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  46703089 gtcttataaaaagggac 46703073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52673449 - 52673233
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  52673449 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 52673350  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||  | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||| |||||||| |||| |     
T  52673349 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaggtggaaataacaaatgg 52673250  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  52673249 gtcttataaaaagggac 52673233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54107615 - 54107399
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  54107615 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 54107516  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| |||||| |||||       ||||||||||||||| |||||  |||||     
T  54107515 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataataaaggg 54107416  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  54107415 gtcttataaaaagggac 54107399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 29383312 - 29383159
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | | |||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29383312 tactacctccgtccctaaatataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgataatagtaataaatttgtttgtaattattattgttttt 29383213  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  29383212 acaattttatccttgaagagagagagttagtttatgttttcaatatagtattta 29383159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4024348 - 4024098
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| |||||||| | || ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  4024348 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaataagaa-agcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 4024250  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  4024249 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 4024150  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4024149 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 4024098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10045137 - 10044887
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  10045137 tactacatccgtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgcattaaagctgtttgtaatcactattgttttt 10045038  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| |  | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  10045037 acaattttatcctgaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 10044938  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  10044937 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg-gtcttataaaaagggac 10044887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33868745 - 33868494
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  33868745 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 33868646  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  33868645 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 33868546  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  33868545 aagaaataattaatgtagttggaaataactaaggggtcttataaaaagggac 33868494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 50647684 - 50647935
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |   |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  50647684 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 50647783  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  50647784 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 50647883  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  50647884 aaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 50647935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 52058985 - 52059236
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |   |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  52058985 tactccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 52059084  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  52059085 acaattttatccttaagagagagagtttgtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 52059184  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  52059185 aagaagtaattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 52059236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 249
Target Start/End: Original strand, 43408542 - 43408720
Alignment:
Q  75 tatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgt 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||    
T  43408542 tatgtttataattagtattgtttttacaattttatc-tttaagagaaagacgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgt 43408640  T
Q  175 ataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaat----gtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||       ||||||||    ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  43408641 ataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtacgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 43408720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Original strand, 20656085 - 20656297
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  20656085 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaataactattgcttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 20656184  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaa-tagggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||| | | |||||||       |||||||| || | ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20656185 ttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 20656284  T
Q  233 ttcttataaaaag 245  Q
     ||||||||||||    
T  20656285 gtcttataaaaag 20656297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21756748 - 21756532
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||     
T  21756748 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttata 21756649  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| |||||| |||||       |||||||||||||||||||||  ||||      
T  21756648 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaagag 21756549  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  21756548 gtcttataaaaagggac 21756532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 26593540 - 26593756
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  26593540 aaaatcacgggaattaagataatagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 26593639  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||        |||||||| |||| | ||||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||| |     
T  26593640 ttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaga 26593739  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  26593740 gtcttataaaaagggac 26593756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 46878214 - 46878430
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||     
T  46878214 aaaatcacgggaattaagataaaggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttata 46878313  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||  |||||     
T  46878314 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggg 46878413  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  46878414 gtcttataaaaagggac 46878430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17591285 - 17591536
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |   |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  17591285 tactccctccatccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 17591384  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||||||| | | |||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  17591385 acaattttatctttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 17591484  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  17591485 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 17591536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 27646046 - 27646211
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||  ||||||| ||| | |  | | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  27646046 tactacctccgtccctaattataggagctttttgcaaaaattacggagattaaaaaagttggttgtagcattaaatttgtatgtaattactattgttttt 27646145  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  27646146 acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 27646211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37728974 - 37728759
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||||    
T  37728974 aaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtatttacaattttatctttaagagagagagttagtttatgt 37728875  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||      
T  37728874 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 37728775  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  37728774 tcttataaaaagggac 37728759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 243
Target Start/End: Original strand, 54604363 - 54604573
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga--gagagatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||  | |  ||||||    
T  54604363 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaatgaatgttagtttatg 54604462  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  54604463 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatggatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaaggg 54604562  T
Q  233 ttcttataaaa 243  Q
     ||||||||||    
T  54604563 atcttataaaa 54604573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 25148897 - 25149113
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||     
T  25148897 aaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttata 25148996  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| |||||| |||||       |||||||| |||||||||||| ||||||     
T  25148997 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggg 25149096  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  25149097 gtcttataaaaagggac 25149113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32569247 - 32569043
Alignment:
Q  48 attaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatat 145  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||| |    
T  32569247 attaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttacaattttatcatttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgt 32569148  T
Q  146 tatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
    |||||||||   |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  32569147 tatttattgtcgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaa 32569048  T
Q  245 gggac 249  Q
    |||||    
T  32569047 gggac 32569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20862494 - 20862242
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||    
T  20862494 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgctttt 20862395  T
Q  100 acaattttatctttta---agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatg 195  Q
    ||||||||||| || |   |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||||||||    
T  20862394 acaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgcta-ttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 20862296  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20862295 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 20862242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36099261 - 36099011
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  36099261 tactccctctgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggataattgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 36099162  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||| ||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  36099161 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 36099062  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  36099061 aagaaataattaatgtaattggaaataacaaagg-gtcttataaaaagggac 36099011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 36317432 - 36317646
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |  |||||||    
T  36317432 aaaatcacgggaattaaga-agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 36317530  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    ||||   ||  |||||||| || |||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |      
T  36317531 tttccttatgctatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtgaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgag 36317630  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  36317631 tcttataaaaagggac 36317646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39952563 - 39952317
Alignment:
Q  6 cctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 104  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||    
T  39952563 cctccgtccctaattataagatccttttgttaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaat 39952464  T
Q  105 tttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnn 202  Q
     ||||| || | |||||||| |  ||||||||||  | ||  |||||||| || |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||          
T  39952463 attatccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaa 39952364  T
Q  203 ntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  39952363 ataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 39952317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 1111388 - 1111553
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||| | ||| | |  | | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  1111388 tactacctccgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagcattaaatttgtatgtaattactattgttttt 1111487  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  1111488 acaattttatc-cttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 1111553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 32962880 - 32963095
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  32962880 aaaatcacaggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattg-ttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 32962978  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  32962979 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgcaaataacaaaggg 32963078  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  32963079 gtcttataaaaagggac 32963095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 49383640 - 49383738
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta--agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  49383640 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaatagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaag 49383738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 54927830 - 54927996
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||  |||||   ||| | |  | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  54927830 tactacctccgtccctaattataggagctttttgcaaaaattacggagattaagcaagttggttgtagtattaaatttgtatgtaattactattgttttt 54927929  T
Q  100 acaattttatctttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    | ||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  54927930 ataattttatcatttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 54927996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 249
Target Start/End: Original strand, 12683011 - 12683173
Alignment:
Q  90 tattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||||||    
T  12683011 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 12683110  T
Q  188 -catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  12683111 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 12683173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 43408192 - 43408268
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaata 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  43408192 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaata 43408268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 35867858 - 35868074
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  35867858 aaaattacgggaattaagatagggcatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 35867957  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| |||  |||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  35867958 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 35868057  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  35868058 gtcttataaaaagggac 35868074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 118
Target Start/End: Original strand, 12675198 - 12675280
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12675198 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaaga 12675280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 88
Target Start/End: Original strand, 46557660 - 46557742
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaatta 88  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46557660 ctccgtccctaattacaagattcttttggaaaaataacgggaattaaaataatggatatatgtattaaatatgtttgtaatta 46557742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 52178050 - 52177980
Alignment:
Q  48 attaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52178050 attaagatagtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 52177980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 54849616 - 54849495
Alignment:
Q  45 ggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaaca 142  Q
    |||||||| | ||| |||||||  ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |  |||||||||||||||    
T  54849616 ggaattaagaaagtggatatttacattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagatggttactttatgttttcaaca 54849517  T
Q  143 tattatttattgctaattgaag 164  Q
    | |||||||||||| |||||||    
T  54849516 tgttatttattgctgattgaag 54849495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 164
Target Start/End: Original strand, 44542303 - 44542379
Alignment:
Q  90 tattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  44542303 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 44542379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 44561436 - 44561601
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||| |||||| ||||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  44561436 tactacctccgtccctaaatatagaagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 44561535  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  44561536 acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 44561601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53271888 - 53271642
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| | ||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||    
T  53271888 tactccctccgtccctaattataagacttttttgctaaaattatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcac-attgttttt 53271790  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||| ||| |  ||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||     
T  53271789 acaattttatccttaagagagggagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 53271690  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
          ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  53271689 aagaaataattaatgtaattggaaataacaaagggatcttataaaaag 53271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38341177 - 38341082
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  38341177 tattaaatctgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 38341082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 41392686 - 41392785
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagag--agagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  41392686 gtattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattatatcctttaagagatagagttggtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaag 41392785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41824369 - 41824155
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| |||| |||||| | ||| ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || | |||||||| |  |||||||    
T  41824369 aaaattacggaaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagttagtttatgt 41824270  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||| | ||  ||||||||| | ||| |||       |||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||| |||| |     
T  41824269 tttccatatgctatttattgttgattcaagaaaaaagtgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagatg 41824170  T
Q  234 tcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||    
T  41824169 tcttataaaaaggga 41824155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20849094 - 20848984
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  20849094 aaaatcacgggaattaggatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 20848995  T
Q  134 ttttcaacata 144  Q
    |||||||||||    
T  20848994 ttttcaacata 20848984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 28810928 - 28811026
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  28810928 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 28811026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 47008242 - 47008396
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||| ||||  ||||||| ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  47008242 tactacctccgtccctaaatataggacccttttgccaaaattacggagattaaaaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 47008341  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    ||||||||||| || |  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  47008342 acaattttatccttaagggagagagttaatttatgttttcaacataatatttatt 47008396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Original strand, 21497554 - 21497715
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||  |||||| ||||  ||||| | ||| |||  | ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||    
T  21497554 tacctccgtctctaattataggagtattttataaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattattattgtttttaca 21497653  T
Q  103 attttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    |||||||| || | |||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  21497654 attttatccttaagagagagagttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattgaa 21497715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25916664 - 25916535
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||  | |||||| |    
T  25916664 aaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttcagagagagaattaatttatat 25916565  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    || | | ||||||||||||| | |||||||    
T  25916564 ttcccatatattatttattgttgattgaag 25916535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 29719451 - 29719616
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  29719451 tactacctccgtccttaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 29719550  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | |||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  29719551 acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttgaacatactatttattgttgattgaag 29719616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26058800 - 26058685
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  26058800 aaaattacgagaattaagatattggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 26058701  T
Q  134 ttttcaacatattatt 149  Q
    |||||||||| |||||    
T  26058700 ttttcaacatgttatt 26058685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 49791533 - 49791413
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | | | || | | |||  |||| |||||||||||| ||||||||| | |    
T  49791533 tacctcagtccctaattatagggtcattttaaaaaaataacgggaattgagaaaattgaaagtggtaacaaatttgtttgtaattactattgttttcata 49791434  T
Q  103 attttatcttttaagagagag 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  49791433 attttatcttttaagagagag 49791413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20877927 - 20877679
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||||||| |||  |||| || ||||||  |||||  | | |||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||  |||||    
T  20877927 tactacctccgtcgctatatataagaccttttgttaaaattgcagaaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattactttta 20877828  T
Q  101 caattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnn 199  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |  |||| |||||| | || |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| | ||||||||||       
T  20877827 caattttat-tcttaagagagagttagtttacgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaa 20877729  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||    
T  20877728 gaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaagatcttataaaaagggac 20877679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 25130943 - 25130832
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| ||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  25130943 tactaccttcgtccctatatataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 25130844  T
Q  100 acaattttatct 111  Q
    ||||||||||||    
T  25130843 acaattttatct 25130832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Original strand, 49543925 - 49544084
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| | | | |||| |  || ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  49543925 ctccgtccctaattatagggccctttagaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttttacaatt 49544024  T
Q  106 ttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||| || | |||||||| | ||||||||||| || ||| |||||| || | |||||||    
T  49544025 ttatccttaagagagagagttaatttatgtttttaatatagtatttaatgttgattgaag 49544084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 17589683 - 17589781
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  17589683 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 17589781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 244
Target Start/End: Original strand, 26806156 - 26806366
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||||||  | |  ||||||    
T  26806156 aaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatc-cttaagagagaaggttagtttatg 26806254  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  26806255 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 26806354  T
Q  233 ttcttataaaaa 244  Q
     |||||||||||    
T  26806355 gtcttataaaaa 26806366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33290638 - 33290489
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||||||| ||||||||| || | ||| |  ||||| |||| |||||| | ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||    
T  33290638 tacctccgtctctaattatatgaacctttagtcaaaatcacggaaattaagaaagttgataatagtattaaatttgtttataattactattatttttaca 33290539  T
Q  103 attttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    ||| ||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  33290538 attgtat-tcttaagagagagttaatttatgttctcaacataatatttatt 33290489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 34021802 - 34021900
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  34021802 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 34021900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 51283802 - 51284054
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || | |||||  ||||| | ||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  51283802 tactccctctgtccctaattataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 51283901  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataat-taata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  |||| |||||| | ||  || |||||||| |||||||       ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  51283902 acaattttatccttaagagagagagttagtttacgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaaataggggcatgtatgt 51284001  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||    
T  51284002 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatggattttataaaaagggac 51284054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1572567 - 1572377
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaat 159  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| | || |||||||||| | ||    
T  1572567 gatatttatattaaagttgtttgtaatcgttattgtttttacaattttatc-cttaagagagagttaatttatgttttccatatgttatttattgttgat 1572469  T
Q  160 t-gaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    | |||        |||||||| |||| |||||||||| |       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  1572468 tggaaaaaaaaaatgtataatgaatatgggcatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaaggac 1572377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8379974 - 8379809
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||  ||||| | |||   |  | ||||||||| ||| | |||||| || |||||||    
T  8379974 tactacctccgtccctaaatatagaagtcttttgaaaaaattacggagattaagaaagttagttgtagtattaaatttgtatataattactactgttttt 8379875  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||| | |||||||    
T  8379874 acaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatattgattgttgattgaag 8379809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 249
Target Start/End: Original strand, 26306407 - 26306598
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaa 158  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || |  ||||||| | |||||||||||| | ||  || |||||||| |    
T  26306407 gatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatccttaagcgagagagttaatttatgttttccatatgctacttattgctga 26306506  T
Q  159 ttgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    || |||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||    
T  26306507 ttaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaaggac 26306598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49543854 - 49543723
Alignment:
Q  119 gagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagtt 217  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||| || || |||| |||||||||       ||||||||||||||    
T  49543854 gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaaaaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 49543755  T
Q  218 ggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  49543754 ggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggac 49543723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31398006 - 31397930
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacat 143  Q
    ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  31398006 gtattaaatttctttataattactattgtttttacaattatatcctttaagagagagttgatttatatcttcaacat 31397930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 42526432 - 42526530
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  42526432 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 42526530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 35938624 - 35938537
Alignment:
Q  35 aaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga 122  Q
    ||||||||||| |||||| | | | || | ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35938624 aaaaataacggaaattaagaaaattgaaagttgtaataaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaagagaga 35938537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 153
Target Start/End: Original strand, 4836516 - 4836585
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4836516 taattactattgtttttacgattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttatt 4836585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 12918645 - 12918743
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| || | |||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  12918645 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagatagttaatttatattttcaatataatatttattgttaattgaag 12918743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15095428 - 15095330
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  15095428 gtattaaatttgtatatatttactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaag 15095330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Original strand, 22832411 - 22832595
Alignment:
Q  62 tatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaatt 160  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || ||||| || |||    
T  22832411 tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgatt 22832510  T
Q  161 gaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
    ||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  22832511 gaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 22832595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 38364400 - 38364342
Alignment:
Q  66 tgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38364400 tgtaataaatttatttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaga 38364342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 42044061 - 42044159
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  42044061 gtattaaatttgtgtataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 42044159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 46879280 - 46879210
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    ||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46879280 aaaatcacgggacttaagaaagttgatatttgtattaaattcgtttgtaattactattgtttttacaattt 46879210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 48904070 - 48904168
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  48904070 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 48904168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 8503240 - 8503387
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaa-taacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| | | | |||| |  || ||||| |||| ||||||| ||||| |||    
T  8503240 tactacctccatccctaattatagggttctttagaaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttt 8503339  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatat 145  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||| ||||    
T  8503340 tacaattttatc-cttaagagagatatttaatttatgttttcaatatat 8503387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 151
Target Start/End: Original strand, 22494483 - 22494552
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22494483 taattactattatttttacaattttatccttaagagagagagttgatttatgttttcaacataatattta 22494552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24813814 - 24813718
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  24813814 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagaaagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 24813718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 28875059 - 28875156
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||||| | |||||||    
T  28875059 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcttaagagagagagttaatttatatttttaatataatatttattgttgattgaag 28875156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 32968966 - 32969131
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  |||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  32968966 tactacctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 32969065  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | ||| ||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  32969066 acaattttatccttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 32969131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 33360885 - 33360954
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgta 69  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  33360885 tactacctccgtccttaattataagacccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgta 33360954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 154
Target Start/End: Original strand, 34265500 - 34265625
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga-------- 127  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| | || | ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||            
T  34265500 aaaattacgggaattaagaaagtcggtagtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-tcttaagagagagatgaataattag 34265598  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34265599 tttatgttttcaacatagtatttattg 34265625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 242
Target Start/End: Original strand, 46557752 - 46557867
Alignment:
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||     
T  46557752 tttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataga 46557851  T
Q  227 aaaggtttcttataaa 242  Q
    |||||  |||||||||    
T  46557852 aaagggatcttataaa 46557867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4564466 - 4564370
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    |||||||| ||| | | |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||    
T  4564466 tattaaatttgtatattattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacacaatatttattgttgattgaa 4564370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 9582464 - 9582397
Alignment:
Q  43 cgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9582464 cgggaattaagaaagtggatatttgtatcaaagttgtttggaattactattgtttttacaattttatc 9582397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 23650639 - 23650686
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23650639 tattaaatttgtttgtaattagtaatgtttttacaattttatccttta 23650686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31541252 - 31541154
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  31541252 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 31541154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 45404604 - 45404518
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttat 152  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||    
T  45404604 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttat 45404518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 46861920 - 46861882
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatattt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46861920 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatattt 46861882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 48902516 - 48902614
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  48902516 gtattaaatttgtatataactactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 48902614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 49543924 - 49543866
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatat 64  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  49543924 ctccgtccctaattataggccccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatat 49543866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 16776486 - 16776607
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  | ||| | |||||||||||||||||| | | |  | | | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16776486 tactacctctgtccctaactatagggccctttaggaaaaataacgggaattaagaaaattaaaagtggtaataaatttgtttgtaattattattgttttt 16776585  T
Q  100 acaattttatcttttaagagag 121  Q
    |||| ||| || ||||||||||    
T  16776586 acaaatttgtcctttaagagag 16776607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 120
Target Start/End: Original strand, 20084697 - 20084746
Alignment:
Q  71 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagaga 120  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20084697 taaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaagaga 20084746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36584935 - 36584839
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||   |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  36584935 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatc-cttaagagagagtaaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 36584839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 123
Target Start/End: Original strand, 16776653 - 16776749
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat-cttttaagagagag 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | | |  | | | ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  16776653 cttttggaaaaataacgggaattaagaaaattaaaagtggtaataaatttgtttgtaattactattgtttttacaaatttgtccttttaagagagag 16776749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 29447602 - 29447688
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttat 152  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  29447602 gtattaaatttgtatataattactattatttgtacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttat 29447688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 40215052 - 40215134
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | | |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  40215052 taattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagagaattaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 40215134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30820079 - 30820010
Alignment:
Q  96 ttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  30820079 ttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaag 30820010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 24813602 - 24813644
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24813602 tactacctccgtccctaattataagatccttttgaaaaaataa 24813644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42755555 - 42755473
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttat-cttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  42755555 taattactattgtttttataattttatccttaaaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 42755473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 74
Target Start/End: Original strand, 7462845 - 7462914
Alignment:
Q  6 cctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaa 74  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  7462845 cctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaa 7462914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 7462943 - 7462988
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  7462943 taattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 7462988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7886500 - 7886455
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  7886500 taattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaaaatggac 7886455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9582334 - 9582289
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9582334 taattaatatagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggac 9582289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 245
Target Start/End: Original strand, 16776833 - 16776874
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16776833 taattaatgtacttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 16776874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26058637 - 26058592
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  26058637 taattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 26058592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30819969 - 30819924
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  30819969 taattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 30819924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 33361639 - 33361684
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  33361639 taattaatgtagttggaaaaagcaaagaggtcttataaaaagggac 33361684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46879109 - 46879068
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  46879109 taattaatgtagttggaaatagcaaaaaattcttataaaaag 46879068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 47008448 - 47008493
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  47008448 taattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaagggac 47008493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 49383277 - 49383334
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagt 58  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  49383277 tactacatccgtccctaattatagggcccttttgaaaaataacgggaattaagatagt 49383334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Original strand, 19667366 - 19667422
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag 123  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  19667366 gtattaaatttggatgtaattagtattgttcttacgattatgtcttttaagagagag 19667422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20919173 - 20919133
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20919173 taattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaa 20919133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20928135 - 20928095
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20928135 taattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaa 20928095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 22527567 - 22527611
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  22527567 taattaatgtagttgaaaatagcaaatgaatcttataaaaaggga 22527611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 164
Target Start/End: Original strand, 53589530 - 53589566
Alignment:
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  53589530 tttatgttttcaacgtattatttattgttaattgaag 53589566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 189)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41317890 - 41317640
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41317890 tactacctccgtctctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 41317791  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||| |||||| ||||||||||||      
T  41317790 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaa 41317691  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41317690 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 41317640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 4102455 - 4102705
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4102455 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 4102554  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||       |||||||||||| |||||||||||||      
T  4102555 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgtaa 4102654  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4102655 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 4102705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34931375 - 34931125
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34931375 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34931276  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  34931275 acaattttatcctttaagagagagttggttcatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 34931176  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34931175 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 34931125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 40614646 - 40614896
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40614646 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 40614745  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||      
T  40614746 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggagcatgtatgtaa 40614845  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  40614846 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaatggac 40614896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52602287 - 52602037
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52602287 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 52602188  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  52602187 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 52602088  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52602087 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 52602037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6090031 - 6089781
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6090031 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 6089932  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  6089931 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 6089832  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6089831 agaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 6089781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 9413067 - 9413316
Alignment:
Q  2 actacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9413067 actaccttcgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 9413166  T
Q  101 caattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnn 199  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       
T  9413167 caattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaa 9413266  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9413267 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 9413316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 229147 - 229388
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  229147 tactacctctgtccttaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgttttt 229246  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  229247 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 229346  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttata 240  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  229347 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 229388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 7763491 - 7763740
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7763491 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 7763590  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||       | ||||||||||| ||||||||||||      
T  7763591 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaagaaaaagat-tataattaataggggcatgtatgtaa 7763689  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7763690 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 7763740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 8923407 - 8923659
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata---ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8923407 tactacccccgtccctaattatatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 8923506  T
Q  98 ttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8923507 ttacagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 8923606  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8923607 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 8923659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 38530891 - 38531141
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38530891 tactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgttttt 38530990  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       ||||||||||||| ||| ||| ||||      
T  38530991 ataattttatcctttaagagggagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggtatgcatgtaa 38531090  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  38531091 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagcgatcttataaaaagggac 38531141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48854114 - 48853864
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48854114 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgttttt 48854015  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  48854014 acaattttatcctttaagagagaaatggtttacgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 48853915  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  48853914 agaaagaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 48853864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8472344 - 8472095
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8472344 tactacctccgtccctaattatagggctcttttaaaaaaataacggaaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8472245  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag-nnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||        |||||| |||||| ||||||||||||     
T  8472244 acaattttatcctttaaga--gagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaaatgtatagttaataggggcatgtatgta 8472147  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  8472146 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 8472095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 43395412 - 43395644
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43395412 tactacatccgtccctaattatagaatcctttagagaaaataacggaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 43395511  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||||||  ||||||||      
T  43395512 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggatatgtatgtaa 43395611  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagg 231  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43395612 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagg 43395644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 21630845 - 21631098
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21630845 tactacctccgtccctaattatatagcctttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 21630944  T
Q  100 acaattttat-cttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatg 195  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||       |||||||| |||| |||||||||||    
T  21630945 acaaatttatccttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 21631044  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21631045 tagagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 21631098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36695152 - 36694900
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36695152 tactccctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 36695053  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  36695052 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 36694953  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  36694952 aaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 36694900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36711253 - 36711001
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36711253 tactccctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 36711154  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  36711153 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 36711054  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  36711053 aaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 36711001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 44529414 - 44529577
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44529414 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 44529513  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  44529514 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaa 44529577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 27530343 - 27530593
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27530343 tactacctccgtccctaattatagggccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgctttta 27530442  T
Q  101 caattttatcttttaagag--agagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||        |||||||| |||| ||||||||||||     
T  27530443 caattttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 27530541  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  27530542 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggac 27530593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3549327 - 3549078
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3549327 tactacctccgtctctaattatagagtcctttcgaaaaaataacgggaattaagatagtgtatatttatattaaatatgtttgtaattagtatt-ttttt 3549229  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||       ||||||||||||| |||||||||| |      
T  3549228 acaattttatcctttaagagataaatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatataa 3549129  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3549128 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggac 3549078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 249
Target Start/End: Original strand, 41855226 - 41855464
Alignment:
Q  13 ccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatct 111  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  41855226 ccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 41855325  T
Q  112 tttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 210  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||       |||||||    
T  41855326 tttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaa 41855425  T
Q  211 tgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41855426 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 41855464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 45285551 - 45285777
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45285551 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaa--taacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 45285648  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||    
T  45285649 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 45285748  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
           ||||||||||||||||||||||    
T  45285749 aaagaaataattaatgtagttggaaatag 45285777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15763613 - 15763361
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15763613 tactacctccgtccataattatagggttcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 15763514  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    | || |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || | |||||       |||||||| |||| | ||||||||||    
T  15763513 aaaaatttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattactgactgaagaaaaaaatgtataataaatatgagcatgtatgt 15763414  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  15763413 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggac 15763361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 9378841 - 9379090
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9378841 tactacctccatccctaattataagatcttttgaaaaaataacggaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 9378940  T
Q  101 caattttatcttttaagagagagat----gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatg 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||     | |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| | ||||| ||||||||    
T  9378941 caattttatcctttaagagagagagagtcggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataagtagggacatgtatg 9379040  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    |       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  9379041 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 9379090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25509470 - 25509254
Alignment:
Q  34 aaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatg 133  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25509470 aaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagagatgttttatg 25509371  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  25509370 ttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggg 25509271  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  25509270 gtcttataaaaagggac 25509254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26550086 - 26549857
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26550086 tactacatccgtccttaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgta-ttagtattgttttt 26549988  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  26549987 acaattttatcctttaagagagaaattgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 26549888  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
         |||||||| |||||||||||||||||    
T  26549887 agaaataattaatatagttggaaatagcaaa 26549857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 19792603 - 19792852
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19792603 tactacctccattcctaattatagggcccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19792702  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||||||  ||||||||      
T  19792703 acaattttatcctttaagataaagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaa 19792802  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
         |||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  19792803 agaaataattaatatagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaaggga 19792852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28052487 - 28052235
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28052487 tactacctccgtccctaattacaggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28052388  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    | ||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  28052387 ataattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattggagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 28052288  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  28052287 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 28052235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31239016 - 31238765
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagg--atcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||  |||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31239016 tactacctccgtccctaattatagggcccctttgaaaaaaatagcgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 31238917  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||       |||||||| || | ||||||||||||     
T  31238916 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgtatgta 31238817  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31238816 aagaaataattaaagtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 31238765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 12814526 - 12814778
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaa--aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12814526 tactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaaataacgggaattaagatactggatattagtattaaatatgtttgcaattactattgtttt 12814625  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatg 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||       ||||||| ||||| |||||||||||    
T  12814626 tacaattttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttactgttgattgaagaaaaagatgtataa-taataggggcatgtatg 12814724  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12814725 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagtgtcttataaaaagggac 12814778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 14089997 - 14090223
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14089997 ctccgtctttaattataagatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 14090096  T
Q  106 ttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnn 202  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||          
T  14090097 ttatcctttaagagagagaggtaatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 14090196  T
Q  203 ntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14090197 ataattaatgtagttggaaataacaaa 14090223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Original strand, 1767631 - 1767853
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  1767631 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgcattatatatgtttgtaattagcattgtttttacaattttatcatttaagagagaaatgg 1767730  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||    
T  1767731 tttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagc 1767830  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  1767831 aaaggggtcttataaaaagggac 1767853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15100660 - 15100402
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15100660 tactacctctgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 15100561  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--------tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcat 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||        || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||    
T  15100560 acaattttatcctttaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcat 15100461  T
Q  191 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||       |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15100460 gtatgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 15100402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23530843 - 23530591
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23530843 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23530744  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  23530743 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatcttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 23530644  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  23530643 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggac 23530591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25284104 - 25283938
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25284104 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 25284005  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  25284004 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 25283938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 36674043 - 36674289
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36674043 ctccgtctctaattataggacctttttgaaaaaataacgcgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 36674142  T
Q  106 ttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnn 202  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||| ||||          
T  36674143 ttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgcatgtaaaaaa 36674242  T
Q  203 ntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  36674243 ataattaatgtagttaaaaatagcaaaaggatcttataaaaagggac 36674289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26544772 - 26544550
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 127  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  26544772 ctttcgaaaaaataacaagaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttatgagagaaatga 26544673  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||       ||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||| ||| ||||||     
T  26544672 tttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataatttataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaattgaaaataga 26544573  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||   ||||||||||||||||    
T  26544572 aaagaggtcttataaaaagggac 26544550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 42275900 - 42276191
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42275900 tactaccttcgtcc-taattataagactcttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 42275998  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  | || | ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  42275999 acaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 42276098  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacgga 289  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  42276099 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacgga 42276191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9715658 - 9715406
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9715658 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 9715559  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaa-tagggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| || | ||||||| ||||    
T  9715558 acaattttatcctttaagaaagagggttgccttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgcatgt 9715459  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  9715458 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggcgcttataaaaagggac 9715406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38261638 - 38261386
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38261638 tactacctccgtccctaattataaggttcttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttctattaaatatgtttgtaattactattgttttt 38261539  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  38261538 acaattttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 38261439  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  38261438 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaagggac 38261386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 48067634 - 48067886
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  48067634 tactacctccgtccctaattacaaaacccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 48067733  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  48067734 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 48067833  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  48067834 aaagaaataattaatttagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 48067886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 5765730 - 5765961
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5765730 tactacctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5765829  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||| || || | |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  5765830 acaattttctccttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 5765929  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5765930 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaa 5765961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 2489141 - 2489391
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2489141 tactacctccgtccctaattatagagccattttgaaaaaataacgggaattaagataatgaacatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 2489240  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |        |||||||| |||| | ||||||||||      
T  2489241 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaa 2489340  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  2489341 agaaataattaatgtagttggaaataccaaaaagttcttataaaaagggac 2489391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 44454565 - 44454724
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaa-aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  44454565 tactacctttgtccctaattataggatccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgattt 44454664  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgct 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44454665 tacaattttatcctttaagagagatggatgatttatgttttcaacatgttatttattgct 44454724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27037567 - 27037315
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27037567 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgttttt 27037468  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||  ||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  27037467 acaattttatcctttaagaaagagagctggcttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 27037368  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  27037367 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagggtcttataaaaagggac 27037315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 28888162 - 28888414
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28888162 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28888261  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    |||||||| || ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  28888262 acaattttttcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 28888361  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||    
T  28888362 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttacaaaaaaggac 28888414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 51561070 - 51561220
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51561070 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 51561169  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  51561170 acaattttatcctttaagagaaagatggtttatgtttt-aacatattattta 51561220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 14171827 - 14171663
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14171827 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 14171728  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  14171727 acaattttatcctttaaaagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaag 14171663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37585249 - 37584999
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  37585249 tactacctccgttcttaattatagggtccttttgaaaaaataacaggaattaagataatagatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 37585150  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  37585149 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 37585050  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||| |||||| |  ||||||  ||||||||||| ||||    
T  37585049 agaaataattaatgtatttggaatttacaaaggggtcttataaaaacggac 37584999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 15892303 - 15892555
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15892303 tactatctctgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 15892402  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| | || ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||        |||||||| |||||| |||| |||||    
T  15892403 acaattttatcctttaagaaagagtgttggtttatgttttcaacattctatttattactgattgaaaaaaaagatgtataataaataggagcatatatgt 15892502  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  15892503 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggac 15892555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 28885842 - 28886094
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28885842 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28885941  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       ||| | || |||| ||||||||||||    
T  28885942 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtttcataaataggggcatgtatgt 28886041  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||    
T  28886042 aaataaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttacaaaaagggac 28886094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38613773 - 38613521
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38613773 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaactaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattattttt 38613674  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  38613673 acaattttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 38613574  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  38613573 aaagaaataattaatgtagttagaaatataaaaggggtcttataaaaagggac 38613521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37589210 - 37589011
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  37589210 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggtt 37589111  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
    | ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||       |||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  37589110 ggtttatgttttcaacattccatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 37589011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15111873 - 15111627
Alignment:
Q  11 gtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 109  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  15111873 gtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaattttacaattttat 15111774  T
Q  110 cttttaagagagaga------tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnn 202  Q
    | |||||||||||||      || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       ||||| || |||| || |||||||||          
T  15111773 cctttaagagagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgtatgtaaagaa 15111674  T
Q  203 ntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15111673 ataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 15111627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25271486 - 25271256
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25271486 tactagctccgtccctaattatatgatatttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 25271387  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    |||||||||  |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  25271386 acaatttta--ttttaagagagaggaatggtttatgttatcaacatgtta-ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 25271290  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaag 230  Q
            ||||||||||||||||||||||||||    
T  25271289 aaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaag 25271256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14347420 - 14347187
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| || |||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14347420 tactacatctgtccctaattataaagctcttttgagaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 14347321  T
Q  100 acaattttatcttttaaga--gagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  14347320 acaattttatcctttaagagggagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 14347221  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaag 230  Q
           ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14347220 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaag 14347187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24855576 - 24855281
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24855576 tacctccgtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 24855477  T
Q  103 attttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnn 199  Q
    |||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||| |||||       
T  24855476 attttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaa 24855377  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacggatatagta 296  Q
        ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  24855376 gaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac-aaaaaaaattctcaaaatggtcttataattagggacggatgtagta 24855281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Original strand, 27575379 - 27575627
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  27575379 tacctccatccctaattataaggtctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgaaattactattgtttttaca 27575478  T
Q  103 attttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnn 199  Q
    |||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       
T  27575479 attttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 27575578  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
        |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  27575579 gaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaggatcttataaaaaggga 27575627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26544508 - 26544377
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26544508 tacctccgtctctaattataggacccttttgaaaacataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatatttgtaattattattgtttttaca 26544409  T
Q  103 attttatcttttaagagagagatgatttatgt 134  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  26544408 attttattctttaagagagagatggtttatgt 26544377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 896792 - 896957
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || |||  |||||||| |  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  896792 tactacctccgtctctaattataaggtccttttgaaaaataaggaaaattaagataattgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 896891  T
Q  101 caattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  896892 caattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 896957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Original strand, 31086690 - 31086894
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga-ga-t 125  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  31086690 cttttgaaaaaataatgggagttaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgatt 31086789  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| || | |||||| |||||       |||||||||||||||||||||    
T  31086790 gatttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaagaggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 31086889  T
Q  225 gcaaa 229  Q
    |||||    
T  31086890 gcaaa 31086894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15290221 - 15289984
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15290221 tactacctccgtcccttattataggatccttttgaaaaaataatgggaat-----------atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 15290133  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  15290132 acaatattatcctttaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 15290033  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
           ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  15290032 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaag 15289984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 32906705 - 32906830
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaa-aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32906705 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtttt 32906804  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||    
T  32906805 tacaattttatcctttaaaagagaga 32906830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 9202245 - 9202491
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  9202245 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 9202344  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  9202345 acaattttatccttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 9202444  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  9202445 aataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 9202491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13344068 - 13343913
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13344068 tacctctgtccctaattataaggttattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 13343969  T
Q  103 attttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgct 156  Q
    |||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||    
T  13343968 attttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacattctatttattgct 13343913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 51422165 - 51422414
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaa--aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||  ||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51422165 tactacctccgtccctaattataaggtccttttaaaaaaaataacgcgaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttt 51422264  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg---catgta 193  Q
    |||||||||||  |||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||       |||||||| |||||||    |||||    
T  51422265 tacaattttatgctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatatgta 51422364  T
Q  194 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaa 243  Q
    |||       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  51422365 tgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 51422414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 51811138 - 51811008
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag--atgatttatg 133  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  51811138 aaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaggaatgatttatg 51811039  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  51811038 ttttcaacatgttattgattgctgattgaag 51811008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 52430913 - 52431165
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  52430913 tactccctccgtccctatatataagatccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgttttt 52431012  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  52431013 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 52431112  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  52431113 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 52431165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 11906967 - 11907219
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  11906967 tactccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgagaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 11907066  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  11907067 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 11907166  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  11907167 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 11907219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25228494 - 25228328
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| |||||| | |  | ||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25228494 tactacctccgtccttaattaaaaggccattttgaaaatataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25228395  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  25228394 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 25228328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26547802 - 26547679
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26547802 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaataacggaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 26547703  T
Q  101 caattttatcttttaagagagaga 124  Q
    |||||||||| ||||||| |||||    
T  26547702 caattttatcatttaagaaagaga 26547679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Original strand, 45038130 - 45038267
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |    
T  45038130 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagaaagagagtt 45038229  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    |  | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  45038230 ggctaatgttttcaacattctatttattgctgattgaa 45038267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3934875 - 3934653
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |    
T  3934875 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgagtatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggtt 3934776  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||  ||||||| |       ||||||||||||||| |||||    
T  3934775 ggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggaacatgtatctaaacaaataattaatgtagttgaaaata 3934676  T
Q  225 gcaaaggtttcttataaaaaggg 247  Q
    | ||| |  ||||||||||||||    
T  3934675 gaaaatgagtcttataaaaaggg 3934653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11741651 - 11741443
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||||    
T  11741651 gggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaac 11741552  T
Q  142 atattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttata 240  Q
    || |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  11741551 atcttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 11741452  T
Q  241 aaaagggac 249  Q
    |||||||||    
T  11741451 aaaagggac 11741443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16456898 - 16456682
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  16456898 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 16456799  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||||| ||||| ||||       |||||||||||||| |||||||||||||     
T  16456798 ttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggagcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggg 16456699  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  16456698 gtcttataaaaagggac 16456682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45794606 - 45794390
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  |  ||||||    
T  45794606 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatg 45794507  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| |||||||| |||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  45794506 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 45794407  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  45794406 gtcttataaaaagggac 45794390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38175163 - 38175008
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaa-atagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  38175163 tccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataatggaaattaaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgtttttacaatt 38175064  T
Q  106 ttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||  |||  ||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  38175063 ttattcttt--gagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa 38175008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39324763 - 39324576
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgcta 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |     
T  39324763 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttg 39324664  T
Q  158 attgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
    |||||||       || |||||  ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  39324663 attgaagaaaaagatgaataatagataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaa 39324576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 244
Target Start/End: Original strand, 50246705 - 50246916
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  50246705 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 50246804  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  50246805 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagga 50246904  T
Q  233 ttcttataaaaa 244  Q
     |||||||||||    
T  50246905 gtcttataaaaa 50246916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 943412 - 943628
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  943412 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 943511  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||  ||||||     
T  943512 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatgacaaagga 943611  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||| ||||    
T  943612 gtcttataaaaaaggac 943628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 42872109 - 42872325
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  42872109 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 42872208  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||| || |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  42872209 ttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaatggg 42872308  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  42872309 gtcttataaaaagggac 42872325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 39750121 - 39750369
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  39750121 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 39750220  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  39750221 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 39750320  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  39750321 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 39750369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 30289602 - 30289853
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  30289602 tactccctccgtccctaattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 30289701  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  30289702 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 30289801  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  30289802 aagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggac 30289853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44649926 - 44649675
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  44649926 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 44649827  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | | |||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  44649826 acaattttatccttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 44649727  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  44649726 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 44649675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 43668188 - 43668374
Alignment:
Q  47 aattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagag-agaga-tgatttatgttttcaacata 144  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||     
T  43668188 aattaagatagtggatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagaaaagattgatttatgttttcaacatg 43668287  T
Q  145 ttatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaag 230  Q
    |||||||||||| ||||| |       |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43668288 ttatttattgctgattgatgaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagcaaag 43668374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Original strand, 47300668 - 47300881
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  47300668 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 47300767  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  47300768 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaatgg 47300867  T
Q  233 ttcttataaaaagg 246  Q
     ||| |||||||||    
T  47300868 gtctcataaaaagg 47300881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Original strand, 1837316 - 1837484
Alignment:
Q  5 acctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaa 103  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1837316 acctccgtccctaattatatgactcttttataaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtcttaaatatgtttgtaattactattgcttttacaa 1837415  T
Q  104 ttttatcttttaagagagaga--------tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    | ||||| || ||||||||||        |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1837416 tattatccttcaagagagagagagagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 1837484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2280215 - 2280000
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  2280215 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttctattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 2280116  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2280115 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 2280016  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     || |||||||||||||    
T  2280015 gtc-tataaaaagggac 2280000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 16575867 - 16576083
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  16575867 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattcaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 16575966  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| |||||| |||||       ||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  16575967 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataactaatgtagttggaaataacaaaggg 16576066  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  16576067 gtcttataaaaagggac 16576083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 27974895 - 27975061
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| || | |||||  |||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  27974895 tactacctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaattgcaggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgttttt 27974994  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27974995 acaattttattttttaagagagagagtatatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 27975061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30290527 - 30290311
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  | |  |||||     
T  30290527 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttttagaaagaatgttagtttata 30290428  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||      
T  30290427 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagag 30290328  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  30290327 gtcttataaaaagggac 30290311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 249
Target Start/End: Original strand, 32169740 - 32169945
Alignment:
Q  46 gaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagag-agatgatttatgttttcaacata 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| || || | |||||| ||||||||||     
T  32169740 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttattctttaagaaagaaggttatttatattttcaacatg 32169839  T
Q  145 ttatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaa 243  Q
    |||||||||| | |||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  32169840 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaa 32169939  T
Q  244 agggac 249  Q
    ||||||    
T  32169940 agggac 32169945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34503506 - 34503282
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gat 125  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | |    
T  34503506 ctttcgaaaaaacaacatgaattaagatggtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgcttttataattttatcttttaagagagagggtt 34503407  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||        |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||| ||||| |||||    
T  34503406 ggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttgaaaata 34503307  T
Q  225 gcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||    
T  34503306 gcaaatgaatcttataaaaaaggac 34503282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 245
Target Start/End: Original strand, 39873488 - 39873672
Alignment:
Q  64 tttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattg 161  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39873488 tttgtattaaatatgtatgtaattattattgtttttccaattttatcctttaagagagagggttggtttatgtttttaacatattatttattgctgattg 39873587  T
Q  162 aagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    |||       |||||||| |||||||  ||||||||       |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  39873588 aagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatatgtcttataaaaag 39873672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 15810979 - 15811223
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    |||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15810979 tccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 15811078  T
Q  107 tatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnnt 204  Q
    |||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |    
T  15811079 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 15811178  T
Q  205 aattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  15811179 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 15811223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23542276 - 23542025
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  23542276 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgttttt 23542177  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||| ||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||     
T  23542176 acaattttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgta 23542077  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  23542076 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 23542025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 39362934 - 39363185
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  39362934 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 39363033  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||  | || ||| |||||||| |||||||       |||||||| |||| |||| |||||||     
T  39363034 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgta 39363133  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  39363134 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 39363185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44646568 - 44646317
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  44646568 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 44646469  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | | |||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  44646468 acaattttatccttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 44646369  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  44646368 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 44646317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 46075613 - 46075858
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46075613 ctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 46075712  T
Q  106 ttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnn 202  Q
    ||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||       |||||||| |||| |||||||||||           
T  46075713 ttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatt-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgcaaagaa 46075811  T
Q  203 ntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  46075812 ataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 46075858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50938022 - 50937824
Alignment:
Q  54 atagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||   |||||    
T  50938022 atagtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaattta 50937923  T
Q  152 ttgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||    
T  50937922 ttgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaaaggac 50937824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35693362 - 35693238
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | | | |||| | ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  35693362 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaatttgataatggtaataaatttgtttgtaaatactattgttttt 35693263  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  35693262 acaattttatccttgaagagagaga 35693238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1039121 - 1039372
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || | |||||  ||||| |||| |||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  1039121 tactccctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 1039220  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| || ||||||||||| | ||  || ||||| || |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||     
T  1039221 acaattttatccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 1039320  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  1039321 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 1039372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1046027 - 1046278
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || | |||||  ||||| |||| |||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  1046027 tactccctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 1046126  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| || ||||||||||| | ||  || ||||| || |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||     
T  1046127 acaattttatccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 1046226  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  1046227 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 1046278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45039709 - 45039458
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  45039709 tacttcctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatattagtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 45039610  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| ||| |||| ||||||||     
T  45039609 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgta 45039510  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  45039509 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 45039458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 1047992 - 1048242
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  1047992 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 1048091  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||  | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||     
T  1048092 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 1048191  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||    
T  1048192 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttttaaaaaggga 1048242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49907276 - 49907067
Alignment:
Q  43 cgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaa 140  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||| |||||||    
T  49907276 cgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttaacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttattttttcaa 49907177  T
Q  141 catattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttat 239  Q
    |||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  49907176 catgatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat 49907077  T
Q  240 aaaaagggac 249  Q
    ||||||||||    
T  49907076 aaaaagggac 49907067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 31635870 - 31636117
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||    
T  31635870 tactacctcggtccctaattataagacttttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttataatcactattgttttt 31635969  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatat--tatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    |||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||       |||| ||| |||| ||||||||||||    
T  31635970 acaattttatc-cttaaaagagagttaatttatgttttccatatatgctatttatggctaattgaagaaaaagatgtagaataaataggggcatgtatgt 31636068  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
           |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  31636069 aaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 31636117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Original strand, 50008258 - 50008470
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  50008258 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttgcaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 50008357  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| ||| |||||| | |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  50008358 ttttcaacatgttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 50008457  T
Q  233 ttcttataaaaag 245  Q
     ||||||||||||    
T  50008458 atcttataaaaag 50008470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4592840 - 4592625
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatg 133  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||||   |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||  |  ||||||    
T  4592840 aaaatcacgagaattaagaaagtagatatttgcattaatattgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctataagagatagagttagtttatg 4592741  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||| |||| || |||||||||       || |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  4592740 ttttcaacatattatttattgctagttgaagaaaaagatgtataataaatatggacatgtatgtaaagtaatagttaatgtacttgaaaatatcaaaggt 4592641  T
Q  233 ttcttataaaaaggga 248  Q
     |||||||||||||||    
T  4592640 gtcttataaaaaggga 4592625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7784291 - 7784037
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaa-aatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  7784291 tactccctccgtccctaattataagactcttttgttaaaattacgggaattaagaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 7784192  T
Q  99 tacaattttatctttta---agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtat 194  Q
    |||||||||||| || |   |||||||| |  ||||| ||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||| |||||||||    
T  7784191 tacaattttatccttaagagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgtat 7784092  T
Q  195 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||       ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||    
T  7784091 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataataagggac 7784037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18172609 - 18172460
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaa-taacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaat-atgtttgtaattagtattgttt 97  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||      ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  18172609 tactaccttcgtccttaattataggactcttttgaaaaaaataacgggag-----atagtggatatttatattaaattatgtttgtaattactgttgttt 18172515  T
Q  98 ttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttat 152  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18172514 ttacaattttatcctttaagagttggatgatttatgtttttaacatgttatttat 18172460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 10383817 - 10384034
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta---agagagagatgatttat 132  Q
    ||||| |||| |||||| | ||| ||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |   |||||||| |  |||||    
T  10383817 aaaatcacggaaattaagaaagtggatatttatattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttat 10383916  T
Q  133 gttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagg 231  Q
    |||||| | || ||||||||| ||||||||||       | |||||| |||| ||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10383917 gttttccatatgttatttattactaattgaagaaaaagatatataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 10384016  T
Q  232 tttcttataaaaagggac 249  Q
      ||||||||||||||||    
T  10384017 agtcttataaaaagggac 10384034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 37951689 - 37951940
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||    
T  37951689 tactccctccgtccctaattatatgacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgttttt 37951788  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||| ||||| || | | |||||| |  ||||||||||| | ||  |||||||| || |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  37951789 acaatattatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 37951888  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  37951889 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 37951940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39497730 - 39497479
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  39497730 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 39497631  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | ||||| || |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| ||| || ||||||||||     
T  39497630 acaattttatccttaagagagatagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgta 39497531  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  39497530 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 39497479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 164
Target Start/End: Original strand, 32149086 - 32149216
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttt--aagagagagatgatttatg 133  Q
    ||||| || |||||||| | |||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |  ||||||    
T  32149086 aaaattacaggaattaagaaagtagatattttcattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaaaatagagagttagtttatg 32149185  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  32149186 ttttgaacatgttatttattgctgattgaag 32149216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45336147 - 45335931
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| || |  |||||     
T  45336147 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttcttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttata 45336048  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||        |||||||| ||| |  ||||||||||       ||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  45336047 ttttcaacatgttatttattgttaattgaaaaaaaaaatgtataataaatggaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtaggaaataacaaaggg 45335948  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||| ||||    
T  45335947 gtcttataaaaaaggac 45335931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9425062 - 9424899
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| | | | |||| |   | ||| | ||||| |||||| ||||||||||    
T  9425062 tactacttccgtccctaattataagatcattttaaaaaaataacgggaactaagaaaattgataat---aataagtttgtttataattaatattgttttt 9424966  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||    
T  9424965 acaattttatcttttaagagagagaattattttatgttttcaacataatatttaatgttgattgaag 9424899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 11351441 - 11351541
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagata-tttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11351441 tactaccttcatccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatattttatattaaatatgtttgtaattattattatttt 11351540  T
Q  99 t 99  Q
    |    
T  11351541 t 11351541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 36880362 - 36880525
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||    
T  36880362 tactccctccgtccctatatataagatccttttgtcaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtattt 36880461  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||| |  | |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  36880462 acaattttatcctttaaga-aatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 36880525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1427497 - 1427331
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt--gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||| | | | |||| |  || ||||| |||| ||||||| ||||| |||    
T  1427497 tactacctccgtccctaattataggatcatttaaaaaaaaataacggaaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttt 1427398  T
Q  99 tacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||    
T  1427397 tacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaag 1427331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 229
Target Start/End: Original strand, 8104073 - 8104261
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||||    
T  8104073 gggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaac 8104172  T
Q  142 atattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
    || |||||||||  | |||||||       |||||||| |||| |||||||||| |       ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8104173 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 8104261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10433573 - 10433369
Alignment:
Q  46 gaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatt----tatgttttcaac 141  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||    ||| ||||||||    
T  10433573 gaattaagaaagtagatatttgtattaaatttgtttctaatcactattgtttttacaattttat-tcttaagagagagagaattagtatatattttcaac 10433475  T
Q  142 atattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttata 240  Q
    || |||||||||||| ||||||        |||||||| |||| ||||||||||||       ||| |||||||||||| |||| |||| |  |||||||    
T  10433474 atgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataaataatgtagttggcaataacaaatgagtcttata 10433375  T
Q  241 aaaagg 246  Q
    ||||||    
T  10433374 aaaagg 10433369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 35984409 - 35984653
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    |||||||||||||||| || | |||||   |||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35984409 tccgtccctaattataagacccttttgcttaaatcacgggaattaaaaaagcatatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 35984508  T
Q  107 tatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnnt 204  Q
    |||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |    
T  35984509 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 35984608  T
Q  205 aattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  35984609 aattaatgtagttaaaaataacaaagggattttataaaaagggac 35984653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 164
Target Start/End: Original strand, 41619998 - 41620071
Alignment:
Q  90 tattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  41619998 tattgtttttacaattttatcttt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaag 41620071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18237353 - 18237138
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || | |||||||| |  ||||| |    
T  18237353 aaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattctatccttaagagagagagttagtttatat 18237254  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||| | ||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||||  ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||| |      
T  18237253 tttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaagaaataagtaatgtagttggaaatagcaaatgag 18237154  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  18237153 tcttataaaaagggac 18237138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 39425570 - 39425735
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||   ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  39425570 tactacctccgtcattaaatataggatctttttgcaaaaataacgcagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 39425669  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  39425670 acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 39425735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33337097 - 33336947
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt--gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||| | | | |||| |  || ||||| |||| ||||||| ||||| |||    
T  33337097 tactacctccgtccttaattataggatcctttaaaaaaaaataacgagaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttt 33336998  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattattt 150  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  33336997 tacaattttatc-cttaagagagagttaatttatgttttcaatataatattt 33336947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50008217 - 50008024
Alignment:
Q  54 atagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||| | |  | |  |||||||||||||||| |||||||    
T  50008217 atagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttcataattttatcatttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgttattta 50008118  T
Q  152 ttgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    ||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  50008117 ttgttgattgaag-aaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 50008024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 18114211 - 18114377
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| || ||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||| | ||| || | | ||| ||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  18114211 tactacctctgtacctaattatagggcccttttggaaaaataacggaaattaagaaagttgaaaatggtaataaacttgtttgtaatttctattgttttt 18114310  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | | || ||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  18114311 acaattttatcctttaagagagagggttaatatatgttttcaatataatatttaatgctgattgaag 18114377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22567366 - 22567115
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||    
T  22567366 tactacctccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacggaaattaagaaagtggatatttgtattatttttgtttgtaatcactattgttttt 22567267  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||       ||||| || |||| || |||||||||    
T  22567266 acaattttat-tattaagagagagagttaatttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtattataaatatggacatgtatgt 22567168  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  22567167 aaggaaataattaatatagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaaaagggac 22567115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27479895 - 27479730
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||| | ||| |||  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  27479895 tactacctccgtccctaaatataggagtcttttgtcaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 27479796  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||  ||||||| |||   | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  27479795 acaattttatc-cttaagagggaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 27479730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 247
Target Start/End: Original strand, 47296342 - 47296556
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgtt 135  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| | |||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |  ||||||||    
T  47296342 aaaatcacgagaattaagataatcgatattggtattaaagatgtttgtaatcactattgttttcacaattttgtccttt-agagagaggtagtttatgtt 47296440  T
Q  136 ttcaacatattattta---ttgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagg 231  Q
    ||||||||  ||||||   ||| | |||||||       |||||||| |||| |||||| |||||       |||||||||||||||||||||||||||     
T  47296441 ttcaacatgatatttattgttgattattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaacaaataattaatgtagttggaaatagcaaaga 47296540  T
Q  232 tttcttataaaaaggg 247  Q
    | || |||||||||||    
T  47296541 tatcctataaaaaggg 47296556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 47754623 - 47754457
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| |||||||||||  ||||  |||||| |||||||  ||||||||| ||   | ||||||    
T  47754623 tactacctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaatttagtgaatatttatattaaagttgtttgtaaataccgtcgttttt 47754524  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47754523 acaaatttatcctttaagatagagagtttgtttatgttttcaacatactatttattgctgattgaag 47754457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47069078 - 47068835
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    |||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  47069078 tccgtccctaattataagacccttttgttaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattt 47068979  T
Q  107 tat-cttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnnt 204  Q
    ||| |||  ||||||||| |  ||||| ||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |    
T  47068978 tatccttaaaagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 47068879  T
Q  205 aattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||   |||||||||||||||    
T  47068878 aattaatgcagttagaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 47068835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 243
Target Start/End: Original strand, 46506204 - 46506398
Alignment:
Q  51 aaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatt 149  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||| || | | |||||| |||||||||||||| | ||  | ||    
T  46506204 aaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagaaagagagttgatttatgttttccatatgatgtt 46506303  T
Q  150 tattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaa 243  Q
    ||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  46506304 tattgctcattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaagtaattaatatagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaa 46506398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 164
Target Start/End: Original strand, 32153569 - 32153699
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga--gagagatgatttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||| | ||||| ||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |  ||||||    
T  32153569 aaaatcacggaaattaagaaagtaggtatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagatggagagttagtttatg 32153668  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||||    
T  32153669 ttttgaacatgttatttattgttgattgaag 32153699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Original strand, 1197950 - 1198073
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaa----gagagagatgatttatgttttca 139  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||    ||||||| | ||||||||||| |    
T  1197950 gggaattaaaaaagttgatgtttgtattaaagctgtttataattgctattgtttttaaaattttatcttttaagagggagagagttaatttatgttttta 1198049  T
Q  140 acatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||  ||||||||| | ||||||    
T  1198050 acatgctatttattgttgattgaa 1198073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 122
Target Start/End: Original strand, 2606722 - 2606776
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2606722 tattaaatttgtttgtaattagtattgtttttacgattttatcctttaagagaga 2606776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 2636993 - 2637091
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  2636993 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 2637091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13698872 - 13698744
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatg 133  Q
    ||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||    
T  13698872 aaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat-tcttaagagagagagttggtttatg 13698774  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    |||||   ||| | ||||||||| ||||||    
T  13698773 ttttccttatactttttattgctgattgaa 13698744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45810287 - 45810122
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||||| || |  ||||| | ||| |||  | ||||||||| | | | |||||| |||| |||||    
T  45810287 tactatcttcgtccctaattataggagccttttgcaaaaattaccgagattaagaaagttgattgtagtattaaatttatatataattactattattttt 45810188  T
Q  100 acaattttatcttttaa--gagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  45810187 acaattttatcctttaaaggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 45810122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 47263755 - 47263645
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||  ||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  47263755 tactacctccgtttctaattgtaggacccttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 47263656  T
Q  100 acaattttatc 110  Q
    |||||||||||    
T  47263655 acaattttatc 47263645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31465936 - 31465714
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga-- 124  Q
    |||||||  ||||| || |||||||| | |||  ||||||| ||||||  | ||||| || | || |||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  31465936 tcttttgccaaaatcactggaattaagaaagtgaatatttgcattaaacttatttgttatcactaatgtttttacaattttatcctttaagagagatagt 31465837  T
Q  125 tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaat 223  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||       |||||||| |||| ||| ||||||||       || |||||||| ||||||||    
T  31465836 tagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattaaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaggaatagttaatgtacttggaaat 31465737  T
Q  224 agcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    | ||||||  |||| ||||||||    
T  31465736 aacaaagggatcttgtaaaaagg 31465714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 37850177 - 37850332
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  37850177 tactacctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtgtataattactattgttttt 37850276  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
     ||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37850277 gcaattttatc-cttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattg 37850332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4389839 - 4389751
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  4389839 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattg 4389751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 7212334 - 7212550
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| || |||  | |  ||||||    
T  7212334 aaaatcacggaaattaatatagtgaatatttgtataaaagttgtttgtaatcattattgtttttataattttatcctttatgaaagatggttagtttatg 7212433  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||| |||       |||||||| ||| | || ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||     
T  7212434 ttttcaacatgatatttattgttcattcaagaaaaatatgtataataaataaaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 7212533  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     | ||||| ||||||||    
T  7212534 gttttatagaaagggac 7212550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 164
Target Start/End: Original strand, 9700552 - 9700655
Alignment:
Q  62 tatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaatt 160  Q
    |||||||||||||  | |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||    
T  9700552 tatttgtattaaagttatttgtaatcactattgattttacaattttatcctttagaaagagagatagtttatattttcaacatgctatttattgctgatt 9700651  T
Q  161 gaag 164  Q
    ||||    
T  9700652 gaag 9700655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 23893505 - 23893602
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  23893505 tattaaatttgtatataattaccattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 23893602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 249
Target Start/End: Original strand, 47429177 - 47429378
Alignment:
Q  50 taaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta-tcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattat 148  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| || |||| |||||||    
T  47429177 taaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtagtcactattatttttacaattttattctttagagagagagttagtttatattctcaatatattat 47429276  T
Q  149 ttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggg 247  Q
    |||||| | ||| |||       |||||||| ||| ||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  47429277 ttattgttgattaaagaaaaagatgtataataaatggggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttataaaaaggg 47429376  T
Q  248 ac 249  Q
    ||    
T  47429377 ac 47429378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 154
Target Start/End: Original strand, 4371574 - 4371659
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  4371574 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagagttaatttatattttcaacataatacttattg 4371659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9413610 - 9413516
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| | |||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9413610 gatatttgtattaaagttgtttgcaatcattatcatttttacaattttatctttgaaaagagatatagtttatattttcaacatactatttattg 9413516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27255555 - 27255465
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | | || | | ||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27255555 cttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaaatggtaataaatttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcatttaaga 27255465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 52429117 - 52429019
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  52429117 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 52429019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 46084135 - 46083998
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga-gatga 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | | | || | |  || ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||      
T  46084135 ttttgaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttgtaattaatattgcttttacaattttatcttttaagcaagaggattc 46084036  T
Q  128 tt-tatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    || ||||||||||||||| |||||| | || |||||||    
T  46084035 ttgtatgttttcaacatagtatttaattcttattgaag 46083998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 49549231 - 49549134
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  49549231 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaa 49549134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15616397 - 15616310
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||| || |||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15616397 aaaatcacgggaattaagaaagtggataattatattaaagttgtttgtaatcatcattgtttttacaattttatc-tttaagagagaga 15616310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 48363821 - 48363919
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  48363821 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 48363919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 154
Target Start/End: Original strand, 29437678 - 29437749
Alignment:
Q  84 aattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  29437678 aattactattgtttttacaattttatccttaatagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattg 29437749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 15302551 - 15302649
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  15302551 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 15302649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 15624646 - 15624756
Alignment:
Q  15 ctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttt 113  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | | | || | | ||| ||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||    
T  15624646 ctaattatagggctcttttgaaaaaataacggaaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttgtttgtaattactattattttgataattttatcctt 15624745  T
Q  114 taagagagaga 124  Q
    ||||| |||||    
T  15624746 taagaaagaga 15624756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17483962 - 17483864
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  17483962 gtattaaatttgtatataattactattgattttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 17483864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 22940561 - 22940714
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||| || |||||||| | ||| |||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  22940561 tactacctccgtctctaattataggacccttttgatcaaatcacaggaattaagaaagttgatagtagtatt-aatttgtttgtaattactattgctttt 22940659  T
Q  100 acaatttta-tcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    ||| ||||| ||| || ||||||   |  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22940660 acagttttattctcttcagagagtattagtttatgtttccaacataatatttatt 22940714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27670071 - 27669974
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt-acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  27670071 gtattaaatttgtatataattactattgttttttacaattttatccttaaa-agagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 27669974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 124
Target Start/End: Original strand, 31338946 - 31339011
Alignment:
Q  61 atatttgtattaaatatgtttgtaat--tagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  31338946 atatttgtattaaatttgtttgtaattgtattattgtttttacaatttcatcctttaaaagagaga 31339011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5858346 - 5858301
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  5858346 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 5858301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 109
Target Start/End: Original strand, 23932941 - 23932982
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23932941 tattaaatttgtttgtaattagtattgtttttataattttat 23932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 39867602 - 39867647
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  39867602 taattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 39867647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 153
Target Start/End: Original strand, 46271159 - 46271246
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  46271159 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-tcttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttatt 46271246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 52001573 - 52001528
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctt 112  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  52001573 gtattaaatttgtttgtaattattattgtttttataattttatctt 52001528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 249
Target Start/End: Original strand, 11352933 - 11353055
Alignment:
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggc-atgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||        |||||||| |||||||  ||||||||       ||||||||||||||| ||||| |    
T  11352933 tttatattttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaataataattaatgtagttgaaaataac 11353032  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  11353033 aaaggggtcttataaaaagggac 11353055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 151
Target Start/End: Original strand, 33163201 - 33163284
Alignment:
Q  65 ttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    ||||||||||  | |||||||| | |||||||| |||||||||||||||   ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33163201 ttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttatacaattttatcttt---gagagagttagtttatgttttcaacataatattta 33163284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47754109 - 47754065
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  47754109 taattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 47754065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Original strand, 8946442 - 8946501
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagag 119  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  8946442 gatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacatttttattctttaagag 8946501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26768611 - 26768560
Alignment:
Q  71 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga 122  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26768611 taaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttaacctttaagagaga 26768560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30996973 - 30996876
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||   | ||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  30996973 tattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatc-cttaagagagaggattaatttacgttttcaacataatatttattgttgattgaag 30996876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 4279951 - 4280033
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  4279951 taattactattgtttttacaattttatccttaagcgagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 4280033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5966869 - 5966749
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||| |||| | | | || ||| | | ||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  5966869 tactacctctgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatcggatttaagaaaattgaaatt-gaaataaagttgtttgtaatta-tattgctttt 5966772  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  5966771 acaattttatcctttaagagaga 5966749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18172419 - 18172377
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  18172419 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 18172377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 29437891 - 29437849
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29437891 tactacctccgtccctaattataagactcttttgaaaaaataa 29437849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 38920448 - 38920378
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttat 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||    
T  38920448 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttat 38920378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 39626985 - 39627131
Alignment:
Q  10 cgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 108  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||| | ||||| |  | ||||||||| | | | |||||| |||||||||||||||||||    
T  39626985 cgtccctaaatataggaaccttttgcaaaaattacggagattaagaaagtaggttgtagtattaaatttatatataattactattgtttttacaatttta 39627084  T
Q  109 tctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    || || | ||| | || | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  39627085 tccttaagagaaatagttaatttatgttttcaacataatacttattg 39627131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 47420730 - 47420668
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatt 129  Q
    ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  47420730 gtattaaatttgtttatacttactattgtttttataattttatcttttagaagagaaatgatt 47420668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 51467280 - 51467378
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| || | |||||| | | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  51467280 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatccttaagagagagggttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 51467378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 27531007 - 27530946
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 97  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  27531007 aaaatcacgggaattaagaaagtagataattgtattaaagttatttgtaattactattgttt 27530946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 32908332 - 32908377
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  32908332 taattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaagggac 32908377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Original strand, 1867262 - 1867350
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||| ||| | ||| || ||||| ||||||||||||||| || | | | |||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1867262 gtattaaatttgtatataagtactattggttttacaattttatccttaagaaatagagttaatttatgttttcaacataatatttattg 1867350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10332415 - 10332367
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaa 116  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  10332415 tattaaatttatttgtaattattattatttttacaattttatcctttaa 10332367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 123
Target Start/End: Original strand, 10758451 - 10758479
Alignment:
Q  95 tttttacaattttatcttttaagagagag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10758451 tttttacaattttatcttttaagagagag 10758479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 13274617 - 13274569
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaatta 51  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  13274617 tacctccgtccttaattataggatccttttggaaaaataacggaaatta 13274569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 6351 - 6601
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6351 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 6450  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  6451 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaa 6550  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6551 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 6601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 158)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23487360 - 23487110
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23487360 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23487261  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||      
T  23487260 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaa 23487161  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23487160 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 23487110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 9035280 - 9035525
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9035280 tactccctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 9035379  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  9035380 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 9035479  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9035480 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 9035525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 18111716 - 18111966
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18111716 tactacctctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 18111815  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  18111816 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaa 18111915  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18111916 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 18111966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 23687905 - 23688155
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23687905 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 23688004  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  23688005 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 23688104  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23688105 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 23688155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 32522584 - 32522834
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32522584 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 32522683  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  32522684 acaattttatcctttaagagagagttggcttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 32522783  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32522784 agaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 32522834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 33865283 - 33865532
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33865283 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 33865382  T
Q  101 caattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnn 199  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||       
T  33865383 cagttttatcctttaagagatagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaa 33865482  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33865483 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggac 33865532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26016865 - 26016615
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26016865 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 26016766  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||      
T  26016765 acaattttatcctttaagagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 26016666  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26016665 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagcggtcttataaaaagggac 26016615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 5783886 - 5784139
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5783886 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5783985  T
Q  100 acaattttat-ctttta--agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatg 195  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| ||||||||||||    
T  5783986 acaattttatccttttaagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatg 5784085  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  5784086 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggac 5784139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33980759 - 33980510
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33980759 tactacctccgtccttgattatagggtccttttgaaaaaa-aacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattagtattgttttt 33980661  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||||||| |||||||||||||      
T  33980660 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgtaa 33980561  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  33980560 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 33980510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 2944013 - 2944263
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2944013 tactccctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 2944112  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       | |||||| |||| ||||||| ||||      
T  2944113 acaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatatataataaataggggcatgcatgtaa 2944212  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2944213 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 2944263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5162602 - 5162350
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5162602 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5162503  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  5162502 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 5162403  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  5162402 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 5162350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39406857 - 39406605
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39406857 tactacctccgtccctaattatagaacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 39406758  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||       |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  39406757 acaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 39406658  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39406657 aaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 39406605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 32474972 - 32475218
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaa-aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32474972 tactccctccgtccctaattctaggacctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 32475071  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtnnn 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||||||   | ||||       
T  32475072 acaattttatcctttaagagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggg---gcatgtaaa 32475168  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  32475169 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 32475218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44888978 - 44888726
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  44888978 tactacctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattattttt 44888879  T
Q  100 acaattttatcttttaagagag--agatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || ||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||       ||| |||| ||||||| ||||||||     
T  44888878 acaattttatcctttaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtgtaataaatagggtcatgtatga 44888779  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44888778 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaagggac 44888726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8566498 - 8566199
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8566498 tactacatccgtccctaattataggccattttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgttttta 8566399  T
Q  101 caattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnn 199  Q
    |||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||||||| |       
T  8566398 caattttatcctttatgagagagttggtttatgttttcaacatgtcatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaa 8566299  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacggatatagtacta 299  Q
        |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| || ||         |||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  8566298 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaagggaacaaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattaggaacggaggtagtacta 8566199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31886967 - 31886803
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31886967 tactacctccgtccttaattatagaacccttttaaaaaaataacgggaattaagataataaatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgttttt 31886868  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31886867 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag 31886803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 11482859 - 11483111
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11482859 tactacctccgtccctaattataagacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 11482958  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  11482959 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 11483058  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  11483059 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagtggtcttataaaaagggac 11483111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 257277 - 257524
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  257277 tactacctccgtccctaattatagcacttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttctt 257376  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  257377 acaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgt 257476  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
           ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  257477 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 257524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 658643 - 658396
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  658643 tactacctccgtccctaattatagcacttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttctt 658544  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  658543 acaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgt 658444  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
           ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  658443 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 658396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 844379 - 844132
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  844379 tactacctccgtccctaattatagcacttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttctt 844280  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  844279 acaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgt 844180  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
           ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  844179 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 844132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 44580616 - 44580870
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  44580616 tactacctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 44580715  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag--nnnnnnntgtataattaata-gggcatgtat 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||         |||||||| |||| ||||||||||    
T  44580716 acaattttatcctttaagagagatgaatggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaaaatgtataataaataggggcatgtat 44580815  T
Q  195 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||       |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  44580816 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 44580870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44747345 - 44747098
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44747345 tactacctccgtccttaattataaggtccttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 44747246  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||||||||||||     
T  44747245 acaattttatcttttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggcatgtatgta 44747146  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
          |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  44747145 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 44747098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25058338 - 25058107
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25058338 tactatctctgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25058239  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||       |||||||| ||||| |||||||||||      
T  25058238 acaattttatcctttaagagatagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaa 25058139  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaag 230  Q
         |||||||||||||||||||||||||||    
T  25058138 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaag 25058107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39029473 - 39029224
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39029473 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 39029374  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||      
T  39029373 acaattttatcctttaagagagaattagtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 39029274  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  39029273 agaaat-attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggac 39029224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 8072868 - 8073120
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8072868 tactaccttcgtccttaattataaggcttttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 8072967  T
Q  100 acaattttatctttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||  || |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  8072968 acaattttatcctttaaaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 8073067  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||    
T  8073068 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaacagatcttataaaaagggac 8073120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30140380 - 30140214
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30140380 tactacctccgtccctaattatagggtttttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 30140281  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30140280 acaattttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag 30140214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40785184 - 40784936
Alignment:
Q  5 acctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaa 103  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40785184 acctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaa 40785085  T
Q  104 ttttatctttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnn 200  Q
    ||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||        
T  40785084 ttttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttacttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 40784985  T
Q  201 nnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
       |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  40784984 aaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 40784936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 7683303 - 7683554
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaa-aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7683303 tactacctccgtccataattataggacctttttaaaaaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7683402  T
Q  100 acaattttat-cttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtn 197  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  || |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||        |||||||| ||||||| |||||||||     
T  7683403 acaattttatcctttaaagagagaattggtttatgttttcaacatgttatatatcgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 7683502  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  7683503 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 7683554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24992810 - 24992561
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24992810 tacctccgtccctaattataaggttattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 24992711  T
Q  103 attttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnn 199  Q
    |||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||||| ||||| ||||       
T  24992710 attttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagcatgaatgtaaa 24992611  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  24992610 aaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaacggac 24992561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 7682777 - 7683022
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7682777 tactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7682876  T
Q  100 acaattttat-cttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtn 197  Q
    |||||||||| |||| |||||| |  || |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||     
T  7682877 acaattttatcctttaaagagataattggtttatgttttcaacatgttatttatcgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgta 7682976  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaa 243  Q
          ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||    
T  7682977 aagaaataattaatgtagtcgaaaatagcaaaggggtcttataaaa 7683022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5774347 - 5774094
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5774347 tactacctccgtccctaattacaaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5774248  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataat-taata-gggcatgtatg 195  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       ||||||||  |||| |||||||||||    
T  5774247 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatggaataggggcatgtatg 5774148  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  5774147 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 5774094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 26980722 - 26980967
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26980722 ctccgtccttaattatagtacctttttgaaaaaatatcgggaattaagatagtggatattt-tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 26980820  T
Q  106 ttatcttttaagagaga-ga-tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnn 202  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||       |||||||| |||| ||||||||||||          
T  26980821 ttatcctttaagagagatgattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 26980920  T
Q  203 ntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  26980921 ataattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaagggac 26980967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Original strand, 35143289 - 35143511
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||     
T  35143289 cttttgaaaaaataaccggaattaagatagtatatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttgtcctttaagagagagttgg 35143388  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |    
T  35143389 tttatgttttcaacatgttttttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataac 35143488  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||    ||||||||||||||||    
T  35143489 aaataagtcttataaaaagggac 35143511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12825244 - 12825078
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12825244 tactacctccgtccctaattatagagcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttttaattactattgttttt 12825145  T
Q  100 acaattttatcttttaagagag--agatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  12825144 acaattttatcctttaagagagatagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaag 12825078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 38780881 - 38781132
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38780881 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 38780980  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    | || |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||    
T  38780981 ataa-tttatcctttaagagagaggattgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 38781079  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  38781080 aaagaaataattattgtggttggaaataggaaaggggtcttataaagagggac 38781132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 45283531 - 45283778
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | | |  |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45283531 tactaccttcgtccttaattatgggctcttttgaaaaa-taacgggaattaagacaatgaatatttatatcaaatatgtttgtaattattattgttttta 45283629  T
Q  101 caattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtn 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||     
T  45283630 caattttatcctttaagagagagaattggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgta 45283729  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  45283730 aaaagataattaatgtagttggaaataacaaagatgtcttataaaaagg 45283778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4778887 - 4778640
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4778887 tactacctccgtccctaattatatgattattttaaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 4778788  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||| |||||||  ||||||||||  | || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  4778787 acagttttatccattaagagagagggttggtttat-ttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataa-taataggggcatatatgt 4778690  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  4778689 aaagaattaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttatagaaagg 4778640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38967441 - 38967189
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38967441 tactacctccgttcctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattattattgttttt 38967342  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  | || | ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||||||  ||||||||    
T  38967341 acaattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgt 38967242  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  38967241 aaagaaataattcatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggac 38967189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 45260520 - 45260355
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45260520 tactacctccgtccctaattatatgactcttttgaaaaa-taacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgttttt 45260422  T
Q  100 acaattttatcttttaagag--agagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||||  | || || |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  45260421 acaattttatcctttaagagataaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaag 45260355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44021304 - 44021055
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  44021304 tactacatccgtccctaattacaaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatacgtttataattactattgttttt 44021205  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       | |||||| |||| ||||||||||||    
T  44021204 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatctataataaataggggcatgtatgt 44021105  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
           |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||    
T  44021104 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagg 44021055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Original strand, 42985283 - 42985421
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--t 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  42985283 cttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagtt 42985382  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  42985383 ggtttatgttttcaatatgttatttattgttaattgaag 42985421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 8948126 - 8948342
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  8948126 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 8948225  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  8948226 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 8948325  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  8948326 gtcttataaaaagggac 8948342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16448492 - 16448744
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16448492 tactaccttcgtccctaattataaggctattttaaaaaaataacttgaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 16448591  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||   ||  |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||        |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  16448592 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 16448691  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  16448692 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 16448744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28965758 - 28965643
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28965758 ctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 28965659  T
Q  106 ttatcttttaagagag 121  Q
    ||||| ||||||||||    
T  28965658 ttatcctttaagagag 28965643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34490787 - 34490563
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gat 125  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |    
T  34490787 cttttgcaaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggtt 34490688  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
      |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  34490687 agtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 34490588  T
Q  225 gcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||  ||||||||||||||||    
T  34490587 acaaaggggtcttataaaaagggac 34490563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 110370 - 110203
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  110370 tactacattcgtccctaattataggacccttttgaaaaaataatgggaattaagatcgtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 110271  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga----tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||    || |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||    
T  110270 acaatcttatcctttaagagagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattggtgattgaa 110203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 8797028 - 8797288
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaa--------atatgtttgtaattagta 91  Q
    |||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||        |||||||| |||||| ||    
T  8797028 tactacctccgttcctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttatatgtttataattacta 8797127  T
Q  92 ttgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggc 188  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  | || ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||       |||||||| ||||  |||    
T  8797128 ttgtttttacaattatatcctttaagagagagggttggtttattttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatcggc 8797227  T
Q  189 atgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  8797228 atgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 8797288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 50870 - 51086
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  50870 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 50969  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  50970 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 51069  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  51070 gtcttataaaaagggac 51086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18455990 - 18455766
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gat 125  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |    
T  18455990 cttttgaaaaaaacacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggtt 18455891  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
      |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| |||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  18455890 agtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 18455791  T
Q  225 gcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||  ||||||||||||||||    
T  18455790 acaaaggggtcttataaaaagggac 18455766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Original strand, 29806038 - 29806214
Alignment:
Q  76 atgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntg 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||    
T  29806038 atgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatg 29806137  T
Q  174 tataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  29806138 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 29806214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 32675532 - 32675748
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||     
T  32675532 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttata 32675631  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  32675632 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 32675731  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  32675732 gtcttataaaaagggac 32675748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41616208 - 41615952
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41616208 tactacctccgtctctaattatagggccattttgaaaatataacatgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattagtattgttttt 41616109  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga-----ga-tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgt 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||     || | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||       |||||||| || | ||||||||    
T  41616108 acaattttatcctttaagagagatgtttgatttatttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgt 41616009  T
Q  193 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||       ||||||||||||||| ||||| |||||   | ||||||||||||||    
T  41616008 atgtaaagatataattaatgtagttgaaaataacaaagaaattttataaaaagggac 41615952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 8251708 - 8251924
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  8251708 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 8251807  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  8251808 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 8251907  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  8251908 gtcttataaaaagggac 8251924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14625797 - 14625702
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14625797 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagaaagag 14625702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 28191950 - 28192166
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  28191950 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttatacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 28192049  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  28192050 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 28192149  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  28192150 gtcttataaaaagggac 28192166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38878983 - 38878767
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  38878983 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 38878884  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||      
T  38878883 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaataacaaagag 38878784  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  38878783 gtcttataaaaagggac 38878767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 4631300 - 4631544
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4631300 tccgtccctaattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 4631399  T
Q  107 tatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnnt 204  Q
    |||| || | |||||||| |  ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||||||| |       |    
T  4631400 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatataaagaaat 4631499  T
Q  205 aattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4631500 aattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 4631544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 35504319 - 35504566
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  35504319 tactccctccgtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 35504418  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  35504419 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 35504518  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
           ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  35504519 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaa 35504566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40741561 - 40741311
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  40741561 tactccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgg-aattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 40741463  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  40741462 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 40741363  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  40741362 aagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 40741311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 42218113 - 42218335
Alignment:
Q  27 tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatg 126  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  42218113 tcttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgtttttacaattttatctttt-agagagagtta 42218211  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
     ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||| |||||||       ||||||||||||||| |||||     
T  42218212 gtttatgtcttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcttgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataa 42218311  T
Q  226 caaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||    
T  42218312 caaagggatcttataaaaaaggac 42218335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 35203089 - 35202970
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacat 143  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  35203089 gggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatccttt-agagagagttggtttatgttttcaacat 35202991  T
Q  144 attatttattgctaattgaag 164  Q
     |||||||||| | |||||||    
T  35202990 gttatttattgttgattgaag 35202970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4076434 - 4076218
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  4076434 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 4076335  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||  | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  4076334 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 4076235  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     | ||||||||||||||    
T  4076234 gtattataaaaagggac 4076218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 18641116 - 18641368
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaa-taacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18641116 tactatctccgtcactaattataagacctttttaaaaaaataataggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 18641215  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||   ||  ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||||||  ||||||||    
T  18641216 ataattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttaaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggttatgtatgt 18641315  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18641316 aaagaaataattaatttagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaagggac 18641368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29598486 - 29598270
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  29598486 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 29598387  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  29598386 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaat 29598287  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  29598286 gtcttataaaaagggac 29598270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 36176878 - 36177094
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | | |||||||    
T  36176878 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatg 36176977  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| ||||||| |||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  36176978 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatctatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 36177077  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  36177078 gtcttataaaaagggac 36177094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 42598491 - 42598706
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  42598491 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaacgttagtttatg 42598590  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  42598591 ttttcaacatgttatttattgttgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg- 42598689  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||| ||||||||||||    
T  42598690 gtctaataaaaagggac 42598706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 17851249 - 17851343
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17851249 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 17851343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 29321034 - 29321285
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggat-ctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  29321034 tactacctccgtcccttattataggattcttttagaaaaaata-cgggttttaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 29321132  T
Q  99 tacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    |||||||||||| || | |||||||| |  ||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||       ||||| || |||| ||||||||||||    
T  29321133 tacaattttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgt 29321232  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  29321233 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 29321285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13154225 - 13153974
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  13154225 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 13154126  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  13154125 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 13154026  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  13154025 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 13153974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28579894 - 28579685
Alignment:
Q  42 acgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttca 139  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | | |||||||||||||    
T  28579894 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgttt-taatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttca 28579796  T
Q  140 acatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttctta 238  Q
    |||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  28579795 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatctta 28579696  T
Q  239 taaaaagggac 249  Q
    |||||||||||    
T  28579695 taaaaagggac 28579685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29279493 - 29279242
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||    
T  29279493 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaaattttttgtaatcactattgttttt 29279394  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | || ||| |||||| |||||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  29279393 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 29279294  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  29279293 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 29279242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 43653943 - 43654194
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  43653943 tactccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 43654042  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  43654043 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 43654142  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  43654143 aagaaataattaatgtagttggaaataataaagatgtcttataaaaagggac 43654194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5951318 - 5951164
Alignment:
Q  96 ttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtat 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||    
T  5951318 ttttacaattttatcctttaagaggtagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtat 5951219  T
Q  195 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||       ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5951218 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 5951164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41014766 - 41014553
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||     
T  41014766 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttata 41014667  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||  | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  41014666 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 41014567  T
Q  233 ttcttataaaaagg 246  Q
     |||||||||||||    
T  41014566 gtcttataaaaagg 41014553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 8951203 - 8951419
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  8951203 aaaatcacgagaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttccaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 8951302  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  8951303 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaga 8951402  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  8951403 gtcttataaaaagggac 8951419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14699714 - 14699498
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  14699714 aaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcgtttaagaaagaatgttagtttatg 14699615  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||| ||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  14699614 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 14699515  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  14699514 gtcttataaaaagggac 14699498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 16125491 - 16125683
Alignment:
Q  42 acgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttca 139  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||    
T  16125491 acgggaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttca 16125590  T
Q  140 acatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagg 231  Q
    |||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16125591 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 16125683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 16117232 - 16117423
Alignment:
Q  42 acgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttca 139  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||    
T  16117232 acgggaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttca 16117331  T
Q  140 acatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaag 230  Q
    |||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16117332 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 16117423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18754436 - 18754190
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18754436 tccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 18754337  T
Q  107 tatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnn 203  Q
    |||| ||||| | |||  | |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||           
T  18754336 tatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 18754237  T
Q  204 taattaatgtag-ttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  18754236 taattaatgtagtttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 18754190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 28864247 - 28864498
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || | |||||  ||||| |  |||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  28864247 tactccctccatccctaattataagacccttttgttaaaatcagaggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 28864346  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  28864347 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 28864446  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  28864447 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 28864498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Original strand, 33745680 - 33745887
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga-tttatgttttcaaca 142  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| | || | | |||||||||||||||    
T  33745680 gggaaataagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttgagaaaaaggttagtttatgttttcaaca 33745779  T
Q  143 tattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataa 241  Q
    | |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  33745780 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataa 33745879  T
Q  242 aaagggac 249  Q
    ||||||||    
T  33745880 aaagggac 33745887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1774604 - 1774388
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  1774604 aaaatcacgggaattaagatagtggatatatgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 1774505  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       | ||||||||||||||||||| |||| |     
T  1774504 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaatcattaatgtagttggaaataacaaatga 1774405  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||| ||||    
T  1774404 gtcttataaaaaaggac 1774388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Original strand, 38183341 - 38183537
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  38183341 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 38183440  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38183441 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaa 38183537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11798902 - 11798651
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| | ||||||||| | |   |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  11798902 tactccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcatgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 11798803  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  11798802 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 11798703  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  11798702 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 11798651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16999259 - 16999045
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||     
T  16999259 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatc 16999160  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||| |||||||||||| |||| |     
T  16999159 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaataacaaaagg 16999060  T
Q  233 ttcttataaaaaggg 247  Q
     ||||||||||||||    
T  16999059 atcttataaaaaggg 16999045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 17856517 - 17856768
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  17856517 tactccctccgtccttaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 17856616  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | ||||| || || ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  17856617 acaattttatccttaagagagatagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 17856716  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||    
T  17856717 aagaaataattaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaagggac 17856768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44502912 - 44502665
Alignment:
Q  9 ccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 107  Q
    ||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  44502912 ccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatttt 44502813  T
Q  108 atctttta-----agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnn 201  Q
    ||| || |     |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||         
T  44502812 atccttaagagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaata 44502713  T
Q  202 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  44502712 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 44502665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Original strand, 36661701 - 36661914
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||  | |  ||||||    
T  36661701 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatg 36661800  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| || | |||||||||| |       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  36661801 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatataaagaattaattaatgtagttgaaaataacaaaggg 36661900  T
Q  233 ttcttataaaaagg 246  Q
     |||||||||||||    
T  36661901 gtcttataaaaagg 36661914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 44748257 - 44748450
Alignment:
Q  55 tagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttat 152  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||    
T  44748257 tagtggatatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttat 44748356  T
Q  153 tgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    |||| |||||||       |||||||| ||| ||| |||||||||       |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  44748357 tgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaag 44748450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5952581 - 5952482
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5952581 tactaccttcgtccctaattatatggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgatttt 5952482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34568752 - 34568536
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||  | |  ||||||    
T  34568752 aaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttattttatg 34568653  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaa-tagggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||  |||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  34568652 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaacaagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 34568553  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     |||||||| |||||||    
T  34568552 gtcttataataagggac 34568536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5268230 - 5268016
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||  | |||||||    
T  5268230 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaaacattatt-attttacaaatttatcctttatgagagagaattaatttatg 5268132  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||| |     
T  5268131 ttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaagtagcaaaaga 5268032  T
Q  233 ttcttataaaaaggga 248  Q
     |||||| ||||||||    
T  5268031 gtcttatgaaaaggga 5268016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 35203261 - 35203134
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgat 128  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||        |||||| | ||||    
T  35203261 ttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataatttt--------agagagggttgat 35203170  T
Q  129 ttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  35203169 ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 35203134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 2151980 - 2152231
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  2151980 tactacctccgtccctatatataagactcttttgttaaaatcacgtgaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgttttt 2152079  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||| ||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| ||| |||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  2152080 acagttttatcgttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 2152179  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  2152180 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaataggtcttataaaaagggac 2152231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12255356 - 12255141
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || | | |||||| |  |||||||    
T  12255356 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattatccttaagaaagagagttagtttatgt 12255257  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||       
T  12255256 tttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagg 12255157  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  12255156 tcttataaaaagggac 12255141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12260899 - 12260684
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || | | |||||| |  |||||||    
T  12260899 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattatccttaagaaagagagttagtttatgt 12260800  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||       
T  12260799 tttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagg 12260700  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  12260699 tcttataaaaagggac 12260684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 44250859 - 44251112
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||    
T  44250859 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattattttt 44250958  T
Q  100 acaattttatctttta---agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatg 195  Q
    ||||||||||| || |   |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| ||| |||       |||||||| ||||||| ||||||||    
T  44250959 acaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatg 44251058  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  44251059 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 44251112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 164
Target Start/End: Original strand, 21652257 - 21652387
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||   |  ||||||    
T  21652257 aaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatttttattgtttttaccattttatcctttaaaagagagggttagtttatg 21652356  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21652357 ttttcaacataatatttattgctgattgaag 21652387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 42747472 - 42747359
Alignment:
Q  34 aaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgattta 131  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||  | || ||||    
T  42747472 aaaaaataacgaaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattttttttacaattttattctttaagagagagggttggttta 42747373  T
Q  132 tgttttcaacatat 145  Q
    | ||||||||||||    
T  42747372 tattttcaacatat 42747359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 43292738 - 43292901
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||| ||||  ||||| ||||| | |  |  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  43292738 tactacctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattacggagattaagatagttggttgtaatattaaatttgtatataattactattgttttt 43292837  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  43292838 acaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 43292901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45425330 - 45425081
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| || | |||||  |||||  ||| |||||| | ||| ||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  45425330 tactacctccgtccctatatataagaccattttgttaaaattgcggaaattaagaaagttgatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 45425231  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnn 198  Q
    |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||       |||||||| ||| ||| |||||||||      
T  45425230 acaattttatc-cttaagagagagttaatttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataaggacatgtatgtaa 45425132  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||    
T  45425131 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataaaaagggac 45425081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12802904 - 12802742
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||   ||||| | ||  ||||||| ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  12802904 tactacctccgtccctaaatataggagccttttccaaaattatggagattaaaaaagttggttgtagtattaaatttgtatttaattactattgttttta 12802805  T
Q  101 caattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  12802804 caattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 12802742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11293950 - 11293785
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  11293950 tactacctccgtctctaaatataggagtcttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 11293851  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  11293850 acaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 11293785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13141670 - 13141602
Alignment:
Q  84 aattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13141670 aattactattgtttttacaattttatcttt-aagagagagataatttatgttttcaacataatatttatt 13141602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36941565 - 36941400
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  |||  ||||| | ||| |||  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  36941565 tactacctccgtccctaaatataggagtcttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 36941466  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  36941465 acaattttatccttaagagagagagtagatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 36941400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21137109 - 21136998
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagag--agagatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  21137109 gggaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttccaattttatcatttaagagatagagttaatttatgttttcaac 21137010  T
Q  142 atattatttatt 153  Q
    || |||||||||    
T  21137009 atgttatttatt 21136998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28741108 - 28740988
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaaca 142  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||| | |||||| ||||| | |    
T  28741108 gggaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttacaattattattgtttttacaattttatccttaagagcgagagttaatttatattttctata 28741009  T
Q  143 tattatttattgctaattgaa 163  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  28741008 tattatttattgctcattgaa 28740988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 42885432 - 42885356
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctt 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42885432 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatctt 42885356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 19700749 - 19700868
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | | | || | | ||| || || |||||||||||| || ||||||||    
T  19700749 tactacccccgtccctaattatagggtctttttggaaaataacgggaattaagaaaattgaaagtggtaatatatttgtttgtaattattactgttttta 19700848  T
Q  101 caattttatcttttaagaga 120  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  19700849 caattttatcctttaagaga 19700868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 13568656 - 13568895
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||  ||||| ||| ||||||| | || |||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13568656 tccgtccttaattataagacacttttgttaaaattacgagaattaagaaagcagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 13568755  T
Q  107 tatcttttaagagagaga-tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnnt 204  Q
    ||||  |||||||| ||| |||||||||||||| | ||  ||||||||| | || ||||       |||||||| |||| ||||||||||||            
T  13568756 tatc-cttaagagaaagagtgatttatgttttccatatgctatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag---- 13568850  T
Q  205 aattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  13568851 aattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 13568895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 164
Target Start/End: Original strand, 23894718 - 23894811
Alignment:
Q  70 ttaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  23894718 ttaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 23894811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36786697 - 36786599
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  36786697 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 36786599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17336714 - 17336550
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||  ||||| | | | | |  | ||||||||| ||| |||||||| |||||||||     
T  17336714 tactacgtccgtccctaattataggaacattttgcaaaaattacggagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtatgtaattactattgtttt- 17336616  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  17336615 acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 17336550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 149
Target Start/End: Original strand, 25056707 - 25056791
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatt 149  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  25056707 gtattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagtttgtttatgttttcaacatactatt 25056791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19176987 - 19176836
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || |  ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  19176987 tactacctccgtccttaattatagaagtcttttgcaaaaattacagagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatgtaattaatactgttttt 19176888  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga-tgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  19176887 acaattttatc-cttaagagagagattaatttatgttttcaacataatattta 19176836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23498027 - 23497863
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||  ||| | | ||| | |  | ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||    
T  23498027 tactaccttcgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacggagattgagaaagttggttgtagtattaaatttgtatgcaattattattgttttt 23497928  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaa 163  Q
     |||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  23497927 ccaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 23497863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 249
Target Start/End: Original strand, 36245694 - 36245904
Alignment:
Q  42 acgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaa 140  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||| |||| |  ||||||||||||||||| || || | |||||||| |  ||||||||||| |    
T  36245694 acgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttctaatcacaattgtttttacaattttctccttaagagagagagttagtttatgttttcca 36245793  T
Q  141 catattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt-nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttctta 238  Q
     || |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||    
T  36245794 tatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatggatctta 36245893  T
Q  239 taaaaagggac 249  Q
    |||||||||||    
T  36245894 taaaaagggac 36245904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 34070971 - 34071058
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctt-ttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaatt 87  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34070971 tactacctctgtccctaattatagggccctcttgaaaaaataacggaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaatt 34071058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 164
Target Start/End: Original strand, 31089751 - 31089825
Alignment:
Q  90 tattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||    
T  31089751 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagttagtttatgttttcaacatgctatttattactgattgaag 31089825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2767868 - 2767775
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |  |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  2767868 gatatttgtattaaagatctttgtaatcactattgtttttacaatattattatttaagagataattattttatgttttcaacatgttatttatt 2767775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11114049 - 11113911
Alignment:
Q  30 tttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag----agagagat 125  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||    |||||| |    
T  11114049 tttgacaaaatcacgtgaattaaaaaagttcatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttactattttatcctttaagagatagagagtt 11113950  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    | |||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||    
T  11113949 gttttatgtttttaacatgatatttatcgctgattgaag 11113911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 14548464 - 14548679
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat-cttttaagagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||  |||||| || | |||||||     
T  14548464 aaaatcacgggaattaagaaagtgcatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgtgtttacaattttatccttaaaagagatagtttatttatgg 14548563  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||       |||||||| |||||| |||||||||||       
T  14548564 tttccatatgctatttattgctgattgaagaccaatatgtataataaatagaggcatgtatgtacataaataattaatatagttgaaaatagcaaagaga 14548663  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| ||||    
T  14548664 tcttataaaaaaggac 14548679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5449729 - 5449586
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||| | |  |||||||| ||| | |  | ||||||||| | | | |||||| ||||||||||    
T  5449729 tactacctccgtctctaaatataggaattttttgtaaaaattatgcaaattaaaaaagttggttgtagtattaaatttatatataattattattgttttt 5449630  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacata 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  5449629 acaattttatc-tttaagagagagttaatttatattttcaacata 5449586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 153
Target Start/End: Original strand, 39112543 - 39112655
Alignment:
Q  42 acgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga-tttatgttttcaa 140  Q
    |||||||| || | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||| |||||    
T  39112543 acgggaatgaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcatctaagagagaaattagtttatgtattcaa 39112642  T
Q  141 catattatttatt 153  Q
    |||  ||||||||    
T  39112643 catgctatttatt 39112655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39463215 - 39463117
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  39463215 gtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatc-cttaagaaagagactaggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaag 39463117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 24260702 - 24260817
Alignment:
Q  10 cgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 108  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| | | |  | | | ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  24260702 cgtccctaattatatgattcttttgagaaaataacgggaattaagaaaattaaaaatggtaataaatttgtttgtaattactattgcttttacaattcta 24260801  T
Q  109 tcttttaagagagaga 124  Q
    || ||||| |||||||    
T  24260802 tcctttaaaagagaga 24260817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5593654 - 5593470
Alignment:
Q  62 tatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaatt 160  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || ||||| || |||    
T  5593654 tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgatt 5593555  T
Q  161 gaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
    ||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  5593554 gaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 5593470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30512991 - 30512900
Alignment:
Q  71 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||| || | |||||||    
T  30512991 taaatttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt--agagagagctagtttgtgttttcaacatagtatttaatgttcattgaag 30512900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 42486351 - 42486236
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||   | || |    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42486351 ctccgtccctaattataagactgttttgaaaaagtaacgggaattaaaaa--ttgacaacgataataaatttgtttgtaattactattgtttttacaatt 42486254  T
Q  106 ttat-cttttaagagaga 122  Q
    |||| |||||||||||||    
T  42486253 ttatacttttaagagaga 42486236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16894175 - 16894062
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| | ||||||| | | | || | | ||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16894175 tacctccgtccttaattataaaatccttttgaaaaaataatgagaattaagaaaattgaaaatggtaataaaattgtttgtaattactattgtttttaca 16894076  T
Q  103 attttatcttttaa 116  Q
    |||||||| |||||    
T  16894075 attttatcctttaa 16894062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 31618992 - 31619154
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatct-tttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | | | || | | ||| ||||| ||| | |||||  |||| |||||    
T  31618992 tactacctccgtccttaattataggatccatttgaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaaatggtaataaatttgtctataattgctatttttttt 31619091  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||| ||| |||  ||||||| |  | || ||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  31619092 acaatttaatcattt--gagagagttagtgtacgttttcaacatattatttaatgttgattgaag 31619154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35179830 - 35179743
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  35179830 gtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatc-cttaagaaagagaattaatttatgttttcaacataatatttatt 35179743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 40856058 - 40855981
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttt 113  Q
    ||||| |||| |||||| | |||  |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40856058 aaaatcacggtaattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaattattattgtttttacaattttatcttt 40855981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5110111 - 5110025
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttat 152  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||    
T  5110111 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatc-cttaagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttat 5110025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 164
Target Start/End: Original strand, 29738159 - 29738262
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaat 159  Q
    |||||||||||||||  || | ||||| | |||| ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||| ||| ||    
T  29738159 gatatttgtattaaagttgatggtaatcactattatttttacaattttgt-tcttaagagagagttgatttatgttttccatatgttatttatcgctgat 29738257  T
Q  160 tgaag 164  Q
    |||||    
T  29738258 tgaag 29738262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 137
Target Start/End: Original strand, 44056870 - 44056945
Alignment:
Q  61 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgtttt 137  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||    
T  44056870 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatc-cttaagagagagttagtttatgtttt 44056945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Original strand, 44165276 - 44165364
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  44165276 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattg 44165364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 5244366 - 5244532
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgt-aattagtattgtttt 98  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | | ||||| |||||||||    
T  5244366 tactacttccgtccctaaatataggagtcttttacaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataaattactattgtttt 5244465  T
Q  99 tacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    || ||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||    
T  5244466 tagaattttatccttaagagagagagttcatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaag 5244532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23995806 - 23995708
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  23995806 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttacaattttatccttgagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 23995708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 41388545 - 41388630
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagag--agagatgatttatgttttcaacat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || | |||| |||||||||||||||| ||||||||  | || | |||||||||||||||||    
T  41388545 gatatttgtattaaaattgtttgtgatgactattatttttacaattttatcctttaagagatatagctaatttatgttttcaacat 41388630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 7758855 - 7758900
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  7758855 taattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 7758900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 14584077 - 14584122
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  14584077 taattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggac 14584122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23425106 - 23424953
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||  ||||| ||||  ||||| | ||| | |  ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  23425106 tactacctctgtccctaaatataggagcattttgtcaaaattacggagattaagaaagttggttgttgtattaaatttgtatataattactattgttttt 23425007  T
Q  100 acaattttat-cttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttat 152  Q
    |||||||||| |||  |||||| |  | |||||||||||||| ||| |||||||    
T  23425006 acaattttatccttaaaagagataattaatttatgttttcaagataatatttat 23424953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42885145 - 42885100
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  42885145 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 42885100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 164
Target Start/End: Original strand, 44580921 - 44580958
Alignment:
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44580921 atttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag 44580958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 19715581 - 19715692
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttg--aaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||   ||||||||||| ||||||| | | | || | | ||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  19715581 tactaccaccgtctctaattacaggacctttttttaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaagtggtaatatatttgtttgtaattattattgtttt 19715680  T
Q  99 tacaattttatc 110  Q
    ||||||||||||    
T  19715681 tacaattttatc 19715692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 26626007 - 26625935
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  26626007 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattg 26625935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 45145446 - 45145376
Alignment:
Q  95 tttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  45145446 tttttacaattttat-tcttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 45145376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 29073807 - 29073756
Alignment:
Q  113 ttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  29073807 ttaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 29073756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 40530443 - 40530336
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |   |||||||||||||||  |||||||||| |   ||||||||    
T  40530443 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcacggttgttttt 40530344  T
Q  100 acaatttt 107  Q
    ||||||||    
T  40530343 acaatttt 40530336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3382032 - 3381970
Alignment:
Q  102 aattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  3382032 aattatatcctttaagaaagagttgatttatattttcaacataatatttattgttatttgaag 3381970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 118
Target Start/End: Original strand, 7758704 - 7758785
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga 118  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||||||  |||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  7758704 aaaatcacgggaattaagataatggatagttgtattaaagttgtttgtaatcact-ttgtttttacgattttatcctttaaga 7758785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 15021169 - 15021219
Alignment:
Q  72 aaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga 122  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15021169 aaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttaacctttaagagaga 15021219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26990567 - 26990815
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaa-aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||| | ||   ||||||| ||||||  |||||||||| | |||| |||||    
T  26990567 tactccctccgtccctaattataagacctttttactaaaattacgggaattaagaaagcgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactatttttttt 26990666  T
Q  100 ac-aattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
       ||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  26990667 tttaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 26990766  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
           ||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  26990767 aaagaaataattaatgtatttggaaataacaaacgcgtcttataaaaag 26990815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 35179600 - 35179642
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35179600 tactacctccgtccctaattataagactcttttgaaaaaataa 35179642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 41898533 - 41898491
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataa 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  41898533 tactacctccgtccctaattataagatccttttgaaaaaataa 41898491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 120
Target Start/End: Original strand, 25162652 - 25162689
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatcttttaagaga 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25162652 taattattattgtttttacaattttatcatttaagaga 25162689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36409826 - 36409728
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||| || ||  ||||||||| | |||||||    
T  36409826 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttat-tcttaagagagagaattaatttatgtttttaatatgatatttattgttgattgaag 36409728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 162)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 11851927 - 11852177
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11851927 tactacctccgtccttaattatagagttcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattattttt 11852026  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||        ||||||||||||| ||||||| ||||      
T  11852027 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaataggggcatgcatgtaa 11852126  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11852127 ataaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 11852177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38214776 - 38214526
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38214776 tactaccttcgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 38214677  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||        |||||||||||||||| |||||||||      
T  38214676 acaattttatcctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaa 38214577  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  38214576 agaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 38214526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 40680404 - 40680652
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680404 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataatgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 40680503  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||||||||| |||||||||||      
T  40680504 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaa 40680603  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
         |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40680604 agaaataattaatataattggaaatagcaaagg-gtcttataaaaaggga 40680652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 8912615 - 8912865
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8912615 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8912714  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  8912715 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 8912814  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8912815 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 8912865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 12889949 - 12890199
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12889949 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 12890048  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  12890049 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 12890148  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12890149 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 12890199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 22182664 - 22182914
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22182664 tacttcctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 22182763  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  22182764 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 22182863  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  22182864 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 22182914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41004239 - 41003989
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41004239 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgttttt 41004140  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||       ||||||||||||| ||||||  ||||      
T  41004139 ataattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatccatgtaa 41004040  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41004039 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 41003989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 34944158 - 34944403
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34944158 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgttttt 34944257  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| | |||||||       |||||||||||||||| |||||||||      
T  34944258 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttc-----gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaa 34944352  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  34944353 agaaataattaatgtagttggaaacagcaaaatgttcttataaaaagggac 34944403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17665792 - 17665571
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17665792 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 17665693  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||||||||||| |||| ||||       ||||||||||||||| ||||| |    
T  17665692 tatatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataac 17665593  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  17665592 aaaggagtcttataaaaaggga 17665571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 40788829 - 40789079
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40788829 tactacttccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttataattactattgttttt 40788928  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  40788929 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 40789028  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40789029 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 40789079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41834705 - 41834456
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41834705 tactgcctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatactggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattattttt 41834606  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-----gcatgtat 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||       ||||| |||||||||     ||||||||    
T  41834605 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttctacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgattaataggggcatgcatgtat 41834506  T
Q  195 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    ||       ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41834505 gt-aaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaag 41834456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 11385909 - 11386159
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11385909 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 11386008  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||       | |||||||||||||| ||| |||||      
T  11386009 acaattttatcctttaagtgagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaaaatatataattaatagggacatatatgtaa 11386108  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  11386109 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaattagtcttataaaaagggac 11386159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23465431 - 23465181
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23465431 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23465332  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || || || ||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  23465331 acaattttatcctttaagagagaattggttaatattttcaacatgatatttattgatgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaa 23465232  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  23465231 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 23465181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 30779740 - 30779906
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30779740 tactacctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 30779839  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30779840 acaaatttatctttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 30779906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 13336496 - 13336744
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggat-cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13336496 tactacctccgtccctaattatagggttcttttgaaaaaataacgggaattaatatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 13336595  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||        |||||||| |||| |||||| ||| |      
T  13336596 acaattttatcttttaaaagagagttggtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaataaaatgatgtataataaataggggcatatatataa 13336695  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggg 247  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  13336696 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaaaaggg 13336744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20643767 - 20643528
Alignment:
Q  12 tccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20643767 tccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatc 20643668  T
Q  111 ttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaatta 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  20643667 ttttaagagagagatgttttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataatta 20643568  T
Q  210 atgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20643567 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 20643528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Original strand, 32712553 - 32712775
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  32712553 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtagttagtattgattttacaattttatcctttaagagataaatga 32712652  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  32712653 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 32712752  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  32712753 aaaggagtcttataaaaagggac 32712775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 19318794 - 19319046
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19318794 tactacctctgtccctaattatagggtccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19318893  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||       |||||||| ||||||| | |||||||    
T  19318894 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacgtgtatgt 19318993  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19318994 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 19319046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18375490 - 18375238
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18375490 tactacctccgtccctaattatggagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 18375391  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga-ga-tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  18375390 acaattttatcctttaagagagatgagtgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 18375291  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  18375290 aaagaaataattaatatagttgtaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 18375238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2060614 - 2060323
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2060614 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 2060515  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       | |||||| |||| ||| ||||||||    
T  2060514 acaattttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagat-tataataaatatgggaatgtatgt 2060416  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacgga 289  Q
           ||||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  2060415 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtattataaaaagggacaaattttttttctcaaaagggtcttataattagggacgga 2060323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 15227890 - 15228140
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15227890 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 15227989  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||  |||||||  || ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||      
T  15227990 acaattttatccttcgagagagaattggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 15228089  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15228090 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 15228140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2200277 - 2200029
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2200277 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 2200178  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||       |||| | | ||||||| |||||||||    
T  2200177 acaattttatcatttaagagagagtgttggtttctgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtacagtaaatagggtcatgtatgt 2200078  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2200077 aaataaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 2200029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7531889 - 7531650
Alignment:
Q  11 gtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 109  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7531889 gtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 7531790  T
Q  110 cttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaatt 208  Q
    | |||||||||||  || |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||       |||||    
T  7531789 cctttaagagagatttgttttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaatgaaataatt 7531690  T
Q  209 aatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  7531689 aatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaaggga 7531650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1142997 - 1143249
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1142997 tactacctccgtccctaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 1143096  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | || ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  1143097 acaattttatcctttaagaaagatggttggtttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 1143196  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  1143197 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaagggac 1143249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24345715 - 24345463
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24345715 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgttttt 24345616  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  24345615 acaattttatcctttaagaaagagagctgacttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 24345516  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  24345515 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaagggtcttataaaaagggac 24345463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34113823 - 34113577
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34113823 tactccctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaatt----tagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34113728  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||      
T  34113727 acaattttatcctttaagagataattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 34113628  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34113627 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 34113577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40607972 - 40607748
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--t 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  40607972 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggt 40607873  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||       ||||||||||||||| |||||    
T  40607872 ggtttatgttttaaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 40607773  T
Q  225 gcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||  ||||||||||||||||    
T  40607772 acaaaggggtcttataaaaagggac 40607748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 11865026 - 11865275
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11865026 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 11865125  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag-nnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatg 195  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||        |||||||| |||||| |||||||||    
T  11865126 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggagcatgtatg 11865225  T
Q  196 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
    |       |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  11865226 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 11865275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31751370 - 31751115
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31751370 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31751271  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattg---aagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgta 193  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||        |||||||| |||| ||| ||| |    
T  31751270 acaattttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgca 31751171  T
Q  194 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||       ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31751170 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 31751115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19034708 - 19034465
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||    
T  19034708 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacta---ttttt 19034612  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    |||||||| || |||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||| | | |||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  19034611 acaattttgtcctttaagagagagtgttgatttatcttttcaacatgttatttattgttgaatgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 19034512  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaa 243  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  19034511 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 19034465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19353489 - 19353237
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatct-tttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19353489 tactacctccgtccctaattataaggcctctttaaaaaaataaagggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 19353390  T
Q  100 acaattttatcttttaaga--gagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  19353389 acaattttatcctttaagaatgagtgttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 19353290  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  19353289 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 19353237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28840935 - 28840684
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| |||||| || ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28840935 tactacatccgtctcttattataggaccattttaaaaaaataacgggaattaagat-gtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28840837  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||       |||||||| ||||| | |||||||||    
T  28840836 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgt 28840737  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  28840736 aaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 28840684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7933718 - 7933488
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7933718 tactacatccgttcttaattataggacccttttgaaaaaacaacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7933619  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||    
T  7933618 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaacatgtataataaatagaggcatgtatgt 7933519  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagca 227  Q
           ||||||||  ||||||||||||||    
T  7933518 aaaacaataattaatacagttggaaatagca 7933488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25523797 - 25523507
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25523797 tactacctctgttcctaattataggacccttttggaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25523698  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| || ||||||||||      
T  25523697 acaatttaatcctttaagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaattggagcatgtatgtaa 25523598  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggacnnnnnnnnnttctcaaaatggtcttataatcaggaacgga 289  Q
         |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||         |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25523597 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaatgggtcttataaaaagagacaattttttttcttcaaaatggtcttataattaggaacgga 25523507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 44573629 - 44573874
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44573629 tactactttcgtccataattagaggaccttttgaaaaaataacggaaattaagatactgaatatttgta---aatatgtttgtaattagtattgttttta 44573725  T
Q  101 caattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnn 199  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||       
T  44573726 caattttatcctttaagagatggatggtttatgtttt-aacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaa 44573824  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  44573825 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 44573874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Original strand, 26322035 - 26322284
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 102  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26322035 tacctccgtccttaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 26322134  T
Q  103 attttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnnn 199  Q
    |||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||||| ||||||||||       
T  26322135 attttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaa 26322234  T
Q  200 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
        |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  26322235 gaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 26322284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1748381 - 1748633
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  1748381 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagattatggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattattttt 1748480  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       || ||||| ||| |||| ||||||||    
T  1748481 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggtatgtatgt 1748580  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  1748581 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaagggac 1748633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1859817 - 1859594
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--t 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |    
T  1859817 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagaatt 1859718  T
Q  126 gatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||       || ||||| |||| |||||||| ||       ||||||||||||||||||||||    
T  1859717 ggtttatattttcaacatcttatttattgttgattgaagaaaaaaatgaataataaataaggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 1859618  T
Q  226 caaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||| |  ||||||||||||||||    
T  1859617 caaatgagtcttataaaaagggac 1859594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 224
Target Start/End: Original strand, 41967987 - 41968170
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  41967987 gggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaac 41968086  T
Q  142 atattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
    || ||||||||||||||||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  41968087 atgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaata 41968170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24974098 - 24973846
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24974098 tactacatccgtccctaattacaagactcttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 24973999  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    | ||||||||| ||||||  | || | ||  |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  24973998 ataattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 24973899  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  24973898 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 24973846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30466423 - 30466257
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30466423 tactacctccgtccctaattacagtgtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 30466324  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30466323 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 30466257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6007868 - 6007618
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6007868 tactacctccgtctctaattacaagttctttt-aaaaaataacgggaattaagataatatatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 6007770  T
Q  101 caattttatcttttaagagagag--atgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||        |||||||| |||| ||| ||||||||     
T  6007769 caattttatccttcaagagagagaaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgta 6007670  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          |||||||||||||| |||||| ||||  | | ||||||||||||||    
T  6007669 aagaaataattaatgtagttagaaataacaaaaatgttttataaaaagggac 6007618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 38121250 - 38121502
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38121250 tactacctccgtccctaattataaagtccttttaaaaaaataacggaatttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 38121349  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  38121350 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgt 38121449  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  38121450 aaagaaataattaatgtagttggtaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 38121502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 40173142 - 40173308
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40173142 tactacctccgtcccttattatatgatccttttgaaaaaataacgggaattaagatcgtgaatatttatattaaatatgtttataattactattgttttt 40173241  T
Q  100 acaattttatcttttaagag--agagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  40173242 acaattttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 40173308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 45628620 - 45628872
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45628620 tactacctccgtccctaattataaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 45628719  T
Q  100 acaattttatctttt--aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||| | |||  || |||| | ||  |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  45628720 acaattttaccctttaaaaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 45628819  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  45628820 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaagggac 45628872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7418792 - 7418564
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatag-gatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7418792 tactacctcagtccctaattataaagcccttttgaaaaaataacagaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7418693  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  7418692 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataggggcatgtatgt 7418593  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 225  Q
           ||||||||||||||||||||||    
T  7418592 aaagaaataattaatgtagttggaaatag 7418564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 10399201 - 10399453
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  10399201 tactacatccgtccttaattataaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttattttt 10399300  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||| || |||||||       |||||| | |||| ||||||||||||    
T  10399301 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattactcattgaagaaaaagatgtatagtaaataggggcatgtatgt 10399400  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||    
T  10399401 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaacgggac 10399453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5255831 - 5255583
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5255831 tactaccttcgtccctaattataaggcttttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5255732  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  5255731 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 5255632  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
           ||| ||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||    
T  5255631 aaagaaataa-taatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagg 5255583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 20727633 - 20727849
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||    
T  20727633 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatg 20727732  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20727733 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 20727832  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  20727833 gtcttataaaaagggac 20727849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8295606 - 8295461
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8295606 tactacctccgtccctaattataggacgtttttgaaaaaataacgggaattatgatagtggatatttgtatgaaatatgtatgtaattactattgttttt 8295507  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacat 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  8295506 acaattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacat 8295461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 15917820 - 15918070
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  15917820 tactacctctgtccctaattataaggttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatattagtattaaatatgtttgtaattactatt-atttta 15917918  T
Q  101 caattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtn 197  Q
    || ||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||||       |||||||| ||| ||| || ||||||     
T  15917919 cagttttaccctttaagagagagagttgatttacgttttgaacatgttatttattactgattgaagaaaaaaatgtataataaataaggacaagtatgta 15918018  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  15918019 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 15918070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 16636362 - 16636496
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636362 tactacatccgtctttaattatagggtccttttgaaaaattaatgagaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 16636461  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16636462 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgt 16636496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7666546 - 7666324
Alignment:
Q  30 tttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||     
T  7666546 tttgaaaaaataacggaaattaagataatgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagtgaaggttgg 7666447  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 226  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||| ||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  7666446 tatatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 7666347  T
Q  227 aaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |  ||||||||||||||||    
T  7666346 aaatgcgtcttataaaaagggac 7666324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 249
Target Start/End: Original strand, 15435677 - 15435867
Alignment:
Q  61 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15435677 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattatatcatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctaa 15435776  T
Q  159 ttgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  15435777 ttgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt-aaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggac 15435867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25624991 - 25624778
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgtt 135  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |  ||||||||    
T  25624991 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaag-gttagtttatgtt 25624893  T
Q  136 ttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggttt 234  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  25624892 ttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggt 25624793  T
Q  235 cttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||    
T  25624792 cttataaaaagggac 25624778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12620107 - 12619939
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatctttt-gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| || |||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  12620107 tactacctccgtccctaattatatgacatttttgaaaaaataatggtaattaagatagtgactatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttc 12620008  T
Q  100 acaattttatcttttaagaga----gagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| || |||||||||    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12620007 acaattttgtcctttaagagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaag 12619939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 34062440 - 34062656
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  34062440 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 34062539  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  34062540 ttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaataacaaaggg 34062639  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  34062640 atcttataaaaagggac 34062656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 34883623 - 34883839
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  34883623 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 34883722  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34883723 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 34883822  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  34883823 gtcttataaaaagggac 34883839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37229732 - 37229486
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37229732 ctccgtccctatatataagactcttttgtcaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatt 37229633  T
Q  106 ttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnn 202  Q
    ||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       | |||||| |||| ||||||||||||          
T  37229632 ttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgtaaagaa 37229533  T
Q  203 ntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  37229532 ataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 37229486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 15404483 - 15404698
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  15404483 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 15404582  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  15404583 ttttcaacat-ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 15404681  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  15404682 gtcttataaaaagggac 15404698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 156
Target Start/End: Original strand, 3060390 - 3060518
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaag--agagagatg 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||    
T  3060390 ttttgaaaaaataacgg-aattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttg 3060488  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgct 156  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||    
T  3060489 acttatgttttcaacattctatttattgct 3060518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1360088 - 1359837
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  1360088 tactccctccgtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 1359989  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  1359988 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 1359889  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  1359888 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 1359837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 8030758 - 8030992
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagg-atcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||    
T  8030758 tactaactccgtctttaattatagggatcttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattgaatatgtttgtaatttctattattttt 8030857  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||           |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  8030858 acaattttatcgtttaagagagagttggtttatg-----------ttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 8030946  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
         |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  8030947 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtgatcttataaaaa 8030992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16108215 - 16108466
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  16108215 tactccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 16108314  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||| ||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  16108315 acaattttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 16108414  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  16108415 aaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 16108466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16805531 - 16805782
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  16805531 tacttcctccgtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 16805630  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  16805631 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 16805730  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  16805731 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 16805782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 16844813 - 16845064
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  16844813 tacttcctccgtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 16844912  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  16844913 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 16845012  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  16845013 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 16845064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 18374496 - 18374693
Alignment:
Q  54 atagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattattta 151  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||    
T  18374496 atagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt-atcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctattta 18374594  T
Q  152 ttgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18374595 ttgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggagtcttataaaaagggac 18374693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23789266 - 23789015
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  23789266 tactccctccgtccctaattataagactattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 23789167  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  23789166 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 23789067  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  23789066 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 23789015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8782700 - 8782515
Alignment:
Q  64 tttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8782700 tttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattg 8782601  T
Q  162 aagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    |||       |||||||| |||| |  |||||||||       |||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  8782600 aagaaaaagatgtataataaatatgttcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaaatagtcttataaaaagg 8782515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 249
Target Start/End: Original strand, 13197427 - 13197636
Alignment:
Q  43 cgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaa 140  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||    
T  13197427 cgggaattaagatagtggatatttgtattaaacttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaa 13197526  T
Q  141 catattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttat 239  Q
    ||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  13197527 catgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat 13197626  T
Q  240 aaaaagggac 249  Q
    ||||| ||||    
T  13197627 aaaaaaggac 13197636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1943836 - 1943624
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  1943836 aaaatcacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggttagtttatg 1943737  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  1943736 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 1943637  T
Q  233 ttcttataaaaag 245  Q
     ||||||||||||    
T  1943636 gtcttataaaaag 1943624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 8716667 - 8716883
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||     
T  8716667 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttata 8716766  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  8716767 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaaagg 8716866  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  8716867 gtcttataaaaagggac 8716883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32121206 - 32120990
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  32121206 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 32121107  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  32121106 tttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 32121007  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  32121006 gtcttataaaaagggac 32120990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 17408041 - 17408285
Alignment:
Q  8 tccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 106  Q
    |||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17408041 tccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 17408140  T
Q  107 tatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnnt 204  Q
    |||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       |    
T  17408141 tatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatactacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaat 17408240  T
Q  205 aattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  17408241 aattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggac 17408285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5664894 - 5664684
Alignment:
Q  42 acgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttca 139  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | |  |||||||||| |    
T  5664894 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgttttta 5664795  T
Q  140 acatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttctta 238  Q
    |||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  5664794 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtctta 5664695  T
Q  239 taaaaagggac 249  Q
    |||||||||||    
T  5664694 taaaaagggac 5664684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 8841397 - 8841648
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  8841397 tactccctccgtccctaattataagactcttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 8841496  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||       |||||||| |||| |||| |||||||     
T  8841497 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgta 8841596  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  8841597 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 8841648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 39833739 - 39833990
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  39833739 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 39833838  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  39833839 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 39833938  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  39833939 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 39833990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42629626 - 42629418
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgtt 135  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  ||      ||||||||    
T  42629626 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagttag------tttatgtt 42629533  T
Q  136 ttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataat-taatagggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggttt 234  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||       |||||||| ||  |||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  42629532 ttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatatataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggt 42629433  T
Q  235 cttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||    
T  42629432 cttataaaaagggac 42629418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20252472 - 20252260
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  20252472 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 20252373  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  20252372 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggg 20252273  T
Q  233 ttcttataaaaag 245  Q
     ||||||||||||    
T  20252272 gtcttataaaaag 20252260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 36130803 - 36131019
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  36130803 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 36130902  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||       
T  36130903 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaag 36131002  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  36131003 gtcttataaaaagggac 36131019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41450778 - 41450562
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  41450778 aaaatcacaggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 41450679  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| |||||| |||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  41450678 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 41450579  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  41450578 atcttataaaaagggac 41450562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4711980 - 4711773
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||||    
T  4711980 gggaattaagatactggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatc-tttaagaaagaaggttagtttatgttttcaac 4711882  T
Q  142 atattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttata 240  Q
    || |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  4711881 atgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggccttata 4711782  T
Q  241 aaaagggac 249  Q
    |||||||||    
T  4711781 aaaagggac 4711773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8990466 - 8990250
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  8990466 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 8990367  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  8990366 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 8990267  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     | ||||||||||||||    
T  8990266 gttttataaaaagggac 8990250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45474577 - 45474381
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  45474577 aaaatcacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 45474478  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 229  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45474477 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 45474381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11201980 - 11201732
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || | |||||  ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  11201980 tactccctctgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgcgaattaaaaaagcagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 11201881  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | || ||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  11201880 acaattttatccttaagagtgagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 11201781  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
          ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  11201780 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagtgtcttataaaaagg 11201732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2438522 - 2438271
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||    
T  2438522 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgttttt 2438423  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | | |||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  2438422 acaattttatccttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 2438323  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2438322 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 2438271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7492141 - 7491890
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| || |||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  7492141 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacaggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 7492042  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | ||| |||| |  ||||||||||| | || |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  7492041 acaattttatccttaagagaaagagttagtttatgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 7491942  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  7491941 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggac 7491890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22897688 - 22897437
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  22897688 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 22897589  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||| ||||| || | | |||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  22897588 acaatattatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 22897489  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  22897488 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggttttataaaaagggac 22897437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27560503 - 27560252
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || | |||||  ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||    
T  27560503 tactccctccgttcctaattataagaccattttgttaaaatcatgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatgtaatcactattgttttt 27560404  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | | |||||| | |||||||||||  | || ||| |||||| | |||||||       |||||||| |||||| ||||||||||     
T  27560403 acaattttatccttaagaaagagagttaatttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggagcatgtatgta 27560304  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  27560303 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 27560252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5070575 - 5070440
Alignment:
Q  29 ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatg 126  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||  | ||    
T  5070575 ttttaaaaaaataacgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgtttttataattttattctttaagagagatggttg 5070476  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||    
T  5070475 gtttatgttttcaac--attatttattgttgattgaag 5070440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16669888 - 16669672
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  16669888 aaaatcacgggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 16669789  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||  ||| ||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||| |     
T  16669788 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatgggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagg 16669689  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  16669688 gtcttataaaaagggac 16669672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40680989 - 40680773
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  40680989 aaaatcacgggaattaagatggtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 40680890  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||       |||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  40680889 ttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaaggg 40680790  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  40680789 gtcttataaaaagggac 40680773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 26334652 - 26334722
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26334652 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 26334722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8867850 - 8867717
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatga 127  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||       
T  8867850 cttttgacaaaatcacgggaataagaa-agttgatatttctattaaatttgtttgtaattactattatttttacgattttatcctttaagagagaga--g 8867754  T
Q  128 tttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  8867753 tttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaag 8867717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43701246 - 43701021
Alignment:
Q  11 gtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 109  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||            |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43701246 gtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtat------------taattactattgtttttacaattttat 43701159  T
Q  110 cttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaa 206  Q
    | ||||||  |||| | ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| |||||| |||||       |||    
T  43701158 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataa 43701059  T
Q  207 ttaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  43701058 ttaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 43701021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 14493555 - 14493673
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| | | | || | | |||  |||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  14493555 tactacctccgtccctaattatagggtcatttaaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaagtggtaacaaatttgtttgtaattactattgttttca 14493654  T
Q  101 caattttatcttttaagag 119  Q
     ||||||||||||||||||    
T  14493655 taattttatcttttaagag 14493673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 249
Target Start/End: Original strand, 9697941 - 9698132
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaa 158  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |  ||||| ||||  | ||| || |||||||| |    
T  9697941 gatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatatttttcatatactacttattgctga 9698040  T
Q  159 ttgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  9698041 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 9698132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 29239333 - 29239584
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||| | ||  |||||||||  ||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  29239333 tactccctccgtccctaattataagactcttttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgttataaagttgtttgtaatcactattgttttt 29239432  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    | ||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  29239433 agaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgta 29239532  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  29239533 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 29239584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 44436224 - 44436390
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||    
T  44436224 tactacctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgttttt 44436323  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||    
T  44436324 acaaatttatcttttaagaaagagagttagtttatgttttcaagatactatatattgttgattgaag 44436390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 249
Target Start/End: Original strand, 7116099 - 7116290
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaa 158  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |    
T  7116099 gatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctga 7116198  T
Q  159 ttgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    || |||       |||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  7116199 ttcaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggac 7116290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 164
Target Start/End: Original strand, 15353239 - 15353365
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgtt 135  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||||| ||    
T  15353239 aaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcgttta--agagagttaatttatttt 15353336  T
Q  136 ttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  15353337 ttcaacatactatttattgttgattgaag 15353365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 244
Target Start/End: Original strand, 36021033 - 36021235
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |  | |  ||||||||||| ||    
T  36021033 gggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgttttcgac 36021132  T
Q  142 atattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttata 240  Q
    || |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||    
T  36021133 atgttatttattgttgattgaag-aaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataataaaggagtcttata 36021231  T
Q  241 aaaa 244  Q
    ||||    
T  36021232 aaaa 36021235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 1422163 - 1422360
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||    
T  1422163 tactacctccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgttttt 1422262  T
Q  100 acaattttat-cttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgt 196  Q
    |||||||||| |||   |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||||||| ||||    
T  1422263 acaattttatgcttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggcatgcatgt 1422360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Original strand, 16456617 - 16456863
Alignment:
Q  6 cctccgtccctaattataggatcttttgaa-aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 104  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| |  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  16456617 cctccgtccctaattataagacccttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 16456716  T
Q  105 tttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnn 202  Q
    |||||| || | | |||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||          
T  16456717 tttatccttaagacagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 16456816  T
Q  203 ntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||    
T  16456817 ataattaatgtagttggaaatgacaaaagggtcttataaaaagggac 16456863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23083759 - 23083541
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctt--ttaagagagaga----tgatt 129  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||    || ||    
T  23083759 aaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattagagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttaatattccttaagagagagagagttggtt 23083660  T
Q  130 tatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaa 228  Q
    ||||||||| | || |||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||| ||||||||       | |||||||||||| ||||||||||    
T  23083659 tatgttttccatatcttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaaaaattattaatgtagttcgaaatagcaa 23083560  T
Q  229 aggtttcttataaaaaggg 247  Q
    | |  ||||||||||||||    
T  23083559 atgggtcttataaaaaggg 23083541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13598814 - 13598649
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | | | |||| |  || ||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  13598814 tactacctccgtccctaattatagggccctttagaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatctgttggtaattactattggtttt 13598715  T
Q  100 acaattttatcttttaagag--agagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||| | |||||||  |||| | |||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||    
T  13598714 acaattttat-tcttaagagatagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaag 13598649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40544623 - 40544468
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||  ||||| | ||| | |  |  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  40544623 tactacctccgtccctaattataggagtcttttgcaaaaatgatggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtatataattactattgttttt 40544524  T
Q  100 acaattttatcttttaa-gagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    | ||||||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40544523 ataattttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattg 40544468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 164
Target Start/End: Original strand, 7461290 - 7461391
Alignment:
Q  62 tatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattg 161  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  7461290 tatttgtattaaagttgtttgaaatcactatcgtttttacaattttatctttt-agagagagttaatttatgttttcaatatactatttattgttgattg 7461388  T
Q  162 aag 164  Q
    |||    
T  7461389 aag 7461391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28566381 - 28566283
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  28566381 gtattaaatttgtatataattagtattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcagcataatatttattgttgattgaag 28566283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45152002 - 45151794
Alignment:
Q  46 gaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagta----ttgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaac 141  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||    || ||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||| |     
T  45152002 gaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactatagtttttttttacaattttatc-cttaagagagagttagtttatgttttccat 45151904  T
Q  142 atattatttattgctaattgaag-nnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttat 239  Q
    || |||||||||||| |||||||        | |||||| ||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  45151903 atgttatttattgctgattgaagaaaaaagatatataataaataagggcatgtatgtaaaaatataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttat 45151804  T
Q  240 aaaaagggac 249  Q
    ||||||||||    
T  45151803 aaaaagggac 45151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6028639 - 6028474
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||  ||||| | ||| |||  | ||||||||| ||| | ||| || ||||||||||    
T  6028639 tactacctccgtccctaaatataagagtcttttgcaaaaattacggagattaagaaagttgattatagtattaaatttgtatataactactattgttttt 6028540  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    | ||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  6028539 ataattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 6028474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29831002 - 29830909
Alignment:
Q  61 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagag--agagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29831002 atatttgtattaaatttgtttgtaattattat--tttttacaattttatcatttaagagaaagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattg 29830909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3904677 - 3904578
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  3904677 gtattaaatttgtttgcaattactattgtttttataattatatcatttaagagagagagttgatttatatttttaacaaagtatttattgctgattgaag 3904578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Original strand, 11083431 - 11083548
Alignment:
Q  7 ctccgtccctaattataggatcttttgaa-aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 105  Q
    ||||||||||||||||||| || | | || ||||| ||||||||||| | | | || | | ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11083431 ctccgtccctaattatagggtcatcttaacaaaattacgggaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttgtttgtaattgctattgtttttacaatt 11083530  T
Q  106 ttatcttttaagagagag 123  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  11083531 ttatcctttaagagagag 11083548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12360708 - 12360502
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaaca 142  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||| | || |  ||| | ||||| | |    
T  12360708 gggaattaagaaagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagacaaagttagtttctattttccata 12360609  T
Q  143 tattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataa 241  Q
    |||||||||||| | ||| |||       ||||||| ||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  12360608 tattatttattgttgatttaagaaaaagatgtataa-taataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataa 12360510  T
Q  242 aaagggac 249  Q
    ||||||||    
T  12360509 aaagggac 12360502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 140
Target Start/End: Original strand, 16809000 - 16809097
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttt-aagagagagatgatttatgttttcaa 140  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| |||||||    
T  16809000 gggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaagagagagttagtttatattttcaa 16809097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 140
Target Start/End: Original strand, 16848281 - 16848378
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttt-aagagagagatgatttatgttttcaa 140  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| |||||||    
T  16848281 gggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaagagagagttagtttatattttcaa 16848378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30858235 - 30858070
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  |||  ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  30858235 tactacctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 30858136  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  30858135 acaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 30858070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 31633587 - 31633752
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||| | ||| | |  |  |||||||| |||   |||||| ||||||||||    
T  31633587 tactacctccgtccctaaatataggagtcttttgccaaaattacggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtacataattactattgttttt 31633686  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| || || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  31633687 acaattttgtccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 31633752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Original strand, 2788145 - 2788233
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2788145 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattg 2788233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 4408584 - 4408682
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  4408584 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatc-cttaagagagagaattaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 4408682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 12296195 - 12296291
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | | || | |  || ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12296195 cttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttaccctttaagagagaga 12296291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Original strand, 15435587 - 15435655
Alignment:
Q  4 tacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtatt 71  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  15435587 tacctctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtatt 15435655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Original strand, 18970536 - 18970624
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  18970536 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattg 18970624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Original strand, 19630966 - 19631156
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||  ||||||||||||||  | ||| |||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |  |||||||    
T  19630966 aaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 19631065  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
    |||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  19631066 tttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 19631156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Original strand, 19827867 - 19828057
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||  ||||||||||||||  | ||| |||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |  |||||||    
T  19827867 aaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 19827966  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 224  Q
    |||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  19827967 tttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 19828057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21838846 - 21838748
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  21838846 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-tttaagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 21838748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 36556204 - 36556305
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc-ttttaaga----gagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattga 162  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||    
T  36556204 tattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattatatctttttaagagagggagagttgatttatattgtcaacataatatttattgttgattga 36556303  T
Q  163 ag 164  Q
    ||    
T  36556304 ag 36556305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 13215646 - 13215724
Alignment:
Q  87 tagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  13215646 tagtattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 13215724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Original strand, 16807067 - 16807125
Alignment:
Q  66 tgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16807067 tgtaataaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaga 16807125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Original strand, 16846348 - 16846406
Alignment:
Q  66 tgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16846348 tgtaataaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaga 16846406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 30830150 - 30830248
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  30830150 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 30830248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8056226 - 8056089
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt-acaattttatcttttaagagagagatg 126  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| | | | || | | ||| ||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |     
T  8056226 cttttaaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttatttgtaattgttattgtttttcacaattttatcttttaagagagggtta 8056127  T
Q  127 atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
     | ||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  8056126 gtgtatattttcaacataatatttaatgctgattgaag 8056089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15571447 - 15571232
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgt 134  Q
    ||||| |||| |||||| | |||  |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||| | ||||||| || | |||||||| |  |||||||    
T  15571447 aaaatcacggaaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttatagttttatccttaagagagagagttagtttatgt 15571348  T
Q  135 tttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||| | ||  ||||||||||| ||| |||       |||||||| ||||||  ||||||| |       |||||||||||||||||||||||||| |      
T  15571347 tttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggaacatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagga 15571248  T
Q  234 tcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  15571247 tcttataaaaagggac 15571232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11121211 - 11121136
Alignment:
Q  71 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga--gagagatgatttatgttttcaacata 144  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  ||||| || | |||||||||||||||    
T  11121211 taaatttgtttgtaattactactgtttttacaattttatcatttaagagggagagttggtgtatgttttcaacata 11121136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 11944445 - 11944531
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttat 152  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  11944445 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-tttaagagaaagaattaattcatgttttcaacataatatttat 11944531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 12970084 - 12970032
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaa 52  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12970084 tactacctccgtccctaattgtagggtccttttgaaaaaataacgggaattaa 12970032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 121
Target Start/End: Original strand, 18223700 - 18223760
Alignment:
Q  61 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagag 121  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18223700 atatttgtattaaagttgtttgtgatcactattgtttttacaattttatcatttaagagag 18223760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 125
Target Start/End: Original strand, 29830556 - 29830619
Alignment:
Q  61 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagat 125  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29830556 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcattt-agagagagat 29830619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3095530 - 3095431
Alignment:
Q  66 tgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  3095530 tgtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 3095431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 123
Target Start/End: Original strand, 4897421 - 4897516
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | | | || | | ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  4897421 cttttgaaaaaataatgggaattaagaaaattgaaaatagtaataaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtcctttaagagagag 4897516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 123
Target Start/End: Original strand, 4944815 - 4944910
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | | | || | | ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  4944815 cttttgaaaaaataatgggaattaagaaaattgaaaatagtaataaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtcctttaagagagag 4944910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 118
Target Start/End: Original strand, 22302593 - 22302644
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga 118  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22302593 gtattaaatttgtttgtaattattattatttttacaattttatcctttaaga 22302644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30466195 - 30466153
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30466195 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 30466153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 32511298 - 32511188
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| |||  |||| || |||||||  |||||||||| |||||| | |||  | ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  32511298 tactacctccgtctctatatataagactcttttgttaaaataacggaaattaagaaagtgaaaatttgtattaaaattgtttgtaattactgttgttttt 32511199  T
Q  100 acaattttatc 110  Q
    || ||||||||    
T  32511198 acgattttatc 32511188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 34432008 - 34432106
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  34432008 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagggagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 34432106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 43700918 - 43700750
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagga-tcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||   ||||| | | | | |  | ||||||||| |||   | |||| ||||||||||    
T  43700918 tactacctccgtccctaattataggagtcttttgcaaaaaacacgaagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtacatgattactattgttttt 43700819  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatg---atttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  43700818 acaattttatccttaagagagagagaggttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 43700750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 10757924 - 10757969
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  10757924 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 10757969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 24300297 - 24300342
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  24300297 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 24300342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9701300 - 9701202
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||  | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  9701300 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-cttaagagatagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 9701202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12873169 - 12873121
Alignment:
Q  116 agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12873169 agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaag 12873121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 18374429 - 18374481
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattat-aggatcttttgaaaaaataacgggaattaa 52  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18374429 tactacctccgtccctaattataaggcccttttaaaaaaataacgggaattaa 18374481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 41494445 - 41494527
Alignment:
Q  83 taattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  41494445 taattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 41494527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 41422725 - 41422644
Alignment:
Q  84 aattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  41422725 aattactattgtttttacaattttatc-cttaagagagagaatttatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 41422644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7447039 - 7446997
Alignment:
Q  122 agatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7447039 agatggtttatgttttcaacatattatttattgcagattgaag 7446997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 12873235 - 12873177
Alignment:
Q  11 gtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgt 68  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  12873235 gtccctaattataggacccttttgaaaaaataacagaaattaagatagtggatatttgt 12873177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 122
Target Start/End: Original strand, 26273372 - 26273417
Alignment:
Q  77 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga 122  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26273372 tgtttgtaattgctattgttattacaattttatcctttaagagaga 26273417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 44436767 - 44436812
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  44436767 taattaatgtaattggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 44436812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18294220 - 18294150
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagag--agagatgatttatgtttt 137  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||    
T  18294220 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-tcttaagagaaagagttgatttatgtttt 18294150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 140
Target Start/End: Original strand, 18741736 - 18741811
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttt--taagagagagatgatttatgttttcaa 140  Q
    ||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||| |||||||    
T  18741736 gtattaaatttatttctagttattattgtttttacaattttatttttaaaaagagagagttgatttatattttcaa 18741811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 164
Target Start/End: Original strand, 36750719 - 36750789
Alignment:
Q  95 tttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  36750719 tttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 36750789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 44017831 - 44017791
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaa 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  44017831 taattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 44017791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48951 - 48704
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48951 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgttttt 48852  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagg-gcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||       ||||||||||||||| |||| |||||      
T  48851 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgtttgaagaaaaagatgtataattaataggagcatctatgtaa 48752  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagg 246  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  48751 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 48704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45967 - 45717
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45967 tactacctccgttcctaattatagggcccttttcaaaaaacaacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 45868  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  45867 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 45768  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  45767 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaatggac 45717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0907 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0907
Description:

Target: scaffold0907; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 4316 - 4565
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaa-aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4316 tactacctccgtccctaattatagggtctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 4415  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  4416 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 4515  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
         ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4516 agaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 4565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 4404 - 4654
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4404 tactacctccgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattaatattgttttt 4503  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||||||| ||||||||||||      
T  4504 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 4603  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  4604 agaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaatggac 4654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 164510 - 164260
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  164510 tactacctccgtccctaattataggatcgttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 164411  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||      
T  164410 acaattttattctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 164311  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  164310 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggac 164260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 3525 - 3774
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3525 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactactgttttt 3624  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||      
T  3625 acaattttatcctttaagagagaattgatttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 3724  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         | |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3725 agaaat-attaatatagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 3774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18793 - 18542
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18793 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 18694  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||       ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18693 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataa-taataggggcatgtatgt 18595  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  18594 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggac 18542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3735 - 3483
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3735 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 3636  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||        |||||||| |||  ||||||| ||||    
T  3635 acaattttatcctttaagaaagagggttggattatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatcggggcatgcatgt 3536  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3535 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 3483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 285 - 531
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  285 tactacctccgtccctaattatagggccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgttttta 384  T
Q  101 caattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-agggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| |||||||||||||     
T  385 caattttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgt- 483  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
          ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  484 aaagaataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaag 531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 355042 - 355292
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  355042 tactccctccgtctctaattataggaccattttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgttattactattgttttt 355141  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnn 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |       |||||||| |||| ||||| ||||||      
T  355142 acaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaggaaaattatgtataataaataggggcaagtatgtaa 355241  T
Q  199 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
         ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  355242 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 355292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 92416 - 92321
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga--gagagatgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||  || || | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  92416 gatattagtattaaatttatttgtaattcatattctttttacaattttatcctttaagatcgaaagttaattaatgttttcaacataatatttatt 92321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5446 - 5196
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5446 tactacctccgtccctaat-ataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 5348  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||       ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5347 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataa-taataggggcatgtatgt 5249  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  5248 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggac 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 9924 - 10174
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9924 tactacctccgtccctaat-ataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 10022  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||       ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10023 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataa-taataggggcatgtatgt 10121  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  10122 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggac 10174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0883 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0883
Description:

Target: scaffold0883; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1987 - 1766
Alignment:
Q  31 ttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgat 128  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |    
T  1987 ttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggt 1888  T
Q  129 ttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagca 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||       |||||||| |||| ||||||| ||||       |||||||||||| |||||||||||    
T  1887 ttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagca 1788  T
Q  228 aaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  1787 aaggggtcttataaaaagggac 1766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45780 - 45559
Alignment:
Q  31 ttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgat 128  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |    
T  45780 ttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggt 45681  T
Q  129 ttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagca 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||       |||||||| |||| ||||||| ||||       |||||||||||| |||||||||||    
T  45680 ttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagca 45581  T
Q  228 aaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  45580 aaggggtcttataaaaagggac 45559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 19698 - 19951
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19698 tactacatccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagaggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19797  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgt 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||  |||||||||||||||   |||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||    
T  19798 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 19897  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatag-caaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  19898 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaagggatcttataaaaagggac 19951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5049 - 4808
Alignment:
Q  9 ccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  5049 ccgtccctaattataggatccttttaaaaaaataacgagagttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaa-ttt 4951  T
Q  108 atcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnnt 204  Q
    ||| |||||||||||  | || ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||| ||||| ||||||||||||       |    
T  4950 atcctttaagagagagggttggtttttg-tttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataa-taataggggcatgtatgtaaagaaat 4853  T
Q  205 aattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4852 aattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggac 4808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4771 - 4726
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4771 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 4726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 9166 - 9413
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | | |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9166 tactacctctgtccctaattataacacccttttgaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 9265  T
Q  101 caattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    |||||||||| ||||||  |||| | ||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  9266 caattttatcctttaagaaagagggttgacttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 9365  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaag 245  Q
          |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  9366 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaag 9413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 13303 - 13448
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13303 tactacctccgtccctaattatagagccattttgaaaaaataacgtgaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 13402  T
Q  100 acaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttcaacat 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  13403 acaattttatcatttaagagagaaggttggtttatgttttcaacat 13448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Original strand, 8078 - 8134
Alignment:
Q  32 tgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaatta 88  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8078 tgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 223
Target Start/End: Original strand, 8407 - 8545
Alignment:
Q  87 tagtattgtttttacaattttatc-ttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaat-a 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||       |||||||| ||| |    
T  8407 tagtattgtttttacaattttatccttttaagagagagttggtttatgttatcaacatgttacttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataa 8506  T
Q  185 gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaat 223  Q
    ||||||| ||||       ||||||||||||||||||||    
T  8507 gggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 8545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 40606 - 40772
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattatagg--atcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  40606 tactacctccgtccctaattatagggcat-ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactcttatttt 40704  T
Q  99 tacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  40705 tacaattttattctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaag 40772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 31462 - 31678
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||    
T  31462 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatg 31561  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31562 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 31661  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  31662 gtcttataaaaagggac 31678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 94083 - 93917
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattata-ggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  94083 tactacctccatccctaattataaggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgttttt 93984  T
Q  100 acaattttatcttttaag--agagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| | ||||||  |||| | || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  93983 acaattttaacctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaag 93917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Original strand, 103804 - 103913
Alignment:
Q  2 actacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||| | | |||| | ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  103804 actacctccatccctaattataggaccattttgccaaaattacgggaattaaaaaaattgataatagtattaaatttgtttataattgctattgttttta 103903  T
Q  101 caattttatc 110  Q
    ||||||||||    
T  103904 caattttatc 103913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24501 - 24265
Alignment:
Q  5 acctccgtccctaattataggatcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24501 acctccgtccctaattataggatcttttagaaaaataatgggaattaagttaatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 24402  T
Q  105 tttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatag-ggcatgtatgtnnnnnnn 203  Q
    |||||| ||||||     | || |||||||||||||||| |||| |||||   |||||||       |||||||| ||||| |||||||||||           
T  24401 tttatcctttaag-----gttggtttatgttttcaacatgttatatattggcgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgt----aaa 24311  T
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  24310 taaataatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaaaggac 24265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 249
Target Start/End: Original strand, 5067 - 5277
Alignment:
Q  42 acgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatgttttca 139  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||    
T  5067 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttca 5166  T
Q  140 acatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttctta 238  Q
    |||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  5167 acatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtctta 5266  T
Q  239 taaaaagggac 249  Q
    |||||||||||    
T  5267 taaaaagggac 5277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 14124 - 14339
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||    
T  14124 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatg 14223  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||||| | ||||||| ||||||     
T  14224 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgta-taggaaataacaaaggg 14322  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  14323 gtcttataaaaagggac 14339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0649 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0649
Description:

Target: scaffold0649; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 4073 - 4289
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  4073 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 4172  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  4173 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtcaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 4272  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  4273 gtcttataaaaagggac 4289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47937 - 47686
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  47937 tactccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 47838  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||     
T  47837 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 47738  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  47737 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggac 47686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18640 - 18486
Alignment:
Q  13 ccctaattataggatctttt--gaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18640 ccctaattatagg-tctttttggaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatc 18542  T
Q  111 ttttaagaga--gagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
     |||||||||  | | |  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  18541 ctttaagagagggggtttgtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaag 18486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12361 - 12110
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  12361 tactccctccgtccctaattataaaacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 12262  T
Q  100 acaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtn 197  Q
    ||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||       |||||||| ||||||| |||||||||     
T  12261 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgta 12162  T
Q  198 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
          ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  12161 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 12110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 51457 - 51673
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  51457 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaccattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 51556  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||| |||||| |       ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  51557 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 51656  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  51657 atcttataaaaagggac 51673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 258897 - 259113
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  258897 aaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 258996  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||      
T  258997 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagag 259096  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  259097 atcttataaaaagggac 259113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 9529 - 9714
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  9529 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 9628  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||||||    
T  9629 ttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 9714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 6915 - 7131
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  6915 aaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 7014  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  7015 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaatga 7114  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||| ||||    
T  7115 gtcttataaaaatggac 7131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Original strand, 61628 - 61844
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  |||||     
T  61628 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttata 61727  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||| || |||||||||| | ||||||        |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| || |||     
T  61728 ttttcaatatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacataggg 61827  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  61828 gtcttataaaaagggac 61844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8479 - 8264
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  8479 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtntttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 8380  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggt 232  Q
    ||||||| || |||||||||| | |||||||       | |||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  8379 ttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatat-tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaatggg 8281  T
Q  233 ttcttataaaaagggac 249  Q
     ||||||||||||||||    
T  8280 gtcttataaaaagggac 8264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 65378 - 65629
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  65378 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 65477  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgt 196  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||| | ||  || |||||||| ||| |||       |||||||| |||| ||||||||||||    
T  65478 acaattttatc-cttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgt 65576  T
Q  197 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
           ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  65577 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggac 65629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Original strand, 24407 - 24617
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagaga--gatgatttatg 133  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |  ||||||    
T  24407 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 24506  T
Q  134 ttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaatagggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtt 233  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| |||||||   ||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||      
T  24507 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg-gcgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggag 24605  T
Q  234 tcttataaaaag 245  Q
    ||||||||||||    
T  24606 tcttataaaaag 24617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 118083 - 117892
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaa 158  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||| | ||  || |||||||| |    
T  118083 gatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctga 117984  T
Q  159 ttgaagnnnnnnntgtataattaata-gggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||       |||||||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  117983 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 117892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 123
Target Start/End: Original strand, 13101 - 13187
Alignment:
Q  36 aaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagag 123  Q
    ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13101 aaaatcacggaaattaagaaagtaaatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc-tttaagagagag 13187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 249
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1438
Alignment:
Q  116 agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaagnnnnnnntgtataattaataggg-catgtatgtnnnnnnntaattaatgta 214  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||       |||||||| ||| ||| |||||||||       ||||||| |||    
T  1304 agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaacgta 1403  T
Q  215 gttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  1404 gttggaaatagcaaaggagtctcataaaaagggac 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 11402 - 11555
Alignment:
Q  1 tactacctccgtccctaattataggatc-ttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||  ||||| ||||  ||||| | ||| |||  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  11402 tactacctccgtctctaaatataggagcattttgtcaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 11501  T
Q  100 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    ||||||||||   |||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11502 acaattttat-acttaagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattg 11555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17694 - 17596
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttta-agagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  17694 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 17596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 34372 - 34290
Alignment:
Q  28 cttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  34372 cttttgataaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatc 34290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 246685 - 246587
Alignment:
Q  67 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat-cttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgctaattgaag 164  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  246685 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 246587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 110
Target Start/End: Original strand, 156185 - 156251
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  156185 gggaattaaaaaagtagatatttgtactaaagttttttgtaatcactattgtttttacaattttatc 156251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13788 - 13693
Alignment:
Q  60 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaaga--gagagatgatttatgttttcaacatattatttatt 153  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||  || || | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13788 gatattagtattaaatttatttgtaattcatattctttttacaattttatcctttaagaccgaaagttaattaatgttttcaacataatatttatt 13693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Original strand, 1912 - 1998
Alignment:
Q  38 aataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga 124  Q
    ||||||||||||||| | | | || | | ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1912 aataacgggaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttatttgtaattactattgtttttacaattttattctttaagagagaga 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 110
Target Start/End: Original strand, 9067 - 9133
Alignment:
Q  44 gggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  9067 gggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatc 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 9612 - 9656
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaaggga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  9612 taattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaaggga 9656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2116 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2116
Description:

Target: scaffold2116; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 7 - 52
Alignment:
Q  204 taattaatgtagttggaaatagcaaaggtttcttataaaaagggac 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  7 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 52  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 647
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||| |  ||| |||||| || ||| |||||||||    
T  733 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcctatatgagagagttagtttttgtttttaatatagtatttattg 647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7197 - 7111
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattg 154  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||| |  ||| |||||| || ||| |||||||||    
T  7197 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcctatatgagagagttagtttttgtttttaatatagtatttattg 7111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22119 - 22066
Alignment:
Q  68 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagag 121  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22119 tattaaatttgtttgtaattattattatgtttacaattttatcctttaaaagag 22066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 110
Target Start/End: Original strand, 32965 - 33013
Alignment:
Q  62 tatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatc 110  Q
    ||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32965 tatttctattaaagttctttgtaatcagtattgtttttacaattttatc 33013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 15704 times since January 2019
Visitors: 3757