View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1681_low_65 (Length: 232)

Name: NF1681_low_65
Description: NF1681
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1681_low_65
NF1681_low_65
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (3-232)||(1243-1472)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (1-232)||(8650850-8651081)
chr6 (1-232)||(4580368-4580599)
chr6 (1-232)||(25354093-25354323)
chr6 (1-223)||(21190913-21191135)
chr6 (1-232)||(25343506-25343736)
chr6 (1-156)||(32035333-32035488)
chr6 (1-142)||(21782800-21782941)
chr6 (4-232)||(31756265-31756498)
chr6 (1-95)||(8662828-8662922)
chr6 (1-232)||(17581514-17581738)
chr6 (1-133)||(21783356-21783486)
chr6 (1-133)||(21789579-21789709)
chr6 (1-232)||(21197068-21197308)
chr6 (5-232)||(21770609-21770845)
chr6 (1-132)||(18778564-18778695)
chr6 (6-81)||(34603382-34603457)
chr6 (6-81)||(34724659-34724734)
chr6 (1-95)||(6097999-6098089)
chr6 (33-97)||(1106229-1106294)
chr6 (173-232)||(20745438-20745497)
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (1-232)||(11839772-11840003)
chr3 (1-232)||(10244381-10244612)
chr3 (1-232)||(38455597-38455828)
chr3 (1-232)||(8331668-8331899)
chr3 (1-232)||(10760697-10760928)
chr3 (1-232)||(38449110-38449341)
chr3 (1-232)||(10238259-10238490)
chr3 (1-232)||(42191267-42191498)
chr3 (1-232)||(42197209-42197440)
chr3 (1-232)||(17055840-17056071)
chr3 (1-232)||(49151493-49151724)
chr3 (1-232)||(49157560-49157791)
chr3 (1-232)||(30051149-30051380)
chr3 (1-230)||(11846110-11846340)
chr3 (1-232)||(55003459-55003687)
chr3 (3-153)||(17593331-17593481)
chr3 (2-121)||(10766919-10767038)
chr3 (30-232)||(13444939-13445144)
chr3 (118-232)||(10769133-10769247)
chr3 (1-125)||(34300485-34300609)
chr3 (1-211)||(53069101-53069316)
chr3 (1-232)||(48128094-48128318)
chr3 (155-232)||(13837555-13837632)
chr3 (1-101)||(28964881-28964980)
chr3 (1-156)||(46656638-46656796)
chr3 (3-228)||(12108716-12108945)
chr3 (176-232)||(26429639-26429695)
chr3 (174-232)||(34300371-34300429)
chr3 (1-61)||(24643599-24643665)
chr3 (174-216)||(24643773-24643815)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (1-232)||(28421006-28421237)
chr7 (1-232)||(3817358-3817589)
chr7 (1-232)||(20238832-20239063)
chr7 (1-232)||(3811216-3811447)
chr7 (2-232)||(351668-351897)
chr7 (1-232)||(5979221-5979452)
chr7 (1-232)||(339261-339483)
chr7 (72-232)||(15843828-15843988)
chr7 (72-232)||(15860937-15861097)
chr7 (1-160)||(42767342-42767501)
chr7 (1-232)||(43539861-43540097)
chr7 (1-232)||(35148051-35148287)
chr7 (1-232)||(5849411-5849637)
chr7 (1-232)||(22741972-22742207)
chr7 (10-136)||(26383603-26383729)
chr7 (1-146)||(30219293-30219438)
chr7 (1-219)||(12803893-12804112)
chr7 (83-232)||(7608324-7608475)
chr7 (151-232)||(35150736-35150819)
chr7 (5-81)||(18666547-18666622)
chr7 (174-232)||(26380965-26381023)
chr7 (56-136)||(26381056-26381135)
chr7 (174-207)||(24690848-24690881)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-232)||(12686226-12686457)
chr5 (1-232)||(12692328-12692559)
chr5 (1-232)||(28525433-28525664)
chr5 (1-232)||(28531529-28531760)
chr5 (1-232)||(7389595-7389825)
chr5 (1-226)||(41297170-41297389)
chr5 (20-232)||(20500020-20500231)
chr5 (5-232)||(30772163-30772392)
chr5 (1-135)||(32094207-32094340)
chr5 (1-111)||(24054336-24054447)
chr5 (97-232)||(32097165-32097300)
chr5 (1-232)||(30384425-30384664)
chr5 (97-232)||(32094364-32094499)
chr5 (1-132)||(32097008-32097138)
chr5 (5-232)||(19059815-19060049)
chr5 (1-232)||(19066154-19066390)
chr5 (1-89)||(16215221-16215309)
chr5 (141-232)||(14610050-14610141)
chr5 (1-78)||(14610184-14610261)
chr5 (15-82)||(28542269-28542336)
chr5 (64-207)||(8706532-8706672)
chr5 (21-79)||(37896365-37896423)
chr5 (5-94)||(26509871-26509958)
chr5 (5-84)||(26316843-26316922)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (1-232)||(5542207-5542438)
chr8 (1-232)||(32890770-32891001)
chr8 (1-232)||(32896894-32897125)
chr8 (1-232)||(14417822-14418053)
chr8 (1-232)||(42993051-42993281)
chr8 (1-232)||(9935160-9935391)
chr8 (5-230)||(36818855-36819079)
chr8 (15-227)||(10699916-10700127)
chr8 (1-232)||(10705719-10705955)
chr8 (15-232)||(22219778-22220005)
chr8 (1-144)||(7771202-7771344)
chr8 (1-232)||(39735599-39735826)
chr8 (4-232)||(39727370-39727586)
chr8 (1-103)||(14799463-14799564)
chr8 (1-138)||(1882799-1882939)
chr8 (44-210)||(1171249-1171414)
chr8 (174-232)||(42033682-42033740)
chr8 (174-232)||(1883039-1883097)
chr8 (1-45)||(24250171-24250215)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (1-232)||(25387551-25387782)
chr1 (1-232)||(34739867-34740098)
chr1 (1-232)||(25381582-25381813)
chr1 (1-210)||(50306093-50306301)
chr1 (1-232)||(31051426-31051656)
chr1 (1-232)||(31057926-31058156)
chr1 (1-232)||(8092893-8093124)
chr1 (1-232)||(44409882-44410122)
chr1 (1-109)||(1078228-1078336)
chr1 (1-232)||(24926801-24927039)
chr1 (1-231)||(27955042-27955273)
chr1 (5-111)||(12183635-12183740)
chr1 (1-232)||(24963749-24963987)
chr1 (149-232)||(1078126-1078209)
chr1 (2-232)||(38152023-38152242)
chr1 (181-232)||(12183816-12183867)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (1-232)||(13455981-13456212)
chr2 (1-232)||(13461922-13462153)
chr2 (1-232)||(36750296-36750527)
chr2 (1-232)||(28682992-28683223)
chr2 (1-232)||(44716851-44717083)
chr2 (1-232)||(13149733-13149962)
chr2 (1-232)||(31002258-31002489)
chr2 (1-232)||(31008236-31008467)
chr2 (1-232)||(30965209-30965440)
chr2 (1-232)||(35090696-35090930)
chr2 (1-232)||(35084723-35084957)
chr2 (1-232)||(35438756-35438983)
chr2 (1-232)||(11048600-11048829)
chr2 (2-232)||(23343435-23343672)
chr2 (4-136)||(29833188-29833317)
chr2 (176-232)||(19879480-19879536)
chr2 (175-232)||(29034702-29034759)
chr2 (84-232)||(28765462-28765610)
chr2 (174-232)||(29833083-29833142)
chr2 (15-54)||(31651664-31651703)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (1-232)||(6404-6635)
scaffold0208 (1-232)||(12277-12508)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (1-232)||(10739386-10739617)
chr4 (1-232)||(10953155-10953386)
chr4 (1-232)||(24287868-24288099)
chr4 (1-232)||(33458314-33458545)
chr4 (2-232)||(6257253-6257483)
chr4 (1-207)||(10733293-10733499)
chr4 (1-207)||(10947062-10947268)
chr4 (1-232)||(48160841-48161071)
chr4 (1-232)||(48167060-48167290)
chr4 (5-229)||(33461444-33461667)
chr4 (1-232)||(44831659-44831897)
chr4 (106-232)||(10733504-10733630)
chr4 (106-232)||(10947273-10947399)
chr4 (1-232)||(50168476-50168705)
chr4 (1-232)||(49976468-49976699)
chr4 (22-232)||(4632263-4632482)
chr4 (1-133)||(26963388-26963518)
chr4 (7-95)||(3769586-3769673)
chr4 (4-232)||(19686378-19686599)
chr4 (142-232)||(35177678-35177770)
chr4 (5-125)||(50427356-50427483)
chr4 (174-232)||(26957023-26957081)
chr4 (6-74)||(9237402-9237470)
chr4 (1-54)||(26956876-26956929)
chr4 (24-80)||(50155990-50156046)
chr4 (174-221)||(3769462-3769509)
chr4 (173-232)||(33045126-33045185)
chr4 (189-232)||(50427238-50427281)
chr4 (1-71)||(32284694-32284764)
chr4 (2-31)||(4632869-4632898)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-232)||(666-897)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-232)||(172937-173168)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (1-183)||(5465-5647)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (27-232)||(965-1174)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (5-109)||(38434-38536)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (11-92)||(5945-6025)
scaffold0185 (169-232)||(5826-5889)


Alignment Details
Target: scaffold0440 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 1243 - 1472
Alignment:
Q  3 gcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggata 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1243 gcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgatatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggata 1342  T
Q  103 aagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1343 aagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggtttttcctc 1442  T
Q  203 aaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1443 aaccggtacatttatgcctcaagttctctt 1472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 8650850 - 8651081
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8650850 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 8650949  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8650950 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 8651049  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8651050 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 8651081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 4580368 - 4580599
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580368 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 4580467  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4580468 taaagcttttgtaacaaccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacgcaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 4580567  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4580568 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 4580599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25354323 - 25354093
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25354323 tagcggaagcaaacaaagcattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctgga 25354225  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25354224 taaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 25354125  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25354124 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 25354093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21190913 - 21191135
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21190913 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgatatatttgatttatcaaagatattaagaattagggtattagaaatacctgga 21191012  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21191013 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 21191112  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctca 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  21191113 tcaaccggtacctttatgcctca 21191135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25343736 - 25343506
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25343736 tagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatttttgatttatcaag-atattaagaattagagtattaggaatacctaga 25343638  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25343637 taaagcttttgtagcagccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 25343538  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25343537 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 25343506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 32035333 - 32035488
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32035333 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctgga 32035432  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgat 156  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32035433 taaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgat 32035488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 21782800 - 21782941
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21782800 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatagctgga 21782899  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaa 142  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21782900 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaa 21782941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 31756265 - 31756498
Alignment:
Q  4 cggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataa 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  31756265 cggaagcaaataaaacattgaacatgattataatcggatctacgacatgtttgaattatcaaggatattaagaattagggtattatgaatatctggatag 31756364  T
Q  104 agctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacagaca--atagagttagcggcggctgatttggttttt 198  Q
    |||||||| | || |||||||| || |||| |||  || ||||||||   |||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  31756365 agctttcatgacagccctctcaacagcaaccatacacagagagaggaggtgatgatctgaaacacacaatatagggttagcggcggctgatttggttctt 31756464  T
Q  199 cctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31756465 cctcaacaggtacctttatacctcaagttctctt 31756498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 8662828 - 8662922
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatac 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8662828 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatac 8662922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17581738 - 17581514
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17581738 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattattataggatctacgacatgtttgatttacc---------aagaattagggtattaggaatacctgga 17581648  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataacca-aagagaggagatgatctgaaacagaca-atagagttagcggcggctgatttggttttt 198  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||||||| |  || |  ||||||||| ||||||||| || |||   |  ||||| ||| |||||||||||| ||    
T  17581647 taaagctttcatgacagccctctcaacaacaacaacgacaaggagagaggaggtgatctgaagcaaacatcaacggttagtggcagctgatttggttctt 17581548  T
Q  199 cctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17581547 cctcaacttgtacatttatgcctcaagttctctt 17581514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 21783356 - 21783486
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |    
T  21783356 tagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctgaa 21783453  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaac 133  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| |||||||    
T  21783454 taaagcttttatggcacccctctcaacaacaac 21783486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 21789579 - 21789709
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |    
T  21789579 tagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctgaa 21789676  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaac 133  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| |||||||    
T  21789677 taaagcttttatggcacccctctcaacaacaac 21789709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 21197068 - 21197308
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  21197068 tagcggaagcaaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacaacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattatgaatacctgga 21197165  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctct---catcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca--------at--agagttagcggcggctg 187  Q
    |||| |||| | |||| ||||||   || ||||||||||||    ||||||||| |||| || |||| |||        ||  |  ||||||||||||||    
T  21197166 taaatcttttatggcagccctctcaacaacaacaacgataa--ggagagaggaggtgatatggaacaaacatcaacttcatcaacggttagcggcggctg 21197263  T
Q  188 atttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21197264 atttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctctt 21197308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 21770609 - 21770845
Alignment:
Q  5 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaa 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  21770609 ggaagtaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatatctgaataaa 21770706  T
Q  105 gctttcaaggcatccctct---catcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca--------at--agagttagcggcggctgattt 191  Q
    ||||| | |||| ||||||   || ||||||||||||    ||| ||||| |||||||||||| |||        ||  |  |||||| |||||||||||    
T  21770707 gcttttatggcagccctctcaacaacaacaacgataa--ggagataggaggtgatctgaaacaaacatcaacttcatcaacggttagcagcggctgattt 21770804  T
Q  192 ggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21770805 ggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 21770845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18778695 - 18778564
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaatta-gggtattaggaatacctgg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18778695 tagcggaagcaaacaaaacgttgaacataattatgatcggatctacgacgtatttgatttatcaa-tatattaagaattaggggttttaggaatacctgg 18778597  T
Q  100 ataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaa 132  Q
    ||||| |||||| |||| |||||| | ||||||    
T  18778596 ataaaactttcatggcagccctcttaacaacaa 18778564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 81
Target Start/End: Original strand, 34603382 - 34603457
Alignment:
Q  6 gaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattag 81  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  34603382 gaagcaaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgatttatcaaggatattaacaattag 34603457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 81
Target Start/End: Original strand, 34724659 - 34724734
Alignment:
Q  6 gaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattag 81  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  34724659 gaagcaaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgatttatcaaggatattaacaattag 34724734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 6098089 - 6097999
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatac 95  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6098089 tagcggaagtagacaaaacattgaacatgaa---gaacggatctacgacgtgtttgatttatcaag-atgttaagaattagggtattaggaatac 6097999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1106294 - 1106229
Alignment:
Q  33 atgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaatt-agggtattaggaatacct 97  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  1106294 atgatcggatctacaacatgtttgattcatcaagaatattaataattcaaggtattaggaatacct 1106229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20745497 - 20745438
Alignment:
Q  173 agttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||    
T  20745497 agttagcggtgactaatttggtttttcctcaatcggtacttttaagccccaagttctctt 20745438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 11839772 - 11840003
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839772 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 11839871  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11839872 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 11839971  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11839972 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 11840003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10244381 - 10244612
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10244381 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgga 10244480  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10244481 taaagctttcaagacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 10244580  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244581 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 10244612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 38455597 - 38455828
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455597 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 38455696  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38455697 taaagctttcgaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 38455796  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38455797 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 38455828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8331899 - 8331668
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8331899 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgga 8331800  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8331799 taaagctttcaaggcagccctctcgtcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctaaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 8331700  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8331699 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 8331668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10760697 - 10760928
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10760697 tagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 10760796  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10760797 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcc 10760896  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10760897 tcaaccagtacctttatgcctcaagttctctt 10760928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 38449110 - 38449341
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449110 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 38449209  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38449210 taaaactttcgaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 38449309  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38449310 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 38449341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10238259 - 10238490
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10238259 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcagatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgga 10238358  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10238359 taaagctttcaagacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggatatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 10238458  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238459 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 10238490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 42191267 - 42191498
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191267 tagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctgga 42191366  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  42191367 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcc 42191466  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42191467 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 42191498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 42197209 - 42197440
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197209 tagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctgga 42197308  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  42197309 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcc 42197408  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42197409 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 42197440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 17055840 - 17056071
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17055840 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 17055939  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17055940 taaagctttcatagcagccctctaatcaacaacggtaaccaaagataggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 17056039  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17056040 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 17056071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49151724 - 49151493
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49151724 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctgga 49151625  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  49151624 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcc 49151525  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  49151524 tcaaccggtacctttatgcctcacgttctctt 49151493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49157791 - 49157560
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49157791 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctgga 49157692  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  49157691 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcc 49157592  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  49157591 tcaaccggtacctttatgcctcacgttctctt 49157560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 30051149 - 30051380
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051149 tagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattataatcagatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 30051248  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||   || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  30051249 taaagctttcattacagccctctaatcgacaacaataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttgattcttcc 30051348  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30051349 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 30051380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 11846110 - 11846340
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11846110 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagtatattaagaattagggtattaggaatacctgga 11846209  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctga-tttggtttttc 199  Q
    |||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  11846210 taaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgattttggttcttc 11846309  T
Q  200 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctc 230  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  11846310 ctcaaccggaacctttatgccgcaagttctc 11846340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 55003459 - 55003687
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  55003459 tagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaagtatattaagaattagggtattagaaatatctgga 55003558  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  55003559 taaagctttcatagcagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaaaagatgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttgg---ttcc 55003655  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  55003656 tcaatcggtacctttatgcctcaagttctctt 55003687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 17593331 - 17593481
Alignment:
Q  3 gcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggata 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17593331 gcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaagaatattaagaattagggtattaggaatacctggata 17593430  T
Q  103 aagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagat 153  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17593431 aacctttcgaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagat 17593481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 121
Target Start/End: Original strand, 10766919 - 10767038
Alignment:
Q  2 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10766919 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgaccggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggat 10767018  T
Q  102 aaagctttcaaggcatccct 121  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  10767019 aaagctttcaaggcagccct 10767038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13445144 - 13444939
Alignment:
Q  30 attatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| | || | ||||||  ||    
T  13445144 attatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctagataaaacattcatgacagctctctcagtaa 13445045  T
Q  130 caacgataaccaaa---gagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagt 226  Q
    |||| |||| ||||   |||| | ||||||||||| || | || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13445044 caaccataaacaaagaggagatgtgatgatctgaaccacaaaacagggttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaagt 13444945  T
Q  227 tctctt 232  Q
    ||||||    
T  13444944 tctctt 13444939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Original strand, 10769133 - 10769247
Alignment:
Q  118 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10769133 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 10769232  T
Q  218 gcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||||||    
T  10769233 gcctcaagttctctt 10769247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 34300609 - 34300485
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34300609 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatatttgatttataaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaa 34300510  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctca 125  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||    
T  34300509 ttaagctttcatggcaaccctctca 34300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 53069101 - 53069316
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaatta-gggtattaggaatacctgg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  53069101 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctatgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatcaggggtattaagaatacctgg 53069200  T
Q  100 ataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataacca--aagagaggagatgatctgaaacagac--aatagagttagcggcggctgatttggtt 195  Q
    ||||| |||||| || |  | ||| | ||||||| | ||  |  |  ||  | |||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  53069201 ataaaactttcatggtagtcatcttaacaacaacaacaaagatgagaaggtgtgatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcggctgatttggtt 53069300  T
Q  196 tttcctcaaccggtac 211  Q
     |||||||||||||||    
T  53069301 cttcctcaaccggtac 53069316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 48128094 - 48128318
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggta-ttaggaatacctgg 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  48128094 tagcggaaacaaacaaaacattgaacatgattatgatcggttctacgacatgtttgatttattaagaatattaagaattagggtattttggaatacct-g 48128192  T
Q  100 ataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttc 199  Q
    ||||| |||||| ||||   |||||| |||||||| |    ||| | | ||| ||||||| |||| |||| |  |||||| ||||||||||||||| |||    
T  48128193 ataaaactttcatggca--gctctca-caacaacggt----aaaaaaatgaggtgatctggaacaaacaacaatgttagcagcggctgatttggttcttc 48128285  T
Q  200 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  48128286 ctcaactggtacctttatgcctttagttctctt 48128318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13837632 - 13837555
Alignment:
Q  155 atctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13837632 atctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 13837555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 28964980 - 28964881
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||| |  ||||||||||||||||    
T  28964980 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatatcaatagtta-gaaattaggaatacctgga 28964882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 46656796 - 46656638
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||| |||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |    
T  46656796 tagctgaagtaaataaaacattcaatataattatgatcggatctacgatatgtttgatttatcaatgatattgagaatgagggtattagaaatacctgaa 46656697  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgat 156  Q
    | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  46656696 tgaagctttcatgacaaccctctcaacaacaacgatctaaaacaaggagaggagatgat 46656638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 12108716 - 12108945
Alignment:
Q  3 gcggaagcaaa-caaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  12108716 gcggaagcaaatcaaaacattgaatatgattatgatttgatctaagacatgtttgatttatcaaggatattaacaatta-ggtattaagaatacctgaat 12108814  T
Q  102 aaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaataga-gttagcggcggctgatttggtttt 197  Q
     ||||| | | | || || ||| | ||  |||| |   || |  ||||| ||| |||| ||||||| |||| | | |||||||||| ||||||||||| |    
T  12108815 gaagctctaatgacaaccttctgaacatgaacggtctgaaacggagagatgaggtgatatgaaacacacaacataggttagcggcgactgatttggttct 12108914  T
Q  198 tcctcaaccggtacatttatgcctcaagttc 228  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12108915 tctttaaccggtacctttatgcctcaagttc 12108945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 232
Target Start/End: Original strand, 26429639 - 26429695
Alignment:
Q  176 tagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26429639 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 26429695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34300429 - 34300371
Alignment:
Q  174 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34300429 gttagcggcgacttatttggttattcttcaaccggtactttcatgcctcaagttctctt 34300371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 24643599 - 24643665
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatga------ttatgatcggatctacgacatgttttattta 61  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24643599 tagcggaagtaaataaaacattgaacatgattatgattatgatcggatctacgatatgttttattta 24643665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 216
Target Start/End: Original strand, 24643773 - 24643815
Alignment:
Q  174 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacattta 216  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  24643773 gttagcggcggctgatttggttctttctcaaccggtaccttta 24643815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 28421006 - 28421237
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28421006 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgga 28421105  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28421106 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 28421205  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28421206 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 28421237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3817358 - 3817589
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817358 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 3817457  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3817458 taaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 3817557  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3817558 tcaaccagtacctttatgcctcaagttctctt 3817589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20239063 - 20238832
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20239063 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 20238964  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20238963 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 20238864  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20238863 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 20238832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3811216 - 3811447
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811216 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 3811315  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3811316 taaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgataacaaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 3811415  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3811416 tcaaccagtacctttatgcctcaagttctctt 3811447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 351897 - 351668
Alignment:
Q  2 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  351897 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggat 351798  T
Q  102 aaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcct 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  351797 aaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaa-agaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcct 351699  T
Q  202 caaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  351698 caaccggtacctttatgcctcaagttctctt 351668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 5979221 - 5979452
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5979221 tagcgaaagcaaacaaactattgaacatgattatgattggatctacgacatgtttgatttattaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctgga 5979320  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  5979321 taaagcttttgtagcagctctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcc 5979420  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5979421 tcaaccggtacttttatgcctcaagttctctt 5979452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 339483 - 339261
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  339483 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgga 339384  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaac---gataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttt 197  Q
    |||||||            ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  339383 taaagct------------ctctcatcaacaacaatgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattct 339296  T
Q  198 tcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  339295 tcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 339261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15843988 - 15843828
Alignment:
Q  72 taagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaata 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15843988 taagaattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagaggagatgatcggaaacacacaata 15843889  T
Q  172 gagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15843888 gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctctt 15843828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15861097 - 15860937
Alignment:
Q  72 taagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaata 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15861097 taagaattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagaggagatgatcggaaacacacaata 15860998  T
Q  172 gagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15860997 gagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctctt 15860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 42767342 - 42767501
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42767342 tagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatatttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctgga 42767441  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctga 160  Q
    |||||||||    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  42767442 taaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataatcaaagagagaagatgatctga 42767501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43540097 - 43539861
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43540097 tagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattatgaatacctgga 43539998  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacagac--aatagagttagcggcggctgatttggtt 195  Q
    | ||||||| |   ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||  ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  43539997 tgaagctttgataacaatcctctcaacaacaacgataaacaaagagaggaggtgatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggtt 43539898  T
Q  196 tttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
     |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  43539897 cttcctcaaccagtacctttatgcctaaagttctctt 43539861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 35148051 - 35148287
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaatta-gggtattaggaatacctgg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35148051 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacacgtttgatttatcaaggatattaagaattaggggtattaggaatacctgg 35148150  T
Q  100 ataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataacca--aagagaggagatgatctgaaacagac--aatagagttagcggcggctgatttggtt 195  Q
    |||||||||||| || | |||||  | ||||||| | ||  |  |  ||  | |||||||||||||| ||  ||||  || ||| |||||||||||||||    
T  35148151 ataaagctttcatggtagccctcgtaacaacaacaacaaatatgagaaggtgggatgatctgaaacacacaaaatatggtcagcagcggctgatttggtt 35148250  T
Q  196 tttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  35148251 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaaattctctt 35148287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5849637 - 5849411
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5849637 tagcggaagcaaccaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaattaggatattaggaatacctgga 5849538  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaataga-gttagcggcggctgatttggtttttc 199  Q
    | ||||||| | | || | |||||| ||||||||||       ||||    ||||||||||| | |||| | | |||||||||| ||||||||||| |||    
T  5849537 tgaagctttaatgacagctctctcaacaacaacgat------ggagaaactatgatctgaaatacacaacatatgttagcggcgtctgatttggttcttc 5849444  T
Q  200 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5849443 ctcaaccggtacctttatgcctcaagttatctt 5849411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 22741972 - 22742207
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  22741972 tagcggaagcaaactgaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattgaggatta-ggtattaggaatacctgga 22742069  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctc-tcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaga---------caatagagttagcggcggctgatt 190  Q
    | ||||| |   |||| ||||| | |  |||||||||    |||||||||||||||||||||||| |         ||| |  |||||||||||||||||    
T  22742070 tgaagctatggtggcagccctcttgacaaacaacgat----aaagagaggagatgatctgaaacaaatatcaacatcaacacggttagcggcggctgatt 22742165  T
Q  191 tggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22742166 tggtttttcatcaactggtacctttatgcctcaagttctctt 22742207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26383729 - 26383603
Alignment:
Q  10 caaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttt 109  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26383729 caaacaaaatattgaacatgatcatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagcatactaagaattagggtattaggaataccttgatgaagcttt 26383630  T
Q  110 caaggcatccctctcatcaacaacgat 136  Q
     | |||| |||||||| ||||||||||    
T  26383629 gatggcagccctctcaacaacaacgat 26383603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 30219293 - 30219438
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30219293 tagcggaatcaaacaaaacgttgaacatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttattaaagatattaagaattatggtattaggaatatctgga 30219392  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagag 146  Q
    ||||||||||| | || || ||||| || ||||||||| |||||||    
T  30219393 taaagctttcatgacaaccatctcagcatcaacgataaacaaagag 30219438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12804112 - 12803893
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacct--g 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  12804112 tagcggaagcaagcaaaacattgaacatgaacatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattagggtattaagaatacctggg 12804013  T
Q  99 gataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaga---caatagagttagcggcggctgatttggtt 195  Q
    ||| |||||||    ||| |||||||  ||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||| |   ||| |  ||||||| || |||||| ||||    
T  12804012 gatgaagctttggtagcagccctctcgacaacaacgat----aaagagaggaggtgatttgaaacaaacatcaacatggttagcgacgactgattaggtt 12803917  T
Q  196 tttcctcaaccggtacatttatgc 219  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  12803916 cttcctcaaccggtacctttatgc 12803893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7608475 - 7608324
Alignment:
Q  83 gtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagag--ttagcg 180  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||| | | ||  | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |  ||||||    
T  7608475 gtattagaaatatctgaataaagctttgatgacagtcatctcatcaacaatgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacataagcggattagcg 7608376  T
Q  181 gcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||||| |||||||||||||    
T  7608375 gcgactgatttggtacttcctaaatcggtacctttatgactcaagttctctt 7608324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 35150736 - 35150819
Alignment:
Q  151 gatgatctgaaacagacaataga--gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35150736 gatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcggctgatttggttattcttcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 35150819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Original strand, 18666547 - 18666622
Alignment:
Q  5 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattag 81  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  18666547 ggaagcaaacaaaacattgaacttgattatgatcagat-tacgacatgtttgatttagcaatgatattaataattag 18666622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26381023 - 26380965
Alignment:
Q  174 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  26381023 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaactgctacctttatgcctaaagttttctt 26380965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26381135 - 26381056
Alignment:
Q  56 tatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 136  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | | || |||||||| ||||||||||    
T  26381135 tatttatcaagcatgctaagaattagggtattaggagta-ctggatgaagctttgatgacaaccctctcaacaacaacgat 26381056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24690881 - 24690848
Alignment:
Q  174 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccg 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24690881 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccg 24690848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12686226 - 12686457
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12686226 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgga 12686325  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12686326 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 12686425  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12686426 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 12686457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12692328 - 12692559
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12692328 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgga 12692427  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12692428 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 12692527  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12692528 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 12692559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 28525433 - 28525664
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28525433 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctgga 28525532  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||    
T  28525533 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcc 28525632  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28525633 tcaaccggtacctttatgcctcacgttctctt 28525664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 28531529 - 28531760
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28531529 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctgga 28531628  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||    
T  28531629 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcc 28531728  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  28531729 tcaaccagtacctttatgcctcacgttctctt 28531760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 7389595 - 7389825
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389595 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatccacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctgga 7389693  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7389694 taaagcttttgtagccgctctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcc 7389793  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7389794 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 7389825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41297389 - 41297170
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  41297389 tagcagaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatataaagaattagggtattaggaatacctgg- 41297291  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
         ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41297290 -----ctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgataaccaaggagaggaggtgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 41297196  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41297195 tcaaccggtacctttatgcctcaagt 41297170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20500231 - 20500020
Alignment:
Q  20 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatcc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  20500231 attgaacatgattatgatcggatctacgacatacttgatttatcaaggatactaagaattagagtattagaaatacctggataaaacttttatggcagcc 20500132  T
Q  120 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgc 219  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||  ||  ||||||||||| |||| |  |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20500131 ctctcaacatcaacgataaacagagaga-aaggcgatctgaaacaaacaagaaggttagcagcggttgatttggttcttccttaaccggtacatttatgc 20500033  T
Q  220 ctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||||    
T  20500032 ctcaagttctctt 20500020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30772392 - 30772163
Alignment:
Q  5 ggaagcaaacaaaa-cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataa 103  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30772392 ggaagcaaacaaaaacaatgaacatgattatgatcggatcgacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggattacctggataa 30772293  T
Q  104 agctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaa-ag-agaggagatgatctgaaacagaca--atagagttagcggcggctgatttggtttttc 199  Q
    || ||| | |||| |||||   |||||||| |||| ||| || ||  | |||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||| || |||    
T  30772292 agtttttatggcagccctc---tcaacaacaataaacaagagaaggtgtgatgatctgaaacacacaacaaagggttagcggcggctgatttgattcttc 30772196  T
Q  200 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30772195 ctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 30772163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 32094207 - 32094340
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  32094207 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-ggtattaggaatacctgaa 32094305  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 135  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  32094306 taaagctttcatagcagccctctcaacaacaacga 32094340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 24054447 - 24054336
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattaggg-tattaggaatacctgg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24054447 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatttgggatattaggaatacctgg 24054348  T
Q  100 ataaagctttca 111  Q
    ||||||||||||    
T  24054347 ataaagctttca 24054336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Original strand, 32097165 - 32097300
Alignment:
Q  97 tggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggttt 196  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  32097165 tggataaagctttcatagcagccctttaatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttagttc 32097264  T
Q  197 ttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32097265 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 32097300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 30384425 - 30384664
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30384425 tagcggaagcaaacaaaacattgaacacgattatgatcggatcta-gacatgtctgatttatcaaggatattaagaataagggtattaagaatacctgga 30384523  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatg-----atctgaaacagacaatagag-ttagcggcggctgattt 191  Q
    | ||||||||  | || | |||||  || |||||||   || ||| |||||||||||     |||||||||| |||| | || ||||||||| |||||||    
T  30384524 tgaagctttcgtgacaactctctcgccatcaacgatctaaaacaaggagaggagatgatctaatctgaaacacacaacatagcttagcggcgactgattt 30384623  T
Q  192 ggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  30384624 ggttcttcctcaaccggtacctttatacctcgagttctctt 30384664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Original strand, 32094364 - 32094499
Alignment:
Q  97 tggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggttt 196  Q
    ||||||||| |||||  ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  32094364 tggataaaggtttcatagcagccctttaatcaacaacaataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctaatttggttc 32094463  T
Q  197 ttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32094464 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 32094499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 32097008 - 32097138
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  32097008 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-ggtattaggattacctgaa 32097106  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaa 132  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| ||||||    
T  32097107 taaagctttcatagcagtcctctcaacaacaa 32097138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 19059815 - 19060049
Alignment:
Q  5 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctg--gata 102  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||     
T  19059815 ggaagcaaacaaaatattaaacatgaatataaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattagaaatacctggagatg 19059914  T
Q  103 aagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaga---------caatagagttagcggcggctgatttgg 193  Q
    |||||||   |||| |||||||  ||||||||||    |||||||| || |||||||||||| |         ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  19059915 aagctttggtggcagccctctcgacaacaacgat----aaagagagaaggtgatctgaaacaaacatccacatcaacacggttagcggcggctgatttgg 19060010  T
Q  194 tttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19060011 ttcttcctcaactggtacttttatgcctcaagttctctt 19060049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 19066154 - 19066390
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctg-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |      
T  19066154 tagcggaagcaaacaaaacattaagcatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattatggtattaggaataccagga 19066253  T
Q  99 gataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaga-------caatagagttagcggcggctgattt 191  Q
    ||| |||||||   |||| | |||||  ||||||||||    |||||||| |  |||||||||||| |       ||| |  ||||||||| ||||||||    
T  19066254 gatgaagctttggtggcagctctctcgacaacaacgat----aaagagagaaagtgatctgaaacaaacccacatcaacacggttagcggcagctgattt 19066349  T
Q  192 ggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19066350 gattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 19066390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 16215221 - 16215309
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattag 89  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16215221 tagcggaagcaaacaaaacatttaacatgattatgattggatctacgaaatgtttgatttatcaaggatattaaaaattagggtattag 16215309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14610141 - 14610050
Alignment:
Q  141 aaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14610141 aaagagaggagatgatctgaaacaaacaaaagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctaaagttctctt 14610050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14610261 - 14610184
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaat 78  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14610261 tagcggaagcaaataaaccattgaacatgattatgatcggatttacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaat 14610184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 28542336 - 28542269
Alignment:
Q  15 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagg 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28542336 aaaacattgaacatgattatgatcgaaactacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagg 28542269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 207
Target Start/End: Original strand, 8706532 - 8706672
Alignment:
Q  64 aaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | || || ||||| || ||||    || |||||||||||||||||||||||    
T  8706532 aaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaattatgctttcatgacaaccatctcaacagcaac----acgaaagagaggagatgatctgaaac 8706627  T
Q  164 aga-caatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccg 207  Q
    | |   |  | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8706628 aaattgaaggggttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccg 8706672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 79
Target Start/End: Original strand, 37896365 - 37896423
Alignment:
Q  21 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaatt 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  37896365 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgattgatttatcaagaatattaataatt 37896423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26509958 - 26509871
Alignment:
Q  5 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26509958 ggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatataaactacgacatatttgattcatcaa-gatattaagaatta-ggtattaggaata 26509871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 84
Target Start/End: Original strand, 26316843 - 26316922
Alignment:
Q  5 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggt 84  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||| |||||||||    
T  26316843 ggaagcaaaaaaaacattgaacattaatatgattggatctaggacatgtttgatttatctacggtattaataattagggt 26316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 5542207 - 5542438
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5542207 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctaga 5542306  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5542307 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagaggggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 5542406  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5542407 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 5542438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32891001 - 32890770
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32891001 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 32890902  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32890901 taaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 32890802  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32890801 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 32890770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32897125 - 32896894
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32897125 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 32897026  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32897025 taaagctttcaagacaaccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 32896926  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32896925 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 32896894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14418053 - 14417822
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14418053 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 14417954  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14417953 taaagctttcatagcagccctctaatcaacgacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcc 14417854  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14417853 tcaaccggtacgtttatgcctcaagttctctt 14417822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 42993051 - 42993281
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42993051 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaataccttga 42993149  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42993150 taaagcttttgtagccaccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 42993249  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42993250 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 42993281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9935391 - 9935160
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9935391 tagcggaagcaaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 9935292  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9935291 taaatctttcatagcagccctctaatcaacaacgttaaccaaagataggagatgatctgaaacacacaatagatttagcggcggctgatttggttcttcc 9935192  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9935191 tcaatcggtacctttatgcctcaagttctctt 9935160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36819079 - 36818855
Alignment:
Q  5 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36819079 ggaagcaaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctggataaa 36818981  T
Q  105 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaa 204  Q
    |||||    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36818980 gcttttgtagccgccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaa 36818881  T
Q  205 ccggtacatttatgcctcaagttctc 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36818880 ccggtacctttatgcctcaagttctc 36818855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10700127 - 10699916
Alignment:
Q  15 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    |    
T  10700127 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatatctggataaaacttttgtag 10700029  T
Q  115 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatt 214  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10700028 cagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggaaatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctt 10699929  T
Q  215 tatgcctcaagtt 227  Q
    |||||||||||||    
T  10699928 tatgcctcaagtt 10699916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10705955 - 10705719
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgat------cggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaata 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  10705955 tagcgtaagcaaacaaaacattgaacatgattatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggatta 10705857  T
Q  95 cctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggt 194  Q
    |||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10705856 cctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgat 10705757  T
Q  195 ttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    | ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  10705756 tcttcctcaaccggtacctttatggcttaagttctctt 10705719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 22219778 - 22220005
Alignment:
Q  15 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga-taaagctttcaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |    
T  22219778 aaaactttgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggattgaagctttgatg 22219877  T
Q  114 gcatccctct----------catcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctca 203  Q
    ||| ||||||          || |||||||||||| |||||| |  |  |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22219878 gcagccctctcaacaacaaccaacaacaacgataaacaaaga-aaaaattgatctgaaacaaacaataaagttagtggcggctgatttggttcttcctca 22219976  T
Q  204 accggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22219977 accggtacctttatgcctcaagttctctt 22220005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7771344 - 7771202
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7771344 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaagaatacctgga 7771245  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaag 144  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7771244 t-aagcttttgtagcaaccctctcatcaacaacgataaccaaag 7771202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 39735599 - 39735826
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39735599 tagcggaagtaaataaaatattgaacatgattatgattgtatctacgacatgtttgatttatcaaagatattaagaactagggtataaggaatacctgga 39735698  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaa-tagagttagcggcggctgatttggtttttc 199  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||| |||||||| |    |||||||| || |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| || |||    
T  39735699 taaa-atttcatggcaaccctctcaacaacaacggt----aaagagagaaggtgatctgaaacaaacaacaagggttagcggcggctgatttgattcttc 39735793  T
Q  200 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  39735794 cttaactggtacatttatgcctcaagtactctt 39735826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 39727370 - 39727586
Alignment:
Q  4 cggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  39727370 cggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatc---------acatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtataagaaatacctggaaaa 39727460  T
Q  104 agctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca-atagagttagcggcggctgatttggtttttcctc 202  Q
    | |||||  |||| |||||||| |||||||| |    |||||||| || |||||||||||| |||   || ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  39727461 aactttcttggcaaccctctcaacaacaacggt----aaagagagaaggtgatctgaaacaaacagcaagggttagcggctgctgatttggttcttcctc 39727556  T
Q  203 aaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39727557 aaccggtacctttatgcctcaagtactctt 39727586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 14799463 - 14799564
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14799463 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaatacctgga 14799561  T
Q  101 taa 103  Q
    |||    
T  14799562 taa 14799564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 1882799 - 1882939
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctac-gacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctg- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  1882799 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatgaacggatctaatgacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctgg 1882898  T
Q  99 -gataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataa 138  Q
     ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  1882899 agatgaagctttcatggcagccctctcaacaacaacgataa 1882939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1171414 - 1171249
Alignment:
Q  44 tacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaa 143  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||| || ||||  ||| || |    
T  1171414 tacgacatatttgatttatcaag-ataacaagaattagg-tattaggaatacctggttaaagcttttatggcagctctctcaacagcaacagtaaacaga 1171317  T
Q  144 gagaggagatgatctgaaacagacaatagag-ttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggta 210  Q
    |||| ||  |||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1171316 gagatgatgtgatctgaaacaaacaacaacggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 1171249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42033740 - 42033682
Alignment:
Q  174 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42033740 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 42033682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Original strand, 1883039 - 1883097
Alignment:
Q  174 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  1883039 gttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgtctcaagttctctt 1883097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 24250215 - 24250171
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatcta 45  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24250215 tagcggaaacaaacaaaatattgaacattattatgatcggatcta 24250171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 25387551 - 25387782
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387551 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 25387650  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25387651 taaagctttaaaaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 25387750  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25387751 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 25387782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34740098 - 34739867
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34740098 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaa 34739999  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34739998 taaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaaaatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 34739899  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34739898 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 34739867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 25381582 - 25381813
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381582 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgaaatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 25381681  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25381682 taaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 25381781  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25381782 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 25381813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50306301 - 50306093
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50306301 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattataatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattaggctattaggaatacctgga 50306203  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50306202 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 50306103  T
Q  201 tcaaccggta 210  Q
    ||||||||||    
T  50306102 tcaaccggta 50306093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31051656 - 31051426
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31051656 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgattggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaagaatacctgga 31051558  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31051557 taaaacttttgtagcaaccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 31051458  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31051457 ttaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 31051426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31058156 - 31057926
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31058156 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaagaatacttgga 31058058  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31058057 taaaacttttgtagcaaccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctaaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcc 31057958  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31057957 ttaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 31057926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 8092893 - 8093124
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8092893 tagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctatgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatttgggtatgaggaatacctgga 8092992  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaa-tagagttagcggcggctgatttggtttttc 199  Q
    |||||||||    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  8092993 taaagcttttgtagcagtcctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacaaacaactag-gttagcggcggctgatttggttcttc 8093091  T
Q  200 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8093092 ctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 8093124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44410122 - 44409882
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44410122 tagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctgga 44410025  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctct---catcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagaca--------at--agagttagcggcggctg 187  Q
    ||||||||| | |||| ||||||   || ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||| |||        ||  |  ||||||||||||||    
T  44410024 taaagcttttatggcagccctctcaacaacaacaacgataa--ggagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacttcatcaacggttagcggcggctg 44409927  T
Q  188 atttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44409926 atttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctctt 44409882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1078336 - 1078228
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1078336 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaagaatattaagaattagggtattaagaatacctgga 1078237  T
Q  101 taaagcttt 109  Q
    |||||||||    
T  1078236 taaagcttt 1078228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 24926801 - 24927039
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctg-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||      
T  24926801 tagcggaagcaaccaaaacattgaacattaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattaacgtattaggaatacctgaa 24926900  T
Q  99 gataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaga---------caatagagttagcggcggctgat 189  Q
    ||| |||||||   |||| | |||||  ||||||||||    ||||||||||| |||||||||||| |         ||| |  ||||| ||| ||||||    
T  24926901 gatgaagctttggtggcagcactctcgacaacaacgat----aaagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacatcaacacggttagtggcagctgat 24926996  T
Q  190 ttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24926997 ttggttcttcctcaaccggtacctatatgcctcaagttctctt 24927039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27955273 - 27955042
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     |||||||| || || || ||||||||||| |||||||    
T  27955273 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgat-----aaggatataaataa-taaggtattaggaagacctgga 27955180  T
Q  101 taaagctttcaaggca--tccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacagacaataga--gttagcggcggctgatttgg 193  Q
    ||||||||||| |  |  || |||||| ||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||| |||| | |  |||| || || ||||||| |    
T  27955179 taaagctttcatgatagctctctctcaacaacaacgataaagaaagagaggatgtgatgatctgaaacacacaacaaaatgttaacgacgactgatttag 27955080  T
Q  194 tttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctct 231  Q
    || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  27955079 ttattcctcaaccggtacctttatgtcttaagttctct 27955042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 111
Target Start/End: Original strand, 12183635 - 12183740
Alignment:
Q  5 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaa 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  12183635 ggaagcaaacaaaatattgaacataattatgattggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaatttgagtattaggaatacctgaataaa 12183733  T
Q  105 gctttca 111  Q
    |||||||    
T  12183734 gctttca 12183740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 24963749 - 24963987
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctg-- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||      
T  24963749 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatgaacggatctacgccatgtttgatttatcaagaatagtaagaattaaagtattaggaatacctgaa 24963848  T
Q  99 gataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaga---------caatagagttagcggcggctgat 189  Q
    ||| |||||||   || | |||||||  ||||||||||    ||||||||||| |||||||||||| |         ||| |  ||||| ||   |||||    
T  24963849 gatgaagctttggtggtagccctctcgacaacaacgat----aaagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacatcaacacggttagtggaaactgat 24963944  T
Q  190 ttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24963945 ttggttcttcctcaaccagtacatttatgcctcaagtcctctt 24963987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1078209 - 1078126
Alignment:
Q  149 gagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1078209 gagatgatctgaaacacacaatagagttagcggccgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 1078126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 38152023 - 38152242
Alignment:
Q  2 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |      |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38152023 agcggaagcaaacaaaatattgaacatgatca------gatctacgacatgtttgatttatcaaacatattaagaattagggtattaggaatacctgaat 38152116  T
Q  102 aaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaataga-gttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
     || |||| | | ||  ||||||| |||||| |||       ||||    ||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||| |||||||| |||     
T  38152117 gaaactttgatgacaatcctctcaacaacaatgatg------gagaaaccatgatctgaaatacacaacatacgttagcggcagctaatttggttcttct 38152210  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  38152211 tcaaccggtacctttatgcttcaagttttctt 38152242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Original strand, 12183816 - 12183867
Alignment:
Q  181 gcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12183816 gcgactgatttggttatttctcaaccgctacctttatgcctcaagttctctt 12183867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13456212 - 13455981
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13456212 tagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctgga 13456113  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13456112 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcc 13456013  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13456012 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 13455981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13462153 - 13461922
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462153 tagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctgga 13462054  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13462053 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcc 13461954  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13461953 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 13461922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36750527 - 36750296
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750527 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 36750428  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36750427 taaaactttcatagcagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 36750328  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36750327 tcaaccggtatctttatgcctcaagttctctt 36750296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 28682992 - 28683223
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28682992 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctgga 28683091  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  28683092 taaagctttcaagacaaccctctcatcaacaacgataaccaaggagagtggatgatctgaaacacacaatagagttaacagcggctgatttggttcttcc 28683191  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28683192 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 28683223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 44716851 - 44717083
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaac-aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgg 99  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44716851 tagcggaagcaaaagaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgg 44716950  T
Q  100 ataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttc 199  Q
    ||||||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44716951 ataaagcttttgtagcagctctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttc 44717050  T
Q  200 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44717051 ctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 44717083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 13149733 - 13149962
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13149733 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaagaatacctg-a 13149830  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13149831 taaaacttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 13149930  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13149931 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 13149962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31002489 - 31002258
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31002489 tagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaa 31002390  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  31002389 taaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaaaagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcc 31002290  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31002289 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 31002258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31008467 - 31008236
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31008467 tagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaa 31008368  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  31008367 taaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaaaagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcc 31008268  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31008267 tcaaccggtacttttatgcctcaagttctctt 31008236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30965440 - 30965209
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30965440 tagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaattattttaagaattagggtattaggaatacctgta 30965341  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  30965340 taaatcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcc 30965241  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30965240 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 30965209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 35090696 - 35090930
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35090696 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaatacctgga 35090795  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagac--------aatagagttagcggcggctgatttg 192  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| || |||| ||||  | |||||||   |||||||||||| ||        ||||| |||||||||||||||||||    
T  35090796 taaagctttcatggcagccctctcagcatcaacaataa--acagagagg---tgatctgaaacaaacaataaataaatagggttagcggcggctgatttg 35090890  T
Q  193 gtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35090891 gttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 35090930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 35084723 - 35084957
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35084723 tagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaatacctgga 35084822  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagac--------aatagagttagcggcggctgatttg 192  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| || |||| ||||  | |||||||   |||||||||||| ||        ||||| |||||||||||||||||||    
T  35084823 taaagctttcatggcagccctctcagcatcaacaataa--acagagagg---tgatctgaaacaaacaataaataaatagggttagcggcggctgatttg 35084917  T
Q  193 gtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35084918 gttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 35084957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 35438756 - 35438983
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         || || ||| |||||||||||||||||||| |    
T  35438756 tagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatt---------tactaggaaatagggtattaggaatacctgta 35438846  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataacca----aagagaggagatgatctgaaacagaca-atagagttagcggcggctgatttggtt 195  Q
    ||||||||||| |||| || ||||  ||||||| | ||| |     ||||||||| |||||||||||| |||   |  ||||||||||||||||||||||    
T  35438847 taaagctttcatggcagccgtctcgacaacaacaacaacgataaggagagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacggttagcggcggctgatttggtt 35438946  T
Q  196 tttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35438947 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 35438983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 11048600 - 11048829
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  11048600 tagctgaagcaaacaaaacattgaacatgattatgattggatatacgtcatgtttgatgtaccaaggatattaagaattagggcactaggaatacttgga 11048699  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaga---caatagagttagcggcggctgatttggtttt 197  Q
    ||||||||| | | || |||||||  ||||||| ||     ||||||| || |||||||||||| |   ||| | ||||| ||||| || |||||||| |    
T  11048700 taaagcttttatgacagccctctcgacaacaacaat----caagagagaaggtgatctgaaacaaatatcaacacagtta-cggcgactaatttggttct 11048794  T
Q  198 tcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11048795 tcctcaactggtacctttatgcctcaagttctctt 11048829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23343672 - 23343435
Alignment:
Q  2 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctg--g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |    
T  23343672 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatgaacgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagagttggggtattaggaatacatggag 23343573  T
Q  100 ataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacaga---------caatagagttagcggcggctgatt 190  Q
    || || ||||   |||| |||||||  ||||||| ||    ||| ||||||| |||||||||||| |         ||| |  |||||| ||||||||||    
T  23343572 atgaaactttggtggcagccctctcgacaacaacaat----aaatagaggaggtgatctgaaacaaacatcaacatcaacacggttagcagcggctgatt 23343477  T
Q  191 tggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23343476 tggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaagttctctt 23343435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29833317 - 29833188
Alignment:
Q  4 cggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataa 103  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  29833317 cggaaacaaataaaatattgaacataattatgatcggatcgacaacatgtttgatttatcaa-gataacaataatta-ggtattaagaatacctggatga 29833220  T
Q  104 agctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat 136  Q
    || ||| | | || |||||||| ||||||||||    
T  29833219 ag-tttgatgacaaccctctcaacaacaacgat 29833188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19879536 - 19879480
Alignment:
Q  176 tagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19879536 tagcggcggctgatttgattcttcttcaatcggtacctttatgcctcaagttctctt 19879480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29034759 - 29034702
Alignment:
Q  175 ttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  29034759 ttagcggtggctgatttgattcttcctcaactggtacctttatgtctcaagttctctt 29034702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28765610 - 28765462
Alignment:
Q  84 tattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcg 183  Q
    |||||||||||||||||| | | ||| | |||| | || ||| |||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||| |||  |  ||||| || |    
T  28765610 tattaggaatacctggatgatgttttgatggcagctctatcaacaacaatgataaacaaatagtgaagatgatctgaaacaaacaccaaggttagaggag 28765511  T
Q  184 gctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
      |||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||    
T  28765510 attgatttggttcttcctcaataggtaccttgatgcctcaaattctctt 28765462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29833142 - 29833083
Alignment:
Q  174 gttagcggcggctga-tttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  29833142 gttagcggcggctaaatttggttcttcctcaaccgatacatttatccttcaagttctctt 29833083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 31651703 - 31651664
Alignment:
Q  15 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtt 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31651703 aaaacattgaacatgattatgatcggatttatgacatgtt 31651664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6635 - 6404
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6635 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgactgaatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgga 6536  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6535 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 6436  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6435 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 6404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12508 - 12277
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12508 tagcggaagcaaataaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatatctgga 12409  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12408 taaagctttcaaggcagtcctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 12309  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12308 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 12277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10739386 - 10739617
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10739386 tagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 10739485  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10739486 taaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 10739585  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  10739586 tcaaccgatacctttatgcctcaaattctctt 10739617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10953155 - 10953386
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953155 tagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 10953254  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10953255 taaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 10953354  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  10953355 tcaaccgatacctttatgcctcaaattctctt 10953386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24288099 - 24287868
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24288099 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgtatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctgga 24288000  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24287999 taaaactttcatagcagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 24287900  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24287899 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 24287868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 33458314 - 33458545
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33458314 tagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 33458413  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  33458414 taaagctttcttagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttctttc 33458513  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33458514 tcaaccgatacctttatgcctcaagttctctt 33458545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 6257253 - 6257483
Alignment:
Q  2 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6257253 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattaggatattaggaatacctggat 6257352  T
Q  102 aaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcct 201  Q
    |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6257353 aaagctttcgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagtgaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcct 6257452  T
Q  202 caaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6257453 caaccggtacctttatgcctcaagttctctt 6257483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 10733293 - 10733499
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733293 tagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 10733392  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10733393 taaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcc 10733492  T
Q  201 tcaaccg 207  Q
    |||||||    
T  10733493 tcaaccg 10733499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 10947062 - 10947268
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10947062 tagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 10947161  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10947162 taaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcc 10947261  T
Q  201 tcaaccg 207  Q
    |||||||    
T  10947262 tcaaccg 10947268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48161071 - 48160841
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48161071 tagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctgaa 48160973  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  48160972 taaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcc 48160873  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48160872 tcaaccagtacctttatgcctcaagttctctt 48160841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48167290 - 48167060
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48167290 tagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatacctgaa 48167192  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  48167191 taaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcc 48167092  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48167091 tcaaccagtacctttatgcctcaagttctctt 48167060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 33461444 - 33461667
Alignment:
Q  5 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33461444 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatggtcggatttacgacatgtttgatttatcaag-atattaagaattagggtattaggaatatctggataaa 33461542  T
Q  105 gctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaa 204  Q
    |||||    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33461543 gcttttgcagcagccctctcatcaacaacgataatcaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaa 33461642  T
Q  205 ccggtacatttatgcctcaagttct 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  33461643 ccggtacctttatgcctcaagttct 33461667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 44831659 - 44831897
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  44831659 tagcggaagcaaattaatcattgaacatgaatatgatcgaatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaactagggtattaagaatacctaga 44831758  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagag-----gagatgatctgaaacagacaa--tagagttagcggcggctgatttgg 193  Q
    | ||||||| |   || |||||||| |||||||||||| || ||||||     | |||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||| |||    
T  44831759 tgaagctttgataacaaccctctcaacaacaacgataaacagagagagagaaggtgatgatctgaaacacacaaaatagggttagcgacggctgatgtgg 44831858  T
Q  194 tttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44831859 ttcttcctcaaccggtatttttatgcctcaagttctctt 44831897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Original strand, 10733504 - 10733630
Alignment:
Q  106 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaac 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10733504 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaac 10733603  T
Q  206 cggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||    
T  10733604 cgatacctttatgcctcaaattctctt 10733630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Original strand, 10947273 - 10947399
Alignment:
Q  106 ctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaac 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10947273 ctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaac 10947372  T
Q  206 cggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||    
T  10947373 cgatacctttatgcctcaaattctctt 10947399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50168705 - 50168476
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||     
T  50168705 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgaatatacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaatta-ggtataaggaatacctggt 50168607  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaa-tagagttagcggcggctgatttggtttttc 199  Q
    | | ||||||| ||||  || |||| ||||||| | || || ||||||||  |||||||||||| ||||  ||  |||||||||| |||||| ||| |||    
T  50168606 tgaggctttcatggca-gccactcaacaacaacaacaatcagagagaggatgtgatctgaaacaaacaacaaggattagcggcggttgatttagttcttc 50168508  T
Q  200 ctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50168507 ctcaa-cggtacctttatgcctcaagttctctt 50168476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49976699 - 49976468
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||  ||    
T  49976699 tagcgaaagcaaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagga---taataattagagtattaggaatacc-aga 49976604  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagagga---gatgatctgaaacagacaa---tagagttagcggcggctgatttggt 194  Q
    | ||||||| |   ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||| ||||    || |||||||||||||||||||||    
T  49976603 tgaagctttgataacactcctctcaacaacaacgataaacaaagagaggaggtgatgatctcaaacacacaaaataagggttagcggcggctgatttggt 49976504  T
Q  195 ttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  49976503 tcttcctcaa-cggtac-tttatgcctcaagttctctt 49976468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4632482 - 4632263
Alignment:
Q  22 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccct 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  4632482 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtatcagaaatacttggataaagctttcatgacaaccct 4632384  T
Q  122 ctcatcaacaacgataaccaaa---gagaggagatga-------tctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtac 211  Q
     ||| ||||||| |||| ||||   |||| | |||||       ||||||||| | || | ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||     
T  4632383 ttcaacaacaaccataaacaaataggagatgtgatgatctgaattctgaaacacaaaacatagttagcggcttctgatttggttcttcctcaaccggtat 4632284  T
Q  212 atttatgcctcaagttctctt 232  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  4632283 ctttatgcctcaagttctctt 4632263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 26963388 - 26963518
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26963388 tagcggaagcaaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctgga 26963485  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaac 133  Q
    ||||||||| | || | |||||||| |||||||    
T  26963486 taaagcttttatggtagccctctcaacaacaac 26963518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 3769673 - 3769586
Alignment:
Q  7 aagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatac 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3769673 aagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttcattaatcaaggatattaataatta-ggtattaggaatac 3769586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 19686378 - 19686599
Alignment:
Q  4 cggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||    
T  19686378 cggaagcaaacaaaatattgaacgtaattatcatcggatctacaacatgcttgattaatcaagcatattaagaattcgggtattatgaata-ctgaacaa 19686476  T
Q  104 agctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcctca 203  Q
    |||||| | | ||  | | ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||      || | || ||||||||||||  | ||||    
T  19686477 agctttgatgacagacatttcaacagcaatgatcaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaa------tatcagcagctgatttggttcgttctca 19686570  T
Q  204 accggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  19686571 accggtaccattatgcctcaatttctctt 19686599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35177770 - 35177678
Alignment:
Q  142 aagagaggagatgatctgaaacagacaa--tagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35177770 aagagaggtgatgatctgaaacacacaacatagagttagcggcgcctgatttgattatttctcaaccgatacatttatgcctcaagttctctt 35177678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 50427483 - 50427356
Alignment:
Q  5 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttat--------caaggatattaagaattagggtattaggaatacc 96  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||        |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  50427483 ggaagcaatcaaaacattgaa-atgattatgatcggatgtacgacatgtttaatttattgatttatcaagaagattaagaattagggtattaggaatacc 50427385  T
Q  97 tggataaagctttcaaggcatccctctca 125  Q
    |||||| ||| |||| || | ||||||||    
T  50427384 tggatatagcgttcatggaagccctctca 50427356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Original strand, 26957023 - 26957081
Alignment:
Q  174 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26957023 gttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 26957081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 9237470 - 9237402
Alignment:
Q  6 gaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaa 74  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9237470 gaagcaaacagaacattgaatatgattatgctcggatttacgacatgtttgatttatcaagtatattaa 9237402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 26956876 - 26956929
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtt 54  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  26956876 tagcggaagcaaataaaacattgaacataagtatgaacggatctacgacatgtt 26956929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 50156046 - 50155990
Alignment:
Q  24 aacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaatta 80  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  50156046 aacataattaagatcggatatacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaatta 50155990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3769509 - 3769462
Alignment:
Q  174 gttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcct 221  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  3769509 gttagtggcggctgatttggttcttcctcaacccgtatatttatgcct 3769462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33045185 - 33045126
Alignment:
Q  173 agttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  33045185 agttaacggcggctgatttagttctttctcaaccggtacttttatatctcaagttctctt 33045126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50427281 - 50427238
Alignment:
Q  189 tttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50427281 tttggttcttactcaaccggtacatttatgcctcaacttctctt 50427238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 32284764 - 32284694
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatat 71  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  32284764 tagcggaaacaaataaaatattgaacaggaatataatcagatctagaacatgttttatttatcaaagatat 32284694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 4632898 - 4632869
Alignment:
Q  2 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgat 31  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632898 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgat 4632869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 666 - 897
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  666 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 765  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  766 taaagctttcatagcagccctctaatcaacgacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcc 865  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  866 tcaaccggtacgtttatgcctcaagttctctt 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 172937 - 173168
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  172937 tagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaattaggatattaggaatacatgga 173036  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcggctgatttggtttttcc 200  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  173037 taaagctttcaagatagccctcttatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcc 173136  T
Q  201 tcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  173137 tcaaccagtacctttatgcctcaagttctctt 173168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5647 - 5465
Alignment:
Q  1 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5647 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgga 5548  T
Q  101 taaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacagacaatagagttagcggcg 183  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5547 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcg 5465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1174 - 965
Alignment:
Q  27 atgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcat 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||     
T  1174 atgattatgatcggatcaacgacatgtttgacttatcatgcatattaacaattagagtattagaaatatctggataaaactttcatggcagctctctcaa 1075  T
Q  127 caacaacgataaccaaagaga---ggagatgatctgaaacagaca-atagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctc 222  Q
    || |||| ||||   ||||||    | ||||||| |||||| |||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  1074 catcaacaataaaacaagagaaggtgtgatgatcggaaacacacaccaagggttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgttatctttatgcctc 975  T
Q  223 aagttctctt 232  Q
    ||||||||||    
T  974 aagttctctt 965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 38536 - 38434
Alignment:
Q  5 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  38536 ggaagcaaacaaaacattgaacatagttatgatcggatctacaacatg-tttgtttatcaagaatattaataatta-ggtattaggaatacctggatgaa 38439  T
Q  105 gcttt 109  Q
    |||||    
T  38438 gcttt 38434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 6025 - 5945
Alignment:
Q  11 aaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgttttatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaa 92  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||    
T  6025 aaacaaaacattgaacatgaatatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaaaatattattaatta-ggtattaggaa 5945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5889 - 5826
Alignment:
Q  169 atagagttagcggcggctgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctctt 232  Q
    |||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5889 atagggttagcgacgactaatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttatctt 5826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 14223 times since January 2019
Visitors: 8375