View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2071_low_25 (Length: 475)

Name: NF2071_low_25
Description: NF2071
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2071_low_25
NF2071_low_25
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (19-314)||(21511-21806)
scaffold0115 (175-320)||(22465-22610)
[»] chr8 (69 HSPs)
chr8 (19-310)||(1651727-1652018)
chr8 (19-310)||(1740103-1740394)
chr8 (19-315)||(1646656-1646958)
chr8 (19-313)||(15871776-15872071)
chr8 (19-314)||(27473226-27473522)
chr8 (19-314)||(38588587-38588882)
chr8 (19-313)||(15048399-15048694)
chr8 (29-314)||(45276761-45277047)
chr8 (40-315)||(33295860-33296136)
chr8 (19-314)||(7534988-7535284)
chr8 (19-313)||(5435055-5435350)
chr8 (19-315)||(45077357-45077655)
chr8 (28-308)||(1432136-1432417)
chr8 (30-313)||(44594767-44595050)
chr8 (19-308)||(7949417-7949707)
chr8 (19-308)||(5152689-5152978)
chr8 (19-289)||(27669440-27669716)
chr8 (31-313)||(1869934-1870218)
chr8 (88-308)||(11173858-11174079)
chr8 (155-311)||(15048690-15048847)
chr8 (152-313)||(34470832-34470994)
chr8 (152-315)||(37569312-37569476)
chr8 (152-314)||(33819784-33819947)
chr8 (19-300)||(37569469-37569752)
chr8 (152-313)||(45276597-45276759)
chr8 (152-315)||(1646499-1646663)
chr8 (152-311)||(5434902-5435062)
chr8 (152-309)||(1739952-1740110)
chr8 (152-313)||(15871621-15871783)
chr8 (175-310)||(40660198-40660333)
chr8 (153-314)||(1870224-1870386)
chr8 (152-312)||(5152536-5152696)
chr8 (19-313)||(40048067-40048349)
chr8 (152-311)||(38588875-38589035)
chr8 (152-313)||(27473072-27473233)
chr8 (152-315)||(11707748-11707912)
chr8 (152-310)||(40048342-40048501)
chr8 (154-313)||(40659983-40660143)
chr8 (201-315)||(22763271-22763385)
chr8 (31-245)||(18298407-18298611)
chr8 (152-312)||(27669709-27669868)
chr8 (191-315)||(24666006-24666130)
chr8 (187-315)||(33295734-33295862)
chr8 (227-313)||(45077221-45077307)
chr8 (227-316)||(11920136-11920225)
chr8 (19-161)||(11707905-11708047)
chr8 (152-310)||(7534845-7534995)
chr8 (175-310)||(44594604-44594739)
chr8 (231-328)||(24652810-24652905)
chr8 (212-301)||(22762525-22762614)
chr8 (197-313)||(15740613-15740729)
chr8 (35-144)||(34470714-34470823)
chr8 (238-313)||(12643891-12643966)
chr8 (238-313)||(15741607-15741682)
chr8 (32-147)||(24659364-24659479)
chr8 (225-311)||(33819975-33820062)
chr8 (254-314)||(11920075-11920135)
chr8 (240-314)||(29770376-29770450)
chr8 (152-208)||(45077307-45077364)
chr8 (232-308)||(29769368-29769444)
chr8 (238-314)||(45436473-45436549)
chr8 (249-300)||(14897390-14897441)
chr8 (260-315)||(18298612-18298666)
chr8 (249-300)||(45123609-45123660)
chr8 (261-315)||(45435493-45435547)
chr8 (249-314)||(31988513-31988578)
chr8 (249-301)||(9739288-9739340)
chr8 (249-289)||(33098611-33098651)
chr8 (249-301)||(40229102-40229154)
[»] chr3 (108 HSPs)
chr3 (19-314)||(4773242-4773537)
chr3 (29-313)||(10506113-10506398)
chr3 (19-314)||(32633220-32633516)
chr3 (29-314)||(5900588-5900874)
chr3 (19-308)||(39241363-39241653)
chr3 (19-313)||(44893740-44894035)
chr3 (19-314)||(4757649-4757944)
chr3 (19-313)||(42591784-42592079)
chr3 (29-308)||(47669264-47669544)
chr3 (19-313)||(54108057-54108352)
chr3 (19-315)||(53716293-53716588)
chr3 (30-315)||(11256101-11256387)
chr3 (29-311)||(1994334-1994616)
chr3 (19-308)||(12203706-12203996)
chr3 (19-308)||(21969634-21969924)
chr3 (19-308)||(21992070-21992360)
chr3 (19-308)||(29818182-29818472)
chr3 (28-319)||(16931600-16931892)
chr3 (19-313)||(39664339-39664634)
chr3 (19-308)||(8474001-8474291)
chr3 (30-314)||(26318348-26318633)
chr3 (30-308)||(22201621-22201900)
chr3 (19-301)||(27801501-27801784)
chr3 (19-313)||(54752163-54752458)
chr3 (19-320)||(18464449-18464751)
chr3 (29-313)||(15986235-15986519)
chr3 (22-314)||(22151844-22152137)
chr3 (19-300)||(51509274-51509555)
chr3 (19-315)||(24428565-24428862)
chr3 (30-313)||(21568746-21569029)
chr3 (19-315)||(47303174-47303468)
chr3 (19-315)||(39951355-39951652)
chr3 (19-315)||(46152613-46152908)
chr3 (30-308)||(41835092-41835371)
chr3 (19-315)||(28986315-28986593)
chr3 (152-314)||(39664183-39664346)
chr3 (152-315)||(51509117-51509281)
chr3 (152-314)||(21569033-21569196)
chr3 (155-313)||(26318182-26318341)
chr3 (152-314)||(27801777-27801940)
chr3 (152-314)||(54107901-54108064)
chr3 (152-313)||(24428855-24429017)
chr3 (175-313)||(45307004-45307142)
chr3 (153-313)||(47669548-47669709)
chr3 (175-315)||(11256415-11256555)
chr3 (175-314)||(1994168-1994307)
chr3 (175-314)||(1999327-1999466)
chr3 (152-314)||(18464744-18464907)
chr3 (154-315)||(42592074-42592236)
chr3 (152-316)||(4757491-4757656)
chr3 (152-315)||(5900421-5900585)
chr3 (175-315)||(10505946-10506086)
chr3 (152-311)||(29818465-29818625)
chr3 (152-311)||(54752451-54752611)
chr3 (175-310)||(44894052-44894187)
chr3 (175-313)||(12791488-12791626)
chr3 (156-313)||(15986526-15986684)
chr3 (175-313)||(22201928-22202066)
chr3 (175-312)||(16931918-16932055)
chr3 (152-315)||(4773530-4773694)
chr3 (152-313)||(12203551-12203713)
chr3 (175-313)||(45306832-45306970)
chr3 (152-315)||(53716581-53716745)
chr3 (185-318)||(49528144-49528277)
chr3 (155-294)||(8473865-8474005)
chr3 (152-315)||(19883528-19883691)
chr3 (185-313)||(44317537-44317665)
chr3 (152-315)||(47303017-47303181)
chr3 (152-315)||(22152133-22152299)
chr3 (185-310)||(13866023-13866148)
chr3 (152-311)||(21969917-21970079)
chr3 (152-311)||(21992353-21992515)
chr3 (187-314)||(7681447-7681575)
chr3 (202-313)||(28985509-28985620)
chr3 (152-278)||(41834961-41835088)
chr3 (197-300)||(7163463-7163566)
chr3 (19-193)||(19883359-19883535)
chr3 (197-308)||(15790684-15790795)
chr3 (155-285)||(46152904-46153032)
chr3 (171-315)||(20963533-20963677)
chr3 (198-318)||(30681752-30681872)
chr3 (208-315)||(15791454-15791556)
chr3 (152-246)||(39241646-39241741)
chr3 (197-314)||(30681028-30681145)
chr3 (227-315)||(42853244-42853331)
chr3 (183-301)||(49529076-49529194)
chr3 (212-301)||(43844384-43844473)
chr3 (183-301)||(13866920-13867038)
chr3 (175-235)||(32633143-32633203)
chr3 (183-314)||(44316626-44316756)
chr3 (212-289)||(43839984-43840061)
chr3 (192-258)||(39951682-39951748)
chr3 (238-308)||(50394335-50394405)
chr3 (232-308)||(50259112-50259188)
chr3 (249-300)||(966993-967044)
chr3 (249-300)||(6098975-6099026)
chr3 (211-314)||(12992297-12992400)
chr3 (249-300)||(13355721-13355772)
chr3 (240-315)||(40639430-40639505)
chr3 (249-299)||(32309599-32309649)
chr3 (29-66)||(1999493-1999530)
chr3 (185-302)||(8327697-8327814)
chr3 (249-322)||(24242991-24243064)
chr3 (175-212)||(28986261-28986298)
chr3 (238-315)||(51311829-51311906)
chr3 (238-314)||(5348879-5348955)
chr3 (249-313)||(40503726-40503790)
chr3 (280-312)||(42853342-42853374)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (19-313)||(38958879-38959173)
chr5 (19-315)||(9989321-9989618)
chr5 (19-314)||(2182942-2183238)
chr5 (19-314)||(36440355-36440651)
chr5 (29-308)||(37424427-37424709)
chr5 (22-313)||(27185874-27186165)
chr5 (41-308)||(32288254-32288521)
chr5 (19-313)||(24040240-24040537)
chr5 (19-301)||(34264503-34264790)
chr5 (30-301)||(11315970-11316238)
chr5 (48-301)||(35569964-35570218)
chr5 (152-313)||(38958724-38958886)
chr5 (71-314)||(25567195-25567439)
chr5 (153-311)||(39325414-39325573)
chr5 (152-320)||(24040078-24040247)
chr5 (152-310)||(25182941-25183100)
chr5 (152-314)||(27186161-27186324)
chr5 (155-311)||(35569777-35569934)
chr5 (145-313)||(39325636-39325805)
chr5 (152-315)||(36440198-36440362)
chr5 (155-313)||(16860303-16860462)
chr5 (154-312)||(32288079-32288237)
chr5 (175-313)||(37424262-37424400)
chr5 (152-294)||(9989611-9989754)
chr5 (204-313)||(1140106-1140215)
chr5 (185-312)||(19184598-19184725)
chr5 (152-292)||(2183231-2183372)
chr5 (154-285)||(11316244-11316376)
chr5 (172-315)||(29198952-29199093)
chr5 (19-149)||(16860458-16860588)
chr5 (197-314)||(34264350-34264478)
chr5 (40-149)||(16860596-16860705)
chr5 (191-315)||(31756630-31756754)
chr5 (183-314)||(19185504-19185635)
chr5 (244-313)||(19128434-19128503)
chr5 (29-161)||(29199117-29199249)
chr5 (238-308)||(33817659-33817729)
chr5 (261-315)||(2596386-2596440)
chr5 (220-308)||(2597377-2597465)
chr5 (249-314)||(17339794-17339859)
chr5 (249-301)||(3722079-3722131)
chr5 (249-289)||(6157160-6157200)
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (19-315)||(6356284-6356580)
chr7 (19-313)||(44332674-44332969)
chr7 (29-308)||(41453170-41453450)
chr7 (19-315)||(10526309-10526605)
chr7 (29-314)||(6356764-6357050)
chr7 (29-313)||(31638108-31638393)
chr7 (19-314)||(48626218-48626514)
chr7 (19-301)||(33716600-33716879)
chr7 (19-314)||(19681650-19681946)
chr7 (19-313)||(41751650-41751945)
chr7 (28-322)||(17359174-17359471)
chr7 (19-308)||(41191837-41192130)
chr7 (28-321)||(8542491-8542785)
chr7 (29-313)||(21391355-21391640)
chr7 (19-308)||(7579027-7579317)
chr7 (19-308)||(28286272-28286562)
chr7 (19-315)||(43247413-43247710)
chr7 (29-308)||(34037076-34037356)
chr7 (29-308)||(1114059-1114330)
chr7 (19-314)||(8937004-8937300)
chr7 (30-292)||(28297840-28298103)
chr7 (19-308)||(35146854-35147134)
chr7 (19-291)||(36423391-36423664)
chr7 (152-315)||(10526598-10526762)
chr7 (152-314)||(6356573-6356736)
chr7 (152-318)||(35146694-35146861)
chr7 (155-313)||(48626063-48626222)
chr7 (152-313)||(41453005-41453167)
chr7 (156-314)||(31075485-31075644)
chr7 (19-236)||(40673162-40673378)
chr7 (152-313)||(7578872-7579034)
chr7 (152-313)||(17749935-17750097)
chr7 (154-314)||(21391189-21391350)
chr7 (152-315)||(8936847-8937011)
chr7 (152-322)||(1114333-1114504)
chr7 (139-302)||(7909297-7909461)
chr7 (152-295)||(36423657-36423801)
chr7 (152-314)||(28286116-28286279)
chr7 (147-308)||(4931556-4931718)
chr7 (152-312)||(19681496-19681657)
chr7 (154-313)||(6357055-6357215)
chr7 (190-312)||(36673976-36674098)
chr7 (152-313)||(41191683-41191844)
chr7 (154-310)||(31637946-31638103)
chr7 (185-315)||(4155596-4155726)
chr7 (180-313)||(16867707-16867840)
chr7 (134-314)||(27738935-27739115)
chr7 (158-311)||(8542793-8542946)
chr7 (158-294)||(7909460-7909597)
chr7 (201-314)||(8416484-8416597)
chr7 (158-310)||(17363532-17363683)
chr7 (191-313)||(41891966-41892088)
chr7 (175-315)||(41751962-41752103)
chr7 (152-291)||(28298107-28298247)
chr7 (205-313)||(36282786-36282894)
chr7 (191-314)||(29277671-29277794)
chr7 (191-308)||(36283533-36283651)
chr7 (212-313)||(8417285-8417386)
chr7 (227-311)||(29276877-29276961)
chr7 (152-285)||(33716872-33717005)
chr7 (191-280)||(32946669-32946758)
chr7 (227-314)||(36674095-36674180)
chr7 (204-301)||(41893416-41893513)
chr7 (152-311)||(40673014-40673169)
chr7 (253-315)||(36423790-36423852)
chr7 (183-315)||(28263494-28263626)
chr7 (183-308)||(4156509-4156634)
chr7 (28-109)||(17363439-17363524)
chr7 (238-315)||(38677053-38677130)
chr7 (219-310)||(38447691-38447778)
chr7 (232-313)||(40263616-40263697)
chr7 (183-303)||(28264608-28264728)
chr7 (158-216)||(17359479-17359538)
chr7 (30-109)||(17750101-17750180)
chr7 (137-219)||(38447600-38447682)
chr7 (232-302)||(43050395-43050465)
chr7 (212-265)||(46540017-46540070)
chr7 (197-267)||(29276950-29277020)
chr7 (249-315)||(48095356-48095422)
chr7 (249-314)||(42287806-42287871)
chr7 (249-301)||(8090833-8090885)
chr7 (249-313)||(18458276-18458340)
chr7 (234-314)||(36507116-36507196)
chr7 (233-301)||(38676070-38676138)
chr7 (249-301)||(41691937-41691989)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (19-311)||(6137533-6137825)
chr6 (19-308)||(5937968-5938258)
chr6 (31-308)||(5639340-5639618)
chr6 (19-313)||(9046086-9046381)
chr6 (29-315)||(21856720-21857007)
chr6 (22-315)||(18052954-18053245)
chr6 (40-315)||(32993191-32993467)
chr6 (19-313)||(5310826-5311121)
chr6 (19-313)||(32753177-32753468)
chr6 (19-311)||(6236076-6236369)
chr6 (19-315)||(34890642-34890939)
chr6 (19-308)||(2517007-2517297)
chr6 (63-308)||(24744334-24744579)
chr6 (30-313)||(34994546-34994830)
chr6 (19-314)||(7269950-7270248)
chr6 (61-314)||(26600356-26600610)
chr6 (29-314)||(26956968-26957247)
chr6 (19-308)||(31237751-31238041)
chr6 (19-308)||(31247121-31247411)
chr6 (72-314)||(21540185-21540429)
chr6 (30-270)||(7270672-7270913)
chr6 (19-267)||(3423325-3423574)
chr6 (129-313)||(6532192-6532377)
chr6 (41-238)||(25176834-25177032)
chr6 (314-463)||(33857032-33857181)
chr6 (152-313)||(35167490-35167652)
chr6 (152-314)||(9046374-9046537)
chr6 (152-311)||(15932844-15933004)
chr6 (175-315)||(21856553-21856693)
chr6 (175-311)||(32753485-32753621)
chr6 (152-315)||(34994378-34994542)
chr6 (152-314)||(978414-978577)
chr6 (155-313)||(2517293-2517452)
chr6 (152-314)||(3423169-3423332)
chr6 (175-322)||(18053265-18053412)
chr6 (152-314)||(34890932-34891094)
chr6 (154-315)||(6137377-6137538)
chr6 (152-315)||(6235919-6236083)
chr6 (152-310)||(5937816-5937975)
chr6 (158-311)||(25176665-25176819)
chr6 (152-311)||(5311114-5311274)
chr6 (152-313)||(31238034-31238196)
chr6 (178-315)||(14276397-14276534)
chr6 (152-313)||(31247404-31247566)
chr6 (152-301)||(26600635-26600785)
chr6 (175-313)||(26957273-26957411)
chr6 (155-315)||(7270920-7271081)
chr6 (156-311)||(32993017-32993173)
chr6 (19-208)||(35167645-35167837)
chr6 (185-313)||(17244664-17244792)
chr6 (159-328)||(10412796-10412966)
chr6 (197-314)||(7438803-7438920)
chr6 (197-313)||(34518026-34518142)
chr6 (175-315)||(7270265-7270405)
chr6 (152-313)||(24744609-24744770)
chr6 (213-314)||(15932729-15932830)
chr6 (185-313)||(6228730-6228857)
chr6 (212-314)||(34517271-34517373)
chr6 (197-314)||(29261285-29261402)
chr6 (201-308)||(15286350-15286457)
chr6 (201-318)||(29260526-29260642)
chr6 (234-314)||(25180219-25180299)
chr6 (175-267)||(3035926-3036019)
chr6 (241-315)||(35167833-35167907)
chr6 (183-313)||(6229643-6229772)
chr6 (209-314)||(34251553-34251656)
chr6 (212-313)||(27829314-27829414)
chr6 (183-314)||(17245580-17245711)
chr6 (232-322)||(1158579-1158669)
chr6 (249-289)||(22498408-22498448)
[»] chr1 (84 HSPs)
chr1 (22-315)||(12481217-12481511)
chr1 (19-315)||(37304026-37304323)
chr1 (19-314)||(23476496-23476792)
chr1 (19-313)||(16023897-16024192)
chr1 (19-308)||(25995789-25996079)
chr1 (19-308)||(6797962-6798252)
chr1 (19-314)||(1762829-1763125)
chr1 (30-324)||(20305991-20306286)
chr1 (30-308)||(35612248-35612527)
chr1 (29-314)||(8762564-8762850)
chr1 (30-314)||(45052855-45053140)
chr1 (19-313)||(49140298-49140592)
chr1 (19-313)||(27547824-27548119)
chr1 (40-315)||(2064387-2064663)
chr1 (40-314)||(3089341-3089616)
chr1 (19-313)||(37576181-37576476)
chr1 (19-315)||(9006346-9006642)
chr1 (19-324)||(49643826-49644131)
chr1 (29-313)||(37284893-37285177)
chr1 (29-308)||(37585858-37586138)
chr1 (61-312)||(38127710-38127962)
chr1 (29-267)||(31703660-31703898)
chr1 (28-308)||(12127221-12127501)
chr1 (115-308)||(45843368-45843562)
chr1 (28-254)||(27400588-27400815)
chr1 (72-308)||(4330045-4330282)
chr1 (152-312)||(44322948-44323109)
chr1 (19-314)||(39486357-39486643)
chr1 (155-314)||(12127056-12127216)
chr1 (152-314)||(16024185-16024348)
chr1 (152-310)||(49643674-49643833)
chr1 (152-312)||(12481060-12481221)
chr1 (152-324)||(37304316-37304489)
chr1 (152-313)||(27547669-27547831)
chr1 (152-314)||(49140142-49140305)
chr1 (175-313)||(23476341-23476479)
chr1 (152-313)||(37576469-37576631)
chr1 (175-315)||(26707194-26707334)
chr1 (152-310)||(9006194-9006353)
chr1 (175-313)||(1762674-1762812)
chr1 (155-310)||(35612085-35612241)
chr1 (152-314)||(4696881-4697044)
chr1 (175-310)||(38000492-38000627)
chr1 (156-301)||(37284740-37284886)
chr1 (152-315)||(8760270-8760434)
chr1 (184-315)||(23598070-23598201)
chr1 (175-313)||(31703925-31704063)
chr1 (155-315)||(26723092-26723253)
chr1 (152-314)||(20306290-20306453)
chr1 (19-159)||(26707351-26707491)
chr1 (154-315)||(45052688-45052849)
chr1 (152-311)||(6797809-6797969)
chr1 (19-154)||(4697037-4697172)
chr1 (191-314)||(10831130-10831253)
chr1 (175-310)||(37585696-37585831)
chr1 (201-315)||(46593569-46593682)
chr1 (152-308)||(39486207-39486364)
chr1 (30-158)||(44322816-44322944)
chr1 (201-315)||(34967060-34967174)
chr1 (191-313)||(37467548-37467670)
chr1 (191-308)||(34966308-34966425)
chr1 (201-301)||(5537142-5537242)
chr1 (197-314)||(5536397-5536514)
chr1 (212-308)||(10831935-10832031)
chr1 (191-315)||(32047741-32047865)
chr1 (227-313)||(13109191-13109277)
chr1 (201-308)||(46592817-46592924)
chr1 (212-320)||(28884010-28884118)
chr1 (227-313)||(13183766-13183852)
chr1 (191-311)||(28884751-28884871)
chr1 (201-267)||(49837417-49837483)
chr1 (227-308)||(4697163-4697244)
chr1 (191-311)||(32048510-32048630)
chr1 (240-310)||(46289327-46289397)
chr1 (233-313)||(49838756-49838835)
chr1 (191-314)||(37466801-37466922)
chr1 (266-313)||(45843320-45843366)
chr1 (152-209)||(25996072-25996130)
chr1 (220-308)||(43727278-43727366)
chr1 (249-301)||(52179365-52179417)
chr1 (249-300)||(39851187-39851238)
chr1 (238-319)||(4550911-4550992)
chr1 (249-301)||(7334455-7334507)
chr1 (249-301)||(49548134-49548186)
[»] chr4 (92 HSPs)
chr4 (29-314)||(8591968-8592254)
chr4 (32-321)||(16037962-16038252)
chr4 (19-315)||(6711961-6712258)
chr4 (30-315)||(53995100-53995387)
chr4 (19-326)||(53751057-53751365)
chr4 (19-301)||(43734441-43734724)
chr4 (19-308)||(24898194-24898484)
chr4 (19-315)||(42855494-42855791)
chr4 (19-314)||(14985330-14985626)
chr4 (19-314)||(50768820-50769116)
chr4 (19-314)||(19088496-19088792)
chr4 (29-315)||(623844-624131)
chr4 (19-321)||(44991434-44991736)
chr4 (22-314)||(25181970-25182263)
chr4 (29-313)||(38339492-38339777)
chr4 (19-321)||(21763336-21763639)
chr4 (19-313)||(39448643-39448938)
chr4 (19-308)||(46849824-46850114)
chr4 (19-313)||(15477800-15478095)
chr4 (30-308)||(33091619-33091898)
chr4 (40-301)||(30683704-30683966)
chr4 (19-315)||(1433426-1433723)
chr4 (42-315)||(44957387-44957661)
chr4 (19-308)||(53259293-53259583)
chr4 (19-315)||(12817804-12818101)
chr4 (40-308)||(52557263-52557532)
chr4 (19-300)||(41751971-41752253)
chr4 (29-313)||(37206592-37206877)
chr4 (49-308)||(23755985-23756245)
chr4 (29-315)||(50508622-50508909)
chr4 (30-277)||(43566544-43566792)
chr4 (29-315)||(41878024-41878310)
chr4 (19-281)||(19508568-19508831)
chr4 (19-315)||(36122588-36122884)
chr4 (152-313)||(44991279-44991441)
chr4 (152-314)||(6505536-6505698)
chr4 (152-315)||(42855337-42855501)
chr4 (152-310)||(43734289-43734448)
chr4 (156-312)||(53750903-53751060)
chr4 (152-315)||(24898477-24898641)
chr4 (152-314)||(15477644-15477807)
chr4 (175-314)||(25269312-25269451)
chr4 (152-313)||(8592257-8592419)
chr4 (151-314)||(12818093-12818257)
chr4 (154-313)||(38339782-38339942)
chr4 (152-314)||(14985619-14985782)
chr4 (152-314)||(46849668-46849831)
chr4 (155-320)||(50769112-50769278)
chr4 (175-315)||(16037792-16037932)
chr4 (152-311)||(39448490-39448650)
chr4 (152-311)||(52557089-52557249)
chr4 (154-320)||(43566371-43566538)
chr4 (152-313)||(53994934-53995096)
chr4 (152-310)||(19088344-19088503)
chr4 (155-312)||(1433272-1433430)
chr4 (152-313)||(8398031-8398193)
chr4 (156-324)||(41877849-41878017)
chr4 (154-308)||(20888148-20888303)
chr4 (155-312)||(30683527-30683686)
chr4 (152-313)||(623679-623841)
chr4 (154-313)||(23755418-23755578)
chr4 (152-311)||(36122435-36122595)
chr4 (152-314)||(6712251-6712412)
chr4 (152-314)||(25181811-25181974)
chr4 (152-314)||(41751817-41751978)
chr4 (175-314)||(55022283-55022421)
chr4 (152-313)||(33091453-33091615)
chr4 (175-313)||(44957669-44957807)
chr4 (199-315)||(4513252-4513368)
chr4 (175-315)||(44125782-44125922)
chr4 (152-313)||(19508413-19508575)
chr4 (152-313)||(21763180-21763343)
chr4 (197-315)||(47602941-47603059)
chr4 (154-313)||(37206428-37206587)
chr4 (180-311)||(44125624-44125755)
chr4 (212-315)||(47603710-47603813)
chr4 (29-154)||(23755583-23755708)
chr4 (202-310)||(49135976-49136084)
chr4 (152-267)||(53259184-53259300)
chr4 (19-150)||(6505691-6505822)
chr4 (156-258)||(50508512-50508615)
chr4 (201-313)||(52692778-52692889)
chr4 (215-308)||(52692029-52692122)
chr4 (225-314)||(31214161-31214250)
chr4 (227-312)||(55022424-55022508)
chr4 (249-300)||(20614128-20614179)
chr4 (268-311)||(31214250-31214293)
chr4 (249-300)||(56270557-56270608)
chr4 (271-301)||(43734941-43734971)
chr4 (29-98)||(8398195-8398264)
chr4 (249-301)||(46579789-46579841)
chr4 (249-317)||(56271210-56271278)
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (29-313)||(29472242-29472527)
chr2 (29-308)||(15744462-15744742)
chr2 (22-315)||(7496138-7496431)
chr2 (19-315)||(16305023-16305320)
chr2 (19-315)||(13192986-13193283)
chr2 (19-314)||(10991850-10992146)
chr2 (19-315)||(8174040-8174337)
chr2 (19-313)||(15405911-15406205)
chr2 (28-308)||(7469171-7469452)
chr2 (35-314)||(19847490-19847769)
chr2 (19-313)||(26181855-26182150)
chr2 (33-313)||(34735512-34735793)
chr2 (19-310)||(2148041-2148333)
chr2 (70-319)||(38332698-38332948)
chr2 (31-315)||(24372134-24372419)
chr2 (28-314)||(19815868-19816155)
chr2 (19-313)||(36713588-36713880)
chr2 (19-308)||(41474087-41474377)
chr2 (72-313)||(24138714-24138957)
chr2 (74-267)||(12860577-12860771)
chr2 (136-315)||(33470195-33470375)
chr2 (155-315)||(24138066-24138227)
chr2 (152-315)||(15405754-15405918)
chr2 (152-322)||(8173876-8174047)
chr2 (152-314)||(24371966-24372129)
chr2 (155-320)||(19815697-19815863)
chr2 (152-312)||(12860381-12860542)
chr2 (152-309)||(16305313-16305471)
chr2 (175-315)||(7495978-7496118)
chr2 (152-314)||(34735342-34735505)
chr2 (152-317)||(13193276-13193442)
chr2 (155-312)||(26181701-26181859)
chr2 (155-313)||(41474373-41474532)
chr2 (158-311)||(38332974-38333128)
chr2 (155-315)||(29472533-29472694)
chr2 (152-310)||(2147888-2148048)
chr2 (175-310)||(30898613-30898748)
chr2 (152-322)||(17052342-17052513)
chr2 (203-315)||(17032591-17032703)
chr2 (196-313)||(15744780-15744897)
chr2 (203-315)||(17050927-17051039)
chr2 (184-315)||(8444820-8444951)
chr2 (154-283)||(42834452-42834582)
chr2 (152-267)||(10992139-10992255)
chr2 (31-195)||(17052175-17052337)
chr2 (201-308)||(8962365-8962472)
chr2 (152-302)||(36713873-36714024)
chr2 (201-308)||(8445127-8445234)
chr2 (156-310)||(7469458-7469605)
chr2 (212-313)||(8963166-8963267)
chr2 (232-302)||(23992211-23992281)
chr2 (249-300)||(2804969-2805020)
chr2 (249-300)||(13479426-13479477)
chr2 (249-300)||(15044752-15044803)
chr2 (224-315)||(19847276-19847361)
chr2 (249-300)||(33200041-33200092)
chr2 (249-300)||(38807179-38807230)
chr2 (249-302)||(15136870-15136923)
chr2 (232-301)||(16655911-16655980)
chr2 (249-301)||(2822316-2822368)
chr2 (249-301)||(2822675-2822727)
chr2 (30-78)||(24138234-24138282)
chr2 (249-301)||(31557548-31557600)
chr2 (249-301)||(33200519-33200571)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (33-314)||(72761-73042)
scaffold0029 (175-315)||(73073-73213)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (29-315)||(20749-21035)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (19-313)||(50631-50927)
scaffold0019 (152-311)||(50478-50638)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
scaffold0340 (19-301)||(18285-18568)
scaffold0340 (152-313)||(18561-18723)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (19-315)||(14290-14587)
scaffold0134 (152-314)||(14134-14297)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (35-315)||(24160-24441)
scaffold0186 (158-313)||(24456-24612)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (23-315)||(8427-8719)
scaffold0221 (152-309)||(8716-8874)
[»] scaffold0182 (2 HSPs)
scaffold0182 (29-308)||(19713-19993)
scaffold0182 (152-310)||(19996-20155)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (60-315)||(45754-46010)
scaffold0037 (152-310)||(56424-56583)
scaffold0037 (152-310)||(63549-63708)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (19-301)||(349085-349368)
scaffold0003 (152-314)||(349361-349523)
scaffold0003 (152-322)||(113654-113825)
scaffold0003 (19-161)||(113519-113661)
scaffold0003 (184-315)||(113391-113522)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (19-308)||(15458-15743)
scaffold0072 (152-313)||(15736-15898)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (29-236)||(82023-82231)
scaffold0032 (175-315)||(81856-81996)
scaffold0032 (207-301)||(90782-90876)
[»] scaffold0246 (2 HSPs)
scaffold0246 (19-267)||(6044-6290)
scaffold0246 (152-310)||(6283-6439)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (183-315)||(9780-9912)
scaffold0225 (183-302)||(10876-10995)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (155-274)||(14231-14350)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (201-294)||(144039-144132)
scaffold0001 (175-305)||(147152-147281)
[»] scaffold0526 (2 HSPs)
scaffold0526 (280-313)||(4030-4063)
scaffold0526 (280-313)||(4084-4117)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (249-314)||(230871-230936)


Alignment Details
Target: scaffold0115 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21806 - 21511
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21806 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatattttaacgagatatag 21707  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21706 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacctaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 21607  T
Q  219 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21606 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 21511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 175 - 320
Target Start/End: Original strand, 22465 - 22610
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22465 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 22564  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaatt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22565 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctataatt 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 69)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 1651727 - 1652018
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1651727 atgtgggtgcctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataagaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatat 1651826  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1651827 gaccaaaatgatactaacaaataaagttagaggacccacataacacaaaacctaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 1651926  T
Q  219 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1651927 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 1652018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 1740103 - 1740394
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1740103 atgtgggtgcctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataagaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatat 1740202  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1740203 gaccaaaatgatactaacaaataaagttagaggacccacataacacaaaacctaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 1740302  T
Q  219 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1740303 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 1740394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 1646656 - 1646958
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatac------aaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgag 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646656 atgtgggtgcctgacctcctatttcacacatacaaatacaaatgaaacattacaattacccataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgag 1646755  T
Q  113 atataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtag 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646756 atatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacataaaacctaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtag 1646855  T
Q  213 taacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1646856 taacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagatgaccaatccgataccaattaaatagttagaggacgaaaaaggtaattaagc 1646955  T
Q  313 cta 315  Q
    |||    
T  1646956 cta 1646958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 15871776 - 15872071
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  15871776 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacacatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatag 15871875  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15871876 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaagctctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatgtagtaaca 15871975  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15871976 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttatttagaggaccaatctgatacaaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 15872071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 27473226 - 27473522
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  27473226 atgtgggtatctgacctcttgcttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataa 27473325  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27473326 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacctacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacg 27473425  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27473426 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaattgttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 27473522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38588882 - 38588587
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  38588882 atgtgggtacctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatag 38588783  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38588782 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacg 38588683  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  38588682 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagagga-cgaaaaggtaatttagcct 38588587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15048694 - 15048399
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| |   |||     
T  15048694 atgtgagtatctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcaatcattatttaatcataataccttaacaaataatat 15048595  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15048594 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacaaaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacg 15048495  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15048494 gtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 15048399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Original strand, 45276761 - 45277047
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||| ||||||||||    
T  45276761 ctgacctcctgttccacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggaatatgaccaaaatg 45276860  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45276861 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaatccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaact 45276960  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45276961 tagaggaccgaaataaataaatttttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 45277047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 40 - 315
Target Start/End: Original strand, 33295860 - 33296136
Alignment:
Q  40 tttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaa 139  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  33295860 tttcacacatacatatgaatcataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgatcaaaatgatactaataaa 33295959  T
Q  140 taaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccga 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295960 taaagttagaggactcacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccga 33296059  T
Q  239 aataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33296060 aataaattaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 33296136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 7534988 - 7535284
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||     
T  7534988 atgtgggtatctggcctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttacaaataatatcagtcattatttaatcataatacgttaacgaggaataa 7535087  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7535088 gaccaaaatgatactaataaataaagctagaggactcacataacacaaactataacgtttatttgaataaaactaacataaaggattaaatgtagtaacg 7535187  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7535188 atgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 7535284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 5435055 - 5435350
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||   |||| |||||||| |||||| |||||| ||  |||     
T  5435055 atgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatttgtcattatttaattataataccttaactaggcatat 5435154  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5435155 gaccaaaatgatactaataaataaagttagatgacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacaaaagtgactaaatgtagtaacg 5435254  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5435255 gtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagagcaccaatccgataccaattatatagttagaggaccaaaaagataatttagcc 5435350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 45077357 - 45077655
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaa-ttaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatata 117  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  45077357 atgtgggtatctgacctcctctttcacacatacatgtggaccataaaaagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcata 45077456  T
Q  118 ggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaac 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  45077457 agaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaac 45077556  T
Q  217 ggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45077557 agtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgatactaatcaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 45077655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1432417 - 1432136
Alignment:
Q  28 tctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaat 127  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| ||  ||| || ||||||    
T  1432417 tctgacctcctgtttcacacgtacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaaacataatacattaacaaggcatatgatcaaaat 1432318  T
Q  128 gatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaac 226  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1432317 gatattaataaataaagttagaggacccaaataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacggtgagaaac 1432218  T
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1432217 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 1432136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 313
Target Start/End: Original strand, 44594767 - 44595050
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |    
T  44594767 tgacctcctatttcacacatatatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatagaaccaaaataa 44594866  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44594867 tactaataaataaagttagaggatccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaccgaaatgactaaatgtagtaacggttagaaactt 44594966  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  44594967 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccaatatcaattaaatagttagagga-caaaaagataatttagcc 44595050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7949707 - 7949417
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacac-atacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatata 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  7949707 atgtgggtatctgacctcctatttcagaccatacatatgaacaata-cagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcata 7949609  T
Q  118 ggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaac 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7949608 agaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaac 7949509  T
Q  217 ggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7949508 ggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattaaaagaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatt 7949417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 5152689 - 5152978
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||  ||  |||     
T  5152689 atgtgggtatctgacctcctgtttcatatatacatatgaaccataacagttaccaataatatttgtcactatttaatcataataccttaagaaggcatat 5152788  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  5152789 gaccaaaatgatactagtaaataaagttagaggacccatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaaaactaaatgtaataacg 5152888  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  5152889 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaacagtcagagga-caaaaaggtaatt 5152978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27669716 - 27669440
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataa-----caattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgaga 113  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||     || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||     
T  27669716 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataaattaacagttaccaataacatcagtcactatttaatcataataatttaacaagg 27669617  T
Q  114 tataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtag 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27669616 tatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacataaaccctaacgtttatttcaataaaactaacagaaaggactaaatgtac 27669517  T
Q  213 taacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagtta 289  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27669516 taacagtgagaaatttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagtta 27669440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1870218 - 1869934
Alignment:
Q  31 gacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcata--atatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||  ||  ||| ||||||||||    
T  1870218 gacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacggttactaataatatcagtcactatttaatcatataatacattaataaggcataagaccaaaatg 1870119  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1870118 atactaataaataaagttaggggacccacaattcacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 1870019  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1870018 tagagaaccgaaataaattaatttttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagagga-caaaaaggtaatttagcc 1869934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 88 - 308
Target Start/End: Original strand, 11173858 - 11174079
Alignment:
Q  88 tatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaact-taac-tttatttgaat 185  Q
    |||||| |||||||| |||||| |   |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||    
T  11173858 tatttattcataataccttaacaaagcatagaacccaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataat-ctaaactctaacatttatttgaat 11173956  T
Q  186 aaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaata 285  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11173957 aaaactaacataaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatcagataccaattaaata 11174056  T
Q  286 gttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11174057 gttagaggaccaaaaaggtaatt 11174079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Original strand, 15048690 - 15048847
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15048690 cacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 15048789  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15048790 agttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 15048847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Original strand, 34470832 - 34470994
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34470832 acccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacggtgaaaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 34470931  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34470932 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 34470994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37569476 - 37569312
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37569476 acccacataacaaaaaccataacgtttattcgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 37569377  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37569376 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatcaagccta 37569312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33819947 - 33819784
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33819947 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 33819848  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33819847 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaaggtaatttagcct 33819784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 37569469 - 37569752
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactattt-aatcataatatcttaacgagatata 117  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||    
T  37569469 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaatcatatcagtcactattttaatcataataccttaacaagacata 37569568  T
Q  118 ggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaac 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||   |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  37569569 tgaccaaaatgatactaataaataaagttagagaacccacgtagcataaactctaacgtttatttgaataaaactaactgaaaagactaaatatagtaac 37569668  T
Q  217 ggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
       |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||    
T  37569669 aacgagaaatttagaggaccaaaataaataaatttttaattagatgatcaatccgatatcaattaaatacttagaagatcaaaa 37569752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45276759 - 45276597
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45276759 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaatataaatgactaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 45276660  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45276659 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 45276597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1646663 - 1646499
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646663 acccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 1646564  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646563 tttagttagagaaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 1646499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5435062 - 5434902
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  5435062 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaaaaccgaaataaatcaaat 5434963  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5434962 tttaggtagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 5434902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1740110 - 1739952
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1740110 acccacatagcacaaatcttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 1740011  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatta 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1740010 tttagttagaggactaatccgataccgattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatta 1739952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15871783 - 15871621
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15871783 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacagtgagaaatttagaggaccaaaataaattaatt 15871684  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15871683 tttagttagaggaccaatccgatatcaattaaatagttaaaggaccaaaaaggtaattaagcc 15871621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 40660198 - 40660333
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40660198 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaattcgata 40660297  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40660298 acaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 40660333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 314
Target Start/End: Original strand, 1870224 - 1870386
Alignment:
Q  153 cccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattt 251  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1870224 cccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaactttgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattt 1870323  T
Q  252 ttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1870324 ttagttagaggatctatcttataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 1870386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5152696 - 5152536
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5152696 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggacc-aaataaatcaatt 5152598  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5152597 tttagtcagaggaccaatctgataccaattaaacagttagaggatcaaaaaggtaattaagc 5152536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40048349 - 40048067
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||     
T  40048349 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacaa-tgaaccataacggttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaatat 40048251  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  40048250 gaccaaaatgatactaataaataaagttagagg----acataacacaaactttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaac- 40048156  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
           | |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||| |||||| ||||    
T  40048155 -------agttagagaatcaaaataaattaatttttagttagaggactaatccaatatcaattaaatagttagattatcaaaaaagtaatttagcc 40048067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Original strand, 38588875 - 38589035
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38588875 acccacataatacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacataaaggactaaatctagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 38588974  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  38588975 tttagttagaggatcaatccaataccaattaaatagttagagaaccaaaaaaataattaag 38589035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27473233 - 27473072
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27473233 acccacataacacaaatcataatgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacg-tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 27473135  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27473134 tttagttagaggaccaatctgatatcaactaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 27473072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11707912 - 11707748
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11707912 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaagagaaatgactaaatgtattaacagtgagaaacttagaggatcgaaacaaatcaatt 11707813  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11707812 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggatcaaaaagataattaagccta 11707748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 40048342 - 40048501
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  40048342 acccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcaaaataaaacaatt 40048441  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  40048442 tttagttagaggatcaatacgataccaactaaataactagaggatcaaaaaggtaattaa 40048501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40660143 - 40659983
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40660143 ccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactattagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatttt 40660044  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40660043 tagttagatgactaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcc 40659983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 201 - 315
Target Start/End: Original strand, 22763271 - 22763385
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22763271 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 22763370  T
Q  301 aggtaattaagccta 315  Q
    |||||||| ||||||    
T  22763371 aggtaatttagccta 22763385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 18298407 - 18298611
Alignment:
Q  31 gacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgat 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||           | ||  ||||||||    
T  18298407 gacctcctatttcacacatacatatgaatcataacagttactaataatatttgtcactatttaatcataatacct-----------atgattaaaatgat 18298495  T
Q  131 actaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18298496 actaataaataaagttagaggactcacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaattgtgagaaactta 18298595  T
Q  230 gaggaccgaaataaat 245  Q
    ||||||| ||||||||    
T  18298596 gaggaccaaaataaat 18298611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 312
Target Start/End: Original strand, 27669709 - 27669868
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaact-ttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||||||    
T  27669709 acccacataacacaaaccctaatgattatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgtgaaacttaaag-atcgaaataaatcaatt 27669807  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  27669808 tttagttagaagaccaatctgataccaattaaatagttagagga-taaaaagataattaagc 27669868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 315
Target Start/End: Original strand, 24666006 - 24666130
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 290  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24666006 taacagaaaggacgaaatatggtaacggtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttaaaggaccaaaccgttaccaattaaatagttag 24666105  T
Q  291 aggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24666106 aggaccaaaaaggtaattaagccta 24666130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 187 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33295862 - 33295734
Alignment:
Q  187 aaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatag 286  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  33295862 aaactaacagaaatgactaaatgtaataacggtgacaaacttagaataccgaaataaatcaatttttaattagaagaccaatctgataccaactaaatag 33295763  T
Q  287 ttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33295762 ttagaggaccaaaaaggtcattaaaccta 33295734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45077307 - 45077221
Alignment:
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45077307 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 45077221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 316
Target Start/End: Original strand, 11920136 - 11920225
Alignment:
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctag 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11920136 ttagaggacccaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaatttagcctag 11920225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 11707905 - 11708047
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| | || ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | | |||     
T  11707905 atgtgggtatttgtccttctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacaaaacataa 11708004  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 161  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11708005 gatcaaaatgatactaataaataaagttagatgacccacataa 11708047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7534995 - 7534845
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||         |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7534995 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaa---------cggtgagaaacttaaatgaccgaaataaatcaatt 7534905  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7534904 tttaattaaaggactaatccgatatcaactaaataattagaagaccaaaaaggtaattaa 7534845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44594739 - 44594604
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||   | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  44594739 tttatatgaataaaactaacagaaataactaaatgtagtaacgaatataaatttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctaata 44594640  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44594639 gcaattaaataattagaggaccaaaaatgtaattaa 44594604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24652905 - 24652810
Alignment:
Q  231 aggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaatttatatatt 328  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  24652905 aggaccaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgttaccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct--aatttatatatt 24652810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22762614 - 22762525
Alignment:
Q  212 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22762614 gtaacggtgagaaacttaagggatcgaaataaatcaatttttaattagaggattaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaa 22762525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15740729 - 15740613
Alignment:
Q  197 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacc 296  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||    
T  15740729 aaaggactaaaagtggtaacggaaagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaatggacc 15740630  T
Q  297 aaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||| |||||||||    
T  15740629 aaaaaggcaattaagcc 15740613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34470823 - 34470714
Alignment:
Q  35 tcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatacta 134  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| || |||||||||||||    
T  34470823 tcctgtttcacacatacataagaatcataacagttaccaataatatctgtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgatcaaaatgatacta 34470724  T
Q  135 ataaataaag 144  Q
    ||||||||||    
T  34470723 ataaataaag 34470714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Original strand, 12643891 - 12643966
Alignment:
Q  238 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12643891 aaataaatcaatatttagttagaggaccaaatcgatacaaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 12643966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Original strand, 15741607 - 15741682
Alignment:
Q  238 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15741607 aaataaatcaaaatttagttagaggaccaaaccgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaattaagcc 15741682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 147
Target Start/End: Original strand, 24659364 - 24659479
Alignment:
Q  32 acctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgata 131  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||  |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||  | |||||||||||||||    
T  24659364 acctcctgtttcacacatacatattaactataacagttagtaataatatcagtcactatttaatcagaataccttaataaggcagaggaccaaaatgata 24659463  T
Q  132 ctaataaataaagtta 147  Q
    ||||||||||||||||    
T  24659464 ctaataaataaagtta 24659479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 311
Target Start/End: Original strand, 33819975 - 33820062
Alignment:
Q  225 acttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagga-ccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  33819975 acttagaagactgaaataaattaatttttagttagatgatcaatccgataccaattaaatagttagaggataaaaaaaggtaattaag 33820062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11920135 - 11920075
Alignment:
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11920135 agttagaggaccaatccaaaaccaaataaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 11920075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Original strand, 29770376 - 29770450
Alignment:
Q  240 ataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  29770376 ataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatttagcct 29770450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45077364 - 45077307
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaat 208  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45077364 acccacataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaat 45077307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29769444 - 29769368
Alignment:
Q  232 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  29769444 ggaccaaaataaatcaaaatttagttaaggaaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagagaccaaaaaggtaatt 29769368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 314
Target Start/End: Original strand, 45436473 - 45436549
Alignment:
Q  238 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||    
T  45436473 aaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggacaaaaaatgtaatttagcct 45436549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Original strand, 14897390 - 14897441
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14897390 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaaaggaccaaaa 14897441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 315
Target Start/End: Original strand, 18298612 - 18298666
Alignment:
Q  260 aggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  18298612 aggaccaatccaatatcaattaaatagttagaggatc-aaaaggtaatttagccta 18298666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Original strand, 45123609 - 45123660
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  45123609 tttttagttaaaggaccaaaacgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 45123660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45435547 - 45435493
Alignment:
Q  261 ggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  45435547 ggaccaaaccgaaaccaattaaataggtaagggaccaaaaaggtaatttagccta 45435493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31988578 - 31988513
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||    
T  31988578 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaagcatttaagcct 31988513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9739340 - 9739288
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9739340 tttttagttaagggaccaaaacgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 9739288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33098651 - 33098611
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagtta 289  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33098651 tttttagttaaaggaccaaagcgataccaattaaatagtta 33098611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40229154 - 40229102
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40229154 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 40229102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 108)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4773537 - 4773242
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773537 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 4773438  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4773437 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacaaaaaacctaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatatagtaacgg 4773338  T
Q  219 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773337 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 4773242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 10506113 - 10506398
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  10506113 ctgacctcctgtttcacatatacatatgaaccataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatg 10506212  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10506213 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaact 10506312  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10506313 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 10506398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 32633220 - 32633516
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  32633220 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagaaatat 32633319  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32633320 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacg 32633419  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32633420 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccgataacaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 32633516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Original strand, 5900588 - 5900874
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  5900588 ctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacaattaccaaaaatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatg 5900687  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5900688 atgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 5900787  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  5900788 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcct 5900874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39241653 - 39241363
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||     
T  39241653 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataa 39241554  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  39241553 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaacattaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaaca 39241454  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39241453 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 39241363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44894035 - 44893740
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||     
T  44894035 atgtggatatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacaattaccaatgatatcagtcactatttgatcataatatcttaacaagacatat 44893936  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44893935 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacg 44893836  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  44893835 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaagaccaatccgataccaattaaatagttagagaaccaaaaagataatttagcc 44893740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 4757649 - 4757944
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||| | ||  ||||    
T  4757649 atgtgggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttgatcataat-tcttatcaaggaatag 4757747  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4757748 aaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacg 4757847  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4757848 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 4757944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42592079 - 42591784
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  42592079 atgtggatatctgacctcctctttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatat 42591980  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  42591979 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaaca 42591880  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42591879 gtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagaggacaaatccgataccgattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 42591784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47669544 - 47669264
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  47669544 ctgacctcctgtttcacacacacatatgaaccataacagttatcaataatatctatcactatttaatcataatatcttaacaaggaatatgaccaaaatg 47669445  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47669444 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 47669345  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47669344 tagaggaccgaaataaattaatttttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 47669264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 54108057 - 54108352
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||     
T  54108057 atgtgggtacctgagctcctgtttcacacatacctatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatat 54108156  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||     
T  54108157 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataaca 54108256  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54108257 ctgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 54108352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 53716588 - 53716293
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  53716588 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatag 53716489  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  53716488 gaccaaaatgatactaataaataaagttagagg-cccacgtaacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaccaaatatagtaacg 53716390  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  53716389 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagagga-caaaaaagtaatttagccta 53716293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11256387 - 11256101
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11256387 tgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatga 11256288  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11256287 tactaataaataaagttagaggacacacataacagaaactctaacgtttatttgaataaaactatcaaaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaactt 11256188  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    | |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11256187 aaaggatcgaaataaattattttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggactaaaaaggtaattaagccta 11256101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 311
Target Start/End: Original strand, 1994334 - 1994616
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  1994334 ctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttatcaataatatcgctcactatttaatcataat-tcttaacaaggaataggaccaaaatg 1994432  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1994433 atgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaaataacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaact 1994532  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1994533 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaag 1994616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 12203706 - 12203996
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| | | |||     
T  12203706 atgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactgtttaatcataataccttaacaaaacatat 12203805  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12203806 taccaaaatgatactaataaataaagttagaggtcccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactatcagaaaggactaaatgtagtaacg 12203905  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12203906 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggatcaatccgataccaattaaatagttaggggaccaaaacggtaatt 12203996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21969924 - 21969634
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||     
T  21969924 atgtgggtacctgaccttctatttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaaacataataccttaacaaggaataa 21969825  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21969824 gaccaaaacgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaagtaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 21969725  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969724 gtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgttaccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 21969634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21992360 - 21992070
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||     
T  21992360 atgtgggtacctgaccttctatttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaaacataataccttaacaaggaataa 21992261  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21992260 gaccaaaacgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaagtaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 21992161  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21992160 gtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgttaccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 21992070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29818472 - 29818182
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | | |||     
T  29818472 atgtgggtatttgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaataaaacatat 29818373  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29818372 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggatccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaaca 29818273  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29818272 gtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttatttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 29818182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16931892 - 16931600
Alignment:
Q  28 tctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaat 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||    
T  16931892 tctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagctaccaataatatcagtaactatttaatcttaataccttaacaagacatatgaccaaaat 16931793  T
Q  128 gatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactt-tatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaac 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931792 gatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtatatttgtataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaac 16931693  T
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaa-ttaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16931692 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagcaccaatccg-taccaaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcctagaat 16931600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 39664339 - 39664634
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  39664339 atgtgggtacctgacctcttatttcacacatacatatgaactataacatttaccaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacaaggcatag 39664438  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39664439 aaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacagaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacg 39664538  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39664539 gtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 39664634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 8474001 - 8474291
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||     
T  8474001 atgtgagtatctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatat 8474100  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8474101 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaacactaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacg 8474200  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8474201 gtcataaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggactaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 8474291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Original strand, 26318348 - 26318633
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |   ||| |||||||||||    
T  26318348 tgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatga 26318447  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26318448 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaacactaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtcagaaactt 26318547  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26318548 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggattaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaatttagcct 26318633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22201900 - 22201621
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||    
T  22201900 tgacatcctgtttcatacatacatatgaaccataatagttaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatga 22201801  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22201800 tactaataaataaagttagaggactcacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaacctaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 22201701  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22201700 agaggacagaaataaatcaatttttatttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 22201621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27801784 - 27801501
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||    
T  27801784 atgtgggtacctgaccttctatttcacacatacatatgaaccataacaattatcaataatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggcatag 27801685  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||     
T  27801684 aaccaaaatgatattaataaataaagttagaggatccacataacagaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaataaatctagtaaca 27801585  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27801584 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 27801501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54752458 - 54752163
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||     
T  54752458 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatat 54752359  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  54752358 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccataatgtttatttgaataaaactaacagaaaggatcaaatgtagtaacg 54752259  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  54752258 gtgagaaacttatatgaccgaaataaatcaatttttagttacaggaccaatcttataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcc 54752163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18464751 - 18464449
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||     
T  18464751 atgtgggtacctgaccttctgtttcacatatacataggaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaaccataataccttaacaatgcatat 18464652  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  18464651 gaccaaaatgatactaataaataaagctataggacctacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaaca 18464552  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  18464551 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggagcaaaaatgtaatttagcctaga 18464452  T
Q  318 att 320  Q
    |||    
T  18464451 att 18464449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15986519 - 15986235
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||    
T  15986519 ctgacctcctgtatcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacacga-ataggaccaaaatg 15986421  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15986420 atactaataaataaagttagagaacccacataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgcagtaacggtgagaaact 15986321  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  15986320 tagaggaccgaaataaatcaatttttagctaggggactaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaagataatttagcc 15986235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22152137 - 22151844
Alignment:
Q  22 tgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggac 121  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||    
T  22152137 tgggtatctgaccttctgtttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaataggac 22152038  T
Q  122 caaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22152037 caaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctatcgtttatttgaataaaattaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtg 22151938  T
Q  221 agaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  22151937 agaaacttagaaaaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgttaccaattaaatagttataggaccaaaaatgtaatttagcct 22151844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 51509274 - 51509555
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  51509274 atgtgggtatctgacctcctatttcacacgtacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatat 51509373  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  51509374 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataatacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaaca 51509473  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  51509474 gtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttttagttaga-gactaatccaataccaattaaatagttggaggacaaaaa 51509555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24428862 - 24428565
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||    
T  24428862 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaagcataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaagaaggcatag 24428763  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  24428762 gagcaaaatgatactaataaattaagttagaggatccacataacacaaatcccaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaaca 24428663  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24428662 gtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattgaatagttagaggaccaaaaagataatttagccta 24428565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21569029 - 21568746
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||    
T  21569029 tgaccttctgtttcacacatacatatgaaccattatagttaccaataatattagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatatgaccaaaatga 21568930  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21568929 tactaataaataaggttagaggacc-acataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactt 21568831  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  21568830 agaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaagataatttagcc 21568746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 47303174 - 47303468
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||     
T  47303174 atgtgggtatctgacctcctgtttcacatatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaataaggcatat 47303273  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaact-taac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaac 216  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47303274 gatcaaaatgata-taataaataaagttagaggacccacataaca---aactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaac 47303369  T
Q  217 ggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  47303370 ggtgagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttacttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaaaccta 47303468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39951652 - 39951355
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||     
T  39951652 atgtgggtatctgacctcctgtttcacacatatatatgaaccataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatat 39951553  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  39951552 gaccaaaatgatactaataaataaagttaaaggacccacataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacataaagaactaaatatagtaacg 39951453  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  39951452 atgagaaacttaaaggatcgaaataaatcaatttttaattagaggactaatccgataccaattaaatagtcagatgatcaaaagggtaatttagccta 39951355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 46152908 - 46152613
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  46152908 atgtgagtatctgacctcctctttcacacgtacatatgaaccataaccgttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatat 46152809  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  46152808 gaccaaaatgatactaataaataaagttagatg--ccagataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtgatg 46152711  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  46152710 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaattcgatgccaattaaatagttagaggaccaaagatgtaatttagccta 46152613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 41835092 - 41835371
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||| |||||||||||    
T  41835092 tgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcaaaatacattaacaaggaatatgaccaaaatga 41835191  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41835192 tactaataaataaagttagatgacccatgtaacacaaacactaacgtttatttaaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 41835291  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41835292 agaggaccgaaataaatcaatttttaattaaagaactaattcaatatcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 41835371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 28986315 - 28986593
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||                       
T  28986315 atgtgggtatctgacctcctctttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcatat------------------ 28986396  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||     
T  28986397 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggactcatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaat-tagtaaca 28986495  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28986496 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaaggtaatttagccta 28986593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39664346 - 39664183
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39664346 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcattt 39664247  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39664246 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 39664183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 51509281 - 51509117
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51509281 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtaggaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 51509182  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51509181 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 51509117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 21569033 - 21569196
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21569033 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 21569132  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21569133 tttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatcaagcct 21569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 155 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26318341 - 26318182
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26318341 cacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 26318242  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26318241 agttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggactaaaaaggtaattaagcc 26318182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 27801777 - 27801940
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27801777 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcattt 27801876  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27801877 tttaattagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 27801940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 54108064 - 54107901
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108064 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 54107965  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  54107964 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaataaagcct 54107901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Original strand, 24428855 - 24429017
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24428855 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatt 24428954  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24428955 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaattaagcc 24429017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 45307004 - 45307142
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45307004 tttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgata 45307103  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45307104 ccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 45307142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 313
Target Start/End: Original strand, 47669548 - 47669709
Alignment:
Q  153 cccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattt 251  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47669548 cccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagtaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaattt 47669647  T
Q  252 ttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47669648 ttagttagagaaccaatccgataccaaataaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 47669709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Original strand, 11256415 - 11256555
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11256415 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatttagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcattttttagttagaggaccaatctgata 11256514  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11256515 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattacgccta 11256555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 175 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1994307 - 1994168
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1994307 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 1994208  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1994207 ccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 1994168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 175 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1999466 - 1999327
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1999466 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 1999367  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1999366 ccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 1999327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 18464744 - 18464907
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18464744 acccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacggtgataaacttagaggaccgaaataaatcaatt 18464843  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18464844 tttagttagaagaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 18464907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 315
Target Start/End: Original strand, 42592074 - 42592236
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42592074 ccacataaaacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttt 42592173  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42592174 tagttagaggaccaatttgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccta 42592236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4757656 - 4757491
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4757656 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagaataaatgtagtaatggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 4757557  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4757556 tttagttagaggaccaatccgattccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcctag 4757491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5900585 - 5900421
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5900585 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 5900486  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5900485 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagatgaccaaaaatgtaattaagccta 5900421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10506086 - 10505946
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  10506086 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggactaatctgata 10505987  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10505986 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaaaccta 10505946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Original strand, 29818465 - 29818625
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29818465 acccacataacacaatccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 29818564  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  29818565 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaataattagaagatcaaaaaggtaattaag 29818625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Original strand, 54752451 - 54752611
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54752451 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttagagcaccgaaataaatcaatt 54752550  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54752551 tttagttagagaaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 54752611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 44894052 - 44894187
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44894052 tttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggtccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgata 44894151  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44894152 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 44894187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 12791488 - 12791626
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12791488 tttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggaccaatccgata 12791587  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12791588 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcc 12791626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 156 - 313
Target Start/End: Original strand, 15986526 - 15986684
Alignment:
Q  156 acataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 254  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15986526 acataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaacttattgaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 15986625  T
Q  255 gttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15986626 gttagaggaccaatccgataccaactaaataattagaggaccaaaaagttaattaagcc 15986684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 22201928 - 22202066
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22201928 tttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaaccgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 22202027  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22202028 ccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 22202066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 175 - 312
Target Start/End: Original strand, 16931918 - 16932055
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16931918 tttatttgaataagactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacagaaataaatcaatttttagttagaggacaaatccgata 16932017  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16932018 ccaattaaaaagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 16932055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 4773530 - 4773694
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4773530 acccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaagaccaaaataaatcaatt 4773629  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4773630 tttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagatgattaagccta 4773694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12203713 - 12203551
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12203713 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaatataccaatt 12203614  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12203613 tttagttagatgaccaatccgataccaattaaatagttagaggataaaaaaggtaattaagcc 12203551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45306970 - 45306832
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45306970 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaaattttagttagaggactaatccgata 45306871  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45306870 ccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaatttagcc 45306832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 53716581 - 53716745
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaacttta-tttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53716581 acccacataacacaaaccctaacgttaatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaatgatgataaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 53716680  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53716681 tttagttagaagaccaatctgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaattaagccta 53716745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 49528277 - 49528144
Alignment:
Q  185 taaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaat 284  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49528277 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagctagaggaccaaaccgataccaattaaat 49528178  T
Q  285 agttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49528177 agttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaa 49528144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 155 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8474005 - 8473865
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8474005 cacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagtaccgaaataaatcaattttt 8473906  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8473905 agttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagagga 8473865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 19883528 - 19883691
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19883528 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaataaaaacgattaaatgtagtaactgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcattt 19883627  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  19883628 tttagttagagaaccaatccgataccaattaaatagttagagga-taaaaaggtaattaacccta 19883691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 185 - 313
Target Start/End: Original strand, 44317537 - 44317665
Alignment:
Q  185 taaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaat 284  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44317537 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaaaccgataccaattaaat 44317636  T
Q  285 agttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44317637 agttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 44317665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 47303181 - 47303017
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47303181 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatt 47303082  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||| |||||||||  || | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  47303081 tttaattagaggactgattcaataccaattaaatagttagatgatcaaaaaagtaattaagccta 47303017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 22152133 - 22152299
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22152133 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaacgactaaatgtagtaacagtgagaaactcagaggactgaaataaatcaatt 22152232  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaa--atagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22152233 tttagttagaggatcaatctgataccaactaaatatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 22152299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13866148 - 13866023
Alignment:
Q  185 taaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaat 284  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13866148 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaaaccgataccaattaaat 13866049  T
Q  285 agttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13866048 agttagaggaccaaaaaggtaattaa 13866023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Original strand, 21969917 - 21970079
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  21969917 acccacataacacaaaccctaacgtttatttaaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaactcagaggactgaaataaatgaatt 21970016  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaa--atagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21970017 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatatagttagaggaccaaaaatgtaattaag 21970079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Original strand, 21992353 - 21992515
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  21992353 acccacataacacaaaccctaacgtttatttaaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaactcagaggactgaaataaatgaatt 21992452  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaa--atagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21992453 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatatagttagaggaccaaaaatgtaattaag 21992515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 187 - 314
Target Start/End: Original strand, 7681447 - 7681575
Alignment:
Q  187 aaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaga-ggaccaatccgataccaattaaata 285  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7681447 aaactaacagaaaggactgaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagggactaatccgataccaattaaata 7681546  T
Q  286 gttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
     ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  7681547 attagaggaccaaaagtgtaatttagcct 7681575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28985620 - 28985509
Alignment:
Q  202 actaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28985620 actaaatgtaataacggtgagaaacttataggaccgaaataaatcaaattttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaag 28985521  T
Q  302 ggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||    
T  28985520 ggtaattaagcc 28985509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41835088 - 41834961
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41835088 acccacataacacaaaccctaacgtttatttaaatacaactaacagaaaggattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 41834989  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaa 278  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41834988 tttagttagaggaccaatctgataccaa 41834961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 197 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7163566 - 7163463
Alignment:
Q  197 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacc 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7163566 aaaggactaaatgtagtaactgtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagatgaccaatccaataccaattaaatagttagaggacc 7163467  T
Q  297 aaaa 300  Q
    ||||    
T  7163466 aaaa 7163463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19883535 - 19883359
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaat-aataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatata 117  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  19883535 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacatttaccaattaatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagactta 19883436  T
Q  118 ggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaa 193  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||    
T  19883435 gaaccaaaatgatactaataaataaagttaaggtactcacataacacaaaccctaacgtttatttaaataaaactaa 19883359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 197 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15790795 - 15790684
Alignment:
Q  197 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15790795 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggatggaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagatgacc 15790696  T
Q  297 aaaaaggtaatt 308  Q
    |||||| |||||    
T  15790695 aaaaagataatt 15790684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 285
Target Start/End: Original strand, 46152904 - 46153032
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46152904 cacataacacaaacctcaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagta---gtgagaaacttataggaccgaaataaatcaattttt 46153000  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaata 285  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  46153001 agttagagaaccaattcgataccaactaaata 46153032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 315
Target Start/End: Original strand, 20963533 - 20963677
Alignment:
Q  171 taactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatcc 270  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  20963533 taacttttttttaataaaactaacggaaaggactaaaagaagtaacagagagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagaggatcaaacc 20963632  T
Q  271 gataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  20963633 gatactaattaaatagttaagggaccaaaaaggcaattaagccta 20963677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 318
Target Start/End: Original strand, 30681752 - 30681872
Alignment:
Q  198 aaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacca 297  Q
    |||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  30681752 aaggacgaaatatggtaacggtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggaccaaactgttaccaattaaatagttagaggacca 30681851  T
Q  298 aaaaggtaattaagcctagaa 318  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  30681852 aaaagataattaagcctagaa 30681872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 208 - 315
Target Start/End: Original strand, 15791454 - 15791556
Alignment:
Q  208 tgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15791454 tgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagag-----atccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatataat 15791548  T
Q  308 taagccta 315  Q
    | ||||||    
T  15791549 ttagccta 15791556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 39241646 - 39241741
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatc 246  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39241646 acccacataacacaaattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatc 39241741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30681145 - 30681028
Alignment:
Q  197 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacc 296  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30681145 aaaggacgaaatatggtaacggtgataaagttagaggaccaaaataaatatttttttagttagagaaccaaaccgttaccaattaaatagttagatgacc 30681046  T
Q  297 aaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  30681045 aaaaatgtaattaagcct 30681028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42853331 - 42853244
Alignment:
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42853331 ttagaggacccacataaatcaatttttagttagagaaccaatccgataccaactaaatagataga-gaccaaaaaggtaatttagccta 42853244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Original strand, 49529076 - 49529194
Alignment:
Q  183 aataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 282  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  49529076 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 49529175  T
Q  283 atagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  49529176 atagttaagggaccaaaaa 49529194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 301
Target Start/End: Original strand, 43844384 - 43844473
Alignment:
Q  212 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43844384 gtaacggagagaaatttaaaggacaaaaataaatcaatttttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaa 43844473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Original strand, 13866920 - 13867038
Alignment:
Q  183 aataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 282  Q
    ||||||| ||||  |||||| |||| |||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  13866920 aataaaattaacggaaaggattaaaagtagtaactgagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 13867019  T
Q  283 atagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  13867020 atagttaagggaccaaaaa 13867038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32633203 - 32633143
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggac 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32633203 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggac 32633143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44316756 - 44316626
Alignment:
Q  183 aataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 282  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||||    
T  44316756 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggacc-aaataaatcaaattttagttaggggactaaaccgatactaattaa 44316658  T
Q  283 atagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||  |||||||||| | |||| |||||    
T  44316657 atagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 44316626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43840061 - 43839984
Alignment:
Q  212 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagtta 289  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  43840061 gtaacggagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaaaccgatactaattaaatagtta 43839984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 258
Target Start/End: Original strand, 39951682 - 39951748
Alignment:
Q  192 aacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtta 258  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  39951682 aacagaaatgactaaatgtaataacgttgaaaaacttagagaattgaaataaatcaatttttagtta 39951748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 308
Target Start/End: Original strand, 50394335 - 50394405
Alignment:
Q  238 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  50394335 aaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccaaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatt 50394405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 50259188 - 50259112
Alignment:
Q  232 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  50259188 ggaccaaaataattcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaatgtaatt 50259112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 967044 - 966993
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  967044 tttttagttaaaggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 966993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Original strand, 6098975 - 6099026
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6098975 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaaaggaccaaaa 6099026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 314
Target Start/End: Original strand, 12992297 - 12992400
Alignment:
Q  211 agtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||| |||||| | ||  | ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |    
T  12992297 agtaacggagagaaagttaagggaccaaaataatttaaaatatagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggatcaaaaaggtaattta 12992396  T
Q  311 gcct 314  Q
    ||||    
T  12992397 gcct 12992400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Original strand, 13355721 - 13355772
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13355721 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaaaggaccaaaa 13355772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 315
Target Start/End: Original strand, 40639430 - 40639505
Alignment:
Q  240 ataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||    
T  40639430 ataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaacataatttagccta 40639505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Original strand, 32309599 - 32309649
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaa 299  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32309599 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaaaggaccaaa 32309649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 66
Target Start/End: Original strand, 1999493 - 1999530
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataaca 66  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1999493 ctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataaca 1999530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 302
Target Start/End: Original strand, 8327697 - 8327814
Alignment:
Q  185 taaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaat 284  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||| |||||   || ||| ||| |||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  8327697 taaaactaatagaaataactaaatgtggtaacaaagataaatttaaaggaccaaaataaatcaaaatatagttaagggaccaaaccgataccaaataaat 8327796  T
Q  285 agttagaggaccaaaaag 302  Q
    |||||  ||| |||||||    
T  8327797 agttaagggatcaaaaag 8327814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 322
Target Start/End: Original strand, 24242991 - 24243064
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaattta 322  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||  | | ||||||||| ||||||    
T  24242991 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaagagcatttaagcctaaaattta 24243064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28986298 - 28986261
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtag 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28986298 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 28986261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 315
Target Start/End: Original strand, 51311829 - 51311906
Alignment:
Q  238 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  51311829 aaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaacagaccaaaaatgtaatttagccta 51311906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 314
Target Start/End: Original strand, 5348879 - 5348955
Alignment:
Q  238 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||    
T  5348879 aaataaatcaaattttaattacgggaccaaagcgatactaattaaatagttaaaggacaaaaaacataatttagcct 5348955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 313
Target Start/End: Original strand, 40503726 - 40503790
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||    
T  40503726 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaagagcaattaagcc 40503790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 312
Target Start/End: Original strand, 42853342 - 42853374
Alignment:
Q  280 taaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42853342 taaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagc 42853374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 38958879 - 38959173
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38958879 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacgtaacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataa 38958978  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958979 gaccaaaatgatacttataaataaagttagaggactcacataacacaaaatctaactttatttgaataaaattaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 38959078  T
Q  219 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38959079 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 38959173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9989618 - 9989321
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  9989618 atgtgggtgtctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatattagtcactgtttaatcataataccttaataagacatag 9989519  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9989518 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacg 9989419  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  9989418 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaagtaatttagccta 9989321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2183238 - 2182942
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||     
T  2183238 atgtgggtgtctgacctcctgtttcacacatacatataaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataatactttaacaagatatat 2183139  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2183138 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaagctaacataaaggactaaatgtagtaacg 2183039  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  2183038 gtgagaaacttagacgacataaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaattaatttagcct 2182942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 36440355 - 36440651
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||     
T  36440355 atgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaatat 36440454  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |      
T  36440455 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccatataacacaaaccccaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagttata 36440554  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  36440555 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 36440651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Original strand, 37424427 - 37424709
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  37424427 ctgacctcctgtttcacagatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaaaaataggaccaaaatg 37424526  T
Q  129 atactaataaataaagttagagga---cccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaa 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37424527 atattaataaataaagttagaggaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaa 37424626  T
Q  225 acttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37424627 acttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggactaatccaata-caattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 37424709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27186165 - 27185874
Alignment:
Q  22 tgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggac 121  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||    
T  27186165 tgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataataccattcactatttaatcataataccttaacaaggcataagac 27186066  T
Q  122 caaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  |||    
T  27186065 caaaatgatactaattaataaaattagaggacccacataaaacaaaccctaacatttatttgaataaaacta-caggaaggactaaatgtagtaaaagtg 27185967  T
Q  221 agaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27185966 agaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaagaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagcc 27185874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 32288254 - 32288521
Alignment:
Q  41 ttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaat 140  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32288254 ttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcaatcactatttaatcataatactttaacaaggcatatgaccaaaataatactaataaat 32288353  T
Q  141 aaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32288354 aaagttagaggacccacataacacaaactctaacattatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtattaacagtgataaacttagaggaccgaaa 32288453  T
Q  241 taaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32288454 taaatcaatttttagttagaggaccaatctaatatcaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaatt 32288521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 24040240 - 24040537
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  24040240 atgtgggtacctgacctcctgttttacacatacatatgaacaataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatat 24040339  T
Q  119 gaccaaaat--gatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaa 215  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  24040340 gaccaaaatatgatactaataaataaagttagaagacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaggaa 24040439  T
Q  216 cggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24040440 cggtgagaaacttaaaggactgaaataagtcaatttttagttagaggatcaatccgatactaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcc 24040537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Original strand, 34264503 - 34264790
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  34264503 atgtgggtacctgacctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatag 34264602  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||     
T  34264603 aaccaaaatgatattaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaaccaacagaaatgactaaatgtaataaca 34264702  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaa----taaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
     ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34264703 atgagaaacttagaggaccgaaataattaaatcaatttttagttagaggaccaattcaataccaattaaatagttggaggaccaaaaa 34264790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11316238 - 11315970
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| | ||||   || |||||||||||||||    
T  11316238 tgacctcatgttttacacatacatatgaaccataacagttaccaataatataagtcaatatttaatcataat-tgttaa---gacataggaccaaaatga 11316143  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||    
T  11316142 tactaataaataaagttagaggacctacataacacaaaccctaacgtttattggaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaatagtaagaaactt 11316043  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11316042 agaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaaaggacaaaaaa 11315970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 301
Target Start/End: Original strand, 35569964 - 35570218
Alignment:
Q  48 atacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagtta 147  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35569964 atacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataacttaacaaggaataagaccgaaatgatactaataaataaagtta 35570063  T
Q  148 gaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatc 246  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  35570064 gaggactcacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaagtgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagactaaaataaatc 35570163  T
Q  247 aatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35570164 aatttttagttagaggagtaatcaaataccaattaaatagttagaggacaaaaaa 35570218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38958886 - 38958724
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958886 acccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 38958787  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958786 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 38958724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 71 - 314
Target Start/End: Original strand, 25567195 - 25567439
Alignment:
Q  71 ccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaact 170  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25567195 ccaataatattagtcactatttaatcataatactttaacaaggcatatgactaaaataatactaataaataaagttagaggactcacataaca-aaaact 25567293  T
Q  171 -taac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaat 268  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25567294 ctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaaggatcaaaataaatcaatttttagttaaagaaccaat 25567393  T
Q  269 ccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  25567394 ccgataccaattaaatagttaaaggactaaaaaagtaatttagcct 25567439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39325573 - 39325414
Alignment:
Q  153 cccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattt 251  Q
    ||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39325573 cccacataacagaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattt 39325474  T
Q  252 ttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39325473 ttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagtcagaggaccaaaaaggtaattaag 39325414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24040247 - 24040078
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24040247 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtggaccgaaataaatcaatt 24040148  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaatt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  24040147 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaaaggaccaaaaagataattaagtctaaaatt 24040078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 25182941 - 25183100
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25182941 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagcaacattgagaagcttagaggaccgaaataaatcaatt 25183040  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25183041 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 25183100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 27186161 - 27186324
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27186161 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatt 27186260  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27186261 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcct 27186324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35569934 - 35569777
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35569934 cacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 35569835  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35569834 agttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaagaccaaaaaggtaattaag 35569777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Original strand, 39325636 - 39325805
Alignment:
Q  145 ttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataa 243  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39325636 ttagaggagccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagtactaaatgtaataacaatgagaaacttagaggaccgaaataa 39325735  T
Q  244 atcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  39325736 atcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaataattagaggactaaaaatgtaatttagcc 39325805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36440362 - 36440198
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36440362 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 36440263  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36440262 tttagttagaggatcaatctgataccaactaaatagttagaggatcaaaaaggtaattaagccta 36440198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 155 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16860462 - 16860303
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16860462 cacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaattttt 16860363  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16860362 agttagaggaccaatctgataccgattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcc 16860303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32288237 - 32288079
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32288237 ccacataacacaaacctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaattttt 32288138  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32288137 agttagatgaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 32288079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37424400 - 37424262
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37424400 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 37424301  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37424300 ccaaataaatagttagaggatcaaaaagataattaagcc 37424262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 294
Target Start/End: Original strand, 9989611 - 9989754
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9989611 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 9989710  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagga 294  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9989711 tttagttagaagatcaatccgataccaattaaataggtagagga 9989754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 204 - 313
Target Start/End: Original strand, 1140106 - 1140215
Alignment:
Q  204 taaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1140106 taaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaagg 1140205  T
Q  304 taattaagcc 313  Q
     |||||||||    
T  1140206 caattaagcc 1140215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 185 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19184725 - 19184598
Alignment:
Q  185 taaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaat 284  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19184725 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaaaccgataccaattaaat 19184626  T
Q  285 agttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19184625 agttagaggaccaaaaaggtaattaagc 19184598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 292
Target Start/End: Original strand, 2183231 - 2183372
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2183231 acccacataagacaaaccttaatgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttacagaaccgaaataaatcaatt 2183330  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagag 292  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2183331 tttagttaaaggatcaatccgataccaattaaatagttagag 2183372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 285
Target Start/End: Original strand, 11316244 - 11316376
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11316244 ccacataacacaaaccctaacgtttattcgaataaaattaatagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 11316343  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaata 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11316344 tagttagaggaccaatccgataccaattaaata 11316376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 172 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29199093 - 29198952
Alignment:
Q  172 aactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||       
T  29199093 aactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttaattagaggactaattta 29198994  T
Q  272 ataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  29198993 atatcaattaaatagttagagga--tgaaaggtaattaagccta 29198952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Original strand, 16860458 - 16860588
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  16860458 atgtgtgtatctgacctcctgtttcaaacatgcatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagacatgg 16860557  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttaga 149  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16860558 aaccaaaatgatactaataaataaagttaga 16860588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34264478 - 34264350
Alignment:
Q  197 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagg-----------accaatccgataccaattaaata 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           |||||||| | ||||||||||||    
T  34264478 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagagggccaatccaacaccaatccaacaccaattaaata 34264379  T
Q  286 gttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34264378 gttagaggatcaaaaaggtaattaagcct 34264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 149
Target Start/End: Original strand, 16860596 - 16860705
Alignment:
Q  40 tttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaa 139  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16860596 tttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactaattaatcataatacattaacaagacataagaccaaaatgatactaataaa 16860695  T
Q  140 taaagttaga 149  Q
    ||||||||||    
T  16860696 taaagttaga 16860705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 315
Target Start/End: Original strand, 31756630 - 31756754
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 290  Q
    ||||| ||| ||| |||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  31756630 taacagaaatgacaaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggactaaaccgttaccaattaaatagttag 31756729  T
Q  291 aggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
      |||||||||||||||||| ||||    
T  31756730 gagaccaaaaaggtaattaaaccta 31756754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 314
Target Start/End: Original strand, 19185504 - 19185635
Alignment:
Q  183 aataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 282  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||||||    
T  19185504 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccaatactaattaa 19185603  T
Q  283 atagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  19185604 atagttaagggaccaaaaaggtaatttagcct 19185635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 244 - 313
Target Start/End: Original strand, 19128434 - 19128503
Alignment:
Q  244 atcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128434 atcaatttttagttagaggatcaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 19128503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Original strand, 29199117 - 29199249
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| |  ||||||    
T  29199117 ctgagctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttatcaataacatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaattaaaatg 29199216  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataa 161  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  29199217 atactaataaataatgttagaagatccacataa 29199249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 308
Target Start/End: Original strand, 33817659 - 33817729
Alignment:
Q  238 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  33817659 aaataaataaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagagaatcaaaaaggtaatt 33817729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2596440 - 2596386
Alignment:
Q  261 ggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2596440 ggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatttagccta 2596386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 308
Target Start/End: Original strand, 2597377 - 2597465
Alignment:
Q  220 gagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||   |||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  2597377 gagaaagttaaaggaccaaaataaatcaaaatttagttaagagaccaaaccaaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaagataatt 2597465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17339859 - 17339794
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||    
T  17339859 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaagcatttaagcct 17339794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 3722079 - 3722131
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  3722079 tttttagttaaaggaccaaagcgataccaattaaatatttaagggaccaaaaa 3722131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6157200 - 6157160
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagtta 289  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6157200 tttttagttaaaggaccaaagcgataccaattaaatagtta 6157160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6356580 - 6356284
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6356580 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 6356481  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6356480 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccatataacacaaaatctaactttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacgg 6356381  T
Q  219 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6356380 taaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaaggtaattaaaccta 6356284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 44332674 - 44332969
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  44332674 atgtgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatag 44332773  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44332774 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacagaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacg 44332873  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44332874 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatttgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 44332969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Original strand, 41453170 - 41453450
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  41453170 ctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatg 41453269  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41453270 atgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaact 41453369  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41453370 tagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 41453450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10526605 - 10526309
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  ||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||  || |    
T  10526605 atgtgggtacctggcctcttgtttcacaaatacatatgaaacataacagttaccaataatatcagtcaatatttaatcataataccttaac-aggcattg 10526507  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10526506 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacg 10526407  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10526406 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 10526309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6357050 - 6356764
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||    
T  6357050 ctgacctcctctttcacacatacatatgaaccataacagttatcaataatatcaatcactgtttaatcataataccttaacaaggaatagaaccaaaatg 6356951  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6356950 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaacactaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaact 6356851  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6356850 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 6356764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 31638108 - 31638393
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  31638108 ctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatg 31638207  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  31638208 atactaataaataaagttagaggatccacatgacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaatt 31638307  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31638308 taaaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagaaccaaaaaggtaatttagcc 31638393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 48626218 - 48626514
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  48626218 atgtgagtatctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatat 48626317  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  48626318 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacg 48626417  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48626418 gtcagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 48626514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33716879 - 33716600
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||    |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  33716879 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacata----tgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacaagacatag 33716784  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33716783 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacg 33716684  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33716683 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 33716600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 19681650 - 19681946
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||| ||| |||     
T  19681650 atgtgggtatttgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcaatatttaatcataatgcattaacaagaaatat 19681749  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  19681750 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaagagaaatgactaaatgtagtaacg 19681849  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19681850 gtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagtcagaggaccaaaaaggtaatttagcct 19681946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41751945 - 41751650
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  41751945 atgtgggtatatgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataacttaacaagacatag 41751846  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41751845 gaccaaaataatactaataaataaagttagaagatccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggattaaatgtagtaacg 41751746  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  41751745 gttagaaacttagaggaccgaaataagtcaatttttagttagaggactaatccaatatcaattaaatagttaaaggaccaaaaagataatttagcc 41751650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17359471 - 17359174
Alignment:
Q  28 tctgacctcctatttcacacatacaaat----gaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggacca 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||    ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  17359471 tctgacctcctctttcacacatacatatatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagaaataggacca 17359372  T
Q  124 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17359371 aaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgag 17359272  T
Q  223 aaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaattta 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  17359271 aaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttaaagaac--aaaaagtaatttagtctagaattta 17359174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 41191837 - 41192130
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataa---cagtcactatttaatcataatatcttaacgagata 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |    
T  41191837 atgtgggtatctgacctcatgtttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataataatatcagtcactatttaatcataataccttaataagaaa 41191936  T
Q  116 taggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagta 214  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41191937 tatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagta 41192036  T
Q  215 acggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41192037 acagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttttacttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 41192130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8542785 - 8542491
Alignment:
Q  28 tctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||    
T  8542785 tctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccagtaatatccgtcaatatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaat 8542686  T
Q  128 gatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaac 226  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8542685 gatgctaataaataaagttagaagacccacacaacacaaactctgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaac 8542586  T
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaattt 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  8542585 ttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaagacgaaaaaggtaatttagcctacaattt 8542491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 21391355 - 21391640
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| || |||||||    
T  21391355 ctgacctcctgtttcacacatatatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagatcaaaatg 21391454  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21391455 atactaataaataaagttagatgatccacataacacaaacactaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaagagtgagaaact 21391554  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  21391555 tagaggaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaatgtaatttagcc 21391640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 7579027 - 7579317
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  7579027 atgtgggtacctgacctcctgttttacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggaataa 7579126  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7579127 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacaaaaaccataacgtttatttgaatataactaaaataaaggactaaatgtagtaacg 7579226  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7579227 gtgagaaaattagatgatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaagaccaaaaagataatt 7579317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 28286272 - 28286562
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||    
T  28286272 atgtgggtgtctgacctcctgtttcacacatagatatgaaccattacagttgccaataatatcggtcactatttaatcataataccttaagaaggaatag 28286371  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  28286372 ttccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatataaagaactaaatgtagtaacg 28286471  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28286472 gtgagaaacttagaggaccgaaatcaatcaatttttagttaaaggactaatccgataccaattaaaaagttagaggaccaaaaatgtaatt 28286562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43247710 - 43247413
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||     
T  43247710 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataccagttaccagtaatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgcataa 43247611  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaaca-aaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  43247610 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacataaacctaatgtttatttgaataaaactaatagaaagggagtaaatgtagtaacg 43247511  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  43247510 gtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgatatcaattaaatagttagaggacaaaaaatataattcagccta 43247413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Original strand, 34037076 - 34037356
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||    
T  34037076 ctgacctcctgttttacacatacatatgaatcataacagttacaaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaaaaatatgaccaaaatg 34037175  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  34037176 atattaataaataaagttagaggacccacataacataaactctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgcagtaacggagataaact 34037275  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34037276 tagaggaccgaaataaatcaatttttagtcagaggactaatcatataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatt 34037356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1114330 - 1114059
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||         |  ||||||||| ||||    
T  1114330 ctgacctcctatttcacacatatatatgaaccataacagttaccaataatacccgtcactatttaatcataata---------ggaataggaccacaatg 1114240  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  1114239 atgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatttagtaactgtgtgaaact 1114140  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1114139 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 1114059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 8937004 - 8937300
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| ||  |||     
T  8937004 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccaaaacagttaccaataatatcaatcactatttaatcacaataccttaacaaggaatat 8937103  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8937104 gaccaacatgatattaataaataaagttagagaacccacataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaaca 8937203  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  8937204 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaacttttaattagaggacaaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaaatataatttagcct 8937300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28298103 - 28297840
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||    
T  28298103 tgacctcctgtttcacagatacatatgaaccataaaagttattaataatatcagtcactatttaatcataataccttaactagtcatatgaccaaaatga 28298004  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28298003 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacggtgagaaactt 28297904  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagag 292  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28297903 agagaactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagag 28297840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 35146854 - 35147134
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  35146854 atgtgggtatctgacctc-tgtttcacacttacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatat 35146952  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||         |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35146953 gaccaaaatgatattgataaataaagttagag---------aacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacg 35147043  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35147044 gtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaaattttagttagaggactaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatt 35147134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36423664 - 36423391
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||    
T  36423664 atgtgggtacctgatctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccgatagtatcagtcactatttgatcataataccttaaccaggtatag 36423565  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| || | |||     
T  36423564 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagaaccaaaagtggcaaca 36423465  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaga 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  36423464 gtgagaaacttagaggaccaaaataaattaatttttagttagaggaccaatctaatgccaattaaatagttaga 36423391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 10526598 - 10526762
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10526598 acccacataacacaaaacttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 10526697  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10526698 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacaaaaaagataattaagccta 10526762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 6356573 - 6356736
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6356573 acccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 6356672  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6356673 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttataggaccaaaaaggtaattaagcct 6356736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35146861 - 35146694
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35146861 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 35146762  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35146761 tttagttagaggaccaatccgatactaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccaagaa 35146694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 155 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48626222 - 48626063
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48626222 cacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 48626123  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48626122 agttagagaaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 48626063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41453167 - 41453005
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41453167 acccatataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 41453068  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41453067 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 41453005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 31075485 - 31075644
Alignment:
Q  156 acataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 254  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31075485 acataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaacaaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 31075584  T
Q  255 gttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31075585 attggaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcct 31075644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Original strand, 40673162 - 40673378
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||| ||  |||     
T  40673162 atgtgggtgtctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacacttaccaataatatcagtcactatttaattctaatactttaacaaggcatat 40673261  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  40673262 gactaaaat--tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatatagtaacg 40673359  T
Q  218 gtgagaaacttagaggacc 236  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40673360 gtgagaaacttagaggacc 40673378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7579034 - 7578872
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7579034 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgaagtaacattgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 7578935  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7578934 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagcc 7578872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17750097 - 17749935
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17750097 acccatataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatt 17749998  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17749997 tttagttagagaaccaatctgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 17749935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21391350 - 21391189
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21391350 ccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaagactaaatgtagtagcggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 21391251  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21391250 tagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 21391189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8937011 - 8936847
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8937011 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaaaagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 8936912  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8936911 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggactaaaaagataattaagccta 8936847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Original strand, 1114333 - 1114504
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1114333 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagagtaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 1114432  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaattta 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  1114433 tttagttagaggaccaatccgataacaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccaataattta 1114504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7909461 - 7909297
Alignment:
Q  139 ataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccg 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7909461 ataaagttagaggatccacataacacaaactataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccg 7909362  T
Q  238 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7909361 aaataaatcaatttttagttagaaaaccaatctgataccaattaaatagttaaaggacaaaaaag 7909297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 295
Target Start/End: Original strand, 36423657 - 36423801
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36423657 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 36423756  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggac 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36423757 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggac 36423801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28286279 - 28286116
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28286279 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 28286180  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  28286179 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaagaccaaaaatataattaagcct 28286116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 147 - 308
Target Start/End: Original strand, 4931556 - 4931718
Alignment:
Q  147 agaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaat 245  Q
    |||||||  ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4931556 agaggacttacataacacaaattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactgaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataatt 4931655  T
Q  246 caatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4931656 caatttttagttagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 4931718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19681657 - 19681496
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19681657 acccacataacacaaaccctaacgtttattcgactaaaactaacagaaaggaataaatgtagtaacggcaaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 19681558  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19681557 tttagttagaggaccaatccaataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 19681496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Original strand, 6357055 - 6357215
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6357055 ccacatagcacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaactgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 6357154  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  6357155 tagttagaggaccaatccgatactaactaaataattagaggatcaaaaatgtaattaagcc 6357215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 190 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36674098 - 36673976
Alignment:
Q  190 ctaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagtta 289  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36674098 ctaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagtta 36673999  T
Q  290 gaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  36673998 gaggaccataaaggtaattaagc 36673976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41191844 - 41191683
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  41191844 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaactgaaataaaccaatt 41191745  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41191744 tttagttagaggaccaatccaatatcaactaaatagttagagga-taaaaaggtaattaagcc 41191683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31638103 - 31637946
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||| ||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  31638103 ccacgtaacacaaaccctaacgtttatatgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtggttcgaaataaatcaatttt 31638004  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31638003 tagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggactaaaaaggtaattaa 31637946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 185 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4155726 - 4155596
Alignment:
Q  185 taaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaat 284  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4155726 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaaaccgataccaattaaat 4155627  T
Q  285 agttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4155626 agttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 4155596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16867840 - 16867707
Alignment:
Q  180 ttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaat 279  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16867840 ttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtaagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaat 16867741  T
Q  280 taaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16867740 tatatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 16867707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 314
Target Start/End: Original strand, 27738935 - 27739115
Alignment:
Q  134 aataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagag 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  27738935 aataaataaagttagaggacccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaag-attaaatatagtaacggtgagaaactaaaag 27739033  T
Q  233 gaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| || ||  |||| |||||| |||||    
T  27739034 gaccgaaataaatcaatttttagttaggggatcaatctgataccaaataaatagttaaagaacagaaaaagtaatttagcct 27739115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Original strand, 8542793 - 8542946
Alignment:
Q  158 ataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 256  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8542793 ataacacaaaccctaacatttatttgaataaaacta-cagaaaggattaaatgtagtcacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 8542891  T
Q  257 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8542892 tagaggatcaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaag 8542946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 294
Target Start/End: Original strand, 7909460 - 7909597
Alignment:
Q  158 ataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 256  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7909460 ataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtactaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagt 7909559  T
Q  257 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagga 294  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7909560 tagaggaccaatccaatatcaattaaatagttagagga 7909597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 201 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8416597 - 8416484
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8416597 gactaaatgtagtaacagtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 8416498  T
Q  301 aggtaattaagcct 314  Q
    |||||||| |||||    
T  8416497 aggtaatttagcct 8416484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 310
Target Start/End: Original strand, 17363532 - 17363683
Alignment:
Q  158 ataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 256  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17363532 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacattga--aacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagt 17363629  T
Q  257 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  17363630 tagaggacaaatccaataccaattaaatagttagagaaccaaaaatataattaa 17363683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41892088 - 41891966
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41892088 taacagaaaggactaaatgtagtaacattaagaaacttaagggaccgaaagaaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 41891989  T
Q  291 aggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||| |||||| ||||    
T  41891988 aggaccaaaaaagtaatttagcc 41891966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Original strand, 41751962 - 41752103
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41751962 tttatttgattaaaactaacagaaagaactaaatatggtaacagatagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 41752061  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaa-ggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  41752062 ccaattaaatagttagaggataaaaaattgtaattaagccta 41752103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 291
Target Start/End: Original strand, 28298107 - 28298247
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28298107 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaatcgaaataaatcaatt 28298206  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaga 291  Q
    |||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  28298207 tttaattagagggtaaatctgataccaattaaatagttaga 28298247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36282894 - 36282786
Alignment:
Q  205 aaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  36282894 aaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggactaaaaatgt 36282795  T
Q  305 aattaagcc 313  Q
    |||| ||||    
T  36282794 aatttagcc 36282786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 191 - 314
Target Start/End: Original strand, 29277671 - 29277794
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 290  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  29277671 taacagaaaggacgaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgttaccaaataaatagttag 29277770  T
Q  291 aggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29277771 aggaccaaaaaggtaattaagcct 29277794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 308
Target Start/End: Original strand, 36283533 - 36283651
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagga-ccaatccgataccaattaaatagtta 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  36283533 taacaaaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaatttaagggacggaaataaatcaatttttagttagaggatcaaatccgataccaattaaatagtta 36283632  T
Q  290 gaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||| || ||||| ||||||    
T  36283633 gagaacaaaaaatgtaatt 36283651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 313
Target Start/End: Original strand, 8417285 - 8417386
Alignment:
Q  212 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8417285 gtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaattaatttttagttaaaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttag 8417384  T
Q  312 cc 313  Q
    ||    
T  8417385 cc 8417386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29276961 - 29276877
Alignment:
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29276961 ttagaggaccaaaataaatcattttttaattagaggaccaaaccgttaccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaag 29276877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 285
Target Start/End: Original strand, 33716872 - 33717005
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  33716872 acccacataacaccaaccctaacgtttatttgaacaaaattaacataaatgactaa-tgtagtaacaatgagaaacttaaatgaccgaaataaattaatt 33716970  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaata 285  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  33716971 tttagttagatgatcaatccgatatcaattaaata 33717005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 280
Target Start/End: Original strand, 32946669 - 32946758
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaatt 280  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32946669 taacagaaaggactaaatgtactaacagtgaaaaacttagaaaaccgaaataaatcaatttttagttagagtaccaatctgataccaatt 32946758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 314
Target Start/End: Original strand, 36674095 - 36674180
Alignment:
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36674095 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaa--gactaacccgataccaattaaatagtcagaggaccaaaaaggtaatttagcct 36674180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 301
Target Start/End: Original strand, 41893416 - 41893513
Alignment:
Q  204 taaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  41893416 taaatgtagtaacggtgaaaaacttaaggaatcgaaataaataaatttttagttagatgaccaatccgatattaattaaatagttaaaggacaaaaaa 41893513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40673169 - 40673014
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac---tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaa 248  Q
    |||||||||||||||| | ||||   ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||  |||||||| ||    
T  40673169 acccacataacacaaatcctaacgtgtttatttgaa---aactaacagaaaggactaaatgtagtaacaatgaaaaacttacagaactcaaataaattaa 40673073  T
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
     |||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  40673072 attttagttagaggatcaa---gataccaattaaatagatagagga-caaaaatgtaattaag 40673014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 315
Target Start/End: Original strand, 36423790 - 36423852
Alignment:
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36423790 tagttagaggacaaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 36423852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28263626 - 28263494
Alignment:
Q  183 aataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 282  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||  ||||| |||  | ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  28263626 aataaaactaacggaaacgactaaaggtggtaacgggaagaaatttaaggtaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 28263527  T
Q  283 atagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||| ||||||    
T  28263526 atagttaagggatcaaaaaagtaatttagccta 28263494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 308
Target Start/End: Original strand, 4156509 - 4156634
Alignment:
Q  183 aataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 282  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||   |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||| ||||||    
T  4156509 aataaaattaacgaaaaagactaaaagtagtaacagagagaaatttaagagaccaaaataaatcaaattttagttagggtaccaaacagatactaattaa 4156608  T
Q  283 atagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||    
T  4156609 atagttaagggaccaaaaaggcaatt 4156634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 17363524 - 17363439
Alignment:
Q  28 tctgacctcctatttcacacatacaaat----gaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaac 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||    ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17363524 tctgacctcctctttcacacatacatatatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaac 17363439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 315
Target Start/End: Original strand, 38677053 - 38677130
Alignment:
Q  238 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  38677053 aaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatttagccta 38677130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 310
Target Start/End: Original strand, 38447691 - 38447778
Alignment:
Q  219 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |    ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38447691 tgagaaacttaagggactgaaataaatcaatttttaat----ggatcaatctaatatcaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaa 38447778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 313
Target Start/End: Original strand, 40263616 - 40263697
Alignment:
Q  232 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  40263616 ggaccaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatatttaagggaccaaaaaggtaatttagcc 40263697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 303
Target Start/End: Original strand, 28264608 - 28264728
Alignment:
Q  183 aataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 282  Q
    |||||||||||   |||||| |||| ||||||||   ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||   ||||| ||||||    
T  28264608 aataaaactaatggaaaggattaaaagtagtaacatagagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaaaagaccaaattgatactaattaa 28264707  T
Q  283 atagttagaggaccaaaaagg 303  Q
    |||||||  |||| |||||||    
T  28264708 atagttaatggactaaaaagg 28264728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 17359479 - 17359538
Alignment:
Q  158 ataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaac 216  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17359479 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaac 17359538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 109
Target Start/End: Original strand, 17750101 - 17750180
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaac 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||  |||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17750101 tgacctcttgtttcacacatacatatgaactataaaagttatcaataatatcagtcattatttaatcataataccttaac 17750180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38447682 - 38447600
Alignment:
Q  137 aaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |  |  ||||||||||||||| | | | ||| || ||||||||||||||||    
T  38447682 aaataaagttagaggatccacataacacaaacccaatatttatttgaataaaatttaaagaaatgattaaatgtagtaacggt 38447600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43050465 - 43050395
Alignment:
Q  232 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  43050465 ggaccaaaataaatcaatttttaattaggggaccaaaccaatattaattaaatagttaagggaccaaaaag 43050395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 265
Target Start/End: Original strand, 46540017 - 46540070
Alignment:
Q  212 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacc 265  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46540017 gtaacggtgagaaacttaagggattgaaatgaatcaatttttagttagaggacc 46540070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29277020 - 29276950
Alignment:
Q  197 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 267  Q
    ||||||| |||| | ||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  29277020 aaaggacgaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaagaaatcattttttaattagaggaccaa 29276950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 315
Target Start/End: Original strand, 48095356 - 48095422
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||    
T  48095356 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaagcatttaagccta 48095422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Original strand, 42287806 - 42287871
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||    
T  42287806 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaagagtatttaagcct 42287871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8090885 - 8090833
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8090885 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 8090833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18458340 - 18458276
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| |||||||    
T  18458340 tttttagttaagggaccaaaacgataccaattaaatagttaagggaccaaaagagtatttaagcc 18458276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 314
Target Start/End: Original strand, 36507116 - 36507196
Alignment:
Q  234 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||| |||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||    
T  36507116 accgaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatactaattaaatagttaagagaccaaaaacataatttagcct 36507196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38676138 - 38676070
Alignment:
Q  233 gaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38676138 gaccaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaatcaattaaatagttaagggaccaaaaa 38676070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41691989 - 41691937
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41691989 tttttagttaagggaccaaaacgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 41691937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 6137533 - 6137825
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6137533 atgtggatgtctgacctcctatttcacacagacaaatgaaacataacaattacaaataatatcactcactatttaatcataatatcttaacgagatatat 6137632  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6137633 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaatctaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 6137732  T
Q  219 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6137733 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 6137825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 5937968 - 5938258
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  5937968 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatag 5938067  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  5938068 aaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatt 5938167  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5938168 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaataattagatgaccaaaaaggtaatt 5938258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Original strand, 5639340 - 5639618
Alignment:
Q  31 gacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgat 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  5639340 gacctcctatttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgat 5639439  T
Q  131 actaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactta 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5639440 actaataaataaagttagagaacccacataacacaaaccataatgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtaagaaactta 5639539  T
Q  230 gaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  5639540 gaggaccgaaataaataaatttttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaagatcaaaaatgtaatt 5639618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9046381 - 9046086
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  9046381 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatagcttaacaaggcataa 9046282  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9046281 gaccaaaatgatactaataaataaatttagaggacccacataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacg 9046182  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9046181 gtgacaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttacttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcc 9046086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 315
Target Start/End: Original strand, 21856720 - 21857007
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  21856720 ctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttatcaataatatccgtcactgtttaatcataataccttaacaaggaataagaccaaaatg 21856819  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21856820 atgctaataaataaagttagaggacccatataacaaaaaccataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 21856919  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21856920 tagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatacttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 21857007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18053245 - 18052954
Alignment:
Q  22 tgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggac 121  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||    
T  18053245 tgggtatctgacatcctgtttcacacatacata---accataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcatagaac 18053149  T
Q  122 caaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  18053148 caaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacagtg 18053049  T
Q  221 agaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||    
T  18053048 agaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaaaggatcaaaaaagtaatttagccta 18052954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 40 - 315
Target Start/End: Original strand, 32993191 - 32993467
Alignment:
Q  40 tttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaa 139  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32993191 tttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataacaccttaacaaggcataagaccaaaatgatactaataaa 32993290  T
Q  140 taaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccga 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32993291 taaagttagaggacccacataatacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagaaacggtgagaaacttataggaccga 32993390  T
Q  239 aataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  32993391 aataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatataatttagccta 32993467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5311121 - 5310826
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||     
T  5311121 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaatgaatat 5311022  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5311021 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaaca 5310922  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5310921 gtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttttagttataggactactctgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcc 5310826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32753468 - 32753177
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  32753468 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacacttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatag 32753369  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  32753368 gacc----ttatactaataaatacagttagaggacccacataacacaaaccttaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacg 32753273  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32753272 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 32753177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 6236076 - 6236369
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  6236076 atgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatag 6236175  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||     
T  6236176 gaccaagatgatactaataaatgaagttagaggattcacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatttagtaact 6236275  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6236276 gttagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatcaaatatcaattaaatagttaggggaccaaaaaagtaattaag 6236369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34890939 - 34890642
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||  |||     
T  34890939 atgtgggtacctgaccttctgtttcacacacacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataatactttaacaaggcatat 34890840  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||     
T  34890839 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtaataaca 34890740  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34890739 gtgagaaactttgaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggaacaaaaaggtaatttagccta 34890642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2517297 - 2517007
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||     
T  2517297 atgtgagtatctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccactaatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagaatat 2517198  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  2517197 gaccaaaatgattcttataaataaagttggaggacccacataacacaaacactaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaaca 2517098  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2517097 gtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 2517007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 63 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24744579 - 24744334
Alignment:
Q  63 aacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataac 162  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744579 aacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagaaataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataac 24744480  T
Q  163 acaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 261  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744479 acaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgcagtaacggtgtgaaagttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 24744380  T
Q  262 gaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24744379 gactaatccgataccaattaaatagttagagga-caaaaaggtaatt 24744334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 313
Target Start/End: Original strand, 34994546 - 34994830
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||    
T  34994546 tgacctcgtgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataagaccaaaatga 34994645  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34994646 tactaataaatcaagttagaggacccgcataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgcagtaacagtgagaaactt 34994745  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  34994746 agaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagatgactaaaaaggtaatttagcc 34994830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7270248 - 7269950
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||     
T  7270248 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttatcaacaatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggcatat 7270149  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaa--ctaacaaaaaggactaaatgtagtaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||    
T  7270148 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacatttatttaaataaaaaactaacagaaatgactaaatgtagtaa 7270049  T
Q  216 cggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||    
T  7270048 cggtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggattaaaaaagtaatttagcct 7269950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 61 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26600610 - 26600356
Alignment:
Q  61 ataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacata 160  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26600610 ataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcataataccttaataaggaatatgaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacata 26600511  T
Q  161 acacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttag 259  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26600510 acacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgataaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttag 26600411  T
Q  260 aggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  26600410 aggactaatccgataccaatttaatagttagaggaccaaaaagataatttagcct 26600356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26957247 - 26956968
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  26957247 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacacttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatg 26957148  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26957147 atactaataaataaagctagaggacccccataacataaactttaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtaagaaact 26957048  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  26957047 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttag-------aaccgatatcaattaaatagttggaggacaaaaaatgtaatttagcct 26956968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31238041 - 31237751
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  ||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||  | |     
T  31238041 atgtgggtacctgacttcctgtttctcacatacatatgaaccataacagttaacaataatatctgtcattatttaatcataataccttaacaaggaacat 31237942  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31237941 gatcaaaataatactaataaataaagttagaggacccacataaaacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacg 31237842  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31237841 gtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagagaactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 31237751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31247411 - 31247121
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  31247411 atgtgggtacctgacttcctgtttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatctgtcattatttaatcataataccttaacaaggaatat 31247312  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  31247311 gatcaaaatgatactaataaataaagttagaggactcacataaaacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacg 31247212  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31247211 gtgagaaacttagaacaccgaaataaatcaatttttagttagagaactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 31247121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 314
Target Start/End: Original strand, 21540185 - 21540429
Alignment:
Q  72 caataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaactt 171  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  21540185 caataatatcaatcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggatcaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacgcaaaccct 21540284  T
Q  172 aac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatcc 270  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  21540285 aacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggactaatct 21540384  T
Q  271 gataccaattaaatagttagaggacc-aaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  21540385 gataccaattaaatagttaaaggaccaaaaaaggtaatttagcct 21540429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7270913 - 7270672
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||    
T  7270913 tgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatga 7270814  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7270813 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatatagtaacggtaagaaactt 7270714  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatcc 270  Q
    | | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7270713 aaaagatcaaaataaatcaatttttaattagaggaccaatcc 7270672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 3423325 - 3423574
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||     
T  3423325 atgtgggtacctgacctcctgtttaacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcgtaataccttaacaaggcataa 3423424  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3423425 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacatatcacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacg 3423524  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  3423525 gtgagaaaattagaggaccgaaataaaccaatttttaattagcggaccaa 3423574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6532377 - 6532192
Alignment:
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  6532377 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatcactaaatgtagtaacggtgagaaatt 6532278  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6532277 tagagaaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgatacaaattaaatagttagaggacaaaaaaggtaattaagcc 6532192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Original strand, 25176834 - 25177032
Alignment:
Q  41 ttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaat 140  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  25176834 ttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatttgtcactatttaatcataatatcttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaat 25176933  T
Q  141 aaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccga 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176934 aaagttagaggccccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccga 25177032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 314 - 463
Target Start/End: Original strand, 33857032 - 33857181
Alignment:
Q  314 tagaatttatatattcctattaatttcttctttctatatttgaatagagaatttgaaattggtccattgtttctatatttaaaatttattattttaccat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33857032 tagaatttatatattcctattaatttcttctttctatattcgaatatagaatttgaaattgttccattgtttctatatttaaaatttattattttaccat 33857131  T
Q  414 atttaaacaaattaattatgattggtattcataactccatttataatatt 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33857132 atttaaacaaattaattatgattggtattcataactcgatttataatatt 33857181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35167652 - 35167490
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35167652 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 35167553  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35167552 tttagttagaggatcaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 35167490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 9046374 - 9046537
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9046374 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaatagaactaacagaaaggactaaatgtagtagcggtgagaaacttagcggaccgaaataaatcaatt 9046473  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9046474 tttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 9046537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Original strand, 15932844 - 15933004
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15932844 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 15932943  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15932944 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaag 15933004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21856693 - 21856553
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21856693 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 21856594  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21856593 ccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccta 21856553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 175 - 311
Target Start/End: Original strand, 32753485 - 32753621
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32753485 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgata 32753584  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32753585 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 32753621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34994542 - 34994378
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34994542 acccacataacacaaattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 34994443  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34994442 tttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttaaaggaccaaaaaggtaattaaaccta 34994378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 978577 - 978414
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  978577 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 978478  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  978477 tttagttagaggatcaatacgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 978414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 155 - 313
Target Start/End: Original strand, 2517293 - 2517452
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517293 cacataacacagatcataacgtttatttaaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 2517392  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517393 agttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 2517452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3423332 - 3423169
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3423332 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 3423233  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3423232 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagaaccaaaatggtaattaagcct 3423169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 322
Target Start/End: Original strand, 18053265 - 18053412
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18053265 tttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagtaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 18053364  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaattta 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18053365 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaactaagcctataattta 18053412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 34890932 - 34891094
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34890932 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 34891031  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34891032 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa-gtaattaagcct 34891094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6137538 - 6137377
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6137538 ccacataacacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatca-tttt 6137440  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6137439 taattagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 6137377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6236083 - 6235919
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6236083 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgcagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 6235984  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6235983 tttaattataggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 6235919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5937975 - 5937816
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5937975 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 5937876  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5937875 tttagttagagaatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 5937816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25176819 - 25176665
Alignment:
Q  158 ataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 256  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25176819 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccataataaatcaatttttagt 25176720  T
Q  257 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25176719 tagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaag 25176665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Original strand, 5311114 - 5311274
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5311114 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttagagcaccgaaataaatcaatt 5311213  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5311214 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaactaag 5311274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Original strand, 31238034 - 31238196
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactta-gaggaccgaaataaatcaat 249  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31238034 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaagaggaccgaaataaatcaat 31238133  T
Q  250 ttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31238134 ttttagttagag-accaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 31238196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 178 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14276534 - 14276397
Alignment:
Q  178 atttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgatacca 277  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14276534 atttgaataaaactaatacaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccgaagtaaatcaatttttagttagaggatcaatccgatacca 14276435  T
Q  278 attaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14276434 attaaataggtagaggaccaaaaaggtaattaaaccta 14276397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Original strand, 31247404 - 31247566
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactta-gaggaccgaaataaatcaat 249  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  31247404 acccacataacacaaactttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaa-tgtagtaacggtgaaaaacttaagaggactgaaataaattaat 31247502  T
Q  250 ttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31247503 ttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 31247566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Original strand, 26600635 - 26600785
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26600635 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 26600734  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26600735 tttagttagaagaccaatccaataccaactaaatagttagaggacaaaaaa 26600785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 26957273 - 26957411
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  26957273 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctaata 26957372  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26957373 ccaattaaatagttagatgaccaaaaagataattaagcc 26957411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 315
Target Start/End: Original strand, 7270920 - 7271081
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7270920 cacataacacaaaccccaacgtttatttaaataaaactaatagaaaggactaaatatagtaacgatgagaaacttagaggactgaaataaatcaattttt 7271019  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7271020 agttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggcaattaagccta 7271081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32993173 - 32993017
Alignment:
Q  156 acataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 254  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32993173 acataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaccaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttta 32993074  T
Q  255 gttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
     ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32993073 cttagatgaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaagaaggtaattaag 32993017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 35167645 - 35167837
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatc--ataatatcttaacgagatat 116  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||   |    
T  35167645 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccattaatatcagtcactatttaatcatataataccttaacaaggatt 35167744  T
Q  117 aggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaat 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35167745 aggactaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttacttgaataaaactaacagaaaggattaaat 35167837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 185 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17244792 - 17244664
Alignment:
Q  185 taaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaat 284  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17244792 taaaactaacagaaatgacgaaatataataacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaaaccgataccaattaaat 17244693  T
Q  285 agttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17244692 agttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 17244664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 159 - 328
Target Start/End: Original strand, 10412796 - 10412966
Alignment:
Q  159 taacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtt 257  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10412796 taacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaatagaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtt 10412895  T
Q  258 agaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaatttatatatt 328  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| | || ||| |||||||    
T  10412896 agagaactaatccgataccaactaaatagttaaaagaccaaaaagataattaaggcaagtattaatatatt 10412966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7438920 - 7438803
Alignment:
Q  197 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacc 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7438920 aaagaactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggacc 7438821  T
Q  297 aaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  7438820 aaaaagataatttagcct 7438803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 313
Target Start/End: Original strand, 34518026 - 34518142
Alignment:
Q  197 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacc 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518026 aaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttaagggatcgaaataaatcaatttttagtttgaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacc 34518125  T
Q  297 aaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||| ||||    
T  34518126 aaaaaggtaatttagcc 34518142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Original strand, 7270265 - 7270405
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7270265 tttatttgaataaaattaacagaaaagactaaatgtagtaacgatgagaaatttagagaaccaaaaaaaattaatttttagttagaggatcaattcgata 7270364  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  7270365 ccaattaaatagttaaaggaccaaaaagataattaagccta 7270405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Original strand, 24744609 - 24744770
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  24744609 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtaataacagtgagaaacttaaagaatggaaataaatcaatt 24744708  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24744709 tttagttagaggaccaat-taataccaactaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcc 24744770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15932830 - 15932729
Alignment:
Q  213 taacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15932830 taacgatgagaaacttagaggatcaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagc 15932731  T
Q  313 ct 314  Q
    ||    
T  15932730 ct 15932729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6228857 - 6228730
Alignment:
Q  185 taaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaat 284  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6228857 taaaacaaacagaaatgacgaaatatagtaacggtgataaacttag-ggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaaaccgataccaattaaat 6228759  T
Q  285 agttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6228758 aattagaggactaaaaaggtaattaagcc 6228730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34517373 - 34517271
Alignment:
Q  212 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34517373 gtaacagtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgacaccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttag 34517274  T
Q  312 cct 314  Q
    |||    
T  34517273 cct 34517271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 197 - 314
Target Start/End: Original strand, 29261285 - 29261402
Alignment:
Q  197 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacc 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  29261285 aaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaagggaccgacataaatcaatttttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggact 29261384  T
Q  297 aaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||  ||||| |||||    
T  29261385 aaaaatataatttagcct 29261402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15286457 - 15286350
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15286457 gactaaatgcagtaacggtgagaaacttaagggattgaaataaatcaatttttagtcagaggaccaatccgacaccaattaaatagttagaggatcaaaa 15286358  T
Q  301 aggtaatt 308  Q
    ||||||||    
T  15286357 aggtaatt 15286350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 201 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29260642 - 29260526
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29260642 gactaaatgtagtaatg-tgagaaacttaagggaccgaaataaattaatttttagtttgaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccagaa 29260544  T
Q  301 aggtaattaagcctagaa 318  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  29260543 aggtaatttagcttagaa 29260526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 234 - 314
Target Start/End: Original strand, 25180219 - 25180299
Alignment:
Q  234 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25180219 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccagaaaggtaatttagcct 25180299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3036019 - 3035926
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaaca-aaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 267  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3036019 tttatttgaataaaattaacagaaaatgactaaatgtagtaagagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaagaccaa 3035926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 241 - 315
Target Start/End: Original strand, 35167833 - 35167907
Alignment:
Q  241 taaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35167833 taaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagccta 35167907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 6229643 - 6229772
Alignment:
Q  183 aataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 282  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  6229643 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttag-ggaccaaaccgatactaattaa 6229741  T
Q  283 atagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  6229742 atagttaagggaccaaaaaggcaatttagcc 6229772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34251656 - 34251553
Alignment:
Q  209 gtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  34251656 gtagtaacgatgagaaacttagaggatcgaaataaattaatttttagt--caggactaatccgataccaactaaataattagaggattaaaaaggtaatt 34251559  T
Q  309 aagcct 314  Q
     |||||    
T  34251558 tagcct 34251553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 313
Target Start/End: Original strand, 27829314 - 27829414
Alignment:
Q  212 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27829314 gtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttaattagaggaccaaactgttaccaattaaatagttggaggacc-aaaaggtaattaag 27829412  T
Q  312 cc 313  Q
    ||    
T  27829413 cc 27829414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 314
Target Start/End: Original strand, 17245580 - 17245711
Alignment:
Q  183 aataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 282  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  17245580 aataaaattaacggaaaagactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 17245679  T
Q  283 atagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||| |||  |||||||||| | |||| |||||    
T  17245680 ataattaagggaccaaaaatgcaatttagcct 17245711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1158669 - 1158579
Alignment:
Q  232 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaattta 322  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||  |||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  1158669 ggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgtaattaagccaataattta 1158579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22498448 - 22498408
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagtta 289  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22498448 tttttagttaaaggaccaaagcgataccaattaaatagtta 22498408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 84)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 12481217 - 12481511
Alignment:
Q  22 tgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggac 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  12481217 tgggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggac 12481316  T
Q  122 caaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12481317 caaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtg 12481416  T
Q  221 agaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12481417 agaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 12481511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37304323 - 37304026
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  37304323 atgtgggtgtctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatat 37304224  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37304223 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggaccctcataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacg 37304124  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37304123 gtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatggttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 37304026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 23476496 - 23476792
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  23476496 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattatcaataatatcaatcactatttaatcataataccttaacaagacatag 23476595  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  23476596 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaacattaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgaagtaaca 23476695  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23476696 atgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcct 23476792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16024192 - 16023897
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||     
T  16024192 atgtgggtgcctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataatacctcaacaaggcatat 16024093  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16024092 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggaccctcataacacaaaccctaacgtttatttgaataagactaacagaaaagactaaatgtagtaacg 16023993  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16023992 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcc 16023897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25996079 - 25995789
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||    
T  25996079 atgtgggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagccactatttaatcatattaccttaacaaggcatag 25995980  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  25995979 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggatccacataacacaaatctcaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaaca 25995880  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25995879 gtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttaattaaaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 25995789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 6797962 - 6798252
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  6797962 atgtgggtgcctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatat 6798061  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6798062 gaccaaaatgatactaataaataaaattagaggaccctcataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacg 6798161  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6798162 gtgagaaatttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaagaccaaaaagataatt 6798252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 1762829 - 1763125
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||| ||  |||     
T  1762829 atgtgggtatttgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcagaacactttaacaaggcatat 1762928  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1762929 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacg 1763028  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1763029 atgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatttgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 1763125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20306286 - 20305991
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||    
T  20306286 tgacctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatga 20306187  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20306186 tactaataaataaagttagaggactcacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaaccaacagaaatgactaaatgtaataacggtgggaaactt 20306087  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaatttata 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  20306086 agagaaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaaacctatattttata 20305991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 35612248 - 35612527
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  35612248 tgaccttctgtttcacacatacatatgaatcataacatttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatga 35612347  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  35612348 tactaataaataaagttagaggaccaacataacacagaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaataaatgtagtaacagtgataaactt 35612447  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35612448 agaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 35612527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Original strand, 8762564 - 8762850
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  8762564 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaactataacatttaccaataatatcagttactatttattcataataccttaacaagacatatgaccaaaatg 8762663  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8762664 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaactcttaacgtttatttgaataaagctaacagaaaggactaaatgtagtaccgatgagaaact 8762763  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  8762764 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagatgaccaaaaatgtaatttagcct 8762850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Original strand, 45052855 - 45053140
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||| | ||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  45052855 tgacctcttgtttcacacatacatataaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatga 45052954  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45052955 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacactgagaaactt 45053054  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45053055 agatgaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagcct 45053140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 49140298 - 49140592
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  49140298 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatat 49140397  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  49140398 aaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaaca 49140497  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  49140498 gtgagaaacttataggaccgaaataaatcaa-ttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcc 49140592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 27547824 - 27548119
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| |   ||||    
T  27547824 atgtgggtacctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaatagtatcagtcactatttaatcataatactttaacaaagcatag 27547923  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27547924 taccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataccataaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacg 27548023  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27548024 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggacaaaaaaggtaatttagcc 27548119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 40 - 315
Target Start/End: Original strand, 2064387 - 2064663
Alignment:
Q  40 tttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaa 139  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2064387 tttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatagtagtcactatttaatcataataccttaacaagacataagaccaaaatgatactaataaa 2064486  T
Q  140 taaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2064487 taaagttagaggacccacataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacagtgagaaacttagagaaccga 2064586  T
Q  239 aataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  2064587 aataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaatgtaatttagccta 2064663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3089616 - 3089341
Alignment:
Q  40 tttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaa 139  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3089616 tttcacatatacatatgaatcataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataatactttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaa 3089517  T
Q  140 taaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccga 238  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3089516 taaagttataggatccacataacacaaaccctaacgtttatttgaattaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccga 3089417  T
Q  239 aataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3089416 aataaatcaatttttagttagagtaccaatccgatgccaattaaatagttagaggacccaaaaggtaatttagcct 3089341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37576476 - 37576181
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||    
T  37576476 atgtgggtacctgaccccctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcctaataccttaacaaggaatag 37576377  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  37576376 gaccaaaatgatacttataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatttagtaact 37576277  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37576276 ttgataaatttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaatttaatagttaaaggaccaaaaaggtaatttagcc 37576181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 9006346 - 9006642
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||    
T  9006346 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaactataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatacattaacaaggcatag 9006445  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9006446 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaa-g 9006544  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  9006545 gtgagaaacttggaggatccaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataacgattaaatagttagaagaccaaaaagataatttagccta 9006642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 324
Target Start/End: Original strand, 49643826 - 49644131
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  49643826 atgtgggtatttgacctcctgtttcatacatacatatgaaccatagcagttaccaataatatcactcactatttaatcataataccttaacaaggcatag 49643925  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  49643926 gatcaaaatgatactaataaataaagttagagaacccacataacacaaacctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatgg 49644025  T
Q  219 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaa 318  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |    
T  49644026 atggaaacttagaggaccgaattaaatcaatttttaattagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcctaaca 49644125  T
Q  319 tttata 324  Q
    ||||||    
T  49644126 tttata 49644131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 37284893 - 37285177
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  37284893 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatg 37284992  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  37284993 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacatttatttaaataaaactaac-ataaggactaaatgtagtaattgtgagaaatt 37285091  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  37285092 tagagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttaaaggaccaaaaatgtaatttagcc 37285177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Original strand, 37585858 - 37586138
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  37585858 ctgacctcatgtttcacacatacatatgaaccataacagttactaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagacatatgaccaaaata 37585957  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37585958 atactaataaataaagttagaggacccacataatataaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaact 37586057  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  37586058 tagaagaccgaaataaattaatttttaattagaggatcaatccgataccaattaagtagttagatgacaaaaaagataatt 37586138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 61 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38127962 - 38127710
Alignment:
Q  61 ataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacata 160  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38127962 ataacagttactaataatatcattcactatttaatcataataccttaataaggcataagaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacata 38127863  T
Q  161 acacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttag 259  Q
    | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38127862 aaacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacagcaaggactaaatatagtaacagtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttag 38127763  T
Q  260 aggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38127762 atgaccaatccgaaaccaattaaatagttagagaaccaaaaaggtaattaagc 38127710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31703898 - 31703660
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||    
T  31703898 ctgacctcctatttcacacatacat-tgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaatagaaccaaaatg 31703800  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31703799 atgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccccaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 31703700  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 267  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31703699 taaaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 31703660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 308
Target Start/End: Original strand, 12127221 - 12127501
Alignment:
Q  28 tctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaat 127  Q
    ||||||||| | |||||||||||    |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||    
T  12127221 tctgacctcttgtttcacacata----tgaaccataacagttaccaataatatcaatcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaat 12127316  T
Q  128 gatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaac 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12127317 gatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaacaaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtcagaaac 12127416  T
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagg---accaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  12127417 ttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggagaactaatccgataccaattaaatagttagaggataaaaaatgtaatt 12127501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 115 - 308
Target Start/End: Original strand, 45843368 - 45843562
Alignment:
Q  115 ataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  45843368 ataggaccaaaatgatactaataaaaaaagctagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagt 45843467  T
Q  214 aacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45843468 aacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 45843562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 254
Target Start/End: Original strand, 27400588 - 27400815
Alignment:
Q  28 tctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaat 127  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||| ||| |||||    
T  27400588 tctgaccttctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatacattaacaaggcataagactaaaat 27400687  T
Q  128 gatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaac 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27400688 gatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaat 27400787  T
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaattttta 254  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||    
T  27400788 ttagaggaacaaaataaatcaattttta 27400815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 308
Target Start/End: Original strand, 4330045 - 4330282
Alignment:
Q  72 caataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaactt 171  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  4330045 caatgatatcagccactatttaaccataataccttaacaaggaatatgattaaaatgatactaataaataaagttagaagacccacataacacaaaccct 4330144  T
Q  172 aac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatcc 270  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  4330145 aacgtttatttgaataaaactaagagaaaggactaaatgtagtaacagtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagggttaatcc 4330244  T
Q  271 gataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4330245 gataccaattaaataattagaggacaaaaaaggtaatt 4330282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 312
Target Start/End: Original strand, 44322948 - 44323109
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44322948 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 44323047  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44323048 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 44323109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 39486357 - 39486643
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||||||||      ||    ||||    
T  39486357 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatatatatgaaccataatagttactaataatatcaatcactatttaatcataata------cgc---atag 39486447  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacgg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39486448 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccatataacacaaaccctaacgttttttgaataaaactaactgaaaggactaaatgtagtaacgg 39486547  T
Q  219 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    | | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||    
T  39486548 taaaaaacttagaaaacggaaataaatcaatttttagttagaggaacaattcaataccaattaaatagttagatgattaaaaaagtaattatgcct 39486643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 155 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12127216 - 12127056
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12127216 cacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagaaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 12127117  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12127116 agttagagaaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 12127056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 16024185 - 16024348
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16024185 acccacataacataaaccctaacgtttatttgaataaaactaccagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 16024284  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16024285 tttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagcct 16024348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49643833 - 49643674
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49643833 acccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 49643734  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49643733 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaa 49643674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12481221 - 12481060
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12481221 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 12481122  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12481121 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagc 12481060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 324
Target Start/End: Original strand, 37304316 - 37304489
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37304316 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 37304415  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaatttata 324  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  37304416 tttagttataggatcaatccgataccaattaaatagttagagggccaaaaaaataatttaacctagaatttata 37304489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27547831 - 27547669
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27547831 acccacatgacacaaaccctaacgtttatttgaataaaaccaacagaaaggactaaatgtattaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 27547732  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27547731 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaaaagaccaaaaaggtaattaagcc 27547669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 49140305 - 49140142
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49140305 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaagagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 49140206  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49140205 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaagataattaagcct 49140142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23476479 - 23476341
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23476479 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaata 23476380  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23476379 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagcc 23476341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Original strand, 37576469 - 37576631
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37576469 acccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaatt 37576568  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37576569 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 37576631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26707334 - 26707194
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26707334 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggggagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccgatctgata 26707235  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26707234 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtatttaagccta 26707194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9006353 - 9006194
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9006353 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtactaacggtgataaacttagatgaccgaaataaatcaatt 9006254  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9006253 tttagttaaaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaa 9006194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1762812 - 1762674
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1762812 tttatttgaataaaactaacataaatgattaaatgttgtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 1762713  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1762712 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagcc 1762674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35612241 - 35612085
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35612241 cacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaaagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaacaaaataaatcaattttt 35612142  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35612141 agttagaggatcaatccgataccaattaaatacttagaggaccaaaaaggtaattaa 35612085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4697044 - 4696881
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4697044 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaattaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 4696945  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  4696944 tttagttataggaccaatccgataccaattaaatagttagaggactaaaaagataatttagcct 4696881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38000627 - 38000492
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38000627 tttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaagaccaatccgata 38000528  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38000527 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 38000492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 156 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37284886 - 37284740
Alignment:
Q  156 acataacacaaaacttaact-ttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 254  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37284886 acataacacaaaccataactcttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaatgaccgaaataaatcaattttta 37284787  T
Q  255 gttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37284786 gttagagaaccaatccgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaa 37284740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8760434 - 8760270
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8760434 acccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaagctaacataaatgactaaatgtagtaacactgaaaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 8760335  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8760334 tttagttagagggtcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 8760270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23598201 - 23598070
Alignment:
Q  184 ataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaa 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23598201 ataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaattcgataccaattaaa 23598102  T
Q  284 tagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23598101 tagttagaggaccaaaaagataatttagccta 23598070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 31703925 - 31704063
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31703925 tttatttgaataaaattaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttataggtccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 31704024  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31704025 ccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 31704063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 315
Target Start/End: Original strand, 26723092 - 26723253
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    |||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26723092 cacataacacgaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaattttt 26723191  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26723192 agttagatgatcaatctgataccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaatttagccta 26723253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 20306290 - 20306453
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  20306290 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatc 20306389  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20306390 tttagttggaggatcaatctgataccaattaactagttagaggaccaaagaggtaattaagcct 20306453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 26707351 - 26707491
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  26707351 atgtgggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatat 26707450  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26707451 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacat 26707491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45052849 - 45052688
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45052849 ccacataaca-aaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacagtgagaaacttataggaccgaaataaatcaatttt 45052751  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  45052750 tagttagaggatcaatctgataccaattaaatagtttgaagatcaaaaagataattaagccta 45052688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6797969 - 6797809
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6797969 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaacaaaactaacagaaatgactaaatggagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 6797870  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    |||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6797869 tttaattagaagatcaatctgatatcaattaaatagttagagaaccaaaaaagtaattaag 6797809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 4697037 - 4697172
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  4697037 atgtgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatag 4697136  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacc 154  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4697137 gatcaaaatgatactaataaataaagttagaggacc 4697172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10831253 - 10831130
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10831253 taacgaaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaggaaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaattcgataccaattaaatagttag 10831154  T
Q  291 aggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  10831153 aggaccaaaaaggtaatttagcct 10831130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37585831 - 37585696
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  37585831 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatataataacggtgagaaatttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctaata 37585732  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37585731 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaa 37585696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 201 - 315
Target Start/End: Original strand, 46593569 - 46593682
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46593569 gactaaatatagtaacagtgagaaactta-aggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 46593667  T
Q  301 aggtaattaagccta 315  Q
    | |||||| ||||||    
T  46593668 aagtaatttagccta 46593682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39486364 - 39486207
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39486364 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaatagaactaacagaaaagaccaaatgcagtaaatgtgagaaacttaaacgaccgaaataaatcaatt 39486265  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39486264 tttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagagaaccaaaaagataatt 39486207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44322944 - 44322816
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  44322944 tgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcacaatttaatcataataccttaacaaggcataggaccaaaatga 44322845  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccaca 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44322844 tactaataaataaagttagaggacccaca 44322816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 315
Target Start/End: Original strand, 34967060 - 34967174
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  34967060 gactaaatatagtaacggtgagaaacttaatggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagaatcaaaa 34967159  T
Q  301 aggtaattaagccta 315  Q
    | |||||| ||||||    
T  34967160 atgtaatttagccta 34967174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 313
Target Start/End: Original strand, 37467548 - 37467670
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 290  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37467548 taacgaaaaggaccgaatgtagtaacagtgagaaacttaagggacctaaataaattaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 37467647  T
Q  291 aggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    | |||||||||||||||| ||||    
T  37467648 atgaccaaaaaggtaatttagcc 37467670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34966425 - 34966308
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 290  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34966425 taacataaaagactaaatgcagtaacagtgagaaacttaagggactgaaataaatcaagttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 34966326  T
Q  291 aggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  34966325 aggtccaaaaaggtaatt 34966308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 301
Target Start/End: Original strand, 5537142 - 5537242
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5537142 gactaaatgtagtaacagtgagaatcttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccgattaaatagttagaggaccaaaa 5537241  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  5537242 a 5537242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 197 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5536514 - 5536397
Alignment:
Q  197 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacc 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5536514 aaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttaagagacccaaataaatcaaattttaggtagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagggcc 5536415  T
Q  297 aaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  5536414 aaaaatgtaatttagcct 5536397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 308
Target Start/End: Original strand, 10831935 - 10832031
Alignment:
Q  212 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10831935 gtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccagttaaatagttagaggaccaaaaaagtaatt 10832031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 191 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32047865 - 32047741
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 290  Q
    ||||| |||| || |||| | ||||||||||  || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32047865 taacagaaagaacgaaatatggtaacggtgatgaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgttaccaattaaatagttag 32047766  T
Q  291 aggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32047765 aggaccaaaaaggtaattaagccta 32047741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 313
Target Start/End: Original strand, 13109191 - 13109277
Alignment:
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13109191 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatcggataccaattaaatagttagaggactaaaaaggtaatttagcc 13109277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 201 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 46592924 - 46592817
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  46592924 gactaaatgcagtaacagtgagaaacttaagggatcgaaataaatcattttttagttagaggatcaatctgatatcaattaaatagttagagggccaaaa 46592825  T
Q  301 aggtaatt 308  Q
    ||||||||    
T  46592824 aggtaatt 46592817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28884118 - 28884010
Alignment:
Q  212 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  28884118 gtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaattattttttagttagaggaccaaaccgttaccaattaaataattagaggaccaaaaaggtaattaaa 28884019  T
Q  312 cctagaatt 320  Q
    |||| ||||    
T  28884018 cctaaaatt 28884010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13183852 - 13183766
Alignment:
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13183852 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaagactaattcaataccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaatttagcc 13183766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 311
Target Start/End: Original strand, 28884751 - 28884871
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 290  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  28884751 taacagaaaggacgaaatatggtaacagtgataaagttagaggactaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgtaaccaattaaatagttag 28884850  T
Q  291 aggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  28884851 aggaccaaaaaagcaattaag 28884871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 49837483 - 49837417
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49837483 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 49837417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Original strand, 4697163 - 4697244
Alignment:
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||    
T  4697163 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagatagcgaattaaaaaggtaatt 4697244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 311
Target Start/End: Original strand, 32048510 - 32048630
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 290  Q
    ||||| ||||||  |||| | ||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  32048510 taacagaaaggatgaaatatggtaactgtgataaagttagaggacaaaaataaatcattttttagttagaggaccaaaccgttatcaaataaatagttag 32048609  T
Q  291 aggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  32048610 aggaccaaaaaagtaattaag 32048630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 46289397 - 46289327
Alignment:
Q  240 ataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  46289397 ataaatcaatttttagttagatgaccaatctgataccaattaaatagttagaggatcaaaaagataattaa 46289327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 313
Target Start/End: Original strand, 49838756 - 49838835
Alignment:
Q  233 gaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  49838756 gaccgaaataaatcaatttttagttagaagaccaatctgataccaattaaataattaaagg-ccaaaaaggtaatttagcc 49838835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 37466922 - 37466801
Alignment:
Q  191 taacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttag 290  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||    
T  37466922 taacagaaaagactaaatgtagtaacaatgaaaaacttgg--gacggaaataaatcaatttttagttagagcagtaatccgataccaattaaatgattag 37466825  T
Q  291 aggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    || |  ||||| |||||| |||||    
T  37466824 agaataaaaaatgtaatttagcct 37466801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45843366 - 45843320
Alignment:
Q  266 aatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45843366 aatccgataccaattaaatagttagaggatc-aaaaggtaattaagcc 45843320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 209
Target Start/End: Original strand, 25996072 - 25996130
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatg 209  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25996072 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatg 25996130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43727366 - 43727278
Alignment:
Q  220 gagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||||||  ||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  43727366 gagaaagttaaaggatcaaaataaatcaaaatttagttaagggatcaaaccgaaaccaattaaatagttaagggactaaaaaggtaatt 43727278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 52179365 - 52179417
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  52179365 tttttagttaaaggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 52179417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39851238 - 39851187
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39851238 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaaaggaccaaaa 39851187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 319
Target Start/End: Original strand, 4550911 - 4550992
Alignment:
Q  238 aaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaat 319  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||    
T  4550911 aaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcctagaat 4550992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7334507 - 7334455
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7334507 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 7334455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 49548186 - 49548134
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49548186 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 49548134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 92)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8592254 - 8591968
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  8592254 ctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatg 8592155  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8592154 atgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 8592055  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8592054 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggactaaaaaggtaatttagcct 8591968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 321
Target Start/End: Original strand, 16037962 - 16038252
Alignment:
Q  32 acctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgata 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||     
T  16037962 acctcctatttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatatccgtcactacttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatg 16038061  T
Q  132 ctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttag 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16038062 ctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttag 16038161  T
Q  231 aggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaattt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16038162 aggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcctagcattt 16038252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6712258 - 6711961
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||  | ||    
T  6712258 atgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacatttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaataaggcacag 6712159  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6712158 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacagaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacg 6712059  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  6712058 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagagggccaaaaatataatttagccta 6711961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 30 - 315
Target Start/End: Original strand, 53995100 - 53995387
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  53995100 tgaccttctatttcacacatacatatgaaccatatcagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatga 53995199  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaac--aaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53995200 tattaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgttatttgaataaaactaacataaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 53995299  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53995300 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatgcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 53995387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 53751057 - 53751365
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  53751057 atgtaggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaatcataacagttaccaataatataagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataa 53751156  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  53751157 gaccaaaattatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaaca 53751256  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctaga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  53751257 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccaata 53751356  T
Q  318 atttatata 326  Q
    ||| |||||    
T  53751357 attaatata 53751365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Original strand, 43734441 - 43734724
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||     
T  43734441 atgtgggtatctgatctcctatttcacacatacatataaaccataacagttacaaataatatcagtcactatttaatcataatattttaacaaggcataa 43734540  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43734541 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaatcttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacg 43734640  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43734641 gtgagaaacttataggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 43734724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24898484 - 24898194
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||      
T  24898484 atgtgggtgtctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataatacattaacaagacatgt 24898385  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24898384 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacgcacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacg 24898285  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24898284 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 24898194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 42855494 - 42855791
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  42855494 atgtgggtatctgacctcctgtttcacacatatatatgaaccacaacagttaccaataatatcagtcattatttaatcataataccttaacgaggaatag 42855593  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42855594 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacg 42855693  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||    
T  42855694 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttggaggaccaatccgatactaattaaatagttaaatgactaaaaaggtaatttagccta 42855791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14985626 - 14985330
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||    
T  14985626 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgagccataagagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatactttaacaaggcatag 14985527  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14985526 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacgaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatg 14985427  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14985426 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 14985330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 50769116 - 50768820
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  50769116 atgtgtgtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataa 50769017  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  50769016 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggatccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaagtactaaatgtagtaacg 50768917  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  50768916 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagatgaccaattcgataccaattaaatagttaaaggatcaaaaaggtaattaagcct 50768820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 19088496 - 19088792
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  19088496 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataa 19088595  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  19088596 gatcaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaaca 19088695  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19088696 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggattaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 19088792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 315
Target Start/End: Original strand, 623844 - 624131
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  623844 ctgacctcctatttcacacatatatatgaaccataacagttaccaataatatctgtcactatttaatcataatatcttaacaaggaataagaccaaaatg 623943  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  623944 atgctaataaataaagttagaggatccacataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaact 624043  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  624044 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagccta 624131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Original strand, 44991434 - 44991736
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  44991434 atgtgggtacctgacctc-tgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataa 44991532  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  44991533 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaacaaaactaacaaaaaagactaaatgtaataaca 44991632  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  44991633 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttcagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagcctata 44991732  T
Q  318 attt 321  Q
    ||||    
T  44991733 attt 44991736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Original strand, 25181970 - 25182263
Alignment:
Q  22 tgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggac 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  25181970 tgggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataatatcttaacaaggaataggac 25182069  T
Q  122 caaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtg 220  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25182070 caaaatgatgttaataaataaagttagaggacccacataacacaaactcaaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtg 25182169  T
Q  221 agaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  25182170 agaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaactaaatagttagaagaccaaaaagataatttagcct 25182263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38339777 - 38339492
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  38339777 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatgtgtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatg 38339678  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38339677 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaccgaaaggactaaatgtagcaacggtgagaaact 38339578  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38339577 tagaggacctaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccagttaaatagttagaggaccaaaaaggtaattcagcc 38339492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Original strand, 21763336 - 21763639
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||     
T  21763336 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatagatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagaaataa 21763435  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  21763436 aaacaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaaca 21763535  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  21763536 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatcttataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcctata 21763635  T
Q  318 attt 321  Q
    ||||    
T  21763636 attt 21763639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 39448643 - 39448938
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| |||||| || | ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  39448643 atgtgggtatctgacatcttgtttcacacatacatatgaaccataagagttaccaataatatttgtcactatttaatcataataccttaacaaggcataa 39448742  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39448743 gaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccagataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacg 39448842  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39448843 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 39448938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 46849824 - 46850114
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||     
T  46849824 atgtgggtacctgaacccctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcataatatcttaacaaggaataa 46849923  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46849924 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacg 46850023  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  46850024 gtgataaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaatttaatagttagatgaccaaaaagataatt 46850114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 15477800 - 15478095
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  15477800 atgtgggtacctgaccttctgtttcatacatacatatgaaccataacagttaccaataatatgagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatat 15477899  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15477900 gaccaaaatgatactaataaacaaagttagaggacccacgtaacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacg 15477999  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15478000 gtgagaaacttagaggaccgaaattaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaagaccaaaaaggtaatttagcc 15478095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 308
Target Start/End: Original strand, 33091619 - 33091898
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||    
T  33091619 tgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaagcataggaccaaaatga 33091718  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33091719 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactt 33091818  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33091819 agatgactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaatactaattaaatagttagaggactaaaaatgtaatt 33091898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 301
Target Start/End: Original strand, 30683704 - 30683966
Alignment:
Q  40 tttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaa 139  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  30683704 tttcacacatacatatgaaccataacagttgccaataatataagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatgatactaataaa 30683803  T
Q  140 taaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30683804 taaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgcgaaacttagaggaccga 30683903  T
Q  239 aataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30683904 aataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatatttagaggaccaaaaa 30683966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 1433426 - 1433723
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||  |||     
T  1433426 atgtgagtatctgacctcttatttcacacatacatatgaaccataatagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccataacaaggcataa 1433525  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  1433526 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaaca 1433625  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1433626 gtgagaaaattagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagccta 1433723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44957661 - 44957387
Alignment:
Q  42 tcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaata 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44957661 tcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatacattatcaaggcatatgaccaaaatgatactaataaata 44957562  T
Q  142 aagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaa 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44957561 aagttagaggatccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgcagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaa 44957462  T
Q  241 taaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  44957461 taaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaataaaatagttagaggaccaaaaatataatttagccta 44957387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 53259293 - 53259583
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  53259293 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataataattaccaataatatcactcattgtttaatcataataccttaacaaggcataa 53259392  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaactt-tatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  53259393 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaactctaacgtgtatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacg 53259492  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53259493 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatt 53259583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12818101 - 12817804
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  12818101 atgtgggtctctgaccttctctttcacacatatatatgaaccataacatttaacaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggcatat 12818002  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||     
T  12818001 gaccaaaatgatactgataaataaagttacaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaagggctaaatgtagtaaca 12817902  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12817901 gtgataaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagaaccaaaaaggtaatttagccta 12817804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 52557263 - 52557532
Alignment:
Q  40 tttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaa 139  Q
    ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  52557263 tttcagacatacatatgaattataacaattaccaataatatcagttactatttaatcataataccttaacaagacatatgaccaaaatgatactaataaa 52557362  T
Q  140 taaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccga 238  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  52557363 taaagttagaggatccacataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccaa 52557462  T
Q  239 aataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52557463 aataaatcaatttttagttagaagaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatt 52557532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 41751971 - 41752253
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||  |||     
T  41751971 atgtgggtacctgacatcctgtttcacaaatacatatgaatcataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttagcaaggcatat 41752070  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  41752071 gatcaaaatgatattaataaataaaattagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactacatgtagtaaca 41752170  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41752171 gtgagaaacttagaggaccaaaataaatgaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 41752253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Original strand, 37206592 - 37206877
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |   ||| ||||||||||    
T  37206592 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataaaagttaccaataatatcagccactatttaatcataataccttaacaaagaatatgaccaaaatg 37206691  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||| |||||    
T  37206692 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacgatgaaaaact 37206791  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  37206792 tagagaaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgatatcaattaaatagttagagaacaaaaaaggtaatttagcc 37206877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 49 - 308
Target Start/End: Original strand, 23755985 - 23756245
Alignment:
Q  49 tacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttag 148  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23755985 tacatatgaaccataacagttatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaaacatatgaccaaaatgatactaataaataaagttag 23756084  T
Q  149 aggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatca 247  Q
    |||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23756085 aggatccacataacgcaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatta 23756184  T
Q  248 atttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23756185 atttttagttaaaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 23756245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 315
Target Start/End: Original strand, 50508622 - 50508909
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||     
T  50508622 ctgacctcctgtttcgcacatacatatgaaccataacagttaccaataatattagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaata 50508721  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  50508722 atactaataaataaagttagaggacccacataacataaaccataacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgcagtaacggtgaaaaact 50508821  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  50508822 tagaggaccaaaataaatcaatttttagttagatgaccaatctgataccaattaaataattagaaaaccaaaaagataatttagccta 50508909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 43566544 - 43566792
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatga 129  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  43566544 tgacctcctgtttcacacatatatatgaaccataacagttaccaataatatcaatcactatttaatcataataccttaacaagacataggaccaaaatga 43566643  T
Q  130 tactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactt 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43566644 tactaataaataaagtttgaggacccacataacacaaatcctaacgtttatttaaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactt 43566743  T
Q  229 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgatacca 277  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43566744 aaaagactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgatacca 43566792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 315
Target Start/End: Original strand, 41878024 - 41878310
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |   ||| ||||||||||    
T  41878024 ctgacatcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcaatatttaatcataataccttaacaaataatatgaccaaaatg 41878123  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41878124 atactaataaataaagttggaggacccacataacataaaccctaacatttatttgaataaaactagcagaaaggact-aatgtagtaacagtgagaaact 41878222  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41878223 tagaggaccgcaataaatcaatttttagttagaggactaatctgattccaattatatagttagaggaccaaaaaagtaatttagccta 41878310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 281
Target Start/End: Original strand, 19508568 - 19508831
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  19508568 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatgtgaaccataacagttactaataatatcagtcactgtttaatcataataccttaacaaggcatat 19508667  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19508668 gaccaaaatcatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaagg 19508767  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaatta 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19508768 gtgagaaacttggaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgatatcaatta 19508831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 36122588 - 36122884
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||  |||     
T  36122588 atgtgggtacctgatctcctgtttcacacatacatatgaaccatatcagctaccaataatatcaatcactatttagtcataataccttaacaaggcatat 36122687  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||     
T  36122688 gaccaaaatgatactaataaatatagttagaggacctatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtaataaca 36122787  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  36122788 gtgagaaacttagaggaccgaaat-aatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaatgtaatttagccta 36122884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44991441 - 44991279
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44991441 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 44991342  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44991341 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 44991279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6505698 - 6505536
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattt 251  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6505698 acccacataacacaaaccctaactttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattt 6505599  T
Q  252 ttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6505598 ttagttagaggaccaatccgatatcaattaaatagttagaggatcaaaaatgtaattaagcct 6505536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42855501 - 42855337
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42855501 acccacataacacaaaccctaacctttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 42855402  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42855401 tttagttagaggaccactccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattacgccta 42855337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43734448 - 43734289
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43734448 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatctatt 43734349  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43734348 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 43734289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 156 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 53751060 - 53750903
Alignment:
Q  156 acataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 254  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53751060 acataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 53750961  T
Q  255 gttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53750960 gttagaggaccaatccgataccaatttaatagttagaggactaaaaaggtaattaagc 53750903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 24898477 - 24898641
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24898477 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcaaaataaatcaatt 24898576  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24898577 tttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggacaaaaaaagtaattaagccta 24898641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15477807 - 15477644
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15477807 acccacataacacaaacactaacgtttattttaataaaactaacagaatggactaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatg 15477708  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15477707 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 15477644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 314
Target Start/End: Original strand, 25269312 - 25269451
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25269312 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgata 25269411  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25269412 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaattaagcct 25269451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Original strand, 8592257 - 8592419
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8592257 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaacaaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 8592356  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8592357 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcc 8592419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 314
Target Start/End: Original strand, 12818093 - 12818257
Alignment:
Q  151 gacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaat 249  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12818093 gacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaag 12818192  T
Q  250 ttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12818193 ttttagttagagcaccaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaagataagtaagcct 12818257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Original strand, 38339782 - 38339942
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38339782 ccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacagtgtgaaacttagaggatcgaaataaatcaatttt 38339881  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38339882 tagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 38339942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 14985619 - 14985782
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14985619 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggatcaaaataaatcaatt 14985718  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14985719 tttagttagatgaccaatctgatacaaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 14985782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 46849831 - 46849668
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46849831 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 46849732  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46849731 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggacgaaaaaggtaattaagcct 46849668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 320
Target Start/End: Original strand, 50769112 - 50769278
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50769112 cacataacaaaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaaagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaattttt 50769211  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaatt 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  50769212 agttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagtctaaaatt 50769278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16037932 - 16037792
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16037932 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 16037833  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16037832 ccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccta 16037792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39448650 - 39448490
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaact-ttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39448650 acccacataacacaaactctaacgcttatttaaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 39448551  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39448550 tttagttagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaacagataattaag 39448490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 52557249 - 52557089
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52557249 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtaagaaacttataggaccgaaataaatcaatt 52557150  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52557149 tttagttagaggaccaattcgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 52557089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43566538 - 43566371
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43566538 ccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaattgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 43566439  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaatt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||    
T  43566438 tagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaagaccaaaaagataattaaggcaagaatt 43566371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 53995096 - 53994934
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53995096 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 53994997  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53994996 tttagttaaaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 53994934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19088503 - 19088344
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088503 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtattaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 19088404  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19088403 tttagttagaggatcattccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaagataattaa 19088344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1433430 - 1433272
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1433430 cacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacgatgagaaacttagagaaccaaaataaatcaattttt 1433331  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1433330 agttagaggaccaatccaataccaatgaaatagttagaggaccaaaaagataattaagc 1433272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8398193 - 8398031
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8398193 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacaatgagaaagttagaggatcgaaataaatcaatt 8398094  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8398093 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 8398031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 156 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41878017 - 41877849
Alignment:
Q  156 acataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 254  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41878017 acataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaa-cttagaggaccgaaataaatcaattttta 41877919  T
Q  255 gttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaatttata 324  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41877918 gttagatgaccaatctgataccaactaaataattagatgaccaaaaaggtaactaagcctagaatatata 41877849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20888303 - 20888148
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaacttt-atttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20888303 ccacataacacaaaccctaacattcatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgcagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 20888204  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20888203 tagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttagagtacctaaaaggtaatt 20888148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30683686 - 30683527
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaa-ctaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30683686 cacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 30683587  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30683586 taattggaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 30683527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 623841 - 623679
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  623841 acccatataacataaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttataggaccaaaataaaacaatt 623742  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  623741 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttaaaggaccaaaaatataattaagcc 623679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23755578 - 23755418
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23755578 ccacgtaacacaaactttaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacgataagaaacttagagaaccgaaataaattaatttt 23755479  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  23755478 tagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggacgaataagttaattaagcc 23755418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36122595 - 36122435
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  36122595 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggattaaatgtagtaacagtgaaaaacttagatgacaaaaataaatcaatt 36122496  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36122495 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagtcagaggaccaaaaaggtaattaag 36122435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 6712251 - 6712412
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6712251 acccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtga-aaatttagaggaccgaaataaatcaatt 6712349  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    | ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6712350 tgtagttagaggatcaatccattaccaattaaatagttaga-gaccaaaaaggtaattaagcct 6712412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25181974 - 25181811
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25181974 acccatataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagaagaccaaaataaatcaatt 25181875  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25181874 tttagttaaaggaccaatccgatacaaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagcct 25181811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41751978 - 41751817
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  41751978 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagtaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttaaag-accaaaataaatcaatt 41751880  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  41751879 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttaaagga-caaaaaggtaattaagcct 41751817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 55022421 - 55022283
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  55022421 tttattttaataaaactaacagaaagga-taaatgtagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgata 55022323  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55022322 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 55022283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33091615 - 33091453
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  33091615 acccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgcagtaatggtgagaaacttagaggatcaaaataaatcaatt 33091516  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33091515 tttagttagaggaccaatctaatactgattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 33091453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Original strand, 44957669 - 44957807
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  44957669 tttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaaatgtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatttgata 44957768  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44957769 tcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 44957807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 315
Target Start/End: Original strand, 4513252 - 4513368
Alignment:
Q  199 aggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4513252 aggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagaggatcaatccgataccaactaaatagttagaggaccaa 4513351  T
Q  299 aaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||| ||||||    
T  4513352 aaaggtaatttagccta 4513368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Original strand, 44125782 - 44125922
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44125782 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaagaccaatccgaca 44125881  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  44125882 ccaattaaatagttagatgaccaaaaatgtaatttagccta 44125922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19508575 - 19508413
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaact-taac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaat 249  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19508575 acccacataacacaaacccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtcacagtgagaaacttagagggccgacataaatcaat 19508476  T
Q  250 ttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19508475 tgttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaa-gtaattaagcc 19508413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21763343 - 21763180
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaa-ctaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaat 249  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  21763343 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaaacaaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaacctggaggaccgaaataaatcaat 21763244  T
Q  250 ttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21763243 ttttagttggaggaccaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaagataattaagcc 21763180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 47603059 - 47602941
Alignment:
Q  197 aaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacc 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47603059 aaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaagggaccaaaataaatcaatttttaattagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggacc 47602960  T
Q  297 aaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||| ||||| ||||||    
T  47602959 aaaaagataatttagccta 47602941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37206587 - 37206428
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37206587 ccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 37206488  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||  |||||||  |||| |||| ||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37206487 taactagaggattaatctgatatcaactgaatagttagaggatc-aaaaggtaattaagcc 37206428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44125755 - 44125624
Alignment:
Q  180 ttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaat 279  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  44125755 ttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaaaaccgaaaaaaatcaatttttagttagagaaccaatttaataccaat 44125656  T
Q  280 taaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44125655 taaatagttaaaggaccaaaaagataattaag 44125624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 315
Target Start/End: Original strand, 47603710 - 47603813
Alignment:
Q  212 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47603710 gtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttag 47603809  T
Q  312 ccta 315  Q
    ||||    
T  47603810 ccta 47603813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 154
Target Start/End: Original strand, 23755583 - 23755708
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |   ||| ||||||||||    
T  23755583 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataatacattaacaaagcatatgaccaaaatg 23755682  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23755683 atactaataaataaagttagaggacc 23755708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 202 - 310
Target Start/End: Original strand, 49135976 - 49136084
Alignment:
Q  202 actaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  49135976 actaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagacgataaaaaa 49136075  T
Q  302 ggtaattaa 310  Q
     ||||||||    
T  49136076 agtaattaa 49136084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 53259300 - 53259184
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  53259300 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaattaattaatt 53259201  T
Q  251 tttagttagaggaccaa 267  Q
    |||||||||||||||||    
T  53259200 tttagttagaggaccaa 53259184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 150
Target Start/End: Original strand, 6505691 - 6505822
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  6505691 atgtgggtacctgacttcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatag 6505790  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagag 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6505791 gaccaaaatgatactaataaataaaattagag 6505822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 50508615 - 50508512
Alignment:
Q  156 acataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 254  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50508615 acataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaattttta 50508516  T
Q  255 gtta 258  Q
    ||||    
T  50508515 gtta 50508512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 313
Target Start/End: Original strand, 52692778 - 52692889
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  52692778 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaat-cgatagcaattaaatagctaaaggaccaaaa 52692876  T
Q  301 aggtaattaagcc 313  Q
    |||||||| ||||    
T  52692877 aggtaatttagcc 52692889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 215 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 52692122 - 52692029
Alignment:
Q  215 acggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  52692122 acggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggatcaaaaagataatt 52692029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31214250 - 31214161
Alignment:
Q  225 acttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  31214250 actttgaggaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagatgatcaaaaatgtaatttagcct 31214161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 55022424 - 55022508
Alignment:
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  55022424 ttagaggatcgaaataaatcaatttttaattagaggattaatccgataccaattaaatagttagagga-caaaaagataattaagc 55022508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20614179 - 20614128
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20614179 tttttagttaaaggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 20614128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 311
Target Start/End: Original strand, 31214250 - 31214293
Alignment:
Q  268 tccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31214250 tccgatatcaattaaatagttagagaatcaaaaaggtaattaag 31214293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 56270608 - 56270557
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  56270608 tttttagttaaaggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 56270557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 301
Target Start/End: Original strand, 43734941 - 43734971
Alignment:
Q  271 gataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43734941 gataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 43734971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 98
Target Start/End: Original strand, 8398195 - 8398264
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcat 98  Q
    |||||||||| || |||||||||| || || ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8398195 ctgacctcctgttccacacatacatataaaccataatagttatcaataatatcagtcactatttagtcat 8398264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 46579841 - 46579789
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46579841 ttttcagttaaaggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 46579789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Original strand, 56271210 - 56271278
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctaga 317  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||  | | |||||||||||    
T  56271210 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaagagcatttaagcctaga 56271278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29472527 - 29472242
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  29472527 ctgacctcctgtttcacacatacatatgaactataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatatgaccaaaatg 29472428  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29472427 atactaataaataaagttagaggactcacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaggaacggtgagaaact 29472328  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29472327 tagaggaccaaaataaatctatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattgagcc 29472242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15744742 - 15744462
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  15744742 ctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatg 15744643  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15744642 atgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagttagaaact 15744543  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15744542 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 15744462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 7496138 - 7496431
Alignment:
Q  22 tgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggac 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||    
T  7496138 tgggtatctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttactcataat-tcttaacaaggaataggac 7496236  T
Q  122 caaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7496237 caaaatgatgctaataaataaagttagagaacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtg 7496336  T
Q  221 agaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7496337 agaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggactaaaaatgtaattaagccta 7496431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16305320 - 16305023
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  16305320 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcaatcactatttaatcataatatcttaacaagacataa 16305221  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||      
T  16305220 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagaactaaatgtagtaatt 16305121  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggacc-aatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  16305120 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaaatccgataccaattaaatagttagagga-caaaaatgtaatttagccta 16305023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13193283 - 13192986
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  13193283 atgtgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatgagtcattatttaatcataataccttaacaaggcatat 13193184  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13193183 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggaccaacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaaca 13193084  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13193083 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatttagccta 13192986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10992146 - 10991850
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  10992146 atgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataagagttaccaataatatttgtcactatttaatcataatatcttagcaagacatag 10992047  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10992046 gaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaactgtaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacg 10991947  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10991946 gtgaaaaatttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcct 10991850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 8174040 - 8174337
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  8174040 atgtgggtacctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacaattaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaataa 8174139  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  8174140 aaacaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagaaacg 8174239  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8174240 gtgagaaatttaaaggaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataatttagccta 8174337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 15405911 - 15406205
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||     
T  15405911 atgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactgtttaatcataataccttaacaagacatat 15406010  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||     
T  15406011 gaccaaaataatactaataaataaagttagaggactcacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaaca 15406110  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15406111 gtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagagga-caaaaaggtaatttagcc 15406205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7469452 - 7469171
Alignment:
Q  28 tctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaat 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  7469452 tctgacctcctctttcacacatacatatgaaccataacggttaacaataatatcactaactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaat 7469353  T
Q  128 gatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaac 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7469352 gatactagtaaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaac 7469253  T
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7469252 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagagggccaaaaaggtaatt 7469171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 314
Target Start/End: Original strand, 19847490 - 19847769
Alignment:
Q  35 tcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatacta 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||| |||    
T  19847490 tcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcataat-tcttaacaaggaatatgaccaaaatgatgcta 19847588  T
Q  135 ataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19847589 ataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaag 19847688  T
Q  234 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19847689 accgaaataaattaatttttagttagaggaccaatccaataccaactaaatagttagatgaccaaaaatgtaattaagcct 19847769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 26181855 - 26182150
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  26181855 atgtgtgtatctgatctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttactaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatat 26181954  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  26181955 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaaca 26182054  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  26182055 gtgagaaacttagagggccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgatatcaattaaataattaaaggaccaaaaatgtaatttagcc 26182150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Original strand, 34735512 - 34735793
Alignment:
Q  33 cctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatac 132  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  34735512 cctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttatcaattatatcagtcactatttaatcctaataccttaacaaggaataggaccaaaatgatac 34735611  T
Q  133 taataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  34735612 taataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttaaa 34735711  T
Q  232 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34735712 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 34735793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 2148041 - 2148333
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||     
T  2148041 atgtgggtacctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatat 2148140  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2148141 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacagaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacg 2148240  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||    
T  2148241 atgagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgataccaattaaatagttaaatgacaaaaaatgtatttaa 2148333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38332948 - 38332698
Alignment:
Q  70 accaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaac 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  38332948 accaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataaaacaaacc 38332849  T
Q  170 ttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaat 268  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38332848 ctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaat 38332749  T
Q  269 ccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaat 319  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||    
T  38332748 ccaataccaattaaatagttagagaaccaaaaatgtaatttagccaagaat 38332698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Original strand, 24372134 - 24372419
Alignment:
Q  31 gacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgat 130  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||  ||  ||||||||||||||||    
T  24372134 gaccttctgtttcacacatacatatgaaccaaaacagttaccaataatatcagtcacaatttaatcataatactttaaaaaggaataggaccaaaatgat 24372233  T
Q  131 actaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24372234 actaataaataaagttagaggacccacataacacaaatcctaatgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactta 24372333  T
Q  230 gaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24372334 gaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagccta 24372419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 19815868 - 19816155
Alignment:
Q  28 tctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaat 127  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| || ||||||    
T  19815868 tctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgagcaaaat 19815967  T
Q  128 gatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaac 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  19815968 gatactaataaataaagtcagaggacccacataacacagactctaacgtttatttgaataaaactagcagaaaggactaaatgtagtaatggtctgaaac 19816067  T
Q  227 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19816068 ttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaattaaatagtttgaggaccaaaaaggtaatttagcct 19816155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36713880 - 36713588
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||    
T  36713880 atgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatt-aatcataataccttaacaaggcatag 36713782  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  36713781 aaccaaaatga--ctaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaaca 36713684  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
     ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36713683 ctgagaaatttagaggacataaataaatcaatttttagttagaagatcaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaaggtaatttagcc 36713588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41474377 - 41474087
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||    
T  41474377 atgtgagtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaatactatcagtcactatttaattataataccttaacaaggcatag 41474278  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||     
T  41474277 gatcaaaatgatactaataaataaagttagatgacccacataacacaaacactaacgtttatttaaataaaactaacataaaagactaaatgtaataaca 41474178  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41474177 gtgagaaacttagaggaccgaaataaataaatttttaattacaggaccgatccgataccaattaaatagttagaagaccaaaaatgtaatt 41474087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 72 - 313
Target Start/End: Original strand, 24138714 - 24138957
Alignment:
Q  72 caataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaactt 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24138714 caataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccct 24138813  T
Q  172 aac-tttatttgaataaaactaaca-aaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatc 269  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||     
T  24138814 aacgtttatttgaataaaactaacagaaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttaattaaagtactaatt 24138913  T
Q  270 cgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24138914 tgataccaattaaatagttagaataccaaaaaggtaattaagcc 24138957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 74 - 267
Target Start/End: Original strand, 12860577 - 12860771
Alignment:
Q  74 ataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaa 173  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12860577 ataatacccgtcactatttaatcataataccttaacaaggaataggaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccgtaa 12860676  T
Q  174 c-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 267  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12860677 cgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 12860771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 136 - 315
Target Start/End: Original strand, 33470195 - 33470375
Alignment:
Q  136 taaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33470195 taaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 33470294  T
Q  235 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33470295 ccgaaataaatcaatttttagtcagaggatcaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 33470375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 155 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24138227 - 24138066
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24138227 cacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtggaccgaaataaatcaattttt 24138128  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24138127 agttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 24138066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15405918 - 15405754
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15405918 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatt 15405819  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15405818 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccta 15405754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8174047 - 8173876
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaacttt-atttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8174047 acccacataacacaaaccctaacgttcatttgaataaaattaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 8173948  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaattta 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8173947 tttagttagaggaccaatctgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaaacctataattta 8173876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24372129 - 24371966
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24372129 acccacataatacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagaactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 24372030  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24372029 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 24371966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 155 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19815863 - 19815697
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19815863 cacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 19815764  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaatt 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  19815763 agttagagaaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaaacctacaatt 19815697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12860542 - 12860381
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12860542 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 12860443  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12860442 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagc 12860381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 309
Target Start/End: Original strand, 16305313 - 16305471
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaact-ttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16305313 acccacataacacaaaccataactcttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggattgaaataaatcaatt 16305412  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16305413 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggatcaaaaagataatta 16305471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7496118 - 7495978
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7496118 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 7496019  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7496018 ccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccta 7495978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34735505 - 34735342
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34735505 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 34735406  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34735405 tttagttagaggatcaattcgataccaactaaatagttagaggaccaaaaagattattaagcct 34735342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 317
Target Start/End: Original strand, 13193276 - 13193442
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13193276 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 13193375  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctaga 317  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13193376 tttagttagaggatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaatataattaagcctaga 13193442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26181859 - 26181701
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26181859 cacataacacaaaccttaaggtttatttgaataaaactaacagaaaggaatatatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 26181760  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 312  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26181759 agttagtggaccaatccaattccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagc 26181701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 313
Target Start/End: Original strand, 41474373 - 41474532
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41474373 cacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaactcagaggaccgaaataaatcaattttt 41474472  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41474473 agttagaggactaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaaagataattaagcc 41474532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Original strand, 38332974 - 38333128
Alignment:
Q  158 ataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 256  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38332974 ataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 38333073  T
Q  257 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38333074 tagaggatcaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaagataattaag 38333128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 315
Target Start/End: Original strand, 29472533 - 29472694
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29472533 cacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccaaaataaatcaattttt 29472632  T
Q  254 agttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29472633 tgttagaggatcaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtatttaagccta 29472694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2148048 - 2147888
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatca-at 249  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  2148048 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggcccgaaataaatcattt 2147949  T
Q  250 ttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2147948 ttttagttagaggaccaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 2147888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 30898613 - 30898748
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30898613 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaacaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 30898712  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30898713 ccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaa 30898748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Original strand, 17052342 - 17052513
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17052342 acccacataacacaaacactaacgtttatttgaatgaaactaacagaaatgactaaatgtagtaanggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 17052441  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaattta 322  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || ||||||    
T  17052442 tttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaacatgtaatttagcntaaaattta 17052513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 203 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17032703 - 17032591
Alignment:
Q  203 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032703 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttcgaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 17032604  T
Q  303 gtaattaagccta 315  Q
     ||||| ||||||    
T  17032603 ataatttagccta 17032591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 313
Target Start/End: Original strand, 15744780 - 15744897
Alignment:
Q  196 aaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggac 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15744780 aaaacgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttagaggac 15744879  T
Q  296 caaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||| |||||||||||    
T  15744880 caaaaatgtaattaagcc 15744897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 203 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17051039 - 17050927
Alignment:
Q  203 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17051039 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttcgaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccaataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 17050940  T
Q  303 gtaattaagccta 315  Q
     ||||| ||||||    
T  17050939 ataatttagccta 17050927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8444951 - 8444820
Alignment:
Q  184 ataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaa 283  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  8444951 ataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagataaccaatccgatatcaactaaa 8444852  T
Q  284 tagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8444851 tagttagaagaccaaaaaggtaattaaaccta 8444820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42834582 - 42834452
Alignment:
Q  154 ccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttt 252  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42834582 ccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaatagtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaatttt 42834483  T
Q  253 tagttagaggaccaatccgataccaattaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42834482 tagttagaggaccaatccgataccaattaaa 42834452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 267
Target Start/End: Original strand, 10992139 - 10992255
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10992139 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 10992238  T
Q  251 tttagttagaggaccaa 267  Q
    |||| ||||||||||||    
T  10992239 tttaattagaggaccaa 10992255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17052337 - 17052175
Alignment:
Q  31 gacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgat 130  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||     || ||||||||||||    
T  17052337 gacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttatctataatatcagtcattatttaatcataataccttaacgt----taagaccaaaatgat 17052242  T
Q  131 actaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac--tttatttgaataaaactaaca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  17052241 actaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgttttatttgaataaaactaaca 17052175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 201 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8962472 - 8962365
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8962472 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttgagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgatactaattaaatagttagaggaccaaaa 8962373  T
Q  301 aggtaatt 308  Q
    || |||||    
T  8962372 agataatt 8962365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 302
Target Start/End: Original strand, 36713873 - 36714024
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  36713873 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaacaaacagaaatgactaagtgtggtaacggtgagaaacctagatgacgaaaataaatcaatt 36713972  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 302  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36713973 tttagtttgaggaccaattcaataccaattaaatagttagagaaccaaaaag 36714024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 308
Target Start/End: Original strand, 8445127 - 8445234
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8445127 gactaaatgtagtaactgtgataaacttagaggaccgaagtaaatcaatttttaattagagtgctaatccgataccaattaaatagttagaggacaaaaa 8445226  T
Q  301 aggtaatt 308  Q
    ||||||||    
T  8445227 aggtaatt 8445234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 7469458 - 7469605
Alignment:
Q  156 acataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 254  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||        || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7469458 acataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaa--------cgatgagaaacttagacgactgaaataaatcaattttta 7469549  T
Q  255 gttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7469550 gttagagaaccaatctgataccaactaaatagttagagaaccaaaaaggtaattaa 7469605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 313
Target Start/End: Original strand, 8963166 - 8963267
Alignment:
Q  212 gtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8963166 gtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagagaaccaatccgataccaattaaatagttagagaaccaaaaaagtaatttag 8963265  T
Q  312 cc 313  Q
    ||    
T  8963266 cc 8963267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 302
Target Start/End: Original strand, 23992211 - 23992281
Alignment:
Q  232 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 302  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  23992211 ggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttcagggaccaaaaag 23992281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Original strand, 2804969 - 2805020
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2804969 tttttagttaaaggatcaaagcgataccaattaaatagttaaaggaccaaaa 2805020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Original strand, 13479426 - 13479477
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13479426 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaaaggaccaaaa 13479477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15044803 - 15044752
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15044803 tttttagttaaaggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 15044752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19847361 - 19847276
Alignment:
Q  224 aacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  19847361 aacttagagg-ccaaaataaatcaatttttag-tagagg-ccaatccg-taccaactaaatagttaga-gaccaaaaa-ctaattaagccta 19847276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33200092 - 33200041
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33200092 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaaaggaccaaaa 33200041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Original strand, 38807179 - 38807230
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaa 300  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38807179 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaaaggaccaaaa 38807230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 302
Target Start/End: Original strand, 15136870 - 15136923
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaag 302  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15136870 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaag 15136923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 301
Target Start/End: Original strand, 16655911 - 16655980
Alignment:
Q  232 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| |  ||||||||||  ||||||||||    
T  16655911 ggaccaaaataaatcaaattttagttaaaggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 16655980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2822368 - 2822316
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2822368 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 2822316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 2822675 - 2822727
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2822675 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 2822727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Original strand, 24138234 - 24138282
Alignment:
Q  30 tgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataat 78  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  24138234 tgacctcctgtttcacacatacatatgagccataacagttaccaataat 24138282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 31557548 - 31557600
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31557548 tttttagttaagggaccaaaacgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 31557600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 33200519 - 33200571
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33200519 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 33200571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 73042 - 72761
Alignment:
Q  33 cctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatac 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||| |    
T  73042 cctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatattggtcactatttaatcataat-tcttaacaaggaataagaccaaaatgatgc 72944  T
Q  133 taataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  72943 taataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaataaatgtagtaacggtgagaaacttaga 72844  T
Q  232 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72843 ggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 72761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Original strand, 73073 - 73213
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73073 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 73172  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  73173 ccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccta 73213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21035 - 20749
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  21035 ctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcggtcactatttaatcataat-tcttaacaaggaataggaccaaaatg 20937  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20936 atgctaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgtgaaact 20837  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20836 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagatgaccaaaaatgtaattaagccta 20749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Original strand, 50631 - 50927
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  50631 atgtgggtacctgacctcctctttcacacatacataagaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatag 50730  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  50731 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacg 50830  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaatt-aaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  50831 gtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatctgataccaattaaaatagttagaggaccaaaaatgtaatttagcc 50927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50638 - 50478
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50638 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaaataacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 50539  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  50538 tttagttagaggaccaatcagataccaattaaataggtagaggaccaaaaagataattaag 50478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18568 - 18285
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||     
T  18568 atgtgggtacctgaccgcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatat 18469  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  18468 gaccaaaatgatactaataaataaaattagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtagcg 18369  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18368 gtgagaaacttagaagacctaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctaataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 18285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Original strand, 18561 - 18723
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18561 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgaaaaacttagaggaccaaaataaatcaatt 18660  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18661 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaataattaaaggaccaaaaatgtaattaagcc 18723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 14290 - 14587
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  14290 atgtgggtatctgacctcttgtttcacacatacatatgaaccataagagttaccaataatatttgtcactatttaatcataataccttaacaaggcatat 14389  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14390 gaccaaaatgatgctaataaataaagttagaggacccagataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacg 14489  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14490 gtgagaaacatagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggatcaatccgatatcaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 14587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14297 - 14134
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14297 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatt 14198  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14197 tttagttagaggaccaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaacaggtaattaagcct 14134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24441 - 24160
Alignment:
Q  35 tcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatacta 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||  ||    
T  24441 tcctatttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatccgtcactatttaatcataatatcttaacaaggaacaggaccaaaatgatgtta 24342  T
Q  135 ataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24341 ataaataaagttagaggacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaaaaaaactaacagaaatgactaaatgtaataacggtgagaaacttagagg 24242  T
Q  234 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24241 atcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaattcaataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 24160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 158 - 313
Target Start/End: Original strand, 24456 - 24612
Alignment:
Q  158 ataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 256  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24456 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 24555  T
Q  257 tagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24556 tagaggaccaatccgataccaactaaatagttagagtaccaaaaatgtaattaagcc 24612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8719 - 8427
Alignment:
Q  23 gggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggacc 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  8719 gggtatctgacctcctgtttcacacatacacatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcataggacc 8620  T
Q  123 aaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtga 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||| ||||    
T  8619 aaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaacctcaacgtttatttgaataaaactaacagaaaatactaaatattgtaacagtga 8520  T
Q  222 gaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8519 gaaacttaaaggatcgaaataaatcaatttttagtta-aagatcaatctgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagccta 8427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 309
Target Start/End: Original strand, 8716 - 8874
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  8716 acccgcataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaacataaataaatcaatt 8815  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8816 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaagtaatta 8874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19993 - 19713
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  19993 ctgacctcctatttcacacatacatatgaaccataacagttatcaataatatccgtcactatttaatcataaaaccttaacaaggaatatgaccaaaatg 19894  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19893 atgctaataaataaagttagaggacccacataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtaagaaact 19794  T
Q  228 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19793 tagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccaataccaactaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 19713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 19996 - 20155
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||    
T  19996 acccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacaaaaaataatcaatt 20095  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20096 tttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaa 20155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 60 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 46010 - 45754
Alignment:
Q  60 cataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacat 159  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46010 cataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggaatatgaccaaaatgaaactaataagtaaagttagaggacccacat 45911  T
Q  160 aacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtta 258  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45910 aacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaaccgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtta 45811  T
Q  259 gaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  45810 gaggactaatccgataccaattaaataattagaggaccaaaatagtaatttagccta 45754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 56424 - 56583
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56424 acccacataaaacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 56523  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  56524 tttagttagatgaccaatcaaataccaactaaatagttagaggataaaaaagataattaa 56583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 63549 - 63708
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63549 acccacataaaacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 63648  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  63649 tttagttagatgaccaatcaaataccaactaaatagttagaggataaaaaagataattaa 63708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 349368 - 349085
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||     
T  349368 atgtgggtatctgacctcctgtttcacacatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcaatatttaatcataataccttaacaaggaatat 349269  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||    
T  349268 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacgcaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaaaaacg 349169  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  349168 gtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctaatactaattaaatagttagaggacaaaaaa 349085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 349361 - 349523
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  349361 acccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaattaacagaaaggactaaatgtagtaaaagtgagaa-cttagaggaccgaaataaatcaatt 349459  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  349460 tttagttagaggaccaatctgataccaactaaatagttaggggaccaaaaaggtaactaagcct 349523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Original strand, 113654 - 113825
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  113654 acccacataacactaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaatttagatgaccgaaagaaatcaatt 113753  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcctagaattta 322  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  113754 tttagttacaggaccaatctgatagcacttaaatagttagaggaccaaaaatgtaattaagccatgaattta 113825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 113661 - 113519
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  113661 atgtgggtatctgacctcttgtttcacacatacaaatgcactataacaattagcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaaggcatag 113562  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataa 161  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  113561 aaccaaaatgatactaataaataaagttagaggagccacataa 113519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 184 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 113522 - 113391
Alignment:
Q  184 ataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaa 283  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  113522 ataaaactaacggaaaggaataaatttactaacgatgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatcggataccaattaaa 113423  T
Q  284 tagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
     ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  113422 cagttagaggaccaaaaatgttatttagccta 113391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15743 - 15458
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  15743 atgtgggtacctgacctcctgtttcacatatacatacgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaaggcatag 15644  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||     ||||| ||| ||||||||||||||||     
T  15643 gacaaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaactcaaacatttatttgaat-----taacagaaatgactaaatgtagtaaca 15549  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaatt 308  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  15548 gtgagaaacttaaatgaccaaaataaatcaatttttaattagaggatcaatccgataccaattgaatagttagaggataaaaaaggtaatt 15458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Original strand, 15736 - 15898
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15736 acccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaagggattaaatgtagtcatggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 15835  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15836 tttagttagatgaccaatccgataccagttaaatagttagaggatcaaaaaagtaattaagcc 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 236
Target Start/End: Original strand, 82023 - 82231
Alignment:
Q  29 ctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatataggaccaaaatg 128  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  82023 ctgacctcctgtttcacagatacatatgaaccataacagttaccaataatatcagtcactatttaatcataatatcttaacaagaaataggaccaaaatg 82122  T
Q  129 atactaataaataaagttagaggacccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82123 atattaataaataaagttagaggacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaact 82222  T
Q  228 tagaggacc 236  Q
    |||||||||    
T  82223 tagaggacc 82231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 175 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 81996 - 81856
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  81996 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgata 81897  T
Q  275 ccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  81896 ccaaataaatagttagaggatcaaaaagataattaagccta 81856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 207 - 301
Target Start/End: Original strand, 90782 - 90876
Alignment:
Q  207 atgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  90782 atgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatccgataccaactaaatagttagaggacgaaaaa 90876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6290 - 6044
Alignment:
Q  19 atgtgggtgtctgacctcctatttcacacatacaaatgaaacataacaattaccaataataacagtcactatttaatcataatatcttaacgagatatag 118  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||||| || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||     
T  6290 atgtgggtatctgacatcttgtttcacacatccataagaaacataataattatcaataatatcagtcactatttaatcataataccttaacaagacatat 6191  T
Q  119 gaccaaaatgatactaataaataaagttagaggacccacataacacaaa-acttaactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacg 217  Q
    || ||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  6190 gatcaaaatga---taataaataaagttagaggatccacataacacaaactctaatgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaaca 6094  T
Q  218 gtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 267  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6093 atgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaa 6044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 6283 - 6439
Alignment:
Q  152 acccacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 250  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6283 acccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaat-aatcaatt 6381  T
Q  251 tttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaa 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||    
T  6382 tttagttagaggaccaatacgataccaattaattagttaaaggac--aaaaggtaattaa 6439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9912 - 9780
Alignment:
Q  183 aataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 282  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9912 aataaaactaacggaaaggactaaaagtagtaacggatagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagaggagcaaaccgataccaattaa 9813  T
Q  283 atagttagaggaccaaaaaggtaattaagccta 315  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  9812 atagttaagggaccaaaaaggcaattaagccta 9780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 302
Target Start/End: Original strand, 10876 - 10995
Alignment:
Q  183 aataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaa 282  Q
    ||||||| ||||  |||| |||||| || ||||| |  |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  10876 aataaaattaacggaaagaactaaaagtggtaacagaaagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaa 10975  T
Q  283 atagttagaggaccaaaaag 302  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  10976 atagttaagggaccaaaaag 10995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14350 - 14231
Alignment:
Q  155 cacataacacaaaacttaac-tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 253  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14350 cacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagcaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 14251  T
Q  254 agttagaggaccaatccgata 274  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  14250 agttaga-gaccaatccgata 14231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 201 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 144132 - 144039
Alignment:
Q  201 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagagga 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  144132 gactaaaagtagtaacggtgagaaatttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagagaaccaatatgataccaattaaatagttagagga 144039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 305
Target Start/End: Original strand, 147152 - 147281
Alignment:
Q  175 tttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgata 274  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||     
T  147152 tttattcgaataaaattaacggaaatgactaaatatagtaacgatgagaaacttaacggaccgaaataaatcaatttttagttcgaggaccaattcaat- 147250  T
Q  275 ccaattaa--atagttagaggaccaaaaaggta 305  Q
      ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  147251 --aattaaatatagttagaggaccaaaaaggta 147281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0526 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0526
Description:

Target: scaffold0526; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4063 - 4030
Alignment:
Q  280 taaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4063 taaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 4030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0526; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 313
Target Start/End: Original strand, 4084 - 4117
Alignment:
Q  280 taaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4084 taaatagttagaggaccaaaaaggtaatttagcc 4117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 230936 - 230871
Alignment:
Q  249 tttttagttagaggaccaatccgataccaattaaatagttagaggaccaaaaaggtaattaagcct 314  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||    
T  230936 tttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaagcatttaagcct 230871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 14750 times since January 2019
Visitors: 8422